化療耐藥性的癌症的聯合治療的製作方法

2023-06-09 07:26:56 4

化療耐藥性的癌症的聯合治療的製作方法
【專利摘要】本發明公開了治療、預防或控制三陰性乳腺癌(TNBC)或透明細胞腎細胞癌(ccRCC)的方法。該方法包括了HDAC抑制劑羅米地辛聯合胞苷類似物的給藥。還公開了適於在此提供的方法中使用的藥物組合物和單一單位劑型。
【專利說明】化療耐藥性的癌症的聯合治療
[0001]相關申請的交叉引用
[0002]本申請要求2011年9月26日提交的美國臨時專利申請系列號61/539，452的優先權，其公開內容在此全文引入作為參考。
[0003]領域
[0004]提供了使用組蛋白脫乙醯酶(HDAC)抑制劑和DNA甲基轉移酶抑制劑聯合治療化療耐藥性的癌症的方法。在一個實施方式中，HDAC抑制劑為羅米地辛(Romid印sin)。在另一個實施方式中，DNA甲基轉移酶抑制劑為阿扎胞苷或地西他濱。在又一個實施方式中，化療耐藥性的癌症為三陰性乳腺癌(TNBC)或透明細胞腎細胞癌(ccRCC)。
[0005]背景
[0006]腎細胞癌(RCC)是第三大流行的泌尿道癌症和男性第10大常見癌症死亡原因以及女性第 9 大原因(van Spronsen 等人，Crit Rev Oncol Hemato155:177-91, 2005)。透明細胞腎細胞癌(ccRCC)是RCC的最大亞型，佔所有腎臟癌症的大約80%。
[0007]乳腺癌是女性最常見的癌症，其中三陰性乳腺癌(TNBC)佔新診斷乳腺癌的大約15%。TNBC與不良預後、較高的有絲分裂指數和較低的年齡有關(Kreike等人，BreastCancer Res.;9:R65, 2007)。
[0008]在ccRCC和乳腺癌中，早期診斷和治療顯著增加中數生存率。這兩種疾病在轉移時大多是侵襲和耐藥的。轉移性疾病的發展在ccRCC患者中將5年存活率減少至低於10%(Pantuck等人，J Urol 166:1611-23，2001)，在TNBC中將大多數病人的存活率減少至約18個月(Berrada 等人，Ann Oncol 21 Suppl 7:vii30-vii5, 2010)。
[0009]癌症是一種由遺傳異常的累積促進的多步驟過程，其產生遺傳不穩定和腫瘤抑制子及原癌基因的突變。此外，癌症中的表觀遺傳變異通過DNA甲基化和組蛋白脫乙醯化導致對基因表達的調控。在富CpG島區域的胞嘧啶高甲基化和促進核染色質更緊構型的組蛋白脫乙醯化都對基因表達的不恰當沉默做出貢獻。HDAC抑制劑例如曲古抑菌素A(TSA)和羅米地辛和脫甲基轉移酶抑制劑例如地西他濱(DAC ；5-氮雜-2』 -脫氧胞苷)和5-阿扎
胞苷(VIDAZAk)能夠逆轉這些表觀事件並抑制癌症表型。
[0010]組蛋白脫乙醯酶抑制劑羅米地辛在體外和體內的人細胞系中均表現出抗腫瘤性質(Ueda 等人,B1sci B1technol B1chem58:1579-83,1994)。很多研究確認對腫瘤細胞的羅米地辛治療導致對血管生成和細胞生長的抑制，同時誘導細胞凋亡、細胞壞死和細胞分化(JungM., Curr Med Chem8:1505-11，2001 ；Zhu 等人，Cancer Res61:1327-33，2001 ；Sandor等人,Clin Cancer Res8:718-28,2002 ;Konstantinopoulos等人,Cancer ChemotherPharmaco158:711-5，2006 ；Liu 等人，Mol Cancer Ther7:1751-61, 2008)。在 2009 年，羅米地辛被FDA批准用於皮膚T細胞淋巴瘤和周圍T細胞淋巴瘤的治療。
[0011]DNA甲基 轉移酶抑制劑是胞嘧啶的類似物，其在用DNA甲基轉移酶(DNMTs)共價連接之前的複製過程中被引入DNA，從而導致基因甲基化的整體性缺失(Christman J.K.，0ncogene21:5483_95，2002)。用地西他濱進行癌細胞模型的治療通過沉默基因的再表達(Bender 等人，Cancer Res58:95-101,1998 ；Herman 等人，N Engl J Med349:2042-54, 2003)和 p53 及 p2Iffafl7cipl 的活化(Zhu 等人，J B1l Chem279:15161-6，2004)導致抑制生長和凋亡。近期研究確認地西他濱在導致DNA片段化和激活ATM和ATR DNA修復途徑(Palii等人，Mol Cell B1l28 =752-71,2008)的同時導致G2俘獲、降低無性系存活並抑制細胞中的生長。在2006年，地西他濱被FDA批准用於骨髓增生異常症候群的治療。
[0012]作為癌症發展機理的Wnt信號途徑的組成型活化首先在結腸癌中獲得確認(Korinek等人，Science275:1784-7,1997)。分泌的Wnt家族成員與細胞表面捲曲受體複合物的結合通過經典/ β -連環蛋白途徑或一種非經典/ β -連環蛋白獨立途徑導致下遊基因革巴標的活化(ffidelitz R.，Growth Factors ；23:111-6, 2005)。這些途徑中的哪一個被活化是由Wnt/Frizzled複合物的組成控制的。典型Wnt信號途徑影響與細胞增殖、存活和侵入有關的基因(Gumz等人，Clin Cancer Resl3:4740-9, 2007)，而非典型途徑則激活那些涉及細胞粘附、遷移和細胞骨架重組的基因(Komiya等人，0rganogenesis4 =68-75,2008)。sFRPl，分泌的捲曲相關蛋白1，通過隔離Wnt蛋白和與捲曲蛋白異二聚化形成非功能性受體複合物起到Wnt負調節子的作用。然而,在結直腸癌(Suzuki等人,Nat Genet36:417-22,2004);卵巢癌(Takada 等人，Cancer Sci95:741-4, 2004);肺癌(Fukui 等人，0ncogene24:6323-7,2005);肝細胞癌(Shih 等人，Int J Cancerl21:1028-35,2007);腎癌(Gumz 等人，同上)和乳腺癌(Lo等人，Cancer B1l Ther5:281-6,2006)中，已確認sFRPl啟動子的高甲基化和隨後的表達缺失通過典型和非典型途徑允許異常的fct信號。
[0013]在耐藥性TNBC和ccRCC中，再表達後生Gpigenetically)沉默基因的策略是一種有吸引力的化療選擇。在很少存在替代治療的癌症種類中，有效和安全的聯合治療將會是很有價值的。
[0014]概述
[0015]在一個實施方 式中，本文提供了用於診斷、治療或控制患者中化療耐藥性的癌症的方法，包括對所述患者給藥有效量的HDAC抑制劑組合DNA甲基轉移酶抑制劑。
[0016]可用於本文提供的方法的HDAC抑制劑包括但不限於曲古抑菌素A(TSA)、伏立諾他(SAHA)、丙戊酸(VPA)、羅米地辛和MS-275。在一個實施方式中，HDAC抑制劑為羅米地辛。
[0017]在一個實施方式中，可用於本文提供的方法的DNA甲基轉移酶抑制劑為胞苷類似物。可用於本文提供的方法的胞苷類似物包括但不限於5-氮雜胞苷(阿扎胞苷)、5_氮雜脫氧胞苷(地西他濱)、阿糖胞苷、假異胞苷、吉西他濱、zebularine, FCdR、恩曲他濱、5，6- 二氫-5-氮雜胞苷和普魯卡因。在一個實施方式中，胞苷類似物為地西他濱或阿扎胞苷。
[0018]可通過本文提供的方法治療的化療耐藥性的癌症包括但不限於皮膚；淋巴結；乳房；宮頸；子宮；胃腸道；胰腺，肺；卵巢；前列腺；結腸；直腸；口 ；腦；頭部和頸部；喉；睪丸?』腎;胰腺；骨；脾；肝；膀胱；喉；或鼻腔的癌症和復發或難治性癌症。在一個實施方式中，化療耐藥性的癌症為乳腺癌、肝癌、腎癌或胰腺癌。在一個【具體實施方式】中，癌症為三陰性乳腺癌(TNBC)或透明細胞腎細胞癌(ccRCC)。
[0019]在另一個實施方式中，本文提供了一種用於診斷，治療或控制患者中的化療耐藥性的癌症的藥物組合物，其包含HDAC抑制劑、DNA甲基轉移酶抑制劑和藥學上可接受的載體。在一個實施方式中，HDAC抑制劑為羅米地辛。在一個實施方式中，DNA甲基轉移酶抑制劑為胞苷類似物。在一個實施方式中，胞苷類似物為地西他濱或阿扎胞苷。
[0020]在又一個實施方式中，本文提供了單一單位劑量形式、給藥方案和試劑盒，其包括HDAC抑制劑和DNA甲基轉移酶抑制劑。在一個實施方式中，HDAC抑制劑為羅米地辛。在一個實施方式中，DNA甲基轉移酶抑制劑為胞苷類似物。在一個實施方式中，胞苷類似物為地西他濱或阿扎胞苷。
[0021]在一個實施方式中，本文提供了用於癌症的診斷、治療或控制的生物標記物。在一個實施方式中，癌症為TNBC或cRCC。在一個實施方式中，可用於本文提供的方法的生物標記物包括但不限於 RhoB、p21、pl5、pl6、TPRII1、GATA3、sFRP 1、sFRP2、sFRP4、sFRP5、DKKI和 DKK3。
[0022]在一個實施方式中，本文提供了用於預測或監控對有需要的病人進行的治療處理的效果或臨床益處的生物標記物，例如，在用HDAC抑制劑和DNA甲基轉移酶抑制劑組合治療的TNBC或cRCC患者中。在一個實施方式中，HDAC抑制劑為羅米地辛。在一個實施方式中，DNA甲基轉移酶抑制劑為胞苷類似物。在一個實施方式中，胞苷類似物為地西他濱或阿扎胞苷。在一個實施方式中，可用於本文提供的方法的生物標記物包括但不限於RhoB、p21、ρ15、ρ16、Τβ RII1、GATA3、sFRPl、sFRP2、sFRP4、sFRP5、DKKl 和 DKK3。
[0023]在一個實施方式中，本文提供了一種預測或監控治療處理的效果或臨床益處的方法，包括在治療前和治療中檢測從患有某種疾病的患者獲得的細胞的一種或多種特定生物標記物的水平。在一個實施方式中，所述疾病為癌症。在一個實施方式中，癌症為化療耐藥性的癌症。在一個實施方式中，化療耐藥性的癌症為TNBC或cRCC。在一個實施方式中，所述治療是給藥HDAC抑制劑和DNA甲基轉移酶抑制劑的組合。在一個實施方式中，HDAC抑制劑為羅米地辛。在一個實施方式中，DNA甲基轉移酶抑制劑為胞苷類似物。在一個實施方式中，胞苷類似物為地西他濱或阿扎胞苷。
[0024]在一個實施方式中，本文提供了一種預測或監控羅米地辛和地西他濱或阿扎胞苷的組合在TNBC或cRCC患者中的效果的方法，包括在該組合治療前和治療中檢測從患者獲得的細胞的一種或多種特定生物標記物的水平。
[0025]附圖簡述
[0026]圖1A顯示了在ccRCC和TNBC細胞系中對羅米地辛(0.01nM至10nM)的響應。圖1B顯示了在ccRCC和TNBC細胞系中對地西他濱(0.01 μ M至10 μ M)的響應。細胞系Α498、KIJ265T、MDA-231和ΒΤ-20以IxlO5細胞/孔接種，每劑量三份。收集前對細胞進行72小時的處理。
[0027]圖2A、2B、2C和2D顯示了在ccRCC和TNBC細胞系中對羅米地辛和地西他濱的組合藥物劑量響應。(A)A498、(B)KIJ265T、(C)MDA-231和(D)BT_20細胞系以IxlO5細胞/孔接種，每個測試的藥物劑量三份。在用劑量範圍為0.5-7.5nM的羅米地辛處理額外的24小時前，將細胞與0.1、I或10 μ M劑量的地西他濱一起孵育48小時。數據顯示為增殖曲線，包括單治療對照。
[0028]圖3A、3B、3C和3D顯示了在用羅米地辛和地西他濱的組合治療的ccRCC和TNBC細胞系中對 細胞死亡的協同誘導。分析了用單治療劑量的地西他濱或羅米地辛處理的(A)A498、(B)KIJ265T、(C)MDA-231和(D)BT_20細胞系相對於組合治療導致細胞死亡的藥物效果。用溶媒(DMSO)對照處理的細胞被用於設定用於分析的群參數。對處理的細胞進行碘化丙啶染色並通過流式細胞術分析。
[0029]圖4A-4B顯示了在用I μ M地西他濱和5ηΜ羅米地辛處理的ccRCC和TNBC細胞系中對sFRPl表達和凋亡標記物的分析。圖4A顯示了處理的A498、KIJ265T、MDA-231和BT-20細胞產生的蛋白裂解物的免疫印跡，其中探測了 PARP和半胱氨酸蛋白酶-3裂解。圖4C顯示了通過使用用於擴增甲基化的(M)或未甲基化的(U)sFRPl序列的定義的引物的甲基化特異性PCR對sFRPl啟動子的甲基化狀態和單一及組合藥物治療調節這些甲基化事件的能力的分析。
[0030]圖5A-5G顯示了 sFRPl表達水平在用地西他濱和羅米地辛處理的ccRCC和TNBC細胞系中對細胞存活的影響。圖5A是用sFRPlshRNA感染的MDA-231和KIJ265T細胞的實時PCR。圖5B和5C顯示了在被組合劑量範圍的地西他濱和羅米地辛處理時KIJ265T和MDA-231細胞的增加的細胞存活。圖顯示了當用組合的地西他濱和羅米地辛處理時，在sFRPl下調(knockdown)的KIJ265T和MDA-231細胞中的凋亡減弱是通過相對非靶向對照降低PARP和半胱氨酸蛋白酶-3裂解實現的。圖5E顯示了當用重組人sFRPl處理時，KIJ265T和MDA-231親代細胞系以劑量依賴方式降低的增殖。圖5F顯示了當使用組合劑量的1M5A2D和5nM羅米地辛處理時，得到的sFRPl再表達的損失產生了 KIJ265T和MDA-231細胞的細胞存活增加。圖5G顯示了在單一劑量的1.4nM sFRPl後，用重組人sFRPl處理並以劑量依賴的方式觀察到且由PARP裂解所示驗證其為通過誘導凋亡時，KIJ265T和MDA-231親代細胞系的降低的增殖。
[0031]圖6A和6B顯示了對VHL突變體(外顯子2c.407T>C) KIJ265T透明細胞腎細胞癌細胞系的鑑別。圖6A顯示了 KIJ265T患者RCC組織中12種腎臟特異性標記物的STR分析。圖6B通過使用IHC染色腎臟細胞標記物，包括RCC-Ma、水通道蛋白、podocin、PAX2和GGT，顯示KIJ265T ccRCC細胞系來自腎臟組織。
[0032]圖7A-7D顯示了在用溶媒對照或72小時組合治療的(A)A498、(B)KIJ265T、(C)MDA231和(D)BT20細胞系中，sFRPl啟動子區域(起始位點前_299bp至_70bp)的甲基化模式測序分析。在組合治療後的全部細胞系中觀察到啟動子甲基化的整體降低(n = 10個克隆)。
[0033]詳細描述
[0034]定義
[0035]應理解上述一般性描述和之後的詳細描述僅為示例性和解釋性的，不限制所要求的任何主題。在本申請中，除非另有說明，否則單數的使用包括了複數。必需注意，如說明書和隨後的權利要求中使用的單數形式「一」、「一個」和「該」包括複數的指示物，除非上下文清楚地另有陳述。還應注意，除非另有說明，否則「或」的使用表示「和/或」。此外，術語「包括」及其它形式例如「包括」、「包括」和「包括的」的使用是非限制性的。
[0036]如本文使用的術語「治療」是指全部或部分緩解與失調或疾病相關的症狀(例如癌症或腫瘤症候群)，或緩解或根除那些症狀的進一步發展或惡化。
[0037]如本文使用的術語「預防」表示全部或部分預防疾病或失調(例如，癌症)或其症狀的發生、復發或擴散。
[0038]與HDAC抑制劑連用的術語「有效量」表示能夠全部或部分減輕與疾病例如癌症相關的症狀、或減緩或停止這些症狀進一步發展或惡化、或在具有患癌風險的主體中預防癌症或對癌症提供預防治療的數量。有效量的HDAC抑制劑，例如在藥物組合物中，可以是能夠實現期望效果的水平；例如，口服和腸胃外給藥的單位劑量為約0.005mg/kg主體體重至約100mg/kg主體體重。如對本領域技術人員是顯而易見的，可以預期本文公開的有效量的HDAC抑制劑可隨著待治療的跡象的嚴重程度發生變化。
[0039]如本文使用的術語「藥學上可接受的載體」指在將主體化合物從身體的一個器官或部分的給藥位點攜帶或運送至身體的另一器官或部分時、或在體外分析系統中所涉及的藥學上可接受的材料、組合物或溶媒，例如液體或固體填充劑、稀釋劑、賦形劑、溶劑、或封裝材料。在與製劑的其它成分相容且不傷害施用其的主體的意義上，每種載體必須為「可接受的」。可接受的載體也不應改變主體化合物的特定活性。
[0040]術語「藥學上可接受的」指生理可耐受的和當對人給藥時一般不產生過敏或類似不良反應(例如胃部不適、眩暈等等)的分子實體和組合物。
[0041]術語「藥學上可接受的鹽」涵蓋了該術語所涉及的化合物的無毒酸和鹼加成鹽。可接受的無毒酸加成鹽包括衍生自本領域已知的有機和無機酸或鹼的那些鹽，包括如鹽酸、氫溴酸、磷酸、硫酸、甲磺酸、乙酸、酒石酸、乳酸、琥珀酸、檸檬酸、蘋果酸、馬來酸、山梨酸、烏頭酸、水楊酸、鄰苯二甲酸、栓塞酸、庚酸等。
[0042]天然呈酸性的化合物能夠與各種藥學上可接受的鹼形成鹽。可用來製備這種酸性化合物的藥學上可接受的鹼加成鹽的鹼是那些形成無毒鹼加成鹽(即含有藥學上可接受的陽離子的鹽，例如但不限於鹼金屬或鹼土金屬的鹽，尤其是鈣鹽、鎂鹽、鈉鹽或鉀鹽)的鹼。合適的有機鹼包括但不限於，N，N-二苄基乙二胺、氯普魯卡因、膽鹼、二乙醇胺、乙二胺、meglumaine (N-甲基葡萄糖胺)、賴氨酸和普魯卡因。
[0043]術語「前藥」是指化合物的衍生物，其在生物學條件下(體外或體內)能夠發生水解、氧化或發生其他反應而提供該化合物。前藥的實例包括但不限於包含可生物水解的部分的本發明的免疫調節化合物的衍生物，該可生物水解的部分例如可生物水解的醯胺、可生物水解的酯、可生物水解的氨基甲酸鹽、可生物水解的碳酸鹽、可生物水解的醯脲和可生物水解的磷酸鹽類似物。前藥的其他實例包括含有-NO、-NO2、-ONO或-ONO2部分的本發明的免疫調節化合物的衍生物。前藥通常可利用公知的方法來製備，如在Burger’s MedicinalChemistry and Drug Discovery, 172-178,949-982 (Manfred E.Wolff 編輯，第 5 版，1995)和Design of Prodrugs (H.Bundgaard 編輯，Elselvier, New Yorkl985)中描述的方法。
[0044]當用於治療組合物時，術語〃單位劑量〃指本領域已知的作為適於人類的單一劑量的物理性分散單元，各個單位劑量包含足夠產生期望治療效果的預定量活性成分以及需要的稀釋劑，即，載體或溶媒。
[0045]術語「單位劑量形式」指本領域已知的適於施用於人類和動物個體並分別包裝的物理性分散單元。各個單位劑量包含足夠產生期望治療效果的預定量活性成分以及需要的藥物載體或賦形劑。單位劑量形式可以部分施用或多份施用。單位劑量形式的實例包括安瓿、注射器，以及單獨包裝的片劑和膠囊。
[0046]術語「多劑量形式」是包裝在一個容器中的多個相同的單位劑量形式，以分離的單位劑量形式施用。多劑量形式的實例包括小瓶、片劑或膠囊的瓶、或品脫或加侖的瓶。 [0047]術語「腫瘤」指所有新生細胞生長和增殖，不論是惡性或良性的，以及所有前癌性和癌性細胞和組織。如本文使用的術語「新生的」指任何形式的異調節或未調節的細胞生長，不論是惡性或良性的，其導致不正常的組織生長。從而，「新生細胞」包括具有異調節或未調節的細胞生長的惡性和良性細胞。
[0048]術語"癌症"包括但不限於實體瘤和血液出現的腫瘤。術語"癌症"指皮膚組織、器官、血液和血管的疾病，包括但不限於膀胱、骨骼或血液、腦、乳腺、宮頸、胸、結腸、子宮內膜(endrometrium)、食道、眼、頭、腎、肝、淋巴結、肺、口腔、頸、卵巢、胰腺、前列腺、直腸、胃、辜丸、咽和子K的癌症。
[0049]術語「增生性」失調或疾病指在多細胞生物中對該多細胞生物產生傷害(即，不舒服或降低預期壽命)的一個或多個細胞團的不需要的細胞增殖。例如，如本文使用的增生性失調或疾病包括新生性失調和其它增生性失調。
[0050]術語「復發」指曾在治療後獲得癌症緩解的主體具有癌細胞的回覆。
[0051]術語「難治性」或「抵抗性」指即使在強化治療後，主體在身體內仍具有殘餘癌細胞的情況。
[0052]術語「化療 耐藥性的癌症」表示一類癌症，當所述癌症已經響應治療後其突然開始生長，因為癌細胞不響應化療效果。
[0053]術語「活性成分」和「活性物質」指單獨或組合一種或多種藥學上可接受的賦形劑對主體給藥用於治療、預防或減輕病況、失調或疾病的一種或多種症狀的化合物。如本文使用的「活性成分」和「活性物質」可以是本文描述的化合物的光活性異構體或同位素變體。
[0054]術語「藥物」、「治療劑」和「化療劑」指對主體給藥用於治療、預防或減輕病況、失調或疾病的一種或多種症狀的化合物或其藥物組合物。
[0055]除非另有說明，術語「一起給藥」和「與……組合」包括在非特定時間限制內同時、共同或連續給藥兩種或多種治療劑。在一個實施方式中，所述試劑在相同的時間存在於細胞或主體體內，或在相同的時間發揮其生物或治療效果。在一個實施方式中，治療劑在同一組合物或單位劑型中。在其它實施方式中，治療劑在分離的組合物或單位劑型中。在某些實施方式中，第一試劑可以在第二治療劑給藥前(例如，5分鐘、15分鐘、30分鐘、45分鐘、I小時、2小時、4小時、6小時、12小時、24小時、48小時、72小時、96小時、I周、2周、3周、4周、5周、6周、8周或12周前)給藥、基本上伴隨著第二治療劑給藥、或在其之後(例如，5分鐘、15分鐘、30分鐘、45分鐘、I小時、2小時、4小時、6小時、12小時、24小時、48小時、72小時、96小時、I周、2周、3周、4周、5周、6周、8周或12周之後)給藥。
[0056]如本文使用的，除非另有說明，術語「組合物」、「製劑」和「劑型」意為涵蓋了包含規定成分(如果有說明，以規定數量)的產品，以及直接或間接地來自規定數量的規定成分的任何產品。
[0057]術語「DNA甲基轉移酶抑制劑」指抑制甲基轉移至DNA的試劑。在一個實施方式中，DNA甲基轉移酶抑制劑為胞苷類似物。
[0058]本文所指的胞苷類似物意為涵蓋了胞苷類似物的游離鹼或其鹽、溶劑化物、水合物、共晶物、複合物、前藥、前體、代謝物和/或衍生物。在某些實施方式中，本文所指的胞苷類似物涵蓋了胞苷類似物的游離鹼或其鹽、溶劑化物、水合物，共晶物或複合物。在某些實施方式中，本文所指的胞苷類似物涵蓋了胞苷類似物的游離鹼或其藥學上可接受的鹽、溶劑化物或水化物。
[0059]術語「水合物」表示本文提供的化合物或其鹽，其進一步包括通過非共價分子間力結合的化學計量或非化學計量數量的水。
[0060]術語「溶劑化物」表示由一種或多種溶劑分子聯合本文提供的化合物形成的溶劑化物。術語「溶劑化物」包括水合物(例如，半水合物、單水合物、二水合物、三水合物、四水
合物等等)。
[0061]如本文使用的，除非另有說明，本文描述的化合物意為涵蓋了所有可能的立體異構體，除非指定了一個特別的立體化學。如果化合物的結構異構體可通過低能量壁壘互相轉換，該化合物可作為單一互變異構體或互變異構體混合物存在。其可採取質子互變異構的形式；或在例如含有芳香基團的化合物中採用所謂的價互變異構的形式。
[0062]在一個實施方式中，本文描述的化合物意為涵蓋了同位素富集的類似物。例如，化合物中的一個或多個氫位點可富集氘和/或氚。可在化合物特定位點富集的其它合適的同位素包括，但不限於，C-13、C-14、N-15、0-17和/或0_18。在一個實施方式中，本文描述的化合物可在多於一個位點富集相同或不同的同位素。
[0063]術語「約」或「大約」表示由本領域普通技術人員確定的對於一個特定值的可接受的誤差，其部分取決於該值是如何檢測或確定的。在某些實施方式中，術語「約」或「大約」表示在1、2、3或4個標準差之內。在某些實施方式中，術語「約」或「大約」表示在給定值或範圍的 50%、20%、15%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%或 0.05%之內。
[0064]羅米地辛
[0065]羅米地辛是由 Fujisawa Pharmaceuticals 從青紫色素桿菌(Chromobacteriumv1laceum)中分離的天然產物(公開的日本專利申請號64872,1990年12月11日授權的美國專利 4, 977, 138, Ueda 等人，J.Antib1t (Tokyo) 47:301-310,1994 ；Nakajima 等人,ExpCell Res241:126-133，1998 ;和冊02/20817 ;其均在此引入作為參考)。它是由四個胺基酸殘基(D-纈氨酸、D-半胱氨酸、脫氫酪氨酸和L-纈氨酸)和一種同時含有醯胺和酯鍵的新型酸(3-羥基-7-巰基-4-庚烯酸)組成的二環肽。除了使用發酵從C.v1laceum中獲得外，羅米地辛也可通過合成或半合成方式製備。由Kahn等人報導的羅米地辛全合成涉及14個步驟，產生18%總產率的羅米地辛(Kahn等人，J.Am.Chem.Soc.118:7237-7238,1996)。
[0066]羅米地辛的化學名稱是(IS, 4S, 7Z, 10S, 16E, 2IR) ~1~亞乙基-4，21-雙(1-甲基乙基)-2-氧雜-12，13- 二硫-5，8，20, 23-四氮雜二環[8.7.6] 二十三碳-16-烯-3，6，9，19，22-戊酮。經驗式為C24H36N4O6S2。分子量為540.71。在室溫下，羅米地辛是白色粉末。
[0067]其結構如下所示(式I):
[0068]
【權利要求】
1.一種治療化療耐藥性的癌症的方法，所述方法包括對所述治療有需要的患者給藥治療有效量的HDAC抑制劑和治療有效量的DNA脫甲基劑。
2.權利要求1的方法，其中化療耐藥性的癌症為三陰性乳腺癌(TNBC)。
3.權利要求1的方法，其中化療耐藥性的癌症為透明細胞腎細胞癌(ccRCC)。
4.權利要求1-3任一項的方法，其中HDAC抑制劑為羅米地辛。
5.權利要求1-4任一項的方法，其中DNA脫甲基劑為胞苷類似物。
6.權利要求1-5任一項的方法，其中胞苷類似物為阿扎胞苷或地西他濱。
7.權利要求1-6任一項的方法，其中HDAC抑制劑為羅米地辛，數量約0.5至約28mg/m2每天，DNA脫甲基劑為胞苷類似物，數量約10-150mg/m2每天。
8.權利要求1-7任一項的方法，其中胞苷類似物和羅米地辛靜脈給藥。
9.權利要求1-8任一項的方法，其中，胞苷類似物的數量為約15、25、50、75或10mg/m2每天。
10.權利要求1-9任一項的方法，其中羅米地辛的數量為約8、10、12或14mg/m2每天。
11.權利要求1-10之一的方法，其中HDAC抑制劑為羅米地辛，數量約10至約300mg/m2每天，DNA脫甲基劑為胞苷類似物，數量約10-150mg/m2每天。
12.權利要求11的方法，其中胞苷類似物靜脈給藥，羅米地辛口服給藥。
13.權利要求11的方法，其中胞苷類似物皮下給藥，羅米地辛口服給藥。
14.權利要求11的方法，其中胞苷類似物口服給藥，羅米地辛靜脈給藥。
15.權利要求11的方法，其中胞苷類似物和羅米地辛口服給藥。
16.權利要求11-15任一項的方法，其中羅米地辛的數量為約25至約200mg/m2每天。
17.權利要求11-16任一項的方法，其中給藥的羅米地辛的數量為約50、75或10mg/m2每天。
18.權利要求11-17任一項的方法，其中，胞苷類似物的數量為約15、25、50、75或100mg/m2 每天。
19.權利要求1-17任一項的方法，其中脫甲基劑為胞苷類似物，在一個28天的周期內給藥，數量約15、25、50、75或100mg/m2每天,給藥約3至約14天,然後是約21至約25天的停藥期，且其中HDAC抑制劑為羅米地辛，在28天周期的第1、8和15天給藥，數量約10或12mg/m2 每天。
20.權利要求5-19任一項的方法，其中胞苷類似物為地西他濱。
21.權利要求5-19任一項的方法，其中胞苷類似物為阿扎胞苷。
22.—種包含羅米地辛和胞苷類似物的藥物組合物。
23.權利要求22的藥物組合物，其中胞苷類似物為地西他濱。
24.權利要求22的藥物組合物，其中胞苷類似物為阿扎胞苷。
25.一種鑑定經診斷患有TNBC或ccRCC的患者在用羅米地辛和胞苷類似物聯合治療後具有增加的機率獲 得改善的總生存率的方法。
26.權利要求25的方法，其中胞苷類似物為地西他濱。
27.權利要求25的方法，其中胞苷類似物為阿扎胞苷。
【文檔編號】A61K38/15GK104039330SQ201280058094
【公開日】2014年9月10日 申請日期:2012年9月26日 優先權日:2011年9月26日
【發明者】約翰·A·科普蘭三世, 漢·溫·圖恩, 西蒙·詹姆士·庫珀, 蘿拉·安·馬洛 申請人:細胞基因公司