具有增加的產量的植物的製作方法

2024-01-21 22:01:15

專利名稱：具有增加的產量的植物的製作方法
具有增加的產量的植物本文公開的發明中提供了生產較之相應野生型植物而言具有增加的產量的植物的方法，所述方法包括在植物或其部分中增加或產生一種或多種活性。本發明還涉及增強或改善轉基因植物的一種或多種性狀的核酸，以及源於此類植物或部分的細胞、後代、種子和花粉，還涉及生產和使用此類植物細胞或植物、後代、種子或花粉的方法。特別地，所述改善的性狀顯示為增加的產量，這優選通過改善一種或多種產量相關性狀來實現。
背景技術：
在田間條件下，植物性能，例如在生長、發育、生物量積累和種子產生的方面，取決於植物對數種環境條件、改變和脅迫的耐受和順應能力。鑑於開始了農業和園藝，人們需要在作物培養中改善植物性狀。育種策略促進作物性能經受生物性和非生物性脅迫，改善養分使用效率以及改變其它內在(intrinsic)作物特定產量參數，即，通過應用技術進展增加
產量。 植物是固著性生物，其因此需要應付多種環境脅迫。一方面，生物性脅迫(例如植物害蟲和病原體)，另一方面，非生物性環境脅迫，是植物生長和生產力的主要限制因素，其由此限制植物種植和地理分布。通常，暴露給不同脅迫的植物具有低的植物材料(例如種子、果實或其它產品)產量。非生物性和生物性脅迫導致的作物損失和作物產量損失是顯著的經濟和政治因素，其導致食品短缺，特別是在很多不發達國家。現今，用於作物和園藝改善的傳統手段利用選擇性育種技術，來鑑定具有想要的特徵的植物。分子生物學的進展已經允許以特異性方式修飾植物種質。例如，在若干情況下，修飾單個基因導致例如脅迫耐受性顯著增加以及其它產量相關性狀。農業生物技術已經嘗試通過能夠增加作物產量(例如通過賦予對非生物脅迫應答的更好的耐受性或通過增加生物量)的遺傳修飾滿足人們日益增長的需要。農業生物技術員利用指示了轉基因對於作物產量的潛在影響的其它參數的量度。對於飼料作物例如苜蓿、青貯飼料玉米和乾草，植物生物量與總產量相關。但是，對於穀物作物，已經使用了其它參數來評估產量，例如植物尺寸(通過總植物乾重量測量)、地上乾重、地上鮮重、葉面積、莖體積、植物高度、蓮座直徑、葉直徑、根長度、根量、分櫱數和葉數量。早期發育階段的植物尺寸通常將與發育後期的植物尺寸相關聯。具有更大葉面積的更大的植物通常比較小植物吸收更多的光和二氧化碳，因此將可能在相同階段獲得更大的重量。對於植物大小和生長速率而言，有很強的遺傳組分，並且迄今為止在一種環境條件下的一定範圍的不同基因型的植物尺寸可能與另一種下的尺寸相關。以這種方式，使用標準環境來接近田間作物在不同地點和時間所遇到的不同的和動態的環境。表現出對一種非生物性脅迫的耐受性的植物，通常表現出對另一種環境脅迫的耐受性。尚未從機制水平了解該交叉耐受現象。然而，這樣的預期是合理的，即，預期由於轉基因的表達而表現出對低溫如嚴寒溫度和/或冰凍溫度增強的耐受性的植物，也可以表現出對乾旱和/或鹽和/或其它非生物性脅迫的耐受性。已經表徵了在植物中涉及脅迫應答、水利用和/或生物量的一些基因，但是迄今，開發具有改善的產量的轉基因作物植物的成功是受限的，並且沒有此類植物被商業化。
因此，需要鑑別賦予對多種脅迫組合的抗性或者賦予在優化的和/或次優的生長條件下改善的產量的基因。因此，在一個實施方案中，本發明 提供了生產較之相應野生型植物而言具有增加的產量的植物的方法，所述方法包括至少下述步驟在植物中增加或產生一種或多種在下文指出的亞細胞區室和組織中的選自以下的多肽的活性2-氧代戊二酸依賴性雙加氧酶、
3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- 二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L2U57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute蛋白、AT1G29250. I 蛋白、AT1G53885 蛋白、AT2G35300 蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380蛋白、AT5G47440蛋白、CDS5394蛋白、CDS5401截短蛋白、冷反應蛋白、cul I in、細胞色素P450、δ -8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白(Oxygen-evolvingenhancer protein)、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚卩密唳序列結合蛋白(Polypyrimidine tract binding protein)、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋白β亞基、絲氨酸乙醯基轉移酶、絲氨酸羥甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白。因此，本發明提供了在下文所指出的亞細胞區室和組織中過表達如表I中所鑑定的分離的多核苷酸或其同源物的轉基因植物。與植物的野生型品種相比，本發明的轉基因植物表現出改善的或增加的可收穫產量。因此，本發明提供了生產較之相應野生型植物而言具有增加的產量的植物的方法，所述方法包括選自以下的至少一種步驟(i )增加或產生下述多肽的活性，所述多肽包含表II或表IV的第5或7列分別示出的至少一種多肽基序或共有序列；(ii)增加或產生包含表I的第5或7列不出的一種或多種多核苷酸的一種或多種分離的多核苷酸的表達產物的活性。本發明還提供了用於增加作物植物產量的方法，所述方法包括下述步驟(i)增加或產生至少一種多核苷酸的表達；和/或(ii)增加或產生由至少一種多核苷酸所編碼的表達產物的表達；和/或(iii)增加或產生至少一種下述多核苷酸編碼的表達產物的一種或多種活性，其中所述多核苷酸選自(a)編碼表II第5或7列所示的多肽的分離的多核苷酸；(b)表I第5或7列所示的分離的多核苷酸；(C)分離的多核苷酸，其由於遺傳密碼的簡併性的結果，源於表II第5或7列示出的多肽序列，並且賦予較之相應(例如未經轉化的)野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；(d)分離的多核苷酸，其與表I的第5或7列所示的多核苷酸的序列具有30%或更多，例如50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、97%、98%或99% (百分比)或更多的同一性，並且，賦予較之相應(例如未經轉化的)野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；
(e)分離的多核苷酸，其編碼的多肽與(a)至(C)的分離的多核苷酸編碼的多肽的胺基酸序列具有30%或更多，例如50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、97%、98%或99%或更多的同一性，並且其具有表I第5列示出的多核苷酸代表的活性，並且，賦予較之相應(例如未經轉化的)野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；(f)分離的多核苷酸，其在嚴格雜交條件下與(a)至(C)的分離的多核苷酸雜交，並且，賦予較之相應(例如未經轉化的)野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；(g)分離的多核苷酸，其編碼的多肽可在針對(a)至(e)的一種分離的多核苷酸編碼的多肽製造的單克隆或多克隆抗體協助下被分離出來，並且其具有表I第5列示出的多核苷酸代表的活性；(h)分離的多核苷酸，其編碼包含表IV第7列所示的共有序列或一種或多種多肽基序的多肽，並且優選具有表II或IV的第5列示出的多核苷酸代表的活性；
(i)分離的多核苷酸，其編碼具有表II第5列示出的蛋白代表的活性的多肽，並且賦予較之相應(例如未經轉化的)野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；(j )分離的多核苷酸，其是使用源自表I或2的多核苷酸序列的引物通過擴增cDNA文庫或基因組文庫獲得，並且具有表II或IV第5列示出的多核苷酸代表的活性；以及(k)分離的多核苷酸，其可通過在嚴格雜交條件下用包含(a)或(b)的分離的多核苷酸的互補序列的探針或用其片段篩選合適的核酸文庫來獲得，並且編碼具有包含表II第5列示出的多肽的蛋白代表的活性的多肽，所述片段具有與(a)至(e)表徵的多核苷酸序列互補的多核苷酸的15nt或更多，優選20nt、30nt、50nt、100nt、200nt或500nt、lOOOnt、1500nt、2000nt 或 3000nt 或更多。此外，本發明涉及一種方法，用於生產較之相應(例如未經轉化的)野生型植物而言具有增加的產量的轉基因植物，包括用選自以下的分離的多核苷酸來轉化植物細胞或植物細胞核或植物組織，以產生此類植物(a)編碼表II第5或7列所示的多肽的分離的多核苷酸；(b)表I第5或7列所示的分離的多核苷酸；(C)分離的多核苷酸，其由於遺傳密碼的簡併性的結果，源於表II第5或7列示出的多肽序列，並且賦予較之相應(例如未經轉化的)野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；(d)分離的多核苷酸，其與表I的第5或7列所示的多核苷酸具有30%或更多，例如50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、97%、98%或99%或更多的同一性，並且，賦予較之相應(例如未經轉化的)野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；(e)分離的多核苷酸，其編碼的多肽與(a)至(C)的分離的多核苷酸編碼的多肽的胺基酸序列具有30%或更多，例如50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、97%、98%或99%或更多的同一性，並且其具有表I第5列示出的多核苷酸代表的活性，並且，賦予較之相應(例如未經轉化的)野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；(f)分離的多核苷酸，其在嚴格雜交條件下與(a)至(C)的分離的多核苷酸雜交，並且，賦予較之相應(例如未經轉化的)野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；
(g)分離的多核苷酸，其編碼的多肽可在針對(a)至(e)的一種分離的多核苷酸編碼的多肽製造的單克隆或多克隆抗體協助下被分離出來，並且其具有表I第5列示出的多核苷酸代表的活性；(h)分離的多核苷酸,其編碼包含表IV第7列所不的共有序列或一種或多種多肽基序的多肽，並且優選具有表II或IV的第5列示出的多核苷酸代表的活性；(i)分離的多核苷酸，其編碼具有表II第5列示出的蛋白代表的活性的多肽，並且賦予較之相應(例如未經轉化的)野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；(j)分離的多核苷酸，其使用源自表I和2中的多核苷酸序列的引物通過擴增cDNA文庫或基因組文庫獲得，並且具有表II或IV第5列示出的多核苷酸代表的活性；以及(k)分離的多核苷酸，其可通過在嚴格雜交條件下用包含(a)或(b)的分離的多核苷酸的互補序列的探針或用其片段篩選合適的核酸文庫來獲得，並且編碼具有包含表II 第5列示出的多肽的蛋白代表的活性的多肽，所述片段具有與(a)至(e)表徵的多核苷酸序列互補的多核苷酸的至少20、30、50、100、200、300、500或1000或更多nt，並且從該經轉化的植物細胞核、植物細胞或植物組織再生具有增加的產量的轉基因植物。優選實施方案的詳細描述許多產量相關表型與植物產量相關。因此，根據本發明，在表I中鑑定的基因，或其同源物可以用於增強任何產量相關表型。可以在轉基因植物和適當的對照植物的田間實驗中確定增加的產量。可選地，轉基因增加產量的能力可以在模式植物中確定。可以在田間測試或在模式植物中，通過與對照相比較測量任何一種下列表型或者任何下列表型的組合來確定增加的產量表型植物的幹可收穫部分的產量、植物的幹地上可收穫部分的產量、植物的地下幹可收穫部分的產量、植物的鮮重可收穫部分的產量、植物的地上鮮重可收穫部分的產量、植物的地下鮮重可收穫部分的產量、植物果實(鮮和幹)的產量、籽粒乾重、種子(鮮和幹)的產量等。最基本的廣量相關表型是與在植物中作為轉基因的基因或其同源物存在相關的增加的產量，即植物的內在產量。植物的內在產量能力例如，在田間測試或模式系統中可通過表明下述來表現種子產量改善(例如，在增加種子/籽粒大小、增加穗數、增加每穗種子數、改善種子飽滿、改善種子組成、改善胚和/或胚乳等方面)；植物固有生長和發育機制(例如植物高度、植物生長速率、莢果數、莢果在植物上的位置、節間數、莢果破碎發生率、結瘤作用(nodulation)和氮固定效率、碳同化效率)的修飾和改善、幼苗活力/早期萌發勢(early vigour)改善、增強的萌發效率(在非脅迫條件下)、植物構造改善。增加的產量相關表型也可以被測量以確定對非生物環境脅迫的耐受性。非生物脅迫包括乾旱、低溫、鹽度、滲透壓、遮蔽、高植物密度、機械脅迫和氧化脅迫，並且產量相關的表型涵蓋在對此類非生物脅迫的耐受性中。可以監控以確定對非生物環境脅迫的增強的耐受性的其它表型包括但不限於萎蔫、葉變成褐色、導致葉或針葉莖和花下垂的失去膨壓、葉或針葉下垂和/或脫落、葉為綠色，但葉面角與對照相比稍朝向地面、葉片開始內卷(捲曲)、葉或針葉過早衰老、葉或針葉中喪失葉綠素和/或變黃。可以在田間測試或在模式植物中監控上文描述的任何產量相關表型以證明該轉基因植物具有增加的非生物環境脅迫耐受性。根據本發明，在表I中鑑定的基因或其同源物，可以用於在植物遇到非生物環境脅迫時，增強植物中的對非生物環境脅迫的耐受性。定義根據本發明的「產量增加活性」是指選自以下的活性2_氧代戊二酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- 二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L2U57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute蛋白、AT1G29250. I 蛋白、AT1G53885 蛋白、AT2G35300 蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380蛋白、AT5G47440蛋白、CDS5394蛋白、CDS5401截短蛋白、冷反應蛋白、cul I in、細胞色素P450、δ -8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋白β亞基、絲氨酸 乙醯基轉移酶、絲氨酸羥甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白。賦予產量增加活性的多肽可以被表I，第5或7列所示的核酸序列編碼，和/或包含表II第5和7列所述的多肽或由所述多肽組成，和/或可以用表III第7列所示的引物組擴增。本文使用的「轉基因植物」指含有插入其核基因組或細胞器基因組的外源核苷酸序列的植物。其還包括後代，即Τ1、Τ2和後續世代，或者BC1、BC2和後續世代，及其與非轉基因植物或其他轉基因植物的雜種。對環境脅迫例如乾旱、熱、養分耗盡、冰凍和/或嚴寒溫度的「改善的適應性」在本文是指導致增加的產量，特別是在一種或多種如上文更詳細限定的產量相關性狀方面的改善的植物性能。修飾，S卩，增加，可通過內源或外源因素導致。例如，在生物或其部分中活性的增加可通過向介質或營養物中添加基因產物或前體或激活子或激動劑來導致，或者通過將所述物質瞬時或穩定引入生物中來導致。此外，此類增加可通過將本發明的核酸序列或編碼蛋白引入正確的細胞區室來實現，所述區域例如分別是細胞核或胞質或引入質體，這可通過轉化和/或靶向來實現。就本發明描述的目的而言，術語「細胞質」和「非靶向」將表示，本發明的核酸在不添加非天然轉運肽編碼序列的情況下表達。非天然轉運肽編碼序列是這樣的序列其並非本發明核酸(例如表I第5或7列示出的核酸)的天然部分，而是通過分子操作步驟(例如實施例中「質體靶向表達」 一節描述的那些步驟)添加的。因此，術語「細胞質」和「非靶向」將不排除本發明的核酸序列的產物通過其天然存在的序列性質在轉基因生物背景中祀向定位到任何細胞區室。技術人員可使用軟體工具，例如TargetP (Emanuelsson等人，(2000)，Predicting sub-cellular localization of proteins based on theirN-terminal amino acid sequence. , J. Mol. Biol. 300, 1005-1016. )、ChloroP(Emanuelsson等人(1999)，ChloroP, a neural network-based method for predicting chloroplasttransit peptides and their cleavage sites. , Protein Science, 8:978-984.)或其它預測軟體工具(Emanuelsson 等人(2007)，Locating proteins in the cell usingTargetP, SignalP, and related tools. , Nature Protocols 2，953-971)針對生物(植物)預測源於併入的序列的成熟多肽的亞細胞定位。本發明的術語「細胞器」表示例如「線粒體」或「質體」。本發明的術語「質體」旨在包括多種形式的質體，包括前質體、葉綠體、色質體、gerontoplast、白色體、造粉體、油質體和黃化質體，優選葉綠體。它們都具有共同的祖先——前述的前質體。本說明書上下文中的術語「引入」指通過「轉染」、「轉導」或優選通過「轉化」將核酸序列插入生物中。如果核酸序列被引入質體中(即，該序列已穿過該質體的膜)，則該質體(例如葉綠體)被該外源(優選外來的)核酸序列「轉化」。所述外源DNA可整合進(共價連接進)組成該質體基因組的質體DNA中，或者可以保持不被整合(例如,通過包含葉綠體複製起點)。「穩定」整合的DNA序列是這樣的序列，它們在質體複製中遺傳，從而將帶有所整合DNA 序列之特徵的新質體轉移至後代中。在本文中使用時，「植物」表示不僅包括整株植物，還包括其部分，S卩，一個或多個細胞和組織，這包括，例如，葉、莖、枝條、根、花、果實和種子。術語「產量」在本文中使用時一般指來自植物(特別是作物)的可測量的產出(produce)0可以以多種方法來測量產量和產量增加(較之未經轉化的起始或野生型植物)，應當理解，技術人員將能考慮到特別的實施方案、關注的特別的作物和關注的特定目的或應用，應用正確的理解。術語「改善的產量」或「增加的產量」可以互換使用。在本文中使用時，術語「改善的產量」或術語「增加的產量」是指任何可測量的植物產出(例如籽粒、果實或纖維)的產量的任何改善。根據本發明，不同表型性狀的改變可以改善產量。例如而非限制的，參數例如花器官發育、根起始、根生物量、種子數、種子重量、收穫指數、對非生物環境脅迫的耐受性、葉形成、向光性、頂端優勢和果實發育是合適的改善的產量的量度。增加的產量包括更高的果實產量、更高的種子產量、更高的鮮物質產出和/或更高的乾物質產出。根據本發明，任何產量的增加是改善的產量。例如，產量的改善可以包括0. 1%、
0.5%、1%、3%、5%、10%、15%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90% 或更多的任何測量的參數的
增加。例如，與在相同條件下栽培的未處理的大豆或玉米的bu/英畝產量相比，源自包含對於表I的核苷酸和多肽是轉基因的植物的作物的大豆或玉米的bu/英畝產量的增加是根據本發明的改善的產量。增加的或改善的產量可以在脅迫條件存在或不存在時實現。例如，增強或增加的「產量」指選自以下的一種或多種產量參數生物量產量、幹生物量產量、地上幹生物量產量、地下幹生物量產量、鮮重生物量產量、地上鮮重生物量產量、地下鮮重生物量產量；可收穫部分的增強的產量，其可以是乾重或鮮重或兩者，地上或地下或兩者；增強的作物果實的產量，其可以是乾重或鮮重或兩者，地上或地下或兩者；以及優選地，增強的種子的產量，其可以是乾重或鮮重或兩者，地上或地下或兩者。在本文將「作物產量」定義為每英畝收穫的相關農業產物(例如籽粒、飼料或種子)的蒲式耳數。作物產量受到非生物脅迫，例如乾旱、熱、鹽度和冷脅迫，以及植物大小(生物量)的影響。植物產量可取決於每種特別情況下感興趣的特定植物/作物以及感興趣的其意欲應用(例如，食物生產、飼料生產、經加工食物生產、生物燃料、生物氣或乙醇生產等等)。因此，在一種實施方案中，產量被計算為收穫指數(表示為各可收穫部分的重量除以總生物量的比例)、每面積(英畝、平方米等)的可收穫部分重量，等等。收穫指數是產量生物量與收穫時總累積的生物量的比例。收穫指數在許多環境條件下是相對穩定的，並且因此在植物尺寸和籽粒產量之間的穩健相關是可能的。如同非生物脅迫耐受性一樣，在生長室或溫室中的標準化條件下的早期發育中植物尺寸的量度是測量由轉基因存在所賦予的潛在產量優勢的標準實踐。因此，植物的產量可以通過改善一種或多種產量相關表型或性狀來增加。其改善導致增加的產量的植物的此類產量相關表型或性狀包括而非限於，植物的內在產量能力的增加、改善的養分使用效率和/或增加的脅迫耐受性。例如,產量指生物量產量,例如,乾重生物量產量和/或鮮重生物量產量。生物量產量指植物的地上或地下部分，這取決於特定情況(測試條件、感興趣的特定作物、感興趣的應用，等等)。在一種實施方案中，生物量產量指地上和地下部分。生物量產量可作為鮮重、乾重或基於經調整的溼度來計算。生物量產量可基於每株植物來計算，或者可相對於特定面積來計算(例如，每英畝/平方米/或等等的生物量產量)。「產量」還指種子產量，其可通過下述一種或多種參數來測量種子數量或飽滿種子數量(每株植物或每面積(英畝/平方米等等));種子飽滿率(飽滿的種子數和種子總數之間的比例)；每株植物的花數；種子生物量或總種子重量(每株植物或每面積(英畝/平方米等等))；千粒重(TKW ;從計數的飽滿種子數及其總重量外推的；TKW的增加可能是增加的種子尺寸、增加的種子重量、增加的胚尺寸和/或增加的胚乳導致的)。本領域還已知其它一些測量種子產量的參數。可以基於乾重或鮮重來測定種子產量，或者通常，基於經調整的溼度來測定，例如，以15. 5百分比溼度進行。例如，術語「增加的產量」是指植物較之相應的野生型植物而言，例如在非生物環境脅迫存在或不存在的情況下，表現出增加的生長速率。 增加的生長速率可通過例如增加的整株植物生物量生產或增加的植物地上部分生物量生產或增加的植物地下部分生物量生產或增加的植物的部分(例如莖、葉、花、果實和/或種子)的生物量生產來表現，或增加的生長速率可賦予增加的整株植物生物量生產或增加的植物地上部分生物量生產。延長的生長包含在未經轉化的野生型生物顯示可視的缺陷症狀和/或死亡時，植物存活和/或繼續生長。當本發明的植物是玉米植物時，對於玉米植物而言增加的產量意味著例如，增加的種子產量，特別是對於用於飼料或食物的玉米品種而言。玉米的增加的種子產量是指增加的粒(kernel)尺寸或重量，每穗增加的粒，或每株植物增加的穗。可選地或額外地，可以增加穗軸產量，或增加穗軸的長度或尺寸，或改善每穗軸的粒的比例。當本發明的植物是大豆植物時，對於大豆植物而言的增加的產量意味著增加的種子產量，特別是對於用於飼料或食物的大豆品種而言。大豆的增加的種子產量是指例如增加的粒尺寸或重量、增加的每莢果的粒或增加的每株植物的莢果。當本發明的植物是油菜(oil seed rape (OSR))植物時，對於OSR植物而言的增加的產量意味著增加的種子產量，特別是對於用於飼料或食物的OSR品種而言。OSR的增加的種子產量是指增加的種子尺寸或重量、增加的每長角果的種子數或增加的每株植物的長角果O當本發明的植物是棉花植物時，對於棉花植物而言增加的產量意味著增加的棉絨產量。棉花的增加的棉絨產量在一個實施方案是指增加的棉絨長度。所述增加的產量通常可以通過增強或改善一種或多種植物的產量相關性狀來實現。此類植物的產量相關性狀包括，而非限於，植物的內在產量能力的增加，改善的養分使用效率，和/或增加的脅迫耐受性，特別是增加的非生物脅迫耐受性。內在產量能力可例如表現為改善特定(內在)種子產量(例如，在增加種子/籽粒大小、增加穗數、增加每穗種子數、改善種子飽滿、改善種子組成、改善胚或胚乳等方面)；修飾和改善植物的固有生長和發育機制(例如植物高度、植物生長速率、莢果數、莢果在植物上的位置、節間數、莢果破碎發生率、結瘤作用(nodulation)和氮固定效率、碳同化效率、幼苗活力/早期萌發勢(early vigour)、增強的萌發效率(在脅迫或非脅迫條件下)、植物構造 改善、細胞周期修飾、光合作用修飾、多種信號傳導途徑修飾、對轉錄調控的修飾、對翻譯調控的修飾、對酶活性的修飾等)；等等。植物脅迫耐受性的改善或增加可例如表現為改善或增加植物對脅迫(特別是非生物性脅迫)的耐受性。在本申請中，非生物性脅迫通常指植物通常面對的非生物性的環境條件，其包括但不限於，乾旱(對乾旱的耐受可作為改善的水使用效率的結果獲得)、熱、低溫和寒冷條件(例如冰凍和嚴寒條件)、鹽度、滲透脅迫、遮蔽、高植物密度、機械脅迫、氧化脅迫等等。也可以通過增加「植物的養分使用效率」來介導增加的植物產量，這例如通過改善養分(包括但不限於磷、鉀和氮)的使用效率。此外，更高的產量也可以用氮使用的現有或標準水平獲得。通常，術語「增加的脅迫耐受性」可被定義為較之未經轉化的野生型或起始植物而言，在脅迫條件下植物的存活和/或更高的產量生產。例如，本發明的或根據本發明的方法產生的植物更好地適應脅迫條件。在其生命周期中，植物通常要面對多樣環境條件。在某些情況下可能對植物產量造成影響的任何此類條件在本文中都被稱為「脅迫」條件。環境脅迫通常可分為生物性和非生物性(環境)脅迫。不利的養分條件一些時候也被稱為「環境脅迫」。本發明也包括針對這類環境脅迫的解決方案，例如，在增加的養分使用效率的方面。就本發明描述的目的而言，術語「增強的非生物性脅迫耐受性」、「增強的非生物性環境脅迫抗性」、「增強的環境脅迫耐受性」、「改善的環境脅迫適應性」和與其含義類似的其它變化和表達可互換使用，它們用於表示(但不限於)較之相應原始或野生型植物或其部分而言，對本文所述的一種或多種非生物性環境脅迫的耐受性的改善。術語非生物性脅迫耐受性指，例如，低溫耐受性、乾旱耐受性或改善的水使用效率(WUE)、熱耐受性、鹽脅迫耐受性等等。也使用植物對於脫水、滲透衝擊和溫度極限的響應的研究來確定植物對非生物脅迫的耐受性或抗性。水使用效率(WUE)是通常與乾旱耐受性相關的參數。在選擇用於改善作物的性狀中，減少水使用而不改變生長將在灌溉農業系統(其中水輸入耗費高)中具有特別的優點。生長增加而無水使用的相應上漲將對所有農業系統具有應用性。在許多水供應不受限的農業系統中，生長的增加(即使其在水使用增加的代價下獲得)也增加了產量。
乾旱脅迫意味著導致在植物中缺少水或者對植物的水供應減少的任何環境脅迫，包括低溫和/或鹽的次級脅迫，和/或在乾旱或熱期間的初級脅迫，例如脫水等。除非另有指明，術語「多核苷酸」、「核酸」和「核酸分子」在本文上下文中可互換使用。除非另有指明，術語「肽」、「多肽」和「蛋白/蛋白質」在本文上下文中可互換使用。術語「序列」可涉及多核苷酸、核酸、核酸分子、肽、多肽和蛋白，這取決於術語「序列」所使用的上下文。術語「基因」、「多核苷酸」、「核酸序列」、「核苷酸序列」或「核酸分子」在本文中使用時表示任何長度的核苷酸(核糖核苷酸或脫氧核糖核苷酸)的聚合形式。術語「基因」、「多核苷酸」、「核酸序列」、「核苷酸序列」或「核酸分子」在本文中包括已知類型的修飾，例如，甲基化、「帽」、用類似物對一個或多個天然存在的核苷酸的取代。優選地，DNA或RNA序列包含編碼本文定義的多肽的編碼序列。也如本文使用的術語「核酸」和「核酸分子」旨在包括DNA分子(如cDNA或基因組DNA)和RNA分子(如mRNA)以及使用核苷酸類似物產生的DNA或RNA類似物。核酸分子可以是單鏈的或雙鏈的。「分離的」核酸分子是與該核酸天然來源中存在的其他核酸分子基本分開的核酸·分子。這意味著，所存在的其他核酸分子的量為所需核酸量的少於5%重量，優選少於2%重量，更優選少於1%重量，最優選少於O. 5%重量。優選地，「分離的」核酸不含該核酸來源生物的基因組DNA中天然位於該核酸側翼的一些序列(即位於該核酸5』和3』末端的序列)。例如，在多個實施方案中，分離的產量增加(例如低溫抗性和/或耐受性相關)蛋白質的編碼核酸分子可含有該核酸來源細胞的基因組DNA中天然位於該核酸分子側翼的少於約5kb、4kb、3kb、2kb、lkb、0. 5kb或O. Ikb核苷酸序列。此外，「分離的」核酸分子(例如cDNA分子)可不含一些與其天然相關的其他細胞材料，或者在通過重組技術產生的情況下不含培養基，或者在化學合成的情況下不含化學前體或其他化學物質。「編碼序列」是核苷酸序列，其被放置於合適的調控序列控制之下時，轉錄為RNA，例如調控RNA,例如miRNA、ta-siRNA、共遏制(cosuppression)分子、RNAi、核酶等等,或者轉錄為mRNA (其被翻譯為多肽)。編碼序列的邊界由5』末端的翻譯起始密碼子和3』末端的翻譯終止密碼子確定。編碼序列可包括但不限於mRNA、cDNA、重組核苷酸序列或基因組DNA,在某些情況下還可存在內含子。在本文上下文中使用時，核酸分子還可包括位於編碼基因區域3』和5』端的非翻譯序列，例如，位於編碼區域5』端上遊的2000，優選更少，例如500，優選200，尤其優選100個核苷酸的序列以及位於編碼基因區域3』端下遊的例如300，優選更少，例如100，優選50，尤其優選20個核苷酸的序列。「多肽」指胺基酸的聚合物(胺基酸序列)，其並不指代特定長度的分子。因此，多肽的定義內也包括肽和寡肽。該術語還表示或包括對多肽的翻譯後修飾，例如糖基化、乙醯化、磷酸化等等。該定義還包括，例如，含有一個或多個胺基酸類似物(包括例如，非天然胺基酸等等)的多肽、具有經取代的連接以及本領域已知的其它修飾(天然存在的和非天然存在的)的多肽。「分尚的」多核苷酸或核酸分子與該核酸分子天然來源中所存在的其他多核苷酸或核酸分子分開。分離的核酸分子可以是若干kb的染色體片段，或者優選是僅包含基因編碼區的分子。因此，本發明的分離的核酸分子可包含5』和3』的鄰近染色體區或其他鄰近染色體區，但優選不包含該核酸分子來源生物的基因組或染色體環境中天然位於該核酸分子序列側翼的此類序列(例如鄰近編碼核酸分子5』和3』 UTR的區域的序列)。「分離的」或「純化的」多肽或其生物活性部分在通過重組DNA技術產生時不含某些細胞性材料，或在通過化學合成時不含化學前體或其它化學品。詞組「基本不含細胞性材料」包括這樣的蛋白質製品，在所述製品中該多肽與從其中天然或重組地產生此多肽的細胞的某些細胞組分分開。術語「表I」或「表I」 在本申請文件中用來指代表IA和表IB的內容。術語「表II 」在本申請文件中用來指代表IIA和表IIB的內容。術語「表IA」在本申請文件中用來指代表IA的內容。術語「表IB」在本申請文件中用來指代表IB的內容。術語「表IIA」在本申請文件中用來指代表IIA的內容。術語「表IIB」在本申請文件中用來指代表IIB的內容。用於本申請文件中時，術語「包含」或其各種詞性及其語法變化用來表示所指出的特徵、整數、步驟或組分或其組的存在，但並不排除一種或多種其它特徵、整數、步驟、組分或其組的存在或加入。根據本發明，如果蛋白質或多肽的從頭活性或其表達增加直接或間接導致並賦予與相應例如未轉化的野生型植物相比增加的產量(例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一增加的產量相關性狀)，並且該蛋白質具有上述表II第3列所示蛋白質的活性，則該蛋白質或多肽具有「表II第3列所示蛋白質的活性」。在本申請文件全篇中，如果蛋白質或多肽或者編碼這些蛋白質或多肽的核酸分子或序列仍具有表II第3列所示蛋白質的生物活性或酶活性，或者與表II第3列所示釀酒酵母(S. cerevisiae)或大腸桿菌(E. coli)或集胞藻(Synechocystis sp.)或擬南芥(A. thaliana)的蛋白質相比具有原始酶活性的10%或更多、優選20%、30%、40%、50%、特別優選60 %、70 %、80 %、最特別優選90 %、95 %、98 %、99 %或更多，則它們的活性(優選生物活性)是相同或相似的。在另一個實施方案中，表II第3列中所示蛋白質的生物活性或酶活性與表I I第3列中所示釀酒酵母或大腸桿菌或集胞藻或擬南芥的蛋白質相比具有原始酶活性的100%或更多、優選110%、120%、130%、150%、特別優選150%、200%、300%或更多。術語「增加」、「升高」、「延長」、「增強」、「改善」或「擴增」涉及植物、生物、生物部分(例如組織、種子、根、葉、花等)或細胞中特性的相應改變，並可互換使用。優選地，如果增加或增強涉及基因產物活性的增加或增強，則體積中的總活性是增加或增強的，無論基因產物的量或者基因產物的比活性或二者同時是否增加或增強，還是編碼該基因產物的核酸序列或基因的量、穩定性或翻譯效率是否增加或增強。術語「增加」涉及生物或植物、生物的部分(例如組織、種子、根、葉、花等)或細胞中特性的相應改變。優選地，在增加涉及基因產物活性增加的情況下，體積中的總活性是增加的，無論基因產物的量或者基因產物的比活性或二者同時是否增加或產生，或者編碼該基因產物的核酸序列或基因的量、穩定性或翻譯效率是否增加。術語「增加」包括所述特性僅在本發明對象的一部分中改變，例如，修飾可見於細胞區室(如細胞器)中或植物的一部分(如組織、種子、根、葉、花等)中，但在測試整體對象(即完整的細胞或植物)時則檢測不到。因此，術語「增加」指酶的比活性以及化合物或代謝物(例如本發明的多肽、核酸分子或者編碼mRNA或DNA)可在一定體積中增加。術語「增加」包括將化合物或活性(特別是活性)從頭引入細胞、細胞質或亞細胞區室或細胞器中，或者該化合物或活性(特別是活性)之前檢測不到，換言之，「產生」 了該化合物或活性。因此，在下文中，術語「增加」還包括術語「產生」或「刺激」。增加的活性表現為與相應的例如未轉化野生型植物細胞、植物或其部分相比產量增加，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一增加的產量相關性狀。「特性的改變」應理解為特定體積中基因產物的活性、表達水平或量或代謝物含量相對於相應體積的對照、參照或野生型相比發生改變，包括從頭產生活性或表達。「蛋白質或mRNA的量」應理解為指生物(特別是植物)、組織、細胞或細胞區室中多肽或mRNA分子的分子數。蛋白量的「增加」指與野生型、對照或參照相比，生物(特別是植物)、組織、細胞或細胞區室(例如細胞器如質體或線粒體或其部分)中所述蛋白質分子數的定量增加，例如通過下述方法之一增加。分子數的增加總計優選為1%或更多，優選10%或更多，更優選30%或更高，特別 優選50%、70%或更高，非常特別優選100%，最優選500%或更高。然而從頭產生的表達也認為是本發明的主題。術語「野生型」、「對照」或「參照」可互換使用，並可以是未根據本發明所述方法進行修飾或處理的細胞或生物部分(例如細胞器，如葉綠體)或組織或生物，特別是植物。因此，用作野生型、對照或參照的細胞或生物部分(例如細胞器，如葉綠體)或組織或生物(特別是植物)儘可能地與該細胞、生物、植物或其部分對應，並且在除本發明方法之結果以外的任何其他特性均儘可能地與本發明的主題相同。因此，相同或儘可能相同地處理所述野生型、對照或參照，即，僅有不影響測試特性的品質的條件或特性可以不同。優選地，在類似條件下進行任何比較。術語「類似條件」指所有條件(例如培養條件或生長條件、土壤、養分、土壤含水量、溫度、周圍空氣或土壤的溼度、測定條件(如緩衝液組成、溫度、底物、病原體菌株、濃度等))在待比較的實驗之間均保持一致。「參照」、「對照」或「野生型」優選為這樣的對象，例如細胞器、細胞、組織、生物，特別是植物其未以本發明方法進行修飾或處理，並且任何其他特性均儘可能地與本發明的主題相似。參照、對照或野生型在其基因組、轉錄物組、蛋白質組或代謝物組方面與本發明的主題儘可能地相似。優選地，術語「參照」、「對照」或「野生型」細胞器、細胞、組織或生物(特別是植物)指這樣的細胞器、細胞、組織或生物(特別是植物)其與本發明的細胞器、細胞、組織或生物(特別是植物)或其部分在遺傳上近乎相同，優選90%或更多，例如95%，更優選 98%，甚至更優選 99. 00%，特別是 99. 10%,99. 30%,99. 50%,99. 70%,99. 90%,99.99%、99.999%或更多。最優選地，「參照」、「對照」或「野生型」是與本發明方法中所用生物(特別是植物)、細胞、組織或細胞器在遺傳上相同的細胞器、細胞、組織、生物(特別是植物)，只是導致或賦予活性的核酸分子或它們編碼的基因產物根據本發明方法被修改、操作、更換或引入。如果無法提供與本發明主題的差異僅為不是本發明方法之對象的對照、參照或野生型的情況下，對照、參照或野生型可以是這樣的生物，其中賦予與相應例如未轉化野生型植物細胞、植物或其部分相比增強的對非生物性環境脅迫的耐受性和/或產量增加的活性調節的原因或者本文所述的本發明核酸分子的表達已被調回或關閉，例如通過敲除負責基因產物的表達，例如通過反義或RNAi或miRNA抑制,通過使激活劑或激動劑失活，通過使抑制劑或拮抗劑活化，通過加入抑制性抗體實現抑制，通過加入活性化合物(如激素)，通過引入負顯性突變體等。例如，基因產生可通過引入失活性點突變來進行敲除，所述點突變導致酶活性抑制或者去穩定或者抑制結合輔因子的能力等。因此，優選的參照對象是本發明方法的起始對象。優選地，本發明的參照和主題在標準化和歸一化後進行比較，例如以總RNA、DNA或蛋白質的量或者參照基因(如持家基因，如泛素、肌動蛋白或核糖體蛋白)的活性或表達進行標準化和歸一化。術語「表達」指編碼基因區段或基因的轉錄和/或翻譯。通常，所得產物是mRNA或蛋白質。本發明的增加或調節可以是組成型的，例如由於穩定的永久性轉基因表達，或者編碼本發明核酸分子的相應內源基因中的穩定突變，或者調節賦予本發明多肽表達之基因的表達或行為；或者可以是暫時的，例如由於瞬時轉化或者暫時加入調節劑(如激動劑或拮抗劑)；或者可以是誘導型的，例如用帶有誘導型啟動子控制之下的本發明核酸分子的誘導型構建體轉化，並加入誘導物，例如四環素或下文所述。 對基因或其基因產物的調節影響較低應理解為該降低的酶活性調節導致該基因或其產物的比活性或細胞活性增加。酶活性增加應理解為指酶活性與起始生物相比增加10%或更多，有利地20%、30%或40%或更多，特別有利地50%、60%或70%或更多。這導致與相應的例如未轉化的野生型植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀。優選地，細胞、組織、細胞器、器官或生物(優選是植物)或其部分中多肽的活性與對照、參照或野生型相比的增加總計為5 %或更多，優選20 %或50 %，特別優選70 %、80 %、90%或更高，非常特別優選至少100%、150%或200%，最優選250%或更高。在一個實施方案中，術語「增加」指相對於所述生物或其部分之重量的量增加(w/w)。「載體」指除質粒以外本領域技術人員已知的所有其他載體，例如噬菌體；病毒如SV40、CMV、杆狀病毒、腺病毒；轉座子；IS元件；噬粒；噬菌粒；粘粒；線性或環狀DNA。這些載體可在宿主生物中自主複製或隨染色體複製，優選隨染色體複製。本文使用的術語「載體」指能運輸與其相連的其他核酸的核酸分子。載體的一種類型是「質粒」，指其中可連接其他DNA區段的雙鏈DNA環。另一種類型的載體是病毒載體，其中其他DNA區段可連接到病毒基因組中。某些載體能在其所引入的宿主細胞中自主複製(例如，具有細菌複製起點的細菌載體和附加型哺乳動物載體)。其他載體(例如非附加型哺乳動物載體)在引入宿主細胞後整合進宿主細胞或細胞器的基因組中，從而與宿主或細胞器的基因組一起複製。此夕卜，某些載體能指導與其有效連接的基因表達。這樣的載體稱為「表達載體」。一般而言，重組DNA技術中使用的表達載體一般為質粒形式。在本說明書中，「質粒」和「載體」可互換使用，因為質粒是最普遍使用的載體形式。然而，本發明旨在包括發揮等同功能的這些其他形式表達載體，例如病毒載體(例如複製缺陷型逆轉錄病毒、腺病毒和腺伴隨病毒)。在本文中使用時，「有效連接」旨在表示目的核苷酸序列與調節序列以允許表達該核苷酸序列(例如，在體外轉錄/翻譯系統中或當該載體引入宿主細胞的情況下為在宿主細胞中)的方式連接。術語「調節序列」旨在包括啟動子、增強子和其他表達控制元件(例如多腺苷酸化信號)。這些調節序列描述於例如Goeddel, Gene ExpressionTechnology:Methods in Enzymology 185,Academic Press, San Diego,CA(1990)以及Gruber 和 Crosby, :Methods in Plant Molecular Biology and Biotechnology, Glick和Thompson 編輯，第 7 章，89-108，CRC Press; Boca Raton, Florida,包括其參考文獻。調節序列包括指導核苷酸序列在許多宿主細胞類型中組成型表達的調節序列以及指導核苷酸序列僅在某些宿主細胞或在某些條件下表達的調節序列。「轉化」在本文中定義為將異源DNA引入植物細胞、植物組織或植物的方法。這可在天然或人工條件下使用本領域熟知的多種方法來進行。轉化可依賴於將外源核酸序列插入原核或真核宿主細胞的任何已知方法。基於所轉化的宿主細胞來選擇方法，包括但不僅限於病毒感染、電穿孔、脂轉染和微粒轟擊。這些「轉化」細胞包括穩 定轉化的細胞，其中所插入的DNA能作為自主複製質粒複製，或作為宿主染色體的一部分複製。它們也包括在有限的時間內瞬時表達所插入DNA或RNA的細胞。轉化的植物細胞、植物組織或植物應理解為不僅包括轉化方法的終產物，而且還包括其轉基因後代。術語「轉化的」、「轉基因的」和「重組的」指已引入異源核酸分子的宿主生物，例如細菌或植物。所述核酸分子可穩定整合進宿主的基因組中，或者該核酸分子也可作為染色體外的分子存在。這樣的染色體外分子可以自主複製。轉化的細胞、組織或植物應理解為不僅包括轉化方法的終產物，而且還包括其轉基因後代。「非轉化的」、「非轉基因的」或「非重組的」宿主指不含有異源核酸分子的野生型生物，例如細菌或植物。術語「宿主生物」、「宿主細胞」、「重組(宿主)生物」和「轉基因(宿主)細胞」可互換使用。當然，這些術語不僅涉及特定的宿主生物或具體的靶細胞，而且還涉及這些生物或細胞的後代或潛在後代。由於突變或環境效應，可以在後續世代中產生某些改變，因此這些後代不一定與親本細胞相同，但仍包括在本文使用的該術語中。就本發明目的而言，「轉基因」或「重組」指例如含有本發明核酸序列的核酸序列、表達盒(=基因構建體、核酸構建體)或載體，或者以本發明所述核酸序列、表達盒或載體轉化的生物，所有這些構建通過遺傳工程方法產生，其中(a)表I第5列或第7列中所示核酸序列或其衍生物或部分；或(b)與(a)所述核酸序列功能性連接的遺傳控制序列，例如3』和/或5』遺傳控制序列，例如啟動子或終止子，或(c) (a)和(b)不在其天然遺傳環境中，或者已通過遺傳工程方法進行了修飾，所述修飾可以是例如取代、添加、缺失、倒位或插入一個或多個核苷酸殘基。「天然遺傳環境」指來源生物或宿主生物中的天然基因組或染色體基因座或者在基因組文庫中存在。對於基因組文庫的情況，核酸序列的天然遺傳環境優選至少在一定程度上保留。該環境在核酸序列的至少一側，並且序列長度為至少50bp，優選至少500bp，特別優選至少IOOObp,最特別優選至少5000bp。天然發生的表達盒(例如本發明核酸序列的天然啟動子與相應基因的天然組合)在所述基因經非天然合成(「人工」)方法(例如誘變)修飾時成為轉基因表達盒。已經描述了合適的方法，例如US5，565，350或WO 00/15815。本發明使用的術語「轉基因植物」還指轉基因植物的後代，例如VT2、T3和後續的植物世代或者BCp BC2, BC3和後續的植物世代。因此，可以產生本發明的轉基因植物，並且自交或者與其他個體雜交，以獲得其他本發明的轉基因植物。還可通過無性繁殖轉基因植物細胞來獲得轉基因植物。本發明還涉及來自於本發明轉基因植物群的轉基因植物材料。這些材料包括植物細胞和某些組織、器官和植物部分的所有表現形式，例如種子、葉、花葯、纖維、塊莖、根、根毛、莖、胚、愈傷組織、子葉、葉柄、收穫材料、植物組織、繁殖組織和細胞培養物，它們來自於實際的轉基因植物和/或可用於產生轉基因植物。根據本發明獲得的任何轉化植物可用於常規育種方案或體外植物繁殖，以產生更多具有相同特徵的轉化植物和/或可用於將同一特徵引入相同或相關物種的其他品種中。這些植物也可以是本發明的一部分。得自轉化植物的種子一般也含有相同的特徵，並且也是本發明的一部分。如上文所述，本發明基本上可用於可以本領域技術人員已知的任何轉化方法進行轉化的任何植物和作物。術語「同源性」指各個核酸分子或所編碼的蛋白質在功能和/或結構上是等同的。例如，與上述核酸分子同源或者作為所述核酸分子之衍生物的核酸分子是所述核酸分子的變異，其中代表具有相同生物功能(特別是編碼具有相同或基本相同的生物功能的蛋白質)的修飾。它們可以是天然發生的變異，例如來自其他植物品種或物種的序列，或者是突變。這些突變可天然發生，或者可通過誘變技術獲得。等位基因變異可以天然發生的等位 基因變體以及合成產生的或遺傳工程產生的變體。例如，結構等價物可通過測試所述多肽 與抗體的結合或者通過基於計算機的預測來鑑定。結構等價物具有相似的免疫學特徵，例如包含相似的表位。本文使用的術語「基因」和「重組基因」指這樣的核酸分子，其包含編碼本發明多肽的可讀框，或者包含本發明的核酸分子，或者編碼本發明方法中所用的多肽，優選來自作物植物或者來自可用於本發明方法的微生物。這些天然變異一般可導致基因的核苷酸序列中I至5%的變異。本發明範圍中旨在包括編碼本發明多肽或包含本發明核酸分子的基因中的任何及所有核苷酸變異及其引起的胺基酸多態性，這些變異由於天然變異而產生，並且不改變所述功能活性。特定實施方案因此，本發明提供了測量和方法以產生具有增加的產量(例如在表達或過表達時賦予增加的產量相關性狀，例如增強的非生物環境脅迫耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一增加的產量相關性狀的基因)的植物。因此，本發明提供了源自植物的基因。特別地，來自植物的基因描述在表I或II的第5列以及第7列中。因此，本發明提供了與相應的原始或野生型植物相比表現出一種或多種改善的產量相關性狀的轉基因植物，以及產生此類具有增加的產量的轉基因植物的方法。根據本發明通過在轉基因植物中增加或產生一種或多種活性來增加一種或多種增強的產量相關表型，其中活性選自，在如本文所示的(例如在表I第6列)所述植物亞細胞區室和/或組織中的2-氧代戊二酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- 二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute 蛋白、AT1G29250. I 蛋白、AT1G53885 蛋白、AT2G35300 蛋白、AT3G04620蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、CDS5394 蛋白、CDS5401 截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、δ-8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋白β亞基、絲氨酸乙醯基轉移酶、絲氨酸羥甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白活性。本發明的或根據本發明使用的核酸分子編碼賦予選自以下的多肽活性的蛋白質2-氧代戊二酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、
4-二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含ΑΡ2結構域的轉 錄因子、argonaute 蛋白、AT1G29250. I 蛋白、AT1G53885 蛋白、AT2G35300 蛋白、AT3G04620蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、CDS5394 蛋白、CDS5401 截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、δ-8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubiSC0亞基結合蛋白β亞基、絲氨酸乙醯基轉移酶、絲氨酸羥甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白，即賦予「產量增加活性」。因此，在一個實施方案中，本發明涉及編碼具有產量增加活性的多肽的核酸分子，所述多肽由表I第5或7列中所示的核酸序列所編碼、和/或是包含表II第5和7列所示的多肽的蛋白質或者由表II第5和7列所示的多肽組成的蛋白質、和/或可以用表III第7列所示的引物組擴增。一種或多種所述「活性」的增加或產生例如由所述核酸分子的一種或多種表達產物(例如蛋白質)在細胞或其部分中的活性或量的增加所賦予，或通過從新表達(即通過在植物中產生所述「活性」)所賦予。在一個實施方案中，通過在表I第6列所示的細胞的區室中增加表I第5或7列所列出的一種或多種蛋白質的量和/或特定活性來增加一種或多種所述產量增加活性。根據本發明，通過改善如本文所定義的一種或多種產量相關性狀來增加本發明的植物的產量。根據本發明的所述增加的產量通常可以通過，較之原始或野生型植物，增強或改善所述植物的一種或多種產量相關性狀來實現。其改善導致增加的產量的此類植物的產量相關性狀包括而不限於，植物的內在產量能力的增加、改善的養分使用效率和/或增加的脅迫耐受性。在一個實施方案中，非生物環境脅迫指氮利用效率。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 64中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 63中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥(Arabidopsis thaliana)的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 63中所不的核酸分子，或SEQ ID NO. 64所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「2-氧代戊二酸依賴性雙加氧酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:63或SEQ ID NO:64各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 17倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 642中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 641中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優 選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 641中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 642所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT1G53885蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ IDN0:641或SEQ ID N0:642各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 25倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 2458中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 2457中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自毛果楊(Populus trichocarpa)的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 2457中所不的核酸分子，或SEQ ID NO. 2458所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「3-酮脂醯輔酶A硫解酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:2457或SEQ ID NO:2458各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 11倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 3464中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 3463中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 3463中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 3464所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「60S核糖體蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:3463或SEQ ID N0:3464各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 06倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 6495中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 6494中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野 生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 6494中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 6495所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「組蛋白H2B」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQID N0:6494或SEQ ID N0:6495各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 19倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7435中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 7434中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7434中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 7435所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「蛋白激酶家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:7434或SEQ ID N0:7435各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 24倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7514中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 7513中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7513中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 7514所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「包含AP2結構域的轉錄因子」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:7513或SEQ ID N0:7514各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 40倍(例如，力口上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7546中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 7545中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活 性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7545中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 7546所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「寡糖轉移酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQID N0:7545或SEQ ID N0:7546各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 12倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8288中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 8287中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8287中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 8288所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「質體脂相關蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:8287或SEQ ID N0:8288各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 14倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7865中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 7864中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7864中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 7865所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「肌醇半乳糖苷合酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:7864或SEQ ID N0:7865各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 13倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8153中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 8152中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活 性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8152中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 8153所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「冷反應蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQID N0:8152或SEQ ID N0:8153各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 06倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8409中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 8408中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8408中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 8409所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「小熱休克蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表1、1 I或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:8408或SEQ ID N0:8409各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 06倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10881中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 10880中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 10880中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 10881所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「普遍脅迫蛋白家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表Ι、Π或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 10880或SEQ ID NO: 10881各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 05倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10966中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 10965中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野 生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 10965中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 10966所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「熱休克蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQID NO: 10965或SEQ ID NO: 10966各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 13倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 11419中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 11418中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 11418中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 11419所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「argonaute蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 11418或SEQ ID NO: 11419各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 06倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 12197中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 12196中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 12196中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 12197所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT2G35300蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 12196或SEQ ID NO: 12197各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經 轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 23倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 12317中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 12316中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 12316中所示的核酸分子，或SEQIDN0. 12317所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「泛素-蛋白連接酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表Ι、Π或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 12316或SEQ ID NO: 12317各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 08倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13277中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 13276中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13276中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 13277所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13276或SEQ ID NO: 13277各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 24倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13246中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 13245中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13245中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 13246所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「PRLI相互作用因子」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表Ι、Π或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13245或SEQ ID NO: 13246各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 23倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10754中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 10753中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自玉米(Zea mays)的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 10753中所不的核酸分子， 或SEQ ID NO. 10754所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「60952769. R01. I蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 10753或SEQ ID NO: 10754各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 15倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13310中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 13309中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13309中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 13310所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT5G42380蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13309或SEQ ID NO: 13310各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 32倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10750中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 10749中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自玉米的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 10749中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 10750所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「57972199.R01. I蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表Ι、π或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 10749或SEQ ID NO: 10750各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 30倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13502中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 13501中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生 型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自稻(Oryza sativa)的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13501中所不的核酸分子，或SEQ ID NO. 13502所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「0S02G44730蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13501或SEQ ID NO: 13502各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 30倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13103中所示多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 13102中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了本發明的轉基因植物表現出較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的內在產量。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13102中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 13103所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「泛素綴合酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的內在產量，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQID NO: 13102或SEQ ID NO: 13103各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的對照，例如未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 標準條件(例如，不存在養分缺乏)和/或脅迫條件下，I. 05倍至I. 23倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在一個實施方案中，在本發明的方法中使用表VIIId中所示核酸分子或表I中所示其同源物或表達產物，從而與野生型對照相比增加植物的內在產量，例如在標準條件下增加產量，例如在非缺乏或非脅迫條件下增加生物量。
植物對乾旱的耐受性可以通過在乾旱測定(例如周期性乾旱或水使用效率測定)中，在乾旱期間在田間或在模式系統中，監控任何上述表型來測量。周期性乾旱測定和水使用效率測定的實驗設計是已知的。例如，可以通過在將阻礙或破壞各個物種的對照植物的水受限條件下，根據本發明產生的轉基因玉米、大豆、油菜(oilseed rape)或棉花植物的存活，來證明增加的乾旱耐受性。水使用效率(WUE)是通常與乾旱耐受性相關的參數。在低水有效性時生物量的增加可以是由於生長的相對改善的效率或降低的水消耗。在選擇用於改善作物的性狀中，水使用降低而不改變生長將在灌溉的農業系統中有特別的價值，在所述農業系統中水的輸入成本很高。生長增加而無相應的水使用的激增將可用於所有的農業系統。在水供應未受限的許多農業系統中，生長的增加(即使其代價是水使用的增加)也增加了產量。當土壤水耗盡時或者如果水在乾旱期間不可用時，作物產量受限。如果自葉的蒸騰作用超過了自根的水的供應，則植物水將不足。有效的水供應與土壤中保持的水量和植物用其根系統到達該水的能力有關。水自葉的蒸騰作用與通過氣孔的光合作用的二氧化碳的固定有關聯。兩種過程是正相關的，從而通過光合作用的高的二氧化碳流入量與通過蒸 騰作用的水損失緊密相連。由於水自葉蒸騰，貝1J減少了葉水潛力(leaf water potential),氣孔趨向在液壓過程中閉合，限制光合作用的量。鑑於作物產量取決於光合作用中二氧化碳的固定，因此水攝取和蒸騰作用是對作物產量起作用的因素。能夠使用更少的水來固定相同量的二氧化碳或者能夠在更低水勢時正常發揮功能的植物具有進行更多光合作用的潛力並且因此在許多農業系統中產生了更多的生物量和經濟產量。例如，可根據下述方法來測定和定量增加的乾旱條件耐受性將轉化的植物單個培養在培養室(York Indus-triekitl t GmbH, Mannheim, Germany)中的盆中。誘導萌發。在植物為擬南芥的情況下，將種植的種子保持在黑暗中在4°C下保持3天以誘導萌發。其後將條件改變為20°C /6°C的日夜溫度和16/8小時150 μ E/m2s的日夜周期，保持3天。然後將植物在標準培養條件下培養。在植物為擬南芥的情況下，標準培養條件為16小時光照和8小時黑暗的光周期、20°C、60%相對溼度和200 μ E的光子通量密度。培養並栽培植物直至長出葉。在植物為擬南芥的情況下，每天澆水直至約為3周齡。這時通過斷水施加乾旱。在未轉化野生型植物顯示可見損傷症狀之後，開始進行評估，在連續的5至6天中，根據與野生型和臨近植物相比的乾旱症狀和生物量產生對植物進行評分。可以根據實施例中描述的方法來測定乾旱耐受性，例如，對周期性乾旱的耐受性。乾旱耐受性可以是對周期性乾旱的耐受性。因此，在一個實施方案中，本發明涉及增加產量的方法，包括下述步驟(a)測定用於栽種的地區的水供應對於原始或野生型植物(例如作物)的生長來說是否最優或並非最優，和/或，測定用於栽種的地區中植物生長的可視損傷症狀；以及(bl)如果水供應對於原始或野生型植物的生長來說並非最優的話，或者，在該地區生長的標準、原始或野生型植物中可發現乾旱的可視症狀的話，在所述土壤中培育本發明的植物；或者(b2)如果水供應對於原始或野生型植物來說最優的話，在所述土壤中培育本發明的植物，將產量與標準、原始或野生型植物的產量相比，選擇和培育顯示更高產量或最高產量的植物。
可視損傷症狀，其表示下述特徵之一或其中兩種、三種或更多種的任何組合萎蔫；葉變成褐色；失去膨壓，導致葉或針葉莖和花下垂；葉或針葉下垂和/或脫落；葉為綠色，但葉面角與對照相比稍朝向地面；葉片開始內卷(捲曲)；葉或針葉過早衰老；葉或針葉中喪失葉綠素和/或變黃。另一產量相關表型是增加的養分使用效率。在表I中鑑定的基因或其同源物可以用於增強轉基因植物中的養分使用效率。此類轉基因植物可表現出增強的產量，如通過任何上述表型所測量的，具有現有的肥料應用的商業水平。可選地或額外地，具有改善的養分使用效率的轉基因植物可以在減少的肥料輸入時表現出相當的產量或改善的產量。對於植物而言特別重要的養分是氮。根據本發明，包含表I中鑑定的基因或其同源物的轉基因植物表現出增加的氮使用效率(NUE)，這是每單位輸入氮肥料下增加的可收穫產量。可以通過在受控的氮土壤濃度條件下生長的植物中，在田間和模式系統中，測量任何上述產量相關表型來測定增加的氮使用效率。示例性的氮使用效率測定示於下文中。根據本發明的轉基因玉米、大豆、油菜或棉花植物的增加的氮使用效率可以通過例如各個種子(特別是用作為飼料的玉米種子)中的改善或增加的蛋白質含量來表明。增加的氮使用效率還與增加的粒尺寸或每株植物更高的粒數量相關。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 64中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 63中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 63中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 64所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「2-氧代戊二酸依賴性雙加氧酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:63或SEQ ID NO:64各自相同的行中。優選地，增 加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至1.49倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 385中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 384中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 384中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 385所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「放氧增強蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:384或SEQ ID N0:385各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 37倍(例如，力口上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 505中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 504中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 504中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 505所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「2-氧代戊二酸依賴性雙加氧酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:504或SEQ ID NO:505各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至 I. 28倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 608中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 607中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 607中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 608所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:607或SEQ ID NO:608各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 28倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 642中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 641中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 641中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 642所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT1G53885蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:641或SEQ ID N0:642各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 33倍(例如，力口上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 673中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 672中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 672中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 673所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「肽基-脯氨醯順反異構酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的 耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:672或SEQ ID N0:673各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 19倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 1552中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 1551中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 1551中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 1552所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「多聚嘧啶序列結合蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 1551或SEQ ID NO: 1552各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 17倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 1629中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 1628中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 1628中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 1629所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT5G47440蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 1628或SEQ ID NO: 1629各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，1.1倍至I. 56倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 1710，或優選地在SEQ ID NO. :2220中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 1709，或優選地在SEQ ID NO.2219中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自大腸桿菌的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 1709或SEQ ID NO. :2219中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 1710或SEQ ID NO. :2220中所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生 「4- 二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 1709或2219或SEQ ID NO: 1710或2220各自相同的行中。優選地，增加發生在質體中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至1.27倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在優選的實施方案中，通過增加包含SEQ ID NO. :2220的序列的多肽或與SEQ IDNO. :222060%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%,或 99% 或 100% 同一的其同源物的活性或量，或增加包含SEQ ID NO. :2219中所示的序列的核酸分子或包含與SEQ ID NO.2219 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%,或99%或 100% 同一的序列的分子的基因表達，實現在植物中增加的養分使用效率。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 2227，或優選地在SEQ ID NO. :2447中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 2226，或優選地在SEQ ID NO.2446中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自大腸桿菌的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 2226或SEQ ID NO. :2446中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 2227或SEQ ID NO. :2447中所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:2226或2446或SEQ ID N0:2227或2447各自相同的行中。優選地，增加發生在質體中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 15倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在優選的實施方案中，通過增加包含SEQ ID NO. :2447的序列的多肽或與SEQ IDNO. :244760%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%,或 99% 或 100% 同一的其同源物的活性或量，或增加包含SEQ ID NO. :2446中所示的序列的核酸分子或包含與SEQ ID NO.244660%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%,或 99% 或 100% 同一的序列的分子的基因表達，實現在植物中增加的養分使用效率。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 2458中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 2457中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 2457中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 2458所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「3-酮脂醯輔酶A硫解酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:2457或SEQ ID NO: 2458各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 25倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。 因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 3464中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 3463中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 3463中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 3464所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「60S核糖體蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:3463或SEQ ID NO:3464各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 13倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 3795中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 3794中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 3794中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 3795所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「絲氨酸乙醯基轉移酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:3794或SEQ ID NO:3795各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 35倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 4631中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 4630中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自嗜熱棲熱菌(Thermus thermophilus)的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 4630中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 4631所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「S-核糖基高半胱氨酸酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:4630或SEQ IDN0:4631各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言， 賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 36倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 5043中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5042中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自釀酒酵母(Saccharomycescerevisiae)的相應核酸分子或多肽的活性,優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ IDNO. 5042中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 5043所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「液泡蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:5042或SEQ IDN0:5043各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 29倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 5070中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5069中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自釀酒酵母(Saccharomycescerevisiae)的相應核酸分子或多肽的活性,優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ IDNO. 5069中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 5070所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「GTP酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表Ι、Π或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 5069或SEQ ID NO:5070各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 66倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 5493中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5492中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自玉米的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 5492中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 5493所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「硫氧還蛋白H型」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:5492或SEQ ID N0:5493各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 10倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。 因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 5839中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5838中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 5838中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 5839所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT1G29250. I蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:5838或SEQ ID NO:5839各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. 05倍至I. 06倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 5983中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5982中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 5982中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 5983所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「絲氨酸乙醯基轉移酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:5982或SEQ ID NO:5983各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 15倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 6495中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 6494中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 6494中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 6495所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「組蛋白H2B」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:6494或SEQ ID NO:6495各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應 的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至1.20倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7365中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7364中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7364中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 7365所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT4G01870蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:7364或SEQ ID NO:7365各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 17倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7435中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7434中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7434中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 7435所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「蛋白激酶家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:7434或SEQ ID NO:7435各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 13倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7514中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7513中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7513中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 7514所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「包含AP2結構域的轉錄因子」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或 其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:7513或SEQ ID N0:7514各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 33倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7546中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7545中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7545中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 7546所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「寡糖轉移酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:7545或SEQ ID NO:7546各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 14倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7722中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7721中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7721中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 7722所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「ABC轉運蛋白家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 7721或SEQ ID NO: 7722各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 24倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8288中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8287中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8287中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 8288所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「質體脂相關蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:8287或SEQ ID NO:8288各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 12倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。
·
因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7865中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7864中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7864中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 7865所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「肌醇半乳糖苷合酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:7864或SEQ ID NO:7865各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 17倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8065中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8064中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8064中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 8065所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表Ι、Π或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID Ν0:8064或SEQ ID Ν0:8065各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 57倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8105中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8104中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8104中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 8105所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「50S葉綠體核糖體蛋白L21」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:8104或SEQ ID N0:8105各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件 下，I. I倍至I. 60倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID N0.8153中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8152中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8152中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 8153所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「冷反應蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:8152或SEQ ID N0:8153各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 12倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8207中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8206中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8206中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 8207所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「熱休克轉錄因子」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:8206或SEQ ID N0:8207各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 15倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8409中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8408中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8408中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 8409所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「小熱休克蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:8408或SEQ ID NO:8409各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至 I. 17倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8843中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8842中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8842中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 8843所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「rubisco亞基結合蛋白β亞基」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID Ν0:8842或SEQ ID Ν0:8843各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 31倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 9855中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 9854中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自稻的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 9854中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 9855所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「糖轉運蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID Ν0:9854或SEQ ID Ν0:9855各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 77倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 9982中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 9981中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自釀酒酵母的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 9981中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 9982所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表Ι、Π或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID Ν0:9981或SEQ ID Ν0:9982各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 17倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。 因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10799中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10798中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 10798中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 10799所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「蛋白激酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 10798或SEQ ID NO: 10799各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 20倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10839中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10838中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 10838中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 10839所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「haspin相關蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 10838或SEQ ID NO: 10839各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 24倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10881中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10880中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 10880中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 10881所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「普遍脅迫蛋白家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 10880或SEQ ID NO: 10881各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 21倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10966中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10965中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 10965中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 10966所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「熱休克蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 10965或SEQ ID NO: 10966各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 16 倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 11419中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 11418中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 11418中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 11419所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「argonaute蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 11418或SEQ ID NO: 11419各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 18倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 11753中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 11752中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 11752中所示的核酸分子，或SEQID NO. 11753所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「穀胱甘肽-S-轉移酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 11752或SEQ ID NO: 11753各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 18倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。
因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 12197中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 12196中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 12196中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 12197所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT2G35300蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 12196或SEQ ID NO: 12197各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 20倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 12317中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 12316中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 12316中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 12317所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「泛素蛋白連接酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 12316或SEQ ID NO: 12317各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 16倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 12574中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 12573中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 12573中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 12574所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT3G04620蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 12573或SEQ ID NO: 12574各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 11倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。 因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 12669中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 12668中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 12668中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 12669所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「細胞色素P450」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 12668或SEQ ID NO: 12669各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 34倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13132中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13131中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13131中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 13132所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「 δ-8鞘脂脫飽和酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID Ν0:13131或SEQ ID NO: 13132各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 95倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13277中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13276中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13276中所示的 核酸分子，或SEQ IDNO. 13277所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表Ι、Π或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13276或SEQ ID NO: 13277各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 17倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13437中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13436中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13436中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 13437所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「CDS5394蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13436或SEQ ID NO: 13437各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 33倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13478中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13477中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13477中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 13478所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「CDS5401截短蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13477或SEQ ID NO: 13478各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 23倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13552中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13551中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自玉米的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13551中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 13552所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「cullin」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13551或SEQ ID NO: 13552各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 12 倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13246中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13245中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13245中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 13246所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「PRLI-相互作用因子」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13245或SEQ ID NO: 13246各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 32倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10754中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10753中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自玉米的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 10753中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 10754所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「60952769.R01. I蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 10753或SEQ ID NO: 10754各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 18倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13310中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13309中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13309中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 13310所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT5G42380蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13309或SEQ ID NO: 13310各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍 至I. 33倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10750中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10749中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自玉米的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 10749中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 10750所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「57972199.R01. I蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 10749或SEQ ID NO: 10750各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，
I.I倍至I. 14倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13502中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13501中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自稻的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13501中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 13502所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「0S02G44730蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13501或SEQ ID NO: 13502各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 14倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。因此，在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13103中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13102中所示的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的養分使用效率。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13102中所示的核酸分子，或SEQ IDNO. 13103所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「泛素綴合酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物細胞、植物或其部分而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的養分使用效率，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13102或SEQ ID NO: 13103各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，賦予了增加的氮使用效率。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 氮缺乏條件下，I. I倍至I. 17倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在一個實施方案中，在本發明的方法中使用表VIIIa中所示核酸分子或表I中所示其同源物或表達產物，從而與野生型對照相比增加植物的養分使用效率，例如增加氮使用效率。例如，可根據下述方法來測定和定量植物增強的氮使用效率:在培養室(SvaldfWeibull, SvalSv, Sweden)中的盆中培養轉化植物。在植物為擬南芥的情況下，將其種子種在盆中，其中含有營養缺乏土(( 「Einheitserde Typ O」，30% 粘土，Tantau, WansdorfGermany))和沙子的I: I (V: V)混合物。通過黑暗中4°C下的4天時間來誘導萌發。隨後植物生長在標準生長條件下。在植物為擬南芥的情況下，標準培養條件為16小時光照和8小時黑暗的光周期、20°C、60%相對溼度、200 μ E的光子通量密度。在植物為擬南芥的情況下，每隔一天用N缺乏營養液澆水，並在9至10天後，將植物單獨培養。總共29至31天後，收穫植物，通過植物地上部分(優選地，蓮座(rosettes))的鮮重對其加以評估。氮使用效率例如根據本文所述方法來測定。此外，本發明還涉及增加產量的方法，所述方法包括下述步驟(a)測量土壤中的氮含量，以及(b)測定土壤中的氮-含量對原始或野生型植物(例如作物)的生長來說是否最優或並非最優，以及(Cl)如果氮-含量對於原始或野生型植物的生長來說並非最優的話，在所述土壤中培育本發明的植物，或者(c2)如果氮-含量對於原始或野生型植物來說最優的話，在土壤中培育本發明的植物，並將產量與標準、原始或野生型植物的產量相比，選擇和培育顯示更高或最高產量的植物。(過)表達氮使用效率-改善基因的植物可以用於所述植物的產量增強並且改善，例如減少氮肥料利用或使其更有效。通常，對低溫的適應可分為嚴寒耐受性和冰凍耐受性。改善或增強的「冰凍耐受性」或其變化形式在本文中指對接近或低於O度的溫度的改善的適應性，即，所述溫度優選為4° C或更低，更優選3° C或2° C或更低，並且特別優選為是或低於O (零)° C或-4° C或更低，或者甚至極端低的溫度，可低至-10° C或更低；上述溫度在下文中被稱為「冰凍溫度」。此外，對低溫的增加的耐受性可以例如通過早期活力來表現，並且允許根據本發明方法產生的玉米、大豆、油菜或棉花植物的早期種植和播種。、
在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 608中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 607中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 607中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 608所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:607或SEQ ID N0:608各自相同的行中。優選地，增加發生在細 胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 08倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 642中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 641中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 641中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 642所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT1G53885蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:641或SEQ ID N0:642各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 07倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 673中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 672中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 672中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 673所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「肽基-脯氨醯順反異構酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:672或SEQ ID NO:673各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 18倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 1629中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 1628中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 1628中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 1629所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT5G47440蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:1628或SEQ ID NO: 1629各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 07倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 1710中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 1709中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自大腸桿菌的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 1709中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 1710所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「4- 二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、I I或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 1709或SEQID N0:1710各自相同的行中。優選地，增加發生在質體中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至1.24倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 2227中所示多肽的多肽， 或由包含SEQ ID NO. 2226中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自大腸桿菌的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 2226中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 2227所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:2226或SEQ ID N0:2227各自相同的行中。優選地，增加發生在質體中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 09倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 3464中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 3463中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 3463中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 3464所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「60S核糖體蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:3463或SEQ ID NO: 3464各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 09倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 4631中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 4630中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自嗜熱棲熱菌的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ IDNO. 4630中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 4631所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植 物或其部分中增加或產生「S-核糖基高半胱氨酸酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:4630或SEQ ID N0:4631各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 06倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 5493中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5492中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自玉米的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 5492中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 5493所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「硫氧還蛋白H型」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:5492或SEQ ID NO:5493各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 09倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 5839中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5838中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 5838中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 5839所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT1G29250. I蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:5838或SEQ ID NO: 5839各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 20倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 5983中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5982中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 5982中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 5983所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分 中增加或產生「絲氨酸乙醯基轉移酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:5982或SEQ ID N0:5983各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 22倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7365中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7364中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7364中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 7365所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「AT4G01870蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:7364或SEQ ID NO: 7365各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 11倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另一實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7435中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7434中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是增加的低溫耐受性。例如，增加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7434中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 7435所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中增加或產生「蛋白激酶家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO :7434或SEQ ID NO: 7435各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 07倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7514中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7513中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言増加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7513中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 7514所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「包含AP2結構域的轉錄因子」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是増加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所 示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:7513或SEQ ID NO:7514各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 31倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 7546中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7545中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言増加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 7545中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 7546所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「寡糖轉移酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO:7545或SEQ ID NO:7546各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 13倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8288中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8287中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言増加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8287中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 8288所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「質體脂相關蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO :8287或SEQ ID NO: 8288各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 12倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8065中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8064中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言増加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8064中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 8065所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是増加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所 示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:8064或SEQ ID N0:8065各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 10倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8105中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8104中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言増加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8104中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 8105所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「50S葉綠體核糖體蛋白L21」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是増加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:8104或SEQ ID N0:8105各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 08倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8409中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8408中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言増加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8408中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 8409所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「小熱休克蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:8408或SEQ ID N0:8409各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 11倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 8843中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8842中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言増加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 8842中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 8843所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「rubisco亞基結合蛋白P亞基」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非 生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是増加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID N0:8842或SEQ ID N0:8843各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 15倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10881中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10880中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ IDNO. 10880中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 10881所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「普遍脅迫蛋白家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是増加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 10880或SEQ ID NO: 10881各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 07倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 10966中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10965中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ IDNO. 10965中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 10966所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「熱休克蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是増加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 10965或SEQ ID NO: 10966各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 15倍(例如，加上其至少100%)的產
量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 12197中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 12196中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ IDNO. 12196中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 12197所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「AT2G35300蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是増加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 12196或SEQ ID NO: 12197各自 相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 10倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13132中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13131中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ IDNO. 13131中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 13132所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「 S _8鞘脂脫飽和酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是増加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13131或SEQ ID NO: 13132各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 08倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13437中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13436中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ IDNO. 13436中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 13437所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「 CDS5394蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是増加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13436或SEQ ID NO: 13437各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 12倍(例如，加上其至少100%)的產
量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13478中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13477中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自毛果楊的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ IDNO. 13477中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 13478所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「CDS5401截短蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是増加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13477或SEQ ID NO: 13478各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經 轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 16倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13552中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13551中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言増加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自玉米的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ ID NO. 13551中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 13552所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「cullin」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是增加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13551或SEQ ID NO: 13552各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 14倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在另ー實施方案中，如果增加或產生包含在SEQ ID NO. 13246中所示多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13245中所不的核酸分子的核酸分子所編碼的多肽,或所述核酸分子或多肽的同源物的活性，則賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的對非生物環境脅迫的耐受性，特別是増加的低溫耐受性。例如，増加或產生源自擬南芥的相應核酸分子或多肽的活性，優選地所述核酸分子或多肽分別包含SEQ IDNO. 13245中所示的核酸分子，或SEQ ID NO. 13246所示的多肽，或其同源物。例如，如果在植物或其部分中増加或產生「PRLI相互作用因子」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，則賦予較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，對非生物環境脅迫的增加的耐受性，特別是増加的低溫耐受性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序，即與SEQ ID NO: 13245或SEQ ID NO: 13246各自相同的行中。優選地，增加發生在細胞質中。特別地，較之相應的，未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言，賦予了 低溫條件下，I. 05倍至I. 25倍(例如，加上其至少100%)的產量增加。在一個實施方案中，在本發明的方法中使用表I中所不核酸分子或表達產物，從而與野生型對照相比増加植物的脅迫耐受性，例如増加低溫耐受性。上文所示比例特別是指按照生物量(尤其是作為地上部分鮮重生物量)増加實際測量的増加的產量。可例如通過下述方法來測定增強的對低溫的耐受性在培養室(例如York, Mannheim, Germany)中的盆中培育轉化的植物。在植物為擬南芥的情況下，將其種子種在含有富營養土(GS90, Tantau, Wansdorf, Germany)和沙子的3.5:1 (v/v)混合物中。植物在標準培養條件下生長。在植物為擬南芥的情況下，標準培養條件為16小時光照和8小時黑暗的光周期，60%相対溼度和200iimol/m2S的光子通量密度。培養並栽培植物。在植物為擬南芥的情況下，每隔一天澆水。9至10天後將植物単獨培養。在播種14天後施加寒冷(例如11至12°C的寒冷)至實驗結束。總計培養29至31天後，收穫植物並根據植物的地上部分(在擬南芥的情況下優選為蓮座)鮮重進行評分。 令人驚訝地，發現在植物例如擬南芥中，源自第4列所示生物的本發明的核酸分子的轉基因表達，例如，賦予增加的產量。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 64中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 63中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「2-氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ ID N0:63或SEQ ID N0:64各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多妝基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 385中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 384中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「放氧增強蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:384或SEQ ID NO: 385各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 505中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 504中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「2-氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ ID N0:504或SEQ ID N0:505各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。
因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 608中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 607中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ ID N0:607或SEQ ID N0:608各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 642中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 641中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「 AT1G53885蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:641或SEQ ID N0:642各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 673中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 672中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「肽基-脯氨醯順反異構酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID N0:672或SEQ ID N0:673各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 1552中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 1551中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「多聚嘧啶序列結合蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID NO: 1551或SEQ ID NO: 1552各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多妝基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 1629中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 1628中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「AT5G47440蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:1628或SEQ ID NO: 1629各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 1710，或優選地在SEQ ID NO. :2220中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 1709，或優選地在SEQ ID NO. : 2219中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自大腸桿菌的，或如SEQ ID NO. :2219和SEQ ID NO. :2220所示修飾的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「4- ニ磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ ID NO: 1709或2219，或SEQ IDNO: 1710或2220各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在質體中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 2227，或優選地在SEQ ID NO. :2447中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ IDNO. 2226，或優選地在SEQ ID NO. : 2446中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼 的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自大腸桿菌的，或如SEQ ID NO. :2447和SEQ ID NO. :2446所示修飾的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「3』 -磷酸腺苷5'-磷酸磷酸酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID NO:2226或2446，或SEQ ID NO:2227或2447各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在質體中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 2458中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 2457中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自毛果楊的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「3-酮脂醯輔酶A硫解酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、I I或IV第7列中與SEQ ID N0:2457或SEQ ID NO: 2458各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多妝基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 3464中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 3463中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自毛果楊的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「60S核糖體蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:3463或SEQ ID N0:3464各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 3795中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 3794中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自毛果楊的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「絲氨酸羥甲基轉移酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID N0:3794或SEQ ID N0:3795各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 4631中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 4630中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核 酸分子或多肽的同源物(例如源自嗜熱棲熱菌的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「S-核糖基高半胱氨酸酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ ID N0:4630或SEQ ID N0:4631各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 5043中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5042中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自釀酒酵母的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「液泡蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:5042或SEQ ID NO: 5043各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 5070中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5069中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自釀酒酵母的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「 GTP酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ IDN0:5069或SEQ ID NO: 5070各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 5493中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5492中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自玉米的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「硫氧還蛋白H型」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:5492或SEQ ID NO: 5493各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 5839中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5838中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「AT1G29250. I蛋白質」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID N0:5838或SEQ ID N0:5839各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 5983中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 5982中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「絲氨酸こ醯基轉移酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID N0:5982或SEQ ID N0:5983各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。 因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 6495中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 6494中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「組蛋白H2B」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:6494或SEQ ID N0:6495各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 7365中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7364中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「AT4G01870蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:7364或SEQ ID N0:7365各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 7435中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7434中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「蛋白激酶家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQID NO:7434或SEQ ID NO:7435各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。
因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 7514中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7513中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「包含AP2結構域的轉錄因子」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ ID N0:7513或SEQ ID N0:7514各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 7546中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7545中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自毛果楊的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「寡糖轉移酶」的活性或下述 核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ IDN0:7545或SEQ ID NO: 7546各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 7722中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7721中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「 ABC轉運蛋白家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID N0:7721或SEQ ID N0:7722各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 8288中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8287中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「質體脂相關蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQID N0:8287或SEQ ID N0:8288各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 7865中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 7864中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「肌醇半乳糖苷合酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQID N0:7864或SEQ ID N0:7865各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 8065中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8064中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ ID N0:8064或SEQ ID NO: 8065各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ ID NO. 8105中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8104中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「50S葉綠體核糖體蛋白L21」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID N0:8104或SEQ ID N0:8105各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 8153中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8152中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「冷反應蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ IDN0:8152或SEQ ID N0:8153各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 8207中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8206中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「熱休克轉錄因子」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQID N0:8206或SEQ ID N0:8207各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 8409中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8408中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「小熱休克蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:8408或SEQ ID N0:8409各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 8843中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 8842中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自毛果楊的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「rubisco亞基結合蛋白@亞基」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ ID N0:8842或SEQ ID N0:8843各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ ID NO. 9855中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 9854中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自稻的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「糖轉運蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ IDN0:9854或SEQ ID N0:9855各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 9982中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 9981中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自釀酒酵母的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ ID N0:9981或SEQ ID N0:9982各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 10799中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10798中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「蛋白激酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:10798或SEQ ID NO: 10799各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 10839中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10838中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「haspin相關蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID NO: 10838或SEQ ID NO: 10839各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多妝基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 10881中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10880中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「普遍脅迫蛋白家族蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID NO: 10880或SEQ ID NO: 10881各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 10966中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10965中所示的核酸的產量相 關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「熱休克蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:10965或SEQ ID NO: 10966各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 11419中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 11418中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「argonaute蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQID NO: 11418或SEQ ID NO: 11419各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 11753中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 11752中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「穀胱甘肽-S-轉移酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID NO: 11752或SEQ ID NO: 11753各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 12197中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 12196中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「AT2G35300蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQID NO: 12196或SEQ ID NO: 12197各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 12317中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 12316中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「泛素-蛋白連接酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID NO: 12316或SEQ ID NO: 12317各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多妝基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ ID NO. 12574中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 12573中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「AT3G04620蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQID N0:12573或SEQ ID NO: 12574各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 12669中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 12668中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「細胞色素P450」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQID NO: 12668或SEQ ID NO: 12669各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 13132中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13131中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「 S _8鞘脂脫飽和酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID N0:13131或SEQ ID NO: 13132各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多妝基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 13277中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13276中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ ID NO: 13276或SEQ ID NO: 13277各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 13437中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13436中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自毛果楊的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「CDS5394蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQID N0:13436或SEQ ID NO: 13437各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ ID·NO. 13478中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13477中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自毛果楊的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「CDS5401截短蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID NO: 13477或SEQ ID NO: 13478各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多妝基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 13552中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13551中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自玉米的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「 cullin」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ IDN0:13551或SEQ ID NO: 13552各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 13246中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13245中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「PRLI相互作用因子」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID N0:13245或SEQ ID NO: 13246各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多妝基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 10754中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10753中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自玉米的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「60952769. R01. I蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID NO: 10753或SEQ ID NO: 10754各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多妝基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 13310中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13309中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如 源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「AT5G42380蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQID NO: 13309或SEQ ID NO: 13310各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 10750中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 10749中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自玉米的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「57972199. R01. I蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表I、II或IV第7列中與SEQ ID NO: 10749或SEQ ID NO: 10750各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多妝基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 13502中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13501中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自稻的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中增加或產生「0S02G44730蛋白」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDN0:13501或SEQ ID NO: 13502各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，根據本發明的方法，通過增加或產生包含在SEQ IDNO. 13103中所示產量相關多肽的多肽，或由包含SEQ ID NO. 13102中所示的核酸的產量相關核酸分子(或基因)所編碼的多肽，或所述核酸分子或多肽的同源物(例如源自擬南芥的)的活性，賦予了較之相應的未經修飾的(例如未經轉化的)野生型植物而言增加的產量。因此，在一個實施方案中，在植物細胞、植物或其部分中増加或產生「泛素綴合酶」的活性或下述核酸分子或多肽的活性，所述核酸分子或多肽分別包含表1、11或IV第7列中與SEQ IDNO: 13102或SEQ ID NO: 13103各自相同的行中所示的核酸或多肽或共有序列或多肽基序。優選地，增加發生在細胞質中。因此，在一個實施方案中，本發明提供了產生下述植物的方法，所述植物相較於相應的原始或野生型植物而言表現出增加的或改善的產量，這是通過增加或產生選自以下的ー種或多種活性2_氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- ニ磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. ROl. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute蛋白、AT1G29250. I蛋白、AT1G53885蛋白、AT2G35300蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、CDS5394 蛋白、⑶S5401截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、S-8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基_脯氨醯順反異構酶、肽基_脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、:rubisco亞基結合蛋白0亞基、絲氨酸こ醯基轉移酶、絲氨酸輕甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白，例如所述活性是通過選自表I第5或7列所 不的組的一種或多種多核苷酸或通過ー種或多種蛋白質(各自包含由選自表I第5或7列所示的組的ー種或多種核酸序列編碼的多肽)，或通過ー種或多種蛋白質(各自包含選自表II第5和7列所示的組的多肽)，或具有對應於表IV第7列中所示的共有序列的序列的蛋白質所賦予的，以及(b)任選地，在允許所述植物細胞、植物或其部分發育的條件下生長所述植物細胞、植物或其部分，以及(c)再生下述植物，所述植物與相應的，例如未經轉化的，野生型植物或其部分相比，具有増加的產量，例如具有増加的產量相關性狀，例如增強的非生物環境脅迫耐受性，例如増加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或増加的養分使用效率、內在產量和/或另ー增加的產量相關性狀。因此，在ー個另外的實施方案中，用於產生植物或用於再生所述植物的植物部分的所述方法，所述植物顯示出増加的產量，所述方法包括(i )與(例如未經轉化的)野生型植物一起在非生物環境脅迫或缺乏條件下，生長植物或其部分；以及(ii)選擇與相應的，例如未經轉化的，野生型植物相比具有增加的產量的植物，例如在(例如未經轉化的)野生型植物顯示出可見的缺乏症狀和/或死亡後。此外，本發明涉及產生與相應的原始或野生型植物相比具有増加的產量的植物，例如轉基因植物的方法，所述方法包括(a)在植物細胞核、植物細胞、植物或其部分中増加或產生選自2-氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- ニ磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute蛋白、AT1G29250. I蛋白、AT1G53885蛋白、AT2G35300蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、CDS5394 蛋白、⑶S5401截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、S-8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋白0亞基、絲氨酸こ醯基轉移酶、絲氨酸輕甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白的多肽的ー種或多種活性，例如通過本文所述的方法；以及(b)在允許所述植物細胞、植物或其部分發育的條件下，種植或生長所述植物細胞、植物或其部分；以及(c)回收較之相應的(例如未經轉化的)原始或野生型植物而言顯示出增加的產量的植物，所述植物來自所述植物細胞核、所述植物細胞或所述植物部分；以及(d)任選地，選擇較之相應的(例如未經轉化的)野生型植物細胞(例如其顯示出可視缺乏症狀和/或死亡)而言，顯示出増加的產量(例如顯示出増加或改善的產量相關性狀，例如改善的養分使用效率和/或非生物性脅迫抗性)的植物或其部分。此外，還本發明還涉及鑑定出具有増加的產量的植物的方法，所述方法包括針對所述的「活性」，對ー種或多種植物細胞核、植物細胞、植物組織或植物或其部分的群體進行 篩選，將活性水平與參照的活性水平加以比較；鑑定出較之參照而言活性増加的一種或多種植物細胞核、植物細胞、植物組織或植物或其部分，任選地，從鑑定出的植物細胞核、細胞或組織產生植物。在另ー實施方案中，本發明還涉及鑑定出具有増加的產量的植物的方法，所述方法包括針對編碼賦予所述活性的多肽的核酸的表達水平，對ー種或多種植物細胞核、植物細胞、植物組織或植物或其部分的群體進行篩選，將表達水平與參照加以比較；鑑定出較之參照而言表達水平増加的ー種或多種植物細胞核、植物細胞、植物組織或植物或其部分，任選地，從鑑定出的植物細胞核、細胞或組織產生植物。因此，在優選的實施方案中，本發明提供產生用於再生或生產與相應的(例如未經轉化的)野生型植物細胞相比具有増加的產量(例如對非生物環境脅迫的耐受性)和/或另一増加的產量相關性狀的植物的轉基因細胞的方法，這是通過增加或產生ー種或多種選自以下的多肽活性2_氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- ニ磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute蛋白、AT1G29250. I蛋白、AT1G53885蛋白、AT2G35300蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、CDS5394 蛋白、⑶S5401截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、S-8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基_脯氨醯順反異構酶、肽基_脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、:rubisco亞基結合蛋白0亞基、絲氨酸こ醯基轉移酶、絲氨酸輕甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白。細胞可以是例如宿主細胞，例如轉基因宿主細胞。宿主細胞可以是例如微生物，例如來自真菌或細菌的微生物，或特別用於轉化的植物細胞。此外，在一個實施方案中，本發明提供了與相應的，例如未經轉化的，原始或野生型植物細胞或植物相比表現出ー種或多種增加的產量相關性狀的轉基因植物，其在所述植物的本文所指出的亞細胞區室和組織中具有増加的或新生成的一種或多種選自上述「活性」組的「活性」。因此，在一個實施方案中，本發明提供了產生用於再生或生產與相應的(例如未經轉化的)野生型植物細胞相比具有増加的產量性狀(例如對非生物環境脅迫的耐受性)和/或另ー增加的產量相關性狀的植物的細胞的方法，這是通過增加或產生ー種或多種選自以下的多肽或活性2_氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- ニ磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute蛋白、AT1G29250. I蛋白、AT1G53885蛋白、AT2G35300蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、CDS5394 蛋白、⑶S5401截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、S-8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基_脯氨醯順反異構酶、肽基_脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家 族蛋白、rubisco亞基結合蛋白0亞基、絲氨酸こ醯基轉移酶、絲氨酸輕甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白。所述用於重生或產生植物的細胞可以是例如宿主細胞，例如轉基因宿主細胞。宿主細胞可以是例如微生物，例如來自真菌或細菌的微生物，或特別用於轉化的植物細胞。因此，本發明滿足了鑑定新的、獨特基因的需求，所述基因能夠在表達或過表達外源基因時，賦予植物增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增加的對非生物環境脅迫的耐受性，例如増加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或増加的養分利用效率、內在產量和/或另ー增加的產量相關性狀。因此，本發明提供了在表I，例如在表IB中描述的基因的新同源物。在一個實施方案中，細胞器(如質體)中總計多肽的活性増加。在另ー個實施方案中，在細胞質中總計多肽的活性増加。本發明核酸分子所編碼多肽或本發明多肽的比活性可如實施例中所述進行測試。具體地，將細胞(例如植物細胞)中目的蛋白的表達與對照進行比較是簡單的測試，並可如本領域所述進行。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G06620_修飾的序列被描述為2_氧代戊
ニ酸依賴性雙加氧酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有增加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「2-氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G06620_修飾相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G06620_修飾相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G06620_修飾相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示於與所述AT 1G06620_修飾相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G06680. I的序列被描述為放氧增強蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「放氧增強蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G06680. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G06680. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或 (b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G06680. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G06680. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G14130. I的序列被描述為2_氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「2-氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G14130. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G14130. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G14130. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G14130. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G20810. 1_修飾的序列被描述為肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G20810. 1_修飾相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G20810. 1_修飾相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G20810. 1_修飾相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G20810. 1_修飾相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。公開了例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G53885的序列來自釀酒酵母的序列已公開。其活性被描述為AT1G53885蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有增加的產量的植物的本發明的方法包括增加或產生賦予來自擬南芥的活性「AT1G53885蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G53885相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述 AT1G53885相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含不於表II第5列或表IV第7列中並且展不於與所述AT1G53885相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G53885相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。公開了例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT2G38730. I的序列來自釀酒酵母的序列已公開。其活性被描述為肽基-脯氨醯順反異構酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「肽基-脯氨醯順反異構酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT2G38730. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT2G38730. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT2G38730. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT2G 38730. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。公開了例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT3G01150. 1_截短的序列來自釀酒酵母的序列已公開。其活性被描述為多聚嘧啶序列結合蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「多聚嘧啶序列結合蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT3G01150. 1_截短相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT3G01150. 1_截短相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT3G01150. 1_截短相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT3G01150. 1_截短相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。公開了例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT5G47440_修飾的序列。其活性被描述為AT5G47440蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括增加或產生賦予來自擬南芥的活性「AT5G47440蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT5G47440_修飾相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT5G47440_修飾相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表I B第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或
(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT5G47440_修飾相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示於與所述AT5G47440_修飾相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。公開了例如表I第5列中所示來自大腸桿菌的B1208的序列Blattner etal.，Science 277 (5331)，1453 (1997)。其活性被描述為 4- ニ磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤
蘚糖醇激酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自大腸桿菌的活性「4- ニ磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如増加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述B1208相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述B1208相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如質體的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述B1208相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述B1208相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如質體的。公開了例如表I第5列中所示來自大腸桿菌的B4214的序列Blattner etal.，Science 277 (5331)，1453 (1997)。其活性被描述為3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自大腸桿菌的活性「3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述B4214相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述B4214相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如質體的；或
(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述B4214相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述B4214相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如質體的。例如表I第5列中所示來自毛果楊的CDS5293_修飾的序列被描述為3_酮脂醯輔酶A硫解酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有增加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自毛果楊的活性「3-酮脂醯輔酶A硫解酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述CDS5293_修飾相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述CDS5293_修飾相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或 功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽,其包含不於表II第5列或表IV第7列中並且展不於與所述⑶S5293_修飾相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示於與所述CDS5293_修飾相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所不來自毛果楊的⑶S5305的序列被描述為60S核糖體蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自毛果楊的活性「 60S核糖體蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述⑶S5305相同的各行中的核酸分子,或包含表I第7列中所不並且展不於與所述⑶S5305相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽,其包含不於表II第5列或表IV第7列中並且展不於與所述⑶S5305相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述CDS5305相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自毛果楊的CDS5397的序列被描述為絲氨酸羥甲基轉移酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自毛果楊的活性「絲氨酸羥甲基轉移酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述CDS5397相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述CDS5397相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述⑶S5397相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述CDS5397相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自嗜熱棲熱菌的TTCl 186的序列被描述為S-核糖基高半胱氨酸酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自嗜熱棲熱菌的活性「 S-核糖基高半胱氨酸酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如 增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述TTC1186相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述TTC1186相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述TTCl 186相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述TTC1186相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。公開了例如表I第5列中所示來自釀酒酵母的YKL124W的序列在Goffeau等人，Science 274(5287),546(1996)中公開了來自釀酒酵母的序列。其活性被描述為液泡蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自釀酒酵母的活性「液泡蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述YKL124W相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述YKL124W相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述YKL124W相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述YKL124W相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。公開了例如表I第5列中所示來自釀酒酵母的YNL093W的序列在Goffeau等人，Science 274(5287),546(1996)中公開了來自釀酒酵母的序列。其活性被描述為GTP酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有增加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自釀酒酵母的活性「GTP酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述YNL093W相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述YNL093W相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述YNL093W相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述YNL093W相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I 第 5 列中所示來自玉米的 ZM_7266_BQ538406_C0RN_L0FI_344_730_B 的序列被描述為硫氧還蛋白H型。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自玉米的活性「硫氧還蛋白H型」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述ZM_7266_BQ538406_C0RN_L0FI_344_730_B相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中 所示並且展示於與所述ZM_7266_BQ538406_C0RN_L0FI_344_730_B相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽,其包含不於表II第5列或表IV第7列中並且展不於與所述ZM_7266_BQ538406_C0RN_L0FI_344_730_B相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示於與所述ZM_7266_BQ538406_C0RN_L0FI_344_730_B相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G29250. I的序列被描述為AT1G29250. I蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括增加或產生賦予來自擬南芥的活性「AT1G29250. I蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G29250. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G29250. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G29250. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G29250. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G55920. I的序列被描述為絲氨酸こ醯基
轉移酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「絲氨酸こ醯基轉移酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G55920. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G55920. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G55920. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G55920. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT3G09480的序列被描述為組蛋白H2B。因此，在一個實施方案中，用於產生具有增加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「組蛋白H2B」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT3G09480相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT3G09480相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT3G09480相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT3G09480相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT4G01870的序列被描述為AT4G01870蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括 增加或產生賦予來自擬南芥的活性「AT4G01870蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT4G01870相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT4G01870相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT4G01870相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT4G01870相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT4G11890的序列被描述為蛋白激酶家族蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「蛋白激酶家族蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT4G11890相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT4G11890相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或
(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT4G11890相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT4G11890相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT5G07310的序列被描述為包含AP2結構域的轉錄因子。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括增加或產生賦予來自擬南芥的活性「包含AP2結構域的轉錄因子」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT5G07310相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT5G07310相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT5G07310相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT5G07310相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自毛果楊的CDS5422的序列被描述為寡糖轉移酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自毛果楊的活性「寡糖轉移酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述CDS5422相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述CDS5422相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述⑶S5422相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述CDS5422相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G03905. I的序列被描述為ABC轉運蛋白
家族蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「 ABC轉運蛋白家族蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G03905. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G03905. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述、AT1G03905. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G03905. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT4G22240. I的序列被描述為質體脂相關蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「質體脂相關蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT4G22240. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT4G22240. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或 功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT4G22240. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT4G22240. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G09350. I的序列被描述為肌醇半乳糖苷合酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「肌醇半乳糖苷合酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G09350. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G09350. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G09350. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G09350. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G30135. I的序列被描述為茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G30135. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G30135. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G30135. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述ATlG 30135. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G35680. I的序列被描述為50S葉綠體核糖體蛋白L21。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括增加或產生賦予來自擬南芥的活性「50S葉綠體核糖體蛋白L21」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G35680. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G35680. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或
(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G35680. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G35680. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT2G42540. I的序列被描述為冷反應蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「冷反應蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT2G42540. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT2G42540. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT2G42540. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT2G42540. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT3G02990. I的序列被描述為熱休克轉錄因子。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「熱休克轉錄因子」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT3G02990. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT3G02990. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT3G02990. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT3G02990. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的At5g37670. I的序列被描述為小熱休克蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「小熱休克蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述At5g37670. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述At5g37670. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述 At5g37670. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述At5g37670. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自毛果楊的⑶S5376的序列被描述為rubisco亞基結合蛋白P亞基。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自毛果楊的活性「rubisco亞基結合蛋白P亞基」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述⑶S5376相同的各行中的核酸分子,或包含表I第7列中所不並且展不於與所述⑶S5376相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽,其包含不於表II第5列或表IV第7列中並且展不於與所述⑶S5376相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述CDS5376相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自稻的L0C_0s02gl3560. I的序列被描述為糖轉運蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自稻的活性「糖轉運蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述L0C_0s02gl3560. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述L0C_0s02gl3560. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述L0C_0s02gl3560. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述L0C_0s02gl3560. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。公開了例如表I第5列中所示來自釀酒酵母的YCR024C的序列來自釀酒酵母的序列公開於Goffeau等人，Science 274(5287),546(1996)中。其活性被描述為線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自釀酒酵母的活性「線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述YCR024C相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述YCR024C相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或
(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述YCR024C相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述YCR024C相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G05100_-短的序列被描述為蛋白激酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「蛋白激酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G05100_-短相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G05100_-短相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G05100_截短相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示於與所述AT1G05100_-短相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G09450的序列被描述為haspin相關蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「haspin相關蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G09450相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G09450相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G09450相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G09450相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G44760的序列被描述為普遍脅迫蛋白家
族蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「普遍脅迫蛋白家族蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G44760相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述
AT1G44760相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G44760相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G44760相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT1G54050. I的序列被描述為熱休克蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「熱休克蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT1G54050. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT1G54050. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT1G54050. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT1G54050. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT2G27040的序列被描述為argonaute蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「argonaute蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT2G27040相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT2G27040相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT2G27040相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT2G27040相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT2G29490的序列被描述為穀胱甘肽-S-轉移酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「穀胱甘肽-S-轉移酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT2G29490相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT2G29490相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT2G29490相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所 述AT2G29490相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT2G35300的序列被描述為AT2G35300蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括增加或產生賦予來自擬南芥的活性「AT2G35300蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT2G35300相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT2G35300相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT2G35300相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT2G35300相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT2G35930的序列被描述為泛素_蛋白質連接酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「泛素-蛋白質連接酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT2G35930相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT2G35930相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT2G35930相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT2G35930相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT3G04620的序列被描述為AT3G04620蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括增加或產生賦予來自擬南芥的活性「AT3G04620蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT3G04620相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT3G04620相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT3G04620相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT3G04620相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT3G20960的序列被描述為細胞色素P450。因此，在一個實施方案中，用於產生具有增加的產量的植物的本發明的方法包括 增加或產生賦予來自擬南芥的活性「細胞色素P450」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT3G20960相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT3G20960相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT3G20960相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT3G20960相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT3G61580. I的序列被描述為5 -8鞘脂脫飽和酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「 8 -8鞘脂脫飽和酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT3G61580. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT3G61580. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT3G61580. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT3G61580. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT5G13220的序列被描述為茉莉酮酸酯_zim結構域蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT5G13220相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT5G13220相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT5G13220相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT5G13220相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自毛果楊的⑶S5394的序列被描述為⑶S5394蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括 增加或產生賦予來自毛果楊的活性「CDS5394蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述CDS5394相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述CDS5394相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述⑶S5394相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述CDS5394相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自毛果楊的⑶S5401_—短的序列被描述為⑶S5401截
短蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括增加或產生賦予來自毛果楊的活性「 CDS5401截短蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述CDS5401_-短相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述CDS5401_-短相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述⑶S5401_截短相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示於與所述CDS5401_-短相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自玉米的ZM06LC319_C0RN_L0FI_151_2385_A的序列被描述為cullin。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自玉米的活性「 cullin」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加
(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述ZM06LC319_C0RN_L0FI_151_2385_A相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述ZM06LC319_C0RN_L0FI_151_2385_A相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述ZM06LC319_C0RN_L0FI_151_2385_A相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示於與所述ZM06LC319_C0RN_L0FI_151_2385_A相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT4G15420. I的序列被描述為PRLI相互作用因子。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「PRLI相互作用因子」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加 (a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT4G15420. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT4G15420. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT4G15420. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT4G15420. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自玉米的60952769. R01. I的序列被描述為60952769.R01. I蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括增加或產生賦予來自玉米的活性「60952769. R01. I蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述60952769. R01. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所不並且展不於與所述60952769. R01. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含不於表II第5列或表IV第7列中並且展不於與所述60952769.R01. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示於與所述60952769. R01. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT5G42380的序列被描述為AT5G42380蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括增加或產生賦予來自擬南芥的活性「AT5G42380蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT5G42380相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT5G42380相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT5G42380相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT5G42380相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自玉米的57972199. R01. I的序列被描述為57972199.R01. I蛋白。 因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自玉米的活性「57972199. R01. I蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述57972199. R01. I相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述57972199. R01. I相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述57972199.R01. I相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示於與所述57972199. R01. I相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自稻的0S02G44730的序列被描述為0S02G44730蛋白。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括增加或產生賦予來自稻的活性「0S02G44730蛋白」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述0S02G44730相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述0S02G44730相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述0S02G44730相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述0S02G44730相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。例如表I第5列中所示來自擬南芥的AT3G24515的序列被描述為泛素綴合酶。因此，在一個實施方案中，用於產生具有増加的產量的植物的本發明的方法包括増加或產生賦予來自擬南芥的活性「泛素綴合酶」的基因產物或其功能性等價物或其同源物的活性，例如增加(a)下述基因的基因產物，所述基因包含表I第5列中所示並且展示幹與所述AT3G24515相同的各行中的核酸分子，或包含表I第7列中所示並且展示幹與所述AT3G24515相同的各行中的其功能性等價物或同源物，優選表IB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的；或(b)多肽，其包含示於表II第5列或表IV第7列中並且展示幹與所述AT3G24515相同的各行中的多肽、共有序列或多肽基序，或者包含表II第7列中所示並且展示幹與所述AT3G24515相同的各個行中的其功能性等價物或同源物，優選表IIB第7列中所示同源物或功能性等價物，例如細胞質的。因此，在細胞或植物的ー個或多個特定區室或細胞器中增加選自2-氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- ニ磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute 蛋白、AT1G29250. I 蛋白、AT1G53885 蛋白、AT2G35300 蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、CDS5394 蛋白、CDS5401 截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、6 -8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋白^亞基、絲氨酸こ醯基轉移酶、絲氨酸羥甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白的多肽活性，並且所述活性賦予所述增加的產量，例如植物表現出ー種或多種增加的產量相關性狀。例如，在如表I或II第6列中所示的細胞區室中増加所述活性，導致相應植物的増加的產量。例如，所述活性的特定定位賦予了如表VIII所示的改善的或増加的產量相關性狀。例如，所述活性可以在植物細胞的質體或線粒體中増加，因此賦予相 應植物中產量的増加。在一個實施方案中，如果在各表I或II的第6列中，術語「質體」列出用於所述多肽，則由本文所述的基因表達或其表達產物(例如在表II中顯示的多肽)所賦予的活性在質體中増加或產生。在一個實施方案中，如果在各表I或II的第6列中，術語「線粒體」列出用於所述多肽，則由本文所述的基因表達或其表達產物(例如在I或II中顯示的多肽)所賦予的活性在線粒體中増加或產生。在另ー實施方案中，本發明涉及ー種方法，用於生產較之相應(例如未經轉化的)野生型植物而言具有増加的產量(例如具有増加的產量相關性狀，例如增強的非生物性環境脅迫耐受性，例如増加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或増加的養分使用效率、內在產量和/或其它增加的產量相關性狀)的例如轉基因的植物，所述方法包括(a)在植物細胞的細胞質中增加或產生根據本發明的ー種或多種所述「活性」，以及(b)在允許較之相應(例如未經轉化的)野生型植物而言具有增加的產量(例如具有増加的產量相關性狀，例如增強的非生物性環境脅迫耐受性，例如増加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或増加的養分使用效率、內在產量和/或其它增加的產量相關性狀)的植物發育的條件下，培育所述植物。
在一種實施方案中，如果各表I中第6列中，針對所述多肽列出了術語「細胞質」，則由在表II中顯示的多肽所賦予的根據本發明的活性在細胞質中増加或產生。術語「細胞質」和「非靶向」將不排除本發明的核酸序列的產物通過其天然存在的序列性質在轉基因生物背景中靶向定位到任何細胞區室。在一種實施方案中，如果各表I中第6列中，針對所述多肽列出了術語「細胞質」，則由在表II中顯示的多肽所賦予的本文公開的活性非靶向增加或產生。就本發明說明書的目的而言，術語「細胞質的」應表示在未加入非天然轉運肽編碼序列的情況下表達本發明的核酸。非天然轉運肽編碼序列是這樣的序列，它不是本發明核酸的天然部分，而是通過分子操作步驟(例如「質體靶向表達」的實施例中所述)加入的。因此，術語「細胞質」不應排除通過其天然存在的序列特性將本發明核酸序列的產物靶向定位至任何細胞區室。在另ー種實施方案中，本發明涉及ー種方法，用於生產較之相應(例如未經轉化的)野生型植物而言具有増加的產量的例如轉基因的植物或其部分，所述方法包括
(al)在植物細胞的細胞器中增加或產生ー種或多種所述多肽的活性，例如所述基因或基因產物基因的活性，例如選自2-氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4-ニ磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L2U57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute蛋白、AT1G29250. I蛋白、AT1G53885蛋白、AT2G35300 蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、⑶S5394蛋白、⑶S5401截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、S-8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、:rubisco亞基結合蛋白3亞基、絲氨酸こ醯基轉移酶、絲氨酸輕甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白的活性，或(a2)在植物細胞中增加或產生表II第3列所示的或表I第5或7列所示的核酸序列編碼的蛋白的活性，所述核酸序列與編碼轉運肽的核酸序列相連；或者(a3)在植物細胞中增加或產生表II第3列所示的或表I第5或7列所示的核酸序列編碼的蛋白的活性，所述核酸序列與編碼細胞器定位序列(尤其是葉綠體定位序列)的核酸序列相連，(a4)在植物細胞中增加或產生表II第3列所示的或表I第5或7列所示的核酸序列編碼的蛋白的活性，所述核酸序列與編碼線粒體定位序列的核酸序列相連，以及(b)從所述植物細胞再生植物；(c)在允許較之相應(例如未經轉化的)野生型植物而言具有增加的產量(例如具有増加的產量相關性狀，例如增強的非生物性環境脅迫耐受性，例如増加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或増加的養分使用效率、內在產量和/或其它增加的產量相關性狀)的植物發育的條件下，培育所述植物。
因此，在另ー實施方案中，在用於生產具有増加的產量的轉基因植物的所述方法中，通過增加或產生如表II第3列所示的蛋白質(由表I第5或7列所示的核酸序列所編碼)的活性來増加或產生所述活性，這是(al)在植物細胞器中，通過轉化針對所述活性在第6列所示的細胞器，或(a2)在植物的質體中，或在其ー個或多個部分中，通過轉化質體，如果針對所述活性在第6列中示出時；(a3)在植物的葉綠體中，或在其ー個或多個部分中，通過轉化葉綠體，如果針對所述活性在第6列中示出吋；(a4)在植物的線粒體中，或在其ー個或多個部分中，通過轉化線粒體，如果針對所述活性在第6列中示出吋。
根據本發明的公開內容，尤其在實施例中，技術人員能夠將轉運肽核酸序列與表I第5和7列中所示的核酸序列相連，例如對於在表I第6列中指出術語「質體」的核酸序列而曰。根據本發明的多個實施方案可以使用任何轉運肽，例如，von Heijne等人(Plant Molecular Biology Reporter, 9 (2), 104, (1991))公開了編碼轉運妝的特定核酸序列，或 Schmidt 等人(J. Biol. Chem. 268 (36), 27447 (1993)), Della-Cioppa 等人(Plant. Physiol. 84，965(1987))，de Castro Silva Filho 等人(Plant Mol.Biol. 30，769(1996))，Zhao 等人(J. Biol. Chem. 270(11), 6081 (1995)), Roaier 等人(Biochem. Biophys. Res. Commun. 196(3), 1414(1993)), Keegstra 等人(Annu. Rev.Plant Physiol.Plant Mol.Biol.40,471 (1989)),Lubben 等人(PhotosynthesisRes. 17，173 (1988))和 Lawrence 等人(J. Biol. Chem. 272 (33)，20357 (1997)))公開了其它轉運肽，所述參考文獻在本文引用作為參考。關於靶向的一般性綜述公開於KermodeAllison R. Critical Reviews, Plant Science 15 (4)，285 (1996),標題 「Mechanisms ofIntracellular Protein Transport and Targeting in Plant Cells. 」。其它編碼轉運肽的核酸序列可分離自任何生物，例如微生物，例如含有質體(優選含有葉綠體)的藻類或植物。「轉運肽」是胺基酸序列，其編碼核酸序列與相應的結構基因一起被翻譯。這意味著轉運肽是翻譯後蛋白質的整體部分，形成了蛋白質的氨基端延伸。這兩者一起翻譯成所謂的「前蛋白」。一般而言，轉運肽在蛋白質運輸進正確的細胞器(如質體)的過程中或運輸後立即被切下，得到成熟蛋白。轉運肽通過協助蛋白質轉運穿過胞內膜而確保了成熟蛋白的正確定位。例如，有益地用於本發明方法中的這些轉運肽來自編碼選自以下蛋白質的核酸序列核酮糖ニ磷酸羧化酶/加氧酶、5-烯醇式丙酮醯莽草酸-3-磷酸合酶、こ醯乳酸合酶、葉綠體核糖體蛋白CS17、Cs蛋白、鐵氧還蛋白、質體藍素、核酮糖ニ磷酸羧化酶活化酶、色氨酸合酶、醯基載體蛋白、質體陪伴蛋白-60、細胞色素c552、22-kDA熱休克蛋白、33-kDa氧相關增強子蛋白 I (Oxygen-evolving enhancer protein I)、ATP 合酶 Y 亞基、ATP 合酶6亞基、葉綠素-a/b-結合蛋白11-1、氧相關增強子蛋白2、氧相關增強子蛋白3、光系統I:P21、光系統I:P28、光系統I:P30、光系統I:P35、光系統I:P37、甘油_3_磷酸醯基轉移酶、葉綠素a/b結合蛋白、CAB2蛋白、羥甲基膽色烷合酶、丙酮酸-正磷酸雙激酶、CAB3蛋白、質體鐵蛋白、鐵蛋白、早期光誘導蛋白、穀氨酸-1-半醛氨基轉移酶、原葉綠素還原酶、澱粉粒結合的澱粉酶合酶(starch-granule-bound amylase synthase)、光系統II的光收穫葉綠素a/b結合蛋白、主要花粉變應原Lol p 5a、質體ClpB ATP依賴性蛋白酶、超氧化物歧化酶、鐵氧還蛋白NADP氧化還原酶、28-kDa核糖核蛋白、31-kDa核糖核蛋白、33-kDa核糖核蛋白、乙醯乳酸合酶、ATP合酶CF。亞基I、ATP合酶CF。亞基2、ATP合酶CF。亞基3、ATP合酶CF。亞基4、細胞色素f、ADP-葡萄糖焦磷酸化酶、穀氨醯胺合酶、穀氨醯胺合酶2、碳酸酐酶、GapA蛋白、熱休克蛋白hsp21、磷酸易位酶、質體ClpA ATP依賴性蛋白酶、質體核糖體蛋白CL24、質體核糖體蛋白CL9、質體核糖體蛋白PsCL18、質體核糖體蛋白PsCL25、DAHP合酶、澱粉磷酸化酶、根醯基載體蛋白II、甜菜醛脫氫酶、GapB蛋白、穀氨醯胺合成酶2、磷酸核酮糖激酶、亞硝酸還原酶、核糖體蛋白L12、核糖體蛋白L13、核糖體蛋白L21、核糖體蛋白L35、核糖體蛋白L40、磷酸丙糖-3-磷酸甘油酸-磷酸易位蛋白、鐵氧還蛋白依賴性穀氨酸合酶、甘油醛-3-磷酸脫氫酶、NADP依賴性蘋果酸酶和NADP蘋果酸脫氫酶、葉綠體30S核糖體蛋白PSrp-I等。
技術人員會理解，可以從質體定位蛋白中容易地分離編碼轉運肽的多種其他核酸序列，所述蛋白從核基因中表達為前體，接著靶向至質體。編碼轉運肽的核酸序列可以分離自來自任何生物的細胞器靶向的蛋白質。優選地轉運肽分離自選自以下的生物傘藻屬(Acetabularia)、擬南芥屬(Arabidopsis)、芸苔屬(Brassica)、辣椒屬(Capsicum)、衣藻屬(Chlamydomonas)、南瓜屬(Cururbita)、杜氏藻屬(Dunaliella)、裸藻屬(Euglena)、黃花菊屬(Flaveria)、大豆屬(Glycine)、向日葵屬(Helianthus)、大麥屬(Hordeum)、浮萍屬(Lemna)、黑麥草屬(Lolium)、番煎屬(Lycopersion)、蘋果屬(Malus)、苜猜屬(Medicago)、日中花屬(Mesembryanthemum)、菸草屬(Nicotiana)、月見草屬(Oenotherea)、稻屬(Oryza)、牽牛屬(Petunia)、菜豆屬(Phaseolus)、劍葉蘚屬(Physcomitrella)、松屬(Pinus)、豌豆屬(Pisum)、蘿蔔屬(Raphanus)、蠅子草屬(Silene)、芥屬(Sinapis)、煎屬(Solanum)、菠菜屬(Spinacea)、甜菊屬(Stevia)、集球藻屬(Synechococcus)、小麥屬(Triticum)和玉米屬(Zea)。更優選地，編碼轉運肽的核酸序列分離自選自以下的生物地中海傘藻(Acetabularia mediterranea)、擬南芥(Arabidopsis thaliana)、芸苔(Brassica campestris)(Brassica napusノ、1 (Capsicum
湊(Chlamydomonas reinhardtii)、I半J瓜(Cururbita moschata)、鹽生杜氏泰(Dunaliellasaiina)、杜氏藻(Dunalielia tertiolecta)、細小裸藻(Euglena gracilis)、Flaveriatrinervia、大顯(Glycine max)、|ロ」d葵(Helianthus annuus)、大麥(Hordeum vulgare)、浮評(Lemna gibbaノ、黑麥阜(Lolium perenne)、^#方ロ (Lycopersion esculentumノ、蘋果(Malus domestica)、野苜猜(Medicago falcata)、紫苜猜(Medicago sativa)、冰葉日中把(Mesembryanthemum crystallinum)、H ネ七丹葉菸草(Nicotiana plumbaginifolia)、美花菸草(Nicotiana sylvestris)、菸草(Nicotiana tabacum)、月見草(Oenothereahookeri)、稻(Oryza sativa)、巖冬如(Petunia hybrida)、米顯(Phaseolus vulgaris)、展葉劍葉蘚(Physcomitrella patens)、黑松(Pinus tunbergii)、豌豆(Pisum sativum)、蘿蔔(Raphanus sativus)、白花幡子草(Silene pratensis)、白芥(Sinapis alba)、馬鈴薯(Solanum tuberosum)、觀菜(Spinacea oleracea)、舌甘菊(Stevia rebaudiana)、聚球藻屬(Synechococcus)、集胞藻屬(Synechocystis)、小麥(Triticum aestivum)和玉米(Zeamays)。可選地，編碼轉運肽的核酸序列可以部分或完全根據現有技術中公開的轉運肽序列的結構來化學合成。這樣的轉運肽編碼序列可用於構建其他表達構建體。有利地用於本發明方法並且作為本發明核酸序列和蛋白質的一部分的轉運肽一般長度為20至120個胺基酸，優選25至110、30至100或35至90個胺基酸，更優選40至85個胺基酸，最優選45至80個胺基酸，並在翻譯後發揮將蛋白質引導至質體(優選葉綠體)的功能。編碼這些轉運肽的核酸序列位於編碼成熟蛋白的核酸序列的上遊。為了將轉運肽編碼核酸與編碼待靶向蛋白質的核酸正確地進行分子連接，有時必須在連接位置引入額外的鹼基對，其形成可用於對不同核酸分子進行分子連接的限制酶識別序列。該方法可導致成熟輸入蛋白的N端出現很少的額外胺基酸，它們通常(並且優選)不幹擾蛋白質的功能。在任何情況下，連接位置處形成限制酶識別序列的額外鹼基對都必須慎重選擇，以避免形成終止密碼子或編碼對蛋白質摺疊產生強烈影響的胺基酸(如脯氨酸)的密碼子。優選地，這些額外的密碼子編碼結構柔性的小胺基酸，例如甘氨酸或丙氨酸。如上文所述，編碼表II第3或5列所示的蛋白的核酸序列以及表I第7列公開的其同源物可與編碼轉運肽的核酸序列連接，這在例如，如果當表I第6列針對核酸分子指示 出術語「質體的」吋。待表達的基因的核酸序列和編碼轉運肽的核酸序列有效相連。因此，轉運肽與編碼表II的第3或5列所示的蛋白的核酸序列和表I第7列所公開的其同源物符合讀框地融合，這在例如，如果當表I第6列針對核酸分子指示出術語「質體的」的時候。從所述本發明核酸序列翻譯來的蛋白是ー類融合蛋白，其表示編碼轉運肽(例如，表V所不的那些,例如,該表的最後ー個)的核酸序列與基因,例如表I第5和7列所不的核酸序列連接，這在例如，如果當表I第6列針對核酸分子指示出術語「質體的」的時候。本領域技術人員能將所述序列以功能方式連接。有利地，在轉運優選進入質體期間，從表II第5和7列所示的蛋白部分上切下轉運肽部分。對表V最後一行所示的優選轉運肽進行切割的所有產物優選在表II第5和7列中提到的蛋白的起始甲硫氨酸前具有N-末端胺基酸序列QIA CSS或QIA EFQLTT0基因，例如在表II第5和7列中提到的蛋白的起始甲硫氨酸前還能可存在其它短胺基酸序列，所述序列範圍在I至20個胺基酸之間，優選2至15個胺基酸之間，更優選3至10個胺基酸之間，最優選4至8個胺基酸之間。在胺基酸序列QIA CSS的情況下，起始甲硫氨酸前面的三個胺基酸來源於LIC(=ligaton independent cloining,無需連接克隆)盒。在表達大腸桿菌基因的情況下，所述短胺基酸序列是優選的。在胺基酸序列QIA EFQLTT的情況下，起始甲硫氨酸前的六個胺基酸來源於LIC盒。在表達釀酒酵母(S. cerevisiae)基因的情況下所述短胺基酸序列是優選的。技術人員知道，其它短序列也可用於表達表I第5和7列提到的基因。此外，技術人員知道下述事實表達基因無需此類短序列。可選地，除了在例如表V中提到的靶向序列(單獨或與其它靶向序列組合)的協助下將基因，例如具有表I I第5和7列所示的序列(優選地，通常在核中編碼的序列)的蛋白質靶向優選至質體之外，本發明的核酸還可被直接引入質體基因組，例如，表I I第6列中對其指示出術語「質體的」的情況下。因此，在一種優選的實施方案中，基因，例如表I第5和7列所示的核酸序列被直接引入質體並在其中表達，這特別在如果表I第6列指示出術語「質體的」的情況下。通過轉化質體，阻斷物種內的特異性轉基因流動，因為大多數物種，例如，玉米、棉花和稻具有嚴格的質體母系遺傳性。通過在植物質體中放入基因，例如表I第5和7列指出的基因(例如，如果表I第6列針對核酸分子指示出術語「質體的」的情況下)或其活性片段，這些基因將不會存在於所述植物的花粉中。在本發明的另ー實施方案中，例如，如果表I第6列指示出術語「線粒體」的話，用於本發明エ藝中的基因，例如表I第5和7列所示的核酸分子被轉化進具有代謝活性的線粒體。為在質體中良好表達，例如，如果表I第6列指示出術語「質體的」的話，將基因，例如表I第5和7列所示的核酸序列引入使用優選有啟動子和終止子(在質體中具有活性，優選地是葉綠體啟動子)的表達盒。此類啟動子的例子包括來自菠菜或豌豆的基因的PsbA啟動子、rbcL啟動子和來自玉米的atpB啟動子。在一個實施方案中，本發明的方法包括以下步驟中的ー個或多個
(a)使蛋白質穩定，所述蛋白質賦予本發明核酸分子所編碼蛋白質或本發明多肽增加的表達，所述本發明核酸分子所編碼蛋白質或所述本發明多肽具有選自2-氧代戊ニ酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- ニ磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute 蛋白、AT1G29250. I 蛋白、AT1G53885 蛋白、AT2G35300 蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、CDS5394 蛋白、CDS5401 截短蛋白、冷反應蛋白、cul I in、細胞色素P450、6 -8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧唳序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋白3亞基、絲氨酸こ醯基轉移酶、絲氨酸羥甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白的本文所述活性，並且與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比賦予增加的產量，例如增加產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如増加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或増加的養分使用效率、內在產量和/或另ー提到的產量相關性狀；(b)使mRNA穩定,所述mRNA賦予編碼(a)中所述的多肽的多核苷酸的增加的表達；(c)増加蛋白質的比活性，所述蛋白質賦予(a)中所述多肽的増加的表達；(d)產生或増加介導蛋白質表達的內源或人工轉錄因子的表達，所述蛋白質賦予(a)中所述多肽的増加的表達；(e)通過向生物或其部分添加ー種或多種外源誘導因子來刺激蛋白質的活性，所述蛋白質賦予(a)中所述多肽的増加的表達；(f)表達編碼蛋白質的轉基因，所述蛋白質賦予(a)中所述多肽的増加的表達；和/或(g)増加基因的拷貝數，所述基因賦予編碼(a)中所述的多肽的核酸分子的増加的表達；(h)通過加入正表達元件或除去負表達元件來増加編碼(a)中所述多肽的內源基因的表達，例如，可使用同源重組將正調節元件(例如用於植物的35S增強子)引入啟動子中，或者從調節區中除去阻抑物元件。可以使用其他基因轉換方法來破壞阻抑物元件或增強正元件的活性——可通過T-DNA或轉座子誘變向植物中隨機引入正元件，並鑑定其中正元件已整合進本發明基因附近從而增強其表達的株系；和/或(i)調節植物的生長條件，以使編碼(a)中所述多肽的基因或該蛋白質本身的表達或活性被增強的方式來進行；
(j)從天然來源或從誘變來源中選擇具有特別高的(a)中所述多肽活性的生物，並將其培育成靶生物，例如良種作物。優選地，所述mRNA是本發明的核酸分子和/或賦予本發明核酸分子所編碼蛋白質増加表達的蛋白質所編碼的，它們是単獨的或者與轉運核酸序列或轉運肽編碼核苷酸序列或者多肽相連，所述多肽具有本文所述活性(例如在増加所編碼多肽的表達或活性後賦予與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如増加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或増加的養分使用效率、內在產量和/或另ー提到的產量相關性狀)，或者具有下述多肽的活性，所述多肽具有表II第3列中所示蛋白質或其同源物的活性。一般而言，生物的細胞或區室中mRNA或多肽的量與所編碼蛋白質的量相關，因此與所述體積中所編碼蛋白質的總體活性相關。所述相關性並不總是線性的，該體積中的活性取決於分子的穩定性或者激活或抑制性輔因子的存在情況。可以多種方式増加上述本發明核酸分子所編碼蛋白質和/或多肽的活性。例如，通過增加基因產物數(例如通過增加表達率，例如引入強啟動子，或者通過增加所表達mRNA的穩定性，從而增加翻譯率)和/或増加基因產物的穩定性從而減少被破壞的蛋白質，來増加生物或其部分(如細胞)中的活性。此外，可以實現降低或増加反應速率或改變(降低或増加)對所得底物的親和カ的方式影響酶的活性或更新。本發明多肽(例如酶)催化中心中的突變可改變酶的更新率，例如敲除必要胺基酸可導致降低或完全敲除酶活性，或者調節子結合位點的缺失或突變可降低負調節，如反饋抑制(或者底物水平也增加時的底物抑制)。可以增加本發明酶的比活性，從而增加更新率或改善輔因子結合。改善編碼mRNA或蛋白質的穩定性也可増加基因產物的活性。對活性的刺激也在術語「増加的活性」的範圍之內。此外，可以改變對上述核酸序列的調節，從而増加基因表達。這可有利地通過異源調節序列或通過改變(例如突變)已有的天然調節序列來實現。有利的方法還可彼此組合。一般而言，可以通過増加生物或其部分(特別是植物細胞或植物細胞細胞器、植物或植物組織或其部分或微生物)中特定編碼mRNA或相應蛋白質的量來増加所述生物或其部分中基因產物的活性。修飾(即增加)可通過內源或外源因子來實現。例如，生物或其部分中活性的增加可通過向培養基或養分中加入基因產物或前體或激活劑或激動劑來實現，或者可通過將所述對象瞬時或穩定地引入生物中來實現。此外，這樣的増加可通過使用轉化和/或靶向將本發明的核酸序列或所編碼蛋白引入正確的細胞區室(例如分別引入核或細胞質或引入質體)來實現。
在一個實施方案中，植物或其部分(例如細胞、組織、器官、細胞器、細胞質等)中與相應的例如未轉化的野生型植物細胞相比増加的產量，例如増加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如増加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另ー提到的產量相關性狀通過增加本發明多肽的內源水平來實現。因此，在本發明的一個實施方案中，本發明涉及ー種方法，其中編碼本發明多核苷酸或核酸分子的基因的基因拷貝數被増加。此外，可通過修飾多肽的轉錄或翻譯調節來例如增加本發明多肽的內源水平。在一個實施方案中，植物或其部分中增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如増加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另ー提到的產量相關性狀可通過對本發明內源基因進行靶向誘變或隨機誘變來實現。例如，可使用同源重組將正調節元件(如用於植物的35S增強子)引入啟動子中，或者從調節區中除去阻抑物元件。此外，可以使用Kochevenko和 Willmitzer (Plant Physiol. 132 (I)，174 (2003))及其參考文獻中描述的類似於基因轉換 的方法來破壞阻抑物元件或者增強正調節元件的活性。此外，可通過T-DNA或轉座子誘變向(植物)基因組中隨機引入正元件，並可篩選正元件整合進本發明基因附近從而增強其表達的株系。通過隨機整合增強子元件來激活植物基因的方法描述於Hayashi等(Science258, 1350(1992))或Weigel等(PlantPhysiol. 122, 1003(2000))以及其中所列的其他參考文獻。正調節元件的增強或者負調節元件的破壞或弱化也可通過常用誘變技術來實現產生化學或放射誘變的群體是ー種常用技術，並為本領域技術人員所知。用於植物的方法描述於Koorneef 等(Mutat Res.Mar. 93 (I) (1982))及其參考文獻，以及 Lightner 和 Caspar 「Methods in MolecularBiology」 Vol. 82。這些技術一般誘導點突變，可使用諸如TILLING (Colbert等，PlantPhysiol, 126, (2001))的方法在任何已知基因中鑑定所述點突變。因此，如果通過同源重組、Tilling法或基因轉換修飾了編碼賦予編碼本發明多肽表達增加之多肽的內源基因(特別是包含本發明核酸分子的基因)，則可增加表達水平。還可以如本文所述向本發明核酸序列中加入靶向序列。需要時，除了靶向序列或其部分以外，調節序列也可與內源蛋白的編碼區有效連接，並控制其轉錄和翻譯或者編碼mRNA或所表達蛋白的穩定性或衰退。為了修飾和控制表達，可以改變、加入或修改啟動子、UTR、剪接位點、加工信號、多腺苷酸化位點、終止子、增強子、阻抑物、轉錄後或翻譯後修飾位點。例如，Hayashi等(Science 258, 1350(1992))或Weigel等(Plant Physiol. 122, 1003(2000))以及其中所列的其他文獻描述了通過隨機整合增強子元件來激活植物基因。例如，可通過將內源啟動子替換為更強的轉基因啟動子或通過將內源3』 UTR替換為提供更高穩定性而不改變編碼區的3』 UTR來調節內源蛋白的表達水平。此外，可通過引入人工轉錄因子(如實施例中所述)來改變轉錄調節。替代性啟動子、終止子和UTR描述於下文。還可以通過引入與編碼表II第3列之蛋白質的基因的編碼區緊密結合併激活其轉錄的合成轉錄因子増加內源多肽的激活，所述內源多肽具有上述活性，例如具有表II第3列之蛋白質或本發明多肽的活性，例如在細胞質和/或細胞器(如質體)中增加表達或活性後賦予與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比増加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如増加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或増加的養分使用效率、內在產量和/或另ー提到的產量相關性狀。在本發明方法的另ー實施方案中，使用這樣的生物，其中上述基因之一或上述核酸之一被突變，以使得所編碼基因產物的活性與未突變蛋白相比受細胞因子的影響較小，或者完全不受其影響。例如，熟知的酶活性調節機制是底物抑制或反饋調節機制。用於引入相應序列的ー個或多個鹼基、核苷酸或胺基酸的取代、缺失和添加的方法和技術描述於下文相應段落中以及列出的參考文獻中，例如Sambrook等，Molecular Cloning, Cold SpringHarbour, NY, 1989。本領域技術人員能夠通過將本發明核酸分子或其表達產物的序列與本領域現狀進行比較來鑑定調節結構域和調節因子結合位點，這通過包含用於鑑定結合位點和調節結構域之算法的計算機軟體方法來實現，或者通過向核酸分子或蛋白質中系統性地引入突變並測定導致比活性増加或每單位體積(特別是細胞)中活性増加的突變來實現。因此，在生物中表達來自在進化上關係較遠的生物的本發明核酸分子或本發明多 肽可能是有利的，例如在真核宿主中使用原核基因，因為在這些情況下宿主細胞的調節機制可能不會弱化該基因或其表達產物的活性(細胞活性或比活性)。所述突變以下述方式引入，所述方式不會不良地影響增加的產量，例如増加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如増加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或増加的養分使用效率、內在產量和/或另ー提到的產量相關性狀。本發明提供了，可以實施上述方法以增強對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或養分使用效率、內在產量和/或另ー提到的產量相關性狀，其中特別增加對低溫的耐受性。本發明不僅限於特定的核酸、特定多肽、特定細胞類型、特定宿主細胞、特定條件或特定方法等本身，而是可以改變，其多種修改和變化對本領域技術人員來說是很明顯的。應該理解，本文使用的術語僅用於描述具體實施方案的目的，而不g在限制。此外，「蛋白質一般由ー個或多個通常被稱為結構域的功能區組成。不同的結構域組合產生自然界中發現的各種各樣的蛋白質。鑑定蛋白質中存在的結構域可因此提供其功能的信息。Pfam-A條目是高質量的手工收集的家族。Pfam資料庫是蛋白質家族的大集合，姆個蛋白質家族由多重序列比對和隱馬爾可夫模型(HMM)代表。」(見The Pfam proteintamilies database:R. D. Finn, et al. , Nucleic Acids Research(2010), Database Issue38:D211-222)。Pfam蛋白質家族資料庫是超過I萬個蛋白質家族的大集合，並可從http://pfam. sanger. ac. uk/獲得。隱馬爾可夫模型(HMM)譜是可用於描述ー組同源蛋白質/結構域序列共有的一致模式的靈活的概率模型。Pfam資料庫中的HMM是從每種蛋白質結構域的代表序列組的比對(稱為種子比對)中構建的。在本申請中列出的Pfam結構域指Pfam 24. 0 (2009年10月發布，包含11912個
家族)。因此，本發明涉及編碼包含ー個或多個Pfam結構域PF01789. 9的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 385的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%，更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含ー個或多個選自PF01789. 9的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的増加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :385多肽的同源物的一致序列，即如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含ー個或多個Pfam結構域PF01789. 9，且所述多肽的表達賦予植物產量的増加。因此，本發明涉及編碼包含ー個或多個Pfam結構域PF03171. 13的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 505的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%，更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多 肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF03171. 13的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的増加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :505多肽的同源物的一致序列，即如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含ー個或多個Pfam結構域PF03171. 13，且所述多肽的表達賦予植物產量的増加。因此，本發明涉及編碼包含ー個或多個Pfam結構域PF00160. 14的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :673的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%，更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00160. 14的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的増加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :673多肽的同源物的一致序列，即如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含ー個或多個Pfam結構域PF00160. 14，且所述多肽的表達賦予植物產量的増加。因此，本發明涉及編碼包含ー個或多個Pfam結構域PF05703. 4和PF08458. 3的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 1629的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含ー個或多個選自PF05703. 4和PF08458. 3的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的増加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. : 1629多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含ー個或多個Pfam結構域PF05703. 4和PF08458. 3，且所述多肽的表達賦予植物產量的増加。因此，本發明涉及編碼包含ー個或多個Pfam結構域PF00288. 19的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。
因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 1710的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00288. 19的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的増加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. : 1710多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含 ー個或多個Pfam結構域PF00288. 19，且所述多肽的表達賦予植物產量的増加。因此，本發明涉及編碼包含ー個或多個Pfam結構域PF00459. 18的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :2227的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00459. 18的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的増加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :2227多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含ー個或多個Pfam結構域PF00459. 18，且所述多肽的表達賦予植物產量的増加。因此，本發明涉及編碼包含ー個或多個Pfam結構域PF00108. 16和PF02803. 11的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :2458的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00108. 16和PF02803. 11的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的増加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :2458多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含ー個或多個Pfam結構域PF00108. 16和PF02803. 11，且所述多肽的表達賦予植物產量的増加。因此，本發明涉及編碼包含ー個或多個Pfam結構域PF01246. 13的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :3464的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF01246. 13的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的増加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :3464多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含ー個或多個Pfam結構域PF01246. 13，且所述多肽的表達賦予植物產量的増加。因此，本發明涉及編碼包含ー個或多個Pfam結構域PF00464. 12的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :3795的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00464. 12的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。
此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :3795多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00464. 12，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF02664. 8的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :4631的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF02664. 8的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :4631多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF02664. 8，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00071. 15的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :5070的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00071. 15的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :5070多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00071. 15，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF01918. 14的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 5839的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF01918. 14的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :5839多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF01918. 14，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF06426. 7的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :5983的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF06426. 7的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :5983多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF06426. 7，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00125. 17的多肽的核酸分 子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :6495的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00125. 17的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :6495多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00125. 17，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00069. 18的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :7435的多肽50%或更高，優選60%、70%或 75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00069. 18的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :7435多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00069. 18，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00847. 13的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :7514的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00847. 13的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :7514多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00847. 13，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。
因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF03345. 7的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :7546的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF03345. 7的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發 明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :7546多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF03345. 7，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF04755. 5的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :8288的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF04755. 5的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :8288多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF04755. 5，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF01501. 13的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :7865的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF01501. 13的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :7865多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF01501. 13，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF06200. 7的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :8065的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF06200. 7的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :8065多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF06200. 7，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00829. 14的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :8105的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00829. 14的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :8105多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV 的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00829. 14，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00447. 10的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :8207的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00447. 10的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :8207多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00447. 10，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00011. 14的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :8409的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00011. 14的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :8409多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00011. 14，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00118. 17的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :8843的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00118. 17的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :8843多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PFOOl 18. 17，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00152. 13和PF01336. 18的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :9982的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00152. 13和PF01336. 18的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :9982多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00152. 13和PF01336. 18，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。 因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00582. 19的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 10881的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00582. 19的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. : 10881多肽的同源物的一致序列，即如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00582. 19，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00011. 14的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 10966的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00011. 14的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. : 10966多肽的同源物的一致序列，即如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00011. 14，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF02171. 10、PF02170. 15和PF08699. 3的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :11419的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF02171. 10、PF02170. 15和PF08699. 3的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. : 11419多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF02171. 10、PF02170. 15和PF08699. 3，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF02798. 13和PF00043. 18的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :11753的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF02798. 13和PF00043. 18的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。
此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. : 11753多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF02798. 13和PF00043. 18，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF03760. 8的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 12197的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF03760. 8的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. : 12197多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF03760. 8，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF04564. 8的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 12317的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF04564. 8的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :12317多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF04564. 8，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF01918. 14的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. :12574的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF01918. 14的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :12574多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF01918. 14，且所述多肽的表達賦予植物產量的增 加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00067. 15的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 12669的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00067. 15的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :12669多肽的同源物的一致序列，即如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00067. 15，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00487. 17和PF00173. 21的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 13132的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00487. 17和PF00173. 21的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :13132多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00487. 17和PF00173. 21，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF09425. 3和PF06200. 7的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 13277的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF09425. 3和PF06200. 7的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :13277多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF09425. 3和PF06200. 7，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF02902. 12的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 13437的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF02902. 12的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :13437多肽的同源物的一致序列，即如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF02902. 12，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00806. 12的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。 因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 13478的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00806. 12的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :13478多肽的同源物的一致序列，即如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00806. 12，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00888. 15和PF10557. 2的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 13552的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00888. 15和PF10557. 2的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. : 13552多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00888. 15和PF10557. 2，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF03152. 7的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 13246的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF03152. 7的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. : 13246多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF03152. 7，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00036. 25的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。
因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 13310的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00036. 25的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. : 13310多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00036. 25，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。因此，本發明涉及編碼包含一個或多個Pfam結構域PF00179. 19的多肽的核酸分子，其用於產生如本文描述的具有增加產量的植物。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。因此，本發明涉及編碼與SEQ ID NO. : 13103的多肽50%或更高，優選60%、70%或75%,更優選80%、85%、90%或95%，甚至更優選96%、97%、98%、99%或更高和最優選100%同一的多肽的核酸分子，所述多肽包含一個或多個選自PF00179. 19的Pfam結構域，且賦予如本文描述的植物的產量的增加。本發明也涉及由所述核酸分子編碼的多肽。此外，本發明涉及編碼包含SEQ ID NO. :13103多肽的同源物的一致序列，S卩如表IV的第7列中所示的多肽的核酸，且所述多肽還包含一個或多個Pfam結構域PF00179. 19，且所述多肽的表達賦予植物產量的增加。本發明還涉及分離的核酸，其包含選自以下的核酸分子(a)編碼表IIB第7列中所示多肽的核酸分子；(b)表IB第7列中所示核酸分子；(C)核酸分子，其由於遺傳密碼的簡併性而源自表II第5列或第7列中所示多肽序列，並賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀；(d)核酸分子，其與包含表I第5列或第7列中所示核酸分子的多核苷酸的核酸分子序列具有 30% 或更多同一性，優選 40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%,99%,99. 5%或更多同一性，並賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀；(e)核酸分子，其編碼與(a)、(b)、(c)或(d)核酸分子所編碼多肽的胺基酸序列具有 30% 或更多同一性、優選至少 40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、99. 5%或更多同一丨丨生的多肽,並具有包含表I第5列中所不多核苷酸的核酸分子所代表的活性，並賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀；(f)核酸分子，其在嚴格雜交條件下與(a)、(b)、(C)、(d)或(e)的核酸分子雜交，並賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀；(g)核酸分子，其編碼可藉助於針對(a)、(b)、(c)、(d)、(e)或⑴核酸分子之一所編碼多肽產生的單克隆或多克隆抗體來分離的多肽，並具有包含表I第5列中所示多核苷酸的核酸分子所代表的活性；(h)核酸分子，其編碼包含表IV第7列中所示共有序列或一種或多種多肽基序的多肽，並優選地具有包含表II或IV第5列中所示多肽的蛋白質所代表的活性；(i)核酸分子，其編碼具有表II第5列中所示蛋白質所代表的活性的多肽，並賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀；(j)核酸分子，其包含可通過使用表III第7列中的引物擴增cDNA文庫或基因組 文庫獲得的多核苷酸，並優選具有包含表II或表IV第5列中所示多肽的蛋白質所代表的活性；和(k)核酸分子，其可通過嚴格雜交條件下篩選合適的核酸文庫(特別是cDNA文庫和/或基因組文庫)獲得，所述篩選中使用包含(a)或(b)核酸分子之互補序列的探針或者使用其片段，所述片段具有(a)至(e)所表徵核酸分子序列之互補核酸分子的15nt，優選20nt、30nt、50nt、100nt、200nt、500nt、750nt或IOOOnt或更多，並且上述核酸分子編碼多肽，該多肽具有包含表I I第5列中所示多肽的蛋白質所代表的活性。在一個實施方案中，根據(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)、⑴、(j)和(k)的核酸分子至少在一個或多個核苷酸上不同於表IA第5列或第7列中所示序列，並優選地編碼至少在一個或多個胺基酸上不同於表IIA第5列或第7列中所示蛋白質序列的蛋白質。例如，根據(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)、⑴、(j)和(k)的核酸分子來自表 IB。在一個實施方案中，本發明涉及上述序列同源物，它們可有利地分離自酵母、真菌、病毒、藻類、細菌，例如醋化醋桿菌(Acetobacter aceti)，(醋桿菌亞屬);Acidithiobacillus ferrooxidans;不動桿菌屬(Acinetobacter sp.);放線桿菌(Actinobacillus sp.);殺鮭氣單胞菌(Aeromonas salmonicida);根癌農桿菌(Agrobacterium tumefaciens) ;Aquifex aeolicus;化胺隱秘桿菌(Arcanobacteriumpyogenes);翠菊黃化植原體(Aster yellows phytoplasma);芽抱桿菌(Bacillus sp.);雙岐桿菌(Bifidobacterium sp.);布氏疏螺旋體(Borrelia burgdorferi);擴展短桿菌(Brevibacterium linens);馬爾他布魯氏菌(Brucella melitensis);巴克納氏菌(Buchnera sp.);溶纖維丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens);空腸彎曲桿菌(Campylobacter jejuni);新月柄桿菌(Caulobacter crescentus);衣原體(Chlamydiasp. ) ;Chlamydophila sp.;泥生綠菌(棲泥綠菌)(Chlorobium limicola) ;Citrobacterrodentium;梭菌(梭狀芽抱桿菌)(Clostridium sp.);睪丸酮叢毛單胞菌(Comamonastestosteroni);棒桿菌(棒狀菌)(Corynebacterium sp.);伯氏考克斯氏體(Coxiellaburnetii);耐放射異常球菌(Deinococcus radiodurans);節瘤偶蹄形菌(Dichelobacternodosus) ; 魚愛德華氏菌(Edwardsiella ictaluri);腸桿菌(Enterobacter sp.);豬紅斑丹毒絲菌(Erysipelothrix rhusiopathiae);大腸桿菌(E. coli);黃桿菌(Flavobacterium sp.) ; 土拉熱弗朗西絲氏菌(Francisella tularensis);弗蘭克氏菌(Frankia sp.)Cpll;具核梭桿菌(Fusobacterium nucleatum);GeobacillusstearothermophiIus;氧化葡糖桿菌(Gluconobacter oxydans);嗜血菌(Haemophilussp.);幽門螺桿菌(Helicobacter pylori);肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae);乳桿菌(Lactobacillus sp.);乳酸乳球菌(Lactococcus Iactis);利斯特氏菌(Listeriasp.) ; Mannheimia haemoIytica; Mesorhizobium loti ;深海嚼甲基菌(Methylophagathalassica);銅綠微囊藍細菌(Microcystis aeruginosa);微顫藍細菌(Microscillasp.)PREl;莫拉氏菌(Moraxella sp.)TA144;分枝桿菌(Mycobacterium sp.);枝原體(Mycoplasma sp.);奈瑟氏球菌(Neisseria sp .);亞硝化單胞菌(Nitrosomonassp.);念珠藍細菌(Nostoc sp.)PCC 7120;Novosphingobium aromaticivorans;酒酒球菌(Oenococcus oeni);梓樣泛菌(Pantoea citrea);多殺巴斯德氏菌(Pasteurellamultocida);戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus);坑形席藍細菌(Phormidiumfoveolarum) ;Phytoplasma sp. ;Plectonema boryanum;棲瘤胃普雷沃氏菌(Prevotellaruminicola);丙酸桿菌(Propionibacterium sp.);普通變形菌(Proteus vulgaris);假單胞菌(Pseudomonas sp.) ; Ralstonia sp.;根瘤菌(Rhizobium sp.);馬紅球菌(Rhodococcus equi);海洋紅嗜熱鹽菌(Rhodothermus marinus);立克次氏體(Rickettsiasp.);鴨痕立默氏菌(Riemerella anatipestifer);生黃瘤胃球菌(Ruminococcusf Iavefaciens);沙門氏菌(Salmonella sp.);反會月形單胞菌(Selenomonasruminantium);嗜蟲沙雷氏菌(Serratia entomophila);希瓦氏菌(Shigella sp.);苜猜中華根瘤菌(Sinorhizobium meliloti);葡萄球菌(Staphylococcus sp.);鏈球菌(Streptococcus sp.);鏈黴菌(Streptomyces sp.);聚球藍細菌(Synechococcussp.);集胞藻(Synechocystis sp.)PCC 6803;海棲熱袍菌(Thermotoga maritima);密螺旋體(Treponema sp.);解脲鳥枝原體(Ureaplasma urealyticum);霍亂弧菌(Vibrio cholerae);副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus);苛養木桿菌(Xylellafastidiosa);耶爾森氏菌(Yersinia sp.);運動發酵單胞菌(Zymomonas mobilis)，優選沙門氏菌(Salmonella sp.)或大腸桿菌或植物，優選分離自酵母，例如分離自酵母屬(Saccharomyces)、畢赤酵母屬(Pichia)、假絲酵母屬(Candida)、漢遜酵母屬(Hansenula)、球擬酵母屬(Torulopsis)或裂殖酵母屬(Schizosaccharomyces)或者植物，如擬南芥、玉米、小麥、黑麥、燕麥、黑小麥、稻、大麥、大豆、花生、棉花、琉璃苣、向日葵、亞麻子植物(linseed)、報春花、油菜籽植物(rapeseed)、卡諾拉油菜(canola)和球莖甘藍、木薯(manihot)、胡椒、向日葵、萬壽菊；煎科植物包括馬鈴薯、菸草、煎子、西紅柿；蠶豆屬物種、豌豆、苜蓿；灌木植物如咖啡、可可、荼；柳屬物種；樹木如油棕、椰子；多年生草本植物如黑麥草和羊茅草；飼料作物如苜蓿和三葉草；以及分離自例如雲杉、松或冷杉。更優選地，上述序列的同源物可分離自釀酒酵母、大腸桿菌或集胞藻(Synechocystis)或植物，優選歐洲油菜、大豆、玉米、棉花或稻。 本發明的蛋白質優選通過重組DNA技術產生。例如，將編碼該蛋白的核酸分子克隆進表達載體中，例如克隆進雙元載體中，將該表達載體引入宿主細胞，例如擬南芥野生型NASC N906或下文實施例中所述任何其他植物細胞，蛋白質在所述宿主細胞中表達。雙兀載體的實例為 pBIN19，pBIlOl、pBinAR (ll(if gen和 Willmitzer, Plant Science66，221 (1990) )、pGPTV、pCAMBIA、pBIB-HYG、pBecks、pGreen 或 pPZP (Hajukiewicz, P.等，Plant Mo I. Biol. 25, 989(199 4),和 Hellens 等，Trends in PlantScience5，446(2000))。在一個實施方案中，本發明蛋白質優選在細胞區室(例如質體)中產生。將核酸引入質體並在該區室中產生蛋白質的方法為本領域技術人員已知，並也描述於本申請中。在一個實施方案中，本發明的多肽是在如表II第6列中所示表達後定位(例如非靶向的、線粒體或質體)的蛋白質，例如其與上文所述用於質體定位的轉運肽融合。在另一實施方案中，本發明蛋白質例如在細胞的細胞質中產生，而沒有進一步的靶向信號(例如如本文所述)。在細胞質中產生蛋白質的方法為本領域技術人員已知。生產沒有人工靶向的蛋白質的方法為本領域技術人員已知。有利地，本發明的核酸序列或基因構建體與至少一個報告基因一起克隆進表達盒中，該表達盒通過載體引入生物中，或者直接引入基因組中。該報告基因應允許通過生長、螢光、化學物質、生物發光或耐受性測定或通過光度測量而容易地進行檢測。可以提 到的報告基因的實例為抗生素或除草劑耐受性基因、水解酶基因、螢光蛋白基因、生物發光基因、糖或核苷酸代謝基因或生物合成基因，例如Ura3基因、Ilv2基因、螢光素酶基因、^ -半乳糖苷酶基因、gfp基因、2-去氧葡萄糖-6-磷酸磷酸酶基因、P -葡糖醛酸糖苷酶基因、3 -內醯胺酶基因、新黴素磷酸轉移酶基因、潮黴素磷酸轉移酶基因、突變的乙醯羥酸合酶(AHAS)基因(也稱為乙醯乳酸合酶(ALS)基因)、D-胺基酸代謝酶基因或BASTA(=草銨膦耐受性)基因。這些基因允許容易地測量和定量轉錄活性，從而測量和定量基因表達。這樣，可以鑑定顯示不同生產力的基因組位置。為進行表達，本領域技術人員熟悉將核酸序列引入不同細胞器(例如優選的質體)的不同方法。這些方法公開於例如MaigaP. (Annu. Rev. Plant Biol. 55, 289 (2004)), Evans T. (WO 2004/040973), McBride K. E.等(US 5，455，818)，Daniell H.等(US5, 932，479 和 US 5，693，507)以及 Straub J. M.等(US6，781，033)。優選的方法是轉化小孢子來源的下胚軸或子葉組織(是綠色的，因此含有大量質體)葉組織，其後在選擇培養基上從所述轉化的植物材料再生枝條。用於對植物材料進行轉化轟擊的方法或獨立複製穿梭載體的使用為本領域技術人員所熟知。還可以進行質體的PEG介導轉化，或者用雙元載體進行農桿菌轉化。用於質體轉化的有用標記是陽性選擇標記，例如氣黴素、鏈黴素、卡那黴素、新黴素、阿米黴素、大觀黴素、二嚷和/或林可黴素耐受性基因。通常作為第二標記的本領域中已知的其他標記，編碼針對除草劑耐受性的基因可用於進一步選擇，例如膦絲菌素(=草銨膦，BASTA ，Liberty ，由bar基因編碼)、草甘膦(=N-(膦醯基甲基)甘氨酸，Roundup ，由5-烯醇式丙酮基莽草酸-3-磷酸合酶基因=epsps編碼)、磺脲類(如Staple ，由乙醯乳酸合酶(ALS)基因編碼)、咪唑啉酮[=頂1，如咪草煙，imazamox, Clearfield ,由乙醯輕酸合酶(AHAS,也稱為乙醯乳酸合酶(ALS))編碼或者溴草腈(=BUctrilTM，由oxy基因編碼)或者編碼抗生素(如潮黴素或G418)的基因。這些第二標記在轉化多數基因組拷貝的情況下是有用的。此外，陰性選擇標記(如細菌胞嘧啶脫氨酶，由codA基因編碼)也可用於轉化質體。為增加對轉化體加以鑑定的可能性，還可能想要使用報告基因來代替前述耐受性基因或者在所述基因之外還使用報告基因。報告基因例如是￠-半乳糖苷酶基因、￠-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)基因、鹼性磷酸酶基因和/或綠色螢光蛋白(GFP)基因。
在一個優選的實施方案中，核酸構建體(例如表達盒)包含編碼序列上遊(即5』末端)的啟動子和下遊(即3』末端)的多腺苷酸化信號，以及任選的其他調節元件，它們與具有表I第5列和第7列中所示SEQ ID NO的核酸之一的間插編碼序列有效連接。有效連接指啟動子、編碼序列、終止子和任選的其他調節元件依次排列，以使得每個調節元件可以正確的方式在編碼序列的表達中發揮其功能。在一個實施方案中，優選用於有效連接的序列為確保亞細胞定位至質體的靶向序列。然而，也可以利用確保亞細胞定位至線粒體、內質網(=ER)、細胞核、油小體或其他區室的靶向序列，以及翻譯啟動子例如菸草花葉病毒的 5』 前導序列(Gallie 等，Nucl. Acids Res. 15 8693(1987))。例如，核酸構建體(例如表達盒)可以含有組成型啟動子或組織特異性啟動子(優選USP或油菜籽蛋白啟動子)、待表達基因和ER滯留信號。就ER滯留信號而言，優選使用KDEL胺基酸序列(賴氨酸、天冬氨酸、穀氨酸、亮氨酸)或KKX胺基酸序列(賴氨酸-賴氨酸-X-停止，其中X表示每一種其他已知的胺基酸)。為在宿主生物(例如植物)中進行表達,有利地將表達盒插入載體中，例如質粒、噬菌體或其他允許該基因在宿主生物中最佳表達的DNA。合適的質粒的實例為大 腸桿菌中的 PLG338、pACYC184、pBR 系列如 pBR322、pUC 系列如 pUC18 或 pUC19、M113mp系列、pKC30、pRep4、pHSl、pHS2、pPLc236、pMBL24、pLG200、pUR290、pIN-III113_Bl、入 gtll 或 pBdCI;鏈黴菌中的 pIJlOl、pIJ364、pIJ702 或 pIJ361;芽孢桿菌中的 pUBllO、pC194或pBD214;棒桿菌中的pSA77或pAJ667;真菌中的pALSl、pIL2或pBB116;其他有利的真菌載體描述於 Romanos M. A.等，Yeast 8, 423 (1992)和 van den HondeI, C.A. M. J. J.等[(1991)，，Heterologous gene expression in filamentous fungi 「]以及 「More Gene Manipulations」 in，，Fungi，，Bennet J. ff. &Lasure L. L.編輯，396-428頁，Academic Press, San Diego,和」Gene transfer systems and vector developmentfor filamentous fungi 「[van den Hondel, C. A. M. J. J. &Punt, P. J. (1991) :AppliedMolecular Genetics of Fungi, Peberdy, J. F.等編輯，1-28 頁，Cambridge UniversityPress:Cambridge]。有利的酵母啟動子的實例為 2 y M、pAG_l、YEp6、YEp13 或 pEMBLYe23。藻類或植物啟動子的實例為PLGV23、pGHlac+、pBIN19、pAK2004、pVKH或pDH51 (參閱Schmidt, R.和 Willmitzer, L.，Plant Cell Rep. 7, 583 (1988))) 上文指出的載體或者上文所指出載體的衍生物僅為可能的質粒中的一部分。其他質粒為本領域技術人員所熟知，並可見於例如」 Cloning Vectors」(Pouwels P. H.等編輯 Elsevier, Amsterdam-NewYork-Oxford, 1985, ISBN 0444904018)。合適的植物載體描述於 「Methods in PlantMolecular Biology and Biotechnology」(CRC Press, Ch. 6/7，71-119 頁)等。有利的載體已知為能在大腸桿菌和農桿菌中複製的穿梭載體或雙元載體。在載體的另一實施方案中，本發明的表達盒還可有利地以線性DNA的形式引入生物中，並通過異源或同源重組整合進宿主生物的基因組中。這種線性DNA可由線性化的質粒構成，或者僅由作為載體的表達盒或本發明核酸序列構成。核酸序列還可以其自身引入生物中。如果除了本發明核酸序列外還向生物中引入其他基因，則在單個載體與報告基因一起或者每個基因在載體中帶有一個報告基因均可引入，其中不同載體可同時或連續引入。
所述載體有利地含有至少一個拷貝的本發明核酸序列和/或本發明的表達盒(=基因構建體)。本發明還提供分離的重組表達載體，其包含編碼表II第5列或第7列中所示多肽的核酸，其中該載體在宿主細胞中的表達導致與宿主細胞的野生型品種相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對 非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀。本發明的重組表達載體包含本發明的核酸，其為適於在宿主細胞中表達該核酸的形式，這意味著，重組表達載體包含基於用於表達的宿主細胞選擇的與待表達核酸序列有效連接的一個或多個調節序列。本領域技術人員應該理解，表達載體的設計可取決於諸如待轉化宿主細胞的選擇、期望的多肽表達水平等因素。本發明的表達載體可引入宿主細胞中，從而產生本文所述核酸所編碼的多肽或肽，包括融合多肽或肽。本發明的重組表達載體可設計成在植物細胞中表達本發明的多肽。例如可在植物細胞中表達本發明的核酸分子(參閱Schmidt R.,和Willmitzer L. , PlantCell Rep. 7 (1988);Plant Molecular Biology and Biotechnology,C Press,BocaRaton, Florida,第 6/7 章，71-119 頁(1993) ;ffhite F. F. , Jenes B.等，Techniques forGene Transfer, :Transgenic Plants, Vol. I, Engineering and Utilization, Kung和WuR.編輯，128-43，Academic Pres s: 1993; Potrykus, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Molec.Biol. 42, 205 (1991),及其參考文獻)。合適的宿主細胞還討論於Goeddel, Gene ExpressionTechnology:Methods in Enzymology 185, Academic Press: San Diego, CA(1990)。例如，可將植物表達盒裝入 pRT 轉化載體中((a) Toepfer 等，Methods Enzymol. 217, 66 (1993), (b)Toepfer等,Nucl. Acids. Res. 15, 5890 (1987))。或者,還可以在體外轉錄和翻譯重組載體(=表達載體)，例如使用17啟動子和I7RNA聚合酶。在本發明的另一個實施方案中，在植物和植物細胞例如單細胞植物細胞(如藻類)(參閱 Falciatore 等,Marine Biotechnology I (3), 239 (1999)及其參考文獻)和來自高等植物(例如種子植物，如作物植物)的植物細胞中表達本發明的核酸分子，從而例如從植物細胞再生植物。可通過任何方法將表II第5列或第7列中所示的核酸分子「引入」植物細胞中，所述方法包括轉染、轉化或轉導、電穿孔、微粒轟擊、農桿菌感染等。本領域技術人員已知的一種轉化方法是將開花植物浸入農桿菌溶液中(其中所述農桿菌含有本發明的核酸)，然後對轉化配子進行育種。用於轉化或轉染宿主細胞(包括植物細胞)的其他合適方法可見於Sambrook等，見上文以及其他實驗手冊如Methods in Molecular Biology, 1995, Vol. 44, Agrobacterium protocols, Gartland和Davey編輯，Humana Press, Totowa, NewJersey。 在本發明的一個實施方案中，通過農桿菌介導的基因轉移將編碼表II第5列或第7列中所核酸分子的核酸分子轉染進植物中。農桿菌介導的植物轉化可使用例如 GV3101(pMP90)(Koncz 和 Schell, Mol. Gen. Genet. 204，383 (1986))或LBA4404(Clontech)根癌農桿菌菌株來進行。轉化可通過標準轉化和再生技術來進行(Deblaere 等，Nucl. Acids Res.13,4777 (1994), Gelvin, Stanton B.和 SchilperoortRobert A, Plant Molecular Biology Manual,第二 版-Dordrecht:Kluwer AcademicPubl. , 1995. -Sect. , Ringbuc Zentrale Signatur:BTlI-P ISBN 0-7923-2731-4;GlickBernard R. , Thompson John E., Methods in Plant Molecular Biology andBiotechnology, Boca Raton:CRC Press, 1993 360S.，ISBN0-8493-5164-2)。例如，可通過子葉或下胚軸轉化來轉化油菜籽植物(Moloney等，Plant Cell Report 8，238 (1989) ; DeBlock等，Plant Physiol. 91, 694(1989))。用於農桿菌和植物選擇的抗生素的使用取決於用於轉化的雙元載體和農桿菌菌株。一般使用卡那黴素作為植物選擇標記來進行油菜籽植物的選擇。可使用如Mlynarova等，Plant Cell Reportl3, 282 (1994)所述技術通過農桿菌介導基因轉移進亞麻中。此外，可以使用如歐洲專利號424047、美國專利號5，322，783、歐洲專利號397687、美國專利號5，376，543或美國專利號5，169，770所述的技術來轉化大豆。可通過微粒轟擊、聚乙二醇介導的DNA攝取或通過碳化矽纖維技術來實現玉米轉化(參閱如 Freeling 和 Walbot 「The maize handbook」 Springer Verlag:New York(1993) ISBN3-540-97826-7)。玉米轉化的具體實例可見於美國專利號5，990，387，小麥轉化的具體實例可見於PCT申請號W093/07256。根據本發明，如果整合進非染色體自主複製子或整合進植物染色體或細胞器基因 組中，則所引入的編碼表II第5列或第7列所示多肽或其同源物的核酸分子可在植物細胞中穩定維持。或者，所引入的核酸分子可存在於染色體外的非複製型載體中，並瞬時表達或具有瞬時活性。在一個實施方案中，可以產生其中核酸分子已整合進基因組中的異源重組微生物，製備載體，其含有編碼表II第5列或第7列所示蛋白質的核酸分子的至少一部分，其中引入了缺失、添加或取代，以改變(例如功能性破壞)基因。例如，所述基因是酵母基因如釀酒酵母基因或集胞藻屬基因，或細菌基因如大腸桿菌基因，但也可以是來自相關植物或甚至來自哺乳動物或昆蟲來源的同源物。載體可設計成使得在同源重組時編碼表II第5列或第7列所示蛋白質的內源核酸分子被突變或以其他方式改變，但仍編碼功能性多肽(例如，可以改變上遊調節區，從而改變內源核酸分子的表達)。在一個優選的實施方案中，本發明蛋白質的生物活性在同源重組後增加。為了通過同源重組產生點突變，可以在稱為嵌合修復術(chimeraplasty)的技術中使用DNA-RNA雜交體(Cole-Strauss等，Nucleic Acids Research27 (5), 1323(1999)和 Kmiec, Gene Therapy AmericanScientist. 87 (3)，240 (1999))。展葉劍葉蘚(Physcomitrella paten)中的同源重組操作也是本領域技術人員所熟知的，並考慮用於本文中。而在同源重組載體中，編碼表II第5列或第7列中所示蛋白質的核酸分子中改變的部分在其5』和3』末端的側翼為額外的基因核酸分子，以允許在該載體所攜帶的外源基因與微生物或植物中的內源基因之間發生同源重組。所述額外的側翼核酸分子為足以與內源基因發生成功的同源重組的長度。載體中一般包含數百個鹼基對至數千鹼基對的側翼DNA(5』和3』端都是如此)。對同源重組載體的描述參閱如Thomas K. R.,和Capecchi M. R.，Cell 51，503 (1987)，或者對展葉劍葉蘚中基於cDNA的重組參閱Strepp等，PNAS, 95 (8)，4368 (1998)。將該載體引入微生物或植物細胞中(例如通過聚乙二醇介導的DNA)，並使用本領域已知的技術選擇所引入基因已與內源基因發生同源重組的細胞。無論是存在於染色體外非複製型載體中還是存在於整合進染色體的載體中，編碼表II第5列或第7列中所示核酸分子的核酸分子均優選存在於植物表達盒中。植物表達盒優選地含有調節序列，所述調節序列能在植物細胞中驅動與其有效連接的基因表達，以使每個序列可發揮其功能，例如通過聚腺苷酸化信號來終止轉錄。優選的多腺苷酸化信號是來源於根癌農桿菌t-DNA(例如Ti質粒pTiACH5中稱為章魚鹼合酶的基因3)的那些(Gielen等，EMBO J. 3, 835(1984))或其功能等價物，但在植物中具有功能活性的其他終止子也是合適的。由於植物基因表達經常不僅受限於轉錄水平，因此植物表達盒優選含有其他有效連接的序列，如翻譯增強子，如含有增加多肽/RNA比值的菸草花葉病毒5』非翻譯前導序列的超驅動序列(Gallie等，Nucl. Acids Research15，8693(1987))。植物表達載體的實例包括Becker D.等，Plant Mol. Biol. 20, 1195(1992)以及 Bevan M. W.，Nucl. Acid. Res. 12，8711 (1984);和 「Vectors for Gene Transfer inHigher Plants，，Transgenic Plants, Vol. I, Engineering and Utilization, Kung 和 WuR. ,Academic Press, 1993，S. 15-38 中詳細描述的那些。宿主生物(=轉基因生物)有利地含有至少一個拷貝的本發明核酸和/或本發明的核酸構建體。 因為增加的對非生物性環境脅迫的耐受性和/或產量是希望在多種植物中遺傳的一種一般性狀，所述植物例如玉米、小麥、黑麥、燕麥、黑小麥、稻、大麥、大豆、花生、棉花、油菜籽植物和卡諾拉油菜、木薯(manihot)、胡椒、向日葵和萬壽菊；茄科植物如馬鈴薯、菸草、茄子和番茄；蠶豆屬物種、豌豆、苜蓿；灌木植物(咖啡、可可、茶)；柳屬物種；樹木(油棕、椰子)；多年生草本植物和飼料作物，這些作物植物也是本發明另一實施方案中遺傳改造的優選祀植物。飼料作物包括但不僅限於冰草(wheatrass)、薦草(Canarygrass)、雀麥草(Bromegrass)、披喊草(Wildrye Grass)、早熟禾(Bluegrass)、鴨茅(Orchardgrass)、苜猜、Salfoin、百脈根(Birdsfoot Trefoil)、雜三葉(Alsike clover)、紅三葉(red clover)和草木禪(Sweet clover)。原則上，所有植物均可用作宿主生物。優選的轉基因植物為例如選自以下科械樹科(Aceraceae)、漆樹科(Anacadiaceae)、傘形科(Apiaceae)、菊科(Asteraceae)、十字花科(Brassicaceae)、仙人掌科(Cactaceae)、葫蘆科(Cucurbitaceae)、大戟科(Euphorbiaceae)、！^^# (Fabaceae)、錦奏科(Malvaceae)、睡蓮科(Nymphaeaceae)、罌■粟科(Papaveraceae)、蓄薇科(Rosaceae)、楊柳科(Salicaceae)、爺科(Solanaceae)、掠桐科(Arecaceae)、鳳梨科(Bromeliaceae)、莎草科(Cyperaceae)、鸞尾科(Iridaceae)、百合科(Liliaceae)、蘭科(Orchidaceae)、龍膽科(Gentianaceae)、唇形科(Labiaceae)、木蘭科(Magnoliaceae)、毛直科(Ranunculaceae)、Carifolaceae、菌草科(Rubiaceae)、玄參科(Scrophulariaceae)、石竹科(Caryophyllaceae)、杜胃$花科(Ericaceae)、寥科(Polygonaceae)、堇菜科(Violaceae)、燈心草科(Juncaceae)或禾本科(Poaceae)並優選來源於選自槭樹科、漆樹科、十字花科、葫蘆科、豆科、罌粟科、薔薇科、茄科、百合科或禾本科植物。優選作物植物，如有利地選自如下屬的植物花生、油菜(oilseed rape)、卡諾拉油菜(canola)、向日葵屬、紅花、橄欖(olive)、芝麻(sesame)、榛子(hazelnut)、扁桃(almond)、鱷梨(avocado)、月桂(bay)、南瓜(pumpkin/squash)、胡麻、大豆(soya)、阿月混子(pistachio)、琉璃苣、玉米、小麥、黑麥、燕麥、高粱(sorghum)和粟(millet)、黑小麥、稻、大麥、木薯(cassava)、馬鈴薯、甜菜、茄子、苜蓿和多年生草本和飼用植物、油棕、蔬菜(芸苔屬植物、根用蔬菜、塊莖類蔬菜、莢果蔬菜、果類蔬菜、蔥蒜類蔬菜、葉用蔬菜和莖用蔬菜)、養麥(buckwheat)、菊芋(Jerusalem artichoke)、香豆(broad bean)、野豌豆(vetches)、小扁豆(lentil)、四季豆(dwarf bean)、羽扇豆、三葉草和紫花苜猜，此處僅提到它們中的某些。在本發明的一個實施方案中，轉基因植物選自穀類、大豆、油菜籽植物(包括油菜(oil seed rape)，特別是卡諾拉油菜和冬油菜)、棉花、甘鹿、糖蘿蔔(sugar beet)和馬鈴薯，特別是玉米、大豆、油菜籽植物(包括油菜，特別是卡諾拉油菜和冬油菜)、棉花、小麥和稻。
在本發明的另一實施方案中，轉基因植物為裸子植物，特別是雲杉、松樹或冷杉。在一個實施方案中，宿主植物選自槭樹科、漆樹科、傘形科、菊科、十字花科、仙人掌科、葫蘆科、大戟科、豆科、錦葵科、睡蓮科、罌粟科、薔薇科、楊柳科、茄科、棕櫚科、鳳梨科、莎草科、鸞尾科、百合科、蘭科、龍膽科、唇形科、木蘭科、毛莨科、Carifolaceae、菌草科、玄參科、石竹科、杜鵑花科、蓼科、堇菜科、燈心草科或禾本科並優選來源於選自槭樹科、漆樹科、十字花科、葫蘆科、豆科、罌粟科、薔薇科、茄科、百合科或禾本科植物。優選作物植物並且特別是本文中以上提到的植物作為宿主植物，如以上提到的科和屬，例如優選的物種是腰果(Anacardium occidentale)、金蓋花(Calendula officinalis)、紅花(Carthamus tinctorius)、菊芋(Cichorium intybus)、洋薊(Cynara scolymus)、向日葵(Helianthus annus)、香葉萬壽菊(Tagetes Iucida)、萬壽菊(Tagetes erecta)、細葉萬壽菊(Tagetes tenuifolia);胡蘿蔔(Daucus carota);歐洲棒(Corylus avellana)、土耳其棒(Corylus colurna)、琉璃苣(Borago officinalis);歐洲油菜、憲青(Brassicarapa ssp.)、野歐白芥(Sinapis arvensis)、芥菜(Brassica juncea)、芥菜原變種(Brassica juncea var. juncea)、皺葉芥菜(Brassica juncea var. crispifolia)、大葉芥菜(Brassica juncea var. foliosa)、黑芥(Brassica nigra)、Brassica sinapioides、Melanosinapis communis)、甘藍(Brassica oleracea)、擬南芥、鳳梨(Anana comosus)、Ananas ananas、Bromelia comosa、番木瓜(Carica papaya)、大麻(Cannabis sative)、甘薯(Ipomoea batatus)、提琴葉牽牛花(Ipomoea pandurata)、Convolvulus batatas、Convolvulus tiliaceus、Ipomoea fastigiata、Ipomoea tiliacea、三裂葉墓(Ipomoeatriloba)、Convolvulus panduratus、舌甘菜(Beta vulgaris)、舌甘蘿蔔(Beta vulgarisvar. altissima)、甜菜(原變種)(Beta vulgaris var. vulgaris)、沿海甜菜(Betamaritima)、Beta vulgaris var. perennis、Beta vulgaris var. conditiva、Betavulgaris var. esculenta、異瓜(Cucurbita maxima)、灰杆南瓜(Cucurbita mixta)、西葫蘆(Cucurbita pepo)、南瓜(Cucurbita moschata)、油撤攬(Olea europaea)、木薯(Manihot utilissima)、Janipha Manihot、Jatropha manihot、Manihot aipil、Manihot dulcis、Manihot manihot、Manihot melanobasis、木薯(Manihot esculenta)、範麻(Ricinus communis)、豌豆(Pi sum sativum)、飼料豌豆(Pi sum arvense)、早生矮豌豆(Pisum humile)、紫花苜猜(Medicago sativa)、野苜猜(Medicago falcata)、雜交苜猜(Medicago varia)、大豆、Dolichos soja、寬葉蔓豆(Glycine gracilis)、Glycinehispida、Phaseolus max、Soja hispida、Soja max、椰子(Cocos nucifera)、荼麓子天竺葵(Pelargonium grossularioides)、Oleum cocoas、月桂(Laurus nobilis)、魚號梨(Perseaamericana)、花生(Arachis hypogaea)、亞麻(linum usitatissimum)、linum humile、奧地利亞麻(linum austriacum)、linum bienne、窄葉亞麻(linum angustifolium)、灣亞麻(linum catharticum)、金黃亞麻(linum flavum)、大花亞麻(linum grandiflorum)、Adenolinum grandiflorum、劉易斯亞麻(linum Iewisii)、那旁亞麻(linum narbonense)、宿根亞麻(linum perenne)、劉易斯宿根亞麻(linum perenne var. lewisii)、Iinumpratense、linum trigynum、石植(Punica granatum)、陸地棉(Gossypium hirsutum)、樹棉(Gossypium arboreum)、海島棉(Gossypium barbadense)、草棉(Gossypium herbaceum)、瑟伯氏棉(Gossypium thurberi)、香蕉(Musa nana)、小果野蕉(Musa acuminata)、大蕉(Musa paradisiaca)、色蕉(Musa spp.)、油掠(Elaeis guineensis)、東方暫粟(Papaverorientale)、虞美人(Papaver rhoeas)、Papaver dubium、古月麻(Sesamum indicum)、樹古月椒(Piper aduncum)、Piper amalago、狹葉古月椒(Piper angustifolium)、Piper auritum、萎葉(Piper betel)、畢澄煎(Piper cubeba)、蓽菝(Piper longum)、胡椒(Piper nigrum)、假蓽薇(Piper retrofractum)、Artanthe adunca、Artanthe elongata、Peperomia elongata、Piper elongatum、Steffensia elongata、大麥(Hordeum vulgare)、芒穎大麥草(Hordeumjubatum)、鼠大麥(Hordeum murinum)、黑麥狀大麥草(Hordeum secalinum)、栽培二稜大麥(Hordeum distichon)、三叉大麥(Hordeum aegiceras)、栽培六稜大麥(Hordeum hexastichon. ^Hordeum hexastichum)、Hordeum irregulare、大麥(Hordeum sativum)、黑麥狀大麥草(Hordeum secalinum)、燕麥(Avena sativa)、野燕麥(Avena fatua)、比贊燕麥(Avena byzantina)、野燕麥(原變種)(Avena fatua var. sativa)、雜種野燕麥(Avenahybrida)、雙色高梁(Sorghum bicolor)、石茅高梁(Sorghum halepense)、甜高梁(Sorghumsaccharatum)、高梁(Sorghum vulgare)、Andropogon drummondii、Holcus bicolor、Holcus sorghum、Sorghum aethiopicum、Sorghum arundinaceum、卡佛爾高梁(Sorghumcaffrorum)、垂穗高梁草(Sorghum cernuum)、甜高梁(Sorghum dochna)、 Sorghumdrummondii、硬高梁草(Sorghum durra)、Sorghum guineense^Sorghum lanceolatum、多脈高梁草(Sorghum nervosum)、舌甘高梁(Sorghum saccharatum)、Sorghum subglabrescens、Sorghum verticilliflorum、高梁(Sorghum vulgare)、石茅高梁(HoIcus halepensis)、黍(Sorghum miliaceum)(穀子(millet))、稷(Pan i cum militaceum)、玉米、普通小麥(Triticum aestivum)、硬粒小麥(Triticum durum)、圓柱小麥(Triticum turgidum)、Triticum hybernum、馬卡小麥(Triticum macha)、普通小麥(Triticum sativum)或普通小麥(Triticum vulgare)、咖啡(Cofea spp.)、小果咖啡(Coffea arabica)、中果咖啡(Coffea canephora)、大果咖啡(Coffea Iiberica)、辣椒(Capsicum annuum)、Capsicum annuum var. glabriusculum、小米椒(Capsicum frutescens)、辣椒(Capsicumannuum)、菸草(Nicotiana tabacum)、馬鈴薯(Solanum tuberosum)、煎(Solanummelongena)、番煎(Lycopersicon esculentum)、番煎(Lycopersicon lycopersicum.)、梨形番煎(Lycopersicon pyriforme)、紅煎(Solanum integrifolium)、番煎(Solanumlycopersicum)、可可樹(Theobroma cacao)或大葉荼(Camellia sinensis)。漆樹科如黃連木屬(Pistacia)、芒果屬(Mangifera)、腰果屬(Anacardium)例如物種阿月混子(Pistacia vera) [pistachios、Pistazie]、芒果(Mangifer indica)[Mango]或腰果(Anacardium occidentale) [Cashew];菊科如金蓋花屬(Calendula)、紅藍花屬(Carthamus)、矢車菊屬(Centaurea)、菊苣屬(Cichorium)、菜薊屬(Cynara)、向日葵屬(Helianthus)、萬苣屬(Lactuca)、Locusta、萬壽菊屬、糹頓草屬(Valeriana)例如物種金蓋花[Marigold]、紅花[safflower]、矢車菊(Centaurea cyanus) [cornflower]、菊苣(Cichorium intybus)[blue daisy]、洋薊[Artichoke]、向日葵[sunflower]、萬苣(Lactuca sativa)、皺葉萬苣(Lactuca crispa)、Lactuca esculenta、Lactucascariola L. ssp. sativa、 Lactuca scariola L.var. integrata、 Lactuca scariolaL var. integrifolia、Lactuca sativa subsp. romana、Locusta communis、萬苣繳草(Valeriana locusta) [lettuce]、香葉萬壽菊、萬壽菊或細葉萬壽菊[Marigold];傘形科如胡蘿蔔屬(Daucus)例如物種胡蘿蔔[carrot];樺木科(Betulaceae)如榛屬(Corylus)例如物種歐洲榛或土耳其榛[hazelnut];紫草科(Boraginaceae)如琉璃苣屬(Borage)例如物種琉璃苣[borage];十字花科如芸苔屬、Melanosinapis、白芥屬(Sinapis)、擬南芥屬例如物種歐洲油菜、蕪青[卡諾拉油菜、油菜(oilseed rape)、甘藍型油菜]、野歐白芥、芥菜、芥菜原變種、皺葉芥菜、大葉芥菜、黑芥、黑芥(Brassica sinapioides)、黑芥(Melanosinapis communis) [mustard]、甘藍[fodder beet]或擬南芥；鳳梨科如鳳梨屬(Anana)、Bromelia例如物種鳳梨、Ananas ananas 或 Bromelia comosa[疲蘿];番木瓜科如番木瓜屬例如物種番木瓜[papaya];大麻科(Cannabaceae)如大麻屬例如物種大麻[hemp]、旋花科(Convolvulaceae)如番薯屬、旋花屬例如物種甘薯、提 琴葉牽牛花、Convolvulus batatas、Convolvulus tiliaceus、Ipomoea fastigiata、Ipomoea tiliacea、三裂葉暮或 Convolvulus panduratus [sweet potato、Man of theEarth、wild potato]、藜科(Chenopodiaceae)如甜菜屬即物種甜菜、甜蘿蔔、甜菜(原變種)、沿海甜菜、Beta vulgaris var. perennis、Beta vulgaris var. conditiva 或Beta vulgaris var. esculenta [sugar beet];葫蘆科如南瓜屬(Cucurbita)例如物種異瓜、灰籽南瓜(Cucurbita mixta)、西葫蘆或南瓜[pumpkin、squash];胡頹子科(Elaeagnaceae)如胡頹子屬例如物種油橄欖[olive];杜鹽花科如山月桂屬(Kalmia)例如物種寬葉山月桂(Kalmia Iatifolia)、窄葉山月桂(Kalmia angustifolia)、小葉山月桂(Kalmia microphylla)、沼澤山月桂(Kalmia polifolia)、Kalmia occidentalism Cistuschamaerhodendros 或 Kalmia lucida[American laurel、闊葉月桂、calico bush、spoonwood、sheep laurel、alpine laurel、bog laurel、western bog-laurel、swamp-laurel]；大戟科如木薯屬、Janipha、麻瘋樹屬(Jatropha)、菌麻屬(Ricinus)例如物種木薯、Janipha manihot、Jatropha manihot^Manihot aipil、Manihot dulcis、Manihot manihot、Manihot melanobasis、Manihot esculenta[Manihot、arrowroot、tapioca、cassava]或M麻[castor bean、Castor Oil Bush、Castor Oil plant、Palma Christi、Wonder Tree]；豆科如豌豆屬(Pisum)、合歡屬(Albizia)、Cathormion、Feuillea、因加屬(Inga)、圍涎樹屬(Pithecolobium)、金合歡屬(Acacia)、含羞草屬(Mimosa)、苜猜屬(Medicago)、大豆屬(Glycine)、扁豆屬(Dolichos)、菜豆屬(Phaseolus)、Soja例如物種豌豆、飼料豌豆、早生矮豌豆[pea]、Albizia berteriana、合歡(Albizia julibrissin)、大葉合歡(Albizia lebbeck)、Acacia berteriana、Acacia littoralis、Albizia berteriana、Albizzia berteriana、Cathormion berteriana、Feuillea berteriana、Inga fragrans、Pithecellobium berterianum、Pithecellobium fragrans、Pithecolobium berterianum、Pseudalbizzia berteriana^Acacia julibrissin^Acacia nemu、Albizia nemu、Feuilleeajulibrissin、Mimosa julibrissin、Mimosa speciosa、Sericanrda julibrissin、Acacialebbeck、Acacia macrohylla、Albizia lebbek、Feuilleea lebbeck、Mimosa lebbeck、Mimosa speciosa [bastard logwood、silk tree、East Indian Walnut]、紫花苜猜、野首猜、雜交首猜[首猜]、大顯、Dolichos soja、寬葉蔓顯、Glycine hispida、Phaseolusmax、Soja hispida或Soja max[大豆];物牛兒苗科如天竺葵屬(Pelargonium)、椰子屬(Cocos)、Oleum例如物種椰子、荼簏子天竺葵或Oleum cocois[椰子];禾本科如甘鹿屬例如物種甘鹿(Saccharum officinarum)；核桃科(Juglandaceae)如核桃屬、Wallia 例如物種核桃(Juglans regia)、Juglans ailanthifolia、山核桃 Juglanssieboldiana、灰核相匕(Juglans cinerea)、Wallia cinerea、Juglans bixbyi、力口州黑豐亥相匕(Juglans californica)、 ￠(1 胃■豐亥相匕(Juglans hindsii) ^ Juglans intermedia^Juglans jamaicensis^^ct^^l^ (Juglans major) ^ Juglans microcarpa、■豐亥相匕(Juglansnigra)或 Wallia nigra[胡桃、黑胡桃、common walnut、Persian walnut、白胡桃、灰胡桃、黑胡桃];樟科如鱷梨屬、月桂屬例如物種月桂[bay、laurel、bay laurel、sweet bay]、鱷梨、鱷梨(Persea gratissima)或鱷梨(Persea persea) [avocado];豆科如落花生屬(Arachis)例如物種花生[peanut];亞麻科(Linaceae)如亞麻屬(Linum)、Adenolinum 例 如物種亞麻(linum usitatissimum)、linum humile、奧地利亞麻(linum austriacum)、linum bienne、窄葉亞麻(linum angustifolium)、灣亞麻(linum catharticum)、金黃亞麻(linum flavum)、大花亞麻(linum grandiflorum、Adenolinum grandiflorum)、劉易斯亞麻(linum Iewisii)、那旁亞麻(linum narbonense)、宿根亞麻(linum perenne)、劉易斯宿根亞麻(linum perenne var. lewisii)、linum pratense、linum trigynum[亞麻屬、胡麻];Lythrarieae如石植屬(Punica)例如物種石植[pomegranate];錦葵科如棉花屬(Gossypium)例如物種陸地棉、樹棉、海島棉、草棉或瑟伯氏棉(Gossypiumthurberi)[棉花];色蕉科(Musaceae)如色蕉屬(Musa)例如物種香蕉、小果野蕉、大蕉、色蓮[banana];柳葉菜科(Onagraceae)如Camissonia、月見草屬(Oenothera)例如物種月見草(Oenothera biennis)或 Camissonia brevipes [primose、evening primose];掠櫚科如油掠屬(Elacis)例如物種油掠(Elaeis guineensis) [oil pi am] ;S粟科如S粟屬(Papaver)例如物種東方S粟、虞美人、長果S粟(Papaver dubium) [poppy、orientalpoppy、 corn poppy、 field poppy、 shirley poppies、 field poppy、 long-headed poppy、long-pod poppy];胡麻科(Pedaliaceae)如胡麻屬例如物種胡麻[sesame];胡椒科(Piperaceae)如胡椒屬(Piper)、Artanthe、草胡椒屬(Peperomia)、Steffensia 例如物種樹胡椒、Piper amalago、狹葉胡椒、Piper auritum、萎葉、畢澄煎、蓽菝、胡椒、假蓽薇、Artanthe adunca、Artanthe elongata、Peperomia elongata、Piper elongatum、Steffensia elongata [Cayenne pepper、wild pepper];禾本科如大麥屬(Hordeum)、黑麥屬(Secale)、燕麥屬(Avena)、高粱屬(Sorghum)、須芒草屬(Andropogon)、域毛草屬(Holcus)、黍(Panicum)、稻屬(Oryza)、玉米屬、小麥屬(Triticum)例如物種大麥、芒穎大麥草、鼠大麥、黑麥狀大麥草、栽培二稜大麥、三叉大麥、栽培六稜大麥、栽培六稜大麥(Hordeum hexastichum)、Hordeum irregulare、大麥(Hordeum sativum)、黑麥狀大麥草[barley、pearl barley、foxtail barley、wall barley、meadow barley]、黑麥(Secalecereale) [rye]、燕麥、野燕麥、比贊燕麥、野燕麥(原變種)、雜種野燕麥、雙色高粱、石茅高梁(Sorghum halepense)、舌甘高梁(Sorghum saccharatum)、高梁(Sorghum vulgare)、Andropogon drummondii、Holcus bicolor、Holcus sorghum、Sorghum aethiopicum、Sorghum arundinaceum、卡佛爾高梁、垂穗高梁草、甜高梁(Sorghum dochna)、Sorghumdrummondii、硬高梁草、Sorghum guineense、Sorghum lanceolatum、多脈高梁草、甜高梁、Sorghum subglabrescens、Sorghum verticillif lorum、高梁、石茅高梁(Ho Icushalepensis)、黍(Sorghum miliaceum millet)、稷(Panicum militaceum)[Sorghum、millet]、稻、玉米[corn、maize]、普通小麥(Triticum aestivum)、硬粒小麥、圓柱小麥、Triticum hybernum、馬卡小麥、普通小麥(Triticum sativum)或普通小麥(Triticumvulgare) [wheat、bread wheat、common wheat]、山龍眼科(Proteaceae)如澳洲堅果黍(Macadamia)例如物種澳洲堅果(Macadamia intergrifolia) [macadamia];菌草科如咖啡屬例如物種咖啡(Cofea spp.)、小果咖啡(Coffea arabica)、中果咖啡(Coffeacanephora)或大果咖啡(Coffea liberica) [coffee];玄參科如毛蕊花屬(Verbascum)例如物種毛辧毛蕊花(Verbascum blattaria)、南歐毛蕊花(Verbascum chaixii)、Verbascum densiflorum、Verbascum lagurus、Verbascum longifolium、Verbascumlychnitis、Verbascum nigrum、奧林匹克毛蕊花(Verbascum olympicum)、Verbascum phlomoides、紫花毛蕊花(Verbascum phoenicum)、Verbascum pulverulentum 或毛蕊花(Verbascum thapsus) [mullein、white moth mullein、nettle-leaved mullein、密花毛蕊花(dense-flowered mullein)、silver mullein、長葉毛蕊花、white mullein、dark mullein、希臘毛蕊花(greek mullein)、橙色毛蕊花(orange mullein)、紫花毛蕊花(purple mullein)、hoary mullein、great mullein];煎科如辣椒屬、菸草屬(Nicotiana)、煎屬(Solanum)、番煎屬(Lycopersicon)例如物種辣椒、Capsicum annuumvar. glabriusculum、小米椒[辣椒]、辣椒[紅辣椒(paprika)]、菸草、花菸草(Nicotianaalata)、Nicotiana attenuate、光菸草(Nicotiana glauca)、Nicotiana Iangsdorffii^Nicotiana obtusifolia、Nicotiana quadrivalvis、Nicotiana repanda、黃花菸草(Nicotiana rustica)、林菸草(Nicotiana sylvestris)[菸草]、馬鈴薯[potato]、煎[egg-plant]、番煎、番煎、梨形番煎、紅煎或番煎[番煎];梧桐科(Ste rculiaceae)如可可屬例如物種可可樹[可可];山荼科(Theaceae)如山荼屬(Camellia)例如物種荼(Camellia sinensis)[茶]。原則上，可通過本領域技術人員已知的所有方法向生物(如植物)中引入本發明的核酸、表達盒或載體。核酸序列的引入產生了重組生物或轉基因生物。將外源基因轉移進植物基因組中稱為轉化。為此，使用就轉化植物組織或植物細胞並再生植物方面描述的方法進行瞬時或穩定轉化。合適的方法是通過聚乙二醇誘導的DNA攝取進行的原生質體轉化、使用基因槍進行的「生物射彈」法(稱為微粒轟擊法)電穿孔、幹胚在DNA溶液中溫育、顯微注射和農桿菌介導的基因轉移。所述方法描述於例如Jenes B.等，Techniques for Gene Transfer, Transgenic Plants,第一卷，Engineeringand Utilization, Kung S. D 和 Wu R.編輯，Academic Press(1993) 128-143 以及Potrykus, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Molec. Biol. 42，205 (1991)。優選將待表達的核酸或構建體克隆進適用於轉化根癌農桿菌的載體(例如pBinl9)中(Bevan等，Nucl.Acids Res. 12, 8711 (1984)) o轉化有這些載體的農桿菌接著可以已知方式用於轉化植物，特別是作物植物，例如菸草植物，例如通過將擦傷或剪斷的葉浸泡在農桿菌溶液中，接著在合適的培養基中培養它們。通過根癌農桿菌進行的植物轉化描述於例如Hiifgen和 Willmitzer Nucl. Acid Res. 16, 9877 (1988),或者可從 White F. F. , Vectors forGene Transfer in Higher Plants;in Transgenic Plants, Vol. I, Engineering andUtilization, Kung S. D.和 Wu R.編輯，Academic Press, 1993，15-38 頁等中獲知。通過本發明表達載體轉化的農桿菌可類似地以已知方式(例如將擦傷或剪斷的葉浸泡在農桿菌溶液中，接著在合適的培養基中培養它們)用於轉化植物，例如實驗植物如擬南芥，或者作物植物如穀類作物、玉米、燕麥、黑麥、大麥、小麥、大豆、稻、棉花、甜菜、卡諾拉油菜(canola)、向日葵、亞麻、大麻、馬鈴薯、菸草、番爺、胡蘿蔔、紅辣椒、油菜、樹薯、木薯、竹芋、萬壽菊、苜蓿、萵苣和多種樹木、堅果和藤本物種，特別是含油作物植物，例如大豆、花生、蓖麻植物、向日葵、玉米、棉花、亞麻、油菜、椰子、油棕、紅花(Carthamustinctorius)或可可豆,或者特別是玉米、小麥、大豆、稻、棉花和卡諾拉油菜。
可以通過本領域技術人員已知的所有方法產生經遺傳修飾的植物細胞。合適的方法可見於上文提到的Kung S. D.和Wu R.，Potrykus或者Hijf gen和Willmitzer的出版物。因此，本發明的另一方面涉及以至少一種本發明的核酸序列、表達盒或載體轉化的轉基因生物，以及來自這些生物的細胞、細胞培養物、組織、部分(例如對於植物生物的情況為葉、根等)或繁殖材料。在本發明的一個實施方案中，用於本發明核酸、表達盒或載體的宿主植物選自玉米、大豆、油菜(包括卡諾拉油菜和冬油菜(winter oil seed rape))、棉花、小麥和稻。 本發明的另一實施方案涉及核酸構建體(例如表達盒)用於轉化植物細胞、組織或植物部分的用途，所述核酸構建體含有編碼表II中所示一種或多種多肽的一種或多種DNA序列或含有表I中所示一種或多種核酸分子或者編碼其或者與其雜交的DNA序列。為此，取決於啟動子的選擇，可以在葉、種子、根瘤、根、莖或其他植物部分中特異性表達表I或表II所示核酸分子或序列。這些過量產生例如表I所示序列的轉基因植物、其繁殖材料及其植物細胞、組織或部分是本發明的另一目的。此外，含有根據表I的核酸分子或序列的本發明表達盒或核酸序列或構建體還可用於轉化例如上文提到的生物，例如細菌、酵母、絲狀真菌和植物。在本發明的框架內，增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀表示例如，通過與非遺傳修飾的原始植物相t匕，人工獲得的增加的產量性狀，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀，例如通過靶生物的遺傳修飾而獲得的性狀，其歸因於至少在至少一代植物的時間內，在本發明生物(有利的為本發明的或根據本發明方法生產的轉基因植物)中對例如由表I第5列或第7列中所示相應核酸分子和/或同源物編碼的一種或多種表II的多肽(序列)的功能性過表達。此外，組成型表達由表I第5列或第7列中所示相應核酸分子和/或同源物編碼的表II多肽序列是有利的。然而，另一方面，也可能期望誘導型表達。本發明多肽序列的表達可導向宿主細胞(優選植物細胞)的細胞質或細胞器，優選質體。
可通過如枝條分生組織繁殖來體外測定由表I第5列或第7列中所示相應核酸分子和/或同源物編碼的表II序列的表達效率。此外，可在溫室試驗中對測試植物測試在性質和水平上發生了改變的由表I第5列或第7列中所示核酸分子和/或同源物編碼的表II序列的表達和水平及其對產量的影響，例如對增加的產量相關性狀、例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性、例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率的影響，以及對代謝途徑性能的影響。本發明的另一目的包括轉化有包含根據本發明的表I第5列或第7列中所示序列或與其雜交之DNA序列的表達盒的轉基因生物，例如轉基因植物，以及這些植物的轉基因細胞、組織、部分和繁殖材料。這種情況下特別優選轉基因作物植物，例如大麥、小麥、黑麥、燕麥、玉米、大豆、稻、棉花、甜菜、油菜和卡諾拉油菜、向日葵、亞麻、大麻、大薊(thistle)、馬鈴薯、菸草、番爺、樹薯(tapioca)、木薯(cassava)、竹芋(arrowroot)、苜猜、萵苣以及多種樹木、堅果和藤本物種。在本發明的一個實施方案中，轉化有含有或包含根據本發明的表I第5列或第7 列中所示(特別是表IIB的)核酸分子或序列或與其雜交之DNA序列的表達盒的轉基因植物選自玉米、大豆、油菜(包括卡諾拉油菜和冬油菜)、棉花、小麥和稻。就本發明的目的而言，植物是單子葉植物和雙子葉植物、蘚類或藻類，特別是植物，例如在一個實施方案中是單子葉植物，或者例如在另一個實施方案中是雙子葉植物。本發明的另一改良是如上述的轉基因植物，其含有本發明的核酸序列或構建體或者本發明的表達盒。然而，轉基因也指本發明的核酸位於其在生物基因組中的天然位置，但該序列(例如編碼序列或調節序列，例如啟動子序列)與天然序列相比進行了修飾。優選地，轉基因/重組應理解為指本發明的並且顯示於表I中的一種或多種核酸或分子的轉錄存在於基因組中非天然的位置。在一個實施方案中，該核酸或分子的表達是同源的。在另一個實施方案中，該核酸或分子的表達是異源的。這種表達可以是瞬時的，或者是穩定整合進基因組的序列的表達。有利的誘導型植物啟動子為例如PRPl啟動子(Ward等，Plant. Mol.Biol. 22361 (1993))、苯磺醯胺誘導型啟動子(EP 388186)、四環素誘導型啟動子(Gatz等，Plant J. 2，397 (1992))、水楊酸誘導型啟動子(W095/19443)、脫落酸誘導型啟動子(EP335528)和乙醇或環己酮誘導型啟動子(W0 93/21334)。可以有利地使用的植物啟動子的其他實例為來自馬鈴薯的細胞質FBPas啟動子、來自馬鈴薯的ST-LSI啟動子(Stockhaus等，EMB0J. 8，2445(1989))、來自大豆的磷酸核糖焦磷酸轉醯胺酶啟動子(還參閱genebank登記號U87999)或EP 249 676所述的nodiene特異性啟動子。特別有利的是在非生物性脅迫條件開始時確保表達的啟動子。有利的是在有限養分有效性條件下(例如在土壤氮的情況下開始有限氮源時)或養分耗盡時確保表達，例如確保表VIIIa中所示核酸分子或其基因產物表達的啟動子。這類啟動子是本領域技術人員已知的，或可從在上述條件下被誘導的基因中分離。在一個實施方案中，可以對單子葉植物或雙子葉植物使用種子特異性啟動子。原則上，所有帶有其調節序列的天然啟動子均可使用，例如上文針對本發明表達盒和本發明方法所描述的那些。除此以外，還可以有利地使用合成啟動子。在表達盒的製備中，可以操作多種DNA片段以獲得核苷酸序列，其有用地以正確方向閱讀並帶有正確的讀碼框。為了將DNA片段(=本發明核酸)彼此連接，可在片段上附著銜接頭或接頭。啟動子和終止子區可以有用地在轉錄方向上帶有接頭或多聚接頭，其包含用於插入此序列中的一個或多個限制性位點。接頭一般含有I至10個、常為I至8個、優選2至6個限制位點。一般而言，調節區中的接頭的大小小於lOObp，經常小於60bp，但至少為5bp。啟動子可以與宿主生物(例如宿主植物)是天然或同源的，是外源或異源的也可。在5』 -3』轉錄方向上，表達盒含有啟動子、表I所示DNA序列以及用於終止轉錄的區域。不同的終止區可以任何期望的方式彼此交換。可以使用標準分子生物學技術和本文提供的序列信息來分離本發明的核酸分子，例如編碼多肽的核酸分子，所述多肽在植物中賦予增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性和/或增加的養分使用效率和/或增強的周期性乾旱耐受性。例如，可以使用表I所示序列之一的全部或部分，從擬南芥cDNA文庫中分離擬南芥多肽的編碼cDNA，或者從集胞藻、歐洲油菜、大豆、玉米或稻的cDNA文庫中分別分離集胞藻、歐洲油菜、大豆、玉米或稻的多肽的編碼cDNA。此外，可以使用基於 表I序列設計的寡核苷酸引物，通過聚合酶鏈式反應分離包含表I序列之一的全部或部分的核酸分子。例如，可以從植物細胞中分離mRNA(例如通過Chirgwin等，Biochemistry18, 5294(1979)的硫氰酸胍提取法)，並可使用逆轉錄酶(例如Moloney MLV逆轉錄酶，可得自 Gibco/BRL, Bethesda, MD;或者 AMV 逆轉錄酶，可得自 Seikagaku America, Inc. , St.Petersburg, FL)製備cDNA。可以基於表I所示核苷酸序列之一設計用於聚合酶鏈式反應擴增的合成的寡核苷酸引物。可以使用cDNA或基因組DNA作為模板，並使用適當的寡核苷酸引物根據標準PCR擴增技術來擴增本發明的核酸分子。這樣擴增的核酸分子可克隆進適當的載體中，並通過DNA序列分析進行表徵。此外，可以通過標準合成技術(如使用可商購的自動化DNA合成儀)來製備本發明中使用的基因。在一個實施方案中，本發明的分離的核酸分子包含表I所不核苷酸序列或分子之一。此外，本發明的核酸分子可僅包含表I核酸序列或分子之一的編碼區的一部分，例如可用作探針或引物的片段或者編碼根據本發明的多肽的生物活性部分的片段。根據本發明的多肽或編碼本發明的核酸分子的多肽所編碼的蛋白質的部分優選為本文所述的生物活性部分。本文使用的術語多肽的「生物活性部分」旨在包括與增加的產量，例如增加或增強的產量相關性狀，例如增加的低溫抗性和/或耐受性相關的蛋白質的部分(例如結構域/基序)，所述蛋白質參與植物中增強的養分使用效率(例如氮使用效率)和/或增加的內在產量。為了確定根據本發明的多肽或其生物活性部分是否導致增加的產量，例如增加或增強的產量相關性狀，例如增加的低溫抗性和/或耐受性相關的蛋白質，可對包含該多肽的植物進行分析，所述蛋白質參與植物中增強的養分使用效率(例如氮使用效率)和/或增加的內在產量。這些分析方法為本領域技術人員所熟知，並詳細描述於實施例中。更具體地，可以如下製備編碼多肽之生物活性部分的核酸片段分離表I列出的核酸分子序列之一的一部分，表達所編碼的多肽或其肽的部分(例如通過體外重組表達)，以及評估所編碼的部分的活性。根據本發明的多肽的生物活性部分包括在本發明之中，並包括含有來自多肽編碼基因之胺基酸序列的胺基酸序列或者與根據本發明的多肽同源之蛋白質的胺基酸序列的肽，其包含比全長根據本發明的多肽或與根據本發明的多肽同源的全長蛋白更少的胺基酸，並顯示根據本發明的多肽的至少某些酶活性或生物活性。一般地，生物活性部分(例如長度為5，10，15，20，30，35，36，37，38，39，40，50，100或更多個胺基酸的肽)包含具有至少一種根據本發明的多肽活性的結構域或基序。此外，可以通過重組技術製備缺失了該蛋白質中其它區域的其他生物活性部分，並評估本文所述的一種或多種活性。優選地，根據本發明的多肽的生物活性部分包括其具有生物活性的一種或多種選定的結構域/基序或其部分。術語「生物活性部分」或「生物活性」指表II第3列所示多肽，或者所述多肽中仍具有該天然或起始酶或蛋白之酶活性或生物活性的至少10 %或20 %，優選30 %、40 %、50 %或60%，特別優選70%、75%、80%、90%或95%的部分。在本發明的方法中，可以使用適當時含有可摻入DNA或RNA中的合成、非天然或修飾核苷酸鹼基的核酸序列或分子。例如，所述合成、非天然或修飾鹼基可增加該核酸分子在細胞外或細胞內的穩定性。本發明的核酸分子可含有與上述相同的修飾。本文使用的術語「核酸分子」還可包含位於基因編碼區3』和5』末端的非翻譯序列或分子，例如編碼區5』末端上遊至少500個、優選200個、特別優選100個核苷酸的序列，以及基因編碼區3』端下遊至少100個、優選50個、特別優選20個核苷酸的序列。僅選擇編碼區用於克隆和表達目的經常是有利的。優選地，用於本發明方法的核酸分子或本發明的核酸分子是分離的核酸分子。在一個實施方案中，本發明的核酸分子是本發明方法中使用的核酸分子。例如，在多個實施方案中，用於本發明方法的分離的核酸分子可以包含該核酸分子來源細胞的基因組DNA中天然位於該核酸分子側翼的少於約5kb、4kb、3kb、2kb、lkb、0. 5kb或0. Ikb的核苷酸序列。用於本方法的核酸分子(例如本發明的多核苷酸或其部分)可使用分子生物學標準技術和本文提供的序列信息來分離。還可以例如藉助於比較算法來鑑定在DNA或胺基酸水平上的同源序列或同源保守序列區。前者可在標準雜交技術中用作雜交探針(例如描述於Samtoook等，見上的那些)，用於分離可用於該方法的其他核酸序列。還可以通過聚合酶鏈式反應分離包含本方法所用核酸分子(例如本發明的多核苷酸)的完整序列或其部分的核酸分子，其中使用基於該序列或其部分的寡核苷酸引物。例如，可以使用基於該特定序列產生的寡核苷酸引物，通過聚合酶鏈式反應分離包含完整序列或其部分的核酸分子。例如，可以從細胞中分離mRNA (例如通過Ch i r gw i n等，Biochemistry 18, 5294(1979)所述的硫氰酸胍提取法)，並可通過逆轉錄酶(例如Moloney MLV逆轉錄酶，可得自Gibco/BRL, Bethesda, MD,或者AMV逆轉錄酶，可得自Seikagaku America, Inc. , St. Petersburg, FL)產生 cDNA。使用已知方法，用於通過聚合酶鏈式反應進行擴增的合成寡核苷酸引物可基於本文所示序列產生。此外，可以通過與本發明核酸分子所編碼多肽(特別是與表I第5列或第7列中所示核酸分子所編碼的序列)進行蛋白質序列比對來鑑定保守蛋白，由此可以產生保守區並進而產生簡併引物。保守區是在來自不同來源的若干同源物中一個特定位置上的胺基酸極少顯示變異的區域。表IV第7列中所示共有的序列和多肽基序來自於所述比對。此外，可以通過與本發明核酸所編碼的多肽(特別是與表II第5列或第7列中所示多肽分子所編碼的序列)進行蛋白質序列比對來從多種生物中鑑定保守區，由此可以產生保守區並進而產生簡併引物。在一個有利的實施方案中，在本發明方法中增加了多肽的活性，所述多肽包含表IV第7列中所示共有序列或多肽基序或者由其組成，在另一實施方案中，本發明涉及多肽，其包含表IV第7列中所示共有序列或多肽基序或者由其組成，其中所標明胺基酸位置中少於20個，優選少於15或10個，優選少於9、8、7或6個，更優選少於5或4個，甚至更優選少於3個，甚至更優選少於2個，甚至更優選0個可被任何胺基酸替換。在一個實施方案中，以字母標出的胺基酸位置中的不超過15 %，優選10 %，甚至更優選5%、4%、3%或2%，最優選I %或0%被另一胺基酸替換。在一個實施方案中，共有序列或蛋白質基序中插入了少於20個胺基酸，優選少於15或10個，優選少於9、8、7或6個，更優選少於5或4個，甚至更優選少於3個，甚至更優選少於2個，甚至更優選0個胺基酸。共有序列來自於表II中所列序列的多重比對。字母代表單字母胺基酸代碼並且 指出胺基酸在至少80%的比對蛋白質中是保守的，而字母X代表胺基酸，其在至少80%的比對序列中不是保守的。共有序列從比對中第一個保守的胺基酸開始，到所研究的序列的比對中最後一個保守的胺基酸結束。給定的X數字指出保守胺基酸殘基之間的距離，例如Y-x(21，23)-F表示比對中保守的酪氨酸和苯丙氨酸殘基在所有研究的序列的比對中通過最少21最多23個氣基酸殘基彼此隔開。保守結構域從所有序列中鑑定，並且使用標準Prosite記法的子集描述，例如模式Y-x(21，23)-[Fff]表示保守的酪氨酸與苯丙氨酸或色氨酸通過最少21最多23個胺基酸殘基隔開。模式必須匹配至少80%的研究蛋白質。保守性模式使用軟體工具MEME3.5. I版鑑定，或者人工鑑定。MEME 由 Timothy L. Bailey 和 Charles Elkan 描述(Proceedingsof the Second International Conference on Intelligent Systems for MolecularBiology, 28-36 頁,AAAI Press, Menlo Park, California, 1994)。公眾可在聖地牙哥超級計算機中心獲得該獨立程序的原始碼。為了使用軟體工具MEME鑑定所有序列中的共有基序，使用以下設置_maxsize 500000, -nmotifs 15, -evt 0. 001, -maxw 60, -distancele-3,-minsites分析中所用的序列數。MEME的輸入序列是Fasta格式的非比對序列。其他參數可以本版軟體中的默認設置使用。保守性結構域的Prosite圖譜使用軟體工具Pratt 2. I版產生,或者人工產生。Pratt由挪威Bergen大學信息學院的Inge Jonassen開發，並由 Jonassen 等描述(I. Jonassen, J. F. Collins 和 D. G. Higgins, Protein Science4 (1995)，1587-1595 頁；I. Jonassen, Efficient discovery of conserved patterns usinga pattern graph, Submitted to CABIOS Febr. 1997]。該獨立程序的原始碼(ANSI C)是公眾可獲得的，例如在已建立的生物信息學中心如EBI (歐洲生物信息學研究所)。為了使用軟體工具Pratt產生圖譜，使用以下設置PL (最大Pattern長度)100, PN (最大圖譜標記數):100，PX (最大連續X數)30，FN (最大柔性間隔區數)5，FL (最高柔性)30，FP (最高柔性產物)10，0N(最大圖譜數)50。Pratt的輸入序列是由軟體工具MEME鑑定的顯示高度相似性的蛋白質序列的不同區域。必須與所產生圖譜匹配的最小序列數(CM，最小匹配序列數)設置為所提供序列的至少80%。此處未提及的參數以其默認設置使用。可以使用保守性結構域的Prosite圖譜來檢索與該圖譜匹配的蛋白質序列。多個已建立的生物信息學中心提供在資料庫檢索中使用這些圖譜的公眾網際網路入口(例如PIR(ProteinInformation Resource,位於喬治城大學醫學中心)或ExPASy (Expert Protein AnalysisSystem))。或者,有獨立軟體可以使用，如Fuzzpro程序,它是EMBOSS軟體包的一部分。例如，Fuzzpix)程序不僅允許檢索準確的圖譜-蛋白質匹配，還允許在所進行的檢索中設置多種模糊度。比對使用ClustalW軟體(I. 83版)進行，並描述於Thompson等(Nucleic AcidsResearch 22，4673(1994))。公眾可從德國海德堡的歐洲分子生物學實驗室獲得該獨立程序的原始碼。使用ClustalW vl. 83的默認參數進行 分析(缺口罰分10.0;缺口延伸罰分0.2;蛋白質矩陣Gonnet;蛋白質/DNA endgap:_l;蛋白質/DNA gapdist:4)。為了鑑定如在Pfam蛋白質家族資料庫中定義的蛋白質結構域,使用h_scan算法檢索蛋白質序列。H_scan是HMMER3軟體包的一部分，HMMER3軟體包公眾可從HowardHughes Medical Institute, Janelia Farm Research Campus (http: //hmmer. org/)獲得。使用Pfam蛋白質家族資料庫(http://pfam. sanger. ac. uk/)的24. 0版本(2009年10月公布)進行Pfam結構域的檢索。用於hmmscan算法的參數是在hmmscan (HMMER 3. 0版本)中使用的默認參數。如果獨立的E值為0. I或更好且如果比對覆蓋了至少90%的PFAM結構域模型長度，則考慮hmmscan算法報告的結構域。接著可以使用簡併引物通過PCR擴增新的蛋白質的片段，所述蛋白質具有上述活性，例如在增加表達或活性後與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比賦予增加的產量，例如增加的產量相關性狀，特別是增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如低溫耐受性、周期性乾旱耐受性、水使用效率、養分(例如氮)使用效率和/或增加的內在產量，或者具有表II第3列中所示蛋白質或來自其他生物的其他本發明多肽功能同源物的活性。接著，這些片段可作為雜交探針用於分離完整基因序列。或者，可以通過RACE-PCR分離缺少的5』和3』序列。可以使用cDNA或基因組DNA作為模板，使用合適的引物，按照標準PCR擴增技術來擴增本發明的核酸分子。這樣擴增的核酸分子可克隆進合適的載體中，並通過DNA序列分析進行表徵。可以通過標準合成法(例如使用自動化DNA合成儀)產生對應於本方法所用核酸分子之一的寡核苷酸。有利地用於本發明方法的核酸分子可基於其與本文所述核酸分子的同源性來分離，其中使用該序列或其部分作為雜交探針或用於生產雜交探針，並遵循標準雜交技術在嚴格雜交條件下進行。在這種情況下，可以使用例如在嚴格條件下與上述核酸分子雜交(特別是與這樣的核酸分子雜交其包含本發明方法所用核酸分子的核苷酸序列，或者編碼本發明所用蛋白質的核苷酸序列，或者本發明核酸分子的核苷酸序列)的長度為至少15、20、25、30、35、40、50、60或更多個核苷酸(優選至少15、20或25個核苷酸)的分離的一種或多種核酸分子。還可以使用含有30、50、100、250或更多個核苷酸的核酸分子。「雜交」指這些核酸分子在常規雜交條件下雜交，優選在嚴格條件下雜交，如Sambrook(Molecular Cloning;A Laboratory Manual,第二 版，Cold Spring HarborLaboratory Press, Cold Spring Harbor, NY(1989))或Current Protocols in MolecularBiology, John Wiley & Sons, N. Y. (1989)，6. 3. 1-6. 3. 6 所述。根據本發明，可使用本發明核酸的DNA和RNA分子作為探針。此外，作為用於鑑定功能同源物的模板，可以進行Northern印跡測定和Southern印跡測定。Northern印跡測定有利地提供了關於所表達基因產物的進一步信息例如表達譜、加工步驟(如剪接和加帽)的存在情況等。Southern印跡測定提供了關於編碼本發明核酸分子之基因染色體定位和組織的進一步信息。嚴格雜交條件的一個優選的非限制性實例為在約45°C下在6 X氯化鈉/檸檬酸鈉(=SSC)中雜交，然後在 50 至 65°C (例如 50°C、55°C或 60°C )下在 0. 2XSSC、0. 1% SDS 中進行一次或多次洗滌步驟。本領域技術人員了解，這些雜交條件作為核酸類型的函數而變化，並且例如在存在有機溶劑時隨溫 度和緩衝液濃度而變化。例如，「標準雜交條件」下的溫度作為核酸類型的函數在0. IX,0. 5X、1X、2X、3X、4或5XSSC(pH7. 2)濃度的水性緩衝液中可為42°C至58°C不等，優選45°C和50°C。如果上述緩衝液中存在有機溶劑，例如50%甲醯胺，則標準條件下的溫度約為40°C、42°C或45°C。DNA:DNA雜交分子的雜交條件優選為 0. I X SSC 和 201、251、301、351、401或451，優選301至451。DNA: RNA 雜交分子的雜交條件優選為例如0. IxSSC和30 V、35°C、40 V、45°C、50 V或55°C，優選45 V到55°C。上述雜交溫度是在例如不存在甲醯胺的情況下對長度約IOObp (=鹼基對)且G+C含量為50%的核酸確定的。本領域技術人員了解藉助於教科書來確定雜交條件，所述教科書為例如上文提到的那些，或者以下教科書Sambrook等，」Molecular Cloning」，Cold SpringHarbor Laboratory, 1989;Hames 和 Higgins 編輯 1985，』^Nucleic Acids Hybridization:APractical Approach，，，IRL Press at Oxford University Press, Oxford;Brown 編輯1991，』』Essential Molecular Biology :A Practical Approach，，，IRL Press at OxfordUniversity Press,Oxford。一個這種嚴格雜交條件的另一實例是在65°C下在4XSSC中雜交，其後在65°C下以0. IXSSC洗滌I小時。或者，一個示例性嚴格雜交條件為50%甲醯胺、4XSSC，42°C。此夕卜，洗滌步驟過程中的條件可以在劃分為低嚴格條件(約2XSSC，50°C)至高嚴格條件(約0.2父55(，501，優選65°0 的範圍內選擇(20 X SSC :0. 3M 檸檬酸鈉、3M NaCl，pH7.0)。此夕卜，洗滌步驟過程中的溫度可從室溫(約22°C )下的低嚴格條件增加至約65°C的高嚴格條件。鹽濃度和溫度這兩個參數可同時改變，或者可將這兩個參數之一保持恆定而改變另一個。雜交過程中還可以使用變性劑，例如甲醯胺或SDS。在50%甲醯胺存在下，雜交優選在42°C下進行。可在各個情況下組合相關的因素例如I)處理的長度、2)鹽條件、3)洗滌劑條件、4)競爭DNA、5)溫度和6)探針的選擇，因此本文無法提及所有的可能性。因此，在一個優選的實施方案中，在68 °C下將Northern印跡在Rothi-Hybri-Quick緩衝液(Roth, Karlsruhe)中預雜交2小時。與放射性標記探針的雜交在68°C進行過夜。其後在68°C下用IXSSC進行洗滌步驟。對於Southern印跡測定，在68°C下將膜在Rothi-Hybri-Quick緩衝液(Roth, Karlsruhe)中預雜交2小時。與放射性標記探針的雜交在68°C進行過夜。其後棄去雜交緩衝液，並用2XSSC、0. 1% SDS短暫地洗滌濾器。棄去洗滌緩衝液後，加入新的2XSSC、0. 1% SDS緩衝液並在68°C下孵育15分鐘。將該洗滌步驟進行兩次，其後在68°C下使用1XSSC、0. 1% SDS進行10分鐘的額外洗滌步驟。用於DNA雜交(Southern印跡測定)和洗漆步驟的一些條件實例在下文給出(I)雜交條件可選自例如以下條件
(a)4XSSC，65。C,(b)6XSSC，45。C,(c)6XSSC，lOOmg/ml 變性的片段化魚精 DNA，68° C,(d) 6 X SSC, 0. 5%SDS, lOOmg/ml 變性的鮭精 DNA，68。C,(e) 6X SSC, 0. 5%SDS, lOOmg/ml 變性的片段化鮭精 DNA, 50% 甲醯胺，42° C，(f) 50% 甲醯胺，4X SSC，42。C，(g) 50% (v/v)甲醯胺，0. 1%牛血清白蛋白，0. l%Ficoll, 0. 1%聚乙烯吡咯烷酮，50mM磷酸鈉緩衝液pH6. 5，750mM NaCl, 75mM檸檬酸鈉，42° C， (h)2X 或 4XSSC，50° C(低嚴格條件)，或(i)30到40%甲醯胺，2X或4XSSC，42° C(低嚴格條件)。(2)洗滌步驟可選自例如以下條件(a)0. Ol5M NaCl/0. OOl5M 檸檬酸鈉/0. 1%SDS，50。C。(b)0. 1XSSC，65° C。(c)0. 1XSSC, 0. 5%SDS，68。C。(d) 0. I X SSC, 0. 5%SDS, 50% 甲醯胺，42。C。(e)0. 2XSSC, 0. 1%SDS，42° C。(f)2XSSC，65° C (低嚴格條件)。來自其他生物的具有上述活性(即，賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如本文所述的增加的產量相關性狀，例如增加的非生物性脅迫耐受性，例如低溫耐受性，例如具有增加的養分使用效率，和/或水使用效率和/或增加的內在產量)的多肽可由其他DNA序列編碼，所述DNA序列在寬鬆的雜交條件下與表I第5和7列中所示序列雜交，並且在表達時編碼下屬肽，所述肽賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如本文所述的增加的產量相關性狀，例如增加的非生物性脅迫耐受性，例如低溫耐受性或增強的冷耐受性，例如具有增加的養分使用效率，和/或水使用效率和/或增加的內在產量此外，一些應用必須在低嚴格雜交條件下進行，而對雜交特異性無任何影響。例如，可以用本發明核酸分子檢測總DNA的Southern印跡分析，並低嚴格洗滌(55°C下，2XSSPE、0. 1% SDS)。雜交分析可僅顯示出編碼本發明多肽或本發明方法所用多肽(例如具有本文所述與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增強增加的產量的活性，例如本文所述的增加的產量相關性狀，例如增加的非生物性脅迫耐受性，例如增加的低溫耐受性或增強的冷耐受性，例如具有增加的養分使用效率，和/或水使用效率和/或增加的內在產量)的基因的簡單模式。這些低嚴格雜交條件的另一實例是4XSSC，50°C，或者在42°C下用30至40%甲醯胺進行雜交。這些分子包括這樣的分子其為本發明多肽或本發明方法所用多肽的片段、類似物或衍生物，其差異為胺基酸和/或核苷酸的缺失、插入、取代、添加和/或重組或者本領域技術人員已知的單獨或組合地對上述胺基酸序列或其內在核苷酸序列的任何其他修飾。然而，優選使用高嚴格雜交條件。雜交應有利地以至少5、10、15、20、25、30、35或40bp的片段進行，有利地為至少50、60、70或8(^ ，優選至少90、100或11(^ 。最優選至少15、20、25或30bp的片段。還優選至少IOObp或200bp、非常特別優選至少400bp長度的雜交。在一個特別優選的實施方案中，雜交應以上述條件用整個核酸序列進行。術語「片段」、「序列片段」或「序列部分」表示所指代原始序列的截短序列。截短序列(核酸或蛋白質序列)的長度可廣泛變化，最小尺寸是這樣的序列，其大小足以為序列提供與所指代原始序列或分子至少相當的功能和/或活性，或者在嚴格雜交條件下與本發明核酸分子或本發明方法所用核酸分子雜交，而最大尺寸則不是關鍵性的。在一些應用中，最大尺寸一般不顯著大於提供原始序列的期望活性和/或功能所需的大小。截短的胺基酸序列或分子的長度一般為約5至約310個胺基酸。然而，更一般地，序列長度最高將約為250個胺基酸，優選最高約200或100個胺基酸。經常期望選擇至少約10、12或15個胺基酸上至最高約20或25個胺基酸的序列。術語「表位」涉及抗原中的特異性免疫反應性位點，也稱為抗原決定簇。這些表位可以是多聚組合物中單體(如蛋白質中的胺基酸)的線性排列，或者包含更複雜的二級結構或三級結構或者由其組成。本領域技術人員會認識到，免疫原(即能引發免疫應答的物質)是抗原，但一些抗原(如半抗原)則不是免疫原，而是可能通過與載體分子偶聯而具有 免疫原性。術語「抗原」包括提及可對針對其產生抗體和/或抗體對其具有特異免疫反應性的物質。在一個實施方案中，本發明涉及本發明的或本發明方法中所用的多肽的表位，並且賦予與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如本文所述的增加的產量相關性狀，例如增加的非生物性脅迫耐受性，例如低溫耐受性或增強的冷耐受性，例如具有增加的養分使用效率，和/或水使用效率和/或增加的內在產量等等。術語「一個或數個胺基酸」指至少一個胺基酸，但不多於將導致同源性低於50%同一性的胺基酸數。優選地，同一性高於70%或80%，更優選為85%、90%、91%、92%、93%、94%或95%，甚至更優選96%、97%、98%或99%的同一性。此外,本發明的核酸分子包括作為上述核酸分子的核苷酸序列之一或其部分之互補序列的核酸分子。與表I第5列和第7列中所不核苷酸分子或序列之一互補的核酸分子或其序列是這樣的，其與表I第5列和第7列中所示核苷酸分子或序列之一充分互補，以使其能與表I第5列和第7列中所示核苷酸序列之一雜交，從而形成穩定的雙鏈體。優選地，所述雜交在嚴格條件下進行。然而，本文所述序列之一的互補序列優選是根據本領域技術人員熟知的核酸分子的鹼基配對與其互補的序列。例如，鹼基A和G分別與鹼基T以及U或C鹼基配對，反之亦然。對鹼基的修飾可能影響鹼基配對的配偶體。本發明的核酸分子包括這樣的核苷酸序列，其與表I第5列和第7列中所不核苷酸序列或其部分具有至少約30%、35%、40%或45%的同源性，優選至少約50%、55%、60%或65%，更優選至少約70%、80%或90%，甚至更優選至少約95%、97%、98%、99%或更高的同源性，並且優選地具有上述活性，特別是通過例如在細胞溶膠或細胞質或細胞器(如質體或線粒體或這兩者，優選質體)中表達而增加表I中所示基因的活性或基因產物(例如表II第3列中所示)的活性後具有增加產量的活性，例如增加產量相關性狀，例如增強對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加養分使用效率、增加內在產量和/或另一提到的產量相關性狀。在一個實施方案中，表I第6列中標記為「質體」的核酸分子或由所述核酸分子編碼的基因產物與本文所述的靶向信號組合表達。
本發明的核酸分子包括這樣的核苷酸序列或分子，其與表I第5列和第7列中所示核苷酸序列或分子之一或其部分雜交，優選在本文所定義的嚴格條件下雜交，並且編碼具有上述活性的蛋白質，例如通過在細胞溶膠或細胞器(如質體或線粒體或這兩者，優選質體)中表達而賦予與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、增加的內在產量和/或另一提到的產量相關性狀，並且任選地，該活性選自2-氧代戊二酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- 二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute蛋白、AT1G29250. I蛋白、AT1G53885蛋白、AT2G35300 蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、⑶S5394蛋白、⑶S5401截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、S-8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖 轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基_脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋白3亞基、絲氨酸乙醯基轉移酶、絲氨酸輕甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白。此外，本發明的核酸分子可以僅包含表I第5列和第7列中所示序列之一的一部分編碼區，例如可用作探針或引物的片段或者編碼本發明多肽或本發明方法中所用多肽的生物活性部分的片段，即具有上述活性，例如如果其活性例如通過在細胞溶膠或細胞器(如質體或線粒體或這兩者，優選質體)中表達而增加，而賦予與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、增加的內在產量和/或另一提到的產量相關性狀。從本發明蛋白質編碼基因的克隆中測定的核苷酸序列允許產生設計用於在其他細胞類型和生物中鑑定和/或克隆其同源物的探針和引物。所述探針/引物一般包含基本純化的寡核苷酸。該寡核苷酸一般包含這樣的核苷酸序列區域，其在嚴格條件下與(例如表I第5列和第7列中)所示序列之一的有義鏈、(例如表I第5列和第7列中)所示序列之一的反義鏈、或其天然存在的突變體的至少約12、15個、優選約20或25個、更優選約40、50或75個連續核苷酸雜交。基於本發明核苷酸的引物可用於PCR反應中來克隆本發明多肽或本發明方法所用多肽的同源物，例如作為本發明實施例中所述的引物，例如實施例中所示。用表III第7列中所示引物進行的PCR將產生表II第3列中所示基因產物的片段。引物組可互換。本領域技術人員了解組合所述引物來產生期望的產物，例如全長克隆或部分序列。基於本發明核酸分子或本發明方法中所用核酸分子的探針可用於檢測編碼相同或同源蛋白質的轉錄物或基因組序列。探針還可包含其上附著的標記基團，例如所述標記基團可以是放射性同位素、螢光化合物、酶或酶輔因子。這些探針可作為基因組標記物試劑盒的一部分，用於鑑定表達本發明多肽或本發明方法中所用多肽的細胞(例如通過測量細胞樣品中編碼核酸分子的水平(例如檢測mRNA水平))，或者用於確定包含本發明多核苷酸序列或本發明方法中所用多核苷酸序列的基因組基因是否已突變或缺失。本發明的核酸分子編碼多肽或其部分，其包括與表II第5列和第7列中所示胺基酸序列充分同源的胺基酸序列，從而該蛋白質或其部分保持參與與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加產量(例如增加產量相關性狀，例如增強對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加養分使用效率，增加內在產量和/或另一提到的產量相關性狀)的能力，特別包括在所述植物中增加上文所述活性或實施例中所述活性。本文使用的術語「充分同源」指蛋白質或其部分，其具有這樣的胺基酸序列，其包含最少數目的與表II第5列和第7列中所示胺基酸序列相同或等同的胺基酸殘基(例如與本發明多肽序列之一中的胺基酸殘基具有相似側鏈的胺基酸殘基)，以使該蛋白質或其部分能參與與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加產量，例如增加產量相關性狀，例如增強對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加乾旱耐受性和/或低溫 耐受性和/或增加養分使用效率，增加內在產量和/或另一提到的產量相關性狀。例如，具有表II第3列中所示和本文所述的蛋白質的活性。在一個實施方案中，本發明的核酸分子包括編碼本發明蛋白質的一部分的核酸。所述蛋白質與表II第5列和第7列中完整胺基酸序列具有至少約30%、35%、40%、45%或50%的同源性，優選至少約55%、60%、65%或70%，更優選至少約75%、80%、85%、90%、91 %、92%、93%或94%，最優選至少約95%、97%、98%、99%或更高的同源性，並且具有上述活性，例如通過如在細胞溶膠或細胞器(如質體或線粒體或這兩者，優選質體)中表達而賦予與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀。本發明核酸分子所編碼蛋白質的部分優選具有生物活性，優選具有上述生物活性，例如在增加活性後賦予與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀。如本文所述，術語「生物活性部分」旨在包括這樣的部分(例如結構域/基序)，其賦予與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀，或者具有免疫活性從而與抗體結合，所述抗體特異性結合本發明多肽或本發明方法中使用的多肽，所述多肽用於與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加產量，例如增加產量相關性狀，例如增強對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加養分使用效率，增加內在產量和/或另一提到的產量相關性狀。本發明還涉及這樣的核酸分子，其由於遺傳密碼的簡併性而不同於表IA第5列和第7列中所示核苷酸序列之一(及其部分)，並因而編碼本發明的多肽，特別是具有上述活性的多肽，例如表II第5列和第7列中所示序列表示的多肽或其功能同源物。有利地，本發明的核酸分子包含(或在另一些方案中具有)編碼蛋白質的核苷酸序列，所述蛋白質包含(或在另一些實施方案中具有)表II第5列和第7列所示胺基酸序列或其功能同源物。在另一些實施方案中，本發明的核酸分子編碼全長蛋白，其與表II第5列和第7列中所示胺基酸序列或功能同源物基本同源。然而，在一個實施方案中，本發明的核酸分子不由表I(優選表IA第5列和第7列)中所示序列組成。此外，本領域技術人員會理解，在種群中可能存在導致胺基酸序列改變的DNA序列多態性。編碼本發明多肽或包含本發明核酸分子的基因中的這種遺傳多態性可由於天然變異而在種群的個體中存在。可以基於其與本文所述核酸分子的同源性，使用本發明核酸分子或其部分作為雜交探針，根據標準雜交技術在嚴格雜交條件下分離與本發明核酸分子同源之天然變體的相應核酸分子，其也可以是cDNA。因此，在另一實施方案中，本發明的核酸分子長度至少為15、20、25或30個核苷 酸。優選地，其在嚴格條件下與包含本發明核酸分子或本發明方法中所用核酸分子之核苷酸序列(例如包含表I第5列和第7列中所示序列)的核酸分子雜交。所述核酸分子的長度優選為至少20、30、50、100、250或更多個核苷酸。上文定義了術語「在嚴格條件下雜交」。在一個實施方案中，術語「在嚴格條件下雜交」旨在描述這樣的雜交和洗滌條件，在所述條件下彼此具有至少30%、40%、50%或65%同一性的核苷酸序列一般保持彼此雜交。優選地，該條件使得彼此具有至少約70%、更優選至少約75 %或80 %、甚至更優選至少約85 %、90 %或95 %或更高同一性的序列一般保持彼此雜交。優選地，在嚴格條件下與表I第5列和第7列中所示序列雜交的本發明核酸分子對應於本發明的天然核酸分子。本文使用的「天然(存在/發生)的」核酸分子指具有在自然界中存在的核苷酸序列(例如編碼天然蛋白質)的RNA或DNA分子。優選地，該核酸分子編碼具有上述活性的天然蛋白質，所述活性為例如通過如在細胞溶膠和/或細胞器(如質體或線粒體，優選質體)中表達基因產物的核酸序列增加其表達或活性或者本發明蛋白質或本發明方法中所用蛋白質之活性後賦予增加產量，例如增加產量相關性狀，例如增強對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加養分使用效率，增加內在產量和/或另一提到的產量相關性狀。除了本發明多肽或核酸分子以及本發明方法中所用多肽或核酸分子之序列的天然變體以外，本領域技術人員會認識到，可通過突變向編碼本發明多肽或本發明方法中所用多肽的核酸分子的核苷酸序列中引入改變，從而導致所編碼所述多肽的胺基酸序列改變，而不改變該多肽的功能能力，優選不降低所述活性。例如，可以在本發明核酸分子或本發明方法中所用核酸分子(例如表I第5列和第7列中所示)的序列中產生導致在「非關鍵」胺基酸殘基處發生胺基酸取代的核苷酸取代。「非關鍵」胺基酸殘基是在野生型序列中發生變化而不改變所述多肽之活性的殘基，而「關鍵」胺基酸殘基是上述活性(例如在增加該多肽的活性後導致與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加產量，例如增加產量相關性狀，例如增強對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加養分使用效率，增加內在產量和/或另一提到的產量相關性狀)所需的胺基酸殘基。然而，其他胺基酸殘基(例如在具有所述活性的結構域中不保守或僅半保守的殘基)可能不是活性所必需的，因此很可能適於進行改變而不改變所述活性。此外，本領域技術人員了解，生物之間的密碼子使用可能不同。因此，可以使本發明核酸分子中的密碼子使用適用於表達所述多核苷酸或多肽的生物或細胞區室(例如質體或線粒體)中的密碼子使用。因此，本發明涉及編碼多肽的核酸分子，所述多肽通過如在細胞溶膠或細胞器(如質體或線粒體或這兩者，優選質體)中表達而在生物或其部分中具有上述活性，並在所述活性的非關鍵胺基酸殘基中含有改變。這些多肽在胺基酸序列上不同於表II第5列和第7列中所示序列中含有的序列，但仍保留本文所述活性。所述核酸分子可包含編碼多肽的核苷酸序列，其中所述多肽包含與表II第5列和第7列中所示胺基酸序列具有至少約50%同一性的胺基酸序列，並且能在通過如在細胞溶膠或細胞器(如質體或線粒體或這兩者，優選質體)中表達而增加其活性(例如其表達)後參與與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加產量，例如增加產量相關性狀，例如增強對非生物性環境脅 迫的耐受性，例如增加乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加養分使用效率，增加內在產量和/或另一提到的產量相關性狀。優選地，該核酸分子所編碼的蛋白質與表II第5列和第7列中所示序列具有至少約60%的同一性，更優選與表II第5列和第7列中所示序列之一具有至少約70%的同一性，甚至更優選與表II第5列和第7列所示序列具有至少約80%、90%、95%的同源性，最優選與表II第5列和第7列中所示序列具有至少約96%、97%、98%或99%的同一性。為了測定兩胺基酸序列或兩核酸分子之間的百分比同源性(=同一性，本文中可互換使用)，將序列一個寫在另一個下方用於最佳比較(例如，可以向蛋白質或核酸中插入缺口，以產生與另一蛋白質或另一核酸的最佳比對)。接著比較相應胺基酸位置或核苷酸位置上的胺基酸殘基或核酸分子。如果一個序列中的位置被與另一序列中相應位置上相同的胺基酸殘基或相同的核酸分子佔據，則所述分子在此位置上是同源的(即，本文中使用的胺基酸或核酸「同源性」對應於胺基酸或核酸「同一性」)。兩序列間的百分比同源性是所述序列間共有的相同位置數的函數(即，％同源性=相同位置數/總位置數X100)。因此，術語「同源性」和「同一性」應認為是同義的。為了確定兩個或更多個胺基酸或者兩個或更多個核苷酸序列之間的百分比同源性(=同一性)，已經開發了若干計算機軟體程序。兩個或更多個序列的同一性可以使用例如fasta軟體來計算，該軟體目前使用的版本是fasta3 (ff. R. Pearson和D. J. Lipman, PNAS85, 2444(1988);ff. R. Pearson, Methods in Enzymology 183, 63(1990);ff. R. Pearson 和D. J. Lipman, PNAS 85, 2444(1988) ;ff. R. Pearson, Enzymology 183,63(1990))。另一種可用於計算不同序列間同源性的程序是標準blast程序,其包括在Biomax pedant軟體中(Biomax, Munich, Federal Republic of Germany)。遺憾的是,這有時產生非最優的結果，因為bias t不總是包括主題和查詢的完整序列。儘管如此，該程序非常高效，可用於比較大量序列。一般在這樣的序列比較中使用以下設置_P程序名[字符串];-d資料庫[字符串];默認=nr; -i檢索文件[File In];默認=Stdin; -e期望值(E)[實數];默認=10. 0; -m比對視圖選項0=配對；1=查詢固定，顯示名稱；2=查詢固定，無名稱；3=平查詢固定，顯示名稱；4=平查詢固定，無名稱；5=查詢固定，無名稱，平末端；6=平查詢固定，無名稱，平末端；7=XML Blast輸出；8=列表；9有註解行的表[整數];默認=O; -o BLAST報告輸出文件[File Out]可選；默認=stdout;-F過濾查詢序列(DUST使用blastn, SEG使用其他)[字符串];默認=T;_G打開缺口的消耗(0調用默認行為)[整數];默認=0;-E延伸缺口的消耗(0調用默認行為)[整數];默認=0;-X X缺口比對的降低值(比特)(0調用默認行為);blastn 30, megablast 20, tblastx 0,其他均為 15 [整數];默認=0; -I Show GI’sin deflines [T/F];默認=F;-q核苷酸錯配罰分(僅用於blastn)[整數];默認=-3;-r核苷酸匹配獎分(僅用於blastn)[整數];默認=1 ;-v對(V)顯示一行描述的資料庫序列數[整數];默認=500 ;-b對(B)顯示比對的資料庫序列數[整數];默認=250 ;-f延伸命中的閾值，0 為默認；blastp 11, blastn 0, blastx 12, tblastn 13; tblastx 13, megablast0 [整數];默認=0; -g進行缺口比對(tblastx不提供)[T/F];默認=T; -Q使用的查詢遺傳密碼[整數];默認=1 ;_D DB遺傳密碼(僅用於tblast[nx])[整數];默認=1 ;_a使用的處理器數[整數]；默認=1;_0序列比對文件[File Out]可選；-J相信查詢def line [T/F];默認=F;-M矩陣[字符串];默認=BL0SUM62;-W 字號，0 為默認(blastn 11，megablast 28，其他均為3)[整數];默認=0; -Z資料庫有效長度(實際大小使用0)[實數];默認=0; -K區域中保留的最佳命中數(默認關閉，如果使用則推薦值為100)[整數];默認=0;-P多個命中使用0，單個命中使用I [整數];默認=0;-Y檢索空間有效長度(實際大小使用0)[實數];默認=0;_S針對資料庫檢索的查詢鏈(用於blast [nx]和tblastx) ; 3為都是，I為上，2為下[整數];默認=3; -T產生HTML輸出[T/F];默認=F; -I將資料庫檢索限制在GI列表[字符串]可選；_U使用FASTA序列的小寫過濾[T/F]可選；默認=F;-y無缺口延伸的X降低值(比特)(0. 0調用默認行為);blastn 20，megablast 10，其他均為7 [實數];默認=0. 0;-Z最終缺口比對的X降低值(比特)(0. 0調用默認行為);blastn/megablast50，tblastx 0，其他均為 25[整數];默認=0;-R PSI-TBLASTN checkpoint file[File In]可選；_n MegaBlast search [T/F];默認=F;-L查詢序列上的位置[字符串]可選；_A多重命中的窗口大小，0為默認(blastn/megablast 0,其他均為40 [整數];默認=0;_w移碼罰分(blastx使用00F算法)[整數];默認=0;_t tblastn中用於連接HSP的最大允許內含子長度(0不進行連接)[整數];默認=0。使用Needleman和Wunsch或者Smith或Waterman的算法得到了高質量的結果。因此，優選基於所述算法的程序。有利地，序列比較可以使用PileUp程序(J. Mol. Evolution. ,25，351 (1987) ,Higgins 等，CABI0S5, 151(1989))或優選使用「Gap」和「Needle」程序來進行，它們都基於Needleman和Wunsch的算法(J. Mol.Biol. 48; 443 (1970)),還有 「BestFit」，它基於 Smith 和 Waterman 的算法(Adv. Appl.Math. 2; 482 (1981))。「Gap，，和 「BestFit，，是 GCG 軟體包的一部分(Genetics ComputerGroup, 575Science Drive, Madison, Wisconsin, USA 53711 (1991) ; Altschul 等，(NucleicAcids Res. 25，3389(1997)) , 「Needle」 是 The European Molecular Biology OpenSoftware Suite(EMBOSS)的一部分(Trends in Genetics 16 (6)，276 (2000))。因此，優選地，在完整序列範圍內使用「Gap」或「Needle」程序進行用於確定序列同源性百分比的計算。對「Needle」使用以下標準調整用於核酸序列比較矩陣EDNAFULL，缺口罰分10. 0，延伸罰分0.5。對「Gap」使用以下標準調整用於核酸序列比較缺口權重50，長度權、重3，評價匹配10. 000,評價錯配0. 000。例如，在核酸水平上與SEQ ID N0:63具有80%同源性的序列應理解為在以上述參數通過上述程序「Needle」與序列SEQ ID NO:63比較後具有80%的同源性。兩多肽間的同源性應理解為完整序列長度上胺基酸序列的同一性，通過藉助上述程序「Needle」進行比較來計算，其中使用矩陣EBL0SUM62，缺口罰分8. 0，延伸罰分2. O。例如，在蛋白質水平上與序列SEQ ID N0:64具有80%同源性的序列應理解為在以上述參數通過上述程序「Needle」與序列SEQ ID NO:64比較後具有80%的同源性。通過對根據本發明表I第5列和第7列中所示核酸序列進行取代、插入或缺失而產生的功能等價物與根據本發明表II第5列和第7列中所示多肽之一具有至少30%、35%、 40%、45%或50%，優選至少55%、60%、65%或70%，優選至少80%，特別優選至少85%或90%、91%、92%,93%或94%，非常特別優選至少95%、97%、98%或99%的同源性，並且編碼與表II第5列和第7列中所示多肽具有基本相同特性的多肽。通過對根據本發明的表II第5列和第7列中所示多肽之一進行取代、插入或缺失而產生的功能等價物與根據本發明的表II第5列和第7列中所示多肽之一具有至少30%、35%、40%、45%或50%，優選至少55%、60%、65%或70%，優選至少80%，特別優選至少85%或90%、91%、92%、93%或94%，非常特別優選至少95%、97%、98%或99%的同源性，並且與表II第5列和第7列中所示多肽具有基本相同特性。功能等價物的「基本相同的特性」首先應理解為指該功能等價物具有上述活性，例如在細胞溶膠或細胞器(如質體或線粒體或這兩者，優選質體)中表達而增加所述功能等價物在生物(如微生物、植物或植物組織或動物組織、植物或動物細胞或其部分)中的蛋白量、活性或功能。可以這樣產生編碼表II第5列和第7列之蛋白質序列的同源物的核酸分子向本發明核酸分子(特別是表I第5列和第7列)的核苷酸序列中引入一個或多個核苷酸取代、添加或缺失，以使所編碼蛋白質中引入一個或多個胺基酸取代、添加或缺失。可以通過標準技術(如定點誘變和PCR介導的誘變)向表I第5列和第7列的編碼序列中引入突變。優選地，在一個或多個預測的非關鍵胺基酸殘基處產生保守性胺基酸取代。「保守性胺基酸取代」是這樣的胺基酸取代，其中胺基酸殘基被具有相似側鏈的胺基酸殘基取代。具有相似測量的胺基酸殘基家族已在本領域中定義。這些家族包括帶有以下側鏈的胺基酸鹼性側鏈(例如賴氨酸、精氨酸、組氨酸)、酸性側鏈(例如天冬氨酸、穀氨酸)、不帶電的極性側鏈(例如甘氨酸、天冬醯胺、穀氨醯胺、絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、非極性側鏈(例如丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸)、3 -分支側鏈(例如蘇氨酸、纈氨酸、異亮氨酸)和芳香側鏈(例如酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、組氨酸)。因此，本發明多肽或本發明方法所用多肽中預測的非關鍵胺基酸殘基優選被來自同一家族的另一胺基酸殘基取代。或者，在另一實施方案中，可在本發明核酸分子或本發明方法所用核酸分子的編碼序列的全部或部分中隨機引入突變，例如通過飽和誘變引入，並可在所得突變體中篩選本文所述活性，以鑑定保留或甚至增加上述活性(例如賦予與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀)的突變體。在誘變本文所示序列之一後，可以重組表達所編碼的蛋白質並可使用如本文所述的測定(見實施例)來測定蛋白質的活性。通過Gap檢索在以下資料庫條目中發現本發明方法所用核酸分子的最高同源性。具有表I第5列和第7列中所示序列的所用核酸序列的同源物還包括等位基因變體，其與所示核苷酸序列之一或上述衍生的核酸序列或其同源物、衍生物或類似物或其部分具有至少約30%、35%、40%或45%，優選至少約50%、60%或70%，更優選至少約90%、91%、92%、93%、94%或95%，甚至更優選至少96%、97%、98%或99%的同源性。特別地，等位基因變體包括功能變體，其可通過在所示序列(優選表I第5列和第7列中所示或衍生的核酸序列)中缺失、插入或取代核苷酸來獲得，然而，其目的是所合成的蛋白質的酶活性或生物活性有利地被保留或增加。
在本發明的一個實施方案中，本發明的核酸分子或本發明方法所用核酸分子包含表I第5列和第7列任何中所示序列。優選地，該核酸分子包含儘可能少的在表I第5列和第7列任一中未顯不的其他核苷酸。在一個實施方案中，所述核酸分子包含少於500、400、300、200、100、90、80、70、60、50或40個其他核苷酸。在另一實施方案中，所述核酸分子包含少於30、20或10個其他核苷酸。在一個實施方案中，本發明方法所用的所述核酸分子與表I第5列和第7列中所示序列相同。還優選本發明方法所用核酸分子編碼包含表II第5列和第7列中所示序列的多肽。在一個實施方案中，所述核酸分子編碼少於150、130、100、80、60、50、40或30個其他胺基酸。在另一實施方案中，所編碼的多肽包含少於20、15、10、9、8、7、6或5個其他胺基酸。在用於本發明方法的一個實施方案中，所編碼的多肽與表II第5列和第7列中所不序列相同。在一個實施方案中，本發明的核酸分子或者方法中所用核酸分子編碼包含表II第5列和第7列中所序列的多肽,並包含少於100個其他核苷酸。在另一實施方案中，所述核酸分子包含少於30個其他核苷酸。在一個實施方案中，方法中所用核酸分子與表I第5列和第7列中所示序列的編碼序列相同。仍具有本發明多肽賦予與相應例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量(例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀)之必要生物活性或酶活性(即，其活性基本未降低)的多肽(=蛋白質)是具有野生型生物活性或酶活性的至少10%或20%、優選30%或40%、特別優選50%或60%、非常特別優選80%或90或更高的多肽，有利地，該活性與在相同條件下表達的表II第5列和第7列中所示多肽之活性相比基本未降低。表I第5列和第7列的同源物或者表II第5列和第7列中所示衍生序列的同源物還指編碼和非編碼DNA序列的截短序列、cDNA、單鏈DNA或RNA。所述序列的同源物還應理解為指衍生物，其包含非編碼區，例如UTR、終止子、增強子或啟動子變體。所述核苷酸序列上遊的啟動子可通過一個或多個核苷酸取代、插入和/或缺失進行修飾，但卻不幹擾該啟動子、可讀框(=ORF)或遠離ORF的3』調節區(如終止子或其他3』調節區)的功能或活性。還可以如下增加啟動子的活性修飾其序列，或者將其完全取代為活性更高的啟動子，甚至來自異源生物的啟動子。合適的啟動子為本領域技術人員已知，並在下文提及。除了上述編碼根據本發明的多肽的核酸分子以外，本發明的另一方面涉及對選自根據表I第5列和/或第7列(優選第7列)的核酸分子之活性的負調節物。認為其反義多核苷酸抑制這些負調節物的下調活性，這是通過與靶標多核苷酸特異性結合以及幹擾靶標多核苷酸的轉錄、剪接、轉運、翻譯和/或穩定性來實現的。本領域中描述了用於將反義多核苷酸靶向至染色體DNA、初級RNA轉錄物或經加工mRNA的方法。優選地，靶標區包括剪接位點、翻譯起始密碼子、翻譯終止密碼子和可讀框中的其他序列。就本發明目的而言，術語「反義」指這樣的核酸，其包括多核苷酸，上述多核苷酸與基因、初級轉錄物或經加工mRNA的全部或部分充分互補，從而幹擾內源基因的表達。「互補」多核苷酸是能根據標準Watson-Crick互補原則鹼基配對的多核苷酸。具體而言，嘌呤與嘧啶鹼基配對，形成鳥嘌呤與胞嘧啶配對(G:C)和腺嘌呤與胸腺嘧啶(A:T) (DNA的情況)或者腺嘌呤與尿嘧啶(A:U)(RNA的情況)的組合。應該理解，兩個多核苷酸即便不彼此完全互補也能彼此雜交，只要各自具有彼此基本互補的至少一個區域即可。術語「反義核酸」包括單鏈RNA以及能轉錄產生反義RNA的雙鏈DNA表達盒。「活性」反義核酸是能與核酸分子 活性的負調節物選擇性雜交的反義RNA分子，所述核酸分子編碼與選自根據表II第5列和/或第7列(優選第7列)的多肽具有至少80%序列同一性的多肽。反義核酸可以與完整的負調節物鏈互補，或者僅與其一部分互補。在一個實施方案中，反義核酸分子與編碼根據本發明的多肽的核苷酸序列的編碼鏈中的「非編碼區」反義。術語「非編碼區」指編碼區側翼不翻譯成胺基酸的5』和3』序列(S卩，也稱為5』和3』非翻譯區)。反義核酸分子可以僅與mRNA的非編碼區的一部分互補。例如，反義寡核苷酸可以與mRNA翻譯起始位點周圍的區域互補。例如，反義寡核苷酸的長度可以為約5、10、15、20、25、30、35、40、45或50個核苷酸。本發明的反義分子一般包含與表I的核酸之一的非編碼區中至少14個連續核苷酸具有60-100%序列同一性的RNA。優選地,所述序列同一性將為至少70%，更優選至少75%、80%、85%、90%、95%、98%，最優選99%。可以使用本領域已知的方法，使用化學合成和酶連接反應來構建本發明的反義核酸。例如，反義核酸(例如反義寡核苷酸)可以使用天然核苷酸或多種修飾核苷酸來化學合成，所述修飾核苷酸設計用於增加分子的生物穩定性或增加反義與有義核酸之間所形成雙鏈體的物理穩定性，例如，可以使用硫代磷酸酯衍生物和吖啶取代的核苷酸。可用於產生反義核酸的修飾核苷酸的實例包括5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-氯尿嘧啶、5-碘尿嘧啶、次黃嘌呤、黃嘌呤、4-乙醯胞嘧啶、5-(羧基羥甲基)-尿嘧啶、5-羧甲基氨基甲基-2-硫代尿苷、5-羧甲基氨甲基尿卩密唳、二氫尿卩密唳、0-D-半乳糖基queos ine、肌苷、N6_異戍烯基腺嘌呤、I-甲基鳥嘌呤、I-甲基肌苷、2，2-二甲基鳥嘌呤、2-甲基腺嘌呤、2-甲基鳥嘌呤、3-甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、N6-腺嘌呤、7-甲基鳥嘌呤、5-甲基氨甲基尿嘧啶、5-甲氧基氨甲基-2-硫尿嘧啶、P-D-甘露糖基que0Sine、5』 -甲氧基羧甲基尿嘧啶、5-甲氧基尿喃唳、2-甲硫基-N6-異戍烯基腺嘌呤、尿卩密唳-5-氧乙酸(V)、wybutoxosine、假尿卩密唳、queosine、2-硫代胞嘧啶、5-甲基-2-尿嘧啶、2-硫尿嘧啶、4-硫尿嘧啶、5-甲基尿嘧啶、尿嘧啶-5-氧乙酸甲酯、5-甲基-2-硫尿嘧啶、3-(3-氨基-3-N-2-羧基丙基)-尿嘧啶、acp3和2，6-二氨基嘌呤。或者，可以使用已經將核酸以反義方向亞克隆(即，從所插入核酸轉錄的RNA將為目的靶核酸的反義取向，以下章節中進一步描述)的表達載體通過生物方法產生反義核酸。在另一實施方案中，本發明的反義核酸分子是a-端基異構核酸分子。a-端基異構效應核酸分子與互補RNA形成特定的雙鏈雜交體，其中與通常的b單元相反，鏈彼此平行排列(Gaultier等，Nucleic Acids. Res. 15，6625 (1987))。反義核酸分子還可包含2，-O-甲基核糖核苷酸(Inoue 等，Nucleic Acids Res. 15, 6131 (1987))或嵌合 RNA-DNA類似物(Inoue 等，FEBS Lett. 215，327 (1987))。本發明的反義核酸分子一般對細胞施用或 者原位產生，以使其與細胞mRNA和/或基因組DNA雜交或結合。雜交可通過常規核苷酸互補性進行，以形成穩定雙鏈體，或者例如對於與DNA雙鏈體結合的反義核酸分子的情況，通過雙螺旋大溝中的特異性相互作用進行。可以修飾反義分子，以使其特異性結合選定細胞表面上表達的受體或抗原，例如將該反義核酸分子與結合細胞表面受體或抗原的肽或抗體連接在一起。也可以使用本文所述載體將反義核酸分子遞送至細胞中。為了實現足夠的反義分子胞內濃度，優選其中將反義核酸分子置於強原核、病毒或真核(包括植物)啟動子控制之下的載體構建體。作為反義多核苷酸的備選，可以使用核酶、有義多核苷酸或雙鏈RNA(dsRNA)以減少根據本發明多肽的多肽的表達。「核酶」意指具有核糖核酸酶活性的基於催化性RNA的酶，其能夠切割與之具有互補區域的單鏈核酸如mRNA。可以使用核酶(例如Haselhoff和Gerlach, Nature 334, 585(1988)所述的錘頭狀核酶)以催化性切割mRNA轉錄物以便因此抑制mRNA的翻譯。對編碼根據本發明的多肽的核酸呈特異性的核酶可以基於如本文中所公開的根據本發明的多肽cDNA的核苷酸序列或基於根據本發明中已教授的方法而分離的異源序列設計。例如，可以構建四膜蟲(Tetrahymena)L-19IVS RNA的衍生物,在其中活性位點的核苷酸序列與編碼根據本發明多肽的mRNA中待受到切割的核苷酸序列互補。參見例如Cech等的美國專利號4，987，071和5，116，742。備選地，可以使用mRNA以在RNA分子庫內選擇具有特異性核糖核酸酶活性的催化性RNA。參閱如Bartel D.和SzostakJ. ff. ,Science 261，1411 (1993)。在優選的實施方案中，核酶將含有具備至少7、8、9、10、12、14、16、18或20個核苷酸並且更優選地7或8個核苷酸的與靶RNA的部分具有100 %互補性的部分。用於產生核酶的方法對本領域技術人員為已知。例如參見美國專利號6，025，167 ；5，773，260 和 5，496，698。本文使用的術語「dsRNA」指包含兩個RNA鏈的RNA雜交體。dsRNA的結構可以是線性或環狀的。在一個優選的實施方案中，dsRNA對多核苷酸具有特異性，所述多核苷酸編碼根據表II的多肽，或者編碼與根據表II的多肽具有至少70%序列同一性的多肽。雜交的RNA可以是基本互補或完全互補。「基本互補」意指當使用如上所述的BLAST程序優化比對兩種雜交的RNA時，雜交的部分至少95%互補。優選地，dsRNA的長度將是至少100個鹼基對。一般地，雜交的RNA長度相同，沒有突出的5』或3』端並且沒有缺口。然而，達100個核苷酸的具有5』或3』突出端的dsRNA可以用於本發明的方法中。dsRNA可以包含核糖核苷酸或核糖核苷酸類似物如2』 _0_甲基核糖基或其組合。例如，參見美國專利號4，130，641和4，024，222。dsRNA聚核糖次黃苷酸聚核糖胞苷酸在美國專利4，283，393中描述。用於產生和使用dsRNA的方法在本領域已知。一個方法包括在體內或在體外單個反應混合物內同時轉錄兩條互補的DNA鏈。例如，參見美國專利號5，795,715。在一個實施方案中，dsRNA可以通過標準技術直接引入植物或植物細胞。或者，dsRNA可以在植物細胞中通過轉錄兩種互補的RNA得到表達。用於抑制內源基因表達的其他方法如三螺旋形成(Moser等，Science238, 645(1987)，以及 Cooney 等，Science 241, 456(1988))和共抑制(Napoli等，The Plant Cell2, 279, 1990,)為本領域已知。已經將部分或全長的cDNA用於共抑制內源植物基因。參閱如美國專利號 4，801，340,5, 034，323,5, 231，020 和 5，283，184; Van derKroll 等，The Plant Cell2, 291, (1990) ; Smith 等，Mol. Gen. Genetics 224, 477(1990),以及 Napoli 等，The Plant Cell 2,279(1990)。對於有義抑制，認為引入有義多核苷酸封閉相應靶基因的轉錄。有義多核苷酸具有與靶植物基因或靶RNA至少65%的序列 同一性。優選地，同一性百分數是至少80%、90%、95%或更高。引入的有義多核苷酸不必在全長上與靶基因或轉錄物相關。優選地，有義多核苷酸與中表I所不核酸之一的至少100個連續核苷酸具有至少65%的序列同一丨丨生。同一丨I"生的區域可以包含內含子和/或外顯子和非翻譯區域。引入的有義多核苷酸可以短暫存在於植物細胞中，或可以穩定整合至植物染色體或染色體外複製子。此外，本發明的實施方案是包含核酸分子的表達載體，所述核酸分子包含選自下述的核酸分子(a)編碼表II第5或7列中所示多肽的核酸分子；(b)表I第5或7列中所示核酸分子；(c)核酸分子，其由於遺傳密碼的簡併性而源自表II第5列或第7列中所示多肽序列，並賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀；(d)核酸分子,其與包含表I第5列或第7列中所不核酸分子的多核苷酸的核酸分子序列具有至少 30% 同一性，優選至少 40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%,99%,99. 5%同一性，並賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀；(e)核酸分子，其編碼與(a)、(b)、(c)或(d)核酸分子所編碼多肽的胺基酸序列具有至少 30% 同一,注、優選至少 40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、99. 5%同一丨丨生的多肽,並具有包含表I第5列中所不多核苷酸的核酸分子所代表的活性，並賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀；(f)核酸分子，其在嚴格雜交條件下與(a)、(b)、(C)、(d)或(e)的核酸分子雜交，並賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀；(g)核酸分子，其編碼可藉助於針對(a)、(b)、(c)、(d)、(e)或⑴核酸分子之一所編碼多肽產生的單克隆或多克隆抗體來分離的多肽，並具有包含表I第5列中所示多核苷酸的核酸分子所代表的活性；(h)核酸分子，其編碼包含表IV第7列中所示共有序列或一種或多種多肽基序的多肽，並優選地具有包含表II或IV第5列中所示多肽的蛋白質所代表的活性；(i)核酸分子，其編碼具有表II第5列中所示蛋白質所代表的活性的多肽，並賦予與相應的例如未轉化的野生型植物細胞、植物或其部分相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，例如增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀；(j)核酸分子，其包含可通過使用表III第7列中的引物擴增cDNA文庫或基因組文庫獲得的多核苷酸，並優選具有包含表II或表IV第5列中所示多肽的蛋白質所代表的活性；和(k)核酸分子，其可通過嚴格雜交條件下篩選合適的核酸文庫(特別是cDNA文庫和/或基因組文庫)獲得，所述篩選中使用包含(a)或(b)核酸分子之互補序列的探針或 者使用其片段，所述片段具有(a)至(e)所表徵核酸分子序列之互補核酸分子的至少15nt，優選 20nt、30nt、50nt、100nt、200nt、500nt、750nt 或 lOOOnt，並且上述核酸分子編碼多肽，該多肽具有包含表II第5列中所示多肽的蛋白質所代表的活性。本發明還提供分離的重組表達載體，其包含本發明的核酸分子，其中該載體或核酸分子分別在宿主細胞中的表達導致與宿主細胞的相應例如未轉化的野生型相比增加的產量，例如增加的產量相關性狀，例如增強的對非生物性環境脅迫的耐受性，增加的乾旱耐受性和/或低溫耐受性和/或增加的養分使用效率、內在產量和/或另一提到的產量相關性狀。植物表達盒優選地包含調節序列，此類調節序列能夠在植物細胞中驅動基因表達並有效地連接以至每一序列可以充分實現它的功能，如通過聚腺苷酸化信號終止轉錄。優選的聚腺苷酸化信號不但是源自根瘤農桿菌t-DNA如Ti質粒pTiACH5 (Gielen等(1984)EMBO J 3:835)中稱作章魚鹼合酶的基因3或其功能等價物的那些聚腺苷酸化信號，而且在植物中呈功能活性的所有其它終止子也適合。由於植物基因表達並不總是在翻譯水平受限，因此植物表達盒優選地含有有效連接的其它序列，如轉錄增強子，如含有來自菸草花葉病毒的5』非翻譯前導序列的增強每RNA對多肽比率的超驅動序列(Gallie等，Nucl. AcidsResearch 15,8693(1987))。植物基因表達必須有效地連接至賦予基因以時間、細胞或組織特異性方式表達的適宜啟動子。優選的啟動子是驅動組成型表達的啟動子(Benfey等，EMBOJ. 8，2195 (1989))，如那些源自植物病毒如 35S CaMV ((Franck 等，Cell 21，285 (1980))、19S CaMV(還參閱美國專利號5，352，605和PCT申請號WO 84/02913)的啟動子，或植物啟動子，如那些在美國專利號4，962，028中所述來自Rubisco小亞基的啟動子。其他啟動子例如超級啟動子(Ni 等， Plant Journal 7，661 (1995))、泛素啟動子(Callis 等，J. Biol.Chem.，265，12486(1990);US 5, 510, 474;US 6，020，190;KawalIeck 等,Plant. MolecularBiology, 21，673 (1993))或 34S 啟動子(GenBank 登記號 M59930 和 X16673)可類似地用於本發明，並為本領域技術人員已知。發育階段優選的啟動子在發育的某個階段優先受到表達。組織和器官優選的啟動子包括在特定組織或器官如葉、根、種子或木質部中優先受到表達的那些啟動子。組織優選的啟動子包括但不限於果實優選的、胚珠優選的、雄性組織優選的、種子優選的、珠被優選的、塊莖優選的、柄優選的、果皮優選的和葉優選的、柱頭優選的、花粉優選的、花葯優選的、花瓣優選的、萼片優選的、花梗優選的、長角果優選的、莖優選的、根優選的啟動子等。種子優選的啟動子在種子繁育和/或萌發期間優先受到表達。例如，種子優選地啟動子可以是胚優選的、胚乳優選和種衣優選的啟動子。參閱Thompson等，BioEssays 10, 108(1989)。種子優選的啟動子實例包括但不限於纖維素合成酶(celA)、Ciml、Y -玉米醇溶蛋白、球蛋白-I、玉米19kD玉米醇溶蛋白(cZ19Bl)等。其它在本發明表達盒中有用的啟動子包 括但不限於主要葉綠素a/b結合蛋白啟動子、組蛋白啟動子、Ap3啟動子、￠-伴大豆球蛋白啟動子、油菜籽蛋白啟動子，大豆凝集素啟動子、玉米15kD玉米醇溶蛋白啟動子、22kD玉米醇溶蛋白啟動子、27kD玉米醇溶蛋白啟動子、g-玉米醇溶蛋白啟動子、臘質、萎縮I、萎縮2和青銅色啟動子、Zml3啟動子(美國專利號5，086，169)、玉米多聚半乳糖醛酸酶啟動子(PG)(美國專利號5，412，085和5，545，546)和SGB6啟動子(美國專利號5，470，359)以及合成性或其它的天然啟動子。額外有利的調節序列例如包含在植物啟動子如CaMV/35S(Franck等，Cell 21285 (1980))、PRPl (Ward 等，Plant. Mol. Biol. 22，361 (1993))、SSU、OCS, Iib4、usp、STLSUB33、LEB4、nos中或者包含在泛素、油菜籽蛋白或菜豆蛋白啟動子內。誘導型啟動子在本上下文中也有利，如在EP-A-O 388186(苯磺醯胺誘導型)、Plant J. 2, 1992:397-404 (Gatz等，四環素誘導型)、EP-A-O 335 528(脫落酸誘導型)或WO 93/21334(乙醇或環己酮誘導型)中描述的啟動子。額外有利的植物啟動子是馬鈴薯的胞漿FBP酶啟動子或馬鈴薯的ST-LSI啟動子(Stockhaus等，EMBO J. 8 (1989) 2445-245)、大豆的磷酸核糖焦磷酸醯胺轉移酶啟動子(還參見Genebank登錄號U87999)或如EP-A-O 249 676中所述節特異性啟動子。額外特別有利的啟動子是可以用於單子葉植物或雙子葉植物並且在US5，608，152 (來自油菜籽植物的油菜籽蛋白啟動子)、W0 98/45461 (來自擬南芥屬的油質蛋白啟動子)、US5，504，200(來自菜豆的菜豆蛋白啟動子)、W091/13980(來自芸苔屬的Bce4啟動子)和Baeumlein等，Plant J.，2，2，1992:233 — 239 (來自豆科植物的LEB4啟動子)中描述的種子特異性啟動子。所述啟動子用於雙子葉植物中。如下啟動子用於例如單子葉植物來自大麥中Ipt2或Iptl啟動子(W0 95/15389和WO 95/23230)或來自大麥的大麥醇溶蛋白啟動子。其它有用的啟動子在W099/16890中描述。原則上，可以使用具有其調節序列的所有天然啟動子，如以上提及的用於新方法的那些天然啟動子。除此之外，還可能並且可以有利地使用合成性啟動子。基因構建體還可含有待插入生物中並例如參與脅迫耐受性和產量增加的其他基因。在宿主生物中插入並表達調節基因是可能的並且是有利的，例如編碼誘導物、阻遏物或通過其酶活性幹預調節作用的酶的基因，或者生物合成途徑中一種或多種或全部酶的基因。這些基因在來源上可以是異源或同源的。插入的基因可以具有它們自己的啟動子或處於如與表I核酸序列或其同源物的相同啟動子控制下。為了表達存在的其它基因，基因構建體有利地包含根據已選擇的宿主生物和基因選擇用於最佳表達的3』和/或5』末端調節序列以增強表達。這些調節序列用於使如上所述的基因特異性表達和蛋白質表達成為可能。根據宿主生物，這可以意指例如僅在誘導後基因才得以表達或過量表達或基因立即得以表達和/或過量表達。
調節序列或因子還可以優選地有益影響引入的基因的表達並且因此增加表達。有可能通過使用強轉錄信號，如啟動子和/或增強子以這種方式有利地在轉錄水平增強調節元件。然而，除此之外，還有可能例如通過改善mRNA的穩定性增強翻譯。用於植物基因表達盒的其它優選序列是指導基因產物進入適宜細胞區室所需要的靶向序列(綜述參閱Kermode, Crit. Rev. Plant Sci. 15 (4)，285 (1996)及其參考文獻)，如進入液泡、細胞核、所有類型的質粒如澱粉體、葉綠體、細胞外空間、線粒體、色質體、內質網、油體、過氧化物酶體和植物細胞的其它區室。植物基因表達還可以通過誘導型啟動子進行促進(綜述參閱Gatz，Annu.ReV.Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 48，89 (1997))。當基因表達需要以時間特異性方式發生時，化學誘導型啟動子特別合適。表VI列出了可用於調節本發明核酸編碼序列的轉錄的一些啟動子實例。
表VI :植物中組織特異性啟動子和誘導型啟動子的實例
權利要求
1.生產較之相應野生型植物而言具有增加的產量的植物的方法，其中所述方法包括至少下述步驟在植物或其部分中增加或產生一種或多種選自以下的多肽的活性2_氧代戊二酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- 二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. ROl. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute 蛋白、AT1G29250. I 蛋白、AT1G53885 蛋白、AT2G35300 蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、CDS5394 蛋白、CDS5401 截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、δ -8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧唳序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋 白β亞基、絲氨酸乙醯基轉移酶、絲氨酸羥甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白。
2.生產較之相應野生型植物而言具有增加的產量的植物的方法，其中所述方法包括選自以下的至少一種步驟 (i)增加或產生下述多肽的活性，所述多肽包含表II或表IV的第5或7列分別示出的多肽、共有序列或至少一種多肽基序； (ii)增加或產生包含表I的第5或7列示出的多核苷酸的核酸分子所編碼的表達產物的活性，以及 (iii)增加或產生(i)或(ii)的功能性等價物的活性。
3.權利要求I或2的方法，其包括 (i)增加或產生至少一種核酸分子的表達；和/或 (ii)增加或產生由至少一種核酸分子所編碼的表達產物的表達；和/或 (iii)增加或產生至少一種核酸分子編碼的表達產物的一種或多種活性； 其中所述至少一種核酸分子包含選自以下的核酸分子 Ca)編碼表II第5或7列所示的多肽的核酸分子； (b)表I第5或7列所示的核酸分子； (c)核酸分子，其由於遺傳密碼的簡併性的結果，源於表II第5或7列示出的多肽序列，並且賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量; (d)核酸分子,其與包含表I的第5或7列所不的核酸分子的多核苷酸的核酸分子序列具有大約70%或更多的同一性，並且，賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量； (e)核酸分子，其編碼的多肽與(a)至(C)的核酸分子編碼的多肽的胺基酸序列具有大約70%或更多的同一性，並且其具有包含表I第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性，並且，賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量;(f)核酸分子，其在嚴格雜交條件下與(a)至(c)的核酸分子雜交，並且，賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量； (g)核酸分子，其編碼的多肽可在針對(a)至(e)的一種核酸分子編碼的多肽製備的單克隆或多克隆抗體協助下被分離出來，並且其具有包含表I第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性； (h)核酸分子，其編碼包含表IV第7列所示的共有序列或一種或多種多肽基序的多肽，並且優選具有包含表II或IV的第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性； (i)核酸分子，其編碼具有表II第5列示出的蛋白質代表的活性的多肽，並且賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量； (j)核酸分子，其包含使用表III第7列中的引物通過擴增cDNA文庫或基因組文庫獲得的多核苷酸，並且優選具有包含表II或IV第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性；以及 (k)核酸分子，其可通過在嚴格雜交條件下用包含(a)或(b)的核酸分子的互補序列的探針或用其片段篩選合適的核酸文庫來獲得，並且編碼具有包含表II第5列示出的多肽的蛋白質代表的活性的多肽，所述片段具有與(a)至(e)表徵的核酸分子序列互補的核酸分子的大約50nt或更多。
4.用於生產較之相應未經轉化的野生型植物而言具有增加的產量的轉基因植物的方法，其包括用包含選自以下的核酸分子的核酸分子來轉化植物細胞或植物細胞核或植物組織 (a)編碼表II第5或7列所示的多肽的核酸分子； (b)表I第5或7列所示的核酸分子； (c)核酸分子，其由於遺傳密碼的簡併性的結果，源於表II第5或7列示出的多肽序列，並且賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量; (d)核酸分子,其與包含表I的第5或7列所不的核酸分子的多核苷酸的核酸分子序列具有至少大約70%的同一性，並且，賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量； (e)核酸分子，其編碼的多肽與(a)至(C)的核酸分子編碼的多肽的胺基酸序列具有至少大約70%的同一性，並且其具有包含表I第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性，並且，賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量； (f)核酸分子，其在嚴格雜交條件下與(a)至(C)的核酸分子雜交，並且，賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量； (g)核酸分子，其編碼的多肽可在針對(a)至(e)的一種核酸分子編碼的多肽製備的單克隆或多克隆抗體協助下被分離出來，並且其具有包含表I第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性； (h)核酸分子，其編碼包含表IV第7列所示的共有序列或一種或多種多肽基序的多肽，並且優選具有包含表II或IV的第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性； (i)核酸分子，其編碼具有表II第5列示出的蛋白質代表的活性的多肽，並且賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；(j)核酸分子，其包含使用表III第7列中的引物通過擴增CDNA文庫或基因組文庫獲得的多核苷酸，並且優選具有包含表II或IV第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性；以及 (k)核酸分子，其可通過在嚴格雜交條件下用包含(a)或(b)的核酸分子的互補序列的探針或用其片段篩選合適的核酸文庫來獲得，並且編碼具有包含表II第5列示出的多肽的蛋白質代表的活性的多肽，所述片段具有與(a)至(e)表徵的核酸分子序列互補的核酸分子的至少大約400nt, 並且從該經轉化的植物細胞核、植物細胞或植物組織再生具有增加的產量的轉基因植物。
5.根據權利要求2-4中任一項的方法，其中增加或產生的一種或多種活性是選自以下多肽的活性2_氧代戊二酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』-磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- 二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. ROl. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2 結構域的轉錄因子、argonaut e 蛋白、AT1G29250. I 蛋白、AT1G53885 蛋白、AT2G35300蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、CDS5394 蛋白、⑶S5401截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、δ-8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基_脯氨醯順反異構酶、肽基_脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋白β亞基、絲氨酸乙醯基轉移酶、絲氨酸輕甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白。
6.權利要求1-5中任一項的方法，其導致在標準生長條件、低溫、乾旱或非生物性脅迫條件下，與相應的野生型植物相比增加的產量。
7.分尚的核酸分子，其包含選自以下的核酸分子 Ca)編碼表IIB第5或7列所示的多肽的核酸分子； (b)表IB第5或7列所示的核酸分子； (c)核酸分子，其由於遺傳密碼的簡併性的結果，源於表II第5或7列示出的多肽序列，並且賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量; (d)核酸分子,其與包含表I的第5或7列所不的核酸分子的多核苷酸的核酸分子序列具有至少大約70%的同一性，並且，賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量； (e)核酸分子，其編碼的多肽與(a)至(C)的核酸分子編碼的多肽的胺基酸序列具有至少大約70%的同一性，並且其具有包含表I第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性，並且，賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量； Cf)核酸分子，其在嚴格雜交條件下與(a)至(c)的核酸分子雜交，並且，賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量；(g)核酸分子，其編碼的多肽可在針對(a)至(e)的一種核酸分子編碼的多肽製備的單克隆或多克隆抗體協助下被分離出來，並且其具有包含表I第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性； (h)核酸分子，其編碼包含表IV第7列所示的共有序列或一種或多種多肽基序的多肽，並且優選具有包含表II或IV的第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性； (i)核酸分子，其編碼具有表II第5列示出的蛋白代表的活性的多肽，並且賦予較之相應未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量； (j)核酸分子，其包含使用表III第7列中的引物通過擴增cDNA文庫或基因組文庫獲得的多核苷酸，並且優選具有包含表II或IV第5列示出的多核苷酸的核酸分子代表的活性；以及 (k)核酸分子，其可通過在嚴格雜交條件下用包含(a)或(b)的核酸分子的互補序列的探針或用其片段篩選合適的核酸文庫來獲得，並且編碼具有包含表II第5列示出的多肽的蛋白代表的活性的多肽，所述片段具有與(a)至(e)表徵的核酸分子序列互補的核酸分子的至少400nt。
8.權利要求7的核酸分子，其中根據(a)至(k)的核酸分子與表IA的第5或7列示出的序列有至少一個或多個核苷酸不同，且優選的編碼與表II A的第5或7列示出的蛋白質序列有至少一個或多個胺基酸不同的蛋白質。
9.核酸構建體，其賦予權利要求7或8所述的核酸分子的表達，所述核酸構建體包含一種或多種調節元件。
10.載體，其包含權利要求7或8所述的核酸分子，或權利要求9的核酸構建體。
11.生產多肽的方法，其中多肽在權利要求11所述的宿主核或宿主細胞中表達。
12.通過權利要求12所述的方法生產的，或由權利要求7或8所述的核酸分子編碼的，或如表II B中所示的多肽，其中多肽通過一個或多個胺基酸區別於表II A所示序列。
13.抗體，其特異性結合權利要求13所述的多肽。
14.植物細胞核、植物細胞、植物組織、繁殖材料、花粉、後代、收穫的材料或植物，其包含權利要求7或8所述的核酸分子，或權利要求11所述的宿主核或宿主細胞。
15.在再生後產生具有增加產量的植物的植物細胞核、植物細胞、植物組織、繁殖材料、種子、花粉、後代或植物部分；或具有增加產量的植物；或其部分；其中所述與相應的野生型相比增加的產量是通過權利要求1-6的任一項的方法產生的，或轉化了權利要求7或8所述的核酸分子或權利要求9的核酸構建體產生的。
16.源自單子葉植物的權利要求15的轉基因植物細胞核、轉基因植物細胞、轉基因植物或其部分。
17.源自雙子葉植物的權利要求15的轉基因植物細胞核、轉基因植物細胞、轉基因植物或其部分。
18.權利要求15的轉基因植物細胞核、轉基因植物細胞、轉基因植物或其部分，其中相應的植物選自玉米(玉蜀黍)、小麥、黑麥、燕麥、黑小麥、稻、大麥、大豆、花生、棉花、包括卡諾拉油菜和冬油菜的油菜、木薯、胡椒、向日葵、甘蔗、糖蘿蔔、亞麻、琉璃苣、紅花、亞麻子植物、報春花、油菜籽植物、球莖甘藍、萬壽菊、包括馬鈴薯、菸草、茄子、西紅柿的茄科植物；蠶豆屬物種、豌豆、苜蓿、咖啡、可可、茶、柳屬物種、油棕、椰子、多年生草本植物、飼料作物和擬南芥。
19.權利要求15的轉基因植物細胞核、轉基因植物細胞、轉基因植物或其部分，其中植物選自玉米、大豆、油菜(包括卡諾拉油菜和冬油菜)、棉花、小麥和稻。
20.包括一種或多種植物細胞核或植物細胞、後代、種子或花粉，或通過權利要求14-19的任一項的轉基因植物產生的轉基因植物。
21.源自或由權利要求6-9的任一項的轉基因植物生產的轉基因植物、轉基因植物細胞核、轉基因植物細胞、包括一種或多種此類轉基因植物細胞核或植物細胞的植物、後代、種子或花粉，其中所述轉基因植物、轉基因植物細胞核、轉基因植物細胞、包括一種或多種此類轉基因植物細胞核或植物細胞的植物、後代、種子或花粉對於賦予較之相應的未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分而言增加的產量的轉基因是遺傳純合的。
22.用於鑑定與相應的未經轉化的野生型植物細胞、轉基因植物或其部分相比，在植物細胞、轉基因植物或其部分、轉基因植物或其部分中賦予增加的產量的化合物的方法，其包括步驟 Ca)培養表達權利要求12的多肽的植物細胞、轉基因植物或其部分，和讀出系統，該讀出系統能在允許該多肽在化合物或包含多種化合物的樣品存在下與此讀出系統相互作用的合適條件下與該多肽相互作用，並能在一定條件下應答於化合物與所述多肽的結合而提供可檢測信號，該條件允許表達所述讀出系統和權利要求12的核酸分子編碼的多肽； (b)通過檢測由所述讀出系統所產生信號的存在與否或者增加來鑑定該化合物是否是有效的激動劑。
23.生產農業組合物的方法，其包括權利要求22的方法的步驟，以及以農業應用可接受的形式配製權利要求22中鑑定的化合物。
24.組合物，其包含權利要求7或8的核酸分子，權利要求9的核酸構建體，權利要求10的載體，權利要求12的多肽，權利要求22的化合物，和/或權利要求13的抗體；和任選的農業可接受的載體。
25.選自酵母或大腸桿菌的權利要求12的多肽或核酸分子。
26.權利要求7或8的核酸的用途，其用於製備與相應的未經轉化的野生型植物相比具有增加的產量的植物。
27.根據權利要求7或8的核酸的用途，其作為標記物用於鑑定或選擇與相應的未經轉化的野生型植物相比具有增加的產量的植物。
28.根據權利要求17的核酸或其部分作為標記物用於檢測植物或植物細胞中產量增加的用途。
29.鑑定出具有增加的產量的植物的方法，所述方法包括針對選自2-氧代戊二酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- 二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. R01. I蛋白、、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute 蛋白、AT1G29250. I 蛋白、AT1G53885 蛋白、AT2G35300 蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440 蛋白、CDS5394 蛋白、CDS5401 截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、δ -8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧唳序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋白β亞基、絲氨酸乙醯基轉移酶、絲氨酸羥甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白的多肽的活性，對一種或多種植物細胞核、植物細胞、植物組織或植物或其部分的群體進行篩選，將活性水平與參照的活性水平加以比較；鑑定出較之參照而言活性增加的一種或多種植物細 胞核、植物細胞、植物組織或植物或其部分，任選地，從鑑定出的植物細胞核、細胞或組織產生植物。
30.鑑定出具有增加的產量的植物的方法，所述方法包括針對編碼賦予來自下述多肽的活性的多肽的核酸的表達水平，對一種或多種植物細胞核、植物細胞、植物組織或植物或其部分的群體進行篩選，所述多肽選自2-氧代戊二酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3』 -磷酸腺苷5』 -磷酸磷酸酶、4- 二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199. R01. I蛋白、60952769. R01. I蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含ΑΡ2結構域的轉錄因子、argonaute蛋白、AT1G29250. I蛋白、AT1G53885 蛋白、AT2G35300 蛋白、AT3G04620 蛋白、AT4G01870 蛋白、AT5G42380 蛋白、AT5G47440蛋白、CDS5394蛋白、CDS5401截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、δ -8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、0S02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋白β亞基、絲氨酸乙醯基轉移酶、絲氨酸羥甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白，將表達水平與參照加以比較；鑑定出較之參照而言表達水平增加的一種或多種植物細胞核、植物細胞、植物組織或植物或其部分，任選地，從鑑定出的植物細胞核、細胞或組織產生植物。
31.權利要求1-6的任一項的方法或根據權利要求14-20的任一項的植物，其中所述植物表現出改善的產量相關性狀。
32.權利要求1-6的任一項的方法或根據權利要求14或15的任一項的植物，其中所述植物表現出改善的養分使用效率和/或非生物性脅迫耐受性。
33.權利要求1-6的任一項的方法或根據權利要求14-20的任一項的植物，其中所述植物表現出改善的增加的低溫耐受性。
34.權利要求1-6的任一項的方法或根據權利要求14-20的任一項的植物，其中所述植物表現出可收穫產量的增加。
35.權利要求1-6的任一項的方法或根據權利要求14-20的任一項的植物，其中所述植物表現出改善，其中產量增加是基於每株植物或涉及特定可耕地來計算的。
36.增加植物的群體的產量的方法，所述方法包括檢查用於栽種的地區的生長溫度，將所述溫度與考慮用於栽種的植物物種或品種的最優生長溫度相比較，如果生長溫度對於考慮用於栽種的植物物種或品種的栽種和生長來說並非最優的話，栽種和生長權利要求14至20或31至35的任一項的植物。
37.前述權利要求的方法，其包括收穫所產生或栽種的植物或植物部分，並且用收穫的植物或其部分或者從收穫的植物或其部分產生燃料。
38.前述權利要求的方法，其中所述植物是用於澱粉產生的植物，所述方法包括收穫用於澱粉分離的植物部分，並且從該植物部分中分離澱粉。
39.用於產生具有產量增加的植物的編碼包含Pfam結構域PF01789.9的多肽的核酸分子，或由所述核酸分子編碼的多肽。
40.權利要求39的核酸分子，或由所述核酸分子編碼的多肽，所述核酸分子編碼下述多肽，其與SEQ ID NO. :385的多肽具有75%或更高同一性且包含Pfam結構域PF01789. 9，並賦予植物增加的產量。
全文摘要
生產較之相應野生型植物而言具有增加的產量的植物的方法，其中所述方法包括至少下述步驟在植物或其部分中增加或產生一種或多種選自以下的多肽的活性2-氧代戊二酸依賴性雙加氧酶、3-酮脂醯輔酶A硫解酶、3'-磷酸腺苷5'-磷酸磷酸酶、4-二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤蘚糖醇激酶、50S葉綠體核糖體蛋白L21、57972199.R01.1蛋白、60952769.R01.1蛋白、60S核糖體蛋白、ABC轉運蛋白家族蛋白、包含AP2結構域的轉錄因子、argonaute蛋白、AT1G29250.1蛋白、AT1G53885蛋白、AT2G35300蛋白、AT3G04620蛋白、AT4G01870蛋白、AT5G42380蛋白、AT5G47440蛋白、CDS5394蛋白、CDS5401截短蛋白、冷反應蛋白、cullin、細胞色素P450、δ-8鞘脂脫飽和酶、肌醇半乳糖苷合酶、穀胱甘肽-S-轉移酶、GTP酶、haspin相關蛋白、熱休克蛋白、熱休克轉錄因子、組蛋白H2B、茉莉酮酸酯-zim結構域蛋白、線粒體天冬醯胺醯-tRNA合成酶、寡糖轉移酶、OS02G44730蛋白、放氧增強蛋白、肽基-脯氨醯順反異構酶、肽基-脯氨醯順反異構酶家族蛋白、質體脂相關蛋白、多聚嘧啶序列結合蛋白、PRLI相互作用因子、蛋白激酶、蛋白激酶家族蛋白、rubisco亞基結合蛋白β亞基、絲氨酸乙醯基轉移酶、絲氨酸羥甲基轉移酶、小熱休克蛋白、S-核糖基高半胱氨酸酶、糖轉運蛋白、硫氧還蛋白H型、泛素綴合酶、泛素-蛋白質連接酶、普遍脅迫蛋白家族蛋白和液泡蛋白。
文檔編號A01H1/00GK102770543SQ201080061584
公開日2012年11月7日 申請日期2010年11月5日 優先權日2009年11月17日
發明者A·I·桑茲莫林納羅, B·麥可西, C·勒佐, C·達曼, G·裡特, H·舍恩, K·克裡希納, K·布魯因希爾斯, O·布萊辛, O·蒂姆, S·亨克斯, S·范德納比利, V·弗蘭卡德, Y·海茨費爾德 申請人:巴斯夫植物科學有限公司