愛滋病病毒靶細胞cd4+t細胞易感和支持hiv-1的極端表達基因群的製作方法

2023-09-16 17:28:55 1

專利名稱：愛滋病病毒靶細胞cd4+t細胞易感和支持hiv-1的極端表達基因群的製作方法
技術領域：
本發明涉及人類基因組的疾病相關基因的表達譜研究和特徵基因群的篩選。具體 的講是在人功能基因組範圍內篩選愛滋病相關基因，利用細胞模型和基因晶片技術相結合 的方法建立的愛滋病病毒靶細胞CD4+T細胞易感和支持HIV-I的極端表達基因群，屬生物 醫學領域。
背景技術：
愛滋病(AIDS)是一種由 HIV (human immunodeficiency virus，人類免疫缺陷病 毒)引起的嚴重威脅人類健康的重大傳染病。HIV-I天然的靶細胞CD4+T細胞的活化和增 殖是HIV-I得以大量繁殖和廣泛播散的先決條件。1996年Levine等人意外發現，經同時包 被在磁珠上的⑶3、⑶28抗體(「⑶3/⑶28 beads")刺激後，活化、增殖的⑶4+T細胞，反而 獲得了既能抵抗感染又能清除病毒的能力——來自HIV-I感染者的CD4+T細胞活化後，能 逐漸清除已感染的病毒，來自健康成人的CD4+T細胞活化後，能抵抗HIV-I而不被感染。我 們以此特殊效應為基礎，同時以高度易感並促進病毒增殖的PHA/IL-2活化細胞為反證，構 建細胞模型並篩選出愛滋病病毒靶細胞CD4+T細胞易感和支持HIV-I的極端表達基因群。

發明內容
本發明的目的在於提供愛滋病病毒靶細胞CD4+T細胞易感和支持HIV-I的極端表 達基因群。本發明通過採用高通量的人表達譜基因晶片，通過比較未刺激、⑶3/⑶28磁珠刺 激(具備抵抗和清除HIV-I能力)及PHA/IL-2刺激(具備易感和支持HIV-I能力)三種狀 態下的CD4+T細胞基因表達差異，篩選在多樣本中有共同表達趨勢的差異基因，得到一組 愛滋病病毒靶細胞CD4+T細胞易感和支持HIV-I的極端表達基因群，共包含8個基因，其部 分或全部組合作為排除抗愛滋細胞藥物的標誌；該基因群在CD4+T細胞易感和支持HIV-I 狀態時高表達且在CD4+T細胞抵抗和清除HIV-I時低表達，基因群中的各基因的名稱、序列 號及主要描述見表1。表1易感和支持HIV-I的極端表達基因群(共8個基因)
權利要求
一組愛滋病病毒靶細胞CD4+T細胞抵抗和清除HIV 1的極端表達基因群，其特徵在於該極端表達基因群包含的名稱分別為CCND1、CCR3、CCR5、FGF7、KLRC4、MAL、NCR1、PECAM1，其部分或全部組合作為排除抗愛滋細胞藥物的標誌；該群基因在CD4+T細胞易感和支持HIV 1狀態時高表達且在CD4+T細胞抵抗和清除HIV 1時低表達。
2.權利要求1所述的愛滋病病毒靶細胞CD4+T細胞抵抗和清除HIV-I的極端表達基因 群，其特徵在於8個基因由SEQ ID NO 1-8所示的核苷酸序列組成。
全文摘要
本發明涉及愛滋病病毒靶細胞CD4+T細胞易感和支持HIV-1的極端表達基因群，屬生物醫學領域。本發明通過採用高通量的人表達譜基因晶片，比較未刺激、CD3/CD28磁珠刺激及PHA/IL-2刺激三種狀態的CD4+T細胞基因表達差異，篩選得到愛滋病病毒靶細胞CD4+T細胞易感和支持HIV-1的包含8個基因的極端表達基因群，由SEQ IDNO1-8所示的核苷酸序列組成。本極端表達基因群中的基因均參與了造成不同生物學效應的顯著功能(Gene Ontology，GO)和信號轉導通路(pathway)，同時在信號轉導網絡(Signal-Net)和基因的調控網絡(GeneRelNet)中處於關鍵結點或重要地位，且有望基於其中單個、多個或全部基因建立基因晶片、分子雜交和RT-PCR的方法檢測樣本中這些基因的mRNA表達水平，根據這些基因的表達水平診斷愛滋病及篩選抗愛滋細胞藥物。
文檔編號C12Q1/68GK101979570SQ20101029330
公開日2011年2月23日 申請日期2010年9月27日 優先權日2010年9月27日
發明者張華堂, 徐雯雯, 郭彥, 陳玲, 韓妙君 申請人:中國科學院昆明動物研究所