青光眼發病風險的判定方法

2023-04-30 17:28:41 2

專利名稱：青光眼發病風險的判定方法
技術領域：
本發明涉及一種檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或青光眼發病風險高的單核苷酸多態性的存在的方法、以及用於該檢測方法的試劑盒。

背景技術：
青光眼是一種由於視網膜神經節細胞死亡而導致特徵性視神經乳頭凹陷和視野缺損的疾病。眼壓升高被認為是青光眼中乳頭凹陷和視野缺損的主要原因。另一方面，還存在一種眼壓在經統計計算得到出的正常範圍內的青光眼，但這種情況下，對其個體而言該眼壓也是足以產生視野缺損的高眼壓，所以也認為是發生了青光眼。
治療青光眼的基本原則是保持低眼壓，為了保持低眼壓，就必需要考慮導致高眼壓的原因。因此，在青光眼的診斷中，重要的是根據眼壓的高低及其原因對青光眼進行分類。作為導致眼壓升高的原因，充滿眼內的房水的主要排出經路-隅角是否存在閉塞是重要的。從上述觀點考慮，原發性青光眼大致分為伴有隅角閉塞的隅角閉塞型青光眼和不伴有隅角閉塞的隅角開放型青光眼。其中，隅角開放型青光眼又分為伴有眼壓升高的狹義的隅角開放型青光眼、即原發性隅角開放型青光眼和眼壓在正常範圍內的正常眼壓青光眼。
很久以來就已知青光眼與遺傳有關，有報導稱在隅角開放型青光眼中，有5～50％具有家族史，通常有20～25％是遺傳性的。根據上述報導，人們在進行探索青光眼的致病基因的研究，作為研究的成果，有人報導了肌球蛋白樣蛋白(Myocilin，MYOC)基因的突變與隅角開放型青光眼有關(參照專利文獻1)、而視神經蛋白基因(optineurin，OPTN)的突變與正常眼壓青光眼有關(參照非專利文獻1)。但僅憑這些基因還無法說明所有青光眼的遺傳因素，於是設想還存在未知的青光眼相關基因。
另一方面，單核苷酸多態性是指在個體基因組的核苷酸序列中，發現一個鹼基變成其它鹼基的置換突變，該突變在其生物種的集團中以某種程度的頻率、通常約1％以上的頻率存在。單核苷酸多態性存在於基因上的內含子、外顯子或除此以外的基因組的所有區域。
專利文獻1日本特開2000-306165號公報 非專利文獻1Rezaie T其他作者11名，Science，2002年，第295卷，No.5557，第1077～1079頁.

發明內容
發明所要解決的課題 通常，將眼壓或眼底照片用作青光眼的簡單檢查，但通過這些檢查還不能確診青光眼。除此之外，通常還進行視野檢查，但卻存在以下問題檢查時間長，患者負擔大；以及患者必需適應檢查，所以初次檢查結果的可靠性低等。
另一方面，如上所述，在青光眼的發病中強烈懷疑有遺傳因素的參與，但決定性的致病基因還未確定。另一方面，即使根據單一基因的突變或多態性還無法說明與疾病有關，但卻認為可如下說明青光眼的發病與遺傳因素有關存在多個與青光眼有關的比較穩定的基因突變或多態性，各個突變或多態性結合起來發揮作用。
本發明人等為了找出與青光眼有關的基因，著眼於基因組上的多態性、特別是單核苷酸多態性。
通過找出與青光眼發病有關的多態性，具有該多態性、即在青光眼患者中高頻率確認到的多態性的人，甚至在發病前就預知將來青光眼的發病風險高。或者，該多態性可用於篩選是否需要進行初期青光眼的視野檢查，上述初期青光眼通過簡單的青光眼判定、即測定眼壓或眼底照片等方法難以檢測，只能通過視野檢查作出初次診斷。即，通過了解青光眼發病風險，樣品提供者可以採取預防青光眼發病的措置。另外，可以採取例如通過精密檢查作出的早期確診和開始治療等防止視野狹窄所必需的措置，所以找出與青光眼發病相關的多態性具有深遠意義。
本發明的課題在於提供通過檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性來預測青光眼發病風險的方法、和用於該檢測方法的試劑盒。
解決課題的方法 本發明人等對青光眼患者和不具有青光眼家族史的非患者的基因組(常染色體)上所存在的公知多態性部位進行綜合分析，發現了與青光眼發病有關的單核苷酸多態性。在該單核苷酸多態性中進一步發現了在青光眼患者中高頻率確認到的等位基因及其對立等位基因、以及各等位基因的組合、即在青光眼患者中高頻率確認到的基因型。並且發現通過將上述多個與青光眼發病有關的單核苷酸多態性組合起來進行判定，可以精度更高地判定樣品提供者是否容易發生青光眼，從而完成了本發明。
即，本發明涉及下述[1]～[7]。
[1]是否存在青光眼風險的判定方法，該方法包括以下步驟 步驟A在體外檢測在來自受檢者的樣品中存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型的步驟，所述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列；以及 步驟B將上述步驟A中檢測到的等位基因和/或基因型與SEQ IDNO203～514所示的核苷酸序列中包含高風險等位基因的至少一個等位基因和/或基因型進行比較的步驟， 當上述步驟A中檢測到的等位基因為上述高風險等位基因時，判定存在青光眼風險；或者，當上述高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且上述步驟A中檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子或雜合子時，判定存在青光眼風險；當上述高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且上述步驟A中檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子時，判定存在青光眼風險。
[2]是否存在青光眼風險的判定方法，該方法包括以下步驟 步驟C1在體外檢測在來自受檢者的樣品中存在於核酸分子的如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型的步驟，上述核酸分子包含選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列；或 步驟C2使用含有核苷酸序列的核酸分子，在體外檢測上述單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型的步驟，上述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO515～694所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列；以及 步驟D將上述步驟C1或C2中檢測到的等位基因和/或基因型與至少一個核酸分子進行比較的步驟，上述核酸分子含有SEQ IDNO203～514所示的核苷酸序列中包含高風險等位基因的等位基因和/或基因型， 上述步驟C1或C2中檢測到的等位基因為上述高風險等位基因時，判定為存在青光眼風險；或者，當上述高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且上述步驟C1或C2中檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子或雜合子時，判定為存在青光眼風險；當上述高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且上述步驟C1或C2中檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子時，判定為存在青光眼風險。
[3]判定是否存在青光眼風險的試劑盒，該試劑盒含有下述核酸分子包含選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核酸分子，該核酸分子包含存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性；和/或含有核苷酸序列的核酸分子，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO515～694所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列；該試劑盒用於在體外檢測在來自受檢者的樣品中上述單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型。
[4]是否存在青光眼風險的判定方法，該方法包括以下步驟 步驟(i)從來自受檢者的樣品中提取核酸分子的步驟； 步驟(ii)對於上述步驟(i)中提取的核酸分子，將存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因分類的步驟，上述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列或其互補序列的至少一個核苷酸序列； 步驟(iii)根據上述步驟(ii)中檢測到的等位基因判定是否存在青光眼風險的步驟。
[5]核酸分子在判定青光眼風險中的應用，所述核酸分子包含選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列，該核酸分子包含存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型。
[6]青光眼的診斷方法，該方法包括以下步驟 步驟E在體外檢測在來自受檢者的樣品中存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型的步驟，上述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列；以及 步驟F將上述步驟E中檢測到的等位基因和/或基因型與SEQ IDNO203～514所示的核苷酸序列中包含高風險等位基因的至少一個等位基因和/或基因型進行比較的步驟， 上述步驟E中檢測到的等位基因為上述高風險等位基因時，診斷為青光眼；或者，當上述高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且上述步驟E中檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子或雜合子時，診斷為青光眼；當上述高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且上述步驟E中檢測到的基因型為含有上述高風險等位基因的基因型的純合子時，診斷為青光眼。
[7]青光眼發病風險的判定方法，該方法包括以下步驟 步驟(I)使用權利要求3所述的判定方法判定是否存在青光眼發病風險的步驟； 步驟(II)在上述步驟(I)中，當根據至少任一個單核苷酸多態性判定存在發病風險時，判定需要進行進一步的風險判定的步驟； 步驟(III)在上述步驟(II)中，當判定需要進行進一步的風險判定時，使用權利要求5所述的判定方法，進一步判定是否存在青光眼發病風險的步驟。
發明效果 根據本發明的方法，通過分析來自存在於樣品中的基因組的核酸分子中所含的、本發明的單核苷酸多態性的等位基因或基因型，判定樣品提供者是否存在青光眼發病風險，並且可以預測風險的高低。根據該風險，樣品提供者可以採取預防青光眼的措施、或者接受適當的治療。另外，利用本發明的方法，疑似青光眼的樣品提供者可以接受精密檢查，該精密檢查可以診斷根據眼壓或眼底照片難以充分判別的初期青光眼，所述樣品提供者在基因組中具有在青光眼患者中高頻率確認到的包含單核苷酸多態性的等位基因或基因型。當診斷為青光眼時，可以在早期開始治療。
實施發明的最佳方式 本發明涉及是否存在青光眼風險的判定方法，在該青光眼風險的判定方法中，包括下述步驟使用選自特定核苷酸序列的核苷酸序列或其互補序列中所含的至少一個單核苷酸多態性(以下，有時還記作SNP)，在體外檢測具有上述至少一個單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型的步驟；該方法還包括下述步驟在來自受檢者的樣品中，將通過上述步驟檢測到的等位基因和/或基因型與特定核苷酸序列中的含有高風險等位基因的至少一個等位基因和/或基因型進行比較的步驟；當上述檢測到的等位基因為上述高風險等位基因時，判定為存在青光眼風險；或者，當上述高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且上述檢測到的基因型符合包含上述高風險等位基因的基因型的純合子或雜合子時，判定為存在青光眼風險；當上述高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且上述檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子時，判定為存在青光眼風險。本發明具有以下主要特徵發現了與青光眼發病有關的單核苷酸多態性，還發現了在該單核苷酸多態性中，存在青光眼患者中高頻率確認到的等位基因及其對立等位基因、以及各等位基因的組合即青光眼患者中高頻率確認到的基因型，並加以使用。需要說明的是，在本說明書中，多態性是指在某生物種的基因組的特定位置序列中確認到多樣性，而多態性存在的部位(以下還稱作多態性部位)是指確認到單核苷酸多態性的基因組上的部位。
在本說明書中，等位基因是指在某多態性部位能夠獲取的、彼此具有不同鹼基的各型。本說明書中，基因型是指在某多態性部位對立的等位基因的組合。並且，在某多態性部位，對立的等位基因的組合、即基因型中存在三個型，將相同等位基因的組合稱作純合子，將不同等位基因的組合稱作雜合子。
在本說明書中，對立的等位基因是指在構成某單核苷酸多態性的等位基因中，對應於特定的等位基因的其它等位基因。
本發明中，與青光眼有關的單核苷酸多態性是指與青光眼的發病有關的單核苷酸多態性或與青光眼的進展有關的單核苷酸多態性，即與青光眼發病有關的單核苷酸多態性是指，在青光眼患者和非患者中，統計學上的p值顯示該單核苷酸多態性中各等位基因或基因型的頻率顯著不同，而與青光眼的進展有關的單核苷酸多態性是指在青光眼進展例與青光眼非進展例中，統計學上的p值顯示該單核苷酸多態性中各等位基因或基因型的頻率顯著不同。
本發明中，高風險等位基因是指上述與青光眼有關的單核苷酸多態性的各等位基因中，在青光眼患者組中的頻率較在非患者組中的頻率高的等位基因。另一方面，在本發明中，低風險等位基因是指在某多態性部位與高風險等位基因對立的等位基因。
另外，基因型的純合子和雜合子按照與在高風險等位基因和低風險等位基因中相同的方式進行定義。即，在某多態性部位中，將高風險等位基因之間險等位或低風險等位基因之間的組合稱作純合子，將高風險等位基因與低風險等位基因的組合稱作雜合子。
將青光眼患者組與非患者組的等位基因頻率進行統計學比較的方式稱作等位基因模型，而將基因型頻率進行比較的方式稱作基因型模型。需要說明的是，在基因型模型中有顯性遺傳模型和隱性遺傳模型，前者是指高風險等位基因的純合子和雜合子均與發病風險有關的方式，而後者是指高風險等位基因的純合子與發病風險有關的方式。
本發明中，青光眼風險是指與青光眼有關的風險。青光眼的發病風險是指根據疾病感受性確定的、將來發生青光眼的可能性。本發明中，風險預測是指現階段判定將來是否會存在風險、或者現階段確定將來風險的高低。
在本說明書中，青光眼優選是指隅角開放型青光眼(OAG)或正常眼壓青光眼(NTG)，隅角開放型青光眼是指在沒有特別限制使用的情況下，不包括正常眼壓青光眼的狹義的原發性隅角開放型青光眼(POAG)。
以下說明與青光眼有關的單核苷酸多態性的鑑定方法。
本發明中，關於與青光眼有關的單核苷酸多態性，具體而言，從診斷為原發性隅角開放型青光眼或正常眼壓青光眼的青光眼患者和診斷為不是青光眼且通過問診判斷沒有青光眼家族史的非患者(有時還記作對照者)各自的血液中提取總DNA，以人基因組上公知的約50萬個單核苷酸多態性為指標，比較各單核苷酸多態性的等位基因或基因型在青光眼患者和非患者中的頻率，由此選擇作為候選的單核苷酸多態性。並且，通過在不同於上述樣品組的青光眼患者和非患者中取得選擇作為候選的上述各單核苷酸多態性的等位基因或基因型的頻率，並將這些結果整合，發現了頻率之差在統計學上確認為高顯著性的單核苷酸多態性。另外，由青光眼患者組成的組作為青光眼患者組，由非患者組成的組作為非患者組。使用通過上述解析發現的、具有與青光眼發病有關的單核苷酸多態性的等位基因或基因型，從而可以判定是否存在青光眼的發病風險、以及預測發病風險的高低。利用下述方法可以鑑定本發明所公開的與青光眼有關的單核苷酸多態性，有關細節在實施例項下說明。
(與青光眼有關的單核苷酸多態性的鑑定) 首先，從診斷為青光眼的患者和判斷不具有青光眼家族史的非患者各自的血液中提取總DNA。血液中的總DNA可以通過公知的任意方法進行提取，例如將細胞溶解，使洗脫的DNA結合在用二氧化矽包被的磁性珠粒的表面，再利用磁力進行分離、回收，從而可以提取DNA。
在提取的DNA樣品中，單核苷酸多態性中的鹼基種類、即具有單核苷酸多態性的等位基因的鑑定可以利用例如後述的使用固定化探針的方法等任意方法來進行。此時，用於檢測的探針可以根據目標單核苷酸多態性及其周邊的序列信息來設計。設計時，還可以使用dbSNP等公知的單核苷酸多態性資料庫，參考從中得到的序列信息。用於檢測單核苷酸多態性的探針可以是與基因組的有義鏈互補的探針，也可以是與反義鏈互補的探針，兩者均可進行檢測。將大量的可檢測存在於人基因組上的單核苷酸多態性的探針固定化，之後通過相同操作可以確定多個單核苷酸多態性的等位基因的試劑盒也已市售，使用上述試劑盒還可以高效率地確定樣品中的等位基因，其細節見後述。另外，許多上述試劑盒都具有通過相同操作來檢測一個樣品中所含的對立的各等位基因的構成，可以確定基因型。
與青光眼有關的單核苷酸多態性可如下確定事先按照上述方法鑑定存在於來自青光眼患者和非患者的DNA中的等位基因，將各等位基因的頻率和基因型的頻率在青光眼患者組與非患者組之間作統計學比較，對於等位基因頻率或基因型頻率的至少一種，根據是否產生如下差值來進行判定所述差值是p值為低於根據某基準確定的顯著水平的差值。產生差值時，對於上述因子，在青光眼患者組與非患者組之間比較等位基因頻率或基因型頻率，確定是否任一個等位基因或基因型在青光眼患者組被高頻率確認。
在統計學分析中，例如可以採用卡方檢驗。另外，因反覆進行比較而產生的第一種錯誤可以通過公知的校正方法、例如Bonferroni方法進行校正，在基於Bonferroni校正的情況下，例如可以用p值5×10-2除以檢驗的反覆次數、即作為卡方檢驗的比較對象的多態性的個數，得到顯著水平。可以選擇低於如此求得的顯著水平的單核苷酸多態性作為更優選的單核苷酸多態性，而其它公知的用於多重性校正的方法、例如FDR法或置換法也可用於選擇優選的單核苷酸多態性。但是，Bonferroni校正等公知的多重性校正方法是以反覆分析的事件完全獨立為前提的方法，另一方面，如下所述，由於在單核苷酸多態性中確認到連鎖不平衡，所以會存在並不完全獨立的情況。即，認為這種情況下採用Bonferroni方法進行校正會導致過度校正。特別是對於本發明這樣的遍及全基因組的單核苷酸多態性分析，應該進行統計比較的因素非常多，所以若進行多重性校正，則作為基準的p值會顯著降低，忽略與疾病有關的單核苷酸多態性的可能性會增加(Schymick J C等，Lancet Neurology.20076322-8Van Steen K等，Nature Genetics.200537683-691)。學術上所期望的多重性校正方法尚未確立，但作為其它的校正方法，可以利用其它公知的校正方法進行校正，或者在不低於由Bonferroni校正得到的顯著水平的範圍的任意適當水平上設定顯著水平。設定任意的適當水平時，例如在反覆分析50萬個單核苷酸多態性的情況下，顯著水平採用5×10-2，更優選1×10-2，進一步優選1×10-3，更進一步優選1×10-4，再進一步優選3×10-5，又進一步優選1×10-5。如下所述，本發明中已經確認與青光眼的關聯得到認可的單核苷酸多態性在基因組上的某個領域連續存在，所以上述顯著水平的調整是有用的。
另外，已知第一類錯誤與統計學檢測力通常成反比。作為減小第一類錯誤的同時保持檢測力的方法，可以列舉出將單核苷酸多態性分析分兩階段進行實施的方法(Skol A.D.等，Nature Genetics.200638209-213)。例如，對一定數量的某樣品進行單核苷酸多態性分析時，首先，進行一次分析、即對其一部分樣品進行遍及全基因組的多個單核苷酸多態性分析，接著進行二次分析、即使用一次分析中以某種程度縮減的單核苷酸多態性對剩餘樣品進行分析。這種情況下，可以選擇在所有分析中均得到較低p值、例如p值為0.05的單核苷酸多態性，優選按一定的顯著水平選擇在最初分析中作為候選的單核苷酸多態性，使用其它樣品進一步分析上述所選擇的單核苷酸多態性。另一方面，更優選將一次分析和二次分析的結果整合進行分析，而不是分別進行統計分析。這種情況下，可以按照公知的整合分析(メタ解析)方法、例如Mantel-Haenszel法(Mantel N等，Journal of the National CancerInstitute 195922719-748)，將兩次的分析結果整合。按照Mantel-Haenszel法等整合分析方法將分析結果整合時，在各個分析中進行單核苷酸多態性選擇的顯著水平不必是Bonferroni校正的水平，可以考慮縮減效率等來設定。另一方面，使用按照Mantel-Haenszel法等整合分析方法整合的p值來判斷是否顯著時，優選在考慮多重性的情況下使用顯著水平。需要說明的是，Mantel-Haenszel法是指在進行卡方檢驗等時，將通過多次分析得到的結果進行加權，之後將分析結果整合的方法。在按照Mantel-Haenszel法整合的統計學參數中，除p值外，還有後述的比值比等。
就用於檢測與青光眼有關的等位基因或基因型的單核苷酸多態性而言，例如基於使用通過1次操作可檢測50萬個單核苷酸多態性的微陣列進行1次分析而得到的結果時，優選p值為1×10-3以下的單核苷酸多態性，更優選p值為3×10-4以下的單核苷酸多態性，進一步優選p值為1×10-4以下的單核苷酸多態性，更進一步優選p值為3×10-5以下的單核苷酸多態性。當為按照Mantel-Haenszel法等整合分析方法將多個分析結果整合而得到的結果時，優選p值為1×10-2以下的單核苷酸多態性，更優選p值為3×10-3以下的單核苷酸多態性，進一步優選p值為1×10-4以下的單核苷酸多態性，更進一步優選p值為3×10-4以下的單核苷酸多態性。
分析時，為了得到可靠性高的結果，優選對足夠數量的單核苷酸多態性進行分析。例如，相對於總樣品的各單核苷酸多態性的判定率、即檢出率(コ一ルレ一ト，call rate)低的多態性部位發生分型錯誤(タィピングェラ一，typing error)的機率高，可靠性不高。因此，優選使用檢出率足夠高的單核苷酸多態性部位進行分析。作為是否採用單核苷酸多態性的基準的檢出率優選採用例如顯示出優選70％、更優選75％、進一步優選80％、更進一步優選85％、再進一步優選90％以上的檢出率的單核苷酸多態性。
此外，分析時可以考慮的因子有Hardy-Weinberg’s平衡和次要等位基因頻率。
Hardy-Weinberg’s平衡是指在沒有突變和選擇壓力的情況下，通過任意交配形成的具有足夠個體數的遺傳同源集團中，某基因座位上各對立基因的分布頻率即使世代交替也保持恆定。Hardy-Weinberg’s平衡是否成立，這可以通過幾種公知的方法、例如卡方檢驗或Fischer直接概率計算法來確認。在足夠數目的集團中，認為通過1次任意交配Hardy-Weinberg’s平衡成立，即只要不存在近親交配，則Hardy-Weinberg’s平衡成立。因此，通常以母集團中Hardy-Weinberg’s平衡成立為前提，為了檢測標本的基因型判定的錯誤，採用Hardy-Weinberg’s平衡的研究。但是，即使整體上Hardy-Weinberg’s平衡成立，但在某基因座位上在疾病組或對照組中不均勻地存在特定基因型時，例如由於存在特定基因型對疾病具有決定性影響的情形等，所以在探索疾病相關基因時，也可省略本研究。
次要等位基因頻率是指當為兩個等位基因中所含的單核苷酸多態性時，在兩個等位基因頻率中頻率低的等位基因的頻率。閾值可以任意設定。如上所述，單核苷酸多態性的概念是指次要等位基因頻率超過約1％的概念，所以優選捨棄次要等位基因頻率低於1％的單核苷酸多態性。另一方面，在疾病組中等位基因頻率極高或極低的等位基因對疾病可能具有決定性的影響。在對多因子疾病原因的多態性的探索中，認為有多個對疾病的參與相對較低的多態性參與了疾病，所以為了探索這樣的多態性，排出一定值以下的頻率、例如不足5％的次要等位基因，再進行分析，這也可作為優選的方法。反之，在探索對疾病具有決定性影響的多態性時，不進行根據次要等位基因頻率的捨棄也是有效的。
對於如此操作而得到的與青光眼有關的等位基因型或基因型，通過參照Genbank等公知序列資料庫或dbSNP等公知單核苷酸多態性資料庫，可以獲得其單核苷酸多態性所存在的基因組上的位置、序列信息、單核苷酸多態性所存在的基因或鄰近存在的基因、當存在於基因上時內含子或外顯子的區別或其功能、其它生物種中的相同基因等信息，根據這些信息可以獲取本發明中使用的核酸分子，設計本發明中使用的探針等。
在如此操作而確定的與青光眼有關的單核苷酸多態性中，將高風險等位基因定義為判斷是否存在風險的基準。如上所述，在本發明中，高風險等位基因是指在與青光眼有關的單核苷酸多態性的各等位基因中，在青光眼患者組中的頻率較在非患者組中的頻率高的等位基因。在本發明中，低風險等位基因是指在某多態性部位與高風險等位基因對立的等位基因。
判定是否存在發病風險可以根據等位基因或基因型來進行。
根據等位基因進行判定時，由於該單核苷酸多態性具有高風險等位基因，故判斷存在發病風險。
根據基因型進行判定時，要考慮高風險等位基因是符合顯性遺傳模型還是符合隱性遺傳模型，再來判斷發病風險。在某多態性部位，當高風險等位基因的純合子和雜合子的頻率在青光眼患者組中較在非患者組中顯著高時，稱這些基因型符合顯性遺傳模型。當高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且基因型為高風險等位基因的純合子或雜合子時，判斷該單核苷酸多態性存在發病風險。另一方面，當高風險等位基因的純合子的頻率在青光眼患者組中較在非患者組中顯著高時，稱這些基因型符合隱性遺傳模型。當高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且基因型為高風險等位基因的純合子時，判斷該單核苷酸多態性存在發病風險。
判定是否存在發病風險還可以根據低風險等位基因來進行。如上所述，低風險等位基因是與高風險等位基因對立的等位基因，即在非患者組中高頻率確認到的等位基因。根據等位基因進行判定時，由於該單核苷酸多態性不具有低風險等位基因，故判斷存在發病風險。
基因型的情形也同樣地考慮。根據基因型進行判定時，要考慮低風險等位基因是符合顯性遺傳模型還是符合隱性遺傳模型，再來判斷發病風險。在某多態性部位，當低風險等位基因的純合子和雜合子的頻率在非患者組中較在青光眼患者組中顯著高時，稱這些基因型符合顯性遺傳模型。當低風險等位基因符合顯性遺傳模型、且基因型不是低風險等位基因的純合子或雜合子時，判斷該單核苷酸多態性存在發病風險。另一方面，當低風險等位基因的純合子的頻率在非患者組中較在青光眼患者組中顯著高時，稱這些基因型符合隱性遺傳模型。低風險等位基因符合隱性遺傳模型、且基因型不是低風險等位基因的純合子時，判斷該單核苷酸多態性存在發病風險。
至於是否使用等位基因、顯性遺傳模型、隱性遺傳模型中的任一個的方法進行判定，可以採用與求出判斷為顯著的p值的方法相同的方法。當有關一個單核苷酸多態性存在多種求出判斷為顯著的p值的方法時，可以採用任一種方法，但優選採用與計算出最低p值的方法相同的方法。
通常，在與疾病有關的單核苷酸多態性中，採用相對危險度或比值比作為指標，其為在一方的等位基因或基因型與是否患有疾病之間存在何種強度的關係的指標。
通常，相對危險度(relative risk)是指攜帶危險因子的組中的發病率與不攜帶危險因子的組中的發病率之比。而比值比通常是指患者組中攜帶危險因子的人的比例與不攜帶危險因子的人的比例之比，即，用比值除以在非患者組中同樣求得的比值而得到的值，如本發明這樣的情形，在對照研究中往往使用比值比。在本發明中，比值比根據等位基因頻率與基因型頻率而求得。即，與發病有關的單核苷酸多態性的比值比是指用青光眼患者組中的某等位基因或基因型的頻率與其它等位基因或基因型的頻率之比，再除以在非患者組中同樣求得的頻率之比而得到的值。在本發明中，利用上述指標可以預測在具有某等位基因或基因型時與具有除此以外的等位基因或基因型時相比，青光眼的發病風險增加了何種程度。例如，當某單核苷酸多態性的特定等位基因的比值比大於1時，該等位基因是在青光眼患者組中高頻率確認到的等位基因，則比值比越大，攜帶該等位基因的樣品提供者其青光眼發病風險越高。而當等位基因的比值比小於1時，該等位基因是在疾病中高頻率確認到的等位基因的對立等位基因，則比值比越小，攜帶該等位基因的樣品提供者其青光眼發病風險越低。至於基因型，也同樣可以預測疾病的風險。
在本發明中，通過以高風險等位基因為基準求出比值比，比值比的值常常會大於1。如上所述，當攜帶高風險等位基因時，通過定義比值比使其大於1，從而使多個單核苷酸多態性組合來進行預測風險變得容易。
以下細節如實施例中的數學式所示，計算等位基因中的比值比時，可以用青光眼患者組中的高風險等位基因頻率與低風險等位基因頻率之比，再除以非患者組中的高風險等位基因頻率與低風險等位基因頻率之比，以得到的值作為比值比。計算基因型中的比值比時，要考慮高風險等位基因是符合顯性遺傳模型還是符合隱性遺傳模型，之後再計算比值比。即，當高風險等位基因符合顯性遺傳模型時，高風險等位基因的純合子和雜合子成為危險因子；當高風險等位基因符合隱性遺傳模型時，高風險等位基因的純合子成為危險因子。因此，高風險等位基因符合顯性遺傳模型時的比值比可如下求得求出青光眼患者組中高風險等位基因的純合子頻率與雜合子頻率之和，再用該和與低風險等位基因的純合子頻率之比除以在非患者組中同樣求得的頻率之比，即可求得比值比。當高風險等位基因符合隱性遺傳模型時，求出青光眼患者組中低風險等位基因的純合子頻率與雜合子頻率之和，再用高風險等位基因的純合子頻率與上述和之比除以在非患者組中同樣求得的頻率之比，即可求得比值比。
並且，使用比值比可以確認用於預測風險的單核苷酸多態性的可靠性。如上所述，比值比為1以上和1以下時，對於風險預測的意義相反。因此，求出比值比的95％置信區間，當該置信區間包括1時，並不認為這樣的比值比相對於風險預測的可靠性高。
當根據本發明的單核苷酸多態性的組合來預測青光眼的發病風險時，也可以使用比值比的大小來預測其風險的高低。
關於等位基因的比值比，可以通過下式求出將兩個以上的單核苷酸多態性組合時的比值比。
(RA1combRA2comb)/(RA3combRA4comb) 其中， RA1comb在青光眼患者組中，至少一個等位基因為高風險等位基因時的等位基因頻率； RA2comb在青光眼患者組中，所有等位基因均為低風險等位基因時的等位基因頻率； RA3comb在非患者組中，對應於RA1comb的等位基因頻率； RA4comb在非患者組中，所有等位基因均為低風險等位基因時的等位基因頻率。
例如，當考慮組合與青光眼的發病風險有關的兩個單核苷酸多態性的情形時，通過用同時攜帶各單核苷酸多態性的高風險等位基因的、或攜帶任一所述高風險等位基因的青光眼患者組的頻率除以不攜帶任何高風險等位基因的青光眼患者組的頻率，可求出比值比。通過算出與同樣求得的非患者組的比值之比，可以求出將單核苷酸多態性組合時的比值比。
計算基因型組合時的比值比時，與單獨的情形一樣，要考慮高風險等位基因是符合顯性遺傳模型還是符合隱性遺傳模型，再計算比值比。
關於符合顯性遺傳模型時的比值比，可以通過下式求出將兩個以上的單核苷酸多態性組合時的比值比。
(RGd1combRGd2comb)/(RGd3combRGd4comb) 其中， RGd1comb在青光眼患者組中，至少一個基因型為高風險等位基因的純合子或雜合子的頻率 RGd2comb在青光眼患者組中，所有基因型的低風險等位基因均為純合子的頻率 RGd3comb；在非患者組中，對應於RGd1comb的基因型頻率 RGd4comb在非患者組中，所有基因型的低風險等位基因均為純合子的頻率。
例如，兩個單核苷酸多態性的高風險等位基因均符合顯性遺傳模型時的比值比可如下計算用青光眼患者組中兩個單核苷酸多態性中的任一個為高風險等位基因的純合子或雜合子的頻率與兩個單核苷酸多態性的低風險等位基因均為純合子的頻率之比除以在非患者組中同樣求得的頻率之比，即可求得比值比。
關於符合隱性遺傳模型時的比值比，可以通過下式求出將兩個以上的單核苷酸多態性組合時的比值比。
(RGr1combRGr2comb)/(RGr3combRGr4comb) 其中， RGr1comb在青光眼患者組中，至少一個基因型為高風險等位基因的純合子的頻率 RGr2comb在青光眼患者組中，所有基因型的低風險等位基因均為純合子的頻率 RGr3comb在非患者組中，對應於RGr1comb的基因型頻率 RGr4comb在非患者組中，所有基因型的低風險等位基因均為純合子的頻率。
例如，兩個單核苷酸多態性的高風險等位基因均符合隱性遺傳模型時的比值比可如下求得用青光眼患者組中兩個單核苷酸多態性中的任一個的高風險等位基因為純合子的頻率與兩個單核苷酸多態性的低風險等位基因均為純合子的基因型的頻率之比除以在非患者組中同樣求得的頻率之比，即可求得比值比。需要說明的是，關於單核苷酸多態性組合的比值比，還可以將具有不同遺傳形式的單核苷酸多態性組合起來進行計算。
通常，通過將兩個以上的單核苷酸多態性組合起來，與它們單獨使用時相比比值比有所增加。因此，決定利用兩個以上的單核苷酸多態性的組合來鑑定青光眼發病風險較高的樣品提供者，與單獨使用單核苷酸多態性時相比，可以提高預測精度。
為了確認由本發明的單核苷酸多態性的組合得到的青光眼發病風險的預測精度的提高，可以採用多變量分析法。作為多變量分析法，可以採用邏輯回歸分析法、判別分析法、重回歸分析法、比例風險分析法等本領域技術人員所周知的方法，其中，在處理存在和/或不存在青光眼發病風險等二值變量時，邏輯回歸分析法有效。
邏輯回歸分析法是指為了說明一個從屬變數(Φ)而分析多個獨立變數(∏)的貢獻程度的方法(ゎかりゃすぃ醫學統計學、第148-179頁、森實敏夫、Medical Tribune公司)。通過進行邏輯回歸分析，可以求出相對於各獨立變數的回歸係數(λ)，該回歸係數可以用作表示各獨立變數在何種程度上說明從屬變數的指標。另外，通過將該回歸係數代入下式，可以算出得到各獨立變數時的從屬變數。
Φ＝1/{1+exp[-(λ0+λ1∏1+λ2∏2+λ3∏3+…)]} 需要說明的是，進行邏輯回歸分析時，可以採用逐步回歸法等事先減少用於分析的獨立變數∏。逐步回歸法是指按照通過追加任意的獨立變數∏使回歸係數最大化的方式選擇獨立變數∏的方法。即，意思是指通過追加任意的獨立變數∏使回歸係數最大化後，即使再加入其它的獨立變數∏，仍可得到相同結果。
在本發明中，通過將兩個以上判定為與青光眼發病有關的任意的單核苷酸多態性組合起來，與單獨使用各單核苷酸多態性時相比，可以知道發病風險的預測精度所提高的程度。即，以上述任意的兩個以上單核苷酸多態性分別作為獨立變數∏(一方的等位基因的純合子＝0、雜合子＝1、對立等位基因的純合子＝2)，通過邏輯回歸分析求出上式。在各樣品中，將相對於各單核苷酸多態性的變數代入此式，計算從屬變數Φ。當從屬變數Φ大於一定閾值(例如0.5)時，判斷該樣品提供者為青光眼患者。核對該判定結果和具有該單核苷酸多態性的樣品提供者實際上是否是青光眼患者。根據兩個以上本發明的單核苷酸多態性的組合，確認一致的比例有所提高，從而可以確認組合所產生的精度提高。
有時存在於遺傳上足夠近的位置的單核苷酸多態性部位之間並不是獨立遺傳，而是連鎖遺傳。在某集團中，將雖然通過交配發生重組但仍保持這種連鎖的狀態稱作連鎖不平衡，將保持連鎖的單元稱作單元型區段(ハプロタィプブロック，haplotype block)或LD區段。
在本發明人等的實驗結果中，發現與青光眼有關的單核苷酸多態性有時實際上是集中存在於基因組上的鄰近處。認為這些區域屬於與青光眼有關的LD區段。為了確定與青光眼有關的LD區段，利用儘可能多的上述方法分析存在於該區域的單核苷酸多態性，通過採用用於確定LD區段的算法、例如EM算法即可確定。或者，當本發明的與青光眼有關的單核苷酸多態性屬於公知的LD區段時，可以將該LD區段作為與青光眼有關的LD區段。公知的LD區段可以在加利福尼亞大學聖克魯茲分校在網際網路上提供的Genome Browser等中瀏覽。
屬於與青光眼有關的LD區段的單核苷酸多態性與通過本發明人等的實驗鑑定的與青光眼有關的單核苷酸多態性連鎖，所以同樣認為其是與青光眼有關的單核苷酸多態性，將其用於預測青光眼的發病或發病風險。另外，通過再次確定與青光眼有關的LD區段內的序列、或通過本發明人等的實驗鑑定的與青光眼有關的單核苷酸多態性的周邊序列，還有可能發現與該單核苷酸多態性連鎖的、即與青光眼的發病或其進展有關的未知單核苷酸多態性。所發現的單核苷酸多態性實際上是否與青光眼的發病或其進展有關，這可以通過按照與上述說明相同的方式在疾病組與對照組間比較其等位基因或基因型的頻率來判定。
在本發明中，內含子型單核苷酸多態性(iSNP)是指在內含子中確認到的單核苷酸多態性。翻譯區型單核苷酸多態性(cSNP)是指在存在於被翻譯成蛋白的區域的單核苷酸多態性中，在胺基酸序列中伴有如下變化含有該單核苷酸多態性的密碼子突變成編碼其它胺基酸的密碼子或終止密碼子等。沉默型單核苷酸多態性(sSNP)是指在翻譯區確認到的單核苷酸多態性中，不伴有胺基酸序列變化的單核苷酸多態性。基因組型單核苷酸多態性(gSNP)是指存在於基因組上不編碼基因的區域的單核苷酸多態性。轉錄調節型多態性(rSNP)是指存在於認為與轉錄調節有關的部位的單核苷酸多態性。
如上所述，單核苷酸多態性有時會存在於基因組上的任何位置，無論何種情形均可與疾病有關。當單核苷酸多態性存在於內含子或非翻譯區時，有時會影響基因表達控制、或者影響基因轉錄後發生的剪接或mRNA的穩定性。當單核苷酸多態性存在於翻譯區時，因其鹼基置換而發生對應於某胺基酸的密碼子變成對應於其它胺基酸的密碼子或變成終止密碼子等變化，因此有時會在所編碼的蛋白結構上發生變化。由於這些變化，使基因的表達量或功能、以至該基因所編碼的蛋白的表達量或功能發生變化，可以成為各種疾病的病因。當基因組型單核苷酸多態性與疾病有關時，包含該多態性部位的區域實際上被翻譯，有可能對其它基因的表達產生某種影響。當沉默型單核苷酸多態性與疾病有關時，在其單核苷酸多態性的周邊存在與疾病有關的其它多態性，該多態性與沉默型單核苷酸多態性連鎖時，認為確認到了與疾病的關聯。同樣，即使是沉默型單核苷酸多態性以外的單核苷酸多態性，當該單核苷酸多態性本身並不是青光眼的直接原因、而是與存在於周邊的作為青光眼的真正原因的多態性連鎖時，有時也會確認到這些單核苷酸多態性與青光眼的關聯。這種情況下，如下所述，通過對本發明的單核苷酸多態性的周邊進行再測序，也可發現作為青光眼原因的多態性。但是，無論是否是疾病的真正原因，在任一種情況下，為了預測青光眼的發病風險，均可使用這些單核苷酸多態性。
(含有與青光眼有關的等位基因的核酸分子) 在本發明的一個方式中，提供含有與青光眼有關的單核苷酸多態性的核酸分子、以及具有與含有與青光眼有關的單核苷酸多態性的核酸分子互補的序列的核酸分子。
上述含有與青光眼有關的單核苷酸多態性的核酸分子或具有與該核酸分子互補的序列的核酸分子可以用作判定青光眼發病風險高低的標記。並且，這些核酸分子可以用作用於檢測該單核苷酸多態性中的在青光眼患者中高頻率確認到的等位基因或其對立等位基因、或者用作確定基因型的探針。當該單核苷酸多態性存在於外顯子上或其附近時，上述核酸分子可以用於檢測基因轉錄物。
構成真核生物基因組的核酸分子由雙鏈、即有義鏈和與有義鏈互補的反義鏈構成。即，單核苷酸多態性也存在於有義鏈和反義鏈中，檢測任一鏈的單核苷酸多態性均具有相同意義，所以本發明的核酸分子還包括上述所有的鏈。
含有後述表1～2、表5～25、表26～28和表29～51中記載的任一個單核苷酸多態性的核酸分子、含有存在於根據後述表3～4中記載的連鎖不平衡數據等確定的區域或基因上的任意單核苷酸多態性的核酸分子和與上述核酸分子互補的核酸分子均包含在本發明的核酸分子中。
在本發明的一個方式中優選本發明的核酸分子為含有後述表1～2、表26～28或表52～62所記載的單核苷酸多態性的核酸分子或其互補的核酸分子；並且，當該單核苷酸多態性為gSNP時，本發明的核酸分子為包含下述序列的核酸分子或其互補序列的核酸分子，所述序列為從有義鏈上遊側的公知單核苷酸多態性的下一個鹼基到下遊側的公知單核苷酸多態性的單核苷酸之前的鹼基的序列；當該單核苷酸多態性為iSNP、sSNP或cSNP時，本發明的核酸分子為包含含有該單核苷酸多態性的基因組上的基因全長的核酸分子、包含其互補序列的核酸分子、包含含有該單核苷酸多態性的互補DNA(cDNA)分子或其互補序列的核酸分子；當該單核苷酸多態性為rSNP時，本發明的核酸分子為包含從有義鏈上遊側的公知單核苷酸多態性的下一個鹼基到存在於該單核苷酸多態性所存在的啟動子區域的下遊的基因全長的核酸分子或包含其互補序列的核酸分子。
本發明中的核酸分子不限於脫氧核糖核酸、核糖核酸或肽核酸，含有它們的混合序列的核酸分子也包含在本發明中。當將核糖核酸用於本發明的核酸分子時，在本發明的核酸分子的序列(包括互補序列)中，胸腺嘧啶可以讀作尿嘧啶。另外，在不損及本發明所使用的功能的範圍內，根據需要可以對上述核酸分子進行化學修飾。此時的功能是指達到使用核酸分子的目的的功能。
本發明中的核酸分子可以根據本說明書所公開的序列信息、或在資料庫中檢索本說明書所公開的信息而得到的序列信息，採用公知方法、例如亞磷醯胺法進行合成。還可以使用市售的DNA合成機來合成。另外，本發明的核酸分子可以由含有來源於人的DNA的樣品，通過PCR法等公知方法獲得；或者，一部分核酸分子可以由含有來源於人的RNA的樣品，通過RT-PCR法等公知方法取得。取得核酸分子所必需的引物可以由本領域技術人員根據本說明書所公開的序列信息、或可以從本說明書所公開的資料庫的ID檢索到的序列信息進行設計。例如使用PCR法時，可以使用具有與目標核酸分子的一部分序列相同的序列的約10～30鹼基的引物；採用RT-PCR法時，使用寡脫氧胸苷酸(dT)引物或無規六聚體等進行逆轉錄反應，製成cDNA，之後利用上述PCR法擴增該cDNA中的目標序列，即可得到。
優選核酸分子為具有優選16～55鹼基、更優選23～27鹼基或47～53鹼基的長度、且包含上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列的核酸分子。
選擇含有與青光眼發病有關的單核苷酸多態性的核酸分子時，就本發明中的核酸分子而言，例如在基於使用一次操作檢測50萬個核酸分子的微陣列進行1次分析而得到的結果的情況下，優選p值為1×10-3以下的核酸分子，更優選p值為3×10-4以下的核酸分子，進一步優選p值為1×10-4以下的核酸分子，更進一步優選p值為3×10-5以下的核酸分子。當為按照Mantel-Haenszel法等整合分析方法整合多個分析結果而得到的結果時，本發明中的核酸分子優選p值為1×10-2以下的核酸分子，更優選p值為3×10-3以下的核酸分子，進一步優選p值為1×10-3以下的核酸分子，更進一步優選p值為3×10-4以下的核酸分子，又進一步優選p值為1×10-4以下的核酸分子。
作為選擇優選的核酸分子的其它方法，可以按照公知的多重性校正方法設定顯著水平，再選擇優選的核酸分子。例如當基於Bonferroni校正時，可以用p值5×10-2除以檢驗的反覆次數、即作為卡方檢驗的比較對象的多態性的個數，作為顯著水平。可以選擇具有低於如此操作而求得的顯著水平的單核苷酸多態性的核酸分子作為更優選的核酸分子。此時，可以使用按照Mantel-Haenszel法等整合分析方法整合的p值，使用作為整合分析對象的單核苷酸多態性的個數進行Bonferroni校正。可以使用其它公知的用於多重性校正的方法、例如FDR法或置換法來選擇優選的核酸分子。
(與青光眼有關的單核苷酸多態性的檢測方法和青光眼發病風險的預測方法) 在本發明的另一方式中，提供一種在含有來自基因組的核酸分子的樣品中是否具有在青光眼患者組中頻率高的等位基因或基因型的檢測方法。作為樣品，只要可以提取來自基因組的核酸分子即可，可以是任何樣品，例如可以使用血液、白細胞、毛根、毛髮、唾液、口腔黏膜細胞、皮膚、通過活體解剖得到的肌肉或臟器等組織等。
如上所述，構成真核生物基因組的核酸分子由彼此互補的有義鏈和反義鏈構成，本發明的單核苷酸多態性的等位基因的確定還可以通過檢測該多態性部位的有義鏈或反義鏈中的任意鹼基來進行。
如上所述，在含有核酸分子的樣品中是否包含該等位基因或基因型的判定方法可以使用任何方法，例如，使用根據本發明所公開的序列信息設計的各等位基因特異性探針、優選後述本發明的探針進行雜交，通過檢測其信號，可以檢測各等位基因。此外，對於對立的各等位基因、即某單核苷酸多態性的與疾病關聯高的等位基因和關聯低的等位基因分別施行不同的標記，之後通過使用使上述對立等位基因與多態性部位雜交的探針、或使用固定有對立的各等位基因的微陣列等的固定化探針，可以檢測同一樣品中所含的對立的各等位基因。根據上述構成，不僅可以確定樣品的等位基因，還可以確定基因型。使用將對立的各等位基因固定化在同一載體上而得到的微陣列等的固定化探針時，還可以按照相同操作進行雜交，形成按照相同操作進行檢測的構成。
作為檢測本發明的單核苷酸多態性的其它方法，可以使用下述方法。使用探針進行雜交的方法的例子有Taqman法、Invader((註冊商標))法、LightCycler法、細胞周期蛋白探針法、MPSS法、珠粒陣列法等，這些方法均可使用。即使是用於檢測同一等位基因的探針，根據檢測中使用的方法，其更優選的探針有時也會不同。本發明的單核苷酸多態性的等位基因或基因型的判定並不依賴於檢測方法，但優選根據檢測方法使用適當的探針。
Taqman法是指通過使用在5』側結合有螢光物質、在其3』側結合有猝滅劑的任意長度的寡核苷酸探針來檢測基因多態性的方法。探針與具有目標多態性的核酸分子雜交，通過PCR反應剝離5』側的一部分探針，之後測定螢光物質發出的螢光量，由此判定是否存在多態性。
Invader法是指使用含有與具有多態性的核酸分子的3』側共有的序列但5』側的序列完全不同的探針(報導探針)和只具有5』側的共有序列的探針(侵入探針)檢測基因多態性的方法。使上述兩根探針與目標核酸分子雜交，之後用核酸酶處理，被切出的報導探針中的一部分與含有螢光物質和猝滅劑的檢測用探針雜交，之後用核酸酶處理時，螢光物質游離出來，因此利用該螢光量判定是否具有多態性。
LightCycler法是指通過使含有螢光物質的多態性檢測探針和含有猝滅劑的錨定探針與事先用PCR擴增了的具有多態性的核酸分子雜交來檢測多態性的方法。對已雜交的DNA緩慢加熱，當達到某一定溫度時多態性檢測探針游離出來，因此通過測定該螢光量來判定是否具有多態性。
細胞周期蛋白探針法是指使DNA序列按照挾持具有與目標核酸分子的多態性部位互補的序列的RNA序列兩端的方式結合，之後使用在各DNA端具有螢光物質或猝滅劑的探針(DRD探針)的多態性分析法。使DRD探針與事先通過PCR等擴增了的目標核酸分子雜交，再使RNase作用於該複合體時，螢光色素游離出來，所以通過測定該螢光量來判定是否具有多態性。
MPSS法是指使用編碼銜接探針和解碼探針進行多態性分析的方法。編碼銜接探針是指一種寡DNA，該寡DNA在5』側具有4鹼基的突出末端，緊隨其後是限制酶BbvI的識別序列，以及在3』側具有解碼探針所結合的單鏈序列。而解碼探針是指在3』側含有螢光物質的單鏈寡DNA，該探針包含4種不同序列，各序列與一個編碼銜接探針特異性雜交。事先將具有多態性的核酸分子固定在珠粒上，使含有BbvI識別序列的起始銜接頭結合在該核酸分子上，之後用BbvI消化成4鹼基突出末端。從突出的4鹼基的3』末端起依次與編碼銜接探針連接，用特定的解碼探針檢測已結合的編碼銜接探針的序列。
珠粒陣列法是指將等位基因檢測用探針和寡核苷酸(地址序列，address sequence)所結合的珠粒組合起來進行基因型判定的方法，上述寡核苷酸特定利用等位基因檢測用探針檢測的信號在陣列上的位置信息。珠粒陣列法例如有Golden Gate Assay，其中使用僅固定有Illumina公司的地址序列(23鹼基)的珠粒；以及Infinium(註冊商標)Assay，其中使用等位基因檢測用探針(50鹼基)結合在地址序列(30鹼基)上的珠粒。在任一種方法中，根據地址序列可以知道對於任意配置在陣列上的各個珠粒，等位基因檢測用探針結合在陣列上的哪個位置上。
Golden Gate Assay方法如下所示。在單核苷酸多態性的檢測中使用下述探針等位基因特異性探針，即與各等位基因特異性雜交的兩種探針；以及下遊序列識別探針，即與單核苷酸多態性的3』側的1～20鹼基下遊的序列特異性雜交的探針。在下遊序列識別探針中帶有陣列上的位置特定用地址序列。上述3種探針中包含後述通用引物所結合的序列。使3個探針與基因組DNA退火，之後添加DNA聚合酶和連接酶。通過伸長反應和連接反應，生成連接等位基因特異性探針和下遊序列識別探針間的空隙的等位基因特異性產物。以該等位基因特異性產物為模板，使用各等位基因特異性的兩種螢光標記通用引物和結合在下遊序列識別探針上的通用引物進行PCR反應。使被標記的PCR產物經由地址序列與固定在珠粒上的寡核苷酸雜交。通過用共焦雷射掃描儀檢測珠粒上的螢光，來判定等位基因和基因型。
Infinium Assay方法如下所示。後述Illumina公司的陣列[Illumina公司iSelectTM Genotyping BeadChip]遵照該方法。利用該陣列檢測等位基因時存在兩種方法。第一種方法中，使用僅3』末端的鹼基不同的兩種探針(50鹼基的等位基因檢測用探針、Infinium I型)，所述3』末端為檢測單核苷酸多態性的部位。事先進行基因組DNA的全基因組擴增，之後利用酶進行片段化。在探針與片段化基因組DNA雜交後，進行等位基因特異性伸長反應，用一種螢光色素標記的多態性部位的一個鹼基下遊(3』側)的鹼基對應著探針摻入進來。另一種方法中，使用探針內不具有單核苷酸多態性的等位基因特異性序列的一種探針(50鹼基的等位基因檢測用探針、Infinium II型)。該探針的3』末端形成從多態性部位到其上遊一個鹼基(5』側)為止的序列。使探針與片段化基因組DNA雜交，之後通過單核苷酸伸長反應，用兩種螢光色素中的其中一種標記的鹼基對應著目標單核苷酸多態性部位摻入進來。任一種方法中，均通過用共焦雷射掃描儀檢測螢光，來判定等位基因和基因型。
需要說明的是，有關上述雜交方法中所用探針的長度或修飾等特性的細節在後面敘述。
此外，作為不進行與探針雜交的方法，例如有PCR-RFLP法、SSCP法、質量分析法和直接測序法。
PCR-RFLP法是指在具有多態性的核酸分子中，由於多態性存在於限制酶的切斷部位，所以通過酶消化生成不同的DNA片段，根據其電泳圖譜的不同來判定是否存在多態性的方法。利用PCR擴增目標核酸分子，之後用限制酶切斷該擴增片段，分析通過電泳生成的片段。被擴增的含有多態性的核酸分子的長度通常為50～10,000鹼基對，優選為100～1,000鹼基對。
SSCP法是指利用PCR擴增具有多態性的核酸分子，形成單鏈DNA，之後進行電泳，根據其電泳圖譜的不同判定是否存在多態性的方法。利用PCR擴增目標核酸分子，該擴增片段經熱或鹼處理形成單鏈DNA。由於該單鏈DNA形成核苷酸序列特異性的高級結構，所以將這些擴增片段進行電泳時，因其結構的不同，在電泳率上可見差異。用於PCR的引物用放射性同位素或螢光物質標記。所擴增的具有多態性的核酸分子的長度通常為50～10,000鹼基對，優選為100～1,000鹼基對。
質量分析法是指將高分子用基質和雷射等進行離子化，在高電場中加速該離子化的高分子，使其飛入至檢測器中，根據其飛行時間的不同等來鑑定質量的方法。將該質量分析法與上述引物延伸法等組合起來檢測多態性。具體而言，使用與具有多態性的核酸分子的多態性部位的直至單核苷酸上遊的序列相互補的引物、4種雙脫氧核苷中的任意一種、以及與其對應的脫氧核糖核酸以外的脫氧核糖核酸，進行單核苷酸的伸長反應，通過測定摻入3』末端的序列不同的核酸產物質量的差異，可以鑑定多態性。
直接測序法是指直接讀取具有多態性的核酸分子的核苷酸序列的方法。代表性的方法稱作Sanger法(雙脫氧法)。使未標記或用放射性同位素或螢光物質標記的引物與目標核酸分子結合，利用未標記或用放射性同位素或螢光物質標記的4種雙脫氧核苷使由克列諾(Klenow)酶等引發的伸長反應停止，之後用限制酶進行消化，產生的DNA片段通過電泳進行分離。根據電泳圖像，從低分子量的片段開始依次讀取3』末端的核苷酸序列，由此確定含有多態性的前後的核苷酸序列。作為其改良法，有一種稱作引物延伸法的方法。該方法如下使用與具有多態性的核酸分子的多態性部位的直至單核苷酸上遊的序列互補的引物，進行單核苷酸的伸長反應，讀取摻入3』末端的4種雙脫氧核苷中任意一種的序列。在該雙脫氧核苷的鑑定中有各種方法，例如用不同的螢光物質標記4種核苷酸，通過電泳進行分離和鑑定。此外，還採用下述方法，即、將在伸長反應時所生成的焦磷酸變換成ATP，利用螢光素酶的發光來鑑定該ATP的方法。伸長反應中使用的引物的長度通常為10～300鹼基對，優選為15～25鹼基對。
本發明中，雜交是指具有某序列的核酸分子和與該核酸分子的至少一部分互補的核酸分子根據彼此互補的核苷酸序列經由氫鍵進行締合。與原始核酸分子締合的互補的核酸分子的種類可以相同，也可以不同，構成上述核酸分子的核酸可以是脫氧核糖核酸、核糖核酸或肽核酸。上述核酸分子中，當談到核糖核酸時，在核酸分子的序列(包括互補序列)中胸腺嘧啶可以被讀作尿嘧啶。
在本發明中，嚴格條件是指一種核酸分子與具有某序列的核酸分子特異性雜交的條件，上述前一種核酸分子具有與後一種核酸分子的部分序列互補的序列(Fred M.Ausuble等，Current Protocols inMolecular Biology，第2.10.1-2.10.16、John Wiley和Sons，Inc)。上述條件的具體例子有溫度優選比具有某序列的核酸分子和與該核酸分子雜交的互補核酸分子的複合體的熔解溫度(Tm)低約5℃～約30℃、更優選低約10℃～約25℃；0.01～6倍濃度的SSC(氯化鈉、枸櫞酸鈉混合溶液)、SSPE(氯化鈉、磷酸二氫鈉和EDTA混合溶液)或MES(2-(N-嗎啉基)乙磺酸和氯化四甲基銨混合溶液)緩衝液等雜交用反應溶液；以及pH6～8的氫離子濃度等條件。例如，在將25bp的DNA探針固定化得到的固定化探針的情況下，嚴格條件的例子有在1倍濃度的MES緩衝液中(氫離子濃度為6.5～6.7)於49℃下雜交，之後用6倍濃度的SSC(氫離子濃度為8.0)於25℃下清洗，接著用0.6倍濃度的SSC(氫離子濃度為8.0)於45℃下清洗等條件。
在本發明中，等位基因特異性(或對等位基因特異)是指在來自包含該多態性部位的基因組的序列中或所製備的包含該多態性部位的核酸分子中含有該等位基因；或者，某核酸分子在該多態性部位與具有包含該等位基因的序列的核酸分子在嚴格條件下特異性雜交、即按照可以識別與該等位基因對立的等位基因的方式雜交。
本發明所公開的、包含與青光眼發病有關的單核苷酸多態性的61鹼基長度的核酸序列包含僅中央(即第31位)的鹼基不同的兩組核苷酸序列組(SEQ ID NO為奇數號和偶數號的組)，該第31位的鹼基為多態性部位。多態性部位的高風險等位基因記載在後述的表1～2或表52～63中。關於上述任意的單核苷酸多態性，當對存在在青光眼患者中高頻率存在的等位基因進行判定時，通過檢測樣品中的高風險等位基因，可以判定存在在青光眼患者中高頻率存在的等位基因。
對於上述鑑定的任意的與青光眼發病有關的單核苷酸多態性，檢測是否存在一個樣品中所含的對立的各等位基因，可以確定基因型。即，當只檢測到某等位基因時，基因型為該等位基因的純合子；當檢測到兩個等位基因時，基因型為具有該兩個等位基因的雜合子。對於上述單核苷酸多態性中的至少一個，通過檢測基因型，可以判定樣品中是否存在在青光眼患者組中較在非患者組中高頻率確認到的基因型。即，關於上述單核苷酸多態性，當高風險等位基因符合顯性遺傳模型時，高風險等位基因的純合子或雜合子是在青光眼患者組中較在非患者組中高頻率確認到的基因型；當高風險等位基因符合隱性遺傳模型時，高風險等位基因的純合子是在青光眼患者組中較在非患者組中高頻率確認到的基因型。從減小判定錯誤的角度考慮，還優選按照相同操作測定對立的各等位基因。
如此地進行樣品分析，當樣品中存在在青光眼患者組中較在非患者組中高頻率確認到的等位基因或基因型時，預測在提供該樣品的當時未患有青光眼者的青光眼發病風險高，或者，判定必需進行視野檢查等青光眼的精密檢查，提供該樣品的青光眼疑似病例應該被診斷為青光眼的機率高。
在本發明的與青光眼有關的單核苷酸多態性的檢測方法和青光眼發病風險的預測方法中，用於檢測的單核苷酸多態性為存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列； 更優選為存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列； 進一步優選為存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列為選自下述含有單核苷酸多態性的核苷酸序列組的至少一個核苷酸序列或其互補序列。(其中，如上所述，在a～r所示的SEQ ID NO組中，各序列組對應於一個單核苷酸多態性，各核苷酸序列為在第31位鹼基中含有上述單核苷酸多態性的相互對立的等位基因的核苷酸序列) aSEQ ID NO203和/或SEQ ID NO204、 bSEQ ID NO205和/或SEQ ID NO206、 cSEQ ID NO207和/或SEQ ID NO208、 dSEQ ID NO209和/或SEQ ID NO210、 eSEQ ID NO211和/或SEQ ID NO212、 fSEQ ID NO213和/或SEQ ID NO214、 gSEQ ID NO215和/或SEQ ID NO216、 hSEQ ID NO217和/或SEQ ID NO218、 iSEQ ID NO219和/或SEQ ID NO220、 jSEQ ID NO221和/或SEQ ID NO222、 kSEQ ID NO223和/或SEQ ID NO224、 lSEQ ID NO225和/或SEQ ID NO226、 mSEQ ID NO227和/或SEQ ID NO228、 nSEQ ID NO229和/或SEQ ID NO230、 oSEQ ID NO231和/或SEQ ID NO232、 pSEQ ID NO233和/或SEQ ID NO234、 qSEQ ID NO235和/或SEQ ID NO236、以及 rSEQ ID NO237和/或SEQ ID NO238 使用上述任一個單核苷酸多態性時，其中優選使用存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因，所述核苷酸序列為選自下述含有單核苷酸多態性的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列。
SEQ ID NO203、SEQ ID NO206、SEQ ID NO208、SEQ ID NO209、SEQ ID NO211、SEQ ID NO214、SEQ ID NO216、SEQ ID NO218、SEQ ID NO219、SEQ ID NO221、SEQ ID NO224、SEQ ID NO226、SEQ ID NO228、SEQ ID NO229、SEQ ID NO231、SEQ ID NO234、SEQ IDNO235和SEQ ID NO238 需要說明的是，上述序列為在各自的多態性部位含有高風險等位基因的序列。
並且，通過使用一個樣品，將兩個以上本發明的與青光眼有關的等位基因或基因型組合起來進行檢測，還可以提高將來的青光眼發病風險的判定精度。
就組合的單核苷酸多態性而言，只要是本發明的單核苷酸多態性即可使用，但優選為p值低的單核苷酸多態性，更優選為下述單核苷酸多態性，即、對於按照上述Mantel-Haenszel法等整合分析法將兩次分析得到的結果整合而得到的p值，即使在Bonferroni校正水平下也判斷為顯著的單核苷酸多態性。從另一個角度考慮，還優選使用通過後述的邏輯回歸分析，確認有助於提高通過組合得到的風險預測精度的單核苷酸多態性。另一方面，由於處於上述連鎖不平衡狀態的單核苷酸多態性表現出相同的行為，所以當將多個處於連鎖不平衡狀態的單核苷酸多態性組合起來時，有時必需認真評價基於相同區域的青光眼風險。將本發明的單核苷酸多態性組合起來進行疾病的風險預測的情況下、即均衡評價所有風險的情況下，當包含多個處於上述連鎖不平衡狀態的單核苷酸多態性時，還優選只使用處於該連鎖不平衡狀態的單核苷酸多態性中的任一個進行預測。
根據本發明的任意兩個以上的單核苷酸多態性的組合進行發病風險預測時，可以使用通過邏輯回歸分析求得的回歸式預測青光眼的發病風險。即，以上述任意兩個以上的單核苷酸多態性分別作為獨立變數∏(一方的等位基因的純合子＝0、雜合子＝1、對立等位基因的純合子＝2)，通過邏輯回歸分析求出回歸式。在各樣品中，將對應於各單核苷酸多態性的值代入該式，計算從屬變數Φ。當從屬變數Φ大於一定的閾值(例如0.5)時，可以判斷該樣品的提供者存在發病風險。
在本發明的與青光眼有關的單核苷酸多態性的檢測方法和青光眼發病風險的預測方法中，將任意兩個以上的單核苷酸多態性組合時，用於檢測的單核苷酸多態性優選為存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的、含有兩個以上不同的單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列； 更優選為存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列的、含有兩個以上不同的單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列； 進一步優選為存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列為選自下述含有單核苷酸多態性的核苷酸序列組的、含有兩個以上不同的單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列；(其中，如上所述，在a～r所示的SEQ ID NO組中，各序列組對應於一個單核苷酸多態性，各核苷酸序列為在第31位鹼基中含有上述單核苷酸多態性的相互對立的等位基因的核苷酸序列) aSEQ ID NO203和/或SEQ ID NO204、 bSEQ ID NO205和/或SEQ ID NO206、 cSEQ ID NO207和/或SEQ ID NO208、 dSEQ ID NO209和/或SEQ ID NO210、 eSEQ ID NO211和/或SEQ ID NO212、 fSEQ ID NO213和/或SEQ ID NO214、 gSEQ ID NO215和/或SEQ ID NO216、 hSEQ ID NO217和/或SEQ ID NO218、 iSEQ ID NO219和/或SEQ ID NO220、 jSEQ ID NO221和/或SEQ ID NO222、 kSEQ ID NO223和/或SEQ ID NO224、 lSEQ ID NO225和/或SEQ ID NO226、 mSEQ ID NO227和/或SEQ ID NO228、 nSEQ ID NO229和/或SEQ ID NO230、 oSEQ ID NO231和/或SEQ ID NO232、 pSEQ ID NO233和/或SEQ ID NO234、 qSEQ ID NO235和/或SEQ ID NO236、以及 rSEQ ID NO237和/或SEQ ID NO238 更進一步優選為存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列為選自上述含有單核苷酸多態性的核苷酸序列組的、含有10個以上不同的單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列； 又更進一步優選為存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列為選自上述含有單核苷酸多態性的核苷酸序列組的、含有完全不同的單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列。
另外，用於組合的單核苷酸多態性優選使用未處於連鎖不平衡狀態的單核苷酸多態性，從這個角度考慮，在上述組合的所有方式中， 在屬於由 aSEQ ID NO203和/或SEQ ID NO204以及 bSEQ ID NO205和/或SEQ ID NO206 組成的組的核苷酸序列或其互補序列中，以存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性所組成的組作為組1的單核苷酸多態性； 在屬於由 cSEQ ID NO207和/或SEQ ID NO208以及 dSEQ ID NO209和/或SEQ ID NO210 所組成的組的核苷酸序列或其互補序列中，以存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性所組成的組作為組2的單核苷酸多態性； 在屬於由 jSEQ ID NO221和/或SEQ ID NO222、 kSEQ ID NO223和/或SEQ ID NO224以及 lSEQ ID NO225和/或SEQ ID NO226 所組成的組的核苷酸序列或其互補序列中，以存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性所組成的組為組3的單核苷酸多態性； 在屬於由 oSEQ ID NO231和/或SEQ ID NO232、 pSEQ ID NO233和/或SEQ ID NO234、 qSEQ ID NO235和/或SEQ ID NO236以及 rSEQ ID NO237和/或SEQ ID NO238 所組成的組的核苷酸序列或其互補序列中，以存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性構成的組為組4的單核苷酸多態性， 當使用屬於組1的單核苷酸多態性時，優選使用組1中的任一個單核苷酸多態性； 當使用屬於組2的單核苷酸多態性時，優選使用組2中的任一個單核苷酸多態性； 當使用屬於組3的單核苷酸多態性時，優選使用組3中的任一個單核苷酸多態性；和/或 當使用屬於組4的單核苷酸多態性時，優選使用組4中的任一個單核苷酸多態性。
並且，在上述組合的所有方式中，優選存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因，所述核苷酸序列為選自下述含有單核苷酸多態性的核苷酸序列的、含有兩個以上不同的單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列。
SEQ ID NO203、SEQ ID NO206、SEQ ID NO208、SEQ ID NO209、SEQ ID NO211、SEQ ID NO214、SEQ ID NO216、SEQ IDNO218、SEQ ID NO219、SEQ ID NO221、SEQ ID NO224、SEQ ID NO226、SEQ ID NO228、SEQ ID NO229、SEQ ID NO231、SEQ ID NO234、SEQ ID NO235和SEQ ID NO238 需要說明的是，上述核苷酸序列為在各自的多態性部位具有高風險等位基因的核苷酸序列。
(可以檢測與青光眼有關的等位基因的探針) 在本發明的另一方式中，提供可以檢測與青光眼有關的等位基因的等位基因特異性核酸分子或探針(以下，記作探針)、以及使用上述探針檢測與青光眼有關的等位基因或基因型的方法。
探針只要是能夠在嚴格條件下與本發明的與青光眼有關的單核苷酸多態性的多態性部位的等位基因特異性序列雜交的探針即可，可以使用任何探針。多態性部位的等位基因的確定還可以通過檢測基因組的有義鏈或反義鏈的多態性部位來進行，所以本發明的探針包含有義鏈的等位基因特異性序列的互補序列和與反義鏈的等位基因特異性序列互補的序列、即包含有義鏈的等位基因特異性序列中的任一個。本發明的探針還可用於檢測包含本發明的單核苷酸多態性的cDNA或mRNA。用於檢測cDNA或mRNA時，該單核苷酸多態性使用存在於外顯子中或其鄰近的單核苷酸多態性。
可以檢測後述表1～2、表5～25、表26～28、表29～51或表52～62中記載的單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針、以及可以特異性檢測後述表3～4或表63～70中記載的存在於青光眼相關區域的任意的單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針均包含在本發明的探針中。就本發明的探針而言，例如基於使用微陣列進行1次分析而得到的結果時，其中所述微陣列通過一次操作檢測可以特異性檢測50萬個單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針，本發明的探針優選為可以特異性檢測p值為1×10-3以下的單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針；更優選為可以特異性檢測p值為3×10-4以下的單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針；進一步優選為可以特異性檢測p值為1×10-4以下的單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針；更進一步優選為可以特異性檢測p值為3×10-5以下的單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針。當為按照Mantel-Haenszel法等整合分析方法整合多個分析結果而得到的結果時，本發明的探針優選為可以特異性檢測p值為1×10-2以下的單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針；更優選為可以特異性檢測p值為3×10-3以下的單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針；進一步優選為可以特異性檢測p值為1×10-3以下的單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針；更進一步優選為可以特異性檢測p值為3×10-4以下的單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針；又更進一步優選為可以特異性檢測p值為1×10-4以下的單核苷酸多態性的各等位基因或其互補鏈的探針。
本發明中的探針優選含有等位基因特異性序列或其互補鏈，進一步優選在本發明的探針中，有助於等位基因特異性雜交的序列僅包含等位基因特異性序列或其互補鏈。在本發明的探針中，在嚴格條件下能夠與等位基因特異性序列雜交的範圍內，可以在末端添加間隔區或為了穩定化等目的、且不來自該序列的任意鹼基數目的序列。所添加的序列優選為保持髮夾結構等三維結構的序列。
可以對探針實施用於檢測的任意標記。對探針實施的標記可以使用通常所使用的任何標記，但通常使用FITC或Cy3等螢光標記、生物素、或鹼性磷酸酶或辣根過氧化物酶等酶標記等。使用生物素標記時，事先對與生物素特異性結合的鏈黴親和素進一步實施可檢測的標記，將該標記鏈黴親和素用作二次標記。還可以使用標記抗生物素抗體來代替標記鏈黴親和素。對探針實施標記的方法可以採用公知的任何方法，該方法為本領域技術人員所周知。還可以在探針中添加作為上述間隔區的任意序列，並對間隔區實施標記。探針的標記化用試劑、標記鏈黴親和素、標記抗生物素抗體等以試劑的形式出售，可以採購。
本發明中的探針只要能夠與具有目標等位基因的核酸分子特異性雜交即可，不僅包含脫氧核糖核酸、核糖核酸或肽核酸、甚至還包含它們的混合序列的探針也包含在本發明中。其中，在本發明的探針中使用含有核糖核酸的探針時，在本發明探針的序列(包括互補序列)中，胸腺嘧啶可以被讀作尿嘧啶。根據需要還可以對本發明中的探針進行化學修飾，只要其能夠在嚴格條件下與具有目標等位基因的核酸分子進行特異性雜交即可。實施化學標記的方法可以使用公知的任何方法。
檢測用探針既可以在溶液狀態下與樣品反應，之後用公知的方法進行檢測，也可以事先固定在載體上。上述探針還可以取得固定化探針、即所謂的微陣列形式，其如下得到將多個至數十萬個不同單核苷酸多態性各自的等位基因所對應的探針事先固定在固體載體上的確定位置上，每個單核苷酸多態性對應一個至十幾個探針，之後使樣品與其反應，掃描由雜交的探針產生的信號，並用計算機進行分析。取得固定化探針形式時，進行固定化的探針的最大數受探針的固定化密度和固定化部位的面積所限制。
取得上述固定化探針形式時，通過如下方法可以檢測來自被標記的具有目標等位基因的核酸分子的固定層上的信號事先按照公知的方法標記樣品中的核酸分子，再使其與固定化的本發明的非標記探針結合，或者，使具有應該檢測到等位基因的核酸分子與固定化的本發明的非標記探針結合，之後按照公知的方法進行標記。
固定化可以按照公知的任何方法進行，例如可以採用ォリゴプリント(syhthetic oligoprint)、斑點光刻法等方法。對載體的材質沒有限定，可以使用通常所用的材質、例如聚碳酸酯或聚苯乙烯等高分子、玻璃、矽晶體等。為了提高核酸的粘合力，可以在固定化之前對載體事先實施陽離子化等包被。另外，為了防止非特異性核酸吸附到載體上，還可以在固定化之後用公知的封閉劑進行封閉。上述封閉劑中，只要是可以抑制非特異性核酸在載體上吸附的封閉劑均可使用，例如可以使用鮭魚精子DNA、Denhardt溶液、從人胎盤中提取的Cot-I DNA、十二烷基硫酸鈉等陰離子性表面活性劑、聚氧乙烯脫水山梨糖醇單月桂酸酯等非離子性表面活性劑等。
將探針固定化時，通過將對立的各等位基因特異性探針固定在同一載體上，還可以形成按照相同操作檢測一個樣品中所含的對立的各等位基因的構成。在上述構成中，不僅可以確定樣品的等位基因，還可以確定基因型。
用於檢測等位基因的探針優選為優選具有16～55鹼基、更優選23～27鹼基或47～53鹼基、進一步優選具有上述多態性部位及其前後各計25鹼基的長度，且含有上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列的探針；具有上述多態性部位及其5』上遊側、優選具有49鹼基的序列(50鹼基的序列)，且含有上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列的探針；或者，具有上述多態性部位的5』上遊側50鹼基的序列，且含有與上述多態性部位鄰近的序列或與其互補的序列的探針。
用於檢測等位基因的、進一步優選的探針為 1)可以特異性檢測該單核苷酸多態性的等位基因的探針，該探針具有上述多態性部位及其前後各12鹼基的序列、即25鹼基的長度，並且包含上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列；或者 2a)可以特異性檢測該單核苷酸多態性的等位基因的探針，該探針具有上述多態性部位及其5』上遊側49鹼基的序列(50鹼基的序列)，並且包含含有上述多態性部位的序列或與其互補的序列；或者 2b)可以特異性檢測該單核苷酸多態性的等位基因的探針，該探針具有上述多態性部位的5』上遊側50鹼基的序列，並且包含與上述多態性部位鄰近的序列或與其互補的序列。
在本發明的與青光眼有關的單核苷酸多態性的檢測方法和青光眼發病風險的預測方法中，用於檢測的探針為包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的探針，所述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列；和/或包含核苷酸序列的探針，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO515～694所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列； 更優選為包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的探針，所述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列；和/或包含核苷酸序列的探針，所述核苷酸序列包含選自SEQ IDNO515～535所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列； 進一步優選為包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的探針，所述核苷酸序列為選自下述組A的至少一個核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列，所述組A由包含單核苷酸多態性的核苷酸序列組a～r構成；和/或包含序列的探針，所述序列包含選自組B的至少一個核苷酸序列或核苷酸序列組或它們的互補序列，所述組B由aa～rr的核苷酸序列或核苷酸序列組構成。
(其中，在a～r所示的SEQ ID NO組中，各序列組對應於一個單核苷酸多態性，各核苷酸序列為在第31位鹼基中含有上述單核苷酸多態性的相互對立的等位基因的核苷酸序列； 在aa～rr所示的SEQ ID NO或SEQ ID NO組中，各核苷酸序列或核苷酸序列組為用於檢測一個單核苷酸多態性的探針的序列或探針的序列組； a和aa、b和bb、c和cc、d和dd、e和ee、f和ff、g和gg、h和hh、i和ii、j和jj、k和kk、l和ll、m和mm、n和nn、o和oo、p和pp、q和qq、以及、r和rr分別對應於相同的單核苷酸多態性) 組A aSEQ ID NO203和/或SEQ ID NO204、 bSEQ ID NO205和/或SEQ ID NO206、 cSEQ ID NO207和/或SEQ ID NO208、 dSEQ ID NO209和/或SEQ ID NO210、 eSEQ ID NO211和/或SEQ ID NO212、 fSEQ ID NO213和/或SEQ ID NO214、 gSEQ ID NO215和/或SEQ ID NO216、 hSEQ ID NO217和/或SEQ ID NO218、 iSEQ ID NO219和/或SEQ ID NO220、 jSEQ ID NO221和/或SEQ ID NO222、 kSEQ ID NO223和/或SEQ ID NO224、 lSEQ ID NO225和/或SEQ ID NO226、 mSEQ ID NO227和/或SEQ ID NO228、 nSEQ ID NO229和/或SEQ ID NO230、 oSEQ ID NO231和/或SEQ ID NO232、 pSEQ ID NO233和/或SEQ ID NO234、 qSEQ ID NO235和/或SEQ ID NO236、以及 rSEQ ID NO237和/或SEQ ID NO238 組B aaSEQ ID NO515和/或SEQ ID NO533、 bbSEQ ID NO516、 cc；SEQ ID NO517、 ddSEQ ID NO518和/或SEQ ID NO534、 eeSEQ ID NO519、 ffSEQ ID NO520、 ggSEQ ID NO521、 hhSEQ ID NO522、 iiSEQ ID NO523、 jjSEQ ID NO524、 kkSEQ ID NO525、 llSEQ ID NO526、 mmSEQ ID NO527、 nnSEQ ID NO528、 ooSEQ ID NO529、 ppSEQ ID NO530和/或SEQ ID NO535、 qqSEQ ID NO531、以及 rrSEQ ID NO532 使用上述任一個單核苷酸多態性時，其中，在組A中，優選使用包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因的探針，所述核苷酸序列為選自下述包含單核苷酸多態性的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列；SEQ ID NO203、SEQ ID NO206、SEQ ID NO208、SEQ ID NO209、SEQ ID NO211、SEQ ID NO214、SEQ ID NO216、SEQ ID NO218、SEQ ID NO219、SEQ ID NO221、SEQ ID NO224、SEQ ID NO226、SEQ ID NO228、SEO ID NO229、SEQ ID NO231、SEQ ID NO234、SEQ IDNO235和SEQ ID NO238 在組B中，優選包含核苷酸序列的探針，所述核苷酸序列包含選自下述核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列。
SEQ ID NO533、SEQ ID NO516、SEQ ID NO517、SEQ ID NO518、SEQ ID NO519、SEQ ID NO520、SEQ ID NO521、SEQ IDNO522、SEQ ID NO523、SEQ ID NO524、SEQ ID NO525、SEQ ID NO526、SEQ ID NO527、SEQ ID NO528、SEQ ID NO529、SEQ ID NO535、SEQ ID NO531和SEQ ID NO532 需要說明的是，上述核苷酸序列是用於檢測高風險等位基因的探針所對應的序列。
在本發明的與青光眼有關的單核苷酸多態性的檢測方法和青光眼發病風險的預測方法中，在將兩個以上任意的單核苷酸多態性組合的情況下，用於檢測的探針優選為包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的探針，所述核苷酸序列包含選自SEQ IDNO203～514所示的核苷酸序列的、含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列；和/或包含核苷酸序列的探針，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO515～694所示的核苷酸序列的核苷酸序列或其互補序列，該探針對應於其中兩個以上不同的單核苷酸多態性； 更優選為包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的探針，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列的、含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列；和/或包含核苷酸序列的探針，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO515～535所示的核苷酸序列的核苷酸序列或其互補序列，該探針對應於其中兩個以上不同的單核苷酸多態性； 進一步優選為包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的探針，所述核苷酸序列包含選自下述組A的、含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列，所述組A由包含單核苷酸多態性的核苷酸序列組a～r構成；和/或包含序列的探針，所述序列包含選自組B的、兩個以上不同的核苷酸序列或核苷酸序列組或它們的互補序列，所述組B由aa～rr的核苷酸序列或核苷酸序列組構成； (其中，在a～r所示的SEQ ID NO組中，各序列組對應於一個單核苷酸多態性，各核苷酸序列為在第31位鹼基中包含上述單核苷酸多態性的相互對立的等位基因的核苷酸序列； 在aa～rr所示的SEQ ID NO或SEQ ID NO組中，各核苷酸序列或核苷酸序列組為用於檢測一個單核苷酸多態性的探針的序列或探針的序列組； a和aa、b和bb、c和cc、d和dd、e和ee、f和ff、g和gg、h和hh、i和ii、j和jj、k和kk、l和ll、m和mm、n和nn、o和oo、p和pp、q和qq、以及r和rr分別對應於相同的單核苷酸多態性) 組A aSEQ ID NO203和/或SEQ ID NO204、 bSEQ ID NO205和/或SEQ ID NO206、 cSEQ ID NO207和/或SEQ ID NO208、 dSEQ ID NO209和/或SEQ ID NO210、 eSEQ ID NO211和/或SEQ ID NO212、 fSEQ ID NO213和/或SEQ ID NO214、 gSEQ ID NO215和/或SEQ ID NO216、 hSEQ ID NO217和/或SEQ ID NO218、 iSEQ ID NO219和/或SEQ ID NO220、 jSEQ ID NO221和/或SEQ ID NO222、 kSEQ ID NO223和/或SEQ ID NO224、 lSEQ ID NO225和/或SEQ ID NO226、 mSEQ ID NO227和/或SEQ ID NO228、 nSEQ ID NO229和/或SEQ ID NO230、 oSEQ ID NO231和/或SEQ ID NO232、 pSEQ ID NO233和/或SEQ ID NO234、 qSEQ ID NO235和/或SEQ ID NO236、以及 rSEQ ID NO237和/或SEQ ID NO238 組B aaSEQ ID NO515和/或SEQ ID NO533、 bbSEQ ID NO516、 ccSEQ ID NO517、 ddSEQ ID NO518和/或SEQ ID NO534、 eeSEQ ID NO519、 ffSEQ ID NO520、 ggSEQ ID NO521、 hhSEQ ID NO522、 iiSEQ ID NO523、 jjSEQ ID NO524、 kkSEQ ID NO525、 llSEQ ID NO526、 mmSEQ ID NO527、 nnSEQ ID NO528、 ooSEQ ID NO529、 ppSEQ ID NO530和/或SEQ ID NO535、 qqSEQ ID NO531、以及 rrSEQ ID NO532 更進一步優選為包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的探針，所述核苷酸序列包含選自組A的、含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列，所述組A由上述包含單核苷酸多態性的核苷酸序列組構成；和/或包含核苷酸序列的探針，所述核苷酸序列包含選自由上述核苷酸序列組構成的組B的核苷酸序列或其互補序列，該探針對應於其中10個以上不同的單核苷酸多態性； 又更進一步優選為包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的探針，所述核苷酸序列包含選自組A的、含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列，所述組A由上述包含單核苷酸多態性的核苷酸序列組構成；和/或包含核苷酸序列的探針，所述核苷酸序列包含選自由上述核苷酸序列組構成的組B的核苷酸序列或其互補序列，該探針對應於其中所有不同的單核苷酸多態性。
另外，用於組合的單核苷酸多態性優選使用未處於連鎖不平衡狀態的單核苷酸多態性，從這個角度考慮，在上述組合的所有方式中，關於上述組A，在包含屬於 aSEQ ID NO203和/或SEQ ID NO204、以及 bSEQ ID NO205和/或SEQ ID NO206 所組成的組的核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核苷酸序列中，以包含存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的核苷酸序列所組成的組作為組1的核苷酸序列， 在包含屬於 cSEQ ID NO207和/或SEQ ID NO208、以及 dSEQ ID NO209和/或SEQ ID NO210 所組成的組的核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核苷酸序列中，以包含存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的核苷酸序列所組成的組作為組2的核苷酸序列， 在包含屬於 jSEQ ID NO221和/或SEQ ID NO222、 kSEQ ID NO223和/或SEQ ID NO224、以及 lSEQ ID NO225和/或SEQ ID NO226 所組成的組的核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核苷酸序列中，以包含存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的核苷酸序列所組成的組作為組3的核苷酸序列， 在包含屬於 oSEQ ID NO231和/或SEQ ID NO232、 pSEQ ID NO233和/或SEQ ID NO234、 qSEQ ID NO235和/或SEQ ID NO236、以及 rSEQ ID NO237和/或SEQ ID NO238 所組成的組的核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核苷酸序列中，以包含存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的核苷酸序列所組成的組作為組4的核苷酸序列， 關於上述組B，以由包含屬於下述組的核苷酸序列或其互補序列的核苷酸序列構成的組作為組1的核苷酸序列， aaSEQ ID NO515和/或SEQ ID NO533、以及 bbSEQ ID NO516 以由包含屬於下述組的核苷酸序列或其互補序列的核苷酸序列構成的組作為組2的核苷酸序列， ccSEQ ID NO517、以及 ddSEQ ID NO518和/或SEQ ID NO534 以由包含屬於下述組的核苷酸序列或其互補序列的核苷酸序列構成的組作為組3的核苷酸序列， jjSEQ ID NO524、 kkSEQ ID NO525、以及 llSEQ ID NO526 以由包含屬於下述組的核苷酸序列或其互補序列的核苷酸序列構成的組作為組4的核苷酸序列， ooSEQ ID NO529、 ppSEQ ID NO530和/或SEQ ID NO535、 qqSEQ ID NO531、以及 rrSEQ ID NO532 使用屬於組1的核苷酸序列時，優選使用包含組1中的任一個核苷酸序列的探針； 使用屬於組2的核苷酸序列時，優選使用包含組2中的任一個核苷酸序列的探針； 使用屬於組3的核苷酸序列時，優選使用包含組3中的任一個核苷酸序列的探針；和/或 使用屬於組4的核苷酸序列時，優選使用包含組4中的任一個核苷酸序列的探針。
並且，在上述組合的所有方式中，在組A中，優選包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因的探針，所述核苷酸序列包括選自下述包含單核苷酸多態性的核苷酸序列的、包含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列； SEQ ID NO203、SEQ ID NO206、SEQ ID NO208、SEQ ID NO209、SEQ ID NO211、SEQ ID NO214、SEQ ID NO216、SEQ ID NO218、SEQ ID NO219、SEQ ID NO221、SEQ ID NO224、SEQ ID NO226、SEQ ID NO228、SEQ ID NO229、SEQ ID NO231、SEQ ID NO234、SEQ IDNO235和SEQ ID NO238 在組B中，優選由包含選自下述核苷酸序列的核苷酸序列或其互補序列的核苷酸序列構成的探針。
SEQ ID NO533、SEQ ID NO516、SEQ ID NO517、SEQ ID NO518、SEQ ID NO519、SEQ ID NO520、SEQ ID NO521、SEQ ID NO522、SEQ ID NO523、SEQ ID NO524、SEQ ID NO525、SEQ ID NO526、SEQ ID NO527、SEQ ID NO528、SEQ ID NO529、SEQ ID NO535、SEQ IDNO531和SEQ ID NO532 需要說明的是，上述核苷酸序列是用於檢測高風險等位基因的探針所對應的序列。
在等位基因的檢測中使用Taqman法時，探針通常優選具有10～300鹼基的長度，且包含上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列，並且含有螢光物質和消光物質。探針更優選具有20～60鹼基的長度，且包含上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列，並且含有螢光物質和消光物質。
在等位基因的檢測中使用Invader法時，探針包含雖然具有上述多態性部位的3』側的共有序列但5』側的序列完全不同的探針(報導探針)；和只具有5』側的共有序列的探針(侵入探針)。上述探針通常優選具有10～300鹼基的長度，更優選具有20～60鹼基的長度。
在等位基因的檢測中使用LightCycler法時，探針通常優選具有10～300鹼基的長度，且包含上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列，並且含有螢光物質和消光物質。探針更優選具有20～60鹼基的長度，且包含上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列，並且含有螢光物質和消光物質。
在等位基因的檢測中使用細胞周期蛋白探針法時，探針為使DNA序列按照挾持具有上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列的RNA序列的兩端的方式結合，在各DNA端具有螢光物質或猝滅劑。上述探針通常優選具有10～300鹼基的長度，且包含上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列。探針更優選具有20～60鹼基的長度，且包含上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列。
在等位基因的檢測中使用MPSS法時，探針為具有單鏈序列的寡DNA(編碼銜接探針)，所述單鏈序列在5』側具有4鹼基的突出末端，緊隨其後是限制酶BbvI的識別序列，在3』側結合有解碼探針；以及在3』側含有螢光物質的單鏈寡DNA；包含4種不同的序列，各序列與一個編碼銜接探針特異性雜交的寡DNA(解碼探針)。使DNA序列按照挾持具有上述多態性部位及其周邊序列或與其互補的序列的RNA序列兩端的方式結合，在各DNA端含有螢光物質或猝滅劑。編碼銜接探針的長度通常優選為10～300鹼基對，更優選為15～40鹼基對。解碼探針的長度通常優選為10～300鹼基對，更優選為5～30鹼基對。
(用於檢測與青光眼有關的等位基因的試劑盒) 在本發明的另一方式中，提供用於檢測與青光眼有關的單核苷酸多態性的試劑盒。
只要是能夠在樣品中的核酸分子中檢測出本發明所公開的與青光眼有關的任一個單核苷酸多態性的等位基因或基因型的試劑盒，均包括在本發明的試劑盒(或風險預測用組合物)中。如上所述，本發明的試劑盒可以是檢測單核苷酸多態性的有義鏈或反義鏈的鹼基的試劑盒，也可以是檢測上述兩者的試劑盒。關於本發明的試劑盒，例如在基於使用微陣列通過1次分析而得到的結果時，所述微陣列是指檢測與青光眼有關的等位基因或基因型的試劑盒在1次操作中檢測50萬個單核苷酸多態性的微陣列，本發明的試劑盒優選為檢測後述表1～2中記載的p值為1×10-4以下的單核苷酸多態性的與青光眼有關的等位基因或基因型的試劑盒；更優選為檢測p值為3×10-4以下的單核苷酸多態性的與青光眼有關的等位基因或基因型的試劑盒；進一步優選為檢測p值為1×10-4以下的單核苷酸多態性的與青光眼有關的等位基因或基因型的試劑盒；更進一步優選為檢測p值為3×10-5以下的單核苷酸多態性的與青光眼有關的等位基因或基因型的試劑盒。當為按照Mantel-Haenszel法等整合分析方法整合多個分析結果而得到的結果時，本發明的試劑盒優選為檢測後述表52～B中記載的p值為1×10-2以下的單核苷酸多態性的與青光眼有關的等位基因或基因型的試劑盒；更優選為檢測p值為3×10-3以下的單核苷酸多態性的與青光眼有關的等位基因或基因型的試劑盒；進一步優選為檢測p值為1×10-3以下的單核苷酸多態性的與青光眼有關的等位基因或基因型的試劑盒；更進一步優選為檢測p值為3×10-4以下的單核苷酸多態性的與青光眼有關的等位基因或基因型的試劑盒；又更進一步優選為檢測p值為1×10-4以下的單核苷酸多態性的與青光眼有關的等位基因或基因型的試劑盒。
檢測上述在青光眼患者組中高頻率確認到的等位基因和與該等位基因對立的等位基因這兩者的試劑盒也是本發明的實施方式之一。使用這種試劑盒時，如上所述，還可以確定各等位基因的基因型。
通過使用本發明的試劑盒檢測樣品中存在在青光眼患者中高頻率確認到的等位基因或基因型，可以預測目前未患青光眼者將來的青光眼發病風險，判定是否需要進行青光眼的精密視野檢查，或者進行青光眼疑似病例的青光眼的診斷。
如上所述，通過使用對立等位基因各自的特異性探針、並且使探針的標記不同，或者通過形成上述微陣列或珠粒陣列的形式，還可以製成按照相同操作測定對立的等位基因的試劑盒。
通過製成使用一個樣品檢測上述多個等位基因或基因型的構成的試劑盒，還可以提高預測青光眼發病風險或判定是否需要精密的視野檢查的精度。在上述構成中，通過形成實施了不同標記的探針或上述微陣列或珠粒陣列的形式，還可以形成按照相同操作進行檢測的構成。
在本發明的與青光眼有關的單核苷酸多態性的檢測方法和青光眼發病風險的預測方法中，用於檢測或風險預測的試劑盒為使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險的預測的試劑盒，所述核酸分子包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列；和/或使用包含核苷酸序列的核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險的預測的試劑盒，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO515～694所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列； 更優選為使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險的預測的試劑盒，所述核酸分子包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列；和/或使用包含核苷酸序列的核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險的預測的試劑盒，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO515～535所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列； 進一步優選為使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險的預測的試劑盒，所述核酸分子包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列包含選自組A的至少一個核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列，所述組A包含下述包括單核苷酸多態性的核苷酸序列組a～r；和/或使用包含核苷酸序列的核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險的預測的試劑盒，所述核苷酸序列包括選自組B的至少一個核苷酸序列或核苷酸序列組、或它們的互補序列，所述組B包含aa～rr的核苷酸序列或核苷酸序列組。
(其中，在a～r所示的SEQ ID NO組中，各序列組對應於一個單核苷酸多態性，各核苷酸序列為在第31位鹼基中含有上述單核苷酸多態性的相互對立的等位基因的核苷酸序列； 在aa～rr所示的SEQ ID NO或SEQ ID NO組中，各核苷酸序列或核苷酸序列組為用於檢測一個單核苷酸多態性的核酸分子的序列或核酸分子的序列組， a和aa、b和bb、c和cc、d和dd、e和ee、f和ff、g和gg、h和hh、i和ii、j和jj、k和kk、l和ll、m和mm、n和nn、o和oo、p和pp、q和qq、以及r和rr分別對應於相同的單核苷酸多態性) 組A aSEQ ID NO203和/或SEQ ID NO204、 bSEQ ID NO205和/或SEQ ID NO206、 cSEQ ID NO207和/或SEQ ID NO208、 dSEQ ID NO209和/或SEQ ID NO210、 eSEQ ID NO211和/或SEQ ID NO212、 fSEQ ID NO213和/或SEQ ID NO214、 gSEQ ID NO215和/或SEQ ID NO216、 hSEQ ID NO217和/或SEQ ID NO218、 iSEQ ID NO219和/或SEQ ID NO220、 jSEQ ID NO221和/或SEQ ID NO222、 kSEQ ID NO223和/或SEQ ID NO224、 lSEQ ID NO225和/或SEQ ID NO226、 mSEQ ID NO227和/或SEQ ID NO228、 nSEQ ID NO229和/或SEQ ID NO230、 oSEQ ID NO231和/或SEQ ID NO232、 pSEQ ID NO233和/或SEQ ID NO234、 qSEQ ID NO235和/或SEQ ID NO236、以及 rSEQ ID NO237和/或SEQ ID NO238 組B aaSEQ ID NO515和/或SEQ ID NO533、 bbSEQ ID NO516、 ccSEQ ID NO517、 ddSEQ ID NO518和/或SEQ ID NO534、 eeSEQ ID NO519、 ffSEQ ID NO520、 ggSEQ ID NO521、 hhSEQ ID NO522、 iiSEQ ID NO523、 jjSEQ ID NO524、 kkSEQ ID NO525、 llSEQ ID NO526、 mmSEQ ID NO527、 nnSEQ ID NO528、 ooSEQ ID NO529、 ppSEQ ID NO530和/或SEQ ID NO535、 qqSEQ ID NO531、以及 rrSEQ ID NO532 使用上述任一個單核苷酸多態性時，其中，在組A中，優選使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險的預測的試劑盒，所述核酸分子包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因，所述核苷酸序列為選自下述包含單核苷酸多態性的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列； SEQ ID NO203、SEQ ID NO206、SEQ ID NO208、SEQ ID NO209、SEQ ID NO211、SEQ ID NO214、SEQ ID NO216、SEQ ID NO218、SEQ ID NO219、SEQ ID NO221、SEQ ID NO224、SEQ ID NO226、SEQ ID NO228、SEQ ID NO229、SEQ ID NO231、SEQ ID NO234、SEQ IDNO235和SEQ ID NO238 在組B中，優選使用包含核苷酸序列的核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險的預測的試劑盒，所述核苷酸序列包含選自下述核苷酸序列的核苷酸序列或其互補序列。SEQ ID NO533、SEQ ID NO516、SEQ ID NO517、SEQ ID NO518、SEQ ID NO519、SEQ ID NO520、SEQ ID NO521、SEQ IDNO522、SEQ ID NO523、SEQ ID NO524、SEQ ID NO525、SEQ ID NO526、SEQ ID NO527、SEQ ID NO528、SEQ ID NO529、SEQ ID NO535、SEQ ID NO531和SEQ ID NO532 需要說明的是，上述核苷酸序列為用於檢測高風險等位基因的核酸分子所對應的序列。
在本發明的與青光眼有關的單核苷酸多態性的檢測方法和青光眼發病風險的預測方法中，將任意的兩個以上單核苷酸多態性組合時，用於檢測或風險預測的試劑盒優選為使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核酸分子包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的、含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列；和/或使用包含核苷酸序列的核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO515～694所示的核苷酸序列的核苷酸序列或其互補序列，該試劑盒對應於其中兩個以上不同的單核苷酸多態性； 更優選為使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核酸分子包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO203～218所示的核苷酸序列的、含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列；和/或使用包含核苷酸序列的核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核苷酸序列包含選自SEQ IDNO515～535所示的核苷酸序列的核苷酸序列或其互補序列，該試劑盒對應於其中兩個以上不同的單核苷酸多態性； 進一步優選為使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核酸分子包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列包含選自下述含單核苷酸多態性的核苷酸序列組的、含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列；和/或使用包含核苷酸序列的核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核苷酸序列包含選自組B的核苷酸序列或核苷酸序列組、或它們的互補序列，所述組B包含aa～rr的核苷酸序列或核苷酸序列組，該試劑盒對應於其中兩個以上不同的單核苷酸多態性； (其中，在a～r所示的SEQ ID NO組中，各序列組對應於一個單核苷酸多態性，各核苷酸序列為在第31位鹼基中含有上述單核苷酸多態性的相互對立的等位基因的核苷酸序列； 在aa～rr所示的SEQ ID NO或SEQ ID NO組中，各核苷酸序列或核苷酸序列組為用於檢測一個單核苷酸多態性的核酸分子的序列或核酸分子的序列組； a和aa、b和bb、c和cc、d和dd、e和ee、f和ff、g和gg、h和hh、i和ii、j和jj、k和kk、l和ll、m和mm、n和nn、o和oo、p和pp、q和qq、以及r和rr分別對應於相同的單核苷酸多態性的) 組A aSEQ ID NO203和/或SEQ ID NO204、 bSEQ ID NO205和/或SEQ ID NO206、 cSEQ ID NO207和/或SEQ ID NO208、 dSEQ ID NO209和/或SEQ ID NO210、 eSEQ ID NO211和/或SEQ ID NO212、 fSEQ ID NO213和/或SEQ ID NO214、 gSEQ ID NO215和/或SEQ ID NO216、 hSEQ ID NO217和/或SEQ ID NO218、 iSEQ ID NO219和/或SEQ ID NO220、 jSEQ ID NO221和/或SEQ ID NO222、 kSEQ ID NO223和/或SEQ ID NO224、 lSEQ ID NO225和/或SEQ ID NO226、 mSEQ ID NO227和/或SEQ ID NO228、 nSEQ ID NO229和/或SEQ ID NO230、 oSEQ ID NO231和/或SEQ ID NO232、 pSEQ ID NO233和/或SEQ ID NO234、 qSEQ ID NO235和/或SEQ ID NO236、以及 rSEQ ID NO237和/或SEQ ID NO238 組B aaSEQ ID NO515和/或SEQ ID NO533、 bbSEQ ID NO516、 ccSEQ ID NO517、 ddSEQ ID NO518和/或SEQ ID NO534、 eeSEQ ID NO519、 ffSEQ ID NO520、 ggSEQ ID NO521、 hhSEQ ID NO522、 iiSEQ ID NO523、 jjSEQ ID NO524、 kkSEQ ID NO525、 llSEQ ID NO526、 mmSEQ ID NO527、 nnSEQ ID NO528、 ooSEQ ID NO529、 ppSEQ ID NO530和/或SEQ ID NO535、 qqSEQ ID NO531、以及 rrSEQ ID NO532 更進一步優選為使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核酸分子包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列包含選自組A的含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列，所述組A包含上述含單核苷酸多態性的核苷酸序列組；和/或使用包含核苷酸序列的核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核苷酸序列包含選自由上述序列組構成的組B的核苷酸序列或其互補序列，該試劑盒對應於其中10個以上不同的單核苷酸多態性； 又更進一步優選為使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核酸分子包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性，所述核苷酸序列包含選自組A的含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列，所述組A包含上述含單核苷酸多態性的核苷酸序列組；和/或使用包含核苷酸序列的核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核苷酸序列包含選自由上述序列組構成的組B的核苷酸序列或其互補序列，該試劑盒對應於上述所有不同的單核苷酸多態性。
另外，用於組合的單核苷酸多態性優選使用未處於連鎖不平衡狀態的單核苷酸多態性，從這個角度考慮，在上述組合的所有方式中， 關於上述組A，在包含屬於 aSEQ ID NO203和/或SEQ ID NO204、以及 bSEQ ID NO205和/或SEQ ID NO206 所組成的組的核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核苷酸序列中，以包含存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的核苷酸序列所組成的組作為組1的核苷酸序列； 在包含屬於 cSEQ ID NO207和/或SEQ ID NO208、以及 dSEQ ID NO209和/或SEQ ID NO210 所組成的組的核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核苷酸序列中，以包含存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的核苷酸序列所組成的組作為組2的核苷酸序列； 在包含屬於 jSEQ ID NO221和/或SEQ ID NO222、 kSEQ ID NO223和/或SEQ ID NO224、以及 lSEQ ID NO225和/或SEQ ID NO226 所組成的組的核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核苷酸序列中，以包含存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的核苷酸序列所組成的組作為組3的核苷酸序列； 在包含屬於 oSEQ ID NO231和/或SEQ ID NO232、 pSEQ ID NO233和/或SEQ ID NO234、 qSEQ ID NO235和/或SEQ ID NO236、以及 rSEQ ID NO237和/或SEQ ID NO238 所組成的組的核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核苷酸序列中，以包含存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的核苷酸序列所組成的組作為組4的核苷酸序列； 關於上述組B，以包含下述核苷酸序列的組作為組1的核苷酸序列，所述核苷酸序列包含屬於下述aa～bb組的核苷酸序列或其互補序列 aaSEQ ID NO515和/或SEQ ID NO533、以及 bbSEQ ID NO516 以包含下述核苷酸序列的組作為組2的核苷酸序列，所述核苷酸序列包含屬於下述cc～dd組的核苷酸序列或其互補序列 ccSEQ ID NO517、以及 ddSEQ ID NO518和/或SEQ ID NO534 以包含下述核苷酸序列的組作為組3的核苷酸序列，所述核苷酸序列包含屬於下述jj～ll組的核苷酸序列或其互補序列 jjSEQ ID NO524、 kkSEQ ID NO525、以及 llSEQ ID NO526 以包含下述核苷酸序列的組作為組4的核苷酸序列，所述核苷酸序列包含屬於下述oo～rr組的核苷酸序列或其互補序列 ooSEQ ID NO529、 ppSEQ ID NO530和/或SEQ ID NO535、 qqSEQ ID NO531、以及 rrSEQ ID NO532 使用屬於組1的核苷酸序列時，優選使用下述試劑盒，即、使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核酸分子包含組1中的任一個核苷酸序列； 使用屬於組2的核苷酸序列時，優選使用下述試劑盒，即、使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核酸分子包含組2中的任一個核苷酸序列； 使用屬於組3的核苷酸序列時，優選使用下述試劑盒，即、使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核酸分子包含組3中的任一個核苷酸序列；和/或 使用屬於組4的核苷酸序列時，優選使用下述試劑盒，即、使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核酸分子包含組4中的任一個核苷酸序列； 並且，在上述組合的所有方式中，在組A中，優選使用核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核酸分子包含存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因，所述核苷酸序列包含選自下述含單核苷酸多態性的核苷酸序列的、含單核苷酸多態性的核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列； SEQ ID NO203、SEQ ID NO206、SEQ ID NO208、SEQ ID NO209、SEQ ID NO211、SEQ ID NO214、SEQ ID NO216、SEQ ID NO218、SEQ ID NO219、SEQ ID NO221、SEQ ID NO224、SEQ ID NO226、SEQ ID NO228、SEQ ID NO229、SEQ ID NO231、SEQ ID NO234、SEQ IDNO235和SEQ ID NO238 在組B中，優選使用包含核苷酸序列的核酸分子檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性或進行青光眼發病風險預測的試劑盒，所述核苷酸序列包含選自下述核苷酸序列的核苷酸序列或其互補序列。SEQ ID NO533、SEQ ID NO516、SEQ ID NO517、SEQ ID NO518、SEQ ID NO519、SEQ ID NO520、SEQ ID NO521、SEQ ID NO522、SEQ ID NO523、SEQ ID NO524、SEQ ID NO525、SEQ ID NO526、SEQ ID NO527、SEQ ID NO528、SEQ ID NO529、SEQ ID NO535、SEQ IDNO531和SEQ ID NO532 需要說明的是，上述核苷酸序列為用於檢測高風險等位基因的核酸分子所對應的序列。
(分兩階段或多階段進行發病風險預測的青光眼發病風險的預測方法) 使用本發明的單核苷酸多態性進行青光眼發病風險的預測時，可以選擇認為必需精密預測青光眼發病風險的候選人，接著對上述候選人進行詳細的風險預測等兩階段或兩階段以上的多階段風險預測。
進行兩階段或兩階段以上的多階段風險預測時，首先，對本發明的單核苷酸多態性中的至少一個、優選任一個或多個進行上述青光眼發病風險預測，接著，可以使用上述本發明的單核苷酸多態性的組合進行詳細的風險預測。根據需要還可以進一步增加組合的個數，提高風險預測的精度。通過如此地進行兩階段或兩階段以上的多階段風險預測，可以兼顧減少風險預測中的運行費用和高精度的風險預測。
最初階段的風險預測可以採用簡便的風險預測方法。例如，如下所述的方法，即、將能夠檢測至少一個、優選任一個或多個上述單核苷酸多態性的探針固定化，使之能夠檢測本發明的單核苷酸多態性中的至少一個，之後使用該固定化探針的風險預測方法簡便，可用低成本進行檢測。需要說明的是，這種情況下，核酸提取方法可以使用利用公知技術可以實現的、或市售的簡便的核酸提取試劑盒。用於上述風險預測的固定化探針例如使用酶標記探針，之後利用比色法檢測該探針，該方法簡便。用於檢測的樣品也優選唾液、口腔黏膜細胞、尿、毛根、血液或白細胞等通過較低侵襲即可得到的樣品。
下一階段的風險預測可以採用重視精度的風險預測方法。例如，將兩個或兩個以上上述本發明的單核苷酸多態性組合起來，檢測與青光眼發病有關的單核苷酸多態性，可以進行高精度的風險預測。
通過如此進行兩階段或多階段的風險預測，可以降低成本，或者，在將最初階段被驗者的負擔降到最低限度的同時提高風險預測的精度。
利用本發明的方法，可以判斷基因組上具有本發明所公開的、在青光眼患者中高頻率確認到的等位基因或基因型者，其將來的青光眼發病風險高；而基因組上不具有在青光眼患者中高頻率確認到的等位基因或基因型者，其將來的青光眼發病風險低。
另外，基因組上具有本發明所公開的、在青光眼患者中高頻率確認到的等位基因或基因型者，其有可能發生初期青光眼，上述初期青光眼利用簡單的青光眼判定法、例如眼壓測定或眼底檢查難以檢測，進行視野檢查後方可最初確診，所以通過檢測本發明的單核苷酸多態性，可以進行是否需要視野檢查的篩選。另一方面，當青光眼疑似病例在基因組上具有本發明的與青光眼有關的等位基因或基因型時，該青光眼疑似病例診斷為青光眼的機率高。
實施例 以下列舉實施例來說明本發明，但例示實施例只是為了更好地理解本發明，並不意味著本發明範圍受這些實施例的限定。需要說明的是，在下述實施例中，對於沒有特別詳細說明的、通常所使用的分子生物學方法，採用Molexular Cloning(Joseph Sambrook等，MolexularCloning-A Laboratory Manual，第三版，Cold Spring Harbor LaboratoryPress，2001)等出版物中記載的方法和條件。
在本發明中，從診斷為青光眼的患者和診斷為不是青光眼且通過問診判斷不具有青光眼家族史的非患者各自的血液中提取總DNA，以人基因組上公知的約50萬個單核苷酸多態性為指標，分析與疾病有關的基因座位，確認與疾病的關係。對於青光眼進展迅速的患者即青光眼進展例、和青光眼進展緩慢的患者即青光眼非進展例，同樣進行單核苷酸多態性的鑑定和確認與進展的關聯。
實施例1從樣本中提取DNA 從樣本中提取DNA時，使用市售的自動核酸提取機(QUIAGEN公司、BIOROBOT(註冊商標)EZ1)和核酸提取試劑盒(EZ1 DNA Blood350μl Kit)，該試劑盒適用於上述提取機，其通過磁力回收吸附在磁珠上的核酸。總DNA的提取按照儀器和試劑盒的操作說明書進行。利用本方法從350μL血液樣本中得到約5μg的總DNA。
實施例2單核苷酸多態性的分析 分析單核苷酸多態性時，使用市售的微陣列型單核苷酸多態性分析試劑盒(Affimetrix公司GeneChip(註冊商標)Human Mapping 500K)(以下，記作微陣列)，該試劑盒可以分析人基因組上公知的約50萬個單核苷酸多態性。單核苷酸多態性的檢測使用適用於該試劑盒的掃描裝置(Affimetrix公司GeneChip(註冊商標)Scanner 3000)。單核苷酸多態性的分析使用專用分析軟體(Affimetrix公司GTYPE(商標))。
按照試劑盒和儀器的說明書處理實施例1中提取的總DNA，之後將其應用於微陣列上，分析存在於自樣本中提取的DNA上的單核苷酸多態性。簡單說明如下製備用限制酶NspI處理250ng總DNA而得到的樣品和用限制酶StyI處理250ng總DNA而得到的樣品，使銜接頭結合在各樣品的突出末端，利用PCR法進行擴增。回收PCR產物，用DNaseI將其片段化，使用試劑盒中所含的標記試劑對片段化的PCR產物末端進行生物素標記。向標記過的、已形成兩個片段的PCR產物中加入雜交用緩衝液，在99℃下熱處理10分鐘，之後在49℃下溫育1分鐘，根據最初處理的限制酶注入到NspI處理樣品用微陣列或StyI處理樣品用微陣列上，在49℃下雜交16～18小時。雜交結束後，將微陣列用鏈黴親和素-藻紅素染色。使用上述掃描裝置，讀取來自藻紅素的螢光，利用上述軟體進行分析，所述藻紅素經由生物素和鏈黴親和素結合在與固定化的等位基因特異性探針雜交的樣品中的DNA末端。將對應於約25萬個單核苷酸多態性的探針事先分別固定在NspI處理樣品用微陣列和StyI處理樣品用微陣列上，將兩者的結果整合，作為每個樣品對應於約50萬個單核苷酸多態性的分析結果。根據該方法，按照相同操作讀取各單核苷酸多態性的對立等位基因，從而由該結果確定基因型。這種情況下，當檢測到構成單核苷酸多態性的各等位基因兩方的信號時，確定基因型為雜合子；當只檢測到任一方的信號時，確定該被檢測的等位基因的基因型為純合子。
需要說明的是，根據該試劑盒的說明書，被固定在該試劑盒中的探針使用對應於基因組的有義鏈的探針或對應於反義鏈的探針。另外，根據該試劑盒的數據表，針對HapMap project中報導的單核苷酸多態性和本試劑盒中重複的單核苷酸多態性，使用270個樣品比較本試劑盒的判定結果和HapMap的判定結果時，記載著顯示出99％以上的一致率。
實施例3青光眼患者與非患者的單核苷酸多態性的比較 與疾病有關的單核苷酸多態性的比較按照Klein等人在老年性黃斑變性的致病基因研究中使用的方法(Science、308卷、385頁、2005年)進行。
將根據青光眼學會指導原則診斷的原發性隅角開放型青光眼患者和正常眼壓青光眼患者劃分到青光眼患者組，將通過問診確認不具有青光眼家族史的健康者劃分到非患者組。在充分說明了研究內容的情況下、且根據參加者的自主意願得到同意的情況下，將由418例青光眼患者組和300例非患者組提供的血液作為樣本，按照實施例1中記載的方法提取總DNA，按照實施例2中記載的方法分析單核苷酸多態性。將在每一名患者中得到的單核苷酸多態性的分析結果存入採用了關係資料庫的Laboratory Information Management系統(WorldFusion公司、LaboServer)中。在該系統內製作、安裝單核苷酸多態性分析專用程序，進行下述分析。即，在青光眼患者組和非患者組中均捨棄檢出率(call rate)不足90％的單核苷酸多態性、青光眼患者組與非患者組的檢出率之差為5％以上的單核苷酸多態性、次要等位基因頻率不足5％的單核苷酸多態性、以及根據卡方檢驗在p值為1×10-4以下判定Hardy-Weinberg’s平衡不成立的單核苷酸多態性，從而得到認為實驗可靠性高的單核苷酸多態性，在組間比較該單核苷酸多態性的等位基因頻率和基因型頻率。將等位基因頻率和基因型頻率通過卡方檢驗進行統計學比較。對於p值為1×10-3以下的單核苷酸多態性，確認作為基因型判定依據的聚類圖像。儘管聚類的分離不清楚，但基因型已判定的情況下，將該單核苷酸多態性從分析對象中除去。即，通過本操作除去基因型判定的錯誤。進行聚類評價時，在隱瞞單核苷酸多態性的名稱和危險率值的情況下進行。p值為1×10-4以下、即-logP為4以上時等位基因或基因型顯示出與青光眼相關的單核苷酸多態性見表1～2。需要說明的是，在各表中，根據下式(1)～(5)算出各等位基因與疾病相關聯的比值比、基因型與疾病相關聯的比值比。
等位基因頻率＝該組中該等位基因的測出數/該組中所有等位基因的測出數…·式(1) 基因型頻率＝該組中該基因型的測出數/該組中所有基因型的測出數…·式(2) 等位基因的比值比＝[(青光眼患者組中的、在青光眼患者組中高頻率確認到的等位基因的測出數)/(青光眼患者組中的、與在青光眼患者組中高頻率確認到的等位基因對立的等位基因的測出數)]/[(非患者組中的、在青光眼患者組中高頻率確認到的等位基因的測出數)/(非患者組中的、與在青光眼患者組中高頻率確認到的等位基因對立的等位基因的測出數)]…·式(3) 純合子基因型的比值比＝[(青光眼患者組中的、具有在青光眼患者組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)/(青光眼患者組中的、具有在非患者組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)]/[(非患者組中的、具有在青光眼患者組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)/(非患者組中的、具有在非患者組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)]…·式(4) 雜合子基因型的比值比＝[(青光眼患者組中雜合子基因型的測出數)/(青光眼患者組中的、具有在非患者組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)]/[(非患者組中雜合子基因型的測出數)/(非患者組中的、具有在非患者組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)]…·式(5)

表1和表2中列出特定所得的公知單核苷酸多態性的dbSNP ID編號或Affimetrix陣列ID編號、構成等位基因1和等位基因2的各鹼基、外顯子·內含子信息(單核苷酸多態性存在於基因上時，顯示基因名稱和SNP所存在的外顯子或內含子；單核苷酸多態性未存在於基因上時，顯示鄰近基因和該基因與該單核苷酸多態性間的距離)、單核苷酸多態性所存在的染色體編號、單核苷酸多態性的物理位置、通過卡方檢驗得到的等位基因的p值(-logP)、青光眼患者組和非患者組的高風險等位基因頻率、高風險等位基因的類型(顯示高風險等位基因是等位基因1或者是等位基因2)、等位基因的比值比、通過卡方檢驗得到的基因型的p值(-logP)、純合子和雜合子的基因型的比值比、以及各多態性部位的包含等位基因1的序列的SEQ ID NO和包含等位基因2的序列的SEQ ID NO。需要說明的是，利用上述dbSNP ID編號或Affimetrix陣列ID編號，本領域技術人員可以由上述編號獲取該單核苷酸多態性的序列或等位基因的信息。
比較不具有家族史的非患者和青光眼患者的、表1～2中記載的等位基因或基因型頻率時，確認存在統計學差異。通過確定上述任一個單核苷酸多態性的等位基因，可以判定樣品中是否存在在青光眼患者組中較在非患者組中高頻率確認到的等位基因。
以表1～2中記載的最初的單核苷酸多態性為例進行具體說明時，在佔據彼此相同的基因座位的SEQ ID NO1或2所示的核酸分子中存在一個多態性部位。即，第31位鹼基為A(等位基因1)或G(等位基因2)的單核苷酸多態性與青光眼的發病有關，以高風險等位基因的形式表示的等位基因1、即在青光眼患者組中高頻率確認到該單核苷酸多態性的鹼基為A的等位基因。並且，使用等位基因的比值比、純合子和雜合子的基因型的比值比，可以預測具有該等位基因或基因型時疾病風險提高的程度。同樣，表1～2所公開的序列在其序列中均具有與青光眼有關的多態性部位，在青光眼患者組中高頻率確認到該多態性部位中的一個等位基因或至少一個基因型。
通過上述研究，在21個區域中發現了40個以集團形式存在於基因組上較接近的區域的單核苷酸多態性，該單核苷酸多態性的等位基因或基因型與青光眼的關聯為p值1×10-4以下。
關於表1～2中記載的單核苷酸多態性，在青光眼患者組中高頻率確認到的等位基因或基因型可以用作顯示青光眼發病風險高的標誌。另一方面，與該等位基因對立的等位基因或該基因型以外的基因型可以用作顯示青光眼發病風險低的標誌。
接下來，參考由HapMap project提供的資料庫，確定表1～2中所示的單核苷酸多態性的周邊區域和/或基因。即，根據HapMap project中的日本人與中國人合併的連鎖不平衡數據，確定認為與表1～2所示的單核苷酸多態性處於連鎖不平衡的單核苷酸多態性所存在的區域。
當表1～2所示的單核苷酸多態性處於包含基因的連鎖不平衡區域時，確定該區域的物理位置和基因名稱。而當表1～2所示的單核苷酸多態性存在於不含基因的連鎖不平衡區域時，僅確定該區域的物理位置。當表1～2所示的單核苷酸多態性存在於超出連鎖不平衡區域的一個基因上時，僅確定該基因名稱。
各區域中以p值最低的單核苷酸多態性作為代表該區域的單核苷酸多態性，表3～4中列出代表各區域的單核苷酸多態性、該區域所存在的染色體編號、該區域的物理位置(起點和終點)、以及區域中所含的基因名稱。
表3


表4


表3～4中記載的區域認為是與表3～4中記載的、本發明的與青光眼有關的單核苷酸多態性連鎖的區域或基因，認為存在於這些區域或基因中的單核苷酸多態性與本發明的單核苷酸多態性連鎖。即，存在於這些區域中的任意的單核苷酸多態性與存在於該區域內的、表3～4中記載的單核苷酸多態性連鎖，這些任意的單核苷酸多態性也同樣可以用於青光眼的風險預測。
同樣，p值為1×10-3以下、即-logP為3以上時等位基因或基因型顯示與青光眼有關的單核苷酸多態性見表5～25。





















表5～25中列出特定所得的公知單核苷酸多態性的dbSNP ID編號或Affimetrix陣列ID編號、外顯子·內含子信息(單核苷酸多態性存在於基因上時，顯示基因名稱和SNP所存在的外顯子或內含子；單核苷酸多態性未存在於基因上時，顯示鄰近基因和該基因與該單核苷酸多態性間的距離)、該單核苷酸多態性所存在的染色體編號、該單核苷酸多態性的物理位置、通過卡方檢驗得到的等位基因的p值(-logP)、青光眼患者組和非患者組的高風險等位基因頻率、等位基因的比值比、通過卡方檢驗得到的基因型的p值(-logP)、以及純合子和雜合子的基因型的比值比。需要說明的是，表中，比值比以ND表示的部位表示作為分母的測出數均為0，比值比無法計算。
通過上述研究，發現413個等位基因或基因型與青光眼的關聯為p值1×10-3以下的單核苷酸多態性。
比較不具有家族史的非患者和青光眼患者的、表5～25中記載的等位基因或基因型的頻率時，確認存在統計學差異。通過確定上述任一個單核苷酸多態性的等位基因，可以判定樣品中是否存在在青光眼患者組中較在非患者組中高頻率確認到的等位基因。
實施例4青光眼進展例與青光眼非進展例的單核苷酸多態性的比較 進行與實施例3相同的操作，比較青光眼進展例與青光眼非進展例的單核苷酸多態性。
即，在根據青光眼學會指導原則診斷為原發性隅角開放型青光眼患者和正常眼壓青光眼患者中，在充分說明研究內容的情況下、且根據參加者的自主意願得到同意的情況下，以由一定期間內雖然給予降眼壓藥或進行手術等降眼壓治療但視野缺損仍在進展的210例患者(青光眼進展例)、175例視野缺損未進展的患者(青光眼非進展例)提供的血液為樣本，進行與實施例3同樣的分析，比較組間的等位基因頻率和基因型頻率。對於等位基因頻率和基因型頻率，也同樣通過卡方檢驗進行統計學比較。在p值為1×10-4以下、即-logP為4以上時，等位基因或基因型顯示與青光眼進展相關的單核苷酸多態性見表26～28。需要說明的是，根據下式(6)～(8)算出各表中各等位基因與青光眼進展相關聯的比值比、基因型與青光眼進展相關聯的比值比。等位基因的比值比＝[(青光眼進展組中的、在青光眼進展組中高頻率確認到的等位基因的測出數)/(青光眼進展組中的、與在青光眼進展組中高頻率確認到的等位基因對立的等位基因的測出數)]/[(青光眼非進展組中的、在青光眼進展組中高頻率確認到的等位基因的測出數)/(青光眼非進展組中的、與在青光眼進展組中高頻率確認到的等位基因對立的等位基因的測出數)]…式(6) 純合子基因型的比值比＝[(青光眼進展組中的、具有在青光眼進展組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)/(青光眼進展組中的、具有在青光眼非進展組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)]/[(青光眼非進展組中的、具有在青光眼進展組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)/(青光眼非進展組中的、具有在青光眼非進展組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)]…式(7) 雜合子基因型的比值比＝[(青光眼進展組中雜合子基因型的測出數)/(青光眼進展組中的、具有在青光眼非進展組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)]/[(青光眼非進展組中雜合子基因型的測出數)/(青光眼非進展組中的、具有在青光眼非進展組中高頻率確認到的等位基因的純合子的基因型的測出數)]…式(8)


表26～28中列出特定所得的公知單核苷酸多態性的dbSNP ID編號或Affimetrix陣列ID編號、構成等位基因1和等位基因2的各鹼基、外顯子·內含子信息(單核苷酸多態性存在於基因上時，顯示基因名稱和SNP所存在的外顯子或內含子；單核苷酸多態性未存在於基因上時，顯示鄰近基因和該基因與該單核苷酸多態性間的距離)、該單核苷酸多態性所存在的染色體編號、該單核苷酸多態性的物理位置、通過卡方檢驗得到的等位基因的p值(-logP)、青光眼進展組和青光眼非進展組的高風險等位基因頻率、高風險等位基因的類型(顯示高風險等位基因是等位基因1或者是等位基因2)、等位基因的比值比、通過卡方檢驗得到的基因型的p值(-logP)、純合子基因型的比值比、雜合子基因型的比值比、以及各多態性部位中的包含等位基因1的序列的SEQ ID NO和包含等位基因2的序列的SEQ ID NO。需要說明的是，表中比值比以ND表示的部位表示作為分母的測出數均為0，比值比無法計算。
通過上述研究，發現了61個等位基因或基因型與青光眼進展的關聯為p值1×10-4以下的單核苷酸多態性。
關於表26～28中記載的等位基因或基因型的頻率，在青光眼進展例和青光眼非進展例之間，確認存在統計學差異。通過確定上述任一個單核苷酸多態性的等位基因，可以判定樣品中是否存在在青光眼進展組中較在青光眼非進展組中高頻率確認到的等位基因。
另外，關於表26～28中記載的單核苷酸多態性，在青光眼進展組中高頻率確認到的等位基因或基因型可以用作顯示青光眼的進展風險高的標誌。而與該等位基因對立的等位基因或該基因型以外的基因型可以用作顯示青光眼的進展風險低的標誌。
同樣，在p值為1×10-3以下、即-logP為3以上的情況下，等位基因或基因型顯示與青光眼進展有關的單核苷酸多態性見表29～51。























表29～51中列出特定所得的公知單核苷酸多態性的dbSNP ID編號或Affimetrix陣列ID編號、外顯子·內含子信息(單核苷酸多態性存在於基因上時，顯示基因名稱和SNP所存在的外顯子或內含子；單核苷酸多態性未存在於基因上時，顯示鄰近基因和該基因與該單核苷酸多態性間的距離)、該單核苷酸多態性所存在的染色體編號、該單核苷酸多態性的物理位置、通過卡方檢驗得到的等位基因的p值(-logP)、青光眼進展組與青光眼非進展組的高風險等位基因頻率、等位基因的比值比、通過卡方檢驗得到的基因型的p值(-logP)、以及純合子和雜合子的基因型的比值比。需要說明的是，表中比值比以ND表示的部位表示作為分母的測出數均為0，比值比無法計算。
通過上述研究，發現了480個等位基因或基因型與青光眼進展的關聯為p值1×10-3以下的單核苷酸多態性。
關於表29～51中記載的等位基因或基因型的頻率，在青光眼進展例與青光眼非進展例之間，確認存在統計學差異。通過確定上述任一個單核苷酸多態性的等位基因，可以判定樣品中是否存在在青光眼進展組中較在青光眼非進展組中高頻率確認到的等位基因。
實施例5利用所特定的單核苷酸多態性的周邊序列確定法確認新型單核苷酸多態性 進行表1～2或表26～28中記載的單核苷酸多態性周邊的再測序，可以確認檢測到的各單核苷酸多態性、以及鑑定有可能存在的未知單核苷酸多態性。再測序可以按照公知的任何方法實施，例如可以按照直接測序法來進行。
實施例6 為了判定實施例3或4中鑑定的與青光眼有關的單核苷酸多態性、或判定存在於表1～51中記載的單核苷酸多態性周邊的公知單核苷酸多態性的等位基因以及基因型，可以製作固定化探針。公知的單核苷酸多態性例如可以從dbSNP或J SNP的資料庫中引用。在固定化探針中，例如可以搭載寡核苷酸探針，該寡核苷酸探針被設計成使幾個至數十萬個左右的靈敏度、特異性、重現性達到最大。固定化探針可以按照下述方法進行製備，例如在固體載體上合成寡核苷酸的方法，或者先合成寡核苷酸，之後將其以高密度固定在固體載體上的方法等。
實施例7 使用實施例6中製備的固定化探針，可以高精度地判定是否患有青光眼。通過將多個測出與疾病有關的單核苷酸多態性的探針組合起來，評價青光眼發病風險所增加的程度。超過某閾值時，判定患有青光眼。
另外，使用實施例6中製備的固定化探針，可以比較青光眼患者和非青光眼患者的基因組上所存在的單核苷酸多態性。存在於鄰近位置上的單核苷酸多態性之間有可能通過連鎖不平衡進行連鎖而遺傳。利用固定化探針可以鑑定與表1～2或表26～28中所示的單核苷酸多態性連鎖的單核苷酸多態性，可以期待著發現與青光眼的關聯更強的單核苷酸多態性。
實施例8定製陣列的設計 為了在減小第一類錯誤的同時保持檢測力，針對實施例3的一次分析中鑑定的青光眼發病相關候選單核苷酸多態性，使用獨自設計的單核苷酸多態性分析用陣列(以下，記作定製陣列)，進行另外收集的樣品的單核苷酸多態性的二次分析。
在定製陣列中，使用Illumina公司市售的單核苷酸多態性分析試劑盒[Illumina公司iSelectTM Genotyping BeadChip]。對於實施例3中顯示p值為1×10-3以下的446個青光眼發病相關單核苷酸多態性，嘗試著設計特異性檢測上述單核苷酸多態性的探針。由於上述探針經由珠粒被任意固定在基板上，所以特定珠粒位置的步驟(解碼)是必需的。將用於檢測在解碼過程中無法特定位置的單核苷酸多態性的探針從分析對象中除去。其結果，446個單核苷酸多態性中，可以製作能夠定型412個單核苷酸多態性的定製陣列，將上述定製陣列用於分析後述的單核苷酸多態性。需要說明的是，如珠粒陣列法的Infinium(註冊商標)分析項中所述，在本分析法中有兩種方法，即、使用一種探針的方法和使用兩種探針的方法。基本上是，檢測一個單核苷酸多態性時使用一種探針，檢測一部分單核苷酸多態性時使用兩種探針。
實施例9使用定製陣列的單核苷酸多態性的分析 按照Illumina公司的定製陣列試劑盒和分析儀器的說明書，使用試劑盒中所含的專用試劑進行實驗。以下簡單說明實驗步驟。向實施例1中提取的150～300ng總DNA中加入基因組處理專用試劑和氫氧化鈉溶液。接著，加入全基因組擴增酶，在37℃下溫育20～24小時，擴增全基因組。再加入片段化酶，在37℃下溫育1小時。利用異丙醇使DNA沉澱，之後向其中添加增溶試劑，在48℃下懸浮1小時。在95℃下熱改性20分鐘，將該溶液注入定製陣列中，在48℃下雜交16～24小時。
雜交結束後，對各探針進行等位基因特異性伸長反應或單核苷酸伸長反應，擴增螢光信號。信號通過適合於該試劑盒的掃描裝置(Illumina公司BeadArray Reader)來讀取。另外，在單核苷酸多態性的分析中使用專用軟體(Illumina公司BeadStudio 3.1)。通過該分析方法，可以同時判定各單核苷酸多態性的對立等位基因，根據該分析結果確定基因型。當檢測到構成各單核苷酸多態性的各等位基因兩方的信號時，確定基因型為雜合子；僅檢測到其中一方的信號時，確定基因型為該檢測的等位基因的純合子。
根據Illumina公司的分析手冊、即Infinium(註冊商標)GenotypingData Analysis，對於作為分析對象的所有單核苷酸多態性，根據顯示出螢光信號分布的聚類圖像，確認其基因型判定的正確性。對於正確確定的單核苷酸多態性的基因型，螢光信號形成各自完全分離的3個聚類(兩種的純合子和雜合子)，顯示在圖像上。而對於未能正確判定的單核苷酸多態性，3個聚類的邊界線不清楚。通過分析軟體判定聚類分離度不高時，再次確認該單核苷酸多態性的聚類圖像。雖然聚類不清楚但基因型已判定時，將該樣品從以後的分析操作中除去。需要說明的是，確認聚類圖像時，在掩蔽狀態下即無法與該單核苷酸多態性核對單核苷酸多態性名稱及p值的狀態下實施。需要說明的是，對於在用於二次分析的該定製陣列和用於一次分析的Affimetrix公司GeneChip Human Mapping 500K中重複的單核苷酸多態性，使用104個樣品比較基因型判定的一致率時，顯示出99％以上的一致率。
實施例10青光眼患者與非患者的基因型判定 將根據青光眼學會指導原則診斷為原發性隅角開放型青光眼患者和正常眼壓青光眼患者劃分到青光眼患者組，將通過問診確認不具有青光眼家族史的健康者劃分到非患者組。該分析中不使用進行一次分析的實施例3中使用的相同樣品，而是收集新的樣品。在充分說明研究內容的情況下、且根據參加者的自主意願得到同意的情況下，以由不同於實施例3的409例青光眼患者組、448例非患者組提供的血液作為樣品，按照實施例1中記載的方法提取總DNA，按照實施例9中記載的方法分析單核苷酸多態性。將由每個患者提供的樣品而得到的單核苷酸多態性的分析結果存入採用了關係資料庫的LaboratoryInformation Management系統(World Fusion公司、LaboServer)中。在該系統內製作、安裝單核苷酸多態性分析專用程序，進行下述分析。即，在青光眼患者組和非患者組中均捨棄檢出率不足90％的單核苷酸多態性、次要等位基因頻率不足5％的單核苷酸多態性，從而得到認為實驗可靠性高的單核苷酸多態性。
實施例11整合分析 整合分析中使用Mantel-Haenszel法(ゎかりやすぃ醫學統計學、第48-80頁、森實敏夫、Medical Tribune公司)。即，對於在實施例3和實施例10所記載的兩種方法中均認為實驗可靠性高的402個單核苷酸多態性，採用Mantel-Haenszel卡方檢驗將等位基因頻率和兩個基因型頻率(顯性遺傳模型、隱性遺傳模型)進行統計學比較。在p值為1.2×10-4以下(進行402次多重比較時，相當於p＜5×10-2的Bonferroni校正水平)、即-logP為3.91以上的條件下，在等位基因模型、顯性遺傳模型、隱性遺傳模型中均顯示與青光眼發病相關的單核苷酸多態性見表52。
Mantel-Haenszel卡方檢驗以及上述單核苷酸多態性的Mantel-Haenszel法的比值比和95％置信區間的計算按以下程序進行。
求出等位基因模型、顯性遺傳模型、隱性遺傳模型的Mantel-Haenszel卡方值，與自由度1的卡方分布進行比較，算出p值。
等位基因模型的Mantel-Haenszel卡方值(xAMH2)按下式計算。
數學式1
EAi＝xAimAi/NAi xAi高風險等位基因的總測出數 yAi低風險等位基因的總測出數 mAi青光眼患者組的等位基因總測出數 nAi非患者組的等位基因總測出數 NAi等位基因的總測出數 hAi青光眼患者組的高風險等位基因測出數 顯性遺傳模型的Mantel-Haenszel卡方值(xDMH2)按下式計算。
數學式2
EDi＝xDimDi/NDi xDi高風險等位基因的純合子的總測出數與雜合子總測出數之和 yDi低風險等位基因的純合子的總測出數 mDi青光眼患者組的基因型的總測出數 nDi非患者組的基因型的總測出數 NDi基因型的總測出數 hDi青光眼患者組的高風險等位基因的純合子的測出數與雜合子的測出數之和 隱性遺傳模型的Mantel-Haenszel卡方值(xRMH2)按下式計算。
數學式3
ERi＝xRimRi/NRi xRi高風險等位基因的純合子的總測出數 yRi低風險等位基因的純合子的總測出數與雜合子的基因型的總測出數之和 mRi青光眼患者組的基因型的總測出數 nRi非患者組的基因型的總測出數 NRi基因型的總測出數 hRi青光眼患者組的高風險等位基因的純合子的測出數 計算等位基因模型、顯性遺傳模型、隱性遺傳模型的Mantel-Haenszel檢驗的比值比。
等位基因模型的Mantel-Haenszel檢驗的比值比(ORaMH)按下式計算。
數學式4
Aai青光眼患者組中高風險等位基因的測出數 Bai青光眼患者組中低風險等位基因的測出數 Cai非患者組中高風險等位基因的測出數 Dai非患者組中低風險等位基因的測出數 Zai等位基因的總測出數 顯性遺傳模型的Mantel-Haenszel檢驗的比值比(ORdMH)按下式計算。
數學式5
Adi青光眼患者組中高風險等位基因的純合子的測出數與青光眼患者組中雜合子的測出數之和 Bdi青光眼患者組中低風險等位基因的純合子的測出數 Cdi非患者組中高風險等位基因的純合子的測出數與非患者組中雜合子的測出數之和 Ddi非患者組中低風險等位基因的純合子的測出數 Zdi基因型的總測出數 隱性遺傳模型的Mantel-Haenszel檢驗的比值比(ORrMH)按下式計算。
數學式6
Ari青光眼患者組中高風險等位基因的純合子的測出數 Bri青光眼患者組中雜合子的測出數與青光眼患者組中低風險等位基因的純合子的測出數之和 Cri非患者組中高風險等位基因的純合子的測出數 Dri非患者組中雜合子的測出數與非患者組中低風險等位基因的純合子的測出數之和 Zri基因型的總測出數 計算等位基因模型、顯性遺傳模型、隱性遺傳模型的Mantel-Haenszel檢驗的比值比的95％置信區間。
等位基因模型的95％置信區間(95％CIA)按下式計算。
數學式7
aAi青光眼患者組中高風險等位基因的測出數 bAi青光眼患者組中低風險等位基因的測出數 cAi非患者組中高風險等位基因的測出數 dAi非患者組中低風險等位基因的測出數 zAi等位基因的總測出數 ORaMH等位基因模型的Mantel-Haenszel檢驗的比值比 顯性遺傳模型的95％置信區間(95％CId)按下式計算。
數學式8
aDi青光眼患者組中高風險等位基因的純合子的測出數與青光眼患者組中雜合子的測出數之和 bDi青光眼患者組中低風險等位基因的純合子的測出數 cDi非患者組中高風險等位基因的純合子的測出數與非患者組中雜合子的測出數之和 dDi非患者組中低風險等位基因的純合子的測出數 zDi基因型的總測出數 ORdMH顯性遺傳模型的Mantel-Haenszel檢驗的比值比 隱性遺傳模型的95％置信區間(95％CIr)按下式計算。
數學式9
aRi青光眼患者組中高風險等位基因的純合子的測出數 bRi青光眼患者組中雜合子的測出數與青光眼患者組中低風險等位基因的純合子的測出數之和 cRi非患者組中高風險等位基因的純合子的測出數 dRi非患者組中雜合子的測出數與非患者組中低風險等位基因的純合子的測出數之和 zRi基因型的總測出數 ORrMH隱性遺傳模型的Mantel-Haenszel檢驗的比值比
表52中列出特定所得的公知單核苷酸多態性的dbSNP ID、單核苷酸多態性所存在的染色體編號、單核苷酸多態性的物理位置、外顯子·內含子信息(單核苷酸多態性存在於基因上時，顯示基因名稱和單核苷酸多態性所存在的外顯子或內含子；單核苷酸多態性未存在於基因上時，顯示鄰近基因和該基因與該單核苷酸多態性間的距離)、連鎖不平衡狀態的信息(對存在於同一連鎖不平衡區域的單核苷酸多態性賦予編號LD1～LD4)、構成等位基因1和等位基因2的各鹼基、高風險等位基因的鹼基、青光眼患者組和非患者組的高風險等位基因頻率、3種的Mantel-Haenszel檢驗(等位基因頻率、顯性遺傳模型、隱性遺傳模型)中p值最低的檢驗方法中的p值、其檢驗種類、比值比、95％置信區間、各多態性部位中的包含等位基因1的序列的SEQ ID NO和包含等位基因2的序列的SEQ ID NO、以及顯示二次分析時所用探針的核酸序列的SEQ ID NO(基本上是利用同一種探針檢測兩方的等位基因，但在使用兩種探針識別等位基因時，將兩個SEQ ID NO同時標記)。需要說明的是，利用上述dbSNP ID編號，本領域技術人員可以由上述編號獲取該單核苷酸多態性的序列或等位基因的信息。
比較非患者與青光眼患者的、表52的單核苷酸多態性的等位基因或基因型的頻率時，通過Mantel-Haenszel卡方檢驗確認到存在統計學差異。與實施例3的情形一樣，通過確定上述任一個單核苷酸多態性的等位基因，可以判定樣品中是否存在在青光眼患者組中較在非患者組中高頻率確認到的等位基因。
通過上述研究，在11個區域中發現了18個以集團形式存在於基因組上較接近的區域的單核苷酸多態性，該單核苷酸多態性的等位基因或基因型與青光眼的關聯為p值1.2×10-4以下。
關於表52中記載的單核苷酸多態性，在青光眼患者組中高頻率確認到的等位基因(即高風險等位基因)或基因型(即，當高風險等位基因符合顯性遺傳模型時，基因型為高風險等位基因的純合子或雜合子；當高風險等位基因符合隱性遺傳模型時，基因型為高風險等位基因的純合子)可以用作顯示青光眼的發病風險高的標誌。而與該等位基因對立的等位基因或該基因型以外的基因型可以用作顯示青光眼的發病風險低的標誌。
同樣，在p值為1×10-2以下、即-logP為2以上時，等位基因或基因型顯示與青光眼發病相關的單核苷酸多態性見表53～62。










表53～62中記載的單核苷酸多態性同樣可以用作用於預測青光眼發病風險的標誌。
接下來，參考由HapMap project提供的資料庫，確定表52所示的單核苷酸多態性的周邊區域和/或基因。即，根據HapMap project中的日本人和中國人合併的連鎖不平衡數據，確定認為與表52所示的單核苷酸多態性處於連鎖不平衡的單核苷酸多態性所存在的區域。
當表52所示的單核苷酸多態性存在於包含基因的連鎖不平衡區域時，確定該區域的物理位置和基因名稱。而當表52所示的單核苷酸多態性存在於不含基因的連鎖不平衡區域時，僅確定該區域的物理位置。當表52所示的單核苷酸多態性存在於超出連鎖不平衡區域的1個基因上時，確定該基因名稱以及該基因的物理位置。
在各區域中，以p值最小的單核苷酸多態性作為代表該區域的單核苷酸多態性，表63～70中列出代表各區域的單核苷酸多態性、該區域所存在的染色體編號、該區域的物理位置(起點和終點)、以及區域中所含的基因名稱。
表63

表64

表65


表66

表67

表68

表69

表70

表63～70中記載的區域是認為與表53～62中記載的、與本發明的青光眼發病有關的單核苷酸多態性連鎖的區域或基因，認為存在於這些區域或基因中的單核苷酸多態性與本發明的單核苷酸多態性連鎖。即，存在於上述區域中的任意的單核苷酸多態性與存在於該區域內的表53～62中記載的單核苷酸多態性連鎖，上述任意的單核苷酸多態性也同樣可以用於預測青光眼的發病風險。
實施例12邏輯回歸分析 在本發明中，採用邏輯回歸分析來研究通過將判定與青光眼發病有關的任意兩個以上單核苷酸多態性組合起來，與各單核苷酸多態性單獨使用時相比，疾病危險性的預測精度提高的程度。在該分析中，通過將等位基因或基因型的頻率進行統計比較，可以使用判定為與青光眼的發病顯著相關的上述單核苷酸多態性中任意的組合。其中一個例子為對即使進行Bonferroni校正也顯示出顯著差異的17個單核苷酸多態性進行邏輯回歸分析。
首先，利用逐步回歸法從17個在Bonferroni校正下具有顯著性的單核苷酸多態性中進一步減少用於邏輯回歸分析的單核苷酸多態性。採用逐步回歸法時，變數取·/舍的基準採用0.01。另外，應用逐步回歸法時，屬於同一LD區段的單核苷酸多態性(表52中，連鎖不平衡的欄內具有相同記載的單核苷酸多態性)用屬於各LD區段的任一個單核苷酸多態性來代表，並進行設定使上述任一個單核苷酸多態性成為採納對象。以縮減過的各單核苷酸多態性作為獨立變數(∏)(一方的等位基因的純合子＝0、雜合子＝1、對立等位基因的純合子＝2)，通過邏輯回歸分析求出回歸係數(λ)，來確定下式(18)。
式(18) Φ＝1/{1+exp[-(λ0+λ1∏1+λ2∏2+λ3∏3+…)]} 接下來，在各樣品中，將各自的單核苷酸多態性所對應的變數代入該式，計算風險預測值(Φ)。Φ大於0.5時，判斷該樣品的提供者存在發病風險。通過核對該判定結果與具有該單核苷酸多態性的樣品提供者實際上是否是青光眼患者，算出一致率。並且，求出採納的各單核苷酸多態性單獨和任意兩個以上單核苷酸多態性的所有組合的上述一致率，對於每一個用於組合的單核苷酸多態性求出一致率的平均值和標準偏差。表71中列出單獨和任意個數的單核苷酸多態性的組合、將任意個數的單核苷酸多態性組合時的組合數、以及一致率的平均值和標準偏差的關係。需要說明的是，所有計算均使用SASInstitute Japan株式會社的Windows(註冊商標)版SAS 9.1.3來進行。
如表71所示，利用逐步回歸法，17個單核苷酸多態性中，將屬於同一LD區段的單核苷酸多態性分別看作一個時，10個全部入選(rs7081455、rs693421、rs9358578、rs7961953、rs16935718、rs11123034、rs13110551、rs7559118、rs10517556、rs6451268)。上述10個單核苷酸多態性中，對於各自單獨或任意兩個以上的組合，使用邏輯回歸式算出每個症例的風險預測值(Φ)。風險預測值的截斷值為0.5時，各單核苷酸多態性單獨使用時的一致率的平均值±標準偏差為54.7±1.4％。該一致率隨著用於組合的單核苷酸多態性數的增大而增加，將10個全部組合時達到最大值59.9％。
表71
由此可知通過單核苷酸多態性判定青光眼的發病風險時，即使單獨使用各單核苷酸多態性也可得到良好的一致率，但通過將它們組合起來可以進一步提高診斷精度。
綜上所述，基因組上具有本發明所公開的、在青光眼患者中高頻率確認到的等位基因或基因型者，將來其青光眼的發病風險高；而基因組上不具有在青光眼患者中高頻率確認到的等位基因或基因型者，將來其青光眼的發病風險低。
產業實用性 根據本發明的方法，通過分析樣品中的本發明的單核苷酸多態性的等位基因或基因型，可以判定樣品提供者的青光眼發病風險的高低。根據該風險，樣品提供者可以採取預防青光眼的措施、或者接受適當的治療。基因組上具有本發明的單核苷酸多態性的、在青光眼患者中高頻率確認到的等位基因或基因者，可以接受精密檢查以判斷是否為通過眼壓或眼底照片難以充分判別的初期青光眼。當診斷為青光眼時，可以早期開始治療，所以本發明的方法是有用的。
序列表
參天製藥株式會社
木下茂
田代啟
青光眼發病風險的判定方法
08-017-PCTJP
JP 2007-108688
2007-04-17
694
PatentIn version Ver.3.3
1
61
DNA
Homo sapiens
1
cggtgctgca ccgtggatgt gagtccttgc acagtggtga aatgtagtag aggagtgatc60
t61
2
61
DNA
Homo sapiens
2
cggtgctgca ccgtggatgt gagtccttgc gcagtggtga aatgtagtag aggagtgatc60
t61
3
61
DNA
Homo sapiens
3
ccggagtatc ccgctttctt tggaggaaac aaccgcatca gatctgcgct gcggcagagg60
c61
4
61
DNA
Homo sapiens
4
ccggagtatc ccgctttctt tggaggaaac caccgcatca gatctgcgct gcggcagagg60
c61
5
61
DNA
Homo sapiens
5
tcagcaccct gcaccagtcc aagtacatga cagataccac agggaaggag ttcagaactg60
t61
6
61
DNA
Homo sapiens
6
tcagcaccct gcaccagtcc aagtacatga tagataccac agggaaggag ttcagaactg60
t61
7
61
DNA
Homo sapiens
7
ttctccatca tcctctttct ctattctcca gacattaggc acccactgtg tgcccagcac60
a61
8
61
DNA
Homo sapiens
8
ttctccatca tcctctttct ctattctcca tacattaggc acccactgtg tgcccagcac60
a61
9
61
DNA
Homo sapiens
9
gtttccagaa ctctttttgg ccaggctcca agctaagctc tgtaggaagc ttgatgatgg60
g61
10
61
DNA
Homo sapiens
10
gtttccagaa ctctttttgg ccaggctcca ggctaagctc tgtaggaagc ttgatgatgg60
g61
11
61
DNA
Homo sapiens
11
cctgcagagg ggatttgctt tgctaaagga gtcaccacag agcacccgag agtaacaggt60
t61
12
61
DNA
Homo sapiens
12
cctgcagagg ggatttgctt tgctaaagga ttcaccacag agcacccgag agtaacaggt60
t61
13
61
DNA
Homo sapiens
13
gagtgggcag ttggaaacag ctatgaaacc agcatttagt gatggggcag tagggctggg60
g61
14
61
DNA
Homo sapiens
14
gagtgggcag ttggaaacag ctatgaaacc ggcatttagt gatggggcag tagggctggg60
g61
15
61
DNA
Homo sapiens
15
aaccccatgc ctacatccat tatcaaccta cgcctatgct aaagcttgtt acaatgagca60
g61
16
61
DNA
Homo sapiens
16
aaccccatgc ctacatccat tatcaaccta tgcctatgct aaagcttgtt acaatgagca60
g61
17
61
DNA
Homo sapiens
17
ttccctgact cttgaagagg acagtggaca atgctgttta atggtggaca cagaaggatc60
a61
18
61
DNA
Homo sapiens
18
ttccctgact cttgaagagg acagtggaca gtgctgttta atggtggaca cagaaggatc60
a61
19
61
DNA
Homo sapiens
19
tatggaagca ctgtgaaaga caaactactc cgaatactga aagtttcttt tacaaaaaca60
t61
20
61
DNA
Homo sapiens
20
tatggaagca ctgtgaaaga caaactactc tgaatactga aagtttcttt tacaaaaaca60
t61
21
61
DNA
Homo sapiens
21
ataacacctg ccactgacct tccatgagca gtgactatgt ggtttcaaca ttggtcccac60
c61
22
61
DNA
Homo sapiens
22
ataacacctg ccactgacct tccatgagca ttgactatgt ggtttcaaca ttggtcccac60
c61
23
61
DNA
Homo sapiens
23
gccactgcca ccactcctgc agattgttcc agctgtgtta ctaaatacag gttgcttttc60
t61
24
61
DNA
Homo sapiens
24
gccactgcca ccactcctgc agattgttcc cgctgtgtta ctaaatacag gttgcttttc60
t61
25
61
DNA
Homo sapiens
25
gtgagccacc atgcccagcc ctgtcatcta cctttctgag agcagcttct acccatctga60
a61
26
61
DNA
Homo sapiens
26
gtgagccacc atgcccagcc ctgtcatcta tctttctgag agcagcttct acccatctga60
a61
27
61
DNA
Homo sapiens
27
cttgtcttca agagcagatg cagattatcc cgagcccagg ggacctatgt gagggagctt60
c61
28
61
DNA
Homo sapiens
28
cttgtcttca agagcagatg cagattatcc tgagcccagg ggacctatgt gagggagctt60
c61
29
61
DNA
Homo sapiens
29
agtgggaccc tgtgaggcaa acatcaccac aaggctggga acagcaggac tcaggcactg60
c61
30
61
DNA
Homo sapiens
30
agtgggaccc tgtgaggcaa acatcaccac gaggctggga acagcaggac tcaggcactg60
c61
31
61
DNA
Homo sapiens
31
tatataataa agacatctga taacatgaca gctaaggctc cttctaggta taaaacgtta60
t61
32
61
DNA
Homo sapiens
32
tatataataa agacatctga taacatgaca tctaaggctc cttctaggta taaaacgtta60
t61
33
61
DNA
Homo sapiens
33
atggcagggg ccagggtgag tggagaatac cgcttgatga gagaacccca aggcggagag60
g61
34
61
DNA
Homo sapiens
34
atggcagggg ccagggtgag tggagaatac tgcttgatga gagaacccca aggcggagag60
g61
35
61
DNA
Homo sapiens
35
cccttttctt tcttgttctt tttaagactc aatctcaaat ctgcaaccta cctaccataa60
g61
36
61
DNA
Homo sapiens
36
cccttttctt tcttgttctt tttaagactc gatctcaaat ctgcaaccta cctaccataa60
g61
37
61
DNA
Homo sapiens
37
tttctggctt agaattattc ataggtacaa cgctgatggc tcttctgaaa ttgcccctgc60
a61
38
61
DNA
Homo sapiens
38
tttctggctt agaattattc ataggtacaa ggctgatggc tcttctgaaa ttgcccctgc60
a61
39
61
DNA
Homo sapiens
39
acaaagcagc tatgatcata ggcacatgaa agcaaaatgt actggtgatt tcatgttcct60
c61
40
61
DNA
Homo sapiens
40
acaaagcagc tatgatcata ggcacatgaa cgcaaaatgt actggtgatt tcatgttcct60
c61
41
61
DNA
Homo sapiens
41
aagagatagg aaaagacaca gagacacaga cgggaatgcc gggtgaagac agaggaaaat60
a61
42
61
DNA
Homo sapiens
42
aagagatagg aaaagacaca gagacacaga ggggaatgcc gggtgaagac agaggaaaat60
a61
43
61
DNA
Homo sapiens
43
taatatactg caaccacatg agatttatct aagaagtgca agttttgttt aacatgcaga60
a61
44
61
DNA
Homo sapiens
44
taatatactg caaccacatg agatttatct gagaagtgca agttttgttt aacatgcaga60
a61
45
61
DNA
Homo sapiens
45
tgcaaagaaa atgaatcact catgggtata caaaatgtta cagcctcttt ggaaaacagt60
t61
46
61
DNA
Homo sapiens
46
tgcaaagaaa atgaatcact catgggtata taaaatgtta cagcctcttt ggaaaacagt60
t61
47
61
DNA
Homo sapiens
47
ccggagtatc ccgctttctt tggaggaaac aaccgcatca gatctgcgct gcggcagagg60
c61
48
61
DNA
Homo sapiens
48
ccggagtatc ccgctttctt tggaggaaac caccgcatca gatctgcgct gcggcagagg60
c61
49
61
DNA
Homo sapiens
49
tcagcaccct gcaccagtcc aagtacatga cagataccac agggaaggag ttcagaactg60
t61
50
61
DNA
Homo sapiens
50
tcagcaccct gcaccagtcc aagtacatga tagataccac agggaaggag ttcagaactg60
t61
51
61
DNA
Homo sapiens
51
ttctccatca tcctctttct ctattctcca gacattaggc acccactgtg tgcccagcac60
a61
52
61
DNA
Homo sapiens
52
ttctccatca tcctctttct ctattctcca tacattaggc acccactgtg tgcccagcac60
a61
53
61
DNA
Homo sapiens
53
tagggagcaa caccatggtg gtagagaacc aaagtttatt agcatctcta aactcatata60
g61
54
61
DNA
Homo sapiens
54
tagggagcaa caccatggtg gtagagaacc gaagtttatt agcatctcta aactcatata60
g61
55
61
DNA
Homo sapiens
55
aatgatatat caatgatata ttgaggagcc cagtaagatc ttaaatctag agggaaggta60
g61
56
61
DNA
Homo sapiens
56
aatgatatat caatgatata ttgaggagcc tagtaagatc ttaaatctag agggaaggta60
g61
57
61
DNA
Homo sapiens
57
aattgtgtgt gtgtgttttt aagtttgata cgtctaatgc ttatgaaaat ttttaccaga60
t61
58
61
DNA
Homo sapiens
58
aattgtgtgt gtgtgttttt aagtttgata tgtctaatgc ttatgaaaat ttttaccaga60
t61
59
61
DNA
Homo sapiens
59
catatacttg ttctcaaacc attcactagc aagaaaaagt ggcctagagc aggggtcagc60
a61
60
61
DNA
Homo sapiens
60
catatacttg ttctcaaacc attcactagc cagaaaaagt ggcctagagc aggggtcagc60
a61
61
61
DNA
Homo sapiens
61
ggaagggaac ctgagtatga gaaggacaga cgaggagaag ttggttaatg tttacaaact60
t61
62
61
DNA
Homo sapiens
62
ggaagggaac ctgagtatga gaaggacaga tgaggagaag ttggttaatg tttacaaact60
t61
63
61
DNA
Homo sapiens
63
cttgatttta ttgctaggga ttgtggtaaa acacccaaag aatgtgggta tgtgcctact60
t61
64
61
DNA
Homo sapiens
64
cttgatttta ttgctaggga ttgtggtaaa gcacccaaag aatgtgggta tgtgcctact60
t61
65
61
DNA
Homo sapiens
65
caacattatc tttctgaggg atacaactca accctgaaca cctgcttaca caggaaacgc60
a61
66
61
DNA
Homo sapiens
66
caacattatc tttctgaggg atacaactca cccctgaaca cctgcttaca caggaaacgc60
a61
67
61
DNA
Homo sapiens
67
ccatacagcc aaaagcccac atcctacatc cgagtaacag cccaggctga catgacccca60
g61
68
61
DNA
Homo sapiens
68
ccatacagcc aaaagcccac atcctacatc tgagtaacag cccaggctga catgacccca60
g61
69
61
DNA
Homo sapiens
69
gtttgtccct ttttaaagtt gttggtttaa aatttctctg atacaaaaat agtgacccag60
g61
70
61
DNA
Homo sapiens
70
gtttgtccct ttttaaagtt gttggtttaa catttctctg atacaaaaat agtgacccag60
g61
71
61
DNA
Homo sapiens
71
acaaagcagc tatgatcata ggcacatgaa agcaaaatgt actggtgatt tcatgttcct60
c61
72
61
DNA
Homo sapiens
72
acaaagcagc tatgatcata ggcacatgaa cgcaaaatgt actggtgatt tcatgttcct60
c61
73
61
DNA
Homo sapiens
73
gagctctctg gatagatatt tccattccac cgtcgcatct tcccagcaga gtgtgggtga60
a61
74
61
DNA
Homo sapiens
74
gagctctctg gatagatatt tccattccac tgtcgcatct tcccagcaga gtgtgggtga60
a61
75
61
DNA
Homo sapiens
75
cttaggaagt ggtatcctaa ggtgagatgt aaaggaagac taggagttag gtcagcaaga60
g61
76
61
DNA
Homo sapiens
76
cttaggaagt ggtatcctaa ggtgagatgt gaaggaagac taggagttag gtcagcaaga60
g61
77
61
DNA
Homo sapiens
77
gttgaacttt tatttctcaa ggagcagata ctagatatac ataccatgtt gactcaagcc60
c61
78
61
DNA
Homo sapiens
78
gttgaacttt tatttctcaa ggagcagata gtagatatac ataccatgtt gactcaagcc60
c61
79
61
DNA
Homo sapiens
79
ggtgctttga aagaacaatt gctcctacaa acatcaaatc aaacttttag aagctgataa60
a61
80
61
DNA
Homo sapiens
80
ggtgctttga aagaacaatt gctcctacaa ccatcaaatc aaacttttag aagctgataa60
a61
81
61
DNA
Homo sapiens
81
tatgccaatg aaatccccat gctggagaca acttattaga aagactgagc atatgtacta60
t61
82
61
DNA
Homo sapiens
82
tatgccaatg aaatccccat gctggagaca gcttattaga aagactgagc atatgtacta60
t61
83
61
DNA
Homo sapiens
83
attcccctta ggattcaagg cagactgcac cgtgagaaat catttgtcct ttgcacacag60
t61
84
61
DNA
Homo sapiens
84
attcccctta ggattcaagg cagactgcac tgtgagaaat catttgtcct ttgcacacag60
t61
85
61
DNA
Homo sapiens
85
gtcaatactt tagagtaatg ttatagacca gggctaaaat ttacatgaga atagaagagg60
c61
86
61
DNA
Homo sapiens
86
gtcaatactt tagagtaatg ttatagacca tggctaaaat ttacatgaga atagaagagg60
c61
87
61
DNA
Homo sapiens
87
tgtgagattt gtaacaaata aattagctct gaactcttca tgtaacaaga tgtctagttt60
c61
88
61
DNA
Homo sapiens
88
tgtgagattt gtaacaaata aattagctct taactcttca tgtaacaaga tgtctagttt60
c61
89
61
DNA
Homo sapiens
89
cgattactta attattccat ctggaattta cggactaaaa cagaagtcta tttttatttt60
a61
90
61
DNA
Homo sapiens
90
cgattactta attattccat ctggaattta tggactaaaa cagaagtcta tttttatttt60
a61
91
61
DNA
Homo sapiens
91
tttttttttt ttacagattt tgataacata cgtgcttgtt agaagacaaa ttatatgaca60
g61
92
61
DNA
Homo sapiens
92
tttttttttt ttacagattt tgataacata tgtgcttgtt agaagacaaa ttatatgaca60
g61
93
61
DNA
Homo sapiens
93
caagaccgaa aactttgtgg caaagataag cagtgagtga gctcctgaag tctttatctt60
t61
94
61
DNA
Homo sapiens
94
caagaccgaa aactttgtgg caaagataag gagtgagtga gctcctgaag tctttatctt60
t61
95
61
DNA
Homo sapiens
95
acctcttagg taagctttga gtgtctgtca agaaatgtgt ccatttgatt tatcaaattt60
a61
96
61
DNA
Homo sapiens
96
acctcttagg taagctttga gtgtctgtca cgaaatgtgt ccatttgatt tatcaaattt60
a61
97
61
DNA
Homo sapiens
97
aacatacttt taaataactt gtaagtcaaa gaggaaggca taaggaaatt aaaaactatt60
t61
98
61
DNA
Homo sapiens
98
aacatacttt taaataactt gtaagtcaaa taggaaggca taaggaaatt aaaaactatt60
t61
99
61
DNA
Homo sapiens
99
ttaaaaatat tgttgggtgt gaattttgaa aagggaagag ttttatgaaa tgcttctaat60
g61
100
61
DNA
Homo sapiens
100
ttaaaaatat tgttgggtgt gaattttgaa gagggaagag ttttatgaaa tgcttctaat60
g61
101
61
DNA
Homo sapiens
101
tagaaataat gtaaatcgat actgctctga cgtttttctt tgtatttact gatcagatat60
c61
102
61
DNA
Homo sapiens
102
tagaaataat gtaaatcgat actgctctga tgtttttctt tgtatttact gatcagatat60
c61
103
61
DNA
Homo sapiens
103
gtcaatagag gtcagaactt caaggacata agttgggaat gctacagccg agaaaggcag60
t61
104
61
DNA
Homo sapiens
104
gtcaatagag gtcagaactt caaggacata ggttgggaat gctacagccg agaaaggcag60
t61
105
61
DNA
Homo sapiens
105
tatttatgaa gtcaactata ttctagtaga acgatgctta atgaattatt acacatccag60
a61
106
61
DNA
Homo sapiens
106
tatttatgaa gtcaactata ttctagtaga ccgatgctta atgaattatt acacatccag60
a61
107
61
DNA
Homo sapiens
107
cacatttttt cttagatgaa tttttatgta aatcaaggca taatcaaaat aaatttttgt60
c61
108
61
DNA
Homo sapiens
108
cacatttttt cttagatgaa tttttatgta gatcaaggca taatcaaaat aaatttttgt60
c61
109
61
DNA
Homo sapiens
109
aactcctttt gaagagtctc tgagctaaca agtcaacatc agcataaagt aatgcagcct60
g61
110
61
DNA
Homo sapiens
110
aactcctttt gaagagtctc tgagctaaca cgtcaacatc agcataaagt aatgcagcct60
g61
111
61
DNA
Homo sapiens
111
agagatgcta taaattgtac ttggtttcaa cgtagggtga tcaccttttc tttcatgact60
a61
112
61
DNA
Homo sapiens
112
agagatgcta taaattgtac ttggtttcaa tgtagggtga tcaccttttc tttcatgact60
a61
113
61
DNA
Homo sapiens
113
ttacatctat ccaggggcaa tttctgatga ctatttttat taatgatcta ataaaatgtc60
t61
114
61
DNA
Homo sapiens
114
ttacatctat ccaggggcaa tttctgatga gtatttttat taatgatcta ataaaatgtc60
t61
115
61
DNA
Homo sapiens
115
cgcagaccaa cacctggaat cctgtagcaa atgccttcat aagaactgaa aaggactctt60
a61
116
61
DNA
Homo sapiens
116
cgcagaccaa cacctggaat cctgtagcaa ctgccttcat aagaactgaa aaggactctt60
a61
117
61
DNA
Homo sapiens
117
tcagggcaaa tgacctcact ccatgatgga cgctttgagg aagggaataa atgaataaat60
a61
118
61
DNA
Homo sapiens
118
tcagggcaaa tgacctcact ccatgatgga tgctttgagg aagggaataa atgaataaat60
a61
119
61
DNA
Homo sapiens
119
gctgtgcggt ttgaaatatg aactctgtaa cctcttcagt ggctcccaca tcccagggct60
g61
120
61
DNA
Homo sapiens
120
gctgtgcggt ttgaaatatg aactctgtaa tctcttcagt ggctcccaca tcccagggct60
g61
121
61
DNA
Homo sapiens
121
tccctgaggg cctcacttgc tccatgagac aaactcacta cagcgttcat cttgtttaaa60
a61
122
61
DNA
Homo sapiens
122
tccctgaggg cctcacttgc tccatgagac gaactcacta cagcgttcat cttgtttaaa60
a61
123
61
DNA
Homo sapiens
123
tcatgttact tactgagttc taatttctac agtaccacta aaaactctgg agtgaccgtc60
t61
124
61
DNA
Homo sapiens
124
tcatgttact tactgagttc taatttctac ggtaccacta aaaactctgg agtgaccgtc60
t61
125
61
DNA
Homo sapiens
125
atcaatccac tcaaaaattg ccccatataa agttgaaatt taatgttgca tgtaaatgat60
c61
126
61
DNA
Homo sapiens
126
atcaatccac tcaaaaattg ccccatataa ggttgaaatt taatgttgca tgtaaatgat60
c61
127
61
DNA
Homo sapiens
127
tggctggaag actcccagcc tgagtcattc agaaacagat ttacaaagca ctcgggagga60
t61
128
61
DNA
Homo sapiens
128
tggctggaag actcccagcc tgagtcattc ggaaacagat ttacaaagca ctcgggagga60
t61
129
61
DNA
Homo sapiens
129
gaggatcccg agggaatgat caggccgaga cggaggaaga gccttcatga ccaagtgggt60
c61
130
61
DNA
Homo sapiens
130
gaggatcccg agggaatgat caggccgaga tggaggaaga gccttcatga ccaagtgggt60
c61
131
61
DNA
Homo sapiens
131
ccacaaaggc ttccttcacg tgtctggtca cgaatgctgc ctgccaacag gggaaccttg60
g61
132
61
DNA
Homo sapiens
132
ccacaaaggc ttccttcacg tgtctggtca tgaatgctgc ctgccaacag gggaaccttg60
g61
133
61
DNA
Homo sapiens
133
taaacaggaa ttgtaaatac ttgtgtgtta cgaaattatt tgagcagaat tccttctcat60
a61
134
61
DNA
Homo sapiens
134
taaacaggaa ttgtaaatac ttgtgtgtta tgaaattatt tgagcagaat tccttctcat60
a61
135
61
DNA
Homo sapiens
135
gaaaagccaa cagtggcaca aaggccacta cctaaaaacg tcattttagt ttagtaataa60
a61
136
61
DNA
Homo sapiens
136
gaaaagccaa cagtggcaca aaggccacta tctaaaaacg tcattttagt ttagtaataa60
a61
137
61
DNA
Homo sapiens
137
ctgggttcaa gttaataatc cctgttagac cgaatgtacc tccccagaag ggcctacctc60
a61
138
61
DNA
Homo sapiens
138
ctgggttcaa gttaataatc cctgttagac ggaatgtacc tccccagaag ggcctacctc60
a61
139
61
DNA
Homo sapiens
139
ctattagcta ttcactgtat ctgtaatata cgctgtctaa tgtatctgta agggttaaat60
c61
140
61
DNA
Homo sapiens
140
ctattagcta ttcactgtat ctgtaatata tgctgtctaa tgtatctgta agggttaaat60
c61
141
61
DNA
Homo sapiens
141
taaaattaag atttcacgtt tcatgtattc cccgagaaaa ttaagctgag tgatggaata60
c61
142
61
DNA
Homo sapiens
142
taaaattaag atttcacgtt tcatgtattc tccgagaaaa ttaagctgag tgatggaata60
c61
143
61
DNA
Homo sapiens
143
agaagctccc gcatttctca ccttttacaa ctataatgac agaactagac gctgtcctct60
a61
144
61
DNA
Homo sapiens
144
agaagctccc gcatttctca ccttttacaa gtataatgac agaactagac gctgtcctct60
a61
145
61
DNA
Homo sapiens
145
accttaatca gaaatttcca gtttccaaaa attgtattat actcaggttg gccctaggtt60
t61
146
61
DNA
Homo sapiens
146
accttaatca gaaatttcca gtttccaaaa gttgtattat actcaggttg gccctaggtt60
t61
147
61
DNA
Homo sapiens
147
accaaagtgg gtaggatttg ttttcagtgg ccacatatca agcccatttt taaattattg60
a61
148
61
DNA
Homo sapiens
148
accaaagtgg gtaggatttg ttttcagtgg gcacatatca agcccatttt taaattattg60
a61
149
61
DNA
Homo sapiens
149
ctagctaaag gactaagaac ggggcagcct aacaaaatga aggcttttag acaataacca60
c61
150
61
DNA
Homo sapiens
150
ctagctaaag gactaagaac ggggcagcct cacaaaatga aggcttttag acaataacca60
c61
151
61
DNA
Homo sapiens
151
cccttctctg taataacact acgctaggtc acgatagatc tttagggggt gtatatttgg60
a61
152
61
DNA
Homo sapiens
152
cccttctctg taataacact acgctaggtc gcgatagatc tttagggggt gtatatttgg60
a61
153
61
DNA
Homo sapiens
153
ggaactagag tttctgagag caaggtgaga agattatgca tgaagacact gggctgtcat60
c61
154
61
DNA
Homo sapiens
154
ggaactagag tttctgagag caaggtgaga ggattatgca tgaagacact gggctgtcat60
c61
155
61
DNA
Homo sapiens
155
ttagaaaata actgagaagt aaagtgtaga cgaaggaaag tgtatattgg taaaagcata60
t61
156
61
DNA
Homo sapiens
156
ttagaaaata actgagaagt aaagtgtaga tgaaggaaag tgtatattgg taaaagcata60
t61
157
61
DNA
Homo sapiens
157
tgctattacc ctcctcggtt ggctccagca ataagcctaa tgacctctac aaagctgttc60
t61
158
61
DNA
Homo sapiens
158
tgctattacc ctcctcggtt ggctccagca gtaagcctaa tgacctctac aaagctgttc60
t61
159
61
DNA
Homo sapiens
159
attctcgttt gaggaagatt ttctaagtca ctaacctgta atcttcctat tacaaccaat60
t61
160
61
DNA
Homo sapiens
160
attctcgttt gaggaagatt ttctaagtca ttaacctgta atcttcctat tacaaccaat60
t61
161
61
DNA
Homo sapiens
161
ttctgtttaa caattaatat tttatctgag actattgtgc actgtaattt ttatgaactt60
a61
162
61
DNA
Homo sapiens
162
ttctgtttaa caattaatat tttatctgag cctattgtgc actgtaattt ttatgaactt60
a61
163
61
DNA
Homo sapiens
163
ctaagcagga gtctttcagg actgaaaaaa cgttatgagg ctgttggtga aacttgaatg60
g61
164
61
DNA
Homo sapiens
164
ctaagcagga gtctttcagg actgaaaaaa tgttatgagg ctgttggtga aacttgaatg60
g61
165
61
DNA
Homo sapiens
165
taagcctagc tgggggagta gaacacatta caattgaaca caaattataa taatgcaagg60
c61
166
61
DNA
Homo sapiens
166
taagcctagc tgggggagta gaacacatta gaattgaaca caaattataa taatgcaagg60
c61
167
61
DNA
Homo sapiens
167
agttttaggt gacttcctca aattccccaa acctaaattc tatttgctta ttttacttct60
g61
168
61
DNA
Homo sapiens
168
agttttaggt gacttcctca aattccccaa tcctaaattc tatttgctta ttttacttct60
g61
169
61
DNA
Homo sapiens
169
acagtggaga cttcgtgctc agagaagaga agggaagttt tcttggtccg ccctagtgtt60
t61
170
61
DNA
Homo sapiens
170
acagtggaga cttcgtgctc agagaagaga cgggaagttt tcttggtccg ccctagtgtt60
t61
171
61
DNA
Homo sapiens
171
agcaaaggag gtaaatggtg tccttgaaaa cacttgcctg tgagtttctg gatctccatg60
c61
172
61
DNA
Homo sapiens
172
agcaaaggag gtaaatggtg tccttgaaaa tacttgcctg tgagtttctg gatctccatg60
c61
173
61
DNA
Homo sapiens
173
agcagcacag aattgcaggt ggactcttta aagctattct gttctgctaa caaggagcaa60
g61
174
61
DNA
Homo sapiens
174
agcagcacag aattgcaggt ggactcttta cagctattct gttctgctaa caaggagcaa60
g61
175
61
DNA
Homo sapiens
175
gtccctcact ggaacaagat ctgtgagtga cgtaaagctt tctggtaaag gcaaaggaag60
t61
176
61
DNA
Homo sapiens
176
gtccctcact ggaacaagat ctgtgagtga tgtaaagctt tctggtaaag gcaaaggaag60
t61
177
61
DNA
Homo sapiens
177
cacatgtgta gaccctggtc tatgcaagca acatatattt tctcatttat ttcttaccac60
a61
178
61
DNA
Homo sapiens
178
cacatgtgta gaccctggtc tatgcaagca gcatatattt tctcatttat ttcttaccac60
a61
179
61
DNA
Homo sapiens
179
ttggtctatt ttggtgaaaa gcagatatta agcctatttg tccccttcca cagtgtgacc60
t61
180
61
DNA
Homo sapiens
180
ttggtctatt ttggtgaaaa gcagatatta ggcctatttg tccccttcca cagtgtgacc60
t61
181
61
DNA
Homo sapiens
181
ccactgggcc atttctgtgt gtaagttccc cataataaaa ccttgtgcct tgtttgttgg60
c61
182
61
DNA
Homo sapiens
182
ccactgggcc atttctgtgt gtaagttccc tataataaaa ccttgtgcct tgtttgttgg60
c61
183
61
DNA
Homo sapiens
183
tttgatgaca tattctgaga gatgttctga atattaaata cttggttttg aaaacaagtt60
t61
184
61
DNA
Homo sapiens
184
tttgatgaca tattctgaga gatgttctga gtattaaata cttggttttg aaaacaagtt60
t61
185
61
DNA
Homo sapiens
185
tagcaattag gaatgctact agtaatacca atatctgcac tgagtagttt caaagagctg60
a61
186
61
DNA
Homo sapiens
186
tagcaattag gaatgctact agtaatacca gtatctgcac tgagtagttt caaagagctg60
a61
187
61
DNA
Homo sapiens
187
gttatagaag aggtgaaagg tgaatcaata aaatcaataa agagtttata atgtcagtac60
a61
188
61
DNA
Homo sapiens
188
gttatagaag aggtgaaagg tgaatcaata gaatcaataa agagtttata atgtcagtac60
a61
189
61
DNA
Homo sapiens
189
ttccttattc ctcttctaca cagtcttcat gaaatcaatc actggagccc acattgctgc60
c61
190
61
DNA
Homo sapiens
190
ttccttattc ctcttctaca cagtcttcat taaatcaatc actggagccc acattgctgc60
c61
191
61
DNA
Homo sapiens
191
cgttctgatc aagggctgta agtactagaa cggaagaaca gtgtgctgtg ggaagaaatg60
g61
192
61
DNA
Homo sapiens
192
cgttctgatc aagggctgta agtactagaa tggaagaaca gtgtgctgtg ggaagaaatg60
g61
193
61
DNA
Homo sapiens
193
ggaagaattc atcaccagca tacctgtata caaaaaaagt gttgataagt cctttaggca60
a61
194
61
DNA
Homo sapiens
194
ggaagaattc atcaccagca tacctgtata gaaaaaaagt gttgataagt cctttaggca60
a61
195
61
DNA
Homo sapiens
195
tgaaggatct cctgccaggt aaagcaaatg aaacttaaca tatcaacgtt aaagaattga60
c61
196
61
DNA
Homo sapiens
196
tgaaggatct cctgccaggt aaagcaaatg gaacttaaca tatcaacgtt aaagaattga60
c61
197
61
DNA
Homo sapiens
197
ccctagaggg tatcaagggt tgagcaagaa cgtttacttg tgtcaagcca tttatattta60
t61
198
61
DNA
Homo sapiens
198
ccctagaggg tatcaagggt tgagcaagaa tgtttacttg tgtcaagcca tttatattta60
t61
199
61
DNA
Homo sapiens
199
atcatgttaa cacaggaagg aactatatag aagaagcaac tttggaggaa gagatttcat60
c61
200
61
DNA
Homo sapiens
200
atcatgttaa cacaggaagg aactatatag gagaagcaac tttggaggaa gagatttcat60
c61
201
61
DNA
Homo sapiens
201
tgtatttaaa aatggggcta attatgccca aatcatgatg ggatgaagtg ttgtaaggct60
t61
202
61
DNA
Homo sapiens
202
tgtatttaaa aatggggcta attatgccca catcatgatg ggatgaagtg ttgtaaggct60
t61
203
61
DNA
Homo sapiens
203
ttcagtacac aaatattcag cctctcacaa ctgctagata aacgctgtgc tgttaactgg60
g61
204
61
DNA
Homo sapiens
204
ttcagtacac aaatattcag cctctcacaa gtgctagata aacgctgtgc tgttaactgg60
g61
205
61
DNA
Homo sapiens
205
actgttctta actgtactga tagctcttct atagctttgt caaggataag agattcttcc60
c61
206
61
DNA
Homo sapiens
206
actgttctta actgtactga tagctcttct gtagctttgt caaggataag agattcttcc60
c61
207
61
DNA
Homo sapiens
207
caaagacttc tgggcttgag taagctgagt atgttgcaaa gagtacttag tttagaaagt60
a61
208
61
DNA
Homo sapiens
208
caaagacttc tgggcttgag taagctgagt gtgttgcaaa gagtacttag tttagaaagt60
a61
209
61
DNA
Homo sapiens
209
gtgggttcct ggtaaaatgg taggtttagt acttttcctc tctcactctc ttgccctcac60
c61
210
61
DNA
Homo sapiens
210
gtgggttcct ggtaaaatgg taggtttagt tcttttcctc tctcactctc ttgccctcac60
c61
211
61
DNA
Homo sapiens
211
atctaagtaa ggttagaaat gcttcggcct atatgacttt ttaacctggt acacttaaac60
c61
212
61
DNA
Homo sapiens
212
atctaagtaa ggttagaaat gcttcggcct gtatgacttt ttaacctggt acacttaaac60
c61
213
61
DNA
Homo sapiens
213
gatttaaaaa cttatcaagg tcactagtta atcactgctg gagccagaac tggagcccat60
g61
214
61
DNA
Homo sapiens
214
gatttaaaaa cttatcaagg tcactagtta gtcactgctg gagccagaac tggagcccat60
g61
215
61
DNA
Homo sapiens
215
gcaaaaccag taaatctaac tgcaattgtg attgatggca aatctacaga gtgaacaatc60
a61
216
61
DNA
Homo sapiens
216
gcaaaaccag taaatctaac tgcaattgtg gttgatggca aatctacaga gtgaacaatc60
a61
217
61
DNA
Homo sapiens
217
ttcagatggg tagaagctgc tctcagaaag atagatgaca gggctgggca tggtggctca60
c61
218
61
DNA
Homo sapiens
218
ttcagatggg tagaagctgc tctcagaaag gtagatgaca gggctgggca tggtggctca60
c61
219
61
DNA
Homo sapiens
219
gctgtatata atatttgaaa atgacactga acaagcgaag attacagtgg tttttcttct60
t61
220
61
DNA
Homo sapiens
220
gctgtatata atatttgaaa atgacactga gcaagcgaag attacagtgg tttttcttct60
t61
221
61
DNA
Homo sapiens
221
attagccatg aacactaaag aaatagcctg ataacacttt gtggattata aagttagcaa60
g61
222
61
DNA
Homo sapiens
222
attagccatg aacactaaag aaatagcctg gtaacacttt gtggattata aagttagcaa60
g61
223
61
DNA
Homo sapiens
223
tgattcctca taaaaggata agatttagct aggcaaagtt gaggaaagac attccaagag60
a61
224
61
DNA
Homo sapiens
224
tgattcctca taaaaggata agatttagct cggcaaagtt gaggaaagac attccaagag60
a61
225
61
DNA
Homo sapiens
225
acaaataaaa tttcttcttt caatcattcc ataattccct ggggctacag ccactttggt60
a61
226
61
DNA
Homo sapiens
226
acaaataaaa tttcttcttt caatcattcc gtaattccct ggggctacag ccactttggt60
a61
227
61
DNA
Homo sapiens
227
aagttcctat accgtgaagc tggccaaaac agtataatct caatatttac acttaaagtt60
a61
228
61
DNA
Homo sapiens
228
aagttcctat accgtgaagc tggccaaaac ggtataatct caatatttac acttaaagtt60
a61
229
61
DNA
Homo sapiens
229
gccactgcca ccactcctgc agattgttcc agctgtgtta ctaaatacag gttgcttttc60
t61
230
61
DNA
Homo sapiens
230
gccactgcca ccactcctgc agattgttcc cgctgtgtta ctaaatacag gttgcttttc60
t61
231
61
DNA
Homo sapiens
231
acttttctca taataaaacc tttattgctc aaggtgcctc aaattggttt cgcttaactt60
g61
232
61
DNA
Homo sapiens
232
acttttctca taataaaacc tttattgctc caggtgcctc aaattggttt cgcttaactt60
g61
233
61
DNA
Homo sapiens
233
gtgacctgtc cttgtgactt ggaaaaaatg ccatcatgtt ctgtccgatg tgtttccgct60
a61
234
61
DNA
Homo sapiens
234
gtgacctgtc cttgtgactt ggaaaaaatg gcatcatgtt ctgtccgatg tgtttccgct60
a61
235
61
DNA
Homo sapiens
235
cccaaaataa aactctccta ttattgtgac acttggatgg ccccatccaa cagcaaaatc60
a61
236
61
DNA
Homo sapiens
236
cccaaaataa aactctccta ttattgtgac ccttggatgg ccccatccaa cagcaaaatc60
a61
237
61
DNA
Homo sapiens
237
ctgtactttt atatacgcct aatttgttcc atctcaatga caatattccc cacatctaat60
a61
238
61
DNA
Homo sapiens
238
ctgtactttt atatacgcct aatttgttcc gtctcaatga caatattccc cacatctaat60
a61
239
61
DNA
Homo sapiens
239
accccaaaag tggtttataa aacattgact ccacatcact gtagttaacc caaaccaaaa60
g61
240
61
DNA
Homo sapiens
240
accccaaaag tggtttataa aacattgact gcacatcact gtagttaacc caaaccaaaa60
g61
241
61
DNA
Homo sapiens
241
acatcactgt agttaaccca aaccaaaaga ctgtcgcttg acactgagaa aaatcccctc60
a61
242
61
DNA
Homo sapiens
242
acatcactgt agttaaccca aaccaaaaga gtgtcgcttg acactgagaa aaatcccctc60
a61
243
61
DNA
Homo sapiens
243
gcagagggat cagagacagc tcgaggagag agcatattcc atagttcaga gacagcatac60
c61
244
61
DNA
Homo sapiens
244
gcagagggat cagagacagc tcgaggagag ggcatattcc atagttcaga gacagcatac60
c61
245
61
DNA
Homo sapiens
245
tttgcaacca gtgtgcatga aactggagga actcatccta agtgaaatgt caggcataga60
a61
246
61
DNA
Homo sapiens
246
tttgcaacca gtgtgcatga aactggagga cctcatccta agtgaaatgt caggcataga60
a61
247
61
DNA
Homo sapiens
247
tttcaaaatt aattttcaaa tttctactgg acgataacta ataatcattt atttaaaact60
t61
248
61
DNA
Homo sapiens
248
tttcaaaatt aattttcaaa tttctactgg gcgataacta ataatcattt atttaaaact60
t61
249
61
DNA
Homo sapiens
249
gcaatagaga gaaatgagct tctgaaatgc aaaactatgg attaatttca gaaatattat60
a61
250
61
DNA
Homo sapiens
250
gcaatagaga gaaatgagct tctgaaatgc gaaactatgg attaatttca gaaatattat60
a61
251
61
DNA
Homo sapiens
251
tctgctcaac cagttctttt gcttcctctg aattcatcac tgggggcagg aggagtctgc60
a61
252
61
DNA
Homo sapiens
252
tctgctcaac cagttctttt gcttcctctg gattcatcac tgggggcagg aggagtctgc60
a61
253
61
DNA
Homo sapiens
253
ttgactttat atggggatgg aggccgcctc aggtagtctt tgcaggagga ctgtgggttt60
g61
254
61
DNA
Homo sapiens
254
ttgactttat atggggatgg aggccgcctc gggtagtctt tgcaggagga ctgtgggttt60
g61
255
61
DNA
Homo sapiens
255
atagagtagt tatgttttca gcatctccac atgaatgaat agcaatcacc ttgaaaagtg60
a61
256
61
DNA
Homo sapiens
256
atagagtagt tatgttttca gcatctccac gtgaatgaat agcaatcacc ttgaaaagtg60
a61
257
61
DNA
Homo sapiens
257
cctatgcgtg tgcctttctt acctctgaca acatctagtt ccatcttgtt aggaggccta60
a61
258
61
DNA
Homo sapiens
258
cctatgcgtg tgcctttctt acctctgaca gcatctagtt ccatcttgtt aggaggccta60
a61
259
61
DNA
Homo sapiens
259
aacctgttac tctcgggtgc tctgtggtga atcctttagc aaagcaaatc ccctctgcag60
g61
260
61
DNA
Homo sapiens
260
aacctgttac tctcgggtgc tctgtggtga ctcctttagc aaagcaaatc ccctctgcag60
g61
261
61
DNA
Homo sapiens
261
gtttccagaa ctctttttgg ccaggctcca agctaagctc tgtaggaagc ttgatgatgg60
g61
262
61
DNA
Homo sapiens
262
gtttccagaa ctctttttgg ccaggctcca ggctaagctc tgtaggaagc ttgatgatgg60
g61
263
61
DNA
Homo sapiens
263
ggccatggct gagttgactg ggttcagatt ctggttcagc agtgtggtct cgggcaagtt60
g61
264
61
DNA
Homo sapiens
264
ggccatggct gagttgactg ggttcagatt gtggttcagc agtgtggtct cgggcaagtt60
g61
265
61
DNA
Homo sapiens
265
acaagttgca gagaaacctt taataattac accagagctg ggcacagtgg ctcacacctg60
t61
266
61
DNA
Homo sapiens
266
acaagttgca gagaaacctt taataattac gccagagctg ggcacagtgg ctcacacctg60
t61
267
61
DNA
Homo sapiens
267
caacattatc tttctgaggg atacaactca accctgaaca cctgcttaca caggaaacgc60
a61
268
61
DNA
Homo sapiens
268
caacattatc tttctgaggg atacaactca cccctgaaca cctgcttaca caggaaacgc60
a61
269
61
DNA
Homo sapiens
269
ataaccacag atgttctatt tcaagcaatt aaaggcatta atctcatact aagtggatcg60
c61
270
61
DNA
Homo sapiens
270
ataaccacag atgttctatt tcaagcaatt caaggcatta atctcatact aagtggatcg60
c61
271
61
DNA
Homo sapiens
271
ttttcataag acattatact ctagccatga attggttttg actacttgca atcccctaaa60
c61
272
61
DNA
Homo sapiens
272
ttttcataag acattatact ctagccatga gttggttttg actacttgca atcccctaaa60
c61
273
61
DNA
Homo sapiens
273
atgggggcag ctgatgaccc tttgctcctc aggatcttgt gccctgttct tcatgcctac60
g61
274
61
DNA
Homo sapiens
274
atgggggcag ctgatgaccc tttgctcctc gggatcttgt gccctgttct tcatgcctac60
g61
275
61
DNA
Homo sapiens
275
cagttacatg ttggatcaca gtgaggttgt agcaacgaaa cccccagctc ttctcccctc60
t61
276
61
DNA
Homo sapiens
276
cagttacatg ttggatcaca gtgaggttgt ggcaacgaaa cccccagctc ttctcccctc60
t61
277
61
DNA
Homo sapiens
277
agagctatgt tggggaagat ggtgaagcca agtctaaatt cagcaaataa ataaataaat60
a61
278
61
DNA
Homo sapiens
278
agagctatgt tggggaagat ggtgaagcca cgtctaaatt cagcaaataa ataaataaat60
a61
279
61
DNA
Homo sapiens
279
ccggagtatc ccgctttctt tggaggaaac aaccgcatca gatctgcgct gcggcagagg60
c61
280
61
DNA
Homo sapiens
280
ccggagtatc ccgctttctt tggaggaaac caccgcatca gatctgcgct gcggcagagg60
c61
281
61
DNA
Homo sapiens
281
ttggcttcca actggcctct aaactctaat ctagcatttt ccagtccatt gtgacaaagt60
c61
282
61
DNA
Homo sapiens
282
ttggcttcca actggcctct aaactctaat gtagcatttt ccagtccatt gtgacaaagt60
c61
283
61
DNA
Homo sapiens
283
tttagtcatg ggcaattagt aagcattaac actcctggtg atttacactg tatttcttag60
a61
284
61
DNA
Homo sapiens
284
tttagtcatg ggcaattagt aagcattaac cctcctggtg atttacactg tatttcttag60
a61
285
61
DNA
Homo sapiens
285
gttctccatg gtactaaccc attctcttca ataaaagcat agtcagcctg acctatggaa60
g61
286
61
DNA
Homo sapiens
286
gttctccatg gtactaaccc attctcttca gtaaaagcat agtcagcctg acctatggaa60
g61
287
61
DNA
Homo sapiens
287
catatacttg ttctcaaacc attcactagc aagaaaaagt ggcctagagc aggggtcagc60
a61
288
61
DNA
Homo sapiens
288
catatacttg ttctcaaacc attcactagc cagaaaaagt ggcctagagc aggggtcagc60
a61
289
61
DNA
Homo sapiens
289
atctggtaaa aattttcata agcattagac atatcaaact taaaaacaca cacacacaat60
t61
290
61
DNA
Homo sapiens
290
atctggtaaa aattttcata agcattagac gtatcaaact taaaaacaca cacacacaat60
t61
291
61
DNA
Homo sapiens
291
taagagagcc tctaggttag cgccgctgaa cgagctagtg gaggaggagt gtgagactga60
g61
292
61
DNA
Homo sapiens
292
taagagagcc tctaggttag cgccgctgaa ggagctagtg gaggaggagt gtgagactga60
g61
293
61
DNA
Homo sapiens
293
tgtcctatgc cctctcgttg aatgctcaca atgacccaat gggatgaccc tgtcaccatc60
g61
294
61
DNA
Homo sapiens
294
tgtcctatgc cctctcgttg aatgctcaca gtgacccaat gggatgaccc tgtcaccatc60
g61
295
61
DNA
Homo sapiens
295
gtagggcatt tgatttaatc accaagagcc atgtaaacct catgcaaaca ttaagctatt60
a61
296
61
DNA
Homo sapiens
296
gtagggcatt tgatttaatc accaagagcc gtgtaaacct catgcaaaca ttaagctatt60
a61
297
61
DNA
Homo sapiens
297
acctctatga ctttacattg caggcagggt aaaatccaaa catgactaat aggcggagaa60
g61
298
61
DNA
Homo sapiens
298
acctctatga ctttacattg caggcagggt gaaatccaaa catgactaat aggcggagaa60
g61
299
61
DNA
Homo sapiens
299
aaaaaaccac attcctcgct atcttcatca attttgtgta aggatcagga agctgttaca60
c61
300
61
DNA
Homo sapiens
300
aaaaaaccac attcctcgct atcttcatca gttttgtgta aggatcagga agctgttaca60
c61
301
61
DNA
Homo sapiens
301
ttccccttat cagactggca aatagccaaa aagtggatag caaaccactc tcatacattg60
c61
302
61
DNA
Homo sapiens
302
ttccccttat cagactggca aatagccaaa tagtggatag caaaccactc tcatacattg60
c61
303
61
DNA
Homo sapiens
303
ctcatgacat gcttcagatt ggtcaaagaa agagatttta tcaagtgttc ccttctcaag60
a61
304
61
DNA
Homo sapiens
304
ctcatgacat gcttcagatt ggtcaaagaa cgagatttta tcaagtgttc ccttctcaag60
a61
305
61
DNA
Homo sapiens
305
ttcctggcaa ttaagtcaaa ccttaagcta ctctcatagt tcagtgctct cagttccaaa60
a61
306
61
DNA
Homo sapiens
306
ttcctggcaa ttaagtcaaa ccttaagcta gtctcatagt tcagtgctct cagttccaaa60
a61
307
61
DNA
Homo sapiens
307
gatgttgctg tatcgctcag atctaatgtt atgtggccca ttttaccatg gtatcactga60
a61
308
61
DNA
Homo sapiens
308
gatgttgctg tatcgctcag atctaatgtt ctgtggccca ttttaccatg gtatcactga60
a61
309
61
DNA
Homo sapiens
309
gtttaaatgt aaaaatttaa attatgagaa acagttgaca tttcaggttt atattcttaa60
c61
310
61
DNA
Homo sapiens
310
gtttaaatgt aaaaatttaa attatgagaa gcagttgaca tttcaggttt atattcttaa60
c61
311
61
DNA
Homo sapiens
311
aatatcttat gactactact cttacaaaat cccactctat accccctgcc tcctggaata60
g61
312
61
DNA
Homo sapiens
312
aatatcttat gactactact cttacaaaat gccactctat accccctgcc tcctggaata60
g61
313
61
DNA
Homo sapiens
313
atagagcata agaatctata gcataaaaga aaatgatgtg aattaacact gcagcatcgc60
t61
314
61
DNA
Homo sapiens
314
atagagcata agaatctata gcataaaaga caatgatgtg aattaacact gcagcatcgc60
t61
315
61
DNA
Homo sapiens
315
tctaaagtga aagtaaaata gctgagatat aggtgaaaag agagacagat acaagtgtgt60
g61
316
61
DNA
Homo sapiens
316
tctaaagtga aagtaaaata gctgagatat gggtgaaaag agagacagat acaagtgtgt60
g61
317
61
DNA
Homo sapi ens
317
acagttctga actccttccc tgtggtatct atcatgtact tggactggtg cagggtgctg60
a61
318
61
DNA
Homo sapiens
318
acagttctga actccttccc tgtggtatct gtcatgtact tggactggtg cagggtgctg60
a61
319
61
DNA
Homo sapiens
319
tgtgctgggc acacagtggg tgcctaatgt atggagaata gagaaagagg atgatggaga60
a61
320
61
DNA
Homo sapiens
320
tgtgctgggc acacagtggg tgcctaatgt ctggagaata gagaaagagg atgatggaga60
a61
321
61
DNA
Homo sapiens
321
ctccatatcc cctccatccc atgctacccc aatttcagct gctttaagga aaaagatgtt60
t61
322
61
DNA
Homo sapiens
322
ctccatatcc cctccatccc atgctacccc gatttcagct gctttaagga aaaagatgtt60
t61
323
61
DNA
Homo sapiens
323
aagtttgtaa acattaacca acttctcctc atctgtcctt ctcatactca ggttcccttc60
c61
324
61
DNA
Homo sapiens
324
aagtttgtaa acattaacca acttctcctc gtctgtcctt ctcatactca ggttcccttc60
c61
325
61
DNA
Homo sapiens
325
agtcctcatt ttaaatttag tagaatagtt aacagctcaa ggtctagatt cagagatatt60
t61
326
61
DNA
Homo sapiens
326
agtcctcatt ttaaatttag tagaatagtt tacagctcaa ggtctagatt cagagatatt60
t61
327
61
DNA
Homo sapiens
327
gaaggaacaa aatgctgcta agtagcaaaa agtcctcatt ttaaatttag tagaatagtt60
t61
328
61
DNA
Homo sapiens
328
gaaggaacaa aatgctgcta agtagcaaaa ggtcctcatt ttaaatttag tagaatagtt60
t61
329
61
DNA
Homo sapiens
329
cttgatttta ttgctaggga ttgtggtaaa acacccaaag aatgtgggta tgtgcctact60
t61
330
61
DNA
Homo sapiens
330
cttgatttta ttgctaggga ttgtggtaaa gcacccaaag aatgtgggta tgtgcctact60
t61
331
61
DNA
Homo sapiens
331
agtgctttga aatcaagcag aacactcatc acttaaatca aaccagactt tggatttcag60
a61
332
61
DNA
Homo sapiens
332
agtgctttga aatcaagcag aacactcatc gcttaaatca aaccagactt tggatttcag60
a61
333
61
DNA
Homo sapiens
333
aagtgttaga catcaaactg atgcttgaaa atgaaaatgt aaagtggtaa aaacttgaat60
c61
334
61
DNA
Homo sapiens
334
aagtgttaga catcaaactg atgcttgaaa gtgaaaatgt aaagtggtaa aaacttgaat60
c61
335
61
DNA
Homo sapiens
335
tagggagcaa caccatggtg gtagagaacc aaagtttatt agcatctcta aactcatata60
g61
336
61
DNA
Homo sapiens
336
tagggagcaa caccatggtg gtagagaacc gaagtttatt agcatctcta aactcatata60
g61
337
61
DNA
Homo sapiens
337
aatcacaggc tagactatta gtgaaggtct attcctacaa tgaacacctg taaaggccaa60
a61
338
61
DNA
Homo sapiens
338
aatcacaggc tagactatta gtgaaggtct gttcctacaa tgaacacctg taaaggccaa60
a61
339
61
DNA
Homo sapiens
339
tacgcaccag gcagtgaggg aaaaggagca actgaacctc tccccacaca gcaagtgagc60
c61
340
61
DNA
Homo sapiens
340
tacgcaccag gcagtgaggg aaaaggagca gctgaacctc tccccacaca gcaagtgagc60
c61
341
61
DNA
Homo sapiens
341
ctggcaccat gtctgctcca ttcaccatca atgcacatca gagtgacata acctgtgtgt60
c61
342
61
DNA
Homo sapiens
342
ctggcaccat gtctgctcca ttcaccatca gtgcacatca gagtgacata acctgtgtgt60
c61
343
61
DNA
Homo sapiens
343
caatgtgagc tgcacattgt aaacaccagc attattagat gtctgtatcg tttttagcct60
a61
344
61
DNA
Homo sapiens
344
caatgtgagc tgcacattgt aaacaccagc gttattagat gtctgtatcg tttttagcct60
a61
345
61
DNA
Homo sapiens
345
aagagatagg aaaagacaca gagacacaga cgggaatgcc gggtgaagac agaggaaaat60
a61
346
61
DNA
Homo sapiens
346
aagagatagg aaaagacaca gagacacaga ggggaatgcc gggtgaagac agaggaaaat60
a61
347
61
DNA
Homo sapiens
347
aactgttttc caaagaggct gtaacatttt atatacccat gagtgattca ttttctttgc60
a61
348
61
DNA
Homo sapiens
348
aactgttttc caaagaggct gtaacatttt gtatacccat gagtgattca ttttctttgc60
a61
349
61
DNA
Homo sapiens
349
ccaatcatac accaagaaca tggtcttaca aagtgagggt gtggcaggct tcaccatggt60
t61
350
61
DNA
Homo sapiens
350
ccaatcatac accaagaaca tggtcttaca cagtgagggt gtggcaggct tcaccatggt60
t61
351
61
DNA
Homo sapiens
351
tggggcctga tgagttgtga ttggcctctg attagagcac agcatagccg aagaagagag60
t61
352
61
DNA
Homo sapiens
352
tggggcctga tgagttgtga ttggcctctg gttagagcac agcatagccg aagaagagag60
t61
353
61
DNA
Homo sapiens
353
ctgtgaaagc agaggctcga gggaccattc acttttgttt tcttataaat ggtaaaacaa60
g61
354
61
DNA
Homo sapiens
354
ctgtgaaagc agaggctcga gggaccattc gcttttgttt tcttataaat ggtaaaacaa60
g61
355
61
DNA
Homo sapiens
355
agaatcattc tttctccttc ctactccttc atatctgctc agtacaacat cagacaagca60
t61
356
61
DNA
Homo sapiens
356
agaatcattc tttctccttc ctactccttc gtatctgctc agtacaacat cagacaagca60
t61
357
61
DNA
Homo sapiens
357
caaaatgctg ataatgatat ggacaataaa attcaggata agacgttctc aggtggagat60
g61
358
61
DNA
Homo sapiens
358
caaaatgctg ataatgatat ggacaataaa cttcaggata agacgttctc aggtggagat60
g61
359
61
DNA
Homo sapiens
359
attaaaagta tttgcaagga gctggttaca attctggccc atgcattcta tagttctgtg60
t61
360
61
DNA
Homo sapiens
360
attaaaagta tttgcaagga gctggttaca gttctggccc atgcattcta tagttctgtg60
t61
361
61
DNA
Homo sapiens
361
taaaggcagt gtctttgtgc acatcagttc atgcaatgca gaggaacttt attacaagaa60
a61
362
61
DNA
Homo sapiens
362
taaaggcagt gtctttgtgc acatcagttc gtgcaatgca gaggaacttt attacaagaa60
a61
363
61
DNA
Homo sapiens
363
aaagctgacc tgtgagggct tctttagggt cctctctgat ttgtatccca tctcacctcc60
c61
364
61
DNA
Homo sapiens
364
aaagctgacc tgtgagggct tctttagggt gctctctgat ttgtatccca tctcacctcc60
c61
365
61
DNA
Homo sapiens
365
tggcagacat cagttccttg aagctgaagg actgaggctc tcaactccta caaaccacct60
a61
366
61
DNA
Homo sapiens
366
tggcagacat cagttccttg aagctgaagg gctgaggctc tcaactccta caaaccacct60
a61
367
61
DNA
Homo sapiens
367
cccttgtatt acacatgaat tattatttgg aaaaactgaa aggctaaaat atcttcagaa60
t61
368
61
DNA
Homo sapiens
368
cccttgtatt acacatgaat tattatttgg gaaaactgaa aggctaaaat atcttcagaa60
t61
369
61
DNA
Homo sapiens
369
tactttttta attagaataa tactgccagc ataggtaagt gggtaaagaa acattacttt60
c61
370
61
DNA
Homo sapiens
370
tactttttta attagaataa tactgccagc gtaggtaagt gggtaaagaa acattacttt60
c61
371
61
DNA
Homo sapiens
371
attggaatta taacaagcaa gacccctggc atacctcaga aactaatctc tgcaggaatt60
a61
372
61
DNA
Homo sapiens
372
attggaatta taacaagcaa gacccctggc gtacctcaga aactaatctc tgcaggaatt60
a61
373
61
DNA
Homo sapiens
373
gatggcaaaa taacagcaaa ttaacctgaa atgactacat agctttcctc attttaaatt60
g61
374
61
DNA
Homo sapiens
374
gatggcaaaa taacagcaaa ttaacctgaa ttgactacat agctttcctc attttaaatt60
g61
375
61
DNA
Homo sapiens
375
gggccttggt ttccaaagct ttcttacatc aaccatctca ttaaaacctc actgcagcct60
g61
376
61
DNA
Homo sapiens
376
gggccttggt ttccaaagct ttcttacatc caccatctca ttaaaacctc actgcagcct60
g61
377
61
DNA
Homo sapiens
377
tgtctaaaaa gggtccctgt tttgccttcc attttttcac agagattttg gctgggtaaa60
g61
378
61
DNA
Homo sapiens
378
tgtctaaaaa gggtccctgt tttgccttcc gttttttcac agagattttg gctgggtaaa60
g61
379
61
DNA
Homo sapiens
379
tatacactga attttgaaga tgtggtttca aaaagtaaag aatatgaaat atctaatgaa60
t61
380
61
DNA
Homo sapiens
380
tatacactga attttgaaga tgtggtttca gaaagtaaag aatatgaaat atctaatgaa60
t61
381
61
DNA
Homo sapiens
381
atatttctct gaactgcctg cagcttttac aacatccttc cttcctttta tgcagtggta60
a61
382
61
DNA
Homo sapiens
382
atatttctct gaactgcctg cagcttttac gacatccttc cttcctttta tgcagtggta60
a61
383
61
DNA
Homo sapiens
383
acccgtcgac atggtctccc tggtgatctc atttacactg acggttttat cgaccacctt60
t61
384
61
DNA
Homo sapiens
384
acccgtcgac atggtctccc tggtgatctc gtttacactg acggttttat cgaccacctt60
t61
385
61
DNA
Homo sapiens
385
tcccagcttc ccccttcaag gtatatgtcc atgcactaga atatccatca caacactccc60
c61
386
61
DNA
Homo sapiens
386
tcccagcttc ccccttcaag gtatatgtcc gtgcactaga atatccatca caacactccc60
c61
387
61
DNA
Homo sapiens
387
agaagggaag tataatttca gaggcctggc aataaagcac tggagaaagg atatttggaa60
a61
388
61
DNA
Homo sapiens
388
agaagggaag tataatttca gaggcctggc cataaagcac tggagaaagg atatttggaa60
a61
389
61
DNA
Homo sapiens
389
aggccactca aagtgcaatc aggaagcata atagatcatc caagttaaag gctttggggc60
a61
390
61
DNA
Homo sapiens
390
aggccactca aagtgcaatc aggaagcata ctagatcatc caagttaaag gctttggggc60
a61
391
61
DNA
Homo sapiens
391
aatacttgag agttttctaa tctgtcattt atggttgact ttgatgcctt ttgcaaggag60
g61
392
61
DNA
Homo sapiens
392
aatacttgag agttttctaa tctgtcattt ctggttgact ttgatgcctt ttgcaaggag60
g61
393
61
DNA
Homo sapiens
393
gaacctagaa actgtggctt acaggatgca acctatttga tggaactcat agtcacttct60
a61
394
61
DNA
Homo sapiens
394
gaacctagaa actgtggctt acaggatgca gcctatttga tggaactcat agtcacttct60
a61
395
61
DNA
Homo sapiens
395
ttcagcacgt tttcttgtga tttgctgatt acccttaaaa gtctagtagc ataagttttc60
t61
396
61
DNA
Homo sapiens
396
ttcagcacgt tttcttgtga tttgctgatt tcccttaaaa gtctagtagc ataagttttc60
t61
397
61
DNA
Homo sapiens
397
agtgagacag tatattttca ggaaacgtac acaggtccct cacatgaaaa taccggagag60
c61
398
61
DNA
Homo sapiens
398
agtgagacag tatattttca ggaaacgtac gcaggtccct cacatgaaaa taccggagag60
c61
399
61
DNA
Homo sapiens
399
acttctatta cattcacagc taaatatggc agctttggtt tggaatagac tgtaaaaacc60
t61
400
61
DNA
Homo sapiens
400
acttctatta cattcacagc taaatatggc ggctttggtt tggaatagac tgtaaaaacc60
t61
401
61
DNA
Homo sapiens
401
atgctctcgc cccgcatctg tgcactgact cggtcctctg catggatgct ctttccttgg60
a61
402
61
DNA
Homo sapiens
402
atgctctcgc cccgcatctg tgcactgact gggtcctctg catggatgct ctttccttgg60
a61
403
61
DNA
Homo sapiens
403
gctaaaatca atagccattg aagctccact aatgtgttca gttcgctttg aacaatgcaa60
a61
404
61
DNA
Homo sapiens
404
gctaaaatca atagccattg aagctccact gatgtgttca gttcgctttg aacaatgcaa60
a61
405
61
DNA
Homo sapiens
405
gagtgggcag ttggaaacag ctatgaaacc agcatttagt gatggggcag tagggctggg60
g61
406
61
DNA
Homo sapiens
406
gagtgggcag ttggaaacag ctatgaaacc ggcatttagt gatggggcag tagggctggg60
g61
407
61
DNA
Homo sapiens
407
ggtgccactg gattgcttaa gatcttcctg agagggaatt tgaacaatac ttagagggct60
a61
408
61
DNA
Homo sapiens
408
ggtgccactg gattgcttaa gatcttcctg ggagggaatt tgaacaatac ttagagggct60
a61
409
61
DNA
Homo sapiens
409
atgtttttgt aaaagaaact ttcagtattc agagtagttt gtctttcaca gtgcttccat60
a61
410
61
DNA
Homo sapiens
410
atgtttttgt aaaagaaact ttcagtattc ggagtagttt gtctttcaca gtgcttccat60
a61
411
61
DNA
Homo sapiens
411
ttggttgtgt gaatttagtg cttgtgaggc agtttctttc taggtgctct gcctgtagct60
a61
412
61
DNA
Homo sapiens
412
ttggttgtgt gaatttagtg cttgtgaggc ggtttctttc taggtgctct gcctgtagct60
a61
413
61
DNA
Homo sapiens
413
aaagacagag tgctgtttga acctagagaa agcaagacca ggcagcttgg gcaggaagtc60
c61
414
61
DNA
Homo sapiens
414
aaagacagag tgctgtttga acctagagaa ggcaagacca ggcagcttgg gcaggaagtc60
c61
415
61
DNA
Homo sapiens
415
attttataga tatatgaact gaggatcgga aaggcaaagg gactatctta aggtattgct60
g61
416
61
DNA
Homo sapiens
416
attttataga tatatgaact gaggatcgga gaggcaaagg gactatctta aggtattgct60
g61
417
61
DNA
Homo sapiens
417
tgtgaatggc tgcttggaac acagtgttga aaaggattcc gaggctgtgt ccaggttcag60
t61
418
61
DNA
Homo sapiens
418
tgtgaatggc tgcttggaac acagtgttga gaaggattcc gaggctgtgt ccaggttcag60
t61
419
61
DNA
Homo sapiens
419
atgtctcctc cccaggtcat cagaataatc aatacttgtc tccaacactg tagaaattgt60
g61
420
61
DNA
Homo sapiens
420
atgtctcctc cccaggtcat cagaataatc gatacttgtc tccaacactg tagaaattgt60
g61
421
61
DNA
Homo sapiens
421
tcaatcttat cccacactct ggtcatacaa cgtttctaag actgctgctt tttctaaatc60
c61
422
61
DNA
Homo sapiens
422
tcaatcttat cccacactct ggtcatacaa ggtttctaag actgctgctt tttctaaatc60
c61
423
61
DNA
Homo sapiens
423
agagacttgg taaacaaacc aactaggccc aaccacaaca tgttgaggct gactttctaa60
c61
424
61
DNA
Homo sapiens
424
agagacttgg taaacaaacc aactaggccc gaccacaaca tgttgaggct gactttctaa60
c61
425
61
DNA
Homo sapiens
425
ctccgccccc tggcacttgg cacccattca atcatacatg tctcagactc ctctgcagcc60
a61
426
61
DNA
Homo sapiens
426
ctccgccccc tggcacttgg cacccattca gtcatacatg tctcagactc ctctgcagcc60
a61
427
61
DNA
Homo sapiens
427
gcagatggaa gatgccgggc ttttcatttc aaggactgag taggaaggtt aatgatggaa60
g61
428
61
DNA
Homo sapiens
428
gcagatggaa gatgccgggc ttttcatttc gaggactgag taggaaggtt aatgatggaa60
g61
429
61
DNA
Homo sapiens
429
tgtgcatcct aaaagcagtg acaggttaga cagaactgtg ctagaattct agctgtatta60
c61
430
61
DNA
Homo sapiens
430
tgtgcatcct aaaagcagtg acaggttaga gagaactgtg ctagaattct agctgtatta60
c61
431
61
DNA
Homo sapiens
431
gacctcagta aatatgttga tggtccagac aaaaatgtgt agataatatc cattcgtgat60
t61
432
61
DNA
Homo sapiens
432
gacctcagta aatatgttga tggtccagac gaaaatgtgt agataatatc cattcgtgat60
t61
433
61
DNA
Homo sapiens
433
agtgggaccc tgtgaggcaa acatcaccac aaggctggga acagcaggac tcaggcactg60
c61
434
61
DNA
Homo sapiens
434
agtgggaccc tgtgaggcaa acatcaccac gaggctggga acagcaggac tcaggcactg60
c61
435
61
DNA
Homo sapiens
435
acttttgggt tgtagctgcc tatagctgcc aagtagcccc agggagtagt ggaagggcag60
a61
436
61
DNA
Homo sapiens
436
acttttgggt tgtagctgcc tatagctgcc gagtagcccc agggagtagt ggaagggcag60
a61
437
61
DNA
Homo sapiens
437
taccttctgt taaaacttct ttgtctggct aaacccaaaa actttagggg agattgaagt60
a61
438
61
DNA
Homo sapiens
438
taccttctgt taaaacttct ttgtctggct gaacccaaaa actttagggg agattgaagt60
a61
439
61
DNA
Homo sapiens
439
aagacttttt tttttttttt ggtagaatca acaacttaga tagattgctt actttttcag60
g61
440
61
DNA
Homo sapiens
440
aagacttttt tttttttttt ggtagaatca ccaacttaga tagattgctt actttttcag60
g61
441
61
DNA
Homo sapiens
441
ggtcagcagg cagagattct gtgacggact aaagctctca agaaaacatc ttaaaacatg60
t61
442
61
DNA
Homo sapiens
442
ggtcagcagg cagagattct gtgacggact gaagctctca agaaaacatc ttaaaacatg60
t61
443
61
DNA
Homo sapiens
443
caatttgacc ttcttcacag ggctgcttgg aaacctatag agtgatatgg atataactgt60
g61
444
61
DNA
Homo sapiens
444
caatttgacc ttcttcacag ggctgcttgg gaacctatag agtgatatgg atataactgt60
g61
445
61
DNA
Homo sapiens
445
atgggctagg ccacaagctc ttctcagctc aatctcacaa ttggcagatt aaccaagacc60
c61
446
61
DNA
Homo sapiens
446
atgggctagg ccacaagctc ttctcagctc gatctcacaa ttggcagatt aaccaagacc60
c61
447
61
DNA
Homo sapiens
447
aaaggaaggg tctctccagc ttgtggacaa aagacctaat ggttcccccg gtgaccctct60
c61
448
61
DNA
Homo sapiens
448
aaaggaaggg tctctccagc ttgtggacaa gagacctaat ggttcccccg gtgaccctct60
c61
449
61
DNA
Homo sapiens
449
tacttaagca gcacgtgctc ttcatttcaa attcagatgt gtcacctccc aactaacaat60
a61
450
61
DNA
Homo sapiens
450
tacttaagca gcacgtgctc ttcatttcaa gttcagatgt gtcacctccc aactaacaat60
a61
451
61
DNA
Homo sapiens
451
cacagctgag ctgtgggagg gcagaagtga aggatctttg aaggaaaaga aagtgaatgg60
a61
452
61
DNA
Homo sapiens
452
cacagctgag ctgtgggagg gcagaagtga gggatctttg aaggaaaaga aagtgaatgg60
a61
453
61
DNA
Homo sapiens
453
gacaggtggc tagataattc tgaggaaaaa atgggaatgt cagtttcatg gagtttcgaa60
t61
454
61
DNA
Homo sapiens
454
gacaggtggc tagataattc tgaggaaaaa ttgggaatgt cagtttcatg gagtttcgaa60
t61
455
61
DNA
Homo sapiens
455
ttcagatttt ggggtcacac tgcagacacc aggctttctt ttccctccac attttaacat60
a61
456
61
DNA
Homo sapiens
456
ttcagatttt ggggtcacac tgcagacacc gggctttctt ttccctccac attttaacat60
a61
457
61
DNA
Homo sapiens
457
cggtgctgca ccgtggatgt gagtccttgc acagtggtga aatgtagtag aggagtgatc60
t61
458
61
DNA
Homo sapiens
458
cggtgctgca ccgtggatgt gagtccttgc gcagtggtga aatgtagtag aggagtgatc60
t61
459
61
DNA
Homo sapiens
459
gagtgcctgg ctggtgacag gggagaaaag aagaacgggt ctgcaggtgg aaagaggtgt60
t61
460
61
DNA
Homo sapiens
460
gagtgcctgg ctggtgacag gggagaaaag gagaacgggt ctgcaggtgg aaagaggtgt60
t61
461
61
DNA
Homo sapiens
461
caaggggtag aatctatgga aggaagcgag agcatgtcat aaaatctcag tgagacatta60
a61
462
61
DNA
Homo sapiens
462
caaggggtag aatctatgga aggaagcgag ggcatgtcat aaaatctcag tgagacatta60
a61
463
61
DNA
Homo sapiens
463
actctacttc cttcctgttt aactgtacca acttcttccc tctgactcaa attcatgagc60
t61
464
61
DNA
Homo sapiens
464
actctacttc cttcctgttt aactgtacca gcttcttccc tctgactcaa attcatgagc60
t61
465
61
DNA
Homo sapiens
465
ctgctcattg taacaagctt tagcataggc ataggttgat aatggatgta ggcatggggt60
t61
466
61
DNA
Homo sapiens
466
ctgctcattg taacaagctt tagcataggc gtaggttgat aatggatgta ggcatggggt60
t61
467
61
DNA
Homo sapiens
467
ctctattcaa taaatggtgc tgggataatg agttagacgt atacagaagg gtgaacctgg60
a61
468
61
DNA
Homo sapiens
468
ctctattcaa taaatggtgc tgggataatg ggttagacgt atacagaagg gtgaacctgg60
a61
469
61
DNA
Homo sapiens
469
ctaattctca ccaatggaat gtgtgtggaa ataatgcgtc tccttcaggc tgaggcagtt60
a61
470
61
DNA
Homo sapiens
470
ctaattctca ccaatggaat gtgtgtggaa gtaatgcgtc tccttcaggc tgaggcagtt60
a61
471
61
DNA
Homo sapiens
471
aactcttaat aaacattcac tgttcaatgg atagtcatca tagtgattga cactgcatat60
t61
472
61
DNA
Homo sapiens
472
aactcttaat aaacattcac tgttcaatgg gtagtcatca tagtgattga cactgcatat60
t61
473
61
DNA
Homo sapiens
473
agaaatgcag attctcgggt ccaaccgcca aacttactaa atcagaaacc ctgagaacgg60
c61
474
61
DNA
Homo sapiens
474
agaaatgcag attctcgggt ccaaccgcca gacttactaa atcagaaacc ctgagaacgg60
c61
475
61
DNA
Homo sapiens
475
gcttgagcca ccgtgcccag cctcagagtc agtgattttt aagtctccaa ccccaacatg60
c61
476
61
DNA
Homo sapiens
476
gcttgagcca ccgtgcccag cctcagagtc ggtgattttt aagtctccaa ccccaacatg60
c61
477
61
DNA
Homo sapiens
477
cccttttctt tcttgttctt tttaagactc aatctcaaat ctgcaaccta cctaccataa60
g61
478
61
DNA
Homo sapiens
478
cccttttctt tcttgttctt tttaagactc gatctcaaat ctgcaaccta cctaccataa60
g61
479
61
DNA
Homo sapiens
479
acacatgctt aatatgaatg ctttaatcaa atcataatca gatggtactt gccctaccta60
a61
480
61
DNA
Homo sapiens
480
acacatgctt aatatgaatg ctttaatcaa ttcataatca gatggtactt gccctaccta60
a61
481
61
DNA
Homo sapiens
481
ttggattggt actttccatt accaactgat agcttttaga ccattgtcca aattacccat60
a61
482
61
DNA
Homo sapiens
482
ttggattggt actttccatt accaactgat tgcttttaga ccattgtcca aattacccat60
a61
483
61
DNA
Homo sapiens
483
tgaggctgtc ttgagacttg actgatagaa acgcccagtg aactgtgaaa gctccagcag60
c61
484
61
DNA
Homo sapiens
484
tgaggctgtc ttgagacttg actgatagaa gcgcccagtg aactgtgaaa gctccagcag60
c61
485
61
DNA
Homo sapiens
485
cttttttcta tttctttcct ttctacatac ataacacaga tcacacatat atatccatac60
t61
486
61
DNA
Homo sapiens
486
cttttttcta tttctttcct ttctacatac gtaacacaga tcacacatat atatccatac60
t61
487
61
DNA
Homo sapiens
487
agactatgct tttttcattg aatcgccttt ctgtgttttt cataaatcag ttgactacat60
t61
488
61
DNA
Homo sapiens
488
agactatgct tttttcattg aatcgccttt gtgtgttttt cataaatcag ttgactacat60
t61
489
61
DNA
Homo sapiens
489
gtcactcagt gagcaagagg ttgatttttt aaacttcatg acaactatga cattatgctg60
t61
490
61
DNA
Homo sapiens
490
gtcactcagt gagcaagagg ttgatttttt gaacttcatg acaactatga cattatgctg60
t61
491
61
DNA
Homo sapiens
491
gaataacaga agaatgcaca cacattccaa ataagggcct ttctcacaaa cacatcagaa60
g61
492
61
DNA
Homo sapiens
492
gaataacaga agaatgcaca cacattccaa gtaagggcct ttctcacaaa cacatcagaa60
g61
493
61
DNA
Homo sapiens
493
atagatgtag tatccagttc tgatgtcagg attagagaaa ttatctttgg ctaaggttat60
c61
494
61
DNA
Homo sapiens
494
atagatgtag tatccagttc tgatgtcagg gttagagaaa ttatctttgg ctaaggttat60
c61
495
61
DNA
Homo sapiens
495
aatatacaca taacctaaca tccactaaaa acaacagaaa tgtccactaa gagaatacta60
g61
496
61
DNA
Homo sapiens
496
aatatacaca taacctaaca tccactaaaa ccaacagaaa tgtccactaa gagaatacta60
g61
497
61
DNA
Homo sapiens
497
ggaggaggta gcttgaacta ggatgacggc agtgggaata aaaagagttg gatgaattca60
a61
498
61
DNA
Homo sapiens
498
ggaggaggta gcttgaacta ggatgacggc ggtgggaata aaaagagttg gatgaattca60
a61
499
61
DNA
Homo sapiens
499
ttccagtgtc ttgggaatgc agcctgttac actgtgtatt cgtgtgctgg ataagttcaa60
a61
500
61
DNA
Homo sapiens
500
ttccagtgtc ttgggaatgc agcctgttac gctgtgtatt cgtgtgctgg ataagttcaa60
a61
501
61
DNA
Homo sapiens
501
aatatatcaa agacatgtag ctaaaaagat attcctacat cctcactggt gaacacaaag60
t61
502
61
DNA
Homo sapiens
502
aatatatcaa agacatgtag ctaaaaagat cttcctacat cctcactggt gaacacaaag60
t61
503
61
DNA
Homo sapiens
503
ataaatactc tctggaaaaa tctaccttca atctaggcct tgaacagctc acacagataa60
a61
504
61
DNA
Homo sapiens
504
ataaatactc tctggaaaaa tctaccttca gtctaggcct tgaacagctc acacagataa60
a61
505
61
DNA
Homo sapiens
505
gagacattca gtcttgtctt aagtcatata ctagctatcc aacttagaga atgtctcaaa60
t61
506
61
DNA
Homo sapiens
506
gagacattca gtcttgtctt aagtcatata gtagctatcc aacttagaga atgtctcaaa60
t61
507
61
DNA
Homo sapiens
507
acagcaaaag cagatggaag ggaggttaat attatgacat aggaaataat gtagtatcaa60
t61
508
61
DNA
Homo sapiens
508
acagcaaaag cagatggaag ggaggttaat gttatgacat aggaaataat gtagtatcaa60
t61
509
61
DNA
Homo sapiens
509
tctcttttcc tggaaactcc accaggaagc agtgccatag accccaaaga catccaggtc60
a61
510
61
DNA
Homo sapiens
510
tctcttttcc tggaaactcc accaggaagc cgtgccatag accccaaaga catccaggtc60
a61
511
61
DNA
Homo sapiens
511
gcctatgggc tgccttcctg aaaactatct agcttgtggt tacatgaagc cagagtccac60
t61
512
61
DNA
Homo sapiens
512
gcctatgggc tgccttcctg aaaactatct ggcttgtggt tacatgaagc cagagtccac60
t61
513
61
DNA
Homo sapiens
513
gcaaacagat gaattcagcc cctccaaacc aagcgcggag cgcgctgctt ttgtgcgcca60
g61
514
61
DNA
Homo sapiens
514
gcaaacagat gaattcagcc cctccaaacc gagcgcggag cgcgctgctt ttgtgcgcca60
g61
515
50
DNA
Homo sapiens
515
cagacttctt gaatgtatcc ccagttaaca gcacagcgtt tatctagcag50
516
50
DNA
Homo sapiens
516
aacctgaggc aggatttcat actgttctta actgtactga tagctcttct50
517
50
DNA
Homo sapiens
517
atttggctct ttaccctgac caaagacttc tgggcttgag taagctgagt50
518
50
DNA
Homo sapiens
518
tgagttagtt actccaggag tgggttcctg gtaaaatggt aggtttagta50
519
50
DNA
Homo sapiens
519
tgatgctctt cagtgaaggt atctaagtaa ggttagaaat gcttcggcct50
520
50
DNA
Homo sapiens
520
taggctctcc tgttagactg catgggctcc agttctggct ccagcagtga50
521
50
DNA
Homo sapiens
521
aaaattcccc cagattgaaa gcaaaaccag taaatctaac tgcaattgtg50
522
50
DNA
Homo sapiens
522
tcaatcagac ctcccagggt ttcagatggg tagaagctgc tctcagaaag50
523
50
DNA
Homo sapiens
523
gaggatcatt ctcttgaaga aagaagaaaa accactgtaa tcttcgcttg50
524
50
DNA
Homo sapiens
524
attcagtttg ctaaaggccc attagccatg aacactaaag aaatagcctg50
525
50
DNA
Homo sapiens
525
gaggaggttc tctttttagc tgattcctca taaaaggata agatttagct50
526
50
DNA
Homo sapiens
526
gtaggaacgt atctatacaa taccaaagtg gctgtagccc cagggaatta50
527
50
DNA
Homo sapiens
527
aaagatctta tcaaagcttc aagttcctat accgtgaagc tggccaaaac50
528
50
DNA
Homo sapiens
528
taaattagac cttttctctc gccactgcca ccactcctgc agattgttcc50
529
50
DNA
Homo sapiens
529
gtggttccat ggaatttccc acttttctca taataaaacc tttattgctc50
530
50
DNA
Homo sapiens
530
gtgagtcctg ggtgcacttg tgacctgtcc ttgtgacttg gaaaaaatgc50
531
50
DNA
Homo sapiens
531
ttaaaaaata gtgtttggcc tgattttgct gttggatggg gccatccaag50
532
50
DNA
Homo sapiens
532
ctattataat gctactcaac ctgtactttt atatacgcct aatttgttcc50
533
50
DNA
Homo sapiens
533
cagacttctt gaatgtatcc ccagttaaca gcacagcgtt tatctagcac50
534
50
DNA
Homo sapiens
534
tgagttagtt actccaggag tgggttcctg gtaaaatggt aggtttagtt50
535
50
DNA
Homo sapiens
535
gtgagtcctg ggtgcacttg tgacctgtcc ttgtgacttg gaaaaaatgg50
536
50
DNA
Homo sapiens
536
gataagggac ctcccacaca ccccaaaagt ggtttataaa acattgactc50
537
50
DNA
Homo sapiens
537
tttataaaac attgactcca catcactgta gttaacccaa accaaaagac50
538
50
DNA
Homo sapiens
538
ggctgaagag ccccataccc ggtatgctgt ctctgaacta tggaatatgc50
539
50
DNA
Homo sapiens
539
aaaaaaggga aatcctgcca tttgcaacca gtgtgcatga aactggagga50
540
50
DNA
Homo sapiens
540
agaatttggt gaatgaatct tttcaaaatt aattttcaaa tttctactgg50
541
50
DNA
Homo sapiens
541
tcataggatg ggagtactca gcaatagaga gaaatgagct tctgaaatgc50
542
50
DNA
Homo sapiens
542
gctatgttag aagggtgtct tctgctcaac cagttctttt gcttcctctg50
543
50
DNA
Homo sapiens
543
taaatctggg aggtcagttt ttgactttat atggggatgg aggccgcctc50
544
50
DNA
Homo sapiens
544
ggtggattca gttgcataac tcacttttca aggtgattgc tattcattca50
545
50
DNA
Homo sapiens
545
ctcctcagaa acaagagcca ttaggcctcc taacaagatg gaactagatg50
546
50
DNA
Homo sapiens
546
acctgccttg acacgccatg aacctgttac tctcgggtgc tctgtggtga50
547
50
DNA
Homo sapiens
547
ggctggggct gcagcctagt cccatcatca agcttcctac agagcttagc50
548
50
DNA
Homo sapiens
548
ctgacagcct aggggacagg gccatggctg agttgactgg gttcagattc50
549
50
DNA
Homo sapiens
549
ctggagacac tgctaagagt acaagttgca gagaaacctt taataattac50
550
50
DNA
Homo sapiens
550
ggtaccagag atgagaactt caacattatc tttctgaggg atacaactca50
551
50
DNA
Homo sapiens
551
ttgtgtcagc atgtcttgga gcgatccact tagtatgaga ttaatgcctt50
552
50
DNA
Homo sapiens
552
cagttattgc cccaggttct ttttcataag acattatact ctagccatga50
553
50
DNA
Homo sapiens
553
gtgctgtgag attctgctgg atgggggcag ctgatgaccc tttgctcctc50
554
50
DNA
Homo sapiens
554
tcggggtaac ctcttggcat cagttacatg ttggatcaca gtgaggttgt50
555
50
DNA
Homo sapiens
555
gataaatagt ggatgcctga agagctatgt tggggaagat ggtgaagcca50
556
50
DNA
Homo sapiens
556
tccacgctag ggacttgcct gcctctgccg cagcgcagat ctgatgcggt50
557
50
DNA
Homo sapiens
557
ttcaccttga agattgcagt tggcttccaa ctggcctcta aactctaatc50
558
50
DNA
Homo sapiens
558
cactagacat tatgtagagc tttagtcatg ggcaattagt aagcattaac50
559
50
DNA
Homo sapiens
559
acatcattga gcaactcttc cttccatagg tcaggctgac tatgctttta50
560
50
DNA
Homo sapiens
560
tgtgctggtc aaacctggac catatacttg ttctcaaacc attcactagc50
561
50
DNA
Homo sapiens
561
ttaagtttgc tttctaagtt atctggtaaa aattttcata agcattagac50
562
50
DNA
Homo sapiens
562
acgtacagaa tgggattctt aagagagcct ctaggttagc gccgctgaac50
563
50
DNA
Homo sapiens
563
tatgagcact taccagccac tgtcctatgc cctctcgttg aatgctcaca50
564
50
DNA
Homo sapiens
564
tagcatcgcc acatcactga gtagggcatt tgatttaatc accaagagcc50
565
50
DNA
Homo sapiens
565
gataggaagt ctcagaacct cttctccgcc tattagtcat gtttggattt50
566
50
DNA
Homo sapiens
566
aacttgtatt tgccatttga gtgtaacagc ttcctgatcc ttacacaaaa50
567
50
DNA
Homo sapiens
567
tactacagga gataccactt tccccttatc agactggcaa atagccaaaa50
568
50
DNA
Homo sapiens
568
ctgctagcac ttatcacaca tcttgagaag ggaacacttg ataaaatctc50
569
50
DNA
Homo sapiens
569
tcttgaaaag gacattacgt tcctggcaat taagtcaaac cttaagctac50
570
50
DNA
Homo sapiens
570
agctcttttc cttgtgctgt gatgttgctg tatcgctcag atctaatgtt50
571
50
DNA
Homo sapiens
571
atgaggaata gttatatact gttaagaata taaacctgaa atgtcaactg50
572
50
DNA
Homo sapiens
572
acagtgcgga aagaggcaac tattccagga ggcagggggt atagagtggg50
573
50
DNA
Homo sapiens
573
taacactctt aaatattttg agcgatgctg cagtgttaat tcacatcatt50
574
50
DNA
Homo sapiens
574
cacttatttc tcatggagat cacacacttg tatctgtctc tcttttcacc50
575
50
DNA
Homo sapiens
575
gacaagcctg caccctttcc acagttctga actccttccc tgtggtatct50
576
50
DNA
Homo sapiens
576
cctgtattca ctcccaaaac tgtgctgggc acacagtggg tgcctaatgt50
577
50
DNA
Homo sapiens
577
ctggcctcag ccctgcccct aaacatcttt ttccttaaag cagctgaaat50
578
50
DNA
Homo sapiens
578
atgatagcta ctgaaaactt ggaagggaac ctgagtatga gaaggacaga50
579
50
DNA
Homo sapiens
579
agagtgagaa tttgagccaa aatatctctg aatctagacc ttgagctgtt50
580
50
DNA
Homo sapiens
580
gaatctagac cttgagctgt aaactattct actaaattta aaatgaggac50
581
50
DNA
Homo sapiens
581
ctcacactaa aatattcatt aagtaggcac atacccacat tctttgggtg50
582
50
DNA
Homo sapiens
582
gtatagctag tgattaccag agtgctttga aatcaagcag aacactcatc50
583
50
DNA
Homo sapiens
583
gtctcttcca gggcctagca aagtgttaga catcaaactg atgcttgaaa50
584
50
DNA
Homo sapiens
584
agctgatgcc aaatgtcccc tagggagcaa caccatggtg gtagagaacc50
585
50
DNA
Homo sapiens
585
ggagttgtca gccctttcag aatcacaggc tagactatta gtgaaggtct50
586
50
DNA
Homo sapiens
586
ccaacttttg ccaccatggg tacgcaccag gcagtgaggg aaaaggagca50
587
50
DNA
Homo sapiens
587
cagtgcctgg ctggtttaga gacacacagg ttatgtcact ctgatgtgca50
588
50
DNA
Homo sapiens
588
gtacaaagct cattataaca caatgtgagc tgcacattgt aaacaccagc50
589
50
DNA
Homo sapiens
589
tatagatgca taactacaat attttcctct gtcttcaccc ggcattcccg50
590
50
DNA
Homo sapiens
590
acaccaaatg atggccagta tgcaaagaaa atgaatcact catgggtata50
591
50
DNA
Homo sapiens
591
attatacgcc attgtcgctg ccaatcatac accaagaaca tggtcttaca50
592
50
DNA
Homo sapiens
592
acttcttttc ttttgtgtac actctcttct tcggctatgc tgtgctctaa50
593
50
DNA
Homo sapiens
593
ctccctcaaa gcacaaacat ctgtgaaagc agaggctcga gggaccattc50
594
50
DNA
Homo sapiens
594
aggaatttta agacagtgcg agaatcattc tttctccttc ctactccttc50
595
50
DNA
Homo sapiens
595
ccagttccca acaagttcct catctccacc tgagaacgtc ttatcctgaa50
596
50
DNA
Homo sapiens
596
atgttatgtc ctctttacta acacagaact atagaatgca tgggccagaa50
597
50
DNA
Homo sapiens
597
aatgaggcag catttgggta tttcttgtaa taaagttcct ctgcattgca50
598
50
DNA
Homo sapiens
598
tctctgtcta tcttaacaga aagctgacct gtgagggctt ctttagggtc50
599
50
DNA
Homo sapiens
599
acccacgtgg caaagaactg taggtggttt gtaggagttg agagcctcag50
600
50
DNA
Homo sapiens
600
acctgttggg aaatatctct cccttgtatt acacatgaat tattatttgg50
601
50
DNA
Homo sapiens
601
gctaaataat agcatgtaat tactttttta attagaataa tactgccagc50
602
50
DNA
Homo sapiens
602
taactttctc tcttggtcca attggaatta taacaagcaa gacccctggc50
603
50
DNA
Homo sapiens
603
cctctgtttt gtattattac aatttaaaat gaggaaagct atgtagtcat50
604
50
DNA
Homo sapiens
604
taacagctaa cacgtgctct gggccttggt ttccaaagct ttcttacatc50
605
50
DNA
Homo sapiens
605
aaattctttt ggcttttgta tgtctaaaaa gggtccctgt tttgccttcc50
606
50
DNA
Homo sapiens
606
agatgtaccc aagtgtaaaa tatacactga attttgaaga tgtggtttca50
607
50
DNA
Homo sapiens
607
cccggccgcc tttttcaata atatttctct gaactgcctg cagcttttac50
608
50
DNA
Homo sapiens
608
agtttagggc cagtcagcat aaaggtggtc gataaaaccg tcagtgtaaa50
609
50
DNA
Homo sapiens
609
ttctttaggc aggtcaatgt ggggagtgtt gtgatggata ttctagtgca50
610
50
DNA
Homo sapiens
610
gggccccttt ccaatgttat tttccaaata tcctttctcc agtgctttat50
611
50
DNA
Homo sapiens
611
aattttatct ttcttccctg tgccccaaag cctttaactt ggatgatcta50
612
50
DNA
Homo sapiens
612
gggctatcca caggccaagg aatacttgag agttttctaa tctgtcattt50
613
50
DNA
Homo sapiens
613
gtaggtgcca tctttttcta tagaagtgac tatgagttcc atcaaatagg50
614
50
DNA
Homo sapiens
614
gtctaaaaaa ctgttaatga gaaaacttat gctactagac ttttaagggt50
615
50
DNA
Homo sapiens
615
ctctttcttg ctggaccctg agtgagacag tatattttca ggaaacgtac50
616
50
DNA
Homo sapiens
616
gggtataggg gaaggaacaa acttctatta cattcacagc taaatatggc50
617
50
DNA
Homo sapiens
617
gcttttcttt atgctaggca tgctctcgcc ccgcatctgt gcactgactc50
618
50
DNA
Homo sapiens
618
gtatccttaa atatccattg gctaaaatca atagccattg aagctccact50
619
50
DNA
Homo sapiens
619
tgagcaagtt tgcttcccct ccccagccct actgccccat cactaaatgc50
620
50
DNA
Homo sapiens
620
tgaagacact ctattgagag tagccctcta agtattgttc aaattccctc50
621
50
DNA
Homo sapiens
621
aaacttcttt aaacttggaa atgtttttgt aaaagaaact ttcagtattc50
622
50
DNA
Homo sapiens
622
gtcacgatag tagcacaccc tagctacagg cagagcacct agaaagaaac50
623
50
DNA
Homo sapiens
623
cagcacgctg agatgggatg aaagacagag tgctgtttga acctagagaa50
624
50
DNA
Homo sapiens
624
aatatctgcc ccagtatctg cagcaatacc ttaagatagt ccctttgcct50
625
50
DNA
Homo sapiens
625
tccttccaca ttagtttaaa tgtgaatggc tgcttggaac acagtgttga50
626
50
DNA
Homo sapiens
626
caaatgactc ttttaagttg atgtctcctc cccaggtcat cagaataatc50
627
50
DNA
Homo sapiens
627
catttaatta cttcttgctt caatcttatc ccacactctg gtcatacaac50
628
50
DNA
Homo sapiens
628
gatgtggaat atgctagctt gttagaaagt cagcctcaac atgttgtggt50
629
50
DNA
Homo sapiens
629
ctaaattaca gccagacctc tggctgcaga ggagtctgag acatgtatga50
630
50
DNA
Homo sapiens
630
atcatcataa ataacgtgga gcagatggaa gatgccgggc ttttcatttc50
631
50
DNA
Homo sapiens
631
aagcattagg gacaattggt gtgcatccta aaagcagtga caggttagac50
632
50
DNA
Homo sapiens
632
gaggaggagg taaaggagag gacctcagta aatatgttga tggtccagac50
633
50
DNA
Homo sapiens
633
ggtagttccc caaggactcg agtgggaccc tgtgaggcaa acatcaccac50
634
50
DNA
Homo sapiens
634
aggtcttgca gccctgggag acttttgggt tgtagctgcc tatagctgcc50
635
50
DNA
Homo sapiens
635
aaaagagtga ccattgggct taccttctgt taaaacttct ttgtctggct50
636
50
DNA
Homo sapiens
636
aaaggaaatt tattttttct cctgaaaaag taagcaatct atctaagttg50
637
50
DNA
Homo sapiens
637
gtaatagcat tctccattcc acatgtttta agatgttttc ttgagagctt50
638
50
DNA
Homo sapiens
638
catctgtgaa ctgggagtaa caatttgacc ttcttcacag ggctgcttgg50
639
50
DNA
Homo sapiens
639
tccagtttct ggttaactgt gggtcttggt taatctgcca attgtgagat50
640
50
DNA
Homo sapiens
640
gactgtgccc tgtgtgtatc aaaggaaggg tctctccagc ttgtggacaa50
641
50
DNA
Homo sapiens
641
atgctgaaga accttaagca tacttaagca gcacgtgctc ttcatttcaa50
642
50
DNA
Homo sapiens
642
ttgtgggatg aaaagatggt cacagctgag ctgtgggagg gcagaagtga50
643
50
DNA
Homo sapiens
643
ggggaaagag aaaagaaaga ttcgaaactc catgaaactg acattcccat50
644
50
DNA
Homo sapiens
644
atctgtagag acttgccaga tatgttaaaa tgtggaggga aaagaaagcc50
645
50
DNA
Homo sapiens
645
cacagcatga gagttgctcc agatcactcc tctactacat ttcaccactg50
646
50
DNA
Homo sapiens
646
tcacaggcag ggcacaccta aacacctctt tccacctgca gacccgttct50
647
50
DNA
Homo sapiens
647
gagatgaccc caaaggttaa ttaatgtctc actgagattt tatgacatgc50
648
50
DNA
Homo sapiens
648
gaaaaaggct ttgacttcca actctacttc cttcctgttt aactgtacca50
649
50
DNA
Homo sapiens
649
gtgaatgggc aaggcattct aaccccatgc ctacatccat tatcaaccta50
650
50
DNA
Homo sapiens
650
tatattgtaa aaagaagaag tccaggttca cccttctgta tacgtctaac50
651
50
DNA
Homo sapiens
651
ccccaatagt ccttgtctct taactgcctc agcctgaagg agacgcatta50
652
50
DNA
Homo sapiens
652
actgtgccca aaacatagca aactcttaat aaacattcac tgttcaatgg50
653
50
DNA
Homo sapiens
653
gttaaaacac agattgccag gccgttctca gggtttctga tttagtaagt50
654
50
DNA
Homo sapiens
654
gccacaactt acagaattta gcatgttggg gttggagact taaaaatcac50
655
50
DNA
Homo sapiens
655
ttttttgaga gaagaagggg cttatggtag gtaggttgca gatttgagat50
656
50
DNA
Homo sapiens
656
tttcacagtg gagttgctat taggtagggc aagtaccatc tgattatgat50
657
50
DNA
Homo sapiens
657
aatccaaaac acccagcatt atgggtaatt tggacaatgg tctaaaagct50
658
50
DNA
Homo sapiens
658
gcagggagac agcatgtgtg tgaggctgtc ttgagacttg actgatagaa50
659
50
DNA
Homo sapiens
659
acacctctgt ttagcagtga agtatggata tatatgtgtg atctgtgtta50
660
50
DNA
Homo sapiens
660
cccagaaatc aacccataca atgtagtcaa ctgatttatg aaaaacacag50
661
50
DNA
Homo sapiens
661
atcactgtaa gctgctcctt gtcactcagt gagcaagagg ttgatttttt50
662
50
DNA
Homo sapiens
662
agcaagcttg ctgaaatcgt gaataacaga agaatgcaca cacattccaa50
663
50
DNA
Homo sapiens
663
gggaaattta tttaaagaca atagatgtag tatccagttc tgatgtcagg50
664
50
DNA
Homo sapiens
664
gatgtactaa tattatttgg ctagtattct cttagtggac atttctgttg50
665
50
DNA
Homo sapiens
665
tttgtactcc aggaaagaga ggaggaggta gcttgaacta ggatgacggc50
666
50
DNA
Homo sapiens
666
tggccagaaa agatgaaata tttgaactta tccagcacac gaatacacag50
667
50
DNA
Homo sapiens
667
tttattgtca ctgagatact actttgtgtt caccagtgag gatgtaggaa50
668
50
DNA
Homo sapiens
668
ggcacctggg agaagcaaat ataaatactc tctggaaaaa tctaccttca50
669
50
DNA
Homo sapiens
669
cagacaaatg caaaagatta tttgagacat tctctaagtt ggatagctag50
670
50
DNA
Homo sapiens
670
agaagacatg agactactaa acagcaaaag cagatggaag ggaggttaat50
671
50
DNA
Homo sapiens
671
aagccctgta gatgagagct tctcttttcc tggaaactcc accaggaagc50
672
50
DNA
Homo sapiens
672
atcgtgtgct cataaccaca agtggactct ggcttcatgt aaccacaagc50
673
50
DNA
Homo sapiens
673
atacgcaggt ggaatggtct gcaaacagat gaattcagcc cctccaaacc50
674
50
DNA
Homo sapiens
674
gataagggac ctcccacaca ccccaaaagt ggtttataaa acattgactg50
675
50
DNA
Homo sapiens
675
tttataaaac attgactcca catcactgta gttaacccaa accaaaagag50
676
50
DNA
Homo sapiens
676
ctgacagcct aggggacagg gccatggctg agttgactgg gttcagattg50
677
50
DNA
Homo sapiens
677
ttcaccttga agattgcagt tggcttccaa ctggcctcta aactctaatg50
678
50
DNA
Homo sapiens
678
acgtacagaa tgggattctt aagagagcct ctaggttagc gccgctgaag50
679
50
DNA
Homo sapiens
679
tactacagga gataccactt tccccttatc agactggcaa atagccaaat50
680
50
DNA
Homo sapiens
680
tcttgaaaag gacattacgt tcctggcaat taagtcaaac cttaagctag50
681
50
DNA
Homo sapiens
681
acagtgcgga aagaggcaac tattccagga ggcagggggt atagagtggc50
682
50
DNA
Homo sapiens
682
agagtgagaa tttgagccaa aatatctctg aatctagacc ttgagctgta50
683
50
DNA
Homo sapiens
683
tatagatgca taactacaat attttcctct gtcttcaccc ggcattcccc50
684
50
DNA
Homo sapiens
684
tctctgtcta tcttaacaga aagctgacct gtgagggctt ctttagggtg50
685
50
DNA
Homo sapiens
685
cctctgtttt gtattattac aatttaaaat gaggaaagct atgtagtcaa50
686
50
DNA
Homo sapiens
686
gtctaaaaaa ctgttaatga gaaaacttat gctactagac ttttaaggga50
687
50
DNA
Homo sapiens
687
gcttttcttt atgctaggca tgctctcgcc ccgcatctgt gcactgactg50
688
50
DNA
Homo sapiens
688
catttaatta cttcttgctt caatcttatc ccacactctg gtcatacaag50
689
50
DNA
Homo sapiens
689
aagcattagg gacaattggt gtgcatccta aaagcagtga caggttagag50
690
50
DNA
Homo sapiens
690
ggggaaagag aaaagaaaga ttcgaaactc catgaaactg acattcccaa50
691
50
DNA
Homo sapiens
691
tttcacagtg gagttgctat taggtagggc aagtaccatc tgattatgaa50
692
50
DNA
Homo sapiens
692
aatccaaaac acccagcatt atgggtaatt tggacaatgg tctaaaagca50
693
50
DNA
Homo sapiens
693
cccagaaatc aacccataca atgtagtcaa ctgatttatg aaaaacacac50
694
50
DNA
Homo sapiens
694
cagacaaatg caaaagatta tttgagacat tctctaagtt ggatagctac50
權利要求
1.是否存在青光眼風險的判定方法，該方法包括以下步驟
步驟A在來自受檢者的樣品中，在體外檢測存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型的步驟，所述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列；以及
步驟B將上述步驟A中檢測到的等位基因和/或基因型與SEQ IDNO203～514所示的核苷酸序列中包含高風險等位基因的至少一個等位基因和/或基因型進行比較的步驟；
當上述步驟A中檢測到的等位基因為上述高風險等位基因時，判定存在青光眼風險；或者，當上述高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且上述步驟A中檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子或雜合子時，判定存在青光眼風險；當上述高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且上述步驟A中檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子時，判定存在青光眼風險。
2.權利要求1所述的判定方法，其中青光眼風險為青光眼的發病風險。
3.權利要求2所述的判定方法，其中核苷酸序列選自SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列。
4.權利要求3所述的判定方法，其中，選擇SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列中包含高風險等位基因的任意的兩個以上等位基因和/或基因型並組合起來，進行步驟B中的比較；當上述步驟A中檢測到的等位基因為上述步驟B中為了比較而選擇的上述任一個等位基因時，判定存在青光眼風險；或者，當上述高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且上述步驟A中檢測到的基因型為上述步驟B中為了比較而選擇的上述任一個基因型的純合子或雜合子時，判定存在青光眼風險；當上述高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且上述步驟A中檢測到的基因型為上述步驟B中為了比較而選擇的上述任一個基因型的純合子時，判定存在青光眼風險。
5.權利要求4所述的判定方法，其中，選擇SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列中包含高風險等位基因的所有等位基因和/或基因型並組合起來，進行步驟B中的比較；當上述步驟A中檢測到的等位基因為上述步驟B中為了比較而選擇的上述任一個等位基因時，判定存在青光眼風險；或者，當上述高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且上述步驟A中檢測到的基因型為上述步驟B中為了比較而選擇的上述任一個基因型的純合子或雜合子時，判定存在青光眼風險；當上述高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且上述步驟A中檢測到的基因型為上述步驟B中為了比較而選擇的上述任一個基因型的純合子時，判定存在青光眼風險。
6.權利要求2所述的判定方法，其中進一步包括預測發病風險的高低的步驟。
7.權利要求1所述的判定方法，其中青光眼為原發性隅角開放型青光眼簡稱POAG或正常眼壓青光眼簡稱NTG。
8.是否存在青光眼風險的判定方法，該方法包括以下步驟
步驟C1在來自受檢者的樣品中，在體外檢測存在於核酸分子中的如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型的步驟，所述核酸分子包含選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列；或
步驟C2使用含有核苷酸序列的核酸分子，在體外檢測上述單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型的步驟，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO515～694所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列；以及
步驟D將上述步驟C1或C2中檢測到的等位基因和/或基因型與至少一個核酸分子進行比較的步驟，上述核酸分子含有SEQ IDNO203～514所示的核苷酸序列中包含高風險等位基因的等位基因和/或基因型；
當上述步驟C1或C2中檢測到的等位基因為上述高風險等位基因時，判定存在青光眼風險；或者，當上述高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且上述步驟C1或C2中檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子或雜合子時，判定存在青光眼風險；當上述高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且上述步驟C1或C2中檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子時，判定存在青光眼風險。
9.權利要求8所述的判定方法，其中青光眼風險為青光眼的發病風險。
10.權利要求9所述的判定方法，其中上述步驟C1和D中的核苷酸序列選自SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列；或者，上述步驟C2中的核苷酸序列選自SEQ ID NO515～535所示的核苷酸序列。
11.權利要求10所述的判定方法，其中，選擇任意的兩個以上核酸分子並組合起來，進行步驟D中的比較，所述核酸分子含有SEQID NO203～238所示的核苷酸序列中包含高風險等位基因的等位基因和/或基因型；當上述步驟C1或C2中檢測到的等位基因為上述步驟D中為了比較而選擇的上述任一個核酸分子中的高風險等位基因時，判定存在青光眼風險；或者，當上述高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且上述步驟C1或C2中檢測到的基因型為上述步驟D中為了比較而選擇的上述任一個核酸分子中的基因型的純合子或雜合子時，判定存在青光眼風險；當上述高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且上述步驟C1或C2中檢測到的基因型為上述步驟D中為了比較而選擇的上述任一個核酸分子中的基因型的純合子時，判定存在青光眼風險。
12.權利要求12所述的判定方法，其中，選擇所有核酸分子並組合起來，進行步驟D中的比較，所述核酸分子含有SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列中包含高風險等位基因的等位基因和/或基因型；當上述步驟C1或C2中檢測到的等位基因為上述步驟D中為了比較而選擇的上述任一個核酸分子中的高風險等位基因時，判定存在青光眼風險；或者，當上述高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且上述步驟C1或C2中檢測到的基因型為上述步驟D中為了比較而選擇的上述任一個核酸分子中的基因型的純合子或雜合子時，判定存在青光眼風險；當上述高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且上述步驟C1或C2中檢測到的基因型為上述步驟D中為了比較而選擇的上述任一個核酸分子中的基因型的純合子時，判定存在青光眼風險。
13.權利要求9所述的判定方法，其中進一步包括預測發病風險的高低的步驟。
14.權利要求8～13中任一項所述的判定方法，其中使用核酸分子作為探針。
15.權利要求14所述的判定方法，其中核酸分子為23鹼基～55鹼基。
16.權利要求14所述的判定方法，其中探針被固定化。
17.權利要求8所述的判定方法，其中青光眼為原發性隅角開放型青光眼簡稱POAG或正常眼壓青光眼簡稱NTG。
18.判定是否存在青光眼風險的試劑盒，該試劑盒含有下述核酸分子包含選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核酸分子，該核酸分子包含存在於各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性；和/或含有核苷酸序列的核酸分子，所述核苷酸序列包含選自SEQ ID NO515～694所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列；該試劑盒用於在體外檢測在來自受檢者的樣品中上述單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型。
19.權利要求18所述的試劑盒，其中青光眼風險為青光眼的發病風險。
20.權利要求19所述的試劑盒，其中核苷酸序列選自SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列、和/或選自SEQ ID NO515～535所示的核苷酸序列。
21.權利要求20所述的試劑盒，其中含有任意的兩個以上核酸分子，所述核酸分子為包含SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核酸分子、和/或包含SEQ IDNO515～535所示的核苷酸序列或其互補序列的核酸分子。
22.權利要求21所述的試劑盒，其中含有所有的核酸分子，所述核酸分子為包含SEQ ID NO203～238所示的核苷酸序列或其互補序列或它們的部分序列的核酸分子、和/或包含SEQ ID NO515～535所示的核苷酸序列或其互補序列的核酸分子。
23.權利要求19所述的試劑盒，該試劑盒用於進一步進行發病風險高低的預測。
24.權利要求18～23中任一項所述的試劑盒，其中使用核酸分子作為探針。
25.權利要求24所述的試劑盒，其中核酸分子為23鹼基～55鹼基。
26.權利要求24所述的試劑盒，其中探針被固定化。
27.權利要求18所述的試劑盒，其中青光眼為原發性隅角開放型青光眼簡稱POAG或正常眼壓青光眼簡稱NTG。
28.是否存在青光眼風險的判定方法，該方法包括以下步驟
步驟(i)從來自受檢者的樣品中提取核酸分子的步驟；
步驟(ii)對於上述步驟(i)中提取的核酸分子，檢測存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因的步驟，所述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列或其互補序列的至少一個核苷酸序列；
步驟(iii)根據上述步驟(ii)中檢測到的等位基因判定是否存在青光眼風險的步驟。
29.權利要求28所述的判定方法，其中步驟(iii)包括根據上述步驟(ii)中檢測到的等位基因來確定基因型的步驟。
30.權利要求28或29所述的判定方法，其中步驟(iii)包括判定上述步驟(ii)中檢測到的等位基因是否是高風險等位基因的步驟。
31.權利要求30所述的判定方法，其中步驟(iii)包括當上述步驟(ii)中檢測到的等位基因為高風險等位基因時，判定青光眼風險高的步驟。
32.核酸分子在判定青光眼風險中的應用，所述核酸分子包含選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列、或它們的部分序列，並且包含存在於上述各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型。
33.青光眼的診斷方法，該方法包括以下步驟
步驟E在來自受檢者的樣品中，在體外檢測存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型的步驟，所述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列；以及
步驟F將上述步驟E中檢測到的等位基因和/或基因型與SEQ IDNO203～514所示的核苷酸序列中包含高風險等位基因的至少一個等位基因和/或基因型進行比較的步驟；
當上述步驟E中檢測到的等位基因為上述高風險等位基因時，診斷為青光眼；或者，當上述高風險等位基因符合顯性遺傳模型、且上述步驟E中檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子或雜合子時，診斷為青光眼；當上述高風險等位基因符合隱性遺傳模型、且上述步驟E中檢測到的基因型為包含上述高風險等位基因的基因型的純合子時，診斷為青光眼。
34.青光眼發病風險的判定方法，該方法包括以下步驟
步驟(I)使用權利要求3所述的判定方法，判定是否存在青光眼發病風險的步驟；
步驟(II)在上述步驟(I)中，當根據至少任一個單核苷酸多態性判定存在發病風險時，判定需要進行進一步的風險判定的步驟；
步驟(III)在上述步驟(II)中，當判定需要進行進一步的風險判定時，使用權利要求5所述的判定方法，進一步判定是否存在青光眼發病風險的步驟。
全文摘要
本發明提供是否存在青光眼風險的判定方法，該判定方法包括以下步驟在來自受檢者的樣品中，在體外檢測存在於如下各核苷酸序列的第31位的單核苷酸多態性的等位基因和/或基因型的步驟，所述核苷酸序列為選自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一個核苷酸序列或其互補序列(步驟A)；以及將上述步驟A中檢測到的等位基因和/或基因型與SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列中包含高風險等位基因的至少一個等位基因和/或基因型進行比較的步驟(步驟B)。根據本發明的方法，通過分析樣品中的本發明的單核苷酸多態性的等位基因或基因型，可以判定樣品提供者的青光眼發病風險的高低，根據該風險，樣品提供者可以採取預防青光眼的措施、或者接受適當的治療。
文檔編號C12Q1/68GK101679970SQ200880020560
公開日2010年3月24日 申請日期2008年4月17日 優先權日2007年4月17日
發明者木下茂, 田代啟, 中野正和, 八木知人, 森和彥, 池田陽子, 谷口孝純, 景山正明 申請人:參天製藥株式會社, 木下茂, 田代啟