數據採集和分發方法

2023-04-26 14:59:31

數據採集和分發方法
【專利摘要】本文提供了進行研究的方法，其中通過早期訪問所採集的數據和樣品來激勵參與。還公開了分發研究數據的方法。
【專利說明】數據採集和分發方法
[0001] 奪叉引用
[0002] 本申請要求2011年7月13日提交的美國臨時專利申請號61/507,531以及2012 年3月14日提交的美國臨時專利申請號61/610, 807的權益，其中每一篇均通過引用整體 併入本文。
[0003] 發明背景
[0004] 多發性骨髓瘤是一種骨髓中的漿細胞的癌症。
[0005] 需要開發新一代的多發性骨髓瘤治療來延長患者的壽命並將其治癒。
[0006] 發明概沭
[0007] 本文公開了研究方法，其包括：招募一名或多名受試者，其中至少一名受試者被診 斷出患有疾病；從其中至少一名受試者採集一個或多個生物樣品和臨床數據；分析至少一 個所述生物樣品的一部分以生成至少一名所述受試者的概況；將所述臨床數據和概況存儲 在數據存儲庫中；授權利益相關方（stakeholder)在第一段時間訪問所述數據存儲庫以換 取其支持，其中所述支持包括：提供資金、參與和/或其組合，由此進行研究。在一些實施方 案中，所述招募在一個或多個招募點進行。在一些實施方案中，所述招募點包括醫院、學術 醫療中心、社區衛生服務中心、政府機構、政府資助的醫療中心和/或其組合。在一些實施 方案中，所述招募點由科學顧問委員會選擇。在一些實施方案中，所述科學顧問委員會包括 非營利性機構或其成員、非營利性研究者，學術研究者或其組合。在一些實施方案中，每名 受試者均被診斷出患有所述疾病。在一些實施方案中，至少其中一名受試者新被診斷出患 有所述疾病。在一些實施方案中，每名受試者均新被診斷出患有所述疾病。在一些實施方案 中，所述疾病是癌症。在一些實施方案中，所述疾病是骨髓瘤。在一些實施方案中，所述疾病 是多發性骨髓瘤。在一些實施方案中，所述疾病是骨病。一些實施方案進一步包括從每名受 試者中採集生物樣品和臨床數據。在一些實施方案中，至少一個所述生物樣品包括血液樣 品、血漿樣品、骨髓樣品、骨髓抽吸物、毛髮樣品、尿液樣品、糞便樣品、呼吸樣品、皮膚樣品、 細針抽吸物、組織活檢、脊髓液樣品、淚液樣品、黏液樣品、羊水樣品、精液樣品、組織樣品或 其組合。在一些實施方案中，所述生物樣品包括血液樣品和骨髓樣品。在一些實施方案中， 所述臨床數據包括患者報告的數據、生命體徵、醫學圖像和/或其組合。在一些實施方案 中，所述醫學圖像包括X-射線圖像、磁共振圖像、計算機控制軸向斷層攝影圖像、正電子發 射斷層攝影圖像、單光子發射計算斷層攝影圖像，超聲圖像、螢光檢查圖像、熱成像圖像、閃 爍照相圖像、放射性同位素圖像、光聲圖像和/或其組合。在一些實施方案中，所述生物樣 品和臨床數據是在貫穿所述疾病治療的全過程中採集的。在一些實施方案中，所述採集在 第一次治療之前進行。在一些實施方案中，所述採集在治療過程之前、之中或之後進行。在 一些實施方案中，所述採集在每次治療過程之前、之中或之後進行。在一些實施方案中，所 述採集是在治療過程之後進行。在一些實施方案中，所述採集在所述疾病復發之後進行。 在一些實施方案中，所述疾病治療過程是針對每名受試者單獨確定的。在一些實施方案中， 所述疾病治療過程是由私人醫生確定的。在一些實施方案中，所述疾病治療過程不使用試 驗性藥物。在一些實施方案中，所述疾病治療過程包括具有針對所述疾病的標示適應症的 藥物。在一些實施方案中，所述疾病治療過程包括具有針對所述疾病的標示外適應症的藥 物。一些實施方案進一步包括分析每個生物樣品的一部分，以生成從中採集了所述生物樣 品的每名受試者的概況。在一些實施方案中，所述分析由第三方機構進行。在一些實施方 案中，第三方機構是非營利性機構、營利性機構、生物醫學研究所、醫院、製藥公司、生物技 術公司、實驗室或其組合。在一些實施方案中，所述分析包括對多核苷酸、多肽、細胞、組織 或其組合的分析。在一些實施方案中，所述分析包括利用鏈終止法、染料終止劑法、雜交測 序法、合成測序法或基於高解析度顯微術的技術，對一個或多個多核苷酸進行測序。在一些 實施方案中，所述概況包含多核苷酸序列、多肽序列、mRNA表達水平、蛋白質表達水平、細胞 形態、核型、腫瘤大小、腫瘤密度或其組合。在一些實施方案中，所述數據存儲庫可通過因特 網訪問。在一些實施方案中，所述數據存儲庫可通過研究者門戶（researcher portal)訪 問。在一些實施方案中，所述研究者門戶是網頁界面，其允許對數據進行檢索、整理、歸類、 總結、下載和/或分析。在一些實施方案中，所述利益相關方包括營利性企業。在一些實施 方案中，所述支持是提供資金。在一些實施方案中，所述利益相關方包括至少一個所述招募 點。在一些實施方案中，所述支持是參與。在一些實施方案中，所述第一段時間為約1個月 至約3年。在一些實施方案中，所述第一段時間為約5個月、約6個月或約9個月。一些實 施方案進一步包括將數據存儲庫訪問擴展至第二利益相關方，持續第二段時間。在一些實 施方案中，所述第二利益相關方包括所述招募點中的至少一個。在一些實施方案中，所述支 持是參與。在一些實施方案中，所述第二段時間接著所述第一段時間開始。在一些實施方 案中，所述第二段時間為約1個月至約2年。在一些實施方案中，所述第二段時間為約1個 月或約3個月。一些實施方案進一步包括授權任何人在所述第一段時間之後訪問數據存儲 庫。一些實施方案進一步包括授權任何人在所述第二段時間之後訪問數據存儲庫。一些實 施方案進一步包括將生物樣品儲存在組織庫中。在一些實施方案中，組織庫與患者數據存 儲庫一起被授權訪問。在一些實施方案中，由組織庫應用委員會授權對組織庫的訪問。在 一些實施方案中，所述研究是縱向研究的一部分，其中生物樣品和/或臨床數據是在兩個 或多個時間點採集的。在一些實施方案中，所述兩個或多個時間點包括在治療過程開始前 的一個或多個時間點、治療過程中的一個或多個時間點、治療過程後的一個或多個時間點、 復發事件後的一個或多個時間點或其組合。在一些實施方案中，在兩個或多個時間點採集 的臨床數據用於評價治療結果。在一些實施方案中，所述治療結果和概況用於鑑定預後的 或治療診斷（theranostic)指標。
[0008] 本文還公開了分發數據的方法，其包括：提供數據存儲庫，其中所述數據存儲庫包 括：（i)從一名或多名受試者採集的臨床數據，其中所述受試者中的至少一名被診斷出患 有疾病，（ii)概況數據，其中所述概況數據通過分析從至少一名所述受試者採集的一個或 多個生物樣品而生成；授權利益相關方訪問數據存儲庫以換取支持，其中所述支持是為所 述提供數據存儲庫提供資金、參與提供數據存儲庫或其組合，其中所述訪問是訪問來自其 中一名受試者、一名或多名受試者或全部受試者的臨床數據、概況數據或兩者；並允許利益 相關方取出來自其中一名受試者、一名或多名受試者或全部受試者的臨床數據、概況數據 或兩者，從而分發數據。在一些實施方案中，所述數據存儲庫可通過網際網路訪問。在一些實 施方案中，被取出的數據是所述數據的拷貝。在一些實施方案中，臨床數據包括患者報告的 數據、生命體徵、醫學圖像或其組合。在一些實施方案中，醫學圖像包括X-射線圖像、磁共 振圖像、計算機控制軸向斷層攝影圖像、正電子發射斷層攝影圖像、單光子發射計算斷層攝 影圖像、超聲圖像、螢光檢查圖像、熱成像圖像、閃爍照相圖像、放射性同位素圖像、光聲圖 像或其組合。在一些實施方案中，概況數據包括多核苷酸序列、多肽序列、mRNA表達水平、 蛋白質表達水平、細胞形態、核型、腫瘤大小、腫瘤密度或其組合。在一些實施方案中，所述 分析包括多核苷酸、多肽、細胞、組織或其組合的分析。在一些實施方案中，所述參與包括招 募至少一名所述受試者、採集臨床數據、採集至少一個所述生物標本，分析至少一個所述生 物標本或其組合。在一些實施方案中，授權利益相關方在第一段時間進行訪問。在一些實 施方案中，所述利益相關方包括營利性企業。在一些實施方案中，所述支持是為所述提供數 據存儲庫提供資金。在一些實施方案中，授權第二利益相關方在第二段時間進行訪問。在 一些實施方案中，所述第二段時間接著所述第一段時間開始。在一些實施方案中，所述支持 是參與提供所述數據存儲庫。一些實施方案進一步包括授權任何人在一段時間之後進行訪 問。在一些實施方案中，所述臨床和概況數據作為縱向研究的一部分採集，其中所述生物樣 品和/或臨床數據在兩個或多個時間點採集。在一些實施方案中，所述兩個或多個時間點 包含治療過程開始前的一個或多個時間點、治療過程中的一個或以上的時間點、治療過程 後的一個或多個時間點、復發事件後的一個或多個時間點或其組合。在一些實施方案中，在 兩個或多個時間點採集的臨床數據用於評價治療結果。在一些實施方案中，所述治療結果 和概況數據用於鑑定預後或治療診斷指標。
[0009] 本文還公開了進行縱向研究（longitudinal research study)的方法，其包括：招 募一名或多名受試者，其中所述一名或多名受試者被診斷出患有疾病；在一個或多個時間 點從所述一名或多名受試者中的每一名中採集一個或多個生物樣品；分析至少一個所述生 物樣品的一部分，以生成所述一名或多名受試者中的每一名的概況；在兩個或多個時間點 從所述一名或多名受試者的每一名中採集臨床數據；和將所述臨床數據與所述概況進行關 聯，以鑑定預後或治療診斷指標，由此進行縱向研究。一些實施方案進一步包括將所述臨床 數據和概況存儲在數據存儲庫中。一些實施方案進一步包括授權利益相關方在第一段時間 訪問數據存儲庫以換取其支持，其中，所述支持包括提供資金、參與和/或其組合。在一些 實施方案中，所述一個或多個生物樣品是在所述疾病的治療過程開始前從一名或多名受試 者中採集的。在一些實施方案中，所述兩個或多個時間點包含所述疾病的治療過程開始前 的一個或多個時間點、所述疾病的治療過程中的一個或多個時間點、所述疾病的治療過程 之後的一個或多個時間點、所述疾病復發後的一個或多個時間點或其組合。在一些實施方 案中，利用計算機可執行代碼進行所述關聯。
[0010] 榜引併入
[0011] 本說明書中提及的所有出版物、專利和專利申請均通過引用而以相同程度併入本 文，猶如特別地且單獨地指出每個單獨的出版物、專利和專利申請通過引用而併入。

【專利附圖】

【附圖說明】
[0012] 隨附的權利要求書中詳細描述了本發明的新特徵。通過參考描述採用了本發明原 理的說明性實施方案的下列詳細說明和附圖，可以更好地理解本發明的特徵和優點，其中 附圖如下：
[0013] 圖1顯示了信息技術平臺（Information Technology Platform)的一個實施方案 的概覽：縱向列代表用戶網站，其中方框中的文本包含了主要功能組件；站點下方的組件 代表資料庫、分析流水線以及數據輸入/輸出；組件之間的標記代表數據流。
[0014] 圖2顯不了觀察性研究平臺（Observational Study Platform)的邏輯架構圖。
[0015] 圖3顯示了社區門戶（Community Portal)的邏輯架構圖。
[0016] 圖4顯示了患者數據存儲庫（Patient Data Repository)中的數據整合。
[0017] 圖5顯示了患者數據存儲庫的邏輯架構圖。
[0018] 圖6顯示了研究者門戶（Researcher Portal)的邏輯架構圖。
[0019] 圖7顯示了傳入數據處理器（Incoming Data Processor)的邏輯架構圖。
[0020] 圖8顯示了 BioBank -獨立實驗室的邏輯架構圖。
[0021] 圖9顯示了個人健康記錄的邏輯架構圖。
[0022] 圖10顯示了數據訪問的訪問層和時間線。
[0023] 圖11 (A和B)顯示了示例性數據採集日程。
[0024] 圖12顯示了研究組件的示例性組織結構。
[0025] 發明詳沭
[0026] -方面，本文公開了進行研究、提供資金並進行研究以及採集和/或分發研究數 據的方法。所述研究可包括縱向研究以支持疾病研究、促進藥物開發和/或提高治療功效。 可以包括在本文所公開的方法中的一個特徵是構建集中的患者資料庫("患者數據存儲庫" 和組織樣品存儲庫("BioBank")）。所述患者數據存儲庫可包含，例如臨床數據和分子數據， 其連同BioBank -起可用於支持個性化藥物研究與開發。本文所公開的方法可支持不同組 利益相關方之間的合作，所述利益相關方包括患者和患者組、社區衛生服務提供者(例如， 社區醫療中心、免費診所、醫院等)、工業開發商(例如，營利性企業，例如，製藥和生物技術 公司）、學術研究者(例如，學術醫療中心、教學醫院、研究機構、大學等）和支付方(例如，保 險公司）。本文所公開的方法可以通過分層的數據訪問系統推動利益相關方參與，通過該系 統可以基於參與水平(例如，供資水平、患者招募水平等）授權對研究過程中所採集的患者 數據和樣品的早期、非競爭性訪問。提出多發性骨髓瘤作為與本文所公開的方法相關的示 例性疾病，但是，這並非意在將本文所公開的方法限定到任何特定的實施方案。
[0027] 本文公開了一種個性化的醫療計劃（personalized medicineinitiative)，其中， 新診斷出的患者可通過一個或多個國家的一個或多個招募點(例如，醫院、學術醫療中心和 其他社區衛生服務中心）被招募。臨床數據和/或生物樣品(例如，組織樣品，如血液和骨 髓樣品）可以在其治療過程中的一個或多個時間點從所述患者中取得。所述一個或多個 時間點可以是在治療前、治療過程中、治療後、復發後或其組合。針對每名患者的醫護標準 (例如，藥物和治療）可由患者的私人醫生確定。所述醫護標準可以包括試驗性的或已知的 治療。在一個實施方案中，僅使用獲批准的治療(例如，藥物)。所採集的生物樣品可置於 BioBank中。可以對所採集的全部或部分樣品或樣品亞組進行實驗室檢測以生成關於所招 募的受試者或患者的全部或亞組的分子和/或基因組概況。在一個實施方案中，由無關的、 第三方非營利性生物醫藥研究機構進行所述實驗室檢測。
[0028] 所述研究的目的可以如下："此縱向研究的目標在於鑑定由分子概況分析和臨床 特徵所定義的患者亞組和表型。這些概況將能允許更好地理解疾病機理、藥物反應和患者 疾病復發。最後，此研究意在推動在多發性骨髓瘤中成功的藥物開發和患者醫護"。基本來 說，個性化藥物方式著眼於個人遺傳構成（genetic makeup),並可以允許醫生基於患者的 遺傳信息，在適當的時機，採用適當的劑量對適當的患者給予適當的藥物。換言之，所述研 究的最終目的可以是基於患者的基因組數據提出針對疾病（例如，多發性骨髓瘤）的醫護模 式標準。該研究可用於鑑定預後和/或治療診斷指標。預後指標可以包括預測疾病的可能 結果(例如，預期的腫瘤生長速率、預期壽命等等)的因素(例如，生物標記、遺傳標記等)。治 療診斷指標可以包括預測可能的治療結果(例如，預期的副作用、預期的治癒率、預期的緩 解率等等）的因素(例如，生物標記、遺傳標記等)。
[0029] 一旦已經採集了一定數量(例如，約1至約500,例如，約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、 15、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90、100、125、150、175、200、250、300、400、500 或更多）的 患者信息，並且由第三方所進行的實驗室檢測生成了基因組數據，便可將所採集的分子和/ 或基因組數據和臨床數據放入一個大資料庫中（例如，包括分子和/或基因組數據以及臨 床數據的資料庫）患者數據存儲庫")。隨後研究者即可通過網際網路訪問所述患者數據存 儲庫。
[0030] 本文中所用的術語"約"意指在所述值的+或-10%範圍的值。例如，術語"約100" 意指涵蓋90至110。除非另有說明，所有列舉的數字均應如同前面加有術語"約"一樣地解 釋。
[0031] 每次分析新的裡程碑數量(例如，約50、100、150、200等)的患者生物樣品並得出分 子和/或基因組信息後，即可將此類信息連同相關患者的臨床數據一起發布到患者數據存 儲庫中，並可授權一組或多組利益相關方(例如，研究者）訪問。
[0032] 在患者數據存儲庫中所採集的分子和/或基因組數據以及臨床數據的公開也可 以是依賴於時間的。例如，可以大約每1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17或 18個月使未公開的分子和/或基因組數據以及臨床數據可訪問（例如，發布或公開)。在一 個實施方案中，可以每6個月使未公開的基因組和/或臨床數據可訪問。
[0033] 對發布在患者數據存儲庫上的信息的訪問可如下進行：在任何信息發布到患者數 據存儲庫後，一組利益相關方(例如，項目方（theprogram)，來自領先的學術醫療中心的多 發性骨髓瘤研究中的某些主要研究者，將患者招募到研究中的某些招募點(例如，主招募點 (high enrollment sites),某些製藥和生物技術公司，或其組合)可被授權在每次信息發布 後的第一段時間(例如，約1個月至約12個月，例如，1-12個月、1-9個月、1-6個月、1-3個 月、3-12 個月、3-9 個月、3-6 個月、6-12 個月、6-9 個月，例如，約 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11 或12個月）訪問所述信息。在一個實施方案中，所述第一段時間是5個月。每個利益相關 方均有權在所述第一段時間期間和/或到期後(例如，在科學期刊中、在專著中等等)發表他 們的發現。或者，發表其發現的權力可以不受限制。
[0034] 在任何信息發布後的第一段時間之後，參與所述研究但還無法訪問患者數據存儲 庫中的所述信息發布的第二組利益相關方(例如，研究者、招募點、醫療研究中心、非營利性 研究中心、製藥公司、生物技術公司或其組合）可被授權在第二段時間訪問。所述第二組利 益相關方有權在所述第二段時間期間或之後發表其發現。所述第二段時間可以是，例如，約 1個月至約12個月，例如，1-12個月、1-9個月、1-6個月、1-3個月、3-12個月、3-9個月、3-6 個月、6-12個月、6-9個月，例如，約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12個月。在一個實施方 案中，所述第二段時間可以是1個月。在任何發布後的第二段時間結束時，任何感興趣的公 眾即可獲得該次發布所包含的信息，用於研究、教學和出版。
[0035] 該研究的啟動資金可來自若干製藥和生物技術公司。在一個實施方案中，這些公 司將沒有對於方案設計、誰能訪問發布到患者數據存儲庫的信息、發布到患者數據存儲庫 的信息內容或者誰可以使用患者組織的決策權。招募點的選擇可由項目方、非營利性機構 或非營利性研究機構自行決定。科學方面的決定可由科學顧問委員會作出。所述科學顧問 委員會可包括非企業科學家和研究者。所述科學顧問委員會可包括非營利性機構、非營利 性研究機構或其成員。
[0036] 所述研究中來自患者的生物樣品可被已經訪問了患者數據存儲庫的利益相關方 獲取。在一個實施方案中，可以授權直接參與所述研究、並能最高效且最有效地結合發布在 患者數據存儲庫中的信息使用樣品的利益相關方考慮進一步的疾病治癒(例如，多發性骨 髓瘤)。對生物樣品的使用無需限制於已獲準訪問患者數據存儲庫的利益相關方。例如，可 授權任何人使用生物樣品。在一個實施方案中，對生物樣品的使用由組織使用委員會決定。
[0037] 疾病
[0038] 許多疾病可以根據本文所公開的方法很好地進行研究。一種這樣的疾病是多發性 骨髓瘤。
[0039] 多發件骨髓瘤
[0040] 多發性骨髓瘤可以是血液系統的(血液）癌症。其可能是僅次於非霍奇金淋巴瘤 的第二常見的血液癌症。美國癌症協會（AmericanCancer Society)估計2010年診斷出 20, 180例多發性骨髓瘤新增病例。在特定時間報導的骨髓瘤病例數(患病率)可根據性別、 年齡以及種族/民族而不同。例如，多發性骨髓瘤可佔白人個體中的所有癌症的大約1%，佔 黑人中的所有癌症的2%。多發性骨髓瘤在男性中比在女性中更為常見，並且隨著年齡的增 加可能發生得更加頻繁。
[0041] 多發性骨髓瘤可能在骨髓中發生；特別是在具有最多活動的骨髓(例如，脊柱、盆 骨、肋骨、肩胛或髖骨中的骨髓)中。骨髓瘤可能主要影響漿細胞，漿細胞可以是產生有助於 對抗感染和疾病的免疫球蛋白（抗體）的細胞。在多發性骨髓瘤中，正常的漿細胞轉化成為 惡性骨髓瘤細胞，並可產生大量被稱為單克隆（M)蛋白的異常免疫球蛋白。所述惡性細胞還 可以排擠並抑制骨髓中正常血細胞和抗體的產生。此外，骨髓瘤細胞群體可能導致骨髓中 的其他細胞去除骨的固體部分，並且可能在骨中導致軟性斑產生。這些亦可稱作溶骨性病 變的軟性斑以及其他骨丟失體徵是常見的，儘管它們並非出現於所有患骨髓瘤的個體中。 [0042] 骨髓瘤的發展
[0043] 漿細胞可自B淋巴細胞（B細胞）--一種白細胞--發育而來。
[0044] 通常，B細胞可佔骨髓中所有細胞的大約5%。漿細胞的發育主要可發生在骨髓以 外的淋巴結中。
[0045] 由B細胞/漿細胞向骨髓瘤細胞的轉化可能是多階段的過程。早期，骨髓瘤細胞 可附著於骨髓的基質(支持)細胞。所附著的細胞可產生細胞因子和生長因子(例如，白細胞 介素6(IL-6)、白細胞介素1β (IL-Ιβ)、腫瘤壞死因子β (TNF-β)、血管內皮生長因子 (VEGF)等)。所述細胞因子可以在骨髓內創造一種微環境，該微環境有助於骨髓瘤細胞的不 受控制的生長，並通過被稱為破骨細胞的細胞刺激骨骼的分解，破骨細胞可能是溶骨性病 變發展的一種促進因子。VEGF之類的生長因子可刺激血管發生(血管生長)，血管發生可為 新生腫瘤提供氧和營養物質供其繼續生長。
[0046] 當漿細胞變為惡性後，它們可通過迅速分裂而失控地生長。很快就可能有過多的 惡性細胞，它們開始排擠骨髓中的正常細胞。惡性細胞能侵襲骨骼堅硬的外部，然後擴散至 體內大骨骼的腔內並形成腫瘤。當只形成了一個腫瘤時，其可被稱為孤立性漿細胞瘤。當 形成多個小腫瘤時，該疾病可被稱為多發性骨髓瘤。
[0047] 血液中高水平的Μ蛋白可能是骨髓瘤的一個特徵。骨髓瘤細胞可以彼此完全相 同，並可以產生大量相同的特異性Μ蛋白（例如，IgG或IgA)。這種異常免疫球蛋白不具有 任何已知的對身體的益處，並且隨著Μ蛋白量的增加，其可排擠功能正常的免疫球蛋白。結 果，在患有多發性骨髓瘤的個體中，正常的免疫球蛋白的水平可能較低。骨髓瘤的特徵可能 在於其所產生的Μ蛋白的類型。
[0048] 發病率
[0049] 基於從北美中央癌症登記協會（North American Association ofCentral Cancer Registries，NAACCR)獲得的從1995年到2006年的數據，估計2010年將有20, 180例多發 性骨髓瘤新病例，男性為11，170例，女性為9, 010例；NAACCR代表了約89%的美國人口。多 發性骨髓瘤的發病率隨年齡增長而提高，通常以超過20%的發生率出現在55歲及以上的人 群中；2003-2007年期間，65歲以下的人群中經年齡調整的發病率為2. 1/100, 000,與之相 t匕，65歲或以上的人群中的發病率為29. 8/100, 000。2004-2008年，經年齡調整的總發病率 為5. 7/100, 000/年；男性中經年齡調整的發病率（7. 2/100, 000)高於女性（4. 6/100, 000)。 1999到2008年，骨髓瘤的經年齡調整的發病率年度百分比變化（APC)為-0. 3%，其在女 性中的下降（_〇. 4%)較之男性（-0. 2%)更高；儘管負號表示出下降的趨勢，但是由於這些 APC估值與0之間並沒有顯著差異，所以此趨勢應解釋為穩定。當合併兩種性別時，僅就 2003-2007年期間黑人患者中經年齡調整的發病率（11. 7/100,000)而言，多發性骨髓瘤 處於排名前15位的癌症之中。在男性中，就合併的所有種族/民族而言，骨髓瘤處於排名 前15位的癌症之中，並且對於白人（6. 7/100, 000)、黑人（14. 3/100, 000)、亞洲人/太平 洋群島居民（4. 0/100, 000)、美洲印第安人/阿拉斯加原住民（4. 8/100, 000)和西班牙裔 (6. 3/100, 000)而言，其也保持在前15位。對於女性，僅在黑人患者中，骨髓瘤的發病率包 含在前15位的癌症之內（11. 7/100, 000)。儘管這些估值與0沒有顯著不同，但相比於黑人 患者的APC為0. 4,白人患者的APC為-0. 4%。
[0050] 患病率
[0051] 2008年1月1日，美國所估計的骨髓瘤患病率為64, 615例；在男性中的患病率 (35, 445例）較之女性（29, 170例）更高，且在兩種性別中均隨年齡的增長而升高。經年齡 調整的患病率在黑人中比在白人中更高。
[0052] 死亡率
[0053] 基於 1969-2007 年美國死亡率數據（US Mortality Datal969-2007)，估計 在2010年因骨髓瘤死亡的總數為10, 650例；所估計的死亡數在男性和女性中分別為 5, 760例和4, 890例。2003-2007年期間，就經年齡調整的死亡率而言，在合併的所有種 族中（3. 6/100, 000)以及在白人（3. 3/100, 000)、黑人（6. 7/100, 000)、亞洲人/太平洋 群島居民（1. 7/100, 000)、美洲印第安人/阿拉斯加原住民（3. 5/100, 000)和西班牙裔 (2. 9/100, 000)中，骨髓瘤處於排名前15位的癌症之中。就經年齡調整的死亡率而言， 對於合併的所有種族以及針對每個單獨的種族/民族人群，對於男性和女性，骨髓瘤仍處 於排名前15位的癌症之中，其中對於黑人男性（8. 1/100,000)和女性（5. 8/100,000)報 道了最高的死亡率。從1998年到2007年，經年齡調整的骨髓瘤死亡率年度百分比變化 是-1. 3% ;這一趨勢與0之間存在顯著差異（p〈0. 05)，表明在這一時間段內死亡率確有下 降。據報導，在女性中的下降幅度（-1.8%)高於男性（-1.0%)。在全部的種族/民族人群 中均注意到死亡率下降，但並非都與0之間存在顯著差異。可以預計，考慮到偶發病例的 年齡分布，骨髓瘤所導致的死亡隨年齡的增長而升高；在2003年到2007年期間，經年齡 調整的死亡率對於65歲以下的人群為0.9/100, 000,而與之相比，65歲或以上的人群是 22. 0/100,000 ;因骨髓瘤所導致的死亡者的年齡中值為75歲。2003年到2007年期間，在 美國經年齡調整的、因骨髓瘤導致的死亡率最高的五個州是：阿拉巴馬州（4. 3/100, 000)、 南卡羅來納州（4. 31/100, 000)、田納西州（4. 15/100, 000)、北卡羅來納州（4. 13/100, 000) 和路易斯安那州（4. 08/100, 000);華盛頓特區具有最高的死亡率，為5. 08/100, 000。死亡 率最低的五個州包括佛羅裡達州（3. 09/100, 000)、亞利桑那州（3. 09/100, 000)、阿拉斯加 州（2. 90/100, 000)、內華達州（2. 87/100, 000)和夏威夷州（2. 39/100, 000)。
[0054] 存活率
[0055] 從1975年到2006年，一年存活率一直穩定在69%到74%的範圍內。然而，骨髓瘤 患者的五年相對存活率由1950-1954年間的6%升高到2001-2007年間的約41. 5% ;相對存 活率近似於患者在給定的時間段內不會死於所診斷出的癌症的機率。經年齡調整的5年相 對存活率在男性中（40. 6%)略高於女性（38. 6%)，但是在白人和黑人患者之間差異不大(對 於白人和黑人約為39%)。在作出診斷時，大多數（95%)的病例已被分期為遠離原發部位(癌 症已經轉移)，其餘的病例（5%)被分期為局部化的（限於原發部位）;這一分期分布在男性與 女性以及白人與黑人之間具有很小的差異。具有局部化疾病的患者的5年相對存活率為 70. 6%，與之相比，處於遠離原發部位的分期的患者的5年相對存活率僅為36. 4%。在男性與 女性以及白人與黑人之間，處於遠離原發部位的分期的患者的5年相對存活率相似。在具 有局部化疾病的患者中，男性的5年相對存活率高於女性，白人高於黑人。
[0056] 病因和風險因素
[0057] 還沒有鑑定出骨髓瘤的單一病因，而風險因素表明多發性骨髓瘤可能起因於數種 因素的綜合作用。多發性骨髓瘤可能與免疫系統功能下降、特定職業、暴露於某些化學品和 /或暴露於輻射相關。例如，在務農者、石油工人、皮革工業的工人和/或美容師中患多發性 骨髓瘤的可能性高於平均水平。暴露於除草劑、殺蟲劑、石油產品、重金屬、塑料和包括石棉 在內的各種粉塵也可能是該病的風險因素。但是，多發性骨髓瘤也可能發生在沒有已知風 險因素的個體中。
[0058] 多發性骨髓瘤的發生也可涉及遺傳因素；但是一個家庭中的一個以上成員患骨髓 瘤的情況並不常見，這提示潛在的遺傳學可能是複雜的。非洲血統者中該疾病的家族性高 發和較高發病率可能提示多發性骨髓瘤的遺傳因素，具有可能的常染色體顯性遺傳方式。 在某些家族中高發B細胞血液惡性腫瘤也提示可能的遺傳因素。
[0059] 利用靈敏的試驗，例如螢光原位雜交（FISH)，已在幾乎所有的多發性骨髓瘤患者 中檢測出遺傳學異常；在約33-52%的患者中發現染色體13異常。在Kyle等人的綜述 (Immunol Rev. (2003)Aug; 194:112-39)中，1027名患者中的42%有惡性腫瘤家族史，包括 6%為血液惡性腫瘤，2%為骨髓瘤。對家族性骨髓瘤的遺傳學基礎知之甚少。許多流行病學 研究已經提出了與骨髓瘤的多種可能的相關性，但是這些研究通常較小或者受到批評。明 確的骨髓瘤風險因素僅有年齡增長、黑人種族、男性、淋巴樣惡性腫瘤家族史以及意義未定 的單克隆丙種球蛋白病（MGUS)的診斷。
[0060] 多發性骨髓瘤最有意義的風險因素可能是年齡，因為96%的病例是在45歲以上的 人群中診斷出來的，而75%以上的病例是在70歲以上的人群中診斷出來的。因此可以認為， 伴隨著衰老過程，骨髓瘤易感性可能增高。
[0061] 骨髓瘤對身體的影響
[0062] 多發性骨髓瘤的主要影響可能是對骨的影響。也可影響血液和腎臟。
[0063] 量
[0064] 骨髓瘤細胞引起的損壞能夠以兩種方式導致骨丟失。首先，細胞可聚集在一起在 骨髓中形成團塊，該團塊能夠破壞周圍骨骼的正常結構。其次，骨髓瘤細胞可分泌能夠幹擾 正常的骨修復和生長過程的物質(例如，細胞因子)。骨骼可以被稱作破骨細胞和成骨細胞 的細胞不斷地分解和修復。正常情況下，成骨細胞的骨構建和破骨細胞的骨破壞之間存在 一種平衡；但是骨髓瘤分泌的細胞因子能刺激破骨細胞的發育，打破這一平衡。在患有骨 髓瘤的個體中，骨結構的損壞可能導致軟性斑或者溶骨性病變。這些軟性斑能夠以"洞"的 形式出現在標準骨骼X-光片中。這些病變能使得骨弱化，引發疼痛，並且提高骨折的風險。 受到影響的骨骼可包括脊柱、骨盆和肋廓。在多發性骨髓瘤中可見的骨分解增多可以使血 流中的鈣水平升高，這種狀況被稱為高鈣血症，其可能與多發性骨髓瘤的一些症狀相關。
[0065] 血液
[0066] 漿細胞的不受控制的生長可引起其他血細胞類型的相應減少，並且可以導致許多 繼發病症/症狀的發生。白細胞數的減少(一種被稱為白細胞減少症的狀況)可提1?感染的 風險。紅細胞水平的下降會造成貧血。血小板的減少(被稱作血小板減少症)可阻止正常的 凝血，可使個體容易形成淤傷。此外，高水平的Μ蛋白和輕鏈(本周蛋白)可排擠功能正常的 免疫球蛋白，並且可使血液"稠化"，從而引起其他症狀。
[0067] 置髒
[0068] 血液中過量的Μ蛋白和鈣可使腎臟在過濾血液時負荷過度。產生的尿量會增多， 腎臟會無法正常地發揮功能。可能由骨再吸收增多所引起的高鈣血症也可促進多發性骨髓 瘤患者的腎衰竭。
[0069] 症狀/臨床表現
[0070] 早期多發性骨髓瘤可能是無症狀的。隨著病情進展，患者會表現出一些主要和次 要症狀。示例性的症狀可見表1。
[0071] 表1.與多發性骨髓瘤相關的症狀及其原因
[0072]

【權利要求】
1. 一種研究方法，其包括： 招募一名或多名受試者，其中，至少一名所述受試者被診斷出患有疾病； 從至少一名所述受試者採集一個或多個生物樣品和臨床數據； 分析至少一個所述生物樣品的一部分以生成至少一名所述受試者的概況； 將所述臨床數據和概況存儲在數據存儲庫中；和 授權利益相關方在第一段時間訪問數據存儲庫以換取其支持，其中，所述支持包括提 供資金、參與和/或其組合，並由此進行研究。
2. 權利要求1的方法，其中，所述招募在一個或多個招募點進行。
3. 權利要求2的方法，其中，所述招募點包括醫院、學術醫療中心、社區衛生服務中心、 政府機構、政府資助的醫療中心和/或其組合。
4. 權利要求2的方法，其中，所述招募點由科學顧問委員會選擇。
5. 權利要求4的方法，其中，所述科學顧問委員會包括非營利性機構或其成員、非營利 性研究者、學術研究者或其組合。
6. 權利要求1的方法，其中，每名受試者均被診斷出患有所述疾病。
7. 權利要求1的方法，其中，至少一名所述受試者新被診斷出患有所述疾病。
8. 權利要求1的方法，其中，每名受試者均新被診斷出患有所述疾病。
9. 權利要求1的方法，其中，所述疾病是癌症。
10. 權利要求1的方法，其中，所述疾病是骨髓瘤。
11. 權利要求1的方法，其中，所述疾病是多發性骨髓瘤。
12. 權利要求1的方法，其中，所述疾病是骨病。
13. 權利要求1的方法，其進一步包括從每名受試者採集生物樣品和臨床數據。
14. 權利要求1的方法，其中，至少一個所述生物樣品包括血液樣品、血漿樣品、骨髓樣 品、骨髓抽吸物、毛髮樣品、尿液樣品、糞便樣品、呼吸樣品、皮膚樣品、細針抽吸物、組織活 檢、脊髓液樣品、淚液樣品、黏液樣品、羊水樣品、精液樣品、組織樣品或其組合。
15. 權利要求1的方法、其中，所述生物樣品包括血液樣品和骨髓樣品。
16. 權利要求1的方法，其中，所述臨床數據包括患者報告的數據、生命體徵、醫學圖像 和/或其組合。
17. 權利要求16的方法，其中，所述醫學圖像包括X-射線圖像、磁共振圖像、計算機 控制軸向斷層攝影圖像、正電子發射斷層攝影圖像、單光子發射計算斷層攝影圖像、超聲圖 像、螢光檢查圖像、熱成像圖像、閃爍照相圖像、放射性同位素圖像、光聲圖像和/或其組 合。
18. 權利要求1的方法，其中，所述生物樣品和臨床數據在貫穿所述疾病治療的全過程 中採集。
19. 權利要求18的方法，其中，所述採集在第一次治療之前進行。
20. 權利要求18的方法，其中，所述採集在治療過程中的治療之前、同時或之後進行。
21. 權利要求18的方法，其中，所述採集在治療過程中的每次治療之前、同時或之後進 行。
22. 權利要求18的方法，其中，所述採集在治療過程之後進行。
23. 權利要求18的方法，其中，所述採集在所述疾病復發之後進行。
24. 權利要求18的方法，其中，所述疾病的治療過程是針對每名受試者單獨確定的。
25. 權利要求24的方法，其中，所述治療過程由私人醫生確定。
26. 權利要求18的方法，其中，所述疾病的治療過程不使用試驗性藥物。
27. 權利要求18的方法，其中，所述治療過程包括具有針對所述疾病的標示適應症的 藥物。
28. 權利要求18的方法，其中，所述治療過程包括具有針對所述疾病的標示外適應症 的藥物。
29. 權利要求1的方法，其進一步包括分析每個生物樣品的一部分，以生成從中採集了 所述生物樣品的每名受試者的概況。
30. 權利要求1的方法，其中，所述分析由第三方機構進行。
31. 權利要求30的方法，其中，所述第三方機構是非營利性機構、營利性機構、生物醫 學研究所、醫院、製藥公司、生物技術公司、實驗室或其組合。
32. 權利要求1的方法，其中，所述分析包括對多核苷酸、多肽、細胞、組織或其組合的 分析。
33. 權利要求1的方法，其中，所述分析包括利用鏈終止法、染料終止劑法、雜交測序 法、合成測序法或者基於高解析度顯微術的技術，對一個或多個多核苷酸進行的測序。
34. 權利要求1的方法，其中，所述概況包含多核苷酸序列、多肽序列、mRNA表達水平、 蛋白質表達水平、細胞形態、核型、腫瘤大小、腫瘤密度或其組合。
35. 權利要求1的方法，其中，所述數據存儲庫可通過網際網路訪問。
36. 權利要求35的方法，其中，所述數據存儲庫可通過研究者門戶訪問。
37. 權利要求36的方法，其中，所述研究者門戶是網頁界面，其允許對數據進行檢索、 整理、歸類、總結、下載和/或分析。
38. 權利要求1的方法，其中，所述利益相關方包括營利性企業。
39. 權利要求38的方法，其中，所述支持是提供資金。
40. 權利要求1的方法，其中，所述利益相關方包括至少一個所述招募點。
41. 權利要求40的方法，其中，所述支持是參與。
42. 權利要求1的方法，其中，所述第一段時間為約1個月到約3年。
43. 權利要求1的方法，其中，所述第一段時間為約5個月、約6個月或約9個月。
44. 權利要求1的方法，其進一步包括將數據存儲庫訪問擴展至第二利益相關方，持續 第二段時間。
45. 權利要求44的方法，其中，所述第二利益相關方包括所述一個招募點中的至少一 個。
46. 權利要求44的方法，其中，所述支持是參與。
47. 權利要求44的方法，其中，所述第二段時間接著所述第一段時間開始。
48. 權利要求44的方法，其中，所述第二段時間為約1個月至約2年。
49. 權利要求44的方法，其中，所述第二段時間為約1個月或約3個月。
50. 權利要求1的方法，其進一步包括授權任何人在所述第一段時間之後訪問數據存 儲庫。
51. 權利要求44的方法，其進一步包括授權任何人在所述第二段時間之後訪問數據存 儲庫。
52. 權利要求1的方法，其進一步包括將生物樣品儲存在組織庫中。
53. 權利要求52的方法，其中，所述組織庫同患者數據存儲庫一起被授權訪問。
54. 權利要求52的方法，其中，由組織庫應用委員會授權對所述組織庫的訪問。
55. 權利要求1的方法，其中所述研究是縱向研究的一部分，並且其中生物樣品和/或 臨床數據是在兩個或更多個時間點採集的。
56. 權利要求55的方法，其中，所述兩個或更多個時間點包含在治療過程開始前的一 個或多個時間點、治療過程中的一個或多個時間點、治療過程後的一個或多個時間點、復發 事件後的一個或多個時間點，或其組合。
57. 權利要求55的方法，其中，在兩個或更多個時間點採集的臨床數據用於評價治療 結果。
58. 權利要求57的方法，其中，所述治療結果和概況用於鑑定預後或治療診斷指標。
59. -種分發數據的方法，其包括： 提供數據存儲庫，其中，所述數據存儲庫包含： (i) 從一名或多名受試者採集的臨床數據，其中，至少一名所述受試者被診斷出患有疾 病， (ii) 概況數據，其中，所述概況數據通過分析從至少一名所述受試者採集的一個或多 個生物樣品而生成； 授權利益相關方訪問數據存儲庫以換取支持，其中，所述支持是為所述提供數據存儲 庫提供資金、參與提供數據存儲庫或其組合，其中，所述訪問是訪問來自一名受試者、一名 或多名受試者或者全部受試者的臨床數據、概況數據或兩者；和 允許利益相關方取出來自一名受試者、一名或多名受試者或者全部受試者的臨床數 據、概況數據或兩者，從而分發數據。
60. 權利要求59的方法，其中，所述數據存儲庫可通過網際網路訪問。
61. 權利要求59的方法，其中，被取出的數據是所述數據的拷貝。
62. 權利要求59的方法，其中，所述臨床數據包括患者報告的數據、生命體徵、醫學圖 像或其組合。
63. 權利要求59的方法，其中，醫學圖像包括X-射線圖像、磁共振圖像、計算機控制軸 向斷層攝影圖像、正電子發射斷層攝影圖像、單光子發射計算斷層攝影圖像、超聲圖像、熒 光檢查圖像、熱成像圖像、閃爍照相圖像、放射性同位素圖像、光聲圖像或其組合。
64. 權利要求59的方法，其中，所述概況數據包括多核苷酸序列、多肽序列、mRNA表達 水平、蛋白質表達水平、細胞形態、核型、腫瘤大小、腫瘤密度或其組合。
65. 權利要求59的方法，其中，所述分析包括對多核苷酸、多肽、細胞、組織或其組合的 分析。
66. 權利要求59的方法，其中，所述參與包括招募至少一名所述受試者、採集臨床數 據、採集至少一個所述生物標本、分析至少一個所述生物標本或其組合。
67. 權利要求59的方法，其中，授權利益相關方在第一段時間進行訪問。
68. 權利要求59的方法，其中，所述利益相關方包括營利性企業。
69. 權利要求59的方法，其中，所述支持是為所述提供數據存儲庫提供資金。
70. 權利要求67的方法，其中，授權第二利益相關方在第二段時間進行訪問。
71. 權利要求70的方法，其中，所述第二段時間接著所述第一段時間開始。
72. 權利要求70的方法，其中，所述支持是參與提供所述數據存儲庫。
73. 權利要求59的方法，其進一步包括授權任何人在一段時間之後進行訪問。
74. 權利要求59的方法，其中，所述臨床和概況數據作為縱向研究的一部分採集，其 中，所述生物樣品和/或臨床數據在兩個或更多個時間點採集。
75. 權利要求74的方法，其中，所述兩個或更多個時間點包括在治療過程開始前的一 個或多個時間點、治療過程中的一個或多個時間點、治療過程後的一個或多個時間點、復發 事件後的一個或多個時間點，或其組合。
76. 權利要求74的方法，其中，在兩個或更多個時間點採集的臨床數據用於評價治療 結果。
77. 權利要求76的方法，其中，所述治療結果和概況數據用於鑑定預後或治療診斷指 標。
78. -種進行縱向研究的方法，其包括： 招募一名或多名受試者，其中，所述一名或多名受試者被診斷出患有疾病； 在一個或多個時間點從所述一名或多名受試者中的每一名中採集一個或多個生物樣 品； 分析至少一個所述生物樣品的一部分，以生成所述一名或多名受試者中的每一名的概 況； 在兩個或更多個時間點從所述一名或多名受試者中的每一名中採集臨床數據；和 將所述臨床數據和所述概況進行關聯，以鑑定預後或治療診斷指標，由此進行縱向研 究。
79. 權利要求78的方法，其進一步包括將所述臨床數據和概況存儲在數據存儲庫中。
80. 權利要求79的方法，其進一步包括授權利益相關方在第一段時間訪問數據存儲庫 以換取其支持，其中，所述支持包括提供資金、參與和/或其組合。
81. 權利要求78的方法，其中，所述一個或多個生物樣品是在所述疾病的治療過程開 始前從一名或多名受試者中採集的。
82. 權利要求78的方法，其中，所述兩個或更多個時間點包含在所述疾病的治療過程 開始前的一個或多個時間點、在所述疾病的治療過程中的一個或多個時間點、在所述疾病 的治療過程之後的一個或多個時間點、在所述疾病復發後的一個或多個時間點，或其組合。
83. 權利要求78的方法，其中，利用計算機可執行代碼進行所述關聯。
【文檔編號】G06Q50/24GK104126191SQ201280044704
【公開日】2014年10月29日 申請日期:2012年7月11日 優先權日:2011年7月13日
【發明者】卡斯裡恩·E·朱斯蒂, 沃爾特·卡波尼, 路易斯·珀金斯 申請人:多發性骨髓瘤研究基金會公司