涉及her3抑制劑的診斷和治療的製作方法

2023-06-05 05:09:51

涉及her3抑制劑的診斷和治療的製作方法
【專利摘要】本申請描述了NRG1超表達作為用於使用HER3抑制劑（如，雙特異性HER3/EGFR抑制劑）治療癌症患者的選擇標準的用途，以及治療那些患者的方法。
【專利說明】涉及HER3抑制劑的診斷和治療
[0001] 相關申請的奪叉參考
[0002] 本申請要求於2012年3月27日提交的U.S.專利申請61/616241的優先權權益， 在此將其完整內容全部按引用併入本文中。

【技術領域】
[0003] 本申請涉及癌症治療和選擇癌症患者用於使用HER3抑制劑治療的方法的領域。

【背景技術】
[0004] 受體酪氨酸激酶的HER家族是細胞生長、分化和存活的重要介質。該受體家族 包括四個截然不同的成員，包括表皮生長因子受體（EFGR、ErbBl或HER1)、HER2(ErbB2或 pl85neu)、HER3 (ErbB3)和 HER4 (ErbB4 或 tyro2)。
[0005] 祀向HER通路的治療目前用於治療如乳癌、非小細胞肺癌、結腸直腸癌、頭頸癌和 胰腺癌這樣的疾病。
[0006] EGFR被六個不同的配體結合：表皮生長因子（EGF)、轉化生長因子a (TGF-α )、雙 調蛋白（amphiregulin)、肝素結合表皮生長因子（HB-EGF)、betacellulin和表皮調節蛋白 (epiregulin) (Groenen 等，Growth Factors，11:235-257(1994))。
[0007] 神經調節蛋白（Neuregulin)是Her3和Her4受體酪氨酸激酶的配體。存在四個 已知的神經調節蛋白家族的成員，NRG1、NRG2、NRG3和NRG4(Falls，D. L.，Ex Cell Res， 284:14-30(2003) ;Hirsch 和 Wu(2007) ,Expert Reviews，Vol. 7, 147-157)。NRGl 轉錄產物 經歷大範圍的交替剪接，形成至少15種不同的異構體。所有活性異構體共享對於活性必需 的且足夠的 EGF-樣結構域（Holmes，W.E.等，Science，256:1205-1210(1992) ;Yarden，Y·， 和 Peles，Ε·，Biochemistry 30:3543-3550 (1991))。
[0008] 去年在美國診斷出大約52140個頭頸癌的鱗狀上皮細胞癌（HNSCC)的新病例，並 且估計11460人死於該疾病（1)。用於HNSCC的醫療幹預包括外科手術、放療和組合的放 療-化療。對於原發性HNSCC的總體5-年相對存活率大約為60%。然而，對於診斷為轉移 性疾病的患者，5-年相對存活率僅有35% (2)。患有晚期HNSCC患者中差的結果清楚地表 明這一人群需要更有效的治療（3)。
[0009] 通過表皮生長因子受體（EGFR)通路的信號傳導是HNSCC的主要驅動者（4)。在高 達90%的全部HNSCC中，EGFR是超表達的（5,6)。已經證明了使用西妥昔單抗（cetuximab) 的EGFR抑制是成功的治療策略，雖然由於先天性的或獲得性的抗藥性，其具有有限的長期 臨床益處（7)。已經在HNSCC的臨床研究中研究了靶向EGFR和或HER2酪氨酸激酶抑制劑 (TKIs),如厄洛替尼（erlotinib)、吉非替尼（gefitinib)和拉帕替尼（Iapatinib)，但尚未 在隨機化試驗中證明存活優勢（8-10)。
[0010] NRGl自分泌信號傳輸已經顯示出調節肺上皮細胞增殖（Jinbo等，Am. J. Respir. Cell Mol.Biol. 27:306-313(2002))並且在人的肺發育中起著作用（Patel 等，Am. J.Resp Cell Mol Bio, 22:432-440 (2000))，並且已經涉及NSCLC對EGFR抑制劑的不敏感性（Zhou 等，Cancer cell 10:39-50(2006))。臨床前研究表明了特定的癌細胞系受自分泌-信 號傳輸環路驅動，其中NRGl通過嚙合HER2激酶促進惡化（Wilson等，Cancer Cell， 20:158-173(2011))〇


【發明內容】

[0011] 本發明的一個方面提供一種治療患者一種類型的癌症的方法，包括將治療有效 量的HER3抑制劑給藥至患者，其中在給藥HER3抑制劑之前，所述患者被診斷為患有超表 達NRGl的癌症。NRGl超表達表示患者對HER3抑制劑的治療應答性。在一個實施方案 中，所述患者被診斷為患有以高於癌症類型中NRGl表達中值水平的水平表達NRGl的癌 症。在特定的實施方案中，所述患者被診斷為患有以癌症類型中NRGl表達的60個百分比 (60 thpercentiIe)或更高、75個百分比或更高，或80個百分比或更高的水平表達NRGl的癌 症。在一個實施方案中，癌症的類型是其呈現出由超表達模式和缺乏超表達模式組成的雙 峰表達譜的一種類型。在一個實施方案中，所述雙峰表達譜的拐點是1. 5,如依據線性標度 測量的。在一個實施方案中，癌症的類型是其呈現出自分泌神經調節蛋白-誘導的信號傳 輸的一種類型，如HNSCC。
[0012] 在一個實施方案中，所述HER3抑制劑抑制NRGl結合HER3。在一個實施方案中， 所述HER3抑制劑是抗體。在一個實施方案中，所述HER3抑制劑是雙特異性HER3/EGFR抑 製劑。在一個實施方案中，所述雙特異性HER3/EGFR抑制劑是雙特異性抗體，其包含特異性 結合HER3和EGFR的抗原結合結構域。在一個實施方案中，所述雙特異性抗體包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域的HVR序列和SEQ ID NO: 2的輕鏈可變結構域序列的HVR序列。在 一個實施方案中，所述雙特異性抗體包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域和SEQ ID N0:2 的輕鏈可變結構域序列。
[0013] 在一個實施方案中，診斷包括測定來自患者癌症的樣品中的NRGl的表達水平，並 且將樣品中的NRGl的表達水平相對於樣品中的AL-137727和VPS33B中的一種或兩種的表 達水平進行量化。
[0014] 本發明的另一個方面提供一種治療患者頭頸鱗狀上皮細胞癌（HNSCC)的方法， 包括將治療有效量的雙特異性HER3/EGFR抑制劑給藥至患者，其中在給藥雙特異性HER3/ EGFR抑制劑之前，所述患者被診斷為患有超表達NRGl的HNSCC。NRGl超表達表示患者對雙 特異性HER3/EGFR抑制劑的治療應答性。在一個實施方案中，所述雙特異性HER3/EGFR抑 製劑是雙特異性抗體，其包含特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域。在一個實施方案 中，所述雙特異性抗體包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域的HVR序列和SEQ ID NO: 2的 輕鏈可變結構域序列的HVR序列。在一個實施方案中，所述雙特異性抗體包含SEQ ID N0:1 的重鏈可變結構域和SEQ ID NO:2的輕鏈可變結構域序列。
[0015] 本發明的另一個方面提供了一種用於選擇治療的方法，所述治療用於患有一種類 型的呈現出自分泌神經調節蛋白誘發的信號傳輸的癌症的患者，所述方法包括確定來自患 者的癌症樣品中的神經調節蛋白I(NRGl)表達並且如果癌症樣品超表達NRG1，選擇HER3抑 製劑用於治療。在一個實施方案中，癌症樣品以高於癌症類型中的NRGl表達的中值水平的 水平表達NRGl。在特定的實施方案中，所述癌症樣品以癌症類型中的NRGl表達的60個百分 比或更高、75個百分比或更高，或80個百分比或更高的水平表達NRGl。在一個實施方案中， 癌症的類型是其呈現出由超表達模式和缺乏超表達模式組成的雙峰表達譜的一種類型。在 一個實施方案中，所述雙峰表達譜的拐點是1. 5,如依據線性標度測量的。在一個實施方案 中，癌症的類型是其呈現出自分泌神經調節蛋白-誘導的信號傳輸的一種類型，如HNSCC。 在一個實施方案中，該方法進一步包括將治療有效量的HER3抑制劑給藥至患者。在一個實 施方案中，癌症的類型是HNSCC。在一個實施方案中，所述HER3抑制劑抑制NRG結合HER3。 在一個實施方案中，所述HER3抑制劑是抗體。在一個實施方案中，所述HER3抑制劑是雙特 異性HER3/EGFR抑制劑。在一個實施方案中，所述雙特異性HER3/EGFR抑制劑是雙特異性 抗體，其包含特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域。在一個實施方案中，所述雙特異 性抗體包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域的HVR序列和SEQ ID N0:2的輕鏈可變結構域 序列的HVR序列。在一個實施方案中，所述雙特異性抗體包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結 構域和SEQ ID NO:2的輕鏈可變結構域序列。
[0016] 在一個實施方案中，NRGl表達的確定包括測定來自患者癌症的樣品中的NRGl的 表達水平並且將樣品中的NRGl的表達水平相對於樣品中的AL-137727和VPS33B中的一種 或兩種的表達水平進行量化。
[0017] 本發明的另一個方面提供了一種用於選擇治療的方法，所述治療用於患有頭頸鱗 狀上皮細胞癌（HNSCC)的患者，所述方法包括測定來自患者的HNSCC樣品中的神經調節蛋 白（NRGl)表達，並且如果HNSCC樣品超表達NRGl，選擇雙特異性HER3/EGFR抑制劑作為治 療。在一個實施方案中，該方法進一步包括將治療有效量的雙特異性HER3/EGFR抑制劑抑 製劑給藥至患者。在一個實施方案中，所述雙特異性HER3/EGFR抑制劑是雙特異性抗體，其 包含特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域。在一個實施方案中，所述雙特異性抗體 包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域的HVR序列和SEQ ID NO: 2的輕鏈可變結構域序列 的HVR序列。在一個實施方案中，所述雙特異性抗體包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域 和SEQ ID N0:2的輕鏈可變結構域序列。在一個實施方案中，NRGl表達的確定包括測定來 自患者癌症的樣品中的NRGl的表達水平並且將樣品中的NRGl的表達水平相對於樣品中的 AL-137727和VPS33B中的一種或兩種的表達水平進行量化。
[0018] 本發明的另一個方面提供了一種用於宣傳 HER3抑制劑或其藥物學上可接受的組 合物的方法，包括將HER3抑制劑或其藥物組合物用於治療患有一種類型的癌症的患者群 的用途促銷給目標聽眾，其中患者的癌症超表達NRG1。在一個實施方案中，所述HER3抑制 劑抑制NRG結合HER3。在一個實施方案中，所述HER3抑制劑是抗體。在一個實施方案中， 所述HER3抑制劑是雙特異性HER3/EGFR抑制劑。在一個實施方案中，所述雙特異性HER3/ EGFR抑制劑是雙特異性抗體，其包含特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域。在一個 實施方案中，所述雙特異性抗體包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域的HVR序列和SEQ ID NO: 2的輕鏈可變結構域序列的HVR序列。在一個實施方案中，所述雙特異性抗體包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域和SEQ ID NO:2的輕鏈可變結構域序列。
[0019] 本發明的另一個方面提供了一種用於宣傳雙特異性HER3/EGFR抑制劑或其藥物 學上可接受的組合物的方法，包括將雙特異性HER3/EGFR抑制劑或其藥物組合物用於治療 患有HNSCC的患者群體的用途促銷給目標聽眾，其中患者的HNSCC超表達NRG1。在一個 實施方案中，所述雙特異性HER3/EGFR抑制劑是雙特異性抗體，其包含特異性結合HER3和 EGFR的抗原結合結構域。在一個實施方案中，所述雙特異性抗體包含SEQ ID NO: 1的重鏈 可變結構域的HVR序列和SEQ ID NO:2的輕鏈可變結構域序列的HVR序列。在一個實施方 案中，所述雙特異性抗體包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域和SEQ ID N0:2的輕鏈可變 結構域序列。
[0020] 本發明的另一個方面提供了一種定量癌症樣品中的NRGl表達水平的方法，包括 測定樣品中的NRGl的表達水平，並且將樣品中的NRGl的表達水平相對於樣品中的一種 或多種內部參照基因的表達水平進行量化。在一個實施方案中，一種或多種參照基因是 AL-137727和VPS33B中的一種或兩種。在一個實施方案中，樣品來自呈現出自分泌神經調 節蛋白誘發的信號傳輸的癌症，如頭頸鱗狀上皮細胞癌（HNSCC)。在這種方法的一個特定實 施方案中，使用聚合酶鏈式反應（PCR)來測定NRGl的表達水平以及AL-137727和VPS33B 中的一種或兩種的表達水平。在一個實施方案中，該方法中使用的PCR是定量實時聚合酶 鏈式反應（qRT-PCR)。在另一個實施方案中，使用免疫組織化學（IHC)或ELISA測定NRGl 的表達水平。在另一個實施方案中，通過直接RNA測序測定了 NRGl的表達水平。在另一個 實施方案中，使用RNA原位雜交測定NRGl的表達水平。
[0021] 附圖簡沭
[0022] 圖1是證明了 MEHD7945A抗體結合HER3-ECD和EGFR-ECD兩者的圖。
[0023] 圖2A和B是證明了 MEHD7945A抑制EGFR和HER2/HER3依賴性信號傳輸的圖。
[0024] 圖3是顯示了 FaDu癌症模型中腫瘤生長受到MEHD7945A抑制的圖。
[0025] 圖4是在許多小鼠異種移植模型中，與西妥昔單抗或抗-HER3相比，MEHD7945A的 腫瘤生長抑制作用的概述。
[0026] 圖5顯示了通過qRT-PCR測定的癌症類型中的NRGl (A)和HER3⑶表達水平。
[0027] 圖6顯示了與其他癌症類型相比，HNSCC中的NRGl表達的雙峰分布。
[0028] 圖7顯示了以Iogltl標度作圖時，HNSCC中的NRGl表達的雙峰分布。虛線表示HNSCC 中NRGl表達的超表達和缺乏超表達模式之間的拐點，將其在對數標度上設定在0. 3689,對 應於線性標度上的大約1.50。
[0029] 圖8顯示了來自未治療SCHNN患者的新鮮冷凍腫瘤樣本中的pHER3和pTyr的 IP-western印跡分析的結果。MCF7是陰性對照；MCF7+NRG和PCI6A是陽性對照。用於pTyr 印跡的對照分開運行，而用於PHER3的對照同時運行。
[0030] 圖9顯示了 qRT-PCR試驗的結果，表明高NRGl表達與23個SCHNN腫瘤中的HER3 信號傳輸的PHER3不同的激活相關（18/19與IP-western重疊）。X-軸下的黑線表示具有 通過IP-western可檢測的pHER3的腫瘤。
[0031] 圖10是概括了分析中使用的患者及其腫瘤的病理和人口統計變量的表。
[0032] 圖11顯示了比較未匹配的原發性和復發性HNSCC樣本中的NRGl表達水平的 qRT-PCR 分析。
[0033] 圖12顯示了比較匹配的原發性和復發性HNSCC中的NRGl表達水平的qRT-PCR分 析。
[0034] 圖13是顯示了匹配的未治療和治療後的HNSCC之間的比較。
[0035] 圖14是顯示了匹配的未治療和化療後HNSCC樣品之間的NRGl或HER3表達和自 分泌生物學變化的表。使用定義軟體來檢測復染核內的NRGl或NER3或兩種轉錄產物的表 達。
[0036] 圖15顯示了原發性和復發性SCHNN中NRGl⑷和HER3⑶的RNA-ISH和qRT-PCR 的成對分析。
[0037] 圖16顯示了 HNSCC和CRC患者的NRGl表達水平。
[0038] 圖17顯示了與1期研究中的HNSCC患者的NRGl表達水平相比，原發性&復發性 HNSCC中的NRGl表達水平。
[0039] 圖18顯示了抗體MEHD7945A的胺基酸序列（SEQ ID NO: 1和2)。
[0040] 優詵實施方案的詳沭
[0041] I.定義
[0042] 除非另外限定，本文中使用的所有技術術語、符號和其他科學技術確定具有本發 明所屬領域的技術人員通常理解的含義。在一些情況中，為了清楚和/或為了現成的參 考，本文中限定了具有通常理解含義的術語，並且本文中中包含這樣的定義不必然解釋為 表示與本領域通常理解的實質性差異。本文中描述或參考的技術和程序通常是本領域 技術人員充分了解的並且通常是使用常規方法來使用的，例如，Sambrook等，Molecular Cloning: A Laboratory Manual (分子克隆：實驗室手冊）第 2版（1989)Cold Spring Harbor Laboratory Press，Cold Spring Harbor，N.Y.中描述的廣泛使用的分子克隆方法。 如果適用，通常根據製造商限定的實驗方案和/或參數進行涉及使用商業購得的試劑盒和 試劑的程序。
[0043] 因此在描述本發明的方法、試劑盒和用途之前，應了解本發明不限於所描述的特 定方法、實驗方案、細胞系、動物種或屬、構建體和試劑，因為這些當然可以改變。還應了 解本文中使用的術語僅僅是為了描述特定實施方案的目的，並且不是用來限制本發明的範 圍，其將只通過所附權利要求來限制。
[0044] 必須注意到，除非文中另外清楚地指出，否則本文和所附權利要求中使用的，單數 形式"一個（a) "、"和"和"該"包括複數指示物。
[0045] 在整個說明書和權利要求中，詞語"包含"或"包括"，將理解為表示包含所述整體 或整體的組，但不排除任何其他整體或整體的組。
[0046] 在本文中術語"抗體"以最寬的含義來使用並且尤其涵蓋單克隆抗體、多克隆抗 體、多特異性抗體和抗體片段，只要它們呈現出所需的生物活性。術語"多特異性抗體"以 最寬的含義來使用並且特意涵蓋包含具有多表位特異性（即，能夠特異性結合兩個，或多 個不同生物分子上的表位）的抗原結合結構域的抗體。抗原結合結構域的一個特定實例是 由重鏈可變結構域（V h)和輕鏈可變結構域（VJ組成的Vh'單位。這樣的多特異性抗體包 括，但不限於，全長抗體，具有兩個或多個'和V h結構域的抗體，抗體片段，如Fab，FV，dsFv， scFv，雙抗，雙特異性雙抗和三抗，已經共價或非共價連接的抗體片段。"雙特異性抗體"是 包含能夠特異性結合一個生物分子上的兩個不同表位的或能夠特異性結合兩個不同生物 分子上的表位的抗原結合結構域的多特異性抗體。雙特異性抗體在本文中還稱為具有"雙 重特異性"或"雙重特異性的"。
[0047] 在特定的實施方案中，本發明的抗體對其靶標HER或HERs具有彡1 μ M、彡ΙΟΟηΜ、 彡1011]\1、彡111]\1、彡0.111]\1、彡0.0111]\1或彡0.00111]\1(例如，101或更低，例如，101至10 -13]\1， 例如，KT9M至I(T13M)的解離常數（Kd)。
[0048] 基礎的4-鏈抗體單體是由兩個相同的輕（L)鏈和兩個相同的重（H)鏈組成的雜 四聚糖蛋白（IgM抗體由5個基礎雜四聚單體連同另外的稱為J鏈的多肽組成，並且因此含 有10個抗原結合位點，而分泌的IgA抗體可以聚合形成包含2-5個基礎4-鏈單體連同J 鏈的多價聚集物）。在IgG的情況中，4-鏈單體通常約150, 000道爾頓。每個L鏈通過一 個共價二硫化物鍵連接H鏈，而兩個H鏈根據H鏈的同種型，通過一個或多個二硫化物鍵彼 此連接。每個H和L鏈還規則地間隔了鏈內二硫化物橋。每個H鏈在N-端具有可變結構 域（V h)，其對於每個α和Y鏈，連有三個恆定結構域（Ch)，而對於μ和ε同種型，連有 四個C h結構域。每個L鏈在N-端具有可變結構域（VJ，其在另一端連有恆定結構域（Q)。 '與Vh排列成行，而Q與重鏈的第一個恆定結構域（C hI)排列成行。認為特定的胺基酸殘 基在輕鏈和重鏈可變結構域中間形成了界面。Vh和'一起的配對形成了單個抗原結合位 點。對於不同類別的抗體的結構和特性，參見，例如，Basic and Clinical Immunology, H 8 版，Daniel P. Stites，Abba I. Terr 和 Tristram G. Parslow(編輯），Appleton&Lange, Norwalk，CT，1994,第 71 頁和第 6 章。
[0049] 基於恆定結構域的胺基酸序列，來自任何脊椎動物物種的L鏈可以分配給兩種明 顯不同類型中的一種，這兩種類型稱為κ和λ。根據重鏈（C 0)的恆定結構域的胺基酸序 列，免疫球蛋白可以分配給不同的類型或同種型。存在五種類別的免疫球蛋白：IgA、IgD、 IgE、IgG和IgM，具有分別指定為α、δ、Y、ε和μ的重鏈。基於C0序列和功能相對次要 的差異，將Y和α類別進一步分成亞類，例如，人表達以下亞類：IgGl、IgG2、IgG3、IgG4、 IgAl 和 IgA2。
[0050] 術語"可變的"是指可變結構域的特定片段在抗體的序列中大範圍地不同。V結構 域介導抗原結合併且限定了特定抗體對其特定抗原的特異性。然而，可變性不是均勻分布 於可變結構域的110個胺基酸跨度範圍中。相反，V區域由相對不變的鏈組成，所述鏈稱為 框架區（FR)，其是由極高可變性的稱為"超變區"或HVR的較短區域隔開的15-30個氨基 酸。天然重鏈和輕鏈的可變結構域各自包含四個FR，大部分採用β-摺疊構造，通過三個超 變區連接，其形成環連接，並且在一些情況中，形成β-摺疊結構的一部分。每個鏈中的超 變區通過FR在近端連在一起，並且與來自其他鏈的超變區連接，有助於抗體的抗原結合位 點的形成（參見 Kabat 等，Sequences of Proteins of Tmmuol ogical Interest,第 5 版， Public Health Service，National Institutes of Health，Bethesda，MD. (1991))。恆定 結構域不直接涉及抗體與抗原結合，但呈現出各種效應物功能，如抗體依賴性細胞性細胞 毒性（ADCC)中的抗體沉澱。
[0051] 術語"超變區"、"HVR"或"HV"在用於本文中時，是指抗體可變域中序列超變和/ 或形成結構上限定的環的區域。通常，抗體包含六個HVR;三個在VH中（HVR-HUHVR-H2、 HVR-H3)，三個在VL中（HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3)。在天然抗體中，H3和L3呈現出六個 HVR的最大多樣性，特別是認為H3在給予抗體精細的特異性中起到了獨特的作用。參 見，例如，Xu 等，Immunity 13:37-45(2000) ;Johnson 和 Wu，在 Methods in Molecular Biology 248:1-25 中（Lo 編輯，Human Press，Totowa，NJ，2003)。實際上，只有重鏈組成 的天然產生的羊駝（camelid)抗體在不存在輕鏈的情況下是功能性的並且是穩定的。參 見，例如，Hamers-Casterman 等，Nature 363:446-448(1993) ;Sheriff 等，Nature Struct. Biol. 3:733-736(1996)。
[0052] HVR通常包含來自超變環和/或來自"互補決定區"(⑶R)的胺基酸殘基，後者是最 高序列可變性的和/或涉及抗原識別。各種HVR描繪在使用中並且包括在本文中。Kabat互 補性決定區（⑶R)是基於序列可變性並且是最常使用的（Kabat等，Sequences of Proteins of Immunological Interest,第 5 版，Public Health Service, National Institutes of Health，Bethesda，MD. (1991))。Chothia 而是提到了結構環的位置（Chothia 和 Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987))。AbM HVR 表示 Kabat HVR 和 Chothia 結構環之間的折 衷，並且通過Oxford Molecular's AbM抗體建模軟體來使用。"接觸"HVR是基於可用的復 合晶體結構的分析。以下記錄了來自這些HVR中的每一個的殘基。
[0053]

【權利要求】
1. 一種治療患者一種類型的癌症的方法，包括將治療有效量的HER3抑制劑給藥至所 述患者，其中在給藥HER3抑制劑之前，所述患者被診斷為患有超表達NRGl的癌症。
2. 如權利要求1的方法，其中所述患者被診斷為患有以高於該癌症類型中NRGl表達的 中值水平的水平表達NRGl的癌症。
3. 如權利要求2的方法，其中所述患者被診斷為患有以該癌症類型中NRGl表達的第 60百分位或更高的水平表達NRGl的癌症。
4. 如權利要求2的方法，其中所述患者被診斷為患有以該癌症類型中NRGl表達的第 75百分位或更高的水平表達NRGl的癌症。
5. 如權利要求2的方法，其中所述患者被診斷為患有以該癌症類型中NRGl表達的第 80百分位或更高的水平表達NRGl的癌症。
6. 如權利要求1的方法，其中所述類型的癌症是呈現出由超表達模式和缺乏超表達模 式組成的雙峰表達譜的癌症。
7. 如權利要求1-6中任一項的方法，其中所述類型的癌症呈現出自分泌神經調節蛋白 誘導的信號傳輸。
8. 如權利要求1-7中任一項的方法，其中所述類型的癌症是頭頸鱗狀上皮細胞癌 (HNSCC)。
9. 如權利要求1-8中任一項的方法，其中所述HER3抑制劑抑制NRGl結合HER3。
10. 如權利要求1-9中任一項的方法，其中所述HER3抑制劑是抗體。
11. 如權利要求1-10中任一項的方法，其中所述HER3抑制劑是雙特異性HER3/EGFR抑 製劑。
12. 如權利要求11的方法，其中雙特異性HER3/EGFR抑制劑是包含特異性結合HER3和 EGFR的抗原結合結構域的雙特異性抗體。
13. 如權利要求12的方法，其中特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域包含： 包含胺基酸序列 LSGDWIH(SEQ ID NO:3)的 HVR-Hl， 包含胺基酸序列 VGEISAAGGYTD(SEQ ID N0:4)的 HVR-H2， 包含胺基酸序列 ARESRVSFEAAMDY(SEQ ID N0:5)的 HVR-H3,和 包含胺基酸序列 NIATDVA(SEQ ID NO:6)的 HVR-Ll， 包含胺基酸序列SASF(SEQ ID N0:7)的HVR-L2,和 包含胺基酸序列 SEPEPYT(SEQ ID N0:8)的 HVR-L3。
14. 如權利要求13的方法，其中特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域包含與SEQ ID NO: 1的胺基酸序列具有至少95%序列同一性的重鏈可變結構域以及與SEQ ID N0:2的 胺基酸序列具有至少95%序列同一性的輕鏈可變結構域。
15. 如權利要求12的方法，其中特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域和SEQ ID NO:2的輕鏈可變結構域。
16. 如權利要求1-15中任一項的方法，其中所述診斷包括測定來自患者癌症的樣品中 的NRGl的表達水平並且相對於樣品中的AL-137727和VPS33B中的一種或兩種的表達水 平，將樣品中的NRGl的表達水平進行量化。
17. -種治療患者頭頸鱗狀上皮細胞癌（HNSCC)的方法，包括將治療有效量的雙特異 性HER3/EGFR抑制劑給藥至所述患者，其中在給藥雙特異性HER3/EGFR抑制劑之前，所述患 者被診斷為患有超表達NRGl的HNSCC。
18. 如權利要求17的方法，其中所述雙特異性HER3/EGFR抑制劑是包含特異性結合 HER3和EGFR的抗原結合結構域的雙特異性抗體。
19. 如權利要求17的方法，其中特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域包含： 包含胺基酸序列 LSGDWIH(SEQ ID NO:3)的 HVR-Hl， 包含胺基酸序列 VGEISAAGGYTD(SEQ ID N0:4)的 HVR-H2,和 包含胺基酸序列 ARESRVSFEAAMDY(SEQ ID N0:5)的 HVR-H3， 和 包含胺基酸序列 NIATDVA(SEQ ID NO:6)的 HVR-Ll， 包含胺基酸序列SASF(SEQ ID N0:7)的HVR-L2,和 包含胺基酸序列 SEPEPYT(SEQ ID N0:8)的 HVR-L3。
20. 如權利要求19的方法，其中特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域包含與SEQ ID NO: 1的胺基酸序列具有至少95%序列同一性的重鏈可變結構域以及與SEQ ID N0:2的 胺基酸序列具有至少95%序列同一性的輕鏈可變結構域。
21. 如權利要求18的方法，其中特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域和SEQ ID NO:2的輕鏈可變結構域。
22. 如權利要求17-21中任一項的方法，其中診斷包括測定來自患者HNSCC的樣品中的 NRGl的表達水平並且相對於樣品中的AL-137727和VPS33B中的一種或兩種的表達水平，將 樣品中的NRGl的表達水平進行量化。
23. -種用於選擇治療的方法，所述治療用於患有呈現出自分泌神經調節蛋白誘發的 信號傳輸的一種類型的癌症的患者，所述方法包括測定來自所述患者的癌症樣品中的神經 調節蛋白I (NRGl)表達並且如果癌症樣品超表達NRGl，選擇HER3抑制劑用於治療。
24. 如權利要求23的方法，其中所述癌症樣品以高於該癌症類型中的NRGl表達的中值 水平的水平表達NRGl。
25. 如權利要求24的方法，其中所述癌症樣品以該癌症類型中的NRGl表達的第60百 分位或更高的水平表達NRGl。
26. 如權利要求24的方法，其中所述癌症樣品以該癌症類型中的NRGl表達的第75百 分位或更高的水平表達NRGl。
27. 如權利要求24的方法，其中所述癌症樣品以該癌症類型中的NRGl表達的第80百 分位或更高的水平表達NRGl。
28. 如權利要求23的方法，其中所述類型的癌症是呈現出由超表達模式和缺乏超表達 模式組成的雙峰表達譜的癌症。
29. 如權利要求23-28中任一項的方法，其中所述類型的癌症是頭頸鱗狀上皮細胞癌 (HNSCC)。
30. 如權利要求23-29中任一項的方法，其中所述HER3抑制劑抑制NRGl結合HER3。
31. 如權利要求23-30中任一項的方法，其中所述HER3抑制劑是抗體。
32. 如權利要求31的方法，其中所述HER3抑制劑是雙特異性HER3/EGFR抑制劑。
33. 如權利要求32的方法，其中雙特異性HER3/EGFR抑制劑是包含特異性結合HER3和 EGFR的抗原結合結構域的雙特異性抗體。
34. 如權利要求33的方法，其中特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域包含： 包含胺基酸序列 LSGDWIH(SEQ ID NO:3)的 HVR-Hl， 包含胺基酸序列 VGEISAAGGYTD(SEQ ID N0:4)的 HVR-H2， 包含胺基酸序列 ARESRVSFEAAMDY(SEQ ID N0:5)的 HVR-H3,和 包含胺基酸序列 NIATDVA(SEQ ID NO:6)的 HVR-Ll， 包含胺基酸序列SASF(SEQ ID N0:7)的HVR-L2,和 包含胺基酸序列 SEPEPYT(SEQ ID N0:8)的 HVR-L3。
35. 如權利要求34的方法，其中特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域包含與SEQ ID NO: 1的胺基酸序列具有至少95%序列同一性的重鏈可變結構域以及與SEQ ID N0:2的 胺基酸序列具有至少95%序列同一性的輕鏈可變結構域。
36. 如權利要求33的方法，其中特異性結合HER3和EGFR的抗原結合結構域包含SEQ ID NO: 1的重鏈可變結構域和SEQ ID NO:2的輕鏈可變結構域。
37. 如權利要求23-36中任一項的方法，其中使用聚合酶鏈式反應（PCR)測定NRGl表 達。
38. 如權利要求37的方法，其中所述PCR是定量實時聚合酶鏈式反應（qRT-PCR)。
39. 如權利要求23-36中任一項的方法，其中使用IHC測定了 NRGl表達。
40. 如權利要求23-39中任一項的方法，其中測定HNSCC樣品中的NRGl表達包括測定 所述樣品中的NRGl的表達水平並且相對於樣品中的AL-137727和VPS33B中的一種或兩種 的表達水平，將所述樣品中的NRGl的表達水平進行量化。
41. 如權利要求23-40中任一項的方法，進一步包括將治療有效量的HER3抑制劑給藥 至所述患者。
42. -種定量癌症樣品中的NRGl表達水平的方法，包括： 測定所述樣品中的NRGl的表達水平，和 相對於所述樣品中的AL-137727和VPS33B中的一種或兩種的表達水平，將所述樣品中 的NRGl的表達水平進行量化。
43. 如權利要求42的方法，其中所述癌症呈現出自分泌神經調節蛋白誘導的信號傳 輸。
44. 如權利要求42或43的方法，其中所述癌症是頭頸鱗狀上皮細胞癌（HNSCC)。
45. 如權利要求42-44中任一項的方法，其中使用聚合酶鏈式反應（PCR)測定NRGl的 表達水平以及AL-137727和VPS33B中的一種或兩種的表達水平。
46. 如權利要求45的方法，其中所述PCR是定量實時聚合酶鏈式反應（qRT-PCR)。
47. 如權利要求42-44中任一項的方法，其中使用免疫組織化學（IHC)測定NRGl的表 達水平以及AL-137727和VPS33B中的一種或兩種的表達水平。 48. HER3抑制劑，其用於治療超表達NRGl的癌症類型。
【文檔編號】C07K16/28GK104220457SQ201380017013
【公開日】2014年12月17日 申請日期:2013年3月15日 優先權日:2012年3月27日
【發明者】L.阿姆勒, D.沙梅斯 申請人:霍夫曼-拉羅奇有限公司