預測dlbcl患者對於抗-cd20治療的響應的製作方法
2023-11-30 03:55:41 2
預測dlbcl患者對於抗-cd20治療的響應的製作方法
【專利摘要】本發明提供涉及生物標誌物的方法、組合物和試劑盒，所述生物標誌物的表達水平與瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLCBL)患者的對與用CD20拮抗劑，例如CD20抗體，以利妥昔單抗為例治療的響應相關。本發明的方法、組合物和試劑盒可以用於鑑定可能或不可能對於抗CD20治療響應的DLBCL患者。
【專利說明】預測DLBCL患者對於抗-CD20治療的響應
[0001]發明背景
淋巴瘤是西方世界女性中第五大最常見的癌症，和男性中第六大最常見癌症(見Murawski 等 i2Q\^)Unresolved issues in diffuse large B~cell lymphomas, ExpertRev.Anticancer Ther., 10 (3):387)。90%的侵襲性淋巴瘤從B細胞起源,並分類為瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)。直到最近，對DLBCL的治療的接受的形式是CHOP方案:環磷醯胺、羥基柔紅黴素(多柔比星)、0ncOvin?(長春新鹼)和強的松的組合。1997年，FDA批准利妥昔單抗(Rituxan?)用於治療侵襲性非霍奇金淋巴瘤。利妥昔單抗是針對主要在B細胞的表面上發現的CD20蛋白的嵌合小鼠-人單克隆抗體。已證明利妥昔單抗在DLBCL中作為單個藥劑是有效的(參見 Coiff ier 等，(1998) Rituximab (anti~CD20 monoclonalantibody) for the treatment of patients with relapsing or refractory aggressivelymphoma: a mu I ti center Phase II study.Blood92 (6): 1927)。利妥昔單抗與 CHOP 方案相結合的後續研究證明了具有高的整體生存和無進展生存的高響應率，即使在更少輪數的CHOP方案治療下(參見Murawski等，(2010年)，同上)。然而，似乎接受利妥昔單抗的患者具有不同的響應率，其導致不同的生存時間。因此，存在鑑定將受益於抗⑶20治療如利妥昔單抗治療的患者，和可能對該治療響應不佳並將需要不同的治療代替的患者的需要。
[0002]發明概述
在一方面，本發明涉及預測具有瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)的患者是否可能表現對於抗CD20治療響應的方法，包括:確定表1和表2中所列的一種或多種基因在從患者獲得的樣品中的表達水平；基於患者的樣本中每個基因測量的表達水平與一組對照樣品之間的比較，預測患者是否可能表現出對抗-CD20治療的響應。在本實施方案的一些變化中，所述抗⑶20治療包括抗⑶20抗體，例如利妥昔單抗。在一些實施方案中，預測患者是否可能表現出對於抗CD20治療的 響應是基於患者的樣品中每個基因測量的表達水平與一組對照樣品之間的相似性。在該方法的某些實施方案中，確定表1中列出的所有基因的表達水平和/或確定表2中列出的所有基因的表達水平。在某些實施方案中，測量基因的表達是通過測量從每個基因轉錄的RNA的水平。在其它實施方案中，測量基因的表達是通過測量每個基因相應的蛋白水平。在另一個實施方案中，測量基因的表達是通過測量在生物學途徑中位於表1或表2中所列的基因的下遊的基因的RNA或蛋白的水平。在又一個實施方案中，測量基因的表達是通過測量表1或表2中所列的基因相應的蛋白的活性的產物水平。在某些實施方案中，對於抗CD20治療的響應構成治療開始後三年或更多年的生存。在某些實施方案中，使用一組對照樣品，其中相應基因的表達已被確定。在一些實施方案中，樣品的對照組包括代表性數量的表現出對於抗CD20治療的響應的患者和代表性數量的表現出對於抗⑶20治療無響應或響應不佳的患者。在某些實施方案中，預測患者是否可能表現出對於抗CD20治療的響應是使用統計方法進行。在某些實施方案中，統計方法是支持向量機的方法。在某些實施方案中，統計方法是K最近鄰方法。
[0003]在另一方面，本發明涉及一組診斷探針，用於預測具有瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)的患者是否可能表現出對於抗CD20治療的響應，包括用於檢測表1和表2中所列的一種或更多基因的表達的核酸探針或抗體。在某些實施方案中，診斷探針是核酸探針。在其它實施方案中，診斷探針是抗體。
[0004]在另一方面，本發明涉及包括核酸探針或抗體的一組診斷探針的體外應用，其用於在從患者獲得的樣品中檢測表1和表2所列的一種或多種基因的表達，以基於患者樣品中測量的每個基因的表達和一組對照樣品之間的比較，預測患者是否可能表現出對於抗⑶20治療的響應。在某些實施方案中，患者是瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)患者並且預測患者可能表現出對於抗CD20治療的響應會導致抗CD20抗體的施用。在另一個實施方案中，預測該患者可能不表現出對於抗CD20治療的響應導致不施用抗CD20抗體。在某些實施方案中，所述抗CD20抗體是利妥昔單抗。在某些實施方案中，檢測表1中列出的所有基因的表達和/或檢測表2中列出的所有基因的表達。在一些實施方案中，預測患者是否可能表現出對於抗CD20治療的響應是基於患者的樣品中每個基因測量的表達水平與一組對照樣品之間的相似性。在某些實施方案中，使用一組對照樣品，其中相應基因的表達已被確定。
[0005]在另一方面，本發明涉及試劑盒，其用於預測具有瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)的患者是否可能表現出對於抗CD20治療的響應,所述試劑盒包括一組診斷探針,包括用於檢測表1和表2中所列的一種或更多基因的表達的核酸探針或抗體；和用於檢測診斷探針的雜交和/或結合必需的試劑。在某些實施方案中，所述試劑盒包括用於在表1中所列基因的核酸探針和/或用於在表2中所列基因的核酸探針。在此實施方案的變式中，試劑盒包括用於表1和表2中所列基因表達的蛋白的抗體。在某些實施方案中，試劑盒進一步包括樣品的對照組，包括來自代表性數量的表現出對於抗CD20治療的響應的患者的樣品和來自代表性數量的表現出對於抗CD20治療無響應或響應不佳的患者的樣品。在某些實施方案中，使用一組對照樣品，其中相應基因的表達已被確定。在某些實施方案中，所述抗CD20治療是用利妥昔單抗治療。
[0006]附圖簡述
圖1是Kaplan-Meier 曲線，顯示對於實施例1中建立的模型用重新置換驗證的生存的差異。
[0007]圖2是Kaplan-Meier曲線,顯示對於實施例1中建立的模型的留一法交叉驗證的生存的差異。
[0008]圖3是KapIan-Meier曲線，對於實施例2中建立的模型用根據SVM法的分類構建。
[0009]圖4是Kaplan-Meier曲線，對於實施例2中建立的模型用根據SVM法分配的概率構建。
[0010]圖5是Kaplan-Meier曲線，顯示對於實施例3中的樣品的獨立的組的生存的差
巳
[0011]定義
術語「陣列」，「微陣列」和「DNA晶片」在本文中可互換使用，是指固定在基底上的不同的多核苷酸的陣列，所述基底如玻璃、塑料、紙、尼龍或其它類型的膜、過濾器、晶片，或任何其它合適的固體支持物。所述多核苷酸可以直接在基底上合成，或者與基底分開合成並然後固定到基底上。在另一方面，「陣列」或「微陣列」涉及抗體陣列，其提供了蛋白質表達的有效概況分析(efficient profiling),例如來自細胞裂解物的蛋白表達,和生物標誌物的有效概況分析，例如來自血清或尿的生物標誌物。本文中，抗體微陣列構成捕獲抗體的集合，所述抗體點在並固定在固體表面，如玻璃、塑料或矽晶片，用於檢測抗原的目的。可獲得包含用於特定類型的樣品所有可能存在的靶的診斷探針(即，核酸探針或抗體)的商品化的陣列。商品化的陣列可以包含用於基因組中存在的所有核苷酸序列的探針。或者，陣列可以包含僅用於表達的序列的探針。術語「定製的陣列」指包含僅用於所選靶的探針的陣列。在本發明的背景下，定製的陣列可包含用於預測對於抗CD20治療的響應的表達概況中的一些或所有基因的探針。
[0012]術語「生物標誌物」是指基因或核酸序列，其對於具體表型，如疾病是有關的。例如，生物標誌物可以是編碼蛋白的基因，其活化或失活導致疾病。在這種情況下，mRNA或蛋白質的存在能夠指示或預測該疾病。在另一個實例中，生物標誌物可以是與引起疾病的未知基因連鎖不平衡的序列多態性。在這種情況下，多態性的存在能夠指示或預測該疾病。在又一實例中，生物標記是基因中的體細胞突變，其中所述突變的存在與疾病相關。在這種情況下，mRNA突變的存在能夠指示或預測該疾病。在本發明的背景下，生物標誌物是其表達(通過mRNA、cDNA或蛋白的存在來測量)與對於抗CD20治療響應或不響應相關的基因。
[0013]術語「基因表達概況」或「基因表達特徵」指許多基因的表達水平的集合。概況中的基因是在具有不同表型的個體之間區分的標誌物。獲得這種區分因為每個基因的表達水平在具有不同表型個體的組間表現出統計學上的顯著差異。因此，每種表型表徵為概況中一些基因的降低的表達，和概況中其它基因的過表達。通過確定「表達概況」，即概況中一些或所有基因的表達，可以將表型分配到其表型還沒有自己表現出來的個體。在本發明的背景下，通過確定本文公開的基因表達概況，可以預測DLBCL患者對於抗⑶20治療的響應。
[0014]術語「雜交」指由於互補鹼基配對在兩個單鏈核酸之間的雙鏈體的形成。雜交可以在完全互補的核酸鏈或基本上(而非完全)互補的(包含一個或多個錯配的)核酸鏈之間發生。只有完全互補的核酸鏈才可雜交的條件稱為「嚴格的」雜交條件。基本上互補的核酸的穩定雙鏈體可以在較低嚴格的雜交條件下實現。核酸【技術領域】的技術人員可以使用例如，計算機軟體如 Visual OMP? (DNA Software, Inc., Ann Arbor, Mich.)確定雙鏈體的穩定性。反向平行的多核苷酸分子之間的主要相互作用典型地是鹼基特異性的，例如，A/T和G/C,通過Watson/Crick和/或Hoo`gsteen型氫鍵鍵合。在一些方面，雜交複合物可以由分子間的相互作用形成，或者可選地，可以從分子內相互作用形成。
[0015]術語「引物」指核酸，即多核苷酸或寡核苷酸，其在合適的條件下，在存在核酸前體和用於聚合的試劑的情況下，充當DNA合成起始的點。另外，引物可以以模板依賴性的方式引發核苷酸的聚合反應，以獲得與靶多聚核苷酸互補的多核苷酸。對於引物延伸的發生，弓丨物不需要與其模板序列具有100%互補性；具有小於100%互補性的引物可以足夠用於雜交和聚合酶延伸的發生。引物或者可以完全由靶雜交區域組成，或者可以包含額外的特徵，其允許擴增產物的檢測、固定或操作。
[0016]在本發明的一個方面中，術語「探針」指核酸，即多核苷酸或寡核苷酸，其在合適的條件下選擇性地雜交到靶核酸。核酸探針或者可以完全由靶雜交區域組成，或者可以包含額外的特徵，其允許探針和/或探針-靶雙鏈體的檢測、固定或操作。可以通過添加標籤、接頭、肽或在所選擇的格式中進行檢測測定所必需的任何其它基團，使核酸探針包含對其一級結構的修飾。用於標記的核酸探針的檢測系統包括，但不限於，螢光檢測、螢光猝滅(例如，當使用FRET對檢測系統時)、酶活性、吸光度、分子量、放射性、發光或允許報告物特異性結合的結合性質(例如，當報告物是抗體時)。典型地，核酸探針對核酸中包含的特異性靶序列充分互補，以在所選的雜交條件，例如但不限於，嚴格的雜交條件下，形成穩定的雜交複合物。在本發明的另一個方面，探針可以是抗體，而不是核酸，其對於目的核酸核苷酸序列或對於目的蛋白具有結合特異性。因此，根據本發明，「診斷探針」可以是適合用於檢測一個或多個靶基因表達的核酸探針或抗體，所述檢測或者通過將核酸探針在合適的條件下雜交到靶核酸以形成雜交複合物，或者通過在合適的條件下將抗體探針結合到靶核酸或靶蛋白以形成抗原-抗體複合物。
[0017]本文中提到的「抗體」包括多克隆抗體和單克隆抗體，及其片段，例如Fv、Fab和F(ab)2片段，其能夠結合抗原或半抗原。本文中，抗原或半抗原可以是蛋白質或核酸(即RNA或DNA)。還包括單鏈抗體和人源化的雜交抗體，其中表現出所需抗原特異性的非人供體抗體的胺基酸序列與人受體抗體的序列相結合。供體序列將通常包括至少供體的抗原結合胺基酸殘基，但也可包括供體抗體的其它結構和/或功能相關的胺基酸殘基。這樣的雜交物可以通過本領域中熟知的多種方法製備。優選地，所述配體特異性結合抗體肽或多肽。特異性結合指配體或試劑不應該實質上與存在於待分析樣品中的另一種肽、多肽、核酸或物質結合，即交叉反應。優選地，所述特異性結合的肽或多肽，應以比任何其它相關肽或多肽高至少3倍，更優選高至少10倍，並且甚至更優選高至少50倍的親和力結合。配體的結合可以通過本領域中已知的任何方法測量。優選地，所述方法是半定量或定量的。
[0018]術語「探針組」指的是一組獨特的核酸探針或抗體，其能夠檢測一種或多種標誌物。可在擴增/檢測反應OM^_pcr、lamp、nasba、rdc、pear)中使用一組核酸探針，用於確定一種或多種基因的表達水平。或者，如果抗體用作探針，可以使用一組抗體，例如，在免疫測定或ELISA中，用於確定一種或多種基因的表達。在一些實施方案中，探針組可以在陣列或微陣列上提供。典型地，微陣列包含若干個探針組，用於檢測每個標誌物或基因。在商品化的微陣列中，每個探針組與一個序列相關，該序列在公共資料庫中可以通過唯一的登記號搜索到。
[0019]術語「靶序列」或「靶」指待分析的核酸區域。當抗體用作診斷探針的情況下，「靶」可以指核酸的區域或者蛋白質的區域，其是待分析的區域，並且其提供了用於抗體結合的抗原。
[0020]術語「核酸」、「多核苷酸」和「寡核苷酸」指靶序列、引物和探針。該術語不受長度的限制，並且對於脫氧核糖核苷酸(單鏈或雙鏈DNA)、核糖核苷酸(RNA)，以及嘌呤或嘧啶鹼基(包括腺苷、鳥苷、胞苷、胸腺嘧啶和尿嘧啶以及這些鹼基的修飾物)的任何其它N-糖苷的線性聚合物是通用的。
[0021]術語「對治療的響應」,指歸於治療的益處。響應可以通過測量臨床相關參數來評估，所述臨床相關參數如腫瘤縮小、整體生存或無疾病進展生存的長度。例如，臨床相關參數可以是治療開始後生存的長度。可認為已經生存了一定時間，例如至少三年的患者對治療有響應。認為沒有生存超過三年的患者對治療沒有響應或響應不佳。
[0022]術語「樣品」指包含或推測包含核酸或蛋白質的任何組合物。這包括從個體分離的組織或液體的樣品，例如，皮膚、血漿、血清、脊髓液、淋巴液、滑液、尿液、淚液、血細胞、器官和腫瘤，包括新鮮冷凍的組織和福馬林固定的石蠟包埋的組織(FFPET)，並且還包括由採自個體的細胞建立的體外培養的樣品，和從中分離的核酸或蛋白。
[0023]術語「訓練組」或「對照組」指用於建立兩個變量之間的相關性的一組樣品。例如，訓練組是用於建立基因表達和患者的狀況之間的相關性的一組患者樣本。在本發明的背景下，訓練組是來自接受抗CD20治療的DLBCL患者的一組樣品，對其可獲得生存信息。訓練組被用於建立表達概況和生存之間的相關性。
[0024]術語「測試組」指用於驗證使用訓練組建立的相關性的一組樣品。例如，測試組是來自對其基因表達和患者的狀況都已知的患者的一組樣品。該組被用於驗證使用訓練組確定的相關性是否將正確地預測患者的狀況。在本發明的背景下，測試組是來自接收抗⑶20治療的患者的一組獨立的樣品，對其可獲得生存信息。測試組用於測量在概況中的基因表達並測試實際的生存數據是否與通過測量基因表達所作的預測相匹配。
[0025]術語「測試樣品」指待對具體參數進行測試的患者樣本。
[0026]發明詳述
本發明基於以下發現:某些基因的表達預測瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)的患者對於抗⑶20治療的響應。具體地，發現一些基因在對利妥昔單抗治療具有響應的一組DLBCL患者和對利妥昔單抗治療響應不佳的患者之間表現出差異表達，其中所述響應通過治療後生存的長度進行測量。本發明包括這些基因和包含這些基因的基因表達概況。本發明進一步包括所述基因和基因表達概況用於預測DLBCL患者對於抗CD20治療的響應的用途。
[0027]在DLBCL患者中鑑定為在對於抗⑶20治療響應者和響應不佳者中差異表達的基因列於表 I 和 2。在表 I 和 2 中，列「PS ID」列出了在 Affymetrix GeneChip? Human GenomeU133 Plus 2.0 陣列(Affymetrix, Santa Clara, Calif.)中的探針組的識別編碼。列「NCBI」列出了相應的公共參考編號(NCBI登錄號)。列「基因名稱」列出了基因的名稱(如果有的話)。列「基因符號」列出了基因符號(如果有的話)。表1中的列「P-值」列出了統計學 P-值。表 2 中的列 「FDR_BH」 列出了根據 Benjamini Y.和 Hochberg, Y., (1995)J Royal Stat.Soc.Ser.B 57:289`中描述的方法計算的統計錯誤發現率(FDR)的值。
[0028]表1
實施例1中鑑定的預測性標誌物
【權利要求】
1.預測具有瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)的患者是否可能表現對於抗CD20治療的響應的方法，所述方法包括: (a)在從患者獲得的樣品中確定一個或多個選自下列的基因的表達水平:U2AF1、RNF2、ZC3H7B、CCN1、PSMDl1、ABUMl、GYG2、CAMK2G、NFl、編碼 cDNA 克隆 EUROIMAGE 826033的基因(NCBI 登錄號 BE858194)、TRIM66, FBX021、MKNK2、FYTTDU GET4、CABLES2、FMNL3、C22orf27、TBCEL, ZNF707、對應 NCBI 登錄號 AI763196 的基因、CSTB, BAHCCU L0C723809、NPIP、編碼 CDNA FLJ40566 fis 的基因(NCBI 登錄號 AL576118)、L0C730367、RXFP2、MGC24125、編碼在惡性黑色素瘤克隆麗A2中差異表達的mRNA的基因(NCBI登錄號AJ293390)、PTP4A1、OSBP, HNRNPD, AHCYLl、BMP2K、IDS、SERPINB9、CSRP2BP、CD58、HERC4、MAGOH、TMB頂4、SFRS12、FAS、ZNF333、對應 NCBI 登錄號 Al 127295 的基因、USP6、CHD6、L0C653160、對應 NCBI 登錄號 R64696 的基因、SRPR、MIR21、ARHGAP18、對應 NCBI 登錄號AW004885 的基因、CBFA2T2、--ΜΡ3、CTBS, USP16、RASAl 和 YJEFN3 ;和 (b)基於步驟(a)中測量的在患者的樣品中的每個基因的表達水平與一組對照樣品之間的比較，預測患者是否可能表現出對於抗CD20治療的響應。
2.根據權利要求1的方法，其中所述抗CD20治療包括抗CD20抗體。
3.根據權利要求1或2中任一項的方法，其中所述抗CD20抗體是利妥昔單抗。
4.根據權利要求1-3中任一項的方法，其中在步驟(a)中確定表1中列出的所有基因的表達水平和/或其中在步驟(a)中確定表2中列出的所有基因的表達水平。
5.根據權利要求1-4中任一項的方法，其中通過測量由每個基因轉錄的RNA的水平來測量所述基因的表達。
6.根據權利要求1-4中任一項的方法，其中通過測量每個基因對應的蛋白的水平來測量所述基因的表達。
7.根據權利要求1-4中任一項的方法，其中通過測量在生物學途徑中位於表1或表2中所列的基因的下遊的基因的RNA或蛋白的水平來測量所述基因的表達。
8.根據權利要求1-4中任一項的方法，其中通過測量表1或表2中所列的基因對應的蛋白的活性的產物來測量所述基因的表達。
9.根據權利要求1-8中任一項的方法，其中所述樣品的對照組包括代表性數量的表現出對於抗CD20治療的響應的患者和代表性數量的表現出對於抗CD20治療無響應或響應不佳的患者。
10.一組診斷探針，其用於預測具有瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)的患者是否可能表現出對於抗CD20治療的響應，包括用於檢測一個或多個選自下列的基因的表達的核酸探針或抗體:U2AF1、RNF2、ZC3H7B、CCN1、PSMDl1、ABUMl、GYG2、CAMK2G、NFl、編碼 cDNA 克隆 EUR0IMAGE 826033 的基因(NCBI 登錄號 BE858194)、TRIM66, FBX021、MKNK2、FYTTDUGET4、CABLES2、FMNL3、C22orf27、TBCEL, ZNF707、對應 NCBI 登錄號 AI763196 的基因、CSTB、BAHCC1、L0C723809、NPIP、編碼 CDNA FLJ40566 fis 的基因(NCBI 登錄號 AL576118)、L0C730367、RXFP2、MGC24125、編碼在惡性黑色素瘤克隆MM A2中差異表達的mRNA的基因(NCBI 登錄號 AJ293390)、PTP4A1、OSBP、HNRNPD, AHCYLl、BMP2K、IDS、SERPINB9、CSRP2BP、CD58、HERC4、MAG0H、TMBM4、SFRS12、FAS、ZNF333、對應 NCBI 登錄號 AI127295 的基因、USP6、CHD6、L0C653160、對應 NCBI 登錄號 R64696 的基因、SRPR、MIR21、ARHGAP18、對應 NCBI 登錄號 AW004885 的基因、08卩六212、11]\^3、0^5、舊？16、狀5六1 和 YJEFN3。
11.包括用於在從患者獲得的樣品中檢測一個或多個選自下列的基因的表達的核酸探針或抗體的一組診斷探針的體外用途:U2AF1、RNF2、ZC3H7B、CCN1、PSMDl1、ABUMl、GYG2、CAMK2G、NFl、編碼 cDNA 克隆 EUROIMAGE 826033 的基因(NCBI 登錄號 BE858194)、TRIM66,FBX021、MKNK2、FYTTD1、GET4、CABLES2、FMNL3、C22orf 27、TBCEL, ZNF707、對應 NCBI 登錄號AI763196 的基因、CSTB、BAHCCl、L0C723809、NPIP、編碼 CDNA FLJ40566 fis 的基因(NCBI登錄號AL576118)、L0C730367、RXFP2、MGC24125、編碼在惡性黑色素瘤克隆MM A2中差異表達的 mRNA 的基因(NCBI 登錄號 AJ293390)、PTP4A1、OSBP, HNRNPD, AHCYLl、BMP2K、IDS、SERPINB9、CSRP2BP、CD58、HERC4、MAGOH、TMBIM4, SFRS12、FAS、ZNF333、對應 NCBI 登錄號Al 127295 的基因、USP6、CHD6、L0C653160、對應 NCBI 登錄號 R64696 的基因、SRPR、MIR21、ARHGAP18,對應 NCBI 登錄號 AW004885 的基因、CBFA2T2、--ΜΡ3、CTBS, USP16、RASAl 和YJEFN3，其用於基於患者的樣品中測量的每個基因的表達與一組對照樣品之間的比較，預測患者是否可能表現出對於抗CD20治療的響應。
12.根據權利要求11的用途，其中所述患者是瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)患者並且其中預測患者可能表現出對於抗CD20治療的響應導致抗CD20抗體，優選利妥昔單抗的施用。
13.試劑盒，其用於預測具有瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)的患者是否可能表現對於抗CD20治療的響應，所述試劑盒包括: (a)一組診斷探針，其包括用於檢測一個或多個選自下列的基因的表達的核酸探針或抗體:U2AF1、RNF2、ZC3H7B、CCN1、PSMDl1、ABLIMU GYG2、CAMK2G、NFl、編碼 cDNA 克隆 EUROIMAGE 826033 的基因(NCBI 登錄號 BE858194)、TRIM66, FBX021、MKNK2、FYTTDl、GET4、CABLES2、FMNL3、C22orf27、TBCEL, ZNF707、對應 NCBI 登錄號 AI763196 的基因、CSTB、BAHCC1 、L0C723809、NPIP、編碼 CDNA FLJ40566 fis 的基因(NCBI 登錄號 AL576118)、L0C730367、RXFP2、MGC24125、編碼在惡性黑色素瘤克隆MM A2中差異表達的mRNA的基因(NCBI 登錄號 AJ293390)、PTP4A1、OSBP、HNRNPD, AHCYLl、BMP2K、IDS、SERPINB9、CSRP2BP、CD58、HERC4、MAG0H、TMBM4、SFRS12、FAS、ZNF333、對應 NCBI 登錄號 AI127295 的基因、USP6、CHD6、L0C653160、對應 NCBI 登錄號 R64696 的基因、SRPR、MIR21、ARHGAP18、對應 NCBI 登錄號 AW004885 的基因、CBFA2T2、--ΜΡ3、CTBS, USP16、RASAl 和 YJEFN3 ； (b)檢測所述診斷探針的雜交和/或結合必需的試劑。
14.根據權利要求13的試劑盒，其包括用於在表1中所列基因的核酸探針和/或用於在表2中所列基因的核酸探針。
15.根據權利要求13的試劑盒，其包括用於由表1和2中所列基因表達的蛋白的抗體。
【文檔編號】G01N33/574GK103717755SQ201280038561
【公開日】2014年4月9日 申請日期:2012年8月4日 優先權日:2011年8月8日
【發明者】Y.李, C-J.利, W-m.劉, Y.C.邰 申請人:霍夫曼-拉羅奇有限公司