Slc39a7基因作為豬脂肪沉積性狀的遺傳標記及應用的製作方法

2023-10-11 05:07:34 1

+J,+jf+glt+5Z,+/covvttB+c咖o+c血rf+e,加模型1和2主要區別是是否考慮SLC39A7基因作為固定效應，其中模型1不考慮SLC39A7基因作為6固定效應，模型2考慮了SLC39A7基因作為固定效應通過QTL連鎖分析表明在不考慮SLC39A7基因作為固定效應的前提下(模型l),在該染色體上存在顯著影響板油重、內脂率、肩部最厚處背膘厚、胸腰椎結合處背膘厚、醬部平均背膘厚以及平均背膘厚等脂肪沉積性狀的QTL,同時存在顯著影響眼肌面積和瘦肉率的QTL。當考慮SLC39A7基因作為固定效應的前提下(模型2),影響上述脂肪沉積性狀的QTL的顯著性水平(F值)顯著下降或為不顯著(表3),而對於眼肌面積、眼肌髙以及瘦肉率等肌肉相關性狀，F值變化不大(表3),說明該基因對肌肉相關性狀的影響不大加性效應為正值表明來源於梅山豬的等位基因具有降低背膘厚的效應QTL。表3背膘厚QTL定位結果tableseeoriginaldocumentpage7以上兩種方法的應用均有力的支持了S丄C^U7基因作為豬7號染色體隱性有利背膘厚QTL候選基因的證據。序列表華中農業大學SLC39A7基因作為豬脂肪沉積性狀的遺傳標記及應用<130〉<141〉2007-06-12<160〉2<170〉Patentlnversion3,1<210〉1402<212〉艦豬(Susscrofa)<220〉<221〉genb<222〉(l)..(卿<223〉<220〉<221〉e咖<222〉(218).(271)<223〉<220〉mutation<222〉(250),.(250)1atcctgctgagttttgcttcgggtgggctcttgggagatgccttcctgcacctcattcct60catgctctgggtaagtgacctcaaatcttagagtgttttattcttt卿tgagagggttc120tttcctctttgtgatccctgaccttctagtgtccccccaatacacaccttttgtgtggga180tattcccttatctaaccttttcccccacttcttccagaaccccattetcaccacc235AsnProlieLeuThrThr15etctggageageccagacacggacBttcccacagtggt卿gaagg281LeuTrpSerSerProAspThrAsplieProThrVal1015ggaggatggagataatggtttggggtgctagggaaggtctgtccctccctgttctcctct341acttggggaggaagagtctggaatctatatttctcttaatgtctcaatgtgtccatcccc401a4022402DNA豬(Susscrofa)<220〉<221〉gene<222〉(1)..(402)<223〉〈220〉mutation〈222>(250)..(250)<223〉〈221〉exoii(218)..(271)<400〉2atcctgctgagttttgcttcgggtgggctcttgggagatgccttcctgcacctcattcct60catgctctgggtaagtgacctcaaatcttagagtgttttattctttgaatgagagggttc120tttcctctttgtgatccctgaccttctagtgtccccccaatacacaccttttgtgtggga180tattcccttatctaaccttttcccccacttcttccagaaccccattetcaccacc235AsnProlieLeuThrThr15etctgg8gcageccggacBeggac8ttcccacsgtggt肪ggBBBg281LeuTrpSerSerProAspThrAsplieProThrVal1015ggaggatggagataatggtttggggtgctagggaaggtctgtccctccctgttctcctct341acttggggaggaagagtctggaatctatatttctcttaatgtctcaatgtgtccatcccc401a40權利要求1、一種篩選的豬脂肪沉積性狀SLC39A7基因的遺傳標記，其具有如序列表SEQIDNO1和SEQIDNO2所示的核苷酸序列。2、根據權利要求1所述的遺傳標記，其特徵在於，序列表SEQIDNO:l的第250bp處有一個A250—G250的錯義突變，導致其編碼的胺基酸由精氨酸(Arg)變成甘氨酸(Gly),並導致處all—RFLP多態性。3、根據權利要求1所述的遺傳標記，其中克隆虹C3A47基因第3外顯子的特異DNA片段所用引物的DNA序列如下所示正向引物F:ATCCTGCTGAGTTTTGCTTCG，反向引物R:TGGGGATGGACACATTGAGAC。4、一種篩選適用於豬脂肪沉積性狀的遺傳標記的方法，按照以下步驟從豬血液中提取基因組DNA，根據豬SLC39A7基因基因組序列設計引物，得到如權利要求3所示的引物，用權利要求3所示的弓l物在豬基因的基因組DNA中進行PCR擴增，PCR產物純化和克隆測序，獲得如序列表SEQIDNO:1和SEQIDN0:2所示的核苷酸序列。5、權利要求1所述的遺傳標記在豬脂肪沉積性狀輔助選擇中的應用。全文摘要本發明屬於豬遺傳育種及分子標記輔助選擇
技術領域：
，具體涉及一種篩選的豬脂肪沉積性狀SLC39A7基因的遺傳標記，該遺傳標記具有有如序列表SEQIDNO1和SEQIDNO2所示的核苷酸序列。在序列表SEQIDNO1的第250bp處有一個A250-G250的錯義突變，導致其編碼的胺基酸由精氨酸(Arg)變成甘氨酸(Gly)，並導致HpaII-RFLP多態性。利用本發明的遺傳標記對來自國外血緣豬和中國地方血緣豬品種進行了脂肪沉積相關性狀的關聯分析。本發明還公開了豬SLC39A7基因第3外顯子的SNP分型的檢測方法，為豬的分子標記輔助選擇提供了新的遺傳標記和檢測方法。文檔編號C12N15/11GK101113470SQ20071005245公開日2008年1月30日申請日期2007年6月13日優先權日2007年6月13日發明者波左,熊遠著,陳朝國,馬志雄申請人:華中農業大學