切片文件存儲方法及裝置與流程
2023-11-09 19:23:17 2
本發明涉及計算機技術領域，尤其是涉及一種切片文件存儲方法及裝置。
背景技術：
數字切片系統將整個載玻片全信息、全方位快速掃描，使傳統物質化的載玻片變成新一代數位化病理切片，是對病理診斷技術實現劃時代的變革。可使病理醫生脫離顯微鏡，隨時隨地通過網絡解決病理診斷，實現全球在線同步遠程會診或離線遠程會診，由於提供全切片信息，使診斷價值等同顯微鏡觀察，其時間空間穿插傳遞優勢具有重大意義。該系統可廣泛用於病理臨床診斷、病理教學、組織學細胞成像、螢光分析、免疫組化數字成像。
然而，由於目前切片文件非常大，大約都在1g-2g，使得將整個切片文件上傳至伺服器的時間過長，大約要30-60分鐘甚至更久，在切片文件未上傳完畢時，無法查看切片文件，在需要快速診斷的情況下，時間無法滿足需求，需要等待，浪費大量時間；若提高帶寬，可以有效地提高上傳速度，但成本高且無法普及。
技術實現要素：
有鑑於此，本發明的目的在於提供一種切片文件存儲方法及裝置，以緩解現有技術中存在的整個切片文件上傳至伺服器時時間過長的技術問題。
第一方面，本發明實施例提供了一種切片文件存儲方法，包括：
獲取掃描設備掃描病理切片後得到的切片文件，所述切片文件包括多個切片圖片、每個所述切片圖片所在的切片層以及所述切片圖片在所在的所述切片層中的行號及列號，所述切片層與所述切片圖片的放大倍率對應；
根據所述切片層、所述行號及所述列號確定每個所述切片圖片的第一存儲位置標識，與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置位於存儲所述切片文件的存儲區域內；
將多個所述切片圖片分別存儲到與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置。
結合第一方面，本發明實施例提供了第一方面的第一種可能的實施方式，其中，所述根據所述切片層、所述行號及所述列號確定每個所述切片圖片的第一存儲位置標識，包括：
獲取切片文件標識、切片文件大小、當前系統時間、各個所述切片圖片的層號、行號及列號；
按照預設標識生成規則，根據所述切片文件標識、所述切片文件大小、所述當前系統時間、各個所述切片圖片的層號、行號及列號生成第一存儲位置標識，所述第一存儲位置標識對應的存儲位置位於所述存儲區域內的圖片分區中。
結合第一方面，本發明實施例提供了第一方面的第二種可能的實施方式，其中，所述圖片分區位於外網的至少一個存儲節點上；
所述將多個所述切片圖片分別存儲到與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置，包括：
獲取所述切片文件的大小；
按照預設分布式存儲規則，根據所述切片文件的大小在至少一個預設的存儲節點上確定所述切片文件的圖片分區；
在所述圖片分區中，根據所述第一存儲位置標識查找對應的存儲位置；
將多個所述切片圖片分別存儲到查找到的存儲位置。
結合第一方面，本發明實施例提供了第一方面的第三種可能的實施方式，其中，所述圖片分區位於本地伺服器；
所述將多個所述切片圖片分別存儲到與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置，包括：
在所述本地伺服器中，根據所述第一存儲位置標識查找對應的存儲位置；
將多個所述切片圖片分別存儲到與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置。
結合第一方面，本發明實施例提供了第一方面的第四種可能的實施方式，其中，所述存儲區域包括固定信息分區，所述方法還包括：
獲取所述切片文件的文件信息，所述文件信息包括歸屬信息、時間信息、切片層信息、圖片信息、倍率信息、病例基本信息和/或病例籤發報告；
將所述歸屬信息、時間信息、切片層信息、圖片信息、病例基本信息和/或病例籤發報告存儲到所述固定信息分區中對應的存儲位置。
結合第一方面，本發明實施例提供了第一方面的第五種可能的實施方式，其中，所述方法還包括：
獲取所述切片文件中各個切片層的標籤圖和標籤圖信息，所述標籤圖信息包括所述標籤圖所在切片層的層號、行號、列號、起始位置和大小；
按照預設標識生成規則，根據所述標籤圖所在切片層的層號、行號、列號、起始位置和大小生成所述標籤圖的第二存儲位置標識，每個所述第二存儲位置標識唯一對應一個預設的存儲區域；
將各個標籤圖分別存儲到所述固定信息分區中與所述標籤圖的第二存儲位置標識對應的存儲區域。
結合第一方面，本發明實施例提供了第一方面的第六種可能的實施方式，其中，所述方法還包括：
獲取所述切片文件中各個切片層的縮略圖和縮略圖信息，所述縮略圖信息包括所述縮略圖所在切片層的層號、行號、列號、起始位置和大小；
按照預設標識生成規則，根據所述縮略圖所在切片層的層號、行號、列號、起始位置和大小生成所述縮略圖的第三存儲位置標識，每個所述第三存儲位置標識唯一對應一個預設的存儲區域；
將各個所述縮略圖分別存儲到所述固定信息分區中與所述縮略圖的第三存儲位置標識對應的存儲區域。
第二方面，本發明實施例還提供一種切片文件存儲裝置，包括：
獲取模塊，用於獲取掃描設備掃描病理切片後得到的切片文件，所述切片文件包括多個切片圖片、每個所述切片圖片所在的切片層以及所述切片圖片在所在的所述切片層中的行號及列號，所述切片層與所述切片圖片的放大倍率對應；
確定模塊，用於根據所述切片層、所述行號及所述列號確定每個所述切片圖片的第一存儲位置標識，與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置位於存儲所述切片文件的存儲區域內；
存儲模塊，用於將多個所述切片圖片分別存儲到與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置。
第三方面，本發明實施例還提供一種電子設備，包括存儲器、處理器及存儲在所述存儲器上並可在所述處理器上運行的電腦程式，所述處理器執行所述電腦程式時實現上述第一方面所述的方法的步驟。
第四方面，本發明實施例還提供一種具有處理器可執行的非易失的程序代碼的計算機可讀介質，所述程序代碼使所述處理器執行所述第一方面所述的方法。
本發明實施例帶來了以下有益效果：本發明實施例通過首先獲取掃描設備掃描病理切片後得到的切片文件，然後根據所述切片層、所述行號及所述列號確定每個所述切片圖片的第一存儲位置標識，可以將多個所述切片圖片分別存儲到與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置。
本發明實施例能夠將切片文件中的各個切片圖片分別存儲到與第一存儲位置標識對應的存儲位置，分別存儲多個切片圖片，能夠提高文件存儲效率，在任一張切片圖片存儲完畢後，醫生即可觀看，便於快速診斷和臨床會診時使用，避免將整個存儲切片文件上傳至伺服器時導致的上傳慢，耗時過長，未上傳完畢無法觀看切片圖片的問題。
本發明的其他特徵和優點將在隨後的說明書中闡述，並且，部分地從說明書中變得顯而易見，或者通過實施本發明而了解。本發明的目的和其他優點在說明書、權利要求書以及附圖中所特別指出的結構來實現和獲得。
為使本發明的上述目的、特徵和優點能更明顯易懂，下文特舉較佳實施例，並配合所附附圖，作詳細說明如下。
附圖說明
為了更清楚地說明本發明具體實施方式或現有技術中的技術方案，下面將對具體實施方式或現有技術描述中所需要使用的附圖作簡單地介紹，顯而易見地，下面描述中的附圖是本發明的一些實施方式，對於本領域普通技術人員來講，在不付出創造性勞動的前提下，還可以根據這些附圖獲得其他的附圖。
圖1為本發明實施例提供的一種切片存儲方法的流程圖；
圖2為圖1中步驟s103的一種流程圖；
圖3為圖1中步驟s103的另一種流程圖；
圖4為本發明實施例提供的一種切片存儲裝置的結構圖。
圖標：11-獲取模塊；12-確定模塊；13-存儲模塊。
具體實施方式
為使本發明實施例的目的、技術方案和優點更加清楚，下面將結合附圖對本發明的技術方案進行清楚、完整地描述，顯然，所描述的實施例是本發明一部分實施例，而不是全部的實施例。基於本發明中的實施例，本領域普通技術人員在沒有做出創造性勞動前提下所獲得的所有其他實施例，都屬於本發明保護的範圍。
目前由於目前切片文件非常大，大約都在1g-2g，使得將整個切片文件上傳至伺服器的時間過長，大約要30-60分鐘甚至更久，在需要快速診斷的情況下，時間無法滿足需求，需要等待，浪費大量時間；若提高帶寬，可以有效地提高上傳速度，但成本高且無法普及，基於此，本發明實施例提供的一種切片文件存儲方法及裝置，可以將切片文件中的各個切片圖片分別存儲到與第一存儲位置標識對應的存儲位置，分別存儲多個切片圖片，能夠提高文件存儲效率，在任一張切片圖片存儲完畢後，醫生即可觀看，便於快速診斷和臨床會診時使用，避免將整個存儲切片文件上傳至伺服器時導致的上傳慢，耗時過長，未上傳完畢無法觀看切片圖片的問題。
為便於對本實施例進行理解，首先對本發明實施例所公開的一種切片文件存儲方法進行詳細介紹，如圖1所示，切片文件存儲方法包括以下步驟。
步驟s101，獲取掃描設備掃描病理切片後得到的切片文件。
在本發明實施例中，切片文件即數字切片，數字切片並非一張靜態圖片，它是包含了玻璃切片上的所有病變信息，此數字切片(超大空間、高解析度圖片)可以在電腦上進行任意的放大和縮小，並切片利用數字切片可以觀測到玻璃切片上的任何一個位置，也可以將相應的位置放大到5倍、10倍、20倍、40倍，如同在顯微鏡上的放大縮小一樣。掃描設備掃描病理切片後得到的切片文件中包括多個切片圖片、每個所述切片圖片所在的切片層以及所述切片圖片在所在的所述切片層中的行號及列號，行號和列號即切片圖片在當前放大倍率下的任一切片層中所在的行號和列號，所述切片層與所述切片圖片的放大倍率對應，不同所述放大倍率下各層的切片圖片不同。
步驟s102，根據所述切片層、所述行號及所述列號確定每個所述切片圖片的第一存儲位置標識。
在本發明實施例中，與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置位於存儲所述切片文件的存儲區域內。
在該步驟中，可以首先獲取切片文件的切片文件標識、切片文件大小、當前系統時間、各個所述切片圖片的層號、行號及列號；切片文件標識可以指在掃描生成切片文件後用戶為切片文件設置的標識，切片文件大小即切片文件所佔存儲空間的大小，例如1g或者2g等等，當前系統時間即生成第一存儲位置標識時的系統時間，然後按照預設標識生成規則，根據所述切片文件標識、所述切片文件大小、所述當前系統時間、各個所述切片圖片的層號、行號及列號生成第一存儲位置標識，所述第一存儲位置標識對應的存儲位置位於所述存儲區域內的圖片分區中。
步驟s103，將多個所述切片圖片分別存儲到與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置。
在本發明實施例中，所述圖片分區可以位於外網的至少一個存儲節點上，例如，圖片分區的前部四分之一可以位於存儲節點001上，圖片分區的中部四分之一可以位於存儲節點002上，圖片分區的後部三分之一可以位於存儲節點003上等等。這時，如圖2所示，所述步驟s103可以包括以下步驟。
步驟s201，獲取所述切片文件的大小。.
步驟s202，按照預設分布式存儲規則，根據所述切片文件的大小在至少一個預設的存儲節點上確定所述切片文件的圖片分區。
預設分布式存儲規則可以指在每個存儲節點上存儲切片文件的大小，例如，假設存在10個存儲節點，則可以在每個存儲節點上分別存儲切片文件的十分之一，當然，也可以在每個存儲節點上存儲其他比例，可以根據實際需要設定，本發明實施例中不做限定。
步驟s203，在所述圖片分區中，根據所述第一存儲位置標識查找對應的存儲位置。
在該步驟中，根據第一存儲位置標識在至少一個存儲節點上分別查找與第一存儲位置標識對應的存儲位置。
步驟s204，將多個所述切片圖片分別存儲到查找到的存儲位置。
本發明實施例通過將多個切片圖片分別存儲在至少一個存儲節點上，可以減少切片文件的上傳時間，提高切片文件上傳效率。
由於冰凍讀片一般要求30分鐘內出診斷報告，所以為了便於冰凍讀片，在本發明實施例中，所述圖片分區還可以位於本地伺服器上，這時本地伺服器連接的路由器需要進行埠映射設置，以便外網中的設備能夠訪問本地伺服器。這時，如圖3所示，所述步驟s103可以包括以下步驟。
步驟s301，在所述本地伺服器中，根據所述第一存儲位置標識查找對應的存儲位置。
步驟s302，將多個所述切片圖片分別存儲到與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置。
在本發明的又一實施例中，所述存儲區域還包括固定信息分區，所述方法還包括以下步驟。
獲取所述切片文件的文件信息，所述文件信息包括歸屬信息、時間信息、切片層信息、圖片信息、倍率信息、病例基本信息和/或病例籤發報告；
歸屬信息可以指切片文件所屬集體或者個人的名稱等，時間信息可以指創建切片文件的時間等，切片層信息可以指切片層最小標識和最大標識等，圖片信息可以指圖片解析度大小等，倍率信息可以指圖片放大倍數的最小值和最大值等，病例基本信息可以指提供病理切片的患者的年齡、性別和臨床診斷信息等等，本發明實施例中的病例基本信息兼容醫學數字成像和通信(digitalimagingandcommunicationsinmedicine，dicom)的國際協議，病例籤發報告可以指疾病診斷結果等。
將所述歸屬信息、時間信息、切片層信息、圖片信息、病例基本信息和/或病例籤發報告存儲到所述固定信息分區中對應的存儲位置。
為了便於區分各個切片文件，在本發明的又一實施例中，所述方法還包括以下步驟。
獲取所述切片文件中各個切片層的標籤圖和標籤圖信息，每個切片文件只對應一個標籤圖，所述標籤圖信息包括所述標籤圖所在切片層的層號、行號、列號、起始位置和大小；
按照預設標識生成規則，根據所述標籤圖所在切片層的層號、行號、列號、起始位置和大小生成所述標籤圖的第二存儲位置標識，每個所述第二存儲位置標識唯一對應一個預設的存儲區域；
將各個標籤圖分別存儲到所述固定信息分區中與所述標籤圖的第二存儲位置標識對應的存儲區域。
本發明實施例可以為每個切片文件分別存儲對應的標籤圖，可以便於區分各個切片文件。
為了便於醫生了解當前觀看的切片圖片在整個病理切片中的位置，所述方法還包括以下步驟。
獲取所述切片文件中各個切片層的縮略圖和縮略圖信息，每個切片層對應一個縮略圖，所述縮略圖信息包括所述縮略圖所在切片層的層號、行號、列號、起始位置和大小；
按照預設標識生成規則，根據所述縮略圖所在切片層的層號、行號、列號、起始位置和大小生成所述縮略圖的第三存儲位置標識，每個所述第三存儲位置標識唯一對應一個預設的存儲區域；
將各個所述縮略圖分別存儲到所述固定信息分區中與所述縮略圖的第三存儲位置標識對應的存儲區域。
本發明實施例可以為每個切片層分別存儲對應的縮略圖，可以便於醫生了解當前查看的切片圖片在整個病理切片中的位置。
如圖4所示，在本發明的又一實施例中，還提供一種切片文件存儲裝置，包括：獲取模塊11、確定模塊12和存儲模塊13；
獲取模塊11，用於獲取掃描設備掃描病理切片後得到的切片文件，所述切片文件包括多個切片圖片、每個所述切片圖片所在的切片層以及所述切片圖片在所在的所述切片層中的行號及列號，所述切片層與所述切片圖片的放大倍率對應；
確定模塊12，用於根據所述切片層、所述行號及所述列號確定每個所述切片圖片的第一存儲位置標識，與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置位於存儲所述切片文件的存儲區域內；
存儲模塊13，用於將多個所述切片圖片分別存儲到與所述第一存儲位置標識對應的存儲位置。
在本發明的又一實施例中，還提供一種電子設備，包括存儲器、處理器及存儲在所述存儲器上並可在所述處理器上運行的電腦程式，所述處理器執行所述電腦程式時實現上述方法實施例所述的方法的步驟。
在本發明的又一實施例中，還提供一種具有處理器可執行的非易失的程序代碼的計算機可讀介質，所述程序代碼使所述處理器執行上述方法實施例所述的方法。
本發明實施例所提供的切片文件存儲方法及裝置的電腦程式產品，包括存儲了程序代碼的計算機可讀存儲介質，所述程序代碼包括的指令可用於執行前面方法實施例中所述的方法，具體實現可參見方法實施例，在此不再贅述。
所屬領域的技術人員可以清楚地了解到，為描述的方便和簡潔，上述描述的系統和裝置的具體工作過程，可以參考前述方法實施例中的對應過程，在此不再贅述。
另外，在本發明實施例的描述中，除非另有明確的規定和限定，術語「安裝」、「相連」、「連接」應做廣義理解，例如，可以是固定連接，也可以是可拆卸連接，或一體地連接；可以是機械連接，也可以是電連接；可以是直接相連，也可以通過中間媒介間接相連，可以是兩個元件內部的連通。對於本領域的普通技術人員而言，可以具體情況理解上述術語在本發明中的具體含義。
所述功能如果以軟體功能單元的形式實現並作為獨立的產品銷售或使用時，可以存儲在一個計算機可讀取存儲介質中。基於這樣的理解，本發明的技術方案本質上或者說對現有技術做出貢獻的部分或者該技術方案的部分可以以軟體產品的形式體現出來，該計算機軟體產品存儲在一個存儲介質中，包括若干指令用以使得一臺計算機設備(可以是個人計算機，伺服器，或者網絡設備等)執行本發明各個實施例所述方法的全部或部分步驟。而前述的存儲介質包括：u盤、移動硬碟、只讀存儲器(rom，read-onlymemory)、隨機存取存儲器(ram，randomaccessmemory)、磁碟或者光碟等各種可以存儲程序代碼的介質。
在本發明的描述中，需要說明的是，術語「中心」、「上」、「下」、「左」、「右」、「豎直」、「水平」、「內」、「外」等指示的方位或位置關係為基於附圖所示的方位或位置關係，僅是為了便於描述本發明和簡化描述，而不是指示或暗示所指的裝置或元件必須具有特定的方位、以特定的方位構造和操作，因此不能理解為對本發明的限制。此外，術語「第一」、「第二」、「第三」僅用於描述目的，而不能理解為指示或暗示相對重要性。
最後應說明的是：以上所述實施例，僅為本發明的具體實施方式，用以說明本發明的技術方案，而非對其限制，本發明的保護範圍並不局限於此，儘管參照前述實施例對本發明進行了詳細的說明，本領域的普通技術人員應當理解：任何熟悉本技術領域的技術人員在本發明揭露的技術範圍內，其依然可以對前述實施例所記載的技術方案進行修改或可輕易想到變化，或者對其中部分技術特徵進行等同替換；而這些修改、變化或者替換，並不使相應技術方案的本質脫離本發明實施例技術方案的精神和範圍，都應涵蓋在本發明的保護範圍之內。因此，本發明的保護範圍應所述以權利要求的保護範圍為準。