一種用於健康風險評估的飛行質譜生物晶片及其檢測方法
2023-07-21 11:58:51
專利名稱：一種用於健康風險評估的飛行質譜生物晶片及其檢測方法
技術領域：
本發明涉及一種用於健康風險評估的飛行質譜生物晶片及其檢測方法。
背景技術：
自20世紀以來，生命科學獲得了極大的發展，但是依然無法對個人的健康風險進行有效評估，從而無法在遺傳方面揭露患病風險高低而給予個性化的健康幹預。
發明內容
本發明提供了一種用於健康風險評估的飛行質譜生物晶片及其檢測方法。一種用於天賦潛質評估的飛行質譜生物晶片，包括樣品分析物和質譜晶片基質，所述樣品分析物與所述質譜晶片基質共結晶，所述樣品分析物包括用於天賦潛質評估的目的基因、PCR引物和單鹼基延伸引物，所述目的基因對應的SNP位點包括；rs2273535、rsl866813、 rsl056836、 rsl2304921、 rs2285053、 rs2165241、 rsll36450、 rs3024505、rsl800797、rs20417、rs608995、rs6025、rs2200733、rsl801133、rs3130340、rs2981582、rs2104286、rsl6890979、rs8055236、rsl801278、rs3794808、rs2648875、rsl219648、rs2279744、 rs2227956、 rs7530511、 rs41360247、 rsl6996148、 rsl0889677、 rs2976392、rsl061581、rs9264942、rs6700125、rsl82549、rsl800750、rs669、rs2395029、rsl0380、rsl260326、rs4655595、rs4420638、rs283413、rs2180439、rsl695、rsl051730、rs9465871、rs4988235、rs7923837、rs664143、rs403016。
一種所述的用於天賦潛質評估的飛行質譜生物晶片的檢測方法，包括如下步驟I)提取受檢者樣本DNA ;2)設計PCR引物及單鹼基延伸引物，所述PCR引物具有選自SEQID NO :1 SEQ ID NO : 390所示序列，所述單鹼基延伸引物選自SEQ IDNO :391 SEQ IDNO 585所不序列；3)對樣本DNA進行目的基因的PCR擴增和單喊基延伸形成樣品分析物，所述目的基因對應的 SNP 位點包括:rs2273535、rsl866813、rsl056836、rsl2304921、rs2285053、rs2165241、rsll36450、rs3024505、rsl800797、rs20417、rs608995、rs6025、rs2200733、 rsl801133、 rs3130340、 rs2981582、 rs2104286、 rsl6890979、 rs8055236、rsl801278、rs3794808、rs2648875、rsl219648、rs2279744、rs2227956、rs7530511,rs41360247、rsl6996148、rsl0889677、rs2976392、rsl06158U rs9264942、rs6700125、rsl82549、rsl800750、rs669、rs2395029、rsl0380、rsl260326、rs4655595、rs4420638、rs283413、rs2180439、rsl695、rsl051730、rs9465871、rs4988235、rs7923837、rs664143、rs403016 ；4)所述樣品分析物與質譜晶片基質共結晶，檢測目的基因的SNP位點。本發明通過上述技術方案帶來的有益效果包括解碼疾病的內因；做到疾病的早知道、早預防、早治療；避免人們盲目補充保健品；有效避免臨床誤診。
圖1是根據本發明的具體實施方式
中的步驟I的瓊脂糖凝膠電泳質檢結果圖；圖2是根據本發明的具體實施方式
中的步驟3的PCR產物片段化後的電泳檢測結果圖；圖3是根據本發明的具體實施方式
中的步驟7的檢測晶片結果圖。
具體實施例方式下列實施例中未註明具體條件的實驗方法，通常按常規條件，例如Sambrook等人，分子克隆:實驗室手冊(New York Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989)中所述條件，或按製造廠商所建議的條件。步驟I 提取受檢者樣本 DNA 使用 Wizard Genomic DNA purificationKit (Promega)或NucleoSpin Tissue (MN)提取組織、細胞血樣或口腔黏膜中的DNA,用分光光度計定量，瓊脂糖凝膠電泳質檢。質檢合格的DNA將濃度調整到50 n g/ml，-20°C儲存備用。步驟2設計PCR弓丨物及單鹼基延伸弓丨物針對SNP位點利用設計PCR弓丨物及單鹼基延伸引物(見表I)。表I
權利要求
1.一種用於天賦潛質評估的飛行質譜生物晶片，包括樣品分析物和質譜晶片基質，所述樣品分析物與所述質譜晶片基質共結晶，其特徵在於，所述樣品分析物包括用於天賦潛質評估的目的基因、PCR引物和單鹼基延伸引物，所述目的基因對應的SNP位點包括rs2273535、rsl866813、rsl056836、rsl2304921、rs2285053、rs2165241、rsll36450、rs3024505、rsl800797、rs20417、rs608995、rs6025、rs2200733、rsl801133、rs3130340、rs2981582、rs2104286、rsl6890979、rs8055236、rsl801278、rs3794808、rs2648875、rsl219648、rs2279744、rs2227956、rs7530511、rs41360247、rsl6996148、rsl0889677、rs2976392、rsl061581、rs9264942、rs6700125、rsl82549、rsl800750、rs669、rs2395029、rsl0380、rsl260326、rs4655595、rs4420638、rs283413、rs2180439、rsl695、rsl051730、rs9465871、rs4988235、rs7923837、rs664143、rs403016。
2.如權利要求1所述的用於天賦潛質評估的飛行質譜生物晶片，其特徵在於，所述PCR引物選自SEQ ID NO :1 SEQ ID NO :100所示序列。
3.如權利要求1所述的用於天賦潛質評估的飛行質譜生物晶片，其特徵在於，所述單鹼基延伸引物選自SEQ ID NO :101 SEQ ID NO :150所示序列。
4.一種如權利要求1-3中任一項所述的用於天賦潛質評估的飛行質譜生物晶片的檢測方法，其特徵在於，包括如下步驟 1)提取受:檢者樣本DNA； 2)設計PCR引物及單鹼基延伸引物，所述PCR引物具有選自SEQID NO :1 SEQ IDNO 100所示序列，所述單鹼基延伸引物選自SEQ ID NO :101 SEQ ID NO :150所示序列； 3)對樣本DNA進行目的基因的PCR擴增和單鹼基延伸形成樣品分析物，所述目的基因對應的 SNP 位點包括rs2273535、rsl866813、rsl056836、rsl2304921、rs2285053、rs2165241、rsll36450、rs3024505、rsl800797、rs20417、rs608995、rs6025、rs2200733、rsl801133、rs3130340、rs2981582、rs2104286、rsl6890979、rs8055236、rsl801278、rs3794808、 rs2648875、 rsl219648、 rs2279744、 rs2227956、 rs7530511、 rs41 % 0247、rsl6996148、rsl0889677、rs2976392、rsl061581、rs9264942、rs6700125、rsl82549、rsl800750、rs669、rs2395029、rsl0380、rsl260326、rs4655595、rs4420638、rs283413、rs2180439、rsl695、rsl051730、rs9465871、rs4988235、rs7923837、rs664143、rs403016 ； 4)所述樣品分析物與質譜晶片基質共結晶，檢測目的基因的SNP位點。
5.如權利要求4所述的用於天賦潛質評估的飛行質譜生物晶片的檢測方法，其特徵在於，所述步驟I)包括對提取的樣本DNA進行分光光度計定量和瓊脂糖凝膠電泳質檢。
6.如權利要求4所述的用於天賦潛質評估的飛行質譜生物晶片的檢測方法，其特徵在於，所述步驟3)包括對PCR擴增產物進行純化和對單鹼基延伸產物進行樹脂純化。
7.如權利要求4所述的用於天賦潛質評估的飛行質譜生物晶片的檢測方法，其特徵在於，所述步驟4)包括利用基質輔助雷射解吸附電離飛行時間質譜進行分析。
全文摘要
本發明公開了一種用於健康風險評估的飛行質譜生物晶片，包括樣品分析物和質譜晶片基質，所述樣品分析物與所述質譜晶片基質共結晶，所述樣品分析物包括用於天賦潛質評估的目的基因、PCR引物和單鹼基延伸引物。本發明還公開了利用該晶片進行檢測方法，包括提取受檢者樣本DNA；設計PCR引物及單鹼基延伸引物；對樣本DNA進行目的基因的PCR擴增和單鹼基延伸形成樣品分析物；所述樣品分析物與質譜晶片基質共結晶，檢測目的基因的SNP位點。本發明的基因晶片能揭示受檢者在遺傳方面患某病的風險高低，進而給予具有個性化的健康幹預措施，使得受檢者維持在良好的健康水平。
文檔編號C12Q1/68GK103060427SQ20111032122
公開日2013年4月24日 申請日期2011年10月20日 優先權日2011年10月20日
發明者張成虎 申請人:上海華翼生物科技有限公司