一種寡核苷酸標籤及其應用的製作方法

2023-06-10 22:52:01

專利名稱：一種寡核苷酸標籤及其應用的製作方法
技術領域：
本發明涉及一種寡核苷酸標籤及其應用。
背景技術：
與已知生物基因組序列無相似性(同源性)的寡核苷酸標籤(oligonucleotidetag)在現代分子生物學應用中扮演越來越重 要的作用。例如，在RNA模板特異性PCR擴增(RS-PCR)中，就是在反轉錄中使用了一種5』端帶有一段寡核苷酸標籤的反轉錄引物，在完成反轉錄反應後，以這段寡核苷酸標籤為引物進行PCR擴增，就可以只擴增RNA的反轉錄產物，而不會擴增汙染的基因組DNA，實現RNA模板的特異性PCR擴增，避免了假陽性的出現。其中，所使用的寡核苷酸標籤必須與該生物基因組沒有顯著的序列相似性。在單核苷酸多態性分型(SNP genotyping)研究中，也經常使用一種「tag-antitag」系統。即，在核酸擴增中將每種可能的SNP類型和一種特定的寡核苷酸標籤相連接，這種帶有寡核苷酸標籤的SNP序列將會和DNA微陣列或微球上的tag互補序列(antitag)相結合,從而判別出是否存在某種類型的SNP。與生物基因組無顯著相似性的寡核苷酸標籤還被廣泛應用於基因晶片中的探針臂和多種高通量檢測技術的接頭、多種多重檢測技術的「條碼」(barCOde)等等，這些現代高通量檢測技術的檢測效果高度依賴於所用寡核苷酸標籤的質量，其中衡量寡核苷酸標籤質量的最重要的指標就是該標籤與生物基因組的相似性是否足夠低，如果相似性不夠低，就會出現交叉雜交、非特異性擴增等問題，嚴重幹擾這些檢測技術的準確性。

發明內容
本發明的一個目的是提供一種與人基因組相似性低的寡核苷酸。本發明所提供的寡核苷酸，其核苷酸序列如SEQ ID NO 1所示。上述寡核苷酸在以RNA為模板進行PCR擴增中的應用也屬於本發明的保護範圍。上述寡核苷酸在檢測寡核苷酸多態性中的應用也屬於本發明的保護範圍。上述寡核苷酸在作為基因晶片中的探針臂中的應用也屬於本發明的保護範圍。上述寡核苷酸在作為高通量檢測技術的接頭中的應用也屬於本發明的保護範圍。上述寡核苷酸在作為多重檢測技術的條碼中的應用也屬於本發明的保護範圍。實驗證明，本發明得到的寡核苷酸標籤與人基因組的相似性明顯低於對照，因此本發明標籤在基因晶片中的探針臂、多種高通量檢測技術的接頭、多種多重檢測技術的「條碼」(barcode)等領域具有廣闊的應用前景。


圖I為PCR擴增結果。圖2為雜交結果
具體實施例方式下述實施例中所使用的實驗方法如無特殊說明，均為常規方法。下述實施例中所用的材料、試劑等，如無特殊說明，均可從商業途徑得到。實施例I、寡核苷酸的製備及驗證
權利要求
1.一種寡核苷酸，其核苷酸序列如SEQ ID N0:1所示。
2.權利要求I所述的寡核苷酸在以RNA為模板進行PCR擴增中的應用。
3.權利要求I所述的寡核苷酸在檢測寡核苷酸多態性中的應用。
4.權利要求I所述的寡核苷酸在作為基因晶片中的探針臂中的應用。
5.權利要求I所述的寡核苷酸在作為高通量檢測技術的接頭中的應用。
6.權利要求I所述的寡核苷酸在作為多重檢測技術的條碼中的應用。
全文摘要
本發明公開了一種寡核苷酸標籤。本發明的寡核苷酸，其核苷酸序列如SEQ ID NO1所示。實驗證明，本發明得到的寡核苷酸標籤與人基因組的相似性明顯低於對照，因此本發明標籤在基因晶片中的探針臂、多種高通量檢測技術的接頭、多種多重檢測技術的「條碼」(barcode)等領域具有廣闊的應用前景。
文檔編號C12N15/11GK102732512SQ20121009987
公開日2012年10月17日 申請日期2012年4月6日 優先權日2011年4月8日
發明者孫義民, 張亮, 張巖, 楊萍 申請人:博奧生物有限公司, 清華大學