非小細胞肺癌中miR-10a基因的應用的製作方法
2023-12-10 04:07:06 2
專利名稱:非小細胞肺癌中miR-10a基因的應用的製作方法
技術領域:
本發明涉及一種非小細胞非癌中miRNA基因的應用。
背景技術:
微 RNA( microRNA,miRNA )功能調控是當前生命科學的重要前沿。微RNA是一類長度為21-22 nt的非編碼RNA分子,其通過轉錄後基因沉默調控靶基因的活性。通過對miRNA生物學功能及其調控的靶基因的研究表明,miRNA在腫瘤發生過程中起重要作用,miRNA很有可能成為癌症治療新的途徑。miRNA與靶基因mRNA的非編碼序列(3' -UTR或5' -UTR)存在著一對多的關係。miRNA通常是在細胞核內由RNA聚合酶II轉錄,初產物為pri一miRNA, pri一miRNA被核酸酶RNase III Drosha和其輔助因子Drasha加工成為發卡型前體miRNA(pre—miRNA),pre一miRNA被轉運蛋白Exportin 5從細胞核輸出到細胞質,之後被Dicer酶複合物剪切成為短的miRNA雙鏈,在解旋酶的幫助下miRNA雙鏈被解離,成熟的miRNA和RNA誘導的沉默複合體(RISC)結合。miRNA與RISC的複合體通過鹼基配對可與靶基因mRNA 3' - UTR中的互補序列相結合,隨即依據miRNA與其靶基因序列的互補性高低,或是抑制蛋白質翻譯延伸,或是引發mRNA降解,從而負調控靶基因的表達。肺癌是導致全球癌症死亡的最主要原因,每年因肺癌死亡的人數超過100萬,並且每年新增病例120萬。肺腺癌(lung adenocarcinoma)是最常見的癌症,其中約80%的肺癌是非小細胞肺癌(non- small cell lung cancer, NSCLC),其5年存活率僅為15%,主要原因是缺乏有效的針對肺癌的早期診斷和治療手段。miRNA通過調控靶基因mRNA的翻譯,在肺癌發生、發展及轉移發揮重要作用。miRNA可能成為新的肺癌早期診斷和癌症進程相關的標記物,有助於疾病的準確診斷及個性化治療。這一切設想的實現必須建立在miRNA靶基因功能研究工作的基礎上。
發明內容
本發明的目的之一在於提供一種非小細胞肺癌中miR-lOa基因在抑制癌細胞的增殖中的應用。本發明的目的之二在於提供一種miR-lOa基因在促進癌細胞的凋亡中的應用。本發明的目的之三在於提供一種miR-lOa基因在下調H1299細胞系中非小細胞肺癌旁組織的表達中應用。本發明首先分別從正常肺組織和非小細胞肺癌的肺組織中提取RNA。通過反轉錄構建二者的cDNA文庫,利用solexa測序技術,得到二者的miRNA表達圖譜。第二步,分析得到的數據,鑑定出二者有顯著表達差異的miRNA,並從中選擇了miR-10ao第三步,利用qRT-PCR的技術檢測多種非小細胞肺癌細胞系中的miR-lOa的表達量變化,並從中選擇一種miR-10a表達下調的非小細胞肺癌細胞系,在此細胞系中過表達miR-lOa以檢測其功能。
第四步,利用流式細胞儀技術和MTS技術,分別檢測過表達HiiR-IOa後H1299細胞的凋亡和增殖情況的變化。第五步,通過Targetscan軟體預測miR-lOa的祀基因,並將其m RNA的3' -UTR連接pGL-3載體。將miR-lOa與重組質粒共轉入HEK-293T細胞48h後檢測螢光。第六步,在H1299細胞中過表達miR-10a,檢測MAP3K7編碼的蛋白含量變化。H1299細胞系中miR-lOa基因通過與其靶基因MAP3K7的mRNA的:V -UTR互補,抑制靶基因mRNA的翻譯或直接降解靶基因的mRNA。結合生理生化試驗,確定了在H1299細胞系中miR-lOa與MAP3K7有相互作用。這種相互作用影響了 H1299細胞的增殖、凋亡等生命活動。本實驗通過軟體預測、solexa測序分析,並構建載體,在HEK293T細胞中利用螢光素酶報告基因分析驗證了 MAP3K7是miR-lOa的靶基因,並在H1299細胞中利用過表達和western-blot的技術,進一步驗證了該發現。所公開的為在H1299細胞系中MAP3K7是miR-lOa的靶基因的首次報導,該發明在臨床上為利用miRNA來診斷和治療非小細胞肺癌,以及提供藥物靶點方面提供了一定的應用價值。·
圖I solexa測序結果
圖2 H1299細胞中miR-lOa的相對表達含量 圖3過表達miR-lOa後促進H1299細胞凋亡 圖4過表達miR-lOa後抑制H1299的增殖 圖5 MAP3K7是miR-lOa的靶基因。
具體實施例方式下面將結合具體實例進一步闡述本發明。應理解,這些實例僅用於闡述本發明,而不用於限制本發明的範圍。下列實例中未註明具體實驗條件的實驗方法,通常按照分子克隆(Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd ed.)中所述的條件,或按照製造廠商所建議的條件。實施例一根據solexa測序結果,確定miR-10a抑制非小細胞肺癌生長
本發明所用到的k-ras基因突變小鼠肺癌模型(L703T2)和正常肺癌模型(L1805)由中科院生化細胞所季宏斌教授課題組提供。將正常小鼠的肺組織和患有非小細胞肺癌的小鼠的肺組織取樣,用TRIZOL法裂解組織,加入氯仿,待蛋白與核酸分層,離心之後吸取上清並加入異丙醇沉澱。再次離心後以乙醇洗滌沉澱,晾乾,獲得總RNA。利用TaKaRa公司的反轉錄試劑盒構建兩種組織的cDNA文庫,以oligo dt為引物進行反轉錄,通過變性反應和反轉錄2步獲得後續實驗的cDNA。將樣品利用solexa方法測序(Solexa測序由華大基因公司完成),參見圖I和圖2。利用得到的數據,分析後發現在非小細胞肺癌肺組織中miR-lOa的表達顯著的下調,參見表1,說明miR-lOa具有抑制非小細胞肺癌的作用。表I miR-lOa的表達豐度及變化___
miRNANon-tumorlungtissuesNSCLC Foldchange(Log2)
權利要求
1.一種非小細胞肺癌中miR-lOa基因在抑制癌細胞的增殖中的應用。
2.一種非小細胞肺癌中miR-lOa基因在促進癌細胞的凋亡中的應用。
3.一種非小細胞肺癌中miR-lOa基因在下調H1299細胞系中非小細胞肺癌旁組織的表達中應用。
全文摘要
本發明涉及一種非小細胞非癌中miRNA基因的應用。H1299細胞系中miR-10a的一種靶基因,miR-10a通過與靶基因mRNA的3′-UTR互補,抑制靶基因mRNA的翻譯或直接降解靶基因的mRNA。結合生理生化試驗,確定了在H1299細胞系中miR-10a與MAP3K7有相互作用。這種相互作用影響了H1299細胞的增殖、凋亡等生命活動。本實驗通過軟體預測、solexa測序分析,並構建載體,在HEK293T細胞中利用螢光素酶報告基因分析驗證了MAP3K7是miR-10a的靶基因,並在H1299細胞中利用過表達和western-blot的技術,進一步驗證了該發現。所公開的為在H1299細胞系中MAP3K7是miR-10a的靶基因的首次報導,該發明在臨床上為利用miRNA來診斷和治療非小細胞肺癌,以及提供藥物靶點方面提供了一定的應用價值。
文檔編號A61P35/00GK102743765SQ201210162999
公開日2012年10月24日 申請日期2012年5月24日 優先權日2012年5月24日
發明者侯品品, 王德韜, 金由辛, 韋嘉勵, 馬中良 申請人:上海大學