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胃癌的評價方法、胃癌評價裝置、以及胃癌評價系統的製作方法

2023-06-10 02:16:41

胃癌的評價方法、胃癌評價裝置、以及胃癌評價系統的製作方法
【專利摘要】本發明的課題在於,提供可以利用血液中的胺基酸濃度中與胃癌的狀態相關的胺基酸濃度來高精度地評價胃癌狀態的胃癌的評價方法、以及胃癌評價裝置、胃癌評價方法、胃癌評價系統、胃癌評價程序和記錄介質。本發明所述的胃癌的評價方法是針對從評價對象採集到的血液測定關於胺基酸濃度值的胺基酸濃度數據,根據測定的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸的濃度值,對於評價對象評價胃癌的狀態。
【專利說明】胃癌的評價方法、胃癌評價裝置、以及胃癌評價系統
[0001]本申請是原案申請日為2009年I月30日、原案申請號為200980104993.4 (國際申請號為PCT/JP2009/051548)、發明名稱為「胃癌的評價方法、以及胃癌評價裝置、胃癌評價方法、胃癌評價系統、胃癌評價程序和記錄介質」的專利申請的分案申請。

【技術領域】
[0002]本發明涉及利用血液(血漿)中的胺基酸濃度的胃癌的評價方法、以及胃癌評價裝置、胃癌評價方法、胃癌評價系統、胃癌評價程序和記錄介質。

【背景技術】
[0003]在2003年,日本因胃癌而死亡的人數中,男性為32846人,女性為17711人,為全部因癌症死亡總人數的第2位,在男性中為因癌症死亡人數的第2位,在女性中為因癌症死亡人數的第I位。
[0004]在胃癌的治療中,腫瘤局限於黏膜和黏膜下層時預後良好,早期(1-1I期)胃癌的5年存活率為50%以上,特別是IA期胃癌(浸潤程度為黏膜和黏膜下層,無淋巴結轉移)的5年存活率約為90%。
[0005]但是,隨著胃癌病期的進展,存活率降低,因此早期發現對於胃癌治癒來說至關重要。
[0006]這裡,胃癌的診斷有:胃蛋白酶原檢查、X射線檢查、內窺鏡檢查、腫瘤標誌物等。
[0007]但是,胃蛋白酶原檢查、X射線檢查、腫瘤標誌物並不能進行確診。例如胃蛋白酶原檢查時,雖然侵襲性低,但關於靈敏度則是各有不同的報告,大約為40?85 %,特異度為70?85%。但是,胃蛋白酶原檢查的要精密檢查率為20%,可以認為漏檢多。另外,採用X射線檢查(間接拍攝)時,關於靈敏度各有不同的報告,大約為70?80%,特異度為85?90%。但是可能有鋇餐帶來的副作用或暴露於放射線的可能性。關於腫瘤標誌物,目前尚未存在對胃癌的存在診斷有效的腫瘤標誌物。
[0008]而內窺鏡檢查可以確診,但這是侵襲度高的檢查,在篩查階段進行內窺鏡檢查是不現實的。並且,在象內窺鏡檢查這樣的侵襲診斷中,患者有伴隨痛苦等的負擔,也可能發生檢查導致的出血等的風險。
[0009]因此,從對患者的身體的負擔以及費用與效果的角度考慮,優選縮小篩選範圍至胃癌發病可能性高的被驗者,以這些人作為治療的對象。具體來說,優選用侵襲少且靈敏度、特異度高的方法選擇被驗者,通過對選擇的被驗者實施胃內窺鏡來縮小被驗者範圍,以確診為胃癌的被驗者作為治療的對象。
[0010]已知血液中的胺基酸濃度根據癌症發病而變化。例如根據Cynober的報導(非專利文獻I),例如由於穀氨醯胺主要作為氧化能量源、精氨酸作為氮氧化物或多胺的前體,它們激活癌細胞甲硫氨酸攝入能力,甲硫氨酸在各癌細胞中的消耗量增加。根據Vissers等人(非專利文獻2)或Kubota (非專利文獻3)的報導,胃癌患者的血漿中胺基酸組成與健康人不同。
[0011]專利文獻I或專利文獻2公開了胺基酸濃度與生物狀態(b1logical state)相關聯的方法。
[0012]專利文獻1:國際公開第2004/052191號小冊子
[0013]專利文獻2:國際公開第2006/098192號小冊子
[0014]非專利文獻 1:Cynober, L.ed.,Metabolic and therapeutic aspects of aminoacids in clinical nutrit1n.2nd ed., CRC Press.
[0015]非專利文獻 2:Vissers,Y.LJ.,等人.,Plasma arginine concentrat1n arereduced in cancer patients: evidence for arginine deficiency ? ,The AmericanJournal of Clinical Nutrit1n,2005,81,1142-1146 頁.
[0016]非專利文獻3:Kubota,A.,Meguid,Μ.Μ.,和 Hitch,D.C.,Amino acid profilescorrelate diagnostically with organ site in three kinds of malignanttumors.,Cancer, 1991,69,2343-2348 頁.


【發明內容】

[0017]發明所要解決的課題
[0018]但是,目前為止存在的問題是,以多種胺基酸為變數來診斷有否胃癌發病的技術的開發從時間和成本的角度考慮並未得到進行,未得到實際應用。另外存在的問題是,即使利用專利文獻I或專利文獻2中公開的指標式進行胃癌發病的有無的評價,也無法獲得足夠的精度。
[0019]本發明針對上述問題而設,其目的在於提供可利用血液中的胺基酸濃度中與胃癌的狀態相關的胺基酸的濃度高精度地評價胃癌的狀態的胃癌的評價方法,以及胃癌評價裝置、胃癌評價方法、胃癌評價系統、胃癌評價程序和記錄介質。
[0020]解決課題的方法
[0021]本發明人等為解決上述課題進行了深入的研究,結果鑑定了對於胃癌和非胃癌的2組判別有用的胺基酸(具體來說,是在胃癌和非胃癌的2組間隨著統計學上的顯著性差異而變動的胺基酸)、或對於胃癌病期的判別有用的胺基酸(具體來說,是在胃癌的病期la、lb、I1、Ilia、Illb、IV中隨著統計學上的顯著性差異而變動的胺基酸)、對於胃癌有否向其它器官轉移的判別有用的胺基酸(具體來說,是在向其它器官有轉移和無轉移的2組間隨著統計學上的顯著性差異而變動的胺基酸),同時進一步發現,包括已鑑定的胺基酸的濃度為變數的多變量判別式(指標式、相關式)與胃癌(具體來說是早期胃癌)的狀態(具體來說是病態進展)具有顯著相關,從而完成了本發明。
[0022]為了解決上述課題並達成目的,本發明所述的胃癌的評價方法的特徵在於,該方法包括下述步驟:測定步驟,針對從評價對象採集到的血液測定關於胺基酸濃度值的胺基酸濃度數據;濃度值基準評價步驟,根據在上述測定步驟中測定的上述評價對象的上述胺基酸濃度數據中所含的 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe> Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr, Tyr中的至少一種胺基酸的上述濃度值,對於上述評價對象評價其胃癌的狀態。
[0023]本發明所述的胃癌的評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌的評價方法中,上述濃度值基準評價步驟進一步包括下述濃度值基準判別步驟:根據在上述測定步驟中測定的上述評價對象的上述胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、Hi s、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr中的至少一種胺基酸的上述濃度值,對於上述評價對象,判別是上述胃癌還是非胃癌、判別上述胃癌的病期、或判別上述胃癌有否向其它器官轉移。
[0024]本發明所述的胃癌的評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌的評價方法中,上述濃度值基準評價步驟進一步包括下述步驟:判別值計算步驟,根據在上述測定步驟中測定的上述評價對象的上述胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr中的至少一種胺基酸的上述濃度值以及以上述胺基酸的濃度為變數的預先設定的多變量判別式,計算該多變量判別式的值即判別值;判別值基準評價步驟,根據在上述判別值計算步驟中計算的上述判別值,對於上述評價對象評價上述胃癌的上述狀態,上述多變量判別式含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr中的至少一種胺基酸作為上述變數。
[0025]本發明所述的胃癌的評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌的評價方法中,上述判別值基準評價步驟進一步包括下述判別值基準判別步驟:根據在上述判別值計算步驟中計算的上述判別值,對於上述評價對象,判別是上述胃癌還是非胃癌、判別上述胃癌的病期、或判別上述胃癌有否向其它器官轉移。
[0026]本發明所述的胃癌的評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌的評價方法中,上述多變量判別式以I個分數式或多個上述分數式之和表示,構成該判別式的上述分數式的分子和 / 或分母中含有 Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為上述變數。
[0027]本發明所述的胃癌的評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌的評價方法中,在上述判別值基準判別步驟中判別是上述胃癌或上述非胃癌時,上述多變量判別式是數式1、數式2或數式3 ;在上述判別值基準判別步驟中判別上述胃癌的上述病期時,上述多變量判別式是數式4 ;在上述判別值基準判別步驟中判別上述胃癌有否向上述其它器官轉移時,上述多變量判別式是數式5,
[0028]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0029]…(數式I)
[0030]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0031]...(數式 2)
[0032]a3 X Trp/Cln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0033]...(數式 3)
[0034]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0035]...(數式 4)
[0036]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg) /His+c5
[0037]...(數式 5)
[0038](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0039]本發明所述的胃癌的評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌的評價方法中,上述多變量判別式為邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析(Canonical Discriminant Analysis)製作的公式、由決策樹製作的公式的任意一種。
[0040]本發明所述的胃癌的評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌的評價方法中,上述多變量判別式是以Orn、Gin、Trp、Cit為上述變數的上述邏輯回歸式,或以Orn、Gin、Trp、Phe、CU、Tyr為上述變數的上述線性判別式,或以Glu、Phe、His、Trp為上述變數的上述邏輯回歸式,或以Glu、Pro、His、Trp為上述變數的上述線性判別式,或以Val、lie、His、Trp為上述變數的上述邏輯回歸式,或以Thr、He, His, Trp為上述變數的上述線性判別式。
[0041]本發明還涉及胃癌評價裝置,本發明所述的胃癌評價裝置為具備控制裝置和存儲裝置且對於評價對象評價其胃癌的狀態的胃癌評價裝置,其特徵在於,上述控制裝置具備下述裝置:判別值計算裝置,根據以胺基酸的濃度為變數、含有Asn、Cys> His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為上述變數、在上述存儲裝置中存儲的多變量判別式以及預先取得的與上述胺基酸的濃度值相關的上述評價對象的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys> His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸的上述濃度值,計算該多變量判別式的值即判別值;判別值基準評價裝置,根據在上述判別值計算裝置中計算的上述判別值,對於上述評價對象評價上述胃癌的上述狀態。
[0042]本發明所述的胃癌評價裝置的特徵還在於,在上述的胃癌評價裝置中,上述判別值基準評價裝置進一步具備下述判別值基準判別裝置:根據在上述判別值計算裝置中計算的上述判別值,對於上述評價對象,判別是上述胃癌還是非胃癌、判別上述胃癌的病期、或判別上述胃癌有否向其它器官轉移。
[0043]本發明所述的胃癌評價裝置的特徵還在於,在上述的胃癌評價裝置中,上述多變量判別式以I個分數式或多個上述分數式之和表示,構成該判別式的上述分數式的分子和/ 或分母中含有 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr中的至少一種胺基酸作為上述變數。
[0044]本發明所述的胃癌評價裝置的特徵還在於,在上述的胃癌評價裝置中,在上述判別值基準判別裝置中判別是上述胃癌或上述非胃癌時,上述多變量判別式是數式1、數式2或數式3 ;在上述判別值基準判別裝置中判別上述胃癌的上述病期時,上述多變量判別式是數式4;在上述判別值基準判別步驟中判別上述胃癌有否向上述其它器官轉移時,上述多變量判別式是數式5,
[0045]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0046]…(數式I)
[0047]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0048]...(數式 2)
[0049]a3 X Trp/Cln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0050]...(數式 3)
[0051]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0052]...(數式 4)
[0053]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0054]...(數式 5)
[0055](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,c3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0056]本發明所述的胃癌評價裝置的特徵還在於,在上述的胃癌評價裝置中,上述多變量判別式為邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式的任意一種。
[0057]本發明所述的胃癌評價裝置的特徵還在於,在上述的胃癌評價裝置中,上述多變量判別式是以Orn、Gln、Trp、Cit為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Orn、Gin、Trp、Phe、CU、Tyr為上述變數的上述線性判別式;或以Glu、Phe、His、Trp為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Glu、Pro、His、Trp為上述變數的上述線性判別式;或以Val、lie、His、Trp為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Thr、He, His, Trp為上述變數的上述線性判別式。
[0058]本發明所述的胃癌評價裝置的特徵還在於,在上述的胃癌評價裝置中,上述控制裝置進一步具備下述多變量判別式製作裝置:根據含有上述胺基酸濃度數據和與表示上述胃癌的上述狀態的指標相關的胃癌狀態指標數據、在上述存儲裝置中存儲的胃癌狀態信息,製作在上述存儲裝置中存儲的上述多變量判別式,上述多變量判別式製作裝置進一步具備下述裝置:候選多變量判別式製作裝置,根據規定的公式製作方法,由上述胃癌狀態信息製作上述多變量判別式的候選即候選多變量判別式;候選多變量判別式驗證裝置,根據規定的驗證方法,驗證在上述候選多變量判別式製作裝置中製作的上述候選多變量判別式;變數選擇裝置,根據規定的變數選擇方法,從上述候選多變量判別式驗證裝置的驗證結果中選擇上述候選多變量判別式的變數,來選擇在製作上述候選多變量判別式時使用的上述胃癌狀態信息中所含的上述胺基酸濃度數據的組合,根據反覆運行上述候選多變量判別式製作裝置、上述候選多變量判別式驗證裝置以及上述變數選擇裝置而累積的上述驗證結果,從多個上述候選多變量判別式中選出用作上述多變量判別式的上述候選多變量判別式,來製作上述多變量判別式。
[0059]本發明還涉及胃癌評價方法,本發明所述的胃癌評價方法是在具備控制裝置和存儲裝置的信息處理裝置中實行的對於評價對象評價其胃癌的狀態的胃癌評價方法,其特徵在於,在上述控制裝置中實行以下步驟:判別值計算步驟,根據以胺基酸的濃度為變數、含有 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸作為上述變數、在上述存儲裝置中存儲的多變量判別式以及關於上述胺基酸的濃度值的預先取得的上述評價對象的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸的上述濃度值,計算該多變量判別式的值即判別值;判別值基準評價步驟,根據在上述判別值計算步驟中計算的上述判別值,對於上述評價對象評價上述胃癌的上述狀態。
[0060]本發明所述的胃癌評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌評價方法中,上述判別值基準評價步驟進一步包括下述判別值基準判別步驟:根據在上述判別值計算步驟中計算的上述判別值,對於上述評價對象,判別是上述胃癌還是非胃癌、判別上述胃癌的病期、或判別上述胃癌有否向其它器官轉移。
[0061 ] 本發明所述的胃癌評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌評價方法中,上述多變量判別式以I個分數式或多個上述分數式之和表示,構成該判別式的上述分數式的分子和/ 或分母中含有 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr中的至少一種胺基酸作為上述變數。
[0062]本發明所述的胃癌評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌評價方法中,在上述判別值基準判別步驟中判別是上述胃癌或上述非胃癌時,上述多變量判別式是數式1、數式2或數式3 ;在上述判別值基準判別步驟中判別上述胃癌的上述病期時,上述多變量判別式是數式4;在上述判別值基準判別步驟中判別上述胃癌有否向上述其它器官轉移時,上述多變量判別式是數式5,
[0063]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0064]…(數式I)
[0065]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0066]…(數式2)
[0067]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0068]...(數式 3)
[0069]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0070]...(數式 4)
[0071]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0072]…(數式5)
[0073](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0074]本發明所述的胃癌評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌評價方法中,上述多變量判別式為邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式的任意一種。
[0075]本發明所述的胃癌評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌評價方法中,上述多變量判別式是以Orn、Gin、Trp、Cit為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Orn、Gin、Trp、Phe、CU、Tyr為上述變數的上述線性判別式;或以Glu、Phe、His、Trp為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Glu、Pro、His、Trp為上述變數的上述線性判別式;或以Val、lie、His、Trp為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Thr、He, His, Trp為上述變數的上述線性判別式。
[0076]本發明所述的胃癌評價方法的特徵還在於,在上述的胃癌評價方法中,在上述控制裝置中進一步實行下述多變量判別式製作步驟:根據包含上述胺基酸濃度數據和與表示上述胃癌的上述狀態的指標相關的胃癌狀態指標數據、在上述存儲裝置中存儲的胃癌狀態信息,製作在上述存儲裝置中存儲的上述多變量判別式,上述多變量判別式製作步驟進一步包括下述步驟:候選多變量判別式製作步驟,根據規定的公式製作方法,由上述胃癌狀態信息製作上述多變量判別式的候選即候選多變量判別式;候選多變量判別式驗證步驟,根據規定的驗證方法,驗證在上述候選多變量判別式製作步驟中製作的上述候選多變量判別式;變數選擇步驟,根據規定的變數選擇方法,從上述候選多變量判別式驗證步驟的驗證結果中選擇上述候選多變量判別式的變數,來選擇在製作上述候選多變量判別式時使用的上述胃癌狀態信息中所含的上述胺基酸濃度數據的組合,根據反覆運行上述候選多變量判別式製作步驟、上述候選多變量判別式驗證步驟以及上述變數選擇步驟而累積的上述驗證結果,從多個上述候選多變量判別式中選出用作上述多變量判別式的上述候選多變量判別式,來製作上述多變量判別式。
[0077]本發明還涉及胃癌評價系統,本發明所述的胃癌評價系統是經由網絡以可通信的方式將具備控制裝置和存儲裝置且對於評價對象評價其胃癌的狀態的胃癌評價裝置,以及提供上述評價對象的關於胺基酸濃度值的胺基酸濃度數據的信息通信終端裝置連接在一起而構成,上述信息通信終端裝置具備下述裝置:胺基酸濃度數據發送裝置,將上述評價對象的上述胺基酸濃度數據發送至上述胃癌評價裝置;評價結果接收裝置,接收由上述胃癌評價裝置發送的針對上述評價對象作出的與上述胃癌的上述狀態相關的評價結果,上述胃癌評價裝置的上述控制裝置具備下述裝置:胺基酸濃度數據接收裝置,接收由上述信息通信終端裝置發送的上述評價對象的上述胺基酸濃度數據;判別值計算裝置,根據以胺基酸的濃度為變數、含有 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr>Tyr中的至少一種胺基酸作為上述變數、在上述存儲裝置中存儲的多變量判別式,以及在上述胺基酸的濃度數據接收裝置中接收的上述評價對象的上述胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸的上述濃度值,計算該多變量判別式的值即判別值;判別值基準評價裝置,根據在上述判別值計算裝置中計算的上述判別值,對於上述評價對象評價上述胃癌的上述狀態;評價結果發送裝置,將上述判別值基準評價裝置中作出的對上述評價對象的上述評價結果發送至上述信息通信終端裝置。
[0078]本發明所述的胃癌評價系統的特徵還在於,在上述的胃癌評價系統中,上述判別值基準評價裝置進一步具備下述判別值基準判別裝置:根據在上述判別值計算裝置中計算的上述判別值,對於上述評價對象,判別是上述胃癌還是非胃癌、判別上述胃癌的病期、或判別上述胃癌有否向其它器官轉移。
[0079]本發明所述的胃癌評價系統的特徵還在於,在上述的胃癌評價系統中,上述多變量判別式以I個分數式或多個上述分數式之和表示,構成該判別式的上述分數式的分子和/ 或分母中含有 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr中的至少一種胺基酸作為上述變數。
[0080]本發明所述的胃癌評價系統的特徵還在於,在上述的胃癌評價系統中,在上述判別值基準判別裝置中判別是上述胃癌或上述非胃癌時,上述多變量判別式是數式1、數式2或數式3 ;在上述判別值基準判別裝置中判別上述胃癌的上述病期時,上述多變量判別式是數式4;在上述判別值基準判別裝置中判別上述胃癌有否向上述其它器官轉移時,上述多變量判別式是數式5,
[0081]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0082]…(數式I)
[0083]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0084]...(數式 2)
[0085]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0086]...(數式 3)
[0087]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0088]...(數式 4)
[0089]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0090]...(數式 5)
[0091](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0092]本發明所述的胃癌評價系統的特徵還在於,在上述的胃癌評價系統中,上述多變量判別式為邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式的任意一種。
[0093]本發明所述的胃癌評價系統的特徵還在於,在上述的胃癌評價系統中,上述多變量判別式是以Orn、Gin、Trp、Cit為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Orn、Gin、Trp、Phe、CU、Tyr為上述變數的上述線性判別式;或以Glu、Phe、His、Trp為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Glu、Pro、His、Trp為上述變數的上述線性判別式;或以Val、lie、His、Trp為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Thr、He, His, Trp為上述變數的上述線性判別式。
[0094]本發明所述的胃癌評價系統的特徵還在於,在上述的胃癌評價系統中,上述控制裝置進一步具備下述多變量判別式製作裝置:根據含有上述胺基酸濃度數據和與表示上述胃癌的上述狀態的指標相關的胃癌狀態指標數據、在上述存儲裝置中存儲的胃癌狀態信息,製作在上述存儲裝置中存儲的上述多變量判別式,上述多變量判別式製作裝置進一步具備下述裝置:候選多變量判別式製作裝置,根據規定的公式製作方法,由上述胃癌狀態信息製作上述多變量判別式的候選即候選多變量判別式;候選多變量判別式驗證裝置,根據規定的驗證方法,驗證在上述候選多變量判別式製作裝置中製作的上述候選多變量判別式;變數選擇裝置,根據規定的變數選擇方法,從上述候選多變量判別式驗證裝置的驗證結果中選擇上述候選多變量判別式的變數,來選擇在製作上述候選多變量判別式時使用的上述胃癌狀態信息中所含的上述胺基酸濃度數據的組合,根據反覆運行上述候選多變量判別式製作裝置、上述候選多變量判別式驗證裝置以及上述變數選擇裝置而累積的上述驗證結果,從多個上述候選多變量判別式中選出用作上述多變量判別式的上述候選多變量判別式,來製作上述多變量判別式。
[0095]本發明還涉及胃癌評價程序,本發明所述的胃癌評價程序其是在具備控制裝置和存儲裝置的信息處理裝置中實行的對於評價對象評價胃癌的狀態的胃癌評價程序,其特徵在於,在上述控制裝置中實行下述步驟:判別值計算步驟,根據以胺基酸的濃度為變數、含有 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸作為上述變數、在上述存儲裝置中存儲的多變量判別式,以及關於上述胺基酸的濃度值的預先取得的上述評價對象的上述胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸的上述濃度值,計算該多變量判別式的值即判別值;判別值基準評價步驟,根據在上述判別值計算步驟中計算的上述判別值,對於上述評價對象評價上述胃癌的上述狀態。
[0096]本發明所述的胃癌評價程序的特徵還在於,在上述的胃癌評價程序中,上述判別值基準評價步驟進一步具備下述判別值基準判別步驟:根據在上述判別值計算步驟中計算的上述判別值,對於上述評價對象,判別是上述胃癌還是非胃癌、判別上述胃癌的病期、或判別上述胃癌有否向其它器官轉移。
[0097]本發明所述的胃癌評價程序的特徵還在於,在上述的胃癌評價程序中,上述多變量判別式以I個分數式或多個上述分數式之和表示,構成該判別式的上述分數式的分子和/ 或分母中含有 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr中的至少一種胺基酸作為上述變數。
[0098]本發明所述的胃癌評價程序的特徵還在於,在上述的胃癌評價程序中,在上述判別值基準判別步驟中判別是上述胃癌或上述非胃癌時,上述多變量判別式是數式1、數式2或數式3 ;在上述判別值基準判別步驟中判別上述胃癌的上述病期時,上述多變量判別式是數式4;在上述判別值基準判別步驟中判別上述胃癌有否向上述其它器官轉移時,上述多變量判別式是數式5,
[0099]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0100]...(數式 I)
[0101]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0102]…(數式I)
[0103]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0104]...(數式 I)
[0105]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0106]…(數式I)
[0107]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0108]…(數式I)
[0109](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0110]本發明所述的胃癌評價程序的特徵還在於,在上述的胃癌評價程序中,上述多變量判別式為邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式的任意一種。
[0111]本發明所述的胃癌評價程序的特徵還在於,在上述的胃癌評價程序中,上述多變量判別式是以Orn、Gin、Trp、Cit為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Orn、Gin、Trp、Phe、CU、Tyr為上述變數的上述線性判別式;或以Glu、Phe、His、Trp為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Glu、Pro、His、Trp為上述變數的上述線性判別式;或以Val、lie、His、Trp為上述變數的上述邏輯回歸式;或以Thr、He, His, Trp為上述變數的上述線性判別式。
[0112]本發明所述的胃癌評價程序的特徵還在於,在上述的胃癌評價程序中,上述控制裝置進一步實行下述多變量判別式製作步驟:根據含有上述胺基酸濃度數據和與表示上述胃癌的上述狀態的指標相關的胃癌狀態指標數據、在上述存儲裝置中存儲的胃癌狀態信息,製作在上述存儲裝置中存儲的上述多變量判別式,上述多變量判別式製作步驟進一步包括下述步驟:候選多變量判別式製作步驟,根據規定的公式製作方法,由上述胃癌狀態信息製作上述多變量判別式的候選即候選多變量判別式;候選多變量判別式驗證步驟,根據規定的驗證方法,驗證在上述候選多變量判別式製作步驟中製作的上述候選多變量判別式;變數選擇步驟,根據規定的變數選擇方法,從上述候選多變量判別式驗證裝置的驗證結果中選擇上述候選多變量判別式的變數,來選擇在製作上述候選多變量判別式時使用的上述胃癌狀態信息中所含的上述胺基酸濃度數據的組合,根據反覆運行上述候選多變量判別式製作步驟、上述候選多變量判別式驗證步驟以及上述變數選擇步驟而累積的上述驗證結果,從多個上述候選多變量判別式中選出用作上述多變量判別式的上述候選多變量判別式,來製作上述多變量判別式。
[0113]本發明還涉及記錄介質,本發明所述的記錄介質的特徵在於,該記錄介質記錄有上述的胃癌評價程序。
[0114]發明效果
[0115]根據本發明所述的胃癌的評價方法,針對從評價對象採集到的血液測定關於胺基酸濃度值的胺基酸濃度數據,根據測定的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr 中的至少一種胺基酸的濃度值,對於評價對象評價其胃癌的狀態,因此,利用血液中的胺基酸濃度中與胃癌的狀態相關的胺基酸的濃度,發揮可高精度地評價胃癌的狀態的效果。
[0116]根據本發明所述的胃癌的評價方法,根據所測定的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸的濃度值,對於評價對象判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移,因此,利用血液中的胺基酸濃度中對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別有用的胺基酸的濃度,發揮可高精度地進行這些判別的效果。
[0117]根據本發明所述的胃癌的評價方法,根據所測定的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸的濃度值以及以胺基酸的濃度為變數、含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸為變數的預先設定的多變量判別式,計算該多變量判別式的值即判別值,根據計算的判別值,對於評價對象評價胃癌的狀態,因此,利用由與胃癌的狀態具有顯著相關的多變量判別式得到的判別值,發揮可高精度地評價胃癌的狀態的效果。
[0118]根據本發明所述的胃癌的評價方法,根據計算的判別值,對於評價對象判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別有用。
[0119]根據本發明所述的胃癌的評價方法,多變量判別式以I個分數式或多個分數式之和表示,構成該判別式的分數式的分子和/或分母中含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為上述變數,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0120]根據本發明所述的胃癌的評價方法,在判別是胃癌或非胃癌時,多變量判別式是數式1、數式2或數式3 ;在判別胃癌的病期時,多變量判別式是數式4 ;在判別胃癌有否向其它器官轉移時,多變量判別式是數式5,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0121]H1XOrn/(Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0122]...(數式 I)
[0123]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0124]...(數式 2)
[0125]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0126]...(數式 3)
[0127]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0128]...(數式 4)
[0129]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0130]...(數式 5)
[0131](數式I中,a1、Id1是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0132]根據本發明所述的胃癌的評價方法,多變量判別式為邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析(Canonical Discriminant Analysis)製作的公式、由決策樹製作的公式的任意一種,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0133]根據本發明所述的胃癌的評價方法,多變量判別式是以Orn、Gin、Trp、Cit為變數的邏輯回歸式,或以Orn、Gin、Trp、Phe、CU、Tyr為變數的線性判別式,或以Glu、Phe、His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Glu、Pro、His、Trp為變數的線性判別式,或以Val、Ile、His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Thr、lie、His、Trp為變數的線性判別式,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0134]根據本發明所述的胃癌評價裝置、胃癌評價方法和胃癌評價程序,根據以胺基酸的濃度為變數、含有 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr>Tyr中的至少一種胺基酸作為變數、在存儲裝置中存儲的多變量判別式以及預先取得的與胺基酸的濃度值相關的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸的濃度值,計算該多變量判別式的值即判別值,根據計算的判別值,對於評價對象評價胃癌的狀態,因此,利用由與胃癌的狀態具有顯著相關的多變量判別式得到的判別值,發揮可高精度地評價胃癌的狀態的效果。
[0135]根據本發明所述的胃癌評價裝置、胃癌評價方法和胃癌評價程序,根據計算的判別值,對於評價對象判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別有用。
[0136]根據本發明所述的胃癌評價裝置、胃癌評價方法和胃癌評價程序,多變量判別式以I個分數式或多個分數式之和表示,構成該判別式的分數式的分子和/或分母中含有Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸作為變數,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0137]根據本發明所述的胃癌評價裝置、胃癌評價方法和胃癌評價程序,在判別是胃癌或非胃癌時,多變量判別式是數式1、數式2或數式3 ;在判別胃癌的病期時,多變量判別式是數式4 ;在判別胃癌有否向其它器官轉移時,多變量判別式是數式5,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0138]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0139]...(數式 I)
[0140]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0141]...(數式 2)
[0142]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0143]...(數式 3)
[0144]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0145]...(數式 4)
[0146]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0147]...(數式 5)
[0148](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0149]根據本發明所述的胃癌評價裝置、胃癌評價方法和胃癌評價程序,多變量判別式為邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式的任意一種,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0150]根據本發明所述的胃癌評價裝置、胃癌評價方法和胃癌評價程序,多變量判別式是以Orn、Gin、Trp、Cit為變數的邏輯回歸式;或以Orn、Gin、Trp、Phe、CU、Tyr為變數的線性判別式;或以Glu、Phe、His、Trp為變數的邏輯回歸式;或以Glu、Pro、His、Trp為變數的線性判別式;或以Val、lie、His、Trp為變數的邏輯回歸式;或以Thr、lie、His、Trp為變數的線性判別式,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判另O、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0151]根據本發明所述的胃癌評價裝置、胃癌評價方法和胃癌評價程序,根據含有胺基酸濃度數據和與表示胃癌的狀態的指標相關的胃癌狀態指標數據、在存儲裝置中存儲的胃癌狀態信息,製作在存儲裝置中存儲的多變量判別式。具體來說,(I)根據規定的公式製作方法,由胃癌狀態信息製作候選多變量判別式;(2)根據規定的驗證方法,驗證製作的候選多變量判別式;(3)根據規定的變數選擇方法,從該驗證結果中選擇候選多變量判別式的變數,來選擇在製作候選多變量判別式時使用的胃癌狀態信息中所含的上述胺基酸濃度數據的組合;(4)根據反覆運行(I)、(2)和(3)而累積的驗證結果,從多個候選多變量判別式中選出用作多變量判別式的候選多變量判別式,來製作多變量判別式。由此,發揮可製作最適合胃癌狀態評價的多變量判別式(具體來說,是與胃癌(早期胃癌)的狀態(病態進展)具有顯著相關的多變量判別式(更具體來說,是對於胃癌和非胃癌的2組判別有用的多變量判別式、對於胃癌病期的判別有用的多變量判別式、對於胃癌有否向其它器官轉移的2組判別有用的多變量判別式))的效果。
[0152]根據本發明所述的胃癌評價系統,首先,信息通信終端裝置將評價對象的胺基酸濃度數據發送到胃癌評價裝置。胃癌評價裝置接收由信息通信終端裝置發送來的評價對象的胺基酸濃度數據,根據以胺基酸的濃度為變數、含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為變數、在存儲裝置中存儲的多變量判別式以及接收的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、Hi s、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸的濃度值,計算該多變量判別式的值即判別值,根據計算的判別值,對於評價對象評價胃癌的狀態,將該評價對象的評價結果發送至信息通信終端裝置。信息通信終端裝置接收由胃癌評價裝置發送的針對評價對象作出的與胃癌狀態相關的評價結果。由此,利用由與胃癌的狀態具有顯著相關的多變量判別式得到的判別值,發揮可高精度地評價胃癌的狀態的效果。
[0153]根據本發明所述的胃癌評價系統,胃癌評價裝置根據計算的判別值,對於評價對象判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判另Ij式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別有用。
[0154]根據本發明所述的胃癌評價系統,多變量判別式以I個分數式或多個分數式之和表示,構成該判別式的分數式的分子和/或分母中含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為變數,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0155]根據本發明所述的胃癌評價系統,在判別是胃癌或非胃癌時,多變量判別式是數式1、數式2或數式3 ;在判別胃癌的病期時,多變量判別式是數式4 ;在判別胃癌有否向其它器官轉移時,多變量判別式是數式5,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判另O、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0156]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0157]…(數式I)
[0158]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0159]…(數式2)
[0160]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0161]...(數式 3)
[0162]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0163]...(數式 4)
[0164]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0165]...(數式 5)
[0166](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0167]根據本發明所述的胃癌評價系統,多變量判別式為邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式的任意一種,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判另O、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0168]根據本發明所述的胃癌評價系統,多變量判別式是以Orn、Gin、Trp、Cit為變數的邏輯回歸式;或以Orn、Gin、Trp、Phe、CU、Tyr為變數的線性判別式;或以Glu、Phe、His、Trp為變數的邏輯回歸式;或以Glu、Pro、His、Trp為變數的線性判別式;或以Val、Ile、His、Trp為變數的邏輯回歸式;或以Thr、lie、His、Trp為變數的線性判別式,因此,利用由多變量判別式得到的判別值,發揮可進一步高精度地進行這些判別的效果,其中,所述多變量判另IJ式對於胃癌和非胃癌的2組判別、或胃癌病期的判別、或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。
[0169]根據本發明所述的胃癌評價系統,胃癌評價裝置根據含有胺基酸濃度數據和與表示胃癌的狀態的指標相關的胃癌狀態指標數據、在存儲裝置中存儲的胃癌狀態信息,製作在存儲裝置中存儲的多變量判別式。具體來說,(I)根據規定的公式製作方法,由胃癌狀態信息製作候選多變量判別式;(2)根據規定的驗證方法,驗證製作的候選多變量判別式;
(3)根據規定的變數選擇方法,從該驗證結果中選擇候選多變量判別式的變數,來選擇在製作候選多變量判別式時使用的胃癌狀態信息中所含的上述胺基酸濃度數據的組合;(4)根據反覆運行(I)、(2)和(3)而累積的驗證結果,從多個候選多變量判別式中選出用作多變量判別式的候選多變量判別式,來製作多變量判別式。由此,發揮可製作最適合胃癌狀態評價的多變量判別式(具體來說,是與胃癌(早期胃癌)的狀態(病態進展)具有顯著相關的多變量判別式(更具體來說,是對於胃癌和非胃癌的2組判別有用的多變量判別式、對於胃癌病期的判別有用的多變量判別式、對於胃癌有否向其它器官轉移的2組判別有用的多變量判別式))的效果。
[0170]根據本發明所述的記錄介質,通過計算機讀取並實行記錄在該記錄介質上的胃癌評價程序,在計算機上實行胃癌評價程序,因此,發揮可獲得與胃癌評價程序同樣的效果的效果。
[0171]本發明中,在評價胃癌的狀態時(具體來說,在判別胃癌或非胃癌時、判別胃癌的病期時、判別胃癌有否向其它器官轉移時等),除胺基酸的濃度以外,可以進一步使用其它的代謝物(生物代謝物)的濃度或蛋白質的表達量、被驗者的年齡和性別、生物指標等。另夕卜,本發明中,在評價胃癌的狀態時(具體來說,判別胃癌或非胃癌時、判別胃癌的病期、判別胃癌有否向其它器官轉移時等),作為多變量判別式中的變數,除胺基酸的濃度之外,還可以進一步使用其它的代謝物(生物代謝物)的濃度或蛋白質的表達量、被驗者的年齡和性別、生物指標等。

【專利附圖】

【附圖說明】
[0172]圖1是表示本發明的基本原理的原理構成圖。
[0173]圖2是表示實施方案I所述的胃癌的評價方法的一個例子的流程圖。
[0174]圖3是表示本發明的基本原理的原理構成圖。
[0175]圖4是表示本系統的全體構成的一個例子的圖。
[0176]圖5是表示本系統的全體構成的又一個例子的圖。
[0177]圖6是表示本系統的胃癌評價裝置100的構成的一個例子的框圖。
[0178]圖7是表示保存在利用者信息文件106a中的信息的一個例子的圖。
[0179]圖8是表示保存在胺基酸濃度數據文件106b中的信息的一個例子的圖。
[0180]圖9是表示保存在胃癌狀態信息文件106c中的信息的一個例子的圖。
[0181]圖10是表示保存在指定胃癌狀態信息文件106d中的信息的一個例子的圖。
[0182]圖11是表示保存在候選多變量判別式文件106el中的信息的一個例子的圖。
[0183]圖12是表示保存在驗證結果文件106e2中的信息的一個例子的圖。
[0184]圖13是表示保存在選擇胃癌狀態信息文件106e3中的信息的一個例子的圖。
[0185]圖14是表示保存在多變量判別式文件106e4中的信息的一個例子的圖。
[0186]圖15是表示保存在判別值文件106f中的信息的一個例子的圖。
[0187]圖16是表示保存在評價結果文件106g中的信息的一個例子的圖。
[0188]圖17是表示多變量判別式製作部102h的構成的框圖。
[0189]圖18是表示判別值基準評價部102j的構成的框圖。
[0190]圖19是表示本系統的客戶端裝置200的構成的一個例子的框圖。
[0191]圖20是表示本系統的資料庫裝置400的構成的一個例子的框圖。
[0192]圖21是表示在本系統中進行的胃癌評價服務處理的一個例子的流程圖。
[0193]圖22是表示在本系統的胃癌評價裝置100中進行的多變量判別式製作處理的一個例子的流程圖。
[0194]圖23是表示非胃癌與胃癌的2組間的胺基酸變數的分布的箱線圖。
[0195]圖24是表示胺基酸變數的ROC曲線的AUC的圖。
[0196]圖25是表示用於評價2組間的診斷性能的ROC曲線的圖。
[0197]圖26是表示與指標式I具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0198]圖27是表示與指標式I具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0199]圖28是表示與指標式I具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0200]圖29是表示與指標式I具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0201]圖30是表示用於評價2組間的診斷性能的ROC曲線的圖。
[0202]圖31是表示與指標式2具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0203]圖32是表示與指標式2具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0204]圖33是表示與指標式2具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0205]圖34是表示與指標式2具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0206]圖35是表示用於評價2組間的診斷性能ROC曲線的圖。
[0207]圖36是表示與指標式3具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0208]圖37是表示與指標式3具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0209]圖38是表示與指標式3具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0210]圖39是表示與指標式3具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0211]圖40是表不胃癌的病理病期和指標式4的值的標圖。
[0212]圖41是表示與指標式4具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0213]圖42是表示與指標式4具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0214]圖43是表示與指標式4具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0215]圖44是表示與指標式4具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0216]圖45是表不胃癌的病理病期和指標式5的值的標圖。
[0217]圖46是表示與指標式5具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0218]圖47是表示與指標式5具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0219]圖48是表示與指標式5具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0220]圖49是表示與指標式5具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0221]圖50是表示用於評價2組間的診斷性能的ROC曲線的圖。
[0222]圖51是表示與指標式6具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0223]圖52是表示與指標式6具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0224]圖53是表示與指標式6具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0225]圖54是表示與指標式6具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0226]圖55是表示用於評價2組間的診斷性能的ROC曲線的圖。
[0227]圖56是表示與指標式7具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0228]圖57是表示與指標式7具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0229]圖58是表示與指標式7具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0230]圖59是表示與指標式7具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0231]圖60是表示用於評價2組間的診斷性能的ROC曲線的圖。
[0232]圖61是表示與指標式8具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0233]圖62是表示與指標式8具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0234]圖63是表示與指標式8具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0235]圖64是表示與指標式8具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0236]圖65是表示根據ROC曲線的AUC提取的胺基酸的一覽圖。
[0237]圖66是表示胃癌患者和非胃癌患者的胺基酸變數的分布的圖。
[0238]圖67是表示胺基酸變數的ROC曲線的AUC的圖。
[0239]圖68是表示用於評價2組間的診斷性能的ROC曲線的圖。
[0240]圖69是表示與指標式9具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0241]圖70是表示與指標式9具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0242]圖71是表示用於評價2組間的診斷性能的ROC曲線的圖。
[0243]圖72是表示與指標式10具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0244]圖73是表示與指標式10具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0245]圖74是表示用於評價2組間的診斷性能的ROC曲線的圖。
[0246]圖75是表示與指標式11具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0247]圖76是表示與指標式11具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0248]圖77是表示根據ROC曲線的AUC提取的胺基酸的一覽圖。
[0249]圖78是表示胃癌患者和非胃癌患者的胺基酸變數的分布的圖。
[0250]圖79是表示胺基酸變數的ROC曲線的AUC的圖。
[0251]圖80是表示與指標式12具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0252]圖81是表示與指標式12具有同等的診斷性能的式的一覽圖。圖82是表示與指標式12具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0253]圖83是表示與指標式12具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0254]圖84是表示用於評價2組間的診斷性能的ROC曲線的圖。
[0255]圖85是表示與指標式13具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0256]圖86是表示與指標式13具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0257]圖87是表示與指標式13具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0258]圖88是表示與指標式13具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0259]圖89是表示用於評價2組間的診斷性能的ROC曲線的圖。
[0260]圖90是表示與指標式14具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0261]圖91是表示與指標式14具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0262]圖92是表示與指標式14具有同等的診斷性能的式的一覽圖。
[0263]圖93是表示用於評價2組間的診斷性能的ROC曲線的圖。
[0264]圖94是表示根據ROC曲線的AUC提取的胺基酸的一覽圖。
[0265]符號說明
[0266]100胃癌評價裝置
[0267]102控制部
[0268]102a要求解釋部
[0269]102b閱覽處理部
[0270]102c認證處理部
[0271]102d電子郵件生成部
[0272]102e網頁生成部
[0273]102f 接收部
[0274]102g胃癌狀態信息指定部
[0275]102h多變量判別式製作部
[0276]102hl候選多變量判別式製作部
[0277]102h2候選多變量判別式驗證部
[0278]102h3變數選擇部
[0279]102?判別值計算部
[0280]102j判別值基準評價部
[0281]102jl判別值基準判別部
[0282]102k結果輸出部
[0283]102m 發送部
[0284]104通信接口部
[0285]106存儲部
[0286]106a利用者信息文件
[0287]106b胺基酸濃度數據文件
[0288]106c胃癌狀態信息文件
[0289]106d指定胃癌狀態信息文件
[0290]106e多變量判別式關聯信息資料庫
[0291]106el候選多變量判別式文件
[0292]106e2驗證結果文件
[0293]106e3選擇胃癌狀態信息文件
[0294]106e4多變量判別式文件
[0295]106f判別值文件
[0296]106g評價結果文件
[0297]108輸入輸出接口部
[0298]112輸入裝置
[0299]114輸出裝置
[0300]200客戶端裝置(信息通信終端裝置)
[0301]300 網絡
[0302]400資料庫裝置

【具體實施方式】
[0303]以下,根據附圖,對本發明所述的胃癌的評價方法的實施方案(實施方案I)以及本發明所述的胃癌評價裝置、胃癌評價方法、胃癌評價系統、胃癌評價程序和記錄介質的實施方案(實施方案2)進行詳細說明。本發明並不受本實施方案限定。
[0304][實施方案I]
[0305][1-1.本發明的概要]
[0306]這裡,參照圖1,對本發明所述的胃癌的評價方法的概要進行說明。圖1是表示本發明的基本原理的原理構成圖。
[0307]首先,本發明中,針對從評價對象(例如,動物或人等個體)採集到的血液測定關於胺基酸濃度值的胺基酸濃度數據(步驟S-11)。這裡,血液中胺基酸濃度的分析如下進行。將採血得到的血樣採集到經肝素處理的管中,將採集到的血樣通過離心從血液中分離血漿。全部的血漿樣品在_70°C下冷凍保存至胺基酸濃度測定之前。在胺基酸濃度測定時,添加硫代水楊酸調節為3%濃度,由此進行除蛋白處理,測定使用胺基酸分析儀,該胺基酸分析儀是以採用了柱後茚三酮反應的高效液相色譜(HPLC)為原理。胺基酸濃度的單位可以是例如摩爾濃度或重量濃度、對這些濃度加減乘除任意的常數而得到的。
[0308]接著,本發明中,根據在步驟S-1l測定的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸的濃度值,對於評價對象評價其胃癌的狀態(步驟S-12)。
[0309]以上,根據本發明,針對從評價對象採集到的血液測定關於胺基酸濃度值的胺基酸濃度數據,根據測定的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸的濃度值,對於評價對象評價胃癌的狀態。由此,利用血液中的胺基酸濃度中與胃癌狀態相關的胺基酸的濃度,可高精度地評價胃癌的狀態。
[0310]這裡,在實行步驟S-12之前,可以從步驟S-1l中測定的評價對象的胺基酸濃度數據中除去缺失值或偏離值等數據。由此,可進一步高精度地評價胃癌的狀態。
[0311]步驟S-12中,根據在步驟S-1l中測定的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸的濃度值,對於評價對象,可以判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期(具體來說是la、lb、I1、Ilia、Illb、IV)、或者判別胃癌有否向其它器官(具體來說是淋巴結或腹膜或肝臟等)轉移。具體來說,可通過對 Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸的濃度值和預先設定的閥值進行比較,對於評價對象判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移。由此,利用血液中的胺基酸濃度中對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別有用的胺基酸的濃度,可高精度地進行這些的判別。
[0312]步驟S-12中,根據在步驟S-1l中測定的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸的濃度值以及以胺基酸的濃度為變數、含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為變數的預先設定的多變量判別式,計算該多變量判別式的值即判別值,可根據計算的判別值,對於評價對象評價胃癌的狀態。由此,利用由與胃癌的狀態具有顯著相關的多變量判別式得到判別值,可高精度地評價胃癌的狀態。
[0313]步驟S-12中,可以根據在步驟S-1l中測定的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸的濃度值以及以胺基酸的濃度為變數、含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為變數的預先設定的多變量判別式,計算該多變量判別式的值即判別值,可根據計算的判別值,對於評價對象判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移。具體來說,可通過對判別值和預先設定的閥值進行比較,對於評價對象判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移。由此,利用由多變量判別式得到的判別值,可高精度地進行這些的判別,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別有用。
[0314]多變量判別式可以以I個分數式或多個分數式之和表示,構成該判別式的分數式的分子和 / 或分母中可含有 Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為變數。具體來說,在步驟S-12中判別是胃癌或非胃癌時,多變量判別式可以是數式1、數式2或數式3,在步驟S-12中判別胃癌病期時,多變量判別式可以是數式4,在步驟S-12中判別胃癌有否向其它器官轉移時,多變量判別式可以是數式5。由此,利用由多變量判別式得到的判別值,可進一步高精度地進行這些的判另O,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。這些多變量判別式可以按照本本 申請人:的國際申請即國際公開第2004/052191號小冊子中所述的方法、或本 申請人:的國際申請即國際公開第2006/098192號小冊子中所述的方法(後述的實施方案2中所述的多變量判別式製作處理)製作。如果是由這些方法得到的多變量判別式,則不管作為輸入數據的胺基酸濃度數據中的胺基酸濃度的單位,該多變量判別式均可適用於胃癌狀態的評價。
[0315]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0316]...(數式 I)
[0317]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0318]...(數式 2)
[0319]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0320]...(數式 3)
[0321]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0322]...(數式 4)
[0323]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0324]...(數式 5)
[0325](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0326]這裡,分數式是指:該分數式的分子由胺基酸A、B、C等的之和表示,且該分數式的分母由胺基酸a、b、c等的之和表示。分數式也包含上述構成的分數式α、β、Y等的之和(例如,α + β等)。分數式也包含分割的分數式(divided fract1nal express1n)。分子或分母中使用的胺基酸可以分別具有適當的係數。分子或分母中使用的胺基酸可以重複。各分數式可以具有適當的係數。另外,各變數的係數的值或常數項的值只要是實數即可。分數式中,將分子的變數和分母的變數互換的組合中,與目標變數相關的正負符號均顛倒,但它們仍保持相關性,因此,在判別性中視為同等,因此,分數式也包含將分子的變數與分母的變數互換的組合。
[0327]多變量判別式還可以是邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式等的任意一種。具體來說,多變量判別式可以是以Orn、Gln、Trp、Cit為變數的邏輯回歸式,或以Orn、Gln、Trp、Phe、Cit、Tyr為變數的線性判別式,或以Glu、Phe、His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Glu、Pro、His、Trp為變數的線性判別式,或以Val、lie、His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Thr、lie、His、Trp為變數的線性判別式。由此,利用由多變量判別式得到的判別值,可進一步高精度地進行這些的判別,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。這些多變量判別式可按照本 申請人:的國際申請即國際公開第2006/098192號小冊子中所述的方法(後述的實施方案2中所述的多變量判別式製作處理)製作。如果是由該方法得到的多變量判別式,則不管作為輸入數據的胺基酸濃度數據中的胺基酸濃度的單位,該多變量判別式均可適用於胃癌狀態的評價。
[0328]這裡,多變量判別式是指通常在多變量分析中使用的式的形式,包含例如多重回歸式、多重邏輯回歸式、線性判別函數、馬氏距離、典型判別函數、支持向量機、決策樹等。還包含由不同形式的多變量判別式之和表示的式。多重回歸式、多重邏輯回歸式、典型判別函數中,各變數可以附加係數和常數項,此時的係數和常數項優選為實數,更優選為了由數據進行判別而得到的係數和常數項的99%可靠區間的範圍的值,進一步優選為了由數據進行判別而得到的係數和常數項的95%可靠區間的範圍的值。各係數的值及其可靠區間可以是將其實數倍所得的值,常數項的值及其可靠區間可以是對其加減乘除任意的實常數所得的值。
[0329]本發明在評價胃癌的狀態時(具體來說是判別是胃癌或非胃癌時、判別胃癌的病期時、判別胃癌有否向其它器官轉移時等),除胺基酸的濃度之外,可以進一步使用其它的代謝物(生物代謝物)的濃度或蛋白質的表達量、被驗者的年齡和性別、生物指標等。本發明在評價胃癌的狀態時(具體來說是在判別是胃癌或非胃癌時、判別胃癌的病期時、判別胃癌有否向其它器官轉移時等),作為多變量判別式中的變數,除胺基酸的濃度之外,還可以進一步使用其它代謝物(生物代謝物)的濃度或蛋白質的表達量、被驗者的年齡和性別、生物指標等。
[0330][1-2.實施方案I的胃癌的評價方法]
[0331]這裡,參照圖2對實施方案I所述的胃癌的評價方法進行說明。圖2是表示實施方案I所述的胃癌的評價方法的一個例子的流程圖。
[0332]首先,針對從動物或人等的個體採集的血液測定關於胺基酸的濃度值的胺基酸濃度數據(步驟SA-11)。胺基酸的濃度值的測定按照上述方法進行。
[0333]接著,從在步驟SA-1l中測定的個體的胺基酸濃度數據中除去缺失值或偏離值等的數據(步驟SA-12)。
[0334]接著,對步驟SA-12中除去了缺失值或偏離值等數據的個體的胺基酸濃度數據中所含的 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸的濃度值和預先設定的閥值進行比較,對於個體判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移,或者,根據步驟SA-12中除去了缺失值或偏離值等的數據的個體的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸的濃度值以及含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr 中的至少一種胺基酸作為變數的預先設定的多變量判別式,計算判別值,通過對計算的判別值和預先設定的閥值進行比較,對於個體判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移(步驟 SA-13)。
[0335][1-3.實施方案I的總結、以及其它實施方案]
[0336]如以上的詳細說明,根據實施方案I所述的胃癌的評價方法,(I)針對從個體採集到的血液測定胺基酸濃度數據,(2)從測定的個體的胺基酸濃度數據中除去缺失值或偏離值等的數據,(3)通過對除去了缺失值或偏離值等數據的個體的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr>Tyr 中的至少一種胺基酸的濃度值和預先設定的閥值進行比較,對於個體判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移,或者,根據除去了缺失值或偏離值等的數據的個體的胺基酸濃度數據中所含的 Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr中的至少一種胺基酸的濃度值以及含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為變數的預先設定的多變量判別式,計算判別值,通過對計算的判別值和預先設定的閥值進行比較,對於個體判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移。由此,利用血液中的胺基酸濃度中對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別有用的胺基酸的濃度、或利用由對這些判別有用的多變量判別式得到的判別值,可高精度地進行這些的判別。
[0337]步驟SA-13中,多變量判別式可以以I個分數式或多個分數式之和表示,構成該判別式的分數式的分子和/或分母中可含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys>Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為變數。具體來說,步驟SA-13中判別是胃癌或非胃癌時,多變量判別式可以是數式1、數式2或數式3,步驟SA-13中判別胃癌的病期時,多變量判別式可以是數式4,步驟SA-13中判別胃癌有否向其它器官轉移時,多變量判別式可以是數式5。由此,利用由多變量判別式得到的判別值,可進一步高精度地進行這些的判別,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。這些多變量判別式可按照本 申請人:的國際申請即國際公開第2004/052191號小冊子中所述的方法、或本 申請人:的國際申請即國際公開第2006/098192號小冊子中所述的方法(後述的實施方案2中所述的多變量判別式製作處理)製作。如果是由這些方法得到的多變量判別式,則不管作為輸入數據的胺基酸濃度數據中的胺基酸濃度的單位,該多變量判別式均可適用於胃癌狀態的評價。
[0338]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0339]…(數式I)
[0340]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0341]…(數式2)
[0342]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0343]...(數式 3)
[0344]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0345]...(數式 4)
[0346]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg) /His+c5
[0347]...(數式 5)
[0348](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0349]步驟SA-13中,多變量判別式可以是邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式等的任意一種。具體來說,多變量判別式是以Orn、Gln、Trp、Cit為變數的邏輯回歸式,或以Orn, Gin、Trp、Phe, CU、Tyr為變數的線性判別式,或以Glu, Phe, His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Glu、Pro、His、Trp為變數的線性判別式,或以Val、lie、His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Thr、lie、His、Trp為變數的線性判別式。由此,利用由多變量判別式得到的判別值,可進一步高精度地進行這些的判別,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。這些多變量判別式可按照本 申請人:的國際申請即國際公開第2006/098192號小冊子中所述的方法(後述的實施方案2中所述的多變量判別式製作處理)製作。如果是由該方法得到的多變量判別式,則不管作為輸入數據的胺基酸濃度數據中胺基酸濃度的單位,該多變量判別式均可適用於胃癌狀態的評價。
[0350][實施方案2]
[0351][2-1.本發明的概要]
[0352]這裡,參照圖3對本發明所述的胃癌評價裝置、胃癌評價方法、胃癌評價系統、胃癌評價程序和記錄介質的概要進行說明。圖3是表示本發明的基本原理的原理構成圖。
[0353]首先,本發明是在控制部,根據以胺基酸的濃度為變數、含有Asn、Cys、His、Met、Orn> Phe> Trp、Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸作為變數、在存儲部存儲的多變量判別式以及預先取得的與胺基酸濃度值相關的評價對象(例如,動物或人等個體)的胺基酸濃度數據中所含的Asn、Cys、His、Met、Orn> Phe> Trp、Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr, Tyr中的至少一種胺基酸的濃度值,計算該多變量判別式的值即判別值(步驟 S-21)。
[0354]接著,本發明是在控制部,根據在步驟S-21中計算的判別值,對於評價對象評價胃癌的狀態(步驟S-22)。
[0355]以上,根據本發明,根據以胺基酸的濃度為變數、含有Asn、CyS、HiS、Met、Orn、Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr中的至少一種胺基酸作為變數、在存儲部存儲的多變量判別式以及預先取得的與胺基酸濃度值相關的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe> Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸的濃度值,計算該多變量判別式的值即判別值,根據計算的判別值,對於評價對象評價胃癌的狀態。由此,利用由與胃癌的狀態具有顯著相關的多變量判別式得到的判別值,可高精度地評價胃癌的狀態。
[0356]步驟S-22中,可以根據在步驟S-21中計算的判別值,對於評價對象判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移。具體來說,通過對判別值和預先設定的閥值進行比較,可以對於評價對象判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移。由此,利用由多變量判別式得到的判別值,可高精度地進行這些的判別,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別有用。
[0357]多變量判別式可以以I個分數式或多個分數式之和表示,構成該判別式的分數式的分子和 / 或分母中可含有 Asn、Cys、His、Met、Orn> Phe> Trp、Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr, Tyr中的至少一種胺基酸作為變數。具體來說,在步驟S-22中判別是胃癌或非胃癌時,多變量判別式可以是數式1、數式2或數式3,在步驟S-22中判別胃癌的病期時,多變量判別式可以是數式4,在步驟S-22中判別胃癌有否向其它器官轉移時,多變量判別式可以是數式5。由此,利用由多變量判別式得到的判別值,可進一步高精度地進行這些的判別,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。這些多變量判別式可按照本 申請人:的國際申請即國際公開第2004/052191號小冊子中所述的方法、或本 申請人:的國際申請即國際公開第2006/098192號小冊子中所述的方法(後述的多變量判別式製作處理)製作。如果是由這些方法得到的多變量判別式,則不管作為輸入數據的胺基酸濃度數據中的胺基酸濃度的單位,該多變量判別式均可適用於胃癌狀態的評價。
[0358]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0359]…(數式I)
[0360]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0361]...(數式 2)
[0362]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0363]…(數式3)
[0364]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0365]...(數式 4)
[0366]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0367]…(數式5)
[0368](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0369]這裡,分數式是指:該分數式的分子由胺基酸A、B、C等的之和表示,且該分數式的分母由胺基酸a、b、c等的之和表示。分數式也包含上述構成的分數式α、β、Y等的之和(例如,α+β等)。分數式也包含分割的分數式。分子或分母中使用的胺基酸可以分別具有適當的係數。分子或分母中使用的胺基酸可以重複。各分數式可以具有適當的係數。另夕卜,各變數的係數的值或常數項的值只要是實數即可。分數式中,將分子的變數和分母的變數互換的組合中,與目標變數相關的正負符號均顛倒,但它們仍保持相關性,因此,在判別性中視為同等,因此,分數式也包含將分子的變數與分母的變數互換的組合。
[0370]多變量判別式可以是邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式等的任意一種。具體來說,多變量判別式可以是以Orn、Gin、Trp、Cit為變數的邏輯回歸式,或以Orn、Gin、Trp、Phe, CU、Tyr為變數的線性判別式,或以Glu、Phe、His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Glu、Pro、His、Trp為變數的線性判別式,或以Val、lie、His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Thr、Ile、HiS、Trp為變數的線性判別式。由此,利用由多變量判別式得到的判別值,可進一步高精度地進行這些的判別,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別特別有用。這些多變量判別式可按照本 申請人:的國際申請即國際公開第2006/098192號小冊子所述的方法(後述的多變量判別式製作處理)製作。如果是由該方法得到的多變量判別式,則不管作為輸入數據的胺基酸濃度數據中的胺基酸濃度的單位,該多變量判別式均可適用於胃癌狀態的評價。
[0371]這裡,多變量判別式是指通常在多變量分析中使用的式的形式,包含例如多重回歸式、多重邏輯回歸式、線性判別函數、馬氏距離、典型判別函數、支持向量機、決策樹等。也包含由不同形式的多變量判別式之和表示的式。多重回歸式、多重邏輯回歸式、典型判別函數中,各變數可以附加係數和常數項,此時的係數和常數項優選為實數,更優選為了由數據進行判別而得到的係數和常數項的99%可靠區間的範圍的值,進一步優選為了由數據進行判別而得到的係數和常數項的95%可靠區間的範圍的值。各係數的值及其可靠區間可以是其的實數倍的值,常數項的值及其可靠區間可以是對其加減乘除任意的實常數而得到的值。
[0372]本發明在評價胃癌的狀態時(具體來說,是判別是胃癌或非胃癌時、判別胃癌的病期時、判別胃癌有否向其它器官轉移時等),除胺基酸的濃度以外,可以進一步使用其它的代謝物(生物代謝物)的濃度或蛋白質的表達量、被驗者的年齡和性別、生物指標等。本發明在評價胃癌的狀態時(具體來說,是判別是胃癌或非胃癌時、判別胃癌的病期時、判別胃癌有否向其它器官轉移時等),作為多變量判別式中的變數,除胺基酸的濃度以外,還可以進一步使用其它的代謝物(生物代謝物)的濃度或蛋白質的表達量、被驗者的年齡和性別、生物指標等。
[0373]這裡,對多變量判別式製作處理(步驟I?步驟4)的概要進行詳細說明。
[0374]首先,本發明是在控制部,根據規定的公式製作方法,由含有胺基酸濃度數據和與表示胃癌的狀態的指標相關的胃癌狀態指標數據、在存儲部存儲的胃癌狀態信息製作多變量判別式的候選即候選多變量判別式(例如、y = alXl+a2x2+-+anxn,y:胃癌狀態指標數據,x1:胺基酸濃度數據,a1:常數,i = l,2,…,η)(步驟I)。可以事先從胃癌狀態信息中除去具有缺失值或偏離值等的數據。
[0375]步驟I中,可以結合使用多個不同的公式製作方法(包括與主成分分析或判別分析、支持向量機、多重回歸分析、邏輯回歸分析、k-means法、聚類分析、決策樹等的多變量分析相關的方法),由胃癌狀態信息製作多個候選多變量判別式。具體來說,可以利用多種不同的算法,對於胃癌狀態信息,同時並行地製作多個群的候選多變量判別式,其中,所述胃癌狀態信息是由通過分析從許多的健康人和胃癌患者獲取的血液而得到的胺基酸濃度數據和胃癌狀態指標數據構成的多變量數據。例如,可以利用不同的算法,同時進行判別分析和邏輯回歸分析,製作兩種不同的候選多變量判別式。還可以利用進行主成分分析來製作的候選多變量判別式,變換胃癌狀態信息,對變換的胃癌狀態信息進行判別分析,從而製作候選多變量判別式。由此,最終可以製作符合診斷條件的適當的變量判別式。
[0376]這裡,使用主成分分析製作的候選多變量判別式是含有使全部的胺基酸濃度數據的離散為最大的各胺基酸變數的一次式。使用判別分析製作的候選多變量判別式是含有使各群內的離散之和相對於全部胺基酸濃度數據的離散的比為最小的各胺基酸變數的高次式(包括指數或對數)。另外,使用支持向量機製作的候選多變量判別式是含有使群間的分界為最大的各胺基酸變數的高次式(包括核函數)。使用多重回歸分析製作的候選多變量判別式是含有使自全部胺基酸濃度數據的距離之和為最小的各胺基酸變數的高次式。使用邏輯回歸分析製作的候選多變量判別式是含有使似然率為最大的各胺基酸變數、項中具有以一次式作為指數的自然對數的分數式。k-means法是探索k個各胺基酸濃度數據聚類(近傍),在聚類點(近傍點)所屬的群中,將最多的數據定義為該數據的所屬群,選擇使輸入的胺基酸濃度數據所屬的群與定義的群最一致的胺基酸變數的方法。聚類分析是將全部胺基酸濃度數據中位於最近距離的點之間進行聚類(群化)的方法。決策樹是給胺基酸變數排序,由序列上位的胺基酸變數可取得的圖案來預測胺基酸濃度數據的群的方法。
[0377]返回多變量判別式製作處理的說明,本發明是在控制部,根據規定的驗證方法,驗證(相互驗證)步驟I中製作的候選多變量判別式(步驟2)。候選多變量判別式的驗證是對步驟I中製作的各候選多變量判別式進行。
[0378]步驟2中,可以根據自舉(bootstrap)法或保持(holdout)法、留一(leave-one-out)法等中的至少一種,驗證候選多變量判別式的判別率或靈敏度、特異性、信息量基準等中的至少一種。由此,可以製作考慮了胃癌狀態信息或診斷條件的、預測性或可靠性高的候選多變量判別式。
[0379]這裡,判別率是在全部輸入數據中本發明所評價的胃癌的狀態正確的比例。靈敏度是在輸入數據所記載的胃癌的狀態為患病的數據中本發明所評價的胃癌的狀態正確的比例。特異性是在輸入數據所記載的胃癌的狀態為正常的數據中本發明所評價的胃癌的狀態正確的比例。信息量基準是將步驟I中製作的候選多變量判別式的胺基酸變數的數目、和本發明所評價的胃癌的狀態以及輸入數據所記載的胃癌的狀態的差異加在一起所得。預測性是反覆進行候選多變量判別式的驗證得到的判別率或靈敏度、特異性的平均。可靠性是反覆進行候選多變量判別式的驗證得到的判別率或靈敏度、特異性的離散。
[0380]返回多變量判別式製作處理的說明,本發明是在控制部,根據規定的變數選擇方法,從步驟2的驗證結果中選擇候選多變量判別式的變數,來選擇在製作候選多變量判別式時使用的上述胃癌狀態信息中所含的胺基酸濃度數據的組合(步驟3)。胺基酸變數的選擇是對步驟I中製作的各候選多變量判別式進行。由此,可以適當選擇候選多變量判別式的胺基酸變數。使用包含步驟3中選擇的胺基酸濃度數據的胃癌狀態信息,再次運行步驟
1
[0381]步驟3中,可以根據逐步法、最優路徑法(best path method)、聚類探索法(近傍探索法,local search method)、遺傳算法中的至少一種,從步驟2的驗證結果中選擇候選多變量判別式的胺基酸變數。
[0382]這裡,最優路徑法是將候選多變量判別式中所含的胺基酸變數一個個依次減少,使候選多變量判別式帶來的評價指標最優化,由此選擇胺基酸變數的方法。
[0383]回到多變量判別式製作處理的說明中,本發明是在控制部,根據反覆運行上述的步驟1、步驟2和步驟3而累積的驗證結果,從多個候選多變量判別式中選出用作多變量判別式的候選多變量判別式,由此製作多變量判別式(步驟4)。候選多變量判別式的選出,例如有從按照相同的公式製作方法製作的候選多變量判別式中選出最佳的情況,也有從所有的候選多變量判別式中選出最佳的情況。
[0384]如上述說明,在多變量判別式製作處理中,根據胃癌狀態信息,通過一系列的流程使與候選多變量判別式的製作、候選多變量判別式的驗證和候選多變量判別式的變數的選擇相關的處理體系化(系統化)並運行,由此可以製作最適合胃癌狀態評價的多變量判別式。
[0385][2-2.系統構成]
[0386]這裡,參照圖4?圖20對實施方案2所述的胃癌評價系統(以下可以稱為本系統)的構成進行說明。本系統只是一個舉例,本發明並不限於此。
[0387]首先,參照圖4和圖5對本系統的全體構成進行說明。圖4是表示本系統的全體構成的一個例子的圖。圖5是表不本系統的全體構成的又一例子的圖。本系統如圖4所不,是經由網絡300以可通信的方式將對於評價對象評價胃癌的狀態的胃癌評價裝置100和提供評價對象的關於胺基酸濃度值的胺基酸濃度數據的客戶端裝置200(相當於本發明的信息通信終端裝置)連接在一起而構成。
[0388]本系統如圖5所示,除胃癌評價裝置100或客戶端裝置200之外,還可以將保存了在胃癌評價裝置100中製作多變量判別式時使用的胃癌狀態信息或用於評價胃癌狀態的多變量判別式等的資料庫裝置400經由網絡300以可通信的方式連接在一起而構成。由此,經由網絡300可以自胃癌評價裝置100向客戶端裝置200或資料庫裝置400、或者自客戶端裝置200或資料庫裝置400向胃癌評價裝置100提供與胃癌狀態相關的信息等。這裡,與胃癌狀態相關的信息是對與包括人的生物的胃癌狀態相關的特定項目進行測定所得的值的相關信息。與胃癌狀態相關的信息是在胃癌評價裝置100或客戶端裝置200或其它裝置(例如,各種計測裝置等)中生成,主要積累在資料庫裝置400中。
[0389]接著,參照圖6?圖18對於本系統的胃癌評價裝置100的構成進行說明。圖6是表示本系統的胃癌評價裝置100的構成的一個例子的框圖,只概念性表示了該構成中與本發明有關的部分。
[0390]胃癌評價裝置100由下述部分構成:綜合地控制該胃癌評價裝置100的CPU (中央處理裝置,Central Processing Unit)等的控制部102 ;經由路由器等的通信裝置和專用線等的有線或無線的通信線路,將該胃癌評價裝置與網絡300以可通信的方式連接在一起的通信接口部104 ;保存各種資料庫或表格或文件等的存儲部106 ;與輸入裝置112或輸出裝置114連接的輸入輸出接口部108,這些部分可以經由任意的通信線路以可通信的方式連接。這裡,胃癌評價裝置100可以與各種的分析裝置(例如,胺基酸分析儀等)在同一框體中構成。胃癌評價裝置100的分散/綜合的具體的形態並不限於圖示,可以將其全部或部分以對應各種負荷等的任意單元進行功能性或物理性地分散/綜合來構成。例如,可以使用CGI (公共網關接口,Common Gateway Interface)實現處理的一部分。
[0391]存儲部106是存儲裝置,可以使用例如RAM和ROM等的存儲裝置、硬碟等的固定盤裝置、軟盤、光碟等。存儲部106中記錄電腦程式,該電腦程式與OS(作業系統,Operating System)協同,對CPU發出指令,進行各種處理。存儲部106如圖所示,保存利用者信息文件106a、胺基酸濃度數據文件106b、胃癌狀態信息文件106c、指定胃癌狀態信息文件106d、多變量判別式關聯信息資料庫106e、判別值文件106f和評價結果文件106g。
[0392]利用者信息文件106a中保存與利用者相關的利用者信息。圖7是表示保存在利用者信息文件106a中的信息的一個例子的圖。保存在利用者信息文件106a中的信息如圖7所示,由用於專門識別利用者的利用者ID、用於認證利用者是否為正當的利用者的利用者密碼、利用者姓名、用於專門識別利用者的所屬機構的所屬機構ID、用於專門識別利用者的所屬機構的部門的部門ID、部門名稱和利用者的電子郵件地址相互關聯地構成。
[0393]返回圖6,胺基酸濃度數據文件106b保存關於胺基酸濃度值的胺基酸濃度數據。圖8是表示保存在胺基酸濃度數據文件106b中的信息的一個例子的圖。保存在胺基酸濃度數據文件106b中的信息如圖8所示,由用於專門識別評價對象個體(樣品)的個體編號和胺基酸濃度數據相互關聯地構成。這裡,圖8中,將胺基酸濃度數據作為數值即連續尺度應用,但胺基酸濃度數據也可以是名義尺度或順序尺度。為名義尺度或順序尺度時,可通過對各狀態賦予任意的數值進行分析。胺基酸濃度數據中還可以組合其它的生物信息(性別差異、年齡、有無吸菸、數位化的心電圖的波形、酶濃度、基因表達量、胃蛋白酶原的值、有否幽門螺桿菌感染、胺基酸以外的代謝產物的濃度等)。
[0394]返回圖6,胃癌狀態信息文件106c中保存製作多變量判別式時使用的胃癌狀態信息。圖9是表示保存在胃癌狀態信息文件106c中的信息的一個例子的圖。保存在胃癌狀態信息文件106c中的信息如圖9所示,由個體編號、與表示胃癌狀態的指標(指標T1、指標T2、指標IV..)相關的胃癌狀態指標數據(T)和胺基酸濃度數據相互關聯地構成。這裡,圖9中,胃癌狀態指標數據和胺基酸濃度數據以數值(即連續尺度)的形式應用,胃癌狀態指標數據和胺基酸濃度數據也可以是名義尺度或順序尺度。為名義尺度或順序尺度時,可通過對各狀態賦予任意的數值進行分析。胃癌狀態指標數據是作為胃癌狀態的標誌物的已知的單一的狀態指標,可以使用數值數據。
[0395]返回圖6,指定胃癌狀態信息文件106d中保存在後述的胃癌狀態信息指定部102g中指定的胃癌狀態信息。圖10是表示保存在指定胃癌狀態信息文件106d中的信息的一個例子。保存在指定胃癌狀態信息文件106d中的信息如圖10所示,由個體編號、指定的胃癌狀態指標數據和指定的胺基酸濃度數據相互關聯地構成。
[0396]返回圖6,多變量判別式關聯信息資料庫106e由以下文件構成:保存在後述的候選多變量判別式製作部102hl中製作的候選多變量判別式的候選多變量判別式文件106el、保存後述的候選多變量判別式驗證部102h2中的驗證結果的驗證結果文件106e2、保存包括在後述的變數選擇部102h3中選擇的胺基酸濃度數據的組合的胃癌狀態信息的選擇胃癌狀態信息文件106e3、保存在後述的多變量判別式製作部102h中製作的多變量判別式的多變量判別式文件106e4。
[0397]候選多變量判別式文件106el中保存在後述的候選多變量判別式製作部102hl中製作的候選多變量判別式。圖11是表示保存在候選多變量判別式文件106el中的信息的一個例子的圖。保存在候選多變量判別式文件106el中的信息如圖11所示,由順序(rank)和候選多變量判別式(圖 11 中的 FjGly』Leu』Phe,…)或 F2 (Gly,Leu,Phe,...)、F3(Gly,Leu, Phe,...)等)相互關聯地構成。
[0398]返回圖6,驗證結果文件106e2中保存後述的候選多變量判別式驗證部102h2中的驗證結果。圖12是表示保存在驗證結果文件106e2中的信息的一個例子的圖。保存在驗證結果文件106e2中的信息如圖12所示,由順序、候選多變量判別式(圖12中的Fk(Gly,Leu, Phe,…)或 Fm(Gly, Leu, Phe,…)、F1 (Gly, Leu, Phe,…)等)和各候選多變量判別式的驗證結果(例如,各候選多變量判別式的評價值)相互關聯地構成。
[0399]返回圖6,選擇胃癌狀態信息文件106e3中保存胃癌狀態信息,該胃癌狀態信息包括與在後述的變數選擇部102h3中選擇的變數對應的胺基酸濃度數據的組合。圖13是表示保存在選擇胃癌狀態信息文件106e3中的信息的一個例子的圖。保存在選擇胃癌狀態信息文件106e3中的信息如圖13所示,由個體編號、在後述的胃癌狀態信息指定部102g中指定的胃癌狀態指標數據和在後述的變數選擇部102h3中選擇的胺基酸濃度數據相互關聯地構成。
[0400]返回圖6,多變量判別式文件106e4中保存在後述的多變量判別式製作部102h中製作的多變量判別式。圖14是表示保存在多變量判別式文件106e4中的信息的一個例子的圖。保存在多變量判別式文件106e4中的信息如圖14所示,由順序、多變量判別式(圖14 中的 Fp (Phe,…)或 Fp (Gly, Leu, Phe)、Fk(Gly, Leu, Phe,…)等)、與各公式製作方法對應的閥值和各多變量判別式的驗證結果(例如,各多變量判別式的評價值)相互關聯地構成。
[0401]返回圖6,判別值文件106f中保存在後述的判別值計算部102i計算的判別值。圖15是表示保存在判別值文件106f中的信息的一個例子的圖。保存在判別值文件106f中的信息如圖15所示,由用於專門識別評價對象個體(樣品)的個體編號、順序(用於專門識別多變量判別式的編號)和判別值相互關聯地構成。
[0402]返回圖6,評價結果文件106g保存在後述的判別值基準評價部102 j中得到的評價結果(具體來說,在後述的判別值基準判別部102jl中得到的判別結果)。圖16是表示保存在評價結果文件106g中的信息的一個例子的圖。保存在評價結果文件106g中的信息由用於專門識別評價對象個體(樣品)的個體編號、預先取得的評價對象的胺基酸濃度數據、由多變量判別式計算的判別值和關於胃癌狀態的評價結果(具體來說,是關於是胃癌還是非胃癌的判別結果、關於胃癌的病期的判別結果、關於胃癌有否向其它器官轉移的判別結果等)相互關聯地構成。
[0403]返回圖6,在存儲部106中,除上述信息之外,作為其它信息,還記錄有用於將網站提供給客戶端裝置200的各種網站數據、CGI程序等。網站數據有用於表示後述的各種網頁的數據等,這些數據以例如用HTML或XML記述的文本文件的形式形成。用於製作網站數據的部件用的文件(部品用O 7 r O)或操作用的文件(作業用Θ 7 r O)或其它臨時性的文件等也存儲於存儲部106中。在存儲部106中,根據需要可以將發送給客戶端裝置200的聲音以如WAVE形式或AIFF形式的聲音文件保存、或者將靜止圖像或動態圖像以如JPEG形式或MPEG2形式的圖像文件保存。
[0404]通信接口部104連通胃癌評價裝置100和網絡300 (或路由器等的通信裝置)之間的通信。即,通信接口部104具有經由通信線路與其它終端進行數據通信的功能。
[0405]輸入輸出接口部108與輸入裝置112或輸出裝置114連接。這裡,輸出裝置114除了使用監視器(包括家庭用電視)之外,也可以使用擴音器或印表機(以下可以將輸出裝置114稱為監視器114)。輸入裝置112除了使用鍵盤或滑鼠或麥克風之外,還可以使用與滑鼠協同、實現指點器(pointing device)功能的監視器。
[0406]控制部102具有用於保存OS(作業系統)等的控制程序、規定各種處理順序等的程序和所需要的數據等的內存,根據這些程序運行各種信息處理。控制部102如圖所示,大致具備要求解釋部102a、閱覽處理部102b、認證處理部102c、電子郵件生成部102d、網頁生成部102e、接收部102f、胃癌狀態信息指定部102g、多變量判別式製作部102h、判別值計算部1021、判別值基準評價部102j、結果輸出部102k和發送部102m。控制部102對於由資料庫裝置400發送的胃癌狀態信息或由客戶端裝置200發送的胺基酸濃度數據進行有缺失值的數據的除去、偏離值多的數據的除去、除去有缺失值的數據的很多變數等的數據處理。
[0407]要求解釋部102a是解釋來自客戶端裝置200或資料庫裝置400的要求內容,根據該解釋結果,將處理交付控制部102的各部。閱覽處理部102b接受來自客戶端裝置200的各種畫面的閱覽要求,進行這些畫面的網站數據的生成或發送。認證處理部102c接受來自客戶端裝置200或資料庫裝置400的認證要求,進行認證判斷。電子郵件生成部102d生成包含各種信息的電子郵件。網頁生成部102e生成利用者可在客戶端裝置200閱覽的網頁。
[0408]接收部102f經由網絡300,接收由客戶端裝置200或資料庫裝置400發送的信息(具體來說,胺基酸濃度數據或胃癌狀態信息、多變量判別式等)。胃癌狀態信息指定部102g在製作多變量判別式時,指定作為對象的胃癌狀態指標數據和胺基酸濃度數據。
[0409]多變量判別式製作部102h根據在接收部102f中接收的胃癌狀態信息、或在胃癌狀態信息指定部102g中指定的胃癌狀態信息製作多變量判別式。具體來說,多變量判別式製作部102h是根據反覆運行候選多變量判別式製作部102hl、候選多變量判別式驗證部102h2和變數選擇部102h3而累積的驗證結果,根據胃癌狀態信息,從多個候選多變量判別式中選出用作多變量判別式的候選多變量判別式,來製作多變量判別式。
[0410]多變量判別式預先保存在存儲部106的規定的存儲區域時,多變量判別式製作部102h可以通過從存儲部106中選擇所需要的多變量判別式來製作多變量判別式。多變量判別式製作部102h通過從預先保存了多變量判別式的其它的計算機裝置(例如,資料庫裝置400)中選擇所需要的多變量判別式並下載,可以製作多變量判別式。
[0411]這裡,參照圖17對多變量判別式製作部102h的構成進行說明。圖17是表示多變量判別式製作部102h的構成的框圖,該構成中只概念性地表示了與本發明有關的部分。多變量判別式製作部102h進一步具備候選多變量判別式製作部102hl、候選多變量判別式驗證部102h2和變數選擇部102h3。候選多變量判別式製作部102hl是根據規定的公式製作方法由胃癌狀態信息製作多變量判別式的候選即候選多變量判別式。候選多變量判別式製作部102hl可以將多個不同的公式製作方法結合使用,由胃癌狀態信息製作多個候選多變量判別式。候選多變量判別式驗證部102h2根據規定的驗證方法,驗證在候選多變量判別式製作部102hl中製作的候選多變量判別式。候選多變量判別式驗證部102h2還可以根據自舉法、保持法、留一法中的至少一種,對於候選多變量判別式的判別率、靈敏度、特異性、信息量基準中的至少一種進行驗證。變數選擇部102h3根據規定的變數選擇方法,從候選多變量判別式驗證部102h2的驗證結果中選擇候選多變量判別式的變數,來選擇在製作候選多變量判別式時使用的胃癌狀態信息中所含的胺基酸濃度數據的組合。變數選擇部102h3還可根據逐步法、最優路徑法、聚類探索法、遺傳算法中的至少一種,從驗證結果中選擇候選多變量判別式的變數。
[0412]返回圖6,判別值計算部102i根據在多變量判別式製作部102h中製作的含有Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸作為變數的多變量判別式以及在接收部102f中接收的評價對象的胺基酸濃度數據中所含的 Asn、Cys> His、Met、Orn> Phe、Trp> Pro、Lys> Leu、Glu、Arg、Ala、Thr> Tyr 中的至少一種胺基酸的濃度值,計算該多變量判別式的值即判別值。
[0413]這裡,多變量判別式可以以I個分數式或多個分數式之和表示,構成該判別式的分數式的分子和 / 或分母中含有 Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為變數。具體來說,在判別是胃癌或非胃癌時,多變量判別式可以是數式1、數式2或數式3 ;在判別胃癌的病期時,多變量判別式可以是數式4 ;在判別胃癌有否向其它器官轉移時,多變量判別式可以是數式5。
[0414]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0415]...(數式 I)
[0416]a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0417]...(數式 2)
[0418]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0419]...(數式 3)
[0420]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0421]...(數式 4)
[0422]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0423]...(數式 5)
[0424](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0425]多變量判別式還可以為邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式等的任意一種。具體來說,多變量判別式可以是以Orn、Gin、Trp、Cit為變數的邏輯回歸式;或以Orn、Gin、Trp、Phe、CU、Tyr為變數的線性判別式;或以Glu、Phe、His、Trp為變數的邏輯回歸式;或以Glu、Pro、His、Trp為變數的線性判別式;或以Val、lie、His、Trp為變數的邏輯回歸式;或以Thr、lie、His、Trp為變數的線性判別式。
[0426]判別值基準評價部102j根據在判別值計算部102i計算的判別值,對於評價對象評價胃癌的狀態。判別值基準評價部102j進一步具備判別值基準判別部102jl。這裡,參照圖18對判別值基準評價部102 j的構成進行說明。圖18是表示判別值基準評價部102 j的構成的框圖,只概念性地表示了該構成中與本發明有關的部分。判別值基準判別部102jl根據判別值,對評價對象判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移。具體來說,判別值基準判別部102jl通過對判別值和預先設定的閥值進行比較,對於評價對象判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移。
[0427]返回圖6,結果輸出部102k將控制部102的各處理部得到的處理結果(包括在判別值基準評價部102j得到的評價結果(具體來說是在判別值基準判別部102jl得到的判別結果))等輸出到輸出裝置114中。
[0428]發送部102m對評價對象的胺基酸濃度數據的發送源頭的客戶端裝置200發送評價結果,或對資料庫裝置400發送在胃癌評價裝置100製作的多變量判別式或評價結果。
[0429]接著,參照圖19對本系統的客戶端裝置200的構成進行說明。圖19是表示本系統的客戶端裝置200的構成的一個例子的框圖,只概念性地表示該構成中與本發明有關的部分。
[0430]客戶端裝置200由控制部210、R0M220、HD230、RAM240、輸入裝置250、輸出裝置260、輸入輸出IF270和通信IF280構成,這些各部經由任意的通信線路以可通信的方式連接。
[0431]控制部210具備網頁瀏覽器211、電子郵箱212、接收部213、發送部214。網頁瀏覽器211進行解釋網站數據、將解釋的網站數據顯示在後述的監視器261上的瀏覽處理。可以在網頁瀏覽器211中插入具備進行影像流的接收、顯示、反饋等的功能的流式播放器等的各種軟體。電子郵箱212按照規定的通信協議(例如,SMTP (簡單郵件傳輸協議)或POP3 (郵局協議的第3個版本)等)進行電子郵件的發送接收。接收部213經由通信IF280,接收由胃癌評價裝置100發送的評價結果等的各種信息。發送部214經由通信IF280,將評價對象的胺基酸濃度數據等的各種信息發送至胃癌評價裝置100。
[0432]輸入裝置250是鍵盤或滑鼠或麥克風等。後述的監視器261也與滑鼠協同,實現指點器功能。輸出裝置260是將經由通信IF280接收的信息進行輸出的輸出裝置,包含監視器(包括家庭用電視機)261和印表機262。除此之外還可以在輸出裝置260中設置擴音器等。輸入輸出IF270與輸入裝置250或輸出裝置260連接。
[0433]通信IF280將客戶端裝置200與網絡300 (或路由器等的通信裝置)以可通信的方式連接。換言之,客戶端裝置200經由數據機或TA或路由器等的通信裝置以及電話線路,或者經由專用線,與網絡300連接。由此,客戶端裝置200按照規定的通信協議與胃癌評價裝置100連通(access)。
[0434]這裡,通過在根據需要連接了印表機、監視器、圖像掃描儀等的外圍裝置的信息處理裝置(例如,已知的個人計算機、工作站、家庭用遊戲裝置、網際網路TV、PHS終端、便攜終端、移動通信終端、PDA等的信息處理終端等)上安裝可實現網站數據的瀏覽功能或電子郵件功能的軟體(程序、數據等),也可以實現客戶端裝置200。
[0435]客戶端裝置200的控制部210中,通過CPU和由該CPU解釋並運行的程序,也可實現在控制部210進行的處理的全部或任意的一部分。R0M220或HD230中記錄與OS (作業系統)協同、對CPU發出指令、用於進行各種處理的電腦程式。該電腦程式通過裝載在RAM240中來運行,與CPU協同,構成控制部210。該電腦程式可以記錄在經由任意的網絡與客戶端裝置200連接的應用程式伺服器中,客戶端裝置200可以根據需要下載其全部或部分。還可通過布線邏輯等的硬體實現在控制部210進行的處理的全部或任意的一部分。
[0436]接著,參照圖4、圖5對本系統的網絡300進行說明。網絡300具有以可通信的方式將胃癌評價裝置100和客戶端裝置200和資料庫裝置400相互連接在一起的功能,例如網際網路或內聯網或LAN(包括有線/無線兩者)等。網絡300可以是VAN、個人計算機通信網、公眾電話網(包括模擬/數字兩者)、專用線路網(包括模擬/數字兩者)、CATV網、便攜線路交換網或便攜網絡包交換網(包括MT2000方式、GSM方式或roc/roc-p方式等)、無線呼出網、Bluetooth (藍牙)(註冊商標)等的局域無線網、PHS網或衛星通信網(包括CS、BS 或 ISDB 等)等。
[0437]接著,參照圖20對本系統的資料庫裝置400的構成進行說明。圖20是表示本系統的資料庫裝置400的構成的一個例子的框圖,只概念性地表示了該構成中與本發明有關的部分。
[0438]資料庫裝置400具有保存在胃癌評價裝置100或該資料庫裝置400製作多變量判別式時使用的胃癌狀態信息、在胃癌評價裝置100製作的多變量判別式、胃癌評價裝置100的評價結果等的功能。如圖20所示,資料庫裝置400由綜合控制該資料庫裝置400的CPU等的控制部402、經由路由器等的通信裝置以及專用線等的有線或無線通信線路將該資料庫裝置與網絡300以可通信的方式連接的通信接口部404、保存各種資料庫或表格或文件(例如,網頁用文件)等的存儲部406、和與輸入裝置412或輸出裝置414連接的輸入輸出接口部408構成,這些部分經由任意的通信線路以可通信的方式連接。
[0439]存儲部406是存儲裝置,可使用例如RAM、ROM等的存儲裝置、硬碟等的固定盤裝置、軟盤或光碟等。存儲部406中保存各種處理中所使用的各種程序等。通信接口部404連通資料庫裝置400與網絡300 (或路由器等的通信裝置)之間的通信。S卩,通信接口部404具有經由通信線路與其它終端進行數據通信的功能。輸入輸出接口部408與輸入裝置412或輸出裝置414連接。這裡,輸出裝置414除使用監視器(包括家庭用電視機)之外,還可以使用擴音器或印表機(以下,有時將輸出裝置414記為監視器414)。輸入裝置412除鍵盤或滑鼠或麥克風之外,還可以使用與滑鼠協同、實現指點器功能的監視器。
[0440]控制部402具有用於保存OS(作業系統)等的控制程序、對各種處理順序等進行規定的程序、所需數據等的內存,根據這些程序運行各種信息處理。控制部402如圖所示,大體具備要求解釋部402a、閱覽處理部402b、認證處理部402c、電子郵件生成部402d、網頁生成部402e和發送部402f。
[0441]要求解釋部402a解釋來自胃癌評價裝置100的要求內容,根據該解釋結果,將處理交付控制部402的各部。閱覽處理部402b接受來自胃癌評價裝置100的各種畫面的閱覽要求,進行這些畫面的網站數據的生成或發送。認證處理部402c接受來自胃癌評價裝置100的認證要求,進行認證判斷。電子郵件生成部402d生成包含各種信息的電子郵件。網頁生成部402e生成利用者通過客戶端裝置200閱覽的網頁。發送部402f將胃癌狀態信息或多變量判別式等的各種信息發送給胃癌評價裝置100。
[0442][2-3.本系統的處理]
[0443]這裡,參照圖21對由如上構成的本系統進行的胃癌評價服務處理的一個例子進行說明。圖21是表示胃癌評價服務處理的一個例子的流程圖。
[0444]本處理中使用的胺基酸濃度數據是關於對預先由個體採血得到的血液進行分析得到的胺基酸的濃度值。這裡,對血液的胺基酸的分析方法進行簡單說明。首先,將採血得到的血樣採集到肝素處理的管中,然後對該管進行離心,分離血漿。分離的全部的血漿樣品在-70°C下冷凍保存至胺基酸濃度測定之前。測定胺基酸濃度時,在血漿樣品中添加硫代水楊酸調節為3%濃度,由此進行除蛋白處理。胺基酸濃度的測定採用胺基酸分析儀,該胺基酸分析儀以使用柱後茚三酮反應的高效液相色譜(HPLC)為原理。
[0445]首先,在顯示了網頁瀏覽器211的畫面上,利用者經由輸入裝置250來指定胃癌評價裝置100所提供的網站的地址(URL等),客戶端裝置200與胃癌評價裝置100連通。具體來說,利用者指示客戶端裝置200的網頁瀏覽器211的畫面更新,則網頁瀏覽器211通過規定的通信協議,將胃癌評價裝置100所提供的網站的地址發送給胃癌評價裝置100,通過基於該地址的路由,對胃癌評價裝置100提出發送與胺基酸濃度數據發送畫面對應的網頁的要求。
[0446]接著,胃癌評價裝置100在要求解釋部102a接受來自客戶端裝置200的發送,分析該發送的內容,根據分析結果將處理轉移至控制部102的各部。具體來說,發送的內容是要求發送與胺基酸濃度數據發送畫面對應的網頁時,胃癌評價裝置100主要是在閱覽處理部102b取得保存在存儲部106的規定的存儲區、用於顯示該網頁的網站數據,將取得的網站數據發送給客戶端裝置200。更具體地說,利用者要求發送與胺基酸濃度數據發送畫面對應的網頁時,胃癌評價裝置100首先在控制部102要求利用者輸入利用者ID或利用者密碼。輸入利用者ID或密碼後,胃癌評價裝置100在認證處理部102c對輸入的利用者ID或密碼、和保存在利用者信息文件106a中的利用者ID或利用者密碼進行認證判斷。只在可以認證時,胃癌評價裝置100在閱覽處理部102b將用於顯示與胺基酸濃度數據發送畫面對應的網頁的網站數據發送至客戶端裝置200。客戶端裝置200的特定是通過在來自客戶端裝置200的發送要求的同時發送的IP位址進行。
[0447]接著,客戶端裝置200在接收部213接收由胃癌評價裝置100發送的網站數據(用於顯示與胺基酸濃度數據發送畫面對應的網頁),在網頁瀏覽器211解釋所接收的網站數據,將胺基酸濃度數據發送畫面顯示在監視器261上。
[0448]接著,利用者經由輸入裝置250,對於顯示在監視器261上的胺基酸濃度數據發送畫面進行個體的胺基酸濃度數據等的輸入、選擇,則客戶端裝置200在發送部214將用於特定輸入信息或選擇事項的標識符發送至胃癌評價裝置100,由此將評價對象個體的胺基酸濃度數據發送至胃癌評價裝置100(步驟SA-21)。步驟SA-21中的胺基酸濃度數據的發送可通過FTP等的現有的文件傳輸技術等來實現。
[0449]接著,胃癌評價裝置100在要求解釋部102a解釋由客戶端裝置200發送的標識符,由此解釋客戶端裝置200的要求內容,將胃癌評價用(具體來說,是胃癌和非胃癌的2組判別用、胃癌病期的判別用、胃癌有否向其它器官轉移的2組判別用等)的多變量判別式的發送要求發送至資料庫裝置400。
[0450]接著,資料庫裝置400在要求解釋部402a解釋來自胃癌評價裝置100的發送要求,將保存在存儲部406的規定的存儲區域的、含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為變數的多變量判別式(例如,更新的最新的多變量判別式)發送至胃癌評價裝置100 (步驟SA-22)。
[0451]這裡,步驟SA-22中,發送至胃癌評價裝置100的多變量判別式可以以I個分數式或多個分數式之和表示,構成該判別式的上述分數式的分子和/或分母中含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr 中的至少一種胺基酸作為變數。具體來說,在步驟SA-26中判別是胃癌或非胃癌時,發送到胃癌評價裝置100的多變量判別式可以是數式1、數式2或數式3 ;在步驟SA-26中判別胃癌的病期時,多變量判別式可以是數式4;在步驟SA-26中判別胃癌有否向其它器官轉移時,多變量判別式可以是數式5。
[0452]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0453]…(數式I)
[0454]Sl2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0455]...(數式 2)
[0456]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0457]…(數式3)
[0458]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0459]...(數式 4)
[0460]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0461]…(數式5)
[0462](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0463]步驟SA-22中,發送至胃癌評價裝置100的多變量判別式可以是邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式等的任意一種。具體來說,發送至胃癌評價裝置100的多變量判別式可以是以Orn、Gin、Trp、Cit為變數的邏輯回歸式,或以Orn、Gin、Trp、Phe、Cit、Tyr為變數的線性判別式,或以Glu、Phe、His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Glu、Pro、His、Trp為變數的線性判別式,或以Val、Ile、His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Thr、Ile、His、Trp為變數的線性判別式。
[0464]接著,胃癌評價裝置100在接收部102f接收由客戶端裝置200發送的個體的胺基酸濃度數據和由資料庫裝置400發送的多變量判別式,將接收的胺基酸濃度數據保存在胺基酸濃度數據文件106b的規定的存儲區域,同時將接收的多變量判別式保存在多變量判別式文件106e4的規定的存儲區域(步驟SA-23)。
[0465]接著,胃癌評價裝置100在控制部102,從在步驟SA-23接收的個體的胺基酸濃度數據中除去缺失值或偏離值等的數據(步驟SA-24)。
[0466]接著,胃癌評價裝置100在判別值計算部102i,根據在步驟SA-24中除去了缺失值或偏離值等數據的個體的胺基酸濃度數據以及在步驟SA-23接收的多變量判別式,計算判別值(步驟SA-25)。
[0467]接著,胃癌評價裝置100在判別值基準判別部102jl對在步驟SA-25計算的判別值和預先設定的閥值進行比較,對於個體判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移,將該判別結果保存在評價結果文件106g的規定的存儲區域(步驟 SA-26)。
[0468]接著,胃癌評價裝置100在發送部102m將在步驟SA-26得到的判別結果(關於是胃癌或還是非胃癌的判別結果、關於胃癌的病期的判別結果、關於胃癌有否向其它器官轉移的判別結果)發送至胺基酸濃度數據的發送源頭的客戶端裝置200和資料庫裝置400 (步驟SA-27)。具體來說,首先,胃癌評價裝置100在網頁生成部102e製作用於顯示判別結果的網頁,將與製作的網頁對應的網站數據保存在存儲部106的規定的存儲區域。接著,利用者經由輸入裝置250,向客戶端裝置200的網頁瀏覽器211輸入規定的URL,通過了上述的認證後,客戶端裝置200將該網頁的閱覽要求發送給胃癌評價裝置100。接著,胃癌評價裝置100在閱覽處理部102b解釋由客戶端裝置200發送的閱覽要求,由存儲部106的規定的存儲區域讀取與用於表示判別結果的網頁對應的網站數據。然後,胃癌評價裝置100在發送部102m將讀取的網站數據發送至客戶端裝置200,同時將該網站數據或判別結果發送至資料庫裝置400。
[0469]這裡,在步驟SA-27中,胃癌評價裝置100可以在控制部102通過電子郵件將判別結果通知利用者的客戶端裝置200。具體來說,首先,胃癌評價裝置100在電子郵件生成部102d,基於利用者ID等,按照發送時間,參照保存在利用者信息文件106a的利用者信息,取得利用者的電子郵件地址。接著,胃癌評價裝置100在電子郵件生成部102d,以獲得的電子郵件地址為發送地址,生成包含利用者的姓名和判別結果的電子郵件相關的數據。接著,胃癌評價裝置100在發送部102m將生成的該數據發送至利用者的客戶端裝置200。
[0470]步驟SA-27中,胃癌評價裝置100可以通過FTP等的已有的文件傳輸技術等,將判別結果發送至利用者的客戶端裝置200。
[0471]返回圖21的說明,資料庫裝置400在控制部402接收由胃癌評價裝置100發送的判別結果或網站數據,將接收的判別結果或網站數據保存(積累)在存儲部406的規定的存儲區域(步驟SA-28)。
[0472]客戶端裝置200在接收部213接收由胃癌評價裝置100發送的網站數據,在網頁瀏覽器211中解釋接收的網站數據,將記錄有個體的判別結果的網頁的畫面表示在監視器261上(步驟SA-29)。判別結果通過電子郵件由胃癌評價裝置100發送時,客戶端裝置200由於電子郵箱212的公知的功能,可以在任意的時間接收由胃癌評價裝置100發送的電子郵件,並將接收的電子郵件顯示在監視器261上。
[0473]以上,利用者通過閱覽在監視器261上顯示的網頁,可以確認關於胃癌和非胃癌的2組判別的個體的判別結果、或關於胃癌病期的判別的個體的判別結果、或關於胃癌有否向其它器官轉移的2組判別的個體的判別結果。利用者可以通過印表機262列印顯示在監視器261上的網頁的顯示內容。
[0474]判別結果通過電子郵件由胃癌評價裝置100發送時,利用者通過閱覽在監視器261上顯示的電子郵件,可以確認關於胃癌和非胃癌的2組判別的個體的判別結果、或關於胃癌病期的判別的個體的判別結果、或關於胃癌有否向其它器官轉移的2組判別的個體的判別結果。利用者可以通過印表機262列印顯示在監視器261上的電子郵件的顯示內容。
[0475]至此,胃癌評價服務處理的說明結束。
[0476][2-4.實施方案2的總結、以及其它的實施方案]
[0477]如上述詳細說明,根據胃癌評價系統,客戶端裝置200將個體的胺基酸濃度數據發送至胃癌評價裝置100,資料庫裝置400接受來自胃癌評價裝置100的要求,將胃癌評價用的多變量判別式(具體來說,是胃癌和非胃癌的2組判別用的多變量判別式、胃癌病期的判別用的多變量判別式、胃癌有否向其它器官轉移的2組判別用的多變量判別式等)發送至胃癌評價裝置100,胃癌評價裝置100接收來自客戶端裝置200的胺基酸濃度數據,同時接收來自資料庫裝置400的多變量判別式,根據接收的胺基酸濃度數據和多變量判別式計算判別值,通過對計算的判別值和預先設定的閥值進行比較,對個體判別是胃癌還是非胃癌、判別胃癌的病期、或判別胃癌有否向其它器官轉移,將該判別結果發送至客戶端裝置200或資料庫裝置400,客戶端裝置200接收由胃癌評價裝置100發送的判別結果並顯示,資料庫裝置400接收由胃癌評價裝置100發送的判別結果並保存。由此,利用由多變量判別式得到的判別值,可高精度地進行這些的2組判別,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別有用。
[0478]根據胃癌評價系統,多變量判別式可以以I個分數式或多個分數式之和表示,構成該判別式的分數式的分子和/或分母中含有Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe、Trp、Pro、Lys、Leu、Glu、Arg、Ala、Thr、Tyr中的至少一種胺基酸作為變數。具體來說,在判別是胃癌或非胃癌時,多變量判別式可以是數式1、數式2或數式3 ;在判別胃癌的病期時,多變量判別式可以是數式4 ;在判別胃癌有否向其它器官轉移時,多變量判別式可以是數式5。由此,利用由多變量判別式得到的判別值,可進一步高精度地進行這些的判別,其中,所述多變量判別式對胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別更為有用。這些多變量判別式可通過本 申請人:的國際申請即國際公開第2004/052191號小冊子中所述的方法或本 申請人:的國際申請即國際公開第2006/098192號小冊子中所述的方法(後述的多變量判別式製作處理)來製作。如果是由這些方法得到的多變量判別式,則不管作為輸入數據的胺基酸濃度數據中的胺基酸濃度的單位,該多變量判別式均可適用於胃癌狀態的評價。
[0479]H1X Orn/ (Trp+His)+Id1 X (ABA+Ile)/Leu+q
[0480]…(數式I)
[0481 ] a2 X Glu/Hi s+b2 X Ser/Trp+c2 X Arg/Pro+d2
[0482]...(數式 2)
[0483]a3 X Trp/Gln+b3 X Hi s/Glu+c3
[0484]...(數式 3)
[0485]a4XGly/ (Glu+Trp+Val) +b4X Arg/His+c4
[0486]...(數式 4)
[0487]a5X Ile/Glu+b5X (Gly+Asn+Arg)/His+c5
[0488]...(數式 5)
[0489](數式I中,a1、bi是不為零的任意的實數,C1是任意的實數;數式2中,a2、b2、C2是不為零的任意的實數,d2是任意的實數;數式3中,a3、b3是不為零的任意的實數,C3是任意的實數;數式4中,a4、b4是不為零的任意的實數,C4為任意的實數;數式5中,a5、b5是不為零的任意的實數,C5是任意的實數)。
[0490]根據胃癌評價系統,多變量判別式可以是邏輯回歸式、線性判別式、多重回歸式、由支持向量機製作的公式、由馬氏距離法製作的公式、由典型判別分析製作的公式、由決策樹製作的公式等的任意一種。具體來說,多變量判別式可以是以Orn、Gin、Trp、Cit為變數的邏輯回歸式,或以Orn、Gln、Trp、Phe、Cit、Tyr為變數的線性判別式,或以Glu、Phe、His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Glu、Pro、His、Trp為變數的線性判別式,或以Val、Ile、His、Trp為變數的邏輯回歸式,或以Thr、Ile、His、Trp為變數的線性判別式。由此,利用由多變量判別式得到的判別值,可進一步高精度地進行這些的判別,其中,所述多變量判別式對於胃癌和非胃癌的2組判別或胃癌病期的判別或胃癌有否向其它器官轉移的2組判別更為有用。這些多變量判別式可通過本 申請人:的國際申請即國際公開第2006/098192號小冊子中所述的方法(後述的多變量判別式製作處理)製作。
[0491]本發明所述的胃癌評價裝置、胃癌評價方法、胃癌評價系統、胃癌評價程序和記錄介質除了上述的實施方案2以外,在權利要求文件記載的技術思想的範圍內,可以以各種不同的實施方案實施。例如,在上述實施方案2中說明的各處理中,以自動進行的形式說明的處理的全部或一部分可以是手動進行,以手動進行的形式說明的處理的全部或一部分可以按照公知的方法自動進行。除此之外,除了特別說明的之外,上述文章中或附圖中表示的處理程序、控制程序、具體名稱、各種登錄數據以及包括檢索條件等的參數的信息、畫面例、資料庫構成均可任意變更。例如關於胃癌評價裝置100,圖示的各構成要素是功能概念性的,物理學上未必是如圖示的構成。另外,關於胃癌評價裝置100的各部或各裝置所具備的處理功能(特別是通過控制部102進行的各處理功能),可通過CPU (中央處理裝置)以及由該CPU解釋並運行的程序來實現其全部或任意的一部分,也可以以接線邏輯的硬體的形式實現。
[0492]這裡,「程序」是通過任意的語言或記述方法記述的數據處理方法,不管其原始碼或二進位代碼等的形式。「程序」並不限於單一構成,包含多個模塊或以庫的形式分散構成的程序、或與以OS(作業系統)為代表的個別程序協同來實現其功能的程序。程序記錄在記錄介質上,根據需要,可以機械讀取到胃癌評價裝置100中。關於在各裝置中讀取記錄在記錄介質上的程序的具體的構成或讀取程序或讀取後的安裝程序等,可以採用周知的構成或程序。
[0493]「記錄介質」包含任意的「可移動的物理介質」或任意的「固定的物理介質」或「通信介質」。「可移動的物理介質」是指軟盤、光磁碟、ROM、EPROM、EEPROM、CD-ROM、MO或DVD等。「固定的物理介質」是指內置於各種計算機系統的R0M、RAM或HD等。「通信介質」如經由LAN或WAN或網際網路等網絡發送程序時的通信線路或載波,是短期保有程序的介質。
[0494]最後,參照圖22對於在胃癌評價裝置100中進行的多變量判別式製作處理的一個例子進行詳細說明。圖22是表示多變量判別式製作處理的一個例子的流程圖。該多變量判別式製作處理可以在管理胃癌狀態信息的資料庫裝置400中進行。
[0495]本說明中,胃癌評價裝置100是將事先由資料庫裝置400取得的胃癌狀態信息保存在胃癌狀態信息文件106c的規定的存儲區域。胃癌評價裝置100是將事先在胃癌狀態信息指定部102g中指定的包含胃癌狀態指標數據和胺基酸濃度數據的胃癌狀態信息保存在指定胃癌狀態信息文件106d的規定的存儲區域。
[0496]首先,多變量判別式製作部102h是在候選多變量判別式製作部102hl中,根據規定的公式製作方法,由保存在指定胃癌狀態信息文件106d的規定的存儲區域的胃癌狀態信息製作候選多變量判別式,將製作的候選多變量判別式保存在候選多變量判別式文件106el的規定的存儲區域(步驟SB-21)。具體來說,首先,多變量判別式製作部102h是在候選多變量判別式製作部102hl中,從多個不同的公式製作方法(包含關於主成分分析或判別分析、支持向量機、多重回歸分析、邏輯回歸分析、k-means法、聚類分析、決策樹等的多變量分析的方法)中選擇所需的一種,根據所選擇的公式製作方法,確定製作的候選多變量判別式的形式(公式的形式)。接著,多變量判別式製作部102h是在候選多變量判別式製作部102hl,根據胃癌狀態信息,運行與所選擇的公式選擇方法對應的各種(例如,平均或分散等)的計算。接著,多變量判別式製作部102h是在候選多變量判別式製作部102hl中,確定計算結果和所確定的候選多變量判別式的參數。由此,根據所選擇的公式製作方法來製作候選多變量判別式。將多個不同的公式製作方法結合使用、同時並行(並列)地製作候選多變量判別式時,可以根據所選擇的公式製作方法,將上述處理並行運行。另外,將多個不同的公式製作方法結合使用、依次製作候選多變量判別式時,例如可以利用進行主成分分析製作的候選多變量判別式,變換胃癌狀態信息,對變換的胃癌狀態信息進行判別分析,由此製作候選多變量判別式。
[0497]接著,多變量判別式製作部102h是在候選多變量判別式驗證部102h2中,根據規定的驗證方法,對在步驟SB-21中製作的候選多變量判別式進行驗證(相互驗證),將驗證結果保存在驗證結果文件106e2的規定的存儲區域(步驟SB-22)。具體來說,多變量判別式製作部102h是在候選多變量判別式驗證部102h2中,根據保存在指定胃癌狀態信息文件106d的規定的存儲區域的胃癌狀態信息,製作驗證候選多變量判別式時使用的驗證用數據,根據製作的驗證用數據來驗證候選多變量判別式。在步驟SB-21中結合使用多個不同的公式製作方法來製作多個候選多變量判別式時,多變量判別式製作部102h是在候選多變量判別式驗證部102h2中,對於每種與各公式製作方法對應的候選多變量判別式,按照規定的驗證方法進行驗證。這裡,在步驟SB-22中,可以根據自舉法或保持法、留一法等中的至少一種,對候選多變量判別式的判別率或靈敏度、特異性、信息量基準等中的至少一種進行驗證。由此,可以選擇考慮了胃癌狀態信息或診斷條件的、預測性或可靠性高的候選指標式。
[0498]接著,多變量判別式製作部102h是在變數選擇部102h3中,根據規定的變數選擇方法,由步驟SB-22中的驗證結果選擇候選多變量判別式的變數,由此選擇在製作候選多變量判別式時使用的胃癌狀態信息中所含的胺基酸濃度數據的組合,將包含所選擇的胺基酸濃度數據的組合的胃癌狀態信息保存在選擇胃癌狀態信息文件106e3的規定的存儲區域(步驟SB-23)。在步驟SB-21中,結合使用多個不同的公式製作方法,製作多個候選多變量判別式,在步驟SB-22中,根據規定的驗證方法,對於每種與各公式製作方法對應的候選多變量判別式進行驗證時,在步驟SB-23中,多變量判別式製作部102h是在變數選擇部102h3中,對每種與步驟SB-22中的驗證結果對應的候選多變量判別式,根據規定的變數選擇方法選擇候選多變量判別式的變數。這裡,步驟SB-23中,可以根據逐步法、最優路徑法、聚類探索法、遺傳算法中的至少一種,由驗證結果選擇候選多變量判別式的變數。最優路徑法是將候選多變量判別式中所含的變數一個個依次減少,使候選多變量判別式所賦予的評價指標最佳化,由此選擇變數的方法。步驟SB-23中,多變量判別式製作部102h是在變數選擇部102h3中,可以根據保存在指定胃癌狀態信息文件106d的規定的存儲區域的胃癌狀態信息,選擇胺基酸濃度數據的組合。
[0499]接著,多變量判別式製作部102h判定保存在指定胃癌狀態信息文件106d的規定的存儲區域的胃癌狀態信息中所含的全部胺基酸濃度數據的組合是否結束,判定結果為「結束」時(步驟SB-24:Yes),進入下一步驟(步驟SB-25),判定結果為未「結束」時(步驟SB-24:No),返回步驟SB-21。多變量判別式製作部102h判定預先設定的次數是否結束,判定結果為「結束」時(步驟SB-24:Yes),進入下一步驟(步驟SB-25),判定結果為未「結束」時(步驟SB-24:No),可以返回步驟SB-21。多變量判別式製作部102h判定在步驟SB-23中選擇的胺基酸濃度數據的組合與保存在指定胃癌狀態信息文件106d的規定的存儲區域的胃癌狀態信息中所含的胺基酸濃度數據的組合或在上一步驟SB-23中選擇的胺基酸濃度數據的組合是否相同,判定結果為「相同」時(步驟SB-24:Yes),進入下一步驟(步驟SB-25),判定結果為不「相同」時(步驟SB-24:No),可以返回步驟SB-21。在具體來說驗證結果為關於各候選多變量判別式的評價值時,多變量判別式製作部102h可根據該評價值與各公式製作方法所對應的規定的閥值的比較結果,判定是進入步驟SB-25還是返回步驟SB-21。
[0500]接著,多變量判別式製作部102h根據驗證結果,從多個候選多變量判別式中選出用作多變量判別式的候選多變量判別式,由此確定多變量判別式,將確定的多變量判別式(選出的候選多變量判別式)保存在多變量判別式文件106e4的規定的存儲區域(步驟SB-25)。這裡,在步驟SB-25中,例如有從按照相同的公式製作方法製作的候選多變量判別式中選出最佳的情況,也有從全部的候選多變量判別式中選出最佳的情況。
[0501]至此,對多變量判別式製作處理的說明結束。
[0502]實施例1
[0503]通過上述的胺基酸分析法,針對確診為胃癌的胃癌患者組的血樣以及非胃癌組的血樣測定血液中胺基酸濃度。胺基酸濃度的單位是nmol/ml。與胃癌患者和非胃癌患者的胺基酸變數的分布相關的箱線圖(boxplot)如圖23所示。圖23中,橫軸表示非胃癌組(對照)和胃癌組,圖中的ABA和Cys分別表示α-ΑΒΑ(α-氨基丁酸)和半胱氨酸。為了進行胃癌組和非胃癌組的判別,實施了 2組間的t檢驗。
[0504]與非胃癌組相比,胃癌組中Thr> Ser> Pro> Gly> Ala> Cit> Cys> Val>Met> Ile、Leu、Tyr、Phe、0rn、Lys顯著增加(顯著性差異概率P〈0.05), ABA、His顯著減少(顯著性差異概率 Ρ〈0.05) ο 由此表明,胺基酸變數 Thr> Ser、Pro> Gly、Ala、Cit、Cys> Val、Met、lie、Leu、Tyr、Phe、Orn、Lys、ABA、His具有胃癌組和非胃癌組的2組間的判別能力。
[0505]並且,關於基於各胺基酸變數的胃癌組和非胃癌組的2組判別,利用ROC曲線(圖24)的曲線下面積(AUC)進行評價,關於胺基酸變數Ser、Asn、Pro、Cit、Cys、Met、Ile、Phe、His、Orn, AUC顯示出大於0.7的值。由此表明,胺基酸變數Ser、Asn、Cys、Pro、Cit、Met、Ile、Phe、His、0rn具有胃癌組和非胃癌組的2組間的判別能力。實施例2
[0506]使用實施例1中使用的樣品數據。採用本 申請人:的國際申請即國際公開第2004/052191號小冊子中所述的方法,關於胃癌判別,深入研究使胃癌組和非胃癌組的2組判別性能最大化的指標,在具有同等性能的多個指標中得到了指標式I。
[0507]指標式1:
[0508](Asn) / (ABA) + (Leu) / (His)
[0509]關於胃癌組和非胃癌組的2組判別,基於指標式I的胃癌的診斷性能通過ROC曲線(圖25)的AUC進行評價,得到0.972 ±0.011(95%可靠區間為0.951-0.994)。關於通過指標式I進行的胃癌組和非胃癌組的2組判別的閥值,以胃癌組的有症率為0.038,求出最佳的閥值時,閥值為4.51,並且得到靈敏度為93%,特異度為94%,陽性預測值為65%、陰性預測值為99%,診斷正確率為94%,由此表明指標式I的診斷性能高是有用的指標。除此之外還得到了多個與指標式I具有同等的判別性能的分數式。它們如圖26、圖27、圖28、圖29所示。
[0510]實施例3
[0511]使用實施例1中使用的樣品數據。關於胃癌,通過邏輯分析(BIC最小基準的變數覆蓋法(variable coverage method)),研究使胃癌組和非胃癌組的2組判別性能最大化的指標,以指標式2的形式得到由Asn、Orn、Phe、His構成的邏輯回歸式(胺基酸變數Asn、Orn,Phe,His 的數的係數和常數項依次為 0.291±0.051,0.088±0.028,0.116±0.025,-0? 299±0.067、-9.499±3.204)。
[0512]關於胃癌組和非胃癌組的2組判別,基於指標式2的胃癌的診斷性能通過ROC曲線(圖30)的AUC進行評價,得到0.997 ± 0.002 (95%可靠區間為0.993-1.00),由此表明指標式2的診斷性能高是有用的指標。關於通過指標式2進行的胃癌組和非胃癌組的2組判別的閥值,以胃癌組的有症率為0.038,求出最佳的閥值時,閥值為0.125,並且得到靈敏度為98%,特異度為99%,陽性預測值為92%,陰性預測值為99%,診斷正確率為99%,由此表明指標式2的診斷性能高是有用的指標。除此之外,還得到了多個與指標式2具有同等的判別性能的邏輯回歸式。它們如圖31、圖32、圖33、圖34所示。圖31、圖32、圖33、圖34所示的式中的各係數的值及其95%可靠區間可以是將其實數倍所得的值,常數項的值及其95%可靠區間可以是對其加減乘除任意的實常數所得的值。
[0513]實施例4
[0514]使用實施例1中使用的樣品數據。關於胃癌,通過線性判別分析(變數覆蓋法),研究使胃癌組和非胃癌組的2組判別性能最大化的指標,以指標式3的形式得到由Asn、Orn> Phe、His、Gin、Tyr構成的線性判別式(胺基酸變數Asn、Orn、Phe、His、Gin、Tyr的數的係數依次為 33.35±1.69,9.85±1.67,12.62±2.70,-15.80±2.48,-1.00±0.35,-9.02
+ 2.16)ο
[0515]關於胃癌組和非胃癌組的2組判別,基於指標式3的胃癌的診斷性能通過ROC曲線(圖35)的AUC進行評價,得到0.996 ±0.003 (95%可靠區間為0.991-1.00),由此表明指標式3的診斷性能高是有用的指標。關於通過指標式3進行的胃癌組和非胃癌組的2組判別的閥值,以胃癌組的有症率為0.038,求出最佳的閥值時,閥值為1177,並且得到靈敏度為98%,特異度為99%,陽性預測值為98%,陰性預測值為99%,診斷正確率為99%,由此表明指標式3的診斷性能高是有用的指標。除此之外,還得到了多個與指標式3具有同等的判別性能的線性判別式。它們如圖36、圖37、圖38、圖39所示。圖36、圖37、圖38、圖39所示的式中的各係數的值及其95%可靠區間可以是將其實數倍所得的值,常數項的值及其95%可靠區間可以是對其加減乘除任意的實常數後所得的值。
[0516]實施例5
[0517]使用實施例1中使用的樣品數據。關於胃癌,對胃癌的病理病期(la、lb、I1、Ilia、IIIb、IV)和壁浸潤程度、有無組織學的腹膜播種、有無組織學的肝轉移、有無組織學的淋巴結轉移的數據進行典型相關分析,使胃癌的病理病期數值化。通過多重回歸分析(BIC最小基準的變數覆蓋法),對所得的病理病期的數值數據研究與病期相關性最高的指標,以指標式4的形式得到含有His、Glu、Gly、Arg的線性判別式(胺基酸變數His、Glu、Gly、Arg的數的係數依次為-11.68±4.14、-3.91±3.25,1.00±0.66,3.22±2.39)。
[0518]此時,進行數值化的病理病期與指標式4的值之間的皮爾遜相關係數為0.542(95%可靠區間為0.400-0.659,p<0.001),由此表明指標式4的診斷性能高是有用的指標(圖40)。除此之外,還得到了多個與指標式4具有同等的判別性能的線性判別式。它們如圖41、圖42、圖43、圖44所示。圖41、圖42、圖43、圖44所示的式中的各係數的值及其95%可靠區間可以是將其實數倍所得的值,常數項的值及其95%可靠區間可以是對其加減乘除任意的實常數所得的值。
[0519]實施例6
[0520]使用實施例1中使用的樣品數據。採用本 申請人:的國際申請即國際公開第2004/052191號小冊子中所述的方法,關於胃癌,對與胃癌的病理病期(la、lb、I1、Ilia、I lib、IV)深入研究與病期的相關性最聞的指標,在具有同等性能的多個指標中得到了指標式5。
[0521]指標式5:
[0522](Gly) / (Glu+Trp+Val) + (A rg) / (His)
[0523]此時,病理病期與指標式5的值之間的斯皮爾曼等級相關係數為0.482(95%可靠區間為0.324-0.615,p〈0.001),由此表明指標式5的診斷性能高是有用的指標(圖45)。除此之外,還得到了多個與指標式5具有同等的判別性能的指標式。它們如圖46、圖47、圖48、圖49所示。
[0524]實施例7
[0525]採用本 申請人:的國際申請即國際公開第2004/052191號小冊子中所述的方法,關於胃癌,對於胃癌有否向淋巴結轉移,深入研究使2組判別性能最大化的指標,在具有同等性能的多個指標中得到了指標式6。
[0526]指標式6:
[0527](He) / (Glu) + (Gly+Asn+Arg) / (His)
[0528]關於轉移組和非轉移組的2組判別,基於指標式6的胃癌向淋巴結轉移的診斷性能通過ROC曲線(圖50)的AUC進行評價,得到0.760±0.044(95 %可靠區間為
0.673-0.847)。關於通過指標式6進行的胃癌組和非胃癌組的2組判別的閥值,以胃癌組的有症率為0.038,求出最佳的閥值時,閥值為7.706,並且得到靈敏度為69%,特異度為69%,陽性預測值為64%,陰性預測值為74%,診斷正確率為69%,由此表明指標式6的診斷性能高是有用的指標。除此之外,還得到了多個與指標式6具有同等的判別性能的分數式。它們如圖51、圖52、圖53、圖54所示。
[0529]實施例8
[0530]使用實施例1中使用的樣品數據。關於胃癌,通過邏輯分析(BIC最小基準的變數覆蓋法)研究使胃癌有否向淋巴結轉移的2組判別性能最大化的指標,以指標式7的形式得到了由His、Met、Tyr構成的邏輯回歸式(胺基酸變數His、Met、Tyr的數的係數和常數項依次為-0.067±0.009,0.161 ±0.002、-0.045±0.025,2.476±1.319)。
[0531]關於轉移組和非轉移組的2組判別,基於指標式7的胃癌的診斷性能通過ROC曲線(圖55)的AUC進行評價,得到0.729 ± 0.046 (95%可靠區間為0.631-0.819),由此表明指標式7的診斷性能高是有用的指標。關於通過指標式7進行的轉移組和非轉移組的2組判別的閥值,以轉移組的有症率為0.443,求出最佳的閥值時,閥值為0.468,並且得到靈敏度為59%、特異度為76%、陽性預測值為67%、陰性預測值為70%、診斷正確率為69%,由此表明指標式7的診斷性能高是有用的指標。除此之外,還得到了多個與指標式7具有同等的判別性能的線性判別式。它們如圖56、圖57、圖58、圖59所示。圖56、圖57、圖58、圖59所示的式中的各係數的值及其95%可靠區間可以是將其實數倍所得的值,常數項的值及其95%可靠區間可以是對其加減乘除任意的實常數所得的值。
[0532]實施例9
[0533]使用實施例1中使用的樣品數據。關於胃癌,通過線性判別分析(變數覆蓋法)研究使有否向淋巴結轉移的2組判別性能最大化的指標,以指標式8的形式得到了由His、Met、Tyr構成的線性判別式(胺基酸變數His、Met、Tyr的數的係數依次為-1.885±0.982、
3.680±1.821、-1.000±0.704)。
[0534]關於轉移組和非轉移組的2組判別,基於指標式8的胃癌的診斷性能通過ROC曲線(圖60)的AUC進行評價,得到0.731 ± 0.046 (95%可靠區間為0.642-0.821),由此表明指標式8的診斷性能高是有用的指標。關於通過指標式8進行的胃癌組和非胃癌組的2組判別的閥值,以轉移組的有症率為0.443,求出最佳的閥值時,閥值為-83.3,並且得到靈敏度為61 %、特異度為76%、陽性預測值為67%、陰性預測值為71 %、診斷正確率為70%,由此表明指標式8的診斷性能高是有用的指標。除此之外,還得到了多個與指標式8具有同等的判別性能的線性判別式。它們如圖61、圖62、圖63、圖64所示。圖61、圖62、圖63、圖64所示的式中的各係數的值及其95%可靠區間可以是將其實數倍所得的值,常數項的值及其95%可靠區間可以是對其加減乘除任意的實常數所得的值。
[0535]實施例10
[0536]通過變數覆蓋法,從全部公式中提取進行2組判別的線性判別式。此時,出現在各式中的胺基酸變數的最大值為4,計算滿足該條件的全部公式的ROC曲線下面積。此時,在ROC曲線下面積為某一閥值以上的式中測定出現各胺基酸的頻率,結果,在分別以ROC曲線下面積0.9,0.925,0.95,0.975作為閥值時,可確認Asn、Cys、His、Met、Orn、Phe為常以高頻率提取的胺基酸前10位以內,表明使用這些胺基酸作為變數的多變量判別式具有胃癌組和非胃癌組的2組間的判別能力(圖65)。
[0537]實施例11
[0538]通過上述的胺基酸分析法,針對通過胃活檢確診為胃癌的胃癌患者組的血樣和非胃癌患者組的血樣測定血液中胺基酸濃度。胃癌患者和非胃癌患者的胺基酸變數的分布如圖66所示。以胃癌組和非胃癌胃癌組的判別為目的,實施了 2組間的t檢驗。
[0539]與非胃癌組相比,胃癌組中Glu顯著增加,Asn、Val、Met、lie、Leu、Tyr、Phe、His、Trp、Lys、Arg 顯著減少。由此表明,胺基酸變數 Glu、Asn、Val、Met、lie、Leu、Tyr、Phe、His、Trp、Lys、Arg具有胃癌組和非胃癌組的2組間的判別能力。
[0540]並且,關於胃癌組和非胃癌組的2組判別,通過ROC曲線的AUC進行評價,對於胺基酸變數 Asn、Glu、Met、Leu、Phe、His、Trp、Lys、Arg,AUC 顯示出大於 0.75 的值(圖 67)。由此表明,胺基酸變數Asn、Glu、Met、Leu、Phe、His、Trp、Lys、Arg具有胃癌組和非胃癌組的2組間的判別能力。
[0541]實施例12
[0542]使用實施例11中使用的樣品數據。採用本 申請人:的國際申請即國際公開第2004/052191號小冊子中所述的方法,關於胃癌判別,深入研究使胃癌組和非胃癌組的2組判別性能最大化的指標,在具有同等性能的多個指標中得到了指標式9。
[0543]指標式9:
[0544]Glu/His+0.15XSer/Trp-0.38XArg/Pro
[0545]關於胃癌組和非胃癌組的2組判別,基於指標式9的胃癌的診斷性能通過ROC曲線(圖68)的AUC進行評價,得到0.997 + 0.003 (95%可靠區間為0.991-1)。關於通過指標式9進行的胃癌組和非胃癌組的2組判別的閥值,以胃癌組的有症率為0.16%,求出最佳的閥值時,閥值為0.585,得到靈敏度為96.67 %、特異度為100.0 %、陽性預測值為100.0%,陰性預測值為99.99%、診斷正確率為99.99% (圖68),由此表明指標式9的診斷性能高是有用的指標。除此之外,還得到了多個與指標式9具有同等的判別性能的多變量判別式。它們如圖69和圖70所示。圖69和圖70所示的式中的各係數的值可以是將其實數倍所得的值,或者附加任意的常數項所得的值。
[0546]實施例13
[0547]使用實施例11中使用的樣品數據。關於胃癌,通過邏輯分析(BIC最小基準的變數覆蓋法)研究使胃癌組和非胃癌組的2組判別性能最大化的指標,以指標式10的形式得到由Glu、Phe、His、Trp構成的邏輯回歸式(胺基酸變數Glu,Phe, His, Trp的數的係數和常數項依次為 0.1254±0.001、-0.0684±0.004、-0.1066±0.002、-0.1257±0.0027、12.9742±0.1855)。
[0548]關於胃癌組和非胃癌組的2組判別,基於指標式10的胃癌的診斷性能通過ROC曲線(圖71)的AUC進行評價,得到0.977 + 0.023 (95%可靠區間為0.932-1),由此表明指標式10的診斷性能高是有用的指標。關於通過指標式10進行的胃癌組和非胃癌組的2組判別的閥值,以胃癌組的有症率為0.16%,求出最佳的閥值時,閥值為0.536,並且得到靈敏度為96.7%、特異度為100%、陽性預測值為100%、陰性預測值為99.99%、診斷正確率為99.99% (圖71),由此表明指標式10的診斷性能高是有用的指標。除此之外,還得到了多個與指標式10具有同等的判別性能的邏輯回歸式。它們如圖72和圖73所示。圖72和圖73所示的式中的各係數的值可以是將其實數倍所得的值。
[0549]實施例14
[0550]使用實施例11中使用的樣品數據。關於胃癌,通過線性判別分析(變數覆蓋法)研究使胃癌組和非胃癌組的2組判別性能最大化的指標,以指標式11的形式得到由Glu、Pro、His、Trp構成的線性判別函數(胺基酸變數Glu、Pro、His、Trp的數的係數依次為1±0.2,0.2703±0.0085、-1.0845±0.0359、-1.4648±0.0464)。
[0551]關於胃癌組和非胃癌組的2組判別,基於指標式11的胃癌的診斷性能通過ROC曲線(圖74)的AUC進行評價,得到0.984 + 0.015 (95%可靠區間為0.955-1),由此表明指標式11的診斷性能高是有用的指標。關於通過指標式11進行的胃癌組和非胃癌組的2組判別的閥值,以胃癌組的有症率為0.16%,求出最佳的閥值時,閥值為-72.45,並且得到靈敏度為96.7%、特異度為98.3%、陽性預測值為8.50%、陰性預測值為99.99%、診斷正確率為98.33% (圖74),由此表明指標式11的診斷性能高是有用的指標。除此之外,還得到了多個與指標式11具有同等的判別性能的線性判別函數。它們如圖75和圖76所示。圖75和圖76所示的式中的各係數的值可以是將其實數倍所得的值,或附加任意的常數項所得的值。
[0552]實施例15
[0553]使用實施例11中使用的樣品數據。關於胃癌,通過變數覆蓋法從全部公式中提取進行胃癌組和非胃癌組的2組判別的線性判別式,此時,出現在各式中的胺基酸變數的最大值為4,計算滿足該條件的全部公式的ROC曲線下面積。此時,用ROC曲線下面積最大達到前500的判別式測定出現各胺基酸的頻率,結果可確認Trp、Glu、His、Ala、Pix)位於以高頻率提取的胺基酸的前5位,由此表明使用這些胺基酸作為變數的多變量判別式具有胃癌組和非胃癌組的2組間的判別能力(圖77)。
[0554]實施例16
[0555]通過上述的胺基酸分析法,針對通過胃活檢確診為胃癌的胃癌患者組的血樣和非胃癌患者組的血樣測定血液中胺基酸濃度。胃癌患者和非胃癌患者的胺基酸變數的分布如圖78所示。以胃癌組和非胃癌胃癌組的判別為目的,實施了 2組間的威爾科克森(氏)秩和檢驗。
[0556]與非胃癌組相比,胃癌組中Glu顯著增加,Thr、Asn、Ala、Cit、Val、Met、Leu、Tyr、Phe>His>Trp>Lys>Arg 顯著減少。由此表明,胺基酸變數 Glu、Thr、Asn、Ala、Val、Met、Leu、Tyr、Phe、His、Trp、Lys、Arg具有胃癌組和非胃癌組的2組間的判別能力。
[0557]並且,關於胃癌組和非胃癌組的2組判別,通過ROC曲線的AUC進行評價,對於胺基酸變數 Thr、Asn、Val、Met、Tyr、Phe、His、Trp、Arg, AUC 顯示出大於 0.7 的值(圖 79)。由此表明,胺基酸變數Thr、Asn、Val、Met、Tyr、Phe、His、Trp、Arg具有胃癌組和非胃癌組的2組間的判別能力。
[0558]實施例17
[0559]使用實施例16中使用的樣品數據。採用本 申請人:的國際申請即國際公開第2004/052191號小冊子中所述的方法,關於胃癌判別,深入研究使胃癌組和非胃癌組的2組判別性能最大化的指標,在具有同等性能的多個指標中得到了指標式12。除此之外,還得到了多個與指標式12具有同等的判別性能的多變量判別式。它們如圖80、圖81、圖82和圖83所示。圖80、圖81、圖82和圖83所示的式中的各係數的值可以是將其實數倍所得的值,或附加任意的常數項所得的值。
[0560]指標式12:
[0561]-6.272XTrp/Gln-0.08814XHis/Glu
[0562]關於胃癌組和非胃癌組的2組判別,基於指標式12的胃癌的診斷性能通過ROC曲線(圖84)的AUC(曲線下面積)進行評價,得到0.905±0.022(95%可靠區間為
0.860-0.950)。關於通過指標式12進行的胃癌組和非胃癌組的2組判別的閥值,以胃癌組的有症率為0.16%,求出最佳的閥值時,閥值為-0.712,並且得到靈敏度為84.3%、特異度為84.9 %、陽性預測值為0.886 %、陰性預測值為99.97 %、診斷正確率為84.88 % (圖84),由此表明指標式12的診斷性能高是有用的指標。實施例18
[0563]使用實施例16中使用的樣品數據。關於胃癌,通過邏輯分析(BIC最小基準的變數覆蓋法)研究使胃癌組和非胃癌組的2組判別性能最大化的指標,以指標式13的形式得到由Val、lie、His、Trp構成的邏輯回歸式(胺基酸變數Val、lie、His、Trp的數的係數和常數項依次為-0.0149±0.0061,0.0467±0.0148、-0.0296±0.0197、-0.1659±0.0233、
9.182±1.467)。除此之外,還得到了多個與指標式13具有同等的判別性能的邏輯回歸式。它們如圖85、圖86、圖87和圖88所示。圖85、圖86、圖87和圖88所示的式中的各係數的值可以是將其實數倍所得的值。
[0564]關於胃癌組和非胃癌組的2組判別,基於指標式13的胃癌的診斷性能通過ROC曲線(圖89)的AUC進行評價,得到0.909 ± 0.027 (95%可靠區間為0.857-0.961),由此表明指標式13的診斷性能高是有用的指標。關於通過指標式13進行的胃癌組和非胃癌組的2組判別的閥值,以胃癌組的有症率為0.16%,求出最佳的閥值時,閥值為-1.477,並且得到靈敏度為87.1 %、特異度為88.1 %、陽性預測值為1.16%、陰性預測值為99.98%、診斷正確率為88.08% (圖89),由此表明指標式13的診斷性能高是有用的指標。
[0565]實施例19
[0566]使用實施例16中使用的樣品數據。關於胃癌,通過線性判別分析(變數覆蓋法)研究使胃癌組和非胃癌組的2組判別性能最大化的指標,以指標式14的形式得到由Thr、lie、His、Trp構成的線性判別函數(胺基酸變數Thr、lie、His、Trp的數的係數依次為-0.0021 ±-0.0011,0.0039±-0.0018,-0.0038±_0.0023,-0.0143±_0.0024)。除此之夕卜,還得到了多個與指標式14具有同等的判別性能的線性判別函數。它們如圖90、圖91和圖92所示。圖90、圖91和圖92所示的式中的各係數的值可以是將其實數倍所得的值,或者附加任意的常數項所得的值。
[0567]關於胃癌組和非胃癌組的2組判別,基於指標式14的胃癌的診斷性能通過ROC曲線(圖93)的AUC進行評價,得到0.914±0.024 (95%可靠區間為0.867-0.962),由此表明指標式14的診斷性能高是有用的指標。關於通過指標式14進行的胃癌組和非胃癌組的2組判別的閥值,以胃癌組的有症率為0.16%,求出最佳的閥值時,閥值為-0.935,並且得到靈敏度為85.7%、特異度為89.8%、陽性預測值為1.33%、陰性預測值為99.97%、診斷正確率為89.82% (圖93),由此表明指標式14的診斷性能高是有用的指標。
[0568]實施例20
[0569]使用實施例16中使用的樣品數據。關於胃癌,自使用進行胃癌組和非胃癌組的2組判別的邏輯回歸式的胺基酸變數中,以出現在各式中的胺基酸變數的最大值為4,計算全部公式的ROC曲線下面積。此時,通過各組合中ROC曲線下面積達到前100位、250位、500位、1000位的判別式,按照出現頻率自高至低的順序提取10種胺基酸。其結果,提取了作為在達到前100位、250位、500位、1000位的判別式中常常出現頻率為前10位以內的胺基酸Trp、Asn、Glu、CU、Thr、Tyr、Arg,表明使用這些胺基酸作為變數的多變量判別式具有胃癌組和非胃癌組的2組間的判別能力(圖94)。
[0570]產業實用性
[0571]如上所述,本發明所述的胃癌的評價方法、胃癌評價裝置、胃癌評價方法、胃癌評價系統、胃癌評價程序和記錄介質可在工業上的眾多領域、特別是藥物或食品、醫療等的領域中廣泛實施,特別是在進行胃癌的病態預測或疾病風險預測或蛋白質組或代謝組學分析等的生物信息領域極為有用。
【權利要求】
1.信息處理裝置的實行方法,其特徵在於,該方法包括下述步驟: 取得步驟,針對從評價對象採集到的血液取得關於胺基酸濃度值的胺基酸濃度數據;濃度值基準評價步驟,根據在上述取得步驟中取得的上述評價對象的上述胺基酸濃度數據中所含的Asn、Met、Phe、Lys、Leu、Tyr、Val中的至少一種胺基酸的上述濃度值,對於上述評價對象評價胃癌的狀態。
【文檔編號】G01N33/574GK104237528SQ201410323349
【公開日】2014年12月24日 申請日期:2009年1月30日 優先權日:2008年2月6日
【發明者】今泉明, 安東敏彥, 木村毅, 野口泰志, 合地明, 山本浩史 申請人:味之素株式會社

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