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用於治療淋病奈瑟球菌感染的三環含氮化合物的製作方法

2024-04-05 22:27:05

本發明是在美國政府支持下完成,即美國衛生和人類服務部公共衛生的防範與突發事件應對中心(The United States Of America Department Of Health And Human Services Assistant Secretary For Preparedness And Response)、美國衛生和人類服務部公共衛生的防範與突發事件應對中心內的生物醫學高級研究與發展局(Biomedical Advanced Research and Development Authority,BARDA)的支持下完成的,資助合同號:HHSO100201300011C。美國政府對本發明有一定的權利。

技術領域

本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥本文所述的新的三環含氮化合物及相應的藥物組合物。



背景技術:

淋病是全球第二大最常見的細菌性性傳播感染,並且仍然是全世界的重要臨床和公共衛生問題。性傳播和圍產期傳播後的淋球菌感染是全世界發病率的主要原因[Barry,2009]。感染可以涉及宮頸炎、直腸炎、尿道炎、盆腔炎性疾病、附睪炎、睪丸炎、前列腺炎、結膜炎、咽炎和其他播散性淋球菌性疾病。

淋病奈瑟球菌也被稱為淋球菌(複數形式:gonococci,單數形式:gonococcus)或GC(縮寫),是引起性傳播感染淋病的革蘭氏陰性咖啡豆形雙球菌的一種。[1]

併發症包括不育、異位妊娠、慢性盆腔疼痛、不良妊娠結局,以及人類免疫缺陷病毒的易感性和傳播性增加[Workowski,2008;Barry,2009]。

由沙眼衣原體和淋病奈瑟球菌引起的感染可導致宮頸炎、尿道炎、直腸炎和盆腔炎性疾病(PID),並且它們的併發症可顯著損害婦女的生殖功能。這些感染是非自願不孕和異位妊娠的主要可預防的原因,並且可以影響包括低出生體重、早產、胎兒死亡和先天性感染在內的妊娠結局。衣原體和淋球菌感染也可以增加對HIV的易感性和促進HIV的傳播。Kimberly Workowski.2013American College of Physicians,Annals of Internal Medicine,In the Clinic。

多年來已經使用多種抗微生物劑來治療淋病;然而,淋病的有效治療選擇已經迅速減少,這是因為對先前使用或考慮的第一線的許多藥物(即青黴素、窄譜頭孢菌素、四環素、大環內酯類和氟喹諾酮類)的抗微生物劑耐藥性的出現和全世界擴散[Workowski,2008;Barry,2009]。

目前疾病控制和預防中心(CDC)推薦的單純性淋病治療方案是使用單一肌內劑量的頭孢曲松加單一劑量的阿奇黴素或7天多西環素方案的組合治療[CDC,2012]。雖然CDC指南可能有助於延遲頭孢菌素耐藥性淋病的出現,但它們不能消除這種即將來臨的威脅。

因此,CDC敦促科學家和私營部門藥物開發商優先鑑定和研究新的、有效的淋病的抗生素治療選擇[CDC,2013]。

WO02/08224、WO02/50061、WO02/56882、WO02/96907、WO2003087098、WO2003010138、WO2003064421、WO2003064431、WO2004002992、WO2004002490、WO2004014361、WO2004041210、WO2004096982、WO2002050036、WO2004058144、WO2004087145、WO2006002047、WO2006014580、WO2006010040、WO2006017326、WO2006012396、WO2006017468、WO2006020561、WO2006081179、WO2006081264、WO2006081289、WO2006081178、WO2006081182、WO01/25227、WO02/40474、WO02/07572、WO2004024712、WO2004024713、WO2004035569、WO2004087647、WO2004089947、WO2005016916、WO2005097781、WO2006010831、WO2006021448、WO2006032466、WO2006038172、WO2006046552、WO06099884、WO06126171、WO06137485、WO06105289、WO06125974、WO06134378、WO07016610、WO07081597、WO07071936、WO07115947、WO07118130、WO07122258、WO08006648、WO08003690和WO08009700公開了具有抗菌劑活性的喹啉、二氮雜萘、嗎啉、環己烷、哌啶和哌嗪衍生物。WO2004104000公開了能夠選擇性作用於大麻素受體的三環稠環化合物。WO2003048081、WO2003048158和US2003232804公開了甘氨醯胺作為Xa因子抑制劑。



技術實現要素:

總體上,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥如本文所述的新的三環含氮化合物及其相應的藥物組合物。

發明詳述

化合物

總體上,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥如本文所述的新的三環含氮化合物及其相應的藥物組合物。

具體地,本發明提供了式(I)化合物或其藥學上可接受的鹽和/或N-氧化物的用途:

其中:

Z1和Z2獨立地選自CH和N;

R1a和R1b獨立地選自氫;滷素;氰基;(C1-6)烷基;(C1-6)烷基硫基;三氟甲基;三氟甲氧基;羧基;其任選被(C1-6)烷基或(C1-6)烷氧基-取代的(C1-6)烷基取代的羥基;(C1-6)烷氧基-取代的(C1-6)烷基;羥基(C1-6)烷基;氨基,其任選在N上被一個或兩個(C1-6)烷基、甲醯基、(C1-6)烷基羰基或(C1-6)烷基磺醯基取代;和氨基羰基,其中所述氨基任選被(C1-4)烷基取代;

條件是當Z2或Z1分別為N時,R1a和R1b為H;

R2為氫或(C1-4)烷基,或與R6一起形成如下定義的Y;

A為基團(i):

其中:R3如針對R1a和R1b所定義,或R3為氧代且n為1或2:

或A為基團(ii)

W1、W2和W3為CR4R8;

或W2和W3為CR4R8且W1代表W3和N之間的鍵;

X為O、CR4R8或NR6;

一個R4如針對R1a和R1b所定義且剩餘的R4和R8為氫,或一個R4和R8一起為氧代且剩餘的R4和R8為氫;

R6為氫或(C1-6)烷基;或與R2一起形成Y;

R7為氫;滷素;任選被(C1-6)烷基取代的羥基;或(C1-6)烷基;

Y為CR4R8CH2;CH2CR4R8;(C=O);CR4R8;CR4R8(C=O);或(C=O)CR4R8;

或當X為CR4R8時,R8和R7一起代表鍵;

U選自CO和CH2,且

R5為任選取代的雙環碳環或雜環系統(B):

各環中含有至多四個雜原子,其中

(a)和(b)環的至少一個環為芳香環;

當X1為芳香環的一部分時,X1為C或N,或當X1為非芳香環的一部分時,X1為CR14;

當X2為芳香環或非芳香環的一部分時,X2為N、NR13、O、S(O)x、CO或CR14,或當X2為非芳香環的一部分時,X2還可為CR14R15;

X3和X5獨立地為N或C;

Y1為0至4個原子的連接基,其中當各原子為芳香環或非芳香環的一部分時,各原子獨立地選自N、NR13、O、S(O)x、CO和CR14,或當各原子為非芳香環的一部分時,各原子還可為CR14R15;

Y2為2至6個原子的連接基,其中當Y2的各原子為芳香環或非芳香環的一部分時,Y2的各原子獨立地選自N、NR13、O、S(O)x、CO和CR14,或當Y2的各原子為非芳香環的一部分時,Y2的各原子還可以為CR14R15;

各個R14和R15獨立地選自:H;(C1-4)烷基硫基;滷素;羧基(C1-4)烷基;(C1-4)烷基;(C1-4)烷氧基羰基;(C1-4)烷基羰基;(C1-4)烷氧基(C1-4)烷基;羥基;羥基(C1-4)烷基;(C1-4)烷氧基;硝基;氰基;羧基;氨基或氨基羰基,其任選被(C1-4)烷基單-或二-取代;或

R14和R15可一起表示氧代;

各個R13獨立地為H;三氟甲基;任選被羥基、(C1-6)烷氧基、(C1-6)烷基硫基、滷素或三氟甲基取代的(C1-4)烷基;(C2-4)烯基;(C1-4)烷氧基羰基;(C1-4)烷基羰基;(C1-6)烷基磺醯基;氨基羰基,其中所述氨基任選被(C1-4)烷基單或二取代;且

各個X獨立地為0、1或2。

本發明還提供了藥物組合物,其包含式(I)化合物或其藥學上可接受的鹽和/或N-氧化物,和藥學上可接受的載體。

一方面,Z1和Z2之一為CH或N且另一個為CH。

在具體的方面中:

(i)Z1和Z2均為CH;

(ii)Z1為N和Z2為CH;或

(iii)Z1為CH和Z2為N。

在具體的方面中,R1a和R1b獨立地為氫、(C1-4)烷氧基、(C1-4)烷基硫基、(C1-4)烷基、氰基、羧基、羥基甲基或滷素;更具體地,為氫、甲氧基、甲基、氰基或滷素。

在具體實施方案中,R1a和R1b為氫。

在具體的方面中,R2為氫。

R3的具體實例包括氫;任選取代的羥基;任選取代的氨基;滷素;(C1-4)烷基;1-羥基-(C1-4)烷基;任選取代的氨基羰基。更具體地,R3為氫;CONH2;1-羥基烷基,例如CH2OH;任選取代的羥基,例如甲氧基;任選取代的氨基;和滷素,具體為氟。最具體地,R3為氫、羥基或氟。

在具體的方面中,當A為(ia)時,n為1。在其他方面中,R3在3-或4-位。在更具體的方面中,A為(ia)、n為1且R3在3-位,更具體地,R3與NR2基團成順式。在具體實施方案中,A為基團(ia),其中n為1且R3為氫或羥基。更具體地,其中A為3-羥基-哌啶-4-基,其構型為(3R,4S)或(3S,4R)。或者且更具體地,其中A為哌啶-4-基,其構型為(3R,4S)。

在可選的更具體的方面中,當A為(ia)時,n為1、R3在4-位且為甲基。

在具體的方面中,當A為(ii)時,X為CR4R8,其中R8為H且R4為H或OH,更具體地,與R7成反式的OH。在其他方面中,W1為鍵。在另一方面中,R7為H。在其他方面中,W1為鍵,W2和W3均為CH2且R7為H。在具體的方面中,當A為4-羥基吡咯烷-3-基甲基時,其構型為(3S,4S)。在具體的方面中,當A為吡咯烷-3-基甲基時,其構型為3S。

在具體的方面中,當A為(ii)時,X為O、R7為H且W1、W2和W3各為CH2。

在具體實施方案中,U為CH2。

在具體實施方案中,R5為具有8-11個環原子且包括2-4個雜原子的芳香雜環(B),其中至少一個雜原子為N或NR13,其中,在具體實施方案中,Y2包括2-3個雜原子,其中一個為S且1-2個為N,且其中一個N連接至X3。

在可選實施方案中,所述雜環(B)具有環(a)芳香環,其選自任選取代的苯並、吡啶並、噠嗪並和嘧啶並,和環(b)非芳香環,且Y2具有3-5個原子,更具體地,4個原子,其中包括至少一個雜原子,且O、S、CH2或NR13連接至X5,其中R13不是氫,或者NHCO經N連接至X3,或O、S、CH2或NH連接至X3。在具體的方面中,所述環(a)含有芳香氮,和更具體地,環(a)為吡啶或吡嗪。環(B)的實例包括任選取代的以下基團:

(a)和(b)均為芳香環

1H-吡咯並[2,3-b]-吡啶-2-基、1H-吡咯並[3,2-b]-吡啶-2-基、3H-咪唑並[4,5-b]-吡啶-2-基、3H-喹唑啉-4-酮-2-基、苯並咪唑-2-基、苯並[1,2,3]-噻二唑-5-基、苯並[1,2,5]-噁二唑-5-基、苯並呋喃-2-基、苯並噻唑-2-基、苯並[b]噻吩-2-基、苯並噁唑-2-基、色烯-4-酮-3-基、咪唑並[1,2-a]吡啶-2-基、咪唑並-[1,2-a]-嘧啶-2-基、吲哚-2-基、吲哚-6-基、異喹啉-3-基、[1,8]-二氮雜萘-3-基、噁唑並[4,5-b]-吡啶-2-基、喹啉-2-基、喹啉-3-基、喹喔啉-2-基、萘-2-基、1,3-二氧代-異吲哚-2-基、1H-苯並三唑-5-基、1H-吲哚-5-基、3H-苯並噁唑-2-酮-6-基、3H-苯並噁唑-2-硫酮-6-基、3H-苯並噻唑-2-酮-5-基、3H-喹唑啉-4-酮-6-基、吡啶並[1,2-a]嘧啶-4-酮-3-基(4-氧代-4H-吡啶並[1,2-a]嘧啶-3-基)、苯並[1,2,3]噻二唑-6-基、苯並[1,2,5]噻二唑-5-基、苯並[1,4]噁嗪-2-酮-3-基、苯並噻唑-5-基、苯並噻唑-6-基、噌啉-3-基、咪唑並[1,2-b]噠嗪-2-基、吡唑並[1,5-a]吡嗪-2-基、吡唑並[1,5-a]吡啶-2-基、吡唑並[1,5-a]嘧啶-6-基、吡唑並[5,1-c][1,2,4]三嗪-3-基、吡啶並[1,2-a]嘧啶-4-酮-2-基(4-氧代-4H-吡啶並[1,2-a]嘧啶-2-基)、喹唑啉-2-基、喹喔啉-6-基、噻唑並[3,2-a]嘧啶-5-酮-7-基、噻唑並[5,4-b]吡啶-2-基、噻吩並[3,2-b]吡啶-6-基、噻唑並[5,4-b]吡啶-6-基、噻唑並[4,5-b]吡啶-5-基、[1,2,3]噻二唑並[5,4-b]吡啶-6-基、2H-異喹啉-1-酮-3-基(1-氧代-1,2-二氫-異喹啉-3-基)、[1,2,3]噻二唑並[5,4-b]吡啶-6-基,

→為連接點

(a)為非芳香環

(2S)-2,3-二氫-1H-吲哚-2-基、(2S)-2,3-二氫-苯並[1,4]二氧雜環己二烯-2-基、3-(R,S)-3,4-二氫-2H-苯並[1,4]噻嗪-3-基、3-(R)-2,3-二氫-[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-b]吡啶-3-基、3-(S)-2,3-二氫-[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-b]吡啶-3-基、2,3-二氫-苯並[1,4]二噁烷-2-基、3-取代的-3H-喹唑啉-4-酮-2-基,

→為連接點

(b)為非芳香環

1,1,3-三氧代-1,2,3,4-四氫l6-苯並[1,4]噻嗪-6-基、苯並[1,3]二氧雜環戊烯-5-基、2,3-二氫-苯並[1,4]二氧雜環己二烯-6-基、3-取代的-3H-苯並噁唑-2-酮-6-基、3-取代的-3H-苯並噁唑-2-硫酮-6-基、3-取代的-3H-苯並噻唑-2-酮-6-基、4H-苯並[1,4]噁嗪-3-酮-6-基(3-氧代-3,4-二氫-2H-苯並[1,4]噁嗪-6-基)、4H-苯並[1,4]噻嗪-3-酮-6-基(3-氧代-3,4-二氫-2H-苯並[1,4]噻嗪-6-基)、4H-苯並[1,4]噁嗪-3-酮-7-基、4-氧代-2,3,4,5-四氫-苯並[b][1,4]硫氮雜-7-基、5-氧代-2,3-二氫-5H-噻唑並[3,2-a]嘧啶-6-基、1H-吡啶並[2,3-b][1,4]噻嗪-2-酮-7-基(2-氧代-2,3-二氫-1H-吡啶並[2,3-b]噻嗪-7-基)、2,3-二氫-1H-吡啶並[2,3-b][1,4]噻嗪-7-基、2-氧代-2,3-二氫-1H-吡啶並[3,4-b]噻嗪-7-基、2,3-二氫-[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-b]吡啶-6-基、2,3-二氫-[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基、2,3-二氫-[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-b]吡啶-7-基、3,4-二氫-2H-苯並[1,4]噁嗪-6-基、3,4-二氫-2H-苯並[1,4]噻嗪-6-基、3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基、3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基、3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基、3,4-二氫-1H-喹啉-2-酮-7-基、3,4-二氫-1H-喹喔啉-2-酮-7-基、6,7-二氫-4H-吡唑並[1,5-a]嘧啶-5-酮-2-基、5,6,7,8-四氫-[1,8]二氮雜萘-2-基(1,2,3,4-四氫-[1,8]二氮雜萘-7-基)、2-氧代-3,4-二氫-1H-[1,8]二氮雜萘-6-基、6-氧代-6,7-二氫-5H-噠嗪並[3,4-b][1,4]噻嗪-3-基(6-氧代-6,7-二氫-5H-8-硫雜-1,2,5-三氮雜-萘-3-基)、2-氧代-2,3-二氫-1H-吡啶並[3,4-b][1,4]噁嗪-7-基、2-氧代-2,3-二氫-1H-吡啶並[2,3-b][1,4]噁嗪-7-基、6,7-二氫-[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-d]嘧啶-2-基、[1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基、3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基、2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基、6,7-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]噠嗪-3-基、5,6,7,8-四氫異喹啉-3-基、6,7-二氫-5H-環戊二烯並[c]吡啶-3-基、1,3-二氫呋喃並[3,4-c]吡啶-6-基、3,4-二氫-2H-[1,4]氧硫雜環庚二烯並[2,3-c]吡啶-8-基、[1,3]氧硫雜環戊烯並[4,5-c]吡啶-6-基、6,7-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]噠嗪-3-基、6,7-二氫-5H-吡喃並[2,3-c]噠嗪-3-基、5,6-二氫呋喃並[2,3-c]噠嗪-3-基、2,3-二氫呋喃並[2,3-c]吡啶-5-基、2-取代的1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噁嗪-7(6H)-酮、2-取代的5,6-二氫吡啶並[2,3-d]嘧啶-7(1H)-酮、7-取代的2H-色烯-2-酮、7-取代的2H-吡喃並[2,3-b]吡啶-2-酮、2-取代的6,7-二氫-5H-吡喃並[2,3-d]嘧啶、8-取代的2H-吡啶並[1,2-a]嘧啶-2-酮、2,3-二氫-1-苯並呋喃-5-基、1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噻嗪-7(6H)-酮-2-基、3,4-二氫-2H-色烯-7-基、2,3-二氫-1-苯並呋喃-6-基、3,4-二氫-2H-色烯-6-基、3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基、3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基、6,7-二氫-5H-噻吩並[3,2-b]吡喃-2-基、2,3,4,5-四氫-1,5-苯並硫氮雜-7-基,

其中R為任選取代基

→為連接點

在一些實施方案中,當R13在環(a)中時,R13為H,或當R13在環(b)中時,R13還可為(C1-4)烷基,例如甲基或異丙基。更具體地,在環(b)中,當NR13連接至X3時,R13為H,和當NR13連接至X5時,R13為(C1-4)烷基。

在其他實施方案中,R14和R15獨立地選自氫、滷素、羥基、(C1-4)烷基、(C1-4)烷氧基、硝基和氰基。更具體地,R15為氫。

更具體地,各個R14選自氫、氯、氟、羥基、甲基、甲氧基、硝基和氰基。更具體地,R14選自氫、氟或硝基。

最具體地,R14和R15均為H。

具體基團R5包括:

[1,2,3]噻二唑並[5,4-b]吡啶-6-基

1H-吡咯並[2,3-b]吡啶-2-基

2,3-二氫-[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-b]吡啶-6-基

2,3-二氫-[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-b]吡啶-7-基

2,3-二氫-[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基

2,3-二氫-苯並[1,4]二氧雜環己二烯-6-基

2-氧代-2,3-二氫-1H-吡啶並[2,3-b][1,4]噁嗪-7-基

2-氧代-2,3-二氫-1H-吡啶並[2,3-b][1,4]噻嗪-7-基

3,4-二氫-2H-苯並[1,4]噁嗪-6-基

3-甲基-2-氧代-2,3-二氫-苯並噁唑-6-基

3-氧代-3,4-二氫-2H-苯並[1,4]噁嗪-6-基

3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基

3-氧代-3,4-二氫-2H-苯並[1,4]噻嗪-6-基(4H-苯並[1,4]噻嗪-3-酮-6-基)

4-氧代-4H-吡啶並[1,2-a]嘧啶-2-基

6-硝基-苯並[1,3]二氧雜環戊烯-5-基

7-氟-3-氧代-3,4-二氫-2H-苯並[1,4]噁嗪-6-基

8-羥基-1-氧代-1,2-二氫-異喹啉-3-基

8-羥基喹啉-2-基

苯並[1,2,3]噻二唑-5-基

苯並[1,2,5]噻二唑-5-基

苯並噻唑-5-基

噻唑並-[5,4-b]吡啶-6-基

3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基

7-氯-3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基

7-氯-3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基

7-氟-3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基

2-氧代-2,3-二氫-1H-吡啶並[3,4-b][1,4]噻嗪-7-基

[1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基

3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基

5-氰基-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-7-基

2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基

6,7-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]噠嗪-3-基

5,6,7,8-四氫異喹啉-3-基

6,7-二氫-5H-環戊二烯並[c]吡啶-3-基

1,3-二氫呋喃並[3,4-c]吡啶-6-基

6-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-7-基

3,4-二氫-2H-[1,4]氧硫雜環庚二烯並[2,3-c]吡啶-8-基

[1,3]氧硫雜環戊烯並[4,5-c]吡啶-6-基

2,3-二氫-1-苯並呋喃-5-基

6,7-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]噠嗪-3-基

6,7-二氫-5H-吡喃並[2,3-c]噠嗪-3-基

5,6-二氫呋喃並[2,3-c]噠嗪-3-基

2-取代的1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噁嗪-7(6H)-酮

2-取代的4-氯-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噁嗪-7(6H)-酮

2-取代的5,6-二氫吡啶並[2,3-d]嘧啶-7(1H)-酮

2-取代的4-氯-5,6-二氫吡啶並[2,3-d]嘧啶-7(1H)-酮

2-取代的4-甲基-5,6-二氫吡啶並[2,3-d]嘧啶-7(1H)-酮

2-取代的4-甲基氧基-5,6-二氫吡啶並[2,3-d]嘧啶-7(1H)-酮

7-取代的2H-色烯-2-酮

7-取代的2H-吡喃並[2,3-b]吡啶-2-酮

4-氯-6,7-二氫-5H-吡喃並[2,3-d]嘧啶-2-基

8-取代的2H-吡啶並[1,2-a]嘧啶-2-酮

6,7-二氫-5H-吡喃並[2,3-d]嘧啶-2-基

5-氯-1-苯並噻吩-2-基

6-氯-1-苯並噻吩-2-基

1-苯並噻吩-5-基

1-甲基-1H-1,2,3-苯並三唑-6-基

咪唑並[2,1-b][1,3]噻唑-6-基

4-甲基-3,4-二氫-2H-1,4-苯並噁嗪-7-基

1-甲基-1H-吲哚-2-基

1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噻嗪-7(6H)-酮-2-基

[1,2,5]噻二唑並[3,4-b]吡啶-6-基

4-氟-1H-苯並咪唑-2-基

3,4-二氫-2H-色烯-7-基

2,3-二氫-1-苯並呋喃-6-基

3,4-二氫-2H-色烯-6-基

6-氯-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-7-基

7-氯-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基

7-氯-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基

3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基

5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-7-基

5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基

8-氟-2H-1,4-苯並噁嗪-3(4H)-酮-6-基

8-氟-3,4-二氫-2H-1,4-苯並噁嗪-6-基

7,8-二氟-3,4-二氫-2H-1,4-苯並噁嗪-6-基

6,7-二氫-5H-噻吩並[3,2-b]吡喃-2-基

5-甲基-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-7-基

4-氧代-2,3,4,5-四氫-1,5-苯並硫氮雜-7-基

3,4-二氫-2H-1,4-苯並噻嗪-6-基

2,3,4,5-四氫-1,5-苯並硫氮雜-7-基

7-氟-3,4-二氫-2H-1,4-苯並噁嗪-6-基

→為連接點

尤其為

3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基

3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基

2,3-二氫-[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基

[1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基

6-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-7-基

2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基

3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基

5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-7-基

5-氰基-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-7-基

2,3-二氫-苯並[1,4]二氧雜環己二烯-6-基

→為連接點

定義

當用於本文時,術語"烷基"包括直鏈和支鏈的基團,例如,當合適時,甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、仲丁基、叔丁基、戊基和己基。術語'烯基'也相應地解釋。

滷或滷素包括氟、氯、溴和碘。

滷素烷基基團包括1-3個滷素原子。

本發明中的化合物含有雜環基,且可能以兩種或更多種互變異構形式存在,取決於所述雜環基的性質;所有這些互變異構形式均包括在本發明的範圍內。

本發明的一些化合物可以從溶劑(例如水性溶劑和有機溶劑)中結晶或重結晶。在該情況下,可以形成溶劑合物。本發明在其範圍內包括化學計量的溶劑合物(包括水合物)以及含有可變量水的化合物,其通過例如冷凍乾燥的方法製備。

另外,將理解,短語例如"式(I)化合物或其藥學上可接受的鹽或N-氧化物"旨在包括式(I)化合物、式(I)化合物的N-氧化物、式(I)化合物的藥學上可接受的鹽、式(I)化合物的溶劑合物,或上述的任意藥學上可接受的組合。因此,通過用於例示目的的非限制性實例,"式(I)化合物或其藥學上可接受的鹽"可以包括式(I)化合物的藥學上可接受的鹽,其進一步存在為溶劑合物。

由於式(I)化合物旨在用於藥物組合物,因此容易理解,在具體實施方案中,它們以基本上純的形式提供,例如至少60%純,更合適地,至少75%純,具體地,至少85%,尤其至少98%純(%為重量比)。所述化合物的不純製品可以用於製備用於藥物組合物的更純形式;化合物的這些較不純的製品應當含有至少1%,更合適地,至少5%,更具體地,至少10%的式(I)化合物或藥學上可接受的鹽和/或N-氧化物。

本發明的具體化合物包括實施例中提及的那些化合物及其藥學上可接受的N-氧化物、鹽和溶劑合物。

所述式(I)化合物的藥學上可接受的鹽包括酸加成鹽或季銨鹽,例如與以下無機酸形成的鹽:例如鹽酸、氫溴酸、硫酸、硝酸或磷酸,或與以下有機酸形成的鹽:例如乙酸、富馬酸、琥珀酸、馬來酸、檸檬酸、苯甲酸、對甲苯磺酸、甲烷磺酸、萘磺酸或酒石酸。式(I)化合物還可以製備為N-氧化物。本發明的範圍包括所有這些衍生物。

一些式(I)化合物可以存在為光學異構體的形式,例如非對映異構體和所有比例的異構體的混合物,例如外消旋混合物。本發明包括所有這些形式,尤其純的異構體形式。例如,本發明包括在NR2和R3的連接點處的對映異構體和非對映異構體。所述不同的異構體形式可以通過常規方法彼此分離或拆分,或任何給定的異構體可以通過常規的合成方法獲得或通過立體特異性或不對稱合成獲得。一些式(I)化合物還可以存在為多晶型物形式,且本發明包括這些多晶型物形式。

製備用於本發明的化合物的方法

使用常規有機合成製備本發明化合物或其藥學上可接受的鹽。

合適的合成路線描述在以下通用反應方案中。本領域技術人員將理解,如果本文所述的取代基與本文所用合成方法不相容,則可以用對該反應條件穩定的合適保護基保護該取代基。可以在反應順序中的必要或合適處除去該保護基以提供所需中間體或目標化合物。

合適的保護基以及使用該合適的保護基保護和脫保護不同的取代基的方法對本領域技術人員是熟知的;其實例可以在T.Greene and P.Wuts,Protecting Groups in Chemical Synthesis(3rd ed.),John Wiley&Sons,NY(1999)中找到。在一些情況下,可以具體選擇取代基以在所使用的反應條件下具有反應性。在這些情況下,反應條件將所選擇的取代基轉化為另一種取代基,其可用作中間體化合物或是目標化合物中的所需取代基。

在本發明的其他方面中,提供了製備式(I)化合物(其中Z2為氮)和其藥學上可接受的鹽和/或N-氧化物的方法,該方法包括將式(IIA)化合物與(i)溴乙酸乙酯反應,然後環化和氧化,或與(ii)氧代乙酸乙酯反應,然後環化,以得到式(IIIA)化合物:

在式(IIA)化合物中L為離去基團或-A(Q1)(Q2),其中Q1和Q2均連接至A上的相同碳原子,Q1為H且Q2為N(R20)R2』,或Q1和Q2一起形成乙二氧基或氧代,R20為UR5或可以轉化為UR5的基團,且R2』為R2或可以轉化為R2的基團,A、R1b、R2、U和R5如式(I)中所定義,

之後任選或根據需要將L轉化為-A-NR2-UR5,互相轉化任何可變基團,和/或形成其藥學上可接受的鹽和/或N-氧化物。

反應變化(i)為在鹼性條件(例如碳酸鉀)下用溴乙酸乙酯的選擇性烷基化(在烷基化2,3-二氨基吡啶中的選擇性的實例請參見Yoshizawa,H.等人,Heterocycles(2004),63(8),1757-1763)、在強鹼性條件(例如叔丁醇鉀)下加熱環化,然後在常規條件下用二氧化錳氧化(參見例如Smith,M.B.;March,J.M.Advanced Organic Chemistry,Wiley-Interscience 2001)。

反應變化(ii)可以在甲苯中進行,並且環化在強鹼性條件(例如叔丁醇鉀)下實現。

L可為羥基,其可以通過常規方法(例如1,1,1-三-(乙醯基氧基)-1,1-二氫-1,2-苯碘醯-3-(1H)-酮)氧化為醛,用於在常規條件下用HA-N(R20)R2』還原烷基化(參見例如Smith,M.B.;March,J.M.Advanced Organic Chemistry,Wiley-Interscience 2001)。

或者,L可以為溴,其可以在常規條件下用HA-N(R20)R2』烷基化。

當Q1和Q2一起形成乙二氧基時,該縮酮可以通過用例如HCl水溶液或三氟乙酸的常規酸水解處理轉化為酮(Q1和Q2一起形成氧代),並且通過常規還原烷基化用胺NHR2』R20轉化為NR2UR5(參見例如Nudelman,A.,et al,Tetrahedron 60(2004)1731-1748),隨後轉化為所需取代的胺,或例如用三乙醯氧基硼氫化鈉在二氯甲烷/甲醇中直接用NHR2UR5轉化為NR2UR5。

方便地,R20和R2』之一為N保護基,例如叔丁氧基羰基、苄基氧基羰基或9-芴基甲基氧基羰基。可以通過本領域技術人員熟知的多種方法(例如參見「Protective Groups in Organic Synthesis,T.W.Greene and P.G.M.Wuts,Wiley-Interscience,1999)脫保護該取代基,例如用例如三氟乙酸或鹽酸的常規酸水解。本發明還提供了式(IIIA)化合物,其中L為-A-N(R20)R2』且R20為氫。

其中R20為氫的式(IIIA)的游離胺可以通過以下常規方法轉化為NR2UR5:例如對於其中U為CO的化合物,用醯基衍生物R5COW的醯胺形成,或其中U為CH2時,通過在鹼的存在下用烷基滷化物R5CH2-滷化物烷基化、用醯基衍生物R5COW醯基化/還原,或在常規條件下用醛R5CHO還原烷基化(參見例如Smith,M.B.;March,J.M.Advanced Organic Chemistry,Wiley-Interscience 2001)。含有所需R5基團的合適試劑是已知化合物,或可以類似於已知化合物製備,參見例如WO02/08224、WO02/50061、WO02/56882、WO02/96907、WO2003087098、WO2003010138、WO2003064421、WO2003064431、WO2004002992、WO2004002490、WO2004014361、WO2004041210、WO2004096982、WO2002050036、WO2004058144、WO2004087145、WO06002047、WO06014580、WO06010040、WO06017326、WO06012396、WO06017468、WO06020561、WO2004/035569、WO2004/089947、WO2003082835、WO06002047、WO06014580、WO06010040、WO06017326、WO06012396、WO06017468、WO06020561、WO06132739、WO06134378、WO06137485、WO06081179、WO06081264、WO06081289、WO06081178、WO06081182、WO07016610、WO07081597、WO07071936、WO07115947、WO07118130、WO07122258、WO08006648、WO08003690、WO08009700、WO2007067511和EP0559285。

當R5含有NH基團時,可以在R5衍生物與式(IIB)的游離胺偶聯時,用合適的N保護基(例如叔丁氧基羰基、苄基氧基羰基或9-芴基甲基氧基羰基)對其進行保護。可以通過常規方法(例如通過三氟乙酸處理)脫除該保護基。

在本發明的其他方面中,提供了製備式(I)化合物(其中Z1為氮)和其藥學上可接受的鹽和/或N-氧化物的方法,該方法包括將式(IIB)化合物與(i)溴乙酸乙酯反應,然後環化和氧化,或與(ii)氧代乙酸乙酯反應,然後環化,以得到式(IIIB)化合物:

在式(IIB)化合物中L為離去基團或-A(Q1)(Q2),其中Q1和Q2均連接至A上的相同碳原子上,Q1為H且Q2為N(R20)R2』,或Q1和Q2一起形成乙二氧基或氧代,R20為UR5或可以轉化為UR5的基團,且R2』為R2或可以轉化為R2的基團,A、R1a、R2、U和R5如式(I)中所定義,

之後任選或根據需要將L轉化為-A-NR2-UR5,互相轉化任何可變基團,和/或形成其藥學上可接受的鹽和/或N-氧化物。

反應和隨後轉換如製備式(IIIA)化合物那樣進行。

本發明還提供了式(IIIB)化合物,其中L為-A-N(R20)R2』且R20為氫。

式(IIB)化合物(L=-A(Q1)(Q2))可以通過方案1製備:

方案1

可以將氯吡啶(2)與烯丙基胺反應,得到(3),然後將其用溴環化,在水解後處理後生成吡啶酮(4)(參見Schmid,S et al,Synthesis,2005(18),3107。用H-A(Q1)(Q2)置換得到(5),並且在Pd/C上氫化(5)得到胺(6)。

式(IIIA)化合物可以通過方案2,使用式(IVA)化合物製備:

起始原料可以通過用甲醇鈉還原來自方案1的化合物(3),然後用氯化錫(II)或連二亞硫酸鈉還原而製備。用丙炔酸酯對(IVA)進行環化得到(19)(方案2)(參見Kalyanam,N.et al,Indian Journal of Chemistry,Section B:Organic Chemistry Including Medicinal Chemistry(1992),31B(7),415-420)。標準保護得到(20),然後用溴環化(參見Schmid,S et al,Synthesis,2005(18),3107),可以得到溴甲基類似物(21),可以將其用TFA脫保護得到(22),並且用過氧化氫或氧化錳(II)氧化,得到(23)(參見Sakata,G.,Heterocycles(1985),23(1),143-51)。

方案2

式(I)化合物(其中Z1和Z2均為CH)可以通過方案3製備:

方案3

L為-A(Q1)(Q2)

(a)正丁基鋰,二溴乙烷(b)三(二亞苄基丙酮)二鈀(0),N,N-二環己基甲胺,雙(三叔丁基膦)鈀(0),丙炔酸丁酯(c)氫,鈀/碳,然後酸處理(HCl)(d)參見下文(e)胺H-A(Q1)(Q2),加熱(f)甲烷磺酸酐,三乙胺,然後KI(g)2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌(h)i)DMF,加熱,ii)甲烷磺醯氯,三乙胺,iii)胺H-A(Q1)(Q2),加熱。

用正丁基鋰金屬化(1)(市售可得),然後用二溴乙烷溴化,得到溴吡啶衍生物(2)(該類型的金屬化化學的實例請參見Zhichkin,P.et al,Synlett(2006),(3),379-382)。使用鈀催化對(2)進行Heck反應(該類型的Heck反應中的催化的實例請參見Sydorenko,N,et al,Organic&Biomolecular Chemistry(2005),3(11),2140-2144),得到丙烯酸酯(3)。氫化(3)的雙鍵,然後酸處理除去新戊酸酯殘基並實現內醯胺化,得到雙環內醯胺(4)。可以以許多方法實現轉化為環氧化物(5):在鹼性條件下與表氯環氧丙烷反應得到外消旋環氧化物。與市售可得的R或S-間硝基苯磺酸縮水甘油酯((2R)-或(2S)-3-硝基苯磺酸2-環氧乙烷基甲基酯)或(2R)-或(2S)-4-甲基苯磺酸2-環氧乙烷基甲基酯反應(用鹼例如氫化鈉或叔丁醇鉀),得到相應的手性環氧化物。或者,在鹼性條件下用烯丙基溴烯丙基化,得到相應的N-烯丙基材料,其可以在標準非手性或手性條件下氧化,得到相應的非手性或手性環氧化物。可以用胺H-A(Q1)(Q2)(例如4-哌啶基氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯)通過加熱在DMF中開環環氧化物(5),得到(6),然後用甲烷磺酸酐將其環化,得到(7)。或者,環氧化物(5)可以通過加熱直接開環和環化,得到(7)(L=OH)。可以通過用2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌(DDQ)氧化為(8)。隨後可以如本文一般所述進行轉化為式(I)化合物。具體地,將L轉化為A(Q1)(Q2)可以在(7)或(8)上進行。作為方案3的其他變化,環氧化物(5)可以由(2)製備:首先通過引入合適的環氧化物前體基團(-CH2-CHOH-CH2OH,作為環化酯保護),然後進行步驟(b)和(c)。

本發明還提供了來自方案3的式(8)化合物,其中L為-A-N(R20)R2』且R20為氫。

式(I)化合物(其中Z2為N)可以備選地通過方案4製備:

方案4

(a)2-氨基-1,3-丙二醇(b)二甲氧基丙烷,對甲苯磺酸(c)氫,鈀/碳(d)溴乙酸乙酯,碳酸鉀(e)氫化鈉(f)氯甲酸苄基酯(g)酸水溶液(h)甲烷磺酸酐(i)氫,鈀/碳(j)MnO2

硝基吡啶(1)與2-氨基-1,3-丙二醇反應,得到二醇(2),其保護為縮醛(3)。還原硝基得到胺(4),將其烷基化,得到酯(5)。可以用氫化鈉實現環化,得到(6)。將其用苄氧羰基(CBz)基團保護,得到(7),然後斷裂得到二醇(8)。用甲烷磺酸酐環化,得到甲磺酸酯(9),然後氫解CBz基團,得到(10),隨後用氧化錳(II)氧化,得到重要的二酮中間體甲磺酸酯(11)。可以改變步驟順序以經過(7a)。甲磺酸酯(11)可以如本文一般所述轉化為式(I)化合物。

手性式(I)化合物(其中Z2為N)可以備選地通過方案4a製備:

方案4a

Bn=苄基

(a)EtOH,回流,(b)TBS-Cl,(c)鋅,乙酸,(d)溴乙酸乙酯,碳酸鉀(e)NaH,(f)氫,鈀/碳(g)MnO2,(h)甲烷磺酸酐(i)TFA,(j)甲烷磺酸酐

硝基吡啶(1)與手性胺(2)反應,得到中間體(3)。用叔丁基-二甲基氯矽烷保護(3),得到(4)。還原硝基得到胺(5),將其烷基化,得到酯(6)。(6)的環化可以用氫化鈉然後用氫氣在鈀/碳催化劑上處理實現,得到中間體(7)。用氧化錳(II)氧化並用甲烷磺酸酐處理,得到(8)。該中間體可以用TFA脫保護,得到(9),並且與甲烷磺酸酐反應,得到(10)。然後可以如本文一般所述將形成的甲磺酸酯(10)轉化為式(I)化合物。

式(I)化合物(其中Z1為N)可以備選地通過方案5製備:

方案5

L為-A(Q1)(Q2)

(a)NH3/MeOH(b)氫,鈀/碳(c)溴乙酸乙酯,碳酸鉀(d)叔丁醇鉀(e)CBzCl(f)NaH,(S)-間硝基苯磺酸縮水甘油酯(g)DMF,加熱(h)甲烷磺醯氯(i)胺H-A(Q1)(Q2),加熱(j)氫,鈀/碳,然後MnO2

硝基吡啶(1)與氨水反應,得到硝基-吡啶(2),其還原為雙-苯胺(3)。用溴乙酸乙酯烷基化,然後用叔丁醇鉀環化,得到(5)。將其用羧基苄基保護,得到(6),然後將其與市售可得的S-間硝基苯磺酸縮水甘油酯((2S)-3-硝基苯磺酸2-環氧乙烷基甲基酯)反應,得到(7)。在熱條件下環化得到(8)。甲磺醯化、用合適的胺置換、氫解(10)中的CBz基團,隨後用氧化錳(II)氧化,得到(13)。或者,氫解CBz基團,得到(10),隨後用氧化錳(II)氧化,然後甲磺醯化和用合適的胺置換,也得到(13)。將其如本文一般所述轉化為式(I)化合物。

式(I)化合物(其中Z1和Z2均為N)可以通過方案6製備:

方案6

(a)氯乙醯氯(b)氨水(c)Boc-甘氨酸(d)HCl

通過用氯乙醯氯醯化將化合物(1)(Bioorganic&Medicinal Chemistry Letters(2005),15(24),5446-5449)轉化為(2),然後用氨水處理,得到(4)。或者,(1)可以通過與Boc-甘氨酸偶聯轉化為(3),然後通過酸性脫保護,得到(4)。然後,化合物(4)可以通過參照方案5中轉化化合物(5)的方法轉化為式(I)化合物。

R1a、R1b、R2、A和R5的相互轉化是常規的。在含有任選保護的羥基的化合物中,合適的常規羥基保護基(其可以在不幹擾分子其餘部分的情況下脫除)包括醯基和烷基矽基。通過常規方法脫除N-保護基。

R1a和R1b基團的相互轉化可以常規地在式(I)化合物上進行。例如,通過用鋰和二苯基膦(一般方法描述在Ireland et al,J.Amer.Chem.Soc.,1973,7829中)或HBr處理,R1a或R1b甲氧基可以轉化為R1a或R1b羥基。用帶有離去基團(例如滷素)的合適的烷基衍生物烷基化羥基,得到R1a或R1b取代的烷氧基。R1a或R1b滷素(例如溴)可以通過用氰化亞銅(I)在N,N-二甲基甲醯胺中處理轉化為氰基。R1a或R1b羧基可以通過常規水解R1a或R1b氰基獲得,並且通過常規的還原將羧基轉化為羥基甲基。

式HA-N(R20)R2』化合物是已知化合物,或可以類似於已知化合物進行製備,參見,例如WO2004/035569、WO2004/089947、WO02/08224、WO02/50061、WO02/56882、WO02/96907、WO2003087098、WO2003010138、WO2003064421、WO2003064431、WO2004002992、WO2004002490、WO2004014361、WO2004041210、WO2004096982、WO2002050036、WO2004058144、WO2004087145、WO2003082835、WO2002026723、WO06002047和WO06014580、WO06134378、WO06137485、WO07016610、WO07081597、WO07071936、WO07115947、WO07118130、WO07122258、WO08006648、WO08003690和WO08009700。

製備式(I)化合物的其他細節詳見實施例。

藥物組合物和製劑

根據本發明的抗菌劑化合物可以通過與其它抗菌劑/抗結核化合物類似的方式配製用於以任何方便的方式給藥用於人或獸醫學。

本發明的藥物組合物可以配製用於通過任何途徑給藥,並且包括適於口服、局部或腸胃外使用的形式的那些,並且可以用於治療細菌感染,包括哺乳動物(包括人)的結核病。

組合物可以是片劑、膠囊、粉劑、顆粒劑、錠劑、栓劑、乳膏或液體製劑的形式,例如口服或無菌腸胃外溶液或懸浮液。

本發明的局部製劑可以作為例如軟膏劑、乳膏或洗劑、眼用軟膏和滴眼劑或滴耳劑、浸漬敷料和氣霧劑,並且可以含有合適的常規添加劑,例如防腐劑,幫助藥物滲透的溶劑,在軟膏和乳膏中的軟化劑。

製劑還可以含有相容的常規載體,例如乳膏或軟膏劑基質和用於洗劑的乙醇或油醇。此類載體可以以製劑的約1%至最多約98%存在。更通常地,它們將構成高達約80%的製劑。

用於口服給藥的片劑和膠囊可以是單位劑量呈現形式,並且可以含有常規賦形劑,例如粘合劑,例如糖漿、阿拉伯膠、明膠、山梨糖醇、黃蓍膠或聚乙烯吡咯烷酮;填充劑,例如乳糖、糖、玉米澱粉、磷酸鈣、山梨糖醇或甘氨酸;壓片潤滑劑,例如硬脂酸鎂、滑石粉、聚乙二醇或二氧化矽;崩解劑,例如馬鈴薯澱粉;或可接受的潤溼劑如十二烷基硫酸鈉。片劑可以根據通常藥物實踐中熟知的方法包衣。口服液體製劑可以是例如水性或油性懸浮液、溶液、乳劑、糖漿或酏劑的形式,或者可以作為用於在使用前用水或其它合適的載體重構的乾燥產品。這樣的液體製劑可以含有常規的添加劑,例如懸浮劑,例如山梨糖醇、甲基纖維素、葡萄糖糖漿、明膠、羥乙基纖維素、羧甲基纖維素、硬脂酸鋁凝膠或氫化食用脂肪,乳化劑,例如卵磷脂、脫水山梨醇單油酸酯、阿拉伯膠;非水性載體(其可包括食用油),例如杏仁油,油性酯如甘油、丙二醇或乙醇;防腐劑,例如對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯或山梨酸,以及如果需要,常規調味劑或著色劑。

栓劑將含有常規的栓劑基質,例如可可脂或其它甘油酯。

對於腸胃外給藥,使用化合物和無菌載體(優選水)製備流體單位劑型。取決於所使用的載體和濃度,化合物可以懸浮或溶解在載體中。在製備溶液時,化合物可以溶解在注射用水中並過濾滅菌,然後填充到合適的小瓶或安瓿中並密封。

有利地,試劑例如局部麻醉劑、防腐劑和緩衝劑可以溶解在載體中。為了提高穩定性,可以在填充到小瓶中之後將組合物冷凍,並在真空下除去水。然後將乾燥的凍乾粉末密封在小瓶中,並且可以提供相伴小瓶的注射用水,以在使用前重構液體。以基本上相同的方式製備胃腸外懸浮液,不同的是將化合物懸浮在載體中而不是溶解,並且不能通過過濾進行滅菌。化合物可以在懸浮於無菌載體中之前通過暴露於環氧乙烷來滅菌。有利地,組合物中包括表面活性劑或潤溼劑以促進化合物的均勻分布。

此外,所給藥的本發明的化合物或組合物的量將根據患者和給藥方式而變化,並且可以是任何有效量。

給藥本發明的化合物和/或組合物的治療方案也可由本領域技術人員容易地確定。所給藥的本發明的化合物和/或組合物的量可以在寬範圍內變化,以在單位劑量中提供基於患者體重的每天有效量以實現期望的效果。

根據給藥方法,組合物可以含有0.1重量%,優選10-60重量%的活性物質。當組合物包含劑量單位時,每個單位優選含有50-1000mg的活性成分。

用於成人治療的劑量優選為100-3000mg/天,例如1500mg/天,取決於給藥的途徑和頻率。這樣的劑量對應於每天約1.5至約50mg/kg。合適地,劑量為每天5-30mg/kg。

具體地,本發明組合物作為單位劑量呈現,優選每日服用1至5次,最優選每日一次,以實現期望的效果。

常規的給藥方法可以適用於本發明。

取決於所進行的治療,本發明的化合物和/或組合物可以口服、血管內、腹膜內、皮下、肌內或局部給藥。優選地,所述組合物適合於口服給藥。

根據本發明製備的化合物和/或組合物可用於治療溫血動物,例如包括人的哺乳動物。

式(I)化合物可以是本發明組合物中的唯一治療劑或與包括抗結核化合物的其它抗菌劑組合。如果其它抗菌劑是β-內醯胺,則也可以使用β-內醯胺酶抑制劑。

式(I)化合物可用於治療由廣泛範圍的生物體引起的細菌感染,包括革蘭氏陰性和革蘭氏陽性生物體,例如上呼吸道和/或下呼吸道感染、皮膚和軟組織感染,和/或尿道感染。式(I)化合物還可以用於治療由結核分枝桿菌引起的肺結核。一些式(I)化合物可以對多於一種生物體具有活性。這可以通過本文所述的方法確定。

治療方法

本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥如本文所述的新的三環含氮化合物和相應的藥物組合物。

一方面,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥有效量的式(I)化合物:

其中:

Z1和Z2獨立地選自CH和N;

R1a和R1b獨立地選自氫;滷素;氰基;(C1-6)烷基;(C1-6)烷基硫基;三氟甲基;三氟甲氧基;羧基;任選被(C1-6)烷基或(C1-6)烷氧基-取代的(C1-6)烷基取代的羥基;(C1-6)烷氧基-取代的(C1-6)烷基;羥基(C1-6)烷基;氨基,其任選在N上被一個或兩個(C1-6)烷基、甲醯基、(C1-6)烷基羰基或(C1-6)烷基磺醯基取代;和氨基羰基,其中所述氨基任選被(C1-4)烷基取代;

條件是當Z2或Z1分別為N時,R1a和R1b為H;

R2為氫或(C1-4)烷基,或與R6一起形成如下定義的Y;

A為基團(i):

其中:R3如R1a和R1b所定義,或為氧代且n為1或2:

或A為基團(ii)

W1、W2和W3為CR4R8;

或W2和W3為CR4R8且W1表示W3和N之間的鍵;

X為O、CR4R8或NR6;

一個R4如R1a和R1b所定義,且剩餘的R4和R8為氫,或一個R4和R8一起為氧代,且剩餘的R4和R8為氫;

R6為氫或(C1-6)烷基;或與R2一起形成Y;

R7為氫;滷素;任選被(C1-6)烷基取代的羥基;或(C1-6)烷基;

Y為CR4R8CH2;CH2CR4R8;(C=O);CR4R8;CR4R8(C=O);或(C=O)CR4R8;

或當X為CR4R8時,R8和R7一起代表鍵;

U選自CO和CH2,且

R5為任選取代的雙環碳環或雜環系統(B):

各環中含有至多四個雜原子,其中

(a)和(b)環的至少一個環為芳香環;

當X1為芳香環的一部分時,X1為C或N,或當X1為非芳香環的一部分時,X1為CR14;

當X2為芳香環或非芳香環的一部分時,X2為N、NR13、O、S(O)x、CO或CR14,或當X2為非芳香環的一部分時,X2還可為CR14R15;

X3和X5獨立地為N或C;

Y1為0至4個原子的連接基,其中當各原子為芳香環或非芳香環的一部分時,各原子獨立地選自N、NR13、O、S(O)x、CO和CR14,或當各原子為非芳香環的一部分時,各原子還可為CR14R15;

Y2為2至6個原子的連接基,其中當Y2的各原子為芳香環或非芳香環的一部分時,Y2的各原子獨立地選自N、NR13、O、S(O)x、CO和CR14,或當Y2的各原子為非芳香環的一部分時,Y2的各原子還可以為CR14R15;

各個R14和R15獨立地選自:H;(C1-4)烷基硫基;滷素;羧基(C1-4)烷基;(C1-4)烷基;(C1-4)烷氧基羰基;(C1-4)烷基羰基;(C1-4)烷氧基(C1-4)烷基;羥基;羥基(C1-4)烷基;(C1-4)烷氧基;硝基;氰基;羧基;氨基或氨基羰基,其任選被(C1-4)烷基單-或二-取代;或

R14和R15可一起表示氧代;

各個R13獨立地為H;三氟甲基;任選被羥基、(C1-6)烷氧基、(C1-6)烷基硫基、滷素或三氟甲基取代的(C1-4)烷基;(C2-4)烯基;(C1-4)烷氧基羰基;(C1-4)烷基羰基;(C1-6)烷基磺醯基;氨基羰基,其中所述氨基任選被(C1-4)烷基單或二取代;且

各個X獨立地為0、1或2;或

或其藥學上可接受的鹽。

在另一個方面,本發明涉及所述方法,其中在式I化合物中:

(i)Z1和Z2均為CH;

(ii)Z1為N和Z2為CH;或

(iii)Z1為CH和Z2為N。

在另一個方面,本發明涉及所述方法,其中R1a為氫且R1b為氫,如式I化合物中所定義。

在另一個方面,本發明涉及所述方法,其中在式I化合物中:

A為(ia)、n為1且R3為3-位的H或羥基;

A為(ii)、X為CR4R8、R8為H且R4為H或OH;或

A為(ii)、X為O、R7為H且W1、W2和W3各為CH2。

在另一個方面,本發明涉及所述方法,其中A為哌啶-4-基或吡咯烷-4-基甲基,如式I化合物中所定義。

在另一個方面,本發明涉及所述方法,其中U為CH2,如式I化合物中所定義。

在另一個方面,本發明涉及所述方法,其中在式I化合物中:

R5為具有8-11個環原子且其中包括2-4個雜原子的芳香雜環(B),其中至少一個雜原子為N或NR13,其中Y2包含2-3個雜原子,其中一個為S且1-2個為N,並且一個N連接至X3,或

所述雜環(B)具有環(a)芳香環,選自任選取代的苯並、吡啶並、噠嗪並和嘧啶並,和環(b)非芳香環,且Y2具有3-5個原子且其中包括至少一個雜原子,並且O、S、CH2或NR13連接至X5,其中R13不是氫,或者NHCO經N連接至X3,或O、S、CH2或NH連接至X3。

在另一個方面,本發明涉及所述方法,其中在式I化合物中:

R5選自:

3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基;

3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基;

2,3-二氫-[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基;

[1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基;

6-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-7-基;

2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基;

3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基;

5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-7-基;

5-氰基-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-7-基;或

2,3-二氫-苯並[1,4]二氧雜環己二烯-6-基。

在另一個方面,本發明涉及所述方法,其中在式I化合物中:A選自:

1-({4-[(2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

1-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

1-({4-[(2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

1-({4-[(2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[(5,6,7,8-四氫-3-異喹啉基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[(6,7-二氫-5H-環戊二烯並[c]吡啶-3-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[(1,3-二氫呋喃並[3,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

7-[({1-[(4,9-二氧代-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-1-基)甲基]-4-哌啶基}氨基)甲基]-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-5-甲腈;

1-[(4-{[(3-氧代-3,4-二氫-2H-1,4-苯並噻嗪-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(1R)-1-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(1R)-1-({4-[(2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(2R)-2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(2S)-2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(2R)-2-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

2-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(2S)-2-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

2-({4-[(2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(1R)-1-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-4-甲基-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-甲基-4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(2R)-2-({4-[(2,1,3-苯並噻二唑-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(2R)-2-[(4-{[(7-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-[1,4]氧硫雜環庚二烯並[2,3-c]吡啶-8-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(2R)-2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[4,5-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(2R)-2-[(4-{[(3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(1R)-1-({4-[(2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-[(4-{[(8-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-[(4-{[(7-氯-3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-[(4-{[(4-氯-7-氧代-6,7-二氫-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噁嗪-2-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-[(4-{[(7-氧代-6,7-二氫-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噻嗪-2-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[(1,2,3-苯並噻二唑-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[(2,3-二氫-1-苯並呋喃-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(1R)-1-({4-[(2,3-二氫呋喃並[2,3-c]吡啶-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(2R)-2-({4-[(2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(2R)-2-[(4-{[(8-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

7-{[(1-{[(2R)-3,8-二氧代-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-2-基]甲基}-4-哌啶基)氨基]甲基}-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-5-甲腈;

(2R)-2-({4-[(2,3-二氫呋喃並[2,3-c]吡啶-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(1R)-1-({4-[(2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(1R)-1-({4-[([1,2,5]噻二唑並[3,4-b]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-[(4-{[(4-氟-1H-苯並咪唑-2-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-[((2S)-2-{[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]甲基}-4-嗎啉基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-{[(2S)-2-({[(7-氯-3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基)甲基]氨基}甲基)-4-嗎啉基]甲基}-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(2R)-2-({4-[([1,2,5]噻二唑並[3,4-b]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(1R)-1-({4-[(3,4-二氫-2H-色烯-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[(2,3-二氫-1-苯並呋喃-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[(3,4-二氫-2H-色烯-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(2R)-2-[(4-{[(5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(1R)-1-{[(2S)-2-({[(7-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}甲基)-4-嗎啉基]甲基}-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-[((3S)-3-{[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]甲基}-1-吡咯烷基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

7-{[(1-{[(1R)-3,8-二氧代-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-1-基]甲基}-4-哌啶基)氨基]甲基}-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-5-甲腈;

(1R)-1-[(4-{[(7-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(1R)-1-[(4-{[(8-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮;

(1R)-1-[(4-{[(2-氧代-2H-色烯-7-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-[(4-{[(2-氧代-2H-色烯-7-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-[(4-{[(2-氧代-2H-色烯-7-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

(1R)-1-({4-[(3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;或

1-[(4-{[(3-氧代-3,4-二氫-2H-1,4-苯並噻嗪-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮;

或表1化合物的游離鹼;

或其藥學上可接受的鹽。

在另一個方面,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥藥物組合物,其包含有效量的式(I)化合物:

其中:

取代基A、R1a、R1b、R2、R5、Z1和Z2如權利要求1所定義;

和藥學上可接受的賦形劑。

在另一個方面,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥有效量的以下化合物

式(IIIA):

式(IIIB):

式(8):

其中:

L為-A-N(R20)R2』,其中R20為氫、R2』為R2或可以轉化為R2的基團,且A、R2、R1a和R1b如權利要求1所定義。

在另一個方面,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥藥物組合物,其包含有效量的以下化合物:

式(IIIA):

式(IIIB):

式(8):

其中:

L為-A-N(R20)R2』,其中R20為氫、R2』為R2或可以轉化為R2的基團,且A、R2、R1a和R1b如權利要求1所定義;

和藥學上可接受的賦形劑。

在另一個方面,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥有效量的如下所示的化合物:

或其藥學上可接受的鹽。

在另一個方面,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥有效量的如下所示的化合物:

在另一個方面,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥藥物組合物,其包含:

化合物:

或其藥學上可接受的鹽;

和藥學上可接受的賦形劑。

在另一個方面,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥有效量的化合物(2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮:

其藥學上可接受的鹽。

在另一個方面,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥有效量的化合物(2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮:

在另一個方面,本發明涉及一種治療淋病奈瑟球菌感染的方法,其包括向需要的受試者給藥藥物組合物,其包含:

化合物(2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮:

其藥學上可接受的鹽;

和藥學上可接受的賦形劑。

闡述以下實施例用於闡明本發明,但是並不旨在以任何方式限制本發明的範圍。

實施例

以下實施例闡明了本發明。這些實施例並不旨在限定本發明的範圍,而是為本領域技術人員提供製備和使用本發明的化合物、組合物和方法的指導。雖然具體公開了本發明的實施方案,本領域技術人員將理解,在不背離本發明的精神和範圍的前提下,可以對其進行各種修改和改進。

以下實施例闡明了具體式(I)化合物的製備和具體式(I)化合物針對多種細菌生物體(包括淋病奈瑟球菌)的活性。

實施例和實驗

通用部分

實施例中的縮寫:

MS=質譜

ES=電噴霧質譜

LCMS/LC-MS=液相色譜質譜

HPLC=高效液相色譜

rt=室溫

Rf=保留因子

也在此提供了具體試劑的縮寫。TFA是指三氟乙酸,THF是指四氫呋喃,Pd/C是指鈀/碳催化劑,DCM是指二氯甲烷,MeOH是指甲醇,DMF是指二甲基甲醯胺,EtOAc是指乙酸乙酯,DDQ是指2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌,NaBH(OAc)3是指三乙醯氧基硼氫化鈉,Pd2(dba)3是指三(二亞苄基丙酮)二鈀(0)。

質子核磁共振(1H NMR)波譜在400或250MHz記錄,化學位移報導為內標四甲基矽烷(TMS)低場方向的百萬分率(ppm)。NMR數據的縮寫如下:s=單峰,d=雙重峰,t=三重峰,q=四重峰,m=多重峰,dd=兩組雙重峰,dt=兩組三重峰,td=三組雙重峰,app=表觀的,br=寬峰。J表示NMR偶合常數,測得為赫茲。CDCl3為氘代氯仿且CD3OD為四氘代甲醇。使用電噴霧(ES)離子化技術獲得質譜。所有溫度均以攝氏度報導。

MP-碳酸鹽是指大孔的碳酸甲基聚苯乙烯三乙基銨(triethylammonium methylpolystyrene carbonate)(Argonaut Technologies)。A21是弱鹼性、具有烷基胺官能團的大網絡樹脂,表示Rohm&Haas Co的註冊商標。

AD mixα通過混合鋨酸鉀(K2OsO4.2H2O)(0.52g)、(3a,9R,3」'a,4」'b,9」'R)-9,9'-[1,4-酞嗪二基雙(氧基)]雙[6'-(甲基氧基)-10,11-二氫脫氧辛可寧][(DHQ)2PHAL](5.52g),然後加入鐵氰化鉀[K3Fe(CN)6](700g)和碳酸鉀粉末(294g)製備。將該混合物在混合器中攪拌30分鐘。如此提供大約1kg的AD mixα,其可從Aldrich市售獲得。參見K.Barry Sharpless et al,J.Org.Chem.,1992,57(10),2771。AD mixβ是用(9S,9」'S)-9,9'-[1,4-酞嗪二基雙(氧基)]雙[6'-(甲基氧基)-10,11-二氫脫氧辛可寧][(DHQD)2PHAL]製備的相應混合物。當提及AD mixα/β時,指的是α和β的1:1混合物。

是由酸-洗滌的硅藻土組成的過濾助劑,是Manville Corp.,Denver,Colorado的商標。

SCX柱是含有強陽離子交換樹脂(苯磺酸)的離子交換柱,由Varian,USA供應。

Chiralpak IA和Chiralpak AS-H是基於多糖的手性HPLC柱(Chiral Technologies Inc.)。Chiralpak AS-H柱包括直鏈澱粉三[(S)-α-甲基苄基氨基甲酸酯],其塗覆在5μm矽膠上。Chiralpak IA柱包括矽膠製備柱(5μm粒度,21mm ID x 250mm L),其固定有直鏈澱粉三(3,5-二甲基苯基氨基甲酸酯)。Chiralpak AD和AD-H柱包括矽膠製備柱(5μm粒度AD-H和10μm粒度AD,21mm ID x 250mm L;20μM粒度AD,101mm ID x 250mm L),其塗覆有直鏈澱粉三(3,5-二甲基苯基氨基甲酸酯)(Chiral Technologies USA)。測量的保留時間取決於色譜操作的精確條件。當在下面的實施例中引用時,它們指示洗脫順序。Kromasil 5微米C-18柱(21mm x 250mm)包括化學連接至5微米多孔矽膠的十八基矽烷。

本領域化學人員將理解,提及的以與其他製備相似的方式或通過其他製備的通用方法進行的製備,可以包括常規參數的變化,例如時間、溫度、後處理條件、試劑量的少量變化等。

涉及金屬氫化物(包括氫化鋰、氫化鋁鋰、二異丁基氫化鋁、氫化鈉、硼氫化鈉和三乙醯氧基硼氫化鈉)的反應在氬氣或其他惰性氣體中進行。

實施例1 1-({4-[(2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮二鹽酸鹽

(a)6-氯-3-硝基-N-2-丙烯-1-基-2-吡啶胺

通過改進Schmid,S.,et al,Synthesis(2005),(18),3107-3118的方法進行製備。在氬氣中,將2,6-二氯-3-硝基吡啶(8.0g,41.45mmol)在無水二氯甲烷(180ml)中的溶液冷卻至-15℃。加入三乙胺(6.0ml,43mmol),然後分小批經3小時加入烯丙基胺(3.23ml,43mmol),保持溫度為-15℃。將反應混合物攪拌過夜,期間溫熱至室溫。將反應混合物用0.2M檸檬酸水溶液(100ml)、飽和NaHCO3水溶液(100ml)洗滌,通過疏水砂芯漏鬥,蒸發得到黃色油狀物,將其通過矽膠色譜純化,用0-50%乙酸乙酯的己烷溶液洗脫,得到黃色固體(7.49g,85%)。

C8H8ClN3O2計算值213,MS(ES+)m/z 214,216(MH+)。

(b)3-(溴甲基)-8-硝基-2,3-二氫咪唑並[1,2-a]吡啶-5(1H)-酮

通過改進Schmid,S.,et al,Synthesis(2005),(18),3107-3118的方法進行製備。將6-氯-3-硝基-N-2-丙烯-1-基-2-吡啶胺(20g,93.6mmol)在氯苯(500ml)中的溶液用溴(4.75ml,92.7mmol)在氯苯(100ml)中的溶液滴加處理,經4.5小時,保持T<26℃,需要時冷卻。將粘稠懸浮液在室溫攪拌18小時,並用己烷(200ml)稀釋,然後將反應混合物倒入己烷(1000ml)中。15分鐘後,將橙色沉澱通過過濾收集,並用己烷(250ml)洗滌,得到26.6g橙色固體(3-(溴甲基)-5-氯-8-硝基-2,3-二氫咪唑並[1,2-a]吡啶-1-鎓溴化物)。將該中間體經45分鐘加入至快速攪拌的飽和NaHCO3水溶液(1000ml)和乙酸乙酯(500ml)的混合物中。將該鮮紅色混合物攪拌1小時,用乙酸乙酯(200ml)稀釋,並分離各層。將水層用乙酸乙酯(200ml)洗滌,並將有機萃取物合併、乾燥(無水硫酸鈉)、過濾和蒸發,得到產物,其為棕色固體(18.3g,含40%6-溴-3-(溴甲基)-8-硝基-2,3-二氫咪唑並[1,2-a]吡啶-5(1H)-酮)。

C8H8BrN3O3計算值273,MS(ES+)m/z 274,276(MH+)。

(c){1-[(8-硝基-5-氧代-1,2,3,5-四氫咪唑並[1,2-a]吡啶-3-基)甲基]-4-哌啶基}氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯

將3-(溴甲基)-8-硝基-2,3-二氫咪唑並[1,2-a]吡啶-5(1H)-酮和6-溴-3-(溴甲基)-8-硝基-2,3-二氫咪唑並[1,2-a]吡啶-5(1H)-酮(18.2g)的3:2混合物在乙腈(900ml)中的懸浮液用4-哌啶基氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯(26.6g,132.8mmole),然後用吡啶(10.7ml,132mmol)處理。將混合物在60℃在氬氣中加熱17小時,然後在70℃加熱2小時,冷卻和蒸發至大約一半體積。將該粘稠的黃色沉澱通過過濾除去,並用乙醚充分洗滌。將濾液蒸發至幹,並將殘餘物在氯仿(500ml)和水(200ml)之間分配。將未溶解的物質通過過濾除去,並用氯仿(100ml)洗滌。分離濾液中的各層,並將水層用氯仿(200ml)洗滌。將合併的有機萃取液通過疏水砂芯漏鬥,並蒸發得到深黃色膠狀物,將其色譜純化,用0-100%乙酸乙酯的己烷溶液,然後用0-30%甲醇的乙酸乙酯溶液洗脫,得到黃色固體(10.98g)。

C18H27N5O5計算值393,MS(ES+)m/z 394(MH+)。

(d){1-[(3,8-二氧代-1,2,5a,8b-四氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-1-基)甲基]-4-哌啶基}碳酸1,1-二甲基乙基酯

將{1-[(8-硝基-5-氧代-1,2,3,5-四氫咪唑並[1,2-a]吡啶-3-基)甲基]-4-哌啶基}氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯(2.0g,5.08mmol)和無水碳酸鉀(700mg,5.06mmol)在無水乙醇(150ml)中的懸浮液在常壓在10%Pd/C(1g)的存在下氫化4小時。將反應經Keiselguhr過濾,經乙醇(100ml)洗滌,並將深紫色混合物通過用無水碳酸鉀(1.4g,10mmol)和溴乙酸乙酯(550ul,4.95mmol)處理而立即反應,並在室溫攪拌20小時,然後在60℃加熱30分鐘。45分鐘後,加入另外0.25ml溴乙酸乙酯,並在60℃加熱1.5小時。加入0.25ml溴乙酸乙酯,並將反應再次在60℃加熱1小時。將反應經Keiselguhr過濾和蒸發至幹。將混合物與氯仿共沸,然後色譜純化,用0-100%乙酸乙酯的己烷溶液,然後用0-20%甲醇的乙酸乙酯溶液洗脫。用0-50%甲醇的乙酸乙酯溶液洗脫二次純化,得到深色膠狀物(37mg,1.6%)。

C20H27N5O2計算值401,MS(ES+)m/z 402(MH+)。

(e)1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2,5a,8b-四氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮

將{1-[(3,8-二氧代-1,2,5a,8b-四氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-1-基)甲基]-4-哌啶基}氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯(37mg,0.092mmol)在無水二氯甲烷(2ml)中的溶液用TFA(1ml)處理,並在室溫攪拌1小時,蒸發至幹,與無水二氯甲烷混合,並蒸發得到深色膠狀物。將該膠狀物溶於1:1二氯甲烷:甲醇(10ml)中,並用MP-碳酸鹽樹脂(600mg)處理,並攪拌1.5小時。將反應過濾,並將樹脂用1:1二氯甲烷:甲醇(30ml)洗滌,並將濾液蒸發至幹。在5gSCX柱上純化,用甲醇至2N氨的甲醇溶液梯度純化,得到產物,其為膠狀物。進一步從乙醚蒸發得到產物,其為棕色固體(22.8mg,82%)。

C15H19N5O2計算值301,MS(ES+)m/z 302(MH+)。

(f)標題化合物

將1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2,5a,8b-四氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(22.8mg,0.0757mmol)在無水二氯甲烷(3ml)和無水甲醇(0.6ml)中的溶液用2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-甲醛(12.5mg,0.076mmol)(其合成請參見WO2004058144實施例2(c)或WO03/087098實施例19(d))處理,並在氬氣中攪拌15分鐘,然後用三乙醯氧基硼氫化鈉(48mg,0.226mmol)處理,並在室溫攪拌17小時。然後將反應用另一部分2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-甲醛(2mg)和三乙醯氧基硼氫化鈉(10mg)處理,並將混合物攪拌4小時,用飽和NaHCO3水溶液(1ml)處理,並攪拌10分鐘。分離各層,並將水層用9:1二氯甲烷:甲醇(2x10ml)洗滌。將合併的有機萃取液通過疏水砂芯漏鬥,並蒸發得到棕色膠狀物,將其色譜純化,用0-30%甲醇的二氯甲烷溶液洗脫,得到標題化合物的游離鹼,其為黃色膠狀物(20.6mg,60%)。

C23H26N6O4計算值450,MS(ES+)m/z 451(MH+)。

1H NMR(250MHz)δ(CDCl3)1.38-1.54(2H,m),1.83-1.93(2H,m),2.19-2.36(2H,m),2.54-2.73(3H,m),2.93-2.98(1H,m),3.09-3.15(1H,m),3.85(2H,s),4.26-4.61(6H,m),4.96-5.05(1H,m),6.33(1H,d),6.82(1H,s),7.76(1H,d),7.87(1H,s)和8.10(1H,s)

將標題化合物的游離鹼溶於無水二氯甲烷(2ml)和無水甲醇(0.5ml)中,並用1M HCl的乙醚溶液(0.5ml)處理。加入乙醚(5ml),並冷卻懸浮液。離心後,除去溶劑,並將固體乾燥,得到標題化合物,其為棕色固體(23.5mg)。

C23H26N6O4計算值450,MS(ES+)m/z 451(MH+)。

實施例2 1-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

(a)N-(6-氯-2-吡啶基)-2,2-二甲基丙醯胺

在50℃,在氬氣中,將6-氯-2-吡啶胺(13.776g,107mmol)在甲苯(100ml)和三乙胺(16.28ml,118mmol)中的溶液用2,2-二甲基丙醯氯(13.81ml,112mmol)處理。然後將反應在50℃攪拌4h,然後在室溫攪拌18h。然後加入2M HCl(200ml),並將混合物用乙醚(3x 500ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)、過濾和蒸發,得到產物,其為棕色固體(21.005g,92%)。

MS(ES+)m/z 213/215(MH+)。

(b)N-(3-溴-6-氯-2-吡啶基)-2,2-二甲基丙醯胺

在-78℃,在氬氣中,經10min,將N-(6-氯-2-吡啶基)-2,2-二甲基丙醯胺(4.83g,22.7mmol)在THF(40ml)中的溶液用正丁基鋰(20ml,2.5M的己烷溶液,50mmol)處理,然後溫熱至0℃,在0℃攪拌3h,然後冷卻至-78℃。然後將反應用二溴乙烷(2.057ml,23.9mmol)滴加處理,並將反應溫熱至室溫,並在室溫攪拌0.5h。然後將反應用水(5ml)處理,在室溫攪拌5min,用更多水(500ml)處理,並用乙醚(3x 500ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)、過濾、蒸發並將殘餘物色譜純化(0-25%乙酸乙酯:己烷),得到產物,其為黃色固體(3.489g,53%)。

MS(ES+)m/z 291/293/295(MH+)。

(c)N-(3-溴-6-氯-2-吡啶基)-2,2-二甲基-N-2-丙烯-1-基丙醯胺

在0℃,在氬氣中,將N-(3-溴-6-氯-2-吡啶基)-2,2-二甲基丙醯胺(2.305g,7.907mmol)在DMF(40ml)中的溶液用氫化鈉(0.696g,17.395mmol)處理,然後經0.25h溫熱至室溫,在室溫攪拌0.25h,然後用烯丙基碘(1.61ml,17.395mmol)處理,並在室溫攪拌1h。然後將反應用水(10ml)處理,濃縮至大約5ml,用更多水(200ml)處理,並用DCM(3x 200ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)、過濾、蒸發並將殘餘物色譜純化(0-20%乙酸乙酯:己烷),得到產物,其為黃色油狀物,其固化為米白色固體(5.324g,67%)。

MS(ES+)m/z 331/333/335(MH+)。

(d)N-[3-溴-6-(甲基氧基)-2-吡啶基]-2,2-二甲基-N-2-丙烯-1-基丙醯胺

在室溫,在氬氣中,將N-(3-溴-6-氯-2-吡啶基)-2,2-二甲基-N-2-丙烯-1-基丙醯胺(12.388g,37.370mmol)在甲醇(100ml)中的溶液用甲醇鈉溶液(25%w/v的甲醇溶液,17.76g,82.212mmol)處理,然後加熱回流42h。然後將反應冷卻,用水(500ml)處理,並用乙醚(3x 200ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)和蒸發,得到產物(10.918g,89%)。

MS(ES+)m/z 327/329(MH+)。

(e)N-[3-溴-6-(甲基氧基)-2-吡啶基]-N-(2,3-二羥基丙基)-2,2-二甲基丙醯胺

在室溫,在氬氣中,將N-[3-溴-6-(甲基氧基)-2-吡啶基]-2,2-二甲基-N-2-丙烯-1-基丙醯胺(1.246g,3.81mmol)在叔丁醇(40ml)中的溶液用水(40ml)處理,然後用AD-mixα(2.86g)和AD-mixβ(2.86g)處理,並在室溫攪拌18h。然後將反應用飽和亞硫酸鈉水溶液(40ml)處理,攪拌10min,用20%甲醇/DCM(3x 100ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)和蒸發,得到粗產物(1.728g,126%),含有殘留叔丁醇。

MS(ES+)m/z 361/363(MH+)。

(f)N-[3-溴-6-(甲基氧基)-2-吡啶基]-2,2-二甲基-N-[(2-氧代-1,3-二氧戊環-4-基)甲基]丙醯胺

在-78℃,在氬氣中,經5min將N-[3-溴-6-(甲基氧基)-2-吡啶基]-N-(2,3-二羥基丙基)-2,2-二甲基丙醯胺(7.628g,21.130mmol)在DCM(100ml)和吡啶(3.407ml,42.26mmol)中的溶液用三光氣(6.27g,21.130mmol)在DCM(20ml)中的溶液處理,然後將反應溫熱至室溫,並在室溫攪拌30min。然後將反應用飽和碳酸氫鈉溶液(200ml)小心處理,用DCM(3x 200ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)、蒸發和色譜純化(0-50%乙酸乙酯:己烷),得到產物,其為白色固體(5.722g,70%)。

MS(ES+)m/z 387/389(MH+)。

(g)(2E)-3-[2-{(2,2-二甲基丙醯基)[(2-氧代-1,3-二氧戊環-4-基)甲基]氨基}-6-(甲基氧基)-3-吡啶基]-2-丙烯酸丁基酯

將N-[3-溴-6-(甲基氧基)-2-吡啶基]-2,2-二甲基-N-[(2-氧代-1,3-二氧戊環-4-基)甲基]丙醯胺(5.722g,14.722mmol)、Pd(PtBu3)2(151mg,0.296mmol)、Pd2(dba)3(135mg,0.149mmol)在1,4-二噁烷(40ml)中的混合物用N,N』-二環己基甲胺(3.48ml,16.265mmol)和丙烯酸正丁酯(2.54ml,17.743mmol)處理,然後將混合物在80℃加熱1h。然後將反應冷卻,用水(200ml)處理,用DCM(3x 200ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)、蒸發和色譜純化(0-50%乙酸乙酯:己烷),得到產物,其為黃色油狀物(6.156g,96%)。

MS(ES+)m/z 435(MH+)。

(h)3-[2-{(2,2-二甲基丙醯基)[(2-氧代-1,3-二氧戊環-4-基)甲基]氨基}-6-(甲基氧基)-3-吡啶基]丙酸丁基酯

將(2E)-3-[2-{(2,2-二甲基丙醯基)[(2-氧代-1,3-二氧戊環-4-基)甲基]氨基}-6-(甲基氧基)-3-吡啶基]-2-丙烯酸丁基酯(6.156g,14.184mmol)在乙醇(200ml)中的溶液用鈀/碳(10%糊狀物,1.23g)處理,然後將混合物在室溫在1個大氣壓氫化18h。然後將反應混合物經薄Celite墊過濾,用更多乙醇(200ml)洗滌。然後將有機濾液液蒸發,得到產物,其為黃色油狀物(6.065g,98%)。

MS(ES+)m/z 437(MH+)。

(i)1-(2,3-二羥基丙基)-7-(甲基氧基)-3,4-二氫-1,8-二氮雜萘-2(1H)-酮

將3-[2-{(2,2-二甲基丙醯基)[(2-氧代-1,3-二氧戊環-4-基)甲基]氨基}-6-(甲基氧基)-3-吡啶基]丙酸丁基酯(6.065g,13.911mmol)在甲醇(100ml)中的溶液用濃HCl水溶液(12M,50ml)處理,然後加熱回流48h。然後將反應混合物濃縮至大約50ml,用碳酸鉀中和,並用20%甲醇/DCM(3x 100ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)和蒸發,得到粗產物,其為黃色油狀物(2.325g,66%)。

MS(ES+)m/z 279(MH+)。

(j)7-(甲基氧基)-1-(2-環氧乙烷基甲基)-3,4-二氫-1,8-二氮雜萘-2(1H)-酮

在0℃,在氬氣中,將1-(2,3-二羥基丙基)-7-(甲基氧基)-3,4-二氫-1,8-二氮雜萘-2(1H)-酮(2.325g,9.226mmol)在DCM(40ml)和三乙胺(1.915ml,13.839mmol)中的溶液用甲烷磺醯氯(0.714ml,9.226mmol)處理,並在0℃攪拌0.5h。然後將反應混合物用水(100ml)處理,用DCM(3x 100ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)和蒸發。然後將殘餘物溶於甲醇(50ml),用碳酸鉀(6.366g,46.130mmol)處理,並在室溫攪拌15min。然後將反應混合物用水(100ml)處理,用DCM(3x 200ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)、蒸發和色譜純化(0-100%乙酸乙酯:己烷),得到產物,其為黃色油狀物(428mg,20%)。

MS(ES+)m/z 235(MH+)。

(k)(1-{2-羥基-3-[7-(甲基氧基)-2-氧代-3,4-二氫-1,8-二氮雜萘-1(2H)-基]丙基}-4-哌啶基)氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯

在氬氣中,將7-(甲基氧基)-1-(2-環氧乙烷基甲基)-3,4-二氫-1,8-二氮雜萘-2(1H)-酮(428mg,1.829mmol)和4-哌啶基氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯(366mg,1.829mmol)在DMF(2ml)中的溶液在120℃加熱1h。然後將混合物蒸發和色譜純化(0-10%甲醇/DCM),得到產物,其為黃色油狀物(301mg,38%)。

MS(ES+)m/z 435(MH+)。

(l){1-[(4,9-二氧代-1,2,8,9-四氫-4H,7H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-2-基)甲基]-4-哌啶基}氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯

在室溫,在氬氣中,將(1-{2-羥基-3-[7-(甲基氧基)-2-氧代-3,4-二氫-1,8-二氮雜萘-1(2H)-基]丙基}-4-哌啶基)氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯(301mg,0.694mmol)在氯仿(10ml)和三乙胺(0.24ml,1.735mmol)中的溶液用甲烷磺酸酐(242mg,1.388mmol)處理,並加熱回流2h。然後將反應混合物蒸發和溶於乙腈(10ml),用碘化鈉(520mg,3.47mmol)處理,並在80℃加熱0.25h。然後將混合物冷卻,蒸發,然後用水(200ml)處理,用20%甲醇/DCM(3x 200ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)、蒸發和色譜純化(0-10%甲醇/DCM),得到產物,其為橙色油狀物(194mg,70%)。

MS(ES+)m/z 403(MH+)。

(m){1-[(4,9-二氧代-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-1-基)甲基]-4-哌啶基}氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯

將{1-[(4,9-二氧代-1,2,8,9-四氫-4H,7H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-1-基)甲基]-4-哌啶基}氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯(194mg,0.0.483mmol)(301mg,0.694mmol)在1,4-二噁烷(5ml)中的溶液用DDQ(164mg,0.724mmol)處理,並在60℃攪拌24h。加入另外的DDQ(164mg,0.724mmol),並將反應攪拌另外2h。然後將反應用5%碳酸鉀水溶液(100ml)處理,用20%甲醇/DCM(3x 200ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)和蒸發,得到產物,其為橙色油狀物(159mg,82%)。

MS(ES+)m/z 401(MH+)。

(n)1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽

在氬氣中,在室溫,將{1-[(4,9-二氧代-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-1-基)甲基]-4-哌啶基}氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯(159mg,0.398mmol)在氯仿(2ml)和甲醇(2ml)中的溶液用4M HCl的1,4-二噁烷溶液(2ml)處理,並在室溫攪拌0.5h。然後將反應乾燥和蒸發,得到產物,其為黃色固體(138mg,93%)。

MS(ES+)m/z 301(MH+)。

(o)標題化合物

在氬氣中,在室溫,將1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(49mg,0.131mmol)在DCM(2ml)和甲醇(0.1ml)中的混合物用三乙胺(58μl,0.419mmol)處理,並在室溫攪拌0.25h,然後加入[1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-甲醛(其合成參見WO2004058144實施例61)(22mg,0.131mmol)。然後將混合物在室溫攪拌1h,然後加入NaBH(OAc)3(56mg,0.262mmol)。將反應在室溫攪拌另外0.5h,然後加入飽和碳酸氫鈉水溶液(20ml)。將混合物用20%甲醇/DCM(3x 100ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)、蒸發和色譜純化(0-20%甲醇/DCM),得到產物,其為透明油狀物(28mg,47%)。

MS(ES+)m/z 452(MH+)。

δH(CDCl3,400MHz)1.38-1.48(2H,m),1.78-1.95(2H,m),2.15-2.37(2H,m)2.45-2.60(1H,m),2.61-2.72(2H,m),2.92-3.02(1H,m),3.05-3.12(1H,m),3.83(2H,s),4.32-4.42(1H,m),4.52-4.61(1H,m),4.96-5.05(1H,m),5.74(2H,s),6.22-6.32(2H,m),7.20(1H,s),7.45-7.52(2H,m),7.99(1H,s)。

通過加入等當量的4M氯化氫的1,4-二噁烷溶液,然後蒸發至幹,將標題化合物的游離鹼在甲醇和氯仿中轉化為鹽酸鹽。

實施例3 1-({4-[(2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

方法A

在氬氣中,在室溫,將1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(36mg,0.0965mmol)(其製備參見實施例2(n))在DCM(2ml)和甲醇(0.1ml)中的混合物用三乙胺(43μl,0.309mmol)處理,並在室溫攪拌0.25h,然後加入2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-甲醛(其合成參見WO2004058144實施例2(c)或WO03/087098實施例19(d)))(16mg,0.0965mmol)。然後將混合物在室溫攪拌1h,然後加入NaBH(OAc)3(41mg,0.193mmol)。然後將反應在室溫攪拌另外0.5h,然後加入飽和碳酸氫鈉水溶液(20ml)。將混合物用20%甲醇/DCM(3x 100ml)萃取。將有機萃取物乾燥(MgSO4)、蒸發和色譜純化(0-20%甲醇/DCM),得到標題化合物的游離鹼,其為透明油狀物(24mg,55%)。

MS(ES+)m/z 450(MH+)。

δH(CDCl3,400MHz)1.30-1.50(2H,m),1.80-1.92(2H,m),2.19-2.35(2H,m)2.49-2.72(3H,m),2.92-3.02(1H,m),3.07-3.13(1H,m),3.81(2H,s),4.22-4.51(5H,m)4.52-4.60(1H,m),4.96-5.04(1H,m),6.22-6.32(2H,m),6.81(1H,s),7.45-7.53(2H,m),8.04(1H,s)。

通過加入等當量的4M氯化氫的1,4-二噁烷溶液,然後蒸發至幹,將標題化合物的游離鹼在甲醇和氯仿中轉化為鹽酸鹽。

方法B

(a)2-溴-3-[(苯基甲基)氧基]丙酸

將外消旋O-(苯基甲基)絲氨酸(5g,25.6mmol)和溴化鉀(10.7g,89.6mmol)溶於冰冷卻的H2SO4(2.5N)中,並經50分鐘(保持反應溫度二鹽酸鹽的理論產率,因為存在殘留溶劑)。

將一部分粗品二鹽酸鹽(0.513g)溶於甲醇(4ml)和水(1ml),並加載於SCX柱(10g)(用2柱體積的甲醇預先調節)。然後將柱在重力下使用(i)甲醇(2x50ml),(ii)0.5M氨的甲醇溶液(3x50ml級分)洗脫。將合適的級分合併,並在減壓下蒸除,得到粗品標題化合物,其為黃褐色無定形固體(410mg),其含有甲醇不溶的且LCMS不顯示的雜質(可能是氯化銨)。將產物溶於甲醇(30ml),並將懸浮液過濾。將固體用甲醇(20ml)洗滌,並將合併的濾液和清洗液在減壓下蒸除,得到標題化合物(360mg,87%)。

MS(ES+)m/z 302(MH+)。

方法B

將{1-[(3,8-二氧代-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-2-基)甲基]-4-哌啶基}氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯(9.735g,24.25mmol)懸浮於DCM(90ml),並加入4M HCl的1,4-二噁烷溶液(45ml),得到亮黃色懸浮液(並且冒出氣泡)。將亮黃色混合物在室溫攪拌1小時。將溶劑在減壓下除去,得到粗品二鹽酸鹽,其為亮黃色無定形固體(10.420g,含有殘留溶劑)。

分三批,將外消旋的二鹽酸鹽(10.4g)通過手性HPLC使用Chiralpak AD(20微米)製備柱(用50:50:0.1乙腈:甲醇:異丙基胺作為流動相)拆分為兩種對映異構體。α值為3.1,且三次運行均觀察到基線分離度。沒有重疊級分,並且兩種對映異構體(作為游離鹼)各以>99.8ee分離。

(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(洗脫的第一組分):(3.30g,淺褐色固體,手性HPLC:100%ee)。

MS(ES+)m/z 302(MH+)。

旋光度:αD=-120°(C=1.00,甲醇,21.8℃)。

(2S)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(洗脫的第二組分):(3.30g,淺褐色固體,手性HPLC:99.8%ee)。

MS(ES+)m/z 302(MH+)。

旋光度:αD=+122°(C=1.00,甲醇,21.8℃)。

(k)標題化合物

在室溫,將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(100mg,0.332mmol)與[1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-甲醛(其合成參見WO2004058144實施例61)(45mg,0.811當量)在氯仿:甲醇(9:1,v:v,5ml)中攪拌2小時;然後在室溫,伴隨劇烈攪拌,將混合物用三乙醯氧基硼氫化鈉(211mg,3.0當量)處理30分鐘。將混合物通過加入飽和碳酸氫鈉水溶液(1ml)淬滅。加入DCM(10ml),並繼續劇烈攪拌10分鐘,然後分離各相(疏水砂芯漏鬥)。將有機相在減壓下蒸除,並將粗產物通過矽膠柱色譜純化(用0-12%(2M NH3的MeOH溶液)的DCM溶液洗脫)。將合適的級分合併,並在減壓下蒸除和在真空管線下乾燥過周末,得到標題化合物的游離鹼,其為淡黃色泡沫(70mg,44.3%)。

MS(ES+)m/z 453(MH+)。

1H NMR(CDCl3)8.00(1H,s);7.82(1H,s);7.77(1H,d,J=9.7Hz);7.18(1H,s);6.39(1H,d,J=9.7Hz);5.73(2H,s);5.03(1H,m);4.55(1H,dd,J=12.5Hz,4.6Hz);4.38(1H,dd,J=12.5Hz,9.2Hz);3.80(2H,s);3.13(1H,dd,J=12.9Hz,3.5Hz);2.93(1H,m);2.70(1H,dd,J=12.9Hz,9.0Hz);2.67(1H,m);2.50(1H,m);2.33(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);2.25(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);1.85(3H,m);1.36(2H,m)。

用一當量1M HCl的乙醚溶液處理上述游離鹼(70mg)在DCM(1ml)中的溶液,在減壓下除去溶劑後,得到標題化合物,其為淡黃褐色無定形固體(75mg)。

MS(ES+)m/z 453(MH+)。

實施例17A(2S)-2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,將(2S)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(其製備參見實施例16A(j)(100mg,0.332mmol)與[1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-甲醛(其合成參見WO2004058144實施例61)(45mg,0.811當量)在氯仿:甲醇(9:1,v:v,5ml)中攪拌2小時;然後伴隨劇烈攪拌,在室溫,將混合物用三乙醯氧基硼氫化鈉(211mg,3.0當量)處理30分鐘。將混合物通過加入飽和碳酸氫鈉水溶液(1ml)淬滅。加入DCM(10ml),並繼續劇烈攪拌10分鐘,然後分離各相(疏水砂芯漏鬥)。將有機相在減壓下蒸除,並將粗產物通過矽膠柱色譜純化(2M NH3的MeOH溶液)的DCM溶液。將合適的級分合併,並在減壓下蒸除和在真空管線下乾燥過周末,得到標題化合物的游離鹼,其為淡黃色泡沫(91mg,61%)。

MS(ES+)m/z 453(MH+)。

1H NMR(CDCl3)(等同於(2R)對映異構體,實施例16A)8.00(1H,s);7.82(1H,s);7.77(1H,d,J=9.7Hz);7.18(1H,s);6.39(1H,d,J=9.7Hz);5.73(2H,s);5.03(1H,m);4.55(1H,dd,J=12.5Hz,4.6Hz);4.38(1H,dd,J=12.5Hz,9.2Hz);3.80(2H,s);3.13(1H,dd,J=12.9Hz,3.5Hz);2.93(1H,m);2.70(1H,dd,J=12.9Hz,9.0Hz);2.67(1H,m);2.50(1H,m);2.33(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);2.25(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);1.85(3H,m);1.36(2H,m)。

用一當量1M HCl的乙醚溶液處理上述游離鹼在DCM(1ml)中的溶液,在減壓下除去溶劑後,得到標題化合物,其為無定形黃色固體(95mg)。

MS(ES+)m/z 453(MH+)。

實施例18 2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,將外消旋2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(其製備參見實施例16A(j))(400mg,1.327mmol)與[1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-甲醛(其合成參見WO2004058144實施例61)(200mg,0.9當量)在氯仿:甲醇(9:1,v:v,15ml)中攪拌30分鐘;然後伴隨劇烈攪拌,在室溫,將混合物用三乙醯氧基硼氫化鈉(844mg,3.0當量)處理30分鐘。將反應通過加入飽和碳酸氫鈉水溶液(5ml)淬滅,並將混合物在室溫攪拌5分鐘。分離有機相,經無水Na2SO4乾燥,並在減壓下蒸除。將粗產物通過矽膠柱色譜純化(用0-12%(2M氨的甲醇溶液)的DCM溶液洗脫,將合適的級分合併,並在減壓下蒸除,得到(外消旋)標題化合物的游離鹼,其為淡黃色泡沫(290mg,46.8%)。

MS(ES+)m/z 453(MH+)。

1H NMR(CDCl3)(與純手性樣品(實施例16A和17A)相同,除了NH的位置)8.00(1H,s);7.82(1H,s);7.77(1H,d,J=9.7Hz);7.18(1H,s);6.39(1H,d,J=9.7Hz);5.73(2H,s);5.03(1H,m);4.55(1H,dd,J=12.5Hz,4.6Hz);4.38(1H,dd,J=12.5Hz,9.2Hz);3.80(2H,s);3.13(1H,dd,J=12.9Hz,3.5Hz);2.93(1H,m);2.70(1H,dd,J=12.9Hz,9.0Hz);2.67(1H,m);2.50(1H,m);2.33(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);2.25(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);1.85(2H,m);(NH在1.70的HOD峰下);1.36(2H,m)。

將游離鹼(290mg)溶於DCM(5ml),並用一當量1M HCl的乙醚溶液處理。在減壓下蒸發溶劑,得到標題化合物,其為淡黃色無定形固體(281mg)。

MS(ES+)m/z 453(MH+)

實施例16B(2R)-2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮苯甲酸鹽,和

實施例17B(2S)-2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮苯甲酸鹽

通過製備型手性HPLC(使用21x 250mm Chiralpak IA,(5微米)製備柱),使用1:1乙腈(含有0.1%異丙基胺)和乙腈(含有0.1%TFA)作為流動相,將外消旋2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽(200mg)拆分為兩個對映異構體。

(2R)-2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(洗脫的第一組分):(81mg)

旋光度:在23.9℃的{α}D=-85.58°(C=.798,在MeOH中)

MS(ES+)m/z 302(MH+)。

將游離鹼溶於甲醇,並用苯甲酸(1當量)處理。在減壓下蒸發溶劑,得到產物(實施例16B),其為苯甲酸鹽。

(2S)-2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(洗脫的第二組分):(76mg)

旋光度:在23.9℃的{α}D=+84.9°(C=.798,在MeOH中)

MS(ES+)m/z 302(MH+)。

將游離鹼溶於甲醇,並用苯甲酸(1當量)處理。在減壓下蒸發溶劑,得到產物(實施例17B),其為苯甲酸鹽。

實施例19A(2R)-2-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(其製備參見實施例16A(j))(600mg,1.991mmol)、2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-甲醛(其合成參見WO2004058144,實施例60)(325mg,0.900當量)和20μL乙酸在氯仿:甲醇(9:1,v:v,30ml)中攪拌2小時;然後伴隨劇烈攪拌,在室溫,將混合物用三乙醯氧基硼氫化鈉(1.266g,3.0當量)處理30分鐘。將混合物通過加入飽和碳酸氫鈉水溶液(6ml)淬滅。加入DCM(60ml),並繼續劇烈攪拌10分鐘,然後分離各相(疏水砂芯漏鬥)。將有機相在減壓下蒸除,並將粗產物通過矽膠柱色譜純化(用0-12%(2M NH3的MeOH溶液)的DCM溶液洗脫)。

將合適的級分合併,並在減壓下蒸除和在真空乾燥過夜,得到標題化合物的游離鹼,其為淡黃色無定形固體(658mg)。

MS(ES+)m/z 467(MH+)。

1H NMR(CDCl3,400MHz)1.25-1.40(2H,m),1.80-1.90(2H,m),2.20-2.30(1H,m),2.30-2.40(1H,m),2.45-2.55(1H,m),2.65-2.75(2H,m),2.90-2.95(1H,m),3.10-3.20(3H,m),3.75(2H,s),4.35-4.45(3H,m),4.50-4.60(1H,dd),5.00-5.10(1H,m),6.40(1H,d),7.00(1H,s),7.75(1H,d),7.85(1H,s),8.05(1H,s)。

將游離鹼(650mg,1.393mmol)懸浮於無水DCM(10ml),加入1M氯化氫的乙醚溶液(1393μL,1.000當量)。將體系保持密封、振搖1分鐘,然後將溶劑在減壓下除去,並將殘餘物在真空乾燥,得到標題化合物,其為無定形黃色固體(682mg)。

實施例20 2-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

實施例19B(2R)-2-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮三氟乙酸鹽,和

實施例21(2S)-2-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮

在室溫,將外消旋2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(其製備參見實施例16A(j))(360mg,1.195mmol)與2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-甲醛(其合成參見WO2004058144,實施例60)(195mg,0.9當量)在氯仿:甲醇(9:1,v:v,15ml)中攪拌30分鐘;然後伴隨劇烈攪拌,在室溫,將混合物用三乙醯氧基硼氫化鈉(760mg,3.0當量)處理30分鐘。將反應通過加入飽和碳酸氫鈉水溶液(5ml)淬滅,並將混合物在室溫攪拌5分鐘。分離有機相,經無水Na2SO4乾燥,並在減壓下蒸除。將粗產物通過矽膠柱色譜純化(用0-12%(2M氨的甲醇溶液)的DCM溶液洗脫,將合適的級分合併,並在減壓下蒸除,得到標題化合物的游離鹼,其為淡黃色泡沫(235mg,42%)。

NMR和LC-MS與實施例19A的產物相同。

將游離鹼(225mg)溶於DCM(5ml),並用一當量1M HCl的乙醚溶液處理。在減壓下蒸發溶劑,得到標題化合物(實施例20),其為淡黃色無定形固體(224mg)。

MS(ES+)m/z 467(MH+)。

通過製備型手性HPLC(使用21x 250mm Chiralpak IA,(5微米)製備柱),使用2:2:1甲醇:乙腈:叔丁醇(含有0.1%異丙基胺)作為流動相,將標題外消旋鹽酸鹽(實施例20,80mg)拆分為兩種對映異構體。

(2R)-2-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(洗脫的第一組分):(31mg)MS(ES+)m/z 467(MH+)。

2R原料具有98.7%純度;通過反相HPLC(Kromasil 5微米,C-18柱(21mm x 250mm),用9:1水(+0.1%TFA)和乙腈(+0.1%TFA)洗脫(3次))進一步純化,得到二-三氟乙酸鹽(實施例19B)。

(2S)-2-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(洗脫的第二組分):(32mg)(實施例21)。該化合物的立體化學通過小分子x-射線晶體學確定。MS(ES+)m/z 467(MH+)。

實施例22 2-({4-[(2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,將外消旋2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(其製備參見實施例16A(j))(50mg,0.166mmol)在9:1v:v氯仿:甲醇(2ml)中與2,3-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-甲醛(其合成參見WO2004058144實施例2(c)或WO03/087098實施例19(d))(28mg,1.0當量)攪拌30分鐘,然後將混合物用三乙醯氧基硼氫化鈉(105mg,3.0當量)處理,伴隨劇烈攪拌。攪拌另外25分鐘後,將反應通過加入飽和碳酸氫鈉水溶液(2ml)淬滅,用二氯甲烷稀釋,並在室溫劇烈攪拌20分鐘。分離有機相(疏水砂芯漏鬥)和在減壓下蒸除,得到橙色膠狀物;將其通過矽膠柱色譜純化(用0-12%(2M NH3的MeOH溶液)的DCM溶液洗脫)。將合適的級分合併,並在減壓下蒸除,得到標題化合物的游離鹼,其為乳狀無定形固體(30mg,40%)。

MS(ES+)m/z 451(MH+)。

1H NMR(CD3OD)δ7.98(1H,s);7.88(1H,d,J=9.7Hz);7.77(1H,s);6.94(1H,s);6.37(1H,d,J=9.7Hz);5.12(1H,m);4.43(2H,m);4.35(2H,m);4.29(2H,m);3.73(2H,s);3.07(1H,m);3.03(1H,m);2.83(1H,dd,J=13.2Hz,8.3Hz);2.70(1H,m);2.44(1H,m);2.26(1H,dt,J=11.6Hz,2.4Hz);2.18(1H,dt,J=11.6Hz,2.4Hz);1.85(2H,m);1.33(2H,m)。

將游離鹼溶於DCM(1ml),並用1M氯化氫的乙醚溶液(67μL,1.0當量)處理;將容器密封並在室溫保持5分鐘,然後將溶劑在減壓下除去,得到標題化合物(20mg;由於蒸發溶劑時飛濺,損失了一些產物)。

MS(ES+)m/z 451(MH+)。

實施例23(1R)-1-({4-[(2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-基甲基)氨基]-4-甲基-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

(a)4-甲基-4-({[(苯基甲基)氧基]羰基}氨基)-1-哌啶甲酸1,1-二甲基乙基酯

將1-{[(1,1-二甲基乙基)氧基]羰基}-4-甲基-4-哌啶甲酸(12.092g,49.7mmol)在甲苯(300ml)中的溶液用三乙胺(13.85ml,99mmol)處理,然後用疊氮磷酸二苯酯(21.42ml,99mmol)處理,加熱至90℃保持2h(觀察到冒泡),然後用苄醇(10.34ml,99mmol)處理。然後將反應在90℃加熱另外18h,然後冷卻,用飽和碳酸氫鈉水溶液(500ml)處理,將有機萃取物分離,並將水相用乙醚(200ml)萃取,將合併的有機萃取液乾燥(MgSO4),過濾,蒸發,色譜純化(0-50%乙酸乙酯:40-60石油醚,Rf=0.4,在4:1乙酸乙酯:40-60石油醚中),得到產物,其為透明油狀物(15.473g,89%)。

(b)(4-甲基-4-哌啶基)氨基甲酸苯基甲基酯

在氬氣中,在室溫,將4-甲基-4-({[(苯基甲基)氧基]羰基}氨基)-1-哌啶甲酸1,1-二甲基乙基酯(15.473g,44.4mmol)在DCM(50ml)中的溶液用三氟乙酸(50ml,649mmol)處理,並在室溫攪拌0.5h。然後將反應混合物蒸發,溶於水(200ml),用乙醚(3x 200ml)洗滌。然後將水相用固體碳酸鉀鹼化,用20%甲醇/DCM(3x 200ml)萃取,然後將這些有機萃取物乾燥(MgSO4),過濾和蒸發,得到產物,其為黃色油狀物(6.327g,57%)。

MS(ES+)m/z 249(MH+)。

(c)(1-{[(2R)-4,9-二氧代-1,2,8,9-四氫-4H,7H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-2-基]甲基}-4-甲基-4-哌啶基)氨基甲酸苯基甲基酯

在0℃,在氬氣中,將(1S)-1-(羥基甲基)-1,2,5,6-四氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(其製備參見實施例5A(g))(1.494g,6.78mmol)在DCM(50ml)中的溶液用三乙胺(1.7ml,12.20mmol)處理,然後用甲烷磺醯氯(0.800ml,10.27mmol)處理,然後溫熱至室溫,並在室溫攪拌1h。然後將反應混合物用飽和碳酸氫鹽水溶液(200ml)處理,並將混合物用DCM(3x 200ml)萃取。然後將合併的有機溶劑乾燥(MgSO4),過濾,蒸發,得到粗品甲磺酸酯(2.082g,6.987mmol,103%粗產率)。將甲磺酸酯溶於無水乙腈(30ml),然後用吡啶(1.097ml,13.57mmol)處理,並將(4-甲基-4-哌啶基)氨基甲酸苯基甲基酯(3.164g,12.74mmol)在無水乙腈(20ml)中的溶液加熱回流(加熱塊95℃)6h。然後將反應混合物蒸發,用飽和NaHCO3水溶液(200ml)處理,並將混合物用DCM(3x 200ml)萃取。然後將合併的有機溶劑乾燥(MgSO4),過濾,蒸發,得到粗產物,其為橙色固體,然後將其色譜純化(0-10%甲醇/DCM,Rf=0.5,在10%甲醇/DCM中),得到產物,其為黃色固體(1.848g,61%)。

MS(ES+)m/z 451(MH+)。

(d)(1R)-1-[(4-氨基-4-甲基-1-哌啶基)甲基]-1,2,5,6-四氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮

在室溫,在氬氣中,將(1-{[(2R)-4,9-二氧代-1,2,8,9-四氫-4H,7H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-2-基]甲基}-4-甲基-4-哌啶基)氨基甲酸苯基甲基酯(1.848g,4.10mmol)在乙醇中的溶液用鈀/碳(10%糊狀物)(0.462g,4.34mmol)(20%w/w)處理,並在1個大氣壓氫氣下攪拌2h,將反應混合物經薄Kielselguhr墊過濾,用乙醇(100ml)洗脫。將濾液用鈀/碳(10%糊狀物)(0.462g,4.34mmol)處理,並在1atm氫氣下攪拌18h。將反應混合物經薄Kielselguhr墊過濾,用乙醇(500ml)洗脫,然後將濾液蒸發,得到產物,其為黃色固體(1.294g,100%)。

MS(ES+)m/z 317(MH+)。

(e)(1R)-1-[(4-異氰酸酯基-4-甲基-1-哌啶基)甲基]-1,2,5,6-四氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮

在氬氣中,在室溫,將(1R)-1-[(4-氨基-4-甲基-1-哌啶基)甲基]-1,2,5,6-四氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(1.294g,4.09mmol)在DCM(30ml)中的溶液用三乙胺(0.684ml,4.91mmol)處理,然後用碳酸二叔丁酯(1.045ml,4.50mmol)處理,最後用4-二甲基氨基吡啶(0.050g,0.409mmol)處理,並在室溫攪拌1h。將反應混合物用碳酸氫鈉水溶液(100ml)處理,並用DCM(3x 200ml)萃取。將合併的有機級分乾燥(MgSO4),過濾和蒸發,得到粗產物,其為黃色固體,然後將其色譜純化(0-10%甲醇/DCM,Rf=0.5,在10%甲醇/DCM中),得到產物,其為白色固體(561mg,40%)。

MS(ES+)m/z 343(MH+)。

(f)(1R)-1-[(4-氨基-4-甲基-1-哌啶基)甲基]-1,2,5,6-四氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮

在室溫,將(1R)-1-[(4-異氰酸酯基-4-甲基-1-哌啶基)甲基]-1,2,5,6-四氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(561mg,1.638mmol)在THF(10ml)和水(10.00ml)中的溶液用氫氧化鈉(5ml,10.00mmol)處理,並在室溫攪拌1h。然後將反應用濃HCl(5ml,12M)處理,並在室溫攪拌18h,然後蒸發。將所得的固體用甲醇(20ml)處理,然後將溶劑從固體中傾倒,蒸發,得到產物,其為不純的綠色固體(687mg,108%)。

MS(ES+)m/z 317(MH+)。

(g)N-(1-{[(2R)-4,9-二氧代-1,2,8,9-四氫-4H,7H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-2-基]甲基}-4-甲基-4-哌啶基)-2,2,2-三氟乙醯胺

在0℃,在氬氣中,將(1R)-1-[(4-氨基-4-甲基-1-哌啶基)甲基]-1,2,5,6-四氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(687mg,1.765mmol)在DCM(20ml)和三乙胺(1.476ml,10.59mmol)中的溶液用三氟乙酸酐(0.299ml,2.118mmol)處理,並在室溫攪拌1h。將反應用飽和碳酸氫鈉(50ml)處理,並用DCM(3x 100ml)萃取。然後將合併的有機溶劑乾燥(MgSO4),過濾,蒸發,得到粗產物,其為橙色固體,然後將其色譜純化(0-10%甲醇/DCM,Rf=0.4,在10%甲醇/DCM中),得到產物,其為不純的黃色固體(375mg,52%)。

MS(ES+)m/z 413(MH+)。

(h)N-(1-{[(1R)-4,9-二氧代-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-1-基]甲基}-4-甲基-4-哌啶基)-2,2,2-三氟乙醯胺

在室溫,將N-(1-{[(2R)-4,9-二氧代-1,2,8,9-四氫-4H,7H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-2-基]甲基}-4-甲基-4-哌啶基)-2,2,2-三氟乙醯胺(375mg,0.909mmol)在1,4-二噁烷(20ml)中的溶液用DDQ(248mg,1.091mmol)處理,然後在80℃加熱1h。然後將反應冷卻至室溫。將反應混合物用飽和K2CO3水溶液(5%,100ml)處理,然後用DCM(100ml)處理,並將混合物經Kieselguhr過濾。將有機級分分離,並將水層用DCM(2x 100ml)萃取。然後將合併的有機溶劑乾燥(MgSO4),過濾和蒸發,得到粗產物,其為黃色油狀物。矽膠色譜純化(0-10%甲醇:DCM,Rf=0.4,在10%MeOH/DCM中)得到產物,其為透明油狀物(171mg,46%)。

MS(ES+)m/z 411(MH+)。

(i)(1R)-1-[(4-氨基-4-甲基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮

將N-(1-{[(1R)-4,9-二氧代-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-1-基]甲基}-4-甲基-4-哌啶基)-2,2,2-三氟乙醯胺(171mg,0.417mmol)用7%碳酸鉀溶液(450mg在2ml水/5ml甲醇中)處理,並在室溫攪拌2h,然後在70℃攪拌18h,然後蒸發和溶於5%MeOH/DCM(100ml),過濾和通過SCX純化(5g,用MeOH,然後用0.5M NH3/MeOH,然後用2M NH3/MeOH洗脫)。然後將含有產物的級分蒸發,得到產物,其為粉色固體(60mg,46%)。

MS(ES+)m/z 315(MH+)。

(j)標題化合物

在室溫,在氬氣中,將(1R)-1-[(4-氨基-4-甲基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(34mg,0.108mmol)在氯仿(2ml)和甲醇(0.1ml)中的懸浮液用2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-甲醛(19.60mg,0.108mmol)(其合成參見WO2004058144,實施例60)處理,並攪拌2h。然後將溶液用三乙醯氧基硼氫化鈉(68.8mg,0.324mmol)處理,並在室溫攪拌0.5h。然後將反應用飽和NaHCO3水溶液(20ml)處理,並用20%甲醇/DCM(3x 100ml)萃取。將合併的有機萃取液乾燥(MgSO4),過濾,蒸發和色譜純化(0-20%甲醇/DCM,Rf=0.4,在15%甲醇/DCM中),得到標題化合物的游離鹼,其為淡棕色固體(32mg,0.067mmol,62%)。

MS(ES+)m/z 517(MH+)。

δH(CDCl3,250MHz)1.14(3H,s),1.42-1.70(4H,m),2.30-2.45(1H,m),

2.50-2.82(4H,m),3.05-3.22(3H,m),3.68(2H,s),4.28-4.48(3H,m)4.51-4.63(1H,m),4.96-5.11(1H,m),6.20-6.35(2H,m),7.04(1H,s),7.46-7.51(2H,m),8.00(1H,s)。

將游離鹼在DCM/MeOH 2:1(10ml)中用1M HCl的乙醚溶液處理,然後蒸發,得到標題單-鹽酸鹽,其為白色固體(34mg)。

實施例24(1R)-1-({4-甲基-4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氬氣中,將(1R)-1-[(4-氨基-4-甲基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(26mg,0.083mmol)(其製備參見實施例23(i))在氯仿(2ml)和甲醇(0.1ml)中的懸浮液用[1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-甲醛(13.83mg,0.083mmol)(其合成參見WO2004058144實施例61)處理,並在室溫攪拌2h。然後將溶液用三乙醯氧基硼氫化鈉(52.6mg,0.248mmol)處理,並在室溫攪拌0.5h。然後將反應用飽和NaHCO3水溶液(10ml)處理,並用20%甲醇/DCM(3x 50ml)萃取。將合併的有機級分乾燥(MgSO4),過濾,蒸發和色譜純化(0-20%甲醇/DCM,Rf=0.3,在15%甲醇/DCM中),得到標題化合物的游離鹼,其為黃色固體(29mg,75%,)。

MS(ES+)m/z 466(MH+)。

δH(CDCl3,250MHz)1.14(3H,s),1.40-1.71(4H,m),2.30-2.46(1H,m),2.51-2.82(4H,m),3.08-3.22(1H,m),3.73(2H,s),4.28-4.42(1H,m)4.51-4.65(1H,m),4.92-5.09(1H,m),5.72(2H,s),6.20-6.34(2H,m),7.25(1H,s),7.50-7.51(2H,m),7.98(1H,s)。

將游離鹼在DCM/MeOH 2:1(5ml)中用1M HCl的乙醚溶液處理,然後蒸發,得到標題單-鹽酸鹽。

實施例25(2R)-2-({4-[(2,1,3-苯並噻二唑-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(50mg,0.166mmol)(其製備參見實施例16(j))和2,1,3-苯並噻二唑-5-甲醛(25mg,0.918當量)在9:1v:v氯仿:甲醇(1ml)中攪拌2.5小時。然後一次性加入三乙醯氧基硼氫化鈉(105mg,3.000當量),並將混合物在室溫劇烈攪拌30min。然後加入飽和碳酸氫鈉水溶液(0.5ml),和二氯甲烷(10ml),並將混合物在室溫劇烈攪拌10min,分離各相(疏水砂芯漏鬥)。將有機相在減壓下蒸除,並將粗產物通過矽膠柱色譜純化(用0-12%(2M NH3的MeOH溶液)的DCM溶液洗脫)。將合適的級分合併,並在減壓下蒸除,得到標題化合物的游離鹼,其為黃色固體(41mg)。

MS(ES+)m/z 450(MH+)。

1H NMR(CDCl3):δ7.95(1H,d,J=9.0Hz);7.90(1H,s);7.83(1H,s);7.77(1H,d,J=9.7Hz);7.61(1H,dd,J=9.2Hz,1.8Hz);6.39(1H,d,J=9.7Hz);5.03(1H,m);4.56(1H,dd,J=12.5Hz,4.6Hz);4.39(1H,dd,J=12.5Hz,9.2Hz);3.98(2H,s);3.14(1H,dd,J=13.2Hz,3.5Hz);2.94(1H,broad m);2.69(2H,m);2.56(1H,m);2.34(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);2.25(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);1.89(2H,m);(NH在1.48的HOD峰下);1.37(2H,m)。

將游離鹼(35mg,0.078mmol)溶於DCM(1ml),並加入1.0M氯化氫的乙醚溶液(78μL,1.0當量)。將體系密封,並在室溫振搖1分鐘,然後將溶劑在減壓下除去,得到標題化合物,其為黃色固體(38mg)。

MS(ES+)m/z 450(MH+)。

實施例26(2R)-2-[(4-{[(7-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(50mg,0.166mmol)(其製備參見實施例16(j))和7-氟-2,3-二氫-苯並[1,4]二氧雜環己二烯-6-甲醛(28mg,0.926當量)(其合成參見WO2002056882,實施例23(a))在9:1v:v氯仿:甲醇(1ml)中攪拌2.5小時。然後一次性加入三乙醯氧基硼氫化鈉(105mg,3.000當量),並將混合物在室溫劇烈攪拌30min。然後加入飽和碳酸氫鈉水溶液(0.5ml),和二氯甲烷(10ml),並將混合物在室溫劇烈攪拌10min,並分離各相(疏水砂芯漏鬥)。將有機相在減壓下蒸除,並將粗產物通過矽膠柱色譜純化(用0-12%(2M NH3的MeOH溶液)的DCM溶液洗脫。將合適的級分合併,並在減壓下蒸除,得到標題化合物的游離鹼,其為白色固體(48mg)。

MS(ES+)m/z 468(MH+)。

1H NMR(CDCl3):δ7.82(1H,s);7.76(1H,d,J=9.7Hz);6.79(1H,d,J=7.2Hz);6.57(1H,d,J=10.5Hz);6.38(1H,d,J=9.7Hz);5.03(1H,m);4.54(1H,dd,J=12.5Hz,4.4Hz);4.38(1H,dd,J=12.5Hz,9.4Hz);4.23(4H,m);3.71(2H,s);3.12(1H,dd,J=12.9Hz,3.3Hz);2.92(1H,m);2.68(2H,m);2.68(2H,m);2.47(1H,m);2.33(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);2.24(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);1.83(2H,m);(NH在1.50的HOD峰下);1.33(2H,m)。

將游離鹼(48mg,0.103mmol)溶於DCM(1ml),並加入1.0M氯化氫的乙醚溶液(103μL,1.0當量)。將體系密封,並在室溫振搖1分鐘,然後將溶劑在減壓下除去,得到標題化合物,其為黃色固體(55mg)。

MS(ES+)m/z 468(MH+)。

實施例27(2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-[1,4]氧硫雜環庚二烯並[2,3-c]吡啶-8-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(50mg,0.166mmol)(其製備參見實施例16(j))和3,4-二氫-2H-[1,4]氧硫雜環庚二烯並[2,3-c]吡啶-8-甲醛(29mg,0.895當量)(可以類似於合成2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-甲醛(WO2004058144,實施例60)但替換二溴乙烷為二溴丙烷來製備)在9:1v:v氯仿:甲醇(1ml)中攪拌2.5小時。然後一次性加入三乙醯氧基硼氫化鈉(105mg,3.000當量),並將混合物在室溫劇烈攪拌30分鐘。加入飽和碳酸氫鈉水溶液(0.5ml),和二氯甲烷(10ml),並將混合物在室溫劇烈攪拌10min,分離各相(疏水砂芯漏鬥)。將有機相在減壓下蒸除,並將粗產物通過矽膠柱色譜純化(用0-12%(2M NH3的MeOH溶液)的DCM溶液洗脫)。將合適的級分合併,並在減壓下蒸除,得到標題化合物的游離鹼,其為淡黃色固體(65mg)。

MS(ES+)m/z 481(MH+)。

1H NMR(CDCl3):δ8.12(1H,s);7.82(1H,s);7.76(1H,d,J=9.7Hz);7.17(1H,s);6.38(1H,d,J=9.7Hz);5.03(1H,m);4.55(1H,dd,J=12.5Hz,4.5Hz);4.37(3H,m);3.79(2H,s);3.13(3H,m);2.94(1H,m);2.69(2H,m);2.52(1H,m);2.30(4H,m);1.86(3H,m);1.37(2H,m)。

將游離鹼(60mg,0.125mmol)懸浮於無水DCM(1ml),並加入1M氯化氫的乙醚溶液(125μL,1.000當量)。將體系保持密封並振搖1分鐘,然後將溶劑在減壓下除去,並將殘餘物在真空管線上乾燥,得到標題化合物,其為無定形黃色固體(64mg)。

MS(ES+)m/z 481(MH+)。

實施例28(2R)-2-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[4,5-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

(a)[1,3]氧硫雜環戊烯並[4,5-c]吡啶-6-甲醛

標題化合物如下製備:(i)用三苯基磷,偶氮二甲酸二異丙基酯和苄醇處理[5-({[4-(甲基氧基)苯基]甲基}氧基)-4-氧代-1,4-二氫-2-吡啶基]甲酸乙酯(其合成參見WO2004058144,實施例60(c)),得到乙酸{5-({[4-(甲基氧基)苯基]甲基}氧基)-4-[(苯基甲基)氧基]-2-吡啶基}甲基酯;(ii)用三氟乙酸和三乙基矽烷處理乙酸{5-({[4-(甲基氧基)苯基]甲基}氧基)-4-[(苯基甲基)氧基]-2-吡啶基}甲基酯,得到乙酸{5-羥基-4-[(苯基甲基)氧基]-2-吡啶基}甲基酯三氟乙酸鹽;(iii)用1,1,1-三氟-N-苯基-N-[(三氟甲基)磺醯基]甲烷磺醯胺和三乙胺處理乙酸{5-羥基-4-[(苯基甲基)氧基]-2-吡啶基}甲基酯三氟乙酸鹽,得到乙酸(4-[(苯基甲基)氧基]-5-{[(三氟甲基)磺醯基]氧基}-2-吡啶基)甲基酯;(iv)用(R)-(+)-2,2雙(二苯基膦基)-1,1-聯萘、乙酸鈀和2-甲基-2-丙烷硫醇鈉處理乙酸(4-[(苯基甲基)氧基]-5-{[(三氟甲基)磺醯基]氧基}-2-吡啶基)甲基酯,得到乙酸{5-[(1,1-二甲基乙基)硫基]-4-[(苯基甲基)氧基]-2-吡啶基}甲基酯;(v)用鈀/碳在1個大氣壓氫氣下處理乙酸{5-[(1,1-二甲基乙基)硫基]-4-[(苯基甲基)氧基]-2-吡啶基}甲基酯,得到乙酸{5-[(1,1-二甲基乙基)硫基]-4-氧代-1,4-二氫-2-吡啶基}甲基酯;(vi)用濃鹽酸處理乙酸{5-[(1,1-二甲基乙基)硫基]-4-氧代-1,4-二氫-2-吡啶基}甲基酯,得到2-(羥基甲基)-5-巰基-4(1H)-吡啶酮;(vii)用碳酸鉀和二溴甲烷處理2-(羥基甲基)-5-巰基-4(1H)-吡啶,得到[1,3]氧硫雜環戊烯並[4,5-c]吡啶-6-基甲醇,和(viii)用二氧化錳處理[1,3]氧硫雜環戊烯並[4,5-c]吡啶-6-基甲醇,得到標題化合物。

(b)標題化合物

將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(50mg,0.166mmol)(其製備參見實施例16(j))和[1,3]氧硫雜環戊烯並[4,5-c]吡啶-6-甲醛(25mg,0.901當量)在9:1v:v氯仿:甲醇(1ml)中攪拌2.5小時。然後一次性加入三乙醯氧基硼氫化鈉(105mg,3.000當量),並將混合物在室溫劇烈攪拌30min。然後加入飽和碳酸氫鈉水溶液(0.5ML),和二氯甲烷(10ml),並將混合物在室溫劇烈攪拌10min,分離各相(疏水砂芯漏鬥)。將有機相在減壓下蒸除,並將粗產物通過矽膠柱色譜純化(用0-12%(2M NH3的MeOH溶液)的DCM溶液洗脫)。將合適的級分合併,並在減壓下蒸除,得到標題化合物的游離鹼,其為淡黃色無定形固體(48mg)。

1H NMR(CDCl3)δ8.22(1H,s);7.82(1H,s);7.76(1H,d,J=9.7Hz);6.80(1H,s);6.38(1H,d,J=9.7Hz);5.77(2H,s);5.03(1H,m);4.55(1H,dd,J=12.5Hz,4.6Hz);4.38(1H,dd,J=12.5Hz,9.4Hz);3.81(2H,s);3.13(1H,dd,J=13.0Hz,3.5Hz);2.93(1H,m);2.68(2H,m);2.49(1H,m);2.33(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);2.24(1H,dt,J=11.4Hz,2.6Hz);1.84(3H,m);(NH在1.66的HOD峰下);1.34(2H,m)。

MS(ES+)m/z 453(MH+)。

將標題化合物的游離鹼(48mg,0.106mmol)懸浮於無水DCM(1ml),並加入1M氯化氫的乙醚溶液(106μL,1.000當量)。將體系保持密封並振搖1分鐘,然後將溶劑在減壓下除去,並將殘餘物在真空管線上乾燥,得到標題化合物,其為無定形黃色固體(48mg)。

MS(ES+)m/z 453(MH+)。

實施例29(2R)-2-[(4-{[(3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(50mg,0.166mmol)(其製備參見實施例16(j))和3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-甲醛(29mg,0.90當量)(其合成參見WO2003087098,實施例301(d))在9:1氯仿:甲醇(1ml)中攪拌3小時,然後加入三乙醯氧基硼氫化鈉(105mg,3.00當量)。將混合物在室溫攪拌另外30分鐘,然後加入飽和碳酸氫鈉水溶液(0.5ml),並將有機相用DCM(10ml)稀釋。將混合物劇烈攪拌10分鐘,然後將有機相分離(疏水砂芯漏鬥)和在減壓下蒸除。將殘餘物溶於DCM(約3ml)+1滴MeOH,並通過矽膠柱色譜純化(用0-12%(2M NH3的MeOH溶液)的DCM溶液洗脫)。將合適的級分合併,和蒸發,得到標題化合物的游離鹼,其為黃色無定形固體。

1H NMR(CDCl3)δ8.58(1H,寬單峰);7.83(1H,s);7.77(1H,d,J=9.7Hz);7.57(1H,d,J=7.8Hz);6.97(1H,d,J=7.8Hz);6.38(1H,d,J=9.7Hz);5.04(1H,m);4.55(1H,dd,J=12.5Hz,4.5Hz);4.38(1H,dd,J=12.5Hz,9.3Hz);3.82(2H,s);3.47(2H,s):3.14(1H,dd,J=13.0Hz,3.5Hz);2.94(1H,m);2.69(2H,m);2.51(1H,m);2.33(1H,dt,J=11.4Hz,2.4Hz);2.25(1H,dt,J=11.4Hz,2.4Hz);(NH在2.06的HOD峰下);1.85(2H,m);1.37(2H,m)。

MS(ES+)m/z 480(MH+)。

將標題化合物的游離鹼(43mg,0.090mmol)溶於DCM(2ml),並加入1M氯化氫的乙醚溶液。將體系保持密封並振搖1分鐘,然後將溶劑在減壓下除去,並將殘餘物在真空管線上乾燥,得到標題化合物,其為無定形黃色固體(38mg)。

MS(ES+)m/z 480(MH+)。

將溶劑除去,並將固體在乾燥器(P2O5)中乾燥過夜,得到產物,其為白色固體(51mg,LCMS和NMR與產物一致)。

實施例30(1R)-1-({4-[(2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氬氣中,將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j))(60mg,0.161mmol)在氯仿(2ml)和甲醇(0.100ml)中的懸浮液用三乙胺(0.067ml,0.482mmol)處理,並在室溫攪拌15h。然後將溶液用2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-甲醛(市售可得)(23.75mg,0.145mmol)處理,並攪拌另外30min。然後將溶液用三乙醯氧基硼氫化鈉(102mg,0.482mmol)處理,並在室溫攪拌30min,30min後,LC-MS顯示一些起始原料存在,加入更多三乙醯氧基硼氫化鈉(19mg),將反應攪拌15min。然後將其用飽和NaHCO3水溶液(10ml)處理,並用20%甲醇/DCM(3x 25ml)萃取。將合併的有機萃取液乾燥(MgSO4),過濾,蒸發和色譜純化(0-20%甲醇/DCM),得到標題化合物,其為游離鹼(48mg,67%),其為黃色膠狀物。

1H NMRδH CDCl3,(250MHz)1.28-1.51(m,2H),1.75-1.99(m,2H),2.13-2.38(m,2H),2.41-2.80(m,3H),2.90-3.15(m,2H),3.75(s,2H),4.22(s,4H),4.31-4.42(m,1H),4.51-4.62(m,1H),4.90-5.08(m,1H),6.20-6.32(m,2H),6.81(m,2H),6.84(m,1H),7.42-7.53(m,2H)。

MS(ES+)m/z 449(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量DCM,用一當量1M HCl的乙醚溶液處理,然後蒸發,得到標題化合物,其為單-HCl鹽(44mg,53%)。LCMS與產物一致。

實施例31(1R)-1-[(4-{[(8-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氬氣中,將(1R)-1-({4-[(1,2,3-苯並噻二唑-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j))(50mg,0.134mmol)在氯仿(2ml)和甲醇(0.100ml)中的懸浮液用三乙胺(0.056ml,0.402mmol)處理,並在室溫攪拌15min。然後將溶液用8-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-甲醛(其合成參見WO2007122258,實施例8(b))(21.96mg,0.121mmol)處理,並攪拌另外30min。將溶液用三乙醯氧基硼氫化鈉(85mg,0.402mmol)處理,並在室溫攪拌30min,30min後,LCMS顯示仍有起始原料和產物的亞胺。因此加入更多三乙醯氧基硼氫化鈉(40mg),將反應攪拌另外30min。此後,LCMS顯示反應完成。然後將反應用飽和NaHCO3水溶液(10ml)處理,並用20%甲醇/DCM(3x 25ml)萃取。將合併的有機級分乾燥(MgSO4),過濾,蒸發和色譜純化(0-20%甲醇/DCM),得到標題化合物的游離鹼(6mg,9.6%),其為淡黃色固體,一些粗產物(15mg,24%),其為不純的淡黃色固體,將其使用SCX柱純化,得到更多相同的標題化合物的游離鹼。

1H NMRδH CDCl3,(250MHz)1.15-1.50(m,2H),1.70-2.10(m,2H),2.15-2.39(m,2H),2.41-2.58(m,1H),2.60-2.74(2H,m),2.85-3.11(m,1H),3.11-3.15(m,1H),3.69(s,2H),4.22-4.45(m,5H),4.50-4.62(m,1H),4.90-5.09(m,1H),

6.20-6.35(m,2H),6.60-6.72(m,2H),7.41-7.52(m,2H)。

MS(ES+)m/z 467(MH+)。

然後將標題化合物的游離鹼用一當量1M HCl的乙醚溶液處理,得到標題化合物,其為單鹽酸鹽(16.7mg,27.5%)。LCMS與產物一致。

實施例32(1R)-1-[(4-{[(7-氯-3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽

在10mL圓底燒瓶中,混合(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(其製備參見實施例5A(j)(80mg,0.266mmol)、7-氯-3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-甲醛(其合成參見WO2003064421,實施例15(c))(62.3mg,0.293mmol)和碳酸氫鈉(100mg,1.190mmol)於DCM(4ml)和甲醇(1ml)中,得到棕色溶液。加入硫酸鈉(200mg,1.408mmol),並將反應在室溫攪拌過夜。15h後,加入三乙醯氧基硼氫化鈉(113mg,0.533mmol),並將反應在25℃在氮氣下攪拌4h。將反應混合物吸附在矽膠上,並使用0-10%MeOH/DCM(1%NH4OH)純化。產物的LCMS和1H NMR與標題化合物一致,其為游離鹼。

1H NMRδH D-4MeOH,(400MHz)1.24-1.45(m,2H),1.79-1.96(m,2H),2.22-2.31(m,2H),2.46-2.53(m,1H),2.59-2.68(m,1H),2.87-3.09(m,4H),3.89(s,2H),4.42-4.51(m,2H),4.69(s,2H),5.07-5.15(m,1H),6.26-6.35(m,2H),7.39(s,1H),7.75-7.81(m,2H),MS(ES+)m/z 497/499(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於10%MeOH/DCM,並用1N HCl處理,形成標題化合物,其為二HCl鹽(55mg,36.2%)。

實施例33(1R)-1-[(4-{[(4-氯-7-氧代-6,7-二氫-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噁嗪-2-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮

在10mL圓底燒瓶中,混合(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(其製備參見實施例5A(j))(60mg,0.178mmol)、4-氯-7-氧代-6,7-二氫-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噁嗪-2-甲醛(其合成參見WO2008009700,實施例124(g))(38mg,0.178mmol)和碳酸氫鈉(150mg,1.78mmol)於DCM(5ml)和甲醇(1ml)中,得到棕色溶液。加入硫酸鈉(200mg,1.408mmol),並將反應在室溫攪拌過夜。15h後,加入三乙醯氧基硼氫化鈉(113mg,0.533mmol),並將反應在25℃在氮氣下攪拌4h。將反應混合物吸附在矽膠上,並使用0-20%MeOH/DCM(1%NH4OH)純化,得到標題化合物(4mg橙色固體,4.51%)。

1H NMRδH CDCl3,(250MHz)1.28-1.51(m,2H),1.75-1.99(m,2H),2.13-2.38(m,2H),2.41-2.80(m,3H),2.90-3.15(m,2H),3.75(s,2H),4.31-4.42(m,1H),4.51-4.62(m,1H),4.8(s,2H),4.90-5.08(m,1H),6.25-6.32(m,2H),7.51-7.53(m,2H),MS(ES+)m/z 498/500(MH+)。

實施例34(1R)-1-[(4-{[(7-氧代-6,7-二氫-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噻嗪-2-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽

(a)[(2,4-二氧代-1,2,3,4-四氫-5-嘧啶基)硫基]乙酸乙基酯

將5-溴-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮(15g,79mmol)和巰基乙酸乙基酯(8.58ml,79mmol)在DMF(200mL)中的溶液用四丁基硫酸氫銨(6.67g,19.64mmol)和碳酸鉀(23.88g,173mmol)處理,並在室溫攪拌過夜。將溶液過濾和在減壓下濃縮,得到標題化合物,其為黃色油狀物,其在減壓下形成泡沫。

MS(ES+)m/z 231.1(MH+)。

(b)[(2,4-二氯-5-嘧啶基)硫基]乙酸乙基酯

將[(2,4-二氧代-1,2,3,4-四氫-5-嘧啶基)硫基]乙酸乙基酯(粗品)(18.19g,79mmol)在三氯氧磷(100ml,1073mmol)中的懸浮液用二甲基苯胺(2.500ml,19.72mmol)處理,並將反應加熱至回流,並攪拌2小時。將溶液冷卻至室溫,並緩慢倒在冰上以淬滅過量的三氯氧磷。一旦淬滅,將水層用CH2Cl2萃取(3X)。將有機層合併,在Na2SO4上乾燥,過濾和在減壓下濃縮。將粗品色譜純化,使用0-50%EtOAc/己烷梯度。產物分離為深黃色油狀物。

1H NMR(400MHz,氯仿-d)ppm 1.22(t,J=7.07Hz,3H)3.71(s,2H)4.15(d,J=7.33Hz,1H)8.53(s,1H)。

(c)[(4-氨基-2-氯-5-嘧啶基)硫基]乙酸乙基酯

在壓力管中,將[(2,4-二氯-5-嘧啶基)硫基]乙酸乙基酯(2.0g,7.49mmol)在DMF(75ml)中的溶液用氨的異丙醇溶液(7.49ml,14.97mmol)處理。將管蓋上蓋,並將反應在室溫攪拌。一旦完成,將溶液在減壓下濃縮,用泵抽吸,以除去殘留的DMF。將粗品色譜純化,使用0-10%丙酮/氯仿梯度。產物含有少量環化物質(其為下一步的產物)。產物分離為淡黃色固體。

MS(ES+)m/z 248.0(MH+)。

(d)2-氯-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噻嗪-7(6H)-酮

將[(4-氨基-2-氯-5-嘧啶基)硫基]乙酸乙基酯(0.786g,3.17mmol)在乙醇(50ml)中的懸浮液加熱至70℃。加入碳酸銫(1.034g,3.17mmol),並將溶液加熱另外5分鐘。白色固體幾乎立即從溶液中沉澱。將溶液在減壓下濃縮。將殘餘物溶於水,並用1N HCl調節至pH=5。將水層用CH2Cl2萃取(2X)。將有機層合併,在Na2SO4上乾燥,過濾和在減壓下濃縮,得到淡黃色固體。

MS(ES+)m/z 202.0(MH+)。

(e)2-乙烯基-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噻嗪-7(6H)-酮

在微波瓶中,將2-氯-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噻嗪-7(6H)-酮(0.639g,3.17mmol)用三丁基乙烯基錫(1.388ml,4.76mmol)和四(三苯基膦)鈀(0)(0.293g,0.254mmol)在1,4-二噁烷(4ml)和甲苯(4mL)中處理。將反應在微波中在140℃加熱20分鐘。將溶液用EtOAc稀釋,並用飽和NaHCO3溶液洗滌。將水層用EtOAc萃取(2X)。將有機溶液合併,在Na2SO4上乾燥,過濾和在減壓下濃縮。將粗品色譜純化,使用0-60%CH2Cl2/(CH2Cl2/MeOH/NH4OH)(90:10:1)梯度。產物分離為所需產物和三苯基膦的混合物。通過研磨和用乙醚洗滌獲得純的物質。產物分離為橙色固體。

MS(ES+)m/z 194.0(MH+)。

(f)7-氧代-6,7-二氫-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噻嗪-2-甲醛

將2-乙烯基-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噻嗪-7(6H)-酮(0.262g,1.356mmol)在甲醇/DCM中的溶液冷卻至-78℃,並用臭氧處理,直至溶液變為藍色。將在-78℃攪拌另外5分鐘。加入二甲硫(5.0ml,67.6mmol),並將溶液溫熱至室溫,並攪拌過夜。將溶液濃縮在矽膠上,並將粗品色譜純化,使用0-100%CH2Cl2/(CH2Cl2/MeOH/NH4OH)(90:10:1)梯度。產物分離為淡黃色固體。

MS(ES+)m/z 195.9(MH+)。

(g)標題化合物

將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(其製備參見實施例5A(j))(0.060g,0.179mmol)在1:1CH2Cl2/MeOH(10mL)中的懸浮液用7-氧代-6,7-二氫-1H-嘧啶並[5,4-b][1,4]噻嗪-2-甲醛(0.035g,0.179mmol)和碳酸氫鈉(0.151g,1.793mmol)處理。加入過量的Na2SO4,並將反應在室溫攪拌18小時。加入三乙醯氧基硼氫化鈉(0.114g,0.538mmol),並將反應在室溫攪拌1小時。將溶液濃縮在矽膠上,並將粗品色譜純化,使用0-100%CH2Cl2/(CH2Cl2/MeOH/NH4OH)(90:10:1)梯度。標題化合物的游離鹼分離為黃色固體(0.027g)。

MS(ES+)m/z 480.1(MH+)。

1H NMR(400MHz,氯仿-d)ppm 1.62(d,J=2.53Hz,1H)1.61(br.s.,1H)1.90-2.09(m,3H)2.20-2.42(m,2H)2.59-2.78(m,2H)3.14(dd,J=12.88,3.03Hz,2H)3.53(s,2H)4.05-4.14(m,2H)4.41(dd,J=12.38,9.35Hz,1H)4.57(dd,J=12.63,4.04Hz,1H)5.04(dd,J=7.96,4.42Hz,1H)5.32(s,1H)6.28(dd,J=16.29,9.22Hz,2H)7.49(d,J=3.28Hz,1H)7.50-7.57(m,1H)。

通過將游離鹼溶於CH2Cl2並加入0.113mL 1N HCl/乙醚,形成標題二-HCl鹽。

實施例35(1R)-1-({4-[(1,2,3-苯並噻二唑-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(1R)-1-({4-[(1,2,3-苯並噻二唑-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j))(60mg,0.161mmol)在氯仿(2ml)和甲醇(0.100ml)中的懸浮液用三乙胺(0.067ml,0.482mmol)處理,並在室溫攪拌15h。然後將溶液用1,2,3-苯並噻二唑-5-甲醛(其合成參見WO0208224實施例20(a))(23.75mg,0.145mmol)處理,並攪拌另外30min。然後將溶液用三乙醯氧基硼氫化鈉(102mg,0.482mmol)處理,並在室溫攪拌45min,45min後,LC-MS顯示反應完成。然後將其用飽和NaHCO3水溶液(10ml)處理,並用20%甲醇/DCM(3x 25ml)萃取。將合併的有機萃取液乾燥(MgSO4),過濾,蒸發和色譜純化(0-5%甲醇/DCM 5%甲醇/DCM),得到標題化合物的游離鹼(26mg,36%),其為淡黃色固體。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.30-1.49(m,2H),1.80-1.98(m,2H),2.21-2.39(m,2H),2.51-2.61(m,1H),2.61-2.75(m,2H),2.90-3.02(m,1H),3.05-3.19(m,1H),4.04(s,2H),4.31-4.42(m,1H),4.51-4.61(m,1H),4.92-5.05(m,1H),6.20-6.31(m,2H),7.45-7.53(2H,m),7.71(d,1H)。8.11(d,1H),8.56(s,1H)

MS(ES+)m/z 449(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量DCM,用一當量1M HCl的乙醚溶液處理,然後蒸發,得到標題化合物,其為單-HCl鹽(16.2mg,20.8%)。LCMS與產物一致。

實施例36(1R)-1-({4-[(2,3-二氫-1-苯並呋喃-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(1R)-1-({4-[(1,2,3-苯並噻二唑-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j))(60mg,0.161mmol)在氯仿(2ml)和甲醇(0.100ml)中的懸浮液用三乙胺(0.067ml,0.482mmol)處理,並在室溫攪拌15min。然後將溶液用2,3-二氫-1-苯並呋喃-5-甲醛(市售可得)(0.020ml,0.161mmol)處理,並攪拌另外30min。然後將溶液用三乙醯氧基硼氫化鈉(102mg,0.482mmol)處理,並在室溫攪拌45min。然後將其用飽和NaHCO3水溶液(10ml)處理,並用20%甲醇/DCM(3x 25ml)萃取。將合併的有機級分乾燥(NaSO4),過濾,蒸發和色譜純化(5-25%甲醇/DCM),得到標題化合物的游離鹼(24mg,34.5%),其為白色固體。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.22-1.49(m,2H),1.79-2.10(m,2H),2.21-2.40(m,2H),2.45-2.58(m,1H),2.61-2.72(m,2H),2.90-3.01(m,1H),3.05-3.15(m,1H),3.21(t,2H),3.72(s,2H),4.32-4.42(m,1H),4.51-4.62(m,3H),4.95-5.05(m,1H),6.22-6.33(m,2H),6.72(d,1H),7.14(d,1H),7.19(s,1H),7.45-7.52(2H,m),MS(ES+)m/z 433(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量DCM,用一當量1M HCl的乙醚溶液處理,然後蒸發,得到標題化合物,其為單-HCl鹽(22.7mg,28.6%)。LCMS與產物一致。

實施例37(1R)-1-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例13(k)或15(d))(50mg,0.100mmol)在氯仿(4ml)和甲醇(0.200ml)中的懸浮液用三乙胺(0.042ml,0.301mmol)處理,並攪拌0.25h(懸浮液變為溶液)。然後加入3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-甲醛(其合成參見WO2004058144,實施例126(e))(16.35mg,0.100mmol),並將反應在室溫攪拌0.5h。然後加入三乙醯氧基硼氫化鈉(67.1mg,0.301mmol),並將反應在室溫攪拌。3h後,仍有一些起始原料,因此加入30mg三乙醯氧基硼氫化鈉。1h後,加入飽和碳酸氫鈉水溶液(25mL),然後加入20%甲醇/DCM(25mL),並將水層萃取,然後與有機層分離。將水層用20%甲醇/DCM(2x25mL)再萃取兩次。將合併的有機層在硫酸鈉上乾燥,過濾和蒸發,得到60mg粗產物。將粗產物通過矽膠色譜純化(0-20%MeOH/DCM),得到標題化合物的游離鹼,其為黃色固體(39mg,87%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.25-1.45(m,2H),1.78-2.08(m,4H),2.22-2.38(m,2H),2.45-2.60(m,1H),2.62(d,1H),2.67-2.80(m,3H),2.93(d,1H),3.05-3.14(m,1H),3.78(s,2H),4.15-4.25(m,2H),4.30-4.45(m,1H),4.50-4.60(m,1H),4.95-5.05(m,1H),6.33(d,1H),6.96(s,1H),7.75(s,1H),7.87(s,1H),8.07(s,1H)。

MS(ES+)m/z 449(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量甲醇/DCM,並用1當量的1M氯化氫的乙醚溶液處理。除去溶劑,並將固體在乾燥器(在P2O5的存在下)中乾燥過周末,得到標題化合物,其為單-HCl鹽,其為黃色固體(40.6mg,79%)。LCMS與產物一致。

實施例38(1R)-1-({4-[(2,3-二氫呋喃並[2,3-c]吡啶-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例13(k)或15(d))(50mg,0.100mmol)在氯仿(20ml)和甲醇(0.800ml)中的懸浮液用三乙胺(0.042ml,0.301mmol)處理,並攪拌0.25h(懸浮液變為溶液)。然後加入2,3-二氫呋喃並[2,3-c]吡啶-5-甲醛(其合成參見WO2007122258,實施例43(f)(14.94mg,0.100mmol),並將反應在室溫攪拌0.5h。然後加入三乙醯氧基硼氫化鈉(67.1mg,0.301mmol),並將應在室溫攪拌。3h後,仍有一些起始原料,因此加入30mg三乙醯氧基硼氫化鈉。1h後,加入飽和碳酸氫鈉水溶液(25mL),然後加入20%甲醇/DCM(25mL),並將水層萃取,然後與有機層分離。將水層用20%甲醇/DCM(2x25mL)再萃取兩次。將合併的有機萃取液在硫酸鈉上乾燥,過濾和蒸發,得到50mg粗產物。將粗產物通過矽膠色譜純化(0-20%甲醇/DCM),得到標題化合物的游離鹼,其為黃色固體(31mg,71.2%)。

1H NMRδH CDCl3,(250MHz)1.25-1.43(m,2H),1.81-2.00(m,2H),2.22-2.35(m,2H),2.49-2.54(m,1H),2.66(d,1H),2.71-2.74(m,1H),2.92(d,1H),3.07-3.12(m,1H),3.19-3.24(m,2H),3.82(s,2H),4.37-4.42(m,1H),4.56-4.62(m,3H),4.96-5.06(m,1H),6.33(d,1H),7.18(s,1H),7.76(d,1H),7.86(s,1H),8.06(s,1H)。

MS(ES+)m/z 435(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量甲醇/DCM,並用1當量的1M氯化氫的乙醚溶液處理。將溶劑除去,並將固體在乾燥器中(在P2O5的存在下)乾燥過周末,得到標題化合物,其為單-HCl鹽,其為橙色固體(33.5mg,67.4%)。LCMS與產物一致。

實施例39(2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(其製備參見實施例16A(j))(60mg,0.199mmol)和3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-甲醛(其合成參見WO2004058144,實施例126(e))(29.2mg,0.179mmol)在氯仿(2ml)和甲醇(0.061ml)中的懸浮液用三乙醯氧基硼氫化鈉(127mg,0.597mmol)處理,並在室溫攪拌30min。然後將反應用飽和NaHCO3水溶液(10ml)處理,並用20%甲醇/DCM(3x 20ml)萃取。將合併的有機萃取液乾燥(MgSO4),過濾,蒸發和使用矽膠色譜純化(0-20%MeOH/DCM),得到標題化合物的游離鹼,其為淡棕色固體。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.28-1.40(m,2H),1.78-1.86(m,2H),1.96-2.01(m,2H),2.14-2.34(m,2H),2.45-2.52(m,1H),2.62-2.74(m,4H),2.91(m,1H),3.07-3.11(m,1H),3.74(s,2H),4.16-4.18(m,2H),4.32-4.37(m,1H),4.48-4.52(m,1H),4.97-5.03(m,1H),6.34(d,1H),6.93(s,1H),7.72(d,1H),7.77(s,1H),8.03(s,1H),MS(ES+)m/z 449(MH+)。

將溶於少量DCM的標題化合物的游離鹼用一當量1M HCl的乙醚溶液(0.17ml)處理,蒸發和在乾燥器中乾燥過夜,得到標題化合物,其為單-HCl鹽(57.3mg,56.4%產率)。LCMS與產物一致。

實施例40(2R)-2-({4-[(2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(其製備參見實施例16A(j))(60mg,0.199mmol)和2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-甲醛(市售可得)(29.4mg,0.179mmol)在氯仿(2ml)和甲醇(0.100ml)中的懸浮液用三乙醯氧基硼氫化鈉(127mg,0.597mmol)處理,並攪拌90min,90min後,LC-MS顯示反應完成。將其用飽和NaHCO3水溶液(10ml)處理,並用20%甲醇/DCM(3x 25ml)萃取。將合併的有機萃取液乾燥(MgSO4),過濾,蒸發和色譜純化(0-20%甲醇/DCM),得到標題化合物的游離鹼(46.8mg,58.4%),其為黃色膠狀物。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.20-1.41(m,2H),1.73-1.91(m,2H),2.09-2.38(m,2H),2.42-2.55(m,1H),2.61-2.72(m,2H),2.85-2.95(m,1H),3.05-3.15(m,1H),3.68(s,2H),4.32(m,4H)。4.32-4.42(m,1H),4.49-4.59(m,1H),4.95-5.06(m,1H),6.39(d,1H),6.71-6.85(m,3H),7.75(d,1H),7.81s,1H)。

MS(ES+)m/z 450(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量DCM,用一當量1M HCl的乙醚溶液處理,然後蒸發,得到標題化合物,其為單-HCl鹽(43.8mg,53.4%)。LCMS與產物一致。

實施例41(2R)-2-[(4-{[(8-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(其製備參見實施例16A(j))(58.5mg,0.194mmol)和8-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-甲醛(其合成參見WO2007122258,實施例8(b))(31.8mg,0.175mmol)在氯仿(2ml)和甲醇(0.100ml)中的懸浮液攪拌0.5h。然後將其用三乙醯氧基硼氫化鈉(123mg,0.582mmol)處理,並攪拌90min。然後將其用飽和NaHCO3水溶液(10ml)處理,並用20%甲醇/DCM(3x 25ml)萃取。將合併的有機萃取液乾燥(NaSO4),過濾,蒸發和使用矽膠色譜純化(0-20%甲醇/DCM),得到標題化合物的游離鹼,其為黃色膠狀物(44.9mg,49.5%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.24-1.55(m,2H),1.78-1.85(m,2H),2.21-2.36(m,2H),2.44-2.51(m,1H),2.64-2.73(m,2H),2.92(d,1H),3.10-3.14(m,1H),3.65(s,2H),4.26-4.30(m,4H),4.35-4.40(m,1H),4.52-4.56(m,1H),4.99-5.05(m,1H),6.38(d,1H),6.62-6.67(m,2H),7.76(d,1H),7.81(s,1H),

MS(ES+)m/z 468(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量DCM,用一當量1M HCl的乙醚溶液處理,然後蒸發和在乾燥器中乾燥過夜,得到標題化合物,其為單-HCl鹽(30.1mg,29.2%)。LCMS與產物一致。

實施例42 7-{[(1-{[(2R)-3,8-二氧代-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-2-基]甲基}-4-哌啶基)氨基]甲基}-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-5-甲腈鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(其製備參見實施例16A(j))(60mg,0.199mmol)和7-甲醯基-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-5-甲腈(其合成參見WO06014580製備13或WO2007122258,實施例31(d))(37.7mg,0.199mmol)在氯仿(2ml)和甲醇(0.100ml)中的懸浮液用三乙醯氧基硼氫化鈉(127mg,0.597mmol)處理,並攪拌90min。然後將其用飽和NaHCO3水溶液(10ml)處理,並用20%甲醇/DCM(3x 25ml)萃取。將合併的有機萃取液乾燥(NaSO4),過濾,蒸發和使用矽膠色譜純化(0-20%甲醇/DCM),得到標題化合物的游離鹼,其為黃色膠狀物(40mg,42.3%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.24-156(m,2H),1.79-1.86(m,2H),2.21-2.36(m,2H),2.43-2.50(m,1H),2.65-2.72(m,2H),2.93(d,1H),3.12-3.16(m,1H),3.68(s,2H),4.29-4.41(m,5H),4.53-4.57(m,1H),5.00-5.06(m,1H),6.39(d,1H),7.06-7.09(m,2H),7.77(d,1H),7.83(s,1H),

MS(ES+)m/z 475(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量DCM,用一當量1M HCl的乙醚溶液處理,蒸發和在乾燥器中乾燥過夜,得到標題化合物,其為單-HCl鹽(45mg,42%),其為淡黃色固體。LCMS與產物一致。

實施例43(2R)-2-({4-[(2,3-二氫呋喃並[2,3-c]吡啶-5-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮(其製備參見實施例16A(j))(70mg,0.232mmol)和2,3-二氫呋喃並[2,3-c]吡啶-5-甲醛(其合成參見WO2007122258,實施例43(f)(34.6mg,0.232mmol)在氯仿(5ml)和甲醇(0.250ml)中的懸浮液攪拌0.5h(懸浮液變為溶液)。然後加入三乙醯氧基硼氫化鈉(155mg,0.697mmol),並將反應在室溫攪拌。3h後,無起始原料剩餘,因此加入飽和碳酸氫鈉水溶液(25mL),然後加入20%甲醇/DCM(25mL),並將水層萃取,然後與有機層分離。將水層用20%甲醇/DCM(2x25mL)再萃取兩次。將合併的有機萃取液在硫酸鈉上乾燥,過濾和蒸發,得到90mg粗產物。將粗產物通過矽膠色譜純化(0-20%MeOH/DCM),得到標題化合物的游離鹼,其為淡黃色固體(77mg,76%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.28-1.48(m,2H),1.81-1.89(m,2H),2.21-2.36(m,2H),2.43-2.55(m,1H),2.64-2.72(m,2H),2.93(d,1H),3.10-3.14(m,1H),3.19-3.23(m,2H),3.81(s,2H),4.34-4.40(m,1H),4.52-4.61(m,3H),4.95-5.08(m,1H),6.37(d,1H),7.17(s,1H),7.76(d,1H),7.81(s,1H),8.06(s,1H)。

MS(ES+)m/z 435(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量甲醇/DCM,並用1當量的1M氯化氫的乙醚溶液處理。將溶劑除去,並將固體在乾燥器中(在P2O5的存在下)乾燥過周末,得到標題化合物,其為單-HCl鹽,其為米色固體(78.9mg,68.5%)。LCMS與產物一致。

實施例44(1R)-1-({4-[(2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例13(k)或15(d))(50mg,0.100mmol)在氯仿(4ml)和甲醇(0.200ml)中的懸浮液用三乙胺(0.042ml,0.301mmol)處理,並攪拌0.25h(懸浮液變為溶液)。然後加入2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-甲醛(市售可得)(16.45mg,0.100mmol),並將反應在室溫攪拌0.5h。然後加入三乙醯氧基硼氫化鈉(67.1mg,0.301mmol),並將反應在室溫攪拌。3h後,加入40mg更多三乙醯氧基硼氫化鈉。1h後,加入30mg更多三乙醯氧基硼氫化鈉。1h後,加入飽和NaHCO3(25mL),然後加入20%MeOH/DCM(25mL),並將水層與有機層分離。將水層用20%MeOH/DCM(2x25mL)再萃取兩次。將合併的有機萃取液用NaSO4乾燥,過濾和蒸發,得到粗產物。將粗產物通過矽膠色譜純化(0-20%MeOH/DCM),得到27mg標題化合物的游離鹼(59.9%總產率)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.21-1.42(m,2H),1.70-1.92(m,2H),2.21-2.36(m,2H),2.41-2.55(m,1H),2.58-2.78(m,2H),2.88-2.98(m,1H),3.05-3.14(m,1H),3.68(s,2H),4.25(s,4H),4.43-4.52(m,1H),4.51-4.62(m,1H),4.98-5.06(m,1H),6.34(d,1H),6.75-6.84(m,3H),7.76(d,1H),7.87(s,1H)。

MS(ES+)m/z 450(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量MeOH/DCM,並用1當量的1M HCl的Et2O溶液處理。

將溶劑合併,並將固體在乾燥器(P2O5)中乾燥過夜,得到標題化合物,其為單-HCl鹽(26mg,0.051mmol,50.7%產率),其為黃色固體。

實施例45(1R)-1-({4-[([1,2,5]噻二唑並[3,4-b]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

向(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j)(60mg,0.161mmol)中加入氯仿(3ml)、甲醇(0.3ml)和三乙胺(0.067ml,0.482mmol)。將反應在氮氣氣氛下攪拌30分鐘,然後加入[1,2,5]噻二唑並[3,4-b]吡啶-6-甲醛(其製備參見實施例49(b))(25.2mg,0.153mmol)。將反應攪拌另外2小時,然後加入三乙醯氧基硼氫化鈉(102mg,0.482mmol),並繼續攪拌16小時。加入更多三乙醯氧基硼氫化鈉(102mg,0.482mmol),並攪拌30分鐘。加入更多三乙醯氧基硼氫化鈉(102mg,0.482mmol),並繼續攪拌2小時。將反應在飽和NaHCO3和20%MeOH的DCM溶液之間分配。將水溶液用20%MeOH的DCM溶液再次萃取,並將合併的有機萃取液通過疏水砂芯漏鬥並過濾,得到紅棕色固體(約65mg)。將其通過矽膠色譜純化,用0-20%MeOH的DCM溶液洗脫,得到標題化合物的游離鹼,其為淡黃褐色膠狀物(18mg)。

1H NMRδH CD3OD 400MHz 1.30(m,1H),1.42(m,1H),1.88(br d,1H),1.98(br d,1H),2.28(q,2H),2.63(m,2H),2.89(dd,1H),3.01(dd,1H),3.06(br d,1H),4.08(s,2H),4.45(m,2H),5.10(m,1H),6.28(dd,2H),7.76(d,2H),8.41(br d,1H),9.08(br d,1H)

MS(ES+)m/z 450(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於2:1DCM:MeOH(1ml),並加入HCl(1M的乙醚溶液)(0.040ml,0.04mmol)。將溶劑蒸發,得到淡棕色固體(22mg,28%)。

實施例46(1R)-1-[(4-{[(4-氟-1H-苯並咪唑-2-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽

向10mL圓底燒瓶中加入(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(其製備參見實施例5A(j))(80mg,0.238mmol)、4-氟-1H-苯並咪唑-2-甲醛(其合成參見WO2003087098,實施例320)(42.9mg,0.261mmol)和碳酸氫鈉(100mg,1.190mmol)於DCM(4ml)和甲醇(1ml)中的溶液,得到棕色懸浮液。加入硫酸鈉(200mg,1.408mmol),並將反應在室溫攪拌過夜。15h後,加入三乙醯氧基硼氫化鈉(101mg,0.475mmol),並將反應在25℃氮氣下攪拌4h。將反應混合物吸附在矽膠上,並和使用0-10%MeOH/DCM(1%NH4OH)純化,得到標題化合物的游離鹼。LCMS和1H NMR與所需產物一致。

1H NMRδH D-4MeOH,(400MHz)1.35-1.55(m,2H),1.90-1.96(m,2H),2.30-2.41(m,2H),2.71-2.81(m,2H),2.91-2.99(m,1H),3.05-3.15(m,2H),4.20(s,2H),4.41-4.50(m,2H),4.69(s,2H),5.10-5.20(m,1H),6.25-6.36(m,2H),6.91-7.05(m,1H),7.16-7.25(m,1H),7.31-7.39(m,1H),7.75-7.81(m,2H),

MS(ES+)m/z 449(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於10%MeOH/DCM,並用1N HCl處理,形成標題化合物,其為二HCl鹽(17mg,0.033mmol,13.73%產率)。

實施例47(1R)-1-[((2S)-2-{[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]甲基}-4-嗎啉基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽

(a)[((2S)-4-{[(2R)-4,9-二氧代-1,2,8,9-四氫-4H,7H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-2-基]甲基}-2-嗎啉基)甲基]氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯

在0℃,在100mL圓底燒瓶中加入(1S)-1-(羥基甲基)-1,2,5,6-四氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(其製備參見實施例5A(g))(450mg,2.043mmol)和三乙胺(0.342ml,2.452mmol)於DCM(20ml)中的溶液,得到橙色溶液。加入甲烷磺醯氯(0.174ml,2.248mmol),並將反應溫熱至室溫,並攪拌1h。LCMS指示已經形成甲磺酸酯。將反應混合物用DCM(100mL)稀釋,並用2X 25mL飽和NaHCO3水溶液洗滌。分離有機相併在Na2SO4上乾燥。將溶液在真空下濃縮,並溶於乙腈(20.00ml)。加入吡啶(0.500ml),然後加入[(2R)-2-嗎啉基甲基]氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯(其合成參見WO2008009700實施例89(e))(884mg,4.09mmol),並將反應加熱至75℃。將反應攪拌5h,之後,LCMS指示反應完成。將反應冷卻至室溫,並在真空濃縮。將反應混合物用DCM(100mL)稀釋,並用25mL飽和NaHCO3水溶液洗滌。分離有機相,並在Na2SO4上乾燥。將所得殘餘物在矽膠上純化,使用0-10%MeOH/DCM,得到標題化合物(805mg,1.539mmol,75%產率),分離為紅色油狀物。

MS(ES+)m/z 419(MH+)。

(b)[((2S)-4-{[(1R)-4,9-二氧代-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-1-基]甲基}-2-嗎啉基)甲基]氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯

在室溫,在氮氣下,向50mL圓底燒瓶中加入[((2S)-4-{[(2R)-4,9-二氧代-1,2,8,9-四氫-4H,7H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-2-基]甲基}-2-嗎啉基)甲基]氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯(805mg,1.924mmol)於1,4-二噁烷(10ml)中的溶液,得到橙色溶液。加入DDQ(655mg,2.89mmol),並且反應變為非常黑。將反應油浴上加熱至90℃,並攪拌30min。將反應冷卻至室溫,加入200mL5%K2CO3水溶液,並將反應用DCM(3X200mL)萃取。將合併的有機層用飽和NaCl水溶液洗滌;將有機層分離,並在Na2SO4上乾燥,並濃縮,得到粗產物。將粗產物加至矽膠柱,並用0-20%MeOH/CHCl3洗脫,得到標題化合物(830mg,1.794mmol,93%產率),其為紅色油狀物。

MS(ES+)m/z 417(MH+)。

(c)(1R)-1-{[(2S)-2-(氨基甲基)-4-嗎啉基]甲基}-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(HCl)

向50mL圓底燒瓶中加入[((2S)-4-{[(1R)-4,9-二氧代-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-1-基]甲基}-2-嗎啉基)甲基]氨基甲酸1,1-二甲基乙基酯(830mg,1.993mmol)於DCM(10ml)中的溶液,得到棕色溶液。加入4N HCl的二噁烷溶液(2.491ml,9.96mmol),並將反應混合物在室溫攪拌。30min後,溶液變渾濁,因此加入2mL甲醇,並將反應攪拌另外30min。將反應在真空下濃縮,得到所需產物,其為HCl鹽(520mg,1.474mmol,74.0%產率),其為棕色固體,其不經進一步純化直接使用。

(d)標題化合物:

向10mL圓底燒瓶中加入(1R)-1-{[(2S)-2-(氨基甲基)-4-嗎啉基]甲基}-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(HCl)(85mg,0.241mmol)、[1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-甲醛(40.3mg,0.241mmol)(其合成參見WO2004058144實施例61)和NaHCO3(60.7mg,0.723mmol)於DCM(4ml)和甲醇(1ml)中的溶液,得到黃色懸浮液。將反應攪拌過夜,並加入三乙醯氧基硼氫化鈉(102mg,0.482mmol)。將應攪拌4h,然後經Celite墊過濾,並將墊用10%MeOH/DCM洗滌。矽膠色譜純化,用0-10%MeOH/CHCl3(1%NH4OH)洗脫,得到標題化合物的游離鹼,其中LCMS、1HNMR一致。

1H NMRδH D-4MeOH,(400MHz)2.02-2.13(m,1H),2.34-2.49(m,2H),2.60-2.78(m,2H),2.85-3.08(m,2H),3.40-3.68(m,2H),3.72-3.89(m,1H),4.40-4.51(m,2H),4.89(s,2H),5.10-5.20(m,1H),5.80-5.89(m,2H),6.23-6.38(m,2H),7.72-7.82(m,2H),7.90-7.96(m,2H),

MS(ES+)m/z 468(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於10%MeOH/DCM,並用500uL 1N HCl的乙醚溶液處理。將溶液在真空下濃縮,得到標題化合物,其為二HCl鹽(49mg,0.091mmol,37.6%產率),其為褐色固體。

實施例48(1R)-1-{[(2S)-2-({[(7-氯-3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基)甲基]氨基}甲基)-4-嗎啉基]甲基}-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽

向10mL圓底燒瓶中加入(1R)-1-{[(2S)-2-(氨基甲基)-4-嗎啉基]甲基}-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(HCl)(其製備參見實施例47(c))(85mg,0.241mmol)、7-氯-3-氧代-3,4-二氫-2H-1,4-苯並噁嗪-6-甲醛(51.0mg,0.241mmol)(其合成參見WO2003064421,實施例15(c))和NaHCO3(60.7mg,0.723mmol)於DCM(4ml)和甲醇(1ml)中的溶液,得到黃色懸浮液。加入Na2SO4(171mg,1.205mmol),將反應攪拌過夜,並加入三乙醯氧基硼氫化鈉(102mg,0.482mmol)。將反應攪拌4h,經Celite墊過濾,並將墊用10%MeOH/DCM洗滌。矽膠色譜純化,用0-10%MeOH/CHCl3(1%NH4OH)洗脫,得到標題化合物的游離鹼,其中LCMS、1H NMR與所需產物一致。

1H NMRδH D-4MeOH,(400MHz)2.05-2.13(m,1H),2.32-2.49(m,2H),2.59-2.80(m,2H),2.88-3.07(m,3H),3.42(s,2H),3.40-3.49(m,1H),3.58-3.67(m,1H),3.72-3.96(m,3H),4.42-4.51(m,2H),4.68(s,2H),5.10-5.18(m,1H),6.22-6.35(m,2H),7.39(s,1H)7.72-7.80(m,2H)。

MS(ES+)m/z 513/515(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於10%MeOH/DCM,並用500uL 1N HCl的乙醚溶液處理。將溶液在真空下濃縮,得到標題化合物,其為二HCl鹽(61mg,0.104mmol,43.2%產率),其為淡黃色固體。

實施例49(2R)-2-({4-[([1,2,5]噻二唑並[3,4-b]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮

(a)6-[(E)-2-苯基乙烯基][1,2,5]噻二唑並[3,4-b]吡啶

向6-溴[1,2,5]噻二唑並[3,4-b]吡啶(其製備參見Indian Journal of Chemistry,Section B:Organic Chemistry Including Medicinal Chemistry(1979),17B(1),13-16)(1.9g,8.79mmol)、[(E)-2-苯基乙烯基]硼酸(1.561g,10.55mmol)和四三苯基磷鈀(0)(0.508g,0.440mmol)中加入在水(19ml)中的1,4-二噁烷(38ml)和碳酸鉀(1.276g,9.23mmol)。然後將反應在回流下攪拌1.5小時。將冷卻的反應在氯仿和水之間分配。用疏水砂芯漏鬥分離各相,並將有機萃取物濃縮,得到黑色固體/膠狀物(~2.4g)。將該粗品通過矽膠色譜純化,用20-50%EtOAc的環己烷溶液洗脫,得到產物,其為黃色/棕色固體(0.88g)。

1H NMRδH D6-DMSO 400MHz 7.36(t,1H),7.45(t,2H),7.55(d,1H),7.70(d,2H),7.78(d,1H),8.3(s,1H),9.51(s,1H)

MS(ES+)m/z 240(MH+)。

(b)[1,2,5]噻二唑並[3,4-b]吡啶-6-甲醛

向6-[(E)-2-苯基乙烯基][1,2,5]噻二唑並[3,4-b]吡啶(0.88g,3.68mmol)中加入丙酮(30ml)、50wt.%N-甲基-嗎啉-N-氧化物的水溶液(1.525ml,7.35mmol)和四氧化鋨的水溶液(0.225ml,0.037mmol)。然後將反應攪拌20小時。向淡棕色溶液中加入高碘酸鈉(3.15g,14.71mmol),並繼續攪拌45分鐘。將溶劑旋轉蒸發減少,並將剩餘物在氯仿和水之間分配。將水相用氯仿再次萃取,並將合併的有機萃取液通過疏水砂芯漏鬥並濃縮,得到棕色/黑色固體(0.6g)。將部分該物質(0.575g)通過矽膠色譜純化,用20%EtOAc的環己烷溶液洗脫,得到淡黃色固體(160mg)。

1H NMRδH D6-DMSO 400MHz 9.18(s,1H),9.49(s,1H),10.30(s,1H)

(c)標題化合物

向(2R)-2-[(4-氨基環己基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例16A(j))(100mg,0.333mmol)中加入氯仿(3ml)、甲醇(0.300ml)和三乙胺(0.139ml,0.999mmol)。將混合物攪拌20分鐘,然後加入[1,2,5]噻二唑並[3,4-b]吡啶-6-甲醛(52.2mg,0.316mmol)。將反應攪拌過夜,然後加入三乙醯氧基硼氫化鈉(212mg,0.999mmol),並繼續攪拌1小時。加入另外的三乙醯氧基硼氫化鈉(212mg,0.999mmol),並將反應攪拌1小時。將反應在飽和NaHCO3和20%MeOH的氯仿溶液之間分配。將水相用20%MeOH的氯仿溶液再次萃取,並將合併的有機萃取液通過疏水砂芯漏鬥並濃縮。將該粗品(~110mg)通過色譜純化,用0-20%MeOH的DCM溶液洗脫,得到產物(46mg,27%)。將其冷凍乾燥除去1,4-二噁烷,得到標題化合物,其為淡棕色固體(45mg,25%))。

1H NMRδH CDCl3 400MHz 1.38(m,2H),1.91(t,2H),2.25(dt,1H),2.35(dt,1H),2.58(m,1H),2.71(m,2H),2.96(br d,1H),3.16(dd,1H),4.06(s,2H),4.40(dd,1H),4.56(dd,1H),5.04(m,1H),6.40(d,1H),7.78(d,1H),7.83(s,1H),8.26(s,1H)

MS(ES+)m/z 451(MH+)。

實施例50(1R)-1-({4-[(3,4-二氫-2H-色烯-7-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

在室溫,將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j))(188mg,0.503mmol)和三乙胺(0.175ml,1.256mmol)在氯仿(4.5ml)和甲醇(0.5ml)中的溶液在室溫攪拌15min,然後在室溫滴加3,4-二氫-2H-色烯-7-甲醛(其合成參見WO2007067511實施例19(色滿-7-甲醛))(68mg,0.419mmol)在氯仿(2ml)中的溶液。將反應混合物在室溫攪拌1h,然後一次性加入三乙醯氧基硼氫化鈉(444mg,2.096mmol),並將反應混合物在室溫攪拌過夜。LCMS顯示產物的混合物,殘留一些醛。加入另外的三乙醯氧基硼氫化鈉(267mg,1.258mmol),並將反應在室溫攪拌6h。將反應用NaHCO3(水溶液)(20ml)淬滅,並用20%MeOH/DCM(3x 30ml)萃取。將合併的有機層經MgSO4乾燥,過濾,蒸發和色譜純化(0-50%MeOH/DCM),得到標題化合物的游離鹼,其為淡黃色透明油狀物(49mg,0.11mmol,26%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.28-1.42(m,2H),1.78-1.87(m,2H),1.97-2.01(m,2H),2.17-2.31(m,2H),2.47-2.55(m,1H),2.62-2.68(m,2H),2.74-2.77(m,2H),2.95(d,1H),3.07(dd,1H)3.71(m,2H),4.17(t,2H),4.35(dd,1H),4.56(dd,1H),4.96-5.02(m,1H),6.23-6.31(m,2H),6.72(s,1H),6.77(dd,1H),6.98(d,1H),7.47-7.50(m,2H)。

MS(ES+)m/z 447(MH+)。

將標題化合物的游離鹼在2ml DCM中用一當量1M HCl的乙醚溶液處理,然後蒸發,得到標題化合物,其為單-HCl鹽,其為淡橙色粉末(51mg,25%)。LCMS與產物一致。

實施例51(1R)-1-({4-[(2,3-二氫-1-苯並呋喃-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

(a)2,3-二氫-1-苯並呋喃-6-甲醛

在-78℃,向6-溴-2,3-二氫-1-苯並呋喃(190mg,0.955mmol)在THF(4ml)中的溶液中加入n-BuLi(1.313ml,2.100mmol)。將反應混合物在-78℃攪拌45min,然後滴加DMF(1.109ml,1.6M的己烷溶液,14.32mmol)在THF(2ml)中的溶液,並將反應在-78℃攪拌10min,然後溫熱至室溫,並攪拌1h。LCMS顯示無起始原料剩餘。然後將反應在室溫攪拌另外2.5h。將反應混合物小心地倒入2M HCl(50ml),並用乙酸乙酯(3x 50ml)萃取。將合併的有機萃取液用飽和食鹽水(50ml)洗滌,經MgSO4乾燥,過濾,蒸發和色譜純化(用0-100%EtOAc/己烷洗脫)。將相關級分合併,並蒸發,得到產物,其為透明、無色油狀物(44mg,0.297mmol,31%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)3.28(t,2H),4.64(t,2H),7.26(s,1H),7.33-7.39(m,2H),9.91(s,1H)。

(b)標題化合物

在室溫,將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j))(133mg,0.356mmol)和三乙胺(0.124ml,0.891mmol)在氯仿(4.5ml)和甲醇(0.5ml)中的溶液在室溫攪拌15min,然後在室溫滴加2,3-二氫-1-苯並呋喃-6-甲醛(44mg,0.297mmol)在氯仿(2ml)中的溶液。將反應混合物在室溫攪拌過夜。將反應用NaHCO3(水溶液)(20ml)淬滅,用20%MeOH/DCM(3x 30ml)萃取。將合併的有機層經MgSO4乾燥,過濾,蒸發和色譜純化(0-50%MeOH/DCM)。將相關級分合併,並蒸發,得到標題化合物的游離鹼,其為淡黃色透明油狀物(18mg,0.04mmol,26%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.40-1.53(m,2H),1.85-1.92(m,2H),2.16-2.30(m,2H),2.54-2.68(m,3H),2.98(d,1H),3.08(dd,1H),3.16(t,2H),3.78(s,2H),4.33-4.38(m,1H),4.52-4.57(m,3H),4.96-5.02(m,1H),6.24(d,1H),6.29(d,1H),6.79(s,1H),6.84(d,1H),7.13(d,1H),7.47-7.50(m,2H)。

MS(ES+)m/z 433(MH+)。

將標題化合物的游離鹼在2ml DCM中用1M HCl的乙醚溶液(0.04ml,0.04mmol)滴加處理,得到標題化合物,其為單-HCl鹽,其為橙色粉末(20mg,14%)。

實施例52(1R)-1-({4-[(3,4-二氫-2H-色烯-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽

將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j))(12mg,0.032mmol)和三乙胺(0.139ml,0.999mmol)在DCM(4.5ml)和甲醇(0.5ml)中的溶液在室溫攪拌5min。加入3,4-二氫-2H-色烯-6-甲醛(市售可得)(45mg,0.277mmol),並將所得溶液攪拌過夜18h。LCMS顯示有醛剩餘且無胺剩餘。加入另外的(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(120mg,0.321mmol)和另外的三乙胺(0.138ml,0.999mmol),並將所得混合物攪拌1h。加入另外的三乙醯氧基硼氫化鈉(294mg,1.387mmol),並將所得溶液攪拌60h。將反應用DCM(10ml)和碳酸氫鈉溶液(10ml)稀釋,並在室溫攪拌10分鐘,並用甲醇:DCM(20%,3x150ml)萃取。將合併的有機萃取液乾燥(MgSO4),過濾,蒸發和色譜純化(0-50%甲醇:DCM)。濃縮柱洗脫液,得到棕色油狀物,將其再次色譜純化(0-50%甲醇:DCM)。將相關級分合併,得到標題化合物的游離鹼,其為白色固體(27mg,0.06mmol,22%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.76-1.86(m,2H),1.91-1.97(m,2H),2.04-2.06(mm,2H),2.15(t,1H),2.24(t,1H),2.62(dd,1H),2.75-2.81(m,4H),3.06-3.14(m,2H),3.85(s,2H),4.12(t,2H),4.40(dd,1H),4.51(dd,1H),4.96-5.02(m,1H),6.22-6.29(m,2H),6.77(d,1H),7.25-7.27(m,2H),7.47-7.50(m,2H)。

MS(ES+)m/z 447(MH+)。

將標題化合物的游離鹼在氯仿(5ml)和甲醇(3ml)中用氯化氫的乙醚溶液(1M,0.06ml,0.06mmol)滴加處理,得到標題化合物,其為單-HCl鹽,其為白色固體(6mg,4%)。

實施例53(2R)-2-[(4-{[(5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

(a)5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯

將3-氟-1,2-苯二醇(5.278g,41.2mmol)在DMF(50ml)中的溶液用碳酸鉀(17.08g,124mmol)和1,2-二溴乙烷(3.91ml,45.3mmol)處理,並在室溫攪拌72h。將反應用水(200ml)處理,並用3x200ml(EtOAc)萃取。將合併的有機萃取液用水(200ml)、飽和食鹽水(200ml)洗滌,乾燥(MgSO4),蒸發和色譜純化(0-20%EtOAc-環己烷),得到產物,其為透明油狀物(2.437g,38%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)4.22-4.39(m,4H),6.60-6.82(m,3H)。

(b)6-溴-5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯

在0℃,將5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯(0.335g,2.173mmol)在甲醇(10ml)中的溶液用溴(0.134ml,2.61mmol)處理,並經10min溫熱至室溫,並在室溫攪拌18h。然後將反應用飽和偏亞硫酸鈉水溶液(100ml)處理,用3x 100ml(DCM)萃取,將合併的有機萃取液乾燥(MgSO4),過濾,蒸發,色譜純化(0-50%EtOAC:環己烷),得到產物,其為透明油狀物,其在冰箱中固化,得到白色固體(351mg,59%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)4.20-4.39(m,4H),6.52-6.65(m,1H),6.91-7.05(m,1H)。

(c)5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-甲醛

在-78℃,在氮氣氣氛下,將6-溴-5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯(146mg,0.627mmol)在THF(5ml)中的溶液用n-BuLi(0.551ml,1.378mmol)處理,並在-78℃攪拌15min,然後用DMF(0.243ml,3.13mmol)在THF(2.00ml)中的溶液處理。將反應在-78℃攪拌10min,然後經10min將反應溫熱至室溫,並在室溫攪拌0.5h。將反應用2M HCl(20ml)處理,並用乙酸乙酯(3x 100ml)萃取。將有機萃取物蒸發,乾燥(MgSO4),過濾,蒸發,色譜純化(0-100%EtOAC:環己烷),得到產物,其為白色固體(25mg,22%)。

MS(ES+)m/z 183(MH+)。

(d)標題化合物

在室溫,在氬氣中,將(2R)-2-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例16A(j),在手性hplc純化後,胺轉化為二鹽酸鹽)(51.3mg,0.137mmol)在氯仿(5ml)和甲醇(0.1ml)中的懸浮液用三乙胺(0.057ml,0.411mmol)處理,並在室溫攪拌0.25h。然後將溶液用5-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-甲醛(24.95mg,0.137mmol)處理,並攪拌另外0.5h。然後將溶液用三乙醯氧基硼氫化鈉(174mg,0.822mmol)處理,並在室溫攪拌2h,加入更多三乙醯氧基硼氫化鈉(174mg,0.137mmol),將反應攪拌另外1h,然後將反應用飽和NaHCO3水溶液(20ml)處理,並用20%甲醇/DCM(3x 20ml)萃取。將合併的有機萃取液乾燥(MgSO4)和色譜純化(0-20%甲醇:DCM),得到標題化合物的游離鹼,其為白色固體(29mg,0.062mmol,45%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.20-1.46(m,2H),1.73-1.95(m,2H),2.15-2.39(m,2H),2.41-2.55(m,1H),2.61-2.75(m,2H),2.88-3.00(m,1H),3.10-3.20(m,1H),3.78(s,2H),4.22-4.42(m,5H)。4.51-4.60(m,1H),4.95-5.09(m,1H),6.38(d,1H),6.62(m,1H),6.71-6.80(m,1H),7.76(d,1H),7.81(s,1H)

MS(ES+)m/z 468(MH+)。

將標題化合物的游離鹼(29mg)在DCM/MeOH 2:1(5ml)中用1M HCl的乙醚溶液62ul)處理,然後蒸發,得到標題化合物,其為單-HCl鹽(31mg,0.062mmol),其為黃色固體。

實施例54(1R)-1-{[(2S)-2-({[(7-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}甲基)-4-嗎啉基]甲基}-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽

向10mL圓底燒瓶中加入(1R)-1-{[(2S)-2-(氨基甲基)-4-嗎啉基]甲基}-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(HCl)(85mg,0.241mmol)(其製備參見實施例47(c))、7-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-甲醛(48.3mg,0.265mmol)(其合成參見WO2002056882,實施例23(a))和NaHCO3(60.7mg,0.723mmol)於DCM(4ml)和甲醇(1ml)中的溶液,得到黃色懸浮液。加入硫酸鈉(171mg,1.205mmol),將反應攪拌過夜,此時加入三乙醯氧基硼氫化鈉(102mg,0.482mmol)。將反應攪拌4h,此時LCMS顯示反應完成。將反應混合物用10%MeOH的DCM溶液(20mL)稀釋,過濾,吸附在矽膠上並通過矽膠色譜純化,用0-10%MeOH/CHCl3(1%NH4OH)洗脫,得到標題化合物的游離鹼,其中LCMS、1H NMR與所需產物一致。

1H NMRδH D-4MeOH,(400MHz)2.03-2.10(m,1H),2.33-2.49(m,2H),2.51-2.68(m,2H),2.83-2.95(m,2H),2.99-3.07(m,1H),3.39(s,2H),3.41-3.50(m,1H),3.55-3.63(m,1H),3.68-3.80(m,3H),4.42-4.51(m,2H),4.79(s,2H),5.08-5.18(m,1H),6.22-6.32(m,2H),6.58-6.62,(m,1H),6.81-6.88(m,1H),7.73-7.80(m,2H)。

MS(ES+)m/z 483(MH+)。

將標題化合物的游離鹼用5%MeOH/CHCl3稀釋,並用1N HCl的乙醚溶液100uL處理,並濃縮,得到標題化合物,其為二HCl鹽(55mg,0.099mmol,41.1%產率),其為淡黃色固體。

實施例55(1R)-1-[((3S)-3-{[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]甲基}-1-吡咯烷基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽

(a)(3S)-3-{[(三氟乙醯基)氨基]甲基}-1-吡咯烷甲酸1,1-二甲基乙基酯

向100mL圓底燒瓶中加入(3S)-3-(氨基甲基)-1-吡咯烷甲酸1,1-二甲基乙基酯(市售可得)(750mg,3.74mmol)於DCM(20ml)中的溶液,得到無色溶液。加入三乙胺(1.044ml,7.49mmol),並將反應冷卻至0℃。加入三氟乙酸酐(0.635ml,4.49mmol),並將反應溫熱至室溫同時攪拌14h。將溶液用100mL DCM稀釋,並用飽和NaHCO3水溶液和飽和NaCl水溶液洗滌。分離有機層,經Na2SO4乾燥,過濾和濃縮。將殘餘物接受矽膠色譜純化,得到產物(0.990g,3.34mmol,89%產率),其為淡黃色油狀物。

MS(ES+)m/z 297(MH+)。

(b)2,2,2-三氟-N-[(3R)-3-吡咯烷基甲基]乙醯胺鹽酸鹽

在25℃,向100mL圓底燒瓶中加入(3S)-3-{[(三氟乙醯基)氨基]甲基}-1-吡咯烷甲酸1,1-二甲基乙基酯(830mg,2.80mmol)於DCM(25ml)中的溶液,得到無色溶液。加入4N HCl(3.50ml,14.01mmol)的二噁烷溶液,並將反應攪拌過夜。將反應在真空下濃縮,得到所需化合物,其為無色油狀物,將其不經進一步純化直接用於下一步反應。分離得到2,2,2-三氟-N-[(3R)-3-吡咯烷基甲基]乙醯胺(550mg,2.364mmol,84%產率)。

MS(ES+)m/z 197(MH+)。

(c)N-[((3S)-1-{[(2R)-4,9-二氧代-1,2,8,9-四氫-4H,7H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-2-基]甲基}-3-吡咯烷基)甲基]-2,2,2-三氟乙醯胺

0℃,向100mL圓底燒瓶中加入(1S)-1-(羥基甲基)-1,2,5,6-四氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮HCl(其製備參見實施例47(c))(350mg,1.589mmol)、三乙胺(0.266ml,1.907mmol)於DCM(20ml)中的溶液,得到橙色溶液。加入甲烷磺醯氯(0.135ml,1.748mmol),並將反應溫熱至室溫,並攪拌1h。LCMS顯示已經形成甲磺酸酯。將反應用DCM(100mL)稀釋,並用2X 25mL飽和NaHCO3水溶液洗滌。分離有機相,並經Na2SO4乾燥。將溶液在真空下濃縮,用乙腈(20.00ml)稀釋,並加入吡啶(0.500ml)。加入2,2,2-三氟-N-[(3R)-3-吡咯烷基甲基]乙醯胺(550mg,2.364mmol),並將反應加熱至80℃,並攪拌25h。LCMS顯示反應完成。將反應冷卻至室溫,並在真空下濃縮。將反應混合物用DCM(100mL)稀釋,並用25mL飽和NaHCO3溶液洗滌。將有機相分離,並經Na2SO4乾燥。將粗產物在矽膠上純化,用0-15%MeOH/DCM洗脫,得到產物(240mg,0.602mmol,37.9%產率),其為淡黃色油狀物。

MS(ES+)m/z 399(MH+)。

(d)N-[((3S)-1-{[(1R)-4,9-二氧代-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-1-基]甲基}-3-吡咯烷基)甲基]-2,2,2-三氟乙醯胺

在室溫,在氮氣下,向25mL圓底燒瓶中加入N-[((3S)-1-{[(2R)-4,9-二氧代-1,2,8,9-四氫-4H,7H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-2-基]甲基}-3-吡咯烷基)甲基]-2,2,2-三氟乙醯胺(240mg,0.602mmol)於1,4-二噁烷(5ml)中的溶液,得到橙色溶液。加入DDQ(205mg,0.904mmol),並且反應變得很深色。將反應在油浴上加熱至80℃,並攪拌10h。將反應冷卻至室溫、加入5%K2CO3水溶液(20mL),並將反應用DCM(3X100mL)萃取。將合併的有機層用飽和NaCl水溶液洗滌,並將有機相經Na2SO4乾燥,過濾和濃縮,得到粗產物。將粗產物加至矽膠柱上,並用0-20%MeOH/CHCl3洗脫,得到產物(85mg,0.214mmol,35.6%產率),其為橙色固體。

MS(ES+)m/z 397(MH+)。

(e)(1R)-1-{[(3S)-3-(氨基甲基)-1-吡咯烷基]甲基}-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮

向25mL圓底燒瓶中加入N-[((3S)-1-{[(1R)-4,9-二氧代-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-1-基]甲基}-3-吡咯烷基)甲基]-2,2,2-三氟乙醯胺(85mg,0.214mmol)在甲醇(9ml)和水(1.00ml)中的溶液,得到黃色溶液。加入碳酸鉀(59.3mg,0.429mmol),並將反應攪拌過夜。LCMS顯示反應完成。將反應用20%MeOH/DCM(100mL)稀釋,經Na2SO4乾燥,過濾和濃縮,得到產物(60mg,0.200mmol,93%產率),其為橙色固體。

MS(ES+)m/z 301(MH+)。

(f)標題化合物

向10mL圓底燒瓶中加入(1R)-1-{[(3S)-3-(氨基甲基)-1-吡咯烷基]甲基}-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(60mg,0.200mmol)、[1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-甲醛(33.4mg,0.200mmol)(其合成參見WO2004058144實施例61)和硫酸鈉(250mg,1.760mmol)於DCM(4ml)和甲醇(1.00ml)中的溶液,得到橙色懸浮液。將反應在氮氣下攪拌過夜。加入三乙醯氧基硼氫化鈉(85mg,0.400mmol),並將反應攪拌3h。將反應混合物用10%MeOH/DCM(20mL)稀釋,過濾,吸附在矽膠上,然後通過矽膠色譜純化,用0-10%MeOH/DCM(1%NH4OH)洗脫,得到標題化合物的游離鹼,其為黃色油狀物。LCMS/NMR與所需產物一致。

1H NMRδH D-4MeOH,(400MHz)1.34-1.43(m,1H),1.85-1.96(m,1H),2.15-2.30(m,2H),2.38-2.51(m,3H),2.68-2.75(m,1H),2.04-3.17(m,2H),3.41-3.50(m,1H),3.69(s,2H),4.42-4.51(m,2H),5.08-5.18(m,1H),5.83(s,2H),6.26-6.32(m,2H),7.33(s,1H),7.73-7.78(m,2H),7.94(s,1H)。

MS(ES+)m/z 452(MH+)。

將標題化合物的游離鹼用10%MeOH/CHCl3稀釋,加入100uL 1N HCl的乙醚溶液,並將混合物在真空下濃縮,得到標題化合物,其為二鹽酸鹽(47mg,0.090mmol,44.9%產率),其為黃褐色固體。

實施例56 7-{[(1-{[(1R)-3,8-二氧代-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-1-基]甲基}-4-哌啶基)氨基]甲基}-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-5-甲腈鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例13(k)或15(d))(50mg,0.100mmol)在氯仿(4ml)和甲醇(0.121ml)中的懸浮液用三乙胺(0.587ml,4.21mmol)處理,並攪拌15min(懸浮液形成溶液)。然後加入7-甲醯基-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-5-甲腈(其合成參見WO06014580製備13或WO2007122258,實施例31(d))((18.95mg,0.100mmol),並將反應攪拌30min。然後加入三乙醯氧基硼氫化鈉(63.7mg,0.301mmol),並將反應攪拌1h。1h後,LC-MS顯示一些亞胺中間體,因此加入更多三乙醯氧基硼氫化鈉(63.7mg,0.301mmol),並將反應攪拌2h。之後,LCMS仍顯示亞胺中間體,加入更多三乙醯氧基硼氫化鈉(63.7mg,0.301mmol),並將反應攪拌過夜(16h),之後,LCMS顯示無起始原料。加入飽和NaHCO3(10mL),然後加入20%MeOH/DCM(20ml),並將水相萃取,然後與有機層分離。將水相用20%MeOH/DCM(2x20ml)再次萃取。將合併的有機萃取液乾燥(NaSO4),過濾和蒸發,得到粗產物。將粗產物在矽膠柱上純化(0-20%MeOH/DCM),得到標題化合物的游離鹼(33mg,69.4%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.15-1.41(m,2H),1.72-1.91(m,2H),2.19-2.39(m,2H),2.40-2.52(m,1H),2.53-2.78(m,2H),2.89-2.98(m,1H),3.02-3.14(m,1H),3.68(s,2H),4.22-4.49(m,5H),4.51-4.62(m,1H),4.98-5.08(m,1H),6.32(d,1H),7.06(m,2H),7.78(d,1H),7.88(s,1H)。

MS(ES+)m/z 475(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量DCM,並用一當量1M HCl的乙醚溶液處理。得到標題化合物,其為單HCl鹽(33mg,65%)。

實施例57(1R)-1-[(4-{[(7-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例13(k))或15(d)(50mg,0.100mmol)在氯仿(3ml)和甲醇(0.150ml)中的懸浮液用三乙胺(0.042ml,0.301mmol)處理,並攪拌0.25h(懸浮液形成溶液)。然後加入7-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-甲醛(其合成參見WO2002056882,實施例23(a))(18.25mg,0.100mmol),並將反應在室溫攪拌0.5h。然後加入三乙醯氧基硼氫化鈉(67.1mg,0.301mmol),並將反應在室溫攪拌。1h後,加入更多三乙醯氧基硼氫化鈉(67.1mg,0.301mmol),並將反應在室溫過夜。然後加入更多三乙醯氧基硼氫化鈉(67.1mg,0.301mmol),並將反應在室溫攪拌。1h後,無起始原料剩餘。加入飽和NaHCO3(30mL),然後加入20%MeOH/DCM(30mL),並將水相萃取,然後與有機層分離。將水相用20%MeOH/DCM(2x30mL)再次萃取兩次。將合併的有機萃取液NaSO4乾燥,過濾和蒸發,得到粗產物。將粗產物通過矽膠色譜純化(0-20%MeOH/DCM),得到35mg標題化合物的游離鹼,其為黃色固體(74.7%)。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.21-1.41(m,2H),1.76-1.92(m,2H),2.10-2.39(m,2H),2.41-2.52(m,1H),2.61-2.79(m,2H),2.86-2.98(m,1H),3.05-3.14(m,1H),3.72(s,2H),4.18-4.29(m,4H),4.38-4.43(m,1H),4.51-4.62(m,1H),4.94-5.05(m,1H),6.33(d,1H),6.58(d,1H),6.80(1H,d),7.77(d,1H),7.86(s,1H)。

MS(ES+)m/z 468(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量DCM/MeOH,並用1當量1M HCl的Et2O溶液處理。將溶劑除去,並將固體在乾燥器中(P2O5)乾燥,得到標題化合物,其為鹽酸鹽,其為深黃色固體(36mg)。

實施例58(1R)-1-[(4-{[(8-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽

在室溫,在氮氣下,將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例13(k)或15(d))(50mg,0.100mmol)在氯仿(25ml)和甲醇(1.250ml)中的懸浮液用三乙胺(0.042ml,0.301mmol)處理,並攪拌0.25h(懸浮液形成溶液)。然後加入8-氟-2,3-二氫-1,4-苯並二氧雜環己二烯-6-甲醛(其合成參見WO2007122258,實施例8(b))(19.62mg,0.100mmol),並將反應在室溫攪拌0.5h。然後加入三乙醯氧基硼氫化鈉(67.1mg,0.301mmol),並將反應在室溫攪拌。1h後,仍有起始原料,因此加入三乙醯氧基硼氫化鈉(67.1mg,0.301mmol),並將在室溫攪拌過夜。仍有起始原料,因此加入三乙醯氧基硼氫化鈉(67.1mg,0.301mmol),並將反應在室溫攪拌1h。加入飽和NaHCO3(30mL),然後加入20%MeOH/DCM(30mL),並將水相萃取,然後與有機層分離。將水相用20%MeOH/DCM(2x30mL)再次萃取兩次。將合併的有機萃取液NaSO4乾燥,過濾和蒸發,得到粗產物。將粗產物通過矽膠色譜純化(0-20%MeOH/DCM),得到26mg標題化合物的游離鹼,其為黃色固體。

1H NMRδH CDCl3,(400MHz)1.20-1.41(m,2H),1.72-1.89(m,2H),2.09-2.35(m,2H),2.42-2.52(m,1H),2.55-2.78(m,2H),2.85-2.99(m,1H),3.08-3.15(m,1H),3.63(s,2H),4.22-4.48(m,5H),4.51-4.63(m,1H),4.95-5.06(m,1H),6.32(d,1H),6.61-6.72(m,2H),7.75(d,1H),7.89(s,1H)。

MS(ES+)m/z 468(MH+)。

將標題化合物的游離鹼溶於少量DCM/MeOH,並用1當量1M HCl的Et2O溶液處理。將溶劑除去,並將固體在乾燥器中(P2O5)乾燥過夜,得到標題化合物,其為鹽酸鹽,其為黃色固體(26.6mg,與產物一致)。

實施例59(1R)-1-[(4-{[(2-氧代-2H-色烯-7-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮

向10mL圓底燒瓶中加入(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j))(80mg,0.266mmol)、2-氧代-2H-色烯-7-甲醛(其合成參見WO2008009700實施例224)(46.4mg,0.266mmol)和NaHCO3(100mg,1.190mmol)於二氯甲烷(DCM)(4ml)和甲醇(1ml)中的溶液,得到棕色溶液。加入硫酸鈉(200mg,1.408mmol),並將反應在室溫攪拌過夜。15h後,加入三乙醯氧基硼氫化鈉(113mg,0.533mmol),並將反應在25℃在氮氣下攪拌4h。將反應混合物吸附在矽膠上,並使用0-10%MeOH/DCM(1%NH4OH)純化,得到標題化合物,其為游離鹼(30mg,0.064mmol,24.07%產率),其為黃褐色固體。LCMS和1H NMR與所需產物一致。

1H NMRδH D-4MeOH,(400MHz)1.20-1.39(m,2H),1.72-1.89(m,2H),1.90-2.09(m,1H),2.13-2.31(m,2H),2.39-2.50(m,1H),2.56-2.70(m,2H),2.90-3.10(m,2H),3.83(s,2H),4.32-4.58(m,2H),4.98-5.18(m,1H),6.20-6.39(m,3H),7.19-7.28(m,2H),7.39-7.51(m,3H),7.62-7.71(m,1H)。

MS(ES+)m/z 459(MH+)。

實施例60(1R)-1-[(4-{[(2-氧代-2H-色烯-7-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮

向10mL圓底燒瓶中加入(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j))(45mg,0.134mmol)、7-氯-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-甲醛(通過(1)用LiAlH4還原7-氯-3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-甲醛(其合成參見WO2003064421實施例15(c)),得到(7-氯-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噁嗪-6-基)甲醇,和然後(2)用MnO2(29.2mg,0.147mmol)氧化製備)和NaHCO3(100mg,1.190mmol)於二氯甲烷(DCM)(4ml)和甲醇(1ml)中的溶液,得到棕色懸浮液。加入硫酸鈉(200mg,1.408mmol),並將反應在室溫攪拌過夜。15h後,加入三乙醯氧基硼氫化鈉(56.6mg,0.267mmol),並將反應在25℃在氮氣下攪拌4h。將反應混合物吸附在矽膠上,並使用0-10%MeOH/DCM(1%NH4OH)純化,得到標題化合物,其為游離鹼(9.4mg,0.019mmol,14.57%產率)。

1H NMRδH D-4MeOH,(400MHz)1.49-1.70(m,2H),2.00-2.17(m,2H),2.28-2.49(m,2H),2.72-2.81(m,1H),2.89-2.94(m,1H),3.05-3.20(m,3H),3.38(s,2H),3.50-3.58(m,1H),4.18(s,2H)4.20-4.24(m,2H),4.43-4.50(m,2H),5.08-5.18(m,1H),6.28-6.35(m,2H),7.06(s,1H),7.78-7.83(m,2H)。

MS(ES+)m/z 483/485(MH+)。

實施例61(1R)-1-[(4-{[(2-氧代-2H-色烯-7-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮

向10mL圓底燒瓶中加入(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j))(75mg,0.223mmol)、7-氯-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-甲醛(通過(1)用LiAlH4還原7-氯-3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-甲醛(其合成參見WO2003087098實施例306(e)),得到(7-氯-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基)甲醇,和然後(2)用MnO2(47.8mg,0.223mmol)氧化製備)和NaHCO3(100mg,1.190mmol)於DCM(4ml)和甲醇(1ml)中的溶液,得到棕色懸浮液。加入硫酸鈉(200mg,1.408mmol),並將反應在室溫攪拌過夜。15h後,加入三乙醯氧基硼氫化鈉(94mg,0.445mmol),並將反應在25℃在氮氣下攪拌4h。將反應混合物吸附在矽膠上,並使用0-10%MeOH/DCM(1%NH4OH)純化,得到標題化合物,其為游離鹼(45mg,0.090mmol,40.5%產率)。LCMS和1H NMR與所需產物一致。

1H NMRδH D-4MeOH,(400MHz)1.20-1.45(m,2H),1.65-1.92(m,2H),2.19-2.39(m,2H),2.42-2.71(m,2H),2.82-3.10(m,5H),3.65-3.80(m,4H),4.40-4.50(m,2H),5.05-5.20(m,1H),6.25-6.35(m,2H),7.22(s,1H),7.72-7.83(m,2H)。

MS(ES+)m/z 483/485(MH+)。

實施例62(1R)-1-({4-[(3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮

在室溫,在氬氣中,將(1R)-1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮二鹽酸鹽(其製備參見實施例5A(j))(0.075g,0.201mmol)在二氯甲烷(5ml)和甲醇(1ml)中的懸浮液用3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-甲醛(通過(1)用LiAlH4還原3-氧代-3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-甲醛(其合成參見WO2003087098,實施例301(d)),得到3,4-二氫-2H-吡啶並[3,2-b][1,4]噻嗪-6-基甲醇,和然後(2)用MnO2(0.036g,0.201mmol)氧化製備)、碳酸氫鈉(0.150g,1.786mmol)和硫酸鈉(0.300g,2.112mmol)處理,並在室溫攪拌5h。然後將溶液用三乙醯氧基硼氫化鈉(0.128g,0.603mmol)處理,並攪拌過周末65小時。將溶液蒸發,溶於CH3OH,吸附在矽膠上,並用矽膠色譜純化(0-15%CH3OH的DCM溶液(含1%NH4OH)),得到標題化合物,其為游離鹼(59mg,63%),其為淺褐色固體。

1H NMR DMSO-D6,(400MHz)1.02-1.27(m,2H),1.61-1.78(m,2H),1.81-1.96(s,1H),2.01-2.19(m,2H),2.28-2.38(m,1H),2.67-2.79(m,1H),2.82-2.98(m,4H),3.50(s,2H),3.55-3.61(m,2H),4.21-4.34(m,2H),4.91-4.99(m,1H),6.10-6.19(m,2H),6.48-6.52(d,1H),6.69-6.75(s,1H),7.12-7.19(d,1H),7.71-7.82(d,2H)

MS(ES+)m/z 465(MH+)。

實施例63 1-[(4-{[(3-氧代-3,4-二氫-2H-1,4-苯並噻嗪-6-基)甲基]氨基}-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮鹽酸鹽(R:S的2:1混合物)

標題化合物由1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(R:S的2:1混合物,其製備參見實施例11(d))和2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-甲醛(其合成參見WO2004058144,實施例60),根據實施例12的通用方法製備。

1H NMR、LC-MS和單-鹽酸鹽形成參見實施例6A。

實施例64 1-({4-[([1,3]氧硫雜環戊烯並[5,4-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(S:R2:1的混合物)

標題化合物由1-[(4-氨基-1-哌啶基)甲基]-1,2-二氫-4H,9H-咪唑並[1,2,3-ij]-1,8-二氮雜萘-4,9-二酮(S:R的2:1混合物,類似於實施例11(a-d),但使用7-(甲基氧基)-1-[(2R)-2-環氧乙烷基甲基]-3,4-二氫-1,8-二氮雜萘-2(1H)-酮(其合成參見實施例5(f)製備)和2,3-二氫[1,4]氧硫雜環己二烯並[2,3-c]吡啶-7-甲醛(其合成參見WO2004058144,實施例60),根據實施例12的通用方法製備。

1H NMR、LC-MS和單-鹽酸鹽形成參見實施例6A。

表1:使用指定起始原料,根據實施例5(k)的方法製得

製備A:6,7-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]噠嗪-3-甲醛

(a)3,4,6-三氯噠嗪

通過稍微改進Kasnar et al,Nucleosides&Nucleotides(1994),13(1-3),459-79的方法製備。

將硫酸肼鹽(51g)懸浮於水(250ml),加熱至回流,並滴加溴馬來酸酐(90.38g)。將混合物加熱回流4小時,然後冷卻至室溫。將反應用29g硫酸肼、53g溴馬來酸酐和130ml水重複。將沉澱通過過濾收集,用水和丙酮洗滌,並將批次合併在真空中乾燥,得到4-溴-1,2-二氫-3,6-噠嗪二酮,其為白色固體(113g)。

將固體分兩批用三氯氧磷(2x200ml)處理,並加熱至回流保持3.5小時。將混合物冷卻,蒸發和與甲苯共沸。將殘餘物在二氯甲烷和飽和碳酸氫鈉水溶液之間分配,並用DCM萃取兩次。將有機萃取物乾燥和蒸發。將該殘餘物在二氯甲烷中再次溶解,並用矽膠色譜純化(300g)(DCM作為洗脫劑),得到白色固體(101.5g,87%)。

(LC/MS分析顯示約20-30%雜質,溴-二氯噠嗪的異構體)。

MS(+ve離子電噴霧)m/z 184/185/186(MH+),三氯噠嗪。

MS(+ve離子電噴霧)m/z 228/229/231(MH+),溴-二氯噠嗪。

(b)2-[(3,6-二氯-4-噠嗪基)氧基]乙醇

經40分鐘,將乙二醇(55ml)在四氫呋喃(200ml)中的溶液在大約0℃(冰浴冷卻)用氫化鈉(60%油中分散液,5.9g)處理。加入完成後,分批加入含有溴-二氯噠嗪的異構體作為雜質的3,4,6-三氯噠嗪(27g),並用更多無水THF(50ml)洗滌,並將混合物在0℃攪拌1小時,然後在室溫攪拌過夜。將混合物濃縮(至1/3體積),然後用碳酸氫鈉水溶液稀釋,並用氯仿(5x)和乙酸乙酯(3x)萃取。將合併的有機萃取液用水洗滌,經硫酸鈉乾燥和蒸發,並將固體濾除,並用CHCl3(x3)洗滌和在真空烘箱中在40℃乾燥過夜,得到白色固體(25.5g,83%),含有一些溴-衍生物(10-15%)。

MS(+ve離子電噴霧)m/z 209/211(MH+)。

MS(+ve離子電噴霧)m/z 255/7(MH+),溴-衍生物。

(c)3-氯-6,7-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]噠嗪

將含有一些溴-衍生物的2-[(3,6-二氯-4-噠嗪基)氧基]乙醇(15.46g;0.0703mol)在無水1,4-二噁烷(1.2L)中的溶液用氫化鋰(2.3g;0.28mol)分批處理,並在室溫在氬氣中攪拌1小時,然後在110℃加熱過夜。將反應混合物用溼的1,4-二噁烷淬滅,然後用冰水淬滅。將溶液蒸發至一半體積,用5M鹽酸調節至pH 8,並蒸發至幹。加入水,並將殘餘物用氯仿萃取五次,乾燥(硫酸鈉)和蒸發,得到白色固體(12.4g,約77%)(含有約15%溴物質)。

MS(+ve離子電噴霧)m/z 173/5(Cl MH+);217/9(Br MH+)

(d)3-乙烯基-6,7-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]噠嗪

將含有約15%溴物質的3-氯-6,7-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]噠嗪(13.6g,0.079mol)在二甲氧基乙烷(400ml)中的溶液在氬氣中脫氣10min,然後加入四(三苯基膦)鈀(0)(2g)、碳酸鉀(10.33g)、2,4,6-三乙烯基三氧雜三硼雜環己烷吡啶複合物(11.32g)和水(55ml)。將混合物在95℃加熱48小時,並冷卻和蒸發至幹。將混合物用碳酸氫鈉水溶液處理,並用DCM萃取(5x)。將萃取物乾燥(硫酸鈉),蒸發,並將殘餘物矽膠色譜純化(500g),用0-100%乙酸乙酯-己烷洗脫,得到產物(6.43g,50%);[仍有一些不純級分(1.8g)]。

MS(+ve離子電噴霧)m/z 165(MH+)。

(e)標題化合物

將在冰中冷卻的3-乙烯基-6,7-二氫[1,4]二氧雜環己二烯並[2,3-c]噠嗪(11.58g)在1,4-二噁烷/水(600ml/180ml)中的溶液用水溶液四氧化鋨(4%w/v,25ml)和高碘酸鈉(43g)處理。將該混合物溫熱至室溫,攪拌7小時後,將混合物蒸發至幹,並與1,4-二噁烷共沸。加入矽膠、1,4-二噁烷和氯仿,並將混合物蒸發至幹過夜,然後加至矽膠柱(400g)並色譜純化,用氯仿然後用0-100%乙酸乙酯的己烷溶液洗脫,得到白色固體(7.55g,64%)。

MS(+ve離子電噴霧)m/z 167(MH+)。

生物活性

抗微生物活性分析:

使用臨床和實驗室標準研究所(CLSI)推薦的操作,文件M7-A7,"Methods for Dilution Susceptibility Tests for Bacteria that Grow Aerobically",通過肉湯微量稀釋測定全細胞抗微生物活性。以範圍從0.016至16mcg/ml的連續兩倍稀釋度測試化合物。

將最小抑菌濃度(MIC)確定為抑制可見生長的化合物的最低濃度。鏡讀取器用於幫助確定MIC終點。

針對選自金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌、釀膿鏈球菌、糞腸球菌和屎腸球菌的革蘭氏陽性生物體評價化合物。

此外,針對選自流感嗜血桿菌、黏膜炎莫拉菌、大腸桿菌、銅綠假單胞菌、奇異變形桿菌、陰溝腸桿菌、產氣腸桿菌、肺炎克雷伯菌和嗜麥芽窄食單胞菌的革蘭氏陰性生物體評價化合物。

如本申請中所述,除了實施例71-73和76-79之外,所列出的實施例中的每一個都以至少一種示例的鹽或游離鹼形式進行測試。除非另有說明,否則測試的實施例對至少一種上述生物體的菌株具有≤2μg/ml的MIC,除了實施例9對於至少一種上述生物體的菌株具有≤4μg/ml的MIC。對於上面列出的每種生物體的至少一種菌株,至少一個實施例具有≤2μg/ml的MIC。

結核分枝桿菌H37Rv抑制分析

在96孔平底、聚苯乙烯微量滴定板中進行每種測試化合物的最小抑菌濃度(MIC)的測量。在純DMSO中進行10次兩倍藥物稀釋,從400μM開始。將5μl這些藥物溶液加入95μl Middlebrook 7H9培養基中。(板布局的A-H行、1-10列)。使用異煙肼作為陽性對照,製備異煙肼的8次兩倍稀釋,從160μg/ml開始,並將5μl的該對照曲線加入95μl Middlebrook 7H9(Difco目錄號271310)+ADC培養基(Becton Dickinson目錄號211887)。(11列,A-H行)。將5μl純DMSO加入第12列(生長和空白對照)。

將接種物標準化至約1x107cfu/ml,並在Middlebrook 7H9+ADC培養基和0.025%Tween 80(Sigma P4780)中稀釋100倍,以產生H37Rv菌株(ATCC25618)的最終接種物。將100μl該接種物加入到整個板中,除了G-12和H-12孔(空白對照)。將所有板置於密封箱中以防止外周孔乾燥,並將它們在37℃靜止孵育6天。通過將一片刃天青(用於牛奶測試的刃天青片;參見330884Y VWR International Ltd)溶解在30ml無菌PBS(磷酸鹽緩衝鹽水)中製備刃天青溶液。將25μl該溶液加入每個孔中。48小時後測量螢光(SpectramaxM5Molecular Devices,激發530nm,發射590nm)以測定MIC值。

實施例1-4、5A、6A、7-9、12、13A、14、15、16A、17A、19A、20、23-32、34、37-44、46-50、53-57、59和63在結核分枝桿菌H37Rv抑制分析中進行了測試。實施例2、4、5A、6A、7、8、12、13A、14、16A、19A、20、23-26、28-32、34、37、39、40、42、44、46、49、50、56、59和63顯示出低於2.0μg/ml的MIC值。實施例4、5A、7、8、12、13A、14、16A、19A、25、26、30-32、37、40、49、50和56顯示出1.0μg/ml或更低的MIC值。

體外分析

進行研究以評價本發明化合物的體外活性。

具體地,本發明的實施例39(即,確定為(2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽)針對在2003至2007年間收集的30株淋病奈瑟球菌進行了測試。

頭孢曲松和環丙沙星作為比較劑。根據臨床和實驗室標準研究所(CLSI)批准的方法和指南(即,參見臨床實驗室標準協會(CLSI)),批准的標準M07-A9,Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically,第九版,Wayne,PA,2012),通過瓊脂稀釋測定實施例39和比較劑的最小抑菌濃度(MIC)。

實施例39((2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽)的針對30株淋病奈瑟氏菌的分離菌株的MIC90(抑制90%測試的分離菌株的MIC)為0.5μg/mL。

該MIC90值是頭孢曲松(≤0.03μg/ml)的至少16倍,並且是環丙沙星(>2μg/mL)的最多1/8倍。實施例39((2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽)的眾數值對9株測試的環丙沙星耐藥淋病奈瑟氏菌保持不變。

第二項研究通過CLSI瓊脂稀釋法測試了實施例39((2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽)針對145株淋病奈瑟球菌分離菌株的效果,其中絕大多數菌株在2013年收集。實施例39((2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽)對所有測試的分離菌株的MIC90為0.5μg/mL。針對37株環丙沙星不敏感的分離菌株的亞組,實施例39((2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽)的MIC90為1μg/mL。

這些研究證明了實施例39((2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽)針對淋病奈瑟球菌(包括環丙沙星耐藥菌株)的體外活性。

體內分析數據

建立了淋病奈瑟球菌陰道定殖的小鼠模型以評價本發明化合物的功效。兩個獨立的研究由同一個實驗室進行。

具體地,在單劑口服或同一天總共兩劑口服給藥後,在該模型中測試了實施例39(即,(2R)-2-({4-[(3,4-二氫-2H-吡喃並[2,3-c]吡啶-6-基甲基)氨基]-1-哌啶基}甲基)-1,2-二氫-3H,8H-2a,5,8a-三氮雜苊烯-3,8-二酮鹽酸鹽)。使用雌二醇引發雌性小鼠用於定殖;給藥甲氧苄啶硫酸鹽和鏈黴素用於控制共生菌。在第0天,用淋病奈瑟球菌MS11(實施例39:MIC 1μg/ml)陰道內接種小鼠。在第1天和第2天通過陰道拭子培養物證實成功建群。在第2天給藥實施例39的100mg/kg和200mg/kg的單劑口服劑量或各100mg/kg的總共兩次口服劑量。一直至第10天(處理後8天)每天收集陰道拭子用於定量培養。

在一項研究中,在實施例39給藥後1、2、6和12小時,從每組小鼠的末端收集血液樣品(對每個時間點和劑量n=3),以允許評估PK參數。

到研究結束時,以單劑口服劑量100或200mg/kg或在同一天給藥的兩次100mg/kg劑量的實施例39分別消除了70-80%、90-100%和100%小鼠中淋病奈瑟球菌MS11的定殖,而接受鹽水載體的小鼠僅0-10%表現出細菌清除。這些劑量的fAUC0-24值分別估計為8、22和16μg.h/mL。

在第一項研究中,每個實施例39劑量組中的一隻小鼠表現出淋病奈瑟菌的連續幾天的初始清除,隨後在研究結束時再生長至大量生物體。儘管在隨訪研究中沒有觀察到這種再生長,評估了從GSK2140944處理的小鼠中回收的淋病奈瑟球菌MS11的菌落,並且與有機體的儲備培養物相比,沒有顯示對GSK2140944的易感性的任何改變。

應當理解,本發明不限於上文闡述的實施方案,並且保留在闡述的實施方案和在所附權利要求的範圍內進行的所有修改的權利。

本文引用的各種對期刊、專利和其它出版物包括現有技術並且通過引用併入本文,如同完全闡述一樣。

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