工業上有用的微生物的製作方法

2023-12-03 06:53:06

專利名稱：：工業上有用的微生物的製作方法工業上有用的微生物
技術領域：
0001本發明涉及染色體DNA比野生型大腸桿菌短的大腸桿菌突變體、以及使用該突變體製備有用物質的方法。
背景技術：
：0002已經闡明大腸桿菌的染色體DNA的完整鹼基序列(非專利文獻1以及2)。此外，已知使用同源重組的方法，使大腸桿菌的染色體DM上存在的任意基因或者染色體DNA上的任意區域按照希望產生缺失的方法(非專利文獻3)。另外，利用染色體DNA的完整鹼基序列信息以及同源重組方法可以製備將大腸桿菌染色體DM上的各基因網絡性地破壞的突變林文庫、以及將可以刪除的20kbp左右的染色體DNA上的區域分別網絡性地使之缺失的突變抹文庫等(非專利文獻4以及5)。0003作為染色體DNA上的多個區域存在缺失的大腸桿菌突變林，據報導有缺失376kbp的突變林(非專利文獻6)、缺失262kbp的突變林(非專利文獻7)、缺失313kbp的突變林(非專利文獻5),不過只是記栽了任何一株的生長繁殖(菌體量或者生長繁殖速度)和作為親本林的野生型林相同，並沒有記載當向染色體DNA導入400kbp以上的缺失的情況下、該缺失會對大腸桿菌的生長繁殖造成怎樣的影響。0004即、尚且未知在染色體DM上的多個區域被缺失的、並且生長繁殖比野生型的大腸桿菌提高了的大腸桿菌突變體、以及使用該突變體製備有用物質的方法。非專利文獻l:Science,277，1453(1997)非專利文獻2:日本DNAf'—夕乂《》夕、"EscherichiacoliK12W3110"、[online]、[平成16年10月29日]、國際網際網路〈URL:http://gib.genes.nig.ac.jp/single/index.phpspid=Ecol_K12_W3110>非專利文獻3:J.Bacteriol.，180，2063(1998)非專利文獻4:蛋白質核酸酶、第462巻386頁、2001年非專利文獻5:NatureBiotechnol.，20，1018(2002)非專利文獻6:GenomeResearch,12，640(2002)非專利文獻7:GenomeResearch,13，644(2003)
發明內容發明所要解決的問題0005本發明的目的是提供染色體DNA上的多個區域缺失的大腸桿菌突變體、以及使用該突變體製備有用物質的方法。用於解決問題的方法0006本發明涉及下述(l)~(47):(l)含有下述[1]和[2]所述的基因或者與它們同源的基因、且具有比野生型大腸桿菌短470kbp以上的染色體DM的大腸桿菌突變體，不過，在下述[1]和[2]所述的基因或者與它們同源的基因中存在野生型大腸桿菌原來不具有的基因(以下稱為NC基因)的情況下，該源自野生型大腸桿菌的上述大腸桿菌突變體也可以不具有NC基因，其中[1〗和[2]所述的基因為[1〗thrA基因、thrB基因、thrC基因、talB基因、mog基因、htgA基因、dnaK基因、dnaJ基因、hokC基因、nhaA基因、nhaR基因、rpsT基因、ribF基因、ileS基因、lspA基因、fkpB基因、lytB基因、dapB基因、carA基因、carB基因、caiF基因、caiE基因、caiD基因、caiC基因、caiB基因、caiA基因、caiT基因、fixA基因、fixB基因、fixC基因、fixX基因、kefC基因、folA基因、apaH基因、apaG基因、ksgA基因、pdxA基因、surA基因、,imp基因、djlA基因、rluA基因、hepA基因、polB基因、araD基因、ara人基因、araB基因、araC基因、tbpA基因、leuD基因、leuC基因、leuB基因、leuA基因、leuL基因、leu0基因、ilvl基因、ilvH基因、fruR基因、ftsL基因、ftsl基因、murE基因、murF基因、mraY基因、murD基因、ftsW基因、murG基因、murG基因、ddlB基因、ftsQ基因、ftsA基因、ftsZ基因、lpxC基因、基因、mutT基因、yacE基因、guaC基因、hofC基因、hofB基因、ppdD基因、nadC基因、ampD基因、ampE基因、aroP基因、pdhR基因、aceE基因、aceF基因、lpdA基因、acnB基因、,speD基因.>speE基因、gcd基因、hpt基因、yadF基因、panD基因、panC基因、panB基因、htrE基因、ecpD基因、folK基因、pcnB基因、dksA基因、sfsA基因、ligT基因、hrpB基因、ponB基因、hemL基因、pfs基因、dgt基因、htrA基因、dapD基因、,glnD基因、map基因、,rpsB基因、tsf基因、,smb基因、rrf基因、dxr基因、rth基因、cdsA基因、yaeL基因、hlpA基因、lpxD基因、fabZ基因、lpxA基因、lpxB基因、rnhB基因、dnaE基因、acc人基因、ldcC基因、mesJ基因、.rof基因、cutF基因、proS基因、rcsF基因、abc基因、dniR基因、gloB基因、rnhA基因、dnaQ基因、upl8基因、gmhA基因、pepD基因、gpt基因、crl基因、phoE基因、proB基因、proA基因、hemB基因、proC基因、aroL基因、aroM基因、ar"基因、sbcC基因、sbcD基因、phoB基因、phoR基因、brnQ基因、proY基因、malZ基因、,queA基因、.tgt基因、secD基因、S6CF基因、tsx基因、ribD基因、ribH基因、nusB基因、thiL基因、PgpA基因、dxs基因、ispA基因、xseB基因、thil基因、thiJ基因、apbA基因、cyoE基因、cyoD基因、cyoC基因、cyoB基因、cyoA基因、ampG基因、bolA基因、tig基因、clpP基因、clpX基因、lon基因、hupB基因、cof基因、mdlA基因、mdlB基因、glnK基因、amtB基因、tesB基因、maa基因、hha基因、acrB基因、acr人基因、acrH基因、aefA基因、priC基因、apt基因、dnaX基因、recR基因、htpG基因，adk基因、hemH基因、,aes基因、gsk基因、fsr基因、ushA基因、cueH基因、gcl基因、gip基因、purK基因、purE基因、ybbF基因、ppiB基因、cysS基因、folD基因、sfmA基因、sfmC基因、sfmD基因、sfmH基因、sfmF基因、fimZ基因、entD基因'.fepA基因、fes基因、entF基因、fepE基因、fepC基因、fepG基因、fepD基因、fepB基因、entC基因、entE基因、entB基因、entA基因、cstA基因、dsbG基因、ahpC基因、ahpF基因、rnk基因、rna基因、citT基因、citG基因、citX基因、citF基因、citE基因、citD基因、citC基因、citA基因、citB基因、dcuC基因、dcuC基因、crcA基因、cspE基因、crcB基因、lipA基因、lipB基因、dacA基因、rlpA基因、mrdB基因、mrdA基因、phpB基因、nadD基因、holA基因、rlpB基因，.leuS基因、lnt基因、phoL基因、ubiF基因、asnB基因、nagD基因、nagC基因、nagA基因、nagB基因、nagE基因、glnS基因.、fur基因、fldA基因、seqA基因，.pgm基因、potE基因、speF基因、kdpE基因、kdpD基因、kdpC基因、kdpB基因、kdpA基因、phrB基因、end8基因、abrB基因、glU基因、sdhC基因、sdhD基因、sdhA基因、sdhB基因、sucA基因、sucB基因、sucG基因、sucD基因、farR基因、hrsA基因、cydA基因、cydB基因、tolQ基因、tolR基因、tolA基因、tolB基因.、pal基因、nadA基因、pnuC基因、czcD基因、aroG基因、gpmA基因、galM基因、galK基因、galT基因、galE基因、modF基因、modE基因、modA基因、modB基因、modC基因、bioA基因、bioB基因、bioF基因、bioC基因、bioD基因、uvrB基因、moaA基因、moaB基因、moaG基因、moaD基因、moaE基因、rhlE基因、dps基因、ompX基因、mipB基因、moeB基因、moe人基因、mdfA基因、grxA基因、poxB基因、aqpZ基因、cspD基因、clpA基因、infA基因、aat基因、cydC基因、cydD基因、trxB基因、lrp基因、ftsK基因、lolA基因、serS基因、dmsA基因、dmsB基因、dmsC基因、pflA基因、pflB基因、focA基因、serC基因、aroA基因、cmk基因、rpsA基因、himD基因、msbA基因、lpxK基因、kdsB基因、smtA基因、mukF基因、kicA基因、mukB基因、aspC基因、ompF基因、asnS基因、pncB基因、pepN基因、ssuB基因、ssuC基因、ssuD基因、ssuA基因、ssuE基因、pyrD基因、uup基因、pqiA基因、pqiB基因、rmf基因、fabA基因、ompA基因、sulA基因、helD基因、mgsA基因、acyP基因、hyaA基因、hyaB基因、hyaC基因、hyaD基因、hyaE基因、hyaF基因、appC基因、appB基因、appA基因、csgG基因、csgF基因、csgE基因、csgD基因、csgB基因、csgA基因、csgC基因、sfaA基因、mdoG基因、mdoH基因、msyB基因、htrB基因、solA基因、dinl基因、pyrC基因、grxB基因、rimJ基因、mviM基因、mviN基因、HgN基因、flgM基因、flgA基因、flgB基因、HgC基因、HgD基因、flgE基因、flgF基因、flgG基因、flgH基因、flgl基因、flgJ基因、flgK基因，.HgL基因、rri6基因、rluC基因、rpmF基因、plsX基因、fabH基因、fabD基因、fabG基因、acpP基因、fabF基因、pabC基因、tmk基因、holB基因、ptsG基因、fhuE基因、nagZ基因、,ndh基因、mfd基因、ycfU基因、ycfV基因、ycfW基因、cobB基因、potD基因、potC基因、potB基因、potA基因、pepT基因、phoQ基因、phoP基因、purB基因、trmU基因、icdA基因、minE基因、minD基因、minC基因、clyA基因、umuD基因、umuG基因、dsbB基因、nhaB基因、fadR基因、dadA基因、dadX基因、ldcA基因、mltE基因、tagl基因、treA基因、dhaR基因'.pth基因、prsA基因、ychB基因、hemM基因、hemA基因、prfA基因、hemK基因、kdsA基因、chaA基因、chaB基因、chaC基因、narL基因、narX基因、基因、narG基因、narH基因、narJ基因、narl基因，.tpr基因、purU基因、sprE基因、galU基因、,hns基因、tdk基因、adhE基因、oppA基因、oppB基因、oppC基因、,oppD基因、oppF基因、cls基因，,kch基因、tonB基因、trpA基因、trpB基因、trpC基因、trpD基因、trpE基因、trpL基因、btuR基因、sohB基因、topA基因、cysB基因、acii人基因、ribA基因、pgpB基因、pyrF基因、osmB基因，.rnb基因、6HVM基因、sapF基因、sapD基因、sapC基因、sapB基西、sapA基西、aldH基因、ordL基因、goaG基因、pspF基因、pspA基因、pspB基因、pspC基因、pspD基因、pspE基因、sucP基因、,ompG基因、tyrR基因、tpx基因、mppA基因、,fnr基因、ogt基因、dbpA基因、intR基因、lar基因、recT基因、recE基因、racC基因、>kil基因、sieB基因、racH基因、dnaC基因、'enpP基因、trkG基因、VMTH一LAMBD基因、VL0M丄AMBD基因、tnp0基因、upo3基因、ompN基因、nifJ基因、hslJ基因、ldhA基因、feaR基因、feaB基因、tynA基因、paaZ基因、paaA基因、paaB基因、paaC基因、paaD基因、paaE基因、paaF基因、paaG基因、paaH基因、paal基因、paaJ基因、paaK基因、paaX基因、paaY基因、acpD基因、hrpA基因、aldA基因、gapC基因、,gapC基因、cybB基因、trg基因、rimL基因、tehA基因、tehB基因、prtC基因、potA基因、potC基因、ansP基因、nhoA基因、narV基因、narW基因、narY基因、narZ基因、narU基因、fdnG基因、fdnH基因、fdnl基因、adhP基因、sfcA基因、rpsV基因、osmC基因、dos基因、xasA基因、gadB基因、pqqL基因、chuR基因、hipA基因、hipB基因、,tam基因、腿B基因、marG基因、marR基因、marA基因、marB基因、dcp基因、lycV基因、dicA基因、dicB基因、rspB基因、rspA基因、speG基因、dmsB基因、dmsC基因、bioD基因、mlc基因、asr基因、ebr基因、pntB基因、pntA基因、arcD基因、rsU基因、rstB基因、tus基因、fumC基因、f頭A基因、manA基因、uidC基因、uidB基因、uidA基因、uidR基因、hdhA基因、mail基因、malX基因、malY基因1、add基因、blr基因、,nth基因、gst基因、pdxY基因、tyrS基因、pdxH基因、slyB基因、slyA基因、sodC基因、nemA基因'>gloA基因、rnt基因、lhr基因、sodB基因、ar"基因、purR基因、cfa基因、ribE基因、ag43基因、phsC基因、nrfC基因、pykF基因、lpp基因、sufS基因、aroD基因、ppsA基因、aroH基因、nlpC基因、btuD基因、btuE基因、btuC基因、himA基因、pheT基因、pheS基因、pheM基因、rplT基因、rpml基因、infC基因、thrS基因、arp基因、pfkB基因、cedA基因、katE基因、celF基因、celD基因、celC基因、celB基因、celA基因、osmE基因、nadE基因、spy基因、astE基因、astB基因、astD基因、astA基因、cstC基因、xthA基因、gdhA基因、topB基因、selD基因、sppA基因、ans人基因、tdh基因、gapA基因、ttuC基因、caiT基因、rnd基因、fadD基因、slp基因、pabB基因、sdaA基因、manX基因、manY基因、manZ基因、rrmA基因、cspC基因、kdgR基因.,tcmA基因、htpX基因、pre基因、pqiB基因、.pphA基因、holE基因、exoX基因、ptrB基因、purT基因、eda基因、edd基因、zwf基因、pykA基因、mlt基因、znu人基因、znuG基因、ruvB基因、ruv人基因、ruvG基因、ntpA基因、aspS基因、bisZ基因、torY基因、cutC基因,,argS基因、pgsA基因、請n基因、cbl基因、nac基因、agal基因、mtr基因、deaD基因、nlpl基因、pnp基因、rps0基因、truB基因、rbfA基因、infB基因、IIUS人基因、argG基因、secG基因、mrsA基因、folP基因、ftsH基因、ftsJ基因、greA基因、dacB基因、yhbZ基因、rpmA基因、rplU基因、ispB基因、,nlp基因、murA基因、yrbl基因、yrbK基因、rpoN基因、ptsN基因、pts0基因、mtgA基因、arcB基因、gltB基因、醒丁基因、npl基因、nanll基因、dcuD基因、sspB基因、sspA基因、rpsl基因、rplM基因、,hhoA基因'.hhoB基因、mdh基因、argR基因、tldD基因、rng基因、mreD基因、mreG基因、mreB基因、accB基因、accG基因、panF基因、prmA基因、fis基因、,aroE基因.>smg基因、smf基因、def基因、fmt基因、sun基因、trkA基因、mscL基因、zntR基因、rplQ基因、rpoA基因、rpsD基因、rpsK基因、rpsM基因、rpmJ基因、secY基因、rpl0基因、rpmD基因、rpsE基因、rplR基因、rplF基因、rpsH基因、rpsN基因、rplE基因、rplX基因、rplN基因、rpsQ基因、rpmC基因、rplP基因、rpsC基因、rplV基因、rpsS基因、rplB基因、rplW基因、rplD基因、rplC基因、rpsJ基因、tufA基因、fusA基因、rpsG基因、rpsL基因、fkpA基因、slyX基因、slyD基因、kefB基因、prkB基因、crp基因、argD基因、pabA基因'.fic基因、ppiA基因、nirB基因、nirD基因、.nirC基因、cysG基因、php基因、trpS基因、gph基因、rpe基因、dam基因、damX基因、aroB基因、aroK基因、hofQ基因、mrc人基因、pckA基因、envZ基因、oinpR基因、greB基因、feoA基因、feoB基因、bioH基因、gntT基因、malQ基因、malP基因、malT基因、rtcA基因、rtcB基因、rtcR基因、glpR基因、glpG基因、glpE基因、glpD基因、glgP基因、glgA基因、glgC基因、glgX基因、glgB基因、asd基因、gntU基因、gntU基因、gntK基因、gntR基因、ggt基因、ugpQ基因、ugpC基因、ugpE基因、ugpA基因、ugpB基因、livF基因、livG基因、livM基因、livH基因、livK基因、livJ基因、rpoH基因、ftsX基因、ftsE基因、ftsY基因、atzN基因、nikA基因、nikB基因、nikC基因、nikD基因、nikE基因、pitA基因、uspB基因、uspA基因、prlC基因、,gor基因、arsH基因、arsB基因、arsC基因、slp基因、hdeB基因、hdeA基因、hdeD基因、gadA基因、treF基因、kdgK基因、dctA基因、dppF基因、dppD基因、dppC基因、dppB基因、dppA基因、tag基因、bisC基因、cspA基因、giys基因、glyQ基因、xylB基因、xylA基因、xylF基因、xylG基因、xylH基因、xylR基因、bax基因、malS基因、avtA基因、lyx基因、sgbH基因、sgbU基因、sgbE基因、aldB基因、selB基因、selA基因、mtlA基因、mtlD基因、mtlR基因、lldP基因、lldR基因、lldD基因、cysE基因、gpsA基因、secB基因'.grxC基因、tdh基因、kbl基因、htrL基因、rfaD基因、rfaF基因、rfaC基因、rfaL基因、rfaK基因、rfaZ基因、rfaY基因、rfaJ基因、rfal基因、rfaB基因、rfaS基因、rfaP基因、rfaG基因、rfaQ基因、kdtA基因、kdtB基因、mutM基因、rpmG基因、rpmB基因、radC基因、dfp基因、,dut基因、ttk基因、pyrE基因、rph基因、dinD基因、gmk基因、rpoZ基因、spoT基因、spoU基因、recG基因、gltS基因、nlpA基因、uhpT基因、uhpC基因、uhpB基因、uhpA基因、ilvN基因、ilvB基因、ivbL基因、emrD基因、ibpB基因、ibpA基因、gyrB基因、recF基因、dnaN基因、dnaA基因、rpmH基因、rnpA基因、yidC基因、thdF基因、tnaL基因、tnaA基因、tnaB基因、bglB基因、bglF基因、bglG基因、phoU基因、pstB基因、pstA基因、pstC基因、pstS基因、glmS基因、glmU基因、atpC基因、uncD基因、atpG基因、atpA基因、atpH基因、atpF基因、atpE基因、atpB基因、atpl基因、gidB基因、gidA基因、mioC基因、asnC基因、pssR基因、ilvL基因、ilvG基因、ilvM基因、ilvE基因、ilvD基因、UvA基因、ilvY基因、ilvC基因、ppiC基因、,rep基因、gppA基因、rhlB基因、trxA基因、rhoL基因,>rho基因、rfe基因、wzzE基因、nfrC基因、rffD基因、rffG基因、rffH基因、rffA基因、wzxE基因、rffT基因、wecG基因、aslB基因、aslA基因、hemY基因、hemX基因、hemD基因、hemC基因、cyaA基因、cyaY基因、dapF基因、xerG基因、uvrD基因、co"基因、radD基因、pldA基因、recQ基因、pldB基因、metR基因、metE基因、udp基因、ubiE基因、aarF基因、tatC基因、tatD基因、rfaH基因、ubiD基因、ubiB基因、fadA基因、fadB基因、pepQ基因、trkH基因、trkH基因、hemG基因、mobB基因、mobA基因、dsbA基因、polA基因、yihA基因、hemN基因、ntrC基因、ntrB基因、glnA基因、fdhE基因、fdol基因、fdoH基因、fdoG基因、fdhD基因、sodA基因、kdgT基因、cpxA基因、cpxR基因、,cpxP基因、pfkA基因、sbp基因、cdh基因、tpiA基因、fpr基因、glpX基因、glpK基因、glpF基因、m6nG基因、menA基因、hslU基因、hslV基因、ftsN基因、cytR基因、priA基因、rpmE基因、metJ基因、metB基因、metL基因、metF基因、katG基因、gldA基因、talC基因、ppc基因、argE基因、argC基因、argB基因、argH基因、oxyR基因、udhA基因、trmA基因、btuB基因、murl基因、murB基因、birA基因、co"基因、tufB基因、secE基因、nusG基因、rplK基因、rplA基因、rplJ基因、rplL基因、rpoB基因、rpoC基因、htrC基因、thiH基因、thiG基因、thiS基因、thiF基因、thiE基因、thiC基因，.rsd基因、hemE基因、nfi基因、hupA基因、hydH基因、hydG基因、purD基因、purH基因、metA基因、aceB基因、ace人基因、ac6K基因、arp基因、iclR基因、metH基因、pepE基因、lysC基因、pgi基因、ubiC基因、ubiA基因、plsB基因、dgkA基因、lexA基因、dinF基因、,qor基因、dnaB基因、alr基因、tyrB基因、napA基因、hobH基因、證A基因、ssb基因、soxS基因、soxH基因、acs基因、〗mrfA基因、nrfB基因、nrfC基因、nrfD基因、nrfE基因、nrfF基因、nrfG基因、gltP基因、fdhF基因、alsR基因、rpiB基因、proP基因、basS基因、basR基因、adiY基因.、adi基因、melR基因、melA驀因、melB基因、funiB基因、dcuB基因、dcuR基因、dcuS基因、lysU基因、cadA基因、cadB基因i、cadC基因、cutA3基因、cutA2基因、cutA基因、dcuA基因、aspA基因、fxsA基因、groES基因、groEL基因、efp基因、ecnB基因、sugE基因.,blc基因、ampC基因、frdD基因、frdC基因、frdB基因、,frdA基因.、genX基因、psd基因、yjeQ基因、yjeE基因、amiB基因、,mutL基因、miaA基因、hfq基因、hflX基因、hflK基因、hflC基因、purA基因、vacB基因、sgaE基因、rpsF基因、priB基因、rpsR基因、rpll基因、fklB基因、cycA基因、cpdB基因、cysQ基因、msrA基因、,chpS基因、chpB基因、ppa基因、fbp基因、mpl基因、pmbA基因、cybC基因、nrdG基因、nrdD基因、treC基因、treB基因、treR基因、mgtA基因、pyrl基因、pyrB基因、pyrBI基因、argl基因、valS基因、holC基因、xerB基因、idnR基因、idnT基因、idn0基因、idnD基因、idnK基因、fecE基因、fecD基因、fecC基因、fecB基因、fecA基因、fecR基因、fecl基因、dnaC基因、dnaT基因、bglJ基因、fhuF基因、rsmG基因、holD基因、riml基因、prfC基因、osmY基因、deoC基因、deoA基因、deoB基因、deoD基因、lplA基因、smp基因、serB基因、radA基因、nadR基因、slt基因、trpR基因、gpmG基因、rob基因、cre人基因、creB基因、creG基因、creD基因、arc人基因、lasT基因、thrL基因[2]acrE基因、argT基因、artl基因、artJ基因、artM基因、artP基因、artQ基因、bfr基因、chiA基因、chpA基因、dacC基因、deoR基因、dinG基因、elaA基因、elaB基因、elaC基因、elaD基因、envD基因、envR基因、fhuA基因、fhuB基因、fhuC基因、fhuD基因、folX基因、glnH基因、glnP基因、glnQ基因、gUJ基因、gltK基因、gltL基因、gspA基因、gspC基因、gspD基因、gspE基因、gspl基因、gspJ基因、gspK基因、gspL基因、hisJ基因、hisM基因、hisP基因、hisQ基因、hofD基因、hofF基因、hofG基因、hofH基因、UaA基因、mdaA基因、邁daB基因、pin0基因、potF基因、potG基因、potH基因、potl基因、pshM基因、ptwB基因、ptwC基因、rhsB基因、ri邁K基因、xylU基因。(2)上述(1)的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA含有具有序列號l所示鹼基序列中的下述[l]~[69]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1]1位~167064位所示的鹼基序列[2]172980位~243964位所示的鹼基序列[3]253411位~261963位所示的鹼基序列[4〗387532位~389138位所示的鹼基序列[5]403704位~518029位所示的鹼基序列6]532712位~535504位所示的鹼基序列7]550216位~563940位所示的鹼基序列8〗608119位~675103位所示的鹼基序列9]689375位~728820位所示的鹼基序列10111213141516171819202122232425262728293031323334739594位~832551位所示的鹼基序列848090位~867637位所示的鹼基序列883474位~890997位所示的鹼基序列909380位~1048887位所示的鹼基序列1097020位~1198105位所示的鹼基序列1225147位1641039位1650223位1993076位2028210位2044377位2081927位2116065位2187856位2229851位2263492位2286589位2395472位2434099位2482483位2514558位2789481位2800891位2810148位2830263位1630911位所示的鹼基序列1642631位所示的鹼基序列1964523位所示的鹼基序列1996661位所示的鹼基序列2033448位所示的鹼基序列2069148位所示的鹼基序列2104392位所示的鹼基序列2146263位所示的鹼基序列2200668位所示的鹼基序列2255894位所示的鹼基序列2270439位所示的鹼基序列2386261位所示的鹼基序列2423364位所示的鹼基序列2472851位所示的鹼基序列2505074位所示的鹼基序列2755676位所示的鹼基序列2795173位所示的鹼基序列2804307位所示的鹼基序列2825313位所示的鹼基序列2910273位所示的鹼基序列[35I2910574位'-2985361位所示的鹼基序列[363033129位'-3077084位所示的鹼基序列[37]3078917位~3110109位所示的鹼基序列[38]3134342位~3165627位所示的鹼基序列[39〗3172941位-3360736位所示的鹼基序列[40]3370548位~3411159位所示的鹼基序列[41]3420879位~3453020位所示的鹼基序列[42〗3469367位~3618575位所示的鹼基序列[43]3636917位~3854661位所示的鹼基序列[44]3865832位~3867101位所示的鹼基序列[45]3877011位~3926658位所示的鹼基序列〖46]3938879位~4059897位所示的鹼基序列[47]術9660位~4086450位所示的鹼基序列[48]4099983位'~4139231位所示的鹼基序列[49]4149710位~4235358位所示的鹼基序列[50〗4251736位~4298976位所示的鹼基序列[51]4311512位~4313317位所示的鹼基序列[52]4329722位~4409532位所示的鹼基序列[53]4423152位~4496201位所示的鹼基序列[54〗4509535位~4517875位所示的鹼基序列[55]4599638位~4641433位所示的鹼基序列[56]167065位~172979位所示的鹼基序列[57]675104位~689374位所示的鹼基序列[58]832552位~848089位所示的鹼基序列[59]867638位~883473位所示的鹼基序列[60]890998位~909379位所示的鹼基序列[61]2386262位~2395471位所示的鹼基序列[62]2423365位~2434098位所示的鹼基序列[63〗2472852位~2482482位所示的鹼基序列[64]2505075位~2514557位所示的鹼基序列[65]2910274位~2910573位所示的鹼基序列[66]3165628位~3172940位所示的鹼基序列[67]3411160位~3420878位所示的鹼基序列[68〗3453021位~3469366位所示的鹼基序列[69〗3618576位~3636916位所示的鹼基序列。(3)上述(1)或者(2)的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yafJ基因、yafK基因、yafQ基因、dinJ基因、yafL基因、yafM基因、fhiA基因、lafU基因、dinP基因、yafN基因、yafO基因、yafP基因、JW0225基因、prfH基因、ykfl基因、yafW基因、yeeT基因、ykfG基因、yafX基因、ykfF基因、ykfB基因、yafY基因、ypjK基因、yafZ基因、ykfA基因、perR基因、JW0245基因、JW0246基因、JW0247基因、ykfC基因、JW0249基因、is5B基因、yi51基因、mmuP基因、mmuM基因、afuC基因、JW0255基因、insB基因、insA基因、JW0258基因、yagB基因、yagA基因、yagE基因、yagF基因、yagG基因、yagH基因、yagl基因、argF基因、yfjl基因、yagJ基因、yagK基因、yagL基因、yagM基因、yagN基因、intF基因、yagP基因、yagQ基因、yagR基因、yagS基因、yagT基因、yagU基因、ykgJ基因、yagV基因、yagW基因、yagX基因、yagY基因、yagZ基因、ykgK基因、ykgL基因、ykgM基因、eaeH基因、JW0292基因、JW0293基因、ykgA基因、ykgB基因、ykgi基因、merA基因、ykgD基因、ykgE基因、ykgF基因、ykgG基因、ykgH基因、betA基因、betB基因、betl基因、betT基因、yahA基因、yahB基因、yahC基因、yahD基因、yahE基因、yahF基因、yahG基因、yahH基因、arcM基因、yahJ基因、yahK基因、yahL基因、yahM基因、yahN基因、yahO基因、prpR基因、bcpA基因、prpC基因、prpD基因、prpE基因、codB基因、codA基因、cynR基因、cynT基因、cynS基因、cynX基因、lacA基因、lacY基因、lacZ基因、lacl基因、mhpR基因、mhpA基因、mhpB基因、mhpC基因、mhpD基因、mhpF基因、mhpE基因、mhpT基因、yaiL基因、yaiM基因、adhC基因、yaiN基因、yai0基因、JW0350基因、yi2A基因、yi22基因、yi24基因、yi23基因、yaiP基因、yaiS基因、tauA基因、tauB基因、tauC基因、ssiD基因、yaiT基因、JW0363基因、JW0364基因、yaiU基因、yaiV基因、ampH基因、sbmA基因、yaiW基因、yaiY基因、yaiZ基因、ddlA基因、yaiB基因、phoA基因、psiF基因、yaiC基因、ybbO基因、tesA基因、ybbA基因、ybbP基因、rhsD基因、ybbC基因、rhsE基因、ybbD基因、JW0490基因、ybbB基因、ybbS基因、ybbT基因、ybbU基因、ybbQ基因、ybbV基因、allP基因、allA基因、ybbY基因、ybbZ基因、ylbA基因、allC基因、ylbC基因、fdrA基因、ylbE基因、ylbF基因、arcC基因、intD基因、EXO-LAMBD基因、VRPP—LAMBD基因、JW0528基因、JW0529基因、VREN-LAMBD基因、emrE基因、ybcK基因、ybcL基因、ybcM基因、ybcN基因、ninE基因、ybcO基因、rus基因、ybcQ基因、JW0539.5基因、nmpC基因、vlyS基因、ybcS基因、ybcT基因、vboR基因、ybcV基因、ybcW基因、nohB基因、ybcX基因、ybcY基因、JW0552基因、appY基因、ompT基因、envY基因、ybcH基因、nfrA基因、nfrB基因、cusS基因、cusR基因、cusC基因、ylcC基因、cusB基因、cusA基因、pheP基因、ybdG基因、nfnB基因、ybdF基因、ybdJ基因、ybdK基因、hokE基因、yi81基因、yi82基因、ymcC基因、ymcD基因、cspH基因、cspG基因、sfa基因、yccL基因、yccM基因、torS基因、torT基因、torR基因、torC基因、torA基因、torD基因、yccD基因、cbpA基因、yccE基因、agp基因、yccJ基因、wrbA基因、yciG基因、ycdG基因、JW0992基因、腦993基因、JW0994基因、ycdK基因、JW0996基因、JW0997基因、ycdC基因、putA基因、yzpU基因、putP基因、JW1002基因、ycdO基因、ycdB基因、phoH基因、ycdP基因、ycdQ基因、ycdR基因、ycdS基因、ycdT基因、JW1012基因、JW1013基因、JW1014基因、ycdU基因、ymfD基因、ymfE基因、lit基因、intE基因、VXIS—BPP21基因、ymfH基因、ymfl基因、ymfJ基因、RPC2-BPP22基因、JW1132基因、ymfL基因、ymfM基因、ymfN基因、ymfR基因、ymfO基因、JW1138基因、JW1139基因、ycfK基因、ymfS基因、ycfA基因、ycfE基因、pin基因、mcrA基因、JW1146基因、ycgW基因、ycgX基因、ycgE基因、JW1150基因、ycgZ基因、ymgA基因、JW1153基因、ymgC基因、yahA基因、JW1156基因、JW1157基因、aidA基因、ymgD基因、JW1160基因、JW1161基因、JW1162基因、ydfH基因、ydfZ基因、ydfl基因、shiA基因、JW1537基因、tnpR基因、ydfM基因、Y314-LAMBD基因、nohA基因、ydfO基因、yccL基因、cspl基因、ydfR基因、vlyS基因、cspB基因、cspF基因、regQ—LAMBD基因、JW1552基因、rem基因、hokD基因、relE基因、relB基因、ydfV基因、flxA基因、ydfW基因、ydfX基因、dicC基因、sdaC基因、yqeH基因、yqel基因、yqeJ基因、yqeK基因、ygeF基因、ygeG基因、ygeH基因、ygel基因、JW2822基因、ygeK基因、JW2824基因、JW2825基因、JW2830基因、ygeP基因、JW2832基因、nlpD基因、yagR基因、ygeT基因、JW2836基因、ygeV基因、ygeW基因、dpaL基因、ygeY基因、ygeZ基因、arcL基因、yqeB基因、JW2844基因、ygfJ基因、gltD基因、JW2847基因、ygfM基因、yagR基因、ygfO基因、ygfP基因、ygfQ基因、ygfR基因、ygfS基因、ygfT基因、pbuX基因、idi基因、epsM基因、exeL基因、exeC基因、JW2938基因、JW2939基因、JW2940基因、JW2941基因、yghK基因、glcB基因、glcG基因、glcF基因、glcD基因、glcC基因、JW2948基因、yghQ基因、yghR基因、yghS基因、yghT基因、yihL基因、yihM基因、yihN基因、yshA基因、yihO基因、yihP基因、yihQ基因、yihR基因、yihS基因、yihT基因、yihU基因、yihV基因、yihW基因、yihX基因、rbn基因、yihZ基因、yiiD基因、yiiE基因、yiiF基因、yiiG基因、frvR基因、frvX基因、frvB基因、frvA基因、yiiL基因、rhaD基因、rhaA基因、rhaB基因、rhaS基因、rhaR基因、rhaT基因、ptsA基因、JW3920基因、frwC基因、frwB基因、pflD基因、pflC基因、frwD基因、yijO基因、yijP基因、JW3986基因、yjbF基因、yjbG基因、yjbH基因、JW3989.5基因、yjbA基因、xylE基因、malG基因、malF基因、malE基因、malK基因、lamB基因、malM基因、yjbl基因、yjcP基因、yjcQ基因、yjcR基因、yjcS基因、alsK基因、alsE基因、alsC基因、alsA基因、alsB基因、phnQ基因、phnP基因、phn0基因、phnN基因、phnM基因、phnL基因、phnK基因、phnJ基因、phnl基因、phnH基因、phnG基因、phnF基因、phnE基因、phnD基因、phnC基因、phnB基因、phnA基因、yjdA基因以及yjcZ基因。(4)上述(1)~(3)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1]~[18]所述鹼基序列的DM、或者與它們相當的DM:[1〗鹼基編號243965位~253410位所示的鹼基序列[2]鹼基編號261964位~387531位所示的鹼基序列[3]鹼基編號389139位~403703位所示的鹼基序列[4]鹼基編號518030位~532711位所示的鹼基序列[5]鹼基編號535505位~550215位所示的鹼基序列[6〗鹼基編號563941位~608118位所示的鹼基序列[7]鹼基編號1048888位~1097019位所示的鹼基序列[8]鹼基編號1198106位~1225146位所示的鹼基序列[9]鹼基編號1630912位~1641038位所示的鹼基序列[10]鹼基編號1642632位~1650222位所示的鹼基序列[11]鹼基編號2985362位~3033128位所示的鹼基序列[12]鹼基編號3110110位~3134341位所示的鹼基序列[13]鹼基編號4059898位~4079659位所示的鹼基序列[14]鹼基編號4086451位~4099982位所示的鹼基序列[15]鹼基編號4139232位~4149709位所示的鹼基序列[16]鹼基編號4235359位~4251735位所示的鹼基序列[17]鹼基編號4298977位~4311511位所示的鹼基序列[18]鹼基編號4313318位4329721位所示的鹼基序列。(5)上述(1)~(4)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yidF基因、yidG基因、yidH基因、yidl基因、yidJ基因、yidK基因yidL基因、JW3657基因、glvG基因、glvB基因、glvC基因、yidP基因、yidE基因、yidQ基因、yidR基因、yidS基因、dgoT基因、dgoA基因、dgoK基因、dgoR基因、yidW基因、yidX基因、yidA基因、yidB基因、asnA基因、yieM基因、JW3724基因、yieN基因、kup基因、rbsD基因、rbsA基因、rbsC基因、rbsB基因、rbsK基因、rbsR基因以及yieO基因。(6)上述(1)~(5)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1]~[3]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1]鹼基編號3854662位~3865831位所示的鹼基序列[2]鹼基編號3867102位~3877010位所示的鹼基序列[3]鹼基編號3926659位~3938878位所示的鹼基序列。(7)上述(1)~(6)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DM，所述基因為yecT基因、flhE基因、flhA基因、flhB基因、cheZ基因、cheY基因、cheB基因、cheR基因、tap基因、tar基因、cheW基因、cheA基因、motB基因、motA基因、flhC基因、flhD基因、JW1882基因、JW1883基因、yecG基因、otsA基因、otsB基因、araH基因、araG基因、araF基因、yecl基因、yecJ基因、JW1892基因、ftn基因、yecH基因、tyrP基因、uvrC基因、uvrY基因、yecF基因、sdiA基因、yecC基因、yecS基因、yed0基因、fliY基因、fliZ基因、fliA基因、fliC基因、fliD基因、fliS基因、fliT基因、amyA基因、yedD基因、yedE基因、yedF基因、yedK基因、yedL基因、yedN基因、yedM基因、fliE基因、fliF基因、fliG基因、fliH基因、flil基因、fliJ基因、fliK基因、fliL基因、fliM基因、fliN基因、fli0基因、fliP基因、fliQ基因、fliR基因、rcsA基因、dsrB基因、JW1937基因、yedA基因、vsr基因、dcm基因、yedJ基因、JW1946基因、ompC基因、JW1948基因、yedS基因、yedU基因、yedV基因、copR基因、yedX基因、JW1954基因、JW1955基因、JW1956基因、JW1974基因、JW1979基因、JW1980基因、yeeP基因、flu基因、JW1983基因、yeeS基因、yeeU基因、yeeV基因、yeeW基因、yefJ基因、JW2013基因、yefJ基因、yefl基因、wbbJ基因、yefG基因、rfc基因、glf基因、rfbX基因、rfbC基因、rfbA基因、rfbD基因以及rfbB基因。(8)上述(1)~(7)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1]~[5]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1]鹼基編號1964524位~1993075位所示的鹼基序列[2]鹼基編號1996662位~2028209位所示的鹼基序列[3]鹼基編號2033449位~2044376位所示的鹼基序列[4]鹼基編號2069149位~2081926位所示的鹼基序列[5〗鹼基編號2104393位~2116064位所示的鹼基序列。(9)上述(1)~(8)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為intA基因、yfjH基因、alpA基因、yfjl基因、JW2606基因、yfjJ基因、yfjK基因、yfjL基因、yfjM基因、yfjN基因、yfjO基因、yfjP基因、yfjQ基因、yfjR基因、ypjK基因、yfjS基因、yfjT基因、yfjU基因、yfjV基因、JW2622基因、yfjW基因、JW2623.5基因、yfjX基因、yfjY基因、yfjZ基因、ypjF基因、ypjA基因、JW2629基因、JW2630基因、JW2631基因、JW2632基因、JW2633基因、JW2634基因、ygaE基因、yzzM基因、yqaE基因、JW2642基因、ygaP基因、stpA基因、JW2645基因、ygaC基因、ygaM基因、nrdH基因、nrdl基因、nrdE基因、proV基因、proW基因、proX基因、JW2655基因、JW2656基因、ygaZ基因、ygaH基因、srlA基因、srlB基因、srlD基因、gutM基因、srlR基因以及gutQ基因。(10)上述(I)~(9)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DM不含序列號1所示鹼基序列中的下述[1]~[4]所述鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1]鹼基編號2755677位~2789480位所示的鹼基序列鹼基編號2795174位~2800890位所示的鹼基序列[3〗鹼基編號2804308位~2810147位所示的鹼基序列[4]鹼基編號2825314位~2830262位所示的鹼基序列。(11)上述(l)~(10)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含gltF基因、yhcA基因、yhcD基因、yhcE基因、yhcF基因、yhcG基因、yhcH基因、nanK基因以及nanE基因、或者與它們同源的基因。(12)上述(1)~(ll)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3360737位~3370547位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。(13)上述(1)~(12)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yegE基因、alkA基因、yegD基因、JW2055基因、JW2056基因、JW2057基因、JW2058基因、yegM基因、yegN基因、yegO基因、yegB基因、baeS基因、baeR基因、JW2065基因、yegQ基因、ogrK基因、JW2068基因、JW2069基因、yegS基因、gatR基因、JW2072基因、JW2073基因、gatR基因、gatD基因、gatC基因、gatB基因、gatA基因、gatZ基因、gatY基因、fbaB基因、xegT基因、yegU基因、yegV基因、yegW基因、yegX基因、molR基因、yehl基因、yehK基因、yehL基因、yehO基因、yehP基因、yehQ基因、yehR基因、yehS基因、yehT基因、yehU基因、yehV基因、yehW基因、yehX基因、yehY基因、yehZ基因、bglX基因、dld基因、pbpG基因、yohC基因、yeiQ基因、yeiR基因、yeiU基因、spr基因、rtn基因、yejA基因、yejB基因、yejE基因、yejF基因、yejG基因、bcr基因、rsuA基因、yejH基因、yeil基因、yeiJ基因、yeiK基因、yeiL基因、yeiM基因、yeiN基因以及yeiC基因。(14)上述(1)~(13)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1]~[4]所述鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DM:鹼基編號2146264位~2187855位所示的鹼基序列[2]鹼基編號2200669位~2229850位所示的鹼基序列[3]鹼基編號2270440位~2286588位所示的鹼基序列[4]鹼基編號2255895位~2263491位所示的鹼基序列。(l"上述(1)~(14)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DM不含cmtA基因以及cmtB基因、或者與它們同源的基因。(16)上述(1)~(15)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DM不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3077085位~3078916位所示的鹼基序列的DM、或者與該DNA相當的DNA。(17)上述(1)~(16)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為intB基因、JW4228基因、yjgW基因、yjgX基因、yjgY基因、yjgZ基因、yi41基因、yi42基因、yjhB基因、yjhC基因、yjhD基因、yjhE基因、yi91基因、JW4244基因、JW4245基因、JW4246基因、yjhU基因、yjhF基因、yjhG基因、yjhH基因、yjhl基因、sgcR基因、sgcE基因、sgcA基因、sgcQ基因、sgcC基因、JW4266.5基因、sgcX基因、yjhP基因、yjhQ基因、JW4269.5基因、JW4270基因、JW4270.5基因、yjhR基因、yjhS基因、yjhT基因、yjhA基因、fimB基因、fimE基因、fimA基因、fiml基因、fimC基因、fimD基因、fimF基因、fimG基因、fimH基因、gntP基因、uxuA基因、uxuB基因、uxuR基因、yjiC基因、yjiD基因、yjiE基因、iadA基因、yjiG基因、yjiH基因、yjil基因、yjiJ基因、yjiK基因、JW4296.5基因、yjiL基因、yjiM基因、yjiN基因、yji0基因、yjiP基因、yjiQ基因、yjiR基因、yjiS基因、yjiT基因、yjiV基因、mcrD基因、mcrC基因、mcrB基因、yjiW基因、hsdS基因、hsdM基因、hsdR基因、mrr基因、yjiA基因、yjiX基因、yjiY基因、tsr基因、yjjL基因、JW4320基因、yjjM基因、yjjN基因、mdoB基西以及yjjA基因。(18)上述(1)~(17)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1〗或者[2]所述鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:鹼基編號4517876位~4599637位所示的鹼基序列。(19)上述(1)~(18)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DNA不含kdpF基因、ybfA基因、rhsC基因、JW0690基因、ybfB基因、rhsA基因、ybfC基因、ybfD基因、ybfL基因、ybfD基因以及ybgA基因、或者與它們同源的基因。(20)上述(1)~(19)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號728821位~739593位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。(21)上述(1)~(20)的任何一項的的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DM不含yjfI基因、yjfJ基因、yjfK基因、yjfL基因、yjfM基因、yjfC基因、aidB基因、yjfN基因、yjfO基因、yjfP基因、yjfQ基因、yjfR基因、sgaT基因、sgaB基因、sgaA基因、sgaH基因以及sgaU基因、或者與它們同源的基因。(22)上述(1)~(21)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有不含序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號4409533位~4423151位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。(23)含有上述(1)的[1]的基因、spr基因、bcr基因以及rsuA基因、或者與它們同源的基因、且具有比野生型的大腸桿菌的染色體DNA短933kBp以上的染色體DNA的大腸桿菌突變體。(24)上述(23)的大腸桿菌突變體，其具有含有上述(2)的[1]~[55]的鹼基序列的DNA以及具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號2270440位~2286588位所示的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA的染色體DNA。(25)上述(23)或者(24)的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因的染色體DNA,所述基因為yafJ基因、yafK基因、yafQ基因、dinJ基因、yafL基因、yafM基因、fhiA基因、lafU基因、dinP基因、yafN基因、yaf0基因、yafP基因、JW0225基因、prfH基因、ykfl基因、yafW基因、yeeT基因、ykfG基因、yafX基因、ykfF基因、ykfB基因、yafY基因、ypjK基因、yafZ基因、ykfA基因、perR基因、JW0245基因、JW0246基因、JW0247基因、ykfC基因、JW0249基因、is5B基因、yi51基因、mmuP基因、mmuM基因、afuC基因、JW0255基因、insB基因、insA基因、JW0258基因、yagB基因、yagA基因、yagE基因、yagF基因、yagG基因、yagH基因、yagl基因、argF基因、yfjl基因、yagJ基因、yagK基因、yagL基因、yagM基因、yagN基因、intF基因、yagP基因、yagQ基因、yagR基因、yagS基因、yagT基因、yagU基因、ykgJ基因、yagV基因、yagW基因、yagX基因、yagY基因、yagZ基因、ykgK基因、ykgL基因、ykgM基因、eaeH基因、JW0292基因、JW0293基因、ykgA基因、ykgB基因、ykgl基因、m6r人基因、ykgD基因、ykgE基因、ykgF基因、ykgG基因、ykgH基因、betA基因、betB基因、betl基因、betT基因、yahA基因、yahB基因、yahC基因、yahD基因、yahE基因、yahF基因、yahG基因、yahH基因、arcM基因、yahJ基因、yahK基因、yahL基因、yahM基因、yahN基因、yahO基因、prpR基因、bcpA基因、prpC基因、prpD基因、prpE基因、codB基因、codA基因、cynR基因、cynT基因、cynS基因、cynX基因、lacA基因、lacY基因、lacZ基因、lacl基因、mhpR基因、mhpA基因、mhpB基因、mhpC基因、mhpD基因、mhpF基因、mhpE基因、mhpT基因、yaiL基因、yaiM基因、adhC基因、yaiN基因、yaiO基因、JW0350基因、yi2A基因、yi22基因、yi24基因、yi23基因、yaiP基因、yaiS基因、tauA基因、tauB基因、tauC基因、ssiD基因、yaiT基因、JW0363基因、JW0364基因、yaiU基因、yaiV基因、ampH基因、sbmA基因、yaiW基因、yaiY基因、yaiZ基因、ddlA基因、yaiB基因、phoA基因、psiF基因、yaiC基因、ybbO基因、tesA基因、ybbA基因、ybbP基因、rhsD基因、ybbC基因、rhsE基因、ybbD基因、JW0490基因、ybbB基因、ybbS基因、ybbT基因、ybbU基因、ybbQ基因、ybbV基因、allP基因、allA基因、ybbY基因、ybbZ基因、ylbA基因、allC基因、ylbC基因、fdrA基因、ylbE基因、ylbE基因、ylbE基因、ylbF基因、arcC基因、intD基因、EXO-LAMBD基因、VRPP-LAMBD基因、JW0528基因、JW0529基因、V羅一LAMBD基因、emrE基因、ybcK基因、ybcL基因、ybcM基因、ybcN基因、ninE基因、ybc0基因、rus基因、ybcQ基因、JW0539.5基因、nmpC基因、vlyS基因、ybcS基因、ybcT基因、vboR基因、ybcV基因、ybcW基因、nohB基因、ybcX基因、ybcY基因、JW0552基因、appY基因、ompT基因、envY基因、ybcH基因、nfrA基因、nfrB基因、cusS基因、cusR基因、cusC基因、ylcC基因、cusB基因、cus人基因、pheP基因、ybdG基因、nfnB基因、ybdF基因、ybdJ基因、ybdK基因、hokE基因、yi81基因、yi82基因、ymcC基因、ymcD基因、cspH基因、cspG基因'.sfa基因、yccL基因、yccM基因、torS基因、torT基因、torR基因、torC基因、torA基因、torD基因、yccD基因、cbpA基因、yccE基因，.agp基因、yccJ基因、wrbA基因、yciG基因、ycdG基因、JW0992基因、J謂93基因、JW0994基因、ycdK基因、JW0996基因、JW0997基因、ycdC基因、putA基因、yzpU基因、putP基因、JW1002基因、ycdO基因、ycdB基因、phoH基因、ycdP基因、ycdQ基因、ycdR基因、ycdR基因、ycdS基因、ycdT基因、JW1012基因、JW1013基因、JW1014基因、ycdU基因、ymfD基因、ymfE基因、lit基因、intE基因、VXIS-BPP21基因、ymfH基因、ymfl基因、ymfJ基因、RPC2—BPP22基因、JW1132基因、ymfL基因、ymfM基因、ymfN基因、ymfR基因、ymfO基因、JW1138基因、JW1139基因、ycfK基因、ymfS基因、ycfA基因、ycfE基因、pin基因、mcrA基因、JW1146基因、ycgW基因、ycgX基因、ycgE基因、JW1150基因、ycgZ基因、ymgA基因、JW1153基因、ymgC基因、yahA基因、JW1156基因、JW1157基因、aidA基因、ymgD基因、JW1160基因、JW1161基因、JW1162基因、ydfH基因、ydfZ基因、ydfl基西、shiA基因、JW1537基因、tnpR基因、ydfM基因、Y314-LAMBD基因、nohA基因、ydf0基因、yccL基因、cspI基因、ydfR基因、vlyS基因、cspB基因、cspF基因、regQ-LAMBD基因、JW1552基因、rem基因、hokD基因、relE基因、relB基因、ydfV基因、flxA基因、ydfW基因、ydfX基因、dicC基因、sdaC基因、yqeH基因、yqel基因、yqeJ基因、yqeK基因、ygeF基因、ygeG基因、ygeH基因、ygel基因、JW2822基因、ygeK基因、JW2824基因、JW2825基因、JW2830基因、ygeP基因、JW2832基因、nlpD基因、yagR基因、ygeT基因、JW2836基因、ygeV基因、ygeW基因、dpaL基因、ygeY基因、ygeZ基因、arcL基因、yqeB基因、JW2844基因、ygfJ基因、gltD基因、JW2847基因、ygfM基因、yagR基因、ygfO基因、ygfP基因、ygfQ基因、ygfR基因、ygfS基因、ygfT基因、pbuX基因、idi基因、epsM基因、exeL基因、exeC基因、JW2938基因、JW2939基因、JW2940基因、JW2941基因、yghK基因、glcB基因、glcG基因、glcF基因、glcD基因、glcC基因、JW2948基因、yghQ基因、yghR基因、yghS基因、yghT基因、yihL基因、yihM基因、yihN基因、yshA基因、yihO基因、yihP基因、yihQ基因、yihR基因、yihS基因、yihT基因、yihU基因、yihV基因、yihW基因、yihX基因、rbn基因、yihZ基因、yiiD基因、yiiE基因、yiiF基因、yiiG基因、frvR基因、frvX基因、frvB基因、frvA基因、yiiL基因、rhaD基因、rhaA基因、rhaB基因、rhaS基因、rhaR基因、rhaT基因、ptsA基因、JW3920基因、frwC基因、frwB基因、pflD基因、pflC基因、frwD基因、yijO基因、'二基因、JW3986基因、yjbF基因、yjbG基因、yjbH基因、JW3989.5基因、yjbA基因、xylE基因、malG基因、malF基因、malE基因、malK基因、lamB基因、malM基因、yjbl基因、yjcP基因、yjcQ基因、yjcR基因、yjcS基因、alsK基因、alsE基因、alsC基因、alsA基因、alsB基因、phnQ基因、phnP基因、phnO基因、phnN基因、phnM基因、phut基因、phnK基因、phnJ基因、phnl基因、phnH基因、phnG基因、phnF基因、phnE基因、phnD基因、phnC基因、phnB基因、phnA基因、yjdA基因、yjcZ基因、yidF基因、yidG基因、yidH基因、yidl基因、yidJ基因、yidK基因、yidL基因、JW3657基因、glvG基因、glvB基因、glvC基因、yidP基因、yidE基因、yidQ基因、yidR基因、yidS基因、dgoT基因、dgoA基因、dgoK基因、dgoR基因、yidW基因、yidX基因、yidA基因、yidB基因、asnA基因、yieM基因、JW3724基因、yieN基因、kup基因、rbsD基因、rbsA基因、rbsC基因、rbsB基因、rbsK基因、rbsR基因、yie0基因、yecT基因、flhE基因、flhA基因、flhB基因、cheZ基因、cheY基因、cheB基因、cheR基因、tap基因、tar基因、cheW基因、cheA基因、motB基因、motA基因、flhC基因、flhD基因、JW1882基因、JW1883基因、yecG基因、otsA基因、otsB基因、araH基因、araG基因、araF基因、yecl基因、yecJ基因、JW1892基因、ftn基因、yecH基因、tyrP基因、uvrC基因、uvrY基因、yecF基因、sdiA基因、yecC基因、yecS基因、yed0基因、fliY基因、fliZ基因、fliA基因、fliC基因、fliD基因、fliS基因、fliT基因、amyA基因、yedD基因、yedE基因、yedF基因、yedK基因、yedL基因、yedN基因、yedM基因、fliE基因、fliF基因、fliG基因、fliH基因、flil基因、fliJ基因、fliK基因、fliL基因、fliM基因、fliN基因、fli0基因、fliP基因、fliQ基因、fliR基因、rcsA基因、dsrB基因、JW1937基因、yedA基因、vsr基因、dcm基因、yedJ基因、JW1946基因、ompC基因、JW1948基因、yedS基因、yedU基因、yedV基因、copR基因、yedX基因、JW1954基因、JW1955基因、JW1956基因、JW1974基因、JW1979基因、JW1980基因、yeeP基因、flu基因、JW1983基因、yeeS基因、yeeT基因、yeeU基因、yeeV基因、yeeW基因、yefJ基因、JW2013基因、yefJ基因、yefl基因、wbbJ基因、yefG基因、rfc基因、glf基因、rfbX基因、rfbC基因、rfbA基因、rfbD基因、rfbB基因、intA基因、yfjH基因、alpA基因、yfjl基因、JW2606基因、yfjJ基因、yfjK基因、yfjL基因、yfjM基因、yfjN基因、yfjO基因、yfjP基因、yfjQ基因、yfjR基因、ypjK基因、yfjS基因、yfjT基因、yfjU基因、yfjV基因、JW2622基因、yfjW基因、JW2623.5基因、yfjX基因、yfjY基因、yfjZ基因、ypjF基因、ypjA基因、JW2629基因、JW2630基因、JW2631基因、JW2632基因、JW2633基因、JW2634基因、ygaE基因、yzzM基因、yqaE基因、JW2642基因、ygaP基因、stpA基因、JW2645基因、ygaC基因、ygaM基因、nrdH基因、nrdl基因、nrdE基因、proV基因、proW基因、proX基因、JW2655基因、JW2656基因、ygaZ基因、ygaH基因、srlA基因、srlB基因、srlD基因、gutM基因、srlR基因、gutQ基因、gltF基因、yhcA基因、yhcD基因、yhcE基因、yhcE基因、yhcF基因、yhcG基因、yhcH基因、nanK基因、nanE基因、yegE基因、alkA基因、yegD基因、JW2055基因、JW2056基因、JW2057基因、JW2058基因、yegM基因、yegN基因、yeg0基因、yegB基因、baeS基因、baeR基因、JW2065基因、yegQ基因、ogrK基因、JW2068基因、JW2069基因、yegS基因、gatR基因、JW2072基因、JW2073基因、gatR基因、gatD基因、gatC基因、gatB基因、gatA基因、gatZ基因、gatY基因、fbaB基因、xegT基因、yegU基因、yegV基因、yegW基因、yegX基因、molR基因、yehl基因、yehK基因、yehL基因、yehO基因、yehP基因、yehQ基因、yehR基因、yehS基因、yehT基因、yehU基因、yehV基因、yehW基因、yehX基因、yehY基因、yehZ基因-,bglX基因、dld基因、pbpG基因、yohC基因、yeil基因、yeiJ基因、yeiK基因、yeiL基因、yeiM基因、yeiN基因、yeiC基因、cmtA基因、cmtB基因、intB基因、JW4228基因、yjgW基因、yjgX基因、yjgY基因、yjgZ基因、yi41基因、yi42基因、yjhB基因、yjhC基因、yjhD基因、yjhE基因、yi91基因、JW4244基因、JW4245基因、JW4246基因、yjhU基因、yjhF基因、yjhG基因、yjhH基因、yjhl基因、sgcR基因、sgcE基因、sgcA基因、sgcQ基因、sgcC基因、JW4266.5基因、sgcX基因、yjhP基因、yjhQ基因、JW4269.5基因、JW4270基因、JW4270.5基因、yjhR基因、yjhS基因、yjhT基因、yjhA基因、fimB基因、fimE基因、fimA基因、fiml基因、fimC基因、fimD基因、fimF基因、fimG基因、fimH基因、gntP基因、uxuA基因、uxuB基因、uxuR基因、yjiC基因、yjiD基因、yjiE基因、iadA基因、yjiG基因、yjiH基因、yjil基因、yjiJ基因、yjiK基因、JW4296.5基因、yjiL基因、yjiM基因、yjiN基因、yjiO基因、yjiP基因、yjiQ基因、yjiR基因、yjiS基因、yjiT基因、yjiV基因、mcrD基因、mcrC基因、mcrB基因、yjiW基因、hsdS基因、hsdM基因、hsdR基因、mrr基因、yjiA基因、yjiX基因、yjiY基因、tsr基因、yjjL基因、JW4320基因、yjjM基因、yjjN基因、mdoB基因、yjjA基因、kdpF基因、ybfA基因、rhsC基因、JW0690基因、ybfB基因、rhsA基因、ybfC基因、ybfL基因、ybfD基因、ybgA基因、yjfl基因、yjH基因、yjfK基因、yjfL基因、yjfM基因、yjfC基因、aidB基因、yjfN基因、yjfO基因、yjfP基因、yjfQ基因、yjfR基因、sgaT基因、sgaB基因、sgaA基因、sgaH基因、sgaU基因、rhsB基因、JW3448基因、yhhH基因、yibA基因、yhhl基因、yhhJ基因、yhiH基因、yhil基因、yhiJ基因、yhiK基因、yhiL基因、yhiM基因、yhiN基因、JW0782基因、ybiA基因、dinG基因、ybiB基因、yMC基因、ybiJ基因、ybil基因、ybiX基因、ybiL基因、ybiM基因、ybiN基因、ybiO基因、glnQ基因、glnP基因、glnH基因、yliA基因、yliB基因、yliC基因、yliD基因、JW0817基因、JW0818基因、yliG基因、yliH基因、ylil基因、yliJ基因、dacC基因、deoR基因、ybjG基因、ybjC基因、mdaA基因、rimK基因、ybjN基因、potF基因、potG基因、potH基因、potl基因、ybjO基因、ybjF基因、artJ基因、artM基因、artQ基因、artl基因、artP基因、ybjP基因、JW0850基因、JW0851基因、JW0852基因、ybjT基因以及ltaA基因、或者與它們同源的基因。(26)上述(23)~(25)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[l]~[43]所述鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1]鹼基編號243965位~253410位所示的鹼基序列[2]鹼基編號261964位~387531位所示的鹼基序列[3]鹼基編號389139位~403703位所示的鹼基序列[4〗鹼基編號518030位~532711位所示的鹼基序列[5]鹼基編號535505位~550215位所示的鹼基序列[6〗鹼基編號563941位~608118位所示的鹼基序列鹼基編號728821位~739593位所示的鹼基序列[8]鹼基編號832552位~848089位所示的鹼基序列[9]鹼基編號867638位~883473位所示的鹼基序列10]鹼基編號890998位~909379位所示的鹼基序列11]鹼基編號1048888位'~1097019位所示的鹼基序歹'、12]鹼基編號1198106位'~1225146位所示的鹼基序歹i,13]鹼基編號1630912位'~1641038位所示的鹼基序歹i,14]鹼基編號1642632位'~1650222位所示的鹼基序歹i，15〗鹼基編號1964524位'~1993075位所示的鹼基序歹'、16]鹼基編號1996662位~2028209位所示的鹼基序歹',17]鹼基編號2033449位~2044376位所示的鹼基序歹',18]鹼基編號2069149位'~2081926位所示的鹼基序歹'，19]2104393位~2116064位所示的鹼基序歹i20]鹼基編號2146264位~2187855位所示的鹼基序歹',21]鹼基編號2200669位~2229850位所示的鹼基序歹l22]鹼基編號2255895位~2263491位所示的鹼基序歹',23]鹼基編號2755677位~2789480位所示的鹼基序歹i24]鹼基編號2795174位~2800890位所示的鹼基序歹i25]鹼基編號2804308位~2810147位所示的鹼基序歹'26]2825314位~2830262位所示的鹼基序歹'27]鹼基編號2985362位~3033128位所示的鹼基序歹'28]1鹼基編號3077085位~3078916位所示的鹼基序歹'29]1鹼基編號3H0110位~3134341位所示的鹼基序歹'30:1鹼基編號3360737位~3370547位所示的鹼基序歹'31:1鹼基編號3618576位~3636916位所示的鹼基序歹32:4^1^編號3854662位~3865831位所示的鹼基序歹'33'14^基編號3867102位~3877010位所示的鹼基序歹34:1鹼基編號3926659位~3938878位所示的鹼基序歹351鹼基編號4059898位~4079659位所示的鹼基序歹鹼基編號4086451位~4099982位所示的鹼基序列[37]鹼基編號4139232位~4149709位所示的鹼基序列[38]鹼基編號4235359位~4251735位所示的鹼基序列[39]鹼基編號4298977位~4311511位所示的鹼基序列[40]鹼基編號4313318位~4329721位所示的鹼基序列[41]鹼基編號4409533位~4423151位所示的鹼基序列[42]鹼基編號4496202位~4509534位所示的鹼基序列[43]鹼基編號4517876位~4599637位所示的鹼基序列。(27)上述(23)~(26)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含ygiS基因、ygiT基因、ygiU基因、JW2991基因、ygiW基因、ygiX基因、ygiY基因、ygiZ基因、mdaB基因以及ygiN基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA。(28)上述(23)~(27)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DM不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3165628位~3172940位所示的鹼基序列的DM、或者與該DNA相當的DNA。(29)上述(23)~(28)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含ybeL基因、ybeQ基因、ybeR基因、ybeS基因、ybeT基因、ybeU基因、ybeV基因、ybeW基因、ybeK基因、gltL基因、gltK基因、gUJ基因、ybeJ基因以及JW0651基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA。(30)上述(23)~(29)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號675104位~689374位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。(31)上述(23)~(30)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含yfcC基因、JW2296基因、yfcE基因、yfcF基因、yfcG基因、folX基因、JW2301基因、yfcl基因、hisP基因、hisM基因、hisQ基因、hisJ基因、argT基因、yfdB基因、JW2346基因、yfdH基因、JW2348基因、yfdK基因、yfdL基因、yfdM基因、xylU基因、yfdN基因、yfdO基因、JW2356基因、JW2357基因、JW2358基因、JW2359基因、JW2360基因、JW2378基因、yqhT基因、ptwC基因以及ptwB基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA。(32)上述(23)~(31)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[l]~[3]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:鹼基編號2423365位~2434098位所示的鹼基序列[2]鹼基編號2472852位~2482482位所示的鹼基序列[3]鹼基編號2505075位~2514557位所示的鹼基序列。(33)上述(23)~(32)的任何一項的的大腸桿菌突變體，其具有不含pin0基因、gspA基因、gspC基因、gspD基因、gspE基因、hofF基因、hofG基因、hofH基因、gspl基因、gspJ基因、gspK基因、gspL基因、pshM基因、hofD基因、bfr基因、yheA基因以及chiA基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA。(34)上述(23)~(33)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DM，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3453021位~3469366位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。(35)上述(23)~(34)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含elaB基因、elaA基因、elaC基因、elaD基因、yfbK基因、yfbL基因、yfbM基因、yfbN基因、JW2269基因以及JW2270基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA。(36)上述(23)~(35)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號2386262位~2395471位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。(37)上述(23)~(36)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含yhdJ基因、yhdU基因、envR基因、acrE基因、envD基因、yhdV基因、yhdW基因、yhdX基因以及yhdY基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA。(38)上述(23)~(37)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DM不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3411160位~3420878位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。(39)上述(23)~(38)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含chpA基因、或者它的同源基因的染色體DNA。(40)上述(23)~(39)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號2910274位~2910573位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。(41)上述(23)~(40)的任何一項的的大腸桿菌突變體，其具有不含fhuA基因、fhuC基因、fhuD基因以及fhuB基因、或者與它們同源的基因的染色體DM。(")上述(23)~(41)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下迷染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號167065位~172979位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DM相當的DNA。(43)上述(1)~(42)中任何一項的大腸桿菌突變體的突變體，其是通過選擇下迷[l]~[5]的方法仁加以改變得到的緩和或者解除至少一個控制有用物質的生物合成的機制的方法；強化表達至少一種參與有用物質的生物合成的酶的方法；[3]使至少一種參與有用物質的生物合成的酶基因的拷貝數增加的方法；弱化或者抑制至少一個從有用物質的生物合成途徑向該有用物質的另外的代謝產物分支的代謝途徑的方法；相比野生型大腸桿菌而言，選擇對有用物質的類似物的耐受性高的細胞林的方法。(44)上述(1)~(43)中任何一項的大腸桿菌突變體，其中大腸桿菌是大腸桿菌K-12林、大腸桿菌B林或者大腸桿菌W林。(45)上述(44)的大腸桿菌突變體，其中大腸桿菌K-12株是大腸桿菌W3110抹(ATCC27325)或者大腸桿菌MG1655林(ATCC47076)。(46)有用物質的製造方法，其特徵在於，上述(l)~(45)中任何一項的大腸桿菌突變體在培養基中進行培養，向培養物中生成、蓄積有用物質，從該培養物回收該有用物質。(47)上述(43)~(46)的任何一項的的製造方法，其中有用物質選自蛋白質、肽、胺基酸、核酸、維生素、糖、有機酸以及脂類。發明的效果0007通過本發明能夠提供在經過一定時間的培養後，菌體量比野生型大腸桿菌多的大腸桿菌突變體、以及使用該突變體製備有用物質的方法。0008圖l是表示連接了sacB基因以及cat基因的DNA片段的結構示意圖。符號的說明0009sacB表示sacB基因、cat表示cat基因。具體實施方式0010作為野生型大腸桿菌，只要是在自然界中最高頻率可見型的大腸桿菌即可，例如可列舉屬於大腸桿菌K-12林的大腸桿菌W3110林(ATCC27325)以及大腸桿菌MG1655林(ATCC47076)、屬於大腸桿菌B林ATCC11303林、大腸桿菌W林屬於ATCC9637林等。本說明書的表1、表2、序列號1、以及國際網際網路、URL::http://gib.genes,nig.ac.jp/single/index.phpspid=Ecol_K12—W3110中記載了以JW編號限定的基因的鹼基序列，添加的"JW"J編號是日本DNA數據銀行中登記的基因編號。0011此外，序列號1所示鹼基序列是在上述國際網際網路上於2004年10月29日登記的大腸桿菌W3110株的染色體DNA的鹼基序列。含有基因的染色體DNA指的是含有特定基因的結構基因、啟動子以及操縱子等特定的具有控制功能的區域的染色體DNA。不含基因的染色體DNA指的是不含有特定基因的結構基因的一部或者全部的染色體DNA、或者不含有該基因的啟動子以及/或者操縱子等具有特定控制功能的區域的染色體DNA。0012不含結構基因的一部分的染色體DNA指只要是不含有該結構基因的一部分、且不能從該結構基因進行功能性的的蛋白質轉錄、表達的染色體DNA即可，例如由於結構基因的5，末端區域缺失而不存在起始密碼子的DNA、3，末端區域的大部分、例如總體的10%以上、優選20%以上、更優選30%以上、進一步優選40%以上缺失的染色體DNA。此外，不含在染色體DNA上相鄰的兩個基因的染色體DNA也可以是不含由兩基因間存在的鹼基序列構成的DM的染色體DNA。0013同源的基因指的是被認為在大腸桿菌種內，在基因鹼基序列上存在序列同源性的基因、或者被認為該基因所編碼的蛋白質的胺基酸序列上具有列同源性的基因。被認為具有序列同源性是指鹼基序列上具有85%以上、優選90%以上、更優選95%以上、進一步優選98%以上、特別優選99%以上的序列相似性、胺基酸序列上具有80%以上、優選90%以上、更優選95%以上、進一步優選98%以上、特別優選99%以上的序列相似性。00141與序列號1所示鹼基序列中特定的鹼基編號所示鹼基序列的DNA相當的DNA是指，與在大腸桿菌種內的具有該特定的鹼基編號所示的鹼基序列的DNA所含的基因的構成、以及在染色體DNA上的位置方面基本上相同的DNA。DNA所含的基因的構成基本上相同是指，該DNA所含的基因是一致或者相同的基因、並且如果該基因的排列順序如果相同的話，基因間的鹼基序列也可以不同。不過，在該特定的鹼基編號所示的鹼基序列的DNA中存在插入序列的情況下，與該DNA相當的DNA中也可以沒有該插入序列。染色體DNA上的位置基本上相同是指、將大腸桿菌的染色體DNA上的ThrA基因的起始密碼子腺嘌呤作為編號l，沿著ThrA基因的編碼鏈對染色體DNA的鹼基序列賦予鹼基編號時，與該特定的鹼基編號在鹼基編號上相差50以下、優選30以下、更優選10以下、進一步優選5以下的DNA。不過、在該特定的鹼基編號所示的鹼基序列DNA中存在插入序列的情況下，與該DNA相當的DNA中也可以沒有該插入序列，所以該插入序列分、可以在鹼基編號上進一步存在差異。與序列號1所示鹼基序列中的特定的鹼基編號所示的鹼基序列的DM相當的DNA是指、例如可列舉與該特定的鹼基編號所示的鹼基序列具有80%以上、優選90%以上、更優選"％以上、進一步優選98%以上、特別優選99%以上的序列相似性的DNA。0015胺基酸序列或者鹼基序列的序列相似性可以使用KarlinandAltschul的算法BLAST[Pro.Natl.Acad.Sci.USA,90，5873(1993)]或者FASTA[MethodsEnzymol.，183，63(1990)]進行測定。根據該算法BLAST,開發了稱為BLASTN或BLASTX的程序[J.Mol.Biol.，215，403(1990)]。根據BLAST,通過BLASTN分析鹼基序列的情況下，將參數設定為例如Score=100、wordlength=12。或者，根據BLAST,通過BLASTX分析胺基酸序列的情況下，將參數設定為例如score=50、wordlength=3。在使用BLAST和GappedBLAST程序的情況下，可以使用各程序默認的參數。這些分析方法的具體的操作是公知的(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)。1.本發明的大腸桿菌突變體作為本發明的大腸桿菌突變體，可列舉(l)可以是含有下述[1]和[2]所述的基因或者與它們同源的基因、且具有比野生型大腸桿菌短470kbp以上的染色體DNA的大腸桿菌突變體，也可以是具有在野生型大腸桿菌的染色體DM上存在下述[1]以及[2]的基因以及該基因的同源的基因、此外不含任何基因的染色體DNA的大腸桿菌突變體，具體而言，具有不含選自不是表1記載的基因中的上述[1]以及[2]的基因的、以及不含選自上述基因或者該基因的同源基因的染色體DNA。大腸桿菌突變體〔即、上述[l]以及的基因或者與它們同源的基因中存在野生型大腸桿菌原來不具有的基因(以下稱為NC基因)的情況下，該源自野生型大腸桿菌的上述大腸桿菌突變體也可以不具有NC基因〕。作為本發明的大腸桿菌突變體，以及[2]的基因的鹼基序列之外DNA或者與該DNA相當的DM的染色體DNA，所述[1]以及[2]的基因為[l]thrA基因、thrB基因、thrC基因dnaJ基因、hokC基因基因、dnaK基因、基因、ribF基因、基因、carA基因、基因、caiB基因、基因、fixX基因、基因、pdxA基因、基因、polB基因、基因、leuD基因、基因、ilvl基因、基因、murF基因、基因、ddlB基因、基因、mutT基因、基因、nadC基因、ileS基因'carB基因'caiA基因'kefC基因，sur人基因araD基因,leuC基因，ilvH基因，mraY基因，ftsQ基因、yacE基因'ampD基因,lspA基因caiF基因caiT基因folA基因imp基因、ara人基因leuB基因fruR基因murD基因ftsA基因guaC基因ampE基因talB基因nhaA基因'fkpB基因-caiE基因'fixA基因，apaH基因'djlA基因、araB基因,leuA基因.ftsL基因.ftsW基因.ftsZ基因,hofC基因，aroP基園,mog基因、htgAnhaR基因、rpsTlytB基因、dapBcaiD基因、caiCfixB基因、fixCapaG基因、ksgArluA基因、hepAaraC基因、tbpAleuL基因、leu0ftsl基因、murEmurG基因、murClpxC基因、secAhofB基因、ppdDpdhR基因、aceE基因、aceF基因、lpdA基因，,acnB基因、speD基因、speE基因、gcd基因、hpt基因、yadF基因、panD基因、panC基因、panB基因、htrE基因、ecpD基因、folK基因、pcnB基因、dksA基因、sfsA基因、HgT基因、hrpB基因、,ponB基因、hemL基因、pfs基因、dgt基因、htrA基因、dapD基因、glnD基因、map基因、rpsB基因、tsf基因，>smb基因、rrf基因、dxr基因、rth基因、'cdsA基因、yaeL基因、hlpA基因、lpxD基因、fabZ基因、lpxA基因、lpxB基因、rnhB基因、dnaE基因、accA基因、ldcC基因,>mesJ基因、rof基因、cutF基因、proS基因、rcsF基因、abc基因、dniR基因、gloB基因、rnhA基因、dnaQ基因、upl8基因、,gmhA基因、pepD基因、gpt基因、crl基因、phoE基因、proB基因、proA基因、hemB基因、proC基因、aroL基因、aroM基因、ar"基因、sbcC基因、sbcD基因、phoB基因、phoR基因、brnQ基因、proY基因、malZ基因，.queA基因、tgt基因、secD基因、secF基因、tsx基因、ribD基因、ribH基因、nusB基因、thiL基因、PgpA基因、dxs基因、ispA基因、xseB基因、thil基因、thiJ基因、apbA基因、cyoE基因、cyoD基因、cyoC基因、cyoB基因、cyoA基因、ampG基因、bolA基因、tig基因、clpP基因、clpX基因、lon基因、hupB基因、cof基因、mdlA基因、mdlB基因、glnK基因、amtB基因、tesB基因、maa基因、hha基因、iacrB基因、acr人基因、acrH基因、aefA基因、priC基因、,apt基因、dnaX基因、recR基因、htpG基因,,adk基因、hemH基因'.aes基因、gsk基因、fsr基因、ushA基因、cucK基因、gcl基因、gip基因、:purK基因、purE基因、ybbF基因、ppiB基因、cysS基因、folD基因、sfmA基因、sfmC基因、sfniD基因、sfmH基因、sfmF基因、fimZ基因、,entD基因、fepA基因、fes基因、entF基因、fepE基因、fepC基因、fepG基因、fepD基因、fepB基因、entC基因、entE基因、entB基因、entA基因、cstA基因、dsbG基因、ahpC基因、ahpF基因、,rnk基因、rna基因、citT基因、citG基因、citX基因、citF基因、citE基因、citD基因、citC基因、citA基因、citB基因、dcuC基因、dcuC基因、crc人基因、cspE基西、crcB基因、lipA基因、lipB基因、dacA基因、rlpA基因、mrdB基因、mrdA基因、phpB基因、nadD基因、holA基因、rlpB基因、,leuS基因.>lnt基因、phoL基因、ubiF基因、asnB基因、nagD基因、nagC基因、nagA基因、nagB基因、nagE基因、glnS基因'.fur基因、fldA基因、seqA基因.、Pgm基因、potE基因、speF基因、kdpE基因、kdpD基因、kdpC基因、kdpB基因、kdpA基因、phrB基因、end8基因、abrB基因、gUA基因、sdhC基因、sdhD基因、sdhA基因、sdhB基因、suc人基因、sucB基因、sucG基因、sucD基因、farR基因、hrsA基因、cydA基因、cydB基因、tolQ基因、tolR基因、tolA基因、tolB基因、pal基因、nadA基因、pnuC基因、czcD基因、aroG基因、gpmA基因、galM基因、galK基因、galT基因、galE基因、modF基因、modE基因、modA基因、modB基因、modC基因、bioA基因、bioB基因、bioF基因、bioC基因、bioD基因、uvrB基因、mo"基因、moaB基因、moaG基因、nioaD基因、moaE基因、rhlE基因、dps基因、iompX基因、mipB基因、moeB基因、moeA基因、mdfA基因、grxA基因、poxB基因、aqpZ基因、cspD基因、clpA基因、infA基因、aat基因、cydC基因、cydD基因、trxB基因、lrp基因、ftsK基因、lolA基因、serS基因、dmsA基因、dmsB基因、dmsC基因、pf1A基因、pflB基因、focA基因、serC基因、aroA基因',cmk基因、rpsA基因、himD基因、msbA基因、lpxK基因、kdsB基因、smtA基因、mukF基因、kicA基因、mukB基因、aspC基因、ornpF基因、asnS基因、piicB基因、pepN基因、ssuB基因、ssuC基因、ssuD基因、ssu人基因、ssuE基因、pyrD基因、uup基因、pqiA基因、pqiB基因、rmf基因、fabA基因、ompA基因、sulA基因、helD基因、mgsA基因、acyP基因、hyaA基因、hyaB基因、hyaC基因、hyaD基因、hyaE基因、hyaF基因、appC基因、appB基因、appA基因、csgG基因、csgF基因、csgE基因、csgD基因、csgB基因、csgA基因、csgC基因、sfaA基因、mdoG基因、mdoH基因、msyB基因、htrB基因、solA基因、dinl基因、pyrC基因、grxB基因、rimJ基因、mviM基因、mviN基因、flgN基因、HgM基因、flgA基因、flgB基因、flgC基因、flgD基因、flgE基因、flgF基因、flgG基因、flgH基因、flgl基西、HgJ基因、flgK基因.、HgL基因、rn6基因、rluC基因、rpmF基因、plsX基因、fabH基因、fabD基因、fabG基因、acpP基因、fabF基因、pabC基因、tmfc基因、holB基因、ptsG基因、fhuE基因、nagZ基因、.ndh基因、mfd基因、ycfU基因、ycfV基因、ycfW基因、cobB基因、potD基因、potC基因、potB基因、potA基因、pepT基因、phoQ基因、phoP基因、purB基因、trmU基因、icdA基因、minE基因、minD基因、minC基因、clyA基因、廳D基因、umuG基因、dsbB基因、nhaB基因、fadR基因、dadA基因、dadX基因、ldcA基因、mltE基因、tagl基因、treA基因、dhaR基因,、pth基因、prsA基因、ychB基因、hemM基因、hemA基因、prfA基因、hemK基因、kdsA基因、chaA基因、chaB基因、chaC基因、narL基因、narX基因、narIC基因、imrG基因、narH基因、nar了基因、narl基因,>tpr基因、purU基因、sprE基因、galU基因、,hns基因、tdk基因、adhE基因、oppA基因、oppB基因、oppC基因、,oppD基因、oppF基因、cls基因,,kch基因、tonB基因、trpA基因、trpB基因、trpC基因、trpD基因、trpE基因、trpL基因、btuR基因、sohB基因、topA基因、cysB基因、acn人基因、ribA基因、pgpB基因、pyrF基因、osmB基因、rnb基因、envM基因、sapF基因、sapD基因、sapC基因、sapB基因、sapA基因、aldH基因、ordL基因、goaG基因、pspF基因、pspA基因、pspB基因、pspC基因、pspD基因、pspE基因、sucP基因、ompG基因、tyrR基因、tpx基因、mppA基因、fnr基因、ogt基因、dbpA基因、intR基因，.lar基因、recT基因、recE基因、racC基因、kil基因、sieB基因、racK基因、dnaC基因、enpP基因、trkG基因、VMTH一LAMBD基因、VLOM一LAMBD基因、tnp0基因、upo3基因、ompN基因、nifJ基因、hsU基因、ldhA基因、feaR基因、feaB基因、tynA基因、paaZ基因、paaA基因、paaB基因、paaC基因、paaD基因、paaE基因、paaF基因、paaG基因、paaH基因、paal基因、paaJ基因、paaK基因、paaX基因、paaY基因、acpD基因、hrpA基因、aldA基因、gapC基因、gapC基因、cybB基因、trg基因、rimL基因、tehA基因、tehB基因、prtC基西、potA基因、potC基因、ansP基因、nhoA基因、narV基因、narW基因、narY基因、nar乙基因、narU基因、fdnG基因、fdnH基因、fdnl基因、adhP基因、sfcA基因、rpsV基因、osmC基因、dos基因、xasA基因、gadB基因、pqqL基因、chuR基因、hipA基因、hipB基因，.tam基因、uxaB基因、marG基因、marH基因、marA基因、marB基因,.dcp基因、lycV基因、dicA基因、dicB基因、rspB基因、rspA基因、speG基因、dmsB基因、dmsC基因、bioD基因.,mlc基因、asr基因、ebr基因、pntB基因、pritA基因、arcD基因、rstA基因、rstB基因'.tus基因、fumC基因、fumA基因、man人基因、uidC基因、uidB基因、uidA基因、uidR基因、hdhA基因、mail基因,>malX基因、malY基因1、add基因、blr基因，.nth基因、gst基因、pdxY基因、tyrS基因、pdxH基因、slyB基因、slyA基因、sodC基因、nemA基因、gloA基因、rnt基因、lhr基因、sodB基因、araJ基因、purR基因、cfa基因、ribE基因、ag43基因、phsC基因、nrfC基因、pykF基因、lpp基因、sufS基因、aroD基因、ppsA基因、aroH基因、nlpC基因、btuD基因、btuE基因、btuC基因、himA基因、pheT基因、pheS基因、pheM基因、rplT基因、rpml基因、infC基因、thrS基因、arp基因、pfkB基因、cedA基因、katE基因、celF基因、celD基因、celC基因、celB基因、celA基因、osmE基因、nadE基因、spy基因、astE基因、astB基因、astD基因、astA基因、cstC基因、xthA基因、gdhA基因、topB基因、selD基因、sppA基因、基因、tdh基因、gapA基因、ttuC基因、caiT基因、rnd基因、fadD基因、slp基因、pabB基因、sdaA基因、nrnn乂基因、manY基因、manZ基因、rrmA基因、cspC基因、kdgR基因、.tcmA基因、htpX基因、pre基因、pqiB基因、pphA基因、holE基因、exoX基因、ptrB基因、purT基因、eda基因、edd基因、zwf基因、pykA基因、mlt基因、znu人基因、znuC基因、ruvB基因、ruv人基因、ruvC基因、ntpA基因、aspS基因、bisZ基因、torY基因、cutC基因'.argS基因、pgsA基因、amn基因、cbl基因、nac基因、erfK基因、cobT基因、cobS基因、cobU基因、gyrl基因、phsE基因、sbcB基因、hisL基因、hisG基因、hisD基因、hisC基因、h"B基因、hisH基因、hisA基因、hisF基因、hisl基因、wzz基因、ugd基因、gnd基因、；galF基因、wcaM基因、wcaL基因、wcaK基因、wzxC基因、wc"基因、cpsG基因、cpsB基因、wcal基因、wcaH基因、wcaG基因、gmd基因、wcaF基因、wcaE基因、wcaD基因、wcaC基因、wcaB基因、wca人基因、wzb基因、,wza基因、asm人基因、dcd基因、udk基因、thiD基因、thiM基因、mrp基因、metG基因、cdd基因、san人基因、mglC基因、mglA基因、mglB基因、galS基因、folE基因、cirA基因、lysP基因、nfo基因、fruA基因、fruK基因、fruB基因、rplY基因、narP基因、ccmH基因、dsbE基因、ccmP基因、ccmE基因、ccmD基因、ccmG基因、ccmB基因、ccm人基因、napC基因、napB基因、napH基因、napG基因、napA基因、napD基因、napF基因、eco基因、alkB基因、ada基因、apbE基因、rcsB基因、rcsG基因、atoS基因、atoC基因、atoD基因、atoA基因、atoE基因、atoB基因、gyrA基因、ubiG基因、nrdA基因、nrdB基因、inaA基因、glpQ基因、glpT基因、glpA基因、glpB基因、glpC基因、cinA基因、ais基因、pmrD基因、m6nE基因、menG基因、menB基因、menD基因、m6nF基因、議N基因、nuoM基因、nuoL基因、nuolC基因、nucJ基因、nuol基因、訓H基因、誦G基因、nuoF基因、nuoE基因、nuoD基因、nuoB基因、nuo人基因、lrhA基因、ackA基因、pta基因、ubiX基因、purF基因、dedE基因、dedD基因、folC基因、accD基因、dedA基因、truA基因、usgl基因、pdxB基因、div基因、fabB基因、ddpX基因、mepA基因、aroC基因、sixA基因、fadL基因、vacJ基因、dsdC基因、dsdX基因、dsdA基因、emrY基因、emrIC基因、evgA基因、evgS基因、bifF基因、ddg基因、glk基因、mntH基因、nupC基因、gltX基因、xapR基因、xapB基因、xapA基因、lig基因、zipA基因、cysZ基因、cysK基因、ptsH基因、ptsl基因、gsr基因、pdxK基因、cysM基因、cysA基因、cysW基因、cysU基因、cysP基因、ucpA基因、ptbA基因、amiA基因、hemF基因、cchA基因、eutC基因、eutB基因、eutH基因、eutG基因、eutJ基因、eutE基因、cchB基因、eutl基因、talA基因、tktB基因、aegA基因、narQ基因、acrD基因、dapE基因、purC基因、nlpB基因、dapA基因、gcvR基因、bcp基因、hyfA基因、hyfB基因、hyfC基因、hyfD基因、hyfE基因、hyfF基因、hyfG基因、hyfH基因、hyfl基因、hyfJ基因、hyfR基因、focB基因、perM基因、yfgE基因、ura人基因、upp基因、purM基因、purN基因、,ppk基因、ppx基因、guaA基因、guaB基因、xseA基因、hisS基因、,gcpE基因、ndk基因、pbpC基因、ss"基因、sseB基因、pepB基因、,fdx基因、hscA基因、hscB基因、iscU基因、iscS基因、iscR基因、suhB基因、csiE基因、dgxA基因、dgxB基因、hcaC基因、hcaB基因、hcaD基因、glyA基因、hmpA基因、glnB基因、purL基因、acpS基因、,pdxJ基因.,rec0基因、6ra基因、rnc基因、lepB基因、lepA基因、rseC基因、rseB基因、rse人基因、rpoE基因、nadB基因、srmB基因、ung基因、trx2基因、pssA基因、kgtP基因、clpB基因、rluD基因、pheL基因、pheA基因、tyrA基因、aroF基因、rplS基因、trmD基因、rimM基因'.rpsP基因、ffh基因、grpE基因、recN基因、smpA基因、smpB基因、gabD基因、gabT基因、gabP基因、nrdF基因、emrR基因、emrA基因、emrB基因、gshA基因、csr人基因、alaS基因、or"基因、rec人基因、mltB基因、hypF基因、hydN基因、ascG基因、ascF基因、ascB基因、hycl基因、hycH基因、hycG基因、hycF基因、hycE基因、hycD基因、hycC基因、hycB基因、hycA基因、hypA基因、hypB基因、hypC基因、hypD基因、hypE基因、fhlA基因、mutS基因、prpB基因、rpoS基因'>pcm基因、surE基因、ygbB基因、ygbP基因、ygbQ基因、cysC基因、cysN基因、cysD基因、iap基因、cysH基因、cysl基因、cysJ基因、ptpS基因，.6no基因、pyrG基因、mazG基因、chpR基因、relA基因、barA基因、gud2基因、gudT基因、mioC基因、,syd基因、sdaB基因、exo基因、fuc0基因、fucA基因、fucP基因、fuel基因、fucK基因、fucU基因、fucR基因、gcvA基因、nifS基因、mlU基因、amiC基因、argA基因、thyA基因、lgt基因、ptsP基因、mutH基因、tas基因、aas基因、galR基因、lysA基因、lysR基因、araE基因、kduD基因、kdul基因、lysS基因、prfB基因、re"基因、dsbC基因、xerD基因、fldB基因、upl4基因、bglA基因、gcvP基因、gcvH基因、gcvT基因、visC基因、ubiH基因、pepP基因、serA基因、rpiA基因、iciA基因、sbm基因、argK基因、fba基因、pgk基因、epd基因、tktA基因、speB基因、speA基因、metK基因、galP基因、sprT基因、endA基因、gshB基因、yqgF基因、ansB基因、mutY基因、mltC基因、卿G基因、speC基因、pitB基因、gsp基因、hybG基因、hybF基因、hybE基因、hybD基因、hybC基因、hybB基因、hybA基因、hoxK基因、exbD基因、exbB基因、metC基因、exsA基因、sufl基因、plsC基因.、parC基因、parE基因、icc基因、tolC基因、ribB基因、glgS基因，,rfaE基因、glnE基因、cca基因、bacA基因、folB基因、ttdA基因、ttdB基因、ygjD基因、rpsU基因、dnaG基因、rpoD基因、aer基因、ebgR基因、ebgA基因、ebgC基因、fadH基因、ux"基因、uxaC基因、exuT基因、exu尺基因、tdcE基因、tdcD基因、tdcC基因、tdcB基因、tdcA基因、tdcR基因、sohA基因、agaR基因、agaZ基因、agaV基因、agaW基因、agaA基因、agaS基因、agaY基因、agaB基因、agaC基因，.agaD基因、agal基因、mtr基因、deaD基因、nlpl基因、pnp基因、rps0基因、truB基因、rbfA基因、infB基因、IIUS人基因、argG基因、secG基因、mrs人基因、folP基因、ftsH基因、ftsJ基因、greA基因、dacB基因、yhbZ基因、rpmA基因、rplU基因、ispB基因、nlp基因、mur人基因、yrbl基因、yrbK基因、rpoN基因、ptsN基因、pts0基因、mtgA基因、arcB基因、gltB基因、磁丁基因、npl基因、訓H基因、dcuD基因、sspB基因、sspA基因、rpsl基因、rplM基因、hhoA基因,,hhoB基因、mdh基因、argR基因、UdD基因、rng基因、mreD基因、mreG基因、mreB基因、accB基因、accG基因、panF基因、prmA基因、fis基因、aroE基因,,smg基因、smf基因、def基因、fmt基因、sun基因、trkA基因、mscL基因、zntR基因、rplQ基因、rpoA基因、rpsD基因、rpsK基因、rpsM基因、rpmJ基因、secY基因、rpl0基因、rpmD基因、rpsE基因、rplR基因、rplF基因、rpsH基因、rpsN基因、rplE基因、rplX基因、rplN基因、rpsQ基因、rpmC基因、rplP基因、rpsC基因、rplV基因、rpsS基因、rplB基因、rplW基因、rplD基因、rplC基因、rpsJ基因、tufA基因、fusA基因、rpsG基因、rpsL基因、fkpA基因、slyX基因、slyD基因、kefB基因、prkB基因、crp基因、argD基因、pabA基因.,fic基因、ppiA基因、nirB基因、nirD基因'.nirC基因、cysG基因、php基因、trpS基因、,gph基因、rpe基因、dam基因、damX基因、aroB基因、aroK基因、hofQ基因、mrcA基因、pckA基因、envZ;基因、ompR基因、greB基因、feoA基因、feoB基因、bioH基因、gntT基因、malQ基因、malP基因、malT基因、rtcA基因、rtcB基因、rtcR基因、glpR基因、glpG基因、glpE基因、glpD基因、glgP基因、glgA基因、glgC基因、glgX基因、glgB基因、asd基因、gntU基因、gntU基因、gntK基因、gntR基因、ggt基因、ugpQ基因、ugpC基因、ugpE基因、ugpA基因、ugpB基因、livF基因、HvG基因、livM基因、livH基因、livK基因、livJ基因、rpoH基因、ftsX基因、ftsE基因、ftsY基因、atzN基因、nikA基因、nikB基因、nikC基因、nikD基因、nikE基因、pitA基因、uspB基因、uspA基因、prlC基因，.gor基因、arsH基因、arsB基因、arsC基因、slp基因、hdeB基因、hdeA基因、hdeD基因、gadA基因、treF基因、kdgK基因、dctA基因、dppF基因、dppD基因、dppC基因、dppB基因、dppA基因、tag基因、bisC基因、cspA基因、giys基因、glyQ基因、xylB基因、xylA基因、xylF基因、xylG基因、xylH基因、xylR基因、bax基因、malS基因、avtA基因、lyx基因、sgbH基因、sgbU基因、sgbE基因、aldB基因、selB基因、selA基因、mtlA基因、mtlD基因、mtlR基因、lldP基因、lldR基因、lldD基因、cysE基因、gpsA基因、secB基因、grxC基因、tdh基因、kbl基因、htrL基因、rfaD基因、rfaF基因、rfaC基因、rfaL基因、rfaK基因、rfaZ基因、rfaY基因、rfaJ基因、rfal基因、rfaB基因、rfaS基因、rfaP基因、rfaG基因、rfaQ基因、kdtA基因、kdtB基因、mutM基因、rpmG基因、rpmB基因、radC基因、dfp基因，.dut基因、ttk基因、pyrE基因、rph基因、dinD基因、gmk基因、rpoZ基因、spoT基因、spoU基因、recG基因、gUS基因、nlpA基因、uhpT基因、uhpC基因、uhpB基因、uhpA基因、ilvN基因、ilvB基因、ivbL基因、emrD基因、ibpB基因、ibpA基因、gyrB基因、recF基因、dnaN基因、dnaA基因、rpmH基因、rnpA基因、yidC基因、thdF基因、tnaL基因、tnaA基因、tnaB基因、bglB基因、bglF基因、bglG基因、phoU基因、pstB基因、pstA基因、pstC基因、pstS基因、glmS基因、glmU基因、atpC基因、imcD基因、atpG基因、atpA基因、atpH基因、atpF基因、atpE基因、atpB基因、atpl基因、gidB基因、gidA基因、mioC基因、asnC基因、pssR基因、ilvL基因、ilvG基因、ilvM基因、UvE基因、ilvD基因、ilvA基因、ilvY基因、ilvC基因、ppiC基因、,rep基因、gppA基因、rhlB基因、trxA基因、rhoL基因、.rho基因、rfe基因、wzzE基因、nfrC基因、rffD基因、rffG基因、rffH基因、rffA基因、wzxE基因、rffT基因、wecG基因、aslB基因、aslA基因、hemY基因、hemX基因、hemD基因、hemC基因、cyaA基因、cyaY基因、dapF基因、xerG基因、uvrD基因、corA基因、radD基因、pldA基因、recQ基因、pldB基因、metR基因、metE基因、udp基因、ubiE基因、aarP基因、tatC基因、tatD基因、rfaH基因、uMD基因、ubiB基因、fadA基因、fadB基因、pepQ基因、trkH基因、trkH基因、hemG基因、mobB基因、mobA基因、dsbA基因、polA基因、yihA基因、hemN基因、ntrC基因、ntrB基因、glnA基因、fdhE基因、fdol基因、fdoH基因、fdoG基因、fdhD基因、sodA基因、kdgT基因、cpxA基因、cpxR基因、,cpxP基因.、pfkA基因、sbp基因、cdh基因、tpiA基因、fpr基因、glpX基因、glpK基因、glpF基因、menG基因、menA基因、hslU基因、hslV基因、ftsN基因、cytR基因、priA基因、rpmE基因、metJ基因、metB基因、metL基因、metF基因、katG基因、gldA基因、talC基因、,ppc基因、argE基因、argC基因、argB基因、argH基因、oxyR基因、udhA基因、trmA基因、btuB基因、murl基因、murB基因、birA基因、co"基因、tufB基因、S6CE基因、nusG基因、rplK基因、rplA基因、rplJ基因、rplL基因、rpoB基因、rpoC基因、htrC基因、thiH基因、thiG基因、thiS基因、thiF基因、thiE基因、thiC基因、rsd基因、hemE基因、nfi基因、hupA基因、hydH基因、hydG基因、purD基因、purH基因、metA基因、ac6B基因、ac6人l因、acsK基因、arp基因、iclR基因、metH基因、pepE基因、lysC基因、pgi基因、ubiC基因、ubiA基因、plsB基因、dgkA基因、lexA基因、dinF基因、qor基因、dnaB基因、alr基因、tyrB基因、napA基因、hobH基因、uvrA基因、ssb基因、soxS基因、soxH基因、acs基因、nrfA基因、nrfB基因、nrfC基因、nrfD基因、nrfE基因、nrfF基因、nrfG基因、gltP基因、fdhF基因、alsR基因、rpiB基因、proP基因、basS基因、basR基因、adiY基因、adi基因、melR基因、melA基因、melB基因、fumB基因、dcuB基因、dcuR基因、dcuS基因、lysU基因、cadA基因、cadB基因、cadC基因、cutA3基因、cutA2基因、cutA基因、dcuA基因、aspA基因、fxsA基因、！roES基因、groEL基因、efp基因、ecnB基因、sugE基因、blc基因、ampC基因、frdD基因、frdC基因、frdB基因、frdA基因、genX基因、psd基因、yjeQ基因、yjeE基因、amiB基因、mutL基因、miaA基因、hfq基因、hflX基因、hflK基因、hflC基因、purA基因、vacB基因、sgaE基因、rpsF基因、priB基因、rpsR基因、rpll基因、fklB基因、cycA基因、cpdB基因、cysQ基因、msrA基因、,chpS基因、chpB基因、ppa基因、fbp基因、mpl基因、〗pmbA基因、cybC基因、nrdG基因、nrdD基因、treC基因、treB基因、treR基因、mgtA基因、pyrl基因、pyrB基因、pyrBI基因、argl基因、valS基因、holC基因、xerB基因、idnR基因、idnT基因、idn0基因、idnD基因、idnK基因、fecE基因、fecD基因、fecC基因、fecB基因、fecA基因、fecR基因、feci基因、dnaC基因、dnaT基因、bglJ基因、fhuF基因、rsmC基因、holD基因、riml基因、prfC基因、osmY基因、deoC基因、deoA基因、deoB基因、deoD基因、lplA基因、smp基因、serB基因、radA基因、nadR基因、slt基因、trpR基因、gpmG基因、rob基因、creA基因、creB基因、creC基因、creD基因、arcA基因、lasT基因、thrL基因、以及[2]acrE基因、argT基因、artl基因、artJ基因、artM基因、artP基因、artQ基因、bfr基因、chiA基因、chpA基因、dacC基因、deoR基因、dinG基因、elaA基因、elaB基因、elaC基因、elaD基因、envD基因、envR基因、fhuA基因、fhuB基因、fhuC基因、fhuD基因、folX基因、glnH基因、glnP基因、glnQ基因、gltJ基因、gltK基因、gltL基因、gspA基因、gspC基因、gspD基因、gspE基因、gspl基因、gspJ基因、gspK基因、gspL基因、hisJ基因、hisM基因、hisP基因、hisQ基因、hofD基因、hofF基因、hofG基因、hofH基因、ltaA基因、mdaA基因、mdaB基因、pin0基因、potF基因、potG基因、potH基因、potl基因、pshM基因、ptwB基因、ptwC基因、rhsB基因、rimK基因、xylU基因;大腸桿菌突變體、進一步優選、(2)上述(1)的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA含有具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1]~[69]所述鹼基序列的DM、或者與它們相當的DM:1位~167064位所示的鹼基序列172980位~243964位所示的鹼基序列253411位~261963位所示的鹼基序列387532位~389138位所示的鹼基序列403704位~518029位所示的鹼基序列532712位~535504位所示的鹼基序列550216位~563940位所示的鹼基序列689375位~728820位所示的鹼基序列739594位~832551位所示的鹼基序列883474位~890997位所示的鹼基序列909380位~1048887位所示的鹼基序列1097020位~1198105位所示的鹼基序列1225147位~1630911位所示的鹼基序列1641039位--1642631位所示的鹼基序列1993076位--1996661位所示的鹼基序列2028210位--2033448位所示的鹼基序列2081927位--2104392位所示的鹼基序列2H6065位--2146263位所示的鹼基序列2187856位--2200668位所示的鹼基序列2229851位--2255894位所示的鹼基序列2263492位--2270439位所示的鹼基序列2286589位--2386261位所示的鹼基序列2395472位--2423364位所示的鹼基序列2434099位--2472851位所示的鹼基序列2482483位--2505074位所示的鹼基序列2514558位--2755676位所示的鹼基序列2789481位--2795173位所示的鹼基序列2800891位--2804307位所示的鹼基序列2830263位--2910273位所示的鹼基序列3033129位--3077084位所示的鹼基序列3078917位'-3110109位所示的鹼基序列3134342位'-3165627位所示的鹼基序列3172941位'-3360736位所示的鹼基序列3420879位'-3453020位所示的鹼基序列3469367位'-3618575位所示的鹼基序列3636917位'-3854661位所示的鹼基序列3865832位'-3867101位所示的鹼基序列3877011位~3926658位所示的鹼基序列4t)79660位~4086450位所示的鹼基序列4329722位~4409532位所示的鹼基序列167065位~172979位所示的鹼基序列832552位~848089位所示的鹼基序列890998位~909379位所示的鹼基序列2386262位~2395471位所示的鹼基序列2423365位~2434098位所示的鹼基序列2472852位~2482482位所示的鹼基序列2505075位~2514557位所示的鹼基序列2910274位~2910573位所示的鹼基序列3165628位~3172940位所示的鹼基序列3411160位~3420878位所示的鹼基序列3453021位~3469366位所示的鹼基序列3618576位~3636916位所示的鹼基序列；(3)上述(1)或者(2)的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yafJ基因、yafK基因、yafQ基因、dinJ基因、yafL基因、yafM基因、fhiA基因、lafU基因、dinP基因、yafN基因、yafO基因、yafP基因、JW0225基因、prfH基因、ykfI基因、yafW基因、yeeT基因、ykfG基因、yafX基因、ykfF基因、ykfB基因、yafY基因、ypjK基因、yafZ基因、ykfA基因、perR基因、JW0245基因、JW0246基因、JW0247基因、ykfC基西、JW0249基因、is5B基因、yi51基因、mmuP基因、mmuM基因、afuC基因、JW0255基因、insB基因、insA基因、JW0258基因、yagB基因、yagA基因、yagE基因、yagF基因、yagG基因、yagH基因、yagl基因、argF基因、yfjl基因、yagJ基因、yagK基因、yagL基因、yagM基因、yagN基因、intF基因、yagP基因、yagQ基因、yagR基因、yagS基因、yagT基因、yagU基因、ykgJ基因、yagV基因、yagW基因、yagX基因、yagY基因、yagZ基因、ykgK基因、ykgL基因、ykgM基因、eaeH基因、JW0292基因、JW0293基因、ykgA基因、ykgB基因、ykgl基因、merA基因、ykgD基因、ykgE基因、ykgF基因、ykgG基因、ykgH基因、betA基因、betB基因、betl基因、betT基因、yahA基因、yahB基因、yahC基因、yahD基因、yahE基因、yahF基因、yahG基因、yahH基因、arcM基因、yahJ基因、yahK基因、yahL基因、yahM基因、yahN基因、yahO基因、prpR基因、bcpA基因、prpC基因、prpD基因、prpE基因、codB基因、codA基因、cynR基因、cynT基因、cynS基因、cynX基因、lacA基因、lacY基因、lacZ基因、lacl基因、mhpR基因、mhpA基因、mhpB基因、mhpC基因、mhpD基因、mhpF基因、mhpE基因、mhpT基因、yaiL基因、yaiM基因、adhC基因、yaiN基因、yaiO基因、JW0350基因、yi2A基因、yi22基因、yi24基因、yi23基因、yaiP基因、yaiS基因、tauA基因、tauB基因、tauC基因、ssiD基因、yaiT基因、JW0363基因、JW0364基因、yaiU基因、yaiV基因、ampH基因、sbmA基因、yaiW基因、yaiY基因、yaiZ基因、ddlA基因、yaiB基因、phoA基因、psiF基因、yaiC基因、ybbO基因、tesA基因、ybbA基因、ybbP基因、rhsD基因、ybbC基因、rhsE基因、ybbD基因、JW0490基因、ybbB基因、ybbS基因、ybbT基因、ybbU基因、ybbQ基因、ybbV基因、allP基因、allA基因、ybbY基因、ybbZ基因、ylbA基因、al1C基因、ylbC基因、fdrA基因、ylbE基因、ylbF基因、arcC基因、intD基因、EXO—LAMBD基因、VRPP一LAMBD基因、JW0528基因、JW0529基因、VREN—LAMBD基因、emrE基因、ybcK基因、ybcL基因、ybcM基因、ybcN基因、ninE基因、ybcO基因、rus基因、ybcQ基因、JW0539.5基因、nmpC基因、vlyS基因、ybcS基因、ybcT基因、vboR基因、ybcV基因、ybcW基因、nohB基因、ybcX基因、ybcY基因、JW0552基因、appY基因、ompT基因、envY基因、ybcH基因、nfrA基因、nfrB基因、cusS基因、cusH基因、cusC基因、ylcC基因、cusB基因、cusA基因、pheP基因、ybdG基因、nfnB基因、ybdF基因、ybdJ基因、ybdK基因、hokE基因、yi81基因、yi82基因、ymcC基因、ymcD基因、cspH基因、,cspG基因、sfa基因、yccL基因、yccM基因、torS基因、torT基因、torR基因、torC基因、torA基因、torD基因、yccD基因、cbpA基因、,yccE基因、agp基因、yccJ基因、wrbA基因、yciG基因、ycdG基因、JW0992基因、JW0993基因、JW0994基因、ycdK基因、JW0996基因、JW0997基因、ycdC基因、puU基因、yzpU基因、putP基因、JW1002基因、ycdO基因、ycdB基因、phoH基因、ycdP基因、ycdQ基因、ycdR基因、ycdS基因、ycdT基因、JW1012基因、JW1013基因、JW1014基因、ycdU基因、ymfD基因、ymfE基因、lit基因、intE基因、VXIS-BPP21基因、ymfH基因、ymfl基因、ymfJ基因、RPC2-BPP22基因、JW1132基因、ymfL基因、ymfM基因、ymfN基因、ymfR基因、ymfO基因、JW1138基因、JW1139基因、ycfK基因、ymfS基因、ycfA基因、ycfE基因、pin基因、mcrA基因、JW1146基因、ycgW基因、ycgX基因、ycgE基因、JW1150基因、ycgZ基因、ymgA基因、JW1153基因、ymgC基因、yahA基因、JW1156基因、JW1157基因、aidA基因、ymgD基因、JW1160基因、JW1161基因、JW1162基因、ydfH基因、ydfZ基因、ydfI基因、shiA基因、JW1537基因、tnpR基因、ydfM基因、Y314-LAMBD基因、nohA基因、ydfO基因、yccL基因、cspl基因、ydfR基因、vlyS基因、cspB基因、cspF基因、regQ—LAMBD基因、JW1552基因、rem基因、hokD基因、relE基因、relB基因、ydfV基因、flxA基因、ydfW基因、ydfX基因、dicC基因、sdaC基因、yqeH基因、yqel基因、yqeJ基因、yqeK基因、ygeF基因、ygeG基因、ygeH基因、ygel基因、JW2822基因、ygeK基因、JW2824基因、JW2825基因、JW2830基因、ygeP基因、JW2832基因、nlpD基因、yagR基因、ygeT基因、JW2836基因、ygeV基因、ygeW基因、dpaL基因、ygeY基因、ygeZ基因、arcL基因、yqeB基因、JW2844基因、ygfJ基因、gltD基因、JW2847基因、ygfM基因、yagR基因、ygfO基因、ygfP基因、ygfQ基因、ygfR基因、ygfS基因、ygfT基因、pbuX基因、idi基因、epsM基因、exeL基因、exeC基因、JW2938基因、JW2939基因、JW2940基因、JW2941基因、yghK基因、glcB基因、glcG基因、glcF基因、glcD基因、glcC基因、JW2948基因、yghQ基因、yghR基因、yghS基因、yghT基因、yihL基因、yihM基因、yihN基因、yshA基因、yihO基因、yihP基因、yihQ基因、yihR基因、yihS基因、yihT基因、yihU基因、yihV基因、yihW基因、yihX基因、rbn基因、yihZ基因、yiiD基因、yiiE基因、yiiF基因、yiiG基因、frvR基因、frvX基因、frvB基因、frvA基因、yiiL基因、rhaD基因、rhaA基因、rhaB基因、rhaS基因、rhaR基因、rhaT基因、ptsA基因、JW3920基因、frwC基因、frwB基因、pflD基因、pflC基因、frwD基因、yijO基因、yijP基因、JW3986基因、yjbF基因、yjbG基因、yjbH基因、JW3989.5基因、yjbA基因、xylE基因、malG基因、malF基因、malE基因、malK基因、lamB基因、malM基因、yjbl基因、yjcP基因、yjcQ基因、yjcR基因、yjcS基因、alsK基因、alsE基因、alsC基因、alsA基因、alsB基因、phnQ基因、phnP基因、phnO基因、phnN基因、phnM基因、phnL基因、phnK基因、phnJ基因、phnl基因、phnH基因、phnG基因、phnF基因、phnE基因、phnD基因、phnC基因、phnB基因、phnA基因.*yjdA基因以及yjcZ基因；(4)上述(1)~(3)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DM，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1]~[18]所述鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:鹼基編號243965位~253410位所示的鹼基序列、[2]鹼基編號261964位~387531位所示的鹼基序列、鹼基編號389139位~403703位所示的鹼基序列、[4]鹼基編號518030位~532711位所示的鹼基序列、[5〗鹼基編號535505位~550215位所示的鹼基序列、[6〗鹼基編號563941位~608118位所示的鹼基序列、[7]鹼基編號1048888位~1097019位所示的鹼基序列、[8]鹼基編號1198106位~1225146位所示的鹼基序列、[9]鹼基編號1630912位~1641038位所示的鹼基序列、[10]鹼基編號1642632位~1650222位所示的鹼基序列、[11]鹼基編號2985362位~3033128位所示的鹼基序列、[12]鹼基編號3110110位~3134341位所示的鹼基序列、[13]鹼基編號4059898位~4079659位所示的鹼基序列、[14]鹼基編號4086451位~4099982位所示的鹼基序列、[15]鹼基編號4139232位~4149709位所示的鹼基序列、[16]鹼基編號4235359位~4251735位所示的鹼基序列、[17]鹼基編號4298977位~4311511位所示的鹼基序列、以及[18]鹼基編號4313318位~4329721位所示的鹼基序列；(5)上述(1)~(4)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因或者與它們同源的基因的染色體DM,所述基因為yidF基因、yidG基因、yidH基因、yidl基因、yidJ基因、yidK基因、yidL基因、JW3657基因、glvG基因、glvB基因、glvC基因、yidP基因、yidE基因、yidQ基因、yidR基因、yidS基因、dgoT基因、dgoA基因、dgoK基因、dgoR基因、yidW基因、yidX基因、yidA基因、yidB基因、asnA基因、yieM基因、JW3724基因、yieN基因、kup基因、rbsD基因、rbsA基因、rbsC基因、rbsB基因、rbsK基因、rbsR基因以及yieO基因；(6)上述(1)~(5)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述~[3]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1〗鹼基編號3854662位~3865831位所示的鹼基序列、鹼基編號3926659位~3938878位所示的鹼基序列；(7)上述(1)~(6)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因或者與它們同源的基因的染色體DNA,所述基因為yecT基因、flhE基因、flhA基因、flhB基因、cheZ基因、cheY基因、cheB基因、cheR基因、tap基因、tar基因、cheW基因、cheA基因、motB基因、motA基因、flhC基因、flhD基因、JW1882基因、JW1883基因、yecG基因、otsA基因、otsB基因、araH基因、araG基因、araF基因、yecl基因、yecJ基因、JW1892基因、ftn基因、yecH基因、tyrP基因、uvrC基因、uvrY基因、yecF基因、sdiA基因、yecC基因、yecS基因、yed0基因、fliY基因、fliZ基因、fliA基因、fliC基因、fliD基因、fliS基因、fliT基因、amyA基因、yedD基因、yedE基因、yedF基因、yedK基因、yedL基因、yedN基因、yedM基因、fliE基因、fliF基因、fiiG基因、fHH基因、fiii基因、fuj基因、fiiK基因、na基因、fliM基因、fliN基因、fli0基因、fliP基因、fliQ基因、fliR基因、rcsA基因、dsrB基因、JW1937基因、yedA基因、vsr基因、dcm基因、yedJ基因、JW1946基因、ompC基因、JW1948基因、yedS基因、yedU基因、yedV基因、copR基因、yedX基因、JW1954基因、JW1955基因、JW1956基因、JW1974基因、JW1979基因、JW1980基因、yeeP基因、flu基因、JW1983基因、yeeS基因、yeeU基因、yeeV基因、yeeW基因、yefJ基因、JW2013基因、yefJ基因、yefl基因、wbbJ基因、yefG基因、rfc基因、glf基因、rfbX基因、rfbC基因、rfbA基因、rfbD基因以及rfbB基因；(8)上迷(1)~(7)中任何一項的大腸桿菌突變體、其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述~[5]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1]鹼基編號1964524位~1993075位所示的鹼基序列、[2]鹼基編號1996662位~2028209位所示的鹼基序列、[3〗鹼基編號2033449位~2044376位所示的鹼基序列、鹼基編號2069149位~2081926位所示的鹼基序列、以及[5]鹼基編號2104393位~2116064位所示的鹼基序列；(9)上述(1)~(8)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為intA基因、yfjH基因、alpA基因、yfjl基因、JW2606基因、yfjj基因、yfjK基因、yfjL基因、yfjM基因、yfjN基因、yfjO基因、yfjP基因、yfjQ基因、yfjR基因、ypjK基因、yfjS基因、yfjT基因、yfjU基因、yfjV基因、yfjV基因、JW2622基因、yfjW基因、JW2623.5基因、yfjX基因、yfjY基因、yfjZ基因、ypjF基因、ypjA基因、JW2629基因、JW2630基因、JW2631基因、JW2632基因、JW2633基因、JW2634基因、ygaE基因、yzzM基因、yqaE基因、JW2642基因、ygaP基因、stpA基因、JW2645基因、ygaC基因、ygaM基因、nrdH基因、nrdl基因、nrdE基因、proV基因、proW基因、proX基因、JW2655基因、JW2656基因、ygaZ基因、ygaH基因、srlA基因、srlB基因、srlD基因、gutM基因、srlR基因以及gutQ基因；(10)上述(I)~(9)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述~[4]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1]鹼基編號2755677位~2789480位所示的鹼基序列、[2]鹼基編號2795174位~2800890位所示的鹼基序列、[3]鹼基編號2804308位~2810147位所示的鹼基序列、以及[4]鹼基編號2825314位~2830262位所示的鹼基序列；(11)上述(l)~(IO)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含gltF基因、yhcA基因、yhcD基因、yhcE基因、yhcF基因、yhcG基因、yhcH基因、nanK基因以及nanE基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA;(12)上述(1)~(ll)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3360737位~3370547位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA;(13)上述(1)~(12)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因或者與它們同源的基因的染色體DM，所述基因為yegE基因、alkA基因、yegD基因、JW2055基因、JW2056基因、JW2057基因、JW2058基因、yegM基因、yegN基因、yeg0基因、yegB基因、baeS基因、baeR基因、JW2065基因、yegQ基因、ogrK基因、JW2068基因、JW2069基因、yegS基因、gatR基因、JW2072基因、JW2073基因、gatR基因、gatD基因、gatC基因、,gatB基因、gatA基因、gatZ基因、gatY基因、fbaB基因、xegT基因、,yegU基因、yegV基因、yegW基因、yegX基因、molR基因、yehl基因、,yehK基因、yehL基因、yehO基因、yehP基因、yehQ基因、yehR基因、,yehS基因、yehT基因、yehU基因、yehV基因、yehW基因、yehX基因、yehY基因、yehZ基因、bglX基因、dld基因、pbpG基因、yohC基因、yeiQ基因、yeiR基因、yeiU基因、spr基因、rtn基因、yejA基因、yejB基因、yejE基因、yejF基因、yejG基因、bcr基因、rsu人基因、yejH基因、yeil基因、yeiJ基因、yeiK基因、yeiL基因、yeiM基因、yeiN基因以及yeiC基因；(14)上述(1)~(13)中任何一項的大腸桿菌突變體、其具有下述染色體DNA,所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1〗~[4]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:鹼基編號2146264位~2187855位所示的鹼基序列、[2]鹼基編號2200669位~2229850位所示的鹼基序列、[3〗鹼基編號2270440位~2286588位所示的鹼基序列、以及[4]鹼基編號2255895位~2263491位所示的鹼基序列；(15)上述(1)~(14)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含cmtA基因以及cmtB基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA;(16)上述(1)~(15)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DM，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3077085位~3078916位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA;(17)上述(1)~(16)中任何一項的突變體，其具有不含下述基因或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為intB基因、JW4228基因、yjgW基因、yjgX基因、yjgY基因、yjgZ基因、yi41基因、yi42基因、yjhB基因、yjhC基因、yjhD基因、yjhE基因、yi91基因、JW4244基因、JW4245基因、JW4246基因、yjhU基因、yjhF基因、yjhG基因、yjhH基因、yjhl基因、sgcR基因、sgcE基因、sgcA基因、sgcQ基因、sgcC基因、JW4266.5基因、sgcX基因、yjhP基因、yjhQ基因、JW4269.5基因、JW4270基因、JW4270.5基因、yjhR基因、yjhS基因、yjhT基因、yjhA基因、fimB基因、fimE基因、fimA基因、fiml基因、fimC基因、fimD基因、fifliF基因、fimG基因、fimH基因、gntP基因、uxuA基因、uxuB基因、uxuR基因、yjiC基因、yjiD基因、yjiE基因、iadA基因、yjiG基因、yjiH基因、yjil基因、yjiJ基因、yjiK基因、JW4296.5基因、yjiL基因、yjiM基因、yjiN基因、yji0基因、yjiP基因、yjiQ基因、yjiR基因、yjiS基因、yjiT基因、yjiV基因、mcrD基因、mcrC基因、mcrB基因、yjiW基因、hsdS基因、hsdM基因、hsdR基因、mrr基因、yjiA基因、yjiX基因、yjiY基因、tsr基因、yjjL基因、JW4320基因、yjjM基因、yjjN基因、mdoB基因以及yjjA基因；(18)上述(1)~(17)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1]或者[2]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DM:鹼基編號4517876位~4599637位所示的鹼基序列；(19)上述(1)~(18)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含kdpF基因、ybfA基因、rhsC基因、JW0690基因、ybfB基因、rhsA基因、ybfC基因、ybfD基因、ybfL基因、ybfD基因以及ybgA基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA;U0)上述(1)~(l"中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號728821位~739593位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA;(21)上述(1)~(20)的任何一項的的大腸桿菌突變體、其具有不含下述基因或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yjfl基因、yjfJ基因、yjfK基因、yjfL基因、yjfM基因、yjfC基因、aidB基因、yjfN基因、yjfO基因、yjfP基因、yjfQ基因、yjfR基因、sgaT基因、sgaB基因、sgaA基因、sgaH基因以及sgaU基因；(22)上述(1)~(21)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號4409533位~4423151位所示的鹼基序列的DM、或者與該DNA相當的DM。0016此外，作為本發明的大腸桿菌突變體，可列舉(23)是含有上述(1)的[1]所述的基因、spr基因、bcr基因以及rsuA基因、或者與它們同源的基因、並且具有比野生型大腸桿菌的染色體DNA短933kBp以上的染色體DNA的大腸桿菌突變體，也可以是具有不含野生型大腸桿菌的染色體DNA上存在的上述基因或者該基因的同源的基因以外的任何基因的染色體DNA的該突變體，優選，具有不含表1中的厶43區域所含基因以外的基因的染色體DNA的該突變體、更優選具有不含表l中的厶43區域所對應的鹼基序列構成的DM或者與該DNA相當的DNA以外的DNA的染色體DM的該突變體，進一步優選(24)上述(23)的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DM不含具有上述(2)的[1]~[55]所述的鹼基序列的DM以及序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號2270440位~2286588位所示的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA;(25)上述(23)或者(24)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因的染色體DNA,所述基因為yafJ基因、yafK基因、yafQ基因、dirJ基因、yafL基園、yafM基因、fhiA基因、lafU基因、dinP基因、yafN基因、yaf0基因、yafP基因、JW0225基因、prfH基因、ykfl基因、yafW基因、yeeT基因、ykfG基因、yafX基因、ykfF基因、ykfB基因、yafY基因、ypjK基因、yafZ基因、ykfA基因、perR基因、JW0245基因、扁246基因、扁247基因、ykfC基因、JW0249基因、is5B基因、yi51基因、mmuP基因、mmuM基因、afuC基因、JW0255基因、insB基因、insA基因、JW0258基因、yagB基因、yagA基因、yagE基因、yagF基因、yagG基因、yagH基因、yagl基因、argF基因、yfjl基因、yagJ基因、yagK基因、yagL基因、yagM基因、yagN基因、intF基因、yagP基因、yagQ基因、yagR基因、yagS基因、yagT基因、yagU基因、ykgJ基因、yagV基因、yagW基因、yagX基因、yagY基因、yagZ基因、ykgK基因、ykgL基因、ykgM基因、eaeH基因、JW0292基因、JW0293基因、ykgA基因、ykgB基因、ykgl基因、ni6r人基因、ykgD基因、ykgE基因、ykgF基因、ykgG基因、ykgH基因、betA基因、betB基因、betl基因、betT基因、yaM基因、yahB基因、yahC基因、yahD基因、yahE基因、yahF基因、yahG基因、yahH基因、arcM基因、yahJ基因、yahK基因、yahL基因、yahM基因、yahN基因、yahO基因、prpR基因、bcpA基因、prpC基因、prpD基因、prpE基因、codB基因、codA基因、cynR基因、cynT基因、cynS基因、cynX基因、lacA基因、lacY基因、lacZ基因、lacl基因、mhpR基因、mhpA基因、mhpB基因、mhpC基因、mhpD基因、mhpF基因、mhpE基因、mhpT基因、yaiL基因、yaiM基因、adhC基因、yaiN基因、yaiO基因、JW0350基因、yi2A基因、yi22基因、yi24基因、yi23基因、yaiP基因、yaiS基因、tauA基因、tauB基因、tauC基因、ssiD基因、yaiT基因、JW0363基因、JW0364基因、yaiU基因、yaiV基因、ampH基因、sbmA基因、yaiW基因、yaiY基因、yaiZ基因、ddlA基因、yaiB基因、phoA基因、psiF基因、yaiC基因、ybbO基因、tesA基因、ybbA基因、ybbP基因、rhsD基因、ybbC基因、rhsE基因、ybbD基因、JW0490基因、ybbB基因、ybbS基因、ybbT基因、ybbU基因、ybbQ基因、ybbV基因、allP基因、alU基因、ybbY基因、ybbZ基因、ylbA基因、allC基因、ylbC基因、fdrA基因、ylbE基因、ylbE基因、ylbE基因、ylbF基因、arcC基因、intD基因、EXO-LAMBD基因、VRPP—LAMBD基因、JW0528基因、JW0529基因、VREN一LAMBD基因、emrE基因、ybcK基因、ybcL基因、ybcM基因、ybcN基因、ninE基因、ybc0基因、rus基因、ybcQ基因、JW0539.5基因、mnpC基因、vlyS基因、ybcS基因、ybcT基因、vboR基因、ybcV基因、ybcW基因、nohB基因、ybcX基因、ybcY基因、JW0552基因、appY基因、ompT基因、envY基因、ybcH基因、nfrA基因、nfrB基因、cusS基因、cusR基因、cusC基因、ylcC基因、cusB基因、cus人基因、pheP基因、ybdG基因、nfnB基因、ybdF基因、ybdJ基因、ybdK基因、hokE基因、yi81基因、yi82基因、ymcC基因、ymcD基因、cspH基因、cspG基因、sfa基因、yccL基因、yccM基因、torS基因、torT基因、torR基因、torC基因、torA基因、torD基因、yccD基因、cbpA基因、yccE基因、agp基因、yccJ基因、wrbA基因、yciG基因、ycdG基因、JW0992基因、JW0993基因、JW0994基因、ycdK基因、JW0996基因、JW0997基因、ycdC基因、putA基因、yzpU基因、putP基因、JW1002基因、ycdO基因、ycdB基因、phoH基因、ycdP基因、ycdQ基因、ycdR基因、ycdR基因、ycdS基因、ycdT基因、JW1012基因、JW1013基因、JW1014基因、ycdU基因、ymfD基因、ymfE基因、lit基因、intE基因、VXIS-BPP21基因、ymfH基因、ymfl基因、ymfJ基因、RPC2-BPP22基因、JW1132基因、ymfL基因、ymfM基因、ymfN基因、ymfR基因、ymfO基因、JW1138基因、JW1139基因、ycfK基因、ymfS基因、ycfA基因、ycfE基因、pin基因、mcrA基因、JW1146基因、ycgW基因、ycgX基因、ycgE基因、JW1150基因、ycgZ基因、ymgA基因、JW1153基因、ymgC基因、yahA基因、JW1156基因、JW1157基因、aidA基因、ymgD基因、JW1160基因、JW1161基因、JW1162基因、ydfH基因、ydfZ基因、ydfl基因、shiA基因、JW1537基因、tnpR基因、ydfM基因、Y314-LAMBD基因、nohA基因、ydfO基因、yccL基因、cspI基因、ydfR基因、vlyS基因、cspB基因、cspF基因、regQ—LAMBD基因、JW1552基因、rem基因、hokD基因、relE基因、relB基因、ydfV基因、flxA基因、ydfW基因、ydfX基因、dicC基因、sdaC基因、yqeH基因、yqel基因、yqeJ基因、yqeK基因、ygeF基因、ygeG基因、ygeH基因、ygel基因、JW2822基因、ygeK基因、JW2824基因、JW2825基因、JW2830基因、ygeP基因、JW2832基因、nlpD基因、yagR基因、ygeT基因、JW2836基因、ygeV基因、ygeW基因、dpaL基因、ygeY基因、ygeZ基因、arcL基因、yqeB基因、JW2844基因、ygfJ基因、gltD基因、JW2847基因、ygfM基因、yagR基因、ygf0基因、ygfP基因、ygfQ基因、ygfR基因、ygfS基因、ygfT基因、pbuX基因、idi基因、epsM基因、exeL基因、exeC基因、JW2938基因、JW2939基因、JW2940基因、JW2941基因、yghK基因、glcB基因、glcG基因、glcF基因、glcD基因、glcC基因、JW2948基因、yghQ基因、yghR基因、yghS基因、yghT基因、yihL基因、yihM基因、yihN基因、yshA基因、yihO基因、yihP基因、yihQ基因、yihR基因、yihS基因、yihT基因、yihU基因、yihV基因、yihW基因、yihX基因、rbn基因、yihZ基因、yiiD基因、yiiE基因、yiiF基因、yiiG基因、frvR基因、frvX基因、frvB基因、frvA基因、yiiL基因、rhaD基因、rhaA基因、rhaB基因、rhaS基因、rhaR基因、rhaT基因、ptsA基因、JW3920基因、frwC基因、frwB基因、pflD基因、pflC基因、frwD基因、yijO基因、yijP基因、JW3986基因、yjbF基因、yjbG基因、yjbH基因、JW3989.5基因、yjbA基因、xylE基因、malG基因、nialF基因、malE基因、malK基因、lamB基因、malM基因、yjbl基因、yjcP基因、yjcQ基因、yjcR基因、yjcS基因、alsK基因、alsE基因、alsC基因、alsA基因、alsB基因、phnQ基因、phnP基因、phnO基因、phnN基因、phnM基因、phut基因、phnK基因、phnJ基因、phnl基因、phnH基因、phnG基因、phnF基因、phnE基因、phnD基因、phnC基因、phnB基因、phnA基因、yjdA基因、yjcZ基因、yidF基因、yidG基因、yidH基因、yidl基因、yidJ基因、yidK基因、yidL基因、JW3657基因、glvG基因、glvB基因、glvC基因、yidP基因、yidE基因、yidQ基因、yidR基因、yidS基因、dgoT基因、dgoA基因、dgoK基因、dgoR基因、yidW基因、yidX基因、yidA基因、yidB基因、asnA基因、yieM基因、JW3724基因、yieN基因、kup基因、rbsD基因、rbsA基因、rbsC基因、rbsB基因、rbsK基因、rbsR基因、yie0基因、yecT基因、flhE基因、flhA基因、HhB基因、cheZ基因、cheY基因、cheB基因、cheR基因、tap基因、tar基因、cheW基因、cheA基因、motB基因、motA基因、flhC基因、flhD基因、JW1882基因、JW1883基因、yecG基因、otsA基因、otsB基因、araH基因、araG基因、araF基因、yecl基因、yecJ基因、JW1892基因、ftn基因、yecH基因、tyrP基因、uvrG基因、uvrY基因、yecF基因、sdiA基因、yecC基因、yecS基因、yed0基因、fliY基因、fliZ基因、fliA基因、fliC基因、fliD基因、fliS基因、fliT基因、amyA基因、yedD基因、yedE基因、yedF基因、yedK基因、yedL基因、yedN基因、yedM基因、fliE基因、fliF基因、fliG基因、fliH基因、mi基因、fliJ基因、fliK基因、fliL基因、fliM基因、fliN基因、fli0基因、fliP基因、fliQ基因、fliR基因、rcsA基因、dsrB基因、JW1937基因、yedA基因、vsr基因、dcm基因、yedJ基因、JW1946基因、ompC基因、JW1948基因、yedS基因、yedU基因、yedV基因、copR基因、yedX基因、JW1954基因、JW1955基因、JW1956基因、JW1974基因、JW1979基因、JW1980基因、yeeP基因、flu基因、JW1983基因、yeeS基因、yeeT基因、yeeU基因、yeeV基因、yeeW基因、yefJ基因、JW2013基因、yefJ基因、yefl基因、wbbj基因、yefG基因、rfc基因、glf基因、rfbX基因、rfbC基因、rfbA基因、rfbD基因、rfbB基因、inU基因、yfjH基因、alpA基因、yfjl基因、JW2606基因、yfjJ基因、yfjK基因、yfjL基因、yfjM基因、yfjN基因、yfjO基因、yfjP基因、yfjQ基因、yfjR基因、ypjK基因、yfjS基因、yfjT基因、yfjU基因、yfjV基因、JW2622基因、yfjW基因、JW2623.5基因、yfjX基因、yfjY基因、yfjZ基因、ypjF基因、ypjA基因、JW2629基因、JW2630基因、JW2631基因、JW2632基因、JW2633基因、JW2634基因、ygaE基因、yzzM基因、yqaE基因、JW2642基因、ygaP基因、stpA基因、JW2645基因、ygaC基因、ygaM基因、nrdH基因、nrdl基因、nrdE基因、proV基因、proW基因、proX基因、JW2655基因、JW2656基因、ygaZ基因、ygaH基因、srlA基因、srlB基因、srlD基因、gutM基因、srlR基因、gutQ基因、gltF基因、yhcA基因、yhcD基因、yhcE基因、yhcE基因、yhcF基因、yhcG基因、yhcH基因、nanK基因、nanE基因、yegE基因、alkA基因、yegD基因、JW2055基因、JW2056基因、JW2057基因、JW2058基因、yegM基因、yegN基因、yeg0基因、yegB基因、baeS基因、baeR基因、JW2065基因、yegQ基因、ogrK基因、JW2068基因、JW2069基因、yegS基因、gatR基因、JW2072基因、JW2073基因、gatR基因、gatD基因、gatC基因、gatB基因、gatA基因、gatZ基因、gatY基因、fbaB基因、xegT基因、yegU基因、yegV基因、yegW基因、yegX基因、molR基因、yehl基因、yehK基因、yehL基因、yehO基因、yehP基因、yehQ基因、yehR基因、yehS基因、yehT基因、yehU基因、yehV基因、yehW基因、yehX基因、yehY基因、yehZ基因-.bglX基因、dld基因、pbpG基因、yohC基因、yeil基因、yeiJ基因、yeiK基因、yeiL基因、yeiM基因、yeiN基因、yeiC基因、cmtA基因、cmtB基因、intB基因、JW4228基因、yjgW基因、yjgX基因、yjgY基因、yjgZ基因、yi41基因、yi42基因、yjhB基因、yjhC基因、yjhD基因、yjhE基因、yi91基因、JW4244基因、JW4245基因、JW4246基因、yjhU基因、yjhF基因、yjhG基因、yjhH基因、yjhl基因、sgcR基因、sgcE基因、sgcA基因、sgcQ基因、sgcC基因、JW4266.5基因、sgcX基因、yjhP基因、yjhQ基因、JW4269.5基因、JW4270基因、JW4270.5基因、yjhR基因、yjhS基因、yjhT基因、yjhA基因、fimB基因、fimE基因、fimA基因、fiml基因、fimC基因、fimD基因、fimF基因、fimG基因、fimH基因、gntP基因、uxuA基因、uxuB基因、uxuR基因、yjiC基因、yjiD基因、yjiB基因、iadA基因、yjiG基因、yjiH基因、yjil基因、yjiJ基因、yjiK基因、JW4296.5基因、yjiL基因、yjiM基因、yjiN基因、yjiO基因、yjiP基因、yjiQ基因、yjiR基因、yjiS基因、yjiT基因、yjiV基因、mcrD基因、mcrC基因、mcrB基因、yjiW基因、hsdS基因、hsdM基因、hsdR基因、mrr基因、yjiA基因、yjiX基因、yjiY基因、tsr基因、yjJL基因、JW4320基因、yjjM基因、yjjN基因、mdoB基因、yjjA基因、kdpF基因、ybfA基因、rhsC基因、JW0690基因、ybfB基因、rhsA基因、ybfC基因、ybfL基因、ybfD基因、ybgA基因、yjfl基因、yjfJ基因、yjfK基因、yjfL基因、yjfM基因、yjfC基因、aidB基因、yjfN基因、yjfO基因、yjfP基因、yjfQ基因、yjfR基因、sgaT基因、sgaB基因、sgaA基因、sgaH基因、sgaU基因、rhsB基因、JW3448基因、yhhH基因、yibA基因、yhhl基因、yhhJ基因、yhiH基因、yhil基因、yhiJ基因、yhiK基因、yhiL基因、yhiM基因、yhiN基因、JW0782基因、ybiA基因、dinG基因、ybiB基因、ybiC基因、ybiJ基因、ybil基因、ybiX基因、ybiL基因、ybiM基因、ybiN基因、ybiO基因、glnQ基因、glnP基因、glnH基因、yliA基因、yliB基因、yliC基因、yliD基因、JW0817基因、JW0818基因、yliG基因、yliH基因、ylil基因、yliJ基因、dacC基因、deoR基因、ybjG基因、ybjC基因、mdaA基因、rimK基因、ybjN基因、potF基因、potG基因、potH基因、potl基因、ybjO基因、ybjF基因、artJ基因、artM基因、artQ基因、artl基因、artP基因、ybjP基因、謂850基因、扁851基因、JW0852基因、ybjT基因以及ltaA基因、或者與它們同源的基因；(26)上述(23)~(25)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[l]~[43]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DM的[1]鹼基編號243965位~253410位所示的鹼基序列、[2]鹼基編號261964位~387531位所示的鹼基序列、[3〗鹼基編號389139位~403703位所示的鹼基序列、[4〗鹼基編號518030位~532711位所示的鹼基序列、[5]鹼基編號535505位~550215位所示的鹼基序列、[6〗鹼基編號563941位~608118位所示的鹼基序列、[7]鹼基編號728821位~739593位所示的鹼基序列、[8]鹼基編號832552位~848089位所示的鹼基序列、[9]鹼基編號867638位~883473位所示的鹼基序列、10]鹼基編號890998位~11]4^>^編號1048888位12]鹼基編號1198106位13]鹼基編號1630912位14]鹼基編號1642632位15]鹼基編號1964524位16]鹼基編號1996662位17]>^4基編號2033449位18]鹼基編號2069149位19]鹼基編號2104393位20]鹼基編號2146264位21]鹼基編號2200669位22]鹼基編號2255895位23]鹼基編號2755677位24]鹼基編號2795174位25]鹼基編號2804308位26]鹼基編號2825314位27]鹼基編號2985362位28]鹼基編號3077085位29]鹼基編號3H0110位30]鹼基編號3360737位31]鹼基編號3618576位32]3854662位33]鹼基編號3867102位34]鹼基編號3926659位35]鹼基編號4059898位36]鹼基編號4086451位37]鹼基編號4139232位38]鹼基編號4235359位909379位所示的鹼基序列、-1097019位所示的鹼基序列、-1225146位所示的鹼基序列、-1641038位所示的鹼基序列、-1650222位所示的鹼基序列、-1993075位所示的鹼基序列、-2028209位所示的鹼基序列、-2044376位所示的鹼基序列、-2081926位所示的鹼基序列、-2116064位所示的鹼基序列、-2187855位所示的鹼基序列、-2229850位所示的鹼基序列、-2263491位所示的鹼基序列、-2789480位所示的鹼基序列、-2800890位所示的鹼基序列、-2810147位所示的鹼基序列、-2830262位所示的鹼基序列、-3033128位所示的鹼基序列、-3078916位所示的鹼基序列、-3134341位所示的鹼基序列、-3370547位所示的鹼基序列、-3636916位所示的鹼基序列、-3865831位所示的鹼基序列、-3877010位所示的鹼基序列、-3938878位所示的鹼基序列、-4079659位所示的鹼基序列、-4099982位所示的鹼基序列、-4149709位所示的鹼基序列、-4251735位所示的鹼基序列、[39]鹼基編號4298977位~4311511位所示的鹼基序列、[40]鹼基編號4313318位~4329721位所示的鹼基序列、[41]鹼基編號4409533位~4423151位所示的鹼基序列、[42]鹼基編號4496202位~4509534位所示的鹼基序列、以及[43]鹼基編號4517876位~4599637位所示的鹼基序列；(27)上述(23)~(26)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因的染色體DNA，所述基因為ygiS基因、ygiT基因、ygiU基因、JW2991基因、ygiW基因、ygiX基因、ygiY基因、ygiZ基因、mdaB基因以及ygiN基因、或者與它們同源的基因；(28)上述(23)~(27)中任何一項的大腸桿菌突變體、其具有下述染色體DNA,所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3165628位~3172940位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的腿;(29)上述(23)~(28)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為ybeL基因、ybeQ基因、ybeR基因、ybeS基因、ybeT基因、ybeU基因、ybeV基因、ybeW基因、ybeK基因、gltL基因、gltK基因、gltJ基因、ybeJ基因以及JW0651基因；(30)上述(23)~(29)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DM，所述染色體DM不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號675104位~689374位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA;(31)上述(23)~(30)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yfcC基因、JW2296基因、yfcE基因、yfcF基因、yfcG基因、folX基因、JW2301基因、yfcl基因、hisP基因、hisM基因、hisQ基因、hisJ基因、argT基因、yfdB基因、JW2346基因、yfdH基因、JW2348基因、yfdK基因、yfdL基因、yfdM基因、xylU基因、yfdN基因、yfdO基因、JW2356基因、JW2357基因、JW2358基因、JW2359基因、JW2360基因、JW2378基因、yqhT基因、ptwC基因以及ptwB基因；(32)上述(23)~(31)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DM，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1]~[3]所述鹼基序列的DNA或者與它們相當的DM:鹼基編號2505075位~2514557位所示的鹼基序列。(33)上述(23)~(32)的任何一項的的大腸桿菌突變體，其具有不含pin0基因、gspA基因、gspC基因、gspD基因、gspE基因、hofF基因、hofG基因、hofH基因、gspl基因、gspJ基因、gspK基因、gspL基因、pshM基因、hofD基因、bfr基因、yheA基因以及chiA基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA;(34)上述(23)~(33)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3453021位~3469366位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的腿;(35)上述(23)~(34)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含elaB基因、elaA基因、elaC基因、elaD基因、yfbK基因、yfbL基因、yfbM基因、yfbN基因、JW2269基因以及JW2270基因、或者與它們同源的基因的染色體DM;(36)上述(23)~(35)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所迷染色體DM不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號2386262位~2395471位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA;(37)上述(23)~(36)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含yhdJ基因、yhdU基因、envR基因、acrE基因、envD基因、yhdV基因、yhdW基因、yhdX基因以及yhdY基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA;(38)上述(23)~(37)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3411160位~3420878位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA;(39)上述(23)~(38)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有不含chpA基因、或者它的同源基因的染色體DNA;(40)上述(23)~(39)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DM不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號2910274位~2910573位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA;(41)上述(23)~(40)的任何一項的的大腸桿菌突變體，其具有不含fhuA基因、fhuC基因、fhuD基因以及fhuB基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA;(42)上述(23)~(41)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號167065位~172979位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。0017表1tableseeoriginaldocumentpage105tableseeoriginaldocumentpage106tableseeoriginaldocumentpage107表l(續)tableseeoriginaldocumentpage108表l(續)tableseeoriginaldocumentpage109表l(續)tableseeoriginaldocumentpage110表l(續)tableseeoriginaldocumentpage111表l(續)tableseeoriginaldocumentpage112表l(續)tableseeoriginaldocumentpage113表l(續)tableseeoriginaldocumentpage114表l(續)tableseeoriginaldocumentpage115表l(續)tableseeoriginaldocumentpage116表l(續)tableseeoriginaldocumentpage117表l(續)tableseeoriginaldocumentpage118表l(續)tableseeoriginaldocumentpage119表l(續)tableseeoriginaldocumentpage120表l(續)tableseeoriginaldocumentpage121tableseeoriginaldocumentpage122表l(續)tableseeoriginaldocumentpage123表l(續)tableseeoriginaldocumentpage124表l(續)tableseeoriginaldocumentpage125表l(續)tableseeoriginaldocumentpage126表l(續)tableseeoriginaldocumentpage127tableseeoriginaldocumentpage128表l(續)tableseeoriginaldocumentpage129tableseeoriginaldocumentpage130表l(續)tableseeoriginaldocumentpage131表l(續)基因名稱編碼鏈在序列號1上開始的編號(互補鏈編碼的情況下為結束的編號)在序列號1上結束的編號(互補鏈編碼的情況下為開始的編號)兩834(ybjC)890998891285J謂35(mdaA)891269891991JW0836(rimK)892052892954JW0837(ybjN)893042893518JW0838(potF)893869894981J謂39(potG)894995896209兩840(potH)896219897172JW0841(potl)897169898014JW0842(ybjO)898074898562JW0843(ybjF)898603899730JW0844(artJ)互補鏈899929900660JW0845(artM)互補鏈900951901619扁846(artQ)互補鏈901619902335JW0847(artl)互補鏈902342903073JW0848(artP)互補鏈903091903819JW0849(ybjP)互補鏈904037904552JW0850(211#9)904678905001JW0851(211#10)904998905828JW0852(211#11)互補鏈905825906874JW0853(ybjT)互補鏈906937908442JW0854(ltaA)互補鏈908378909379J謂55(poxB)互補鏈909416911134兩856(ybjV)互補鏈911267912241JW0857(ybjW)互補鏈912247913899兩858(ybjE)互補鏈914043914942JW0859(aqpZ)互補鏈915437916132JW0860(ybjD)916558918216JW0861(ybjX)互補鏈918213919205JW0862(213#3)919320920435JW0863(ybjZ)920432922378JW0864(cspD)互補鏈922451922675表l(續)tableseeoriginaldocumentpage133表l(續)tableseeoriginaldocumentpage134表l(續)tableseeoriginaldocumentpage135表l(續)tableseeoriginaldocumentpage136表l(續)tableseeoriginaldocumentpage137tableseeoriginaldocumentpage138表l(續)tableseeoriginaldocumentpage139表l(續)tableseeoriginaldocumentpage140tableseeoriginaldocumentpage141表l(續)tableseeoriginaldocumentpage142表l(續)tableseeoriginaldocumentpage143表l(續)tableseeoriginaldocumentpage144表l(續)tableseeoriginaldocumentpage145表l(續)tableseeoriginaldocumentpage146表l(續)tableseeoriginaldocumentpage147tableseeoriginaldocumentpage148表l(續)tableseeoriginaldocumentpage149表l(續)tableseeoriginaldocumentpage150表l(續)tableseeoriginaldocumentpage151表l(續)tableseeoriginaldocumentpage152表l(續)tableseeoriginaldocumentpage153表l(續)tableseeoriginaldocumentpage154表l(續)tableseeoriginaldocumentpage155表l(續)tableseeoriginaldocumentpage156tableseeoriginaldocumentpage157表l(續)tableseeoriginaldocumentpage158表l(續)tableseeoriginaldocumentpage159表l(續)tableseeoriginaldocumentpage160表l(續)tableseeoriginaldocumentpage161表l(續)tableseeoriginaldocumentpage162表l(續)tableseeoriginaldocumentpage163表l(續)tableseeoriginaldocumentpage164表l(續)tableseeoriginaldocumentpage165tableseeoriginaldocumentpage166表l(續)基因名稱編碼鏈在序列號1上開始的編號(互補鏈編碼的情況下為結束的編號)在序列號1上結束的編號(互補鏈編碼的情況下為開始的編號)JW1910(fliS)20083012008711JW1911(fliT)20087112009076JW1912(amyA)20091542010641JW1913(yedD)互補鏈20106752011088JW1914(yedE)20112752012480JW1915(yedF)20124772012710JW1916(yedlQ20128192013487JW1917(yedL)20135982014077JW1918(yedN)互補鏈20143462014537JW1919(yedN)互補鏈20145472014867JW1920(yedM)互補鏈20149992015349JW1921(fHE)互補鏈20156982016012JW1922(fliF)20162272017885JW1923(fliG)20178782018873JW1924(fliH)20188662019552JW1925(flil)20195522020925JW1926(fliJ)20209442021387JW1927(fliK)20213842022511JW1928(fliL)20226162023080JW1929(fliM)20230852024089JW1930(fliN)20240862024499JW1931(fliO)20245622024867JW1932(fliP)20248672025604JW1933(fliQ)20256142025883JW1934(fliR)20258912026676JW1935(rcsA)20269662027589JW1936(dsrB)互補鏈20276332027821JW1937(344#6)20279812028211JW1938(yedP)20285092029324JW1939(344#8)互補鏈20293212031015JW1940(344#9)互補鏈20311862031368167表l(續)tableseeoriginaldocumentpage168表l(續)tableseeoriginaldocumentpage169表l(續)tableseeoriginaldocumentpage170tableseeoriginaldocumentpage171表l(續)tableseeoriginaldocumentpage172表l(續)tableseeoriginaldocumentpage173表l(續)tableseeoriginaldocumentpage174表l(續)tableseeoriginaldocumentpage175tableseeoriginaldocumentpage176表l(續)tableseeoriginaldocumentpage177表l(續)tableseeoriginaldocumentpage178表l(續)tableseeoriginaldocumentpage179yqeK基因、ygeF基因、ygeG基因、ygeH基因、ygel基因、JW2822基因、ygeK基因、JW2824基因、JW2825基因、JW2830基因、ygeP基因、JW2832基因、nlpD基因、yagR基因、ygeT基因、JW2836基因、ygeV基因、ygeW基因、dpaL基因、ygeY基因、ygeZ基因、arcL基因、yqeB基因、JW2844基因、ygfJ基因、gltD基因、JW2847基因、ygfM基因、yagR基因、ygfO基因、ygfP基因、ygfQ基因、ygfR基因、ygfS基因、ygfT基因、pbuX基因、idi基因、epsM基因、exeL基因、exeC基因、JW2938基因、JW2939基因、JW2940基因、JW2941基因、yghK基因、glcB基因、glcG基因、glcF基因、glcD基因、glcC基因、JW2948基因、yghQ基因、yghR基因、yghS基因、yghT基因、yihL基因、yihM基因、yihN基因、yshA基因、yihO基因、yihP基因、yihQ基因、yihR基因、yihS基因、yihT基因、yihU基因、yihV基因、yihW基因、yihX基因、rbn基因、yihZ基因、yiiD基因、yiiE基因、yiiF基因、yiiG基因、frvR基因、frvX基因、frvB基因、frvA基因、yiiL基因、rhaD基因、rhaA基因、rhaB基因、rhaS基因、rhaR基因、rhaT基因、ptsA基因、JW3920基因、frwC基因、frwB基因、pflD基因、pflC基因、frwD基因、yijO基因、yijP基因、JW3986基因、yjbF基因、yjbG基因、yjbH基因、JW3989.5基因、yjbA基因、xylE基因、malG基因、malF基因、malE基因、malK基因、lamB基因、malM基因、yjbl基因、yjcP基因、yjcQ基因、yjcR基因、yjcS基因、alsK基因、alsC基因、alsA基因、alsB基因、phnQ基因、phnP基因、phnO基因、phnN基因、phnM基因、phnL基因、phnK基因、phnJ基因、phnl基因、phnH基因、phnG基因、phnF基因、phnE基因、phnD基因、phnC基因、phnB基因、phnA基因.*yjdA基因以及yjcZ基因；(4)上述(1)~(3)中任何一項的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DM，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1]~[18]所述鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:鹼基編號243965位~253410位所示的鹼基序列、[2]鹼基編號261964位~387531位所示的鹼基序列、tableseeoriginaldocumentpage181表l(續)tableseeoriginaldocumentpage182表l(續)tableseeoriginaldocumentpage183表l(續)tableseeoriginaldocumentpage184表l(續)tableseeoriginaldocumentpage185表l(續)tableseeoriginaldocumentpage186表l(續)tableseeoriginaldocumentpage187表l(續)tableseeoriginaldocumentpage188表l(續)tableseeoriginaldocumentpage189表l(續)基因名稱編碼鏈在序列號1上開始的編號(互補鏈編碼的情況下為結束的編號)在序列號1上結束的編號(互補鏈編碼的情況下為開始的編號)JW2622(442#2.2)互補鏈27724942772610JW2623(yfjW)27728362774539JW2623.5(442#4)27752372775440JW2624(yfjX)27754372775895JW2625(yfjY)27759042776386J賜26(yfjZ)27766332776950JW2627(ypjF)27769712777300JW2628(ypjA)互補鏈27776642782373JW2629(4"#1.1)互補鏈27831562783947JW2630(443#1.2)互補鏈27840472784445JW2631(443#2)27862662786952JW2632(443#2.1)27873432787756JW2633(443並2.2)27878952788167JV2634(443#3)27883982789480JW2635(ygaF)27895002790768JW2636(gabD)27907912792239JW2637(gabT)27922532793533JW2638(gabP)2793771279517JW2639(ygaE)27951922795854JW2640(yzzM)互補鏈27958552796304JW2641(yqaE)互補鏈27963882796546JW2642(445#2)27967292797028JW2643(ygaP)27970382797562JW2"4(stpA)互補鏈27976092798013JW2645(445弁5)27986822799131JW2646(ygaC)互補鏈27991682799512JW2647(ygaM)27996522799993JW2648(nrdH)28002412800486JW2649(nrdl)28004832800893JW2650(nrdE)28008662803010JW2651(nrdF)28030202803979表l(續)tableseeoriginaldocumentpage191表l(續)tableseeoriginaldocumentpage192表l(續)tableseeoriginaldocumentpage193表l(續)tableseeoriginaldocumentpage194表l(續)tableseeoriginaldocumentpage195表l(續)tableseeoriginaldocumentpage196tableseeoriginaldocumentpage197表l(續)tableseeoriginaldocumentpage198表l(續)tableseeoriginaldocumentpage199表l(續)tableseeoriginaldocumentpage200表l(續)tableseeoriginaldocumentpage201表l(續)tableseeoriginaldocumentpage202表l(續)tableseeoriginaldocumentpage203tableseeoriginaldocumentpage204tableseeoriginaldocumentpage205表l(續)tableseeoriginaldocumentpage206表l(續)tableseeoriginaldocumentpage207tableseeoriginaldocumentpage208表l(續)tableseeoriginaldocumentpage209表l(續)tableseeoriginaldocumentpage210表l(續)tableseeoriginaldocumentpage211tableseeoriginaldocumentpage212tableseeoriginaldocumentpage213表l(續)tableseeoriginaldocumentpage214tableseeoriginaldocumentpage215表l(續)tableseeoriginaldocumentpage216表l(續)tableseeoriginaldocumentpage217表l(續)基因名稱編碼鏈在序列號1上開始的編號(互補鏈編碼的情況下為結束的編號)在序列號1上結束的編號(互補鏈編碼的情況下為開始的編號)JW3487(treF)36690983670747JW3488(yhjB)互補鏈36707983671400JW3489(yhjC)36718483672819JW3490(yhjD)36728683673881JW3491(yhjE)36742923675614JW3492(yhjG)互補鏈36757963677871JW3493(yhjH)互補鏈36779263678693JW3494(kdgK)36787063679854JW3495(yhjJ)互補鏈36799503681446JW3496(dctA)互補鏈36816673682953JW3497(yhjK)互補鏈36831363685091JW3498(yhjL)互補鏈36852063688628JW3499(yhjM)互補鏈36886603689766JW3500(yhjN)互補鏈36897733692112JW3501(yhjO)互補鏈36921233694789JW3502(yhjQ)互補鏈36947383695466JW3503(yhjR)互補鏈36955023695690JW3504(yhjS)36959633697534JW3505(yhjT)36975343697722JW3506(yhjU)36977193699398JW3507(603#8)互補鏈36994853699760JW3508(yhjV)37000683701339JW3509(dppF)互補鏈37013693702373JW3510(dppD)互補鏈37023703703353JW3511(dppC)互補鏈37033643704266JW3512(dppB)互補鏈37042763705295JW3513(dppA)互補鏈37056033707210JW3514(yzpK)互補鏈37077253708072JW3515(yhjW)互補鏈37082893710013JW3516(yhjX)互補鏈37103043711512JW3517(yhjY)互補鏈37117413712445218表l(續)基因名稱編碼鏈在序列號1上開始的編號(互補鏈編碼的情況下為結束的編號)在序列號1上結束的編號(互補鏈編碼的情況下為開始的編號)JW3518(tag)37125973713160JW3519(yiaC)37131573713597JW3520(bisC)互補鏈37135663715905JW3521(yiaD)37160523716711JW3522(yUE)37168033717789JW3523(yiaF)互補鏈37178393718669JW3524(yiaG)37189833719273JW3525(cspA)37195543719766JW3526(yiaZ)互補鏈37199533720105JW3527(yi5A)37201853720706JW3528(yi5B)37207033721554JW3529(yi5C)互補鏈37209613721317JW3530(glyS)互補鏈37218333723902JW3531(glyQ)互補鏈37239123724823JW3532(601#3)互補鏈37249183725217JW3533(yiaH)37253923726387JW3534(yiaA)互補鏈37264293726866JW3535(yiaB)互補鏈37269123727265JW3536(xylB)互補鏈37274223728876JW3537(xylA)互補鏈37289483730270JW3538(xylF)37306363731628JW3539(xylG)37317063733247JW3540(xylH)37332253734406JW3541(xylR)37344843735662JW3542(bax)互補鏈37358583736682JW3543(malS)37370023739032JW3544(avtA)37392103740463JW3545(ysaA)互補鏈37406143741087JW3546(yiaJ)互補鏈37411893742037JW3547(yiaK)37422383743236JW3548(yiaL)37432483743715219tableseeoriginaldocumentpage220表l(續)tableseeoriginaldocumentpage221表l(續)tableseeoriginaldocumentpage222表l(續)tableseeoriginaldocumentpage223表l(續)tableseeoriginaldocumentpage224表l(續)tableseeoriginaldocumentpage225表l(續)tableseeoriginaldocumentpage226表l(續)tableseeoriginaldocumentpage227tableseeoriginaldocumentpage228表l(續)tableseeoriginaldocumentpage229tableseeoriginaldocumentpage230tableseeoriginaldocumentpage231表l(續)tableseeoriginaldocumentpage232表l(續)tableseeoriginaldocumentpage233tableseeoriginaldocumentpage234表l(續)tableseeoriginaldocumentpage235表l(續)tableseeoriginaldocumentpage236表l(續)tableseeoriginaldocumentpage237表l(續)tableseeoriginaldocumentpage238tableseeoriginaldocumentpage239表l(續)tableseeoriginaldocumentpage240表l(續)tableseeoriginaldocumentpage241tableseeoriginaldocumentpage242tableseeoriginaldocumentpage243tableseeoriginaldocumentpage244表l(續)tableseeoriginaldocumentpage245表l(續)tableseeoriginaldocumentpage2460165作為藥物抗性基因，對大腸桿菌表現出敏感性的藥物，只要是可賦與藥物抗性藥物抗性基因即可，可以使用任何藥物抗性基因。作為該藥物抗性基因，例如可列舉卡那黴素抗性基因、氯黴素抗性基因、慶大黴素抗性基因、鏈黴素抗性基因、四環素抗性基因以及氨千抗性基因等。0166能夠用於陰性篩選的基因是指，在大腸桿菌中表達該基因時，在一定的培養條件下，對該大腸桿菌是致死性的基因，作為該基因，例如可列舉來自屬於桿菌菌屬的微生物的sacB基因[Appl.Environ.Microbiol.,59，1361-1366(1993)]、以及來自屬於大腸桿菌屬的微生物的rpsL基因[Genomics,72，99-104(2001)]等。■01671上述的直鏈DM的兩個末端上存在的、與位於染色體DM上的作為取代或者缺失的導入對象的區域的兩端的外側上的DNA或者與該DNA具有同源性的DNA，在直鏈DM中按照與染色體DNA上的方向相同的方向進行設置、其長度優選lOBp~100Bp左右，更優選20Bp~50Bp左右，進一步優選3040Bp左右。0168被來自酵母的Flp重組酶所識別的鹼基序列，只要是被該蛋白質所識別、催化同源重組的鹼基序列，可以是具有被來自酵母的Flp重組酶識別、催化同源重組的鹼基序列的鹼基序列。具有同源性的DNA是指具有能夠引起上述直鏈DNA與染色體DNA上的目的區域同源重組程度的相同性的DNA，作為具體的同源性，可以列舉具有80%以上、優選90%以上、更優選95%以上、進一步優選100%的同源性的DNA。0169可以使用前述的BLAST或者FASTA等的程序測定上述鹼基序列的同源性。可以通過PCR製備上述直鏈DNA片段。此外，將含有上述直鏈DNA的DNA構建到質粒上之後，可以用限制性酶進行處理得到目的直鏈DNA。0170作為在大腸桿菌的染色體DNA中導入鹼基的缺失、置換或者添加的方法，可以列舉下述1~4的方法。方法l:將上述(a)或者(d)的直鏈DNA導入宿主微生物，根據藥物抗性的指標，選擇該直鏈DNA與染色體DNA通過同源重組而被插入了的轉化林的方法。方法2:通過上述方法1獲得的轉化林中，導入與下述DNA直接連接了的DNA，所述DNA是與作為鹼基的缺失、置換或者添加的導入對象的染色體DNA上的區域的兩外側上存在的DNA或者與該DNA具有同源性的DNA，通過該方法去除在染色體DNA上插入的藥物基因，使微生物的染色體DNA上的區域被取代或者缺失的方法。方法3:上述(c)的直鏈DNA導入宿主微生物，以藥物抗性為指標選擇通過該直鏈DNA在染色體DM上發生同源重組而被插入其中的轉化林；合成下述DNA，所述DNA是與位於染色體DNA上的取代或者缺失的對象區域的兩端的外側的DNA具有同源性的DM按照與染色體DNA上方向的相同的方向連接了的DNA，導入到上述[1]得到的轉化林中；在能夠使用於陰性篩選的基因表達的條件下、培養進行了上述[2]的操作的轉化林，將在該培養中可以生長繁殖的菌抹，選擇將藥物抗性基因以及用於陰性篩選的基因從染色體DNA上除去了的菌林的方法。方法4:將上述(d)的直鏈DM導入宿主微生物，將藥物抗性作為指標，選擇該直鏈DM通過與染色體DNA發生同源重組而^皮插入的轉化林；向上述[1]得到的轉化抹中導入Flp重組酶基因表達質粒，使該基因表達後，獲得上述[1]中使用的對藥物敏感的菌林。0171作為上述方法中使用的將直鏈DNA導入到宿主微生物的方法，只要是能向該微生物導入DNA的方法，就可以使用，例如，可列舉使用鈣離子的方法[Proc.Natl.Acad.Sci.，USA,69，2110(1972)]、原生質法(特開昭63-248394)、電轉化法[NucleicAcidsRes.，16，6127(1988)]等。0172在方法2或者方法3[2]中使用的DNA中，通過向該DNA的中央部分附近，重組入想要插入到染色體DNA上的任意的基因，使藥物抗性基因等去除的同時，可以將任意基因插入到染色體DNA上。在上述方法2~4中，因為是在最終得到的轉化林的染色體DNA上不殘餘藥物抗性基因以及能夠用於陰性篩選的基因等的外來基因^的方法，所以，通過使用該方法，使用相同的藥物抗性基因以及能夠用於陰性篩選的基因，通過重複該方法的操作可以容易地製備在染色體DNA上處於不相同的2個以上的區域具有基因或者DNA的缺失的大腸桿菌。0173通過上述方法獲得的大腸桿菌突變體，在經過一定小時的培養後，菌體量比野生型大腸桿菌多可以通過根據常規方法在每隔一定小時的培養，測定培養物的660nm或者590nm的吸收或者單位培養基的ATP量等加以確認，例:fta:使用由1%的葡萄糖、0.6%的磷酸氬二鈉、0.3%的磷酸二氫鉀、0.05%的氯化鈉、0.1%的氯化銨、2mmo1/1硫酸鎂置七水合物、10mg/l的硫酸鐵、10Oumo1/1的氯化鈣構成的M9最小培養基、或者含有3%葡萄糖的LB液體培養基[10g/l的細菌用蛋白腖(Defico公司製造)、5g八細菌用酵母提取物(Defico公司製造)、5g/1的氯化鈉、lml/1的lmo1/1氫氧化鈉]等，分別培養用作親本林的野生型大腸桿菌以及該突變體，然後每隔一定小時，測定培養物的660nm或者590nm的吸收、或者單位培養基的ATP量。0174此外，本發明的大腸桿菌突變體可以通過如下方法製備使具有生產有用物質的能力的大腸桿菌的染色體DNA上的基因或者DNA缺失的方法、或者向染色體DNA上的基因或者DNA缺失了的大腸桿菌賦與有用物質的生產性的方法。具有生產有用物質的能力的大腸桿菌只要具有生產l種以上的有用物質的能力的大腸桿菌可以是任何大腸桿菌，作為該大腸桿菌，可列舉在其是從自然界分離的菌林自身具有該能力的情況下，對該菌林通過公知的方法人為地賦與生產所期望的有用物質的能力的大腸桿菌等。01751作為該〃>知的方法，可列舉(a)緩和或者解除控制有用物質的生物合成的至少一種機制的方法；(B)強化表達至少一種參與有用物質的生物合成酶的方法；(c)增加至少一種參與有用物質的生物合成的酶基因的拷貝數的方法；(d)弱化或者阻斷至少一個從有用物質的生物合成途徑向該有用物質以外的代謝產物分支的代謝途徑代的方法；以及(e)選擇相較野生型菌林而言，有用物質的類似物的耐受性高的細胞林的方法等，上述公知的方法可以單獨或者組合使用。0176作為上述(a)~(e)的具體的方法可列舉例如有用物質是胺基酸的情況下，對於上述(a)的方法記載在Agric.Biol.Chem.，43，105-111(1979),J.Bacteriol.，110，761-763(1972)以及Appl.Microbiol.Biotechnol.，39，318-323(1993)等記中。對於上述(b)的方法，記載在Agric.Biol.Chem.，43，105-111(1979)以及J.Bacteriol.，110，761-763(1972)等中。上述(c)的方法記栽在Appl.Microbiol.Biotechnol.，39，318-323(1993)以及Agric.Biol.Chem,，39，371-377(1987)等中。上述(d)的方法記栽在Appl.Environ.Micribiol.，38，181-190(1979)以及Agric.Biol.Chem.，42，1773-1778(1978)等中。上述(e)的方法記載在Agric.Biol.Chem.，36，1675-1684(1972)、Agric.Biol.Chem.，41，109-116(1977)、Agric.Biol.Chem.，37，2013-2023(1973)以及Agric.Biol.Chem.，51，2089-2094(1987)等中。參考上述文獻等可以製備具有生成、蓄積各種胺基酸的能力的微生物。0177進一步地，通過上述(a)~(e)中的任一項或者組合的方法，製備具有生成、蓄積胺基酸的能力的微生物的方法在Biotechnology2nded.，Vol.6，ProductsofPrimaryMetabolism(VCHVerlagsgesellschaftmbH，Weinheim，1996)section14a，14b々AdvancesinBiochemicalEngineering/Biotechnology,79，1-35(2003)、胺基酸發酵、學會出版七y夕一、相田浩G(1986)中記載了多個例子。此外，製備具有生成、蓄積上述以外的具體胺基酸的能力的微生物的方法在特開2003-164297、Agric.Biol.Chem.,39，153—160(1975)、Agric.Biol.Chem.，39,1149-1153(1975)、特開昭58-13599、J.Gen.Appl.Microbiol.，4，272-283(1958)、特開昭63-94985、Agric.Biol.Chem.，37，2013-2023(1973)、W097/15673、特開昭56-18596、特開昭56-144092以及特表2003-511086等中有多個報導，通過參考上述文獻等，能夠製備具有生產l種以上的胺基酸的能力的大腸桿菌突變體。與製備具有生產胺基酸的能力的大腸桿菌突變體的方法相同地，也可以製備使該有用物質的生物合成酶的強化、生物合成調節機制以及釋放機制等的改變的其他的具有生產有用物質的能力的大腸桿菌。3.本發明的有用物質的製備方法
技術領域：
：本發明的有用物質的製備方法涉及如下的有用物質的製備方法其特徵在於將本發明的大腸桿菌突變體在培養基中進行培養，在培養物中生成、蓄積有用物質，從該培養物回收該有用物質。0178作為該有用物質，只要是使用本發明的大腸桿菌突變體能夠製備有用物質，沒有特別的限定，例如可列舉蛋白質、肽、胺基酸、核酸、維生素、糖、有機酸、脂類等，作為蛋白質，可列舉肌苷激酶、穀氨酸-5-激酶(EC2.7.2.11)、穀氨酸-5-琥珀酸半醛脫氫酶(EC1.2.1.41)、二氬吡咯-5-羧酸還原酶(EC1.5.1.2)、人粒細胞克隆刺激因子等、作為肽有穀胱甘肽等；作為胺基酸有L-丙氨酸、甘氨酸、L-穀氨醯胺、L-穀氨酸、L-天冬醯胺、L-天冬氨酸、L-賴氨酸、L-蛋氨酸、L-蘇氨酸、L-亮氨酸、L-纈氨酸、L-異亮氨酸、L-脯氨酸、L-組氨酸、L-精氨酸、L-酪氨酸、L-色氨酸、L-苯丙氨酸、L-絲氨酸、L-半胱氨酸、L-3-羥基脯氨酸、L-4-羥基脯氨酸等；作為核酸有肌苷、鳥苷、肌苷酸、鳥苷酸等，作為維生素有核黃素、硫胺、抗壞血酸等；作為糖有木糖、木糖醇等；作為脂類有EPA(二十碳五烯酸)或者DHA(二十二碳六烯酸)等。0179本發明的製造方法中使用的大腸桿菌突變體的培養可以按照下述記載的常用的方法進行。本發明的製造方法中使用的培養大腸桿菌突變體的培養基，可以使用含有該微生物可同化的碳源、氮源、無機鹽類等，只要是能夠對有效率地進行該微生物的培養的培養基，可以使用天然培養基、合成培養基中的任何一種。0180作為碳源，只要是該微生物可以同化的碳源即可，可以使用葡萄糖、果糖、蔗糖、其它含有它們的糖蜜、澱粉和澱粉水解產物等碳水化合物；醋酸和丙酸等有機酸；乙醇和丙醇等醇類。關於氮源，可以使用氨、氯化銨、硫酸銨、醋酸銨和磷酸銨等無機酸或有機酸的銨鹽、含氮化合物、蛋白腖、肉貪、酵母提取物、玉米漿、酪蛋白水解產物、豆餅、豆餅水解產物和各種發酵的微生物菌體及其消化的產物等。0181作為無機鹽，可以使用磷酸二氫鉀、磷酸氫二鉀、磷酸鎂、硫酸鎂、氯化鈉、疏酸亞鐵、硫酸錳、硫酸銅和碳酸鉀等。通常在振蕩培養或在深度通氣攪拌培養等需氧條件下進行培養。培養溫度優選為15~40iC，培養時間通常是16小時至7天。在培養過程中，將pH維持在3.0~9.0。使用無機酸或有機酸、鹼溶液、尿素、碳酸鈣、氨等進行pH調節。0182在有用物質在菌體外生成、蓄積的情況下，可以在培養結束後，從培養物中除去菌體等沉澱物，通過並用離子交換處理法、濃縮法、鹽析法等，從培養物分離、純化目的有用物質。在有用物質在菌體內生成、蓄積的情況下，可以在培養結束後從培養物回收菌體後，通過機械性或者化學方法等適當的方法進行破碎。從該菌體破碎液通過並用離子交換處理法、濃縮法、鹽析法等，從該菌體破碎液分離、純化目的有用物質。實施例10183染色體DNA部分缺失的大腸桿菌突變體文庫的製備(l)可以通過直鏈DNA進行染色體DM上的同源重組的大腸桿菌的製備來自可以通過直鏈DNA進行染色體DNA上的同源重組的大腸桿菌KM22林[Gene，246，321-330(2000)]的Pl噬菌體可以通過下述方法進行製備。將大腸桿菌KM22林在含有20mg/l的卡那黴素的LB液體培養基[10g/l細菌用蛋白腖(Defico公司製造)、5g/l細菌用酵母提取物(Defico公司製造)、5g/l氯化鈉、lml/1的lmol/1氫氧化鈉]中於30'C下培養過夜後，取0.5ml的培養液與1.4ml的新的LB液體培養基以及100|u1的0.lmol/1的氯化4丐溶液混合。0184將該混合溶液在30。C振蕩培養5-6小時後，取400y1的該混合液到滅菌了的管中。向其中添加2ji1的Pl噬菌體種子溶液，在37T保溫10分鐘後，添加在50X:保溫的軟瓊脂溶液(10g/1的細菌用蛋白腖、5g/1的細菌用酵母提取物、5mmo1/1氯化鉤、lml/1的lmol/1氫氧化鈉、3g/1瓊脂)3ml，混合均勻，在Ca-LB瓊脂培養基平板(10g/1細菌用蛋白腖、5g/1細菌用酵母提取物、5mmo1/1氯化鈣、lml/1的lmol/1氫氧化鈉、15g/l瓊脂、平板的直徑為15cm)上鋪板。0185將該平板在37匸培養7小時後，用播種伊將軟瓊脂部分破碎成小塊，回收，在1500g、4X:、離心分離10分鐘。相對上清1.5ml加入100ja1的氯仿，在4匸保存過夜。笫二天，將溶液在15000g離心分離2分鐘，將上清作為噬菌體種子液在4'C保存。然後，使用獲得的噬菌體，轉化大腸桿菌W3110林。分取在Ca-LB液體培養基中，於301C、培養了4小時的大腸桿菌W3110株的培養液200u1，添加lu1的噬菌體種子液。37XM呆溫IO分鐘後，添加5ml的LB液體培養基合200/jl的lmol/l的檸檬酸鈉溶液，攪拌。在1500g、25X:下離心分離IO分鐘後，棄上清，向沉澱的細胞中加入lml的LB液體培養基和IOm1的lmo1/1的檸檬酸鈉溶液，在30r保溫2小時。取IOOM1的該溶液塗布在含有20mg/l的卡那黴素抗生素培養基3瓊脂平板培養基上，30n培養過夜。將出現的數個克隆分別塗布在含有20mg/l的卡那黴素抗生素培養基3瓊脂平板培養基(0.15%肉提取物、0.15%酵母提取物、0.5%蛋白腖、0.1%葡萄糖、0.35%氯化鈉、0.132%磷酸氫二鉀、1.5%瓊脂、pH7.O)上，確認它的藥物敏感性，通過選擇卡那黴素抗性林，獲得可以通過直鏈DM在染色體DNA上發生同源重組的染色體DNA區域[△(recCptrrecBrecD)::Plac-redkan]被轉化了的大腸桿菌W3110red林。(2)染色體DNA部分地缺失的大腸桿菌突變體文庫的製備(i)感受態的製備將上述(l)獲得的大腸桿菌W3110red株在添加了lmmo1/1的IPTG(異丙基硫代半乳糖苷)100ml的LB液體培養基中在30X:培養，直至培養到OD660nm達到0.1。並且，下述的操作在4'C、或者使用冰冷的溶液進行。0186離心分離得到培養物，將沉澱的菌體在50ml的20%甘油溶液中懸浮。離心分離該甘油溶液，將沉澱的菌體再次懸浮在20%的甘油溶液的操作重複3次以上，洗滌菌體後，懸浮在50jjl的10%甘油溶液，中，獲得電轉化用的感受態溶液。(ii)用於向染色體DNA導入缺失的DNA片段的製備按照下述方法製備用於向染色體DNA中導入具有序列號1所示的鹼基序列中的鹼基編號4489585位4535472位的鹼基序列的約46kbp的DNA的缺失的DNA片段。0187合成具有序列號2所示的鹼基序列的DNA(由序列號1所示的鹼基序列中的鹼基編號4487585位~4487605位的鹼基序列構成的DNA。以下稱為引物A)、具有序列號3所示的鹼基序列的DM(由在25mer的連接子序列的3，側，添加了序列號1所示的鹼基序列中的鹼基編號4489584位~4489561位的鹼基序列的鹼基序列構成的DNA。以下稱為引物B)、具有序列號4所示的鹼基序列的DNA(由序列號l所示的鹼基序列中的鹼基編號4537475位~4537451位的鹼基序列構成的DNA。以下、稱為引物C)、具有序列號5所示的鹼基序列的DNA(由在22mer的連接子序列的3，側，添加了序列號1所示的鹼基序列中的鹼基編號4535473位~4535496位的鹼基序列的鹼基序列構成的DNA。以下稱為引物D)。0188以大腸桿菌W3110red抹的染色體DNA作為模板，使用引物A和B、以及引物C和D分別作為引物組，進行PCR。PCR中，使用LA-Taq(寶生物製造)，按照附帶的說明書製備反應液。向該反應液中添加100ng純化的染色體DNA或者接種針的尖端沾取的少量的大腸桿菌W3110red林的菌體、以及各個分別為20pmo1的引物DNA，進行PCR。PCR是在下述條件下進行的94"C保溫3分鐘後；94匸15秒鐘、55X:20秒鐘、68Xn分30秒鐘的循環重複30次；72X:保溫10分鐘。0189使用PCR純化試劑盒(QIAGEN公司製造)純化上述PCR中擴增的DNA片段，分別溶解在50n1的水中。確認該DNA片段是分別與染色體DM上的缺失對象區域的兩端的鹼基序列相同的lkb的DNA。下面，分別稱使用引物A以及B作為引物組擴增的DNA片段為上遊臂、引物C以及D作為引物組擴增的DNA片段為下遊臂。0190然後，以枯草芽孢桿菌(Bacillussubtilis)168林(ATCC23857)的染色體DNA作為模板，使用具有序列號6所示的鹼基序列的DNA和具有序列號7所示的鹼基序列的DNA作為引物組進行PCR。PCR中除了使用的模板DM以及引物DNA的種類不同以外，其他均按照與上述相同的組成的反應液、相同的反應條件進行。0191將上述PCR中擴增的DNA片段用與上述相同的方法純化，溶解在50m1的水中。確認該dna片段是可以用於陰性篩選的來自枯草芽孢桿菌的sacB基因(Genbank登記號X02730)。然後，以pHSG399質粒DM(寶生物公司製造)作為模板，使用具有序列號8所示的鹼基序列的DNA和具有序列號9所示的鹼基序列的DNA作為引物組進行PCR。PCR中除了才莫板DNA以及引物DM的種類不同以外，均使用與上述相同的組成的反應液、在相同的反應條件下進行。0192通過瓊脂糖電泳分離上述PCR擴增的DNA片段，用QIAquickGelExtraction試劑盒(QIAGEN公司製造)純化後、溶解在50m1的水中。確認該DNA片段是含有氯黴素抗性基因(cat基因)的DNA片段。然後，以上迷獲得的sacB基因含有DNA片段以及cat基因含有DNA片段作為模板，用由序列號IO所示的鹼基序列構成的DNA、以及由序列號11所示的鹼基序列構成的DNA作為引物組進行PCR。PCR中除了模板DNA以及引物DNA的種類不同以外，均使用與上述相同的組成的反應液、在相同的反應條件下進行。0193通過瓊脂糖電泳分離上述PCR擴增的DNA片段，用QIAquickGelExtraction試劑盒純化後、溶解在50n1的水中。確認該DM片段是將sacB基因和cat基因以相同方向連接的DNA片段。然後，上述獲得的上遊臂、下遊臂、以及sacB基因和cat基因連接了的DNA片段這3個DNA片段的混合物作為模板DNA，使用由序列號12所示的鹼基序列構成的DNA(由序列號1所示的鹼基序列中的鹼基編號4488585位~4488610位的鹼基序列構成的DNA)、由序列號13所示的鹼基序列構成的DNA(由序列號l所示的鹼基序列中的鹼基編號4536475位~4536451位的鹼基序列構成的DNA)作為引物組進行PCR。作為模板DM使用1ja1的上遊臂DNA溶液、1ja1的下遊臂DM溶液、以及1.5y1的sacB基因以及cat基因連接了的DNA片段，作為引物組使用由序列號12以及13所示的鹼基序列構成的DM，除此之外，使用與上述相同的組成的反應液、相同的反應條件進行PCR。0194通過瓊脂糖電泳分離上述PCR擴增的DNA片段，用QIAquickGelExtraction試劑盒純化後，溶解在50jal的水中。確i人獲得了該DNA片段是在結合了sacB基因和cat基因的DNA的兩端分別添加與缺失對象區域的兩端相同的DNA片段的DNA片段(以下、稱為用於區域缺失的DNA片段)。(iii)染色體DNA部分缺失的大腸桿菌突變體的製備將O.1jig上述獲得的區域缺失用DNA片段添加到50pl上述獲得的大腸桿菌W3110red林的感受態溶液中，一使用0.1cm的小玻璃管(BioRad公司製造)，在1.8KV、25juF的條件進行電轉化。在LBcm平板(10g/1細菌用蛋白腖(Difco公司製造)、5g/l細菌用酵母提取物(Difco公司製造)、20mg/1卡那黴素、15mg/1氯黴素、lml/1的lmol/1NaOH)上選擇該用於區域缺失的DNA片段重組到大腸桿菌W3110red林的染色體上的轉化林。選擇得到的轉化林的單菌落在suLB瓊脂培養基〔10g/1細菌用蛋白腖(Difco公司製造)、5g/l細菌用酵母提取物(Difco公司製造)、10%蔗糖、20mg/l卡那黴素、15mg/l氯黴素、lml/1的lmol/1NaOH〕平板上複印，選擇表現出蔗糖敏感性菌林。0195通過下述方法確認所選擇的菌林的染色體DNA上作為缺失對象區域的序列號1所示的鹼基序列中的4489585位~4535472位的鹼基序列被連接了sacB基因和cat基因的DNA所取代的事實。用由具有與從轉化中使用的直鏈DNA的臂序列末端出發向上遊以及下遊分別距離lkb的區域相同的鹼基序列的序列號2所示的鹼基序列構成的DNA(引物A)以及序列號4所示的鹼基序列構成的DNA(引物C)作為引物組，使用如上選擇的菌林的染色體DNA作為模板進行PCR。PCR中，使用如上選擇的菌株的少量的菌體(用接種針的尖端從單菌落沾取的量)作為模板，使用具有序列號3以及5所示的鹼基序列的DNA作為引物組，此外按照與上述相同的組成的反應液、反應條件進行。0196通過上述PCR，擴增得到約6.7kb的DNA片段。因為連接了sacB基因和cat基因的DNA片段(2.7kb)的兩端分別添加了約2kb的DNA的DNA片段約為6.7kb，所以用引物A以及C作為引物組，通過PCR得到約6.7kb的擴增片段的轉化林是目的轉化林。據此，將該轉化株命名為△E-suc林(缺失區域4489585~4535472bp)。(iv)染色體DNA的部分區域缺失的大腸桿菌突變體的製備採用與AE-suc林的製造方法相同的方法，製備大腸桿菌W3110red林的染色體DNA的各種區域缺失的突變體。0197從AE-suc林出發，按照下述方法製備去除了連接了cat基因和sucB基因的DM的大腸桿菌突變體。合成由序列號14所示的鹼基序列構成的DM(由結合了序列號1所示的鹼基序列中的鹼基編號4535496位~4535476位以及鹼基編號4489584位~4489561位的鹼基序列的鹼基序列構成的DNA。以下、稱為引物E)、序列號15所示的鹼基序列構成的DM(由結合了序列號1所示的鹼基序列中的鹼基編號4489561位~4489584位和4535476位~4535496位的鹼基序列的鹼基序列構成的DNA。以下、稱為引物F)。以大腸桿菌W3110株的染色體DNA作為模板，使用引物A和引物E、以及引物C和引物F分別作為引物組進行PCR。PCR中，除了模板以及引物組的種類不同以外，使用與上迷相同的組成的反應液、反應條件進行。0198上述PCR擴增的DNA片段用PCR純化試劑盒純化後，溶解在50H1的水中。確認該DNA片段具有與缺失對象區域的兩端的染色體DNA的鹼基序列分別相同的2kb的鹼基序列。下面，使用引物A以及E作為引物組擴增的DNA稱為上遊臂，使用引物C以及F作為引物組擴增的DNA稱為下遊臂。0199然後，將上述得到的上遊臂以及下遊臂的混合物作為模板，用由序列號12以及13所示的鹼基序列構成的DNA作為引物組進行PCR。PCR中，作為模板，使用1jn1上述獲得的上遊臂DM溶液、1m1下遊臂DNA溶液；作為引物組，使用序列號12以及13所示的DM，此夕卜，按照與上述相同的組成的反應液、反應條件進行。0200通過瓊脂糖電泳分離上述PCR擴增的DNA片段，以QIAquickGelExtraction試劑盒純化後、溶解在50p1的水中。確i人獲得了擴增上述兩臂的缺失區域側的各lkb的區域結合在一起的2kb的片段的DM片段(以下，稱為用於去除sacB-cat基因的DNA片段)。以上述(2)(i)的方法製備AE—sue林的感受態溶液，添加用於去除基因的DNA片段，通過電轉化，將該DNA片段導入AE—suc林。使用SuLB瓊脂培養基作為選擇培養基。所選擇的轉化株的單菌落在LBcm瓊脂平板上複印，選擇表現出氯黴素敏感性的菌抹。0201然後，以上述選擇的蔗糖抗性並且氯黴素敏感性菌林的染色體DNA作為模板，以引物A以及C作為引物組，進行PCR。除了模板DNA以及引物組不同以外，按照與上述相同的組成的反應液、反應條件進行PCR。通過上述PCR，得到約4.0kB的擴增片段。以導入目的取代的、去除sue基因以及cat基因的、蔗糖抗性且氯黴素敏感性菌株的染色體DNA為模板進行PCR而獲得的擴增DNA片段，因為是接近缺失區域上遊和下遊的各2kbp結合在一起的區域被擴增，可知擴增的應是約4kb的條帶。據此，確認通過上述方法製備了使標記基因不殘留的染色體DNA上的特定區域缺失了的染色體DNA的部分缺失林(AE林)。(v)染色體DM部分缺失的大腸桿菌突變體文庫的製備可以通過將根據想要缺失的染色體DNA上的區域的兩端存在的鹼基序列設計的DNA替代上述引物A~D，用與上述相同的方法製備在大腸桿菌W3110red株的染色體DM上的任意的區域缺失的大腸桿菌突變體。實施例20202使用最小培養基的生長繁殖實驗LB瓊脂培養基(LB培養基的組成中加入15g/l的瓊脂的平板化產物)上塗布在上述實施例1獲得的各種突變體，在37TC培養過夜，得到菌體。將少量該菌體接種到含有50mg/l卡那黴素的5ml的LB培養基中，培養過夜，得到培養物。取50|al該培養物接種到含有1%葡萄糖和10mg/l的硫酸鐵的5ml的M9最小培養基中，在37。C振蕩培養，將0、6、10、13、16、19、32小時培養後的濁度用660nm的吸收來測定。比較上述突變體和親本林大腸桿菌W3110red林的生長繁殖，選擇和親本抹表現出幾乎相同的生長繁殖曲線的突變體。0203所選擇的突變體所具有的染色體DNA的缺失區域和該區域所含的基因示於表2。0204tableseeoriginaldocumentpage2610205表2-ltableseeoriginaldocumentpage2620206表2(續)tableseeoriginaldocumentpage263厶091JW1227(ychG)，JW1227.5(251#6),JW1228(adhE)，JW1229(ychE)，JW1230(yi2A),JW1231(yi22),JW1232(yi24)，JW1233(yi23)，JW1234(251#8.5),JW1235(oppA),JW1236(oppB)，JW1237(oppC),JW1238(oppD)，JW1239(oppF)，JW1240(yciU)厶022JW1302(sucP)，JW1303(258#8)，JW1304(ycj0),JW1305(ycjP),JW1306(ycjQ)，JW1307(259#3),JW1308(ycjS),JW1309(ycjT)，JW1310(ycjU)，JW1311(ycjV),JW1312(ompG),JW1313(ycjW),JW1314(ycjX)，JW1315(ycjF),JW1316(tyrR),JW1317(tpx),JW1318(ycjG),JW1319(ycjI),JW1319.5(260#10),JW1320(ycjY)，JW1321(ycjZ)，JW1321.5(261#1.1),JW1322(mppA),JW1323(ynal)，JW1324(is5B)，JW1325(yi51),JW1326(ynaJ)，JW1327(ydaA)，JW1328(fnr)，JW1329(ogt),JW1330(ydaH)，JW1331(261#9),JW1332(ydaJ)，JW1333(262#1),JW1334(ydaL)，JW1335(262#3)，JW1336(262#4)，JW1336.5(262#5),JW1337(dbpA),JW1338(ydaO),JW1339(intR)，JW1340(ydaQ),JW1341(ydaC)，JW1342(lar)，JW1343(recT)，JW1344(recE),JW1345(racC),JW1346(ydaE)，JW1347(kil)，JW1348(sieB)，JW1349(ydaF),JW1350(263並6.1),JW1351(racR),JW1352(263#6.3)，JW1353(ydaT)，JW1354(ydaU),JW1355(dnaC),JW1356(ydaW),JW1357(enpP)，JW1358(trkG)，JW1359(ynaK),JW1360(ydaY),JW1361(VMTH陽LAMBD),JW1362(V函.LAMBD)，JW1363(is5B)'JW1364(yi51)，JW1365(V函—LAMBD),JW1366(Y401-LAMBD)，JW1367(yzzL)，JW1368(tnp0)，JW1369(ynaE)，JW1370(upo3),A023JW1376(y翻)，JW1377(ynbE),JWi378(ydbL),JW1379(feaR),JW1380(feaB)，JW1381(tynA),JW1382(paaZ)，JW1383(paaA),JW1384(paaB),JW1385(paaC),JW1386(paaD),JW1387(paaE)A024JW1393(paaK),JW1394(paaX),JW1395(paaY),JW1396(ydbA),JW1397(yi22),JW1398(yi24)，JW1399(yi23)，JW1400(yi2A)，JW1401(268#0.5)，JW1402(ydbB)，JW1403(ydbC),JW1404(ydbD),JW1405(269#1)，JW1406(ynbB)，JW1407(269#3)，JW1408(ynbD)A025JW1416(ydcA),JW1416.5(271#2),JW1417(trg)，JW1418(ydcl),JW1419(271#5),JW1420(ydcG),JW1421(271#7),JW1422(ydcH)>JW1423(rimL)02081表2(續tableseeoriginaldocumentpage26502091表2(續tableseeoriginaldocumentpage266tableseeoriginaldocumentpage2670211表2-71表2(續)tableseeoriginaldocumentpage2680212表2(續tableseeoriginaldocumentpage2690213表2-9表2(續)tableseeoriginaldocumentpage27002141表2(續tableseeoriginaldocumentpage271實施例30215具有存在多個部分缺失的染色體DM的大腸桿菌突變體的製備通過下述方法製備使用大腸桿菌W3110red林，將上述實施例2中確定的對生長繁殖不產生影響的缺失區域通過重複上述實施例1的方法，使之在大腸桿菌W3110red株中累積，由此製備具有存在多個部分缺失的染色體DNA的大腸桿菌突變體。表3表示了製備的具有存在多個部分缺失的染色體DNA的大腸桿菌突變體的缺失區域。實施例40216具有存在多個部分缺失的染色體DNA的大腸桿菌突變體的培養評價(l)將實施例3獲得的具有存在多個部分缺失的染色體DM的大腸桿菌的各種突變體塗布在LB瓊脂培養基上，在30C下培養過夜，得到菌體。取少量的該菌體接種到lml含有3%的葡萄糖的LB培養基中，培養過夜，得到培養物。取50nl的該培養物接種到含有3%的葡萄糖的5ml的LB培養基中，在30。C下培養24小時。用590nm的吸收測定培養結束時的濁度。結果示於表3。0217表3tableseeoriginaldocumentpage2720218如表3所示，染色體DNA的總缺失區域在470kbp以上的、具有存在多個部分缺失的染色體DNA的大腸桿菌突變體，與其缺失總量幾乎相關地，在培養24小時後看到濁度的上升。可知任何大腸桿菌突變體細胞的形態與野生型大腸桿菌細胞相同，染色體DNA的總缺失區域在470kbp以上的、具有存在多個部分缺失的染色體DNA的大腸桿菌突變體經過培養得到的菌體數比野生型大腸桿菌多。實施例50219具有存在多個部分缺失的染色體DM的大腸桿菌突變體的培養評價(2)為了確認實施例4中確認的菌體量的增大不僅是由於在各突變體新添加的缺失區域的重組的產生的效果，採用實施例1以及3記載的方法製備具有表3所示的向各突變體僅新添加的缺失的突變體，用與實施例4相同的方法進行培養，測定自培養開始24小時後的濁度。結果示於表4。0220表4tableseeoriginaldocumentpage27302211如表4所示，僅有新添加的缺失的菌體，未見到濁度的上升，可知實施例4中見到的菌體量的上升不是由於具有菌體量的上升的效果的缺失的累加而產生的，而是單獨由於多重並且同時地缺失不影響生長繁殖影響的染色體DNA上的缺失產生的結果。實施例60222具有存在多個部分缺失的染色體dna的大腸桿菌突變體的製備(2)用下述方法用表3所示的Stepl8林為親本株製備表2所示的厶043區域的缺失回復林。使用實施例3記載的方法，獲得缺失了大腸桿菌W3110red林的A041以及厶042區域的菌林。然後，製備在厶043區域鄰近的A88區域中插入連接了的sacB基因與cat基因的盒(以下、記作sacB-cat。參見圖l)的菌抹(以下、稱為大腸桿菌W3110red厶041、A042、△088::sacB.cat林)。0223從大腸桿菌W3110red厶041、A042、△088::sacB一cat林按照實施例l(l)記栽的方法製備Pl轉化導入噬菌體，用實施例l(l)記載的方法用Pl噬菌體轉化Stepl8林，獲得氯黴素抗性林，選擇向A088區域插入了sacB-cat盒的菌抹。選擇得到的Stepl8林的轉化株中、使用實施例1(2)(iii)記載的確認缺失的方法選擇A043區域回復的菌林。通過使用實施例1(2)(iv)記載的方法去除所選擇的菌林染色體DNA上存在的sacB-cat,獲得具有缺失了表5所示區域的染色體dna的Stepl8y抹。0224然後，使用實施例1以及3記載的方法，製備向Stepl8y林的染色體DNA進一步導入缺失的大腸桿菌。製備的具有存在多個部分缺失的染色體DNA的大腸軒菌突變體示於表5。02251表5tableseeoriginaldocumentpage275實施例70226對實施例6得到的突變體的培養評價經實施例6得到的各種突變體塗布在LB瓊脂培養基上，在37t:培養過夜，得到菌體。取少量該菌體接種到含有50mg/l的卡那黴素的5ml的LB培養基中，培養過夜得到培養物。取50ja1的該培養物接種到含有1%葡萄糖、5mg/1硫酸鐵、20g/l碳酸鈣的5ml的M9培養基中，在371C下振蕩培養，以660nm的吸收測定0、6、10、13、16、19、32小時培養後的濁度。0227培養開始後第19小時和第32小時的濁度示於表5。在被認為是親本林進入停止濁度上升的平臺期的第19小時以後，總缺失區域超過933kbp的突變體的濁度也繼續上升。即可知總缺失區域在933kbp以上的、具有存在多個部分缺失的染色體DNA的大腸桿菌突變體經培養得到的菌體數比野生型大腸桿菌多。實施例80228使用具有存在多個部分缺失的染色體DNA的大腸桿菌突變體生產物質1(1)蘇氨酸要求性突變林的製備按照實施例1的方法，製備大腸桿菌W3110red林的染色體DNA上的蘇氨酸生物合成系操縱子(thrABC基因由序列號1所示的鹼基序列中的鹼基編號36~5175位所示的鹼基序列構成的)缺失的蘇氨酸要求性突變林，命名為大腸桿菌W3110redAT林。(2)製備metA基因缺失的、導入了蘇氨酸生物合成系基因的突變林(i)metA基因缺失、thrABC基因導入用DNA片段的製備大腸桿菌W3110red林的染色體DNA作為模板，序列號16所示的鹼基序列構成的DNA以及序列號17所示的鹼基序列構成的DM作為引物組，通過PCR擴增具有metA基因的5，側上遊域的鹼基序列的DNA片段。0229PCR是採用LA-Taq，按照附帶的說明書製備反應液。向該反應液中添加lOng的純化的染色體DNA、各個分別為20pmol的引物DNA，進行PCR。PCR在如下條件下進行941C保溫2分鐘後；94t:i5秒鐘、55匸20秒鐘、68C90秒鐘的循環重複25次後；72X3保溫10分鐘。可通過上述PCR，確認獲得目的DNA片段(片段1)，用相同的方法，作為引物DNA，使用由序列號18所示的鹼基序列構成的DM以及由序列號19所示的鹼基序列構成的DM，獲得具有metA基因的3'側下遊域的鹼基序列的DNA片段(片段2)。0230然後，以大腸桿菌W3110red林的染色體DM作為模板，由序列號20所示的鹼基序列構成的DNA以及序列號21所示的鹼基序列構成的DNA作為引物組，通過PCR擴增蘇含有氨酸操縱子(thrABC基因)的DNA片段。PCR中，使用LA-Taq，按照附帶的說明書製備反應液。向該反應液添加10ng的純化的染色體DM、各個分別為20pmo1的引物DM，進行PCR。0231PCR是在下述條件下進行的94t:保溫2分鐘後；94'C15秒鐘、55匸20秒鐘、68°C5分鐘的循環重複25次後；72。C保溫10分。可通過上述PCR確認獲得了含有thrABC基因的DNA片段(片段3)。此外，以pHSG399質粒DNA(寶生物公司製造)作為模板，由序列號22所示的鹼基序列構成的DNA以及序列號23所示的鹼基序列構成的DNA作為引物組，通過PCR擴增含有氯黴素抗性基因(cat基因)的DNA片段。0232在PCR中使用LA-Taq、按照附帶的說明書製備反應液。向該反應液添加40ng的質粒DNA、各個分別為20pmo1的引物DM,進行PCR。PCR是在下述條件下進行的94C保溫2分鐘後；94X315秒鐘、55t:20秒鐘、68X:i分鐘的循環重複25次後；72'C保溫10分鐘。可通過上述PCR，確認獲得含有氯黴素抗性基因的DNA片段(片段4)。0233將上述PCR獲得的片段14用QIAquickGelExtraction試劑盒(QIAGEN公司製造)純化後，分別溶解在50m1的水中，得到DM溶液。並且用作上述PCR的引物DNA的序列號17所示的DNA和鹼基序列22所示的DNA、序列號19所示的DNA和序列號21所示的DNA、序列號20所示的DNA和序列號23所示的DM分別是可以結合的序列，即具有互補的序列。0234以上述獲得的片段1~4作為模板，由序列號24所示的鹼基序列構成的DNA、序列號25所示的鹼基序列構成的DNA作為引物組，通過PCR擴增將蘇氨酸操縱子基因以及氯黴素抗性基因以相同的轉錄方向連接的、在其兩端進一步連接了具有metA基因的5，側上遊域以及3，側下遊域的鹼基序列的DNA的DNA片段。0235在PCR中使用LA-Taq、按照附帶的說明書製備反應液。向該反應液添加上述DNA溶液各1|i1、各個分別為20pmo1的引物DNA進^f亍PCR。PCR是在下述條件下進行的94C保溫2分鐘後；941C15秒鐘、55匸20秒鐘、68T7分鐘的循環重複25次後；72XM呆溫10分鐘。可通過上述PCR，確認獲得了目的DNA片段(以下、稱為用於蘇氨酸操縱子基因導入的DNA片段)，將該DNA片段使用QIAquickGelExtraction試劑盒純化後，溶解在50ml的水中，得到DNA溶液。(ii)大腸桿菌W3110redAT林的轉化按照實施例1(2)(i)記載的方法製備上述(l)製備的大腸桿菌W3110redAT林的感受態。0236將0.ljug上述(2)(i)獲得的用於蘇氨酸操縱子基因導入的DNA片段添加到50m1的大腸桿菌W3110redAT林的感受態溶液中，使用0.lcffl的小玻璃管，在1.8KV、25yF的條件進行電轉化。在LBcm平板上選擇在染色體DNA上的metA基因區域被用於蘇氨酸操縱子基因導入的DNA片段所取代的株。此處，上述(2)(i)獲得的用於蘇氨酸操縱子基因導入的DNA片段中，因為PCR的時導入了突變，因的菌林，從LBcm平板上選擇的轉化林的中選擇在LB瓊脂培養基上生長繁殖，在M9Met瓊脂最小培養基(1%葡萄糖、0.6%磷酸鈉、0.3%磷酸二氫鉀、0.05%氯化鈉、0.1%氯化銨、2Mmo1/1硫酸鎂.七水合物、lOOMmol1/l氯化釣、lOmg/1硫酸鐵、100mg/1蛋氨酸)上不能生長繁殖的菌林、即表現出蘇氨酸要求性的菌林。確認該菌林是在染色體DNA上的metA基因上插入非活性型蘇氨酸生物合成系基因的菌林，命名為大腸桿菌Thrl林(W3110redAT、△metA::thrABC)。(iii)具有脫敏型突變和衰減突變的蘇氨酸操縱子的製備以大腸桿菌W3110red株的染色體DNA作為模板，有序列號26所示的鹼基序列構成的DNA以及序列號27所示的鹼基序列構成的DNA作為引物組進行PCR，擴增含有脫敏型thrA基因的一部分的、具有蘇氨酸操縱子的上遊區域的鹼基序列的DNA片段。即、序列號27所示的DNA具有J.Bacteriol.,185，5442-5461(2003)記載的脫敏型突變。0237在PCR中使用LA-Taq、按照附帶的說明書製備反應液。向該反應液天際10ng的染色體DNA、各個分別為20pmo1的引物DNA，進行PCR。PCR是在下的條件下進行的94XM呆溫2分鐘後；94XM5秒鐘、551C20秒鐘、681C2分30秒鐘的循環重複25次後；72匸保溫10分鐘。可通過上述PCR，確認獲得了目的DNA片段，將該DNA片段使用QIAquickGelExtraction試劑盒純化後、溶解在50jn1的水中，得到DM溶液。0238然後，以大腸桿菌W3110red林的染色體DNA作為模板，由序列號20所示的鹼基序列構成的DM以及序列號28所示的鹼基序列構成的DNA作為引物組進行PCR，擴增含有脫敏型thrA基因的一部分的、具有蘇氨酸操縱子的下遊區域的鹼基序列的DNA片段。即、序列號28所示的DM具有J.Bacteriol.，185，5442-5461(2003)記載的脫敏型突變。0239在PCR中使用LA-Taq、按照附帶的說明書製備反應液。向該反應液添加10ng的染色體DNA、各個分別為20pmo1的引物DNA，進行PCR。PCR是在下述條件下進行的94'C保溫2分鐘後；94tll5秒鐘、55匸20秒鐘、68^C3分30秒鐘的循環重複25次後；72。C保溫10分鐘。通過上述PCR，確認能夠獲得目的DNA片段，將該DNA片段使用QIAquickGelExtraction試劑盒純化後，溶解到50ji1的水中得到DNA溶液。0240以上述PCR獲得的含有脫敏型thrA基因的一部分的、具有蘇氨酸操縱子的上遊域以及下遊域的鹼基序列的DM片段作為模板，由序列號20所示的鹼基序列構成的DNA以及序列號29所示的鹼基序列構成的DM作為引物組，通過PCR擴增含有脫敏型thrA基因蘇氨酸操縱子的DM片段。0241PCR中使用LA-Taq，按照附帶的說明書製備反應液。向該反應液中添加上述DNA溶液各ly1、各個分別為20pmo1的引物DM，進行PCR。PCR是在下述條件下進行的94XM呆溫2分鐘後；94。C15秒鐘、55X320秒鐘、68匸5分鐘的循環重複25次後；72X:保溫10分鐘。通過上述PCR，可以進行是否獲得目的DNA片段進行確認，將該DNA片段4吏用QIAquickGelExtraction試劑盒純4匕後，溶解在50p1水中，得到DNA溶液。0242然後，將上述獲得的含有脫敏型thrA基因的蘇氨酸操縱子DNA片段作為模板，使用序列號29所示的鹼基序列構成的DM以及序列號30所示的鹼基序列構成的DNA作為引物組，通過PCR擴增具有含有衰減突變的蘇氨酸操縱子上遊區域的鹼基序列的DM片段。即、序列號30所示的鹼基序列構成的DM含有J.Mol.Biol.，183，529-541(1985)記載的蘇氨酸操縱子的衰減突變。0243在PCR中使用LA-Taq，按照附帶的說明書製備反應液。向該反應液中添加模板DNA片段的DNA溶液1m1、各個分別為20pmol的引物腿，進行PCR。PCR是在下述條件下進行的94'C保溫2分鐘後；94XH5秒鐘、55'C20秒鐘、68匸5分鐘的循環重複25次後；72匸保溫10分鐘。可通過上述PCR確認獲得了目的DNA片段(片段5)。0244然後，將上述獲得的含有脫敏型thrA基因的蘇氨酸操縱子MA片段作為模板，使用序列號31所示的鹼基序列構成的DM以及序列號20所示的鹼基序列構成的DNA的引物組，通過PCR擴增具有含有衰減突變的蘇氨酸操縱子下遊區域的鹼基序列的DNA片段。即、序列號31所示的鹼基序列構成的DNA含有J.Mol.Biol.,183，529-541(1985)記栽的蘇氨酸操縱子的衰減突變。0245在PCR中使用LA-Taq、按照附帶的說明書製備反應液。向該反應液中添加才莫板DNA片段的DNA溶液1jli1、各個分別為20pmo1的引物DNA，進行PCR。PCR是在下述條件下進行的94C保溫2分鐘後；94XH5秒鐘、55t)20秒鐘、68tM分30秒鐘的循環重複25次後；72匸保溫10分鐘。可以通過上述PCR確認獲得了目的DM片段(片段6)。0246將上述PCR獲得的片段5以及6使用QIAquickGelExtraction試劑盒純化後，分別溶解在50yl的水中，得到DNA溶液。將上述獲得的片段5以及6作為模板，使用序列號20所示的鹼基序列構成的DNA以及序列號21所示的鹼基序列構成的DNA的引物組，通過PCR，擴增同時具有脫敏型thrA基因和使表達量上升的衰減突變的高活性蘇氨酸操縱子的DNA片段。0247在PCR中使用U-Taq，按照附帶的說明書製備反應液。向該反應液添加含有上述片段5以及6的dna溶液各1m1各個分別為20pmo1的引物DNA，進行PCR。PCR是在下述條件下進行的94X:保溫2分鐘後；94t:i5秒鐘、551C20秒鐘、68C5分鐘的循環重複25次後；721C保溫10分鐘。0248通過上述PCR,能夠確認是否獲得了目的DNA片段，將該DNA片段使用QIAquickGelExtraction試劑盒純化後，溶解在50jal的水中，得到DNA溶液。(iv)含有具有脫敏型thrA基因和衰減突變的高活性蘇氨酸操縱子的大腸桿菌的製備在上述(ii)中製備的大腸桿菌Thrl抹的感受態按照實施例1(2)(i)記載的方法進行製備。0249將O.lyg的含有上述(iii)獲得的具有脫敏型thrA基因和衰減突變的高活性蘇氨酸操縱子的DNA片段添加到50jal的大腸桿菌Thrl林的感受態溶液中，使用0.lcm的小玻璃管、在1.8KV、25liF的條件下進行電轉化。使用M9Met瓊脂最小培養基篩選被染色體DM上具有非活性型蘇氨酸操縱子和、脫敏型thrA基因以及衰減突變的高活性蘇氨酸操縱子取代的轉化林，作為不表現蘇氨酸要求性的生長繁殖菌林。確認在該菌林的染色體DNA上的metA基因上插入了具有脫敏型thrA基因和衰減突變的高活性蘇氨酸操縱子，命名為大腸桿菌Thr2林。(3)蘇氨酸的發酵生產才艮據實施例l(l)記載的方法，製備來自大腸桿菌Thr2林的Pl轉化導入噬菌體。使用該噬菌體對大腸桿菌W3110red林以及實施例3及實施例6製備的具有存在多個部分缺失的染色體DNA的大腸桿菌突變體(Step2、Step4、Step6、Step8、SteplO、Stepl2、Stepl4、Stepl6、Stepl8y、Step20、Step22、Step24、Step26以及Step28)按照實施例l(l)記栽的方法進行通過Pl噬菌體的轉化導入，選擇在各突變體的metA基因上插入了具有來自大腸桿菌Thr2林的脫敏型thrA基因以及衰減(attenuation)突變的高活性蘇氨酸操縱子菌林作為氯黴素抗性林，分別命名為W3110redT、Step2T、Step4T、Step6T、Step8T、SteplOT、Stepl2T、Stepl4T、Stepl6T、Stepl8yT、Step20T、Step22T、Step24T、Step26T以及Step28T。0250將上述轉化林塗布在實施例1記載的LBcm平板上，在371c培養過夜。從該平板上取少量的菌體，接種到裝有25ml的蘇氨酸生產培養基(50g/1葡萄糖、20g/1硫酸銨、1g/1磷酸二氫鉀、2g/1細菌用酵母提取物、0.5g/1硫酸鎂七水合物、5mg/1疏酸鐵、5mg/1硫酸鎂、30g/1碳酸鈣、120mg/1蛋氨酸)的加有擋板的300ml三角培養瓶中，在30。C、250rpm的條件下，用振蕩培養儀培養48小時。培養過程中，從培養開始24小時後使之為2Og/1的濃度地添加葡萄糖，在SteplOT、Stepl2T、Stepl4T、Stepl6T、Stepl8yT、Step20T、Step22T、Step24T、Step26T以及Step28T的培養液中，也在從培養開始36小時後使之為20g/1的濃度地添加葡萄糖。0251培養結束後，使用Dionex公司製造胺基酸分析裝置定量培養液中蓄積的蘇氨酸。此外，培養液中的葡萄糖濃度的定量使用協和Medex公司製造的葡萄糖定量試劑進行測定。結果示於表6。0252表6tableseeoriginaldocumentpage2840253從表6可知，染色體DNA的缺失總長度超過470kb的SteplO株下的強化了菌林的蘇氨酸的生物合成系基因的菌抹、與具有沒有缺失的染色體DM的強化了菌林的蘇氨酸的生物合成系基因的菌林(W3110redT)相比，蘇氨酸的蓄積量有意義地上升、並且從該上升比例是菌體量的上升比例以上的值可知，具有比野生型大腸桿菌的染色體DNA短470kb以上的染色體DNA的大腸桿菌突變體可以作為物質生產的宿主細胞使用。實施例90254使用具有存在多個部分缺失的染色體DM的大腸桿菌突變體生產物質2穀胱甘肽是由3種胺基酸(穀氨酸、半胱氨酸、甘氨酸)構成的肽類物質。通過Y-穀氨醯基半胱氨酸合成酶和穀胱甘肽合成酶的作用，將前述3種胺基酸縮合生物合成穀胱甘肽。ATP是該縮合反應所必需的輔酶。下面，向本發明的大腸桿菌突變體使用ATP供給源，進行穀胱甘肽的生產。(1)穀胱甘肽合成酶基因的獲得在下面的試驗中使用的含有穀胱甘肽合成酶基因的質粒DNA使用從FERMBP-337(特開平2-31690號)提取得到的物質。0255此外，含有穀胱甘肽合成酶基因的質粒DNA可以通過下述方法獲得。即、才艮據特開昭58-20196號以及J.Gen.Microbiol.,128,1047-1052(1982)記載的方法，對大腸桿菌B林使用N-甲基-N，-亞硝基胍進行突變處理，獲得穀胱甘肽合成被弱化的突變林，然後對C912進行同樣的突變處理，獲得穀胱甘肽合成回復抹，從中選擇穀胱甘肽通過Y-穀氨醯基半胱氨酸合成酶的抑制被解除的突變抹(以下稱為抑制解除林)。0256然後，按照特開平2-31690號以及Appl.Environ.Microbiol.,44，1444-1448(1982)記載的方法，將在前述的方法中得到的抑制解除株的染色體上的Y-穀氨醯基半胱氨酸合成酶基因克隆到質粒pBR322上，然後再按照特開平2-31690號以及Agric.Biol.Chem.，47，1381-1383(1983)記載的方法，將抑制解除株的染色體上的穀胱甘肽合成酶基因克隆到質粒pBR322上。0257然後，按照特開平2-31690號以及BioprocessTechno1.，19，159-183(1994)記載的方法，向上述兩個克隆化的片段匯集到載體質粒pBR325上，可以構建具有特開平2-31690號記載的pBR325-gshI.II或者與該質粒DNA等同的穀胱甘肽合成酶基因質粒DNA。使用通過上述方法得到的pBR325-gsh1.II(以下稱為pGS600)，將大腸桿菌C600抹通過氯化鉤法轉化。對轉化林使用含有20ug/ml的氯黴素的LBcm平板進行選擇，命名為大腸桿菌C600/pGS600。0258對大腸桿菌C600/pGS600林使用5ml的含有30/。葡萄糖的LB液體培養基(LBG培養基)使用，在30'C振蕩培養24小時。然後取得到的培養物4ml接種到裝有400ml新的LBG培養基的三角培養瓶中，在30匸振蕩培養24小時。將得到的培養物離心分離，使用體沉澱，使用100ml的100mmol/lTris鹽酸緩沖液(OX:，pH7.4)洗滌該菌體2次。0259將該洗滌後的菌體在-80'C保存，在^f吏用之前加入10ml的100咖ol/lTris鹽酸緩沖液(pH7.4)，將該溶解物作為酶溶液使用。(2)大腸桿菌W3110red林和Step28林的菌體的獲得將W3110red林以及Step28林分別使用2.5ml的含有3%葡萄糖的LB液體培養基(LBG培養基)在30"C振蕩培養24小時，將得到的培養物取200ju1接種到裝有20ml新的LBG培養基的三角培養瓶中，在30'C振蕩培養24小時。將培養結束時測定的濁度(OD660nm)記錄到表7中。0260將得到的培養物分別進行離心分離，使菌體沉澱，使用5ml的100mmol/lTris鹽酸緩沖液(0。C,pH7.4)洗滌該菌體2次。向得到的洗滌菌體中加入200jj1的gt溶液(20%葡萄糖、0.4%TrUonX-lOO)，將得到菌體溶液作為ATP供給源使用。(3)穀胱甘肽的生產向900|li1的反應液(2%葡萄糖、20mmol/l硫酸鎂、20mmol/l硫酸二鉀、0.22mmo1/1氧化型煙醯胺腺噪呤二核普酸、0.14mmo1/1黃素單核苷酸、5mmo1/1穀氨酸、5mmo1/1半胱氨酸、5mmo1/1甘氨酸、Q.4%TritonX-100、15mmo1/1磷酸二氬鉀、200mmol/lMOPS緩沖液、pH7.8)中，添加100ju1上述(l)獲得的酶液、以及100m1上述(2)獲得的大腸桿菌W3110red林或者Step28林的菌體溶液在30C振蕩90分鐘進行反應。0261反應液中蓄積的穀胱甘肽的定量使用穀胱甘肽定量試劑盒(同仁化學研究所公司製造)進行。結果示於表7中。0262表7菌株名培養結束時的菌體量(法度OD660nm)穀胱甘肽的蓄積量(mmo1/1)W3110red2,20.18Step283.61.190263如表7所示，將作為ATP供給源提供給反應的、具有含多個部分的缺失的染色體的大腸桿菌突變體的tep28林的菌體量是具有沒有缺失的染色體DNA的大腸桿菌W3110red林的菌體量的1.6倍(=3.6/2.2)，穀胱甘肽的蓄積量為6.6倍(=1.19/0.18)。即、暗示本發明的大腸桿菌突變體的每個細胞的ATP生產活性(即ATP再生活性)比作為親本抹的沒有染色體DNA缺失的大腸桿菌W3110red抹高，據此可知，本發明的大腸桿菌突變體在其生物合成途徑中必需ATP的有用物質的生產中有用。工業實用性0264通過使用本發明的大腸桿菌突變體作為宿主細胞，能夠很有效率地製備有用物質。序列表0265序列號2-人工序列的說明合成的DM序列號3-人工序列的說明合成的DM序列號4-人工序列的說明合成的DNA序列號5-人工序列的說明合成的DNA序列號6-人工序列的說明合成的DNA序列號7-人工序列的說明合成的DNA序列號8-人工序列的說明合成的DM序列號9-人工序列的說明合成的DNA序列號10-人工序列的說明:合成的DNA序列號11-人工序列的說明:合成的DNA序列號12-人工序列的說明:合成的DNA序列號13-人工序列的說明:合成的DNA序列號14-人工序列的說明:合成的DNA序列號15-人工序列的說明:合成的DNA序列號16-人工序列的說明:合成的DNA序列號17-人工序列的說明:合成的DNA序列號18-人工序列的說明:合成的DNA序列號19-人工序列的說明:合成的DM序列號20-人工序列的說明:合成的DNA序列號21-人工序列的說明:合成的DM序列號22-人工序列的說明:合成的DM序列號23-人工序列的說明:合成的DNA序列號24-人工序列的說明:合成的DNA序列號25-人工序列的說明:合成的DNA序列號26-人工序列的說明:合成的DNA序列號27-人工序列的說明:合成的DNA序列號28-人工序列的說明:合成的DM序列號29-人工序列的說明合成的DNA序列號30-人工序列的說明合成的DNA序列號31-人工序列的說明合成的DNA權利要求1.含有下述[1]和[2]所述基因或者與它們同源的基因、且具有比野生型大腸桿菌短470kbp以上的染色體DNA的大腸桿菌突變體，不過、在下述[1]和[2]所述的基因或者與它們同源的基因中，存在野生型大腸桿菌原來不具有的基因(以下稱為NC基因)的情況下，該源自野生型大腸桿菌的上述大腸桿菌突變體也可以不具有NC基因，其中所述[1]和[2]所述基因如下[1]thrA基因、thrB基因、thrC基因、talB基因、mog基因、htgA基因、dnaK基因、dnaJ基因、hokC基因、nhaA基因、nhaR基因、rpsT基因、ribF基因、ileS基因、lspA基因、fkpB基因、lytB基因、dapB基因、carA基因、carB基因、caiF基因、caiE基因、caiD基因、caiC基因、caiB基因、caiA基因、caiT基因、fixA基因、fixB基因、fixC基因、fixX基因、kefC基因、folA基因、apaH基因、apaG基因、ksgA基因、pdxA基因、surA基因、imp基因、djlA基因、rluA基因、hepA基因、polB基因、araD基因、araA基因、araB基因、araC基因、tbpA基因、leuD基因、leuC基因、leuB基因、leuA基因、leuL基因、leuO基因、ilvI基因、ilvH基因、fruR基因、ftsL基因、ftsI基因、murE基因、murF基因、mraY基因、murD基因、ftsW基因、murG基因、murC基因、ddlB基因、ftsQ基因、ftsA基因、ftsZ基因、lpxC基因、secA基因、mutT基因、yacE基因、guaC基因、hofC基因、hofB基因、ppdD基因、nadC基因、ampD基因、ampE基因、aroP基因、pdhR基因、aceE基因、aceF基因、lpdA基因、acnB基因、speD基因、speE基因、gcd基因、hpt基因、yadF基因、panD基因、panC基因、panB基因、htrE基因、ecpD基因、folK基因、pcnB基因、dksA基因、sfsA基因、ligT基因、hrpB基因、ponB基因、hemL基因、pfs基因、dgt基因、htrA基因、dapD基因、glnD基因、map基因、rpsB基因、tsf基因、smb基因、rrf基因、dxr基因、rth基因、cdsA基因、yaeL基因、hlpA基因、lpxD基因、fabZ基因、lpxA基因、lpxB基因、rnhB基因、dnaE基因、accA基因、ldcC基因、mesJ基因、rof基因、cutF基因、proS基因、rcsF基因、abc基因、dniR基因、gloB基因、rnhA基因、dnaQ基因、up18基因、gmhA基因、pepD基因、gpt基因、crl基因、phoE基因、proB基因、proA基因、hemB基因、proC基因、aroL基因、aroM基因、araJ基因、sbcC基因、sbcD基因、phoB基因、phoR基因、brnQ基因、proY基因、malZ基因、queA基因、tgt基因、secD基因、secF基因、tsx基因、ribD基因、ribH基因、nusB基因、thiL基因、pgpA基因、dxs基因、ispA基因、xseB基因、thiI基因、thiJ基因、apbA基因、cyoE基因、cyoD基因、cyoC基因、cyoB基因、cyoA基因、ampG基因、bolA基因、tig基因、clpP基因、clpX基因、lon基因、hupB基因、cof基因、mdlA基因、mdlB基因、glnK基因、amtB基因、tesB基因、maa基因、hha基因、acrB基因、acrA基因、acrR基因、aefA基因、priC基因、apt基因、dnaX基因、recR基因、htpG基因、adk基因、hemH基因、aes基因、gsk基因、fsr基因、ushA基因、cueR基因、gcl基因、gip基因、purK基因、purE基因、ybbF基因、ppiB基因、cysS基因、folD基因、sfmA基因、sfmC基因、sfmD基因、sfmH基因、sfmF基因、fimZ基因、entD基因、fepA基因、fes基因、entF基因、fepE基因、fepC基因、fepG基因、fepD基因、fepB基因、entC基因、entE基因、entB基因、entA基因、cstA基因、dsbG基因、ahpC基因、ahpF基因、rnk基因、rna基因、citT基因、citG基因、citX基因、citF基因、citE基因、citD基因、citC基因、citA基因、citB基因、dcuC基因、dcuC基因、crcA基因、cspE基因、crcB基因、lipA基因、lipB基因、dacA基因、rlpA基因、mrdB基因、mrdA基因、phpB基因、nadD基因、holA基因、rlpB基因、leuS基因、lnt基因、phoL基因、ubiF基因、asnB基因、nagD基因、nagC基因、nagA基因、nagB基因、nagE基因、glnS基因、fur基因、fldA基因、seqA基因、pgm基因、potE基因、speF基因、kdpE基因、kdpD基因、kdpC基因、kdpB基因、kdpA基因、phrB基因、end8基因、abrB基因、gltA基因、sdhC基因、sdhD基因、sdhA基因、sdhB基因、sucA基因、sucB基因、sucC基因、sucD基因、farR基因、hrsA基因、cydA基因、cydB基因、tolQ基因、tolR基因、tolA基因、tolB基因、pal基因、nadA基因、pnuC基因、czcD基因、aroG基因、gpmA基因、galM基因、galK基因、galT基因、galE基因、modF基因、modE基因、modA基因、modB基因、modC基因、bioA基因、bioB基因、bioF基因、bioC基因、bioD基因、uvrB基因、moaA基因、moaB基因、moaC基因、moaD基因、moaE基因、rhlE基因、dps基因、ompX基因、mipB基因、moeB基因、moeA基因、mdfA基因、grxA基因、poxB基因、aqpZ基因、cspD基因、clpA基因、infA基因、aat基因、cydC基因、cydD基因、trxB基因、lrp基因、ftsK基因、lolA基因、serS基因、dmsA基因、dmsB基因、dmsC基因、pflA基因、pflB基因、focA基因、serC基因、aroA基因、cmk基因、rpsA基因、himD基因、msbA基因、lpxK基因、kdsB基因、smtA基因、mukF基因、kicA基因、mukB基因、aspC基因、ompF基因、asnS基因、pncB基因、pepN基因、ssuB基因、ssuC基因、ssuD基因、ssuA基因、ssuE基因、pyrD基因、uup基因、pqiA基因、pqiB基因、rmf基因、fabA基因、ompA基因、sulA基因、helD基因、mgsA基因、acyP基因、hyaA基因、hyaB基因、hyaC基因、hyaD基因、hyaE基因、hyaF基因、appC基因、appB基因、appA基因、csgG基因、csgF基因、csgE基因、csgD基因、csgB基因、csgA基因、csgC基因、sfaA基因、mdoG基因、mdoH基因、msyB基因、htrB基因、solA基因、dinI基因、pyrC基因、grxB基因、rimJ基因、mviM基因、mviN基因、flgN基因、flgM基因、flgA基因、flgB基因、flgC基因、flgD基因、flgE基因、flgF基因、flgG基因、flgH基因、flgI基因、flgJ基因、flgK基因、flgL基因、rne基因、rluC基因、rpmF基因、plsX基因、fabH基因、fabD基因、fabG基因、acpP基因、fabF基因、pabC基因、tmk基因、holB基因、ptsG基因、fhuE基因、nagZ基因、ndh基因、mfd基因、ycfU基因、ycfV基因、ycfW基因、cobB基因、potD基因、potC基因、potB基因、potA基因、pepT基因、phoQ基因、phoP基因、purB基因、trmU基因、icdA基因、minE基因、minD基因、minC基因、clyA基因、umuD基因、umuC基因、dsbB基因、nhaB基因、fadR基因、dadA基因、dadX基因、ldcA基因、mltE基因、tagl基因、treA基因、dhaR基因、pth基因、prsA基因、ychB基因、hemM基因、hemA基因、prfA基因、hemK基因、kdsA基因、chaA基因、chaB基因、chaC基因、narL基因、narX基因、narK基因、narG基因、narH基因、narJ基因、narI基因、tpr基因、purU基因、sprE基因、galU基因、hns基因、tdk基因、adhE基因、oppA基因、oppB基因、oppC基因、oppD基因、oppF基因、cls基因、kch基因、tonB基因、trpA基因、trpB基因、trpC基因、trpD基因、trpE基因、trpL基因、btuR基因、sohB基因、topA基因、cysB基因、acnA基因、ribA基因、pgpB基因、pyrF基因、osmB基因、rnb基因、envM基因、sapF基因、sapD基因、sapC基因、sapB基因、sapA基因、aldH基因、ordL基因、goaG基因、pspF基因、pspA基因、pspB基因、pspC基因、pspD基因、pspE基因、sucP基因、ompG基因、tyrR基因、tpx基因、mppA基因、fnr基因、ogt基因、dbpA基因、intR基因、lar基因、recT基因、recE基因、racC基因、kil基因、sieB基因、racR基因、dnaC基因、enpP基因、trkG基因、VMTH_LAMBD基因、VLOM_LAMBD基因、tnpO基因、upo3基因、ompN基因、nifJ基因、hslJ基因、ldhA基因、feaR基因、feaB基因、tynA基因、paaZ基因、paaA基因、paaB基因、paaC基因、paaD基因、paaE基因、paaF基因、paaG基因、paaH基因、paaI基因、paaJ基因、paaK基因、paaX基因、paaY基因、acpD基因、hrpA基因、aldA基因、gapC基因、gapC基因、cybB基因、trg基因、rimL基因、tehA基因、tehB基因、prtC基因、potA基因、potC基因、ansP基因、nhoA基因、narV基因、narW基因、narY基因、narZ基因、narU基因、fdnG基因、fdnH基因、fdnI基因、adhP基因、sfcA基因、rpsV基因、osmC基因、dos基因、xasA基因、gadB基因、pqqL基因、chuR基因、hipA基因、hipB基因、tam基因、uxaB基因、marC基因、marR基因、marA基因、marB基因、dcp基因、lycV基因、dicA基因、dicB基因、rspB基因、rspA基因、speG基因、dmsB基因、dmsC基因、bioD基因、mlc基因、asr基因、ebr基因、pntB基因、pntA基因、arcD基因、rstA基因、rstB基因、tus基因、fumC基因、fumA基因、manA基因、uidC基因、uidB基因、uidA基因、uidR基因、hdhA基因、malI基因、malX基因、malY基因、add基因、blr基因、nth基因、gst基因、pdxY基因、tyrS基因、pdxH基因、slyB基因、slyA基因、sodC基因、nemA基因、gloA基因、rnt基因、lhr基因、sodB基因、araJ基因、purR基因、cfa基因、ribE基因、ag43基因、phsC基因、nrfC基因、pykF基因、lpp基因、sufS基因、aroD基因、ppsA基因、aroH基因、nlpC基因、btuD基因、btuE基因、btuC基因、himA基因、pheT基因、pheS基因、pheM基因、rplT基因、rpmI基因、infC基因、thrS基因、arp基因、pfkB基因、cedA基因、katE基因、celF基因、celD基因、celC基因、celB基因、celA基因、osmE基因、nadE基因、spy基因、astE基因、astB基因、astD基因、astA基因、cstC基因、xthA基因、gdhA基因、topB基因、selD基因、sppA基因、ansA基因、tdh基因、gapA基因、ttuC基因、caiT基因、rnd基因、fadD基因、slp基因、pabB基因、sdaA基因、manX基因、manY基因、manZ基因、rrmA基因、cspC基因、kdgR基因、tcmA基因、htpX基因、prc基因、pqiB基因、pphA基因、holE基因、exoX基因、ptrB基因、purT基因、eda基因、edd基因、zwf基因、pykA基因、mlt基因、znuA基因、znuC基因、ruvB基因、ruvA基因、ruvC基因、ntpA基因、aspS基因、bisZ基因、torY基因、cutC基因、argS基因、pgsA基因、amn基因、cbl基因、nac基因、erfK基因、cobT基因、cobS基因、cobU基因、gyrI基因、phsE基因、sbcB基因、hisL基因、hisG基因、hisD基因、hisC基因、hisB基因、hisH基因、hisA基因、hisF基因、hisI基因、wzz基因、ugd基因、gnd基因、galF基因、wcaM基因、wcaL基因、wcaK基因、wzxC基因、wcaJ基因、cpsG基因、cpsB基因、wcaI基因、wcaH基因、wcaG基因、gmd基因、wcaF基因、wcaE基因、wcaD基因、wcaC基因、wcaB基因、wcaA基因、wzb基因、wza基因、asmA基因、dcd基因、udk基因、thiD基因、thiM基因、mrp基因、metG基因、cdd基因、sanA基因、mglC基因、mglA基因、mglB基因、galS基因、folE基因、cirA基因、lysP基因、nfo基因、fruA基因、fruK基因、fruB基因、rplY基因、narP基因、ccmH基因、dsbE基因、ccmF基因、ccmE基因、ccmD基因、ccmC基因、ccmB基因、ccmA基因、napC基因、napB基因、napH基因、napG基因、napA基因、napD基因、napF基因、eco基因、alkB基因、ada基因、apbE基因、rcsB基因、rcsC基因、atoS基因、atoC基因、atoD基因、atoA基因、atoE基因、atoB基因、gyrA基因、ubiG基因、nrdA基因、nrdB基因、inaA基因、glpQ基因、glpT基因、glpA基因、glpB基因、glpC基因、cinA基因、ais基因、pmrD基因、menE基因、menC基因、menB基因、menD基因、menF基因、nuoN基因、nuoM基因、nuoL基因、nuoK基因、nuoJ基因、nuoI基因、nuoH基因、nuoG基因、nuoF基因、nuoE基因、nuoD基因、nuoB基因、nuoA基因、lrhA基因、ackA基因、pta基因、ubiX基因、purF基因、dedE基因、dedD基因、folC基因、accD基因、dedA基因、truA基因、usgl基因、pdxB基因、div基因、fabB基因、ddpX基因、mepA基因、aroC基因、sixA基因、fadL基因、vacJ基因、dsdC基因、dsdX基因、dsdA基因、emrY基因、emrK基因、evgA基因、evgS基因、bifF基因、ddg基因、glk基因、mntH基因、nupC基因、gltX基因、xapR基因、xapB基因、xapA基因、lig基因、zipA基因、cysZ基因、cysK基因、ptsH基因、ptsI基因、gsr基因、pdxK基因、cysM基因、cysA基因、cysW基因、cysU基因、cysP基因、ucpA基因、ptbA基因、amiA基因、hemF基因、cchA基因、eutC基因、eutB基因、eutH基因、eutG基因、eutJ基因、eutE基因、cchB基因、eutI基因、talA基因、tktB基因、aegA基因、narQ基因、acrD基因、dapE基因、purC基因、nlpB基因、dapA基因、gcvR基因、bcp基因、hyfA基因、hyfB基因、hyfC基因、hyfD基因、hyfE基因、hyfF基因、hyfG基因、hyfH基因、hyfI基因、hyfJ基因、hyfR基因、focB基因、perM基因、yfgE基因、uraA基因、upp基因、purM基因、purN基因、ppk基因、ppx基因、guaA基因、guaB基因、xseA基因、hisS基因、gcpE基因、ndk基因、pbpC基因、sseA基因、sseB基因、pepB基因、fdx基因、hscA基因、hscB基因、iscU基因、iscS基因、iscR基因、suhB基因、csiE基因、dgxA基因、dgxB基因、hcaC基因、hcaB基因、hcaD基因、glyA基因、hmpA基因、glnB基因、purL基因、acpS基因、pdxJ基因、recO基因、era基因、rnc基因、lepB基因、lepA基因、rseC基因、rseB基因、rseA基因、rpoE基因、nadB基因、srmB基因、ung基因、trx2基因、pssA基因、kgtP基因、clpB基因、rluD基因、pheL基因、pheA基因、tyrA基因、aroF基因、rplS基因、trmD基因、rimM基因、rpsP基因、ffh基因、grpE基因、recN基因、smpA基因、smpB基因、gabD基因、gabT基因、gabP基因、nrdF基因、emrR基因、emrA基因、emrB基因、gshA基因、csrA基因、alaS基因、oraA基因、recA基因、mltB基因、hypF基因、hydN基因、ascG基因、ascF基因、ascB基因、hycI基因、hycH基因、hycG基因、hycF基因、hycE基因、hycD基因、hycC基因、hycB基因、hycA基因、hypA基因、hypB基因、hypC基因、hypD基因、hypE基因、fhlA基因、mutS基因、prpB基因、rpoS基因、pcm基因、surE基因、ygbB基因、ygbP基因、ygbQ基因、cysC基因、cysN基因、cysD基因、iap基因、cysH基因、cysI基因、cysJ基因、ptpS基因、eno基因、pyrG基因、mazG基因、chpR基因、relA基因、barA基因、gud2基因、gudT基因、mioC基因、syd基因、sdaB基因、exo基因、fucO基因、fucA基因、fucP基因、fucI基因、fucK基因、fucU基因、fucR基因、gcvA基因、nifS基因、mltA基因、amiC基因、argA基因、thyA基因、lgt基因、ptsP基因、mutH基因、tas基因、aas基因、galR基因、lysA基因、lysR基因、araE基因、kduD基因、kduI基因、lysS基因、prfB基因、recJ基因、dsbC基因、xerD基因、fldB基因、up14基因、bglA基因、gcvP基因、gcvH基因、gcvT基因、visC基因、ubiH基因、pepP基因、serA基因、rpiA基因、iciA基因、sbm基因、argK基因、fba基因、pgk基因、epd基因、tktA基因、speB基因、speA基因、metK基因、galP基因、sprT基因、endA基因、gshB基因、yqgF基因、ansB基因、mutY基因、mltC基因、nupG基因、speC基因、pitB基因、gsp基因、hybG基因、hybF基因、hybE基因、hybD基因、hybC基因、hybB基因、hybA基因、hoxK基因、exbD基因、exbB基因、metC基因、exsA基因、sufI基因、plsC基因、parC基因、parE基因、icc基因、tolC基因、ribB基因、glgS基因、rfaE基因、glnE基因、cca基因、bacA基因、folB基因、ttdA基因、ttdB基因、ygjD基因、rpsU基因、dnaG基因、rpoD基因、aer基因、ebgR基因、ebgA基因、ebgC基因、fadH基因、uxaA基因、uxaC基因、exuT基因、exuR基因、tdcE基因、tdcD基因、tdcC基因、tdcB基因、tdcA基因、tdcR基因、sohA基因、agaR基因、agaZ基因、agaV基因、agaW基因、agaA基因、agaS基因、agaY基因、agaB基因、agaC基因、agaD基因、agaI基因、mtr基因、deaD基因、nlpI基因、pnp基因、rpsO基因、truB基因、rbfA基因、infB基因、nusA基因、argG基因、secG基因、mrsA基因、folP基因、ftsH基因、ftsJ基因、greA基因、dacB基因、yhbZ基因、rpmA基因、rplU基因、ispB基因、nlp基因、murA基因、yrbI基因、yrbK基因、rpoN基因、ptsN基因、ptsO基因、mtgA基因、arcB基因、gltB基因、nanT基因、npl基因、nanR基因、dcuD基因、sspB基因、sspA基因、rpsI基因、rplM基因、hhoA基因、hhoB基因、mdh基因、argR基因、tldD基因、rng基因、mreD基因、mreC基因、mreB基因、accB基因、accC基因、panF基因、prmA基因、fis基因、aroE基因、smg基因、smf基因、def基因、fmt基因、sun基因、trkA基因、mscL基因、zntR基因、rplQ基因、rpoA基因、rpsD基因、rpsK基因、rpsM基因、rpmJ基因、secY基因、rplO基因、rpmD基因、rpsE基因、rplR基因、rplF基因、rpsH基因、rpsN基因、rplE基因、rplX基因、rplN基因、rpsQ基因、rpmC基因、rplP基因、rpsC基因、rplV基因、rpsS基因、rplB基因、rplW基因、rplD基因、rplC基因、rpsJ基因、tufA基因、fusA基因、rpsG基因、rpsL基因、fkpA基因、slyX基因、slyD基因、kefB基因、prkB基因、crp基因、argD基因、pabA基因、fic基因、ppiA基因、nirB基因、nirD基因、nirC基因、cysG基因、php基因、trpS基因、gph基因、rpe基因、dam基因、damX基因、aroB基因、aroK基因、hofQ基因、mrcA基因、pckA基因、envZ基因、ompR基因、greB基因、feoA基因、feoB基因、bioH基因、gntT基因、malQ基因、malP基因、malT基因、rtcA基因、rtcB基因、rtcR基因、glpR基因、glpG基因、glpE基因、glpD基因、glgP基因、glgA基因、glgC基因、glgX基因、glgB基因、asd基因、gntU基因、gntU基因、gntK基因、gntR基因、ggt基因、ugpQ基因、ugpC基因、ugpE基因、ugpA基因、ugpB基因、livF基因、livG基因、livM基因、livH基因、livK基因、livJ基因、rpoH基因、ftsX基因、ftsE基因、ftsY基因、atzN基因、nikA基因、nikB基因、nikC基因、nikD基因、nikE基因、pitA基因、uspB基因、uspA基因、prlC基因、gor基因、arsR基因、arsB基因、arsC基因、slp基因、hdeB基因、hdeA基因、hdeD基因、gadA基因、treF基因、kdgK基因、dctA基因、dppF基因、dppD基因、dppC基因、dppB基因、dppA基因、tag基因、bisC基因、cspA基因、glyS基因、glyQ基因、xylB基因、xylA基因、xylF基因、xylG基因、xylH基因、xylR基因、bax基因、malS基因、avtA基因、lyx基因、sgbH基因、sgbU基因、sgbE基因、aldB基因、selB基因、selA基因、mtlA基因、mtlD基因、mtlR基因、lldP基因、lldR基因、lldD基因、cysE基因、gpsA基因、secB基因、grxC基因、tdh基因、kbl基因、htrL基因、rfaD基因、rfaF基因、rfaC基因、rfaL基因、rfaK基因、rfaZ基因、rfaY基因、rfaJ基因、rfaI基因、rfaB基因、rfaS基因、rfaP基因、rfaG基因、rfaQ基因、kdtA基因、kdtB基因、mutM基因、rpmG基因、rpmB基因、radC基因、dfp基因、dut基因、ttk基因、pyrE基因、rph基因、dinD基因、gmk基因、rpoZ基因、spoT基因、spoU基因、recG基因、gltS基因、nlpA基因、uhpT基因、uhpC基因、uhpB基因、uhpA基因、ilvN基因、ilvB基因、ivbL基因、emrD基因、ibpB基因、ibpA基因、gyrB基因、recF基因、dnaN基因、dnaA基因、rpmH基因、rnpA基因、yidC基因、thdF基因、tnaL基因、tnaA基因、tnaB基因、bglB基因、bglF基因、bglG基因、phoU基因、pstB基因、pstA基因、pstC基因、pstS基因、glmS基因、glmU基因、atpC基因、uncD基因、atpG基因、atpA基因、atpH基因、atpF基因、atpE基因、atpB基因、atpI基因、gidB基因、gidA基因、mioC基因、asnC基因、pssR基因、ilvL基因、ilvG基因、ilvM基因、ilvE基因、ilvD基因、ilvA基因、ilvY基因、ilvC基因、ppiC基因、rep基因、gppA基因、rhlB基因、trxA基因、rhoL基因、rho基因、rfe基因、wzzE基因、nfrC基因、rffD基因、rffG基因、rffH基因、rffA基因、wzxE基因、rffT基因、wecG基因、aslB基因、aslA基因、hemY基因、hemX基因、hemD基因、hemC基因、cyaA基因、cyaY基因、dapF基因、xerC基因、uvrD基因、corA基因、radD基因、pldA基因、recQ基因、pldB基因、metR基因、metE基因、udp基因、ubiE基因、aarF基因、tatC基因、tatD基因、rfaH基因、ubiD基因、ubiB基因、fadA基因、fadB基因、pepQ基因、trkH基因、trkH基因、hemG基因、mobB基因、mobA基因、dsbA基因、polA基因、yihA基因、hemN基因、ntrC基因、ntrB基因、glnA基因、fdhE基因、fdoI基因、fdoH基因、fdoG基因、fdhD基因、sodA基因、kdgT基因、cpxA基因、cpxR基因、cpxP基因、pfkA基因、sbp基因、cdh基因、tpiA基因、fpr基因、glpX基因、glpK基因、glpF基因、menG基因、menA基因、hslU基因、hslV基因、ftsN基因、cytR基因、priA基因、rpmE基因、metJ基因、metB基因、metL基因、metF基因、katG基因、gldA基因、talC基因、ppc基因、argE基因、argC基因、argB基因、argH基因、oxyR基因、udhA基因、trmA基因、btuB基因、murI基因、murB基因、birA基因、coaA基因、tufB基因、secE基因、nusG基因、rplK基因、rplA基因、rplJ基因、rplL基因、rpoB基因、rpoC基因、htrC基因、thiH基因、thiG基因、thiS基因、thiF基因、thiE基因、thiC基因、rsd基因、hemE基因、nfi基因、hupA基因、hydH基因、hydG基因、purD基因、purH基因、metA基因、aceB基因、aceA基因、aceK基因、arp基因、iclR基因、metH基因、pepE基因、lysC基因、pgi基因、ubiC基因、ubiA基因、plsB基因、dgkA基因、lexA基因、dinF基因、qor基因、dnaB基因、alr基因、tyrB基因、napA基因、hobH基因、uvrA基因、ssb基因、soxS基因、soxR基因、acs基因、nrfA基因、nrfB基因、nrfC基因、nrfD基因、nrfE基因、nrfF基因、nrfG基因、gltP基因、fdhF基因、alsR基因、rpiB基因、proP基因、basS基因、basR基因、adiY基因、adi基因、melR基因、melA基因、melB基因、fumB基因、dcuB基因、dcuR基因、dcuS基因、lysU基因、cadA基因、cadB基因、cadC基因、cutA3基因、cutA2基因、cutA基因、dcuA基因、aspA基因、fxsA基因、groES基因、groEL基因、efp基因、ecnB基因、sugE基因、blc基因、ampC基因、frdD基因、frdC基因、frdB基因、frdA基因、genX基因、psd基因、yjeQ基因、yjeE基因、amiB基因、mutL基因、miaA基因、hfq基因、hflX基因、hflK基因、hflC基因、purA基因、vacB基因、sgaE基因、rpsF基因、priB基因、rpsR基因、rplI基因、fklB基因、cycA基因、cpdB基因、cysQ基因、msrA基因、chpS基因、chpB基因、ppa基因、fbp基因、mpl基因、pmbA基因、cybC基因、nrdG基因、nrdD基因、treC基因、treB基因、treR基因、mgtA基因、pyrI基因、pyrB基因、pyrBI基因、argI基因、valS基因、holC基因、xerB基因、idnR基因、idnT基因、idnO基因、idnD基因、idnK基因、fecE基因、fecD基因、fecC基因、fecB基因、fecA基因、fecR基因、fecI基因、dnaC基因、dnaT基因、bglJ基因、fhuF基因、rsmC基因、holD基因、rimI基因、prfC基因、osmY基因、deoC基因、deoA基因、deoB基因、deoD基因、lplA基因、smp基因、serB基因、radA基因、nadR基因、slt基因、trpR基因、gpmG基因、rob基因、creA基因、creB基因、creC基因、creD基因、arcA基因、lasT基因、thrL基因；[2]acrE基因、argT基因、artI基因、artJ基因、artM基因、artP基因、artQ基因、bfr基因、chiA基因、chpA基因、dacC基因、deoR基因、dinG基因、elaA基因、elaB基因、elaC基因、elaD基因、envD基因、envR基因、fhuA基因、fhuB基因、fhuC基因、fhuD基因、folX基因、glnH基因、glnP基因、glnQ基因、gltJ基因、gltK基因、gltL基因、gspA基因、gspC基因、gspD基因、gspE基因、gspI基因、gspJ基因、gspK基因、gspL基因、hisJ基因、hisM基因、hisP基因、hisQ基因、hofD基因、hofF基因、hofG基因、hofH基因、ltaA基因、mdaA基因、mdaB基因、pinO基因、potF基因、potG基因、potH基因、potI基因、pshM基因、ptwB基因、ptwC基因、rhsB基因、rimK基因、xylU基因。2.權利要求1所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA含有具有序列號1所示鹼基序列中的下述[1]~[69]所述的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA:[1]1位~167064位所示的鹼基序列[2]172980位~243964位所示的鹼基序列[3]253411位~261963位所示的鹼基序列[4〗387532位~389138位所示的鹼基序列[5〗403704位~518029位所示的鹼基序列[6]532712位~535504位所示的鹼基序列[7]550216位~563940位所示的鹼基序列[8〗608119位~675103位所示的鹼基序列[9〗689375位~728820位所示的鹼基序列10〗739594位~832551位所示的鹼基序列11]84歸0位~867637位所示的鹼基序列12〗883474位~890997位所示的鹼基序列13]909380位~1048887位所示的鹼基序列14〗1097020位~1198105位所示的鹼基序列15]1225147位~1630911位所示的鹼基序列16]1641039位~1642631位所示的鹼基序列17]1650223位~1964523位所示的鹼基序列18]1993076位~1996661位所示的鹼基序列19]2028210位~2033448位所示的鹼基序列20]2044377位~2069148位所示的鹼基序列21]2081927位~2104392位所示的鹼基序列22]2116065位~2146263位所示的鹼基序列23]2187856位~2200668位所示的鹼基序列[24〗2229851位~-2255894位所示的鹼基序列[25]2263492位~'2270439位所示的鹼基序列[26〗2286589位-*2386261位所示的鹼基序列[27]2395472位~-2423364位所示的鹼基序列[28J2434099位~-2472851位所示的鹼基序列[29]2482483位--2505074位所示的鹼基序列[30〗2514558位--2755676位所示的鹼基序列[31〗2789481位--2795173位所示的鹼基序列[32]2800891位--2804307位所示的鹼基序列[33]2S10148位--2825313位所示的鹼基序列[34]2830263位--2910273位所示的鹼基序列[35]2910574位--2985361位所示的鹼基序列[36]3033129位--3077084位所示的鹼基序列[37]3078917位--3110109位所示的鹼基序列[38]3134342位--3165627位所示的鹼基序列[39]3172941位--3360736位所示的鹼基序列[40]3370548位-一3411159位所示的鹼基序列[41]3420879位--3453020位所示的鹼基序列[42]3469367位--3618575位所示的鹼基序列[43]3636917位--3854661位所示的鹼基序列[44]3865832位'-3867101位所示的鹼基序列[45]3877011位'-3926658位所示的鹼基序列[46]3938879位'-4059897位所示的鹼基序列[47]術9660位'-4086450位所示的鹼基序列[48:14099983位'-4139231位所示的鹼基序列[49:14149710位'-4235358位所示的鹼基序列[50:14251736位'-4298976位所示的鹼基序列[si:14311512位'-4313317位所示的鹼基序列[52:14329722位'-4409532位所示的鹼基序列[53]4423152位~4496201位所示的鹼基序列[54]4509535位~4517875位所示的鹼基序列[55]4599638位~4641433位所示的鹼基序列[56]167065位~172979位所示的鹼基序列[57]675104位~689374位所示的鹼基序列[58]832552位~848089位所示的鹼基序列[59]867638位~883473位所示的鹼基序列[60]890998位~909379位所示的鹼基序列[61]2386262位~2395471位所示的鹼基序列[62]2423365位~2434098位所示的鹼基序列[63]2472852位~2482482位所示的鹼基序列[64]2505075位~2514557位所示的鹼基序列[65]2910274位~2910573位所示的鹼基序列[66]3165628位~3172940位所示的鹼基序列[67]3411160位~3420878位所示的鹼基序列[68]3453021位~3469366位所示的鹼基序列[69]3618576位~3636916位所示的鹼基序列。3.權利要求1或者2所述的大腸桿菌突變體，具有不含有下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA,所述基因為yafJ基因、yafK基因、yafQ基因、dinJ基因、yafL基因、yafM基因、fhiA基因、lafU基因、dinP基因、yafN基因、yaf0基因、yafP基因、JW0225基因、prfH基因、ykfl基因、yafW基因、yeeT基因、ykfG基因、yafX基因、ykfF基因、ykfB基因、yafY基因、ypjK基因、yafZ基因、ykfA基因、perR基因、JW0245基因、JW0246基因、JW0247基因、ykfC基因、JW0249基因、is5B基因、yi51基因、mmuP基因、mmuM基因、afuC基因、JW0255基因、insB基因、insA基因、JW0258基因、yagB基因、yagA基因、yagE基因、yagF基因、yagG基因、yagH基因、yagl基因、argF基因、yfjl基因、yagJ基因、yagK基因、yagL基因、yagM基因、yagN基因、intF基因、yagP基因、yagQ基因、yagR基因、yagS基因、yagT基因、yagU基因、ykgJ基因、yagV基因、yagW基因、yagX基因、yagY基因、yagZ基因、ykgK基因、ykgL基因、ykgM基因、eaeH基因、JW0292基因、JW0293基因、ykgA基因、,ykgB基因、ykgl基因、mer人基因、ykgD基因、ykgE基因、ykgF基因、ykgG基因、ykgH基因、betA基因、betB基因、betl基因、betT基因、yahA基因、yahB基因、yahC基因、yahD基因、yahE基因、yahF基因、yahG基因、yahH基因、arcM基因、yahJ基因、yahK基因、yahL基因、yahM基因、yahN基因、yahO基因、prpR基因、bcpA基因、prpC基因、prpD基因、prpE基因、codB基因、codA基因、cynR基因、cynT基因、cynS基因、cynX基因、lacA基因、lacY基因、lacZ基因、lacl基因、mhpR基因、mhpA基因、mhpB基因、mhpC基因、mhpD基因、mhpF基因、mhpE基因、mhpT基因、yaiL基因、yaiM基因、adhC基因、yaiN基因、yaiO基因、JW0350基因、yi2A基因、yi22基因、yi24基因、yi23基因、yaiP基因、yaiS基因、tauA基因、tauB基因、tauC基因、ssiD基因、yaiT基因、扁363基因、JW0364基因、yaiU基因、yaiV基因、ampH基因、sbmA基因、yaiW基因、yaiY基因、yaiZ基因、ddlA基因、yaiB基因、phoA基因、psiF基因、yaiC基因、ybbO基因、tesA基因、ybbA基因、ybbP基因、rhsD基因、ybbC基因、rhsE基因、ybbD基因、JW0490基因、ybbB基因、ybbS基因、ybbT基因、ybbU基因、ybbQ基因、ybbV基因、allP基因、allA基因、ybbY基因、ybbZ基因、ylbA基因、allC基因、ylbC基因、fdrA基因、ylbE基因、ylbF基因、arcC基因、intD基因、EXO-LAMBD基因、VRPP—LAMBD基因、JW0528基因、JW0529基因、VREN-LAMBD基因、emrE基因、ybcK基因、ybcL基因、ybcM基因、ybcN基因、ninE基因、ybcO基因、rus基因、ybcQ基因、JW0539.5基因、nmpC基因、vlyS基因、ybcS基因、ybcT基因、vboR基因、ybcV基因、ybcW基因、nohB基因、ybcX基因、ybcY基因、JW0552基因、appY基因、ompT基因、envY基因、ybcH基因、nfrA基因、nfrB基因、cusS基因、cusR基因、cusC基因、ylcC基因、cusB基因、cusA基因、pheP基因、ybdG基因、nfnB基因、ybdF基因、ybdJ基園、ybdK基西、hokE基因、yi81基因、yi82基因、ymcC基因、ymcD基因、cspH基因、cspG基因、sfa基因、yccL基因、yccM基因、torS基因、torT基因、torR基因、torC基因、torA基因、torD基因、yccD基因、cbpA基因、yccE基因、agp基因、yccJ基因、wrbA基因、yciG基因、ycdG基因、扁992基因、JW0993基因、JW0994基因、ycdK基因、JW0996基因、JW0997基因、ycdC基因、putA基因、yzpU基因、putP基因、JW1002基因、ycd0基因、ycdB基因、phoH基因、ycdP基因、ycdQ基因、ycdR基因、ycdS基因、ycdT基因、JW1012基因、JW1013基因、JW1014基因、ycdU基因、ymfD基因、ymfE基因、lit基因、intE基因、VXIS-BPP21基因、ymfH基因、ymfl基因、ymfJ基因、RPC2-BPP22基因、JW1132基因、ymfL基因、ymfM基因、ymfN基因、ymfR基因、ymfO基因、JW1138基因、JW1139基因、ycfK基因、ymfS基因、ycfA基因、ycfE基因、pin基因、mcrA基因、JW1146基因、ycgW基因、ycgX基因、ycgE基因、JW1150基因、ycgZ基因、yragA基因、JW1153基因、ymgC基因、yahA基因、JW1156基因、JW1157基因、aidA基因、ymgD基因、JW1160基因、JW1161基因、JW1162基因、ydfH基因、ydfZ基因、ydfl基因、shiA基因、JW1537基因、tnpR基因、ydfM基因、Y314一LAMBD基因、nohA基因、ydf0基因、yccL基因、cspl基因、ydfR基因、vlyS基因、cspB基因、cspF基因、regQ—LAMBD基因、JW1552基因、rem基因、hokD基因、relE基因、relB基因、ydfV基因、flxA基因、ydfW基因、ydfX基因、dicC基因、sdaC基因、yqeH基因、yqel基因、yqeJ基因、yqeK基因、ygeF基因、ygeG基因、ygeH基因、ygel基因、JW2822基因、ygeK基因、JW2824基因、JW2825基因、JW2830基因、ygeP基因、JW2832基因、nlpD基因、yagR基因、ygeT基因、JW2836基因、ygeV基因、ygeW基因、dpaL基因、ygeY基因、ygeZ基因、arcL基因、yqeB基因、JW2844基因、ygfJ基因、gltD基因、JW2847基因、ygfM基因、yagR基因、ygfO基因、ygfP基因、ygfQ基因、ygfR基因、ygfS基因、ygfT基因、pbuX基因、idi基因、epsM基因、exeL基因、exeC基因、JW2938基因、JW2939基因、JW2940基因、JW2941基因、yghK基因、glcB基因、glcG基因、glcF基因、glcD基因、glcC基因、JW2948基因、yghQ基因、yghR基因、yghS基因、yghT基因、yihL基因、yihM基因、yihN基因、yshA基因、yih0基因、yihP基因、yihQ基因、yihR基因、yihS基因、yihT基因、yihU基因、yihV基因、yihW基因、yihX基因、rbn基因、yihZ基因、yiiD基因、yiiE基因、yiiF基因、yiiG基因、frvR基因、frvX基因、frvB基因、frvA基因、yiiL基因、rhaD基因、rhaA基因、rhaB基因、rhaS基因、rhaR基因、rhaT基因、ptsA基因、JW3920基因、frwC基因、frwB基因、pflD基因、pflC基因、frwD基因、yijO基因、yijP基因、JW3986基因、yjbF基因、yjbG基因、yjbH基因、JW3989.5基因、yjbA基因、xylE基因、malG基因、malF基因、malE基因、malK基因、lamB基因、malM基因、yjbl基因、yjcP基因、yjcQ基因、yjcR基因、yjcS基因、alsK基因、alsE基因、alsC基因、alsA基因、alsB基因、phnQ基因、phnP基因、phnO基因、phnN基因、phnM基因、phnL基因、phnK基因、phnJ基因、phnl基因、phnH基因、phnG基因、phiiF基因、phnE基因、phnD基因、phnC基因、phnB基因、phnA基因'.yjdA基因以及yjcZ基因。4.權利要求1~3中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DM不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[l]~[18]所述鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA:[1]鹼基編號243965位~253410位所示的鹼基序列[2〗鹼基編號261964位~387531位所示的鹼基序列[3]鹼基編號389139位~403703位所示的鹼基序列[4]鹼基編號518030位~532711位所示的鹼基序列[5]鹼基編號535505位~550215位所示的鹼基序列[6]鹼基編號563941位~608118位所示的鹼基序列[7]鹼基編號1048888位~1097019位所示的鹼基序列[8]鹼基編號1198106位~1225146位所示的鹼基序列[9〗鹼基編號1630912位~1641038位所示的鹼基序列[10]鹼基編號1642632位~1650222位所示的鹼基序列[11]鹼基編號2985362位~3033128位所示的鹼基序列[12]鹼基編號3110110位~3134341位所示的鹼基序列[13]鹼基編號4059898位~4079659位所示的鹼基序列[14]鹼基編號4086451位~4099982位所示的鹼基序列[15]鹼基編號4139232位~4149709位所示的鹼基序列[16]鹼基編號4235359位~4251735位所示的鹼基序列[17]鹼基編號4298977位~4311511位所示的鹼基序列[18]鹼基編號4313318位~4329721位所示的鹼基序列5.權利要求1~4中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yidF基因、yidG基因、yidH基因、yidl基因、yidJ基因、yidK基因、yidL基因、JW3657基因、glvG基因、glvB基因、glvC基因、yidP基因、yidE基因、yidQ基因、yidR基因、yidS基因、dgoT基因、dgoA基因、dgoK基因、dgoR基因、yidW基因、yidX基因、yidA基因、yidB基因、asnA基因、yieM基因、r0724基因、yieN基因、kup基因、rbsD基因、rbsA基因、rbsC基因、rbsB基因、rbsK基因、rbsR基因以及yieO基因。6.權利要求1~5中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DM不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[l]~[3]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DM:[1]鹼基編號3854662位~3865831位所示的鹼基序列[2]鹼基編號3867102位~3877010位所示的鹼基序列[3]鹼基編號3926659位~3938878位所示的鹼基序列。7.權利要求1~6中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yecT基因、flhE基因、flhA基因、HhB基因、cheZ基因、cheY基因、cheB基因、cheR基因、tap基因、tar基因、cheW基因、cheA基因、motB基因、motA基因、flhC基因、flhD基因、JW1882基因、JW1883基因、yecG基因、otsA基園、otsB基因、araH基因、araG基因、araF基因、yecl基因、yecJ基因、JW1892基因、ftn基因、yecH基因、tyrP基因、uvrC基因、uvrY基因、yecF基因、sdiA基因、yecC基因、yecS基因、yed0基因、fliY基因、fliZ基因、fliA基因、fliC基因、fliD基因、fliS基因、fliT基因、amyA基因、yedD基因、yedE基因、yedF基因、yedK基因、yedL基因、yedN基因、yedM基因、fliE基因、fliF基因、fliG基因、fliH基因、flil基因、fliJ基因、fliK基因、fliL基因、fliM基因、fliN基因、fliO基因、fliP基因、fliQ基因、fliR基因、rcsA基因、dsrB基因、JW1937基因、yedA基因、vsr基因、dcm基因、yedJ基因、JW1946基因、ompC基因、JW1948基因、yedS基因、yedU基因、yedV基因、copR基因、yedX基因、JW1954基因、JW1955基因、JW1956基因、JW1974基因、JW1979基因、JW1980基因、yeeP基因、flu基因、JW1983基因、yeeS基因、yeeU基因、yeeV基因、yeeW基因、yefJ基因、JW2013基因、yefJ基因、yefl基因、wbbJ基因、yefG基因、rfc基因、glf基因、rfbX基因、rfbC基因、rfbA基因、rfbD基因以及rfbB基因。8.權利要求1~7中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DM，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[l]~[5]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1]鹼基編號1964524位~1993075位所示的鹼基序列[2]鹼基編號1996662位~2028209位所示的鹼基序列[3〗鹼基編號2033449位~2044376位所示的鹼基序列[4]鹼基編號2069149位~2081926位所示的鹼基序列[5]鹼基編號2104393位~2116064位所示的鹼基序列。9.權利要求1~8中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為intA基因、yfjH基因、alpA基因、yfjl基因、JW2606基因、yfjj基因、yfjK基因、yfjL基因、yfjM基因、yfjN基因、yfjO基因、yfjP基因、yfjQ基因、yfjR基因、ypjK基因、yfjS基因、yfjT基因、yfjU基因、yfjV基因、JW2622基因、yfjW基因、JW2623.5基因、yfjX基因、yfjY基因、yfjZ基因、ypjF基因、ypjA基因、JW2629基因、JW2630基因、JW2631基因、JW2632基因、JW2633基因、JW2634基因、ygaE基因、yzzM基因、yqaE基因、JW2642基因、ygaP基因、stpA基因、JW2645基因、ygaC基因、ygaM基因、nrdH基因、nrdl基因、nrdE基因、proV基因、proW基因、proX基因、JW2655基因、JW2656基因、ygaZ基因、ygaH基因、srlA基因、srlB基因、srlD基因、gutM基因、srlR基因以及gutQ基因。10.權利要求1~9中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下迷[l]~[4]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1]鹼基編號2755677位~2789480位所示的鹼基序列[2]鹼基編號2795174位~2800890位所示的鹼基序列[3]鹼基編號2804308位~2810147位所示的鹼基序列[4〗鹼基編號2825314位~2830262位所示的鹼基序列。11.權利要求1~10中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DM，所述基因為gltF基因、yhcA基因、yhcD基因、yhcE基因、yhcF基因、yhcG基因、yhcH基因、nanK基因以及nanE基因。12.權利要求1~11中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DM，所述染色體DM不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3360737位~3370547位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。13.權利要求1~12中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yegE基因、alkA基因、yegD基因、JW2055基因、JW2056基因、JW2057基因、JW2058基因、yegM基因、yegN基因、yegO基因、yegB基因、baeS基因、baeR基因、JW2065基因、yegQ基因、ogrK基因、JW2068基因、JW2069基因、yegS基因、gatR基因、JW2072基因、JW2073基因、gatR基因、gatD基因、gatC基因、gatB基因、gatA基因、gatZ基因、gatY基因、fbaB基因、xegT基因、yegU基因、yegV基因、yegW基因、yegX基因、molR基因、yehl基因、yehK基因、yehL基因、yeh0基因、yehP基因、yehQ基因、yehR基因、yehS基因、yehT基因、yehU基因、yehV基因、yehW基因、yehX基因、yehY基因、yehZ基因、bglX基因、dld基因、pbpG基因、yohC基因、yeiQ基因、yeiR基因、yeiU基因、spr基因、rtn基因、yejA基因、yejB基因、yejE基因、yejF基因、yejG基因、bcr基因、rsuA基因、yejH基因、yeil基因、yeiJ基因、yeiK基因、yeiL基因、yeiM基因、yeiN基因以及yeiC基因。14.權利要求1~13中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述的[1]~[4]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1]鹼基編號2146264位~2187855位所示的鹼基序列[2]鹼基編號2200669位~2229850位所示的鹼基序列[3〗鹼基編號2270440位~2286588位所示的鹼基序列[4]鹼基編號2255895位~2263491位所示的鹼基序列。15.權利要求1~14中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有不含cmU基因以及cmtB基因、或者與它們同源的基因的染色體DM。16.權利要求1~15中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3077085位~3078916位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。17.權利要求1~16中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為intB基因、JW4228基因、yjgW基因、yjgX基因、yjgY基因、yjgZ基因、yi41基因、yi42基因、yjhB基因、yjhC基因、yjhD基因、yjhE基因、yi91基因、JW4244基因、JW4245基因、JW4246基因、yjhU基因、yjhF基因、yjhG基因、yjhH基因、yjhl基因、sgcR基因、sgcE基因、sgcA基因、sgcQ基因、sgcC基因、JW4266.5基因、sgcX基因、yjhP基因、yjhQ基因、JW4269.5基因、JW4270基因、JW4270.5基因、基因、yjhA基因、fimB基因、fimE基因、fimA基因、fiml基因、fimC基因、fimD基因、fimF基因、fimG基因、fimH基因、gntP基因、uxuA基因、uxuB基因、uxuR基因、yjiC基因、yjiD基因、yjiE基因、iadA基因、yjiG基因、yjiH基因、yjiI基因、yjiJ基因、yjiK基因、JW4296.5基因、yjiL基因、yjiM基因、yjiN基因、yji0基因、yjiP基因、yjiQ基因、yjiR基因、yjiS基因、yjiT基因、yjiV基因、mcrD基因、mcrC基因、mcrB基因、yjiW基因、hsdS基因、hsdM基因、hsdR基因、mrr基因、yjiA基因、yjiX基因、yjiY基因、tsr基因、yjjL基因、JW4320基因、yjjM基因、yjjN基因、mdoB基因以及yjjA基因。18.權利要求1~17中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號l所示鹼基序列中的下述的[1]或者[2]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DM:[1]鹼基編號4496202位~4509534位所示的鹼基序列[2〗鹼基編號4517876位~4599637位所示的鹼基序列。19.權利要求1~18中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為kdpF基因、ybfA基因、rhsC基因、JW0690基因、ybfB基因、rhsA基因、ybfC基因、ybfD基因、ybfL基因、ybfD基因以及ybgA基因。20.權利要求1~19中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號728821位~739593位所示的鹼基序列的DM、或者該DM相當的DNA。21.權利要求1~20中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yjfl基因、yjfJ基因、yjfK基因、yjfL基因、yjfM基因、yjfC基因、aidB基因、yjfN基因、yjfO基因、yjfP基因、yjfQ基因、yjfR基因、sgaT基因、sgaB基因、sgaA基因、sgaH基因以及sgaU基因。22.權利要求1~21中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號4409533位~4423151位所示的鹼基序列的DNA、或者該DNA相當的DNA。23.含有權利要求1[1]所述的基因、spr基因、bcr基因以及rsuA基因、或者與它們同源的基因、且具有比野生型大腸桿菌染色體DNA短933kBp以上的染色體DNA的大腸桿菌突變體，不過、在上述基因或者與它們同源的基因中，存在野生型大腸桿菌原來不具有的基因(以下稱為NC基因)的情況下，該源自野生型大腸桿菌的上述大腸桿菌突變體也可以不具有NC基因。24.權利要求23所述的大腸桿菌突變體，其具有含有具有權利要求2的[1]~[55]所述的鹼基序列的DNA以及具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號2270440位~2286588位所示的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DM的染色體DNA。25.權利要求23或者24所述的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yafJ基因、yafK基因、yafQ基因、dinJ基因、yafL基因、yafM基因、fhiA基因、lafU基因、dinP基因、yafN基因、yaf0基因、yafP基因、JW0225基因、prfH基因、ykfl基因、yafW基因、yeeT基因、ykfG基因、yafX基因、ykfF基因、ykfB基因、yafY基因、ypjK基因、yafZ基因、ykfA基因、perR基因、JW0245基因、JW0246基因、JW0247基因、ykfC基因、JW0249基因、is5B基因、yi51基因、mmuP基因、mmuM基因、afuC基因、JW0255基因、insB基因、insA基因、JW0258基因、yagB基因、yagA基因、yagE基因、yagF基因、yagG基因、yagH基因、yagl基因、argF基因、yfjl基因、yagJ基因、yagK基因、yagL基因、yagM基因、yagN基因、intF基因、yagP基因、yagQ基因、yagR基因、yagS基因、yagT基因、yagU基因、ykgJ基因、yagV基因、yagW基因、yagX基因、yagY基因、yagZ基因、ykgK基因、ykgL基因、ykgM基因、eaeH基因、JW0292基因、JW0293基因、ykgA基因、ykgB基因、ykgl基因、merA基因、ykgD基因、ykgE基因、ykgF基因、ykgG基因、ykgH基因、betA基因、betB基因、betl基因、betT基因、yahA基因、yahB基因、yahC基因、yahD基因、yahE基因、yahF基因、yahG基因、yahH基因、arcM基因、yahJ基因、yahK基因、yahL基因、yahM基因、yahN基因、yah0基因、prpR基因、bcpA基因、prpC基因、prpD基因、prpE基因、codB基因、codA基因、cynR基因、cynT基因、cynS基因、cynX基因、lacA基因、lacY基因、lacZ基因、lacl基因、mhpR基因、mhpA基因、mhpB基因、mhpC基因、mhpD基因、mhpF基因、mhpE基因、mhpT基因、yaiL基因、yaiM基因、adhC基因、yaiN基因、yaiO基因、JW0350基因、yi2A基因、yi22基因、yi24基因、yi23基因、yaiP基因、yaiS基因、UuA基因、tauB基因、tauC基因、ssiD基因、yaiT基因、JW0363基因、JW0364基因、yaiU基因、yaiV基因、ampH基因、sbmA基因、yaiW基因、yaiY基因、yaiZ基因、ddlA基因、yaiB基因、phoA基因、psiF基因、yaiC基因、ybbO基因、tesA基因、ybbA基因、ybbP基因、rhsD基因、ybbC基因、rhsE基因、ybbD基因、JW0490基因、ybbB基因、ybbS基因、ybbT基因、ybbU基因、ybbQ基因、ybbV基因、allP基因、allA基因、ybbY基因、ybbZ基因、ylbA基因、allC基因、ylbC基因、fdrA基因、ylbE基因、ylbE基因、ylbE基因、ylbF基因、arcC基因、intD基因、EXO-LAMBD基因、VRPP-LAMBD基因、JW0528基因、JW0529基因、VREN-LAMBD基因、emrE基因、ybcK基因、ybcL基因、ybcM基因、ybcN基因、ninE基因、ybcO基因、rus基因、ybcQ基因、JW0539.5基因、nmpC基因、vlyS基因、ybcS基因、ybcT基因、vboR基因、ybcV基因、ybcW基因、nohB基因、ybcX基因、ybcY基因、JW0552基因、appY基因、ompT基因、envY基因、ybcH基因、nfrA基因、nfrB基因、cusS基因、cusR基因、cusC基因、ylcC基因、cusB基因、cusA基因、pheP基因、ybdG基因、nfnB基因、ybdF基因、ybdJ基因、ybdK基因、hokE基因、yi81基因、yi82基因、ymcC基因、ymcD基因、cspH基因、cspG基因、sfa基因、yccL基因、yccM基因、torS基因、torT基因、torR基因、torC基因、torA基因、torD基因、yccD基因、cbpA基因、yccE基因、agp基因、yccJ基因、wrbA基西、yciG基因、ycdG基因、JW0992基因、JW0993基因、JW0994基因、ycdK基因、JW0996基因、JW0997基因、ycdC基因、puU基因、yzpU基因、putP基因、JW1002基因、ycdO基因、ycdB基因、phoH基因、ycdP基因、ycdQ基因、ycdR基因、ycdR基因、ycdS基因、ycdT基因、JW1012基因、JW1013基因、JW1014基因、ycdU基因、ymfD基因、ymfE基因、Ut基因、intE基因、VXIS-BPP21基因、ymfH基因、ymfl基因、ymfJ基因、RPC2-BPP22基因、JW1132基因、ymfL基因、ymfM基因、ymfN基因、ymfR基因、ymfO基因、JW1138基因、JW1139基因、ycfK基因、ymfS基因、ycfA基因、ycfE基因、pin基因、mcrA基因、JW1146基因、ycgW基因、ycgX基因、ycgE基因、JW1150基因、ycgZ基因、ymgA基因、JW1153基因、ymgC基因、yahA基因、JW1156基因、JW1157基因、aidA基因、ymgD基因、JW1160基因、JW1161基因、JW1162基因、ydfH基因、ydfZ基因、ydfl基因、shiA基因、JW1537基因、tnpR基因、ydfM基因、Y314—LAMBD基因、nohA基因、ydfO基因、yccL基因、cspI基因、ydfR基因、vlyS基因、cspB基因、cspF基因、regQ-LAMBD基因、JW1552基因、rem基因、hokD基因、relE基因、relB基因、ydfV基因、flxA基因、ydfW基因、ydfX基因、dicC基因、sdaC基因、yqeH基因、yqel基因、yqej基因、yqeK基因、ygeF基因、ygeG基因、ygeH基因、ygel基因、JW2822基因、ygeK基因、JW2824基因、JW2825基因、JW2830基因、ygeP基因、JW2832基因、nlpD基因、yagR基因、ygeT基因、JW2836基因、ygeV基因、ygeW基因、dpaL基因、ygeY基因、ygeZ基因、arcL基因、yqeB基因、JW2844基因、ygfj基因、gltD基因、JW2847基因、ygfM基因、yagR基因、ygfO基因、ygfP基因、ygfQ基因、ygfR基因、ygfS基因、ygfT基因、pbuX基因、idi基因、epsM基因、exeL基因、exeC基因、JW2938基因、JW2939基因、JW2940基因、JW2941基因、yghK基因、glcB基因、glcG基因、glcF基因、glcD基因、glcC基因、JW2948基因、yghQ基因、yghR基因、yghS基因、yghT基因、yihL基因、yihM基因、yihN基因、yshA基因、yihO基因、yihP基因、yihQ基因、yihR基因、yihS基因、yihT基因、yihU基因、yihV基因、yihW基因、yihX基因、rbn基因、yihZ基因、yiiD基因、yiiE基因、yiiF基因、yiiG基因、frvR基因、frvX基因、frvB基因、frvA基因、yiiL基因、rhaD基因、rhaA基因、rhaB基因、rhaS基因、rhaR基因、rhaT基因、ptsA基因、JW3920基因、frwC基因、frwB基因、pflD基因、pflC基因、frwD基因、yijO基因、yUP基因、JW3986基因、yjbF基因、yjbG基因、yjbH基因、JW3989.5基因、yjbA基因、xylE基因、malG基因、malF基因、malE基因、malK基因、lamB基因、malM基因、yjbl基因、yjcP基因、yjcQ基因、yjcR基因、yjcS基因、alsK基因、alsE基因、alsC基因、alsA基因、alsB基因、phnQ基因、phnP基因、phnO基因、phnN基因、phnM基因、phnL基因、phnK基因、phnJ基因、phnl基因、phnH基因、phnG基因、phnF基因、phnE基因、phnD基因、phnC基因、phnB基因、phnA基因、yjdA基因、yjcZ基因、yidF基因、yidG基因、yidH基因、yidl基因、yidJ基因、yidK基因、yidL基因、JW3657基因、glvG基因、glvB基因、glvC基因、yidP基因、yidE基因、yidQ基因、yidR基因、yidS基因、dgoT基因、dgoA基因、dgoK基因、dgoR基因、yidW基因、yidX基因、yidA基因、yidB基因、asnA基因、yieM基因、JW3724基因、yieN基因、kup基因、rbsD基因、rbsA基因、rbsC基因、rbsB基因、rbsK基因、rbsR基因、yie0基因、yecT基因、flhE基因、flhA基因、flhB基因、cheZ基因、cheY基因、cheB基因、cheR基因、tap基因，.tar基因、cheW基因、cheA基因、motB基因、motA基因、flhC基因、flhD基因、JW1882基因、JW1883基因、yecG基因、otsA基因、otsB基因、araH基因、araG基因、araF基因、yecl基因、yecJ基因、JW1892基因、ftn基因、yecH基因、tyrP基因、uvrC基因、uvrY基因、yecF基因、sdiA基因、yecC基因、yecS基因、yed0基因、fliY基因、fliZ基因、HiA基因、fliC基因、fliD基因、fHS基因、fliT基因、amyA基因、yedD基因、yedE基因、yedF基因、yedK基因、yedL基因、yedN基因、yedM基因、fliE基因、fliF基因、fUG基因、fliH基因、flil基因、HiJ基因、fliK基因、fliL基因、fliM基因、fliN基西、fli0基因、fliP基因、fliQ基因、fliR基因、rcsA基因、dsrB基因、JW1937基因、yedA基因、vsr基因、dcm基因、yedJ基因、JW1946基因、ompC基因、JW1948基因、yedS基因、yedU基因、yedV基因、copR基因、yedX基因、JW1954基因、JW1955基因、JW1956基因、JW1974基因、JW1979基因、JW1980基因、yeeP基因、flu基因、JW1983基因、yeeS基因、yeeT基因、yeeU基因、yeeV基因、yeeW基因、yefJ基因、JW2013基因、yefJ基因、yefl基因、wbbJ基因、yefG基因、rfc基因、glf基因、rfbX基因、rfbC基因、rfbA基因、rfbD基因、rfbB基因、intA基因、yfjH基因、alpA基因、yfjl基因、JW2606基因、yfjJ基因、yfjK基因、yfjL基因、yfjM基因、yfjN基因、yfjO基因、yfjP基因、yfjQ基因、yfjR基因、ypjK基因、yfjS基因、yfjT基因、yfjU基因、yfjV基因、JW2622基因、yfjW基因、JW2623.5基因、yfjX基因、yfjY基因、yfjZ基因、ypjF基因、ypjA基因、JW2629基因、JW2630基因、JW2631基因、JW2632基因、JW2633基因、JW2634基因、ygaE基因、yzzM基因、yqaE基因、JW2642基因、ygaP基因、stpA基因、JW2645基因、ygaC基因、ygaM基因、nrdH基因、nrdl基因、nrdE基因、proV基因、proW基因、proX基因、JW2655基因、JW2656基因、ygaZ基因、ygaH基因、srlA基因、srlB基因、srlD基因、gutM基因、srlR基因、gutQ基因、gUF基因、yhcA基因、yhcD基因、yhcE基因、yhcE基因、yhcF基因、yhcG基因、yhcH基因、nanK基因、nanE基因、yegE基因、alkA基因、yegD基因、JW2055基因、JW2056基因、JW2057基因、JW2058基因、yegM基因、yegN基因、yegO基因、yegB基因、baeS基因、baeR基因、JW2065基因、yegQ基因、ogrK基因、JW2068基因、JW2069基因、yegS基因、gatR基因、JW2072基因、JW2073基因、gatR基因、gatD基因、gatC基因、gatB基因、gatA基因、gatZ基因、gatY基因、fbaB基因、xegT基因、yegU基因、yegV基因、yegW基因、yegX基因、molR基因、yehl基因、yehK基因、yehL基因、yehO基因、yehP基因、yehQ基因、yehR基因、yehS基因、yehT基因、yehU基因、yehV基因、yehW基因、yehX基因、yehY基因、yehZ基因、bglX基因、dld基因、pbpG基因、yohC基因、yeil基因、yeiJ基因、yeiK基因、yeiL基因、yeiM基因、yeiN基因、yeiC基因、cmtA基因、cmtB基因、intB基因、JW4228基因、yjgW基因、yjgX基因、yjgY基因、yjgZ基因、yi41基因、yi42基因、yjhB基因、yjhC基因、yjhD基因、yjhE基因、yi91基因、JW4244基因、JW4245基因、JW4246基因、yjhU基因、yjhF基因、yjhG基因、yjhH基因、yjhl基因、sgcR基因、sgcE基因、sgcA基因、sgcQ基因、sgcC基因、JW4266.5基因、sgcX基因、yjhP基因、yjhQ基因、JW4269.5基因、JW4270基因、JW4270.5基因、yjhR基因、yjhS基因、yjhT基因、yjhA基因、fimB基因、fimE基因、fimA基因、fiml基因、fimC基因、fimD基因、fimF基因、nmG基因、fimH基因、gntP基因、uxuA基因、uxuB基因、uxuR基因、yjiC基因、yjiD基因、yjiE基因、iadA基因、yjiG基因、yjiH基因、yjil基因、yjiJ基因、yjiK基因、JW4296.5基因、yjiL基因、yjiM基因、yjiN基因、yji0基因、yjiP基因、yjiQ基因、yjiR基因、yjiS基因、yjiT基因、yjiV基因、mcrD基因、mcrC基因、mcrB基因、yjiW基因、hsdS基因、hsdM基因、hsdR基因、mrr基因、yjiA基因、yjiX基因、yjiY基因、tsr基因、yjjL基因、JW4320基因、yjjM基因、yjjN基因、mdoB基因、yjjA基因、kdpF基因、ybfA基因、rhsC基因、JW0690基因、ybfB基因、rhsA基因、ybfC基因、ybfL基因、ybfD基因、ybgA基因、yjfl基因、yjfJ基因、yjfK基因、yjfL基因、yjfM基因、yjfC基因、aidB基因、yjfN基因、yjfO基因、yjfP基因、yjfQ基因、yjfR基因、sgaT基因、sgaB基因、sgaA基因、sgaH基因、sgaU基因、rhsB基因、JW3448基因、yhhH基因、yibA基因、yhhl基因、yhhJ基因、yhiH基因、yhil基因、yhiJ基因、yhiK基因、yhiL基因、yhiM基因、yhiN基因、JW0782基因、ybiA基因、dinG基因、ybiB基因、yMC基因、ybiJ基因、ybil基因、ybiX基因、ybiL基因、ybiM基因、ybiN基因、ybiO基因、glnQ基因、glnP基因、glnH基因、yliA基因、yliB基因、yliC基因、yliD基因、JW0817基因、JW0818基因、yliG基因、yliH基因、ylil基因、yliJ基因、dacC基因、deoR基因、ybjG基因、ybjC基因、mdaA基因、rimK基因、ybjN基因、potF基因、potG基因、potH基因、potl基因、ybj0基因、ybjF基因、artJ基因、artM基因、artQ基因、artl基因、artP基因、ybjP基因、JW0850基因、JW0851基因、JW0852基因、ybjT基因以及ltaA基因。26.權利要求23~25中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述[l]~[43]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:鹼基編號243965位~253410位所示的鹼基序列261964位~387531位所示的鹼基序列389139位~403703位所示的鹼基序列518030位~532711位所示的鹼基序列535505位~550215位所示的鹼基序列563941位~608118位所示的鹼基序列728821位~739593位所示的鹼基序列832552位~848089位所示的鹼基序列867638位~883473位所示的鹼基序列890998位~909379位所示的鹼基序列鹼基編號鹼基編號鹼基編號鹼基編號械基編號鹼基編號鹼基編號鹼基編號鹼基編號鹼基編號鹼基編號鹼基編號鹼基編號鹼基編號械基編號鹼基編號4^基編號械基編號鹼基編號鹼基編號1048888位U98106位1630912位1642632位1964524位1996662位2033449位2069149位2104393位2146264位2200669位2255895位~1097019位所示的鹼基序列~1225146位所示的鹼基序列~1641038位所示的鹼基序列~1650222位所示的鹼基序列~1993075位所示的鹼基序列~2028209位所示的鹼基序列~2044376位所示的鹼基序列~2081926位所示的鹼基序列~2116064位所示的鹼基序列~2187855位所示的鹼基序列~2229850位所示的鹼基序列~2263491位所示的鹼基序列[23]鹼基編號2755677位--2789480位所示的鹼基序列[24]鹼基編號2795174位--2800890位所示的鹼基序列[25]鹼基編號2S04308位--2810147位所示的鹼基序列[26]鹼基編號2825314位--2830262位所示的鹼基序列[27]鹼基編號2985362位--3033128位所示的鹼基序列[28]鹼基編號3077085位--3078916位所示的鹼基序列[29J鹼基編號3110110位--3134341位所示的鹼基序列[30]鹼基編號3360737位--3370547位所示的鹼基序列[31]鹼基編號3618576位--3636916位所示的鹼基序列[32]鹼基編號3854662位--3865831位所示的鹼基序列[33]鹼基編號3867102位--3877010位所示的鹼基序列[34]鹼基編號3926659位--3938878位所示的鹼基序列[35]4^^>^編萬4313318位--4329721位所示的鹼基序列[41]鹼基編號4409533位--4423151位所示的鹼基序列[42]鹼基編號4496202位--4509534位所示的鹼基序列[43]鹼基編號4517876位--4599637位所示的鹼基序列。27.權利要求23~26中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DM，所述染色體DNA不含ygiS基因、ygiT基因、ygiU基因、JW2991基因、ygiW基因、ygiX基因、ygiY基因、ygiZ基因、mdaB基因以及ygiN基因、或者與它們同源的基因。28.權利要求23~27中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3165628位~3172940位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DM相當的DNA。29.權利要求23~28中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含ybeL基因、ybeQ基因、ybeR基因、ybeS基因、ybeT基因、ybeU基因、ybeV基因、ybeW基因、ybeK基因、gltL基因、gltK基因、gltJ基因、ybeJ基因以及JW0651基因、或者與它們同源的基因。30.權利要求23~29中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號675104位~689374位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DM相當的DNA。31.權利要求23~30中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為yfcC基因、JW2296基因、yfcE基因、yfcF基因、yfcG基因、folX基因、JW2301基因、yfcl基因、hisP基因、hisM基因、hisQ基因、hisJ基因、argT基因、yfdB基因、JW2346基因、yfdH基因、JW2348基因、yfdK基因、yfdL基因、yfdM基因、xylU基因、yfdN基因、yfdO基因、JW2356基因、JW2357基因、JW2358基因、JW2359基因、JW2360基因、JW2378基因、yqhT基因、ptwC基因以及ptwB基因。32.權利要求23~31中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的下述的[1]~[3]所述的鹼基序列的DNA、或者與它們相當的DNA:[1]鹼基編號2423365位~2434098位所示的鹼基序列[2]鹼基編號2472852位~2482482位所示的鹼基序列[3〗鹼基編號2505075位~2514557位所示的鹼基序列。33.權利要求23~32中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有不含下述基因、或者與它們同源的基因的染色體DNA，所述基因為pinO基因、gspA基因、gspC基因、gspD基因、gspE基因、hofF基因、hofG基因、hofH基因、gspl基因、gspJ基因、gspK基因、gspL基因、pshM基因、hofD基因、bfr基因、yheA基因以及chiA基因。34.權利要求23~33中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3453021位~3469366位所示的鹼基序列的DNA、或者與該■相當的DNA。35.權利要求23~34中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含elaB基因、elaA基因、elaC基因、elaD基因、yfbK基因、yfbL基因、yfbM基因、yfbN基因、JW2269基因以及JW2270基因、或者與它們同源的基因。36.權利要求23~35中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DNA不含具有序列號l所示鹼基序列中的鹼基編號2386262位~2395471位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。37.權利要求23~36中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DM不含yhdJ基因、yhdU基因、envR基因、acrE基因、envD基因、yhdV基因、yhdW基因、yhdX基因以及yhdY基因、或者與它們同源的基因。38.權利要求23~37中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號3411160位~3420878位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。39.權利要求23~38中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含chpA基因、或者它的同源的基因。40.權利要求23~39中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號2910274位~2910573位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的DNA。41.權利要求23~40中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA，所述染色體DNA不含fhuA基因、fhuC基因、fhuD基因以及fhuB基因、或者與它們同源的基因。42.權利要求23~41中任一項所述的大腸桿菌突變體，其具有下述染色體DNA,所述染色體DNA不含具有序列號1所示鹼基序列中的鹼基編號167065位~172979位所示的鹼基序列的DNA、或者與該DNA相當的腿。43.權利要求1~42中任一項所述的大腸桿菌突變體，其是通過選自下述[l]~[5]的方法加以改變得到的[1]緩和或者解除至少一個控制有用物質的生物合成的機制的方法；[2]強化表達至少一種參與有用物質的生物合成的酶的方法；[3]使至少一種參與有用物質的生物合成的酶的基因的拷貝數增力口的方法；[4]弱化或者阻斷至少一個從有用物質的生物合成途徑向該有用物質以外的代謝產物分支的代謝途徑的方法；[5]選擇相比野生型大腸桿菌而言，對有用物質的類似物耐受性高的細l包林的方法。44.權利要求1~43中任一項所述的大腸桿菌突變體，其中大腸桿菌是大腸桿菌K-12林、大腸桿菌B林或者大腸桿菌W林。45.權利要求44所述的大腸桿菌突變體，其中大腸桿菌K-12林是大腸桿菌W3110林(ATCC27325)或者大腸桿菌MG1655抹(ATCC47076)。46.有用物質的製備方法，其特徵在於，將權利要求145中任一項所述的大腸桿菌突變體在培養基中培養，在培養物中生成、蓄積有用物質，從該培養物回收該有用物質。47.權利要求43~46中任一項所述的製備方法，其中有用物質選自蛋白質、肽、胺基酸、核酸、維生素、糖、有機酸以及脂類。全文摘要根據本發明，能夠提供具有比野生型大腸桿菌的染色體DNA短470kbp以上的染色體DNA的大腸桿菌突變體，該大腸桿菌突變體在經過一定時間的培養後，菌體數比野生型株多，據此通過將該突變體在培養基中進行培養，使之在培養物中生成、蓄積有用物質，能夠很有效率地製備有用物質，例如蛋白質、肽、胺基酸、核酸、維生素、糖、有機酸以及脂類等。文檔編號C12P19/30GK101115832SQ20058004709公開日2008年1月30日申請日期2005年11月25日優先權日2004年11月26日發明者原清敬,森英郎,溝口寬申請人:協和發酵工業株式會社