一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚mstn幹涉載體及其構建方法
2023-10-09 07:22:44 1
一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚mstn幹涉載體及其構建方法
【專利摘要】一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚MSTN幹涉載體及其構建方法,它涉及一種基於鯉魚MSTN幹涉載體及其構建方法。本發明要解決傳統基因敲出技術的投入大,群體大,耗時的問題。轉基因供體質粒鯉魚MSTN幹涉載體(pzu6p-siMSTN),包括魚類啟動子DNA序列和目的基因。該方法通過將真核表達載體PEGFP-C1的啟動子進行改造,得到斑馬魚U6啟動子的質粒pzu6p-siRNA,然後將幹涉片段siMSTN與載體相連接,得到供體基因pzu6p-siMSTN(鯉魚MSTN幹涉載體)。本發明與傳統的基因敲出技術相比,具有操作簡單,投入少,效率高、特異性強、周期短等優點。
【專利說明】一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚MSTN幹涉載體 及其構建方法
【技術領域】
[0001] 本發明涉及一種基於鯉魚MSTN幹涉載體及其構建方法,具體涉及的轉基因供體 質粒的構建方法,及其在養殖魚類中的應用。本發明屬於魚類基因工程領域。
【背景技術】
[0002] 隨著基因組研究的不斷深入和發展,越來越多的新基因得以成功克隆,對於從基 因組測序中所獲得的大量未知基因功能的研究顯得日益重要,這也是後基因組時代基因功 能研究的重要研究內容,也是一項複雜的系統工程。RNA幹擾技術是近些年發展起來的一種 阻抑基因表達的新方法,是反映基因功能、表達調控、缺陷識別等重要手段。是通過人為地 引入與靶基因具有同源序列的dsRNA,誘導靶基因的mRNA降解,從而達到阻止基因表達、產 生"功能失活"的目的。因此,RNA幹擾技術已成為一種強有力的工具,廣泛應用於魚類基因 功能研究中。
[0003] MSTN(肌肉生長抑制素)基因是動物肌肉生長發育的負調控基因,對myostatin基 因敲除或抑制其表達,都可以使動物的肌肉快速大量增長。動物肌肉發育不僅依靠激素調 節,而且某些組織特異性效應因子也影響肌肉的發育。肌肉生長抑制素是目前所知的最強 的肌肉生長抑制因子,它通過抑制成肌細胞的增值而發揮作用。抑制myostatin活性,使肌 纖維肥大,而肌肉是由肌纖維組成的,肌纖維就是肌細胞,肌纖維增大,肌纖維的直徑和面 積大,肌纖維數量多,肌肉生長快,就會使肌肉不受限制的生長,達到改變魚類肌肉質量和 重量的目的。在魚類育種中,雖然分子輔助育種技術和基因敲出技術(反義核苷酸技術、基 因打靶技術等)等較傳統的數量遺傳育種都有較多的優點,但研究過程中投入大,群體大, 耗時、效率低等缺點也是有待解決的問題。RNA幹擾技術已成為解決這些問題的重要手段。 與其它方法相比,RNA幹擾技術在基因功能研究上具有簡單易行、試驗周期短、成本低、可進 行高通量基因功能分析及具有高度特異性等許多優點。為了解除MSTN基因對肌肉細胞的 抑制作用,本發明利用RNA幹擾技術幹擾MSTN mRNA的表達,來提高魚類養殖品種肌肉含 量,改善肉質性狀,促進魚類養殖品種的生長。
[0004] 隨著鯉魚基因組測序工作完成,與先進的高通量、高靈敏度的轉錄組測序技術相 結合,將有望成為探索魚類特定基因的功能、疾病致病機理及其防治的新途徑。RNA幹擾技 術能達到基因敲出的結果,從而成為研究這些基因功能的良好工具。目前廣泛應用的RNAi 技術的靶標是mRNA,誘導內源靶基因的mRNA降解,達到阻止基因表達的目的,與傳統的基 因敲出的費時費力相比較,RNA幹擾技術是一種有效的研究工具,同時RNA幹擾本身具有高 效、特異和傳遞性,它不僅可以抑制外培養細胞中目的單一基因的表達,也可以抑制體內目 的單一基因的表達。但是目前沒有報導將此技術應用於鯉魚的肉質性狀改善方面。
【發明內容】
[0005] 本發明的目的是為了解決傳統基因敲出技術的投入大,群體大,耗時的問題,而提 供了一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚MSTN幹涉載體及其構建方法。
[0006] 本發明的一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚MSTN幹涉載體,它包括骨架 載體和siMSTN幹涉片段,所述的siMSTN幹涉片段的核苷酸序列如序列表Seq ID No :1所 /_J、1 ο
[0007] 本發明的一種採用魚類轉基因方法構建基於鯉魚MSTN幹涉載體的方法,它是按 照以下步驟進行的:
[0008] 一、pzu6p_siRNA重組載體的構建
[0009] (1)提取斑馬魚尾鰭中的DNA ;
[0010] (2)根據斑馬魚U6啟動子區域設計引物U6-1、U6-2和U6-3,然後以U6-1的上遊 引物和U6-2下遊引物為引物,以步驟一提取的DNA為模板,通過PCR,得到兩端分別為asel 與bamhl酶切位點的U6啟動子片段;其中,U6-1含有asel酶切位點,U6-2含有含有bamh-1 酶切位點,U6-3含有含有mlul酶切位點;
[0011] 其中,U6-1的序列:
[0012] 上遊引物 5' GTCACAGAACTCATCCAATCACA3'
[0013] 下遊引物 5' AACCTCTTCAGGGCAAACC3',
[0014] U6-2 的序列:
[0015] 上遊引物 5' CACAGAACTCATCCAATCACACT3'
[0016] 下遊引物 5' CTTATTCAACTCATTTACCTCAAACA3',
[0017] U6-3 的序列:
[0018] 上遊引物 5' CGAGAGTCTGTGAATGTTTCG3'
[0019] 下遊引物 5'CCAGCAGITTTGTGGAGGT3' ;
[0020] (3)以步驟⑵得到的U6啟動子片段為模板,採用U6-1的上遊引物和U6-3的下 遊引物為引物,進行PCR,得到5 '端含有asel酶切位點、3'端含有bamhl和mlul酶切位點 的斑馬魚U6啟動子片段;
[0021] (4)用限制性內切酶asel和mlul雙酶切PEGFP-C1載體,並用限制性內切酶asel 和mlul雙酶切步驟(3)獲得的斑馬魚U6啟動子片段,同過T4連接酶,將酶切後的PEGFP-C1 載體與酶切後的斑馬魚U6啟動子片段進行連接,得連接產物;
[0022] (5)將步驟(4)得到的連接產物轉化至toplO感受態細胞中,培養,挑取陽性克隆 菌落,進行PCR驗證,篩選出驗證為陽性的菌落,提取質粒,採用asel和mlul酶進行雙酶切 驗證,將驗證為陽性的片段,進行測序,測序成功後的載體,即為pzu6p-siRNA重組載體;
[0023] 二、pzu6p_siMSTN重組載體的構建
[0024] (6)依據鯉魚mstn基因的⑶S區,設計出MSTN幹涉片段,MSTN幹涉片段兩端帶有 bamhl和mlul酶切位點,將MSTN幹涉片段連接到puc57載體上,構建得到puc57-siRNA重 組載體;其中,含有頸環結構的MSTN幹涉片段的核苷酸序列如序列表Seq ID No :2所示;
[0025] (7)用限制性內切酶bamhl和mlul雙酶切分別酶切步驟一構建的pzu6p-siRNA 重組載體以及puc57-siRNA重組載體,然後將酶切後回收得到的MSTN幹涉片段與 pzu6p-siRNA重組載體採用T4連接酶連接;
[0026] (8)將上一步採用T4連接酶連接後的重組載體轉化至toplO感受態細胞中,挑取 陽性克隆,進行菌液PCR鑑定,提取陽性克隆菌的質粒,進行bamhl和mlul雙酶切鑑定,將 鑑定結果均為陽性的載體,命名為pzu6p-siMSTN重組載體,即完成基於鯉魚MSTN幹涉載體 載體的構建。
[0027] 本發明包含以下有益效果:
[0028] 本發明根據鯉魚肌肉生長抑制素 myostation基因的RNA序列設計1個針對 myostation基因的siRNA序列:5'-CGCACCGCCTTTGCAACAA-3',將其設計為中間連有9個鹼 基loop環結構:5' -TTCAAGAGA-3'的發卡DNA序列,並在序列兩端加入BamHl和Mlul酶切 位點,連入PEGFP-C1載體的斑馬魚U6啟動子後,構建鯉魚MSTN幹涉載體(pzu6p-siMSTN)。 用人工合成的鯉魚MSTN幹涉載體通過顯微注射技術將pzu6p-siMSTN基因導入野鯉受精卵 內,分析其生長發育結果。因此本發明旨在構建一種基於鯉魚MSTN幹涉載體的魚類轉基因 方法。藉助於RNA幹擾技術,採用通過抑制MSTN活性,提高養殖魚類的肌肉含量,促進養殖 魚類的生長。也進一步證實了轉RNA幹擾質粒技術是可行的育種技術之一。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0029] 圖1為鯉魚mstn幹涉片段序列圖;
[0030] 圖2為鯉魚MSTN幹涉載體pzu6p_siMSTN圖;
[0031] 圖3為轉鯉MSTN基因幹涉載體基因鯉PCR檢測結果;其中,D為正常魚電泳圖;G 為供體基因電泳圖;Μ為分子量;1-39為轉基因鯉實驗魚電泳圖;
[0032] 圖4、轉鯉MSTN基因幹涉載體基因鯉產物凝膠測序結果。
【具體實施方式】
【具體實施方式】 [0033] 一:本實施方式的一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚MSTN 幹涉載體,它包括骨架載體和siMSTN幹涉片段,所述的siMSTN幹涉片段的核苷酸序列如序 列表Seq ID No :1所示(大小為470bp)。
【具體實施方式】 [0034] 二:本實施方式與一的不同是:所述的siMSTN幹涉片 段是由MSTN幹涉片段通過其兩端的bamh-1和mlul酶切位點分別與斑馬魚U6啟動子和骨 架載體連接而成的;其中,斑馬魚U6啟動子的核苷酸序列如序列表Seq ID No :2所示(大 小為400bp) ;MSTN幹涉片段的核苷酸序列如序列表Seq ID N〇:3所示(大小為70bp)。其 它與一相同。
【具體實施方式】 [0035] 三:本實施方式與一或二的不同是:所述的MSTN幹涉 片段為中間連有5'-TTCAAGAGA-3'鹼基的發卡DNA序列,並在MSTN幹涉片段序列兩端加入 bamh-1和mlul酶切位點。其它與一或二相同。
【具體實施方式】 [0036] 四:本實施方式與一至三之一的不同是:所述的骨架 載體為pzu6p載體。其它與一至三之一相同。
【具體實施方式】 [0037] 五:本實施方式的一種採用魚類轉基因方法構建基於鯉魚MSTN幹 涉載體的方法,其特徵在於它是按照以下步驟進行的:
[0038] 一、pzu6p_siRNA重組載體的構建
[0039] (1)提取斑馬魚尾鰭中的DNA ;
[0040] (2)根據斑馬魚U6啟動子區域設計引物U6-1、U6-2和U6-3,然後以U6-1的上遊 引物和U6-2下遊引物為引物,以步驟一提取的DNA為模板,通過PCR,得到兩端分別為asel 與bamhl酶切位點的U6啟動子片段;其中,U6-1含有asel酶切位點,U6-2含有含有bamh-1 酶切位點,U6-3含有含有mlul酶切位點;
[0041] 其中,U6_1的序列:
[0042] 上遊引物 5' GTCACAGAACTCATCCAATCACA3'
[0043] 下遊引物 5' AACCTCTTCAGGGCAAACC3',
[0044] U6-2 的序列:
[0045] 上遊引物 5' CACAGAACTCATCCAATCACACT3'
[0046] 下遊引物 5, CTTATTCAACTCATTTACCTCAAACA3,,
[0047] U6-3 的序列:
[0048] 上遊引物 5' CGAGAGTCTGTGAATGTTTCG3'
[0049] 下遊引物 5'CCAGCAGITTTGTGGAGGT3' ;
[0050] (3)以步驟⑵得到的U6啟動子片段為模板,採用U6-1的上遊引物和U6-3的下 遊引物為引物,進行PCR,得到5 '端含有asel酶切位點、3'端含有bamhl和mlul酶切位點 的斑馬魚U6啟動子片段;
[0051] (4)用限制性內切酶asel和mlul雙酶切PEGFP-C1載體,並用限制性內切酶asel 和mlul雙酶切步驟(3)獲得的斑馬魚U6啟動子片段,同過T4連接酶,將酶切後的PEGFP-C1 載體與酶切後的斑馬魚U6啟動子片段進行連接,得連接產物;
[0052] (5)將步驟(4)得到的連接產物轉化至toplO感受態細胞中,培養,挑取陽性克隆 菌落,進行PCR驗證,篩選出驗證為陽性的菌落,提取質粒,採用asel和mlul酶進行雙酶切 驗證,將驗證為陽性的片段,進行測序,測序成功後的載體,即為pzu6p-siRNA重組載體;
[0053] 二、pzu6p-siMSTN重組載體的構建
[0054] (6)依據鯉魚mstn基因的⑶S區,設計出MSTN幹涉片段,MSTN幹涉片段兩端帶有 bamhl和mlul酶切位點,將MSTN幹涉片段連接到puc57載體上,構建得到puc57-siRNA重 組載體;其中,含有頸環結構的MSTN幹涉片段的核苷酸序列如序列表Seq ID No :2所示;
[0055] (7)用限制性內切酶bamhl和mlul雙酶切分別酶切步驟一構建的pzu6p-siRNA 重組載體以及puc57-siRNA重組載體,然後將酶切後回收得到的MSTN幹涉片段與 pzu6p-siRNA重組載體採用T4連接酶連接;
[0056] (8)將上一步採用T4連接酶連接後的重組載體轉化至toplO感受態細胞中,挑取 陽性克隆,進行菌液PCR鑑定,提取陽性克隆菌的質粒,進行bamhl和mlul雙酶切鑑定,將 鑑定結果均為陽性的載體,命名為pzu6p-siMSTN重組載體,即完成基於鯉魚MSTN幹涉載體 載體的構建。
【具體實施方式】 [0057] 六:本實施方式與五不同的是:步驟(2)和(3)中所 述的?〇?反應程序為:941:預變性1〇1^11,941:變性3〇8,551:退火3〇8,721:延伸3〇8,30個 循環;循環後72°C延伸10min ;
[0058] PCR反應體系為25 μ L,成分如下:
[0059] 成分 川.Μ: 30?50ng/uL DNΑ 概板 I pL 10pmol4iL 引物 2pL 10XPCR buffer (10XPCR buffer ( fi Mg2' (25mmol/L) 18{iL ΙμΙ、dATP、dGTP、dTTP、dCTP 各 2mmol/L ) TaqDNA 聚爐 0.5pL 無眞水 4.5pL
[0060] 其它與【具體實施方式】五相同。
【具體實施方式】 [0061] 七:本實施方式與五或六不同的是:步驟(4)中限制 性內切酶asel和mlul雙酶切的酶切反應條件為:37°C水浴酶切2小時,4°C保存備用;
[0062] 酶切體系為10 μ L,成分如下:
[0063] 戚分 用S 56ng/uL PEGFP-C1 載體 3,6pL asel 0,5 μ L mlul LOpL K) X Buffer LOpL dd H20 4,4μΕ〇
[0064] 其它與【具體實施方式】五或六相同。
【具體實施方式】 [0065] 八:本實施方式與五至七之一不同的是:步驟(4)中 的連接條件為:16°C循環水浴連接16h ;
[0066] 連接體系為10 μ L,成分如下:
[0067] 成分 PEGFP-C1 載體 LOpL 斑馬魚U6啟動子片段 3.0pL T4 DNA m l'0pL 2xT4 Ligase Buffer 5.0μ?〇
[0068] 其它與【具體實施方式】五至七之一相同。
【具體實施方式】 [0069] 九:本實施方式與五至八之一不同的是:步驟(7)中 的限制性內切酶bamhl和mlul雙酶切的酶切反應條件為:37°C水浴酶切2小時,4°C保存備 用;
[0070] 酶切體系為10 μ L,成分如下:
[0071] 成分 )IJM: 54ng/uL ρζιι?ιρ-siRNA 我體 40pL bamh l 0.5μ? mini 1.0μ L 10X Buffer \Α)μΙ dd H2O 4.0pL〇
[0072] 其它與【具體實施方式】五至八之一相同。
【具體實施方式】 [0073] 十:本實施方式與五至九之一不同的是:步驟(8)的 PCR鑑定的PCR反應程序為:94°C預變性lOmin,94°C變性30s,55°C退火30s,72°C延伸30s, 38個循環;循環後72°C延伸lOmin ;
[0074] PCR反應體系為25 μ L,成分如下:
[0075] 成分 30?50ng/uL DNA 校板 IpL lOpmol/pL *J| 物 2pL 10 X PCR bufTcr ( !0 X PCR buffer (Mg21 (25mnioi/L) 18pL ?L、dATP、dGW、dTW、dCTP 各 2nimol/L ) TaqDNA 聚介_ 0.5μΙ AiW 水 4.5pL;
[0076] 其中,PCR所用的引物為siMSTN幹涉片段引物,其序列為:
[0077] 上遊引物:5' -CTGCGATTAATTCTTTAGCCTCCGAGAG-3'
[0078] 下遊引物:5 ' -GCAAAGGCGGTGCGGGAT-3 '。
[0079] 其它與【具體實施方式】五至九之一相同。
【具體實施方式】 [0080] i^一 :本實施方式與五至十之一不同的是:所述的 pzu6p-siMSTN重組載體中的siMSTN幹涉片段的核苷酸序列如序列表Seq ID No :1所示。 其它與五至十之一相同。
[0081]
【具體實施方式】十二:本實施方式與【具體實施方式】五至i^一之一不同的是:所述的 siMSTN幹涉片段是由MSTN幹涉片段通過其兩端的bamh-l和mlul酶切位點分別與斑馬魚 U6啟動子和骨架載體連接而成的;其中,斑馬魚U6啟動子的核苷酸序列如序列表Seq ID No :2所示;MSTN幹涉片段的核苷酸序列如序列表Seq ID No :3所示。其它與具體實施方 式五至i 之一相同。
[0082]
【具體實施方式】十三:本實施方式與【具體實施方式】五至十二之一不同的是:所述的 MSTN幹涉片段為中間連有5' -TTCAAGAGA-3'鹼基的發卡DNA序列,並在MSTN幹涉片段序 列兩端加入bamh-l和mlul酶切位點。其它與【具體實施方式】五至十二之一相同。
[0083] 通過以下實施例驗證本發明的有益效果:
[0084] 本實施例首先進行生物信息統計,針對物種的基因組進行RNA序列設計;然後根 據設計結果構建表達載體庫;本實施例選取能夠進行改造的的載體,最終選用了真核表達 載體 PEGFP-C1,長度 4. 7kb ;
[0085] 本實施例的一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚MSTN幹涉載體的方法,具 體操作步驟如下:
[0086] (l)pzu6p_siRNA重組載體的構建
[0087] 一、獲取斑馬魚U6啟動子,GenBank:FJ911603. 1,長度大小為414bp,用裂解法提 取斑馬魚尾鰭中的DNA,根據U6的啟動子區域設計3條引物,分別命名U6-1U6-2U6-3,其中 通過U6-1中(含有asel酶切位點)與U6-2中(含有bamh-1酶切位點)從基因組DNA上 克隆U6啟動子區域,斑馬魚U6啟動子兩端分別是asel與bamhl酶切位點;
[0088] 其中,U6-1的序列:
[0089] 上遊引物 5' GTCACAGAACTCATCCAATCACA3'
[0090] 下遊引物 5' AACCTCTTCAGGGCAAACC3',
[0091] U6-2 的序列:
[0092] 上遊引物 5' CACAGAACTCATCCAATCACACT3'
[0093] 下遊引物 5' CTTATTCAACTCATTTACCTCAAACA3',
[0094] U6-3 的序列:
[0095] 上遊引物 5' CGAGAGTCTGTGAATGTTTCG3'
[0096] 下遊引物 5'CCAGCAGITTTGTGGAGGT3' ;
[0097] PCR 反應程序為:94°C預變性 10min,94°C變性 30s,55°C退火 30s,72°C延伸 30s, 30個循環;循環後72°C延伸lOmin ;
[0098] PCR反應體系為25 μ L,成分如下:
[0099] 成分 IIJW 30?50ng/uL DNA 模板 .1 μι 10pmo〖4iL *j|物(U6-i 的 I:遊和 U6-2 的 K遊*j|物) 2pL lOXPCRlmffer (含 Mg2+-(25mmol/L》IjiL、dATP、dGTP、 18μ? dTTP, dCTP2 mmol/L ) TaqDNA 聚介Hi OJpL 無窗水 4·5μ[;
[0100] 二、以步驟一得到的U6啟動子片段為模板,採用U6-1和U6-3為引物,進行二次 PCR,得到5 '端含有asel酶切位點、3'端含有bamhl和mlul酶切位點的斑馬魚U6啟動子 片段;
[0101] PCR 反應程序為:94°C預變性 10min,94°C變性 30s,55°C退火 30s,72°C延伸 30s, 30個循環;循環後72°C延伸lOmin ;
[0102] PCR反應體系為25 μ L,成分如下:
[0103] 成分
[0104] 30......M')ng/uLDN..\ 模板 Ιμ? 10pmol~L引物(U6-1的上遊和U6-3的下遊引物) 2μ[ 10 X PCR buffer ( 10 X PCR bufFer ( -- Mg2' (25mmol/L) 1 Kj! i. lpL、dATP、dGTP、dTTP、dCTP 各 2mmol/L ) TaqDNA 聚浦 0.5μ? 尤菌水 4.5 μ?;
[0105] 三、用限制性內切酶asel和mlul雙酶切PEGFP-C1載體,切除質粒上的CMV啟動 子、egfp表達區域和sv40終止子後,獲得3100bp的框架結構;並用限制性內切酶asel和 mlul雙酶切上一步得到的5 '端asel酶切位點,3'端bamhl和mlul酶切位點的斑馬魚U6 啟動子片段;獲得帶有asel和mlul粘性末端的啟動子片段;通過T4DNA連接酶連接,得連 接產物;其中,限制性內切酶asel和mlul雙酶切的酶切反應條件為:37°C水浴酶切2小時, 4 °C保存備用;
[0106] 酶切體系為10 μ L,成分如下:
[0107] 成分 用W: 56ng/uL PEGFP-C1 栽休 3.6μΙ asel O.SjtL mlul Ι.ΟμΙ 10 X Buffer Ι.Ομ? dd H2O 4A\ihi
[0108] 連接條件為:16°C循環水浴連接16h ;
[0109] 連接體系為10 μ L,成分如下:
[0110] 成分 丨 PEGFP-C1 鈸體 1.0μΙ_ 斑.*§儀U6 )ι!動段 3.0μ? Τ4 DNA 酶 1,0 μ? 2xT4 Ligasc Buffer 5.0μ?;
[0111] 四、將上一步的連接產物轉化進toplO感受態細胞中,鋪板;挑取4個克隆菌液 PCR鑑定(圖3),片段大小正確,為400bp ;然後提取質粒,分別用asel和mlul雙酶切,asel 和bamhl雙酶切鑑定,經鑑定酶切片段大小正確;酶切條件和體系同上;
[0112] 其中,PCR驗證的PCR反應程序為:94°C預變性10min,94°C變性30s,55°C退火 30s,72°C延伸30s,30個循環;循環後72°C延伸lOmin ;
[0113] PCR反應體系為25 μ L,成分如下:
[0114] 成分 用量 30?50ng/uL DNA 模扳 l|iL 10pmol/pL弓丨物(U6-1的上遊和1)6-3的下遊引物) 2μΙ 10 X PCR buffer ( 10 X PCR buffer (含 Mg:i (25mmol/L) 18μ? lpL, dATP, dGTP, dTTP, dCTP ^ 2 mmoi/L ) TaqDNA 聚屬 0J|iL 11 丨W 水 4.5pL:
[0115] (2) pzu6p_siMSTN重組載體的構建
[0116] 五、siRNA是作用在基因的⑶S區從而抑制基因的轉錄後翻譯過程,因此設計 siRNA幹涉片段需要從基因的⑶S區上尋找幹涉片段,因此在鯉魚mstn基因的⑶S區 (GenBank:GQ214770. 1)上通過金斯瑞公司的設計軟體設計了一條含有頸環結構的MSTN幹 涉片段長度為70bp,MSTN幹涉片段的核苷酸序列如序列表Seq ID N〇:2所示;其含有bamhl 和mlul酶切位點;公司合成的MSTN幹涉片段是構建在puc57載體上,命名為puc57-siRNA 重組載體;
[0117] 六、用限制性內切酶bamhl和mlul雙酶切步驟五已經構建好pzu6p_siRNA重組 載體,將pzu6p-siRNA重組載體中切出了 bamhl和mlul的粘性末端,同樣通過限制性內切 酶bamhl和mlul雙酶切puc57-siRNA重組載體,得到MSTN幹涉片段;將MSTN幹涉片段與 pzu6p-siRNA用T4連接酶連接;其中,限制性內切酶asel和mlul雙酶切的酶切體系和酶 切條件同上;連接體系和條件同上;
[0118] 七、將上一步T4連接酶連接的產物轉化進toplO感受態細胞中,挑取克隆菌落,以 siMSTN幹涉片段引物,進行菌液PCR,PCR鑑定為400bp,即為siMSTN幹涉片段;表明已成 功將siMSTN幹涉片段連接到pzu6p載體上;對PCR驗證陽性的菌液提取質粒,進行酶切鑑 定,鑑定結果正確,表明構建成功,命名為pzu6p-siMSTN重組載體;
[0119] 其中,PCR驗證的PCR反應程序為:94°C預變性10min,94°C變性30s,55°C退火 30s,72°C延伸30s,38個循環;循環後72°C延伸lOmin ;
[0120] PCR反應體系為25 μ L,成分如下:
[0121] 成分 川 30 ?50ng/uL DNA 棋板 1 μ?
[0122] lOpmol/.uL *J|物(siMSTN Γ-涉片段…物.) 2μΙ 10 X PCR buffer ( 10 X PCR buffer ( ',t Mg2* (25mmol/L) Ιμ?、dATP、dGTP、dTTP、dCTP 各 2mmol/L ) TaqDNA 聚介_ 0.5μ? iilW水 4.5μΙ_:
[0123] 其中,siMSTN幹涉片段引物的序列為:
[0124] 上遊引物:5 ' -CTGCGATTAATTCTTTAGCCTCCGAGAG-3 '
[0125] 下遊引物:5 ' -GCAAAGGCGGTGCGGGAT-3 '。
[0126] 本實施例的siMSTN幹涉片段是將siRNA幹涉片段與U6啟動子片段連接後形成 的。
[0127] 本實施例通過鯉魚myostatin基因序列,構建了 RNA幹擾質粒載體,為了確定鯉魚 的myostatin雙鏈RNA是否能夠刺激鯉魚的生長,將用人工合成的轉蛋白抑素(Myostatin) RNAi質粒(pZU6p-siMSTN重組載體)通過顯微注射技術導入鯉魚受精卵核區附近,獲得當 年轉基因鯉魚。
[0128] 結果顯示,共導入野鯉受精卵1208粒。受精卵於23°C孵化培育,72h後孵化出膜, 獲得實驗魚548尾,出苗率為45. 36% ;
[0129] 對獲得的實驗魚經PCR和分子雜交檢測,結果表明,PCR檢測後,通過凝膠電泳檢 測結果顯示片段大小在400bp,表明外源基因進入了部分受體魚的基因組內;其中,PCR檢 測的引物為siMSTN幹涉片段引物;在所測定的40尾實驗魚中,有13?16尾顯示出明確的 雜交帶,陽性率為32. 5?40%,表明均有良好的擴增結果;
[0130] 將上步凝膠檢測後的片段回收(Biospin膠回收試劑盒),進行測序,通過測序結 果,進一步確定了供體基因在受體魚中的正確性;
[0131] 經一齡魚的生長實驗表明,轉基因鯉比普通鯉平均體重重49. 6 %,其體高和體厚 分別平均增長18 %和20%。
[0132] 本
【發明內容】
不僅限於上述各實施方式的內容,其中一個或幾個【具體實施方式】的組 合同樣也可以實現發明的目的。
【權利要求】
1. 一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚MSTN幹涉載體,其特徵在於它包括骨架 載體和siMSTN幹涉片段,所述的siMSTN幹涉片段的核苷酸序列如序列表Seq ID No :1所 /Jn 〇
2. 根據權利要求1所述的一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚MSTN幹涉載體,其 特徵在於所述的siMSTN幹涉片段是由MSTN幹涉片段通過其兩端的bamh-1和mlul酶切位 點分別與斑馬魚U6啟動子和骨架載體連接而成的;其中,斑馬魚U6啟動子的核苷酸序列如 序列表Seq ID No :2所不;MSTN幹涉片段的核昔酸序列如序列表Seq ID No :3所不。
3. 根據權利要求1所述的一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚MSTN幹涉載體, 其特徵在於所述的MSTN幹涉片段為中間連有5'-TTCAAGAGA-3'鹼基的發卡DNA序列,並在 MSTN幹涉片段序列兩端加入bamh-1和mlul酶切位點。
4. 根據權利要求1所述的一種採用魚類轉基因方法構建的基於鯉魚MSTN幹涉載體,其 特徵在於所述的骨架載體為pzu6p載體。
5. -種採用魚類轉基因方法構建基於鯉魚MSTN幹涉載體的方法,其特徵在於它是按 照以下步驟進行的: 一、 pzu6p-siRNA重組載體的構建 (1) 提取斑馬魚尾鰭中的DNA ; (2) 根據斑馬魚U6啟動子區域設計引物U6-1、U6-2和U6-3,然後以U6-1的上遊引物 和U6-2下遊引物為引物,以步驟一提取的DNA為模板,通過PCR,得到兩端分別為asel與 bamhl酶切位點的U6啟動子片段;其中,U6-1含有asel酶切位點,U6-2含有含有bamh-1 酶切位點,U6-3含有含有mlul酶切位點; 其中,U6-1的序列: 上遊引物 5' GTCACAGAACTCATCCAATCACA3' 下遊引物 5' AACCTCTTCAGGGCAAACC3', U6-2的序列: 上遊引物 5' CACAGAACTCATCCAATCACACT3' 下遊引物 5' CTTATTCAACTCATTTACCTCAAACA3', U6-3的序列: 上遊引物 5' CGAGAGTCTGTGAATGTTTCG3' 下遊引物 5' CCAGCAGITTTGTGGAGGT3' ; (3) 以步驟(2)得到的U6啟動子片段為模板,採用U6-1的上遊引物和U6-3的下遊引 物為引物,進行PCR,得到5 '端含有asel酶切位點、3'端含有bamhl和mlul酶切位點的斑 馬魚U6啟動子片段; ⑷用限制性內切酶asel和mlul雙酶切PEGFP-Cl載體,並用限制性內切酶asel和 mlul雙酶切步驟(3)獲得的斑馬魚U6啟動子片段,同過T4連接酶,將酶切後的PEGFP-Cl 載體與酶切後的斑馬魚U6啟動子片段進行連接,得連接產物; (5)將步驟(4)得到的連接產物轉化至toplO感受態細胞中,培養,挑取陽性克隆菌落, 進行PCR驗證,篩選出驗證為陽性的菌落,提取質粒,採用asel和mlul酶進行雙酶切驗證, 將驗證為陽性的片段,進行測序,測序成功後的載體,即為pzu6p-siRNA重組載體; 二、 pzu6p_siMSTN重組載體的構建 (6) 依據鯉魚mstn基因的⑶S區,設計出MSTN幹涉片段,MSTN幹涉片段兩端帶有bamhl 和mlul酶切位點,將MSTN幹涉片段連接到puc57載體上,構建得到puc57-siRNA重組載體; 其中,含有頸環結構的MSTN幹涉片段的核苷酸序列如序列表Seq ID No :2所示; (7) 用限制性內切酶bamhl和mlul雙酶切分別酶切步驟一構建的pzu6p-siRNA重組 載體以及puc57-siRNA重組載體,然後將酶切後回收得到的MSTN幹涉片段與pzu6p-siRNA 重組載體採用T4連接酶連接; (8) 將上一步採用T4連接酶連接後的重組載體轉化至toplO感受態細胞中,挑取陽性 克隆,進行菌液PCR鑑定,提取陽性克隆菌的質粒,進行bamh 1和mlu 1雙酶切鑑定,將鑑定 結果均為陽性的載體,命名為pzu6p-siMSTN重組載體,即完成基於鯉魚MSTN幹涉載體載體 的構建。
6. 根據權利要求5所述的一種採用魚類轉基因方法構建基於鯉魚MSTN幹涉載體的方 法,其特徵在於步驟(2)和(3)中所述的PCR反應程序為:94°C預變性10min,94°C變性30s, 55°C退火30s,72°C延伸30s,30個循環;循環後72°C延伸IOmin ; PCR反應體系為25 μ L,成分如下:
7. 根據權利要求5所述的一種採用魚類轉基因方法構建基於鯉魚MSTN幹涉載體的方 法,其特徵在於步驟(4)中限制性內切酶asel和mlul雙酶切的酶切反應條件為:37°C水浴 酶切2小時,4°C保存備用; 酶切體系為10 μ L,成分如下:
8. 根據權利要求5所述的一種採用魚類轉基因方法構建基於鯉魚MSTN幹涉載體的方 法,其特徵在於步驟(4)中的連接條件為:16°C循環水浴連接16h ; 連接體系為lOuL,成分如下:
9. 根據權利要求5所述的一種採用魚類轉基因方法構建基於鯉魚MSTN幹涉載體的方 法,其特徵在於步驟(7)中的限制性內切酶bamhl和mlul雙酶切的酶切反應條件為:37°C 水浴酶切2小時,4°C保存備用; 酶切體系為10 μ L,成分如下:
10. 根據權利要求5所述的一種採用魚類轉基因方法構建基於鯉魚MSTN幹涉載體的方 法,其特徵在於步驟(8)的PCR鑑定的PCR反應程序為:94°C預變性10min,94°C變性30s, 55°C退火30s,72°C延伸30s,38個循環;循環後72°C延伸IOmin ; PCR反應體系為25 μ L,成分如下:
其中,PCR所用的引物為siMSTN幹涉片段引物,其序列為: 上遊引物:5 ' -CTGCGATTAATTCTTTAGCCTCCGAGAG-3 ' 下遊引物:5' -GCAAAGGCGGTGCGGGAT-3'。
【文檔編號】C12N15/63GK104232670SQ201410421731
【公開日】2014年12月24日 申請日期:2014年8月25日 優先權日:2014年8月25日
【發明者】閆學春, 曹頂臣, 何立川 申請人:中國水產科學研究院黑龍江水產研究所