利用自體裂解融合蛋白質的表達系統及新的還原多肽的製作方法

2023-09-14 23:35:40 6

專利名稱：利用自體裂解融合蛋白質的表達系統及新的還原多肽的製作方法
技術領域：
本發明涉及一種需要裂解前體產物的多肽表達系統，和用於該系統的蛋白酶。本發明還涉及一種能夠還原二氯靛酚和氧化態穀胱甘肽的新的多肽，編碼這種新的多肽的DNA，含有該DNA的載體，用該載體轉化的宿主，和含有該多肽的藥物組合物。另外，本發明還涉及抗這種多肽的單克隆抗體，和用該抗體分離和純化所說多肽的方法。
馬鈴薯Y病毒是一組其中每種都有一種大約10,000鹼基的單股RNA基因組，並且能夠感染植物如茄科植物的病毒。馬鈴薯Y病毒基因組的特徵是具有一特別長的開放閱讀框架，或ORF[Dougherty,W.G.and Hiebert,E.(1980),Virology 101:466-474.；Allison,R.et al.(1986),Virology 154:9-20]。為了表達在ORF中編碼的單個蛋白質，用兩種類型的蛋白酶消化翻譯的多聚蛋白質，這兩種類型的蛋白酶也是在ORF內編碼的[Dougherty,W.G.and Carrington,J.C.(1988),Ann.Rev.Phytopath.26:23-143]。
菸草蝕刻病毒(TEV)是馬鈴薯Y病毒家族的一個成員，而且這種病毒能在被感染細胞中產生可被錐蟲藍染色的核內包涵體。核內包涵體明顯是由兩種蛋白組成的。其中一種已被證明是一種病毒蛋白酶，並被命名為核內包涵體a，或NIa[J.Virol.,61:2540-2548(1987)]。
核包涵體是馬鈴薯Y病毒的一種蛋白酶，它能識別和切割包括Gln-Gly,Gln-Ser和Gln-Ala之一的肽序列，據信該序列是六聚體，並且出現在多聚蛋白質內相關NIa的C末端。裂解位點是在構成上述二聚體的兩個殘基之間。
TEV和菸草葉脈斑紋病毒(TVMV)-馬鈴薯Y病毒家族的又一成員-的完整基因組序列已被測出，且同源性檢索表明這些病毒的NIa可以定位在它們的相關基因組中[Virology,154:9-20(1986)；Nuclear Acid Res.,14:5417-5430(1986)]。
三葉草黃葉脈病毒，或簡稱CYVV，也是一種馬鈴薯Y病毒。到目前為止，只測出了CYVV基因組3′端的基因和它所編碼的衣殼蛋白質的序列[Uyeda,I.et al.(1991),Intervirol.32:234-245]。以往未曾推斷出基因組NIa區的結構，也未分離出相應的NIa。
利用本領域中公知的技術，可以容易地做到由表達系統產生外源性蛋白質。但是，還有許多多肽尚不能在外源系統中很容易地被表達。問題可能是多肽不能夠被大量地表達，而且這種情況通常也不能只在基因上遊置入一個調節基因而得以糾正。或者可能是沒有發生為獲得成熟型蛋白質所需的轉錄後加工過程，或錯誤地發生了這一過程。
例如，許多真核多肽是以N末端蛋氨酸開始翻譯的，然後再去掉該胺基酸而得到成熟型多肽。這一過程不能在原核細胞中發生，因此必須尋找獲得表達的其他手段。這種技術之一包括，將所需的外源蛋白質與麥芽糖結合蛋白質或穀胱甘肽轉移酶融合，例如，純化表達的融合蛋白，然後用蛋白酶，如Xa因子，腸激酶，或凝血酶進行切割。這種笨拙方法的主要缺點是它需要兩個純化步驟，導致大量的終產物丟失。
美國專利NO.5,162,601公開了利用TEV蛋白酶生產在所要表達的每種蛋白之間具有接頭序列，如人tPA的多蛋白質。儘管如此，該專利只是公開了將編碼這種多聚蛋白質的多基因克隆到宿主中，而沒有公開蛋白水解裂解終產物的表達或純化。
用於代謝能量所需的氧在細胞環境中一般是以氧化劑形式提供的。
其中氧能被利用的活化形式一般是自由基、如超氧化物(O2-)，過氧化物(H2O2)、或羥基(OH-)，所有這些都在利用後被還原形成水(H2O)。氧化本身是具有高度氧化作用的，但是，本文所用的術語「活化氧」是指比氣體氧有更大氧化能力的氧和含氧分子。最強形式的活化氧是自由基，它是一種具有一個或多個未配對電子的分子或原子。
自由基一般是不穩定的，並且，如果不適當控制，其可使脂類、蛋白質和核酸變性。因此說，儘管活化氧是生命所必需的，但它又是一種潛在的健康不利因素，必須嚴加控制。即使是非常微小的量，活化氧也會因為其高度反應活性而引起疾病。結果是，如果不裝備抵禦活化氧的機制，生命機體就不能存活。
在細胞環境中，必須使活化氧產生的部位、數量和時間與細胞中和相關危險的能力達到平衡。這種能力一般是由利用其自身的抗氧化劑或抗氧化酶的防禦機制提供的。在本發明說明書中，「抗氧化劑」是指天然產生的能夠防止或抑制脂質自動氧化的一類物質的統稱。術語「抗氧化酶」一般用於指能夠催化消除活化氧的反應的酶，術語「抗氧化作用」也由此得到解釋。
在一些異常情況下會產生過量的活化氧，如當人體處於緊張狀態，服用藥物，吸菸，手術後，器官移值，或在大腦或心肌栓塞過程中出現局部缺血時。如此大量的活化氧超過了機體控制系統消除它們的能力，致使過量的活化氧進一步對身體造成損害，進而嚴重地損傷正常細胞。因此說，所謂的氧化應激是許多疾病的致病因素。
以動脈硬化為例，被活化氧氧化的低密度脂蛋白的出現被認為是這種疾病的病因之一[Steinberg,D.(1983),Arteriosclerosis 3,283-301]。氧化應激也被認為與糖尿病的發生、代謝異常和血管併發症相關之機制的誘因與影響密切相關[Kondo,M.ed.,「Approaches from Modern Medicine(4)Free Radicals」,Medical View Pub.,PP.138-146]。
活化氧也與其他的病理狀態和狀況有關，例如局部缺血性疾病(再灌注性疾病、缺血性心臟病、腦缺血、缺血性腸炎等)，水腫、血管通透性增加、炎症、胃黏膜疾病、急性胰腺炎、克羅恩氏病、潰瘍性結腸炎、肝病、帕拉夸特氏病、肺氣腫、化學性癌症、癌轉移、成人呼吸窘迫綜合症、瀰漫性血管內凝血、白內障、早熟性視網膜病、自身免疫性疾病、葉啉血症、溶血性疾病、地中海貧血、帕金森氏症、阿爾茨海墨氏病、癲癇、紫外線照射性疾病、放射性疾病、凍傷、和燒傷。
在細胞內和細胞外都存在有僅以消除生理狀態下產生的活化氧為目的的幾種防禦機制。
在細胞內，已知如下所述的一些抗氧化劑和抗氧化酶可以處理和消除活化氧。例如，存在於過氧化物體中的過氧化氫酶，這種酶可以還原和清除地氧化氫。穀胱甘肽過氧化物酶出現於細胞質和線粒體中，並且這種酶在還原態穀胱甘肽存在下可以還原和解毒過氧化氫及脂質過氧化物。轉鐵蛋白、鐵蛋白和乳鐵傳送蛋白，例如可以通過穩定鐵離子而抑制活化氧的產生；同樣，血漿銅藍蛋白也起到類似的與銅離子相關的作用。另外，存在於細胞質和線粒體中的超氧化物歧化酶能催化超氧化物還原以形成過氧化氫，然後過氧化氫則被過氧化氫酶消除。再者，維生素E和C能還原穀胱甘肽，而且其他的低分子量化合物也能夠還原和清除活化氧。
另一方面，象細胞外超氧化物歧化酶、細胞外穀胱甘肽過氧化物酶和還原態穀胱甘肽這類物質存在於細胞外的環境中，它們與上述的細胞內相應物質具有類似的作用。儘管如此，但是與細胞內的情況相比，細胞外抗氧化劑和抗氧化酶的種類較少，並且只有少數能夠表現出細胞外抗氧化作用。
穀胱甘肽對於保持細胞內和細胞外的還原狀態具有重要的作用，它可由下式表示。穀胱甘肽最初是由de-Rey-Pailhade於1888年在酵母中發現的，Hopkins於1921年將其作為化合物分離出來之後，命名為穀胱甘肽。
穀胱甘肽由三個胺基酸組成穀氨酸、半胱氨酸和甘氨酸。兩個穀胱甘肽分子的巰基可以在活化氧的存在下被氧化形成二硫鍵。
穀胱甘肽主要產生於肝臟，通過血漿在體內循環。在正常機體中，穀胱甘肽幾乎全部以還原形式存在。當氧化形式的穀胱甘肽含量增加時，在煙醯胺腺嘌呤二核苷酸磷酸酯(NADPH)存在下可通過穀胱甘肽還原酶的作用再產生還原形式的穀胱甘肽。因此，還原態穀胱甘肽可以保護細胞膜免於遭受因還原活化氧和自由基所導致的氧化疾病和影響。由於具有這種抗氧化特性，還原態穀胱甘肽還可以抵抗放射性的影響，並且可用作白內障的治療藥物。最近還報導愛滋病病人體內還原態穀胱甘肽的全身水平下降，這似乎表明了還原態穀胱甘肽在體內的作是極為重要的。儘管如此，在異常狀況下，活化氧的量太大以致於使幾乎所有的穀胱甘肽處於被氧化狀態，從而使活化氧不可能儘快地被清除。
人硫氧還蛋白是又一個代表性的物質，它可以在細胞內和細胞外通過其還原活性發揮多種生理學作用。人硫氧還蛋白(也被稱為成人T細胞白血病衍生因子，ADF)作為一種能夠在成人T細胞白血病細胞系中誘導細胞介素2受體(IL-2R)的因子被克隆。它是一種在其活化位點帶有兩個半胱氨酸殘基的巰基依賴性還原酶，並能夠還原活化氧和自由基。
除了能誘導IL-2受體之外，人硫氧還蛋白還可以促進被Epstein-Barr病毒(EBV)感染的B細胞株3B6中的細胞生長；抵抗衍生於單細胞源細胞系U937的腫瘤壞死因子；抵抗由中性白細胞引起的血管內皮細胞損傷。而且，在細胞內環境中，人硫氧還蛋白通過其還原活性作用於轉錄因子NFKB,JUN和FOS，從而促進DNA結合活性，使之發揮作用以增加轉錄活性。人硫氧還蛋白目前正被開發成一种放射性疾病的預防劑，以及用作再灌注性疾病、類風溼性關節炎和炎症的治療藥物，由於它能通過其還原能力防止細胞損傷，所有上述這些痰病也因此得以預防。
如上所述，通過清除活化氧和自由基來保持細胞內和細胞外環境處於還原狀態在生理學上是極為重要的。儘管目前尚不清楚，但相信有許多抗氧化劑和抗氧化酶存在於細胞內和細胞外，在消除活化氧和自由基中發揮作用。因此，發現一種能夠再生，例如，還原態穀胱甘肽的還原物質是非常有用的。這類物質對於異常的身體狀況，如上述那些疾病可能有所幫助。
本發明的第一個目的是提供一種新的蛋白酶，編碼此蛋白酶的核苷酸序列，含有編碼這種蛋白酶之DNA序列的載體，和用所說載體轉化的宿主細胞。
本發明的第二個目的是提供編碼有意義蛋白質且還編碼所說蛋白質上遊之新蛋白酶的DNA，位於所說兩序列之間並進一步編碼可由所說蛋白酶切割之肽的序列。所有的所說序列是在相同的開發放閱讀框架中。本發明的另一個目的是提供一種由所說DNA編碼的蛋白質，以及含有所說DNA的載體，和含有所說載體的表達系統，所說載體能夠在一合適的宿主細胞，例如包含自動複製所必需之核苷酸序列的宿主細胞中自動複製。
從另一個角度說，本發明的首要目的是提供編碼具有體內還原活性的新多肽的核苷酸序列。再一個目的是提供編碼能夠還原二氯靛酚和氧化態穀胱甘肽之多肽的DNA。
本發明的另一個目的是提供含有上述DNA的重組載體，所說載體能夠在合適的宿主細胞中，例如帶有一個能進行自動複製之基本序列的宿主細胞中自動複製。
另外，本發明還有一個目的是提供用上述重組載體轉化的宿主細胞微生物。本發明的另一個目的是提供一種作為轉化宿主細胞表達產物的上述肽，並提供抗這種肽的單克隆抗體。
我們現已鑑定並克隆了新的CYVV蛋白酶(NIa)，並且令人驚奇地發現能夠用CYVV NIa作為融合蛋白質的一部分，在大腸桿菌(E.coli)這樣的宿主中表達，並允許大量產生能通過自身裂解得到所需要外源性蛋白質的融合蛋白質。這種CYVV NIa基因能穩定地保留並在大腸桿菌中表達，所表達的NIa具有特異性蛋白酶的活性，即使該蛋白質形成融合蛋白質的一部分時也具有此種活性。
我們還發現了編碼新多肽的DNA，所說的多肽能夠還原二氯靛酚{也稱為二氯靛酚，2,6-二氯靛酚，或2,6-二氯-4-[(4-羥苯基)亞氨基]-2,5-環己二烯-1-酮}和氧化態穀胱甘肽，可利用合適的基因工程技術大量地獲得所說的多肽。這種多肽特別適用於治療由氧化應激引起的或與之相關的痰病，或由活化氧引起的任何疾病，如動脈硬化，糖尿病和缺血性疾病(包括再灌注疾病、缺血性心臟病、腦供血不足和缺血性腸炎)。
因此，在本發明第一個具體體現的第一方面中，提供了一種多核苷酸序列，其中所說的序列沿5′至3′的方向在同一開放閱讀框架中包括a)編碼三葉草黃色葉脈病毒核包涵體a蛋白，或者是它的與三葉草黃色葉脈病毒核包涵體a蛋白具有相似的蛋白水解特異性之突變體或變異體的序列；b)編碼可被所說三葉草黃色葉脈病毒核包涵體a蛋白或其所說突變體或變異體識別和裂解之肽的序列；和c)至少一個編碼多肽的序列。
本發明還提供了一種編碼三葉草黃色葉脈病毒核包涵體a蛋白，或其與三葉草黃色葉脈病毒核包涵體a蛋白具有相似蛋白水解特異性之突變體或變異體的編碼序列。
本發明還提供含有如上限定之序列的載體，尤其是表達載體。
本發明還進一步提供用上文限定的載體轉化的宿主，以及包括所說宿主和所說表達載體的表達系統，以及由該表達系統產生的多肽。
在本發明的另一個具體體現中，第一個方面提供了多核苷酸序列，它能編碼一種多肽，該多肽是有序列ID No.12中的1至526個胺基酸的胺基酸序列，或者編碼所說多肽的突變體或變異體，條件是由該多核苷酸序列編碼的多肽能夠還原二氯靛酚和氧化態穀胱甘肽。
還提供了一種含有如上所限定之序列的載體，特別是表達載體。
本發明還提供了由如上限定之載體轉化的宿主，以及包括所說宿主和所說表達載體的表達系統，並且還提供了由這種表達系統所產生的多肽。
本發明還提供了上述多肽的醫療用途，以及這種多肽在治療和預防由氧化應激引起或與之相關的疾病或由活化氧引起的任何疾病中的應用，以及含有這種多肽的藥物組合物。
還提供了抗這種多肽的抗體，尤其是單克隆抗體，和它的等同物；本發明另外還提供了產生這種抗體的方法以及用這種抗體純化多肽的方法。
本發明將藉助附圖得以進一步地舉例說明，其中

圖1是從CYVV-cDNA中分離的NIa區之cDNA的限制性酶切圖譜；圖2是含有NIa5′區域之質粒pKNI5′的構建圖；圖3是含有部分IL-11基因和NIa5′區域之質粒PKNI5IL的構建圖；圖4顯示用於製備5′IL DNA片段CIN3 DNA片段的引物，其中NIa基因的3′端和IL-11基因的5′端是融合的；圖5顯示通過PCR使CIN3 DNA片段與IL5′DNA片段融合；圖6顯示質粒pKSUN9的構建圖；圖7是pUCKM31-7的限制性酶切圖譜；圖8是pUCKM31-7和pcD-31之3′端核苷酸序列的比較圖；圖9是pSRα31-7的構建圖；圖10是將一組氨酸六聚體編碼序列導入到pUCKM31-7中的圖解說明；圖11是pMAL31-7的構建圖；圖12是對二氯靛酚還原活性的分析示圖；圖13是對氧化態穀胱甘肽還原活性的確定。
首先通過本發明的第一實施方案舉例說明本發明，但是下述討論也適合於本發明的第二實施方案，除非該討論明顯地不適於第二實施方案。
本發明的多核苷酸序列一般較好為DNA形式的，鑑於這一的原因，本文所引用的序列一般是指DNA。儘管如此，只要合適這些指稱也包括RNA。由於RNA的應用在實際當中受到限制，所以RNA不是優選的。例如，mRNA可以在非洲蟾蜍卵母細胞或麥胚溶解產物系統中表達，但是從經濟角度講兩者在實際生產中均不適於大量生產融合蛋白。
術語「肽」在本文中是指包含通過肽鍵連接之2個或多個胺基酸的任何分子。因此，該術語包括寡肽、多肽和蛋白質。術語「融合蛋白質」是指通過將兩個或多個其他肽序列結合而獲得的任何單一多肽。
理想的是本發明的序列較好是雙股形式的，並且本發明也包括與本發明序列相應的反義序列。本發明的雙股序列可以具有一個或兩個「粘性」末端，這種情況下反意和有意義鏈不一定準確對應。
當本發明的序列在適當表達系統中被表達時，由上述a)中鑑定的序列編碼的蛋白質傾向裂解由上述b)的序列編碼的肽，以釋放出由上述c)的序列編碼的多肽。
在上述a)和b)的序列被翻譯之後的任何時間均可以發生融合蛋白的裂解。因此，由上述c)編碼的多肽不必要在裂解之前全部被翻譯。儘管如此，實踐中我們發現至少某些融合蛋白質(如果不是大多數)，在裂解之前已全部被翻譯。
如果上述的c)序列編碼的不只是一種多肽，而且不是希望，例如，獲得一種未被切割的融合的複數多肽，那麼就不必要在每個被編碼的多肽之間再進一步編碼裂解序列。
如果上述c)的序列編碼超過一種多肽，則該序列在轉錄環境中便易於衰減。在衰減過程中，在整個mRNA被閱讀之前本發明mRNA序列的轉錄即停止，以致於靠近該序列3′端編碼的多肽產生數量將少於靠近5′端編碼的多肽。除非編碼了幾種多肽和/或該多肽非常長，衰減一般不是問題。
除非是希望製備一起使用的多種肽或這些肽是融合的，一般優選上述的c)序列只編碼一種多肽。否則，必須在裂解之後分離單個的多肽，而這是一種笨拙的方法，並且浪費純化過程中的終產物。
然而，當上述c)中的序列編碼一個以上的多肽，並且在每個編碼的多肽之間有一個裂解序列時，該裂解序列不一定要被CYVV-NIa所識別。必須要求的是在a)的序列和b)的序列5′端之間的裂解序列要能夠被由a)序列編碼的蛋白酶所識別。如果希望或能夠允許融合蛋白自身消化來製備多個多肽，那麼任何進一步的裂解序列便可被由a)序列所編碼的蛋白酶識別。儘管如此，對這些進一步的序列應當進行選擇以使它們能被其他工具所切割，從而使融合蛋白質在轉錄之後被它的NIa部分所切割，以產生NIa和多聚蛋白質。然後可以去掉NIa，並通過例如因子Xa或胰蛋白酶切割該多聚蛋白質。
由上述b)序列所編碼的裂解肽(這裡也稱為「裂解序列」和「裂解肽」)可以是一種全部或部分包含於由a)和c)序列所編碼的任一序列(分別是「NIa」或「蛋白酶」，和「多肽」)之中的序列。因此，裂解肽的N末端也可以是包括於蛋白酶C末端序列之中，而裂解肽的C末端部分可以包括於多肽的N末端部分中。在這種情況下，裂解肽或稱切割肽沒有獨立存在，而且蛋白酶識別位點是由蛋白酶的C末端和多肽的N末端組成的。
裂解肽也可以是只被包含於部分蛋白酶或多肽之中。在這種情況下，裂解肽的N末端一般是包含於蛋白酶的C末端部分中，而多肽的N末端部分可以直接連接到裂解序列上或在多肽和接頭之間有一個或多個胺基酸殘基上。
如果裂解序列和蛋白酶和/或在裂解序列和多肽之間有一個或多個胺基酸殘基，那麼這些殘基的數量和性質不應當妨礙蛋白酶的功能。在多肽N末端存在有過量的胺基酸殘基一般是不利的，這些殘基必須去除以獲得成熟形式的多肽。如果可能並且在沒有禁忌的情況下，一般優選對裂解肽進行加工處理以致於融合蛋白質裂解時獲得成熟形式的所希望的蛋白質。但是也完全有可能獲得在N末端上帶有Gly,Ser或Ala的蛋白質，並且如果需要的話，可通過合適的氨基肽酶的作用將其去掉。
在某些情況下，希望在多肽的N末端和裂解序列之間編碼一個脯氨酸。這樣可以允許例如通過氨基肽酶P(3,4,11,9)的作用切割殘基達到脯氨酸殘基處，但不超過它。然後，再通過脯氨酸亞氨基肽酶的作用去掉脯氨酸殘基以產生成熟蛋白質。這便形成了本發明的一個優選方案。
a)序列編碼一種能夠切割由本發明序列編碼之融合蛋白質的蛋白酶。在本發明中，這種蛋白酶是三葉草黃色葉脈病毒核包涵體a蛋白酶，或與三葉草黃色葉脈病毒核包涵體a蛋白酶具有類似蛋白水解特異性的突變體或變異體。
三葉草黃色葉脈病毒NIa蛋白酶是由序列表內序列ID No.1序列中的第10至1311位核苷酸編碼的，而NIa的一級序列是由序列表中序列ID No.2序列的第4到437位胺基酸所給出的。這些序列以及其突變體和變異體都是新的，構成本發明的一部分。
核包涵體a具有能夠特異性水解底物肽中Gln-Ala,Gln-Gly或Gln-Ser之間肽鍵的蛋白水解活性。另外，我們還發現NIa能夠切割Gln-Val。因此，與馬鈴薯Y病毒家族的其他蛋白酶相反，我們已發現CYVV NIa(本文所指的NIa除另有說明者外，-應當理解為CYVV NIa)能夠切割序列Asn Cys Ser Phe GlnX，其中X是任何胺基酸殘基，但是尤其指Gly.Ala.Val Ser，並且特別指Gly,Ala或Ser。
另外還希望含有序列Asn Cys Ser Phe GlnX的肽能夠被NIa所切割，尤其是在這個序列立體結構上曝露於NIa的作用之處。因此，本發明還提供了一種用於製備多肽的系統，其中含有序列Asn CysSer Phe Gln X的多肽的前體形式被NIa裂解。這個系統也可以含有其他的加工步驟，只要合適，可以是在NIa裂解之前、之後或同時發生這些加工。
儘管我們一般優先使用編碼天然產生之NIa的序列(根據序列ID2)，但是本發明同樣也包括使用NIa的突變體或變異體。
如上所述，蛋白酶應當具有與天然NIa相同或相似的特異性。在這方面，蛋白酶一般應當與序列ID NO.2中的胺基酸殘基4至437分享重要的序列同源性，而在沒有改變識別序列或使活性降低到應用水平以下的情況下可能發生實質性變異，對於本領域的普通技術人員來說是顯而易見的。
一般來說，任何給定的蛋白質的活性均取決於分子的某些保守區域，而其他區域與它們的特定序列幾乎沒有重要關聯，並且它可能幾乎完全是多餘的。因此，如上所述，本發明包括了仍然能表現出與天然產生的NIa有類似特異性的該序列的任何突變體和變異體。這種突變體和變異體包括，例如缺失、加入、插入、倒位重複和類型替代(例如，用一個親水殘基替代另一個，但是原則上是不強的親水殘基替代強的疏水殘基)。小的變化一般不影響活性，除非它們是發生在分子的基本部位，而且這種改變可以是基因操作的付產物，例如，如果需要，發生在產生額外限制性位點時。
一般來說，除了對本領域的熟練技術人員來說是顯而易見的情況之外，通常沒有任何特殊的理由要改變NIa的結構。的確，絕大部分胺基酸或編碼序列的突變或變異是在原始野生型病毒上分離新的變異的結果。然而，只要蛋白酶具有必要的特異性和足夠的蛋白水解活性，本發明並不排除精細設計的，甚至是偶然的修飾。
本文所用術語「不利影響」是指能夠影響蛋白酶的特異性或活性使之顯著低於上述天然NIa之效果的任何作用，影響的程度是其活性降低到有用水平以下。
許多取代、加入等都可能發生，唯一的限制是其活性不能受到不利的影響。一般來說，只有在NIa的三維結構受到嚴重的影響時才可能對活性有不利作用。
本文所用術語「突變體」是指對活性不產生不利影響的序列中胺基酸的缺失、加入、插入、倒位和取代。本發明還包括「變異體」，該術語用於指與序列ID2密切相關的天然產生的CYVNIa，但是在大的種群內它以預期方式由之發生變化。這一定義內包含了等位基因變異和來源於其他培育品種的表現出類似活性與相關序列的那些多肽。
應當指出的是，本發明第二方案的NIa和蛋白質都不必分別與序列ID2和12中所描述的序列完全一致。唯一的要求是儘管多肽只是完整天然序列的一部分或該部分的突變體或變異體，但它們都必須有所需的活性。
真核生物的基因，如幹擾素基因，一般被認為表現有多態性[參見Nishi,T.et al.(1985),J.Biochem.97,153-159]。這種多態性導致出現了在多肽中有一個或多個胺基酸取代的情況，以及除了核甘酸序列取代之外沒有胺基酸序列變化的其他情形。
因此，只要對蛋白酶活性沒有不利影響，多核苷酸編碼序列可以以任何所需方式被修飾。點突變和其他的變化可以有效地加入或缺失限制性位點，例如，以有助於基因操作/表達，或增強或方便地修飾NIa分子。
術語「突變體」和「變異體」還用於指多核苷酸序列，並且這種特指應當以合適的方式，mutatis mutandis加以解。應當清楚的是，雖然肽序列的突變體或變異體總是在編碼核苷酸序列中反映出來，但反過來則不一定是真實的。因此，有可能核苷酸序列發生很大變化(參見下文關於基因編碼簡併性的討論)，而不以任何方式影響肽序列。這種核苷酸序列的突變和變異是在本發明之內的。
例如，已經實現了用一個絲氨酸密碼子取代白介素2(IL-2)基因中的半胱氨酸密碼子所獲得的蛋白質仍然能夠表達IL-2的活性[Wang,A.et al.(1984),Science 224:1431-1433]。因此，只要某序列編碼具有合適NIa活性的天然或合成蛋白質，那麼它就包括在本發明範圍之內。
本領域中的熟練技術人員可以容易地由序列ID2經反向工程製得本發明編碼NIa的基因。
應當指出的是，由於基因密碼的簡併性，任何給定的反向工程操作的序列都不一定與來自相同肽的任何反向工程操作的互補序列完好或充分雜交。這是本領域中熟練技術人員預計之中的共同因素。並且任何給定序列的簡併性經常是很寬的，以致於很難合成一個甚至很短的互補寡核苷酸序列作為天然產生之寡核苷酸序列的探針。
密碼子的簡併性是這樣的，例如，對於大多數經常出現的胺基酸會有4個或更多個可能的密碼子。因此，對於任何特定肽的可能的編碼序列的數量可隨著殘基的數量呈指數增加。鑑於此，本發明NIa的可能的編碼序列數會有6位或超過6位數。儘管如此，還是要根據相關表達系統來平衡G+C的含量。而且還應考慮到一些其他因素如用於相關表達系統的密碼子頻率。
如上所述，雜交可能不是表示序列同源性可靠指徵，然而，與序列ID1表現有50％以上，較好70％，最好80％的同源性一般是優選的。在每種情況下，都應是編碼所定義的蛋白酶。
本發明還包括了前導序列編碼的蛋白酶上遊的可能應用。這樣可使得融合蛋白質進入宿主外環境，並在培養上清中收集之。然後使收集到的外在化融合蛋白質自身消化，並收集多肽。作為這種信號序列，可以使用任何合適的序列，尤其是已為特定表達系統特殊製備的序列。
本發明還包括了含有本發明序列的載體。
用於本發明的載體的一般性質對於本發明來說並不十分重要。一般來說，合適的載體和表達載體以及其構建對於本領域中熟練技術人員來說是顯而易見的，並且可以準確地根據操作者要使用該序列達到的目的，如克隆或表達，來選擇適當載體。
合適的表達載體可以是基於噬菌體或質粒的載體，儘管可以對它們進行工程化改造以使適應於其它宿主，但二者一般都是宿主特異性的。其它合適的載體包括粘性質粒(Cosmids)和反轉錄病毒以及任何其他的載體，它們對於特定系統可以有，也可以沒有特異性。合適的控制序列，如識別序列、啟動子、操縱基因、誘導基因、終止子和調節表達中基本的或有用的其它序列，對於本領域中的熟練技術人員來說是顯而易見的，它們可以是與CYVV或所用載體相關的那些序列，或者是其它合適來源的序列。可以以任何合適的方式對載體進行修飾或基因工程化改造。
序列ID2代表了編碼完整NIa的足夠序列。可以加入所需要的終止子，啟動子和其他的這類控制序列，例如，以有利於與合適載體的連接，或表達，或二者兼有之。
可以容易地將編碼本發明NIa的DNA片段，與編碼裂解序列的任何片段及編碼多肽的片段一起插入到任何合適的載體中。理想的是，接受載體含有利於插入的合適的限制性位點，但是也可以利用例如鈍端連接，但是這可以導致在開放閱讀框架上及插入方向上的不確定性。在這種情況下，當然要對轉柒載體轉化的宿主進行檢測，以選擇具有插到正確方向和正確ORF中之必要片段的載體。為了確保該片段位於正確的ORF中，理想的是創製一個序列a)，b)和c)的構建體，然後將其直接插入到載體中，從而減少了獲得所需表達載體的不確定性。本領域中的熟練技術人員根據所需的表達系統可以選擇到合適的載體。
經用例如所獲得的質粒轉化大腸桿菌(E.coli)，用氨苄青黴素抗性或其他合適的工具選擇轉化體，加入色氨酸或其他合適的啟動子誘導物(如吲哚基丙烯酸)，可以表達所需要的融合蛋白質。可經SDS聚丙烯醯胺凝膠電泳法(SDS-PAGE)來分析表達程度[Laemmli et al.,Nature,(1970),227,PP,680-685]。
還需指出的是，如果使用另一種載體時，則使用任何合適的選擇標記物，或其他的選擇方法，和/或使用任何所需的或方便的合適啟動子都是同樣可被接受的。
培養之後，如果要從宿主細胞中收集融合蛋白質，則要適當地收集轉化體細胞、破碎細胞(如用超聲波)並沉澱細胞碎片。破碎也可以是利用酶消化技術，如使用纖維素酶，或者使用某種試劑如玻璃珠振蕩，但一般優選超聲處理破碎方法(因該方法不需要其他的試劑)。對所得到的上清分析其多肽活性，並通過SDS-PAGE確定裂解產物。
常規蛋白質純化方法適合於獲得表達產物。
通過從三葉草黃色葉脈病毒中分離RNA基因組來製備本發明的DNA[Uyeda,I.et al.(1975)Ann.Phytopath.Soc.Japan41:92-203]。合適的CYVV來源是ATCC NO.PV123。在任何情況下，三葉草黃色葉脈病毒可以限定為能夠引起蠶豆壞死的病毒。
從被感染植物中純化的CYVV顆粒中獲得基因組RNA，然後進行反轉錄並用已知方法製備雙股cDNA。
為了確定病毒是否為CYVV相同毒侏的突變體或變異體，序列同源性是一種好的標誌。許多類型的馬鈴薯Y病毒是已知的，它們在致病性方面各不相同。一種已知病毒是否構成該家族的分離的成員，是基於病毒衣殼蛋白的血清學關聯及胺基酸序列的同源性。因此，具有分享90％同源性之一級胺基酸序列的病毒被認為是相同毒株，而具有分享低於70％同源性之一級胺基酸序列的病毒則被認為是不同的家族成員[Shukla,D.D.and Ward,C.W.(1989),Arch.Virol.106:171-200]。根據本發明中所用CYVV之衣殼蛋白質的各種特性[Uyeda,I.et al.(1991),Intervirol.32:234-245]，此CYVV被鑑別為馬鈴薯Y病毒家族的一個獨立成員。因此，任何具有90％或更多的衣殼蛋白質一級胺基酸序列同源性的病毒，或任何用抗CYVV抗血清(如ATCC NO.PVAS-123三葉草黃色葉脈病毒抗血清)經ELISA檢測呈陽性的病毒，均被限定為是三葉草黃色葉脈病毒的毒株。
CYVV能夠在其上面生長的各種植物品種包括普通雲扁豆，蠶豆和Pisum Sativum，但是優選蠶豆，尤其是蠶豆培育品種Wase-Soramame。
純化病毒顆粒的優選方法包括在適合的緩衝液中將被感染之植物的葉子製成勻漿並擠壓，然後用有機溶劑如氯仿提取，反覆差速離心，然後再進行蔗糖密度梯度離心。
確定如此獲得的病毒顆粒是否為CYVV的一種方法是在電子顯微鏡下檢查該病毒顆粒。另一種方法是將病毒顆粒與蠶豆一起培育以觀察是否有症狀出現。
從病毒顆粒中提取基因組RNA的合適方法包括硫氰酸鈲/苯酚法，硫氰酸鈲/三氟銫法和苯酚/SDS方法。但是，我們優選使用鹼性蔗糖密度梯度離心法[Dougherty,W.G.and Hiebert,E.(1980)Virology 101:466-474]。
然後可在一無細胞翻譯體系中檢驗按上述方法獲得的RNA，以確定它的確能編碼蛋白酶。經監測溶解產物中收穫之產物的分子量的改變，即可確定當RNA不只編碼總翻譯產物中的蛋白酶時，產物的自溶(自身消化)現象。例如可藉助抗衣殼蛋白質抗體來進行這一監測。
如果需要，可以利用抗衣殼蛋白質抗體，例如，將被翻譯的基因組RNA注射到爪蟾卵母細胞中[Gurdon,J.B.(1972),Nature 233:177-182]，或利用兔網織紅細胞或麥胚溶解產物系統[Schleif,R.F.and Wensink,P.C.(1981),「Practical Methods in Molecular Biology」Spring-Verlag,N.Y.]以在不同時間監測翻譯產物的產生。
可利用如此獲得的基因組RNA作為模板，用反轉錄酶合成單股DNA，再通過下述的標準方法由單股cDNA合成雙股cDNA(ds-cDNA)。合適的方法包括S1核酸酶法[Efstratidiatis,A.et al.(1976).Cell 7:279-288；Okayama,H.and Berg,P.(1982),Mol.Cell.Biol.2:161-170和其他文獻]、Land法[Land,H.et al.(1981)Nucleic Acids Res.9,2251-2266]和O.Joon Yoo法[Yoo.O.J.et al.(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.USA79,1049-1053]。在各種選擇中，我們優選Gubler-Hoffman法[Gubler,U.and Hoffman,B.J.(1983),Gene 25:263-269]。
可將如此獲得的ds-cDNA結合到克隆載體，如質粒或λ噬菌體中，然後將所得到的重組載轉化到微生物如大腸桿菌，尤其是E.coli DH5α菌株中。按本領域中公知的技術，利用其對抗菌素，如四環素或氨苄青黴素的抗性來選擇轉化株。
可以利用Hanahan方法[Hanahan,D.(1983),J.Mol.Biol.166:557-580]實現轉化，其中將重組DNA載體導入到已經用氯化鈣、氯化鎂或氯化銣處理而處於感受態的細胞中。
選擇具有NIa DNA之轉化株的合適方法如下所述。
(1)用探針篩選如果希望從野生型CYVV開始，那麼分離合適RNA的一種方法是利用cDNA探針，條件是NIa的胺基酸序列已經被闡明(所使用的序列部分可以來自NIa的任何區域)。為此，合成與相關胺基酸序列相對應的寡核苷酸。一般來說，所選擇的胺基酸序應包括儘可能少的簡併性，否則必須利用幾種可能的密碼子生產幾種探針。在這種情況下，考慮到密碼子利用頻率因素可能會有所幫助。或者，可考慮多個核苷酸序列，並可以用次黃嘌呤核苷替代變化的核苷酸。用放射性同位素如32P,35S或生物素標記探針。用放射標記的探針將變性的質粒DNA固定到硝化纖維素濾膜上以檢測轉化體毒株，可通過放射自顯影檢測出陽性克隆。
(2)使用PCR探針在此方法中，合成來源於與部分已知胺基酸序列相對應的有意義鏈和反義鏈的寡核苷酸，並進行聚合酶鏈反應[Saiki,R.K.et al.(1988),Science 239,487-491]。可以將它們聯合使用用於擴增編碼NIa的DNA片段。通過反轉錄已知編碼NIa的病毒基因組RNA獲得的cDNA是合適的模板DNA。用32P,35S或生物素標記如此製備的DNA片段，用該探鍾進行菌落雜交或噬斑雜交以選擇有用克隆。
(3)根據在動物細胞中的外源性產生進行篩選該方法包括培養轉化體毒株以擴增基因，然後將該基團轉染到動物細胞中(一般使用處於複製感受態和含有轉錄啟動子區的質粒，或使用可被整合到適當染色體中的質粒)，以表達由該基因編碼的蛋白質。可通過測定相關活性來選擇轉化株。
(4)使用抗NIa抗體進行選擇從用CYVV感染的植物中製備抗核包涵體(NIa和NIb)的抗體，或在合適的系統中製備抗由該表達載體產生之蛋白質的抗體。這種抗體，或其抗抗體能夠檢測出所需的NIa或有意義的轉化株。
(5)選擇性雜交翻譯系統如上所述，使轉化體cDNA與來源於表達NIa之細胞的mRNA雜交，解離結合到cDNA上的mRNA並回收之。在翻譯系統中將收集的mRNA翻譯成蛋白質，例如，將其注射到爪蟾卵母細胞中，或注射到兔網織細胞溶解產物或麥胚溶解產物這樣的無細胞體系中。通過檢查NIa活性或利用抗NIa抗體檢測NIa，來選擇有意義的轉化株。
可用已知方法[參見Maniatis,T.et al.(1982),「Molecular Cloning A Laboratory Manual」Cold SpringHarbor Laboratory,N.Y.]從有意義的轉化株中獲得編碼CYVV NIa的DNA。例如，從細胞中分離出與載體DNA相對應的一部分，並從所說的質粒DNA上切下編碼所說蛋白質的DNA區域。
可以利用，例如，Maxam-Gilbert化學修飾方法[Maxam,A.M.and Gilbert,W.(1980),「Methods in Enzymology」65:499-276]，或藉助例如使用M13噬菌體的雙脫氧核苷酸鏈終止法[Messing,J.and Vieira,J.(1982),Gene 19:269-276]來完成對所獲得之DNA的序列測定。
近年來，螢光技術傾向於替代較為危險的放射性同位素測定DNA序列。另外，當前一般可通過機機器人在計算機控制下完成雙脫氧核苷酸鏈終止法。用於電泳後閱讀鹼基序列的系統越來越豐富，這方面的例子包括「CATALYST 800」測序機器人和373A DNA測序儀(Perkin-Elmer Japan Applied Biosystems)。這些系統使得DNA鹼基序列測定方法即快捷又安全。
一般所選擇的本發明的載體能夠在原核或真核「標準細胞」中表達。另外，通過將一合適的啟動子和用於表型表達的序列導入到載體中，可以使該基因在相配的宿主細胞中得以表達。
合適的原核宿主包括大腸桿菌和枯草桿菌。為了進行相關基因的表型表達，載體可以適當地含有來源於與宿主相容的種的複製子。在大腸桿菌中，質粒可以含有複製原點和啟動子序列，如Lac或UV5。能夠將基於表型特徵(表現型)的選擇性賦予被轉化細胞的載體是優選的。
經常使用大腸桿菌作為宿主，並且優選衍生於大腸桿菌菌株K12的JM 109菌株。目前用於大腸桿菌的載體一般選自pBR322或pUC質粒系列，但是也可以按照需要使用其他的菌株和載體。適合於大腸桿菌的啟動子包括乳糖啟動子(Lac)、色氨酸啟動子(trp)、色氨酸—乳糖啟動子(tac)，脂蛋白(lpp)啟動子、lambda(λ)PL啟動子(來自λ噬菌體)和多肽鏈延長因子Tu(tufB)啟動子，但是本發明並不限於這些啟動子。
枯草桿菌的合適菌株包括207-25菌株。合適的載體包括pTUB228[Ohmura,K.et al.(1984),J.Biochem.95:87-93]和其他載體。合適的啟動子是枯草桿菌α澱粉酶基因的調節序列。這是一個能夠將信號肽序列(來源於α澱粉酶)用於細胞外分泌的適當例子。
如果希望在真核細胞中表達融合蛋白質，則可以使用脊椎動物、昆蟲、酵母、植物等的細胞。優選性脊椎動物細胞是COS細胞，尤其是COS-1細胞[例如參見Gluzman,Y.(1981),Cell 23:175-182],或二氫葉酸還原酶缺陷性中國倉鼠卵細胞系(CHO)[Urlaub,G.and Chasin,L.A.(1980),Proc.Natl.Acad.Sci.USA77,4216-4220]，但本發明並不局限於這些宿主細胞。如上所述，COS細胞適合於用作脊椎動物宿主細胞，而且這些細胞可以作為實施例。含有SV40複製子的表達載體能夠在COS細胞中自動複製，並且這些載體還具有轉錄啟動子、轉錄終止序列及一個或多個切接位點。可以藉助幾種方法，如DEAE-葡聚糖法[Luthman,H.and Magnusson,G.(1983),Nucleic AcidsRes.11,1295-1308]、磷酸鈣—DNA共沉澱法[Graham,F.L.and van der Eb.A.J.(1973),Virology 52,456-457]和電穿孔法[Neumann,E.etal.(1982),EMBO J.1,841-845]，用含有所需DNA序列的表達載體轉化COS細胞。
如果用CHO細胞作為宿主細胞，則應當使用能夠表達可提供G418抗性之neo基因的載體。攜帶這種標記物的合適載體包括pRSVneo[Sambrook,J.et al.(1989)；「MoleculorCloning-A Laboratory Manual」,Cold Spring HarborLaboratory,NY]和pSV2-neo[Southern,P.J.and Berg,P.(1982),J.Mol.Appl.Genet.1,327-341]。然後可根據它們對G418的抗性來選擇轉化體。
可用常規方法培養選擇的轉化體，並且在本發明的第二個方案的情況下，在細胞內和細胞外都產生多肽。可以根據所使用的宿主細胞，從常用培養基中選擇合適的培養基。例如，對於COS細胞來說，必須向培養基中加入含有血液成份，如胎牛血清的培養基，如RPMI-1640培養基或Dulbecco氏修改的Eagle氏培養基(DMEM)。
如果研究者選用昆蟲細胞，那麼可以使用來源於Spodopterafrugiperda的細胞[Smith,G.E.et al.(1983),Mol.Cell.Biol.3:2156-2165]。
合適的酵母包括貝克氏酵母(Saccharomyces Cerevisiae)和裂殖酵母(Schizosaccharomyces Pombe)。
合適的植物細胞包括來源於菸草(Nicotiana tabacum)和Oryza sativa的植物細胞。
應當指出的是，上面列舉的宿主是本領域中已知的標準宿主，本領域中熟練技術人員能夠在這些和其他宿主中適當地選擇所需要者。
適用於脊椎動物細胞的表達載體包括在待表達之基因上遊有一啟動子的那些載體，而且所說載體中還帶有RNA切接位點與聚腺苷酸化位點，以及轉錄終止序列，如果需要還帶有複製原點。這種表達載體的合適例子是pSV2dhfr，它帶有SV40早期啟動子[Subramani,S.et al.(1981),Mol.Cell.Bio.,1:854-864]。
適用於昆蟲細胞的表達系統包括Spodoptera frugiperda的培養細胞。合適的表達載體在所要表達基因的上遊帶有杆狀病毒多角體啟動子，並且還帶有聚腺苷酸化位點和同源重組所需要的部分AcMNPV(Acutographa Californica核多角體病病毒)基因組。其中一個例子是p BacPAK8[Matuura,Y.et al.(1987),J.Gen.Virol.68:1233-1250]。
對於真核表達，一般使用酵母，如貝克氏酵母(S.cerevisiae))。適用於酵母的表達載體包括醇脫氫酶啟動子[Bennetzen,J.L.andHall,B.D.(1982),J.Biol.chem.257:3018-3025]、酸性磷酸酶啟動子[Miyahara,A.et al.(1983),Proc.Natl.Acad.Sci.USA80,1-5]，或羧基肽酶Y啟動子[Ichikawa,K.et al.(1993),Biosci.Biotech.Biochem.57:1686-1690]。在這種情況下，也可以使用來源於羧基肽酶Y的信號肽序列，以使表達產物分泌到細胞外空間。
適用於植物的表達載體，例如包括pBI121，它具有一個35S啟動子[衍生於花椰菜花葉病毒的早期啟動子)、來源於Agrobacteriumtumefaciens的藍曙紅(nopaline)合成基因的多聚腺苷酸化序列及Agrobacterium tumefaciens基因轉移序列[Jefferson,R.A.et al.(1987),EMBO J.6:3901-3907]。可用Agrobacteriumtumefaciens感染和電穿孔等方法將這些載體導入到植物細胞中。
質pKK 388-1(由Clonetech.Co.生產)具有trc啟動子並適用於大腸桿菌。該表達載體能夠在衍生於大腸桿菌菌株K12的菌株，如JM109菌株中自動複製。可通過如上所述的已知方法很容易地將此載體導入到大腸桿菌中。將如此獲得的菌株接種到培養基上，如已知的LB培養基中，並培養一段時間。
然後經加入，例如異丙基-β-吡喃半乳糖苷(IPTG)誘導啟動子，以激活trc啟動子。進一步培養之後，破碎細胞(如超聲波破碎)並從細胞中提取所表達的蛋白質。如果希望產生的蛋白質在N末端帶有脯氨酸(PrO)，則一般適於使用大腸桿菌作為宿主。
基於上述的描述，並在必要時考慮附帶的實施例，可根據多肽的物理和化學特性，用已知的方法從適當被轉化細胞的培養物中分離和純化含有所需多肽的部分。這些適當的方法包括用蛋白沉澱劑處理、超濾、各種層析法[如分子篩層析(凝膠過濾)，吸附層析、離子交換層析、親和層析和高效液相層析(HPLC)]、透析以及上述方法的聯合使用。
為了確定所表達的NIa蛋白質是否具有所必需的蛋白酶活性，可使純化的NIa蛋白質與含有該蛋白酶裂解序列的底物蛋白質，例如編碼融合之基因的表達產物反應，該融合蛋白質包括了病毒衣殼蛋白(NIa的天然底物)和核包涵體b(NIb)[Dougherty,W.G.et al.(1988),EMBO J.7:1281-1287]。可以將這種融合蛋白質從病毒基因組cDNA中分離出來，並插入到表達載體中。然後將所得到的表達載體導入到合適的宿主細胞中以產生融合蛋白質。按已知方法，如用蛋白質沉澱劑或層析法處理所獲得的融合蛋白質，即可分離並純化之。
使如此分離和純化的底物蛋白質與所說蛋白酶在合適的緩衝溶液中，於合適溫度下反應，並回收反應產物。對回收的反應產物進行電泳分析，並用抗衣殼蛋白抗體進行Western印跡分析，根據譜帶遷移的差別檢測蛋白酶活性。在此方法中，也可以使用含有合適裂解序列的合成寡肽。
不需純化便可測出本發明蛋白酶的蛋白水解活性。因此通過連接蛋白酶基因的序列和相同的開放閱讀框架、啟動子如trc啟動子的下遊，以及蛋白酶裂解序列的上遊即可測出其活性。如果表達產物中的蛋白酶有活性，就可通過Western印跡法觀察到比融合蛋白遷移率高的帶。
通過從凝膠中回收已被觀察到裂解的帶，並通過常規的方法學分析其氨基末端序列就可確定蛋白質是否在所需肽鍵處裂解。
可以產生預期產生的該蛋白質，例如可以作為融合蛋白質，如與穀胱甘肽S-轉移酶蛋白質，一起形成的融合蛋白質，和然後可用本發明的NIa在體外裂解接頭序列。作為一種選擇，所需的蛋白質可以在宿主細胞中直接表達如作為與所說的蛋白酶形成的融合蛋白質，所需的蛋白質則可經自身裂解而製得。
如有必要，可傳用上述方法容易地以高產率和高純度產生NIa，並可將如此得到的本發明的重組NIa用作蛋白酶。
如果必要可以化學合成本發明的DNA，然後可用常規方法學，如亞磷酸三酯法[Hunkapiller,M.et al.(1984)；Nature 310:105-111]或用核苷酸的化學合成法[Grantham,R.et al.(1981),Nucleic Acids Res.9:r43-r74]製備之。如有必需，可用常規方法對這些核苷酸序列進行部分修飾，如用位點特異性誘變法，使用含有編碼所需修飾的合成的寡核苷酸作為引物[Mark,D.F.et al.(1984),Proc.Natl.Acad.Sci.USA.81:5662-5666]。
如上面可提到的，例如可使用由[α-32P]dCTP標記的探針，以隨機引物法[Feinberg,A.P.and Vogelstein,B,(1983)Anal.Biochem.132:6-13]，或缺口翻譯方法[Maniatis,T.et al.(1982),in″Molecular Cloning A Laboratory Mannual″Cold SpringHarbor Labora-tory.N.Y.]確認雜交。用常規方法使DNA固定到固相上，例如吸收到硝酸纖維素膜或尼龍膜上，然後加熱或用紫外線照射。再將固相常規浸沒在預雜交液中，其中含有6×SSC,5％Denhardt溶液和0.1％SDS，並在55℃下保溫4小時或更長時間。然後向預雜交溶液中加入預先製備的探針至最終比活性為1×106cpm/ml，並將混合物在60℃下保溫過夜。然後在室溫下用6×SSC將固相反覆洗5次每次5分鐘，再在57℃下洗20分鐘，並經放射自顯影來確定DNA是否已雜交。需認識到這只是一個特定實例，使用其他方法同樣是可能的。
可用細胞內直接切割法或細胞外切割法來製備所需的蛋白質。細胞內直接切割法通過一裂解序列，較好是Gln-Gly,Gln-Ser或Gln-Ala將編碼NIa的DNA與編碼所需蛋白質的DNA相連接，所得的DNA編碼一融合蛋白，並被插入到含有啟動子和終止子的載體中，然後在適當的宿主細胞中得以表達。被表達的融合蛋白質通過蛋白酶活性自身裂解，從而得到一個，其中Gly,Ser或Ala被一肽鍵連接與有用蛋白質之N-末端上的肽。特別優選的表達蛋白質是IL-11。
可以按上述方法，根據需要從所得蛋白質，的N-末端上裂解，任何殘基，例如使用氨肽酶P來裂解N-末端的Pro殘基是合乎需要的。
一些表達系統已經有氨肽酶P存在。然而，如果不存在氨肽酶P，就需要在原位裂解N-末端胺基酸殘基，然後可將氨肽酶P的表達載體導入宿主細胞。氨肽酶P是已知蛋白質，此酶基因序列是本領域技術人員容易得知的。
當需要得到N-末端以Pro開始的蛋白質時，通常延長培養期限以使細胞的氨肽酶P起作用是有利的。
如上所述，可藉助脯氨酸亞氨肽酶(3,4,11,5)的催化作用除去N-末端的Pro殘基，它可經內源表達或由外源表達載體表達(此酶是已知蛋白質，而且此酶的基因序列是本技術領域人員容易利用的)。另外，可在從表達系統中回收後，例如融合蛋白質從細胞中分泌出來後，再裂解脯氨酸殘基。
因此可以看出，本發明允許生產具有任何預期N末端殘基的蛋白質。
本發明的序列可產生含有Ala N-末端的多肽，然後可通過丙氨酸氨肽酶(3,4,11,14)的催化作用除去該丙氨酸殘基；丙氨酸氨肽酶是已知的酶，且其中基因序列是本領域技術人員容易利用的。此技術還允許生產具有自由選擇之N末端殘基的多肽。
可用已知方法分離和純化所需蛋白質。細胞外切割法可將適當的DNA與載體結合，然後將此載體包括於適當的表達系統中來產生NIa。可使用離子交換柱、凝膠過濾柱或反相柱等純化由被轉化細胞表達的NIa。另外，NIa亦可被表達為與另一多肽，如穀胱甘肽-S-轉移酶或麥芽糖結合蛋白質相融合的蛋白質，然後可分別用穀胱甘肽柱或麥芽糖柱分離並純化之。用腸激酶或Xa因子切割純化的產物後，NIa即可被純化並使用。
同時，製備含有NIa識別序列(裂解序列)的蛋白質前體。它可存在於指定的位置，或者該蛋白質可通過適當接頭(裂解序列)，連接如穀胱甘肽-S-轉移酶或麥芽糖結合蛋白質連接，而成為融合蛋白質的一部分。可在適當緩衝溶液中使前體與NIa反應，在體外裂解前體。如有必要，可按上述方法除去N末端的胺基酸殘基。
同前所述，可用已知方法分離和純化所得到的蛋白質。
有關本發明的第二個具體體現，我們相信自然發生的還原肽具有序列ID12所示的序列，它由526個胺基酸組成，帶有N-末端纈氨酸殘基。
據信自然存在的編碼此肽的DNA具有序列ID11中70至1647位的核苷酸序列。
本發明的肽可以還原氧化的穀胱甘肽和二氯靛酚。這是對此肽準確的描述，但在某種程度上有些累贅，以致本發明的肽在本文中也稱為KM31-7肽或蛋白質。
KM31-7蛋白質來源於體內，也可是它的突變體或變異體，因而與其毒性和/或抗原性有關的問題很少。
在本發明的第二個具體體現中，據信具有序列ID12中序列-23至526的多肽是KM31-7蛋白質的前體。因而本發明也包括此前體及其突變體和變異體，以及編碼它們中的任一個的多核苷酸序列。
下面有關本發明第二個具體體現的討論是必要的。應理解上述與CYVV NIa有關的許多前體對於分離、克隆和表達編碼本發明肽的DNA也是適用的。差別基本上是從這樣的事實中產生的，即CYVV NIa是植物病毒蛋白質，而本發明的肽是哺乳動物蛋白質。現在將描述用基因重組技術從哺乳動物細胞中得到已表達的特定多肽的一般步驟。
用已知方法可得到編碼KM31-7肽的mRNA並將其反轉錄成ds-DNA。任何適當的哺乳動物細胞、細胞系或組織都可用作起始的mRNA的來源，但我們優選使用從人骨髓基質細胞分離的KM-102細胞系[Harigaya,K.and Handa.H.(1985),Proc.Natl.Acad.Sci.USA.82,3447-3480]。
可使用不同的方法，如硫氰酸胍熱酚法或者硫氰酸胍鹽酸胍法從哺乳動物細胞中提取mRNA，但一般優選的是硫氰酸胍氯化銫法。
既然真核細胞細胞質中存在的mRNA中的大多數都已知具有3′末端的polyA序列，因而可利用此特性通過Oligo(d)纖維素柱吸附來影響哺乳動物mRNA的純化。洗脫出的mRNA可進一步通過如蔗糖密度梯度離心的方法來分級分離。
可在適當系統如Xenopus laevis卵母細胞系統、兔網織細胞系統或麥胚系統(文獻同上)中翻譯mRNA，來進一步證實得到的mRNA確實是編碼所需肽的。
按下述方法完成表達產物之還原活性的測定。ⅰ)二氯靛酚還原活性的測定此測定方法由Beinert.H.在″Methods in Enzymology″(1962),5,546中作過描述。
50μm二氯靛酚(Sigma)製劑是用20mM磷酸鹽緩衝液和0.5MNaCl(pH7.8)配製的。將1ml此製劑放入小杯中(SARSTEDT,10×4×45mm)，再加入檢測樣品。將15μl溶於同樣緩衝液的1mM NADPH(Boeringer-Mannheim)在室溫下加入小杯以開始反應。
經監測氧化態二氯靛酚在600nm處，吸收的降低或者經監測NADPH在340mm處吸收的降低測出還原酶活性。(ⅱ)氧化態穀胱甘肽還原活性的測定該檢測法的方法學由Nakajima,T.等人在″New BasicExperimental Methods in Biochemistry(6)-Assay MethodsUsing Biological Activity″,3-34中作過描述。
10mM氧化態穀胱甘肽製劑(Boeringer-Mannheim)是用20mM磷酸鹽緩衝液和0.5M NaCl配製並用調pH至7.8。在小杯(10×4×4mm)中先放入試樣。再放入15μl此製劑然後將15μl用相同緩衝液配製的1mM NADPH在室溫下加入小杯中以開始反應，可經監測340nm處吸收的降低來測定穀胱甘肽還原酶活性。
可用如上所述的不同的方法從mRNA製得ds-DNA。它們包括S1核酸酶方法、Land方法和O.Joon Yoo方法(文獻同上)，但在此例中我們優先使用Okayama-Berg方法[Okayama H.and Berg.P.(1982).Mol.Cell.Biol.,2,161-170]。
然後可將如此得到的ds-cDNA摻入克隆載體中，並將所得的重組質粒被導入上述大腸桿菌中。
可用不同方法篩選到含有編碼本發明肽之所需DNA的菌株，例如使用上述與篩選含NIa DNA轉化體有關並作了適當的修改的方法。例如，如果用PCR來製備探針，則合適的模板DNA可以是上述的CDNA或者是基因組DNA。
在本發明第二個具體體現中，可以經初步篩選來減少所要檢測之菌株的數目。初步篩選是可能的，因為本發明的肽與細胞有關，以致它的mRNA細胞因子的mRNA共同享有AUUUA特徵部分[Shaw,G.and Kamen,R.(1986),Cell 46,659-667]，因此在初步篩選中可以使用與AUUUA特徵部分互補的合成的寡核苷酸探針，然後通過測定哺乳動物細胞中外源蛋白質的產量來進行篩選。
然後可從載體上切掉編碼該肽的DNA，並用上述與NIa DNA有關的相似方法來測定序列。另外，按上述方法將DNA片段引入適當的載體中，用以轉化原核或真核宿主。
KM31-7蛋白質可以單獨使用，也可與一種或多種其他治療藥物聯合使用，用於預防和治療由氧化的壓力導致或與之相關的病理狀態，或者由激活的氧導致的任何疾病。這些狀態包括但不只限於動脈硬化、糖尿病、局部缺血(如再灌注障礙、缺血性心臟病、離缺血和缺血性腸炎)、浮腫、血管滲透性過高、炎症、胃黏膜病變、急性胰腺炎、Crohn′氏病、潰瘍性結腸炎、肝病、Paraquat氏病、肺氣腫、化學致癌、致癌性轉移、成人呼吸困難綜合症、瀰漫性血管內凝血(DIC)、白內障、早熟性視網膜病、自身免疫疾病、卟啉病、溶血症、地中海貧血症，Parkinson氏症、Alzheimer氏病、癲癇、紫外線照射病、放射病、凍傷和燒傷。
本發明第二個具體體現的藥用組合物含有藥學上活性量的KM31-7肽及其藥學上可接受的載體。
本發明的組合物可以不同的方式給藥，如以片劑、膠囊、粒劑、粉末和糖漿劑的形式口服給藥，或者以注射液、輸注液和栓劑的形式經腸道外途徑給藥。其它適當的給藥方式對本技術熟練人員來說是顯而易見的。
當本發明的肽以注射或輸注的方式給藥時，可將此肽的無熱原製劑製成適當的藥學上可接受的水溶液以供腸道外給藥。符合pH、等滲性和穩定性要求的多肽溶液的製備是本領域技術人員熟知的。
對本領域技術人員容易確定給藥的劑量和形式，所考慮的標準包括病人狀態、體重、性別、年齡、飲食、其他感染的嚴重程度、給藥時間以及其他臨床上重要的因素。通常正常成年人口服劑量為每天約0.01mg至1000mg範圍。此量在24小時之內可以以一次劑量給藥或者分幾次亞劑量給藥。當此肽經腸道外途徑給藥時，可通過皮下、肌內或靜脈內注射，每次給藥約0.01mmg至約100mg。
為了完全鑑定KM31-7蛋白質，得到此蛋白質特異性的抗體是重要的，這種抗體對於檢測KMα31-7蛋白質的功能、定量、純化以及組織分配都有用處。
因此，經給實驗動物接種由被PMAL31-7轉化的大腸桿菌所產生的多肽，再將抗體生成細胞與骨髓瘤細胞一起製備雜交瘤，再篩選並克隆雜交瘤即可得到產生抗-KM31-7抗體的雜交瘤。由所得到的雜交瘤產生的抗體可識別從被PSRα31-7轉化的COS-1細胞的無血清培養物上清液中得到的多肽。
因此本發明進一步提供了抗體，較好是單克隆抗體或其等同物，它可特異性地識別KM31-7蛋白質，或KM31-7蛋白質的突變體或變異體。
本發明的抗體是針對KM31-7蛋白質或其突變體或變異體的。應認識到此抗體可為多克隆或單克隆，但更好是單克隆形式的。這是因為存在通常與多克隆抗體有關的非確定性。為保持結果的一致性，不論是用於治療還是用於純化KM31-7蛋白質，都優選使用單克隆抗體。
可由任何適當的動物製備本發明的抗體。然而，當抗體是非人抗體的，就會產生抗原性問題。在這方面，有可能建造出與人抗體更接近相似的抗體。可用本領域中已知的方法，經化學或遺傳修飾可以達到這一目的。
本發明也設想了抗同種異型抗體，即那些識別位點可識別上述抗體之識別位點的抗體。這種抗體可通過給適當的動物使用最初的抗體來製備這類抗同種異型抗體。值得注意的是，此過程與相應於最初的或抗同種異型抗體的各代都可趨於無窮盡地傳遞下去。然而如果每一代不能篩選出可正確識別的抗體，那麼特異性實際上就會消失。抗同種異型抗體是有用的，例如用於檢測游離的抗KM31-7抗體。
本發明也設想了能夠識別KM31-7蛋白質的本發明抗體的片段，以及攜帶有這種抗體之識別位點的分子。這種片段和分子在本文中被稱作本發明抗體的″等同物″。
用質粒pMAL 31-7轉化E.coli，純化表達產物並用於免疫實驗室動物。將被免疫的動物的脾細胞同骨髓瘤細胞融合以製備雜交瘤，即可得到產生高濃度和有良好穩定性之抗KM31-7單克隆抗體的克隆(此克隆被命名為MKM150-2並被保藏於FermentationResearch Institute of the Agency of Industrial Scienceand Technology,Japan，保藏號為FERM BP-5086)。此克隆的培養物在其上清液中產生抗-KM31-7的單克隆抗體。
將得到的抗-KM31-7單克隆抗體與通過在E.coli中引入和表達PMAL31-7得到的融合蛋白質一起發生免疫化學反應。此抗體也與從用編碼KM31-7的cDNA轉化的哺乳動物細胞培養物上清中得到的KM31-7蛋白質發生免疫化學反應。
為了產生單克隆抗體，一般還需接著完成下列步驟，它們包括(a)純化將被用作抗原的生物高聚物；(b)經注射抗原來免疫小鼠，在適當的時候通過取樣和檢查血液從脾臟製備抗體生成細胞；(c)製備骨髓瘤細胞；(d)將脾細胞與骨髓瘤細胞融合；(e)篩選可產生所需抗體的雜交瘤細胞群；(f)製備單個的克隆(克隆化)；(g)培養可大量產生單克隆抗體的雜交瘤，或如條件允許飼養被雜交瘤感染的小鼠；並(h)將所得單克隆抗體作為一標記的試劑來檢測其生理活性或特性。
可參考上面所列的步驟來描述抗KM31-7單克隆抗體的生產。值得注意的是，沒有必要再作詳細精確地描述，而且有可能使用任何適當的步驟。例如，可以使用脾以外的抗體生成細胞和骨髓瘤，以及其他哺乳動物的抗體生成細胞和骨髓瘤。下述步驟代表了目前優選得到抗KM31-7單克隆抗體的方法。(a)抗原純化經在E.coli中表達pMAL31-7並純化表達產物所得到的融合蛋白質是有效的抗原材料。被pMAL31-7轉化的E.coliTB-1培養物需經異丙基-3-D-硫代半乳糖吡喃糖苷(IPTG)誘導。然後使用直鏈澱粉樹脂柱(New England Biolabs)以親合層析法純化被表達的融合蛋白質。從被pSRα31-7轉化的COS-1細胞之無血清培養物上清液中純化得到的KM31-7也是有效的抗原。(b)抗體生成細胞的製備將從(a)中得到的純化的融合蛋白質，與弗氏完全或不完全佐劑，或明礬等佐劑相混合，然後用得到的疫苗免疫實驗室動物。實驗動物優選BALB/C小鼠，因為大多數從小鼠中得到的有用的骨髓瘤都是從BALB/C小鼠中得到的。而且，這些小鼠的特性已經被研究的很詳細。再者，如果抗體生成細胞和骨髓瘤都來自BALB/C小鼠，則所得到的雜交瘤即可在BALB/C小鼠的腹腔中生長。因此使用BALB/C小鼠可提供許多便利，使得單克隆抗體可從腹水中輕易獲得而無需使用複雜的操作步驟。然而，本發明並不局限於使用BALB/C小鼠。
抗原可以任何適當的形式給藥，如皮下注射、機腹膜內注射、靜脈內注射、皮內注射或肌肉內注射，優選皮下注射或腹膜內注射。
免疫可經一次或有適當間隔期的多次給藥而實現。優選的方案是免疫後再進行一次或多次間隔1至5周的加強免疫。如果定期測定免疫動物血清中抗所說抗原的抗體效價則可改善後來步驟的結果。具有很高抗體效價的動物被用來提供可產生抗體的細胞。較好在最後一次免疫後3至5天從動物體內分離得到用於繼後融合的抗體生成細胞。
檢測抗體效價的方法包括，例如可使用放射性同位素免疫測定法(RIA)、酶聯免疫吸附測定法(ELISA)、螢光抗體技術和被動血細胞凝集法等多種不同的已知技術，但因其敏感性、速度、準確性和自動化潛力而優選RIA和ELISA。
ELISA的適當形式如下所述。將抗原吸附於固相上，再將固相表面暴露於與抗原不相關的蛋白質如牛血清白蛋白(BSA)中以封閉沒有吸收抗原的表面任何區域然後洗固相，再將它暴露於最初抗體(如小鼠血清)的系列稀釋樣品。樣品中任何抗-KM31-7的抗體都與抗原結合。洗滌後加入酶聯的抗小鼠第二抗體，以允許結合已被結合的小鼠抗體，洗滌後加入酶底物，通過檢測參數，如由底物分解引起的顏色改變來計算抗體效價。(溶液)(c)骨髓瘤細胞的製備所建立的小鼠細胞系被優選用作骨髓瘤細胞的來源。此細胞系的合適例子包括骨髓瘤細胞系P3-X63 Ag8-U1(P3-U1)，它來自源於BALB/C的8-氮雜鳥嘌呤抗性小鼠[Current Topics in Micro-biology and Immunology,81,1-7(1978)]、以及P3-NSI/1-Ag4,1(NS-1)[Europear J.Immunology,6,511-519(1976)],SP2/0-Ag14(SP-2)[Nature,276,269-270(1978)]、P3-X63-Ag8.653(653)[J.Immunology,123,1548-1550(1979)]和P3-X63-Ag8(X63)[Naturc256,495-497(1975)]。這些細胞系可以在適當培養基中作次級傳代培養，如使用8-氮雜鳥嘌呤培養基(RPMI-1640培養基，含有8-氮雜鳥嘌呤、1.5mM穀氨醯胺、5×10-5M2-巰基乙醇、10μg/ml慶大黴素和10％小牛血清)、Iscovc氏改良的Dul bccco氏培養基(IMDM)或Dulbecco氏改良的Eagle氏培養基(DMEM)。在細胞融合前3至4天，通過在正常培養基中，也即完全GIT[5.5ml MEM非必需胺基酸溶液(NEAA,Gibco)、27.5ml NCTC109(Gibco)、6ml青黴素一鏈黴素溶液(Sigma)和11ml穀氨醯胺在500mlGIT培養基(Wako PureChemicalIndustry)中的200mM溶液(Sigma)中進行傳代培養，使細胞計數在融合當天增加到至少2×107個。(d)細胞融合抗體生成細胞是血漿細胞和它們的前體淋巴細胞。它們可取自動物個體的任何適宜部位，如脾臟、淋巴結、外周血液或這些部位任何適宜的聯合。然而最常用的是脾細胞。未次免疫後3至5天，從至少具有規定的抗體效價的小鼠中收穫抗體生成細胞。將所得的抗體生成細胞與上述(C)中得到的骨髓瘤細胞融合。目前最常用的方法是使用聚乙二醇融合脾細胞和骨髓瘤細胞，這應歸功於該化合物的相對低水平的細胞毒性以及容易處理。此方法按下述步驟進行。
將脾細胞和骨髓瘤細胞用培養基或磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)充分洗滌並混合，以使脾細胞對骨髓瘤細胞的比率大約為5至10∶1，然後經受離心分離之。棄去上清並充分打破細胞團，然後在攪拌下加入聚乙二醇的混合溶液(PEG，分子量1000至4000)。幾分鐘後，離心分離細胞。再棄去上清，在含有5至10ng/ml小鼠IL-6的適當量的完全GIT中懸浮沉澱的細胞，然後將其轉移到培養板的小孔中。一旦證實各孔中有細胞生長，即將培養基換成HAT培養基(含有5至10ng/ml小鼠IL-6,10-6至10-3M次黃嘌呤，10-8至10-7M氨基蝶呤和10-6至10-4M胸苷的完全GTT)。(e)雜交瘤組群的選擇將培養板置於35至40℃的CO2恆溫箱中溫育10至14天在這段時間裡，每隔1至3天加入培養基量一半的新鮮HAT培養基。
骨髓瘤細胞來自8-氮雜鳥嘌呤抗性細胞系，骨髓瘤細胞和僅含骨髓瘤的雜交瘤在HAT培養基中不能存活。然而，含有抗體生成細胞部分的雜交瘤，包括抗體生成細胞與骨髓瘤細胞的雜交瘤則可以存活。僅含有抗體生成細胞的雜交瘤將死亡，從而通過在HAT培養基中培養即可選擇出由骨髓瘤細胞和抗體生成細胞組成的雜交瘤。
在那些可觀察到雜交瘤克隆生長的小孔中，以HT培養基(其中氨基喋呤已從HAT培養基中除去)替代HAT培養基。除去一部分培養物上清液，並例如用ELISA檢測抗KM31-7抗體的效價。
上述方法是就8-氮雜鳥嘌呤抗性細胞而言的，但也可以使用允許選擇雜交瘤的其他細胞系。在這種情況下，通常所使用的培養基成分也應改變。(f)克隆將來自(e)，已確定可產生抗KM31-7特異性抗體的雜交瘤轉移到不同的平板上進行克隆。可使用不同的克隆方法，如接種法(其中雜交瘤經有限稀釋分析，以使每孔只含一個雜交瘤)、軟瓊脂法(其中接種的克隆被軟瓊脂培養基接收)、接種法(其中用顯微操作器移去單個細胞)和分揀器克隆法(其中通過細胞分揀器可分離個別細胞)。有限稀釋分析因其簡單易行而成為最常用的方法。
對於那些可不斷觀察到抗體的小孔，需例如通過有限稀釋分析重複2至4次克隆。選擇不斷顯示有抗KM31-7抗體產生的克隆作為要選擇的雜交瘤。(g)通過雜交瘤培養製備單克隆抗體將從(f)選出的雜交瘤培養於普通培養基中。通過使用大培養瓶或轉瓶旋轉培養得到大體積培養物。對細胞上清液進行凝膠過濾，再收集和純化IgG部分即可得到抗KM31-7單克隆抗體。另外，雜交瘤也可在同系小鼠的腹腔內生長(例上面提到的BALB/C小鼠)或例如Nu/Nu小鼠。進行此步驟的簡單方法是使用單克隆抗體製備試劑盒(例Pharmacia的MAbTrap GII)。(h)單克隆抗體的鑑定可按下述方法鑑定從(g)得到之單克隆抗體的同種異型和亞類。可以使用的鑑定技術的例子包括Ouchterlony方法，ELISA和RIA。儘管Ouchterlony方法簡單，但缺點是在單克隆抗體的濃度十分低時，必須進行濃縮。
如果使用ELISA或RIA，可將培養物上清液直接暴露於已吸附了抗原的固相。然後用IgG亞類的各型特異性的第二抗體鑑定亞類的類型。另外，可使用同種異型分型試劑盒(例如，Amersham的小鼠單克隆抗體同種異型分型試劑盒)。通過Folin-Lowry法或通過測量280nm處的吸收值可進行蛋白質定量[1.4(OD280)=1mg/ml免疫球蛋白]。
在相伴的實施例中，從被稱為MKM150-2的雜交瘤得到的單克隆抗體被鑑定為IgG類同種異型，並被認定屬於IgGl亞類。
按照本發明得到的單克隆抗體對KM31-7蛋白質有高度特異性。而且因為通過培養上面提到的雜交瘤可始終如一地得到高質量的單克隆抗體，所以它可被用來分離和純化KM31-7蛋白質，並且利用抗原-抗體反應，以免疫沉澱法用所說的單克隆抗體分離和純化所說的KM31-7蛋白質，也構成了本發明的一部分。
現參考所附的非限制性的實施例來舉例說明本發明。所有溶液都是含水的和由去離子水製備的，所有百分數，除非另外說明者外都是指W/V。如果方法不是特別的，則都可在′Molecular Cloning-A Laboratory Manual″[第二版，Sambrook,J.,Fritsch,E.F.和Maniatis,T.(1989),Cold Spring HarborLaroratoryPress]中找到。溶液和其它培養基的製備方法在下文標題為″培養基″的部分給出，而不在實施例中給出。在沒有技術的實施例中提到的方法應在前面實施例的上下文中加以解釋。A)CYVV的來源材料將冷凍保存的三葉草黃葉脈病毒(clover yellow vein virus)[CYVV分離物No.30:Uyeda,I.et al.(1975),Am.phytopath.Soc.Japan 41:192-203]感染的葉加10倍體積的接種緩衝液磨碎。
使用已長出第二片成葉的Vicia faba,Cultivar Wase-Soramamefaba繁殖CYVV。在成葉上噴灑金剛砂(400目)，再用玻璃抹刀接種上面得到的液體。接種後約8至10天，被接種的葉已成了網眼狀的花葉病狀態，除去這片葉子以用作CYVV的來源。B)病毒的純化用含有3倍體積提取緩衝液的切碎機切碎上述(A)步驟中分離的葉。切碎後，在研缽用杵進一步磨碎葉。用裝備有發動機的不鏽鋼攪動刀電機在室溫下將所得製品緩慢攪拌1小時。然後通過雙層紗布擠出液體製劑。
隨後的所有步驟都在4℃下進行。
將粗提液與一半體積的氯仿混合，在Waring混合器中被混勻，隨後將製劑在6000×g下離心15分鐘。離心後收集水層，在這部分中加入聚乙二醇(PEG#6,000)至終濃度為4％V/V。
將得到的混合物在冰上攪拌1小時，再將其在冰上放置1小時。將由此得到的液體以6,000×g離心15分鐘，作為含有病毒的部分回收沉澱物。將此沉澱物懸浮於含有0.5M尿素的50ml 10mM磷酸鹽緩衝液(pH7.4)中，再與等體積的四氯化碳相混合，將所得製品劇烈攪拌5分鐘，然後將製劑以3,000×g離心10分鐘。再用Hitachi RP-30轉子在4℃以30,000rpm將水相超速離心90分鐘。所得片狀沉澱物作為含有病毒的那部分被回收。
將片狀沉澱物懸浮於含有1％Triton×100(PH7.4)的10mM磷酸鹽緩衝液中，再將此懸液在4℃以8,000×g離心1分鐘。使所得上清在10至40％蔗糖密度梯度柱管中被分層(40％:10ml,30％:10ml,20％:10ml,10％:10ml；已在4℃下的放置過夜；此柱已預先用10mM磷酸鹽緩衝液(pH7.4))製備得到。一旦上清液在管內分層，即用HitachiPRS 25轉予在4℃下以23,000rpm將其超速離心120分鐘。
離心後，可使用裝配有OD260nm檢測器的分級分離器(ModelUA-2:由ISCO CO.製造)來分級分離庶糖密度梯度柱管。具有約20至30％蔗糖密度，在OD260nm處有吸收的部分即為含有病毒的部分。
用10mM磷酸鹽緩衝液(pH7.4)兩倍稀釋所回收的病毒部分，使用Hitachi RP-65轉子在4℃以下40,000rpm將其離心90分鐘。將所得沉澱物重新懸浮於10mM磷酸鹽緩衝液(pH7.4)中以產生純化的病毒溶液。c)病毒RNA的分離CYVV的基因組RNA含有約10,000個鹼基，並且其3′末端是聚腺苷酸化的。無論是使用常規的酚/十二烷基磺酸鈉法或是硫氰酸鈲法，因其長度和聚腺苷酸化的兩方面問題，都使得在無損失情況下提取到全長度RNA變得很困難。相應地，通過鹼性蔗糖密度梯度離心法則可製得病毒基因組RNA。
將500μl病毒溶液(根據1mg/ml病毒的OD260nmO2.5算得含有2mg病毒)加入到500μl降解溶液中並將混合液在室溫下放置20分鐘。然後使混合物在已用1×SSC製備的0％至33.4％蔗糖密度梯度柱管(33.4％:1.4ml,30.4％:7.6ml,27％:7.0ml,23％:6.3ml,18.7％:5ml,12％:3.2ml,0％:2.7ml；均在4℃下放置過夜)上分層。所用的緩衝液仍為1×SSC，用Hitachi RPS-27轉子將已分層的管在15℃,24,000rpm下超速離心9小時。然後刺穿管的底部以分級分離蔗糖密度梯度。檢測每個部分在260nm處的吸收值即可鑑定出病毒的基因組RNA部分。病毒基因組RNA在蔗糖濃度約為20至30％時發生沉積。所得基因組RNA的產量約為25μg。D)病毒cDNA的合成使用上述C)中製備的基因組RNA作為模板來合成cDNA。 cDNA的合成是使用CDNA合成系統(cDNA Synthesis System Plus)(由Amersham製造)進行的。所得CDNA在Sephadex G50柱(註冊商標，由Pharmacia製造)上純化，用dCTP和末端脫氧核苷酸轉移酶(由Bethesda Research Laboratories製造)將polyc鏈加到純化的cDNA的5′末端上。用限制性酶pstⅠ消化質粒，再在兩端都加上3′poly G鏈即可製得質粒pBR322(由Bethesda ResearchLaboratories製造)的製劑。在此製劑中加入cDNA，在65℃下將混合物溫育5分鐘，然後在57℃下溫育2小時。逐漸冷卻所得混合物以使cDNA的poly C鏈與質粒的poly G鏈退火。E)轉化按氯化鈣法將上述D)中製備的新質粒轉化進E.coli菌株HB101中。E.coli菌株HB101的種子培養物是在液體LB培養基中振蕩過夜而製得的。用0.5ml此種子培養物接種50ml新鮮液體LB培養基，將接種物在37℃下振蕩培養直至OD550mm為0.5。在4℃下以5.000×g離心5分鐘以回收細菌細胞，將所得片狀沉澱物輕輕懸浮在25mlTris-鈣緩衝液中，並在冰上放置5分鐘。將所得懸浮液以4,000×g再離心4分鐘，並將片狀沉澱物懸浮於5ml Tris-鈣緩衝液中，在冰上放置2小時即得到感受態細胞。
將上述D)中得到的100μl新質粒加到200μl如上製得的感受態細胞中，將混合物在冰上放置30分鐘。然後在42℃下溫育2分鐘，再加入1ml液體LB培養基，並在37℃下將所得混合物振蕩培養1小時。將所得混合物塗布在含有12.5μg/ml鹽酸四環素和1.5％W/W瓊脂的固體LB培養基上。在37℃下過夜培養細胞以得到CDNA克隆文庫。F)質粒pNS51的製備與選擇用鹼-SDS法分析cDNA重組質粒文庫。此方法詳述如下。
將得自上述E)的固體LB培養物中抗四環素但對青黴素敏感的細菌菌落接種於2ml液體LB培養基中，將所得懸液在37℃下振蕩培養過夜。以10,000xg離心以回收細胞並將其懸浮於70μl另外含有16μl溶菌酶溶液(10mg/ml)的裂解緩衝液中。攪拌5秒以形成懸浮液後於室溫下放置5分鐘。然後在懸浮液中加入160μl鹼-SDS溶液，將試管倒數幾次以第一次混合所得混合物，並再在冰上放置5分鐘。在混合物中加入120μl的5M醋酸鉀，再在冰上放置5分鐘，然後在4℃下以10,000xg將混合物離心5分鐘。
離心後，將上清液轉移到乾淨試管中，再在試管中加入250μl異丙醇並將所得混合物在冰上放置30分鐘。然後，以10,000xg再將混合物離心5分鐘，將所得狀沉澱物溶於100μlTE緩衝液[10mMTris,1mM EDTA(pH8.0)]中，再在所得混合物中加入等量苯酚/氯仿/異戊醇(25∶24∶1)並劇烈混均之，在4℃下以10,000xg將混合物離心5分鐘(下文中此步驟指的是苯酚提取)。
將離心得到的100μl水層與10μl3M醋酸鈉(pH5.2)和250μl乙醇相混合，將所得混合物在乾冰上放置10分鐘，然後以10,000xg離心5分鐘以得到核酸部分(下文中，將使用同樣相對量上清液、乙醇和醋酸鈉溶液的步驟稱為乙醇沉澱)。
將所得片狀沉澱物懸浮於50μl RNase A(10μg/ml，溶於TE緩衝液)溶液中，再在37℃下保溫1小時。然後向保溫的懸浮液中加入30μl聚乙二醇溶液(2.5M氯化鈉，20％聚乙二醇#8,000)，並將混合物在冰上放置1小時。然後在4℃下以10,000xg將混合物離心5分鐘以得到作為片狀沉澱物的DNA部分，乙醇沉澱兩次以上以得到純化的質粒DNA。
將純化的質粒DNA用限制性酶PstⅠ裂解，再用TBE溶液進行1％瓊脂糖凝膠電泳。電泳後，使凝膠經受Southern印跡雜交[Southern,E.M.(1975),J.Mol.Biol.89:503-517]。更具體地說，凝膠先在變性溶液中振蕩40分鐘，再轉移到中和緩衝溶液振蕩2小時。
振蕩後，將凝膠轉移到含有20×SSC的聚氨酯海綿上以將DNA轉移到一片Hybond-N膜(註冊商標；由Amersham製造)上。DNA轉移到Hybond-N膜上後，將膜在1×SSC中振蕩10分鐘，再在80℃下乾燥1小時以固定DNA。然後將膜置於預雜交溶液[5ml甲醯胺，1ml 50×Denhardt氏溶液，2.5ml 20×SSC,100μl酵母tRNA(50mg/ml),100μl 10％SDS和1.3ml重蒸餾水]中並在50℃下溫育3小時。
用已被Mg2+裂解的病毒基因組RNA作為探針。更具體地說，在上述c)中得到的含有1μg病毒RNA的16μl溶液中加入4μl 5x變性緩衝液。將混合物在37℃下溫育3小時，經乙醇沉澱，再在70℃下加熱5分鐘然後置冰上驟冷，得到含有100ng RNA(根據1mg/ml RNA的OD260為20來計算)的5μl變性的RNA溶液。
向變性的RNA溶液中加入4μl 5x標記緩衝液、1μl 3.3mM[γ-32P]ATP(0.37MBq)以及10μl重蒸餾水然後將20uT4多核苷酸激酶[由Takara Shuzo製造]加入混合物中，並在37℃下溫育30分鐘。重複五次乙醇沉澱步驟以除去未摻入的[γ-32P]ATP。
將所得經標記的探針加入雜交溶液[5ml甲醯胺2ml 50％硫酸葡聚糖、200μl 50×Denhardt氏溶液、2.5ml 20×SCC、50μl酵母tRNA(50mg/ml)、100μl 10％SDS 1.3ml重蒸水]中以達終濃度為5×105cpm/ml，並將上面得到的Hybond-N膜移入此溶液中，經在50℃下保溫過夜進行雜交、然後於60℃下用含有0.1％十二烷基磺酸鈉(SDS)的2×SSC振蕩洗滌。此步驟重複三次，再在室溫下用含有0.1％SDS的0.1×SSC將Hybond-N膜振蕩洗滌1小時，然後乾燥。
放射自顯影結果顯明，被稱為pNs51的質粒具有一插入片段，它含有已與病毒基因組RNA雜交的約6,500個鹼基對(bp)。G)pNS51插入片段的序列測定為了繪製在pNS51中克隆之cDNA的限制性圖譜，用下列每種限制性酶消化質粒BamHⅠ、EcoRⅠ、HindⅢ、KpnⅠ、NcoⅠ、PstⅠ、SalⅠ、SphⅠ、SacⅠ、SmaⅠ、XhoⅠ、XbaⅠ及它們的配對。所得的圖譜如圖1所示。
隨後，將用限制性酶SalⅠ和PstⅠ消化得到的每一個片段插入到M13mp19 RFDNA中。為此，用限制性酶PstⅠ和SalⅠ消化pNS51，並在使用1×TBE的5％聚丙烯醯胺凝膠上電泳分離裂解產物。電泳後，用1μg/ml溴化乙錠使凝膠染色以在紫外燈下分辨出帶。用剃刀切割含有每一DNA帶的凝膠條，再用裝有Centricon-30(由Amicon製造)的電洗脫儀(由Amicon製造)進行洗脫。
使用DNA連接試劑盒(由Takara ShuzO製造)將每一片段插入到預先僅用SalⅠ或用PstⅠ和SalⅠ兩者消化，再用鹼性磷酸酶處理的M13mpl9中。
使用氯化銣法將所得重組M13mpl9RF-DNA(其中已使用T4DNA連接酶將片段插入)引入E.coli菌株JM109中。將已在M9基本瓊脂培養基上培養出的菌株JM109的單菌落接種於液體SOB培養基中並振蕩培養過夜。將0.6ml過夜培養物接種於50ml新鮮的SOB液體培養基中，在37℃下振蕩培養直至OD600nm達到0.5。4℃下5,000xg離心10分鐘以回收細胞；將片狀沉澱物輕輕懸浮在25ml TFB1緩衝液中並在冰上放置20分鐘。
將懸浮液以3,000xg再離心5分鐘，將片狀沉澱物懸浮於2mlTFB2緩衝液中，然後在上放置20分鐘以提供感受態細胞。
連接後，使用1至10μl如上所得的重組M13mp19 RF-DNA與100μl感受態細胞相混合，並在冰上放置1小時。然後將此混合物在42℃下保溫1.5分鐘，然後向混合物中加入500μl SOC液體培養基，在37℃下振蕩培養1小時。
在所得振蕩培養物中加入含有0.8％瓊脂、30μl 100mMIPTG、10μl 10％的5-溴-4-氯-3-吲哚基-1-半乳糖苷(X-gal)和100μl指示劑細菌(菌株JM109在37℃下，2×YT培養基中振蕩培養的過夜培養物)的2×YT培養基，將混合物散布於含有1.2％瓊脂的2×YT固體培養基上。混合物固化後，在37℃下過夜培養。隨後重組噬菌體表現為白色的噬菌斑。
將所得各白色噬菌斑以1/100的量接種於含有指示劑細菌的2×YT液體培養基中。在37℃下振蕩培養過夜。以10,000xg離心1分鐘後，將上清液冷凍或在4℃下貯藏以作為噬菌體溶液，細胞片狀沉澱物按製備質粒的標準方法處理，以回收RF雙鏈DNA(下文中簡稱為RF-DNA)，它是噬菌體的複製中間體。經用限制性酶消化證實插入片段的存在。
由此，得到51SS/M13mp19(例如，含有SalⅠ/SalⅠ片段的M13mp19，該片段本身又是含有來自CYVV基因組5′區域之PstⅠ-SalⅠ片段的51PS5′/M13mp19基因組的一部分)。按照標準方法，通過鹼-SDS和氯化銫密度梯度離心從這些噬菌體克隆中純化RF-DNA′S。
將5μg所得純化的DNA先用BamHⅠ裂解以得到5′粘性末端，再進一步用KpnⅠ裂解以得到3′粘性末端，下一步則根據伴隨有除去一個鹼基的系統(由Promega製造)的方案，加入核酸外切酶以從每一個cDNA線性化質粒的5′粘性末端分步缺失鹼基。用核酸外切酶的持續處理10分鐘，在1至10分鐘的不同時間取出樣品。因為載體有3′粘性末端，它不會受核酸外切酶的攻擊。用S1核酸酶處理得自1至10分鐘期間的不同樣品以將其切成平頭，再用T4DNA連接酶將其連接成環狀形式。
用上述氯化銣法將所得環狀重組M13 mp19 RF-DNA引入E.coli菌株JM109中。相應地，具有不同長度cDNA插入的重組噬菌斑作為白色噬菌斑被得到。
用常規方法從以上得到的重組噬菌體亞克隆中提取RF-DNA，以篩選具有不同長度插入段的克隆。經接種於含有E.coli指示劑菌株的液體2×YT培養基中，並在37℃下振蕩培養過夜，以分別培養篩選出的克隆。然後在4℃下以10,000xg將1.5ml每種培養物離心5分鐘取1ml上清液被轉移並新鮮試管中，並在試管中混合下加入250μl20％聚乙二醇水溶液(20％聚乙二醇#8000,2.5M氯化鈉)，然後在冰上放置30分鐘。將混合物在4℃下10,000xg離心5分鐘，並將所得片狀沉澱物懸浮於100μlTE緩衝液中。按前述方法進行苯酚提取和乙醇沉澱，從每份製劑中回收單鏈DNA(下文簡稱為SSDNA)噬菌體基因組。
使用ssDNA作模板，以雙脫氧鏈終止法測定進行上面所得每一個亞克隆的核苷酸序列。具體地說，使用7-脫氮雜-測序酶2.0變體dCTP試劑盒(由USB製造)，用[α-32P]dCTP(220TBq/mmol，由Amersham製造)標記噬菌體ssDNA。將所得反應產物在含有8M脲素、使用1×TBE為緩衝液的5％聚丙烯醯胺凝膠上電泳，乾燥凝膠，並經放射自顯影確定核苷酸序列。
通過分析pNS51的5′-PstⅠ-SalⅠ片段和M-SalⅠ-SalⅠ片段的核苷酸序列，我們可確定總共3,839個鹼基。
作為尋找以上所得序列中開放閱讀框架(下文簡稱為ORF)的結果，在病毒基因組的正意義鏈上測知了多肽的單個ORF。然後確定在ORF中編碼的多肽序列，使用GeneBank將此多肽序列與已知序列相比較的同源性研究表明它與TEV-HAT同源。
已知如TEV、梅痘病毒(plum pox virus)或脊髓灰質炎病毒(動物病毒)的病毒的成熟需通過蛋白酶的作用，蛋白酶通常裂解含有Gln-Ala、Gln-Ser或者Gln-Gly鍵的肽鍵[Willink J.和VanKammen,A.(1988),Arch.Virol.98:1-26]。對CYVV-No.30的外殼蛋白裂解位點的分析結果是我們可以在推斷出的多肽序列中發現三個裂解序列[Uyeda,I.et al.(1991)Intervirology 32:234-245]。從這些裂解位點的一個開始，自胺基酸序列位置4的Gly至位置437的Gln這段多肽被鑑定為來自CYVV的核包合體a。H)CYVV-NIa/IL-Ⅱ融合蛋白質的製備通過編碼Gln-Ala的連接序列將上述G)中鑑定為編碼CYVV NIa的DNA，在它的3′末端在碼內串聯連接到編碼人白細胞介素Ⅱ(IL-Ⅱ)的DNA上。
需檢查下列情況首先，上述G)中鑑定的DNA是否能編碼其有蛋白質水解活性的NIa；第二，此蛋白酶是否能切割所需的胺基酸序列；第三，當NIa是與所需異源蛋白質一起構成的融合蛋白質的一部分時，NIa的蛋白酶活性是否仍以類似於在被病毒感染的細胞中存在的方式存在；以及第四，裂解該融合蛋白所得的任何異源蛋白質是否能維持其完整性、結構和功能。
由於NIa本身是從病毒前體多肽上切割而產生的，所以NIa順反子沒有起始密碼子。因此，有必要在NIa基因的5′末端加上起始密碼子ATG。 NIa基因的3′端也必需在相同的ORF中與IL-Ⅱ基因的5′端相連接。為了解決這些問題，可利用在NIa基因中間存在的XhoⅠ酶的位點，以聚合酶鏈反應(PCR)技術來修飾NIa。
為了在NIa的5′末端(NIa5′)加上起始密碼子ATG和適於克隆的限制性酶NcoⅠ的識別位點，需製備PCR引物。所製備的序列是5′GTCCATGGGGAAAAGTAAGAGAACA 3′(稱為NSATG；序列ID:3)和5′ACTCTGAGACCGTGCTCGAG 3′(稱為NS×1；序列ID NO:4)。
將0.8μl dNTP溶液(dATP、dTTP、dCTP和dGTP各25mM)。10×Taq緩衝液(由Promega製造)和各1μg所得引物加到1μg質粒pNS51DNA中，混合物用重蒸餾水補足到100μl。加入5單位在10×Taq緩衝液中製得的DNA聚合酶以進行PCR。PCR程序為每次循環92℃,1分鐘； 37℃,1分鐘；72℃,2分鐘，重複20次，接著是92℃,1分鐘；37℃,1分鐘；72℃,30分鐘的單一循環。
將所得經擴增的DNA用苯酚提取並用乙醇沉澱，再在5％聚丙烯醯胺凝膠上電泳，通過溴化乙錠染色檢出含有DNA的一條帶，從凝膠上切下此帶並用裝有Centricon-30(由Amicon製造)的電洗脫儀(由Amicon製造)進行電洗脫。洗脫後，用Centricon(Amicon)在4℃下以7,500xg離心45分鐘，以濃縮和回收洗脫的DNA部分。經用苯酚提取和用乙醇沉澱進一步純化所得DNA濃縮物。
將1μg其中SacⅠ識別位點已被xhoⅠ識別位點取代的質粒pkk388-1(由Clonetech製造)分別用限制性酶NcoⅠ和XhoⅠ切割並用小牛腸鹼性磷酸酶(下文簡稱為CLAP；由Takara Shuzo製造)處理使之脫磷酸化。用連接試劑盒(由Takara Shuzo製造)將所得DNA與100ng已被NcoⅠ和XhoⅠ裂解並按上述方法脫磷酸化的pkk388-1連接，並將如此得到的重組DNA克隆到E.Coli TM 109中，從而得到質粒pKNI 5′，它以正常方向插入pkk388-1之trc啟動予的下遊(圖2)。
質粒pCD 20-2[Kawashima,1.et al.(1991),FEBS L.283:199-202]含有編碼IL-11前體(pre-IL-11)並具有分泌信號序列的cDNA。用限制性酶BanHⅠ和ApaⅠ切割該質粒，切下既含有IL-11前體(pre-IL-11)又含有SV40啟動子的區域。將此片段連接在pBluescript ⅡSK+的BamHⅠ和ApaⅠ位點之間，再用限制性酶XhoⅠ和kpnⅠ切割，即可產生編碼缺少成熟IL-11(Mat-IL-11)N末端之蛋白質的基因。
用T4連接酶將所得Mat-IL-11片段(缺少其N末端)整合到已預先用限制性酶xhoⅠ和kpnⅠ裂解並已用CIAP處理過的pKNI5中。我們將所得構建體定名為pKNI 5IL(圖3)。為了通過Ala在NIa的C末端將此特定序列與Mat-IL-11相連接，同時保持相同的閱讀框架，需合成四種PCR引物5′AGGAAAAGAGTTCCTCGAGC 3′(稱為NS×2；序列ID NO:5),5′AATTGTTCATTCCAAGCACCTGGGCCACCACCTGGC 3′(稱為NSJ 001P；序列ID NO:6),5′GCCAGGTGGTGGCCCAGGTGCTTGGAATGAACAATT 3′(稱為NSJ002N；序列ID NO:7),5′TTGTCAGCACACCTGGGAGCTGTAGAGCTC 3′(稱為ILSAC；序列IDNO:8)。
所進行的第一個PCR反應使用了NS×2和NDJ002N引物對，用PNS51 DNA作模板以擴增編碼NIa之C末端的插入區域(被稱為CNI3區域)。另一個PCR反應則是使用NSJ001P和ILSAC引物對，用pNS 51DNA作模板以擴增編碼IL-11肽之N末端的插入區域(被稱為5′IL區域)。PCR程序是將92℃,1分鐘；37℃,1分鐘和72℃,2分鐘的循環重複20次，然後是92℃,1分鐘；37℃,1分鐘和72℃,30分鐘的單一循環。從每個PCR步驟中得到的產物用苯酚抽提再用乙醇沉澱，然後經受5％聚丙烯醯胺凝膠電泳。切割下含有經擴增之DNA帶的凝膠帶，並使用上述電洗脫法從凝膠條中電洗脫回收DNA。結果如圖4中所示。
所得兩個經擴增的DNA片段是引物NSJ 001P和NDJ002N的區域，即CIN 3 DNA片段的3′末端部分和5′IL DNA片段的5′末端部分，它們在核苷酸序列上有部分同源性。因此，如果使用引物NS×2和ILSAC再進行PCR，同源的部分就會雜交以致於可以得到含有兩基因部分的融合的DNA，同源部分是作為連接部分來起作用的(圖5)。相應地，將所得CIN3 DNA片段和5′IL DNA片段混合，僅使用NS×2和ILSAC作為引物再進行PCR。此PCR程序包括10次循環92℃,1分鐘；37℃,1分鐘和72℃,2分鐘；然後是20次循環92℃,1分鐘；45℃,1分鐘和72℃,2分鐘，最後是一個單循環92℃,1分鐘；55℃,1分鐘和72℃30分鐘。經苯酚處理和乙醇沉澱後，進行5％聚丙烯醯胺凝膠凝膠電泳以獲得CNI3IL DNA片段，其中融合了CNI3和5′IL。方法示於圖5中。
用限制性酶XhoⅠ裂解CNI3 IL DNA片段，並使用T4DNA連接酶將所得片段插入已預先被限制性酶XhoⅠ裂解，並經CIAP脫磷酸化的pKNI 5′中。將所得質粒克隆到E.Coli菌株JM109中。為了選擇出其中CNI 3IL片段已在正確方向插入的克隆，從所得克隆中提取質粒並用引物NSX2和ILSAC連行PCR。使用此系統，只有從其中以正確方向插入了該片段的克隆中才可檢測到DNA帶。從而得到質粒pKSUN 9,其中通過裂解序列Gln-Ala將NIa和Mat-IL-11連接在同一閱讀框架中(圖6)。I)在細菌細胞中表達Ala-IL-11將攜帶有質粒pKSUN 9的E.Coli(下文簡稱為菌株KSUN9)在5ml含有42μg/ml青黴素的LB培養基中，37℃下振蕩培養過夜。將2.5ml所得KSUN9培養物加到250ml新鮮LB培養基中(含有相同量的青黴素)，並在37℃下振蕩培養直至OD600nm達到1.0。一旦OD600nm已達到1.0，即加入IPTG直至終濃度為0.1mM，同時將混合物在28℃下繼續振蕩培養12小時。
確切按照相同步驟生產第二份培養物，不同的是最終培養是在28℃下進行36小時或更長時間(所加IPTG的濃度為1mM)，以獲得成熟的IL-11(它有N末端Pro)。J)western印跡法進行western印跡分析是為了確定pKSUN9在E.Coli中是否有功能以及所構建的重組基因是否被表達。
經IPTG誘導的12和36小時培養物均進一步按下述步驟處理。在4℃下，3,000xg離心5分鐘，從2ml培養物中回收細胞，將片狀沉澱物懸浮於100μl 20mM硼酸鈉緩衝液(用0.1N NaOH將pH調至9.0)中。將所得懸浮液用超聲波發生器處理(手提式超聲波發生器UR-20P，由Tomy Seiko Co製造)，其中置於8處處理2分鐘以使細胞破碎，並在4℃下，10,000xg離心10分鐘。回收含有可溶蛋白質部分的上清液。按照Laemmli方法[Laemmli,U.K.(1970),Nature 227:680-685]取5μl上清液在12％SDS聚丙烯醯胺凝膠上進行電泳。
電泳後，將凝膠在轉移緩衝液(25mM Tris,192mM甘氨酸，20％甲醇)中振蕩5分鐘，並吸印在一片PVDF膜(跨過印跡轉移介質，由Bio-Rad實驗室製造)上。此吸印步驟是使用Trans-Blot-SD Semi-DryTransfer Cell(由Bio-Rad實驗室製造)，在15V下處理1小時完成的。將被吸印的PVDF膜用PBS-Tw培養基洗10分鐘，洗過的PVDF膜被轉移到含有5％脫脂牛奶(由Snow Brand Milk Pmoducts製造)的PBS-Tw中，在37℃下封閉1小時。
封閉後，將PVDF膜在PBS-Tw中進一步洗滌，10分鐘一次，5分鐘兩次，然後將其轉移到在PBS-Tw中被稀釋10,000倍的抗IL-11兔血清中，在37℃下保溫20分鐘。再用PBS-Tw洗PVDF膜，一次洗10分鐘，再兩次各洗5分鐘。
將PVDF膜再轉移到用辣根過氧化物酶(由Amersham製造)標記的，並用PBs-Tw稀釋了5,000倍的抗兔IgG羊抗體中，在37℃下保溫20分鐘。然後再用PBS-Tw洗PVDF膜，一次洗10分鐘，再四次各5分鐘。
進一步洗滌後，將PVDF膜用提示的化學發光(ECL)檢測劑(由Amersham製造)處理，將PVDF膜與x-射線膠片接觸30秒至5分鐘，顯示出與抗IL-11抗體反應的帶。
作為上述Western吸印試驗的結果，從12小時和36小時培養物中都發現了相應於分子量約50KDa和約23KDa的信號帶。23KDa的帶顯示出基本上與作為對照的成熟IL-11有相同的遷移率。因此，23KDa信號帶似乎就是Gln-Ala連接序列處被NIa的蛋白質水解活性從NIa/IL-11融合蛋白質中裂解下來的IL-11。可以推斷較重的帶(50KDa)即為未裂解的融合蛋白質。
下文中，從12小時培養物中得到的23KDa蛋白質被稱為23KDa-ON，從36小時培養物中得到的23KDa蛋白質被稱為23KDa-36hr。K)23KDa-ON和23KDa-36hr蛋白質的純化23KDa-ON和23KDa-36hr蛋白質需經純化以測定它們N末端的胺基酸序列。按照上文Ⅰ)中所述的相同步驟得到各250ml 12小時和36小時培養物。然後培養物再進一步按下述方法處理。將培養物在4℃下5,000xg離心15分鐘，將片狀沉澱物懸浮於10ml 20mM硼酸鹽緩衝液(pH9.0)中，再用French擠壓器或超聲波發生器破細胞。在4℃下15,000xg離心30分鐘後，回收作為上清液的可溶性蛋白質部分。
使用Pharmaria製造的FPLC，利用下述條件對所得可溶性蛋白質部分進行弱離子交換柱層析柱CM Toyopearl Pack 650M(2.2×20cm，由Toso製造)洗脫緩衝液A=10mM硼酸-氫氧化鈉(pH9.0),13mM氯化鉀B=10mM硼酸-氫氧化鈉(pH9.0),13mM氯化鉀，400mM氯化鈉流速2.5ml/分鐘鎦分體積5ml/管所用的濃度梯度是在120分鐘期間從洗脫液A至洗脫液B的線性梯度。
隨後對被洗脫下的每一部分進行酶聯免疫吸附分析(ELlSA)，以找出含IL-11的部分。
ELISA按下述步驟進行。96孔免疫板(Maxisoap；由Nunc製造)的每一孔都裝有含1μg/ml抗IL-11小鼠單克隆抗體的100μl 50mM碳酸鈉緩衝液，將此板置37℃下保溫1小時，然後用PBS-T介質(含有0.1％吐溫20的PBS)將各孔洗四次。
將按上述方法製得的FPLC部分分別用PBS-T稀釋100倍，並以100μl/孔的等分樣品裝進孔中。將板置37℃保溫1小時，再用PBS-T洗滌各孔，然後在各孔內裝入100μl用PBS-T稀釋直至終濃度為1μg/ml的抗IL-11兔IgG。
將此板置37℃下繼續保溫1小時，並用PBS-T洗滌，然後在各孔中裝入100μl已被PBS-T稀釋3,000倍的鹼性磷酸酶標記的羊抗兔IgG抗體(由Gibco Bethesda Research Laboratories製造)。將此板再置37℃下保溫1小時，然後用PBS-T洗。再在各孔中裝入100μl鹼性磷酸酶底物溶液。將此板置室溫下繼續保溫30分鐘至1小時，然後檢測各孔的顏色變化(405nm的吸光度)以鑑定感興趣的部分。
合併從FPLC步驟中得到的、用上述ELLSA方法鑑定為含有可與兔抗IL-11抗體反應之物質的部分(第19-25管)，用Centprep-10(由Amicon製造)濃縮100倍，然後按Laemmli方法(文獻同上)在12％SDS聚丙烯醯胺凝膠上電泳。將凝膠電吸印到一片PVDF膜上，所用方法與上述Western印跡方法中所用的相似，只是使用Problot膜(由Applied Biosystems製造)作為PVDF膜。
吸印後，用重蒸餾水徹底洗膜，用考馬氏亮藍R-250染色，用50％甲醇脫色，然後切下含有在Western印跡中可與抗IL-11抗體反應的蛋白質帶。
用蛋白質測序儀(由Applied Biosystems製造)分析此蛋白質N末端的胺基酸序列，來自可與抗-LL-11抗體反應的23KDa-ON帶的N末端序列被測定為Ala-Pro-Gly-Pro-Pro-Pro-Gly-(序列ID NO:9)此序列符合成熟IL-11蛋白質胺基酸序列的胺基酸序列-1至+6，根據這一發現，可推斷從12小時培養物得到的，並與抗-LL-11抗體反應的23KDa蛋白質是Ala-IL-11。相應地，可明顯看出此蛋白質是通過NIa的蛋白質水解活性在特異裂解序列的Gln-Ala位點上裂解NIa/IL-11融合蛋白質而產生的。
可與抗-IL-11抗體反應的23KDa-36hr帶的N末端序列被測定為Pro-Gly-Pro-Pro-Pro-Gly-Pro(序列ID NO:10)此序列符合成熟IL-11的胺基酸序列+1至+7。因此，可得出下列結論。
經用IPTG誘導後，NIa/IL-11融合蛋白質可在E.Coli.中得以表達。
經誘導後培養12小時，所表達的NIa/IL-11融合蛋白質由NIa的蛋白酶活性在其特異裂解序列的Gln-Ala肽鍵處被裂解。
用NIa裂解肽鍵後，成熟的但在其N末端有一額外Ala的IL-11可在E.Coli中得以表達。
Ala-IL-11的表達被確立後，繼續培養24小時，Ala-IL-11成熟為IL-11，其中存在於Ala-IL-11之N末端上的Ala殘基被刪除了。
根據上述發現，可以推斷出培養36小時後得到的23KDa蛋白質是N末端為Pro的成熟型的IL-11。
因此，可以確定IL-11可與NIa一起表達為融合蛋白質，而NIa的活性可以裂解含有Gln-Ala的特異性接頭序列以產生Ala-IL-11。連續培養可以產生成熟的IL-11，其中通過E.Coli中存在的因子刪除了丙氨酸殘基而暴露出脯氨酸N末端。
為了確保所表達的IL-11和Ala-IL-11具有生物學活性，以脂肪生成抑制因子(AGIF)活性被作為檢測指標。IL-11具有脂肪生成抑制活性這一事實先前已被證明[Kawashima,I.et al(1991),FEBS L.283:199-202]。L)檢測對從3T3-L1細胞變成脂肪細胞之形態學變化的抑制作用本發明所用的檢測AGIF活性的方法如下。使用從ATCC購買的小鼠胚胎成纖維細胞細胞系3T3-L1[Green,H.and Kehinde,O.(1974),Cell 1:113-116]。在所有情況下，此細胞都被置於10％CO2-90％空氣混合的潮溼氣體中，在37℃下培養並用培養基A進行次級培養。按照下述由Rubin等人描述的方法[Rubin,C.S.et al.(1978),J.Biol.Chem.253:7570-7578]進行脂肪生成分化的誘導。
將3T3-L1細胞懸浮於培養基A中至密度為1.0×104細胞/ml，並接種於48孔的多組盤(由Coaster製造，0.5ml/孔)中，然後培養。培養3天後，細胞達到匯合狀態。用新鮮培養基A替換原培養基，再培養2天後，用脂肪生成的誘導培養基，培養基B替換原培養基，同時一起加入0.5ml樣品。每隔兩天用新鮮培養基B和新鮮樣品替換原培養基。
用脂肪細胞維持培養基即培養基C而不是培養基B取代孔中已耗盡營養的培養基。在第一次加入試樣後4天至7天間對於不同的孔在不同的時間開始上述替換。
在培養基C中培養2天後，用5％甲醛固定細胞，分別用油紅0和蘇木精著染在細胞和細胞核中積累的任何脂肪顆粒。進行顯微攝影並計數積累有被染色之脂肪顆粒的細胞數目。按公式計算脂肪生成率(AR)AR(％)=100×積累脂肪顆粒的細胞數目/總的細胞數目根據Yoshio Mitomo和Shojiro Takayama在由IshiyakuShuppan出版的″Lectures on Clinical Testing″Vol.12,″Pathology″(1982)中描述的方法進行細胞固定和用油紅0及蘇木精染色。M)脂蛋白脂酶抑制活性的測定方法按照Beutler等人所描述的方法[Beutler,B.A.et al.,(1985),J.Immonol.135:3972-3977]進行此項測定。按上文L)中所述方法，製備脂肪生成分化的3T3-L1細胞，不同的是當誘導化分成脂肪細胞時不加入試樣。另外亦可將試樣和新鮮的培養基C一起加入，並將細胞培養18小時。
然後，棄去培養基，細胞用PBS(-)(磷酸鹽緩衝鹽水，由NissuiSeiyaku配製)洗滌兩次，再往每孔內加入300μl培養基D繼續培養1小時。從每份培養物上清液中取出100ml的等份樣品用於檢測脂蛋白脂酶(LPL)活性，每份樣品測三次得到一平均數。
LPL活性按Nilsson-Ehle和Schotz[Nilsson-Ehle,P.andSchotz,M.C.(1976),J.Lipid Res.17:536-541]所述的方法測定。將上面所得的每份上清液等份樣品與等體積的LPL底物溶液混合，37℃反應120分鐘。加入1.05ml 0.1M碳酸鉀緩衝液(用0.1M硼酸鉀調至pH10.5)和3.25ml的甲醇∶氯仿∶庚烷[141∶125∶100(V/V)]混合液，劇烈攪拌使反應停止。然後將混合物在室溫下3,000xg離心15分鐘。用液體閃爍計數器測定水一甲醇相中的3H含量。
1單位LPL活性定義為每分鐘產生lμmol脂肪酸所需的活性。在底物溶液中的13mM的甘油三[9,10(n)-3H]油酸酯通過稀釋甘油三[9,10(n)-3H]油酸酯，(37.0GBq/mol)製得，後者是由Amersham用三油酸甘油酯(Sigma生產)製造，然後用矽膠柱層析法純化的。
下列實施例涉及體現本發明的穀胱甘肽還原蛋白質。
實施例1從KM-102細胞中抽提poly(A)=RNA將KM-102細胞置於36個直徑為15cm塑料培養皿中添加含10％小牛血清的Iscove氏改良的基本培養基(Boeringer-Mannheim)中進行培養。
當細胞長到匯合時，加入佛波醇十四烷基乙酸酯(PMA)和鈣離子載體A23187(Sigma)，使其終濃度分別為10ng/ml和0.2μM，並在37℃下繼續培養。在3、6和14小時後，分別收集12個培養皿中的細胞，每個培養皿的細胞分別溶於硫氰酸胍溶液中，並收集液相。
poly(A)+RNA的分離基本上按″Molecular Cloning-A Laboratory Manual″[Maniatis,T,et al.(1982).196-198]中所述方法進行。現對這一方法詳細描述如下。
對每份回收的液相樣品分另作如下處理。液體用一裝有21G注射針頭的10ml注射器反覆吸入和推出。在與RPS 40-T離心機(Hitachi koki)轉子採樣桶大小相稱的Polyaromar離心管中預先加入3ml 5.7M CsCl-0.1M EDTA(p7.5)溶液，然後將細胞樣品加到溶液上直到將管裝滿。
20℃下以30,000rpm離心18小時後，將所得沉澱餅懸浮於400μl蒸餾水中，再用乙醇沉澱。將所得沉澱團塊溶解於400μl蒸餾水中。邊攪拌邊加入等體積的氧仿/1-丁醇混合物(4∶1,V/V)，並離心分離收集水層。再次用乙醇沉澱，將所得沉澱物溶於600μl蒸餾水中以得到總RNA。分別匯集用pMA/A23187刺激3、6和14小時後的樣品，得到大約4.5mg的總RNA。
合併用這種方法得到的三種類型總RNA各600μg，並經Oligo(dT)纖維素柱層析純化poly(A)+RNA。
將總RNA溶於吸附緩衝液中，65℃加熱5分鐘。將所得溶液加到裝有吸附緩衝液的Oligo(dT)纖維素柱(Pharmacia,7型)上，並用洗脫液洗脫以回收100μg poly(A)+RNA。
實施例2製備cDNA文庫用Okayama-Berg方法製備cDNA文庫。
使5μg Poly(A)+RNA和24單位逆轉錄酶(Seikagaku Corp.)在20μl逆轉錄酶反應溶液中42℃反應1小時。
加入2μl 0.25M EDTA和1μl 10％SDS以終止反應，然後用20μl苯酚/氯仿混合液(1:1,V/V)使溶液去蛋白。離心除去蛋白質部分後，向上清液中加入20μl 4M乙酸銨和80μl乙醇，然後於-70℃下冷卻15分鐘。離心分離收集沉澱物，用75％乙醇洗，並減壓乾燥。
將乾燥的沉澱物溶於15μl末端轉移酶反應溶液中，37℃加溫3分鐘。然後向反應溶液中加入18單位的末端脫氧核苷醯轉移酶(Pharmacia)，反應5分鐘。加入1μl 0.25M EDTA和0.5μl 10％SDS終止反應，溶液用苯酚-氯仿(如上所述)脫蛋白。離心去除蛋白部分，收集上清液與15μl 4M乙酸銨和60μl乙醇徹底混合，將混合物於-70℃下冷卻15分鐘，並離心收集沉澱物。
將所得沉澱團塊溶解於10μl限制性酶緩衝液中，加入2.5單位的限制性酶HindⅢ,37℃消化1小時。
反應溶液再用苯酚-氯仿去蛋白，隨後用乙醇沉澱並將上清液於-70℃下冷卻15分鐘。離心收集所得沉澱物並溶解於10μl TE緩衝液[10mM Tris-HCl(pH7.5)和1mM EDTA]中。用1μl所得的溶液製成10μl的反應溶液，其中含10mM Tris-HCl(pH7.5)、1mMEDTA、100mM NaCl和10ng Oligo(dG)-尾部接頭DNA[3′-Ologo(dG)-接尾的PL-1 HindⅢ接頭，Pharmacia]，於65℃加熱5分鐘，然後於42℃加溫30分鐘。反應混合物用冰水冷卻。然後向其中加入10μl 10×連接酶緩衝液、78μl蒸餾水和8單位T4 DNA連接酶。反應溶液於12℃下保存過夜。
第二天，將反應混合物與10μl含1M KCl、1單位核糖核酸酶H、33單位DNA聚合酶I、4單位T4DNA連接酶、0.5μl dNTP溶液(20mMdATP,20mM dCTP,20mM dGTP和20mM dTTP)及0.1μl 50μg/ml牛血清白蛋白(BSA)的溶液混合，所得混合物先在12℃溫育1小時，然後在25℃加溫1小時。之後，反應溶液用蒸餾水稀釋5倍，再用Hanahan方法[hanahan D.(1983)J.Mol.Biol.166,557-580]直接以其轉化E.Coli DH 5α，由此製備KM-102細胞的cDNA文庫。
實施例3製備寡核苷酸探針根據細胞素mRNA之3′非翻譯區的AUUUA序列，用化學方法合成命名為ATT-3的15個鹼基的寡核苷酸5′-TAAATAAATAAATAA-3′(序列ID NO(3)。合成使用380B型自動DNA合成儀(Perkin-Elmer Japan AppliedBiosystems)，按其所附手冊提供的說明進行操作。所用的方法是Caruthers等人[Matteucci,M.D.and Caruthers,M.H.(1981)J.A.Chem.Soc.103,3185-3191]所描述的磷醯胺方法。當合成15-mer後，將所得的寡核苷酸從支持物上分離下來並去掉保護基團。所得的寡核苷酸溶液凍幹形成粉末，然後溶於蒸餾水，貯存於-20℃下備用。
實施例4篩選cDNA文庫按照Grunstein和Hogness[Grunstein,M.and Hogness,D.S.(1975)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 72,3961-3965]所述的方法，將由上面實施例2製備的cDNA文庫產生的6,500個集落固定到硝酸纖維濾膜上。將實施例3中製備的ATT-3探針按標準程序(見″MolecularCloning-A Laboratory Manual″)用32P作5′標記，並用標記的探針進行集落雜交。
預雜交在下述溶液中37℃進行3小時6×SSC、1×Denhardt溶液、0.25％SDS、0.05％焦磷酸鈉和100μg/ml變性魚精DNA。然後，在下述溶液中，31℃下雜交過夜6×SSC、1×Denhardt溶液、17μg/ml酵母tRNA和0.05％含32P-標記之探針ATTT-3的焦磷酸鈉溶液。
第二天用含0.05％焦磷酸鈉的6×SSC溶液室溫將硝酸纖維繫濾膜洗2小時。隨後的放射自顯影發現33個陽性克隆。
按下述標準程序從陽性克隆中提取質粒DNA。隨機挑選幾個克隆用雙脫氧鏈終止法測定其部分cDNA核苷酸序列。然後，通過個人計算機比較這些部分序列與記錄在EMBL或GenBank資料庫的核苷酸序列的同源性，發現由ATT-3檢測到的克隆之部分序列中的某些與Alu重複序列的一些部分有同源性[Schmid,C.W.and Jelinek,W.R.(1982).Science 216,1065-1070]。
按標準方法從人基因組DNA製備含有Alu重複序列的DNA片段並用32P標記之。用該標記的DNA作為使用如上鑑定的33個克隆進行的集落雜交中的探針，進一步發現12個克隆具有Alu重複序列。確定剩下的21個克隆的cDNA插入序列的長度，證實該長度變化範圍為50至3，600個鹼基。
對剩下的21個克隆的cDNA插入序列進行限制性酶切圖譜分析，並按上述方法測定部分核苷酸序列。然後，按上文所述方法通過個人計算機檢測這些部分序列與登記在EMBL或GenBank資料庫中的核苷酸序列的同源性，並選擇出那些具有新序列的克隆。
實施例5第31號克隆的Northern雜交其中的一個克隆，第31號克隆(命名為pcD-31)具有一個大約560bp的cDNA插入序列。從pcD-31的cDNA插入片段得到一個PstⅠ-AatⅠ片段(292bp)並用32P標記，將其用作Northern印跡程序中的探針，這一程序使用從KM-102細胞製備的poly(A)+並與實施例1的程序相似。這一雜交用於測定與pcD-31插入序列相對應的天然形成之mRNA的長度。
Northern雜交的程序如下從KM-102細胞中製備5.5μg poly(A)+RNA並在1M乙二醛、50％二甲亞碸(DMSO)和0.0M磷酸氫二鈉(pH7.0)的混合液中50℃溫育1小時。向保溫的混合物中加入4μl的電泳顏料，然後在1×TAE中用1％瓊脂糖凝膠電。
電泳後，使用毛細管轉移法(見″molecular Cloning-aLaboratory Manual″)以20×SSC將瓊脂糖凝膠上的RNA過夜轉移到尼龍濾膜(Bio Rad,Zeta-Probe)上。轉移後，用2×SSC輕輕洗濾膜，空氣乾燥，再在80℃下繼續乾燥2小時以固定mRNA。
使用Multiprime DNA標記系統(Amersham)，用32P標記pcD-31的PstⅠ-AatⅠ片段。
預雜交在含有5×SSCP,2.5×Denhardt溶液，50％甲醯胺，10mM磷酸氫二鈉(pH7.0),0.5％SDS和100μg/ml變性魚精DNA的溶液中，於37℃下在濾膜上進行3小時。
在含32P-標記的探針、5×SSCP、1×Denhardt溶液、50％甲醯胺、10mM磷酸氫二鈉(pH7.0)、0.1％SDS和100μg/ml變性魚精DNA的溶液中，於42℃下在濾膜上雜交過夜。第2天，濾膜先用含50％甲醯胺、5×SSC和0.1％SDS的溶液37℃洗濾膜1小時，然後再在含有40％甲醯胺、5×SSC和0.1％SDS的溶液中，於相同溫度下洗2小時。最後，在2×SSC溶液中室溫下洗15分鐘。繼後的放射自顯影表明，克隆pcD-31的cDNA插入片段並不是全長度，而且相應mRNA全長為3.9kb(根據分子量標記物的校準曲線測知)。
實施例6製備用於篩選克隆pcD-31cDNA的新文庫使用cDNA合成系統正型和cDNA克隆系統(λgt10，連接物方法，由Amersham提供)製備新cDNA文庫。
從KM-102細胞提取5μg poly(A)+RNA(按與實施例1相似的程序)，加入100單位逆轉錄酶，並在50μl逆轉錄酶反應溶液中於42℃下反應40分鐘。然後向反應溶液中加入20μCi[α-32P]dCTP,93.5μl第二鏈緩衝液，4單位核糖核酸酶H和115單位DNA聚合酶Ⅰ均隨試劑盒提供)，先於12℃溫育1小時，然後於22℃溫育1小時，最後於70℃加熱10分鐘。加熱處理後，加10單位T4DNA聚合酶(隨試劑盒提供)到反應溶液中，於37℃反應10分鐘。
然後，反應混合物用苯酚-氯仿去蛋白質。將反應液離心收集上清液，並與250μl4M乙酸銨和1ml乙醇充分混合。混合物冷卻到-20℃過夜並離心收集沉澱物。將所得沉澱物溶於30μl無菌水中。取出10μl所得的溶液，加到由2μl連接酶/激酶緩衝液、250pmoleEcoRⅠ連接物和5單位T4 DNA連接酶(均隨試劑盒提供)組成的混合物中，於15℃培養過夜。然後將全部反應溶液加到隨試劑盒提供的篩析層析柱上層析除去EcoRⅠ連接物。反應液收集成120μl的等份樣品，每等份與200μl 0.25×TE緩衝液混合。將第10到第17等份合併，並用丁醇濃縮到總體積為120μl。
然後將全部濃縮製品與55μl無菌水、20μl連接酶/激酶緩衝液和40單位T4多核苷酸激酶(均隨試劑盒提供)混合，並將所得混合液於37℃溫育30分鐘。然後將反應混合物以苯酚-氯仿提取法脫蛋白三次，再用乙醇沉澱，-20℃冷凍過夜。離心收集所得沉澱物並溶解於10μl無菌水中，作為備用cDNA樣品。
每2μl cDNA樣品中加入1μg λgt10的EcoRⅠ臂、1μl連接酶/激酶緩衝液和2.5單位T4 DNA連接酶(均隨試劑盒提供)，然後於15℃培養過夜。以同樣方法製備含4μl cDNA樣品的樣品。每份樣品進一步按下述方法處理。首先將所得的全部反應溶液加到10μl抽提物A(隨試劑盒提供)中，然後將所得混合物加到15μl提取物B(隨試劑盒提供)中，並將所得混合液於20℃溫育20分鐘，以便發生體外包裝反應。
然後，向反應溶液中加入470μl SM緩衝液並貯存於4℃下。用貯存的溶液感染經10mM MgSO4處理過的E.Coli菌株NM514，以產生KM-102 cDNA的λgt10文庫。
實施例7cDNA文庫的篩選將從實施例6中製備的合併的cDNA文庫中產生的2×105個噬菌斑，按下述方法固定在尼龍濾膜(Hyband N,Amersham)上。
將實施例6中製備的感染的E.Coli培養在10個含固態LB培養基的9cm培養皿中，以使每個培養皿形成1至2×104個噬菌斑。通過輕壓培養皿上的尼龍濾膜將噬菌斑轉移到培養皿上。然後用18G注射器針頭穿刺濾膜並在凝膠上標記3個位置用於參考。將濾膜於4℃下放置5到10分鐘後，揭去濾膜並浸入鹼性溶液(0.1N NaOH,1.5MNaCl)中20秒鐘。然後將濾膜轉移到中性溶液
中20秒至1分鐘，再在室溫下空氣乾燥2小時。最後，將濾膜置於80℃下乾燥2小時。
實施例8探針的製備和雜交使用Multiprime DNA標記系統標記pcD-31(實施例4)的PstⅠ-AatⅠ片段和EcoT 221-AatⅠ片段(223bp)，製得來自pcD-31的32P-標記的探針。使用上述探針與實施例7所得的濾膜進行噬菌斑雜交。
將濾膜放在50％甲醯胺、5×SSCP、2.5×Denhardt溶液、0.01M磷酸氫二鈉(pH7.0)、0.5％SDS和100μg/ml變性魚精DNA的混合溶液中37℃溫育2小時以進行預雜交。
然後將濾膜放在含上面製備的32P標記之探針和50％甲醯胺、5×SSCP、1×Denhardt溶液、0.01M磷酸氫二鈉(pH7.0)、0.1％SDS和100μg/ml變性魚精DNA的反應溶液中37℃溫育過夜，以完成雜交步驟。
第二天，先用含50％甲醯胺、5×SSC和0.1％SDS的溶液室溫洗濾膜3小時，然後再用2×SSC室溫洗5分鐘。放射自顯影顯示出初篩得到80個陽性克隆。
用每次被鑑定為陽性的克隆，再重複實施例7和8的程序三次(四次篩選)，最終得到共17個陽性克隆。從17個克隆中分別分離其cDNA，用EcoRⅠ切下插入片段。通過瓊脂糖凝膠電泳測定每個cDNA插入片段的長度，並分離出具有3.9kbp之cDNA插片段、相當於原始mRNA的全長的31-7號克隆。
實施例9第31-7號克隆的限制性圖譜用EcoRⅠ消化第31-7號克隆以分離並純化含cDNA插入段的3.9kb片段。再用T4DNA連接酶將此片段插入PUC18中。用這一新質粒轉化E.coli DH 5α。根據抗氨苄青黴素抗性束選擇轉化的細胞。用EcoRⅠ消化DNA並對裂解的DNA作瓊脂糖凝膠電泳分析以鑑定有3.9kbpcNDA插入段的pUCKM3-7克隆。
分別用限制性酶HindⅢ、SacⅠ、XbaⅠ、SmaⅠ、Bg 1Ⅱ、EcoT22Ⅰ和AatⅠ裂解或用其中兩個酶同時裂解pUCKM31-7。對所得的片段作瓊脂糖凝膠電泳分離，用λHindⅢ/ΦX174 HaeⅢ標記物作指示劑測出各片段的長度。所得的限制性圖譜如圖7所示。
實施例10第31-7號克隆的序列測定使用M13噬菌體通過雙脫氧鏈終止法測定pUCKM31-7cDNA插入段的全部核苷酸序列。另外，用373A DNA序列儀(Perkin-ElmerJapan Applied Biosystems)分析該一部分序列。所得的核苷酸序列為列於序列表中的ID No.11。
PUCKM31-7cDNA插入段為3815個鹼基長，清楚地具有一個由549個胺基酸組成，起始胺基酸為蛋氨酸的閱讀框架。顯然沒有poly(A)尾部。比較pcD-31插入段3′端的鹼基順序與克隆pUCK31-7的順序表明，pUCKM31-7插入段僅丟失了poly(A)尾部(圖8)，而無其它缺失。
為了比較鹼基和胺基酸順序，分別檢查了EMBL和GenBank核苷酸資料庫2NBRF和SWISS-PROT資料庫。發現最相近的匹配是該肽序列與人穀胱甘肽還原酶有35.3％的同源性。由此推論pUCKM31-7cDNA插入段的ORF清楚地編碼一個新的多肽。該新的多肽即為所附序列表中的序列ID No.12。
實施例11新多肽的表達和純化高表達載體的構建及在COS-1細胞中的表達按標準程序用HindⅢ消化pUCKM31-7並分離和純化含cDNA插入片段的3003bp片段。用DNA修平端試劑盒(Takara Shuzo)使所得片段的末端變為平端。
同時，高表達載體pCDL-SRα296[Takabe.Y.et al.(1988)Mol.Cell.Biol.8,466-472]用PstⅠ和KpnⅠ消化並用DNA修平端試劑盒使其末端變為平頭。用T4DNA連接酶將修成平頭的插入序列連接到修成平頭的質粒中。用氯化鈣法以所得的DNA轉化E.coli。挑選所得的AmpR轉化細菌，分析保留在細菌內的質粒DNA。
經用HindⅢ和BglⅡ消化質粒，然後瓊脂糖凝膠電泳定位800bp片段，選擇出一個cDNA轉錄方向與SRα啟動子方向一致的菌株，並將選出的質粒命名為pSRα31-7(圖9)。SRα啟動子含有SV40早期啟動子和HTLV-1長末端重複(LTR)的R-U5序列，並具有比單獨的SV40早期啟動子強10到100倍的啟動活性。
然後，用所得的質粒pSRα31-7轉染COS-1細胞。用GTE-1基因導入裝置(Shimadzu)經電穿孔轉染COS-1細胞。
COS-1細胞在七個150cm3培養瓶的底部生長到半匯合。每個瓶裡有25ml DMEM(含10％小牛血清)培養基。收集培養基並各用3mlTrypsin-EDTA溶液(10x溶液可從Sigma得到)處理，室溫放置直至細胞分離。加入1ml滅活的小牛血清和9ml新鮮trypsin-EDTA溶液，離心收集細胞。然後將收集的細胞用PBS(-)緩衝液洗滌二次並以6×107細胞/ml的密度重新懸浮於PBS(-)緩衝液中。
同時，用氯化銫法製備質粒DNA並在PBS(-)緩衝液中配成200μg/ml。
將上面提到的PBS(-)細胞和質粒樣品各20μl混合，將所得的混合物放入含有以2mm間隔分開之電極的小室中。對混合物以1秒鐘間隔施加2個600V的脈衝，每個持續時間為30微秒。
電極小室於4℃冷卻5分鐘，然後，將裡面的細胞DNA混合物與含10％小牛血清的10ml DMEM混合。將該混合物轉移到Petri培養皿中，在5％CO2氣體中37℃培養過夜。第二天，棄去培養物上清液，細胞用無血清DMEM洗滌並重懸於10ml DMEM中，37℃培養3天。然後，收穫細胞上清液。
同樣收集陰性對照培養物的上清液。陰性對照使用不含cDNA插入段的pCDL-SRα296質粒，但用與試驗培養物同樣的方式製備。
1ml陰性對照和試驗培養物的培養上清液分別按以下程序處理。上清液先用三氯乙酸(TCA)處理以沉澱蛋白質，離心收集沉澱物。將所得沉澱物用冰凍丙酮洗滌後空氣乾燥。然後溶於含2-巰基乙醇的SDS-聚丙烯醯胺凝膠電泳(SDS-PAGE)樣品緩衝液中。SDS-PAGE於還原條件下在12.5％凝膠上進行。
對電泳帶的銀染色使用銀染色試劑″Daiichi″(DaiichiChemical Detection)進行。試驗樣品培養物上清液的幾個特定帶(分子量約60,000)被著染。
由於pSRα31-7中序列編碼的多肽分子量約為60,000，而且從胺基酸序列推斷其翻譯後修飾增加糖側鏈是不可能的，因此這幾個特定的帶是與pSRα31-7cDNA編碼的多肽相對應的。
實施例12用於COS-1細胞的高表達質粒的製備下一步證實實施例11中鑑定的幾個特定的60KDa帶與pSRα31-7的插入序列編碼的多肽是一樣的。還可望確定該多肽N末端胺基酸順序。為此，製備了一個克隆，其中由PSRα31-7插入序列編碼的多肽之C末端有額外的6個His殘基，緊接在終止密碼子之前。組氨酸殘基對Ni2+有高親合力，目的是為了表達具有組氨酸6聚體(6×His)的多肽，它可用裝有Ni2+的親合樹脂柱純化。
首先，使用自動DNA合成儀394(Perkin-Elmer JapanAppliedBiosystems)合成66個鹼基的寡核苷酸5′-CTAGCGCTCTGGGGCAAGCATCCTCCAGGCTGGCTGCCACCACCACCACCACCACTGATCTAGACT-3′(序列ID No.14)及其互補的66鹼基鏈並純化之。混合寡核苷酸樣品，於70℃下溫育3分鐘，然後再於37℃溫育30分鐘以使之退火。接著，用T4多核苷酸激酶使末端磷酸化。
用T4DNA連接酶將所得的雙鏈(ds)片段連接到預先經Eco47Ⅲ消化過的pUCKM31-7中。構建體如圖10所示。用該DNA以氯化鈣法轉化E.coli DH5α，選擇並篩選所得的轉化菌株，得到pUCKM31-7His。通過分析該pUCKM31-7His的相關鹼基順序的一部分，證實在pUCKM31-His中插入了該片段的這個部分沒有異常。
然後將pUCKM31-7His的插入段亞克隆到pCDL-SRα296中，製備COS-1細胞的高表達質粒。
用Xbal和HindⅢ消化pUCKM31-7His，純化所得片段，在有2mMdATP,2mM dCTP,2mM dGTP,2mM dTTP,50mM TRIS-HCl(pH7.2)，10mM MgSO4,0.1mM二硫蘇糖醇和50μg/ml BSA存在的條件下，用1單位klenow片段將片段修成平頭。
同時，高表達載體pcDL-SRα296用PstⅠ和KpnⅠ消化並用DNA修平端試劑盒修成平頭，然後用T4DNA連接酶連接平頭片段和平頭質粒。用所得質粒轉化E.Coli DH5α。然後選擇和篩選轉化體。選出cDNA轉錄方向與SRα啟動子方向一致的菌株，這一菌株的質粒命名為pSRα31-7His。用所得質粒pSRα31-7His轉染COS-1細胞，並用如實施例11所述者相似的方法得到無血清上清液。
實施例13純化及N末端胺基酸順序分析使實施例12中製得的600ml上清液在17倍體積的透析緩衝液中4℃透析15小時。用另外17倍體積的透析緩衝液替代上述緩衝液4℃繼續透析4小時。
透析過的製劑在下述條件下用FPLC(快速蛋白質多核苷酸液相層析儀-Pharmacia)做親和層析。
柱20ml ProBondTM樹脂(InVitrogen)裝入XK16/20(Φ2.0×20cm,Pharmacia)柱中洗脫緩衝液A)含200mM味唑、0.5M NaCl的20mM磷酸鹽緩衝液(pH7.8)
B)含300mM味唑、0.5M NaCl的20mM磷酸鹽緩衝液(pH7.8)流速1ml/分鐘洗脫溶液分配5ml/管洗脫條件用洗脫緩衝液A)回收4管後，用洗脫緩衝液B)回收16管，各管按1至20次序編號。
從所得的各部分樣品中各取300μl分別用TCA進行沉澱處理，所得的沉澱按前述方法用12.5％凝膠在還原條件下進行SDS-PAGE。用銀染色法鑑定帶，並在圍繞編號為10的部分(管)檢測到三條帶。這三條帶的存在表明pSRα31-7His插入段編碼一條具有不同N末端順序的3種不同長度的多肽。
剩餘的第7至14管樣品用TCA沉澱法濃縮，對沉澱物用10％凝膠在還原條件下進行SDS-PAGE。使用凝膠膜轉移裝置(Marisol,KS-8441)將蛋白帶從聚丙烯醯胺凝膠上轉移到聚偏二氟乙烯(PVDF)膜(ProBlotTM,Applied Biosystems)上。轉移以9V在轉移緩衝液
中4℃進行2.5小時。
然後，膜用0.2％萘酚藍黑(Sigma)染色。從膜上切下與前面鑑定者相對應的三條帶，用氣相蛋白質測序儀(Shimadzu,PPSQ-10)測定每條帶從N末端到第6個胺基酸的序列。帶有第二大表觀分子量(分子量約60.000)的帶N端順序是Val-Val-Phe-Val-Lys-Gln(序列ID No.12的第1至6位胺基酸)。
這6個胺基酸相當於克隆31-7之ORF的前6個胺基酸，也相當於由pSR 31-7His和PSRα31-7cDNA插入段編碼之前體多肽N末端從第24位胺基酸(Val)開始的6個胺基酸的序列。因此，以這種前體多肽N末端切去1至23號胺基酸將導致分泌以Val殘基起始的成熟形式的蛋白質。
實施例14還原活性的測定ⅰ)表達載體的構建前面實施例中純化的多肽當它從COS-1細胞中表達時只能以極小的產量得到。故不可能將此多肽用於其他用途，如活性試驗。因此必須找到能在可代用的宿主中表達pSRα31-7cDNA的插入段所編碼的多肽，且能得到足夠用於純化和檢測實驗之適當數量產物的辦法。為達到這一目的，進行下述處理。
用HindⅢ消化pUCKM31-7，分離和純化含cDNA插入段的3003bp的片段，用DNA修平端試劑盒使之變成平頭末端。該片段再進一步用XbaⅠ消化。
表達載體pMAL-c[Guan,C.et al.(1987)Gene 67,21-30]用XbaⅠ和StuⅠ消化，然後用T4連接酶將上述XbaⅠ修飾的HindⅡ片段連接到這一裂解的質粒中。所得構建體示於圖11中。用該構建體轉化E.coli TB-1並選擇和篩選AmpR轉化株。挑選cDNA轉錄方向與啟動子方向一致的菌株，所得到的質粒被命名為pMAL31-7。ⅱ)融合蛋白質的表達和純化在3ml含50μg/ml氨苄青黴素的LB培養基中37℃振蕩培養過夜，製備含有pMAL31-7的E.coli種子培養物。第二天，將1ml種子培養物加入100ml含50μg/ml氨苄青黴素的新鮮LB培養基中，37℃振蕩培養至OD600nm值達到0.5。在這一階段，培養物中加入IPTG至終濃度為0.1mM，並將培養物於37℃繼續振蕩培養過夜。
第二天，經以6500rpm於4℃下離心20分鐘，從過夜的培養物中回收細菌細胞。將沉澱物懸浮於10ml柱緩衝液中，用超聲破碎儀處理以破碎所得懸浮液中的細胞。於0℃下8800rpm離心30分鐘除去全部細胞及細胞碎片，回收上清液中的可溶性蛋白質部分。取1ml該可溶性部分在直鏈澱粉樹脂柱(New England Biolabs)上進行層析。
往10ml柱緩衝液中加入麥芽糖至終濃度為10mM，以製備用於層析的洗脫緩衝液。
陰性對照樣品也進行層析。陰性對照樣品的製備用相似程序，不同的是，pMAL-C載體中沒有任何cDNA插入段。然後測定層析樣品中蛋白質的還原活性。ⅲ)測定還原活性用二氯酚-酚(DCIP)和氧化態穀胱甘肽在樣品杯(SARSTEDT,10×4×45mm)中測還原活性。
a)使用DCIP測定還原活性將各90.4μg(用蛋白試驗試劑盒(Bio-Rad)測定的)上述ⅱ)步驟中所得的層析樣品分別與1ml 50μM DCIP(Sigma)混合。然後向各樣品中加入15μl 1mM NADPH(Boehringer Mannheim)，並定時監測OD600nm和OD340nm的吸光度。所得的兩個波長處吸光度的降低如圖12所示，可見僅有pMAL31-7樣品含有減少DCIP的因子。b)用氧化態穀胱甘肽測定還原活性在預先裝入不同小杯中的上面ⅱ)步驟中得到的各90.4μg層析樣品中加入15ml 10mM氧化態穀胱甘肽(Boeringer-Mannheim)。每個小杯中再加入15μl 1mM NADPH，並定時監測OD340nm處的吸光度。結果如圖13所示，可見只有得自pMAL31-7樣品中的蛋白質能還原氧化態穀胱肽。還觀察到，當無氧化態穀胱甘肽存在時則不消耗NADPH，所以可以認為在NADP存在下，只有pMAL31-7樣品中的蛋白質才能還原氧化態的穀胱甘肽。
實施例15N末端胺基酸序列的純化和分析從實施例13可推斷，用pSRα31-7 His轉柒的COS-1細胞表達具有三種類型的N末端的多肽。
在一個單獨實驗中，用從pMAL31-7轉化的E.coli中回收的融合蛋白質免疫兔，得到抗KM31-7蛋白的多克隆抗體製品。使用該多克隆抗體做Western印跡分析，在從pSRα31-7轉染的COS-1細胞中得到的無血清培養物上清液中也清楚地檢測到三種類型的帶。這一結果與實施例13中所得的結果相似。
因此，用pSRα31-7轉染COS-1細胞，以期收集到大體積的無血清培養物上清液，得以純化和分析KM31-7蛋白質的N端序列。
用pSRα31-7轉染COS0-1細胞，在裝有30ml DMEM的150mm培養皿中培養3天。然後收集上清液，再向各培養皿中加入30ml新鮮培養基並繼續培養3天。再次收集培養物上清液。有關轉染和培養的其它方面同實施例11所述，但使用199培養基培養。
合併收穫到的上清液，離心後收集10升無血清培養上清液並將其在10mM Tris-HCl(pH9.0)中透析過夜。對透析的製品用FPLC(Pharmacia)在下述條件下進行離子交換層析8次柱20ml DEAE Sepharose Fast Flow(Pharmacia)，填入XK16/20(Φ2.0×20cm,Pharmacia)洗脫緩衝液A)．10mM Tris-HCl(pH9.0)B)．10mM Tris-HCl(H9.0)-0.5M NaCl流速1ml/分鐘洗脫溶液分配3ml/管洗脫條件在60分鐘以線型濃度梯度由洗脫溶液A變成洗脫溶液B。
收集在0.1M-0.4M間各NaCl濃度下洗脫的各部分並合併之，在含0.1M Tris-HCl,5mM EDTA(pH7.6)和1mM 2-巰基乙醇的透析緩衝液中透析過夜。經透析的製品再使用2′,5′-ADP Sepharose 4B(Pharmacia)於下述條件下進行親合層析柱20ml 2′,5′-ADP Sepharose 4B填入xK16/20(Φ2.0×20cm,Pharmacia)洗脫緩衝液A)0.1M Tris-HCl,5mM EDTA(pH7.6),1mM2-巰基乙醇B)O.1M Tris-HCl,5mM EDTA(pH7.6),1mM2-巰基乙醇，10mMNADPH流速0.5ml/分鐘洗脫溶液分配2ml/管洗脫條件在120分鐘內以線型濃度梯度從洗脫液A變為洗脫液B從每個所得的部分中取100μl等份試樣用TCA沉澱，對沉澱物在還原條件下使用12.5％凝膠做SDS-PAGE。
電泳後，對凝膠作銀染色以確定蛋白帶。從第11管起得到三條帶。
第11至第14管的全部剩餘液經用TCA沉澱而濃縮，沉澱物在還原條件下用12.5％凝膠進行SDS-PAGE。電泳後將蛋白質從凝膠上轉移到ProBlot PVDF膜(Applied Biosystems)上。蛋白質轉移到膜上後，將膜用0.2％萘酚藍黑染色並切下三條蛋白帶。用氣相蛋白質序列儀進行N端序列分析。
測知三種類型中分子量最小的帶N端為Lys-Leu-Leu-Lys-Met。這5個胺基酸相當於由pSRα31-7cDNA之插入段編碼的多肽之N端從第49號胺基酸開始的5個胺基酸。因此可推斷，在第48位胺基酸殘基處裂解該肽產生一個N端以Lys開始的成熟型蛋白質。
實施例16製備抗KM31-7蛋白質的單克隆抗體a.)抗原蛋白質的製備在3ml含50μg/ml氨苄青黴素的LB培養基中37℃下振蕩培養一接種環的細胞，以製備含pMAL31-7的E.coli種子培養物。取1ml所得的種子培養物接種到100ml含50μg/ml氨苄青黴素的新鮮LB培養基中，37℃振蕩培養直至OD600nm達到0.5。此階段向培養液中加入IPTG至終濃度為0.1mM，然後於37℃繼續振蕩培養過夜。
所得的過夜培養物於4℃下以6500r.p.m.離心20分鐘回收細胞，將片狀沉澱物重懸於10ml柱緩衝液中。所得懸液中的細胞用超聲破碎儀破碎，0℃下8,000r.p.m離心30分鐘。所得的上清液即含有可溶性的蛋白質部分。
將該可溶性的蛋白質部分加在1ml直鏈澱粉樹脂柱上進行層析。用10ml含10mM麥芽糖的柱緩衝液洗脫。將從層析中得到的融合蛋白質貯存作為抗原備用。(b)免疫的小鼠脾細胞的製備往上面(a)步驟中純化的2ml(相當於200μg)抗原中加入2ml弗氏完全佐劑以形成乳劑。將該乳劑抽入裝有玻璃活塞的5ml注射器筒內，通過皮下注射免疫年齡為8周的雄性BALB/C小鼠。
進行第二次免疫時，佐劑使用弗氏不完全佐劑，但與第一次免疫的程序相同。以大約每2周免疫一次的速度共做四次免疫。
開始第二次免疫時，免疫前直接從眼基底靜脈叢取血，用固相酶聯免疫吸附試驗(ELISA)測定血清中抗KM31-7抗體的效價。固相抗KM31-7 ELISA在96孔ELISA板(Costar)的各孔中加入用作抗原的150-200μl(約相當於200ng的融合蛋白質)從pSRα31-7轉染的COS-1細胞中得到的無血清培養物上清液。平板於4℃下過夜，使溶液包被板孔的底部表面。第二天，平板用0.1％Tween-20/磷酸鹽緩衝鹽水(0.1％Tween 20/PBS)洗3次，然後每孔加入100μl以PBS配成10μg/ml濃度的BSA溶液，室溫放置1小時。
然後，再用0.1％Tween 20/PBS將平板洗3次，並向各孔內加入30-100μl系列稀釋之樣品形式的第一抗體(例如小鼠血清、雜交瘤培養物上清液或單克隆抗體)，並將平板於室溫下放置1小時。
然後，將平板再用0.1％Tween 20/pBS洗三次，每孔加入100μl的第二抗體。第二抗體由羊抗小鼠IgG過氧化物酶複合物(Amersham)的3000倍稀釋液或羊抗小鼠IgG-鹼性磷酸酶複合物(BIO-RAD)的3000倍稀釋液製成。平板於室溫下放置1至2小時。
然後，平板再用0.1％Tween 20/pBS洗三次，各孔內加入100μl過氧化物酶底物溶液(BIO-RAD，過氧化物酶底物試劑盒ABTS)或含0.001％磷酸對硝基苯酯的10％乙醇胺溶液。將平板在室溫下放置15至30分鐘，然後可使用微板閱讀議(BIO-RAD)測415nm或405nm處吸光率以計算出抗體滴度(效價)。(c)小鼠骨髓瘤細胞的製備在正常培養基(完全GIT)中培養8-氮鳥嘌呤抗性小鼠骨髓瘤細胞P3-X63-Ag8.653(653)(ATCC no.CRL-1580)，最少得到2×107個細胞。(d)雜交瘤的製備按上文(b)中所述方法進行免疫後得到1.4×108個被免疫小鼠的脾細胞，並用DMEM(Nissui Pharmaceutical)徹底洗細胞。洗過的細胞與上述步驟c)中製備的1.5×107個小鼠骨髓瘤細胞P3-X63-Ag 8.653(653)混合，並將所得混合物以800r.p.m離心6分鐘。
收集由脾細胞和P3-X63-Ag.653(653)細胞的混合物組成的細胞團並分散開所形成的沉澱餅。預先將聚乙二醇4000(聚乙二醇#4000)用DMEM配成50％溶液。將該溶液在1分鐘時間內以2ml/分的速度邊攪拌邊滴入分散開的細胞中。然後DMEM以同樣的方式在1分鐘內以2ml/分鐘的速度加入細胞樣品中。按上述方法再一次加入聚乙二醇和DMEM溶液。最後，在3分鐘內逐漸加入16ml DMEM。所得的細胞製品以800r.p.m離心6分鐘。棄去上清液，將細胞懸浮於35ml含5至10ng/ml小鼠IL-6的完全GIT中。(e)雜交瘤的篩選100μl上述步驟d)中製備的懸液加入96孔板的各孔中(Sumitomo Bakelite)並在7.5％CO2培養箱中於37℃下培養。培養7天後，每孔中加入50μl HAT培養基，再培養4天後，每孔再加入50μl HAT培養基。平板再培養3天。此後，在可觀察到融合細胞之菌落生長的孔中取部分培養上清液樣品，按上面步驟b)中所述的固相ELISA法測定抗KM31-7抗體的滴度。立即用HT培養基代替取樣的培養基。(f)克隆用有限稀釋分析法將從用作陽性的試驗孔中得到的細胞重複克隆三次。選擇那些觀察到具有恆定抗體效價的克隆用作產生抗KM31-7單克隆抗體的雜交瘤細胞系。尤其是在這一階段，不僅按上述步驟b)所述方法進行ELISA，而且還使用得自pCDL-pSRα296轉染之COS-1細胞的無血清培養物上清液製備固相，進行對照ELISA。從而，選擇那些與前者反應但不與對照ELISA反應的細胞系進行克隆。(g)單克隆抗體的純化從產生抗KM31-7單克隆抗體的雜交瘤細胞系中收集培養物上清液，用0.22μm濾器(Millipore)過濾除菌，然後用MAb Trap GⅡ(Pharmacia)純化抗體。(h)檢測單克隆抗體1)單克隆抗體的抗原特異性用從pSRα31-7轉染的COS-1細胞得到的無血清培養物上清液做免疫沉澱試驗，以證實單克隆抗體是對KM31-7蛋白質特異的。2)單克隆抗體的分類使用小鼠單克隆抗體分型試劑盒(Amersham)進行本試驗，鑑定該抗體為屬於IgG1亞類的抗體。
實施例17用抗原-抗體反應分離和純化KM31-7蛋白質按上面實施例16h)1)中所述方法進行。還用抗體和從pcDL-pSRα296轉染的COS-1細胞得到的無血清上清液重複同一試驗。
各1.7ml無血清上清液中加入1.4μg單克隆抗體，室溫反應1小時，同時在2.2ml小離心管中以20r.p.m離心。用不加單克隆抗體的pSRα31-7轉染的COS-1細胞無血清上清液作為對照。
各管中加入30μl預先用0.1％Tween 20/PBS洗過的Protein GSepharose 4 Fast Flow(Pharmacia)以吸附抗體，並在室溫下以20r.p.m的速率繼續離心30分鐘。
每份混合物在小離心管中以10000r.p.m離心幾秒鐘後，小心棄去上清液，以免丟失沉澱物。將沉澱物分別用0.1％Tween 20/PBS洗滌並離心，再以同樣的方法洗5次。
將所得沉澱懸浮於含10μl2-巰基乙醇的SDS-PAGE樣品緩衝液中。每份懸液於90℃加熱2分鐘，然後使用12.5％凝膠在還原條件下進行SDS-PAGE。電泳後，將產物從聚丙烯醯胺凝膠上轉移到硝酸纖維素膜(Bio-RAD)上。用實施例1(a)部分中所述的抗KM31-7多克隆抗體和確定從COS-1/pSRα31-7無血清培養物上清液中特異地沉澱KM31-7蛋白質的抗KM31-7單克隆抗體進行Western吸印分析。
實施例18Cyvv-NIa/KM31-7融合蛋白質的製備為了用CYVV-NIa蛋白酶技術表達KM31-7蛋白，必須將NIa基因3′端連接到與KM31-7蛋白DNA相同的閱讀框架中。因此，完成下述二步驟程序ⅰ)將KM31-7cDNA的3′側鏈(SmaⅠ-XbaⅠ,1006bp)引入pKSUN9中為了得到含有KM31-7cDNA 3′端的SmaⅠ-XbaⅠ片段(1,006bp)，用限制性內切酶SmaⅠ和XbaⅠ消化7μg的pSRα31-7質粒DNA，並使用0.8％瓊脂糖凝膠，以GENE CLEANⅡ(Funakoshi Japan)收集和純化所得的片段。
同時，用SmaⅠ和XbaⅠ同樣地消化5μg pKSUN9質粒DNA，用牛鹼性磷酸酶(Alkaline phosphatase,E.coliC75,Takara Shuzo,Japan)使裂解片段去磷酸化。將所得去磷酸的線性化的DNA用連接試劑盒(Takara Shuzo)與SmaⅠ-XbaⅠKM-31片段連接，用所得構建體轉化E.coli菌株JMl09。選擇並篩選轉化體得到含SmaⅠ-XbaⅠ片段的pNⅠa31-7SX克隆。ⅱ)NIa蛋白酶和KM31-7的連接為了將NIa的C端序列與在同一閱讀框架中有Val N末端殘基之KM31-7亞型的N端序列相連接，使用一Perkin-Elmer JapanApplied Biosystems392型DNA合成儀構建4個類型的聚合酶鏈反應(PCR)引物。引物如下5′GGT CAG CAC AAA TIT CCA3′ SEQ.ID No.15(1)5′AAA CAC AAC TTG GAA TGA ACA ATT 3′SEQ.ID No.16(2)5′TCA TTC CAA GTT GTG TTT GTG AAA 3′SEQ.ID No.17(3)5′CAT AGG ATG CTC CAA CAA 3′SEQ.ID No.18(4)第一輪PCR用1μg pKSUN9質粒DNA作模板完成。將引物(1)和(2)各100pmol和1/10體積10倍濃度的Taq聚合酶反應緩衝溶液及最後5單位Taq聚合酶(Takara Shuzo)按此順序加入反應溶液中。PCR反應先在72℃下進行3分鐘，隨後進行30個循環94℃,1分鐘；55℃,2分鐘和72℃,3分鐘，以72℃處理10分鐘結束。PCR反應後，對擴增的DNA產物進行8％聚丙烯醯胺凝膠電泳。用溴化乙錠染色鑑定含DNA的凝膠條並切下之。向各壓碎的凝膠條中加入300μl洗脫緩衝液(0.5乙酸銨，1mM EDTA,pH8.0)37℃下保溫過夜。離心得到含有經純化和擴增之DNA的上清液。
用同樣的方式再進行一次PCR，但使用1μg的pUCKM31-7質粒DNA作模板並用引物(3)和(4)，所得DNA純化方法同上所述。
第一次PCR擴增的片段含有編碼KM31-7蛋白質N末端殘基的序列，從Val-Val-Phe開始，一直到NIa XhoⅠ位點上遊的31bp處。第二次pCR擴增的片段含有編碼Asn-Cys-Ser-Phe-Gln，從NIa之C末端到KM31-7cDNA之SmaⅠ位點下遊32bp的序列。
因此，當用從兩次PCR得到的DNA片段及引物(1)和(4)進行PCR時，產生一條由9bp的NIa之3′端與15bp的編碼KM31-7所需N-端的序列組成的雜交鏈。這樣，可能產生一條以這一部分作為連接子的融合DNA序列。
根據這一邏輯，有充分理由地用這種方式進行第二輪PCR，並從凝膠中收集擴增的片段。ⅲ)將NIa/KM31-7DNA引入pNIa31-7SX中從ⅰ)中得到的5μg pNIa31-7SX質粒DNA用XhoⅠ和SmaⅠ消化後，用牛鹼性磷酸酶處理所得DNA使之脫磷酸化。在ⅱ)中製備的PCR產物也用XhoⅠ和SmaⅠ消化，將所得片段用連接試劑盒與經消化並脫磷酸化的pNIa31-7SX連接。用所得的構建體轉化E.coli菌株JM109。
然後選擇並篩選出AmpR轉化菌。篩選是通過用XhoⅠ消化及隨後做凝膠電泳進行的。選擇僅含有8.0Kbp帶的克隆。然後用HindⅢ消化所選出之克隆的質粒並再做凝膠電泳。所選擇的質粒有一條330bp帶，相當於NIa之cDNA插入段的一部分。該質粒被命名為pNⅠa31-7V，其含有XhoⅠ和SmaⅠPCR產物。
測定克隆pNIa31-7V的鹼基序列，且證實了編碼NIa和KM31-7的序列被連接在同一閱讀框架中，帶有位於NIa和KM31-7蛋白質之間的必要的Gln-Val裂解序列。ⅳ)KM31-7蛋白質的生產Western印跡證實pNⅠa31-7V在E.coli中發揮功能，並且KM31-7蛋白質是由構建的重組基因表達的。
含有pNⅠa31-7V的E.coli種子培養物在3ml含50μg/ml氨苄青黴素的LB培養基中振蕩培養過夜。取1ml種子培養物加入100ml含50μg/ml氨苄青黴素的新鮮LB培養基中，37℃振蕩培養至OD600nm值達到1.0。此時，往培養液中加入IPTG至終濃度為1mM，然後將培養物在28℃下繼續振蕩培養兩夜。
此後，將1ml培養物轉移到一個小離心管中，以15000rpm離心5分鐘。棄去上清液，片狀沉澱物與300μl無菌水和300μl含2-巰基乙醇的SDS-PAGE樣品緩衝液混合以分散沉積的細胞體。所得的懸液於95℃加熱2分鐘，然後取10μl這種懸液在還原條件下用8％凝膠做SDS-PAGE。
電泳後，將蛋白質從凝膠轉移到硝酸纖維素膜上。這一過程通過將凝膠與膜接觸，並在轉錄緩衝液(25mM Tris-HCl,1.4％甘氨酸和20％甲醇)中於4℃保溫2.5小時，並使用凝膠膜轉錄裝置(Marisol,Japan)在19V下完成。
然後，用20mlPBS-T培養基洗硝酸纖維素膜，再在20ml含5％脫脂乳(Snow Brand Co.Ltd)的PBS-T中封閉1小時。然後，膜用2份20ml的PBS-T漂洗，再在含1μl在無菌水中作100倍稀釋的抗KM31-7兔MAb血清(第一抗體)的20ml PBS-T中反應90分鐘。然後將硝酸纖維素膜漂洗一次15分鐘，再洗二次各5分鐘，每次均使用20ml PBS-T將洗過的膜浸入在PBS-T中3,000倍稀釋的過氧化物酶標記的抗兔IgG羊抗體(BIO-RAD)(用作上述第二抗體)溶液中，並放置1小時。然後用20ml PBS-T洗膜並轉移到ECL檢測試劑(Amersham)溶液中，經過放射自顯影檢測出與抗KM31-7抗體反應的帶。
進行Western印跡分析並檢測到一條分子量約為60,000的帶。該帶表現出與用作對照的用pSRα31-7轉染COS-1細胞得到的無血清培養物上清液中檢測到的三種KM31-7蛋白質中分子量次大的蛋白質具有相同的遷移率。
培養基xM磷酸鹽緩衝液一種Na2HPO4的xM溶液，用xM NaH2PO4溶液調到所需的pH值。接種緩衝液
0.1M Tris-HCl緩衝液，pH7.0,0.05MEDTA,1％2-巰基乙醇。提取緩衝液0.1M Tris-HCl緩衝液，0.05MEDTA,1％2-巰基乙醇，pH7.0。降解溶液200mM碳酸銨，2％SDS,2mMEDTA,400μg/ml皂土和20μg/ml蛋白酶K(pH9.0)。1×SSC0.15M NaCl,0.015M檸檬酸三鈉，pH7.0。液態LB培養基10g Bacto Tryptone(Difco),5g Bacto酵母提取物(Difco)和5g氯化鈉，用蒸餾水定容到1升。Tris-鈣緩衝液10mM Tris,50mM氯化鈣，用鹽酸調到pH7.4。溶胞緩衝液0.17g蔗糖，250μl 1M Tris-HCl緩衝液(pH8.0)，200μl 0.5MEDTA(pH8.0)，用重蒸水定容到20ml。鹼-SDS溶液0.2M氫氧化鈉，1％SDS。TBE溶液100mM Tris，100mM硼酸，1mMEDTA。變性溶液1.5M氯化鈉，0.5M氫氧化鈉。中和緩衝液0.5M Tris,3M氯化鈉(p7.4)。50×Denhardt′s溶液1％聚乙烯吡咯烷酮，1％牛血清白蛋白，1％Ficoll 400。溶液用雙蒸水稀釋，根據需要調到合適的濃度。5×變性緩衝液125μl 1M甘氨酸(pH9.0),25μl 1M氯化鎂，850μl重蒸水。5×標記緩衝液25μl 1M Tris-HCl緩衝液(pH7.9),5μl 1M氯化鎂，2.5μl1M二硫蘇糖醇，9.2μl重蒸水。10×M9鹽溶液0.145M磷酸氫二鈉，0.172M磷酸二氫鉀，0.187M氯化銨，0.137M氯化鈉，pH7.0。M9基本瓊脂培養基10ml 10×M9鹽溶液，100μl 1M硫酸鎂，1ml 20％葡萄糖，50μl 1％鹽酸硫胺素鹽，1ml 0.01M氯化鈣和13ml重蒸水，混合後過濾滅菌，在往平皿中加入50ml 3％細菌瓊脂後立即注入該混合液。液態SOB培養基10g細菌蛋白腖，2.5g細菌酵母提取物，100μl 5M氯化鈉和125μl 1M氯化鉀混合，加蒸餾水定容到500ml。高壓滅菌後，加入5ml 1M氯化鎂和5ml 1M硫酸鎂。TFB1緩衝液5ml 1M 2-(N-嗎啉)乙磺酸(MES-以lNHcl 調節至pH6.2),6.045g氯化銣，0.735g二水合氯化鈣和4.94g四水合氯化錳混合，用冰乙酸調到pH5.8，用重蒸水定容到500ml並過濾滅菌。TFB2緩衝液
1ml 1M2-(N-嗎啉)丙磺酸(MOPS),1.102g二水合氯化鈣，0.12g氯化銣和15ml甘油混合，用冰乙酸調pH6.5，用重蒸水定容到100ml並過濾滅菌。液態SOC培養基5ml液體SOC介質，90μ120％葡萄糖。2×YT培養基16g細菌蛋白腖，5g細菌酵母提取物和5g氯化鈉混合，用重蒸水定容到1升。PBS-Tw培養基80mM磷酸氫二鈉，20mM磷酸二氫鈉，100nM氯化鈉，0.1％Tween-20。PBS-T培養基4g氯化鈉，0.1g磷酸二氫鉀，1.45g十二水合磷酸氫二鈉，0.1g氯化鉀和0.1g疊氮鈉，用重蒸水調到1升，pH7.4。鹼性磷酸酶底物溶液0.01％磷酸對硝基苯酯溶於用鹽酸調到pH9.8的10％二乙醇胺水溶液中。培養基ADMEM(Dulbecco氏修飾的Eagle培養基，含4.5g/l葡萄糖)，10％滅活的小牛血清(Hyclone生產)和10mMHEPES(pH7.2)。培養基BDMEM(含4.5g/l葡萄糖)，10mM HEPES(pH7.2)，3％滅活的小牛血清，5μg/ml牛胰島素(Sigma生產)，8μg/ml d-生物素(Sigma生產)，4μg/ml泛酸(Sigma生產)，1.0μM地塞米松(Sigma生產)和0.5mM異丁基甲基黃嘌呤(Aldrich生產)。培養基CDMEM(含4.5g/l葡萄糖)含5％滅活的小牛血清，10mM HEPES(pH7.2)和100ng/ml牛胰島素。培養基DDMEM(含4.5g/l葡萄糖)，5％滅活小牛血清，10mM HEPES(pH7.2)，100ng/ml牛胰島素和10U/ml肝素鈉(Novo Industry Co.生產)。LPL底物溶液13mM甘油三[9,10(n)-3H]油酸酯(51.8KBq/μmol,Amersharm生產)，1.3mg/ml L-α-磷酸醯膽鹼二硬脂醯(Sigma Co.生產)，20mg/l牛血清白蛋白(Sigma Co.生產)，135mM Tris-鹽酸[Tris-HCl(pH8.1),Sigma Co.生產]，16.5％(V/V)甘油和16.5％(V/V)滅活的小牛血清。硫氰酸胍溶液4M硫氰酸胍，1％Sarkosyl,20mM乙二胺四乙酸(EDTA),25nM檸檬酸鈉(pH7.0),100mM42-巰基乙醇和0.1％消泡劑A(Sigma)。吸附緩衝液0.5M NaCl,20mM Tris-HCl(pH7.5),1mM EDTA和0.1％SDS。洗脫溶液10mM Tris-HCl(pH7.5),1mM EDTA和0.05％SDS。實施例2的逆轉錄酶反應溶液50ml Tris-HCl(pH8.3),8mM MgCl2,30mM KCl,0.3nM二硫蘇糖醇，2mM dATP,2mM dGTP,2mM dTTP,10μCi[α-32P]dCTP和1.4μg引物DNA載體(3′-Oligo(dT)結尾的PCDV-1,Pharmacia)。末端轉移酶反應溶液140mM二甲胂酸鉀,30mM Tris-HCl(pH6.8),1mM CoCl2,0.5mM二硫蘇糖醇，0.2μg poly A和100mM dCTP。限制性酶緩衝液50mM NaCl,10mM Tris-HCl(pH7.5),10mM MgCl2和1mM二硫蘇糖醇。10體積連接酶緩衝液10mM ATP,660mM Tris-HCl(pH7.5),66mM MgCl2和100mM二硫蘇糖醇。電泳染料50％甘油，0.01M磷酸氫二鈉(pH7.0)和0.4％溴酚藍。1×TAE0.04 Tris-乙酸，0.001M EDTA。1×SSCP120mM NaCl,15mM檸檬酸鈉，13mM磷酸二氫鉀，和1mM EDTA。實施例6的逆轉錄酶反應溶液1×第一條鏈合成緩衝液，5％焦磷酸鈉，100單位核糖核酸酶抑制劑，1mM dATP,1mM dGTP,1mM dTTP,0.5mM dCTP和3.75μg oligo(dT)引物，均隨cDNA克隆系統(Amersham)提供。SM緩衝液100mM NaCl,8mM MgSO4·7H2O,50mM Tris-HCl(pH7.5)和0.01％明膠。透析緩衝液20mM磷酸鹽緩衝液(pH7.8)和0.5M NaCl。柱緩衝液10mM Tris-HCl(pH7.4),200mM NaCl和1mM EDTA。Taq聚合酶反應緩衝溶液Taq含500mM Tris-HCl(pH8.3),500mM KCl,15mM MgCl2,100mM dATP,100mM dCTP,100mM dGTP,100mMdTTP和2mg/ml明膠。
序列表序列ID號1序列長度1320序列類型核酸鏈型雙鏈拓撲學線型分子類型mRNA的cDNA反意無原始來源生物三葉草黃脈病毒特徵1-1320 E CDS10-1311 E mat多肽序列描述AAG TTC CAA GGG AAA AGT AAG AGA ACA AGA CAA AAG TTG AAG TTC AGA48Lys Phe Gln Gly Lys Ser Lys Arg Thr Arg Gln Lys Leu Lys Phe Arg1 5 10 15GCG GCA AGA GAC ATG AAG GAT CGT TAT GAA GTG CAT GCC GAT GAG GGG96Ala Ala Arg Asp Met Lys Asp Arg Tyr Glu Val His Ala Asp Glu Gly20 25 30ACT TTA GTG GAA AAT TTT GGA ACT CGT TAT TCA AAG AAA GGC AAG ACA 144Thr Leu Val Glu Asn Phe Gly Thr Arg Tyr Ser Lys Lys Gly Lys Thr35 40 45AAA GGT ACT GTT GTG GGT TTG GGT GCA AAA ACA AGA CGG TTC ACT AAC 192Lys Gly Thr Val Val Gly Leu Gly Ala Lys Thr Arg Arg Phe Thr Asn50 55 60ATG TAT GGT TTT GAC CCC ACG GAG TAT TCA TTT GCT AGG TAT CTT GAT 240Met Tyr Gly Phe Asp Pro Thr Glu Tyr Ser Phe Ala Arg Tyr Leu Asp65 70 75 80CCA ATC ACG GGT GCA ACA TTG GAT GAA ACC CCA ATT CAC AAT GTA AAT 288Pro Ile Thr Gly Ala Thr Leu Asp Glu Thr Pro Ile His Asn Val Asn85 90 95TTG GTT GCT GAG CAT TTT GGC GAC ATA AGG CTT GAT ATG GTT GAC AAG 336Leu Val Ala Glu His Phe Gly Asp Ile Arg Leu Asp Met Val Asp Lys100 105 110GAG TTA CTT GAC AAA CAG CAC TTA TAC CTC AAG AGA CCA ATA GAA TGT 384Glu Leu Leu Asp Lys Gln His Leu Tyr Leu Lys Arg Pro Ile Glu Cys115 120125TAC TTT GTA AAG GAT GCT GGT CAG AAG GTG ATG AGG ATT GAT CTA ACA 432Tyr Phe Val Lys Asp Ala Gly Gln Lys Val Met Arg Ile Asp Leu Tnr130 135 140CCC CAC AAC CCA TTG TTG GCA AGC GAT GTT AGC ACA ACC ATA ATG GGT 480Pro His Asn Pro Leu Leu Ala Ser Asp Val Ser Thr Thr Ile Met Gly145150 155 160TAT CCT GAG AGA GAA GGT GAA CTC CGT CAA ACT GGA AAG GCA AGG TTA 528Tyr Pro Glu Arg Glu Gly Glu Leu Arg Gln Thr Gly Lys Ala Arg Leu165 170 175GTC GAC CCA TCA GAG TTG CCC GCG CGG AAT GAG GAT ATT GAT GCA GAG 576Val Asp Pro Ser Glu Leu Pro Ala Arg Asn Glu Asp Ile Asp Ala Glu180 185 190TTT GAG AGT CTA AAT CGC ATA AGT GGT TTG CGC GAC TAT AAT CCC ATT 624Phe Glu Ser Leu Asn Arg Ile Ser Gly Leu Arg Asp Tyr Asn Pro Ile195 200 205TCA CAA AAT GTT TGC TTG CTA ACA AAT GAG TCA GAA GGC CAT AGA GAG 672Ser Gln Asn Val Cys Leu Leu Thr Asn Glu Ser Glu Gly His Arg Glu210 215 220AAG ATG TTT GGA ATT GGA TAT GGT TCA GTG ATC ATT ACA AAT CAA CAT 720Lys Met Phe Gly Ile Gly Tyr Gly Ser Val Ile Ile Thr Asn Gln His225 230 235 240CTG TTC AGA AGG AAT AAT GGG GAG TTA TCA ATT CAA TCC AAG CAT GGC 768Leu Phe Arg Arg Asn Asn Gly Glu Leu Ser Ile Gln Ser Lys His G1y245 250 255TAC TTC AGA TGC CGC AAC ACC ACA AGC TTG AAG ATG CTG CCT TTG GAG 816Tyr Phe Arg Cys Arg Asn Thr Thr Ser Leu Lys Met Leu Pro Leu Glu260 265 270GGA CAT GAC ATT TTG TTG ATT CAG TTA CCA AGG GAC TTT CCA GTG TTT 864Gly His Asp Ile Leu Leu Ile Gln Leu Pro Arg Asp Pha Pro Val Phe275 280 285CCA CAA AAG ATT CGC TTT AGG GAG CCA AGA GTG GAT GAC AAA ATT GTT 912Pro Gln Lys Ile Arg Phe Arg Glu Pro Arg Val Asp Asp Lys Ile Val290 295 300TTG GTC AGC ACA AAT TTC CAG GAA AAG AGT TCC TCG AGC ACG GTC TCA 960Leu Val Ser Thr Asn Phe Gln Glu Lys Ser Ser Ser Ser Thr Val Ser305 310 315 320GAG TCC AGT AAC ATT TCA AGA GTG CAG TCA GCC AAT TTC TAC AAG CAT 1008Glu Ser Ser Asn Ile Ser Arg Val Gln Ser Ala Aan Phe Tyr Lys His325 330 335TGG ATC TCA ACA GTA GCA GGA CAC TGT GGA AAC CCT ATG GTT TCG ACT 1056Trp Ile Sar Thr Val Ala Gly His Cys Gly Asn Pro Met Val Ser Thr340 345 350AAA GAT GGA TTT ATT GTA GGT ATC CAC AGT CTT GCT TCA TTG ACA GGC 1104Lys Asp Gly Phe Ile Val Gly Ile His Ser Leu Ala Ser Leu Thr Gly355 360 365GAC GTT AAC ATC TTC ACA AGC TTT CCG CCG CAG TTT GAG AAC AAA TAT 1152Asp Val Asn Ile Phe Thr Ser Phe Pro Pro Gln Phe Glu Asn Lys Tyr370 375 380CTA CAG AAG CTC AGT GAA CAC ACA TGG TGT AGT GGA TGG AAA CTA AAT 1200Leu Gln Lys Leu Ser Glu His Thr Trp Cys Ser Gly Trp Lys Leu Asn385 390 395 400CTT GGA AAG ATT AGT TGG GGT GGA ATC AAC ATT GTG GAG GAT GCA CCT 1248Leu Gly Lys Ile Ser Trp Gly Gly Ile Asn Ile Val Glu Asp Ala Pro405 410 415GAA GAG CCC TTT ATA ACA TCC AAG ATG GCA AGC CTT CTT AGT GAT TTG 1296Glu Glu Pro Phe Ile Thr Ser Lys Met Ala Ser Leu Leu Ser Asp Leu420 425 430AAT TGT TCA TTC CAA GCA AGT GCG 1320Asn Cys Ser Phe Gln Ala Ser Ala435 440序列ID號2序列長度440序列類型胺基酸拓樸學線型分子類型蛋白質反意無來源生物三葉草黃脈病毒特徵4-437 E mat-肽序列描述Lys Phe Gln Gly Lys Ser Lys Arg Thr Arg Gln Lys Leu Lys Phe Arg1 5 10 15Ala Ala Arg Asp Met Lys Asp Arg Tyr Glu Val His Ala Asp Glu Gly20 25 30Thr Leu Val Glu Asn Phe Gly Thr Arg Tyr Ser Lys Lys Gly Lys Thr35 40 45Lys Gly Thr Val Val Gly Leu Gly Ala Lys Thr Arg Arg Phe Thr Asn50 55 60Met Tyr Gly Phe Asp Pro Thr Glu Tyr Ser Phe Ala Arg Tyr Leu Asp65 70 75 80Pro Ile Thr Gly Ala Thr Leu Asp Glu Thr Pro Ile Hie Asn Val Asn85 90 95Leu Val Ala Glu His Phe Gly Asp Ile Arg Leu Asp Met Val Asp Lys100 105 110Glu Leu Leu Asp Lys Gln His Leu Tyr Leu Lys Arg Pro Ile Glu Cys115 120 125Tyr Phe Val Lys Asp Ala Gly Gln Lys Val Met Arg Ile Asp Leu Thr130 135 140Pro His Asn Pro Leu Leu Ala Ser Asp Val Ser Thr Thr Ile Met Gly145 150 155 160Tyr Pro Glu Arg Glu Gly Glu Leu Arg Gln Thr Gly Lys Ala Arg Leu165 170 175Val Asp Pro Ser Glu Leu Pro Ala Arg Asn Glu Asp Ile Asp Ala Glu180 185 190Phe Glu Ser Leu Asn Arg Ile Ser Gly Leu Arg Asp Tyr Asn Pro Ile195 200 205Ser Gln Asn Val Cys Leu Leu Thr Asn Glu Ser Glu Gly His Arg Glu210 215 220Lys Met Phe Gly Ile Gly Tyr Gly Ser Val Ile Ile Thr Asn Gln His225 230 235 240Leu Phe Arg Arg Asn Asn Gly Glu Leu Ser Ile Gln Ser Lys His Gly245 250 255Tyr Phe Arg Cys Arg Asn Thr Thr Ser Leu Lys Met Leu Pro Leu Glu250 265 270Gly His Asp Ile Leu Leu Ile Gln Leu Pro Arg Asp Phe Pro Val Phe275 280 285Pro Gln Lys Ile Arg Phe Arg Glu Pro Arg Val Asp Asp Lys Ile Val290 295 300Leu Val Ser Thr Asn Phe Gln Glu Lys Ser Ser Sar Ser Thr Val Ser305 310 315 320Glu Ser Ser Asn Ile Ser Arg Val Gln Ser Ala Asn Phe Tyr Lys His325 330 335Trp Ile Ser Thr Val Ala Gly His Cys Gly Asn Pro Mec Val Ser Thr340 345 350Lys Asp Gly Phe Ile Val Gly Ile His Ser Leu Ala Ser Leu Thr Gly355 360 365Asp Val Asn Ile Phe Thr Ser Phe Pro Pro Gln Phe Glu Asn Lys Tyr370 375 380Leu Gln Lys Leu Ser Glu His Thr Trp Cys Ser Gly Trp Lys Leu Asn385 390 395 400Leu Gly Lys Ile Ser Trp Gly Gly Ile Asn Ile Val Glu Asp Ala Pro405410415Glu Glu Pro Phe Ile Thr Ser Lys Met Ala Ser Leu Leu Ser Asp Leu420 425 430Asn Cys Ser Phe Gln Ala Sar Ala435 440序列ID號3序列長度25序列類型核酸拓樸學線型分子類型其它核酸合成DNA序列描述GTCCATGGGG AAAAGTAAGA GAACA 25序列ID號4序列長度20序列類型核酸拓樸學線型分子類型其它核酸，合成的DNA序列描述ACTCTGAGAC CGTGCTCAGAG 20序列ID號5序列長度20序列類型核酸拓樸學線型分子類型其他核酸，合成的DNA序列描述AGGAAAGAG TTCCTCGAGC序列ID號6序列長度36序列類型核酸拓樸學線型分子類型其它核酸，合成的DNA序列描述AATTTGTTCAT TCCAAGCACC TGGGCCACCA CCTGGC 36序列ID號7序列長度36序列類型核酸拓樸線型分子類型其它核酸，合成的DNA序列描述GCCAGGTGGT GGCCCAGGTG CITGGAATGA ACAATT 36序列ID號8序列長度30序列類型核酸拓樸線型分子類型其它核酸，合成的DNA序列描述TTGTCAGCAC ACCTGGGAGC TGTAGAGCTC 25序列ID號9序列長度7序列類型胺基酸拓樸學線型分子類型蛋白質序列描述Ala Pro Gly Pro Pro Pro Gly 75序列ID號10序列長度7序列類型胺基酸拓樸學線型分子類型蛋白質序列描述Pro Gly Pro Pro Pro Gly Pro 75序列ID號11序列長度1650序列類型核酸鏈型雙鏈拓樸學線型分子類型mRNA的cDNA來源生物Homo sapiens特徵表達特徵的符號CDS存在位置1..1647檢測特徵的方法E表達特徵的符號mat-肽存在位置70..1647檢測特徵的方法E表示特徵的符號sig肽存在位置1..69檢測特徵的方法E序列ATG TCA TGT GAG GAC GGT CGG GCC CTG GAA GGA ACG CTC TCG GAA TTG 48Met Ser Cys Glu Asp Gly Arg Ala Leu Glu Gly Thr Leu Ser Glu Leu-23 -20 -15 -10GCC GCG GAA ACC GAT CTG CCC GTT GTG TTT GTG AAA CAG AGA AAG ATA 96Ala Ala Glu Thr Asp Leu Pro Val Val Phe Val Lys Gln Arg Lys Ile-51 5GGC GGC CAT GGT CCA ACC TTG AGG GCT TAT CAG GAG GGC AGA CTT CAA 144Gly Gly His Gly Pro Thr Leu Lys Ala Tyr Gln Glu Gly Arg Leu Gln10 15 20 25AAG CTA CTA AAA ATG AAC GGC CCT GAA GAT CTT CCC AAG TCC TAT GAC 192Lys Leu Leu Lys Met Asn Gly Pro Glu Asp Leu Pro Lys Ser Tyr Asp30 35 40TAT GAC CTT ATC ATC ATT GGA GGT GGC TCA GGA GGT CTG GCA GCT GCT 240Tyr Asp Leu Ile Ile Ile Gly Gly Gly Ser Gly Gly Leu Ala Ala Ala45 50 55AAG GAG GCA GCC CAA TAT GGC AAG AAG GTG ATG GTC CTG GAC TTT GTC 288Lys Glu Ala Ala Gln Tyr Gly Lys Lys Val Met Val Leu Asp Phe Val60 65 70ACT CCC ACC CCT CTT GGA ACT AGA TGG GGT CTT GGA GGA ACA TGT GTG 336Thr Pro Thr Pro Leu Gly Thr Arg Trp Gly Leu Gly Gly Thr Cys Val75 80 85AAT GTG GGT TGC ATA CCT AAA AAA CTG ATG CAT CAA GCA GCT TTG TTA 384Asn Val Gly Cys Ile Pro Lys Lys Leu Met His Gln Ala Ala Leu Leu90 95 100 105GGA CAA GCC CTG CAA GAC TCT CGA AAT TAT GGA TGG AAA GTC GAG GAG 432Gly Gln Ala Leu Gln Asp Ser Arg Asn Tyr Gly Trp Lys Val Glu Glu110 115 120ACA GTT AAG CAT GAT TGG GAC AGA ATG ATA GAA GCT GTA CAG AAT CAC 480Thr Val Lys His Asp Trp Asp Arg Met Ile Glu Ala Val Gln Asn His125 130 135ATT GGC TCT TTG AAT TGG GGC TAC CGA GTA GCT CTG CGG GAG AAA AAA 528Ile Gly Ser Leu Asn Trp Gly Tyr Arg Val Ala Leu Arg Glu Lys Lys140 145 150GTC GTC TAT GAG AAT GCT TAT GGG CAA TTT ATT GGT CCT CAC AGG ATT 576Val Val Tyr Glu Asn Ala Tyr Gly Gln Phe Ile Gly Pro His Arg Ile155 160 165AAG GCA ACA AAT AAT AAA GGC AAA GAA AAA ATT TAT TCA GCA GAG AGA 624Lys Ala Thr Asn Asn Lys Gly Lys Glu Lys Ile Tyr Ser Ala Glu Arg170 175 l80 185TTT CTC ATT GCC ACT GGT GAA AGA CCA CGT TAC TTG GGC ATC CCT GGT 672Phe Leu Ile Ala Thr Gly Glu Arg Pro Arg Tyr Leu Gly Ile Pro Gly190 195 200GAC AAA GAA TAC TGC ATC AGC AGT GAT GAT CTT TTC TCC TTG CCT TAC 720Asp Lys Glu Tyr Cys Ile Ser Ser Asp Asp Leu Phe Ser Leu Pro Tyr205 210 215TGC CCG GGT AAG ACC CTG GTT GTT GGA GCA TCC TAT GTC GCT TTG GAG 768Cys Pro Gly Lys Thr Leu Val Val Gly Ala Ser Tyr Val Ala Leu Glu220 225 230TGC GCT GGA TTT CTT GCT GGT ATT GGT TTA GAC GTC ACT GTT ATG GTT 816Cys Ala Gly Phe Leu Ala Gly Ile Gly Leu Asp Val Thr Val Met Val235 240 245AGG TCC ATT CTT CTT AGA GGA TTT GAC CAG GAC ATG GCC AAC AAA ATT 864Arg Ser Ile Leu Leu Arg Gly Phe Asp Gln Asp Met Ala Asn Lys Ile250 255 260 265GGT GAA CAC ATG GAA GAA CAT GGC ATC AAG TTT ATA AGA CAG TTC GTA 912Gly Glu His Met Glu Glu His Gly Ile Lys Phe Ile Arg Gln Phe Val270 275 280CCA ATT AAA GTT GAA CAA ATT GAA GCA GGG ACA CCA GGC CGA CTC AGA 960Pro Ile Lys Val Glu Gln Ile Glu Ala Gly Thr Pro Gly Arg Leu Arg285 290 295GTA GTA GCT CAG TCC ACC AAT AGT GAG GAA ATC ATT GAA GGA GAA TAT 1008Val Val Ala Gln Ser Thr Asn Ser Glu Glu Ile Ile Glu Gly Glu Tyr300 305 310AAT ACG GTG ATG CTG GCA ATA GGA AGA GAT GCT TGC ACA AGA AAA ATT 1056Asn Thr Val Met Leu Ala Ile Gly Arg Asp Ala Cys Thr Arg Lys Ile315 320 325GGC TTA GAA ACC GTA GGG GTG AAG ATA AAT GAA AAG ACT GGA AAA ATA 1104Gly Leu Glu Thr Val Gly Val Lys Ile Asn Glu Lys Thr Gly Lys Ile350 335 340 345CCT GTC ACA GAT GAA GAA CAG ACC AAT GTG CCT TAC ATC TAT GCC ATT 1152Pro Val Thr Asp Glu Glu Gln Thr Asn Val Pro Tyr Ile Tyr Ala Ile350 355 360GGC GAT ATA TTG GAG GAT AAG GTG GAG CTC ACC CCA GTT GCA ATC CAG 1200Gly Asp Ile Leu Glu Asp Lys Val Glu Leu Thr Pro Val Ala Ile Gln365 370 375GCA GGA AGA TTG CTG GCT CAG AGG CTC TAT GCA GGT TCC ACT GTC AAG 1248Ala Gly Arg Leu Leu Ala Gln Arg Leu Tyr Ala Gly Ser Thr Val Lys380 385 390TGT GAC TAT GAA AAT GTT CCA ACC ACT GTA TTT ACT CCT TTG GAA TAT 1296Cys Asp Tyr Glu Asn Val Pro Thr Thr Val Phe Thr Pro Leu Glu Tyr395 400 405GGT GCT TGT GGC CTT TCT GAG GAG AAA GCT GTG GAG AAG TTT GGG GAA 1344Gly Ala Cys Gly Leu Ser Glu Glu Lys Ala Val Glu Lys Phe Gly Glu410 415 420 425GAA AAT ATT GAG GTT TAC CAT AGT TAC TTT TGG CCA TTG GAA TGG ACG 1392Glu Asn Ile Glu Val Tyr His Ser Tyr Phe Trp Pro Leu Glu Trp Thr430 435 440ATT CCG TCA AGA GAT AAC AAC AAA TGT TAT GCA AAA ATA ATC TGT AAT 1440Ile Pro Ser Arg Asp Asn Asn Lys Cys Tyr Ala Lys Ile Ile Cys Asn445 450 455ACT AAA GAC AAT GAA CGT GTT GTG GGC TTT CAC GTA CTG GGT CCA AAT 1488Thr Lys Asp Asn Glu Arg Val Val Gly Phe His Val Leu Gly Pro Asn460 465 470GCT GGA GAA GTT ACA CAA GGC TTT GCA GCT GCG CTC AAA TGT GGA CTG 1536Ala Gly Glu Val Thr Gln Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lys Cys Gly Leu475 480 485ACC AAA AAG CAG CTG GAC AGC ACA ATT GGA ATC CAC CCT GTC TGT GCA 1584Thr Lys Lys Gln Leu Asp Ser Thr Ile Gly Ile His Pro Val Cys Ala490 495 500 505GAG GTA TTC ACA ACA TTG TCT GTG ACC AAG CGC TCT GGG GCA AGC ATC 1632Glu Val Phe Thr Thr Leu Ser Val Thr Lys Arg Ser Gly Ala Ser Ile510 515 520CTC CAG GCT GGC TGC TGA 1650Leu Gln Ala Gly Cys525序列ID號12序列長度526序列類型氧基酸鏈型單鏈拓樸學線型分子類型肽序列Met Ser Cys Glu Asp Gly Arg Ala Leu Glu Gly Thr Leu Ser Glu Leu-23 -20 -15 -10Ala Ala Glu Thr Asp Leu Pro Val Val Phe Val Lyg Gln Arg Lys Ile-51 5Gly Gly His Gly Pro Thr Leu Lys Ala Tyr Gln Glu Gly Arg Leu Gln10 15 20 25Lys Leu Leu Lys Met Asn Gly Pro Glu Asp Leu Pro Lys Ser Tyr Asp30 35 40Tyr Asp Leu Ile Ile Ile Gly Gly Gly Ser Gly Gly Leu Ala Ala Ala45 50 55Lys Glu Ala Ala Gln Tyr Gly Lys Lys Val Mat Val Leu Asp Phe Val60 65 70Thr Pro Thr Pro Leu Gly Thr Arg Trp Gly Leu Gly Gly Thr Cys Val75 80 85Asn Val Gly Cys Ile Pro Lys Lys Leu Met His Gln Ala Ala Leu Leu90 95 100 105Gly Gln Ala Leu Gln Asp Ser Arg Asn Tyr Gly Trp Lys Val Glu Glu110 115 120Thr Val Lys His Asp Trp Asp Arg Met Ile Glu Ala Val Gln Asn His125 130 135Ile Gly Ser Leu Asn Trp Gly Tyr Arg Val Ala Leu Arg Glu Lys Lys140 145 150Val Val Tyr Glu Asn Ala Tyr Gly Gln Phe Ile Gly Pro Hie Arg Ile155 160 165Lys Ala Thr Asn Asn Lys Gly Lys Glu Lys Ile Tyr Ser Ala Glu Arg170 175 180 185Phe Leu Ile Ala Thr Gly Glu Arg Pro Arg Tyr Leu Gly Ile Pro Gly190 195 200Asp Lys Glu Tyr Cys Ile Ser Ser Asp Asp Leu Phe Ser Leu Pro Tyr205 210 215Cys Pro Gly Lys Thr Leu Val Val Gly Ala Ser Tyr Val Ala Leu Glu220 225 230Cys Ala Gly Phe Leu Ala Gly Ile Gly Leu Asp Val Thr Val Met Val235 240 245Arg Ser Ile Leu Leu Arg Gly Phg Asp Gln Asp Met Ala Asn Lye Ile250 255 260 265Gly Glu His Met Glu Glu His Gly Ile Lys Phe Ile Arg Gln Phe Val270 275 280Pro Ile Lys Val Glu Gln Ile Glu Ala Gly Thr Pro Gly Arg Leu Arg285 290 295Val Val Ala Gln Ser Thr Asn Ser Glu Glu Ile Ile Glu Gly Glu Tyr300 305 310Asn Thr Val Met Leu Ala Ile Gly Arg Asp Ala Cye Thr Arg Lys Ile315 320 325Gly Leu Glu Thr Val Gly Val Lys Ile Asn Glu Lys Thr Gly Lys Ile330 335 340 345Pro Val Thr Asp Glu Glu Gln Thr Asn Val Pro Tyr Ile Tyr Ala Ils350 365 360Gly Asp Ile Leu Glu Asp Lys Val Glu Leu Thr Pro Val Ala Ile Gln365 370 375Ala Gly Arg Leu Leu Ala Gln Arg Leu Tyr Ala Gly Ser Thr Val Lys380 385 390Cys Asp Tyr Glu Asn Val Pro Thr Thr Val Phe Thr Pro Leu Glu Tyr395 400 405Gly Ala Cys Gly Leu Ser Glu Glu Lys Ala Val Glu Lys Phe Gly Glu410 415 420 425Glu Asn Ile Glu Val Tyr His Ser Tyr Phe Trp Pro Leu Glu Trp Thr430 435 440Ile Pro Ser Arg Asp Asn Asn Lys Cys Tyr Ala Lys Ile Ile Cys Asn445 450 455Thr Lys Asp Asn Glu Arg Val Val Gly Phe His Val Leu Gly pro Asn460 465 470Ala Gly Glu Val Thr Gln Gly Phe Ala Ala Ala Leu Lye Cys Gly Leu475 480 485Thr Lys Lys Gln Leu Asp Ser Thr Ile GIy Ile His Pro Val Cys Ala490 495 500 505Glu Val Phe Thr Thr Leu Ser Val Thr Lys Arg Ser Gly Ala Ser Ile510 515 520Leu Gln Ala Gly Cys525序列ID號13序列長度15序列類型核酸鏈型雙鏈拓樸學線型分子類型其它核酸，合成的DNA序列TAAATAAATA AATAA序列ID號14序列長度66序列類型核酸鏈型雙鏈拓樸線型分子類型其它核酸，合成的DNA序列CTAGCGCTCT GGGGCAAGCA TCCTCCAGGC TGGCTGCCAC CACCACCACC ACCACTGATC 60TAGACT66序列ID號15序列長度18序列類型核酸拓樸學線型分子類型其它核酸，合成的DNA序列描述GGTCAGCACA AATTTCCA18序列ID號16序列長度24序列類型核酸拓樸學線型分子類型其它核酸，合成的DNA序列描述AAACACAACT TGGAATGAAC AATT 24序列ID號17序列長度24序列類型核酸拓樸學線型分子類型其它核酸，合成的DNA序列描述TCATTCCAAG TTGTGTTTGT GAAA 24序列ID號18序列長度18序列類型核酸拓樸學線型分子類型其它核酸，合成的DNA序列描述CATAGGATGC TCCAACAA18
權利要求
1．一種多核苷酸序列，它編碼含有序列ID No.12的第1至526號胺基酸之胺基酸序列的多肽，或編碼所說多肽的突變體或變異體，條件是由該多核苷酸序列編碼的多肽能夠還原二氯靛酚或氧化態穀胱甘肽。
2．根據權利要求1的多核苷酸序列，它與序列ID No.12的1至526號胺基酸分享55％或更多的序列同源性。
3．根據權利要求1的多核苷酸序列，它與序列ID No.12的1至526號胺基酸分享70％以上的序列同源性。
4．根據權利要求1的多核苷酸序列，它與序列ID No.12的1至526號胺基酸分享80％以上序列同源性。
5．根據權利要求1的多核苷酸序列，其中編碼序列含有序列IDNo.11中所示的第70至1647位核苷酸序列。
6．根據權利要求1的多核苷酸序列，它編碼具有序列ID 12中序列-23至526的多肽或其突變體或變異體。
7．與權利要求1的多核苷酸序列雜交的DNA，其中相應的有意義鏈編碼具有還源活性的多肽。
8．根據權利要求7的DNA，其中雜交條件是在60℃至70℃使用6X SSC。
9．由權利要求1的多核苷酸序列編碼的多肽。
10．權利要求9的多肽在製備用於治療或預防下述疾病的藥物中的應用氧化應激、動脈硬化、糖尿病、局部缺血性疾病、水腫、血管通透性增加、炎症、胃黏膜疾病、急性胰腺炎、克羅恩氏病、潰瘍性結腸炎、肝病、帕拉夸特氏病、肺氣腫、化學性癌症、癌轉移、成人呼吸窘迫綜合症、彌散性血管內凝血、白內障、早熟性視網膜病、自身免疫性疾病、葉啉血症、溶血性疾病、地中海貧血、帕金森氏病、阿爾茨海默氏病、癲癇、紫外線照射性疾病、放射性疾病、凍傷、燒傷或任何由活化氧引起的疾病。
11．一種藥物組合物，該組合物含有藥學上活性量的權利要求9的肽連同藥學上可接受的載體。
12．一種載體，該載體含有權利要求1的多核苷酸序列。
13．根據權利要求12的載體，它是一種表達載體。
14．用權利要求12的載體轉化的宿主。
15．一種表達系統，該表達系統包括用權利要求13的載體轉化的宿主。
16．根據權利要求15的表達系統，其中宿主是大腸桿菌(E.coli)。
17．由權利要求15的表達系統生產的多肽。
18．一種抗體或其等同物，它特異性地識別KM31-7蛋白質、或特異性地識別KM31-7蛋白質的突變體或變異體。
19．根據權利要求18的抗體，它是一種單克隆抗體。
20．根據權利要求18的抗體，其中所說的抗體在抗原性上類似於人抗體。
21．一種識別權利要求18的抗體的識另位點的抗同種異型抗體。
22．由命名為MKM150-2的雜交瘤產生的抗體，或由命名為MKM150-2的雜交瘤獲得之雜交瘤衍生的抗體，雜交瘤MKM150-2已保藏於日本工業科學技術處發酵研究所，保藏號是FERM BP-5086。
23．根據權利要求18的抗體，該抗體用於分離和純化KM31-7蛋白質。
24．一種純化KM31-7蛋白質的方法，該方法包括用權利要求18的抗體結合所說蛋白質。
25．能夠在培養基中表達權利要求18的抗體的雜交瘤。
26．一種雜交瘤，該雜交瘤命名為MKM150-2，保藏於日本工業科學技術處發酵研究所，保藏號是FERM BP-5086。
全文摘要
利用自體溶解融合蛋白質的表達系系統和新的還原性多肽。本發明提供了用於外源性多肽的表達系統,其中多肽被表達成與三葉草黃色葉脈病毒核包涵體a(NIa)構成的融合蛋白質,該NIa成份在表達之後負責自體溶解該融合蛋白質。此系統可被用於表達一種新的多肽,它被命名為KM31－7蛋白質,並且能夠還原二氯靛酚和氧化態穀胱甘肽。此多肽可用於治療由氧化應激引起的疾病。
文檔編號C12N1/21GK1320689SQ0111089
公開日2001年11月7日 申請日期2001年2月27日 優先權日1994年7月13日
發明者高橋亙, 芹澤伸記, 小石龍太, 川島一郎 申請人:三共株式會社