用銅氧還蛋白治療ephrin信號傳導相關性病變的組合物和方法

2023-06-02 15:37:01

專利名稱：：用銅氧還蛋白治療ephrin信號傳導相關性病變的組合物和方法
技術領域：
：本發明涉及銅氧還蛋白(Cupredoxins)及其在調節涉及Ephrin和Ephrin受體的細胞功能方面的用途。本發明也涉及治療Ephrin相關性病變的方法。更具體地，本發明涉及基本上純化的銅氧還蛋白在減慢癌細胞和病理性病變(特別是那些與Ephrin/Ephrin受體信號傳導相關的病變)的生長和轉移的方法以及其他與Ephrin/Ephrin受體信號傳導相關的治療方法中的用途。本發明也涉及保留了幹擾細胞中Ephrin信號傳導系統的能力的銅氧還蛋白的變體、衍生物和結構等價物。
背景技術：
：Ephrin受體(Eph受體)是一個大的受體酪氨酸激酶家族，其通過結合被稱作Ephrin的配體家族來調節發育和成體組織中的多個過程。用Ephrin配體可以將Eph受體分成A型或B型。目前已知有9種A型成員，即EphAl-8和EphAlO，和4禾中B型成員，EphBl-4和EphB6。A型受體一般優選地結合A型配體，而B型受體優選地結合B型配體。Eph受體和其他受體酪氨酸激酶一樣，具有單個跨膜橫跨結構域、和由具有免疫球蛋白樣基序的配體結合結構域、富半胱氨酸區和兩個m型纖維結合蛋白重複組成的糖基化的細胞外區(Surawskaetal，Cytokine&GrowthFactorReviews15:419-433(2004))。根據其序列保守性可以將Ephrin配體分成A和B型。EphrinA配體是糖基磷脂醯肌醇錨定的，通常被Eph-A型受體所結合，而EphrinB含有跨膜結構域和短的細胞漿區，其通常被Eph-B受體所結合。當Eph受體與Ephrin配體形成二聚體，引起受體成為磷酸化時，信號傳導過程從此開始。通過更高級的成簇形成了Ephrin-Eph受體複合物的聚集物。受體活性被認為是依賴於多聚體化的程度，但是並非限於四聚體形式，因為在更低或更高級的形式中也觀察到了受體磷酸化。根據多聚體化的狀態，不同的Eph受體複合物可以誘導生物學作用。除了通過Eph受體進入到受體表達細胞的"前向"信號傳導外，也有著通過Ephrin進入到Ephrin表達細胞的"反向"信號傳導。例如，B-Ephrin的細胞漿尾部可以變成磷酸化，導致了信號傳導效應物的募集以及Ephrin信號傳導細胞中的信號傳導級聯。現在己知Ephrin在多種細胞-細胞相互作用中發揮作用，包括軸突路徑選擇(axonpathfinding)、神經元細胞遷移、和血管內皮細胞和專門上皮的相互作用(Flanagan&Vanderhaeghen,Annu.Rev.Neurosci.21:309-345(1998);Frisenetal，EMBOJ.18:5159-5165(1999))。Eph受體也參與了多個病理過程，包括腫瘤進展、病理形式的血管生成、組織損傷後的慢性疼痛、脊髓損傷後的神經再生的抑制、和人類先天性畸形(Koolpeetal,JBiolChem.280:17301-17311(2005))。也報導了Eph受體在平衡幹細胞自我更新和細胞結局確定及分化中起到了作用。Eph受體和Ephrin過度表達可以造成腫瘤生成，並且與多種人類癌症類型中的血管生成和轉移相關，包括肺癌、乳腺癌和前列腺癌、以及黑色素瘤禾B白血病(Surawskaetal.，Cytokine&GrowthFactorReviews15:419-433(2004))。Eph受體的過度表達被認為並未影響細胞的增殖，而是改變細胞的侵襲行為。根據一個理論，在具有高水平EphA2的惡性細胞中，受體是錯位的(mislocalized)，其不能結合它們的Ephrin配體，因此不會被磷酸化，造成了細胞外基質粘附的增加以及更高的轉移可能(Ruoslahti,Adv.CancerRes.76:1-20(1999))。血管生成是從預先存在的脈管結構中形成新的血管和毛細血管，這是腫瘤存活和生長的基本過程。有證據表明在腫瘤的血管侵襲期間存在著Eph受體/Ephrin的上調(Surawskaetal，(2004))。具體地，A型Ephrin與腫瘤血管生成相關，EphA2-Fc和EphA3-Fc融合蛋白降低了腫瘤血管密度、腫瘤體積和細胞增殖，也增加了凋亡(Brantleyetal,Oncogene21:7011-7026(2002))。EphB2受體-EphrinB2複合物的晶體結構表明EphrinB2摺疊拓撲學的胞外結構域(ectodomain)是8鏈桶(barrel),其是常見的希臘花邊(3桶摺疊的變體，與銅結合蛋白的銅氧還蛋白家族具有相當多的同源性，不過EphrinB2不結合銅。Ephrin和銅氧還蛋白摺疊蛋白之間的主要差別是EphrinG-Hl和C-Dl袢(loop)的罕見長度，它們分別是二聚體的和四聚體的配體受體界面的一部分。晶體結構還表明G-Hl袢參與了受體結合(Himanenetal，Nature414:933-938(2001))。小鼠EphrinB2的細胞外區也具有與植物Nodulin和Phytocyanin相似的拓撲學(Tothetal,DevelopmentalCell,1:83-92(2001))。關於受微生物病原體感染的人類和動物體內的癌症消退的報導可以追溯到100多年前，源自Coley的第一個報導(Clin.Orthop,Rdat.Res.262:3-12(1891))。一些隨後的報導已經顯示，微生物病原體在缺氧狀態下在腫瘤部位進行複製，並且在感染期間也刺激了宿主的免疫系統，造成了癌症進展的抑制(Alexandrofetal,Lancet353:1689-1694(1999);Paglia&Guzman,CancerImmunol.Immunother.46:88-92(1998);Paweleketal，CancerRes.57:4537-4544(1997))。細菌病原體例如銅綠假單胞菌OP"wcfomomMaen^>w0和許多其他的細菌都生成了多種容許細菌逃脫宿主防禦並引起疾病的致病因素(Tangetal,Infect.Immun.64:37-43(1996);ClarkandBavoil,MethodsinEnzymology,vol.235，BacterialPathogenesis,AcademicPress,Inc.SanDiegoCalif.(1994);SalyersandWhitt，BacterialPathogenesis:AMolecularApproach,ASMPress,WashingtonD.C.(1994))。一些致病因素誘導了吞噬細胞例如巨噬細胞的凋亡，以摧毀宿主的防禦(Monacketal，Proc.Natl.Acad.Sci.USA94:10385-10390(1997);ZychlinskyandSa歸netti,J.Clin.I謂stig.100:493-495(1997》。銅綠假單胞菌生成的兩種氧化還原蛋白，即銅氧還蛋白天青蛋白(Azurin)和細胞色素C551(CytC55I)，兩者都能進入J774細胞，並且與正常細胞相比較，其對人類癌症細胞顯示出了顯著的細胞毒活性(Zaborinaetal,Microbiology146:2521-2530(2000))。天青蛋白也能進入人黑色素瘤UISO-Mel-2或人乳腺癌MCF-7細胞(Yamadaetal，PNAS99:14098-14103(2002);Punjetal,Oncogene23:2367-2378(2004);Yamadaetal,Cell.Biol.7:14181431(2005))。另外，銅綠假單胞菌的天青蛋白優選地進入J774小鼠網狀細胞肉瘤細胞，與腫瘤抑制蛋白p53形成複合物並穩定p53蛋白，增加了p53的細胞內濃度，並誘導凋亡(Yamadaetah,InfectionandImmunity,70:7054-7062(2002))。與非癌症細胞相比較，天青蛋白也引起了人成骨肉瘤細胞凋亡的顯著增加(Yeetal，AiZheng24:298-304(2003))。銅綠假單胞菌的細胞色素C551(CytC551)增加了J774細胞中的腫瘤抑制蛋白pl6自a的水平，並抑制了J774細胞的細胞周期進程(Himokaetal,PNAS101:6427-6432(2004))。但是，當結腸癌細胞例如HCT116細胞或無p53的肺癌H1299細胞與野生型天青蛋白或野生型細胞色素C別一起生長3天時，它們抑制HCT116細胞生長的濃度(天青蛋白的IC50=17ng/ml;CytCIC50=12pg/ml)比抑制H1299細胞(>20pg/ml)更低。癌症是可能無限生長的惡性腫瘤。它主要是人體中所見的各種類型細胞的病理性複製(缺少正常的調節控制)。疾病的初始治療常常是手術、放療或這些治療的組合物，但是局部的復發和轉移性病變也很常見。一些癌症可以進行化學治療，但是這些治療很少獲得長期緩解。因此，它們常常是非治癒性的。在稱作發生多藥耐藥的情況中，腫瘤及其轉移灶常常變得對化療耐藥。在多種情況中，腫瘤對一些類型的化療藥物天生耐藥。另外，這些治療威脅著非癌症細胞，這對人體是一種應激，並產生了許多副作用。因此需要改良藥物來阻止癌症細胞的播散。
發明內容本發明涉及使用銅氧還蛋白和銅氧還蛋白的變體、衍生物及結構等價物來幹擾哺乳動物的Ephrin信號傳導系統的的組合物和方法。具體地，本發明涉及使用銅氧還蛋白例如天青蛋白和質體藍素(Plastocyanin)及其變體、衍生物和結構等價物治療哺乳動物的癌症的組合物和方法。本發明的一個方面涉及分離的肽，其是銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物，其能抑制哺乳動物細胞或組織中癌症的生長。這個肽可以是天青蛋白、質體藍素、假天青蛋白(Pseudoazurin)、質體藍素、Rusticyanin或Auracyanin，特另ll是天青蛋白、質體藍素禾口Rusticyanin。在一些實施方式中，銅氧還蛋白來自銅綠假單胞菌、氧化亞鐵硫桿菌(7TK'o6ac/〃wjy^roo;nV^a"力、P/2orw,d7ww2/am/"oswm、類產減菌(^4/ca/(ge"es/"ecafe)、氧化木糖無色桿菌(^c/zrawo^cferx7/oso;aV^")、支氣管敗血性博德特菌(5orafefe〃a6ra"ctoeWcfl)、甲基單胞菌屬(Mef/^/簡o""51腦膜炎奈瑟菌(jVe&en'a,w'"g"/cfo)、淋病奈瑟菌(7Ve",/ago"orA7zoeae)、螢光假單胞菌(屍化"(iomo"as/7womscera)、綠針假單胞菌(屍^ew^fowo"asc/7/0raraj!/H》、苟養木桿菌(J^"/e〃(3^/^s礎'c^fl)、黃瓜(Cwcwmz,ssarivw"、C7z/oroyfexwsflwraf打A'acws、晶(]溶血虧瓜菌(W6n'opara/2aemo/y"cw"、或孔石蓴(Wva;em^a)，特別是來自銅綠假單胞菌、氧化亞鐵硫桿菌、戶/7wvmW/ww/am/"omw或孔石蓴。戶萬述分離的肽可以是SEQIDNO:l-17和22-23的部分。另外，SEQIDNO:1-17和22-23可以與所述肽具有至少約90%的胺基酸序列相同性。在一些實施方式中，分離的肽可以是銅氧還蛋白的截短形式。在具體的實施方式中，肽具有超過約10個殘基，但不超過約100個殘基。肽可以包括或者是由銅綠假單胞菌天青蛋白殘基96-113、銅綠假單胞菌天青蛋白殘基88-113、孔石蓴質體藍素殘基70-84、孔石蓴殘基57-98或SEQIDNO:22-30組成。在一些實施方式中，所述分離的肽包括與選自由銅綠假單胞菌天青蛋白殘基96-113、銅綠假單胞菌天青蛋白殘基88-113、孔石蓴質體藍素殘基70-84、孔石蓴殘基57-98或SEQIDNO:22-30組成的組目標銅氧還蛋白區域等同的對象銅氧還蛋白的殘基。本發明的另一個方面是包括存在於藥物組合物中的至少一個銅氧還蛋白或能抑制哺乳動物細胞或組織中癌症生長的銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物的組合物。在一些實施方式中，藥物組合物可以被配製成靜脈內施用。銅氧還蛋白是來自銅綠假單胞菌、氧化亞鐵硫桿菌、Phormidiumlaminosum、糞產鹼菌、氧化木糖無色桿菌、支氣管敗血性博德特菌、甲基單胞菌屬、腦膜炎奈瑟菌、淋病奈瑟菌、螢光假單胞菌、綠針假單胞菌、苛養木桿菌、黃瓜、Chloroflexusaurantiacus、副溶血弧菌、或孔石蓴，特別是來自銅綠假單胞菌、氧化亞鐵硫桿菌、Phormidhimlaminosum或孔石蓴。在一些實施方式中，銅氧還蛋白可以是SEQIDNO:1-17和22-23。本發明的另一個方面是治療患有與Ephrin信號傳導系統相關的病理性病變或患有癌症的哺乳動物患者的方法，包括給患者施用治療有效量的藥物組合物中的組合物，其包括至少一種銅氧還蛋白、或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物。在一些實施方式中，患者患有間質性膀胱炎(IC)、與炎性腸病(IBD)相關的病變、HIV感染、心血管病、中樞神經系統疾病、周圍血管病、病毒性疾病、中樞神經系統退行性變(ChristopherReeve病)或Alzheimer病。在其他實施方式中，患者患有癌症，例如乳腺癌、肝癌、胃腸道癌、神經母細胞瘤、神經系統癌症、白血病、淋巴瘤、前列腺癌、胰腺癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、子宮內膜癌、絨癌、畸胎瘤、甲狀腺癌、所有肉瘤包括源自軟組織和骨骼的肉瘤、腎癌、表皮樣癌或非小細胞肺癌。在一些實施方式中，患者是人。本發明的另一個實施方式是包括至少兩種分離的多肽的組合物，所述分離的多肽是銅氧還蛋白或能抑制哺乳動物細胞或組織中癌症生長的銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物。在一些實施方式中，組合物是藥物組合物的形式。本發明的另一個實施方式是試劑盒，其包括瓶裝的藥物組合物中的包括至少一種銅氧還蛋白、或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物。試劑盒可以被設計成靜脈內施用。本發明的另一個方面是方法，其包括用銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物接觸哺乳動物癌細胞；測定癌症細胞的生長。癌症細胞可以是乳腺癌、肝癌、胃腸道癌、神經母細胞瘤、神經系統癌症、白血病、淋巴瘤、前列腺癌、胰腺癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、子宮內膜癌、絨癌、畸胎瘤、甲狀腺癌、所有肉瘤包括源自軟組織和骨骼的肉瘤、腎癌、表皮樣癌或非小細胞肺癌。在一些實施方式中，癌細胞是體內的癌細胞。本發明的另一個方面是編碼能夠抑制哺乳動物細胞或組織中癌症生長的銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物的表達載體。本發明的另一個方面是分離的肽，其是銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物，以及其能結合Ephrin受體，例如EphAl、EphA2、EphA3、EphA4、EphA5、EphA6、EphA7、EphA8、EphAlO、EphBl、EphB2、EphB3、EphB4和EphB6。在一些實施方式中，肽也可以結合Ephrin，例如EphrinAl、EphrinA2、EphrinA3、EphrinA4、EphrinA5、EphrinBl、EphrinB2、EphrinB3和EphrinB4。在其他實施方式中，分離的肽結合Ephrin及其受體，特別是Ephrin2B和Eph2B。在一個相關部分，分離的肽是銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物，其可以結合Ephrin例如EphrinAl、EphrinA2、EphrinA3、EphrinA4、EphrinA5、EphrinB1、EphrinB2、EphrinB3禾口EphrinB4。本發明的另一個方面是方法，包括給哺乳動物患者施用含有至少一種銅氧還蛋白或本發明的肽的藥物組合物，以指導患者體內的血管生長。本發明的另一個方面是方法，包括給哺乳動物患者施用含有至少一種銅氧還蛋白或本發明的肽的藥物組合物，以減少患者體內的血管生長。本發明的另一個方面是方法，包括給哺乳動物患者施用含有至少一種銅氧還蛋白或本發明的肽的藥物組合物，以指導患者體內的神經元生長。本發明的另一個方面是方法，包括給哺乳動物患者施用含有至少一種銅氧還蛋白或本發明的肽的藥物組合物，以促進患者體內的骨生長。本發明的另一個方面是方法，包括給哺乳動物患者施用治療有效量的含有至少一種銅氧還蛋白或本發明的肽的藥物組合物，以取代需要使用Ephrin的治療方法中的Ephrin。本發明的另一個方面是方法，包括給哺乳動物細胞施用含有至少一種銅氧還蛋白或本發明的肽的藥物組合物，以抑制細胞相關的Ephrin受體的活性。本發明的另一個方面是方法，包括施用含有至少一種銅氧還蛋白或本發明的肽的藥物組合物，以增加細胞相關的Ephrin受體的活性。本發明的另一個方面是方法，包括給具有表達Ephrin受體的組織的人類患者施用含有至少一種銅氧還蛋白或本發明的肽的藥物組合物，所述本發明的肽包括Ephrin的衍生物或者與藥物融合的變體、衍生物或結構等價物。在一些實施方式中，表達Ephrin受體的組織是癌。本發明的另一個方面是撿測具有Ephrin受體的組織的方法，其步驟包括給人類患者施用包含與檢測探針融合的至少一種銅氧還蛋白或本發明的肽的藥物組合物，並檢測探針在患者體內的分布。通過下面的附圖和具體實施方式的說明，本發明的這些和其他方面、優點和特點將是顯而易見的。序列說明SEQIDNO:l:SEQIDNO:2:SEQIDNO:3:SEQIDNO:4:SEQIDNO:5:SEQIDNO:6:SEQIDNO:7:SEQIDNO:8:SEQIDNO:9:SEQIDNO:10SEQIDNO:llSEQIDNO:12SEQIDNO:13SEQIDNO:14銅綠假單胞菌天青蛋白的胺基酸序列。Phormidiumlaminosum質體藍素的胺基酸序列。氧化亞鐵硫桿菌Rusticyanin的胺基酸序列。Achromobactercycloclastes亍叚天青蛋白的胺基酸序列糞產鹼菌天青蛋白的胺基酸序列。氧化木糖無色桿菌天青蛋白的胺基酸序列。支氣管敗血性博德特菌天青蛋白的胺基酸序列。甲基單胞菌屬天青蛋白的胺基酸序列。腦膜炎奈瑟菌天青蛋白的胺基酸序列。淋病奈瑟菌天青蛋白的胺基酸序列。螢光假單胞菌天青蛋白的胺基酸序列。綠針假單胞菌天青蛋白的胺基酸序列。苛養木桿菌天青蛋白的胺基酸序列。黃瓜的漆樹花青甙(Stdlacyanin)的胺基酸序列。SEQIDNO:15SEQIDNO:16SEQIDNO:17SEQIDNO:18SEQIDNO:19SEQIDNO:20SEQIDNO:21SEQIDNO:22SEQIDNO:23SEQIDNO:24SEQIDNO:25SEQIDNO:26:SEQIDNO:27:SEQIDNO:28:SEQIDNO:29:SEQIDNO:30:SEQIDNO:31SEQIDNO:32SEQIDNO:33SEQIDNO:34Chloroflexusaurantiacus的AumcyaninA的氣基酸序歹廿。Chloroflexusaurantiacus的AuracyaninB的胺基酸序歹'J。黃瓜的黃瓜鹼性蛋白的胺基酸序列。銅綠假單胞菌天青蛋白的殘基96-113的18個殘基的天青蛋白肽的胺基酸序列。銅綠假單胞菌天青蛋白的殘基88-113的胺基酸序列。孔石蓴質體藍素的殘基70-84的胺基酸序列。副溶血弧菌天青蛋白的胺基酸序列。孔石蓴質體藍素的胺基酸序列。人EphrinB2胞外結構域的胺基酸序列。人EphrinB2的G-H袢區的胺基酸序列。與EphrinB2G-H袢區結構類似的銅綠假單胞菌天青蛋白區的胺基酸序列。與EphrinB2G-H袢區結構類似的氧化亞鐵硫桿菌(氧化亞鐵酸硫豐幹狀菌(」"W^/oZ^c/〃wjybroaxW""力)Rusticyanin區的胺基酸序列。與EphrinB2G-H袢區結構類似的Chloroflexusaurantiacus的AuracyaninB區的胺基酸序列。與EphrinB2G-H袢區結構類似的孔石蓴質體藍素區的胺基酸序列。與EphrinB2G-H袢區結構類似的黃瓜的黃瓜鹼性蛋白區的胺基酸序列。與EphrinB2G-H袢區結構類似的黃瓜漆樹花青甙區的胺基酸序列。人EphrinB2殘基69-138的胺基酸序列。孔石蓴質體藍素殘基57-98的胺基酸序列。人EphrinB2殘基68-138的胺基酸序列。銅綠假單胞菌天青蛋白殘基76-128的氮基酸序列。圖1:圖1描述了天青蛋白和EphrinB2的結構比對。用圖框顯示出了EphrinB-2的G-H拌(介導與EphB受體的高親和力相互作用的區域)。1JZG—A是銅綠假單胞菌天青蛋白的胺基酸序列(SEQIDNO.1)。1KGY_E是人EphrinB2胞外結構域的胺基酸序列(SEQIDNO:2)。圖2:圖2描述了銅氧還蛋白和EphrinB2的結構比對。圖框代表EphrinB2的涉及Eph受體結合的G-H拌(15個胺基酸)。用黑體和下劃線表示保守殘基。大寫字母是重疊位置。虛線是沒有對齊的地方。EphrinB2G-H袢區是SEQIDNO:24。與EphrkB2G-H袢區結構類似的銅綠假單胞菌天青蛋白區是SEQIDNO:25。與EphrinB2G-H袢區結構類似的氧化亞鐵硫桿菌(氧化亞鐵酸硫杆狀菌)Rusticyanin區是SEQIDNO:26。與EphrinB2G-H袢區結構類j以的Chloroflexusaurantiacus的Auracyanin區是SEQIDNO:27。與EphrinB2G-H袢區結構類似的Phormidiumlaminosum的質體藍素區是SEQIDNO:28。與EphrinB2G-H袢區結構類似的黃瓜的黃瓜鹼性蛋白區是SEQIDNO:29。與EphrinB2G-H袢區結構類似的黃瓜漆樹花青甙區是SEQIDNO:30。圖3:圖3描述了人EphrinB2胞外結構域(lkgy—E)、孔石蓴的質體藍素(liuz)、銅綠假單胞菌的天青蛋白(ljzg—A)和氧化亞鐵硫桿菌(氧化亞鐵酸硫杆狀菌)的Rusticyanin(lrcy)的結構之間的比較。在圖3A中，用TOPS動畫顯示出每個蛋白的拓撲學。TOP動畫將結構表示為二級結構元件(SSE)的序列卩鏈(用三角表示)和螺旋(a和310)(用圓圈表示)，它們如何按從氨基末端到羧基末端的序列相連接，以及它們的相對空間位置和定向。可以從連接線中推導出元件的方向。用朝上的三角表示"向上"的鏈，以及用朝下的三角表示"向下"的鏈。圖3B，用MolMol程序畫出的圖像(Koradietah，J.Mol.Graphics14:51-55(1996))。圖4:圖4描述了用於結合銅氧還蛋白和所結合的Eph-Fc的表面等離子共振Sensorgrams。顯示了天青蛋白(圖4A)、質體藍素(圖犯)、Rusticyanin(圖4C)和EphA-Fc和EphB-Fc蛋白的選擇性結合。圖5:圖5描述了源自全長天青蛋白(SEQIDNO:l)的各種截短形式的天青蛋白構建體的圖解說明。圖解了二級結構元件，用箭頭表示J3片以及用矩形表示螺旋(a和310)。編碼128個胺基酸天青蛋白的基因的各種片段與gst基因(編碼穀胱甘肽S-轉移酶)的3'末端骨架融合，並將其克隆於大腸桿菌中，如上所述的進行高表達並純化出融合蛋白(Yamadaetal.，CellMicro.7:1418-1431(2005))。圖6:圖6描述了在表面等離子共振研究中所測定出的天青蛋白和選擇性構建的GST-Azu融合蛋白與EphB2-Fc的相對結合親和力。在圖6A中，進行初篩選試驗，以便確定出天青蛋白或GST-Azu的相對結合強度，其中在將銅氧還蛋白(100nM)注射到EphB2-Fc修飾的CM5傳感器晶片上之後記錄下SPR蹤跡。值得注意的是，天青蛋白、GST-Azu88-113、和GST-Azu36-128與EphB2-Fc的結合比天然配體(EphrinB2-Fc)更強。圖6B顯示了，在滴定逐漸增加的銅氧還蛋白的濃度(0.05-100nM)之後，天青蛋白、GST-Azu88-113、EphrinB2-Fc、和GST-Azu36-89與固定化的EphB2-Fc的相互作用的結合親和力曲線。從單個Sensorgrams中推導出平衡共振信號(Req)，以構建出曲線。在將數據擬合於利用公式11叫=Rmax/(1+Kd/C)的Langmuir(1:1)結合模型之後，計算出結合解離常數(Kd)(表6)，連接滴定曲線上的數據點顯示出曲線。定量數據組與那些從最初結合篩選中獲得的數據相一致。圖7:圖7描述了在結合滴定和競爭檢測法中確定出的天青蛋白和GST-Azu與EphrinB2-Fc和EphB2-Fc的結合相互作用。在圖7A中，顯示了天青蛋白和GST-Azu與EphrinB2-Fc的相互作用的SPR結合曲線，如先前所述的那樣從中測定出結合親和力(Kd)。在圖7B中，用固定於CM5傳感器晶片上的EphB2-Fc進行的SPR結合競爭研究。圖8:圖8描述了經VAST算法計算出的包括孔石蓴的質體藍素的C末端(1IUZ)和銅綠假單胞菌的天青蛋白(1JZG一A)(分別為圖8A和圖8B)與人EphrinB2胞外結構域(1KGY—E)的結構比對。用黑體大寫字母表示重疊的二級結構元件。虛線和小寫字母表示此處沒有對齊。圖解了二級結構元件，用箭頭表示P片以及用空心矩形表示310螺旋。用星號表示相同的胺基酸。在EphrinB2序列中用暗灰色和淺灰色突出顯示的胺基酸分別表示參與EphrinB2和EphB2受體之間的相互作用和配體二聚體化的殘基(Hirnanenetal,Nature414:933-938(2001);Tothetal，Dev.Cell.1:83-92(2001))。用圖框標出並在每個比對的下面顯示了對應於EphrinB2的G-H袢區的質體藍素和天青蛋白肽(分別稱作Pic70-84(SEQIDNO:20)和Azu96-113(SEQIDNO:18))，其是介導Ephrin與Eph受體的高親和力結合的主要區域。在EphrinB2的胺基酸序列的上方，用粗箭頭標記出G和H袢區。分別可以在SEQIDNO:31和33中找到IKGY—E殘基69-138和68-138。在SEQIDNO:32中找到了1IUZ殘基57-98。在SEQIDNO:34中找到了1JZG_A殘基76-128。圖9:圖9描述了銅氧還蛋白肽對癌細胞活力的作用。在圖9A中，描述了天青蛋白(Azu96-113)和質體藍素(Pic70-84)合成肽對星形細胞瘤CCF-STTG1和成膠質細胞瘤LN-229癌細胞株的細胞活力的作用。在圖9B中，描述了不同濃度的質體藍素(Pic70-84)合成肽對黑色素瘤UISO-Mel-2細胞活力的作用。如實施例10所述的，用MTT測定法測定出細胞活力。用不同濃度的合成肽在37。C下處理癌細胞(96孔板，每孔2x104個細胞)24個小時。數據表示為與未處理的對照細胞(活力為100%)相比較的細胞活力百分比。在圖9C中，描述了Azu96-113合成肽對成膠質細胞瘤LN-229細胞的細胞毒活性。用MTT測定法測定出細胞毒作用。用不同濃度的Azu96-113(10、25、50、75、lOOfiM)在37°C下處理癌細胞(96孔板，每孔2x104個細胞)24個小時。數據表示為與未處理的對照細胞(細胞毒性為0%)相比較的細胞死亡百分比。圖10:描述了GST-Azu36-128和GST-Azu88-113對MCF-7細胞的細胞活力的作用。向含有每孔8x103個細胞的96孔板中加入漸增濃度(1.25、6.25和12.5pM)的GST-Azu肽，在37°C下孵育48個小時，隨後用MTT測定法分析。與GST-Azu36-128和GST-Azu88-113平行進行相同濃度的GST和GST-Azu36-89及未處理細胞的試驗，將其作為對照。發明詳述定義除非被特殊地描述為"單個細胞"，否則術語"細胞"在此包括單數或複數術語。術語"多肽"、"肽"、禾『蛋白"在此可以互換使用，其指的是胺基酸殘基的聚合物。該術語適用於其中一個或多個胺基酸殘基是相應天然存在胺基酸的人工化學類似物的胺基酸殘基的胺基酸聚合物。該術語也適用於天然存在胺基酸聚合物。術語"多肽"、"肽"、和"蛋白"也包含修飾，包括但不限於糖基化、脂質連接、硫酸化、穀氨酸殘基的Y羧化、羧化和ADP核糖基化。可以理解，多肽並非都是完全線性的。例如，由於泛素化的結果，多肽可以是分支的，並且它們可以是環形的(有或沒有分支)，一般都是翻譯後事件的結果，包括天然加工事件和不會天然發生的人工處理帶來的事件。通過非翻譯的天然過程以及通過完全合成方法都可以合成環形的、分支的和分支環形的多肽。此外，本發明預期了本發明的含甲硫氨酸和少甲硫氨酸的氨基末端變體的用途。術語"病理性病變，，在此包括不同於正常的解剖的和生理的偏差，其構成了對活體動物或其中一部分的正常狀態的損害，中斷或修飾了軀體功能的性能，並且是一種對各種因素(例如營養不良、工業危害或氣候)、對特殊感染原(例如蠕蟲、寄生原蟲、細菌或病毒)、對生物體的先天缺陷(例如遺傳學異常)或這些因素的組合的應答。術語"病變"在此包括不同於正常的解剖的和生理的偏差，其構成了對活體動物或其中一部分的正常狀態的損害，中斷或修飾了軀體功能的性能。術語"抑制細胞生長"在此表示減慢或停止細胞分裂和域細胞擴增。該術語也包括抑制細胞發育或增加細胞死亡。術語"患有"在此包括目前表現出病理性病變的症狀、具有甚至沒有可觀察到的症狀的病理性病變、處於病理性病變的恢復期以及已經從病理性病變中康復。術語"治療"在此包括阻止、減慢、終止或逆轉與所治療的病變相關的病變或症狀的進展或嚴重度。因此，在當的情況下，術語"治療"包括醫療性的、治療性的、和/或預防性的施用。"治療有效量"是能有效地阻止或減慢所治療對象的特殊病變的現有症狀的進展或部分或完全消除所述症狀的劑量。確定治療有效量是在本領域人員的能力範圍之內。術語"p53腫瘤抑制基因的表達缺陷"在此指的是其中p53腫瘤抑制基因為滅活的、突變的、缺失的或低產的細胞。例如，因為p53基因內的遺傳學異常或者由於表觀遺傳學原因例如腫瘤抑制基因上遊CG島中C殘基的高甲基化或者由於與病毒和細胞的癌基因的相互作用，可能發生這種缺陷。當用於修飾術語"銅氧還蛋白"時，術語"基本上純化的"在此指的是銅氧還蛋白，例如從生長培養基或細胞成分中分離出的銅氧還蛋白，其形式為基本上沒有或者沒有摻雜其他蛋白和/或活性抑制化合物。術語"基本上純化的"指的是，以乾重計，分離的部分的量的分數至少約為75%，或至少"75%基本上純化的"。更具體的，術語"基本上純化的"指的是量至少約為活性化合物乾重的85%或至少"85%基本上純化的"化合物。最具體的，術語"基本上純化的"指的是量至少約為活性化合物乾重的95%或至少"95%基本上純化的"化合物。所述基本上純化的銅氧還蛋白可以聯合一種或多種其他基本上純化的化合物或分離的銅氧還蛋白使用。短語"分離的"、"純化的"或"生物學純化的"指的是，一種物質基本上或實質上不含那些在天然狀態中通常伴隨著所述物質的組分。因此，本發明的分離的肽優選地不含在肽的原位環境中與肽正常相關的物質。"分離的"區指的是不含該區域所來源的多肽的整個序列的區域。"分離的"核酸、蛋白或其相應片段已經基本上從其體內環境中移出，使得其可以被本領域人員加工處理，例如但不限於核苷酸測序、限制性消化、定向誘變、和核酸片段被亞克隆到表達載體內、以及獲得基本上純化質量的蛋白或蛋白片段。當涉及到肽時，術語"變體"在此指的是胺基酸序列變體，其與野生型多肽相比較可以具有取代的、缺失的或插入的胺基酸。變體可以是野生型肽的截短形式。因此，通過加工編碼多肽的基因可以製備出變體肽。通過變更多肽的基本組成或特徵，但是不變更至少一些其基本活性，可以製備出變體。例如，天青蛋白的"變體"可以是突變的天青蛋白，其保留了抑制哺乳動物癌細胞生長的能力。在一些情況中，用非天然胺基酸例如s-(3，5-dinitrobenzoy1)-Lys殘基合成變體肽(Ghadiri&Fernholz,J.Am.Chem.Soc，112:9633-9635(1990))。在一些實施方式中，與野生型肽相比較，變體可以具有不超過20、19、18、17或16個取代的、缺失的或插入的胺基酸。在一些實施方式中，與野生型肽相比較，變體可以具有不超過15、14、13、12或11個取代的、缺失的或插入的胺基酸。在一些實施方式中，與野生型肽相比較，變體可以具有不超過10、9、8、或7個取代的、缺失的或插入的胺基酸。在一些實施方式中，與野生型肽相比較，變體可以具有不超過6個取代的、缺失的或插入的胺基酸。在一些實施方式中，與野生型肽相比較，變體可以具有不超過5或4個取代的、缺失的或插入的胺基酸。在一些實施方式中，與野生型肽相比較，變體可以具有不超過3、2、或1個取代的、缺失的或插入的胺基酸。術語"胺基酸"在此表示包括任一天然存在的或非天然存在的或合成的胺基酸殘基的胺基酸部分，即包括經1、2、3或更多個碳原子(通常是1個(a)碳原子)直接連接的至少一個羧基和至少一個氨基的任何部分。當涉及到肽時，術語"衍生物"在此指的是源自對象肽(subjectpeptide)的肽。衍生作用包括化學修飾肽，使得肽仍然保留一些其基本活性。例如，天青蛋白的"衍生物"可以是保留其抑制哺乳動物癌細胞生長的能力的化學修飾的天青蛋白。感興趣的化學修飾包括但不限於肽的醯胺化、乙醯化、硫酸化、聚乙二醇(PEG)修飾、磷酸化或糖基化。另外，衍生肽可以是多肽或其片段與化合物的融合，所述化合物是例如但不限於另一種肽、藥物分子或其他治療性或藥物試劑或可檢測探針。術語"胺基酸序列相同性百分比(％)"被定義為當兩個序列被比對時，多肽中與候選序列中的胺基酸殘基相同的胺基酸殘基的百分比。為了確定出胺基酸相同性％，比對序列，如果必要，則引入缺口，以便獲得最大的序列相同性％，保守取代不被認為是序列相同性的一部分。確定相同性百分比的胺基酸序列比對方法是本領域人員公知的。使用常常可公用的計算機軟體例如BLAST、BLAST2、ALIGN2或Megalign(DNASTAR)軟體比對肽序列。在一個具體的實施方式中，使用Blastp(來自國立生物技術信息中心，BethesdaMD)，其施用長複雜性濾器(longcomplexityfilter)的預設參數，預期(expect)10、字長(wordsize)3、存在(existence)11和延伸1。當比對胺基酸序列時，給定胺基酸序列A與或相對於給定胺基酸序列B的胺基酸序列相同性％(其或者可以表達為給定胺基酸序列A具有或包括與或相對於給定胺基酸序列B的特定的胺基酸序列相同性％)可以被計算為胺基酸序列相同性％=X/Y*100其中X是通過對A和B的序列比對程序或算法的比對被積分為相同的匹配的胺基酸殘基的數目；而Y是B中胺基酸殘基的總數。如果胺基酸序列A的長度與胺基酸序列B的序列不相等，那麼A與B的胺基酸序列相同性％將不等於B與A的胺基酸序列相同性％。當比較較長的序列與較短的序列時，較短的序列將是"B"序列。例如，當比較截短形式的肽與相應的野生型多肽時，截短形式的肽將是"B"序列。概述本發明的一些方面提供了使用具有與Ephrin相似結構的銅氧還蛋白來幹擾各種哺乳動物細胞和組織中的Ephrin信號傳導系統以及也抑制哺乳動物癌細胞生長的組合物和方法。具體地，本發明提供了使用銅氧還蛋白及其變體、衍生物、和結構等價物來幹擾Ephrin信號傳導系統以及也抑制體外和體內哺乳動物癌細胞的生長的組合物和方法。本發明人先前發現致病性微生物分泌一些ATP非依賴性細胞毒因子，例如氧化還原蛋白如銅綠假單胞菌的天青蛋白，且這些因子通過凋亡引起了J774細胞死亡，在癌細胞中尤為如此。也已知天青蛋白具有一從胺基酸殘基50到77的結構域，其促進了蛋白有限進入到癌細胞內，誘導細胞毒性。令人驚訝的是，本發明人現在已經發現天青蛋白和其他銅氧還蛋白中所見的C末端結構域顯示出了與Ephrin相似的結構。見實施例2、5和9。現在也已知天青蛋白和質體藍素以及這些肽的特殊區域是與EphrinG-H袢結構同源的，按1:1比例競爭性地結合Ephrin受體。見實施例6-8。具體地，銅綠假單胞菌天青蛋白與Ephrin受體EphB2和EphA6結合。見實施例6。Phormidiumlaminosum質體藍素顯示出結合Ephrin受體EphAl、A3和B2的特異性以及更低程度的結合Ephrin受體EphA2和A6的特異性。見實施例6。最後，Rusticyanin表現出與Ephrin受體EphA8和B1的弱結合力。見實施例6。現在也已知含有與EphrinG-H袢區結構同源的天青蛋白區胺基酸殘基88-113與Ephrin受體EphB2結合。見實施例7。最後，現在已知天青蛋白和天青蛋白的88-113區結合EphrinB2和Ephrin受體EphB2，以及能夠與EphrinB2競爭性結合其受體EphB2。見實施例8。本發明人也已經發現具有與EphrinG-H袢區結構相似區域的銅氧還蛋白在體外抑制了哺乳動物癌細胞的生長。總而言之，Phormidiumlaminosum的質體藍素、氧化亞鐵硫桿菌的Rusticyanin和銅綠假單胞菌天青蛋白在臺盼藍測定法中都抑制了Md-2人黑色素瘤細胞和MCF-7人乳腺癌細胞的體外生長。見實施例4。另夕卜，現在已知天青蛋白的88-113殘基區能夠抑制MCF-7乳腺癌細胞的細胞生長。見實施例IO。最後，現在己知對應於與EphrinB2G-H袢區的結構相似的區域的18聚體天青蛋白肽和15聚體孔石蓴質體藍素肽能夠在體外抑制MCF-7人乳腺癌細胞、CCF-STTG1腦瘤星狀細胞瘤細胞和LN-229成膠質細胞瘤的生長。見實施例3和9。令人驚訝的是，與EphrinB2的G-H袢結構相似的銅氧還蛋白也能在體內影響Ephrin相關發育。現在從秀麗隱杆線蟲(C.degans)的Ephrin相關發育的體內研究中得知，銅氧還蛋白Rusticyanin幹擾了尾部肌肉形成，而銅氧還蛋白天青蛋白阻止了胚胎發育，兩者都是Ephrin相關發育。見實施例1。現在已經明白，除了天青蛋白外，銅氧還蛋白Rusticyanin和質體藍素也與EphrinB2的G和H區共享結構同源性。見實施例2和5。此外，已知天青蛋白和Phytocyanin漆樹花青甙和黃瓜鹼性蛋白與Ephrin共享顯著的結構同源性。因為銅氧還蛋白蛋白家族中的普遍的結構保守性，預計許多其他的銅氧還蛋白和銅氧還蛋白樣蛋白也會顯示出與Ephrin的顯著的結構同源性。見實施例2。因此，提出了利用本發明的組合物和方法，銅氧還蛋白家族蛋白一般都可以用於治療Ephrin信號傳導相關性病變和癌症。相關的特殊銅氧還蛋白包括但不限於天青蛋白、Rusticyanin、質體藍素、漆樹花青甙、Auracyanin、假天青蛋白和黃瓜鹼性蛋白。示例蛋白序列在此為質體藍素(SEQIDNO:2和22)、Rusticyanin(SEQIDNO:3)、假天青蛋白(SEQIDNO:4)、漆樹花青甙(SEQIDNO:14)、Auracyanin(SEQIDNO:15和16)、和黃瓜鹼性蛋白(SEQIDNO:17)。術語"銅氧還蛋白"在此指的是銅氧還蛋白蛋白家族的任一成員，包括銅氧還蛋白樣蛋白例如奈瑟菌的Laz。天青蛋白是特別特異的，這些銅氧還蛋白的示例蛋白序列是但不限於從銅綠假單胞菌(SEQIDN0:1)、糞產鹼菌(SEQIDN0:5)、氧化木糖無色桿菌的denitrificansI(SEQIDNO:6)、支氣管敗血性博德特菌(SEQIDNO:7)、甲基單胞菌屬J(SEQIDNO:8)、腦膜炎奈瑟菌(SEQIDNO:9)、淋病奈瑟菌(SEQIDNO:IO)、螢光假單胞菌(SEQIDNO:ll)、綠針假單胞菌(SEQIDNO:12)、苛養木桿菌9a5c(SEQIDNO:13)和副溶血弧菌(SEQIDNO:21)分離到的那些蛋白序列。在最具體的實施方式中，天青蛋白來自銅綠假單胞菌。在其他具體的實施方式中，銅氧還蛋白是質體藍素(SEQIDNO:2和22)、Rusticyanin(SEQIDNO:3)、假天青蛋白(SEQIDNO:4)、漆樹花青武(SEQIDNO:14)、Auracyanin(SEQIDNO:15和16)、以及黃瓜鹼性蛋白(SEQIDNO:17)。在一些實施方式中，銅氧還蛋白具有希臘花邊P桶結構。希臘花邊P桶結構是公知的蛋白摺疊。見例如，Zhang&Kim(Proteins40:409-419(2000))。因為該模式在希臘陶瓷中常見，所以被稱作希臘花邊拓撲學。其具有3個經髮夾結構連接的上和下p鏈，緊接著的是更長的與第4個(3鏈的連接，其位於第1個P鏈的鄰近位置。在一個具體實施方式中，銅氧還蛋白和銅氧還蛋白的變體、衍生物及結構等價物包括至少一個希臘花邊p桶結構。在另一個實施方式中，銅氧還蛋白和銅氧還蛋白的變體、衍生物及結構等價物包括一個至少4個p鏈的希臘花邊結構。在另一個更具體的實施方式中，銅氧還蛋白和銅氧還蛋白的變體、衍生物及結構等價物包括至少8個P鏈的希臘花邊結構。在另一個具體的實施方式中，銅氧還蛋白和銅氧還蛋白的變體、衍生物及結構等價物包括一個以上的希臘花邊P桶結構。本發明的組合物本發明提供了作為銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物的肽。在一些實施方式中，肽是基本上純化的。在其他實施方式中，肽位於包括或基本上由肽組成的組合物中。在其他實施方式中，肽是分離的。在一些實施方式中，肽比全長銅氧還蛋白短，其保留了銅氧還蛋白的一些功能特徵。在一些實施方式中，肽保留了幹擾哺乳動物細胞和組織中Ephrin信號傳導和/或抑制哺乳動物癌細胞生長的能力。在另一個具體的實施方式中，肽不會引起哺乳動物的免疫應答，更具體的是人的免疫應答。本發明也提供了包括至少一個、至少2個或至少三個銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物及結構等價物的組合物。本發明也提供了包括存在於藥物組合物中的至少一個、至少2個或至少三個銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物及結構等價物的組合物。因為銅氧還蛋白之間的高度結構同源性，預期家族中其他銅氧還蛋白也能夠幹擾Ephrin信號傳導，並特異地抑制哺乳動物細胞和組織中癌症的生長。在一些實施方式中，銅氧還蛋白是但不限於天青蛋白、假天青蛋白、質體藍素、假天青蛋白、Rusticyanin或Auracyanin。在一些特別具體的實施方式中，天青蛋白源自銅綠假單胞菌、糞產鹼菌、氧化木糖無色桿菌的denitriflcansI、支氣管敗血性博德特菌、甲基單胞菌屬、腦膜炎奈瑟菌、淋病奈瑟菌、螢光假單胞菌、綠針假單胞菌、苛養木桿菌9a5或副溶血弧菌。在非常具體的實施方式中，天青蛋白來自銅綠假單胞菌。在其他具體的實施方式中，銅氧還蛋白是質體藍素，更具體的是來自Phormidiumlaminosum或孔石蓴的質體藍素。在其他具體的實施方式中，銅氧還蛋白是Rusticyanin，更具體的是源自氧化亞鐵硫桿菌的Rusticyanin。在其他具體的實施方式中，銅氧還蛋白包括胺基酸序列SEQIDNO:l-17、21-22。本發明提供了銅氧還蛋白的胺基酸序列變體，其與野生型多肽相比具有取代的、缺失的或插入的胺基酸。本發明的變體可以是野生型多肽的截短形式。多肽的"截短形式"在此是去除多肽序列的至少一個末端的至少一個胺基酸殘基所形成的肽。在一些實施方式中，截短形式的肽是總共至少去除了多肽序列的一端或兩端的至少1個胺基酸殘基、至少5個胺基酸殘基、至少10個胺基酸殘基、至少50個胺基酸殘基或約100個胺基酸殘基所形成的肽。在一些實施方式中，組合物包括由小於全長野生型多肽的銅氧還蛋白區域組成的肽。在一些實施方式中，組合物包括由截短形式的肽的超過約10個殘基、超過約15個殘基或超過約20個殘基組成的肽。在一些實施方式中，組合物包括由截短形式的肽的不超過約100個殘基、不超過約50個殘基、不超過約40個殘基或不超過約30個殘基組成的肽。在一些實施方式中，變體是與銅氧還蛋白以及具體地是與SEQIDNO:l-17、21-22具有至少約90%胺基酸序列相同性、至少約95%胺基酸序列相同性或至少約99%胺基酸序列相同性的肽。在具體的實施方式中，銅氧還蛋白的變體包括銅綠假單胞菌天青蛋白殘基96-113(SEQIDNO:18)、88-113(SEQIDNO:19)或SEQIDNO:25。在其他的實施方式中，銅氧還蛋白的變體是由銅綠假單胞菌天青蛋白殘基96-113(SEQIDNO:18)、88-113(SEQIDNO:19)或SEQIDNO:25組成的。在其他具體的實施方式中，銅氧還蛋白的變體包括孔石蓴殘基70-84(SEQIDNO:20)、孔石蓴殘基57-98(SEQIDNO:32)、或孔石蓴序列SEQIDNO:28。在其他具體的實施方式中，銅氧還蛋白的變體是由孔石蓴殘基70-84(SEQIDNO:20)、孔石蓴殘基57-98(SEQIDNO:32)、或孔石蓴序列SEQIDNO:28組成的。在其他具體的實施方式中，銅氧還蛋白的變體包括氧化亞鐵硫桿菌Rusticyanin序列SEQIDNO:26、Chloroflexusaumntiacus的Auracyanin(SEQIDNO:27)、黃瓜序列SEQIDNO:29和30。在其他具體的實施方式中，銅氧還蛋白的變體是由氧化亞鐵硫桿菌Rusticyanin序列SEQIDNO:26、Chloroflexusaurantiacus的Auracyanin(SEQIDNO:27)、黃瓜序列SEQIDNO:29和30組成的。在其他具體的實施方式中，變體是由來自其他銅氧還蛋白的上述截短形式序列的等同殘基組成的。也提出了，可以設計出具有與上面所提及的任一變體相似活性的其他銅氧還蛋白變體。為此，用BLAST、BLAST2、ALIGN2或Megalign(DNASTAR)、位於目標銅氧還蛋白序列上的截短形式變體的相關殘基、和對象銅氧還蛋白序列上可見的等同殘基以及因此設計出的等同截短形式變體來比對對象銅氧還蛋白胺基酸序列和目標銅氧還蛋白序列例如那些含有上面的截短形式變體的序列。變體也包含有非天然存在的合成胺基酸製成的肽。例如，非天然存在的胺基酸可以被整合到變體肽內，以便延伸或優化組合物在血流中的半衰期。這些變體包括但不限於D，L-肽(非對映體)(Futakietal，J.Biol.Chem.276(8):5836-40(2001);Papoetal,CancerRes.64(16):5779-86(2004);Milleretal，Biochem.Pharmacol.36(1):169-76,(1987))、含有罕見胺基酸的肽(Leeetal.,J.Pept.Res.63(2):69-84(2004))、和含烯烴的非天然胺基酸繼以碳氫化合物鎖環(stapling)(Schafmeisteretal,J.Am.Chem.Soc.122:5891-5892(2000);Walenskietah,Science305:1466-1470(2004))、以及包括s-(3，5-dinitrobenzoyl)-Lys殘基的肽。在其他實施方式中，本發明的肽是銅氧還蛋白的衍生物。銅氧還蛋白的衍生物是所述肽的化學修飾形式，使得肽仍然保留一些其基本活性。例如天青蛋白的"衍生物"可以是化學修飾的天青蛋白，其保留了其幹擾Ephrin信號傳導以及特異地抑制哺乳動物細胞和組織中癌症生長的能力。感興趣的化學修飾包括但不限於，肽的醯胺化、乙醯化、硫酸化、聚乙二醇(PEG)修飾、磷酸化和糖基化。另外，衍生肽可以是銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物與化合物的融合體，所述化合物是例如但不限於另一個肽、藥物分子或其他治療性或藥物用試劑或可檢測探針。感興趣的衍生物包括通過其可以延長或優化本發明的肽和組合物在血流中的半衰期的化學修飾，例如通過一些本領域人員公知的方法，包括但不限於環lt月太(Circularizedpeptide)(Monketal，BioDrugs19(4):261-78,(2005);DeFreestetal,J.Pept.Res.63(5):409-19(2004))、N-和C-末端修飾(Labrieetal,Clin.Invest.Med.13(5):275-8，(1990))、和含烯烴的非天然胺基酸繼以碳氫化合物鎖環(Schafineisteretal.,J.Am.Chem.Soc.122:5891-5892(2000);Walenskietal.，Science305:1466-1470(2004》。預期本發明的肽可以是銅氧還蛋白的變體、衍生物和/或結構等價物。例如，肽可以是已經被PEG化的天青蛋白的截短形式，因此使得其同時既是變體又是衍生物。在一個實施方式中，用含有帶烯烴的系鏈(tether)的oc，a雙取代的非天然胺基酸來合成本發明的肽，以及隨後通過釕催化的烯烴易位作用形成全碳氫化合物"鎖環"(Scharmeisteretal，J.Am.Chem.Soc.122:5891-5892(2000);Walenskyetal，Science305:1466-1470(2004))。另外，作為天青蛋白的結構等價物的肽可以與其他肽融合，因此製備出同時是結構等價物和衍生物的肽。這些實施例只是為了說明本發明，而不是限制本發明。銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物可以結合或可以不結合銅。在另一個實施方式中，肽是銅氧還蛋白的結構等價物。確定出銅氧還蛋白和其他肽之間的顯著的結構同源性的研究實例包括Tothetal.(DevelopmentalCell1:82-92(2001))。具體地，通過使用VAST算法確定出銅氧還蛋白和結構等價物之間的顯著的結構同源性(Gibratetal，CurrOpinStructBiol6:377-385(1996);Madejetal，Proteins23:356-3690(1995))。在具體的實施方式中，來自銅氧還蛋白與結構等價物的結構比較的VASTp值小於約10—3、小於約10—5、小於約10'7。在其他實施方式中，通過使用DALI算法確定出銅氧還蛋白和結構等價物之間的顯著的結構同源性(Holm&Sander,J.Mol.Biol.233:123-138(1993》。在具體的實施方式中，配對結構比較的DALIZ積分是至少約3.5、至少約7.0、或至少約10.0。在實施例2和9中可找到這些確定方法的實例。在一些實施方式中，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物具有銅綠假單胞菌天青蛋白、孔石蓴質體藍素、Phormidiumlaminosum質體藍素或氧化亞鐵硫桿菌Rusticyanin的一些功能特徵。在一個具體的實施方式中，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物抑制幹擾了Ephrin信號傳導系統，和/或抑制了哺乳動物細胞和組織中癌症的生長。對哺乳動物癌細胞或組織生長的抑制可能與銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物對Ephrin信號傳導系統的任何幹擾有關或無關。確定銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物是否幹擾Ephrin信號傳導的方法是本領域公知的，包括確定銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物是否與Ephrin信號傳導途徑的組分結合，例如但不限於Ephrin和/或Ephrin受體。Ephrin信號傳導系統廣義上包含Ephrin和相關的Ephrin受體、和向後及向前傳送信號所需的任何分子(或"組分")。狹義上說，Ephrin信號傳動系統只包括Ephrin和負責信號傳導的相關Ephrin受體。當在Ephrin信號傳導系統的上下文中使用時，術語"幹擾"可以造成相關的Ephrin信號傳導("向前"和"向後"方向中的一種或兩種)的增加或減少。測定對Ephrin信號傳導系統的幹擾的方法是本領域公知的。確定對Ephrin信號傳導的幹擾的一種方法是肽與Ephrin或Ephrin受體或Ephrin信號傳導系統的其他組分的結合或競爭，如實施例6-8所示。可以使用體內系統例如秀麗隱杆線蟲，其中已知銅氧還蛋白能干擾Ephrin信號傳導，並變更了尾部肌肉形成和胚胎孵育，如實施例1所示。其他方法包括但不限於Himanen等(Nat.Neurosci,7:501-509(2004))和Koolpe等(J.Biol.Chem.280:17301-17311(2005))中的Eph受體磷酸化檢測法。因為現在已知銅氧還蛋白及銅氧還蛋白的變體可以幹擾Ephrin信號傳導並抑制哺乳動物細胞和組織中癌症的生長，因此現在可以設計出保留這種功能的銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物。通過例如利用本領域已知的多種方法中的一種方法生成銅氧還蛋白的各種變體、衍生物和結構等價物的"文庫"，然後測試每種物質的抗癌活性就可以製備出這種變體、衍生物和結構等價物，例如採用實施例3、9和10中的示例方法。預期所形成的具有抗癌活性的銅氧還蛋白的變體、衍生物和結構等價物可以被用於本發明的方法，以替代銅氧還蛋白或與其共同使用。在其他的實施方式中，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物可以與Ephrin具有顯著的結構同源性。在一個具體的實施方式中，銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體和衍生物具有Ephrin的G-H袢區周圍的顯著的結構同源性。確定出銅氧還蛋白和Ephrin之間的顯著的結構同源性的研究實例包括Tothetal.(DevelopmentalCell1:82-92(2001))和本申請的實施例2。具體地，通過使用VAST算法確定出銅氧還蛋白和Ephrin之間的顯著的結構同源性(Gibratetal,CurrOpinStructBiol6:377-385(1996);Madejetal，Proteins23:356-3690(1995))。在具體的實施方式中，來自銅氧還蛋白與Ephrin的結構比較的VASTp值小於約l(T3、小於約10—5、小於約10—7。在其他實施方式中，通過使用DALI算法確定出銅氧還蛋白和Ephrin之間的顯著的結構同源性(Holm&Sander,J.Mol.Biol.233:123-138(1993))。在具體的實施方式中，配對結構比較的DALIZ積分是至少約3.5、至少約7.0、或至少約10.0。在另一個實施方式中，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物與Ephrin和/或Eph受體結合。現在已知一些銅氧還蛋白具有與EphrinB2胞外結構域結構相似的C末端區。見實施例2、5和9。在一個具體的實施方式中，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物與Ephrin結合。在一個特別具體的實施方式中，Ephrin是但不限於EphrinAl、EphrinA2、EphrinA3、EphrinA4、EphrinA5、EphrinB1、EphrinB2、EphrinB3禾口EphrinB4。在一個特別優選的實施方式中，Ephrin是但不限於EphrinBl、EphrinB2、EphrinB3和EphrinB4。在另一個具體的實施方式中，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物與Eph受體結合。在特別具體的實施方式中，Eph受體是但不限於EphAl、EphA2、EphA3、EphA4、EphA5、EphA6、EphA7、EphA8、EphA10、EphBl、EphB2、EphB3、EphB4禾卩EphB6。在一些實施方式中，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物既與Ephrin又與Ephrin受體結合。在一些實施方式中，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物與Ephrin及其受體(特別是EphrinB2及EphB2)結合。用於確定蛋白與其他蛋白結合的方法是本領域公知的。確定與Eph受體結合的方法實例包括實施例6-8以及Koolpe等(J.Biol.Chem.280:17301-17311(2005))和Himanen等(Nat.Neurosci.7:501-509(2004》。在一些具體的實施方式中，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物誘導了哺乳動物癌細胞(更具體的是J774細胞)的凋亡。通過利用MITOSENSORTMAPOLERT線粒體膜傳感器試劑盒(ClontechLaboratories,Inc.,PaloAlto,California,U.S.A.)的MitosensorApoAlert共聚焦顯微鏡，通過用Zou等(J.Biol.Chem.274:11549-11556(1999))所述的方法測定caspase-8、caspase-9和caspase-3活性、以及通過利用例如APOLERTDNA片段化試劑盒(ClontechLaboratories,Inc.,PaloAlto,California,U.S.A.)檢測凋亡誘導的核DNA片段化可以觀察到銅氧還蛋白或其他多肽誘導凋亡的能力。在另一個具體的實施方式中，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物誘導哺乳動物癌細胞(更具體的是J774細胞)的細胞生長停滯。通過例如用Yamada等(PNAS101:4770-4775(2004))所述的方法測定對細胞周期進程的抑制程度可以確定出細胞生長停滯。在另一個具體的實施方式中，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物抑制了哺乳動物癌細胞(更具體的是J774細胞)的細胞周期進程。銅氧還蛋白類這些小的藍銅蛋白(銅氧還蛋白)是參與細菌電子傳遞鏈的電子傳遞蛋白(10-20kDa)或者是未知功能的蛋白。銅離子獨自被蛋白基質所結合。銅周圍的兩個組氨酸和一個半胱氨酸配體的特殊變形的三角平面排列給出了金屬位點的非常奇特的電子性能和強烈的藍色。已經中到高解析度地結晶學表徵出了大量的銅氧還蛋白。銅氧還蛋白一般都具有低的序列同源性，但是具有高的結構同源性(Gough&Clothia,Structure12:917-925(2004);DeRienzoetal"ProteinScience9:1439-1454(2000))。例如，天青蛋白的胺基酸序列與AuracyaninB的胺基酸序列有著31%的相同性，與質體藍素的胺基酸序列有著20.3%的相同性，以及與假天青蛋白的胺基酸序列有著17.3%的相同性。見表1。但是，這些蛋白的結構相似性是更加顯著的。天青蛋白和AuracyaninB的結構比較的VASTp值是l(T74，天青蛋白和Rusticyanin是l(T5，天青蛋白和質體藍素是10—56，以及天青蛋白和假天青蛋白是10—41。所有的銅氧還蛋白都具有8鏈的希臘花邊P桶或P三明治摺疊以及具有高度保守的位點結構(DeRienzoetal,ProteinScience9:1439-1454(2000))。在天青蛋白類、Amicyanin類、籃細菌質體藍素類、黃瓜鹼性蛋白的銅位點周圍存在著由於存在多個長鏈脂肪族殘基例如甲硫氨酸和亮氨酸所形成的明顯的疏水性補片(hydrophobicpatch),假天青蛋白和真核質體藍素類也有較小程度的疏水性補片。在漆樹花青甙和Rusticyanin銅位點出也能找到較小程度的疏水性補片，但具有不同的性能。表l:利用VAST算法對銅綠假單胞菌天青蛋白(1JZG)和其他蛋白的序列和結構比對。complextableseeoriginaldocumentpage34'比對長度兩個結構之間重疊的等價的C-(X原子對數目，即多少殘基已經被用於計算3D重疊。2P-VAL:VASTp值是比較顯著性的測量值，表示可能性。例如，如果p值是0.001，那麼通過純偶然機會看到這種質量的配對的機率是1000:1。對於多個比較的效果，利用假定即在MMDB資料庫中有500個獨立的和無關類型的結構域來調整VASTp值。所示的p值因此對應於每個結構域對的配對比較的p值除以500。3積分VAST結構相似性積分。該數字與重疊的二級結構元件的數目以及這種重疊的質量相關。更高的VAST積分有著更高的相似性。4RMSD:根均方根重疊殘基(埃)。在兩個結構的優化重疊之後，用等價C-a原子之間的方差距離的平方根計算出該數值。注意RMSD數值刻度與結構比對的程度有關，當用RMSD作為總體結構相似性的描述指標時，必須要考慮到這個尺寸。5秀麗隱杆線蟲證實是卵母細胞成熟中的Ephrin拮抗劑的主要精子蛋白(Kuwabara，2003"ThemultifacetedC.elegansmajorspermprotein:anEphrinsignallingantagonistinoocytematuration"GenesandDevelopment,17:155-161)。天青蛋白天青蛋白是128個胺基酸殘基的含銅蛋白，其屬於參與特定細菌的電子傳遞的銅氧還蛋白家族。天青蛋白包括那些來自銅綠假單胞菌(PA)(SEQIDNO:l)、氧化木糖無色桿菌、禾卩A.Denitrificans(Murphyetah,J.MoI.Biol.315:859-871(2002))的天青蛋白。天青蛋白之間的胺基酸序列相同性變化在60-90%之間，這些蛋白顯示出了強的結構同源性。所有的天青蛋白都具有特徵性的P-三明治和希臘花邊基序，以及單個銅原子始終都位於蛋白的相同區域。另外，天青蛋白具有圍繞在銅位點周圍的基本中性的疏水性補片。質體藍素類質體藍素是藍細菌(cyanobacteria)、藻類和植物的可溶性蛋白，其每個分子含有1分子銅，其氧化形式為藍色。它們存在於葉綠體中，其中它們作用為電子載體。自從1978年確定出白楊質體藍素類的結構之後，用結晶學或NMR方法已經確定出了藻類(Scenedesmus、Enteromorpha、Chkmydomonas)和植物(菜豆)質體藍素類的結構，以及白楊的結構已經被精細到1.33A解析度。SEQIDN0:2顯示了Phormidiumlaminosum(一種嗜熱藍細菌)的胺基酸序列。SEQIDNO:22顯示了孔石蓴的質體藍素類的胺基酸序列。儘管藻類和脈管植物之間的序列趨異性(例如衣滴蟲目和白楊植物之間的序列相同性為62%)，但是三維結構是保守的(例如，衣滴蟲目和白楊植物之間的Ca位點的偏差為0.76A)。結構特徵包括8鏈反向平行卩桶的一個末端上的變形的四面體銅結合位點、明顯負性補片和平坦的疏水性表面。優化了銅位點的電子轉移功能，負性和疏水性補片被認為參與了生理反應伴侶的識別。化學修飾、交聯和定點誘變試驗已經驗證了負性和疏水性補片在與細胞色素f的結合相互反應中的重要性，並確認了涉及質體藍素類的兩個功能顯著的電子轉移途徑的模型。一個推定的電子轉移途徑是相對短的(近4A)並涉及疏水性補片上的溶劑暴露的銅配體His-87，而另一個途徑則更長(近12-15A)，並涉及負性補片中的近保守殘基Tyr誦83(Redinboetal,J.Bioenerg.Biomembr.26:49-66(1994))。Rusticyanin類Rusticyanin是從硫桿菌(現在稱作酸硫杆狀菌(Acid他iobacillus))中獲得的含藍銅的單鏈多肽。用多波長異常衍射已經確定出了來自氧化亞鐵硫桿菌的極為穩定的和高度氧化的銅氧還蛋白Rusticyanin的氧化形式的X射線晶體結構，並將其精細到了1.9A解析度。Rusticyanin是由核心p三明治摺疊(由6鏈和7鏈的(3片組成)組成的。與其他銅氧還蛋白相似，銅離子與一簇按變形四面體排列的四個保守殘基(His85、Cysl38、Hisl43、Metl48)配位(Walteretal,J.Mol.Biol.263:730-51(1996》。假天青蛋白類假天青蛋白是含藍銅的單鏈多肽家族。來自Achromobactercycloclastes的假天青蛋白的胺基酸序列如SEQIDNO:4所示。對假天青蛋白的X射線結構分析發現其具有與天青蛋白相似的結構，儘管這些蛋白之間只有低的序列同源性。假天青蛋白和天青蛋白的總體結構之間存在著兩個主要差異。一個是假天青蛋白相對於天青蛋白的包括兩個a螺旋的羧基末端延伸。在肽中間區域，天青蛋白含有延伸環，而假天青蛋白有所縮短，其形成了含有短a螺旋的瓣(flap)。銅原子位點的唯一的主要差別是MET側鏈的構型以及Met-S銅鍵長度，其在天青蛋白中要比假天青蛋白明顯更短。Phytocyanin類被鑑定為Phytocyanin的蛋白包括但不限於黃瓜鹼性蛋白、漆樹藍蛋白、Mavicyanin、Umecyanin、黃瓜皮銅氧還蛋白(cucumberpeelingcupredoxin)、豌豆莢內的推定的藍銅蛋白、和來自擬南芥的藍銅蛋白。在除了黃瓜鹼性蛋白和豌豆莢蛋白外的所有這些蛋白中，正常情況下位於藍銅蛋白位點的中軸(axial)甲硫氨酸配體被穀氨酸取代。Auracyanin已經從嗜熱的綠色光合作用細菌Chloroflexusaurantiacus中分離出被禾爾作AuracyaninA、AuracyaninB-l、禾BAuracyaninB-2的三個小的藍銅蛋白。兩個B形式是糖蛋白，其彼此具有幾乎相同的性能，但是不同於A形式。十二垸基硫酸鈉-聚丙烯醯胺凝膠電泳發現表觀單體分子量為14(A)、18(B-2)、和22(B畫l)kDa。已經確定出AuracyaninA的胺基酸序列，並顯示出AuracyaninA是139殘基的多月太(VanDreisscheetal;.ProteinScience8:947-957(1999))。按預期的空間安置His58、Cysl23、Hisl28、和Metl32，只要它們是已知小銅蛋白質體藍素類和天青蛋白中的進化保守的金屬配體，二級結構預測也表明Auracyanin具有普遍的與銅綠假單胞菌的天青蛋白和白楊葉的質體藍素類相似的13桶結構。但是，Auracyanin表現出兩種小銅蛋白序列組的序列特徵。與天青蛋白的共有序列的總體相似性和與質體藍素的共有序列的總體相似性大致相同，約為30.5%。Auracyanin的N末端序列區l-18特別富含甘氨酸和羥基胺基酸。見來自Chloroflexusaurantiacus的AuracyaninA鏈的示例胺基酸序列SEQIDNO:15(NCBI蛋白資料庫編號No.AAM12874)。AuracyaninB分子具有標準的銅氧還蛋白摺疊。己經研究了來自Chloroflexusaurantiacus的AuracyaninB的晶體結構(Bondetal，J.Mol.Biol.306:47-67(2001);在此通過引用將其全部內容併入本申請)。除了附加的N末端鏈外，分子與細菌銅氧還蛋白天青蛋白的結構非常相似。與其他銅氧還蛋白一樣，一個Cu配體位於多肽的鏈4上，而其他3個配體位於鏈7和8之間的大環上。參照後面3個配體的胺基酸空間位置討論了Cu位點幾何位置。通過表現出與一些其他膜相關的電子傳遞蛋白中己知的系鏈顯著的序列相同性的N末端尾部可能將結晶學表徵的AuracyaninB的Cu結合區繫到細胞膜的胞漿側。McManus等(JBiolChem.267:6531-6540C1992))給出了B形式的胺基酸序列。見來自Chloroflexusaurantiacus的Auracyanin的B鏈的示例胺基酸序列SEQIDNO:16(NCBI蛋白資料庫編號No.IQHQA)。漆樹花青甙漆樹花青甙是Phytocyanin(植物銅氧還蛋白的遍在家族)的一個亞型。SEQIDNO:14給出了漆樹花青甙的一個示例序列。也己知了Umecyanin(—種來自辣根的漆樹花青甙)(Kochetal,J.Am.Chem.Soc.127:158-166(2005))和黃瓜漆樹花青甙(Hartelal，ProteinScience5:2175-2183(1996))的晶體結構。蛋白具有與其他Phytocyanin相似的所有摺疊。EphrinB2蛋白胞外結構域四級結構與漆樹花青甙具有顯著的相似性(Tothetal，DevelopmentalCell1:83-92(2001))。在國立生物技術信息中心蛋白資料庫中可以找到編號為No.1JER的漆樹花青甙的示例胺基酸序列SEQIDNO:14。黃瓜鹼性蛋白SEQIDNO:17給出了黃瓜鹼性蛋白的示例胺基酸序列。黃瓜鹼性蛋白(CBP)是一種l型藍銅蛋白，其晶體結構已經被精細到了1.8A解析度。分子類似於其他具有希臘花邊J3桶結構的藍銅蛋白，不同之處是桶的一側是開放的，且被更好地稱作"(3三明治"或"卩-taco"(Gussetal.,J.Mol.Biol.262:686-705(1996))。EphrinB2蛋白胞外結構域四級結構與黃瓜鹼性蛋白具有高度的相似性(50a碳的rms偏差為1,5A)(Tothetal，DevelopmentalCell1:83-92(2001))。Cu原子具有正常的藍銅NNSS'配位，鍵長為Cu-N(His39)=1.93A、Cu-S(Cys79)=2.16A、Cu-N(His84)=1.95A、Cu畫S(Met89)=2.61A。二硫鍵(Cys52)-S-S-(Cys85)在穩定分子結構方面似乎起到了重要作用。多肽摺疊是藍銅蛋白亞族(Phytocyanin)以及非金屬蛋白豚草過敏原Ra3(其與CBP具有高度的序列相同性)所特有的。現在被鑑定為Phytocyanin的蛋白是CBP、漆樹花青武、Mavicyanin、Umecyanin、黃瓜皮銅氧還蛋白、豌豆莢內的推定的藍銅蛋白、和來自擬南芥的藍銅蛋白。在除了CBP和豌豆莢蛋白外的所有蛋白中，正常位於藍銅蛋白位點的中軸甲硫氮酸配體被穀氨酸取代。在NCBI蛋白資料庫編號No.2CBP中可以發現黃瓜鹼性蛋白的示例序列SEQIDNO:17。本發明的方法
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：本發明的另一個方面涉及一種或多種銅氧還蛋白和其變體、衍生物和結構等價物在治療患有病理性病變的哺乳動物患者的方法中的用途。更具體的，病變與Ephrin信號傳導系統有關。另外，哺乳動物可能患有癌症。現在已知銅氧還蛋白和其變體、衍生物和結構等價物一般能干擾細胞或組織中Ephrin信號傳導系統的活性。另外，現在已知銅氧還蛋白和其變體、衍生物和結構等價物能抑制細胞和組織中的癌症生長。在具體的實施方式中，細胞和組織是哺乳動物的細胞和組織。在更具體的實施方式中，細胞是人類細胞。在一些實施方式中，細胞是非人細胞。在一個實施方式中，給細胞施用銅氧還蛋白和其變體、衍生物和結構等價物以便抑制細胞表面上的Ephrin受體的活性。在另一個實施方式中，施用銅氧還蛋白和其變體、衍生物和結構等價物，以便增加細胞表面上的Ephrin受體的活性。在其他具體的實施方式中，銅氧還蛋白和其變體、衍生物和結構等價物抑制和減增加了前向和/或後向的Ephrin信號傳導。此外，在抑制前向信號的同時增加後向信號是可能的。哺乳動物所患的病理性病變具體的是與Ephrin信號傳導活性相關的病變。現在知道，銅氧還蛋白包括與Ephrin特定的結構同源性，其也可以象Ephrin—樣在體內作用於Ephrin信號傳導系統。提出了銅氧還蛋白可以用於治療與Ephrin信號傳導系統相關的病理性病變。在具體的實施方式中，病理性病變伴有比正常濃度更高或更低濃度的Ephrin信號傳導系統的組分。在其他具體的實施方式中，病理性病變是由於Ephrin信號傳導系統的組分的過度表達或表達低下所造成的。在其他具體的實施方式中，病理性病變是由於Ephrin信號傳導系統的組分的過度循環或循環缺陷所造成的。在其他具體的實施方式中，病理性病變引起了Ephrin信號傳導途徑的組分的過度表達或表達低下。在另一個具體的實施方式中，病理性病變引起了Ephrin信號傳導途徑的組分的過度循環或循環缺陷。Ephrin信號傳導途徑的"組分"包括傳遞Ephrin與Ephrin受體結合所生成的信號或造成Ephrin與Ephrin受體結合所生成的信號被傳遞的任何分子。在更具體的實施方式中，組分是Ephrin或Ephrin受體。另外，病理性病變可以伴有Ephrin信號傳導系統的組分的異常分布(細胞內、細胞間或組織特異性分布)。在一個具體的實施方式中，可以在細胞表面上或細胞中發現更高濃度的Ephrin受體。在一個更具體的實施方式中，上調或下調了組織中的Ephrin受體。在另一個更具體的實施方式中，上調或下調了組織中的Ephrin。在本發明的另一個方面，給患有癌症的患者施用銅氧還蛋白或其變體、衍生物和結構等價物。在一些實施方式中，患者是哺乳動物，特別是人。在其他實施方式中，患者不是人。雖然未限制這個治療方法的作用機制，多個癌症與Ephrin信號傳導途徑的組分的濃度增加或降低有關。腫瘤中多個Ephrin和Eph受體都已經顯示出其受到了上調或下調，特別是腫瘤進展的更晚期。例如，乳腺癌、肝癌和前列腺癌、和成膠質細胞瘤、食道鱗癌、卵巢癌和黑色素瘤中的EphA2受到了上調。在一個具體的實施方式中，癌症與上調的EphA2受體相關。但是，已知在多種腫瘤中，Ephrin信號傳導系統的不同組分得受到了上調或下調，具體的是Ephrin和Eph受體。各種腫瘤中Ephrin和Ephrin受體的異常表達是本領域公矢n的，並如Surawska等(Cytokine&GrowthFactorReviews15:419-433(2004))所述。在其他實施方式中，癌症與異常量的Ephrin信號傳導系統的組分或活性無關。在具體的實施方式中，癌症是但不限於乳腺癌、肝癌、胃腸癌症、神經母細胞瘤、神經系統癌症、白血病、淋巴瘤、前列腺癌、胰腺癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、子宮內膜癌、絨癌、畸胎癌、甲狀腺癌、所有肉瘤包括源自軟組織和骨骼的肉瘤、腎癌、上皮樣癌和非小細胞肺癌。在一個具體的實施方式中，癌症是p53腫瘤抑制基因表達缺陷的。在其他實施方式中，癌症具有與腫瘤生長階段相關的各種屬性。腫瘤發生的早期步驟是血管化，其中募集動脈給腫瘤提供補養。雖然未將操作機制限制為任一方式，但已知Ephrin信號傳導系統與血管生成有關。在一個實施方式中，癌症是一種與血管生成相關的癌症。腫瘤發生的另一個階段是轉移，其中腫瘤形成轉移灶，其被定義為與原發腫瘤不連續的腫瘤植入物。雖然未將操作機制限制為任一方式，認為轉移也與Ephrin信號傳導系統相關。在一個實施方式中，癌症是轉移前的癌症。在另一個實施方式中，癌症是轉移癌。測定化合物對血管生成的作用的方法是本領域公知的。用於測定血管生成的特異方法包括但不限於在下面文章中所見的檢測法，在此通過引用將其內容併入本申請Danieletal，KidneyInt.Suppl.57:S73畫S81(1996);Myersetal,J.CellBiol.148:343-351(2000);Pandeyetal，Science268:567-569(1995);Brantleyetal，Oncogene21:7011-7026(2002)。除了腫瘤外，還有多種與Ephrin信號傳導系統有關的病理性病變。例如，病理性血管生成形式(Adams&Klein,TrendsCardiov.Medicine10:183-188(2000);Brantley-Sieders&Chen，Angiogenesis7:17-28(2004);Norenetal，Proc.Natl.Acad.SciUSA101:5583-558(2004))、組織損傷後的慢性疼痛(Battagliaetal,NatNeurosci.6:339-340(2003))、脊髓損傷後神經再生的抑制(Goldscmitetal,J.Neurosci.6:339-340(2003))、和人先天性畸形(Twiggetal.Proc.Natl.Acad.Sci.USA101:8652-8657(2004);Wielandetal.，Am.J.Hum.Genet.74:1209-1215(2004))，以及本發明的具體實施方式用銅氧還蛋白、或其變體、衍生物和結構等價物治療這些病理性病變。在具體實施方式中，病理性病變是間質性膀胱炎(IC)、炎性腸病(IBD)相關性病變、HIV感染、心血管病、中樞神經系統疾病、周圍血管病、病毒性疾病、中樞神經系統退行性變(ChristopherReeve病)和Alzheimer病。與治療患間質性膀胱炎和炎性腸病患者相關的方法學見例如美國專利申請20050049176(2005年3月3日出版，在此通過引用將其20內容併入本申請)。對於與抑制或刺激血管生成相關的方法學見例如美國專利申請No.20040136983(2004年7月15日出版，在此通過引用將其併入本申請)。對於與治療骨生成相關的方法學，見例如美國專利申請No.20040265808(2004年7月15日出版，在此通過引用將其內容併入本申請)。通過本領域人員公知的多種途徑和多種方案給患者施用銅氧還蛋白或其變體、衍生物和結構等價物。在具體的實施方式中，靜脈內、肌肉內、皮下或通過腫瘤內注射來施用銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體或衍生物。在具體的實施方式中，靜脈內施用銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物和結構等價物。在特別具體的實施方式中，給患癌症或從癌症中康復的患者施用銅氧還蛋白或其變體或衍生物和化療。除了病理性病變外，銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物和結構等價物還可以用於與患者所患的其他病變相關的治療性方法。這些病變可以是損傷了神經或血管系統的意外事故、其他治療如手術的康復、和衰老相關的病變等所造成的。在一個實施方式中，患者需要血管的生長或再生，則施用銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物和結構等價物以指導血管的生長。在另一個實施方式中，患者需要減少血管生長，則施用銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物和結構等價物以抑制血管的生長。在另一個實施方式中，給需要神經元生成或再生的患者施用銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物和結構等價物，以知道神經元的生長。在另一個實施方式中，給患者施用銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物和結構等價物以促進骨生成。本發明的另一個方面是在體內檢測表現出特異的Ephrin受體的細胞。現在已知銅氧還蛋白含有與Ephrin和其他Ephrin高度結構同源的區域，且銅氧還蛋白在體外可以與Ephrin受體特異性結合。因此，銅氧還蛋白將能定位到表達Ephrin受體的細胞表面。因此，在一些實施方式中，銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物可以用於定位未表達Eph受體細胞或組織中的這些表達Eph受體的細胞和組織。另外，表現出對特殊類型的Eph受體的結合優先性的銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物可以用於定位特異地表達這類Eph受體的細胞或組織。在一個實施方式中，銅氧還蛋白或其變體或衍生物與可檢測探針相連接，並被施用給人類患者，測定出可檢測探針在患者體內的位置，以便確定出表達Eph受體的細胞或組織的位置。在特別具體的實施方式中，細胞是癌細胞。可檢測探針可以是多種本領域目前已知的探針之一。特異相關的探針包括但不限於螢光探針、同位素探針和碘、釓和金。在本發明的另一個實施方式中，銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物與藥物相連接，並被施用給人類患者，以便將藥物轉運給表達Eph受體的細胞或組織。在另一個具體的實施方式中，組織是腫瘤。在特別具體的實施方式中，細胞是癌細胞。藥物可以是任何類型的化合物，其對表達Eph受體的細胞有著影響。藥物可以是有機的或無機的化合物，包括但不限於肽、DNA分子、RNA分子、藥物組合物和這些化合物的任一衍生物。在具體的實施方式中，藥物是毒素例如假單胞菌外毒素A結構域III或化合物例如紫杉醇或其他殺死癌細胞的藥物。通過施用在人類患者的所需細胞或組織中表達的含有與啟動子區可操縱地連接的編碼銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物的編碼區的DNA可以向細胞或人類患者施用銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物。在一個具體的實施方式中，給患者施用編碼銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物的DNA，以便治療能被銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物所治療的病變。將其施用給細胞和人類患者的合適載體和方法是本領域公知的。在人類對象中表達外源蛋白的方法學在本領域是公知的，並且可以適用於在患者體內表達銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物。在下面的美國專利中可以找到示例方案2002年1月15日提交的美國專利No.6,339,068、2005年3月15日提交的美國專利No.6,867,000、2004年11月23日提交的美國專利No.6,821,957、2004年11月23日提交的美國專利No.6,821,955、2003年5月13日提交的美國專禾ijNo.6，562，376;在此通過引用將其內容併入本申請。在更具體的實施方式中，將編碼銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物的DNA注射到患有癌症的患者的腫瘤內。在更具體的實施方式中，將編碼銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物的DNA注射到患有癌症的患者的腫瘤內。在一些實施方式中，通過靜脈注射、肌肉內注射、皮下注射、吸入、局部施用、透皮貼劑、栓劑、或口服以及特異地通過靜脈注射可以給患者施用藥物組合物。可以在施用另一種已知能治療Ephrin信號傳導相關的病理性病變或癌症的藥物的同時或在1分鐘到1周或更長時間內給患者施用藥物組合物。可以與另一種抗癌藥物同時施用藥物組合物。包括銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物的藥物組合物用任一常用方法例如通過常用的混合、溶解、顆粒化、制錠、乳化、包囊化、包埋或低壓凍千方法可以生產包括至少一種銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物的藥物組合物。基本上純化的銅氧還蛋白或銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物可以容易地與本領域公知的可藥用載體組合在一起。這些載體使得製品可以被配製成片劑、藥丸、錠劑、膠囊、液體、凝膠、糖漿、膏劑、懸浮液等。合適的輔料也可以包括例如填充劑和纖維素製品。其他的敷料可以包括例如芳香劑、加色劑、防粘劑(detackifiers)、增稠劑和其他可用的添加劑、佐劑或結合齊廿。在Anseletal,PharmaceuticalDosageFormsandDrugDeliverySystems(LippencottWilliams&Wilkins，BaltimoreMD(1999))中可以找到關於藥物劑量形式的通用方法。用多種方式包括通過注射(例如皮內、皮下、肌肉內、腹腔內等)、通過吸入、通過局部施用、通過栓劑、通過使用透皮貼劑或通過口服可以施用本發明所用的包括銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物的組合物。在Anseletal(同上)中可以找到關於藥物轉運系統的一般信息。在一些實施方式中，包括銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物的組合物可以被配製並直接用作用於皮下和靜脈內注射等的注射液。在與保護劑例如聚丙二醇或相似的塗層劑混合之後，也可以口服攝入包括銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物的組合物。當通過注射施用時，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物可以被配製於水溶液，特異地被配製於生理學相容的緩衝液例如Hanks溶液、林格液或生理鹽水緩衝液。溶液可以包含製劑藥物例如懸浮的、穩定的和/或分散的藥物。或者，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物在使用前可以是被合適載體例如無菌的無致熱源水所構建的粉末形式。在一些實施方式中，藥物組合物不包括佐劑或任何其他被加入用於增強所述肽所刺激的免疫應答的物質。在一些實施方式中，藥物組合物包括抑制針對所述肽的免疫應答的物質。當通過靜脈內液體進行施用時，用於施用銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物的靜脈內液體可以是由晶體或膠體組成的。在此所用的晶體是無機鹽或其他水溶性分子的水溶液。在此所用的膠體包含更大的不可溶分子例如凝膠。靜脈內液體可以是無菌的。可以被用於靜脈內施用的晶體液包括但不限於生理鹽水(0.9%氯化鈉溶液)、林格乳酸液或林格液、和5%葡萄糖水溶液(有時也稱作D5W)，如表2所示。表2:常用晶體液的組成實施例1。complextableseeoriginaldocumentpage47*林格乳酸液也含有28mmol/L乳酸、4mmol/LK+和3mmol/LCa2+。當通過吸入施用時，利用合適的推進劑例如二氯二氟甲烷、三氯氟甲垸、二氧化碳或其他合適的氣體可以從加壓的包裝或噴霧器中釋放出氣霧劑形式的銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物。對於加壓氣霧劑而言，通過提供釋放計量的量可以確定出劑量單位。可以配製出用於吸入器或吹入器的含有蛋白和合適的粉末基質如乳糖或澱粉的粉末混合物的凝膠的膠囊和藥筒。當通過局部施用來施用時，可以將銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物配製成溶液、凝膠、軟膏、乳膏、凝膠劑、懸浮液等，如本領域公知的那樣。在一些實施方式中，施用是經透皮貼劑的方式。當施用是通過栓劑(例如直腸內或陰道內)進行時，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物也可以被配製於含有常用栓劑基質的組合物。當施用是口服施用時，通過混合銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物和本領域公知的可藥用載體可以容易地配製出銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物。可以採用固體載體例如甘露醇、乳糖、硬脂酸鎂等；合適的載體使得銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物可以被配製成用於所治療的對象口服攝入的片劑、藥丸、錠劑、膠囊、液體、凝膠、糖漿劑、膏劑、懸浮液等。對於口服的固體製劑例如粉末、膠囊和片劑，合適的賦形劑包括填充劑例如糖、纖維素製品、顆粒化試劑和結合劑。本領域公知的其他常用載體也包含對價載體例如細菌莢膜多糖、葡聚糖或遺傳學加工的載體。另外，包含銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物的持續釋放製劑容許在延長的時間段內釋放出銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物，使得在沒有持續釋放製劑時，銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物在沒有引起或增強治療性作用之前可以被對象系統清除和/或被例如蛋白酶和簡單水解所降解。用本領域熟知的一些方法可以延長或優化本發明的組合物的血流半衰期，所述方法包括但不限於環化肽(Monketal,BioDrugs19(4):261-78,(2005);DeFreestetal"J.PeptRes.63(5):409-19(2004》、D，L陽月太(非對映體)(Futakietal，J.Biol.Chem.Feb23;276(8):5836-40(2001);Papoetal，CancerRes.64(16):5779-86(2004);Milleretal，Biochem.Pharmacol.36(1):169-76,(1987))、含罕見胺基酸的肽(Leeetal，J.Pept.Res.63(2):69-84(2004》、N和C末端的修飾(Labrieetal,Clin.Invest.Med.13(5):275-8,(1990》、和碳氫化合物鎖環(Schafmeisteretal,J.Am,Chem.Soc.122:5891-5892(2000);Walenskietal，Science305:1466-1470(2004))。特別相關的方法是經D-取代或L-胺基酸取代的d-異構化作用(取代)和肽穩定性修飾。在各種實施方式中，藥物組合物包含載體和輔料(包括但不限於緩衝劑、碳水化合物、甘露醇、蛋白、多肽或胺基酸例如甘氨酸、抗氧化劑、制菌劑、螯合劑、懸浮劑、增稠劑和/或防腐劑)、水、油、鹽溶液、葡萄糖水溶液和甘油溶液、近似生理狀態所需的其他可藥用輔助物質例如緩衝劑、毒性調節劑、溼化劑等。要認識到，雖然可以採用本領域人員已知的任一合適的載體來施用本發明的組合物，但是載體的類型將根據施用模式而有所不同。利用公知的技術也可以將化合物包裹在脂質體內。生物可降解的微球也可以被採用作本發明的藥物組合物的載體。例如在美國專利No.4,897,268、5,075,109、5,928,647、5,811,128、5,820,883、5,853,763、5，814，344和5,942,252中描述了合適的生物可降解的微球。藥物組合物可以被常用的公知的滅菌技術滅菌或者被滅菌過濾。所形成的水溶液可以被包裝使用或者被低壓凍幹，低壓凍幹的製品在施用之前可以與無菌溶液組合。銅氧還蛋白的施用可以施用被配製成藥物組合物的銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物，以及可以用任何合適的途徑來進行施用，例如通過口服、頰黏膜、吸入、舌下、直腸、陰道、經尿道、鼻、局部、經皮，即經皮或腸外(包括靜脈內、肌肉內、皮下和冠狀動脈內)施用。可以施用能有效實現其預定目標的任何量的藥物製劑。更具體的，施用治療有效量的組合物。在具體的實施方式中，治療有效量一般是從約0.01至lj20mg/天/kg體重。包括銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物的化合物可以單獨地或聯合其他活性藥物用於治療哺乳動物細胞和組織中的Ephrin信號傳導相關的病變或癌症。合適的劑量當然將根據例如所採用的銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物、宿主、施用模式和所治療的病變的性質和嚴重度的不同而有所不同。但是，一般來說，每日從約0.01到20mg/kg體重的劑量將在人體中獲得滿意的結果。人體中所給出的每日劑量範圍是施用從約0.7mg到約1400mg銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物的化合物，例如是每日劑量、每周劑量、每月劑量和/或連續劑量。每日劑量可以是從每日1次到12次的分離劑量。或者，可以隔日、每3天、每4天、每5天、每6天、每周以及類似地天數間隔增加到31天或更長來施用劑量。或者，劑量可以是使用貼片、靜脈內施用等的連續劑在一些實施方式中，向患者引入銅氧還蛋白和/或其變體、衍生物或結構等價物的方法是共施用已知能治療Ephrin信號傳導相關的特異的病理性病變或癌症或其他病變或方法的其他藥物。這些方法是本領域公知的。在一個具體的實施方式中，銅氧還蛋白和/或其變體、衍生物或結構等價物是含有治療Ephrin相關的病理性病變或癌症的其他藥物的雞尾酒或共劑量的一部分。相關的藥物包括用於治療炎性腸病、HIV感染、病毒性疾病、心血管病、周圍血管病、中樞神經系統疾病、中樞神經系統退行性變和Alzheimer病的那些藥物。用於治療炎性腸病的藥物包括但不限於氨基水楊酸鹽如柳氮磺吡啶(Azulfidine)、奧沙拉嗪(Dipentum⑧)、美沙拉嗪(Asacol、Pentasa)、和巴柳氮(Colazal);糖皮質激素例如潑尼松、Medrol、甲基潑尼松龍、氫化可的松、布地奈德(EntocortEC);免疫調節劑例如硫唑嘌呤(依木蘭⑧)、6-巰基嘌呤(6-MP，Purinethol)和環孢菌素A(Sandimmune,Neoral);抗生素例如甲硝唑(Flagyl)和環丙沙星(Cipro);生物治療例如英夫利昔單抗(Remicade);以及其他治療例如他克莫司(FK506)和麥考黴酚酸酯。用於治療HIV感染的藥物包括但不限於逆轉錄酶抑制劑AZT(齊多夫定[Retrovir⑧])、ddC(扎西他濱[Hivid⑧]、雙脫氧肌苷)、d4T(司他夫定[Zerit⑧])、和3TC(拉米夫定[Epivir⑧]);非核苷逆轉錄酶抑制劑(NNRTIS):地拉夫定(Rescriptor)和奈韋拉平(Viramune);蛋白酶抑制劑利託那韋(Norvir)、洛匹那韋和利託那韋組合物(Kaletra)、沙奎那韋(Invirase)、硫酸印地那韋(Crixivan)、安潑那韋(Agenerase)和那非那韋(Viracept⑧)。用於治療病毒性疾病的藥物包括但不限於阿昔洛韋、水痘帶狀皰疹免疫球蛋白(VZIG)、PEG幹擾素、利巴韋林、阿昔洛韋(Zovirax).伐昔洛韋(Valtrex)、泛昔洛韋(Famvir)、金剛垸胺、金剛乙胺、扎那米韋、奧賽米韋和a-幹擾素。用於治療心血管病的藥物包括但不限於抗凝劑、抗血小板藥、溶栓劑、腎上腺能神經阻斷劑、腎上腺能神經激動劑、a/p-腎上腺能神經阻斷劑、血管緊張素轉換酶(ACE)抑制劑、血管緊張素轉換酶(ACE)抑制劑和鈣離子通道阻斷劑、血管緊張素轉換酶(ACE)抑制劑和利尿劑、血管緊張素II受體拮抗劑、鈣離子通道阻斷劑、利尿劑(包括碳酸酐酶抑制劑、袢利尿劑、保鉀利尿劑、噻嗪類和相關利尿劑)、血管擴張劑和血管升壓藥等。用於治療周圍血管病的藥物包括但不限於乙酮可可鹼(pentoxifylline)(Trental)、口服甲基黃嘌呤衍生物、和西洛他唑(Pletal);III型磷酸二酯酶抑制劑；抗血小板/抗血栓治療如阿司匹林；抗凝劑如肝素和華法林⑧(Coumadin);降膽固醇藥物如煙酸、他汀類、貝特類、1opid⑧片劑(吉非貝齊；Parke-Davis)、tricor片劑(非諾貝特；Abbott)、膽酸多價螯合劑、colestid⑧片劑(微粒化的鹽酸降膽寧；PharmaciaandUpjohn)、welchol⑧片劑(鹽酸考來維綸；Sankyo);鈣離子通道阻斷劑；微生物和食品添加物如葉酸、B-6、B-12、L-精氨酸和co-3脂肪酸；和HMG-COA還原酶抑制劑如advicor⑧片劑(Niadn/Lovastatin;Kos);altocor⑧延長釋放片劑(洛伐他汀；Andryxlabs);lescol⑧膠囊(氟伐他汀鈉；Novartis&Reliant);lipitor⑧片劑(阿託伐他汀；Parke-DavisandPfizer);mevacor⑧片劑(洛伐他汀；Merck);pmvacho胸片劑(普伐他汀鈉；Bristol-MyersSquibb)、pravigardPAC片劑(緩衝阿司匹林和普伐他汀鈉；；Bristol-MyersSquibb);zocor0片劑(辛伐他汀；Merck);煙酸類藥物如advicor⑧片劑(煙酸/洛伐他汀；Kos(也列為HMG-COA還原酶抑制劑))；niaspan(niacin;Kos);和其他藥物如zetia⑧片劑(ezetimibe;Merck/ScheringPlough)。用於治療中樞神經系統疾病的藥物包括但不限於精神治療藥物例如各種苯二氮卓類製品和組合物、抗焦慮藥、抗抑鬱藥(包括單胺氧化酶抑制劑、選擇性5-羥色胺再攝入抑制劑(SSRI)、三環類抗抑鬱藥)、抗躁狂劑、抗驚恐劑、抗緊張劑、精神興奮劑、和強制性障礙疾病治療藥物；偏頭痛製品如P腎上腺能神經阻斷劑、甲異辛烯胺和5-羥色胺受體抑制劑、以及其他的偏頭痛製品包括depakote⑧片劑中的活性成分(Divalproexsodium;Abbott)、和excedrin⑧偏頭痛片劑中的活性成分(對乙醯氨基酚；BMS產品)；鎮靜劑和安眠藥；抗驚厥劑；禾Bpimozide⑧。用於治療帕金森病的藥物包括但不限於抗膽鹼能藥物、兒茶酚-鄰-甲基轉移酶抑制劑、多巴胺藥物和單胺氧化酶(MAO)抑制劑。用於治療CNS退行性變疾病的藥物包括以下藥物用於治療多發性硬化的藥物包括但不限於avonex⑧中的活性成分(幹擾素-pia;BiogenNeurology);用於皮下注射的Betaseron(幹擾素-pib的修飾形式；Berlex);用於注射的Copaxone(醋酸格拉默；TevaNeuroscience);depo-medrol⑧注射用懸浮液(醋酸甲基潑尼松龍；Pharmacia&Upjohn);Novantrone⑧注射用濃縮劑(按鹽酸米託蒽醌提供的米託蒽醌；Serono);Orapred⑧口服液(潑尼松龍磷酸鈉口服液；Ascent);和Rebif⑧注射液(幹擾素-Pla;Pfizer&Serono)。用於治療亨廷頓病的藥物包括但不限於鎮定劑如氯硝西泮(Klonopin⑧)；抗精神病藥如氟哌唑醇(Haldol)和氯氮平(Clozaril);氟西汀(Prozac、Sarafem)、舍曲林(Zoloft⑧)、去甲替林(Aventyl、Pamelor)、和鋰齊lj(Eskalith、Lithobid)。用於治療Alzheimer病的藥物包括但不限於aricept⑧片劑(鹽酸多奈培齊；Eisai或Pfizer);exelon⑧膠囊(利斯的明(rivastigmine)(重酒石酸鹽形式)；Novartis);exelon⑧口服溶液(酒石酸利斯的明；Novartis);reminy鵬口服液(氫溴酸力口蘭他敏(galantaminehydrobromide);Janssen)或reminyl⑧片劑(氫溴酸加蘭他敏；Janssen)。在一些實施方式中，向患者引入銅氧還蛋白和/或其變體、衍生物或結構等價物的方法是共施用已知能治療癌症的其他藥物。這些方法是本領域公知的。在一個具體的實施方式中，銅氧還蛋白和/或其變體、衍生物或結構等價物是含有治療癌症的其他藥物的雞尾酒或共劑量的一部分。相關的藥物包括例如那些在此所列的藥物，特別是5-氟尿嘧啶、幹擾素a、甲氨喋呤、他莫昔芬和長春新鹼。上面的實例指示作為舉例說明的目的，許多其他的化合物是本領域人員所己知的。適用於治療癌症的其他藥物包括但不限於烷化劑如氮芥、烷磺酸鹽、亞硝脲、乙撐亞胺、和三氮烯；抗代謝藥如葉酸拮抗劑、嘌呤類似物、和嘧啶類似物；抗生素類如蒽環類、博萊黴素、絲裂黴素、更生黴素和光輝黴素；酶如L-天冬醯胺酶；法尼基蛋白轉移酶抑制劑；5-oc還原酶抑制劑、3型np-羥類固醇脫氫酶抑制劑；激素類藥物如糖皮質激素、雌激素/抗雌激素、雄激素/抗雄激素、黃體酮、和促黃體生成激素釋放激素拮抗劑、醋酸奧曲肽；微管阻斷劑如海鞘素(ecteinascidin)或其類似和衍生物；微管穩定劑如紫杉垸類例如紫杉醇(Taxo鵬)、多西他奇(Taxotere)及其類似物、和Epothilone類如EpothiloneA-F及其類似物；植物衍生產品如長春花鹼、鬼臼乙叉甙、紫杉垸類；和拓撲異構酶抑制劑；異戊二烯基蛋白轉移酶抑制劑；和其他藥物如羥基脲、甲基苄肼、鄰對滴滴滴、六甲密胺、鉑配位絡合物如順鉑和卡鉑；和用作抗癌和細胞毒藥物的其他藥物如生物效應修飾劑、生長因子；免疫調節劑和單克隆抗體。也可以結合放療和手術來使用本發明的化合物。這些類型的抗癌和細胞毒藥物的代表性實例包括但不限於鹽酸氮芥、環磷醯胺、瘤可寧、馬法蘭、異環磷醯胺、馬利蘭、卡莫司汀、環己亞硝脲、甲基環己亞硝脲、鏈脲黴素、塞替派、氮烯咪胺、甲氨喋呤、硫鳥嘌呤、巰基嘌呤、氟達拉濱、Pentastatin、克拉屈濱、阿糖胞苷、氟尿嘧啶、鹽酸阿黴素、柔紅黴素、去甲氧柔紅黴素、硫酸博萊黴素、絲裂黴素C、方文線菌素D、safracins、saframycins、quinocarcins、discodermolides、長春新鹼、長春鹼、酒石酸長春瑞濱、足葉乙甙、磷酸足葉乙甙、鬼臼噻吩甙、紫杉醇、他莫昔芬、雌氮芥、雌氮芥磷酸鈉、氟他米特、乙基醯胺、亮丙瑞林、蝶啶、二炔基、左旋咪唑、aflacon、幹擾素、白介素、阿地白介素、非格司亭、沙莫司亭、利妥昔單抗、BCG、維甲酸、鹽酸依立替康、倍他米松(betamethosone)、鹽酸吉西他濱、六甲密胺和拓泊替康以及它們的任一類似物或衍生物。這些類型的優選成員包括但不限於紫杉醇、順鉑、卡鉑、阿黴素、去甲氧柔紅黴素、柔紅黴素、氨基蝶呤、甲氨喋呤、甲基葉酸、絲裂黴素C、海鞘素743或Pofiromycin、5-氟尿嘧啶、6-巰基嘌呤、吉西他濱、阿糖胞苷、鬼臼毒素或鬼臼毒素衍生物例如足葉乙甙、磷酸足葉乙甙或鬼臼噻吩甙、馬法蘭、長春鹼、長春新鹼、異長春鹼、長春地辛和長春羅新。用於與本發明的組合物共施用的抗癌藥和其他細胞毒藥物的實例包括以下藥物德國專利No.4138042.8、WO97/19086、WO98/22461、WO98/25929、WO98/38192、WO99/01124、WO99/02224、WO99/02514、WO99/03848、WO99/07692、WO99/27890、WO99/28324、WO99/43653、WO99/54330、WO99/54318、WO99/54319、WO99/65913、WO99/67252、WO99/67253和WO00/00485所述的Epothilone衍生物；WO99/24416(也見於美國專利No.6，040，321)所述的細胞周期蛋白依賴性激酶抑制劑；和WO97/30992和WO98/54966所述的異戊二烯基蛋白轉移酶抑制劑；以及藥物例如那些在美國專利No.6,011,029中屬性和具體描述的藥物(可以與任何NHR調節劑(包括但不限於本發明的那些調節劑)如AR調節、ER調節劑、LHRH調節劑，或者與手術技術特別是治療癌症的手術一起採用美國專利的化合物)。由主治醫師根據患者的病變來決定正確的製劑、施用途徑和劑量。可以個體化地調整劑量的量和間隔，以提供足以保持治療作用的活性銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物的血槳水平。一般都用與經預定施用途徑和標準藥物實踐所選出的藥物載體的混合物來施用所需的銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物。在一個方面，轉運DNA形式的銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物，使得在原位生成多肽。在一個實施方式中，DNA是"裸"DNA，如Ulmer等(Science259:1745-1749(1993))所述以及如Cohen(Science259:1691-1692(1993))所綜述的那樣。通過將DNA塗層到載體例如生物可降解珠上可以增加對裸DNA的攝取，然後裸DNA被有效地轉運到細胞內。在這些方法中，可以用本領域人員已知的多種轉運系統中的任一系統來呈遞DNA，包括核酸表達系統、細菌和病毒表達系統。用於將DNA整合到表達系統中的技術是本領域人員所公知的。見例如WO90/11092、WO93/24640、WO93/17706、和美國專利No.5,736,524。用於將遺傳物質從生物體穿梭到生物體的載體可以分成兩大類克隆載體是可複製的質粒或噬菌體，其具有在合適的宿主細胞內複製所必需的以及其中被插入外源DNA的區域；外源DNA是可複製和繁殖的，只要其是載體的一個組件。表達載體(例如質粒、酵母菌、或動物病毒基因組)被用於將外源遺傳物質引入到宿主細胞或組織內，以便轉錄和翻譯外源DNA例如銅氧還蛋白的DNA。在表達載體中，所引入的DNA與元件例如啟動子可操縱地連接，啟動子給宿主細胞傳遞信號，以便高水平地轉錄所插入的DNA。一些啟動子是特別有用的，例如誘導型啟動子，其控制應答於特異的因素的基因轉錄。銅氧還蛋白和其變體、衍生物或結構等價物的多核苷酸與誘導型啟動子的可操縱地連接可以控制銅氧還蛋白和/或細胞色素c和其變體、衍生物或結構等價物應答於特異的因素的表達。常用的誘導型啟動子的實例是那些應答於oc幹擾素、熱休克、重金屬離子、和類固醇如糖皮質激素(Kaufman,MethodsEnzymol.185:487-511(1990))和四環素的啟動子。其他所需的誘導型啟動子包括那些非細胞內源的啟動子，其中向細胞內引入構建體，當外源性提供誘導劑時，這些細胞中的誘導型啟動子是有應答的。有用的表達載體一般常常是質粒。但是，也關注其他形式的表達載體例如病毒載體(如複製缺陷型逆轉錄病毒、腺病毒和腺伴隨病毒)。由所用的生物體或細胞以及所需的載體性質決定載體選擇。載體一般包括信號序列、複製起點、標記物基因、多連接物位點、增強子元件、啟動子和轉錄終止序列。包括銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物的試劑盒在一個方面，本發明提供了含有包裝或容器中的一個或多個下面的物質的試劑盒(1)包括至少一種銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物的生物學活性組合物；(2)包括共施用藥物的生物學活性組合物；(3)可藥用輔料；(4)施用工具例如注射器；(5)施用說明書。在相同包裝或容器中的兩種或多種組分(1)-(5)的實施方式也被預期。可以從那些先前提及的藥物中選出共施用藥物。當提供試劑盒時，組合物的不同組分可以被包裝在分離的容器內，在使用前即刻將其混合。這種分開包裝組分可以容許長時間儲存，且不丟失活性組分的功能。可以用任一類型的容器提供試劑盒所含的試劑，使得可以保存不同組分的壽命，且不被容器的材料所吸收或變更。例如，密封的玻璃安瓿可以包含低壓凍幹的銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物，或者已經在中性的、無反應的氣體如氮氣下包裝的緩衝液。安瓿可以由任何合適的材料組成，例如玻璃、有機聚合物例如聚碳酸鹽、聚苯乙烯等、陶瓷、金屬或任一通常被用於保存相似試劑的材料。合適容器的其他實例包括普通瓶，其可以由與安瓿相似的物質製成，和外殼，其可以包括夾箔的內層例如鋁箔或合金箔。其他容器包括試管、小瓶、燒瓶、瓶、注射器等。容器可以具有無菌的進孔，例如具有可以被皮下注射針頭穿透的塞子的瓶子。其他容器可以具有由容易取出的膜分隔開的兩個室，在取出膜之後容許組分混合在一起。可取出的膜可以是玻璃、塑料、橡膠等。試劑盒也可以提供說明材料。說明書可以被列印在紙或其他底物上，或者可以提供可電子閱讀的介質如軟盤、CD-ROM、DVD-RPM、zip盤、錄像帶、錄音磁帶、閃盤等。詳細的說明書可以不與試劑盒物理地相連;取而代之的是，用戶可以被引導到試劑盒的產商或經銷商指定的網站或者通過電子郵件來提供。銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物的修飾銅氧還蛋白或其變體、衍生物或結構等價物可以被化學修飾或遺傳學變更，以生成如上面所解釋的變體和衍生物。用標準技術可以合成這些變體和衍生物。除了銅氧還蛋白的天然存在的等位基因變體外，通過向銅氧還蛋白編碼序列中引入突變可以造成改變，這能使得所編碼的銅氧還蛋白的胺基酸序列發生變更，但不會顯著地變更銅氧還蛋白幹擾Ephrin信號傳導或抑制癌症生長的能力。"非必需"胺基酸殘基是銅氧還蛋白的野生型序列中可以被變更且不變更生物學活性的殘基，而"必需"胺基酸殘基是這種生物學活性所必需的胺基酸殘基。例如，預計在銅氧還蛋白中為保守胺基酸的胺基酸殘基是特別不適合於變更的，因此是"必需"胺基酸。可以製備出不會改變多肽活性的保守取代的胺基酸是本領域公知的。表3"優選的取代"顯示了有用的保守取代。其中相同類型的另一個胺基酸對一種類型的胺基酸的保守取代是在本發明的範圍之內，只要取代實質上不會變更化合物的生物學活性。表3:優選的取代complextableseeoriginaldocumentpage57lie(I)Leu，Val,Met,Ala，Phe，正亮氨酸LeuLeu(L)正亮氨酸，He,Val,Met，Ala,PheIleLys(K)Arg,Gin,AsnArgMet(M)Leu,Phe，lieLeuPhe(F)Leu,Val,Ile，Ala,TyrLeuPro(P)AlaAlaSer(S)ThrThrThr(T)SerSerTrp(W)Tyr,PheTyrTyr(Y)Trp，Phe，Thr，SerPheVal(V)Ile,Leu，Met,Phe，Ala,正亮氨酸Leu影響(1)多肽骨架的結構例如P片或a螺旋構象；(2)電荷；(3)疏水性；或(4)耙位點側鏈的體積的非保守取代都能修飾細胞毒因子的功能。根據表4所示的常見側鏈性能可以將殘基分組。非保守取代使得用這些類型之一中的成員交換另一種類型的成員。取代可以被引入到保守取代位點或者更特異地被弓I入到非保守位點。表4:胺基酸類型類型胺基酸疏水性正亮氨酸，Met,Ala,Val,Leu,Ile中性親水性Cys,Ser，Thr酸性Asp,Glu鹼性Asn,Gln，His,Lys,Arg破壞鏈構象Gly,Pro芳香性Trp,Tyr,Phe利用本領域已知的方法例如寡核苷酸介導的(定點)誘變、丙氨酸掃描、和PCR誘變可以製備出變體多肽。可以在所克隆的DNA上實施定點誘變(Carter,BiochemJ.237:1-7(1986);ZollerandSmith,MethodsEnzymol.154:329-350(1987))、限制性選擇誘變(Wellsetal,Gene34:315-323(1985))或其他己知的技術，以生成銅氧還蛋白變體DNA。也可以用已知的銅氧還蛋白突變生成用於本發明的方法中的變體銅氧還蛋白。例如，已知銅綠假單胞菌天青蛋白的C112D和M44KM64E突變體具有不同於天然天青蛋白的細胞毒活性和生長停滯活性，這種變更了的活性可以用於本發明的治療方法。本發明的一個實施方式利用銅氧還蛋白及其保留了幹擾哺乳動物細胞中Ephrin信號傳導或抑制癌症生長的能力的變體和衍生物。在另一個實施方式中，本發明的方法利用了銅氧還蛋白變體如M44KM64E突變體，其具有引起細胞生長停滯的能力。通過參照下面的特殊實施例可以獲得對本發明的更充分的理解。描述實施例只是為了舉例說明的目的，並不打算限制本發明的範圍。給出提示或者出於方便目的的情況下對本發明作出的形式變化和等同替換也屬於本發明的範圍。儘管在此採用了具體的術語，但這些術語只是描述意義的，並不是限制的目的。在不脫離本發明的精神和範圍前提下，可以進行如在此之前所述的本發明的修飾和變異，因此本發明的範圍為所附權利要求書所示的範圍。實施例實施例l:秀麗隱杆線蟲發育的體內研究己知秀麗隱杆線蟲中一些Ephrin參與了尾部的肌肉形成和胚胎發育。我們的初步試驗顯示Rusticyanin幹擾了尾部肌肉形成(引起尾部麻痺)，而天青蛋白阻止了幼蟲出生(胚胎發育)。在這些試驗中，在大腸桿菌中高表達天青蛋白和Rusticyanin基因。維持沒有天青蛋白或Rusticyanin基因的對照大腸桿菌。當用對照大腸桿菌餵養秀麗隱杆線蟲最多3天時，它們是健康的並能生產幼蟲。當用表達Rusticyanin的大腸桿菌餵養秀麗隱杆線蟲時，約30%只能移動它們的頭部或其身體的上半部分，但不能移動它們的尾部或其身體的下半部分，說明尾部麻痺。實施例2:天青蛋白結構鄰近物分析通過用載體比對搜索工具(VAST)算法(Gibratetal，CurrOpinStructBiol6:377國385(1996);Madejetal，Proteins23:356-3690(1995))直接比較分子塑模資料庫中的3維蛋白結構進行蛋白結構鄰近物分析。分子塑模資料庫含有來自結晶學和NMR結構測定的試驗數據，並由國立生物技術信息中心(Bethesda,MD，USA)維護。通過國立生物技術信息中心可以獲得進行VAST蛋白結構鄰近物分析的程序。天青蛋白顯示出與MMDB(分析塑模資料庫)編號1KGYE(EphB2-EphrinB2複合物的晶體結構)的顯著的(VastP值10e46;比對長度90個胺基酸；相同性％:6)(圖1)結構重疊。天青蛋白與參考晶體結構的重疊比對涉及鏈E(138個胺基酸)(被稱作Ephrin的蛋白(Ephrin-B2))。該計算分析與Himanen等(Nature,vol414:933-938(2001》發表的結構數據相一致。進一步的VAST分析表明銅氧還蛋白Rusticyanin、Auracyanin、質體藍素、黃瓜鹼性蛋白和漆樹花青甙也顯示出與EphrinB2在G-H袢區的顯著的結構同源性(圖2)。實施例3:源自天青蛋白和質體藍素的合成肽的功效已經分析了源自天青蛋白和質體藍素的與人EphrinB-2G-H袢結構相似的合成肽的功效。已經用標準技術合成了具有以下序列的18-mer天青蛋白肽TFDVSKLKEGEQYMFFCTSEQIDNO:18將MCF-7乳腺癌細胞在含有5和50|ig/ml18-mer天青蛋白肽的16孔板中孵育0、24、48和72個小時，在此之後，用庫爾特計數器計算出MCF-7細胞的數目。與沒有合成肽處理的細胞相比較，發現50ng/ml肽在48到72個小時內抑制了50%MCF-7細胞的生長。與未處理的對照相比較，5ng/ml18-mer合成肽的細胞生長抑制的程度約為25。/。。該試驗表明只依據其與B-2Ephrin的結構相似性所設計出的合成肽的確抑制了B-2Ephrin所加速的癌細胞進展。實施例4:體外測定銅氧還蛋白對Mel-2和MCF-7細胞的生長的作用用16孔板測定出經銅氧還蛋白處理過的細胞的生長。Md-2或MCF-7細胞(每孔5xls個細胞)被容許粘附到多孔板(在此為16孔板)24個小時。在粘附之後，吸除生長培養基。然後向含有新鮮生長培養基的孔內加入PBS(磷酸緩衝液)或濃度為0.1到IOjiM的各種銅氧還蛋白/細胞色素PBS，癌細胞繼續生長24、48和72個小時。在孵育期之後，將臺盼藍加入到培養物中，並計算出死的漂浮細胞的數目。計算活的和死的漂浮細胞，以便確定出各種銅氧還蛋白劑量的IC50。IC50是抑制50。/。細胞培養物生長的蛋白濃度。當每孔500,000個細胞生長24個小時時，有足夠多的細胞進行重複計數。在無銅氧還蛋白的對照細胞培養中，當細胞生長時，它們沒有足夠的空間粘附到板的底部，就開始死亡並成為漂浮細胞。在質體藍素處理過的或Rusticyanin處理過的細胞培養物中，細胞也生長超過板的表面積，並開始死亡和漂浮，但是其數目小於對照。但是，在天青蛋白處理過的細胞培養物中，Mel-2和MCF-7細胞株生長被抑制到造成了非常少的漂浮細胞。實施例5:EphrinB2胞外結構域和銅氧還蛋白之間的結構相似性用分別通過美國國立衛生研究所和歐洲生物信息研究所獲得的VAST和DALI算法(HolmandSander,J.MoLBiol.233:123-138(1993);Gibratetal.,Curr.Opm.Biol.6"377-385(1996))測定出EphrinB2胞外結構域和銅氧還蛋白之間的結構相似性。禾U用VAST算法計算出基於結構的配對序列比對。用TOPS(蛋白結構的拓撲學)動畫進行2維的蛋白結構算法(Torranceetal，Bioinformatics21:2537-2538(2005))。通過使用程序MolMol來進行結構評估(Koradietal，J，Mol,Graphics14:51-55(1996》。兩個程序都發現了一些同源物，包括單體銅氧還蛋白蛋白的一個小亞組、質體藍素、天青蛋白和Rusticyanin。具體地，EphrinB2胞外結構域與這三種銅氧還蛋白(其被選作銅氧還蛋白家族的代表性蛋白)之間的結構比較所提供的VAST和DALI比對具有顯著的相當相似的積分，範圍分別是從11.0到9.7(超出可能的最大值15.7)和6.7到6.4。DALIZ積分<2.0是結構不相似的(表5)。在EphrinB2和質體藍素之間存在著最明顯的結構保守性，重疊的根均方差(r.m.s.d.)為1.8A(在67個結構等價的Cot原子上計算出的數值)(表5)。相比而言，天青蛋白、質體藍素和Rusticyanin表現出了與EphrinB2胞外結構域更弱的一級序列相同性(小於腦)。表5:人EphrinB2胞外結構域與單結構域銅氧還蛋白家族的三種成員(質體藍素、天青蛋白和Rusticyanin)的結構相似性。complextableseeoriginaldocumentpage62a-VAST積分VAST結構相似性積分。該數字與重疊的二級結構元件的數目以及這種重疊的質量相關。更高的VAST積分有著更高的相似性。b-DALIZ積分利用Ephrin胞外結構域結構和DALI資料庫中的其他結構的配對比較計算出Z積分。Z積分越高，3D結構之間的相似性為隨機的可能性就越小(Z<2.0的配對是結構不相似的)。c-RMSD:結構對的比對部分之間的骨架殘基的根均方差(A)。圖3顯示了所研究的EphrinB2胞外結構域和所有三種銅氧還蛋白的TOPS動畫(A)和MolMol圖像(B)。拓撲學描述表明蛋白採用了形成希臘花邊摺疊核心的兩個P片的三明治結構，並且顯示出了在P鏈數目和空間定位方面的顯著的結構相似性；1KGY—E(EphrinB2)、IIUZ(質體藍素)和1JZGA(天青蛋白)(圖3)。相反的，a螺旋的數目和排列是更不保守的。在JZGA中，與在此所示的其他蛋白相比較，其螺旋結構是獨特的。對於具有不同大小的蛋白可以預計到，連接二級結構元件的環顯示出在其長度及構象方面的差異。IRCY(Rusticyanin)具有最低的結構同源性，主要差異在於共享的二級結構元件(SSE)的長度和非共享SSE的存在。實施例6:通過表面等離子共振分析Eph-Fc受體-銅氧還蛋白相互作用通過表面等離子共振(SPR)分析確定出Eph受體和銅氧還蛋白的特異性相互作用。如先前所述的那樣(Yamadaetal，CellMicrobiol.7:1418-1431(2005);Hiraokaetal，Proc.Natl.Acad.SciUSA101:6427-6432(2004))，在含5°/。C02的溼潤培養箱中、37°C下將人星狀細胞瘤CCF-STTG1、成膠質細胞瘤LN229和MCF-7(乳腺癌)細胞培養在含2mML-穀氨醯胺、10mMHepes、10%(體積/體積)熱滅活FBS、100U/ml青黴素和100|iig/ml鏈黴素的RPMI培養基1640中。將人黑色素瘤細胞UISO-Mel-2(Yamadaetal，Proc.Natl.Acad.SciUSA99:14098-14103(2002))培養在加有10%FBS的MEM和Hank培養基中。大腸桿菌JM109禾口BL21(DE3)用作過量生產天青蛋白、Rusticyanin和質體藍素的宿主菌株。如先前所述的純化出天青蛋白和Rusticyanin(Yamadaetal，Proc.Natl.Acad.SciUSA99:14098-14103(2002);Yamadaetal.,CellCycle3:1182-1187(2004))。早先已經報導了GST-天青蛋白融合衍生物的構建和純化(Yamadaetal,CellMicrobiol.7:1418-1431(2005))。基本上如早先所述的那樣進行對來自Phormidiumlaminosum的質體藍素的純化和表達(Schlarbetal，Gene234:275-283(1999))，除了用大腸桿菌菌株BL21(DE3)Cd+(RIL)取代BL21(DE3)。利用4700M"cm"的吸光係數以分光光度法在598nm確定出充分氧化蛋白的濃度。Eph胞外結構域Fc融合蛋白和Ephrin的低壓凍乾粉末都購自R&DSystems,Minneapolis,MN。所有用於表面等離子共振和生長試驗的化學物都購自BiacoreABInternational或Sigma，它們都是高分析級的。用基於表面等離子共振(SPR)技術的BiacoreX生物傳感器系統(BiacoreAB)測定出銅氧還蛋白或GST肽與Eph-Fc或EphrinB2-Fc之間的直接蛋白-蛋白相互作用。在最初的篩選試驗中，用胺偶聯方法實現了天青蛋白、Rusticyanin、或質體藍素被固定於CM5傳感器晶片上的單個通道。連續注射N-羥基琥珀醯亞胺/N-(3-二甲基氨基丙基)-N-乙基碳二亞胺(N—hydroxysucGinimide/N-(3-dimethylaminopropyl)畫N-ethylGarbodiimide)(0.05M/0.2M，35pL)、銅氧還蛋白蛋白(255^M，50pL)、1M氨基乙醇(50|^L，pH8.8)禾nlOOmMNaOH(10pL)使得蛋白與CM5傳感器晶片共價連接，使得共振信號增加300RU。通過將lOOnMEph-Fc蛋白HBS-EP電泳緩衝液(0.01MHEPES,pH7.4;0.15MNaCl、3mMEDTA、0.005%v/v表面活性劑P20)連續注射到傳感器表面(流速為5和30pL/min，共2.3min)(70|iL注射液)以及間斷注射lOOmMNaOH(10|aL脈衝)以再生銅氧還蛋白-CM5表面來實施結合試驗。在裸AuCM5傳感器表面(陰性通道)上進行所有結合試驗，以校正非特異性結合。通過連續注射lOOnMEph-Fc受體(流速為30|aL/min，共2.3min)可以在銅氧還蛋白修飾傳感器表面上實施結合篩選。曲線代表Eph-Fc和天青蛋白、質體藍素、及Rusticyanin的相互作用的結合相的開始。相對結合親和力是飽和共振(R叫)的函數，Rusticyanin與EphBl-Fc或EphA8-Fc的結合親和力為79RU，天青蛋白與EphB2-Fc的結合親和力為1248RU。銅氧還蛋白與特異性EphA和EphB受體蛋白的交叉選擇性結合是非常顯著的，在銅氧還蛋白和EphB之間出現了最好的相互作用。固定化的銅氧還蛋白與Eph-Fc的結合的SPRSensorgrams說明了這兩個亞組蛋白之間的選擇性識別(圖4A-C)。在這些測定中，Eph-Fc的濃度被保持恆定於100nM，使得用Req表示的結合程度的差異能夠反映出Eph-Fc受體蛋白和銅氧還蛋白之間的親和力差異。天青蛋白顯示了與EphB2-Fc和A6的最高的親和力，其也與A4和A7緊密結合(圖4A)。另一方面，質體藍素顯示出對EphAl-Fc、A3和B2的選擇性，對A2和A6的選擇性較小(圖4B)。最後，Rusticyanin識別EphA8-Fc、和Bl，但是其結合都是弱的(圖4C)。天青蛋白和EphB2-Fc及EphA6-Fc的結合相互作用是最高的，其Req值分別是1248和1200RU。實施例7:分析天青蛋白和GST-Azu肽與EphB2-Fc的結合親和力一SPR結合測量值利用固定化的EphB2-Fc和天青蛋白或GST-Azu肽實施天青蛋白和GST-azu肽與EphB2-Fc的結合親和力(SPR結合測量值)，以評價全長天青蛋白或其可變區與EphB2-Fc受體的相對集合親和力。給EphB2-Fc或EphrinB2-Fc修飾的CM5晶片注射漸增濃度(0.05-100nM)的天青蛋白或GST-Azu肽，注射之間給予100mMNaOH脈衝注射。將數據放入Langmuir(1:1)結合模型Req二Rmax/(1+Kd/C)，以推導出平衡結合常數(Kd)。圖5顯示了用於闡述天青蛋白結合EphB2-Fc的結構決定子的試驗策略，其描述了如先前所述的天青蛋白和GST-Azu構建體的一級/二級結構參數的圖譜(Yamadaetal.,CellMicrobiol.7:1418-1431(2005))。具體地，GST-Azu88-113與EphrinB2(天然配體)的GH袢區相一致，因此其與EphB2-Fc的結合效率是特別相關的。最初對天青蛋白和各種GST-Azu構建體(所有濃度均為100nM)與EphB2-Fc的結合測定發現了它們的相對親和力即天青蛋白〉GST-Azu88-113>GST-Azu36-128>EphrinB2-Fc>GST-Azu36-89>>GST(圖6A)。天青蛋白和GST-標籤的天青蛋白顯示出相當的親和力(數據沒有顯示)。為了定量結合親和力，測定出了作為其濃度(0-100nM)函數的天青蛋白或GST-Azu的飽和反應值(Req)(圖6B)。將結合數據放入Langmuir(1:1)結合公式以測定出平衡解離常數(Kd)。值得注意的是，天青蛋白(Kd=6nM)和GST-Azu88-113(Kd=12nM)與EphB2-Fc的親和力分別比其天然EphrinB2-Fc配體(Kd=30nM)的親和力的5倍和2.5倍。GST-Azu36-128(表6)也顯示比EphrinB2-Fc(Kd=30nM)稍高的親和力。相反的，GST-Azu36-89和GST表現出基本上可忽略的結合(表6)。這些數據說明天青蛋白的Azu88-113區對與EphB2-Fc的高親和力的相互作用的重要性。Azu88-113區是由與EphrinB2中的GH袢結構同源的GH袢區組成的。表6:天青蛋白和GST-Azu構建體與EphB2-Fc的相對結合親和力。complextableseeoriginaldocumentpage66用SPR結合滴定試驗測定出天青蛋白和GST-Azu構建體與EphB2-Fc的相對結合親和力，在此總結了所推測的數據組，並與天然的EphrinB2-Fc配體和GST的結合力進行比較。在向傳感器表面注射1OOnM分析物之後，生成了最初篩選試驗的數據，列出了共振單位的飽和信號(Req)。獲得了圖6b所述的結合曲線的每個滴定點上的飽和結合，用按分析物標繪的這些數值計算出平衡解離常數(Kd)。天青蛋白和GST-Au的Kd數值範圍是從6到61nM，而EphB2-Fc與天然配體具有這個範圍內的中間的結合親和力。實施例8:分析天青蛋白/GST-Azu和EphrinB2-Fc與EphB2-Fc的競爭結合研究為了更好的了解高親和力的天青蛋白-EphB2-Fc結合的生理學作用，我們進行了進一步的結合測定。與結合常數研究相似的進行競爭結合滴定，除了在EphB2-FcCM5傳感器表面上注射EphrinB2-Fc(246nM)+競爭物(天青蛋白或GST-Azu(0-1020nM))。將不同濃度的Azruin(0-1020nM)+EphrinB2-Fc(246nM)樣品加入到傳感器表面上，並標繪出作為共振比例的數據(佔總應答n/。[R叫(天青蛋白+EphrinB2-Fc)/(Req/(EphrinB2-Fc))])。用EphrinB2隱Fc將GST-Azu88-113和GST-Azu36-89滴定到固定化的EphB2-Fc，並用相似的方式進行分析。競爭數據表明Azruin禾nGST-Azu88-113與固定化的EphB2-Fc之間的結合化學計量為1:1。我們首先測定了天青蛋白和GST-Azu構建體與EphB2-Fc配體EphrinB2-Fc的結合。圖7A顯示天青蛋白的確高親和力地結合EphrinB2-Fc(Kd=8.5+0.8nM)，反映出這兩種蛋白之間的結構相似性(表5)。GST-Azu88-113對EphrinB2-Fc的相對高親和力(Kd=39+6.5nM)說明88和113之間的區域也對結合EphrinB2-Fc起到了重要作用。相反的，GST和GST-Azu36-89沒有顯示出與EphrinB2-Fc的相互作用。總而言之，這些數據表明天青蛋白可以經GH袢(88-113)區高親和力地結合EphB2-Fc和EphrinB2-Fc。為了進一步測試這個區域，在EphrinB2-Fc與不同濃度的天青蛋白和GST-Azu構建體孵育之後，我們進行了對EphrinB2-Fc與固定到CM5傳感器晶片上的EphB2-Fc的結合的SPR分析。圖7B顯示了0-1020nM天青蛋白、GST-Azu88-113、和GST-Azu36-89分別對EphrinB2-Fc(246nM)與EphB2-Fc的結合的抑制作用。抑制作用用佔總應答％表示(呵Req(天青蛋白+￡1^1182^0)/1^(￡1^1162^(;單用)]*100)。抑制作用譜表明當用天青蛋白或GST-Azu88-113預孵育EphrinB2-Fc時，減少了總蛋白與固定化的EphB2-Fc的結合，以及天青蛋白是比GST-Azu88-113更強的抑制劑。Azruin或GST-Azu88-113與EphrinB2-Fc的預孵育將總蛋白與表面的結合最多減少了60%。另一方面，GST-Azu36-89不影響總蛋白結合(圖7B)，這和其與EphrinB2-Fc或EphB2-Fc的弱結合力相一致。這表明天青蛋白(或GST-Azu88-113)和EphrinB2-Fc形成了化學計量的複合物，因為當EphrinB2-Fc和天青蛋白(或GST-Azu88-113)的比例為1:1時獲得了最大的抑制作用。天青蛋白或GST-Azu88-113的抑制作用停留於40到50M的事實表明推定的天青蛋白-EphrinB2-Fc複合物與EphB2-Fc受體有著一些親和力。總之，這些結合數據表明天青蛋白對EphrinB2-Fc和EphB2-Fc都有著高親和力，以及表明天青蛋白可以通過配體隔離和受體佔據的雙重機制幹擾EphrinB2-Fc-EphB2-Fc結合。實施例9:對Azu96-113和Plc70-84合成肽以及GST-Azu融合衍生物對各種癌細胞株的細胞毒活性的分析在對azruin和質體藍素與人EphrinB2胞外結構域進行基於結構的序列比對之後，我們設計出了對應於EphrinB2的G-H袢區的肽(稱作Azu96-113(SEQIDNO:18)和Pic70-84(SEQIDNO:20))，所述G-H袢區是介導Ephrin與Eph受體的高親和力結合的主要區域(Himanenetal,Nature414:933-938(2001);Tothetal,Dev.Cell.1:83-92(2001》。在圖8中，可以看到EphrinB2胞外結構域、天青蛋白和質體藍素的C末端片段的結構重疊。用對天青蛋白和質體藍素與人EphrinB2胞外結構域的基於結構的序列比對設計出基於介導EphrinB2與EphB2受體的高親和力結合的區域(EphrinB2-Fc胞外結構域的G鏈-袢-H鏈)的天青蛋白的肽(稱作Azu96-113(96-TFDVSKLKEGEQYMFFCT-113))和質體藍素的肽(稱作Pic70-84(70-VRKLSTPGVYGVYCE-84》(圖8)。從GenScript公司(Piscataway，NJ)購得純度為99%的肽。用反相高壓液相色譜純化肽，並用質譜法確認其身份。將肽溶解於磷酸緩衝液(PBS)(lx)，並分裝儲存在-20°C直到使用。為了判斷天青蛋白的這些區域是否也作用為癌症進展中的Eph信號傳導的拮抗劑，我們在多個已知高表達EphB受體/Ephrin配體的癌細胞株中進行了定量MTT檢測。在37。C孵育24h期間，75pM天青蛋白和質體藍素G-H袢肽都顯示出誘導了腦瘤星狀細胞瘤CCF-STTGl和成膠質細胞瘤LN-229的細胞死亡(圖9A)。質體藍素肽Plc70-84多少顯示了比天青蛋白肽Azu96-113更高的細胞毒活性。為了確定出這種細胞毒性是否是劑量依賴性的以及是否對其他癌細胞株也是有效的，我們評價了一些濃度的這些肽對黑色素瘤(圖9B)或成交質細胞瘤細胞(圖9C)的作用。在兩種情況中，漸增的肽濃度造成了漸增的細胞毒性(圖9B和9C)。實施例10:對GST-Azu融合肽誘導乳腺癌MCF-7細胞細胞死亡的能力的分析我們己經測試了GST-Azu融合肽誘導乳腺癌MCF-7細胞細胞死亡的能力。為了測定天青蛋白和質體藍素合成肽的細胞毒性，進行了四甲基f禺氮唑藍(3-(4，5-dimethylthiazol畫2畫yl-2,5-diphenyltetrazoliumbromide)(MTT》(Sigma)檢測(Mosmann,J,Immunol.Methods65:55-63(1983))。將每孔近2乂104個細胞種植到96孔培養板內的100pLRPMI1640培養基中。在過夜培養後，去除上清液，向粘附細胞加入含有各種指定濃度的天青蛋白或質體藍素合成肽的新培養基。在24或48h處理之後，向培養基加入10fiL5mg/mlMTT溶液，並在37。C下孵育lh。通過加入40mMHC1異丙醇溶液來終止MTT反應。如先前所述的那樣(Mosmann,1983)，分光光度地測定出所形成的MTT甲臘(formazan)。比較未處理的對照細胞和處理過的細胞，以便確定出活力，以及因此確定出細胞毒性的測量值。與對照(沒有蛋白)相似，GST或GST-Azu36-89融合蛋白觸發了非常低的細胞毒性(圖10)。但是，具有能夠幹擾EphrinB2/EphB2結合的天青蛋白區的GST-Azu36-128或GST-Azu88-113顯示出劑量依賴方式的顯著的細胞毒性，驗證了Azu88-113區在觸發MCF-7細胞死亡中的作用。實施例11:患有與Ephrin信號傳導相關的病理性病變的患者的治療在患有癌症的患者中進行銅氧還蛋白化合物(研究藥物)的I/II期臨床研究。具體而言，銅氧還蛋白化合物是Plc70-84(SEQIDNO:20)。在施用研究藥物的開放標籤、前瞻性研究中入選了49例患有經組織學確診的乳腺癌、結腸癌和黑色素瘤成人患者，這些患者都在經目前可獲得的FDA批准的化療藥物和方案充分治療後出現了臨床和放射學的進展或復發。為了符合該研究的入選條件，所有患者在完成經批准的化療方案療程之後出現了可測量腫瘤病灶體積的增加。持續的轉移灶和/或大小或體積的連續增加的證據在組織學上必須是明確的。通過細針穿刺(FNA)活檢可以獲得這種組織學證據。在芝加哥伊利諾斯大學的研究所倫理委員會和FDA的監督下，在得到所有患者的知情同意書之後實施研究方案。患者沒有合併症例如其他惡性腫瘤、既往惡性腫瘤病史、血液惡液質、胰島素依賴性糖尿病或其他嚴重的心血管疾病，這些合併症可能會干擾對所提出的治療的作用的適當評價。在開始治療之前進行基線血液檢查(全血細胞計數(CBC)和血清生化)，其包括肝功能檢查(LFT)。所有入選患者在試驗期間都不能同時接受任何癌症化療。通過每日靜脈內注射研究藥物的可藥用製品共12周來施用研究藥物，觀察所有對象的任何劑量限制性毒性。有7種劑量水平，從10mg/kg/天開始，按5mg/kg/天逐漸增加到最大劑量為50mg/kg/天。在7例患有晚期可測量癌症(乳腺癌、結腸癌和黑色素瘤)的患者中記錄下每個劑量水平的療效。通過2維地測定可測量的腫瘤來評價反應(a和b)。1)耙向轉移性腫瘤的完全消失被認為是完全緩解(CR);2)縮小75°/。被認為是極好的部分反應(PR);禾卩3)良好好的反應(PR)是治療後尺寸縮小了50%;4)尺寸縮小25°/。被認為是疾病穩定(SD)以及5)尺寸縮小<25%被認為是無反應(NR)。被證實出現疾病進展的患者則停止治療，但繼續再隨診12周。靶向轉移性腫瘤的完全消失以及尺寸的任何縮小都表明天青蛋白治療可有效地治療癌症。表明Plc70-84治療是有效治療的其他指示物是降低了新轉移性腫瘤的出現率以及腫瘤相關的血管生成的減少。權利要求1.一種分離的肽，其是銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物，並能抑制哺乳動物癌細胞的生長。2.權利要求l的分離的肽，其中銅氧還蛋白選自由天青蛋白、質體藍素、假天青蛋白、質體藍素、Rusticyanin和Auracyanin組成的組。3.權利要求2的分離的肽，其中銅氧還蛋白選自由天青蛋白、質體藍素和Rusticyanin組成的組。4.權利要求l的分離的肽，其中銅氧還蛋白來自選自由銅綠假單胞菌(i^ewfibwo"oyaerwg/"oja)、氧化亞鐵硫桿菌(77z/oZac///wsy^roox/c/a"j)、屍/20/777/(i/w;W/(3W/"OSWm、糞產石鹹菌(^4/0<3//1^6"&>6￡^/&)、氧"(七木糖無色桿菌04c/7rawo6ac/erx_y/osox/<ia")、支氣管敗血性博德特菌(5orafe&//a6rawc/2&e//ca)、甲基單胞菌屬(A/ef/2少/o"w"ass;.)、腦月莫炎奈瑟菌(iVe/^eWfl艦"/wgi礎》、淋病奈瑟菌(iVe&,/agono/r/7c^—、螢光假單胞菌(Psew(iowo"asyMomscera)、綠針假單胞菌(/^ewiiowowayc/z/orara//7/力、苛養木桿菌(Zy/e//a/a幼Wo犯)、黃瓜(Ccmra"f/acus、畐iJ、溶血弓瓜菌(WZ"'opara/2aewo/;^'cws)、禾口孑L石蓴(L7va/er^sa)組成的組的生物體。5.權利要求4的分離的肽，其來自選自由銅綠假單胞菌、氧化亞鐵硫桿菌、屍/zo，Www/mm'"asww和孔石蓴組成的組的生物體。6.權利要求l的分離的肽，其是選自由SEQIDNO:l-17和22-23組成的組的肽的一部分。7.權利要求1的分離的肽，選自由SEQIDNO:l-17和22-23組成的組的序列與所述肽有至少約90%的胺基酸序列相同性。8.權利要求l的分離的肽，其是銅氧還蛋白的截短形式。9.權利要求1的分離的肽，其中所述肽具有超過約10個殘基但不超過約100個殘基。10.權利要求9的分離的肽，其中所述肽包括選自由銅綠假單胞菌天青蛋白殘基96-113、銅綠假單胞菌天青蛋白殘基88-113、孔石蓴質體藍素殘基70-84、孔石蓴殘基57-98、和SEQIDNO:22-30組成的組的銅氧還蛋白區域。11.權利要求10的分離的肽，其中所述肽由選自由銅綠假單胞菌天青蛋白殘基96-113、銅綠假單胞菌天青蛋白殘基88-113、孔石蓴質體藍素殘基70-84、孔石蓴殘基57-98、和SEQIDNO:22-30組成的組的銅氧還蛋白區域組成。12.權利要求l的分離的肽，其中所述肽包括與選自由銅綠假單胞菌天青蛋白殘基96-113、銅綠假單胞菌天青蛋白殘基88-113、孔石蓴質體藍素殘基70-84、孔石蓴殘基57-98、和SEQIDNO:22-30組成的組的目標銅氧還蛋白區域等價的對象銅氧還蛋白的殘基。13.—種組合物，其包括存在於藥物組合物中的至少一種銅氧還蛋白或權利要求1的肽。14.權利要求13的組合物，其中藥物組合物被配製為用於靜脈內施用。15.權利要求13的組合物，其中銅氧還蛋白來自選自由銅綠假單胞菌、氧化亞鐵硫桿菌、屍/20/7^/"附/aw/"oyww、糞產鹼菌、氧化木糖無色桿菌、支氣管敗血性博德特菌、甲基單胞菌屬、腦膜炎奈瑟菌、淋病奈瑟菌、螢光假單胞菌、綠針假單胞菌、苛養木桿菌、黃瓜、C/2/ora/fea^^rantoa^、副溶血弧菌和孔石蓴組成的組的生物體。16.權利要求15的組合物，其中銅氧還蛋白來自選自由銅綠假單胞菌、氧化亞鐵硫桿菌、屍Aom7^/ww/am/"osww和孔石蓴組成的組的生物體。17.權利要求13的組合物，其中銅氧還蛋白選自由SEQIDNO:l-17和22-23組成的組。18.—種治療患有Ephrin信號傳導系統相關性病理性病變或患有癌症的哺乳動物患者的方法，包括給所述患者施用治療有效量的權利要求13的組合物。19.權利要求18的方法，其中所述患者患有選自由間質性膀胱炎(IC)、炎性腸病(IBD)相關性病變、HIV感染、心血管病、中樞神經系統疾病、周圍血管病、病毒性疾病、中樞神經系統退行性變(ChristopherReeve病)、和Alzheimer病組成的組的病理性病變。20.權利要求19的方法，其中所述患者患有選自由乳腺癌、肝癌、胃腸癌、神經母細胞瘤、神經系統癌症、白血病、淋巴瘤、前列腺癌、胰腺癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、子宮內膜癌、絨癌、畸胎癌、甲狀腺癌、所有肉瘤包括源自軟組織和骨骼的肉瘤、腎癌、表皮樣癌和非小細胞肺癌組成的組的癌症。21.權利要求18的方法，其中所述患者是人。22.權利要求18的方法，其中通過選自由靜脈內注射、肌肉內注射、皮下注射、吸入、局部施用、經皮貼片、栓劑和口服組成的組的方式施用所述組合物。23.權利要求22的方法，其中施用方式是通過靜脈內注射。24.權利要求18的方法，其中在施用另一種已知能治療所述病理性病變或癌症的藥物的O分鐘到1周內施用所述組合物。25.權利要求24的方法，其中與另一種抗癌藥物大約同時施用所述組合物。26.—種組合物，其包括至少兩種選自由銅氧還蛋白和權利要求1的分離的肽組成的組的分離的多肽。27.權利要求26的組合物，其存在於藥物組合物中。28.—種試劑盒，其包括存在於瓶內的權利要求13的組合物。29.權利要求28的試劑盒，其中所述試劑盒被設計為用於靜脈內施用。30.—種方法，包括用權利要求13的組合物接觸哺乳動物癌細胞，並測定癌細胞的生長。31.權利要求30的方法，其中癌細胞選自由乳腺癌、肝癌、胃腸癌、神經母細胞瘤、神經系統癌症、白血病、淋巴瘤、前列腺癌、胰腺癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、子宮內膜癌、絨癌、畸胎癌、甲狀腺癌、所有肉瘤包括源自軟組織和骨骼的肉瘤、腎癌、表皮樣癌和非小細胞肺癌組成的組。32.權利要求30的方法，其中癌細胞是體內的癌細胞。33.—種表達載體，其編碼權利要求1的肽。34.—種分離的肽，其是銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物，並與Ephrin受體結合。35.權利要求34的分離的肽，其中Ephrin受體選自由EphAl、EphA2、EphA3、EphA4、EphA5、EphA6、EphA7、EphA8、EphAlO、Ep固、EphB2、EphB3、EphB4和EphB6組成的組。36.權利要求35的分離的肽，其也結合Ephrin。37.權利要求36的分離的肽，其中Ephrin選自由EphrinAl、EphrinA2、EphrinA3、EphrinA4、EphrinA5、EphrinBl、EphrinB2、EphrinB3和EphrinB4組成的組。38.權利要求36的分離的肽，其結合Ephrin及其受體。39.權利要求38的分離的肽，其結合Ephrin2B和Eph2B。40.—種分離的肽，其是銅氧還蛋白的變體、衍生物或結構等價物，並與選自由EphrinAl、EphrinA2、EphrinA3、EphrinA4、EphrinA5、EphrinBl、EphrinB2、EphrinB3和EphrinB4組成的組的Ephrin結合。41.一種方法，包括給哺乳動物患者施用權利要求13的組合物以指導所述患者體內的血管生長。42.—種方法，包括給哺乳動物患者施用權利要求13的組合物以減少所述患者體內的血管生長。43.—種方法，包括給哺乳動物患者施用權利要求13的組合物以指導所述患者體內的神經元生長。44.一種方法，包括給哺乳動物患者施用權利要求13的組合物以促進所述患者體內的骨生成。45.—種方法，包括給哺乳動物患者施用有效量權利要求13的組合物以替代需要使用Ephrin的治療方法中的Ephrin。46.—種方法，包括用權利要求13的組合物接觸哺乳動物細胞以抑制與所述細胞有關的Ephrin受體的活性。47.—種方法，包括用權利要求13的組合物接觸哺乳動物細胞以增加與所述細胞有關的Ephrin受體的活性。48.—種方法，包括給具有表達Ephrin受體的組織的人類患者施用權利要求13的組合物，所述組合物包括銅氧還蛋白衍生物、或與藥物融合的變體、衍生物或結構等價物。49.權利要求48的方法，其中組織是癌組織。50.檢測哺乳動物患者體內具有Ephrin受體的組織的方法，包括步驟(a)給所述患者施用權利要求13的組合物，所述組合物包括銅氧還蛋白衍生物、或與可檢測探針融合的變體、衍生物或結構等價物；和Cb)檢測探針在患者體內的分布。全文摘要本發明涉及幹擾哺乳動物細胞中Ephrin信號傳導系統的銅氧還蛋白和銅氧還蛋白的變體、衍生物和結構等價物的組合物和使用方法。具體地，本發明涉及使用銅氧還蛋白例如天青蛋白、Rusticyanin和質體藍素及其變體、衍生物和結構等價物治療哺乳動物體內的癌症的組合物和方法。文檔編號A61K39/00GK101198351SQ200680017470公開日2008年6月11日申請日期2006年5月19日優先權日2005年5月20日發明者A·喬杜裡,A·查克拉巴迪,A·菲亞略,T·達斯古普塔,山田亨,朱永華申請人:伊利諾斯大學理事會