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用於處理封閉容器中的樣品的系統和方法以及相關裝置製造方法

2023-10-26 16:49:07 2

用於處理封閉容器中的樣品的系統和方法以及相關裝置製造方法【專利摘要】一種用於核酸和其它樣品的自動處理的系統和方法,包括可任意處置的容器,該可任意處置的容器包括盤和柔性隔離物。該隔離物被布置成密封盤的上部邊緣,在密封的盤中提供封閉,無菌的工作區。吸管頭和/或其它樣品操縱裝置可被連接至隔離物的內部,並且隔離物可以包括用於機器人臂或其它裝置的接口。當在盤上密封隔離物時,該隔離物分離盤的內容與機器人或其它操縱裝置。該隔離物可以是柔性的,並允許機器人臂貫穿盤的工作區地移動吸管頭。在處理過程中,用於處理核酸樣品的全部樣品,試劑,吸管頭和其它工具或裝置可以保持在通過容器提供的封閉隔室中。【專利說明】用於處理封閉容器中的樣品的系統和方法以及相關裝置[0001]相關申請本申請要求於2006年I月18日申請的序列號為60/760,087的美國臨時申請的優先權,因此參照結合其內容,好像於此將其全文闡述一樣。【
技術領域:
】[0002]本發明涉及樣品和材料的自動處理,並且可以特別適用於在封閉環境中處理核酸。【
背景技術:
】[0003]基於核酸的擴增反應被廣泛用於研究和臨床試驗室,以有助於疾病的診斷和/或測試樣品中致病生物的識別。這種擴增反應也可以用於疫苗的研發,這樣的疫苗包括例如從病人自身的腫瘤細胞獲取的自體疫苗。從腫瘤組織隔離的核酸的擴增甚至允許從小的腫瘤產生自體疫苗,並因此提供以最小腫瘤負擔處理病人的機會。[0004]根據是否通過變性溫度(denaturationtemperature)、引物退火溫度(primerannealingtemperature)和擴增子(核酸的酶擴增產物)合成溫度之間溫度的連續循環而驅動酶的擴增反應,或者是否溫度在整個酶的擴增過程(等溫擴增)中保持恆定,通常聲明的,當前已知的擴增方案可被廣泛地分組為兩類。典型的循環核酸擴增技術(熱循環)是聚合酶鏈反應(PCR),以及連接酶鏈反應(LCR)。例如在ShortProtocolsinMiology,第2版,ACompendiumofMethodsfromCurrentProtocoIsinMolecularBiology,(Eds.Ausubel等人,Johnffiley&Son,NewYork,1992)第15章中討論了用於這種反應的具體協議。等溫反應包括轉錄介導擴增(TMA),基於核酸序列的擴增(NASBA),以及鏈置換擴增(SDA)0[0005]例如在美國專利4,683,195;4,683,202;5,130,238;4,876,187;5,030,557;5,399,491;5,409,818;5,485,184;5,409,818;5,554,517;5,437,990和5,554,516中討論了核酸擴增。熟知的是比如在這些專利中描述的那些方法允許不需要無性繁殖(cloning)的核酸的擴增和檢測,並且負責用於核酸序列的敏感試驗。然而,同樣認識到,與核酸擴增可能的檢測敏感度一起,小量的不想要的外生核酸序列的汙染風險是極其大的。通過用以控制不想要的外生核酸和其它汙染的引入的方法可以提高擴增反應的效用。[0006]具體地,對於生物樣品的處理,包括例如治療藥物(therapeuticagent)(如用於自體治療的疫苗)的製造,當前的優良製造標準(GMP)典型地需要在無菌環境製造。[0007]因此,在本領域中存在用以提供用於處理核酸和其它樣品的自動化系統和方法的需要。【
發明內容】[0008]本發明的實施例涉及一種用於一個或多個樣品的自動處理的系統,設備和方法。該系統可以用於操縱封閉環境中的項目,並且可以特別有用於藥物、診斷、生物工藝學、電子和納米工藝領域。本發明的實施例可以特別相關用於處理生物樣品,包括但不局限於組織、血液、血液製品、核酸(例如RNA,DNA)、蛋白質、細胞培養等等。[0009]本發明的實施例提供用於操縱封閉容器中的一個或多個項目的設備。於此也被稱作「隔離容器」的容器包括限定內部腔室的盤,其被布置成保持被操縱的任何數量的項目,以及柔性隔離物,被布置和尺寸化為覆蓋內部區域和密封容器盤。用於操縱內部區域中的項目的工具被附著至柔性隔離物,或與柔性隔離物集成,或被集成在柔性隔離物內。[0010]該工具可以具有從被布置成附著至機器人裝置的隔離物的外側可訪問的第一接口。該工具也包括可以從隔離物的相對側延伸的第二接口,以使用容器密封柔性隔離物時其被布置在內部區域中。該工具可被布置成當機器人裝置被附著至第一接口時操縱容器中的項目。在一些實施例中,封閉容器中的一個或多個項目例如包括核酸、其它樣品、試劑、清洗流體、吸管尖端、器皿、其它消耗品的任何一個和/或其組合。其它工具或裝置也可被布置在容器中,例如用於處理、操縱,測量,分析,採樣和/或存儲容器中的樣品或其它項目的工具或裝置。[0011]在一些實施例中,用於自動處理核酸和其它樣品的系統和方法包括一次性使用的隔離容器組件,其具有盤和被布置成用盤密封的柔性隔離物,從而提供密封盤中的封閉工作區域。該封閉工作區域可以是無菌的。[0012]吸管頭和/或其它樣品操縱裝置可被附著至隔離物的內部,並且該隔離物可以包括用於機器人臂或其它裝置的接口,該機器人臂或其它裝置被用於操縱密封工作區域中的項目。當在盤上密封隔離物時,該隔離物將盤的內容與機器人或其它操縱裝置分開。該隔離物是柔性的,並且允許機器人臂在盤的所有工作區域移動吸管頭或其它樣品操縱裝置。在處理過程中,全部樣品、試劑、吸管尖端、其它消耗品和用於處理核酸樣品的工具或裝置可以保持在由隔離容器提供的封閉隔間中。[0013]在另一實施例中,處理核酸(例如RNA和/或DNA)的方法採用可任意處置(一次性使用)的隔離容器以減小對象材料被不期望的生物物質(例如來自操作者、另一對象或外部環境)汙染的風險。在一些實施例中,為了生物樣品的RNA分離而設計隔離容器,包括但不局限於下面的一個或多個:腫瘤組織,血液,血液製品,細胞,病原體等等。在具體實施例中,生物樣品包括腫瘤勻漿,並且該系統提供用以轉換澄清的腫瘤勻漿成體外轉錄(IVT)RNA的全部特徵和功能性。[0014]典型地,僅隔離容器的內部被暴露至對象材料,從而避免處理系統的可能汙染,並且減小由系統處理的連續對象樣品之間的清潔需要。在一些實施例中,處理系統一次處理一個隔離容器中的樣品。在其它實施例中,該系統可被布置成基本上同步地處理兩個或多個隔離容器中的樣品。[0015]在一些實施例中,本發明提供一種用於流體轉移的設備,該用於流體轉移的設備包括工作流體和通過隔膜被從樣品裝置分開的工作流體泵。在使用中,例如在工作流體泵改變工作流體的壓力時通過隔膜的運動,通過越過隔膜被傳輸的壓力的改變,樣品或其它流體可被吸入樣品裝置,或從樣品裝置排出。在一個實施例中,樣品裝置是吸管尖端或用於吸取、分配和/或混合流動樣品和/或用於從一個位置至另一個位置轉移樣品、試劑或其它流體的其它管。該吸管尖端或管可以是任何合適的形狀和尺寸。[0016]在又一另一實施例中,本發明提供用於測量流體的體積的設備,包括:至少一個光源或發射器,以及至少一個接收器;布置有光路的試管,通過該光路,接收器可以檢測與試管是包含流體或是空的相關的光路的變化;以及與接收器相聯繫的流體轉移裝置,以便確定已從試管被移走的流體的體積。[0017]其它實施例涉及生物樣品處理容器。該容器包括一次性使用的盤,該盤具有基本上剛性的主體,其具有第一工作站,該第一工作站被布置成保持用於在熱塊(例如單個管,多井板或條,PCR板等)中保溫的器皿,第二工作站,該第二工作站被布置成保持試劑,以及被布置成保持吸管的第三工作站。[0018]一些實施例涉及具有外部邊緣部分的柔性隔離物,其被布置成密封至盤,以便限定密封封閉的內部腔室。該柔性隔離物包括彈性體,並且被密封附著至隔離物的中間部分處的機器人臂接口。[0019]又一另一實施例涉及自動吸管尖端脫離系統。該系統包括:Ca)具有側壁的盤;以及(b)併入操縱工具的機器人臂,該操縱工具具有向外延伸的杆,該杆被布置成接觸盤側壁,從而與側壁的接觸使杆樞軸轉動,並且釋放通過操縱工具保持的各個使用的吸管尖端。在一些實施例中,該盤具有接觸操縱工具杆的有角度的側壁。[0020]一些實施例涉及用於處理液體的系統。該系統包括:(a)機器人臂;以及(b)與機器人臂合作的操縱工具,該工具被布置成可鬆脫地接合吸管尖端,並且自動平移,以在通過蓋中的刺穿開口的一個從器皿取出流體之前在間隔開的不同位置多次刺穿器皿上的蓋,。[0021]其它實施例涉及洗脫盤。該盤是無菌生物相容洗脫盤,其具有多個間隔開的接收器,在向上延伸的隔離物的第一側面上的多個,以及在隔離物的相對側上的多個。接收器具有在主要管部的方向上向下逐漸變細的每一側上延伸的通道。[0022]還有其它實施例涉及一種用於自動處理系統的成套工具。該成套工具包括:(a)一次性使用的容器,包括盤和被布置成密封附著至該盤的柔性隔離物;(b)—次性使用的試劑架,被布置成居於第一工作站處的容器中;(c)一次性使用的結合柱歧管,被布置成居於容器中;以及(d)—次性使用的吸管架,被布置成居於容器中。[0023]一些實施例涉及轉移液體的方法。該方法包括:Ca)可編程地導引機器人臂移動可鬆脫地保持吸管尖端的接口工具;(b)利用吸管尖端多次自動刺穿保持目標液體的器皿上的密封劑;然後(c)利用吸管尖端,利用被刺穿的密封材料,從器皿自動吸取液體。[0024]一些實施例涉及從吸管釋放液體的方法。該方法包括:Ca)可編程地導引機器人臂移動可鬆脫地保持吸管的接口工具,以便在按一定角度向下延伸的方向上定向吸管,尖端靠近封閉容器中的接收表面;(b)沿著平面並基本上沿著直線,自動移動向下定向成角度的吸管,同時從吸管釋放可流動的物質。[0025]又一另一實施例涉及抽吸液體進入吸管的方法。該方法包括:Ca)可編程地導引機器人臂移動可鬆脫地保持吸管的接口工具,以便接合保持保持封閉容器中的目標流體的器皿;然後(b)自動移動器皿內部的吸管,以便混合器皿中的液體;然後(C)抽吸混合液體進入吸管。[0026]在一些實施例中,該方法包括抽吸和分配液體以混合液體(一次或多次)。[0027]還有其它實施例涉及處理封閉系統中的樣品的自動方法。該方法包括(a)在具有柔性隔離物的密封封閉容器中提供樣品;以及(b)可編程地導引機器人臂,以與柔性隔離物合作,從而通過一系列操作移動封閉容器內部的接口工具,同時封閉容器保持密封,以便處理樣品。[0028]該方法也可以任意包括下面的一個或多個:(a)在擴增過程中多次電和自動測量樣品的體積和濃度;(b)在使用之前,之後和/或過程中,電和自動監控封閉容器的密封完整性;以及(e)捕獲等份試樣器皿中的至少一個擴增RNA樣品,而不破壞封閉系統的密封狀態。[0029]還有其它實施例涉及用於操縱封閉容器中的項目的設備。該設備包括:(a)具有內部區域的容器,其被布置成保持要被操縱的多個項目;以及(b)再循環真空系統,被布置成在封閉迴路中循環在容器的內部區域中密封的空氣。[0030]儘管關於本發明的方法方面於此描述了一些實施例。可以理解,本發明也可被具體化系統和電腦程式產品。此外需要指出,關於一種類型的權利要求所權利要求的任何特徵,比如系統,設備,方法或電腦程式可被權利要求或實施為任何其它類型的權利要求的操作或特徵。[0031]基於下面的附圖和詳細的說明書的回顧,依據本發明的實施例的其它系統,方法,系統元件和/或電腦程式產品對本領域熟練技術人員將清楚或變得清楚。試圖全部這種附加的系統,方法和/或電腦程式產品被包括在這些描述中,在本發明的範圍中,並且被附加權利要求所保護。【專利附圖】【附圖說明】[0032]當結合附圖閱讀時,從其示範性實施例的下面的詳細描述可以更容易地理解本發明的其它特徵,其中類似的參考數字表示類似的元件。該附圖僅是示範性的,用於描述可被單獨使用或結合其它特徵的某些特徵,並且本發明試圖不局限於示出的實施例。關於一個實施例或附圖示出的特徵可以用於其它實施例獲特徵。[0033]圖1是依據本發明的實施例的處理系統的透視圖;圖2是圖1的系統的上部的側視圖,包括工作表面上的隔離容器;圖3是圖1的系統的工作表面的實施例的透視圖,沒有示出隔離容器;圖4是具有還沒有依據本發明的實施例附著柔性隔離物的隔離容器組件的透視圖;圖5是依據本發明的實施例的隔離容器組件的切開透視描述;圖6是圖5的隔離容器組件的切開透視圖;圖7A和7B是依據本發明的實施例的注射泵系統的側視圖;圖8A和SB是依據本發明的實施例適於與流體泵系統合作的吸管頭的橫截面側視圖;圖8C是依據本發明的實施例,用於圖8A的吸管頭的柔性隔離隔膜的頂視圖;圖8D是在圖SC中示出的柔性隔離隔膜的橫截面圖;圖9A和9B分別是依據本發明的實施例的柔性隔離物的透視和橫截面圖;圖9C和9D分別是柔性隔離物的其它實施例的透視和橫截面圖;圖9E是依據本發明的實施例,具有集成的耦合器的柔性隔離物的透視圖,以部分截面圖示出隔離物中的耦合器;圖9F是依據本發明的實施例,具有耦合器的機器人臂的部分的透視圖,該耦合器被布置成接合在圖9E中示出的隔離物耦合器;圖9G是在圖9E和9F中示出的元件的裝配(沒有柔性隔離物)的透視圖,並且具有在以透明和虛線示出的內部元件上的外殼;圖9H是依據本發明的實施例,附著有柔性隔離物的圖9G中示出的組件的透視圖;圖10是依據本發明的實施例的PCR板和熱循環控制器蓋組件的透視圖;圖11是依據本發明的實施例具有熱循環控制器蓋驅動系統的熱循環控制器組件的透視圖;圖12是依據本發明的實施例用於容器的柔性熱循環控制器蓋密封的圖11的熱循環控制器蓋驅動系統的透視圖;圖13A和13B是依據本發明的實施例在熱蓋進入容器的工作空間和從容器的工作空間出來的運動過程中圖12的蓋密封的橫截面圖;圖13C是在圖13A和13B中示出的蓋密封和容器的部分切開側面透視圖;圖14是依據本發明的實施例裝DNA和RNA結合柱的歧管的透視圖;圖15是依據本發明的實施例在與吸管頭的接合以便在站之間移動歧管的過程中圖14的歧管的透視圖;圖16是依據本發明的實施例描述了在使用隔離容器之前的封閉真空系統的示意性側視圖;圖17是依據本發明的實施例在使用隔離容器過程中圖16的真空系統的示意性側視圖;圖18是具有切開的隔離盤的處理系統工作表面的透視圖,示出了依據本發明的實施例用於控制溼度和蒸汽濃度的冷卻單元;圖19A是依據本發明的實施例附著至隔離盤的試管的截面透視圖;圖19B是依據本發明的實施例的分光光度計試管測量系統的協同操作元件的側面透視圖;圖20A-20D是依據本發明的實施例用於測量體積試管中的體積的系統的操作的例子,每一幅圖是體積試管測量系統的截面圖;圖20E是依據本發明的實施例可以如關於圖20A-20D所述地工作的多個試管體積測量系統的頂部、側面透視圖;圖20F是依據本發明的實施例描述了在容器的邊界之下延伸的試管的在圖4和5中示出的容器的底部透視圖;圖21A是依據本發明的實施例的試劑架的透視圖;圖21B是依據本發明的實施例描述了刺穿技術的在圖21A中示出的試劑架的示意性頂部透視圖;圖22是依據本發明的實施例示出了等份試樣管機構的操作的一系列示意性圖示;圖23A是依據本發明的實施例示出可被載入隔離容器的元件的圖示;圖23B是依據本發明的實施例,利用在圖23A中示出的成套工具元件部分裝配的容器的頂部透視圖;圖23C是在圖23B中示出的部分裝配的成套工具的底視圖;圖23D是依據本發明的實施例在成套工具元件在使用位置處被附著之前在圖23A中示出的成套工具中容器的頂視圖;圖24是依據本發明的實施例描述了具有柔性隔離物的盤的密封的圖23A的隔離容器盤的分解圖;圖25是依據本發明的實施例可被實施的操作的流程圖;圖26A和26B是依據本發明的實施例具有杆的吸管頭的放大的側面透視圖;圖26C是依據本發明的實施例示出與容器的內部表面接合以便釋放吸管尖端的在圖26A和26B中示出的杆的側面透視圖;圖27是依據本發明的實施例可以用於裝載容器於設備之上的臺車的頂部透視圖;圖28A是依據本發明的實施例,具有可以使容器成與機器人臂對準的偏置組件結構的工作表面的放大的側面透視圖;圖28B是依據本發明的實施例,描述了用於在期望的方向上給容器施加力的彈簧的圖28A中示出的工作表面的一部分的底部透視圖;圖29A是依據本發明的實施例的洗脫盤的頂視圖;圖29B是在圖29A中示出的盤的底部透視圖;圖29C是在圖29A中示出的盤的頂部透視圖;圖30A是廢料盤蓋的頂部透視圖;圖30B是在圖30A中示出的盤蓋的底部透視圖;圖31是用於通過本發明構思的自動系統的電路的方塊圖;以及圖32是依據本發明的實施例的數據處理系統的方塊圖。【具體實施方式】[0034]在可以以修改和替代形式獲得本發明的同時,通過附圖中的例子示出其具體實施例,並且將被詳細描述。然而可以理解,其不試圖將本發明限制為公開的具體實施例,而是相反,本發明將覆蓋落入本發明的精神和範圍的全部修改、等價和替代。類似的參考數字表示貫穿【專利附圖】【附圖說明】的類似元件。[0035]在附圖中,為了清楚可以誇大附圖的某些線的厚度、層、部件、元件。虛線描述了任意特徵或操作或隱藏元件,除非另外指明。在權利要求書中,權利要求的方法不局限於敘述的任何步驟的次序,除非在那裡聲明。[0036]於此使用的術語僅用於描述具體實施例,並且不試圖限制本發明。如於此使用的,單數形式「一」、「一個」和「一種」也試圖包括複數形式,除非上下文另外清楚地指出。進一步可以理解,當用於該說明書時,術語「包括」和/或「包含」指定了陳述的特徵、整數、步驟、操作、元件和/或部件的存在,而不是排除一個或多個其它特徵、整數、步驟、操作、元件、部件和/或它們的組的存在或附加。如於此使用的,術語「和/或」包括相關的列出術語的一個或多個的任何和全部組合。如於此使用的,比如「在X和Y之間」和「在大約X和Y之間」的短語被解釋為包括X和Y。如於此使用的,比如「在大約X和Y之間」的短語意味著「在大約X和大約Y之間」。如於此使用的,比如「從大約X至Y」的短語意味著「從大約X至大約Y」。[0037]除非另外定義,於此使用的全部術語(包括技術和科學術語)具有如本發明屬於的本領域的熟練技術人員通常理解的相同意思。可以進一步理解,比如在通常使用的字典中定義的那些術語被解釋為具有與它們在說明書上下文中和相關領域的意思一致的意思,並且不以理想化或極端形式的被解釋,除非於此特意如此定義。為了簡短和/或清楚可以不詳細描述熟知的功能或結構。[0038]可以理解,儘管可以於此使用的術語第一、第二等用以表述各種元件、部件、區域、層和/或部分,但這些元件、部件、區域、層和/或部分將不被這些術語所限制。這些術語僅用於區別一個元件、部件、區域、層或部分與另一個區域、層或部分。因此,在下面討論的第一元件、部件、區域、層或部分可被稱作第二元件、部件、區域、層或部分,不會脫離本發明教導。操作的次序(或步驟)不局限於在權利要求或附圖中給出的順序,除非另外具體示出。[0039]術語「封閉系統」或「封閉容器」分別涉及被密封的系統和容器,並且如果不是完全地,基本上以封閉方式操作,以便抑制或阻止處理過程中外生的或外部材料進入(或離開)系統或容器。封閉系統可被布置成抑制或避免汙染。在一些實施例中,封閉系統或容器的部件在使用之前可在製造位置處被預先消毒,在使用點處被消毒,和/或在裝配各個封閉系統之後被消毒,並且在使用前被封閉。該封閉系統或容器在某些大氣條件處可被壓力或真空密封至某一目標或預定義的漏率。利用真空或壓力傳感器測試或其它洩漏檢查系統等,通過內部和/或外部傳感器可以檢測漏率。從海平面至較高的海拔高度,典型的大氣條件可以隨著設備的位置而改變。然而,通過本發明的實施例構思的封閉系統也可以用於海洋(水面下,深海),飛行和/或空間環境,它的密封足以在那些大氣條件下基本上保持目標漏率。該封閉系統或容器可被採用用於它們的各自預定用途,而不破壞封閉系統的完整性。該封閉系統或容器可以適用於進或出的目標流體樣品的流體轉移,同時保持無菌,和/或可連接至其它封閉系統,同時保持封閉系統的完整性。過濾器可以任意用於流動路徑,在工藝工程中該流動路徑可以是對大氣或其它成分開放的。過濾器可被布置成過濾成期望的清潔水平或等級,以便有助於封閉狀態,比如等級100,000,等級10,000,等級1000的過濾器或甚至等級100的過濾器。[0040]術語「隔離容器」指的是被布置成相對於存在於外部環境中的外部病原體、微生物等和/或其它材料,保持、封裝和/或隔離內部元件和其中保持的一個或多個項目或樣品的處理的容器。隔離容器可以是一次性使用的容器。在一些實施例中,隔離容器中的樣品是核酸或包括核酸,例如用於處理組織(例如澄清的腫瘤勻漿)中的核酸成IVTRNA。[0041]術語「一次性使用」指的是不重複使用的元件。也就是在完成它的預期用途之後,即目標樣品的處理或生成後,它被處理掉。隔離容器可以是一次性使用的(以及可以被標記為這樣),以使隔離容器保持為封閉系統,該封閉系統以它的內部元件保持於其中的封閉密封狀態被處理掉,以便在目標產品的處理/生成之後抑制它的內部內容的任何不利的向外釋放或暴露。[0042]術語「等分試樣」(aliquot)指的是期望量的目標流體;流體的量可以是預定和/或指定的範圍。術語「等分試樣管」指的是允許流體等分試樣從容器移走的管。典型地,術語「等分試樣管」指的是與隔離容器的內部聯繫、以便不破壞隔離容器的封閉狀態或密封完整性而接收至少一個(並且典型地多個)流體等分試樣的管。等分試樣管可以是柔性和無菌的,並且可以包括比如PVC等的彈性體。[0043]術語「試管」(cuvette)指的是被布置成允許器皿中包含的物質(典型地流體)的機械、電或光學測量(典型地濃度或體積測量)的器皿。該試管可被尺寸化為保持相對小量的流體,典型地在大約0.0OlmL至大約5.0mL之間的範圍。[0044]術語「吸管尖端」(pipettetip)指的是在兩端開放的管,以能夠吸入和/或排放流體,典型地小體積的液體,並且典型地以在大約0.1iiL至大約1000UI之間的量。該管可以具有不規則或恆定的周邊形狀或尺寸,典型地從頭部在下部尖端處向下逐漸變細。通過多個瑪塔(matable)元件可以限定「吸管」。也就是,吸管可以包括尖端部和頭部。頭部可被限定在附著(間接)至機器人裝置的操縱工具上,在處理過程中該機器人裝置可鬆脫地(releasably)附著至不同的吸管尖端。不同體積尺寸的吸管可以用於單個的容器/處理系統。[0045]術語「人機接口(HMI)」對本領域技術人員是熟知的,指的是允許操作者輸入、導引、交互或加工的接口,並且典型地包括具有可編程地提供信息至操作者並且接受來自操作者的控制指令的「圖形用戶界面(GUI)」的電子顯示器。[0046]術語「無菌的」指的是抑制或避免容器的內部處理空間中目標樣品被外部病原微生物和/或不期望的外生材料汙染的處理條件,和/或抑制或避免附近的外部環境被容器所含內容汙染的處理條件。[0047]術語「結合柱」(bindingcolumn)指的是可以用於分離樣品的成分或其衍生物的過濾/洗脫柱。在一些實施例中,結合柱可以用於核酸(例如DNA和/或RNA)分離或提純。在一些實施例中,結合柱可以包括娃膜。[0048]術語「盤」指的是具有用以保持一個或多個元件的足夠剛度的基板。該盤可以基本上是平坦的,或者可以具有碗狀形狀。該盤也可以具有其它形狀或結構。該盤可以布置成限定完整的井或保持區域,或者可被布置成可密封地緊密配合和/或保持裝置或容器,典型地與至少一個處理工作站相關的那些元件。[0049]術語「用戶」是用於操作者、程式設計師和/或維修工的通常術語。[0050]術語「機器人」指的是可被可編程地導引,以便在期望的方向上平移,從而實施定義的處理步驟或操作的自動裝置。術語「機器人」被廣泛地使用,並且包括具有多軸平移的固定裝配的機器人臂,以及完全活動的機器人和其它合適的機器人裝置。[0051]本發明可被具體化為系統,方法和/或電腦程式產品。因此,可以以硬體和/或以軟體(包括固件,駐留軟體,微代碼等)具體化本發明。此外,本發明可以採取基於計算機可使用或計算機可讀的存儲介質的電腦程式產品的形式,該存儲介質具有在介質中具體化的計算機可使用或計算機可讀程序代碼,以用於被指令執行系統使用或與指令執行系統相聯繫。在本文獻的上下文中,計算機可使用或計算機可讀介質可以是可以容納、存儲、通信、傳播或傳輸被指令執行系統、設備或裝置使用或與指令執行系統、設備或裝置相聯繫的程序的任何介質。[0052]計算機可使用或計算機可讀介質可以例如是但不局限於電、磁、光、電磁、紅外線或半導體系統,設備,裝置或傳播介質。計算機可讀介質的更具體的例子(不窮舉)包括:具有一個或多個導線的電連接,可攜式計算機磁碟,隨機存取存儲器(RAM),只讀存儲器(R0M),可擦除可編程只讀存儲器(EPR0M或快閃記憶體),或光纖,以及可攜式光碟只讀存儲器(⑶-ROM)。需要指出,計算機可使用或計算機可讀介質可以甚至是紙或其它合適的介質,其上印刷有程序,當程序被電捕獲時,經由例如紙或其它介質的光學掃描,然後被編譯,解釋,或以合適的方式被另外處理,如果必須,還可以存儲於計算機(電)存儲器中。[0053]下面討論用於在封閉環境中的自動處理的設備和方法。該系統可以例如用於處理、製備、裝配或操縱封閉環境中的任何事物,並且特別有用於藥學、法醫、治療、診斷、生物工藝學、電子和納米【
技術領域:
】。為了方便描述,在用於處理核酸的系統的上下文中描述本發明的各個特徵和方法。然而本領域的熟練技術人員可以理解,下面的說明書僅試圖描述本發明,並且不是限制性的。各個其它用途試圖在本發明的範圍中,包括例如用於製備、裝配、處理或另外操縱封閉容器中的任何項目的系統和方法。[0054]示範性自動系統的綜述概括地講,參照圖1,系統10可被布置具有機器人臂20,該機器人臂操縱具有內部腔室(也被描述為內部工作區或區域,其中詞語「區」被廣泛使用,並且不是以兩維數學方式)的封閉容器組件12中的一個或多個項目。在一些實施例中,容器組件12具有被布置成保持要被處理和/或操縱的多個項目的內部區域18。柔性隔離物(barrier)16可被布置或尺寸化為覆蓋容器盤14的內部並被容器盤14密封。用於操縱腔室中的項目的工具附著至柔性隔離物16或在柔性隔離物16中被集成,並且它在隔離物16附著至盤14時能夠延伸進入內部區域。該工具可以具有從隔離物的外側可訪問的適配器或其它接口,以使當利用容器盤密封隔離物或隔離物附著至容器盤時,通過來自容器的外面的機器人裝置可以操縱該工具。盤14可被布置成包括一個或多個工作空間、區、站、架、固定器、容器、井或用於保持封閉容器中的一個或多個項目或過程成分或流體的其它裝置。也可以在容器中設置其它工具或裝置,或者可以從容器中訪問其它工具或裝置;例如用於處理、操作、測量、分析、採樣和/或存儲樣品或其它項目的工具或裝置可以存在於容器的腔室中。[0055]現在回到附圖,圖1示出了示範性的自動化的核酸處理系統10。系統10可以包括容器組件12。容器組件12可以是隔離容器12。系統10也包括機器人20(典型地機器人臂),或用於操作容器組件12中的項目和/或與容器組件12相關的項目的其它自動或人工可導引裝置。容器組件12包括盤14和柔性隔離物16。柔性隔離物16被布置成被盤14密封或附著至盤14。隔離物16的外周邊緣部分16p可以密封地接合容器盤14,提供容器組件12中封閉、無菌的工作區18。在一些實施例中,容器組件12或其任何部分是一次性使用的。在具體實施例中,可以不打開密封容器,在容器之外排放、收集或捕獲樣品,並且密封容器12可被處置,而剩餘的內部內容完好。[0056]盤14可以基本上是剛性的,並且可以是模製體。在一些實施例中,盤14包括醫用等級(比如USPClassVI或其它合適的等級)模製聚合體。盤14的主體可以包括用於提供內部觀察能力的視覺能見度的一個或多個基本上清楚、半透明或透明的磨光區域。可以在空間清潔的模具中和空間清潔的模製設備中鑄造盤14,以便抑制和/或最小化生物負荷(bioburden)和微粒。在密封柔性隔離物16之前或之後,盤14可被消毒,通過利用傳統的消毒技術,比如利用VHP(汽化的過氧化氫)、Y輻射或環氧乙烷蒸汽過氧化氫的表面淨化。為了裝運,可以以雙彈性無菌包裝材料(比如密封的雙塑料包裝/袋)封裝盤14。[0057]隔離物16可被布置成允許機器人20,垂直地大約4-24英寸之間,水平地至少大約盤14的寬度和長度,移動密封的容器組件12的工作區18內部的工具,並且不破壞容器組件12的密封完整性。在一些實施例中,機器人20可以引導內部接口進行密封的容器組件12內6-12英寸之間的垂直運動,不破壞密封的密封完整性。可以相對於盤14尺寸化和布置隔離物16,以便提供足夠量的空氣,從而允許機器人20在期望範圍內運動,而不過度壓縮或減壓容器12的內部體積。[0058]在一些實施例中,系統10用於處理生物樣品,包括但不局限於容器組件12內部的組織、血液、血液製品、核酸、蛋白質、細胞培養等。在這種實施例中,容器12可以包括例如生物樣品,試劑,洗滌液,吸管,吸管尖端,器皿,其它消耗品或其任意組合的項目。[0059]如示出的,系統10可以是自固定(selfstanding)、自主式單元。系統10可以包括用於支持隔離容器組件12和自動系統10的其它兀件的外殼或機架70,自動系統10的其它元件的例子包括機器人20,熱塊30(例如加熱塊和/或冷卻塊等),等分試樣取回組件40和用於收集被處理樣品的相關機構,用戶接口60,以及如在下面的部分中描述的各種其它元件和機構。如示出的,熱塊30可以與熱塊組件1000合作,例如在圖10,11中。[0060]在處理系統10的一些實施例中,操作者或維修工為了正常的操作可以僅需要訪問系統10的前面。如圖1中所示,可以打開一個或多個通道門110,例如通過基本上垂直地升起,或向一側或在另一個方向上打開,以便在安裝或移動隔離容器12的同時提供可訪問性。[0061]在一些實施例中,由於系統10的自動特性,門110可以在工作過程中保護操作者不受系統的移動部件的影響。系統10可以包括電控制的互鎖(interlock)或其它機構,以便當系統在工作中時抑制或避免操作者打開門110。可以提供手動超越控制(override),以允許互鎖防護的打開,並且,如果例如沒有功率供應時,可以採用這種超越控制。用戶接口60,也被稱作HMI(人機接口)可被布置成允許操作者啟動處理操作或控制系統10,並且可被裝配在靠近通道門110的機架70的前面。在一個實施例中,可以定位顯示屏61和HMI的控制(觸控螢幕,鍵盤或其它輸入)成當閒置時允許用戶觀察和操作它們。在一些實施例中,系統10的後面和側面不需要被操作者例行訪問。因此可以相對於牆壁或另一個系統定位該系統。[0062]在一些實施例中,機架70的下部可以容納電控制系統,電源和其它元件,其可以不需要操作者交互。這些元件可被裝在專用外殼中,該專用外殼保護元件不受偶然流體侵入的損壞和保護操作者不受可能的電危險的損害。可包括可移動面板120,130,140,以便提供對外殼內部的電子元件和其它元件的訪問。在一些實施例中,僅受過訓練的服務人員被允許或需要訪問這些外殼的內部。該服務訪問面板可以或不可以是互鎖的,例如用以允許或禁止在面板被移動時系統繼續工作。[0063]圖2示出了系統10的上部的放大側視圖,包括工作表面200上的隔離容器12。吸管頭220和/或其它操縱裝置可以附著至隔離物16,或者可以與隔離物16集成,或者可以在隔離物16中被集成,以使當隔離物附著至盤14時(如圖所示),吸管頭220的至少一部分延伸進入容器12的內部工作區18。吸管頭220可以包括隔離物16的相對側上的接口,其被布置成與機器人裝置20的臂230的端部上的適配器210可鬆脫地連接。在一些實施例中,吸管頭220或其它操縱裝置沒有物理地穿過隔離物16,並且可以不必通過適配器耦合至機器人或其它裝置。此外,這種吸管頭可以附著至隔離物的內部,或者與隔離物的內部集成,並且可以從隔離物16的相對側被操作或操縱,例如利用附著至隔離物的相對側的機器人臂230。在其它實施例中,通過隔離物16由磁體或者由支持操縱裝置和/或與操縱裝置聯繫的其它裝置可以操作吸管頭或與隔離物16(其基本上是不滲透的)集成的其它樣品操縱裝置。[0064]當在盤14上密封隔離物16時,隔離物16將盤14的內容與機器人20或操縱吸管頭220的其它裝置分開。隔離物16和盤14之間的密封可以是氣密的,從而提供容器12中的封閉環境。在一些實施例中,隔離物16是柔性的,並允許機器人臂230遍及盤14中的工作區18移動吸管頭220。在處理過程中,在處理核酸樣品中包括的全部項目或材料,包括例如生物樣品、試劑、吸管尖端或其它消耗品,以及用於處理樣品的其它工具或裝置可以保持在封閉的工作區18中。盤14可以包括多個特徵或站242,該多個特徵或站242可被模製、形成、附著或與盤14的基座240集成、或是盤14的另一部分,以便適應於這些項目。[0065]如圖所示,機器人裝置20可被附著至機架70的壁。在一些實施例中,機器人裝置20可以包附著至工作表面200或另一支持結構的連鎖(linkage)系統、臂或架(gantry)。合適的機器人裝置是本領域已知的。不受限制的例子包括SthbliTX90機器人,EpsonE2LScara機器人,KawasakiFSeries機器人,YamahaYKIScara機器人,ST機器人,STRoboticsR17機器人等。在一些實施例中,機器人裝置20是FANUCLRMATE2001b5C,6軸機器人或其它合適的多軸機器人裝置,並且用於自動執行封閉容器12內部的期望操作,例如,在樣品的處理過程中,利用吸管尖端抽吸和轉移流體,以及滑動或提升結合柱歧管(manifold)。[0066]多軸機器人臂可以用於移動可鬆脫地保持吸管的接口工具,以便在多個不同方向上定向吸管,從而基於抽吸或分配幫助混合液體。例如,可以在按一定角度向下延伸的方向上定向吸管,尖端鄰近封閉容器中接收器皿中的接收表面,然後自動地,沿著平面並基本上沿著直線移動按一定角度向下定向的吸管(類似於芥末(mustard)的典型成層或分配),同時從吸管釋放可流動的物質。在其它實施例中,機器人臂可以自動移動吸管,以便在抽吸之前混合器皿中的液體,然後抽吸混合液體進入吸管。可替代或附加地,在一些實施例中,液體可被抽吸和分配至少一次,以便混合液體。在一些實施例中,接收或分配器皿具有唇緣,並且機器人臂被布置成引導吸管尖端圍繞唇緣的周圍移動。[0067]如圖3中示出的,例如可被定位在前通道門110內部的水平工作表面200,支持與隔離容器12交互的各個元件和機構。工作表面200可以包括一個或多個導向裝置390,其可以包括導向槽390s,該導向槽接合組件支持臺車399上的元件(圖27),以便對準容器12,或其它位置特徵,從而在處理過程中定向和可鬆脫地夾緊至隔離容器12(例如圖2的基座240)。[0068]如圖27中示出的,在可以停靠系統10的臺車399上準備容器組件12。臺車399可以包括槽399s,槽399s與由系統10的支持表面上的導向裝置390限定的槽390s對準。為了轉移容器組件12至系統10,操作者可以滾動鄰近系統10的臺車,從而使臺車399與系統10的導向裝置390對準。容器組件12可以滑動進入系統10的槽390s進入合適的操作位置,不需要操作者提升容器組件12。[0069]如圖28A和28B中示出的,工作表面200可以包括滾軸導向裝置381,382,當在合適的位置時,該滾軸導向裝置接觸容器12的下部。滾軸導向裝置382可以與彈簧383聯繫,該彈簧可以向內偏置容器12,從而相對於最內部的槽壁390密合適配,以與機器人臂期望的對準,從而用於工作站位置的套準。[0070]再次參照圖3,工作站200可以支持溫度控制裝置,比如用於加熱和/或冷卻容器中的區域、器皿或目的目標或位置的保溫裝置。這種裝置對本領域熟練技術人員是已知的。在一個實施例中,系統10包括熱循環控制裝置30,該熱循環控制裝置例如用於在一些核酸擴增反應或其它反應或加工過程中控制PCR板610(圖6)或其它器皿或元件的溫度,以及用於在這種反應過程中選擇性地覆蓋熱循環控制裝置30的熱循環控制裝置蓋機構310。在一個實施例中,真空泵組件320和節流閥組件330在處理過程中提供隔離容器12中空氣的循環和真空的控制。真空泵組件320可以可鬆脫地接合一次性使用的真空頭1602和相關的管1650(圖23B)。工作表面200可以保持容器組件12,從而允許分光光度計1900s與由容器組件12保持的元件相聯繫,如於此進一步討論的。[0071]一個或多個注射泵350(例如示出了兩個泵)可以用於驅動吸管頭220的抽吸和分配(圖2)。在一些實施例中,注射泵350可以用於例如從儲存器340,通過在圖2中示出的吸管頭適配器210,抽取工作流體,以便提供用於吸管頭220的操作的真空和壓力。工作流體可以基本上是不可壓縮的,並且可以例如包括大約50%乙醇的水溶液。可以使用其它流體,甚至空氣。結合圖7和8在下面更詳細地描述泵機構和吸管頭220的示範性實施例的附加細節。[0072]返回圖3,試管固定裝置360(也見圖19A中的分光光度計試管)可以與典型地居於機架70的下部中的分光光度計1900s耦合,以便在處理過程中以期望的操作提供自動濃度測量。任意地,工作表面200可以包括一個或多個冷卻特徵,例如熱交換器,比如被定位成接合隔離容器12的某些部分的冷卻器或Peltier冷卻板370和372,並且幫助控制密封容器12中的溼度和蒸氣濃度。杆380或其它機構或裝置可以用於固定隔離容器進入工作表面200上的位置。[0073]在一些實施例中,RNA處理系統可以以與較大的生產系統和任何數據管理工具或系統隔離的獨立方式工作。內部或外部計算機系統可以控制和/或監控子系統的自動化元件。使用者可以與接口60交互,例如用以作業系統和監控狀態。在其它實施例中,系統10可以與其它系統或者監控站聯繫(其可以在不同的房間中或者甚至在不同的設備中)。[0074]在下面的部分中描述各個元件和裝置,以及使用的示範性方法的附加細節。[0075]示範性的隔離容器參照隔離容器組件12,更詳細地描述盤14和柔性隔離物16。盤14包括內部工作區18,並且可以包括多個插入物,凹槽,架或架裝配特徵和/或用於保持容器中的項目的站242,例如包括一個或多個架,歧管或用於保持器、吸管尖端、結合柱、其它物質和/或其它消耗品的其它固定裝置,或者用於期望的實驗或工藝的裝置。用以處理材料成期望完成狀態或產品的全部項目可被保持於容器中,也就是在處理過程中用於系統的消耗品可以是自主式和密封的,以便最小化汙染容器的內部的風險,或者避免樣品受到環境或使用者的汙染。隔離物16可以具有最外部的周邊部分16p(圖5),該最外部的周邊部分可被布置成可鬆脫或永久地密封盤14,例如圍繞在如圖5中示出的盤14的環狀邊緣452。當隔離物16密封盤14時,吸管頭220和/或另一樣品操縱工具或裝置的至少一部分從隔離物16延伸進入工作區18。[0076]在一些實施例中,隔離物16沿著剛性頂部邊緣452接合盤14(圖5)。隔離物16的最外部周邊部分16p可以抵靠頂部邊緣452(圖5)。頂部邊緣452可被布置為具有間隙空間的直立唇緣,該間隙空間接收相對於隔離物16夾緊的0-環(未示出),以便相對於盤14密封隔離物。[0077]為了產生封閉系統或環境,隔離容器盤14和隔離物16可被布置成在容器12中的項目和外部裝置、機構和用於處理容器中的項目的一件件設備之間形成物理隔離。例如如圖4中所示,柔性熱循環控制裝置蓋密封430可被集成在盤14的壁450中。這種密封430可以封裝和限定接收蓋1010的套管或封閉通道(圖11),並且可以用於允許熱循環控制裝置蓋機構310延伸蓋進入盤14的側壁中的孔14a(圖5),以便通過熱循環控制裝置塊30在加熱過程中覆蓋樣品,同時在蓋機構310和容器12的內部區18中的項目之間提供物理隔離。[0078]而且,冷卻板370,372可以接合盤14的外部表面的部分,以便影響容器12中溫度的變化,同時不接觸隔離工作區中的任何項目。在一些實施例中,冷卻板可以接合容器12和/或盤14的外部表面的部分,以便控制保持在隔離工作區/空間內部的項目(比如試劑)的溫度。[0079]類似地,如圖3中示出的,試管固定裝置360可以選擇性地接合從盤14的基座240延伸的試管660(圖6),以便執行濃度和/或體積的測量,但是固定裝置360可以不接觸容器12中的任何項目。因此,在一些實施例中,僅僅被需要用以直接接觸樣品的試劑、消耗品和工具或裝置被容納在隔離容器中。這種結構可以具有幾個優點。例如可以在它的自身隔離環境中處理樣品和/或居於容器之外的處理設備將不接觸樣品,並因此被保護不會受到可能的汙染。在處理的結束時,在等分試樣管440(圖4)中可以收集期望數量的等分試樣,並從容器12被移走,例如不損害收集的樣品或隔離容器的完整性,如下將進一步討論。在一些實施例中,例如在處理周期之後可以與被樣品材料汙染的元件一起丟棄密封的隔離容器12。[0080]圖5和6示出了示範性的隔離容器12的一些元件的附加細節,包括隔離盤14和柔性隔離物16。內部工作區18可被例如基座240和一個或多個壁450包圍,。隔離物16可以包括吸管頭220或其它裝置或工具,在下面單獨的部分中更詳細地對其進行描述。隔離物16可被布置成覆蓋或密封盤,例如在沿著盤14的環形邊緣452的密封510處,以使當隔離物16密封盤14時,工作區18是封閉的,典型地氣密的隔室。[0081]盤14可以基本上是剛性的,並且包括多個特徵和/或站242。該多個特徵和/或站可被模製、形成、連接或與盤集成,以便調節。下面元件的一些或者全部是可被集成進入盤14的特徵的例子:?洗脫630和廢料630站;?真空進口和出口;?分光光度計(濃度)試管660(圖19A);?其它器皿或試管,例如體積測量試管2060(圖20A-E);?熱循環控制裝置PCR板610和/或利用溫度控制裝置可被加熱和/或冷卻的其它基板或器皿;?架620中的試劑器皿622;?架650中的吸管尖端651;?一個或多個附加尖端架650或其它設置的容器,例如用於使用的吸管尖端653;?結合柱岐管50,例如其可以包括用於核酸處理的一個或多個結合柱;以及?用於處理輸出的一個或多個等分試樣管440:例如核酸,比如(例如DNA,RNA,腫瘤總RNA和/或擴增的腫瘤體外轉錄RNA等)微生物,細胞,藥劑等。[0082]在一些實施例中,柔性隔離物16密封和支持操縱工具,該操縱工具與隔離物的一側上的機器人裝置20接口,並且與隔離物16的內部上的內部元件接口。該工具可以包括吸管頭220和附加的操作特徵,比如手柄520或用於接合內部元件的其它特徵或機構,比如用於分別在廢料和洗脫站632,630之間轉移歧管的結合柱歧管50上的手柄50h(圖5)。柔性隔離物16可以允許吸管頭220充分移動,以訪問盤14中的全部所需的內部元件。該頭220也可以接合結合柱歧管50,以能夠轉移結合柱歧管至廢料632和洗脫630站和/或從廢料632和洗脫630站轉移結合柱歧管。儘管未示出,內部接口可以是多個串聯附著的接口。也就是說,對於封閉容器內部的另一個操縱工具,該吸管頭或第一接口可以可鬆脫地被保持和交換。通過盤14和/或內部操縱工具架(未示出)可以保持操縱工具的選擇。[0083]混合器和/或離心機可以與盤協作,或者可被集成進入盤,以便混合、均勻化、分離或混合或處理流體或樣品,比如生物樣品或期望的其它材料(未示出)。在其它實施例中,可以預先混合起始材料,並且然後被放置在架620中或另一位置處。該混合器可以是旋轉頭混合器,磁混合器或可以混合期望材料的均化器。[0084]示範性的吸管系統參照圖7A和7B,包括吸管頭220和適配器210組件的吸管系統700可以用於在隔離容器12內部執行流體轉移。在保持封閉隔離容器設計中,吸管頭220可被布置成在被轉移的流體和吸管泵機構之間保持阻隔。過濾器和/或柔性隔膜710可以在隔離容器12的內部和外部之間提供抗汙染的物理阻隔。[0085]在一些實施例中,為了提供高體積精確度(volumetricaccuracy),吸管系統700可以使用兩個正位移注射泵350-1,350-2,例如一個用於低體積轉移(例如在大約IμI和大約50μI之間)和一個用於較高體積轉移(例如在大約51μI和大約1000μI之間)。在其它實施例中,可以採用具有不同儲存器的單獨泵腔室或具有計量工作流體的裝置的單獨儲存器。該泵腔室可被經由(基本上剛性的)管和緩衝溶液(工作流體)而液壓連接至柔性隔膜710。該緩衝溶液可以基本上或全部是不可壓縮的液壓流體,該液壓流體可以減小或最小化吸管系統700的彈性。機器人臂230用於在工作空間中的期望位置處定位吸管頭220。為了減小吸管轉移過程中試劑帶出的可能,用完即可丟棄的尖端651可以用於流體處理。也就是說在每一次轉移之後,使用的尖端可被扔進「廢料」接收器,典型地進入使用的架,並且來自無菌架或供給站的新的無菌的不同的尖端可以用於下一次轉移。在圖7Α和7Β中示出吸管系統700的示範性實施例的其它元件。[0086]在一些實施例中,吸管系統700被預先準備好,以便在初始使用之前從吸管管線輸入液體並移走空氣,並且可以每次在不同的吸管頭220連接至吸管頭適配器210之前被預先準備好,比如在新的封閉容器12的處理開始時。例如,經由電磁閥741,排出管線連接吸管頭中的排出埠至工作流體儲存器。在預先準備好順序過程中可以打開閥741,以便允許空氣從泵350通過流體管線222,223(圖8Α)和吸管頭220被排出,並且反回至工作流體儲存器340。機器人臂230可被導引,以便定向吸管頭220中的流體管線,從而在準備過程中使它們是有角度的。一旦系統700被準備好,排出閥可被關閉,並且吸管頭220準備執行流體轉移。在RNA處理結束時,排出閥741可以用於排乾流體管線222,223和吸管頭220。將流體管線填滿空氣可以在吸管頭的斷開過程中避免流體溢出的可能性。[0087]圖8Α和8Β示出了用於通過吸管頭220轉移壓力至吸管尖端651,653的壓力轉移機構800的操作的截面圖。在一些實施例中,例如來自儲存器340的液壓工作流體激勵柔性隔離隔膜710(也見圖SC和8D),並驅動吸管動作,同時保持工作流體和要被吸管抽吸的流體之間的物理分離。工作流體的儲存器可以位於隔膜710的一側上,其從另一側上相對於工作空氣被密封。柔性隔膜710位於工作流體340和內部吸管尖端適配器220a(也就是吸管頭)和抽吸流體之間的頭部220中。圖15描述了沒有隔膜和上部組件的適配器220a。[0088]再次參照圖8A和SB,隔膜710的位移影響隔膜710之下和吸管尖端適配器220中的工作流體體積700a,從而引起吸管尖端吸入或排放(典型地派給)一定量的液體。吸管系統700的總彈性可以直接涉及分配精確度。在一些實施例中,減小空氣體積700a可以提高吸管精密度和精確度。[0089]在一些實施例中,為了有助於試劑器皿,分光光度計試管660和PCR井中流體的徹底混合,可以採用重複的抽吸/分配周期和/或可以導引機器人臂230以多軸平移移動吸管的尖端。[0090]在一些實施例中,盤14和/或吸管頭220可以包括用以允許使用的尖端653從吸管尖端適配器220a(圖8B)被移走的一個或多個特徵。如圖26A-26C中示出的,吸管頭220可以包括基於與靠近使用的吸管架650的容器的部分接觸而樞軸運動的杆221。如圖26C中示出的,容器側壁14w或保持於其上的部件可以是有角度的,以使基於與杆221的外端的接觸,杆221樞軸運動,並且推動使用的吸管尖端653離開適配器220a,並進入架650中的接收空間。也就是說,當吸管頭220朝向使用的架650向下移動時,杆221接觸壁14w,其對杆的一端向上用力並對吸管尖端653上的末端向下用力,以便推動使用的尖端進入架650。也可以使用其它釋放結構。例如,使用的架650可被布置成限制吸管尖端653的向上運動,以便從適配器220a拉動、推動或另外施加力或奪走尖端。[0091]吸管頭220和/或適配器210可以附著至流體管線和可被升高的測壓元件導線,以便跳過(clear)柔性隔離物16以及柔性管道返回機架70。測壓元件導線與負載傳感器聯繫,負載傳感器與無菌或新的吸管尖端聯繫。測壓元件提供用於控制適配器220a上新的吸管的負載的數據。例如機器人臂可以以大約5N至大約50N之間的力使吸管頭220向下前進,以便表示吸管尖端651被合適地附著。適配器210也可以包括用於鎖定和解鎖至吸管頭220的適配器210的套圈,例如作為對接合/釋放手柄機構的不受限制的替代。[0092]示範性的柔性隔離物圖9A-9E描述了依據本發明的實施例的示範性的柔性隔離物16。任何合適的材料可以用於隔離物。隔離物16可以基本上對於空氣、溼氣和乙醇蒸汽不能滲透。隔離物16可被不損失充分的柔性或不影響滲透性地被模製。在一些實施例中,隔離物16包括低密度聚乙烯,但另外的替代可以包括氨基甲酸乙酯(urethane)材料的範圍。在具體實施例中,柔性材料是或包括「ARM0RFLEX」材料,從位於Frederica,Delaware的ILCDoverCompany可得到。[0093]柔性隔離物16的形狀可以允許充分的機器人運動,並且吸管頭(或其它內部接口)對隔離容器12的內部進行訪問時不會限制或擠壓或碰到柔性隔離物。模製的柔性隔離物16的形狀可以基本上是自支持的(例如它將不陷落進入隔離容器),一旦柔性隔離物16被密封至盤14就形成隔離容器12。[0094]在一些實施例中,隔離物16的部分910可以適於與用於操縱容器中的樣品的裝置集成,接收、保持該裝置,附著該裝置,與該裝置匹配,密封該裝置,支持該裝置或與該裝置交互,該裝置的例子包括吸管頭、另外的流體轉移裝置和/或其它操縱工具。部分910可以基本上是金屬部分。隔離物16可以包括被描述為「皺褶結構」920的一個或多個折皺、褶狀物或起伏,其一些可以基本上彼此同心。圖9B描述了部分910可以包括至少一個階梯形部分17,如一系列基本上垂直定向的階梯形部分171;172,173。[0095]在一系列實施例中,如例如在圖9C和9D中示出的,隔離物16可以包括一個或多個徑向皺褶結構930。徑向和/或同心皺褶結構可以有助於吸管頭(或者其它內部操縱工具接口)的全部範圍的運動,並且在吸管頭的運動過程中幫助控制隔離物形狀。輪緣940,凸緣或其它特徵可以用於夾緊、密封、固定、粘合或附著隔離物16至盤14。[0096]如在圖9C和9D中示出的,柔性隔離物16可以包括單一板材料,該單一板材料伸展或形成可以允許頭220的期望運動的一系列基本上同心的折皺、褶狀物或皺褶結構。隔離板16t的外部周邊區域可以具有與中心區域16c不同的厚度。在一些具體實施例中,在製備過程中,在真空成形過程中較厚的材料可被向下牽引至中心,導致隔離板16具有較薄的中心區域和較厚的周邊區域。中心區域16c可以包括一系列柱支(columnated)梯級H1-H3,隨隔離物16遠離工作空間18移動,從較小至較大布置。在其它實施例中,不是單一板材料,柔性隔離物16可以包括相同或不同的合適材料的多個共同結合(co-joined)密封部分(未示出)。[0097]圖9E描述了可密封地附著至吸管頭220的下部、以用於隨後與機器人臂20接合的柔性隔離物16。機器人臂耦合器910c居於隔離物16之外。圖9F描述了被布置成接合耦合器910c的協作耦合器210c。如圖9G中示出的,指狀物211被布置成進入耦合器主體910a中的孔,以便可鬆脫地接合隔離物16。在圖9H中示出該組件(沒有下部容器盤14)。[0098]示範性的熱塊裝置如圖10中所示,核酸處理系統可以結合熱塊組件1000或任何其它溫度控制裝置。例如,核酸處理系統可以結合用於合成和擴增核酸的熱循環控制裝置。熱塊組件1000可以包括例如熱(加熱器)塊30,其可被布置成接收多井的條或板,比如PCR板610,以及熱循環控制裝置加熱的蓋1010,其可被蓋機構310激勵以覆蓋PCR板610。例如在一些實施例中,熱循環控制裝置用於cDNA合成,cDNA擴增,IVTRNA合成和工藝的DNA移走步驟。各種類型的熱塊和/或熱循環控制裝置是可利用的。[0099]如圖10中所示,PCR板610可被結合進入隔離容器盤14。在一些實施例中,PCR板610的周邊可被密封至形成於盤14的基座中的開放(基本上矩形的)區域。板610的下部從盤的基座向下延伸,以便接合熱循環控制裝置加熱器塊30(典型地居於其中),同時板610中井611的開口從密封容器12的內部可訪問。該PCR板610可被密封至隔離容器盤14,從而使井611的向下延伸的部分可以直接接觸熱循環控制裝置或溫度控制裝置。[0100]在一些實施例中,合適的墊圈,O-環或其它合適的密封機構可以用於附著PCR板610至隔離容器盤14。利用熱陷型(heatswaged)夾緊特徵可以附著該合適的墊圈。在一些實施例中,超模製熱塑彈性體(TPE)密封1030用於附著和密封PCR板610至隔離容器盤14,如圖10中示出的。在其它實施例中,PCR板特徵可以形成(比如模製和/或加工)為隔離容器盤基板。在其它實施例中,膠水,帶和/或粘合劑可以用於附著PCR板610至盤14。[0101]蓋(比如被加熱的熱循環控制裝置蓋1010)可以用於減小經由蒸發反應流體的損耗。蓋1010可以例如沿著柔性密封430排列,以便抑制蒸發流體從一些或每一個PCR井611逸出和/或用於保持容器12的內部的隔離。蓋1010可被加熱,以便抑制蓋或除反應混合物外的任何表面上的蒸汽冷凝。為了提供對全部PCR井的訪問,熱循環控制裝置蓋1010可被垂直提升,以便釋放密封壓力,然後帶上柔性蓋密封430基本上水平地縮回。[0102]用於控制蓋1010的自動運動的驅動系統310可被裝配至處理系統10的工作表面200,如圖3中示出的。在其它實施例中,蓋驅動系統310可被裝配在工作表面200之上或之下的其它位置處。現在參照圖11,示範性的蓋驅動系統310被示出具有縮回位置中的蓋1010。臂1122被連接至蓋1010,並且與電動機1150相聯繫;這提供了蓋1010進入容器12和從容器12出來的運動,例如通過盤14的壁中的側面進/出孔14a,其中在蓋1010和容器的內部之間布置蓋密封(其可被描述為套管),如圖12中示出的。機器人工具或人工輸入也可以經由密封430。[0103]圖13A描述了當延伸時容器12中和蓋密封430的腔室430c內部的蓋1010的示範性結構。圖13B描述了縮回結構中容器12外部的蓋1010。[0104]臂1122可被布置成垂直以及水平地導引蓋1010。在圖11和圖12中示出的實施例中,驅動系統310包括提供蓋1010的垂直運動的垂直運動機構1124,例如當在容器12中的PCR板610上定位蓋1010時。垂直運動機構1124可以提供足以用板610和/或塊30(圖10)密封蓋1010的向下的力,例如利用一個或多個偏置元件。一個或多個電動機1150,致動器,齒輪,連鎖或其它電機械裝置可以用於驅動水平和/或垂直運動。如圖12中示出的,驅動系統310包括具有槽1123s的上板1123。臂1122包括在槽1123s中滑動的龍骨1122k。驅動系統310也包括經由樞軸1127附著至上板1123的下板1126和偏置元件1152。垂直驅動1124附著至上和下板1123,1126,並且被布置成向下拉動上板1123,以便當蓋1010在容器內部的延伸結構中時向下給蓋1010施加力。[0105]驅動系統310的一部分可被物理附著至套管或蓋密封430的內表面,以便有助於密封430隨著蓋1010合適地移動。如示出的,在圖11中,在一些實施例中,真空杯1140可被結合在蓋1010上,以便接合柔性蓋密封430,並且在熱循環控制裝置蓋1010的垂直和水平運動過程中使密封430保持在合適的位置。在其它實施例中,可以其它方式附著蓋密封430,或者蓋密封430可以是充分柔性的,以便與蓋1010—致,並且隨其協調運動。[0106]在一些實施例中,為了有助於隔離容器12和柔性蓋密封430之間的可靠密封,夾緊板或其它夾緊元件可以用於相對於密封430的邊緣部分壓縮,比如經由相對於盤14的外側壁的蓋密封上的一個或多個密封肋(未示出)。在其它實施例中,可以超模製(over-mold)蓋密封430至盤14,例如利用如上面關於PCR板610討論的TPE。0-環,墊圈,粘合劑,帶和裝配或密封元件可以用於提供蓋密封430和盤14之間的密封連接。圖13A示出了具有蓋1010的蓋機構310和延伸進入接合位置中的盤18的內部區域的密封430,同時圖13B示出了蓋1010,並且通過容器14的壁縮出來。圖13A描述了在熱循環控制器和96-井板上的合適位置中的蓋1010。圖13C描述了具有延伸進入容器18的內部區域的蓋1010的蓋機構310的部分側面透視切開示意圖。[0107]示範性的廢料和洗脫系統各種提純裝置可以用於處理樣品,比如核酸,蛋白質,細胞,組織等等。這種提純裝置包括但不局限於磁珠(magneticbead),尺寸排除膜,結合板,過濾器和結合柱。這種裝置對本領域熟練技術人員是已知的。[0108]在一個實施例中,處理系統10利用從結合柱洗脫的技術,以用於腫瘤總RNA分離,cDNA提純和IVTRNA提純。結合柱1410(圖14)可以包括矽膜。真空洗脫協議可被集成進入隔離容器設計。在其它實施例中,磁洗脫協議可被集成進入容器。[0109]可以使用一個或多個類型/尺寸的結合柱。例如在一些實施例中,使用結合柱(例如QiagenRneasy?柱),因為它們具有適用於被處理的RNA、cDNA和IVTRNA的定量的結合能力。附加,較小的Qiagen「Mini」柱可被包括,以便提供用以濃縮RNA的能力。[0110]為了抑制廢料流體汙染洗脫器皿,廢料和洗脫站632、630可被分別分離,例如如圖6中示出的。在一些實施例中,岐管50用於保持結合柱(見圖14和15)。岐管50可被布置成保持各種尺寸/類型的一個或多個結合柱,例如Qiagen特大、中等和/或小型結合柱1410。岐管50可以包括用於每一個結合柱的井50w,形成用於吸管頭220的提升部件50h以便提升它的臂或提升部件,以及可以用於關閉不使用的結合柱的一個或多個可滑動移動的蓋1430。蓋1430可以包括允許頭220在期望方向上滑動蓋1430的手柄1430h。在其它實施例中,岐管50可被布置成保持在期望的處理過程中使用的其它類型的基板或裝置。提升部件50h可被布置為任何合適的提升,包括一個或多個手柄(如所述的),翼,凸緣或有助於站之間岐管50的運動的其它特徵。[0111]圖15分別示出了用於在容器12的兩個或多個站或區之間(例如在廢料和洗脫站632,630之間)移動岐管50的機構和方法的例子。吸管頭220和機器人20可以用於在兩個站之間來回移動結合柱岐管50和柱1410。在示出的實施例中,岐管50可以包括手柄50h,翼或與吸管頭220上的對應特徵520接口的其它特徵,並且用於簡化機器人和結合岐管50之間的接合。[0112]每一個隔離和提純過程可以使用不同組的柱;吸管頭機器人可以用於重新定位蓋1430,以便靠近合適組的不使用的柱。這減小或最小化了通過岐管50的氣流,允許在隔離和/或提純工藝步驟過程中泵產生充分高的真空。為了在消毒之後減小結合柱1410的操作者處理,柱1410可被載入在岐管50中,並且組件被密封進入合適的包裝,並且在岐管50中被伽馬消毒。在使用和/或裝配設施(比如在合適的清潔房間中)處裝載隔離容器時,操作者可以從岐管50移走包裝,並將它放置進入廢料站632,甚至不需要直接處理結合柱。[0113]廢料和洗脫站結構可以是柔性和/或可稱的。岐管50設計可以足夠大,以允許修改或使用來配合96井格式,或任何其它類型的板,井或柱,或者特大、中等和小型柱1410的組合的改變。[0114]現在參照圖16和17,洗脫站630可以包括洗脫盤1610,該洗脫盤被布置成捕獲結合柱的最後輸出(例如包括DNA、RNA等的流體)。為了抑制和/或避免DNA和RNA之間可能的交叉汙染,在洗脫盤1610中每一個結合柱1410可以具有它自己的接收器1612,接收器1612低於結合柱1410。在一些實施例中,洗脫工藝可以採用高真空,其可以產生通過結合柱1410的顯著的氣流。該洗脫接收器1612可被成形為允許飛濺流體(如果有的話)也流掉和匯聚進入收集器皿中,同時使氣流偏離匯聚的流體。附加特徵可以減小或最小化從另一個上的接收器通過的氣流。圖29A-29C提供盤1610的進一步的討論。[0115]廢料站632可以包括廢料盤1630和廢料盤罩1640。廢料盤罩1640可被結合進入廢料盤1630,以便最小化容納在廢料站632中廢料流體的蒸汽。該廢料盤罩1640可被成形為導引全部廢料流體向下流進一個或多個(示出為中心)排出孔1641,其中它被保護不受廢料站632內部罩1640之下主要氣流的影響。圖30A和30B描述了採用多個廢料排出孔1641的廢料盤罩1640的另一實施例,利用了基本上類似於洗脫盤1610成形的盤罩。在廢料盤罩1640之下的屏蔽環境中,直接在廢料流體之上的空氣可以保持高溼度,因此減小了進一步的蒸發作用。關於圖30A和30B提供盤罩1640的進一步討論。[0116]在一些實施例中,真空系統1600循環通過容器12的空氣。在一些實施例中,隔離容器真空系統1600被布置成消除了對於過濾器的需要。該真空系統可以包括管1650,典型地柔性管,經由例如節流閥330(圖17)從泵頭1602被連接至廢料632和洗脫630站。泵頭的出口將抽吸的空氣返回進入隔離容器12。[0117]圖17示出了依據真空系統1600的實施例的循環路徑。在該實施例中,在製造過程中,管1650和可任意處置的泵頭1602可被連接至隔離容器盤14。這些可被消毒,並且作為與隔離容器盤14相聯繫的組件的一部分被裝運。一旦裝載和密封隔離容器12,真空系統1600在所有其餘處理中都可以保持封閉。在隔離容器安裝進入處理系統10的過程中,真空管1650可被插進節流閥330,並且可任意處置的泵頭1602連接至真空泵320。在一些實施例中,當需要真空時,僅泵320工作。節流閥330可以用於導引真空至合適的站。當完成處理時,從閥330可以取出管1650,並從泵320斷開泵頭1602。連同隔離容器12的剩餘部分,管1605和泵頭1602可以是一次性使用的。[0118]圖18示出了處理系統10的工作表面上適當位置處盤14的切開示意圖,示出了節流閥330和可任意處置的泵頭1602的示範性位置。Peltier板370和372可以分別提供用於盤14的後壁14p的部分和用於盤14的基座中廢料站集水的冷卻。該壁部分14p可以基本上是平面的(典型地基本上垂直的,但可以是有角度的),並且向內凸出,以便限定用於板372的接收空間。該壁14p可被布置成與板372協作,以便限定冷凝壁。在圖18中需要指出,熱循環控制裝置蓋驅動系統310被示出具有延伸進入容器的蓋,沒有示出合適位置處的密封430和可任意處置的泵頭1602,沒有合適位置處的柔性真空泵管1650。[0119]示範性的過程控制和/或產物測量系統在一些實施例中,可以使用可任意處置的試管660,2060,例如如在圖19A和圖20F中示出的。一個或多個試管660,2060可被固定或可鬆脫地裝配至隔離容器盤14,例如以使試管660,2060從盤14的底部向下垂直延伸。[0120]在一些實施例中,利用分光光度計1900s(圖3,19B)和試管660(圖19A,20F)可以測量例如核酸或蛋白質等樣品的濃度和/或純度,或者例如螢光計等用於濃度測量的其它光學方法可被類似地結合進系統中。[0121]在一些實施例中,如圖19A中示出的,經由比如墊圈或0-環等柔性密封元件1918,一個或多個可任意處置的濃度試管660被密封裝配至盤14。該盤14包括接合夾具1920以相對於密封元件1918緊密保持試管660的裝配元件14m,因此密封試管660至盤14,並保持隔離容器內部的密封處理環境。如示出的,試管660可以包括形成為剛性上緣661的外部邊緣。夾具1920包括相對於緣1901存在的內部直立臂1921和接合裝配元件14m以相對於盤14給試管660施加力的外部臂1922。試管660典型地在其下部處包括試管測量窗660wo[0122]可替代地,試管660(或試管2060)可被模製進入盤,超模製,機械夾緊,溶劑結合,粘附等。分光光度計1900s(圖3)可被裝配在處理系統10上,例如在隔離容器12之下。分光光度計1900s可被布置成通過試管660(圖20F)進行吸收率測量,同時保持在隔離容器之外。[0123]在一些實施例中,存在用於每一個測量的試管660,2060,以使沒有試管需要被重新使用。處理系統10可被布置成對於如需要的每一次測量從試管660至660移動分光光度計試管固定裝置360(例如見圖3,19B)。在一些實施例中,可以從盤14移走試管660和/或2060,在隨後的盤14中清洗和重新使用。在其它實施例中,可移動的試管660,2060僅是一次使用的(也就是一次性使用的)。[0124]各種類型的分光光度計是已知的,並且可被採用用於核酸濃度和純度測量。該分光光度計1900s能夠與和處理系統10聯繫的控制器相聯繫,並被和處理系統10聯繫的控制器控制。例如,處理系統10可以命令分光光度計1900s進行測量,並且分光光度計1900s能夠返回吸收率測量,典型地在紫外波長處,比如在大約260和/或280nm處,或者在任何其它感興趣的波長處。此外,分光光度計1900s的幾何形狀,並且特別是試管固定裝置360的幾何形狀可與整個系統的其它部件集成。[0125]圖19B描述了用於在多個試管660之間移動單個檢測器頭的分光光度計頭部機構,在圖20F中示出為(4)試管660。機器人操作平臺可以用於定位分光光度計試管固定裝置360,例如以便升高,降低和在試管660之間跨越。分光光度計1900s和光源可被裝配在系統的電櫃中,例如在系統的左側或右側上。光纖可以用於允許試管固定裝置360移動,同時分光光度計1900s和光源保持靜止。也就是說,如在圖19B中示出的,分光光度計驅動機構可以用於移動單個檢測器頭1900h,以便連續保持不同試管660的每一個。經由多個(典型地兩個)光纖,檢測器頭1900h中的檢測器可被耦合至分光光度計1900s。在其它實施例中,每一個試管660可被定位在單獨的試管固定裝置360中,並且光源在連接光源至多個試管固定裝置(未示出)的光纖之間被開關,以與用於測量的分光光度計相聯繫。[0126]樣品的體積測量可以用於與濃度測量結合,以便確定產物。在一些實施例中,體積測量單元2000利用專用器皿中的流體傳感器和吸管系統,例如如在圖20A-20E中示出的。例如:?圖20A示出了檢測器頭2002中空的試管2060,其中來自兩個IR發射器2010的光不通過試管2060,並且通過用於反射光的兩個IR接收器2020被接收。[0127]?當要被測量流體2040被存儲於測定體積的試管中時,例如如圖20B中示出的,來自兩個IR接收器2020的光被傳輸通過試管2060和流體2040,並且不被用於反射光的兩個IR接收器2020接收。[0128]?在控制系統監控在測量器皿2060的底部處由系統2000檢測的流體的存在時,吸管頭220用於抽吸樣品2040進入吸管尖端651,如圖20C中示出的。[0129]?如圖20D中示出的,當傳感器系統2000報告流體不存在時,注射泵350(圖3)可被停止,並且可以電子確定和記錄抽吸體積。因此,試管2060具有底部中的稜鏡設計。利用光源,使用檢測器,設備可以根據反射確定試管2060中流體的存在或不存在。因此,結合吸管裝置,通過測量液體確定體積,直至接收沒有流體存在的信號它才被移走。圖20E描述了系統2000,其可以採用多個隔開的檢測器塊2002,每一個具有它自身的一對發射器2010。每一個塊2002可被布置成保持各個試管並與各個試管協作,以用於利用體積測量系統2000獲得體積測量。[0130]如圖20F中不出的,盤14可以包括多個體積試管2060(例如體積測量試管)和多個分光光度計試管660(試管660可以用於濃度測量)。該分光光度計試管660可以是標準的UV可視塑料,其可任意處置,比如BioRad「trUViewcuvettes」,該裝置10可以包括用於測量的分光光度計元件。可以從OceanOptics獲得合適的分光光度計元件,商業位置在Dunedin,Florida。[0131]示範性的工藝成分存儲系統在一些實施例中,試劑器皿用於容納試劑、樣品和隔離容器12中流體組合的混合體積。具有各個不同體積的試劑器皿可被用於容納工藝過程中使用的流體體積範圍。[0132]為了減小試劑汙染,蒸發或溢出的風險,容納試劑的每一個器皿在裝載進入盤14之前,可被密封,典型地在上表面上,比如利用內襯聚丙烯箔。該密封可被布置成被吸管尖端651刺破。該密封允許試劑被裝載和密封進入合適的試劑器皿,並且被沒有汙染、溢出或蒸發地存儲。[0133]在圖21A中示出試劑架620的例子。架620可以具有任何期望的布置,可以容納任何試劑器皿尺寸,並且可以適用於任何工藝。在示出的例子中,試劑盤或架620包括用來裝不同尺寸的多個器皿2110、2112、2114(典型的,管),以及混合器皿的基座,器皿2110、2112、2114可以容納例如樣品或試劑。每一個器皿可被支持在基座2100中,並且罩2120可被夾住或附著在架620之上,以便確保器皿保持在合適位置。該罩2120包括孔,以允許吸管尖端訪問保持在其下的器皿。[0134]在一些實施例中,試劑、樣品或其它流體可被作為子組件裝載進入架620,並且架620然後被裝載進入盤14。在一些實施例中,試劑架620的設計是這樣的:它僅被在一個方向上放置進入隔離容器中。可替代地,試劑架620可被模製或製成隔離容器盤14的集成部分。試劑可被直接裝載進入容納可被放置在試劑盤中的試劑的集成試劑盤或管或其它器皿。限定的架位置(地址)處器皿2110,2112,2114的放置允許機器人接口在過程中在正確的時間處自動接合正確的器皿(試劑)。[0135]在一些實施例中,盤布置允許對全部器皿的訪問,不需要吸管尖端不得不在其它不同的試劑上通過,並因此減小試劑交叉汙染的機會。當然,可以使用其它結構,例如根據將被執行的期望工藝。[0136]圖21B描述了可以用於分別打開器皿2110,2112,2114上的密封的多點(示出為三點)刺穿次序,在收回(試劑)流體之前。也就是說,在移動至實際的收回刺穿(典型地在中心位置處)之前,吸管651可被導引刺穿在兩個外部位置處覆蓋的密封,以便有助於刺穿精確度。[0137]示範性的等分試樣移走系統在系統10的自動處理過程中,樣品和/或產品的一個或多個等分試樣可以用於處理評估,控制,質量測試和/或存儲,以用於進一步的處理(例如見圖4和5中的等分試樣管)。[0138]在一些實施例中,隔離容器12和處理系統10允許在處理過程中移走等分試樣,而不損害隔離容器12的密封特徵。多個柔性管可以與容器12的內部樣品捕獲區域流體聯繫,並且從系統10延伸,以使操作者可在外部訪問。每一個柔性管被預先密封或具有封閉的端部。每一個等分試樣可被吸進各個標記的容器440,例如管,同時容器12保持封閉。操作者或自動的密封器可以將等分試樣密封進入管440,例如流體的捕獲等分試樣的上遊,比如通過利用RF管密封器,或其它密封封閉機構。一旦被密封,從隔離容器可以分開等分試樣管,並且被拿走,以用於存儲,測試或進一步的處理。[0139]在一些實施例中,等分試樣裝置40用於抽吸等分試樣流體進入管440,並採用夾緊元件和等分試樣管440的彈性,以便從容器12內部將流體吸入管。該機構可被自動化,以便有助於管被夾緊短的時間,從而減小通過夾緊變形引起的管的彈性的任何改變的可能性。[0140]圖22描述了利用等分試樣裝置40的示範性方法2200,並且示出了可以用於使等分試樣管440裝載等分試樣流體445的一系列步驟(從左至右和從上到下)。如示出的,具有封閉端441的等分試樣管440密封附著至井14w下的盤14。在該例子中,相對於一個或多個等分試樣管440擠壓夾緊元件(管擠壓器)2210,以便從管(如通過第二和第三圖示出的)排出空氣。響應管被夾子2210完全壓縮,從而排出空氣(利用相對於管和其它夾緊表面對上夾緊元件向下用力)在此同時或之後,等分試樣物質445被放置或分配在與管440相聯繫的井14w中。基於夾緊力的隨後鬆脫,通過彈性管中的負壓,等分試樣流體445被吸入管440。管密封器(比如RF焊機)可以用於密封(在442處),並且任意切斷密封的等分試樣管上遊,以便隔離管中的樣品445。也可以使用其它密封劑機構。[0141]裝配容器的示範性方法圖23A是成套工具2500的分解表示,提供該成套工具以允許操作者製備用於處理的封閉系統。成套工具2500可以包括盤14,結合歧管50,吸管尖端架650(以及吸管尖端651)和試管2060、660。具有附著的等分試樣管440和/或附著的相關管和真空頭的盤14可被封裝和裝運至使用位置。該元件可被消毒並包裝在用於裝運和處理的無菌包裝中(或包裝,然後消毒)。該元件可在使用處被表面消毒,並且元件的裝配可以在等級10000,1000或甚至100的清潔房間中。也可以單獨提供該元件,或以其它組合預先裝載。[0142]圖23B是圖23A中示出的成套工具的部分裝配圖。圖23C是在圖23B中示出的部分裝配的成套工具的底視圖。圖23D是在利用容器或盤14裝運的離散元件的裝配或與容器或盤14分離的離散元件的裝配之前在圖23A中示出的容器14的頂視圖。[0143]圖24描述了依據本發明的實施例(例如對於無菌處理來自一個或多個生物樣品的核酸)分別密封隔離容器12的示範性方法。對於這種無菌處理,隔離容器組件12的隔離物16和盤14部分可被單獨預先包裝和消毒。當隔離容器14被需要用於處理時,盤14和隔離物16可被轉移至生物安全櫃或用於裝載的類似清潔、受控區域。[0144]如圖23A中示出的,隔離容器12的盤14可以裝載包括被用於期望的處理的樣品和試劑的一個或多個試劑盤620。如上面討論的,利用臺車399(圖27)上的盤14可以進行盤14的裝配和/或裝載。一個或多個吸管尖端架650和組合柱歧管50也可以被裝載進入盤14的工作區18。在一些實施例中,一個或多個試管660,2060被附著至盤的基座,例如如圖20F中示出的。根據被執行的期望試驗或處理,其它樣品,分析物,試劑,器皿,其它消耗品,裝置,工具和/或其它項目可被裝載進入盤14。[0145]在一些實施例中,在全部期望項目被放置進入盤14或附著至盤14之後,隔離物16可被附著至盤14,以便密封裝配的隔離容器12,例如如圖24中示出的。在一些實施例中,O-環2400可以用於密封柔性隔離物16至盤14。在隔離物16上可以適當地對O-環用力,並且O-環可被適當地壓進盤14上的周邊槽。在其它實施例中,可以使用一個或多個墊圈,夾子,緊固件,粘合劑和/或其它連接裝置。[0146]如圖27中示出的,在運輸過程中盤14可被鎖定至臺車上的固定表面。在盤14被裝載隔離物16或用隔離物16密封盤14之後,隔離容器12可被轉移至處理系統10的工作表面。可替代地,隔離容器可被裝配和消毒。然後,利用標準的無菌轉移方法或通過其它封閉裝置,試劑和樣品可被引入密封的隔離容器。臺車也可以用於在裝配過程中保持盤14。可替代地,當裝配隔離容器12(未示出)時,可以使用單獨的隔離裝置臺車裝配車。這種隔離裝置臺車可被結合進入隔離裝置自身,並且可以如上面討論地匹配運輸臺車。[0147]隔離容器組件12可被安裝進入系統10,並且連接至用於處理樣品的每一塊設備。為了確保正確的對準,剛性盤14在工作表面200上可被夾緊。柔性隔離物16和吸管頭220可以連接至機器人吸管頭適配器210(例如見圖2)。例如如示出的,在圖12中,熱循環控制裝置蒸發密封430可以連接至熱循環控制裝置蓋1010,例如利用真空杯1140或其它固定或附著裝置,並且用於廢料和洗脫站的可任意處置的泵頭和真空管被適配至對應的閥和泵。為了移走隔離容器,可以使用相反的程序。[0148]圖25是依據本發明的實施例可以在製造位置處實施的操作的流程圖。如示出的,提供輸入樣品3000(典型地從病人採集位置或對象樣本存儲位置)。當時間敏感時,為了12-48小時(比如整夜)之內製造位置處的接收,可以裝運樣本。在製造位置處,在隔離裝置(±夾3010)中準備隔離容器12,並且在放置在容器(例如均勻化,混合和/或離心的)之前,也可以準備(塊3000p)樣品。隔離容器元件的外部包裝,例如盤14,隔離物16和容器內容可被消毒(塊3002)。裝配和密封的隔離容器可以裝配(塊3004)和完整性測試(塊3006),以便確認密封狀態。[0149]封閉裝配的隔離容器可被移動至用於處理的設備(塊3020)。如示出的,利用矽隔膜柱和合適的RNA結合和洗脫試劑可以分離(塊3022)來自病人樣品的RNA。為了計算產出,執行濃度和體積確定,並且標準化濃度(塊3024)。cDNA通過反轉錄(RT)反應被合成,通過PCR被擴增,以及利用矽膜柱和合適的RNA結合和洗脫試劑被提純(塊3026)。執行濃度和體積確定,以便計算產出,並且標準化濃度(塊3028)。從得到的cDNA產生IVTRNA,利用DNase進行處理,並且利用矽膜柱和合適的RNA結合和洗脫試劑提純(塊3030)。執行濃度和體積確定,以便計算產出,並且標準化濃度(塊3032),產生最後擴增的RNA(塊3034)。對可任意處置的RNA進行完整性檢查(塊3036),以便確認該系統仍是被密封的,並且從環境隔離,從而確保在處理過程中不存在汙染。中間和/或最後產品可被作為一個或多個等分試樣量輸出(塊3050)。[0150]圖29A-29C示出了示範性的洗脫盤1610。如示出的,接收器1612被間隔開並具有角度,以便在各個接收器1612的使用過程中抑制濺出。兩個或多個接收器1612位於向上延伸的隔離物1614的每一側上,並且主要管狀接收部分1615合併為淺的通道1616,當它朝向管狀體部分1615移動時,該淺的通道向下逐漸變細,並越來越深和狹窄。通道1616的向前部分也向內和向下逐漸變細,以便捕獲飛濺和導引流體流至主要管部1615。[0151]圖30A-30B描述了用於廢料盤罩1640的類似結構,但是接收器的尖端1632是開放的,或者具有用於排出廢料進入廢料站(圖16)的孔。[0152]圖31是與傳感器4010,4020,4030聯繫的控制電路4000的示意性描述,該傳感器可以用於監控容器的內部的狀態,或提供期望的反饋,以便允許元件(加熱器,冷卻器,機器人臂運動等)的自動控制。如示出的,控制電路4000可以與用戶接口61(圖1)聯繫。傳感器可以包括負載檢測器4010,溫度傳感器4020和壓力傳感器4030。負載檢測器4010可以與新的吸管架聯繫,以便提供用於控制通過機器人臂施加的用來接合新吸管的接合力的負載力數據。溫度傳感器4020可以提供關於封閉容器環境中的內部環境或具體位置(例如一個或多個工作站)的溫度數據。壓力傳感器4030可以用於監控隔離或提純程序過程中封閉環境和/或真空的密封完整性狀態。可以使用傳感器的每一個或一些的多個傳感器,並且也可以使用其它傳感器。控制電路4000可以整個或部分居於系統10中,或者整體或部分在容器12上。[0153]如本領域熟練技術人員可以理解的,本發明的實施例可被具體化為方法,系統,數據處理系統或電腦程式產品。因此,本發明可以採用整個軟體實施方式或組合軟體和硬體方面的實施方式的形式,通常於此全部被稱作「電路」或「模塊」。進一步地,本發明可以採用基於具有在介質中被具體化的計算機可用程序代碼的計算機可用存儲介質使用電腦程式產品的形式。可以採用任何合適的計算機可讀介質,包括硬碟,⑶-ROMs,光學存儲裝置,比如支持網際網路或內部網的那些的傳輸介質,或磁或其它電存儲裝置。[0154]用於實施本發明的操作的電腦程式代碼可寫入PLC碼,比如Graph,Ladder或SCL0然而,計算機代碼可被替代或附加地寫入目標定向程式語言,比如Java,Smalltalk或C++和/或傳統的程序程式語言,比如「C」程式語言或在視覺定向編程環境中,比如VisualBasic0[0155]程序代碼的某些部分(或全部)可以全部在一個或多個該系統的計算機上執行你,作為獨立的軟體包,部分在系統計算機上執行,部分在系統計算機和部分在遠程計算機上執行,或整個在遠程計算機上執行。在後者情況中,通過區域網(LAN)或廣域網(WAN),遠程計算機可被連接至系統計算機,或者可以進行至外部計算機的連接(例如通過利用網際網路服務供應商的網際網路)。在一些實施例中,可以在本地計算機上執行一些程序代碼,並且可以在一個或多個本地和/或遠程伺服器上執行一些程序代碼。利用從成像形態提供的體積數據集,可以實時或接近實時或離線進行通信。[0156]參照依據本發明的實施例的方法,系統,電腦程式產品和數據和/或系統體系結構的流程圖和/或方塊圖部分描述本發明。可以理解,通過電腦程式指令可以執行描述的每一塊和/或塊的組合。這些電腦程式指令可被供給至通用計算機、專用計算機或其它可編程數據處理設備的處理器,以便製造機器,從而使經由計算機處理器或其它可編程數據處理設備執行的指令產生用於實施在一個塊或多個塊中指定的功能/動作的手段。[0157]這些電腦程式指令也可被存儲進計算機可讀存儲器或可以使計算機或其它可編程數據處理設備以特定方式起作用的存儲裝置中,以使存儲於計算機可讀存儲器或存儲裝置中的指令產生包括指令手段的製造品。該指令手段可以執行在一個塊或多個塊中指定的功能/動作。[0158]電腦程式指令也可被載入計算機或其它可編程數據處理設備,以在計算機或其它可編程設備上執行的一系列操作步驟,從而產生計算機實施的處理,使在計算機或其它可編程設備上執行的指令提供用於執行在一個塊或多個塊中指定的功能/動作的步驟。[0159]如圖32中所述的,本發明的實施例可被布置為數據處理系統4116,其可以用於實施或指導繪製(rendering)的操作,並且可以包括處理器電路4100,存儲器4136和輸入/輸出電路4146。該數據處理系統可被結合進例如可編程邏輯控制器(PLC),個人計算機,工作站,伺服器,路由器等的一個或多個中。系統4116可以居於一個機器上,或居於多個機器之間。處理器4100經由地址/數據總線4148與存儲器4136通信,並且經由地址/數據總線4149與輸入/輸出電路4146通信。輸入/輸出電路4146可以利用例如網際網路協議(IP)連接,在存儲器(存儲器和/或存儲介質)4136和另一個計算機系統或網絡之間傳輸信息。這些元件可以是傳統的元件,比如用於多種傳統的數據處理系統中的那些,其可被布置成如於此所述地工作。[0160]具體地,處理器4100可以是市場上可買到的,或是定製微處理器,微控制器,數位訊號處理器等。存儲器4136可以包括包含軟體和數據的任何存儲裝置和/或存儲介質,該軟體和數據用於實施依據本發明的實施例使用的功能電路或模塊。該存儲器4136可以包括但不局限於下面類型的裝置:R0M,PROM,EPROM,EEPR0M,快閃記憶體,SRAM,DRAM和磁碟。在本發明的一些實施例中,存儲器4136可以是內容可尋址存儲器(CAM)。[0161]如圖32中進一步所述的,存儲器(和/或存儲介質)4136可以包括用於數據處理系統的幾類軟體和數據:作業系統4152;應用程式4154;輸入/輸出裝置驅動器4158;以及數據1456。如本領域熟練技術人員可以理解的,作業系統4152可以是適用於數據處理系統的任何作業系統,比如IBM?,OS/2?,AIX?,或zOS?作業系統或Microsoft?Windows?95,Windows98,Windows2000,WindowsXP或WindowsCE作業系統,Unix或Linux?。IBM,OS/2,AIX和Zos是國際商業機器公司在美國或其它國家的商標,同時Linux是的LinusTorvalds在美國或其它國家的商標,Microsoft或Windows是微軟公司在美國或其它國家的商標。輸A/輸出裝置驅動器4158典型地包括應用程式4154通過作業系統4152訪問的軟體程序,以與例如輸入/輸出電路4146和某些存儲器4136元件等通信。應用程式4154是依據本發明的一些實施例實施電路和模塊的各種特徵的程序的說明。最後,數據4156表示由應用程式4154、作業系統4152、輸入/輸出裝置驅動器4158和可以居於存儲器4136中的其它軟體程序使用的靜態和動態數據。[0162]數據4156可以包括(基本上實時存檔或存儲)工藝序列數據集4126和/或封閉環境傳感器反饋數據4127。如圖32中進一步所述的,依據本發明的一些實施例,應用程式4154包括自動工藝序列和監控模塊4125。應用程式4154可被定位在本地伺服器(或處理器)和/或資料庫或遠程伺服器(或處理器)和/或資料庫,或者本地和遠程資料庫和/或伺服器的組合。[0163]在參照圖32中的應用程式4154描述本發明的同時,如本領域熟練技術人員可以理解的,其它結構落入本發明的範圍中。例如,除了應用程式4154,這些電路和模塊也可被結合進作業系統4152或數據處理系統的其它這種邏輯區中。此外,在單獨的數據處理系統中描述應用程式4154的同時,如本領域熟練技術人員可以理解的,可以橫越一個或多個數據處理系統地分布這種功能,例如以上面所述類型的客戶/伺服器布置中。因此,本發明不被解釋為局限於圖32中所述的結構,因為它可通過數據處理系統之間的其它布置和/或功能區提供。例如,儘管圖32被描述為具有各種電路和模塊,這些電路或模塊的一個或多個可被不脫離本發明的範圍地組合或分離。[0164]其它實施例提供前面的示範性系統10,以描述本發明的各個方面和特徵,並且不試圖限制本發明的範圍至用於核酸處理的系統,裝置和方法。相反,本領域的熟練技術人員可以理解,各種其它應用落入本發明的範圍中,包括例如用於製備、裝配,處理或另外操縱典型地在封閉容器中的任何項目的系統和方法。下面的部分提供了可以採用本發明的設備的方法的應用的附加例子。[0165]其它生物和/或藥物應用的例子在其它方面中,本發明提供轉移材料的方法,例如流體,從源至封閉環境中的目標,其中封閉環境被定義為如本申請中描述的設備的容器中的內部區域或腔室。被轉移的流體可以包括例如生物;藥物;毒素;隔離群;放射性同位素;病毒;細菌;真核細胞;提取物;分析物;比如血液,血漿,唾液等的生物樣本;疫苗;核酸;蛋白質;食品等,包括其懸浮液,混合物等等。[0166]可以發現用於即時系統和方法的應用,例如避免封閉環境內部要被轉移材料被容器之外環境中潛在的物質汙染。在某些實施例中,該系統和方法可以致力於材料的製備,或用於在診斷試驗中處理材料,比如(不受限制的例子),無菌性試驗,法醫分析或品質控制試驗,用以測試被用於臨床應用的生物製劑的純度。在其它實施例中,即時方法可以用於藥物或生物製劑(比如疫苗)的製備或製造,以及用於實驗和/或臨床應用的核酸。可以適用於本發明的系統和方法的各種試驗和方法如所述對本領域熟練技術人員是已知的,例如在美國藥典中,UnitedStatesPharmacopeiaandNationalFormulary(USP29-NF24)(2006),U.S.DepartmentofHeathandHumanServices,GuidanceforIndustry:SterileDrugProductsProducedbyAsepticProcessing-CurrentGoodManufacturingPractice(2004年9月),其每一個於此被整體參照結合。[0167]本領域熟練技術人員可以理解,流體被轉移至的目標可以是任何接收器,比如管,小瓶,器皿等,其試圖保持被轉移流體。在一些實施例中,目標是基板,比如結合柱,尺寸排除柱,色譜法介質或過濾器等。然而,根據提供的方法中的具體應用,可以使用任何流過裝置,即試圖捕獲和/或分離和/或濃縮從流體的另一成分轉移的流體的一個或多個成分的任何裝置。[0168]圖14提供了示範性設備的結構的例子,其中位於封閉環境中的結合柱1410是用於轉移例如包含核酸的流體目標。在其它實施例中,在圖14中描述的歧管可以適於適配上面討論的過濾器或其它裝置。[0169]在一些實施例中,通過本發明提供的系統和方法允許擴增的核酸產品的無菌製備,包括從細胞提取物離析RNA和從來自分離的RNA的至少一個RNA分子擴增核酸產品的步驟,其中在被定義為如本發明所述的設備的容器中的內部區域或腔室的封閉環境中執行離析和擴增步驟,從而無菌製備擴增的核酸產品。[0170]在用於擴增的核酸產品的無菌製備的某些實施例中,從病原體獲得擴增的核酸產品,比如從病毒性的病原體。在某些實施例中,從人腫瘤RNA獲得擴增的核酸產品。例如在疫苗或免疫療法的製備中可以使用來自人腫瘤RNA的擴增的核酸產品。[0171]即時方法可以用於在無菌條件下材料的消毒,例如在UnitedStatedCodeofFederalRegulation的Title21下被定義的生物,核酸和/或蛋白質等等。例如在U.S.DepartmentofHealthandHumanServices,GuidanceforIndustry:SteriIeDrugProductsProducedbyAsepticProcessing-CurrentGoodManufacturingPractice(2004年9月)中描述了關於用於臨床應用的這種材料的製備的準則。[0172]因此,在某些實施例中,方法被提供用於材料的消毒,包括轉移包括來自源的材料的流體至過濾器,並收集通過過濾器的之後的材料進入接收器,其中源、過濾器和接收器被容納在作為本申請中所述的設備的容器中的內部腔室或區域的封閉環境中。用於消毒的過濾器是市場上可買到的,例如從WhatmanInc(FlorhamPark,NJ)?[0173]也可以認識到,如果材料包括病原體,比如是HIV病毒,或其它某些微生物,或者包括生物毒素或放射性物質,那麼轉移材料會是危險的,例如分配材料進入小瓶。在比如在本申請的實施例中定義的封閉環境中轉移這種材料進入接收器可以減小危險材料對承擔該轉移的個體的潛在暴露。因此在某些實施例中,提供方法,其中在本申請中所述的設備的容器中的封閉環境中,將危險材料從源轉移至目標。這些方法可被應用於多種程序和試驗,其中危險材料在源和目標之間被轉移,如對本領域熟練技術人員已知的。[0174]本發明的設備可以用於其它應用,典型的蛋白質提純,核酸提純和其它分子生物學工藝。這種應用包括但不局限於:細胞溶解(例如細胞的機械的、促溶(chaotropic)、熱或酶溶解),高分子提純(例如離子交換,起泡(bead),分子重量截去),以及恢復(矽洗脫,珠洗脫,膜洗脫)。[0175]示範性的光刻術,微製備和相關應用本發明的實施例可以用於其中使用清潔的空間環境或希望隔離的的任何情形,例如光刻或組裝工藝。在一些實施例中,本發明的設備滿足等級1,等級10,等級100,等級1000,等級10000或等級100000的清潔空間的條件,該清潔空間如用於清潔空間分類的U.S.FederalStandard209b闡明的,見FederalStandardN0.209B1992,「CleanRoomandWorkStationRequirement,ControlledEnvironment,,,日期為1973年4月24日,因此其被整體參照結合。如此,本發明的實施例可以用於利用清潔空間環境的工藝的廣泛的範圍。這種工藝包括光刻工藝,包括但不局限於晶片圖案化(也稱為光掩模,掩模,光刻,微光刻),摻雜(例如熱擴散,離子注入),熱處理(例如熱,輻射)。在本發明的設備中可被實施的具體圖案化工藝包括但不局限於:(i)抗蝕劑應用(正或負);(ii)對高壓汞,X-射線或E-射束的曝光(例如通過接觸,接近,掃描投影和步進器);(iii)成像(例mi11ing如單層抗蝕劑,多層抗蝕劑,抗反射層的應用,離軸照明,平面化,對比度增強);以及(iv)蝕刻(例如溼化學液體/蒸汽,幹的,等離子,剝離,離子研磨,反應離子蝕刻)。具體的熱處理工藝包括但不局限於熱板,`對流,快速熱處理(RTP)和紅外。在Ka/?Zant,MicroshipFabrication,FourthEdition,Chapter4,2000,McGraw-Hill,NewYork中描述了這些光刻工藝的更多說明,因此於此將其整體參照結合。[0176]除了傳統的光刻技術之外,本發明的設備可以用於下一代光刻,比如極紫外,X-射線光刻(例如LIGA),帶電粒子束光刻(例如電子束,離子束),掃描探針光刻(例如掃描隧道顯微鏡光刻,原子力顯微鏡光刻,掃描電化學顯微鏡光刻),軟光刻(例如複製模型,微接觸印刷,毛細管微模製,微傳遞模製,與溶劑相關的微模製,利用彈性相移掩膜的近場共形光刻),以及三維光刻(例如全息光刻,非平面襯底上的光刻)。在Madou,FundamentalofMicrofabrication,SeondEdition,2002,CRCPressLICBocaRaton,Florida,pp.48-68中描述了這種技術,因此於此將其整體參考結合。[0177]本發明的實施例可以用於蛋白質構圖微光刻技術,該蛋白質構圖微光刻技術涉及例如競爭免疫感受器中的檢測位置的具體蛋白質吸收的問題。例如見Clementi等人StructureandMotion:Menbrace,Nucleic,andProtein,AdeninePress,Schenectady,NewYork,1985,因此於此將其整體參考結合。[0178]本發明的裝置,系統,設備和方法可以用於執行幹蝕刻技術,比如物理蝕刻(例如離子蝕刻,濺射,離子束研磨),等離子體蝕刻(例如自由基蝕刻),物理/化學蝕刻,深反應離子蝕刻,沒有等離子體的氣相蝕刻,幹蝕刻以及單晶反應蝕刻金屬化(SCREAM),如MadouFundamentalofMicrofabrication,SecondEdition,2002,CRCPressLICBocaRaton,Florida的Chapter2中公開的,因此於此將其整體參考結合。[0179]本發明的設備可以用於結合其它技術而執行圖案轉移,該其它技術比如矽生長,矽摻雜,矽的氧化,物理汽相擴散(例如熱蒸發,濺射,分子束外延附生,雷射濺射沉積,燒蝕沉積,離子鍍,團束技術),化學氣相沉積,絲印製(絲網印刷),溶膠凝膠沉積,等離子噴塗,噴塗熱解,以及離子束沉積,如MadouFundamentalofMicrofabrication,SecondEdition,2002,CRCPressLICBocaRaton,Florida的Chapter3中公開的,因此於此將其整體參考結合。[0180]本發明的實施例可以特別有用於B10MEMS領域中的沉積和布陣方法,其包括用於為化學和生物傳感器沉積有機材料的技術,常常被布置在一些類型的陣列結構中。這種結構可以用於例如獲得有機氣體可滲透的膜,離子選擇膜,水凝膠,需用於室溫氣體傳感器的有機單層,離子選擇電極,酶傳感器,免疫傳感器以及DNA和蛋白質陣列。可以基於本發明的設備而被實施的B10MEMS領域中的具體技術是旋塗,浸塗,塑料噴塗,鑄造,模式鑄造,輝光放電(等離子體)聚合,Langmur1-Blogett工藝,噴墨,微定點,以及機械微微定點,如MadouFundamentalofMicrofabrication,SecondEdition,pp.159-167,2002,CRCPressLICBocaRaton,Florida中公開的,因此於此將其整體參考結合。[0181]本發明的實施例可以用於其它清潔空間應用,比如小裝置(例如集成電路)的封裝。利用本發明的設備可被實施的具體封裝技術包括但不局限於集成電路的包封裝,切割,空腔密封和結合,多晶片封裝,以及劃分,如MadouFundamentalofMicrofabrication,SecondEdition,pp.478-508,2002,CRCPressLICBocaRaton,Florida中公開的,因此於此將其整體參考結合。[0182]本發明的實施例可以用於光刻工藝中的光致抗蝕劑的應用。例如,本發明的設備可以用於在清潔的空間環境中施加正或負光致抗蝕劑於襯底。如此,在本發明的設備中可以實施比如抗蝕旋塗,軟烘,硬烘,顯影,曝光後烘焙和多層抗蝕劑工藝,如在LeYinsori,PrincipleofLithography,SPIEPress,Bellingham,Washington,2001,Chapter3中所述的,因此於此將其整體參考結合。本發明的設備可以用於光刻工藝,比如光學光亥IJ,電子束光刻,X-射線光刻,深UV抗蝕劑應用,光掩膜製備,以及光學光刻中的度量衡方法,如Microlithography,Micromachining,andMicrofabrication,ed.Ra1-Choudhury,SPIEPress,Bellinggham,Washington,2001,Chapter1-6中所述的,因此於此將其整體參考結合。本發明的系統,裝置,設備和方法可以進一步用於製備光電池,包括但不局限於磷擴散,邊緣隔離,ARC沉積,前接觸印刷,反向接觸印刷,共點火,測試和存儲,如HandbookofPhotovoltaicScienceandEngineering,LuqueandGegedueds.,Johnffiley&Sons,WestSussex,Englang,2003,pp.271-279中所述的,因此於此將其整體參考結合。[0183]於此引用的全部參考在這裡被整體參考結合至相同的程度,好像每一個單獨的公開出版物或專利或專利申請被具體和分別示出被整體參照結合。然而,通過參考文獻的結合不用於變窄未決申請的權利要求元素的闡明或基於其的任何專利公布。[0184]在前面的說明書和附圖表示本發明的實施例的同時,可以理解,可以在此進行各種附加,修改和替代,只要不脫離如在附加權利要求中限定的本發明的精神和範圍。具體地,對本領域熟練技術人員顯而易見地,本發明可被具體化為其它具體的方面,結構,布置,比例,以及其它元件,材料和部件,只要不脫離其精神或基本特徵。目前公開的實施例因此被認為在全部方面中的,因為是描述性而非限制性的,通過附加權利要求表示本發明的範圍,不試圖是前面的說明書。【權利要求】1.一種用於轉移流體的設備,包括:用於抽取工作流體的至少一個泵;與至少一個泵聯繫的隔膜,隔膜被布置成將工作流體和至少一個泵與流體樣品隔離;以及與隔膜和流體樣品聯繫的管,該管具有向下延伸的腔;其中隔膜被布置成引入隔膜下的工作空氣體積的壓力變化,使得該壓力變化將目標流體吸入管腔或由管保持的吸管尖端中的至少一個或者從管腔或由管保持的吸管尖端中的至少一個排出。2.權利要求1的設備,其中工作流體是基本上或完全不可壓縮的液壓流體,其中工作流體存在於隔膜之上並且工作空氣體積存在於管中,並且其中隔膜之上的工作流體量的變化驅動隔膜並且影響工作空氣體積,使得附著到管的吸管尖端吸進或排放所期望的液體量。3.權利要求1的設備,其中隔膜是柔性的並且在吸管頭部的內側延伸,該吸管頭部具有封裝體積,該封裝體積具有第一和第二流體連接埠,該第一和第二流體連接埠在封裝體積上部上的隔膜之上延伸,並且該封裝體積具有在封裝體積下部上的隔膜之下延伸的管,其中該管限定了吸管尖端適配器,該適配器可釋放地附著吸管尖端,其中吸管頭部密封地附著到柔性隔離物,該柔性隔離物密封容器的內部,並且其中吸管頭部容納機器人臂的吸管頭部適配器,其可釋放地嚙合接合機器人臂,其中,在操作中,機器人臂將吸管尖端適配器上下移動並跨過容器內側的空間,同時容器保持密封。4.權利要求1的設備,其中泵包括與公共工作流體儲存器聯繫的第一和第二正位移注射泵,該公共工作流體儲存器提供工作流體,其中第一注射泵被布置用於比第二注射泵更高的體積轉移,其中該設備包括保持閉合空間的吸管頭部,該閉合空間具有在隔膜之上的用於工作流體的第一和第二流體連接,並且該設備在隔膜下保持在管的頂部之上並進入其中的工作空氣體積,並且該隔膜限定了在工作流體和工作空氣之間的障礙物。5.一種用於轉移流體的設備,包括:至少一個泵,用於從工作流體存儲器抽取基本上或完全不可壓縮的流體;與至少一個泵聯繫的柔性隔膜,該隔膜被布置成將隔膜之上的工作流體和隔膜之下的工作流體隔離;以及存在於隔膜之下的向下延伸的吸管尖端適配器,與工作空氣體積相聯繫,該吸管尖端適配器被布置為可釋放地保持吸管尖端,其中被控制的工作流體的量進入隔膜之上的閉合空間,以使隔膜改變形狀並將壓力變化引入到工作空氣體積,使得該壓力變化可控地將流體吸入由吸管尖端適配器保持的吸管尖端或從其中排出。6.一種處理樣本的方法,包括:提供一次性使用的容器,該容器的內部包括多個處理站;將至少一個反應物和至少一個樣本加載到容器內;用柔性障礙物密封該容器,該柔性障礙物包括與該柔性障礙物成一體或位於其內的吸管頭部,並且該吸管頭部具有從障礙物的一側延伸的吸管尖端適配器,以接合容器內部的吸管尖端,並具有障礙物的相對側上的接受器,以容納機器人臂的吸管頭部適配器;將機器人臂的吸管頭部適配器附著到吸管頭部,使得機器人臂存在於密封容器的外側;使用機器人臂從容器的外側操縱吸管尖端以,在容器中的處理站中的一個或多個之間轉移樣本和反應物;以及在處理站中的一個或多個處處理至少一個樣本。7.權利要求6的方法,其中操縱步驟包括響應於移動機器人臂而移動柔性障礙物的中心部分,使得柔性障礙物的中心部分在三維中平移並且形狀變化,同時柔性障礙物的外側的外圍部分仍然密封地附著到容器,以允許機器人臂在容器的內部區域內移動吸管尖端適配器。8.—種處理樣本的方法,包括:提供密封的一次性使用的容器,該容器的內部包括多個處理站和用於處理的至少一個樣本,該容器具有密封到容器外圍的柔性上部的障礙物,以限定具有密封內部的閉合處理系統,該柔性障礙物包括(i)附著到柔性障礙物的吸管頭部,該吸管頭部具有從障礙物向下延伸的吸管尖端適配器,用於在容器的密封內部內接合吸管尖端,和(ii)從障礙物的相對側向外延伸的接受器,用於外部地接合機器人臂;將機器人臂附著到該接受器,使得機器人臂存在於密封容器的外側;接著使用機器人臂從容器的外側操縱吸管頭部以在密封容器中的處理站中的一個或多個之間轉移樣本。9.一種處理樣本的方法,包括:提供密封的容器,該容器的內部包括多個處理站和至少一個生物樣本,該容器具有密封到容器外圍的柔性上部的障礙物,以限定具有多個間隔開的工作站的密封內部,柔性障礙物;將外部機器人臂附著到柔性障礙物,該機器人臂從柔性障礙物向外延伸;以及使用外部的機器人臂移動在密封的內部內保持的吸管頭部,以在密封的內部內通過所限定的一系列站來使至少一生物樣本前進。10.權利要求9的方法,其中柔性障礙物包括內部吸管頭部適配器,存在於與機器人臂適配器基本上對準的柔性障礙物的內側上,該機器人臂適配器位於柔性障礙物的外側上,吸管頭部適配器被布置為可釋放地保持至少一個吸管尖端,並且其中自動移動步驟被執行以使用可編程地限定的操作集來移動機器人臂和吸管頭部,以處理生物樣本。11.一種用於測量流體體積的設備,包括:至少一個發射器,被布置成朝向樣品容器的預定位置投射信號;至少一個接收器,被布置成在信號與樣品容器交互之後接收信號,其中由接收器接收的信號中的變化表示流體已下降低於所述預定位置的時間;以及與接收器和樣品容器聯繫的流體轉移裝置,其中當接收器檢測到流體已經下降低於所述預定位置時,流體轉移裝置確定已從樣品容器移走的流體的體積。12.權利要求11的設備,其中至少一個發射器是光發射器,並且信號包括光。13.權利要求11的設備,其中流體轉移裝置包括吸管的至少一部分。14.權利要求11的設備,其中樣品容器包括試管。15.權利要求11的設備,進一步包括與至少一個發射器串聯聯繫的多個樣品容器。16.權利要求11的設備,其中至少一個發射器包括存在於樣本容器的相對側上的第一和第二發射器,以能夠彼此成一直線地投射相應的光信號,並且其中至少一個接收器包括存在於在樣本容器的縱向延伸的中心線的不同側上的在樣本容器之下的第一和第二紅外(IR)接收器,其中當流體已經下降低於所述預定位置時,第一IR接收器通信地接收從第一發射器投射的光信號,並且第二IR接收器從第二發射器投射的光信號,並且投射的信號與樣本容器交互以在由相應地IR接收器接收之前轉向90度。17.權利要求11的設備,其中流體轉移裝置包括具有密封地附著到柔性障礙物的吸管頭部的吸管尖端,該柔性障礙物密封容器的內部,並且樣本容器被保持在該容器的內側,並且其中吸管頭部容納機器人臂的吸管頭部適配器,其可釋放地嚙合接合機器人臂,其中,在操作中,機器人臂將吸管尖端適配器上下移動並跨過容器內側的空間,同時容器保持密封。18.一種用於測量流體的體積的設備,包括:用於發射光的至少一個光源;用於接收來自光源的光的至少一個接收器;存在於至少一個光源和至少一個接收器附近的試管,通過該試管,根據試管包含流體或是空的,可以由至少一個接收器檢測光路的改變;以及與接收器聯繫的流體轉移裝置,以當接收器檢測到試管是空的時侯,確定已經從試管移走的流體的體積。【文檔編號】G01N1/28GK103499466SQ201310274447【公開日】2014年1月8日申請日期:2007年1月17日優先權日:2006年1月18日【發明者】S.J.斯潘斯,R.A.格蘭特,T.D.皮爾,W.S.亨特,A.F.阿布德莫特勒布,D.T.克尼恩,R.A.奈爾,S.哈裡斯申請人:阿戈斯治療公司

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