用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光rt-pcr引物、探針及試劑盒的製作方法
2023-04-27 01:28:16
用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光rt-pcr引物、探針及試劑盒的製作方法
【專利摘要】本發明公開了一種用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光RT-PCR引物、探針及試劑盒。所述引物與探針的序列如SEQ ID NO.1~6所示。所述試劑盒中含有引物、探針、反轉錄酶、DNA聚合酶、RNA提取試劑、螢光PCR反應試劑、施馬倫貝格病毒陽性對照和陰性對照。本發明建立的施馬倫貝格病毒螢光RT-PCR試劑盒及檢測方法具有特異、敏感、重複性好、快速、費用低廉,是施馬倫貝格病毒快速檢測的良好方法。
【專利說明】用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光RT-PCR引物、探針及試劑 合 Sl
【技術領域】
[0001] 本發明屬於分子生物學檢測領域,特別涉及一種用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光 RT-PCR引物、探針及試劑盒。
【背景技術】
[0002] 施馬倫貝格病(Schmallenberg,SB)是2011年11月在德國北萊茵-威斯伐倫 州施馬倫貝格鎮牛羊中發現的一種新的病毒性動物傳染病,該病的主要臨床特徵是:受感 染母羊流產、死胎,新生羔羊畸形、成活率下降,感染牛表現為腹瀉、發熱、產奶量下降等,對 畜牧業造成了較大危害。
[0003] 目前SB的實驗室診斷方法主要包括細胞培養分離病毒等病原檢測方法,以及酶 聯免疫吸附試驗(ELISA)、間接免疫螢光試驗(IFA)和中和試驗(NT)等血清學方法。病毒分 離通常是確診疫病的金標準,但由於成年患病動物常不表現臨床症狀,難以掌握病毒血症 的具體時期,且費時費力,因此病毒分離的實施受到一定的限制,不適應快速檢測的需要。
【發明內容】
[0004] 本發明的目的在於提供一種用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光RT-PCR引物組及試 劑盒。
[0005] 本發明的另一個目的在於提供上述螢光RT-PCR引物組及試劑盒在檢測施馬倫貝 格病毒上的應用。
[0006] 本發明所採取的技術方案是: 用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光RT-PCR引物和探針,所述引物是根據施馬倫貝格病 毒核衣殼蛋白基因序列的高度保守區域設計的。其核苷酸序列如下所示: 60F :5' - GCTTGCCTGGGCCAAAT -3'(SEQ ID NO. 1), 60R:5' - CGAATTGCTGCAAGAAGGTTCT -3' (SEQ ID N0.2), 60P :Fam-5' - TGGATTCTCTCCTGCTGC -3' -Eclipse (SEQ ID NO. 3); 一種用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光RT-PCR試劑盒,其含有以上所述的引物和探針, 還含有反轉錄酶、DNA聚合酶、RNA提取試劑、螢光PCR反應試劑、施馬倫貝格病毒陽性對照 和陰性對照。
[0007] 所述施馬倫貝格病毒陽性對照為施馬倫貝格病毒CDNA的質粒,所述陰性對照為 無菌採取澳洲進口牛血清,經檢測BSV、BTV、EHDV、AKV、BVDV、IBRV為陰性。
[0008] 以上所述的試劑盒在施馬倫貝格病毒檢測中的應用。
[0009] 本發明的有益效果是: 本發明建立的施馬倫貝格病毒螢光RT-PCR試劑盒及檢測方法具有特異、敏感、重複性 好、快速、費用低廉,是施馬倫貝格病毒快速檢測的良好方法。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0010] 圖1為RT-PCR電泳結果圖(M :DNA Marker DL-2000 ;P :陽性對照;1 :引物60擴增 pMD-SBV ;N:陰性對照); 圖2為SBV螢光RT-P CR檢測結果; 圖3為SBV螢光RT-PCR特異性試驗; 圖4為陽性質粒稀釋敏感性試驗; 圖5為SBV螢光RT-PCR標準曲線圖。
【具體實施方式】
[0011] 下面結合實施例對本發明作進一步的說明,但並不局限於此。
[0012] 實施例1引物設計 從Genebank下載多個施馬倫貝格病毒(SBV)的核衣殼蛋白基因序列,用DNASTAR 5. 07 軟體進行比對,尋找高度保守的區域,然後選取適當的核衣殼蛋白基因序列分別設計2套 特異性檢測SBV核衣殼蛋白基因的引物、Taqman探針,送大連寶生物技術有限公司合成, 用DEPC處理水溶解,-80°C避光保存。引物、探針見表1 : 表I SBV螢光RT-PCR引物、探針
【權利要求】
1. 用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光RT-PCR引物和探針,其特徵在於,所述引物是根據 施馬倫貝格病毒核衣殼蛋白基因序列的高度保守區域設計的。
2. 根據權利要求1所述的用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光RT-PCR引物和探針,其特徵 在於,其核苷酸序列如下所示: 60F :5' - GCTTGCCTGGGCCAAAT -3'(SEQ ID NO. 1), 60R:5, - CGAATTGCTGCAAGAAGGTTCT -3, (SEQ ID NO. 2), 60P :Fam-5, - TGGATTCTCTCCTGCTGC -3, -Eclipse (SEQ ID N0.3)。
3. -種用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光RT-PCR試劑盒,其含有權利要求1或2所述的 引物和探針。
4. 根據權利要求3所述的用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光RT-PCR試劑盒,其特徵在 於,所述試劑盒中還含有反轉錄酶、DNA聚合酶、RNA提取試劑、螢光PCR反應試劑、施馬倫貝 格病毒陽性對照和陰性對照。
5. 根據權利要求4所述的用於檢測施馬倫貝格病毒的螢光RT-PCR試劑盒,其特徵在 於,所述施馬倫貝格病毒陽性對照為施馬倫貝格病毒cDNA的質粒,所述陰性對照為無菌採 取澳洲進口牛血清,經檢測BSV、BTV、EHDV、AKV、BVDV、IBRV為陰性。
6. 權利要求3?5任一項所述的試劑盒在施馬倫貝格病毒檢測中的應用。
【文檔編號】C12Q1/70GK104450959SQ201410680100
【公開日】2015年3月25日 申請日期:2014年11月20日 優先權日:2014年11月20日
【發明者】楊素, 陶旻, 陳軒, 黃海超, 徐海聶, 沙才華, 廖秀雲, 羅寶正, 薄清如 申請人:中華人民共和國珠海出入境檢驗檢疫局