偏凸-柱穗山羊草雙二倍體d基因組的ssr標記的製作方法
2024-01-20 18:24:15 3
專利名稱:偏凸-柱穗山羊草雙二倍體d基因組的ssr標記的製作方法
技術領域:
偏凸-柱穗山羊草雙二倍體D基因組的SSR標記,屬於作物遺傳育種學領域。
背景技術:
山羊草屬是與小麥親緣關係最為密切的屬,全屬有24個種,包括C、 D、 M、 S和U等 17個染色體組,蘊藏著許多抗病、抗蟲、抗逆等有益基因,同時它在小麥進化中起著重要作
用,並為小麥改良提供了一批優良基因。對山羊草屬進行深入研究具有理論意義和應用價 值。山羊草屬均為一年生野生雜草,系禾本科、小麥族植物,全屬包括11個二倍體種,7個 四倍體種,2個六倍體種和2個兼有四倍體和六倍體的種,所有多倍體種均起源於不同二倍 體的雜交和染色體加倍。經分類學、形態學、細胞學以及地理學等多方面的考證,將山羊草 17個染色體組23種組合分為6個組24個種。山羊草屬植物自然分布在西經10°至東經 83° ,北緯3(T 49°的區域,主要以土耳其為中心,衍生在原蘇聯外高加索、伊朗、阿富 汗、伊拉克、敘利亞等地中海沿岸國家。24個種分別具有各自相對獨立的棲息地。中國的新 疆和黃河流域是粗山羊草的主要分布地區,具有廣泛的遺傳多樣性。
發明內容
偏凸山羊草(DDMVMV)和柱穗山羊草(CCDD)雜交巳經過染色體加倍獲得了 了它們
的完全雙二倍體SDAU18。本研究利用SSR技術對SDAU18中的兩個分別來自不同親本的D
基因組進行了鑑定,為其在小麥遺傳育種中的有效利用提供理論依據。 本研究利用的實驗材料為雙二倍體SDAU18、其雙親偏凸山羊草和柱穗山羊草以及
兩份粗山羊草Ae37和Ae44。其中,偏凸山羊草、柱穗山羊草、粗山羊草引自中國農業科學
院,SDAU18由國家小麥改良中心泰安分中心選育保存。 結果與分析 本研究利用普通小麥D染色體專化的258對SSR引物和11對EST-SSR引物,對 SDAU18、其雙親偏凸山羊草和柱穗山羊草以及粗山羊草Ae37和Ae44之間的多態性進行了 分析。獲得的主要結果如下
偏凸山羊草和SDAU18的多態性表現 絕大多數D組專化的SSR引物和EST引物都能在偏凸山羊草中擴增出帶,出帶 率平均為76.6%。同時,從表l還可以看出絕大多數(平均為86.9%)能在偏凸山羊草 中擴增出帶的引物所產生的帶型能完全(如
圖1引物Xgdmlll-lD、 Xwmc503-2D、圖3引物 Xgdml28-3D、 Xgdm3-5D、 BARC071-3D、 Xgdm34-4D以及圖5引物Xwmc503-2D、 Xwmc552-3D擴 增出的帶型)或部分(如圖1引物Xgwm337-lD、Xgdml07-2D和圖2引物BARC183-6DS庫增 出的帶型)體現在SDAU18的帶型之中;前類引物有123對,後類引物有58對。
柱穗山羊草和SDAU18的多態性表現 絕大多數D組專化的SSR引物和EST引物都能在柱穗山羊草中擴增出帶,出帶率 平均為78.4%。同時,從表2還可以看出多數(平均為56.0%)能在柱穗山羊草中擴增出
3帶的引物所產生的帶型能基本或部分體現在SDAU18的帶型之中;前類引物有83對,後類引 物有35對。
權利要求
本研究以雙二倍體SDAU18、其親本偏凸山羊草(DDMvMv)和柱穗山羊草(CCDD)以及兩份粗山羊草Ae37(DD)和Ae44(DD)為材料,利用D基因組專化的258對SSR引物和11對EST-SSR引物對偏凸-柱穗山羊草雙二倍體SDAU18中分別來自雙親的兩個D基因組進行了鑑定,獲得的主要結果如下在這269對引物中,有206對能在偏凸山羊草中擴增出帶,出帶率為76.6%,同時,有211對引物能在柱穗山羊草中擴增出帶,出帶率為78.4%;另外,在能在偏凸山羊草中擴增出帶的206對引物中有181對引物擴出的帶型能完全或部分體現在SDAU18的帶型之中,並且,這181對引物覆蓋了整個D基因組,同時,在能在柱穗山羊草中擴增出帶的211對引物中有118對引物擴出的帶型能完全或部分體現在SDAU18的帶型之中,並且這118對引物也覆蓋了整個D基因組;此外,還有10對引物雖能同時在偏凸山羊草和柱穗山羊草中擴增出帶,但這些譜帶均未能在SDAU18的帶型中體現出來;此外,還有5對引物能在SDAU18中擴增出雙親所沒有的特徵帶,這說明SDAU18含有雙親的所有D染色體的遺傳物質,同時也說明偏凸山羊草和柱穗山羊草的遺傳物質在SDAU18中已發生了一定程度的結構性變化。
全文摘要
本研究以雙二倍體SDAU18、其親本偏凸山羊草(DDMvMv)和柱穗山羊草(CCDD)以及兩份粗山羊草Ae37(DD)和Ae44(DD)為材料,利用D基因組專化的258對SSR引物和11對EST-SSR引物對偏凸-柱穗山羊草雙二倍體SDAU18中分別來自雙親的兩個D基因組進行了鑑定。結果如下在這269對引物中,有206對能在偏凸山羊草中擴增出帶,出帶率為76.6%,同時,有211對引物能在柱穗山羊草中擴增出帶,出帶率為78.4%;另外,在能在偏凸山羊草中擴增出帶的206對引物中有181對引物擴出的帶型能完全或部分體現在SDAU18的帶型之中,並且,這181對引物覆蓋了整個D基因組。
文檔編號C12Q1/68GK101760551SQ20081023865
公開日2010年6月30日 申請日期2008年12月19日 優先權日2008年12月19日
發明者曹淑蘭 申請人:曹淑蘭