新四季網

新穎全譜抗登革抗體的製作方法

2023-10-31 00:59:02 1

本申請案要求2014年2月11日提交的美國臨時專利申請案第61/938,605號的優先權;所述申請案的全部內容以引用的方式併入本文中。序列表本說明書提及序列表(在2014年2月11日以電子形式作為命名為「SequenceListing.txt」的.txt文檔提交)。所述.txt文檔是在2014年2月11日生成的且大小是19kb。序列表的全部內容以引用的方式併入本文中。
背景技術:
::登革病毒(Denguevirus,DV)是病毒科黃病毒科(Falviviridae)的成員並通過伊蚊屬(genusAedes)內的若干種蚊子(主要是埃及伊蚊(Aedesaegypti))傳播給人。全世界超過36億人處於被DV感染的風險中,並且全球每年發生估計超過2億DV感染(麥克布賴德(McBride)等人,2000微生物與感染(Microbes&Infection)2:1041-1050,古茲曼(Guzman)等人,2010自然評論·微生物學(NatureRev.Microbiol.)8:S7-16)。登革熱是人類最醫學相關的蟲媒病毒病。登革顯著增加的發病率、地域拓展和疾病病例的嚴重度使得DV成為主要的人類病原體。令人遺憾的是,目前無可用的有效治療方案;大部分有效的當前預防措施在於控制蚊子。技術實現要素:本發明提供用於治療和/或預防DV感染的方法和組合物。本發明尤其提供中和所有四種DV血清型的抗體藥劑。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑為參考抗體4E11的變異體;在一些所述實施例中,所提供的抗體藥劑具有展示出與4E11的胺基酸序列的較高總體序列一致性的胺基酸序列或其相關片段,但包括與4E11相比的特定序列變異。在一些實施例中,提供抗體藥劑,其與對4E11觀察到的相比在中和至少一種DV血清型方面展示出顯著改進。本發明提供以下見解:參考抗體4E11具有某些所需屬性,包括結合於所有四種DV血清型並且對四種DV血清型中的三種具有強力中和能力,但還缺乏有效中和第四種DV血清型的能力。本發明找到了4E11不能有效中和這第四種DV血清型的問題來源。具體來說,本發明定義了結構特徵修飾,與缺乏所述修飾的4E11的能力相比,所述修飾改進序列含有所述修飾的抗體藥劑中和相關DV血清型的能力。本發明因此定義並提供具有包括相關結構特徵修飾的結構(但可另外與4E11的結構基本上一致)並且特徵在於中和DV血清型4(DV4)的能力的抗體。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示中和其它三種DV血清型中的每一者的能力,所述能力與4E11的能力相比並未顯著降低。實際上,在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的特徵在於與在4E11下觀察到的相比對於其它三種DV血清型(DV1-4)中的一或多者的中和能力的驚人的提高。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑為參考抗體4E5A的變異體;在一些所述實施例中,所提供的抗體藥劑具有展示出與4E5A的胺基酸序列的較高總體序列一致性的胺基酸序列或其相關片段,但包括與4E5A相比的特定序列變異。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑與對4E5A觀察到的相比在中和至少一種DV血清型方面展示出顯著改進。本發明提供以下見解:參考抗體4E5A具有某些所需屬性,包括結合於所有四種DV血清型並且對所有四種DV血清型的顯著中和能力,但仍展示相對於DV4的低相對中和能力。舉例來說,本發明涵蓋以下認識:參考抗體4E5A展示相對於D4的KD,其為其對DV3的KD的幾乎五倍,且為其對DV1的KD的超過500倍。本發明鑑別出4E5A對此第四種DV血清型的低相對親和力的問題來源。具體來說,本發明定義了結構特徵修飾,與缺乏所述修飾的4E5A的能力相比,所述修飾改進序列含有所述修飾的抗體藥劑中和相關DV血清型的能力。本發明因此定義並提供具有包括相關結構特徵修飾的結構(但可另外與4E5A和/或4E11的結構基本上一致)並且特徵在於以下一或多者的抗體藥劑:(i)對DV1、DV2、DV3和DV4中的每一者低於約100nM的KD;(ii)大於1.25相對於4E5A對DV4的KD;(iii)不小於相對於4E5A對DV3的KD1.75倍的對DV4(相對於4E5A)的KD;(iv)為對DV3的KD至少2.1倍的對DV4的KD。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示中和其它三種DV血清型中的每一者的能力,所述能力與4E5A的能力相比並未顯著降低。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示中和其它三種DV血清型中的每一者的能力,所述能力與4E5A和4E11兩者的能力相比並未顯著降低。實際上,在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的特徵在於與在4E5A下觀察到的相比對於其它三種DV血清型(DV1-4)中的一或多者的中和能力的驚人的提高。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的特徵在於與在4E5A和4E11兩者下觀察到的相比相對於其它三種DV血清型(DV1-4)中的一或多者的中和能力的驚人的提高。本發明提供用於定義賦予多肽以所關注的生物活性的結構修飾同時維持保留其它活性所需的結構特徵的技術。在一些實施例中,本發明提供結合於DV表位的抗體藥劑以及含有其的組合物和設計、提供、調配、使用、鑑別和/或表徵其的方法。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示顯著結合於多種DV血清型。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示顯著結合於所有四種DV血清型。所提供的抗體藥劑例如適用於預防、治療、診斷和/或研究DV。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑與一或多種先前所述的參考抗DV抗體交叉競爭。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑結合於表位,所述表位為或包含以下各者內的胺基酸序列:SEQIDNO.17(EDIII-DV1)、SEQIDNO.18(EDIII-DV2)、SEQIDNO.19(EDIII-DV3)、SEQIDNO.20(EDIII-DV4)和/或其組合。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑不與一或多種具體先前所述的抗DV抗體顯著交叉競爭。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑與一或多種先前所述的參考抗DV抗體相比在所建立的模型系統中以相對於至少一種(例如相對於一種、兩種、三種或四種)DV血清型較高的效力中和DV。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑與一或多種先前所述的參考抗DV抗體相比在所建立的模型系統中以相對於所有四種DV血清型較高的效力中和DV。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑與一或多種參考抗DV抗體(例如4E11和/或4E5A)相比在所建立的模型系統中以相對效力的增加的可比較性中和DV。本發明尤其涵蓋以下認識:所提供的抗體藥劑與先前所述的抗DV抗體相比可提供更大的治療和/或預防益處。所提供的抗體藥劑適用於多種情形,包括例如治療、預防、診斷和/或研究應用。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑適用於治療慢性和/或急性DV感染,例如通過向罹患或易患所述感染的個體投與治療有效量的一或多種所提供的所述所提供的抗體藥劑來治療。在一些實施例中,治療有效量是足以實現一或多種具體生物作用的量,包括(但不限於)(i)在易患或罹患DV感染的個體中降低DV感染的一或多種症狀或特徵的嚴重度或頻率和/或延緩DV感染的一或多種症狀或特徵的發作或復發;和/或(ii)在暴露於DV感染或處於暴露於DV感染風險中的個體中降低感染和/或發展DV感染的一或多種症狀或特徵的風險。在一些實施例中,DV感染的一或多種症狀或特徵為或包含高熱和至少一或多種例如選自以下各者的其它症狀:重度頭痛;重度眼痛;關節疼痛;肌肉疼痛;骨痛;皮疹;輕度出血表現(例如鼻或牙齦出血、皮下血斑症、容易瘀傷);腹痛;嘔吐;黑色焦油狀糞便;嗜眠或易怒;皮膚蒼白、冷或溼冷;呼吸困難;白細胞計數低;個體或其一或多種組織(例如血液、骨髓)或器官(例如肝)中有循環病毒粒子。在一些實施例中,罹患DV感染的個體展示出高熱和至少兩種所述其它症狀。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑可用於預防DV感染的一或多種症狀或特徵、減少其復發和/或延緩其發作。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑可例如用於近期暴露於DV或處於暴露於DV風險中的個體、DV陽性母親產下的新生嬰兒和/或肝移植患者(例如預防所述患者可能的復發性DV感染)的被動免疫接種。在一些實施例中,本發明提供病毒模擬劑,其結構包括某些DV抗原的一或多種例如足以允許病毒模擬劑模擬相關DV抗原的一或多種生物活性的保守元件。在一些實施例中,所述病毒模擬劑包括例如本文所定義的DV抗原的所述保守結構元件,並缺乏所述DV抗原的一或多種其它結構元件。在一些實施例中,所提供的病毒模擬劑為或包含一或多種多肽。在一些實施例中,所提供的病毒模擬劑多肽具有包括來自DV抗原的一或多種保守序列元件的胺基酸序列;在一些實施例中,所提供的病毒模擬劑多肽缺乏來自所述DV抗原的一或多種其它序列元件。舉例來說,在一些實施例中,所提供的病毒模擬劑多肽為或包含DV抗原的片段。在一些實施例中,本發明提供治療的治療性方法,在出現DV感染的一或多種症狀之後使用。在一些實施例中,本發明提供預防的治療性方法,在出現DV感染的一或多種症狀之前和/或在暴露於DV、DV感染或其風險之前使用。在一些具體實施例中,本發明提供被動免疫接種技術。在一些實施例中,本發明提供在如臨床、環境和/或研究樣品的樣品中檢測DV和/或以其它方式表徵所述樣品的診斷方法。本發明提供用於設計、鑑別和/或表徵適用的抗DV抗體藥劑的系統。舉例來說,在一些實施例中,本發明提供捕獲蛋白質界面共同的具體物理化學特徵的經驗計算方法。在一些實施例中,所述方法允許預測蛋白質-蛋白質相互作用(例如抗原-抗體相互作用),包括例如預測哪些胺基酸序列可能展示出特別高的相互作用親和力。在一些實施例中,所提供的方法有效地應用於設計、鑑別和/或表徵序列,所述序列不同於參考序列並在其蛋白質-蛋白質相互作用方面展示出一或多種改進的特徵(例如改進的親和力)。本發明提供基於患者對DV的免疫反應將患者分層的系統。本發明提供用於鑑別那些很可能對DV免疫療法良好反應的患者的方法。舉例來說,患者的血清可用於測試針對DV的具體表位(例如所提供的抗體藥劑特異性地與其結合的表位)的抗體的存在。如果患者不具有足夠水平的針對所述表位的抗體,那麼可將一或多種所提供的DV抗體藥劑投與患者。患者的自身免疫反應可用所提供的DV抗體藥劑補充。在一些實施例中,免疫療法有助於清除DV病毒和/或解除DV感染。在一些實施例中,根據本發明的免疫療法治療和/或預防慢性DV感染。在一些實施例中,本發明提供設計、鑑別和/或表徵適用的抗體藥劑的方法。舉例來說,在一些實施例中,所述方法涉及確定測試抗體藥劑是否與一或多種參考抗DV抗體和/或其它抗體藥劑競爭抗原結合。在一些實施例中,測試抗體藥劑在其與一或多種參考DV抗體交叉競爭時被鑑別為適用的抗體藥劑。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑與一或多種其它醫藥學上可接受的物質組合以得到醫藥組合物。本發明提供用於治療、預防、診斷和/或表徵DV感染的醫藥組合物。在一些實施例中,醫藥組合物包含抗體藥劑,所述抗體藥劑為或包含例如體外結合於任何DV血清型並中和DV感染的人類抗體或其片段或變異體。在一些實施例中,醫藥組合物包含抗體藥劑,所述抗體藥劑為或包含例如體內結合於任何DV血清型並中和DV感染的人類抗體或其片段或變異體。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑在體外系統中所引起的DV中和與所提供的抗體藥劑在體內(例如在人類和/或其它哺乳動物中)所引起的DV中和相關和/或預測此類DV中和。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑可與一或多種其它療法一起使用以用於對DV感染或其一或多種症狀或特徵進行治療、降低其發病率、頻率或嚴重度和/或延緩其發作。舉例來說,在一些實施例中,所提供的抗體藥劑與一或多種抗病毒劑、消炎劑、疼痛緩解劑、免疫調節治療劑和組合療法(其優選地涉及其它DV目標)一起使用。舉例來說,在一些實施例中,在一些實施例中,所提供的抗體藥劑與以下各者組合投與:一或多種幹擾素(例如幹擾素α-2b、幹擾素-γ等)、鎮痛劑(優選地含有對乙醯氨基酚且非阿司匹林(aspirin)和/或布洛芬(ibuprofen))、抗DV單克隆抗體、抗DV多克隆抗體、RNA聚合酶抑制劑、蛋白酶抑制劑、核苷類似物、解螺旋酶抑制劑、免疫調節劑、反義化合物、短幹擾RNA(siRNA)、短髮夾RNA(shRNA)、微RNA(miRNA)、RNA適體、核酶和其組合。因此,在一些實施例中,本發明專門提供結合併中和登革病毒血清型D1、D2、D3和D4中的每一者的抗體藥劑。在一些實施例中,抗體藥劑結合於表位,所述表位為或包含以下各者內的胺基酸序列:SEQIDNO.17(EDIII-DV1)、SEQIDNO.18(EDIII-DV2)、SEQIDNO.19(EDIII-DV3)、SEQIDNO.20(EDIII-DV4)或其組合。在一些實施例中,抗體藥劑在登革病毒的包膜糖蛋白的A股區中結合於表位。在一些實施例中,表位包含一或多個對應於在SEQIDNO.17-20中的任一者的選自由以下組成的群組的位置處的殘基的殘基:305、306、307、308、309、310、311、312、323、325、327、329、360、361、362、363、364、385、387、388、389、390、391和其組合。在一些實施例中,在位置305處的對應的殘基選自由以下組成的群組:絲氨酸、賴氨酸和蘇氨酸。在一些實施例中,在位置310處的對應的殘基為賴氨酸。在一些實施例中,在位置311處的對應的殘基為賴氨酸。在一些實施例中,在位置323處的對應的殘基選自由以下組成的群組:精氨酸、賴氨酸和穀氨醯胺。在一些實施例中,在位置327處的對應的殘基選自由以下組成的群組:賴氨酸和穀氨酸。在一些實施例中,在位置329處的對應的殘基選自由以下組成的群組:精氨酸、天冬氨酸、穀氨酸和蘇氨酸。在一些實施例中,本發明提供一種抗體藥劑,其重鏈可變區和/或輕鏈可變區包括至少一個互補決定區(CDR),所述至少一個互補決定區與參考抗體4E11的CDR具有至少80%序列一致性,但因所述CDR內的至少一個氨基殘基的取代而不同。在一些實施例中,本發明提供一種抗體藥劑,其重鏈可變區和/或輕鏈可變區包括至少一個互補決定區(CDR),所述至少一個互補決定區與參考抗體4E5A的CDR具有至少80%序列一致性,但因所述CDR內的至少一個氨基殘基的取代而不同。在一些實施例中,一或多個所述取代為同源取代。在一些實施例中,一或多個所述取代不為同源取代。在一些實施例中,一或多個所述取代為空取代。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個CDR,所述至少一個CDR與抗體4E11的參考CDR基本上一致,因為其或者與所述參考CDR一致或者包括所述參考CDR內的胺基酸的在1到5個之間的取代。在一些實施例中,參考CDR選自由以下組成的群組:發現於4E11重鏈(SEQIDNO.1)的殘基27與33之間的參考CDR,發現於4E11重鏈(SEQIDNO.1)的殘基53與58之間的參考CDR,發現於4E11重鏈(SEQIDNO.1)的殘基100與106之間的參考CDR,發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.2)的殘基24與38之間的參考CDR,發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.2)的殘基54與60之間的參考CDR,發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.2)的殘基93與101之間的參考CDR;和其組合。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個CDR,所述至少一個CDR與下方闡述的參考CDR基本上一致,因為其或者與所述參考CDR一致或者包括所述參考CDR內的胺基酸的在1到5個之間的取代:GFNIKDT(SEQIDNO.7)、DPANGD(SEQIDNO.8)、GWEGFAY(SEQIDNO.9)、RASENVDKYGNSFMH(SEQIDNO.14)、RASNLES(SEQIDNO.15)和/或QRSNEVPWT(SEQIDNO.16)。在一些實施例中,參考CDR是重鏈CDR。在一些實施例中,參考CDR是輕鏈CDR。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個與重鏈參考CDR基本上一致的重鏈CDR並且還包括至少一個與輕鏈參考CDR一致的輕鏈CDR。在一些實施例中,抗體藥劑中的CDR中的每一者與參考CDR中的一者基本上一致。在一些實施例中,本發明提供一種抗體藥劑,其重鏈可變區包括至少一個互補決定區(CDR),所述至少一個互補決定區與參考抗體4E11的CDR具有至少95%序列一致性,但因所述CDR內的至少一個胺基酸殘基的取代而不同。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個CDR,所述至少一個CDR與抗體4E11的參考CDR基本上一致,因為其或者與所述參考CDR一致或者包括所述參考CDR內的胺基酸的在1到5個之間的取代。在一些實施例中,參考CDR選自由以下組成的群組:發現於4E11重鏈(SEQIDNO.1)的殘基27與33之間的參考CDR,發現於4E11重鏈(SEQIDNO.1)的殘基53與58之間的參考CDR,發現於4E11重鏈(SEQIDNO.1)的殘基100與106之間的參考CDR,發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.2)的殘基24與38之間的參考CDR,發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.2)的殘基54與60之間的參考CDR,發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.2)的殘基93與101之間的參考CDR,和其組合。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個CDR,所述至少一個CDR與下方闡述的參考CDR基本上一致,因為其或者與所述參考CDR一致或者包括所述參考CDR內的胺基酸的在1到5個之間的取代:參考CDR:GFNIKDT(SEQIDNO.7)、DPANGD(SEQIDNO.8)、GWEGFAY(SEQIDNO.9)、RASENVDKYGNSFMH(SEQIDNO.14)、RASNLES(SEQIDNO.15)和/或QRSNEVPWT(SEQIDNO.16)。在一些實施例中,參考CDR是重鏈CDR。在一些實施例中,參考CDR是輕鏈CDR。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個與重鏈參考CDR基本上一致的重鏈CDR並且還包括至少一個與輕鏈參考CDR一致的輕鏈CDR。在一些實施例中,抗體藥劑中的CDR中的每一者與參考CDR中的一者基本上一致。在一些實施例中,重鏈可變區CDR在位置55處具有胺基酸殘基的取代。在一些實施例中,位置55處的取代胺基酸選自由穀氨酸和天冬氨酸組成的群組。在一些實施例中,輕鏈可變區CDR在選自由以下組成的群組的位置處具有胺基酸殘基的取代:27、31、57、59、60和其組合。在一些實施例中,位置27處的取代胺基酸殘基為空取代(即,缺失單一胺基酸)。在一些實施例中,位置27處的取代胺基酸殘基為丙氨酸。在一些實施例中,位置31處的取代胺基酸殘基為賴氨酸。在一些實施例中,位置57處的取代胺基酸殘基選自由穀氨酸和絲氨酸組成的群組。在一些實施例中,位置59處的取代胺基酸殘基選自由穀氨醯胺和天冬醯胺組成的群組。在一些實施例中,位置60處的取代胺基酸殘基選自由色氨酸、酪氨酸和精氨酸組成的群組。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個CDR,所述至少一個CDR與抗體4E5A的參考CDR基本上一致,因為其或者與所述參考CDR一致或者包括所述參考CDR內的胺基酸的在1到5個之間的取代。在一些實施例中,參考CDR選自由以下組成的群組:發現於4E5A重鏈(SEQIDNO.29)的殘基27與33之間的參考CDR,發現於4E11重鏈(SEQIDNO.29)的殘基53與58之間的參考CDR,發現於4E11重鏈(SEQIDNO.29)的殘基100與106之間的參考CDR,發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.30)的殘基24與38之間的參考CDR,發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.30)的殘基54與60之間的參考CDR,發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.30)的殘基93與101之間的參考CDR;和其組合。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個CDR,所述至少一個CDR與下方闡述的參考CDR基本上一致,因為其或者與所述參考CDR一致或者包括所述參考CDR內的胺基酸的在1到5個之間的取代:GFNIKDT(SEQIDNO.35)、DPENGD(SEQIDNO.36)、GWEGFAY(SEQIDNO.37)、RASENVDKYGNSFMH(SEQIDNO.42)、RASELQW(SEQIDNO.3)和/或QRSNEVPWT(SEQIDNO.44)。在一些實施例中,參考CDR為重鏈CDR。在一些實施例中,參考CDR為輕鏈CDR。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個與重鏈參考CDR基本上一致的重鏈CDR並且還包括至少一個與輕鏈參考CDR一致的輕鏈CDR。在一些實施例中,抗體藥劑中的CDR中的每一者與參考CDR中的一者基本上一致。在一些實施例中,本發明提供一種抗體藥劑,其重鏈可變區包括至少一個互補決定區(CDR),所述至少一個互補決定區與參考抗體4E5A的CDR具有至少95%序列一致性,但因所述CDR內的至少一個胺基酸殘基的取代而不同。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個CDR,所述至少一個CDR與抗體4E5A的參考CDR基本上一致,因為其或者與所述參考CDR一致或者包括所述參考CDR內的胺基酸的在1到5個之間的取代。在一些實施例中,參考CDR選自由以下組成的群組:發現於4E5A重鏈(SEQIDNO.29)的殘基27與33之間的參考CDR,發現於4E11重鏈(SEQIDNO.29)的殘基53與58之間的參考CDR;發現於4E11重鏈(SEQIDNO.29)的殘基100與106之間的參考CDR;發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.30)的殘基24與38之間的參考CDR,發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.30)的殘基54與60之間的參考CDR,發現於4E11輕鏈(SEQIDNO.30)的殘基93與101之間的參考CDR;和其組合。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個CDR,所述至少一個CDR與下方闡述的參考CDR基本上一致,因為其或者與所述參考CDR一致或者包括所述參考CDR內的胺基酸的在1到5個之間的取代:GFNIKDT(SEQIDNO.35)、DPENGD(SEQIDNO.36)、GWEGFAY(SEQIDNO.37)、RASENVDKYGNSFMH(SEQIDNO.42)、RASELQW(SEQIDNO.3)和/或QRSNEVPWT(SEQIDNO.44)。在一些實施例中,參考CDR為重鏈CDR。在一些實施例中,參考CDR為輕鏈CDR。在一些實施例中,抗體藥劑包括至少一個與重鏈參考CDR基本上一致的重鏈CDR並且還包括至少一個與輕鏈參考CDR一致的輕鏈CDR。在一些實施例中,抗體藥劑中的CDR中的每一者與參考CDR中的一者基本上一致。在一些實施例中,本發明提供一種抗體藥劑,其胺基酸序列包括與參考抗體序列的相應部分(例如,見於抗體4E11和/或4E5A的重鏈或輕鏈)展示基本一致性但確切差異在少數位置處的部分。在一些實施例中,所述部分包括鄰近CDR的序列;在一些實施例中,所述部分包括CDR;在一些實施例中,所述部分包括1、2或3個CDR;在一些實施例中,所述部分對應於全長鏈。在一些實施例中,所述部分的長度是至少5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、50或更多個胺基酸。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示與參考序列跨所述部分至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或99%以上的序列一致性。在一些實施例中,本發明提供包含多肽的抗體藥劑,所述多肽包括以下CDR序列中的一或多者:GFNIKDT(SEQIDNO.35)、DPENGD(SEQIDNO.36)、GWEGFAY(SEQIDNO.37)、RASENVDKYGNSFMH(SEQIDNO.42)、RASELQW(SEQIDNO.3)和/或QRSNEVPWT(SEQIDNO.44)。在一些實施例中,本發明提供包含至少第一和第二多肽的抗體藥劑,所述多肽中的每一者包括這些CDR序列中的一或多者。在一些實施例中,本發明提供包含至少第一、第二和第三多肽的抗體藥劑,所述多肽中的每一者包括這些CDR序列中的一或多者。在一些實施例中,本發明提供包含至少第一、第二和第三多肽的抗體藥劑,所述多肽中的每一者包括這些CDR序列和框架區中的一或多者,所述CDR序列和框架區中的每一者包括以下序列中的一或多者:EVKLLEQSGAELVKPGASVRLSCTAS(SEQIDNO.31)、YMSWVKQRPEQGLEWIGRI(SEQIDNO.32)、TKYDPKFQGKATITADTSSNTAYLHLSSLTSGDTAVYYCSR(SEQIDNO.33)和/或WGQGTLVTVSA(SEQIDNO.34)。在一些實施例中,本發明提供一種抗體藥劑,其為包含包括序列SEQIDNO.29的重鏈和序列SEQIDNO.30的輕鏈的多肽的完整抗體。在一些實施例中,本發明提供包含多肽的抗體藥劑,所述多肽的胺基酸序列包括對應於包括殘基26和/或27的參考4E11或4E5A重鏈的片段的部分。在一些所述實施例中,所提供的抗體藥劑具有在位置26和27中的一者或兩者處不同於參考文獻的胺基酸序列的胺基酸序列。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其相對於參考多肽在位置26處具有胺基酸殘基的空取代(即,缺失)。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其相對於參考多肽在位置27處具有胺基酸殘基的空取代(即,缺失)。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其相對於參考多肽在位置27處具有胺基酸殘基的取代。在一些實施例中,位置27處的取代胺基酸殘基為丙氨酸。在一些實施例中,本發明提供包含多肽的抗體藥劑,所述多肽的胺基酸序列與參考4E11或4E5A重鏈或輕鏈的胺基酸序列展示至少80%一致性,所述至少一種多肽包括以下序列元件:在重鏈殘基26處空重鏈殘基27處的A在重鏈殘基27處空。在一些實施例中,本發明提供包含多肽的抗體藥劑,所述多肽的胺基酸序列與參考4E11或4E5A重鏈或輕鏈的胺基酸序列一致,除了其在至少一個位置中、但不在超過10、9、8、7、6、5、4、3或2個位置中不同,所述至少一種多肽包括以下序列元件:在重鏈殘基26處空重鏈殘基27處的A在重鏈殘基27處空。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其是IgG。在一些實施例中,抗體藥劑是單克隆抗體。在一些實施例中,抗體藥劑選自由以下組成的群組:小鼠抗體、人類化抗體、人類抗體、經純化抗體、經分離抗體、嵌合抗體、多克隆抗體和其組合。在一些實施例中,提供抗體藥劑,其中抗原結合片段選自由以下組成的群組:Fab片段、Fab'片段、F(ab')2片段、Fd片段、Fd'片段、Fv片段、dAb片段、scFv片段、經分離CDR區、dsFv雙功能抗體、單鏈抗體和其組合。在一些實施例中,本發明提供一種細胞系,其表達對登革病毒具有特異性的抗體藥劑,其中所述抗體藥劑結合併中和登革病毒血清型D1、D2、D3和D4中的每一者。在一些實施例中,本發明提供一種醫藥組合物,其包括一或多種抗體藥劑和醫藥學上可接受的賦形劑,其中所述抗體藥劑結合併中和登革病毒血清型D1、D2、D3和D4中的每一者。在一些實施例中,醫藥組合物進一步包括至少一種其它抗病毒劑。在一些實施例中,本發明提供治療有需要的個體的方法,其包括投與抗體藥劑的步驟,其中所述抗體藥劑結合併中和登革病毒血清型D1、D2、D3和D4中的每一者。在一些實施例中,本發明提供試劑盒,其包括至少一種抗體藥劑、用於向個體投與所述至少一種抗體或片段的注射器、針或施用器以及使用說明書,其中所述抗體藥劑結合併中和登革病毒血清型D1、D2、D3和D4中的每一者。在一些實施例中,本發明提供製造醫藥組合物的方法,所述方法包括以下步驟:提供抗體藥劑,其中所述抗體藥劑結合併中和登革病毒血清型D1、D2、D3和D4中的每一者;和將所述抗體藥劑與至少一種醫藥學上可接受的載劑調配,以便產生醫藥組合物。在一些實施例中,醫藥組合物是液體組合物。在一些實施例中,醫藥組合物經調配以用於腸胃外投與。在一些實施例中,醫藥組合物經調配以用於靜脈內投與。在一些實施例中,醫藥組合物經調配以用於靜脈內投與兒童。附圖說明附圖的圖式僅用於說明目的,而不是為了限制。圖1:圖1展示窗口大小對預測準確性的影響。窗口大小代表所預測的陽性數目。預測準確性利用正確預測的測試用例結構的數目(總共37個)來測定。當窗口大小是一時(即,當101種結構中的一者被預測為陽性時),如果結構是任意選擇的,那麼幾乎一半的x射線結構(約48%,37個中的18個)被正確鑑別,其二項式概率為1.46E-26(n=37,p=0.009,成功數=18)。可見MLR方法的預測準確性為窗口大小的對數性增加函數,且準確性在窗口大小為5時達到85%且在窗口大小為10時達到100%。相反地,ZRANK即使在窗口大小為20時也未能預測100%的結構。圖2:圖2A-C說明局部搜索的對接結果。對於此評估,類天然結構被定義為具有來自x射線結構中配體的小於RMSD,針對固定受體內的配體原子所計算。的結構被稱為非天然結構。(A)曲面圖上的每一點代表對接誘餌。x軸展示ZRANK分數;Y軸代表x射線結構的RMSD(以為單位);Z軸代表基於MLR的預測概率。類天然結構的ZRANK分數在-60到-30Kcal/mol之間變化。(B)ZRANK分數(x軸)與RMSD(y軸)之間的相關性。虛線圓圈內的數據點接近天然x射線結構。(C)基於MLR的概率與RMSD之間的相關性。預測概率與RMSD之間有顯著相關性,但ZRANK與RMSD之間不存在此類相關性。圖3:圖3展示4E11抗體的親和力和體外活性。圖4:圖4展示抗體設計方法的流程圖。圖5:圖5展示固定EDIII上最好的五種對接模型的疊加。EDIII域呈現為球體;4E11展示為各模型中的表面。圖6:圖6A-B說明不佳DV4結合的序列和結構決定子。(A)四種血清型的EDIII域區的序列比對。推定單抗結合殘基加灰色陰影。307、329、361、364、385、388和390處的殘基區分DV4與序列的其餘部分;這些殘基經編號。利用五種mAb突變得到的殘基接觸加方框。值得注意的是,6種新的接觸中的5種針對A和B股的保守表位殘基形成。這解釋了新的突變為何對DV1-3結合不會不利。(B)4E11/EDIII相互作用的結構模型。區分DV4與其它病毒株的序列位置經標記,且其中胺基酸的側鏈呈現為棒。圖7:圖7展示出定位於4E11:EDIII-DV4界面外周的親和力增強性突變。在結合篩選中鑑別的陽性位置被突出顯示,且展示在4E11:EDIII-DV4相互作用的結構模型中。所有陽性突變均位於結合界面的外周。兩個圖代表同一模型的不同視圖。EDIII(頂部)、VH(右側)和VL(左側)蛋白分別呈現在每個圖中。圖8:圖8A-H展示出4E11野生型和4E5A與DV1-4的抗原EDIII的表面等離子體子共振(SPR)傳感圖。圖9:圖9說明通過灶減少中和測試(FRNT)評估的抗體的體外中和活性。中和分析使用DV1-4和抗體4E11野生型、m4E11野生型、4E5A和4G2進行。將抗體的連續稀釋液與等量病毒混合且與粘性覆層一起添加到Vero細胞單層。在4-6天之後,細胞固定,且對灶進行免疫染色和計數。數據點代表重複的平均值,且誤差條代表標準偏差。標準四參數對數模型使用最小平方回歸擬合數據。4E5A展示出對DV1-3與4E11和m4E11類似的中和活性以及對DV4中和活性的大量的增加。4G2(一種代表性黃病毒融合環特異性抗體)展示出相對於4E5A對DV1-3較低的中和活性以及對DV4僅略微較高的活性。圖10:圖10展示出體內預防性DV2攻擊模型。數據展示在病毒攻擊之後第3天時AF129小鼠血清中的病毒。在病毒攻擊之前1天用AB1或安慰劑處理小鼠。從小鼠血清提取的RNA通過QRT-PCR擴增,且基於來自從已知效價樣品獲取的對照RNA的曲線外推大致的Log10CCID50效價。虛線代表大致的檢測限。圖11:圖11展示互補位和表位中的胺基酸頻率。數據從77種抗原-抗體複合體產生。圖12:圖12展示4E5A抗體變異體對EDIII-DVI、EDIII-DVII、EDIII-DVIII和EDIII-DVIV的親和力,如利用競爭ELISA所測定。圖13:圖13展示4E5A抗體變異體對DV1和DV2(圖13A)和對DV3和DV4(圖13B)的結合概況,如利用表面等離子體子共振所測定。圖14:圖14展示4E5A抗體變異體當在酵母細胞表面上表達時的單鏈可變片段結合。圖15:圖15展示4E5A抗體變異體對DV4報導體病毒粒子的中和。具體實施方式定義為了使本發明更易於理解,首先在下文定義某些術語;所屬領域的技術人員將了解並理解如下文定義和/或在本文中以其它方式使用的這些術語的用途和範圍。成人:如本文中所用,術語「成人」是指年齡為十八歲或更年長的人類。成人之間的體重可大幅變化,且典型範圍為90磅到250磅。親和力:如此項技術中已知,「親和力」為特定配體(例如抗體)與其搭配物(例如表位)結合的緊密性的量度。親和力可以不同方式測量。胺基酸:如本文中所用,術語「胺基酸」在其最廣泛意義上是指任何可併入多肽鏈中的化合物和/或物質。在一些實施例中,胺基酸具有通用結構H2N-C(H)(R)-COOH。在一些實施例中,胺基酸為天然存在的胺基酸。在一些實施例中,胺基酸是合成胺基酸;在一些實施例中,胺基酸是d-胺基酸;在一些實施例中,胺基酸是l-胺基酸。「標準胺基酸」是指天然存在的肽中常見的二十種標準l-胺基酸中的任一種。「非標準胺基酸」是指除標準胺基酸外的任何胺基酸,不考慮其是以合成方式製備還是從天然來源獲得。如本文中所用,「合成胺基酸」涵蓋經化學修飾的胺基酸,包括(但不限於)鹽、胺基酸衍生物(諸如醯胺)和/或取代。肽中包括羧基和/或氨基末端胺基酸在內的胺基酸可通過甲基化、醯胺化、乙醯化、保護基和/或以其它化學基團取代來進行修飾,這些修飾可改變肽的循環半衰期,而不會對其活性產生不利影響。胺基酸可參與二硫鍵。胺基酸可包含一個或翻譯後修飾,如與一或多種化學實體(例如甲基、乙酸酯基、乙醯基、磷酸酯基、甲醯基部分、類異戊二烯基、硫酸酯基、聚乙二醇部分、脂質部分、碳水化合物部分、生物素部分等)結合。術語「胺基酸」與「胺基酸殘基」可互換使用且可以指游離胺基酸和/或肽的胺基酸殘基。從使用所述術語的上下文中顯而易見,其不是指游離胺基酸,就是指肽的殘基。動物:如本文中所用,術語「動物」是指動物界的任何成員。在一些實施例中,「動物」是指任一性別且處於任何發育階段的人類。在一些實施例中,「動物」是指處於任何發育階段的非人類動物。在某些實施例中,非人類動物為哺乳動物(例如齧齒動物、小鼠、大鼠、兔、猴、狗、貓、綿羊、牛、靈長類動物和/或豬)。在一些實施例中,動物包括(但不限於)哺乳動物、鳥類、爬行動物、兩棲動物、魚類、昆蟲和/或蠕蟲。在某些實施例中,動物易受DV感染。在一些實施例中,動物可以是轉基因動物、遺傳工程化的動物和/或克隆動物。抗體藥劑:如本文中所用,術語「抗體藥劑」是指特異性結合於特定抗原的藥劑。在一些實施例中,所述術語涵蓋具有足以賦予特異性結合的免疫球蛋白結構元件的任何多肽。適合的抗體包括(但不限於)人類抗體、靈長類化抗體、嵌合抗體、雙特異性抗體、人類化抗體、綴合抗體(即綴合或融合於其它蛋白質、放射性標記、細胞毒素的抗體)、小型模塊化免疫藥物(「SMIPsTM」)、單鏈抗體、駱駝抗體以及抗體片段。如本文中所用,術語「抗體」還包括完整單克隆抗體、多克隆抗體、單域抗體(例如鯊魚單域抗體(例如IgNAR或其片段))、由至少兩個完整抗體形成的多特異性抗體(例如雙特異性抗體)以及抗體片段,只要這些抗體片段展現所需生物活性即可。在一些實施例中,所述術語涵蓋訂書肽。在一些實施例中,所述術語涵蓋一或多種抗體樣結合肽模擬物。在一些實施例中,所述術語涵蓋一或多種抗體樣結合骨架蛋白質。在一些實施例中,所述術語涵蓋單功能抗體或纖連蛋白。在許多實施例中,抗體藥劑為或包含胺基酸序列包括一或多個被所屬領域的技術人員識別為互補決定區(CDR)的結構元件的多肽;在一些實施例中,抗體藥劑為或包含胺基酸序列包括至少一個與發現於參考抗體中的CDR基本上一致的CDR(例如至少一個重鏈CDR和/或至少一個輕鏈CDR)的多肽。在一些實施例中,所包括的CDR與參考CDR基本上一致,因為其與參考CDR相比或者序列一致或者含有在1到5個之間的胺基酸取代。在一些實施例中,所包括的CDR與參考CDR基本上一致,因為其展示出與參考CDR至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的序列一致性。在一些實施例中,所包括的CDR與參考CDR基本上一致,因為其展示出與參考CDR至少96%、96%、97%、98%、99%或100%的序列一致性。在一些實施例中,所包括的CDR與參考CDR基本上一致,因為與參考CDR相比,所包括的CDR內的至少一個胺基酸經缺失、添加或取代,但所包括的CDR具有與參考CDR的胺基酸序列另外一致的胺基酸序列。在一些實施例中,所包括的CDR與參考CDR基本上一致,因為與參考CDR相比,所包括的CDR內的1到5個胺基酸經缺失、添加或取代,但所包括的CDR具有與參考CDR另外一致的胺基酸序列。在一些實施例中,所包括的CDR與參考CDR基本上一致,因為與參考CDR相比,所包括的CDR內的至少一個胺基酸經取代,但所包括的CDR具有與參考CDR的胺基酸序列另外一致的胺基酸序列。在一些實施例中,所包括的CDR與參考CDR基本上一致,因為與參考CDR相比,所包括的CDR內的1到5個胺基酸經缺失、添加或取代,但所包括的CDR具有與參考CDR另外一致的胺基酸序列。在一些實施例中,抗體藥劑為或包含胺基酸序列包括被所屬領域的技術人員識別為免疫球蛋白可變域的結構元件的多肽。在一些實施例中,抗體藥劑為結合域與免疫球蛋白結合域同源或大部分同源的多肽蛋白質。抗體:如此項技術中已知,「抗體」為特異性結合於特定抗原的免疫球蛋白。所述術語涵蓋天然產生的免疫球蛋白(因為其是由對抗原產生反應的生物體產生的),並且還涵蓋合成產生或經工程化的免疫球蛋白。抗體可為單克隆或多克隆。抗體可為任何免疫球蛋白類別的成員,包括人類類別IgG、IgM、IgA和IgD中的任一者。已知如此項技術中所理解的典型免疫球蛋白(抗體)結構單元包含四聚體。每一四聚體均由兩對相同的多肽鏈組成,每一對具有一個「輕鏈」(約25kD)和一個「重鏈」(約50-70kD)。每一鏈的N端界定具有約100到110種或更多種主要引起抗原識別的胺基酸的可變區。術語「可變輕鏈」(VL)和「可變重鏈」(VH)分別是指這些輕鏈和重鏈。每一可變區進一步再分成高變區(HV)和框架區(FR)。高變區包含三個稱為互補決定區的高變序列區域(CDR1、CDR2和CDR3),其由四個框架區(FR1、FR2、FR2和FR4)間隔開,所述框架區形成β摺疊結構且充當骨架以將HV區保持在適當位置上。每一重鏈和輕鏈的C端界定由輕鏈的一個域(CL)和重鏈的三個域(CH1、CH2和CH3)組成的恆定區。在一些實施例中,術語「全長」用於提及抗體以指其含有兩個重鏈和兩個輕鏈,如在天然產生的抗體下出現般任選地利用二硫鍵結合。在一些實施例中,抗體由細胞產生。在一些實施例中,抗體通過化學合成產生。在一些實施例中,抗體來源於哺乳動物。在一些實施例中,抗體來源於動物,如(但不限於)小鼠、大鼠、馬、豬或山羊。在一些實施例中,抗體使用重組細胞培養系統產生。在一些實施例中,抗體可為經純化抗體(例如通過免疫親和色譜法進行)。在一些實施例中,抗體可為人類抗體。在一些實施例中,抗體可為人類化抗體(抗體來自非人類物種,其蛋白質序列已經修飾以增大其與在人類中天然產生的抗體變異體的相似性)。在一些實施例中,抗體可為嵌合抗體(通過將來自非人類來源(例如小鼠、大鼠、馬或豬)的遺傳物質與來自人類的遺傳物質組合而製得的抗體)。抗體片段:如本文中所用,「抗體片段」包括完整抗體的一部分,如抗體的抗原結合或可變區。抗體片段的實例包括Fab、Fab'、F(ab')2和Fv片段;三功能抗體;四功能抗體;線性抗體;單鏈抗體分子;和由抗體片段形成的多特異性抗體。舉例來說,抗體片段包括已分離片段、由重鏈和輕鏈的可變區組成的「Fv」片段、輕鏈和重鏈可變區域通過肽連接子(「ScFv蛋白」)連接的重組單鏈多肽分子以及由模擬高變區的胺基酸殘基組成的最小識別單位。在許多實施例中,抗體片段含有足夠的親本抗體序列,其中其為結合於與親本抗體所結合的相同抗原的片段;在一些實施例中,片段以與親本抗體的親和力可比的親和力結合於抗原和/或與親本抗體競爭結合於抗原。抗體的抗原結合片段的實例包括(但不限於)Fab片段、Fab'片段、F(ab')2片段、scFv片段、Fv片段、dsFv雙功能抗體、dAb片段、Fd'片段、Fd片段和經分離互補決定區(CDR)區域。抗體的抗原結合片段可通過任何手段產生。舉例來說,抗體的抗原結合片段可通過完整抗體的碎片化以酶促方式或以化學方式產生和/或其可以重組方式由編碼部分抗體序列的基因產生。可替代地或另外,抗體的抗原結合片段可完全或部分地以合成方式產生。抗體的抗原結合片段可任選地包含單鏈抗體片段。可替代地或另外,抗體的抗原結合片段可包含例如利用二硫鍵連接在一起的多個鏈。抗體的抗原結合片段可任選地包含多分子複合體。功能性抗體片段通常包含至少約50個胺基酸且更通常包含至少約200個胺基酸。抗病毒劑:如本文中所用,術語「抗病毒劑」是指一類特異性地用於通過抑制、去活化或破壞病毒粒子來治療病毒感染的藥物。一般來說,抗病毒劑可為或包含任何化學類別(例如小分子、金屬、核酸、多肽、脂質和/或碳水化合物)的化合物。在一些實施例中,抗病毒劑為或包含抗體或抗體模擬物。在一些實施例中,抗病毒劑為或包含核酸藥劑(例如反義寡核苷酸、siRNA、shRNA等)或其模擬物。在一些實施例中,抗病毒劑為或包含小分子。在一些實施例中,抗病毒劑為或包含天然產生的化合物(例如小分子)。在一些實施例中,抗病毒劑具有通過人工產生和/或修飾的化學結構。大約:如本文中所用,術語「大約」或「約」在應用於所關注的一或多個值時是指與所述參考值類似的值。在某些實施例中,除非另行說明或另外從上下文顯而易見,否則術語「大約」或「約」是指落入所述參考值的任一方向(大於或小於)25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%或1%以下之內的一系列值(除了其中所述數目將超過100%的可能值)。嬰兒:如本文中所用,術語「嬰兒」是指年齡在兩歲以下的人類。嬰兒的典型體重在3磅到20磅範圍內。生物活性:如本文中所用,短語「生物活性」是指在生物系統(例如細胞培養物、生物體等)中具有活性的任何物質的特徵。舉例來說,當向生物體投與時對所述生物體具有生物效應的物質被視為具有生物活性。在具體實施例中,當蛋白質或多肽具有生物活性時,所述蛋白質或多肽的共有蛋白質或多肽的至少一種生物活性的一部分通常被稱為「生物活性」部分。特徵部分:如本文中所用,術語「特徵部分」在最廣泛意義上用於指物質中其存在(或不存在)與所述物質的具體特徵、屬性或活性的存在(或不存在)相關的一部分。在一些實施例中,物質的特徵部分為在所述物質中和在共有所述具體特徵、屬性或活性的相關物質中而不在不共有所述具體特徵、屬性或活性的物質中可見的部分。在某些實施例中,特徵部分與完整物質共有至少一種功能性特徵。舉例來說,在一些實施例中,蛋白質或多肽的「特徵部分」是含有連續一段胺基酸或連續多段胺基酸集合一起作為蛋白質或多肽的特徵的部分。在一些實施例中,每一所述連續段通常含有至少2、5、10、15、20、50個或50個以上胺基酸。一般來說,物質(例如蛋白質、抗體等)的特徵部分是與相關完整物質除了具有上文規定的序列和/或結構一致性之外還共有至少一種功能性特徵的部分。在一些實施例中,特徵部分可具生物活性。兒童:如本文中所用,術語「兒童」是指年齡在兩歲與18歲之間的人類。體重可跨越年齡和特定兒童大幅變化,且典型範圍為30磅到150磅。組合療法:如本文中所用,術語「組合療法」是指以重疊方案投與兩種或兩種以上不同醫藥劑以使個體同時暴露於兩種藥劑的那些情形。可比的:術語「可比的」在本文中用於描述兩組(或兩組以上)狀況或情形彼此充分類似從而允許比較所獲得的結果或所觀察到的現象。在一些實施例中,可比組的狀況或情形的特徵在於多個基本上相同的特徵和一個或少量變化特徵。所屬領域的技術人員將了解,狀況組在特徵在於充足數目和類型的基本上相同的特徵時是彼此可比的,從而保證以下合理的結論:在不同組的狀況或情形下獲得的結果或觀察到的現象的差異是由改變的那些特徵的變化所引起或指示所述變化。對應於:如本文中所用,術語「對應於」通常用於指定所關注的多肽中胺基酸殘基的位置/身份。所屬領域的技術人員將了解,出於簡單化的目的,多肽中的殘基通常使用標準編號系統(基於參考相關多肽)指定,因此,舉例來說,「對應於」位置190處的殘基的胺基酸無需實際上為具體胺基酸鏈中的第190位胺基酸,而是對應於在參考多肽中位置190處發現的殘基;所屬領域的技術人員易於了解如何鑑別「對應的」胺基酸。劑型:如本文中所用,術語「劑型」和「單位劑型」是指供待治療患者用的治療性蛋白質(例如抗體)的物理上分散的單元。每一單位含有經計算會產生所需治療作用的預定數量的活性物質。然而,應理解組合物的總劑量將由主治醫師在合理醫學判斷範圍內作出決定。給藥方案:「給藥方案」(或「治療方案」)在所述術語在本文中使用時是通常間隔開時間段向個體個別投與的一組單位劑量(通常是一個以上)。在一些實施例中,給定治療劑具有推薦的給藥方案,其可能涉及一或多個劑量。在一些實施例中,給藥方案包含多個劑量,其中的每一者彼此間隔開相同長度的時間段;在一些實施例中,給藥方案包含多個劑量以及間隔開個別劑量的至少兩個不同時間段。在一些實施例中,給藥方案內的所有劑量具有相同單位劑量的量。在一些實施例中,給藥方案內的不同劑量具有不同量。在一些實施例中,給藥方案包含呈第一劑量的量的第一劑量,接著是呈不同於第一劑量的量的第二劑量的量的一或多種其它劑量。在一些實施例中,給藥方案包含呈第一劑量的量的第一劑量,接著是呈與第一劑量的量相同的第二劑量的量的一或多種其它劑量。DV血清型:如本文中所用,術語「血清型」通常是指DV內的獨特的變異體。包含DV基因組的四種不同DV血清型(DV1-4)在胺基酸層面彼此相差約25%到40%。DV的四種血清型在致病性方面有所不同,但均在亞洲、非洲、中美洲和南美洲地區很普遍。經這些血清型中的一者感染得到對所述血清型的終身免疫性,然而其也增加在來自異源DV血清型的二次感染時重度疾病的風險。表位:如本文中所用,術語「表位」具有其如此項技術中所理解的含義。所屬領域的技術人員應了解,表位也稱作抗原決定子,其是抗原中由免疫系統、確切地說由抗體、B細胞或T細胞識別的分子區域。應進一步了解,表位可以由糖、脂質或胺基酸組成。蛋白質抗原的表位基於其結構和與互補位(抗體中識別表位的部分)的相互作用被分成兩個類別:構象表位和線性表位。構象表位由抗原的胺基酸序列的不連續區段組成,且這些表位基於抗原的3D表面特徵和形狀或三級結構與互補位相互作用。線性表位基於其一級結構與互補位相互作用,且線性表位由來自抗原的胺基酸的連續序列形成。表達:如本文中所用,核酸序列的「表達」是指以下事件中的一或多者:(1)(例如通過轉錄)從DNA序列產生RNA模板;(2)(例如通過剪接、編輯、5'帽形成和/或3'端形成)加工RNA轉錄物;(3)將RNA翻譯成多肽或蛋白質;和/或(4)多肽或蛋白質的翻譯後修飾。功能性:如本文中所用,「功能性」生物分子是呈展現其特徵性特性和/或活性的形式的生物分子。基因:如本文中所用,術語「基因」具有其如此項技術中所理解的含義。所屬領域的技術人員應了解,術語「基因」可以包括基因調節序列(例如啟動子、增強子等)和/或內含子序列。應進一步了解,基因的定義包括提及不編碼蛋白質但實際上編碼功能性RNA分子(如tRNA、RNAi誘導劑等)的核酸。出於明確性的目的,我們應注意到,如本申請案中所使用,術語「基因」通常是指核酸中編碼蛋白質的部分;所述術語可任選地涵蓋調節序列,如所屬領域的技術人員從上下文將清楚。這一定義並不打算排除將術語「基因」應用於非蛋白質編碼表達單元,但更確切地說在大多數情況下打算說明如在本文檔中所使用的所述術語是指蛋白質編碼核酸。基因產物或表達產物:如本文中所用,術語「基因產物」或「表達產物」通常是指從基因轉錄的RNA(加工前和/或加工後)或由從所述基因轉錄的RNA所編碼的多肽(修飾前和/或修飾後)。同源性:如本文中所用,術語「同源性」是指聚合物分子之間,例如核酸分子(例如DNA分子和/或RNA分子)之間和/或多肽分子之間的總體相關性。在一些實施例中,如果聚合物分子之間的序列至少25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或99%一致,那麼認為所述分子彼此「同源」。在一些實施例中,如果聚合物分子之間的序列至少25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或99%類似,那麼認為所述分子彼此「同源」。一致性:如本文中所用,術語「一致性」是指聚合物分子之間,例如核酸分子(例如DNA分子和/或RNA分子)之間和/或多肽分子之間的總體相關性。舉例來說,兩個核酸序列的一致性百分比的計算可通過出於最佳比較目的對準兩個序列來進行(例如,可將間隙引入第一和第二核酸序列中的一個或兩個中以便最佳對準且出於比較目的可以忽略非一致序列)。在某些實施例中,出於比較目的所對準的序列長度為參考序列長度的至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%或基本上100%。接著比較相應核苷酸位置的核苷酸。當第一序列中的位置未被與第二序列中的相應位置相同的核苷酸佔據時,則所述分子在那個位置上是一致的。兩個序列之間的一致性百分比與所述序列共有的一致位置的數目有關,並且考慮最佳對準兩個序列需要引入的間隙的數目和每一間隙的長度。序列的比較和兩個序列之間一致性百分比的確定可以使用數學算法實現。舉例來說,兩個核苷酸序列之間的一致性百分比可使用邁爾(Meyers)和米勒(Miller)(生物科學中的計算機應用(CABIOS),1989,4:11-17)的算法來測定,所述算法已併入使用PAM120權數殘基表、間隙長度罰分12和間隙罰分4的ALIGN程序(2.0版)中。可替代地,可以使用GCG軟體包中的GAP程序,使用NWSgapdna.CMP矩陣確定兩個核苷酸序列之間的一致性百分比。經分離:如本文中所使用,術語「經分離」是指如下物質和/或實體:(1)已與最初產生時與其相關的至少一些組分分離(無論在自然界中和/或在實驗環境中);和/或(2)通過人工產生、製備和/或製造。經分離物質和/或實體可與約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或大於約99%的與其最初相關的其它組分分離。在一些實施例中,經分離藥劑是約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或大於約99%純。如本文中所用,物質在其基本上不含其它組分時是「純的」。如本文中所用,經分離物質和/或實體的純度百分比的計算不應包括賦形劑(例如緩衝劑、溶劑、水等)。模擬表位:如本文中所用,術語「模擬表位」是指模擬表位結構的大分子。在一些實施例中,模擬表位引起的抗體反應與其對應的表位所引起的反應一致或相似。在一些實施例中,識別表位的抗體也識別模擬所述表位的模擬表位。在一些實施例中,模擬表位是肽。在一些實施例中,模擬表位是小分子、碳水化合物、脂質或核酸。在一些實施例中,模擬表位是保守DV表位的肽或非肽模擬表位。在一些實施例中,通過模擬所界定的病毒表位的結構,模擬表位幹擾DV病毒粒子結合於其天然結合搭配物(例如DV目標受體、Rab5、GRP78)的能力,例如通過結合於天然結合搭配物自身來幹擾。突變體:如本文中所用,術語「突變體」是指這樣的實體:其展示出與參考實體的顯著結構一致性,但與參考實體相比在一或多種化學部分的存在或水平方面與參考實體結構上不同。在許多實施例中,突變體在功能上也與其參考實體不同。一般來說,具體實體是否被恰當地視為參考實體的「突變體」是基於其與參考實體的結構一致性的程度。如所屬領域的技術人員將了解,任何生物或化學參考實體具有某些特徵性結構元件。通過定義,突變體是共有一或多種所述特徵性結構元件的不同的化學實體。僅舉幾例,小分子可具有特徵性核心結構元件(例如大環核心)和/或一或多個特徵性側位部分,使得小分子的突變體是共有所述核心結構元件和所述特徵性側位部分但在其它側位部分方面和/或在核心內存在的鍵的類型(單對雙,E對Z等)方面有所不同的一者,多肽可具有包含多個胺基酸的特徵性序列元件,所述多個胺基酸在線形或三維空間中相對於彼此具有指定的位置和/或有助於具體生物功能,核酸可具有包含多個核苷酸殘基的特徵性序列元件,所述多個核苷酸殘基在線形或三維空間中相對於彼此具有指定的位置。舉例來說,突變體多肽可因胺基酸序列中的一或多個差異和/或共價連接於多肽主鏈的化學部分(例如碳水化合物、脂質等)中的一或多個差異而不同於參考多肽。在一些實施例中,突變體多肽展示出與參考多肽至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%或99%的總體序列一致性。可替代地或另外,在一些實施例中,突變體多肽並不與參考多肽共有至少一種特徵性序列元件。在一些實施例中,參考多肽具有一或多種生物活性。在一些實施例中,突變體多肽共有參考多肽的生物活性中的一或多者。在一些實施例中,突變體多肽缺乏參考多肽的生物活性中的一或多者。在一些實施例中,突變體多肽與參考多肽相比展示出一或多種生物活性水平降低。核酸:如本文中所用,術語「核酸」在其最廣泛意義上是指併入或可以併入寡核苷酸鏈中的任何化合物和/或物質。在一些實施例中,核酸是經由磷酸二酯鍵併入或可以經由磷酸二酯鍵併入寡核苷酸鏈中的化合物和/或物質。在一些實施例中,「核酸」是指個別核酸殘基(例如核苷酸和/或核苷)。在一些實施例中,「核酸」是指包含個別核酸殘基的寡核苷酸鏈。如本文中所用,術語「寡核苷酸」與「多核苷酸」可互換使用。在一些實施例中,「核酸」涵蓋RNA以及單股和/或雙股DNA和/或cDNA。此外,術語「核酸」、「DNA」、「RNA」和/或類似術語包括核酸類似物,即,具有除磷酸二酯主鏈之外的類似物。舉例來說,此項技術中已知且在主鏈中具有肽鍵以代替磷酸二酯鍵的所謂「肽核酸」被認為在本發明的範圍內。術語「編碼胺基酸序列的核苷酸序列」包括互為簡併形式和/或編碼相同胺基酸序列的所有核苷酸序列。編碼蛋白質和/或RNA的核苷酸序列可包括內含子。核酸可從天然來源純化,使用重組表達系統產生並任選地純化,以化學方式合成等。適當時,例如在以化學方式合成的分子的情況下,核酸可包含核苷類似物,如具有經化學修飾的鹼基或糖、主鏈修飾等的類似物。除非另外指明,否則核酸序列以5'到3'方向呈現。術語「核酸區段」在本文中用於指作為較長核酸序列的一部分的核酸序列。在許多實施例中,核酸區段包含至少3、4、5、6、7、8、9、10個或10個以上殘基。在一些實施例中,核酸是以下物質或包含以下物質:天然核苷(例如腺苷、胸苷、鳥苷、胞苷、尿苷、脫氧腺苷、脫氧胸苷、脫氧鳥苷和脫氧胞苷);核苷類似物(例如2-氨基腺苷、2-硫代胸苷、肌苷、吡咯並-嘧啶、3-甲基腺苷、5-甲基胞苷、C-5丙炔基-胞苷、C-5丙炔基-尿苷、2-氨基腺苷、C5-溴尿苷、C5-氟尿苷、C5-碘尿苷、C5-丙炔基-尿苷、C5-丙炔基-胞苷、C5-甲基胞苷、2-氨基腺苷、7-脫氮腺苷、7-脫氮鳥苷、8-氧代腺苷、8-氧代鳥苷、O(6)-甲基鳥嘌呤和2-硫代胞苷);經化學修飾的鹼基;經生物修飾的鹼基(例如甲基化鹼基);插入的鹼基;經修飾的糖(例如2'-氟核糖、核糖、2'-脫氧核糖、阿拉伯糖和己醣);和/或經修飾的磷酸酯基(例如硫代磷酸酯和5'-N-亞磷醯胺鍵聯)。在一些實施例中,本發明特別針對「未修飾的核酸」,其意思是未經過化學修飾以促進或實現遞送的核酸(例如多核苷酸和殘基,包括核苷酸和/或核苷)。患者:如本文中所用,術語「患者」或「個體」是指可例如出於實驗、診斷、預防、美容和/或治療目的向其投與所提供的組合物的任何生物體。典型患者包括動物(例如哺乳動物,如小鼠、大鼠、兔、非人類靈長類動物和/或人類)。在一些實施例中,患者是人類。人類包括出生前和出生後形式。醫藥學上可接受的:如本文中所用,術語「醫藥學上可接受的」是指在合理醫學判斷範圍內適用於與人類和動物的組織接觸而無過度毒性、刺激、過敏反應或其它問題或併發症,與合理效益/風險比相稱的物質。醫藥學上可接受的載劑:如本文中所用,術語「醫藥學上可接受的載劑」意指醫藥學上可接受的物質、組合物或媒劑,如液體或固體填充劑、稀釋劑、賦形劑或溶劑囊封物質,涉及運載或輸送主題化合物從一個器官或身體的部分到另一器官或身體的部分。每一載體在與調配物的其它成分相容且對患者無害的意義上必須為「可接受的」。可充當醫藥學上可接受的載劑的物質的一些實例包括:糖,如乳糖、葡萄糖和蔗糖;澱粉,如玉米澱粉和馬鈴薯澱粉;纖維素和其衍生物,如羧甲基纖維素鈉、乙基纖維素和乙酸纖維素;粉末狀黃芪膠;麥芽;明膠;滑石;賦形劑,如可可脂和栓劑蠟;油,如花生油、棉籽油、紅花油、芝麻油、橄欖油、玉米油和大豆油;二醇,如丙二醇;多元醇,如甘油、山梨糖醇、甘露糖醇和聚乙二醇;酯,如油酸乙酯和月桂酸乙酯;瓊脂;緩衝劑,如氫氧化鎂和氫氧化鋁;海藻酸;無熱原質水;等滲鹽水;林格氏溶液(Ringer'ssolution);乙醇;pH緩衝溶液;聚酯、聚碳酸酯和/或聚酸酐;和在醫藥調配物中採用的其它無毒相容物質。醫藥組合物:如本文中所用,術語「醫藥組合物」是指與一或多種醫藥學上可接受的載劑一起調配的活性劑。在一些實施例中,活性劑以適合於投與的單位劑量的量存在於治療方案中,其在投與相關群體時展示出統計學上顯著的實現預定治療作用的概率。在一些實施例中,醫藥組合物可專門調配用於以固體或液體形式投與,其包括適合於以下的醫藥組合物:口服投與,例如頓服藥(水性或非水性溶液或懸浮液)、片劑,例如靶向頰內、舌下和全身吸收者、用於向舌施加的大丸劑、散劑、顆粒、糊劑;腸胃外投與,例如作為例如無菌溶液或懸浮液或持續釋放調配物通過皮下、肌肉內、靜脈內或硬膜外注射投與;局部施加,例如施加到皮膚、肺或口腔的乳膏、軟膏或控制釋放貼片或噴霧;經陰道內或直腸內,例如作為子宮託、乳膏或發泡體;經舌下;經眼;經皮;或經鼻、經肺和到其它黏膜表面。多肽:如本文中所用,一般來說,「多肽」為具有至少兩個彼此通過肽鍵連接的胺基酸的鏈。在一些實施例中,多肽可包括至少3-5個胺基酸,其各自藉助於至少一個肽鍵與其它胺基酸連接。所屬領域技術人員將了解,多肽有時包括「非天然」胺基酸或仍能夠任選整合入多肽鏈中的其它實體。蛋白質:如本文中所用,術語「蛋白質」是指多肽(即,由肽鍵彼此連接的至少兩個胺基酸的串)。蛋白質可包括除胺基酸之外的部分(例如可為糖蛋白、蛋白多糖等)和/或可以其它方式加工或修飾。所屬領域的技術人員將了解「蛋白質」可為如由細胞產生的完整多肽鏈(具有或不具有信號序列),或可為其特徵性部分。所屬領域的技術人員將了解蛋白質有時可包括例如由一或多個二硫鍵連接或通過其它方式締合的一個以上多肽鏈。多肽可含有l-胺基酸、d-胺基酸或兩者,且可含有此項技術中已知的多種胺基酸修飾或類似物中的任一者。適用的修飾包括例如末端乙醯化、醯胺化、甲基化等。在一些實施例中,蛋白質可包含天然胺基酸、非天然胺基酸、合成胺基酸和其組合。術語「肽」一般用於指長度小於約100個胺基酸、小於約50個胺基酸、小於20個胺基酸或小於10個胺基酸的多肽。在一些實施例中,蛋白質是抗體、抗體片段、其生物活性部分,和/或其特徵性部分。復發性DV感染:如本文中所用,「復發性DV感染」是指感染的臨床和/或實驗室跡象(例如感染的一或多種症狀或循環DV粒子和/或個體肝中DV粒子的存在)的再度出現。難治性:如本文中所用,術語「難治性」是指如從業醫務人員通常觀察到的,在投與所提供的組合物之後並不以預期臨床功效反應的任何個體。血清型:一般來說,「血清型」或「血清變型」是指在細菌或病毒物種內或在不同個體的免疫細胞之間的獨特變異體。這些微生物通常基於其細胞表面抗原歸類在一起,允許將生物體流行病學歸類到亞物種水平。小分子:一般來說,「小分子」是尺寸小於約5千道爾頓(kilodalton,kD)的分子。在一些實施例中,小分子小於約4kD、3kD、約2kD或約1kD。在一些實施例中,小分子小於約800道爾頓(dalton,D)、約600D、約500D、約400D、約300D、約200D或約100D。在一些實施例中,小分子小於約2000g/mol、小於約1500g/mol、小於約1000g/mol、小於約800g/mol或小於約500g/mol。在一些實施例中,小分子是非聚合物。在一些實施例中,根據本發明,小分子不為蛋白質、多肽、寡肽、肽、多核苷酸、寡核苷酸、多糖、糖蛋白、蛋白多糖等。基本上:如本文中所用,術語「基本上」是指展現全部或接近全部範圍或程度的所關注的特徵或特性的定性條件。生物學領域的技術人員應理解生物學和化學現象很少(如果發生過)達到完全和/或進行到完全或者實現或避免絕對結果。因此,術語「基本上」在本文中用於捕捉許多生物學和化學現象中所固有的潛在完全性缺乏。基本序列同源性:短語「基本同源性」在本文中用於指胺基酸或核酸序列之間的比較。如所屬領域的技術人員將了解,如果兩個序列在相應位置中含有同源殘基,那麼通常認為它們是「基本上同源的」。同源殘基可以是相同殘基。可替代地,同源殘基可以是將適當地具有類似結構和/或功能特徵的不相同殘基。舉例來說,如所屬領域的技術人員眾所周知的,某些胺基酸通常被歸類為「疏水性」或「親水性」胺基酸,和/或歸類為具有「極性」或「非極性」側鏈。一種胺基酸取代相同類型的另一種胺基酸往往可以認為是「同源」取代。單一胺基酸的移除(例如缺失)通常可視為所述胺基酸的「空」取代。典型胺基酸分類概述如下:如此項技術中眾所周知,可以使用多種算法中的任一種來比較胺基酸或核酸序列,包括在商業電腦程式中可獲得的那些算法,如用於核苷酸序列的BLASTN和用於胺基酸序列的BLASTP、間隙BLAST以及PSI-BLAST。示例性所述程序描述於奧特查爾(Altschul)等人,基礎局部比對搜索工具(Basiclocalalignmentsearchtool),分子生物學雜誌(J.Mol.Biol.),215(3):403-410,1990;奧特查爾等人,酶學方法(MethodsinEnzymology);奧特查爾等人,「間隙BLAST和PSI-BLAST:新型蛋白質資料庫搜索程序的產生(GappedBLASTandPSI-BLAST:anewgenerationofproteindatabasesearchprograms)」,核酸研究(NucleicAcidsRes.),25:3389-3402,1997;巴謝瓦尼斯(Baxevanis)等人,生物信息學:基因和蛋白質分析的實用指南(Bioinformatics:APracticalGuidetotheAnalysisofGenesandProteins),威利出版社(Wiley),1998;以及密申納(Misener)等人(編),生物信息學方法和方案(BioinformaticsMethodsandProtocols)(分子生物學方法(MethodsinMolecularBiology),第132卷),胡馬納出版社(HumanaPress),1999;所有前述文獻均以引用的方式併入本文中。除識別同源序列以外,上述程序通常還指示同源程度。在一些實施例中,如果兩個序列中在相關段殘基上至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或99%以上的對應殘基為同源的,那麼認為它們為基本上同源的。在一些實施例中,相關段為整個序列。在一些實施例中,相關段為至少10、至少15、至少20、至少25、至少30、至少35、至少40、至少45、至少50、至少55、至少60、至少65、至少70、至少75、至少80、至少85、至少90、至少95、至少100、至少125、至少150、至少175、至少200、至少225、至少250、至少275、至少300、至少325、至少350、至少375、至少400、至少425、至少450、至少475、至少500個或500個以上的殘基。基本一致性:短語「基本一致性」在本文中用於指胺基酸或核酸序列之間的比較。如所屬領域的技術人員將了解,如果兩個序列在對應位置中含有一致殘基,那麼通常認為它們是「基本上一致的」。如此項技術中眾所周知,可以使用多種算法中的任一種來比較胺基酸或核酸序列,包括在商業電腦程式中可獲得的那些算法,如用於核苷酸序列的BLASTN和用於胺基酸序列的BLASTP、間隙BLAST以及PSI-BLAST。示例性所述程序描述於奧特查爾等人,基礎局部比對搜索工具,分子生物學雜誌,215(3):403-410,1990;奧特查爾等人,酶學方法;奧特查爾等人,核酸研究,25:3389-3402,1997;巴謝瓦尼斯等人,生物信息學:基因和蛋白質分析的實用指南,威利出版社,1998;以及密申納等人(編),生物信息學方法和方案(分子生物學方法,第132卷),胡馬納出版社,1999。除識別一致序列以外,上述程序通常還指示一致程度。在一些實施例中,如果兩個序列中在相關段殘基上至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或99%以上的對應殘基為一致的,那麼認為它們為基本上一致的。在一些實施例中,相關段為整個序列。在一些實施例中,相關段為至少10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375、400、425、450、475、500個或500個以上的殘基。罹患:「罹患」疾病、病症或病況(例如DV)的個體已診斷患有所述疾病、病症或病況和/或展現出所述疾病、病症或病況的一或多種症狀。DV感染時常是無症狀的。在一些實施例中,罹患DV的個體已暴露於和/或感染有DV,但不展示DV感染的任何症狀和/或尚未診斷患有DV感染。在一些實施例中,罹患DV的個體是在他/她的血液中具有一或多個DV粒子的個體。易患:「易患」疾病、病症或病況(例如DV)的個體處於發展所述疾病、病症或病況的風險中。在一些實施例中,易患疾病、病症或病況的個體並未展示所述疾病、病症或病況的任何症狀。在一些實施例中,易患疾病、病症或病況的個體尚未診斷出患有所述疾病、病症和/或病況。在一些實施例中,易患疾病、病症或病況的個體是已暴露於與發展所述疾病、病症或病況有關的條件的個體(例如個體已暴露於DV)。在一些實施例中,發展疾病、病症和/或病況的風險是基於人群的風險(例如靜脈內藥物使用者;在開始對捐獻的血液、血液產品和器官進行篩選的1992年之前所述產品的接受者;處理針的醫療工作者;DV感染的母親產下的嬰兒等)。症狀減少:根據本發明,在具體疾病、病症或病況的一或多種症狀的量級(例如強度、嚴重度等)或頻率減少時,「症狀減少」。出於明確的目的,具體症狀的發作延緩被視為降低所述症狀的頻率的一種形式。僅舉幾例,DV的示例性症狀包括(但不限於)發熱的突然發作、高熱(通常超過40℃)、肌肉和關節疼痛、頭痛、嘔吐、腹瀉、出現為皮膚潮紅或麻疹樣皮疹的皮疹、皮下出血斑(由破裂的毛細血管引起的在按壓皮膚時不會消失的紅色小斑點)、從黏膜出血、低白細胞計數、低血小板、代謝酸中毒、來自肝的轉氨酶水平升高、引起血液濃縮(由紅細胞壓積上升指示)和低白蛋白血症的血漿滲漏、胸腔和腹腔中體液積聚(例如胸膜積液或腹水)、胃腸出血、休克和出血、陽性壓脈帶測試、低血壓、腦或心的感染、重要器官(例如肝)的損傷、神經病症(如橫貫性脊髓炎)和/或其組合。本發明不打算僅限於症狀被消除的情況。本發明專門涵蓋治療使得一或多種症狀即使不被徹底消除,也會被減少(且個體的病況由此得到「改善」)。治療劑:如本文中所用,短語「治療劑」是指在投與生物體時引發所需藥理學作用的任何藥劑。在一些實施例中,藥劑在其在適當群體中展示出統計學上顯著的作用時被視為治療劑。在一些實施例中,適當群體可為模型生物體群體。在一些實施例中,適當群體可利用各種準則界定,如某一年齡組、性別、遺傳背景、先前存在的臨床病況等。在一些實施例中,治療劑是可用於緩解、改善、減輕疾病、病症和/或病況的一或多種症狀或特徵、抑制、預防、延緩其發作、降低其嚴重度和/或降低發病率的任何物質。治療有效量:如本文中所用,術語「治療有效量」是指以適用於任何醫學治療的合理的效益/風險比對所治療的個體賦予治療作用的治療性蛋白質的量。治療作用可為客觀的(即,可通過一些測試或標記來測量)或主觀的(即,個體給出作用的指示或感覺到作用)。具體來說,「治療有效量」是指如通過改善與疾病有關的症狀、預防或延緩疾病的發作和/或減輕疾病的症狀的嚴重度或頻率來有效治療、改善或預防所需疾病或病況、或展現可檢測的治療或預防作用的治療性蛋白質或組合物的量。治療有效量通常以可能包含多個單位劑量的給藥方案來投與。對於任何具體治療性蛋白質來說,治療有效量(和/或在有效給藥方案內的適當單位劑量可例如視投藥途徑、與其它醫藥劑的組合而變化。用於任何具體患者的特定治療有效量(和/或單位劑量)也可以視多種因素而定,包括所治療的病症和病症的嚴重度;所用特定醫藥劑的活性;所用的特定組合物;患者的年齡、體重、一般健康狀況、性別和飲食;投藥時間、投藥途徑和/或所用特定融合蛋白的排洩或代謝速率;治療持續時間;和如醫學技術中熟知的類似因素。治療:如本文中所用,術語「治療(treatment)」(還有「治療(treat)」或「治療(treating)」)是指物質(例如所提供的組合物)的任何投與部分或完全地將具體疾病、病症和/或病況(例如DV)的一或多種症狀、特徵和/或病因緩解、改善、減輕、抑制、延緩發作、降低嚴重度和/或降低發病率。所述治療可為對並未展現相關疾病、病症和/或病況的徵象的個體的治療和/或對僅展現疾病、病症和/或病況的早期徵象的個體的治療。可替代地或另外,所述治療可為對展現相關疾病、病症和/或病況的一或多種確立徵象的個體的治療。在一些實施例中,治療可為對已診斷為罹患相關疾病、病症和/或病況的個體的治療。在一些實施例中,治療可為對已知具有一或多種在統計學上與相關疾病、病症和/或病況發展風險增加相關的易感性因素的個體的治療。單位劑量:如本文所用的表述「單位劑量」是指以醫藥組合物的單個劑量形式和/或在其物理上分散的單位中投與的量。在許多實施例中,單位劑量含有預定數量的活性劑。在一些實施例中,單位劑量含有整個單一劑量的藥劑。在一些實施例中,投與一個以上單位劑量以實現總的單一劑量。在一些實施例中,需要或預期需要投與多個單位劑量以便實現既定作用。單位劑量可為例如含有預定數量的一或多種治療劑的一定體積的液體(例如可接受的載劑)、呈固體形式的預定量的一或多種治療劑、含有預定量的一或多種治療劑的持續釋放調配物或藥物遞送裝置等。應了解,單位劑量可以除了治療劑之外還包括多種組分中的任一者的調配物形式存在。舉例來說,可接受的載劑(例如醫藥學上可接受的載劑)、稀釋劑、穩定劑、緩衝劑、防腐劑等可如下文所述包括在內。所屬領域的技術人員應了解,在許多實施例中,具體治療劑的總的適當日劑量可包含部分或多個單位劑量,且可例如由主治醫師在合理的醫學判斷範圍內決定。在一些實施例中,對於任何具體個體或生物體的特定有效劑量水平可視多種因素而定,包括所治療的病症和病症的嚴重度;所用特定活性化合物的活性;所用的特定組合物;個體的年齡、體重、一般健康狀況、性別和飲食;投藥時間和所用特定活性化合物的排洩速率;治療持續時間;與所用特定化合物組合或同時使用的藥物和/或其它療法和醫療領域中熟知的類似因素。疫苗接種:如本文中所用,術語「疫苗接種」是指投與一種打算例如對引起疾病的試劑產生免疫反應的組合物。出於本發明的目的,疫苗接種可在暴露於引起疾病的試劑之前、期間和/或之後投與,且在某些實施例中,疫苗接種可在暴露於所述藥劑之前、期間和/或之後立即投與。在一些實施例中,疫苗接種包括間隔適當時間的接種疫苗組合物的多次投與。載體:如本文中所用,「載體」是指一種核酸分子,其能夠轉運其所結合的另一核酸。在一些實施例中,載體能夠在如真核細胞和/或原核細胞等宿主細胞中染色體外複製和/或表達其所連接的核酸。能夠引導可操作性連接的基因的表達的載體在本文中稱為「表達載體」。野生型:如本文中所用,術語「野生型」具有其在此項技術中所理解的含義,其是指具有如在自然界中發現的呈「正常」(如與突變體、患病者、改變者等形成對比)狀態或情形的結構和/或活性的實體。所屬領域的技術人員將了解,野生型基因和多肽通常以多種不同形式(例如等位基因)存在。DV命名法所屬領域的技術人員眾所周知,DV命名法通常使用代表DV基因型的羅馬數字(例如「I」、「II」、「III」、「IV」等)或阿拉伯數字(例如「1」、「2」、「3」、「4」等)和代表DV亞型的小寫字母(例如「a」、「b」等)。儘管命名法規則在此項技術中被普遍接受,但所屬領域的技術人員認識到命名法規則在出版物、演示、對話等中並不始終被嚴格地遵循。因此,所屬領域的技術人員應認識到,其例如暗示「DVIa」、「DV基因型Ia」、「DV亞型Ia」、「DV1a」、「DV基因型1a」和「DV亞型1a」可由所屬領域的技術人員可互換地使用,且所有這六種術語均打算指DV基因型I亞型a。如本文中所用,羅馬數字(例如「I」、「II」、「III」、「IV」等)或阿拉伯數字(例如「1」、「2」、「3」、「4」等)用於指DV基因型,且小寫字母(例如「a」、「b」等)用於指DV亞型。還應理解,在本文中提及具體基因型的DV時,其意欲涵蓋所命名的基因型的所有亞型。僅舉一例,「基因型I」在本文中用於指基因型I的所有亞型(例如基因型I亞型a;基因型I亞型b;等)。如本文中所用,應理解在基因型和亞型名稱之後呈現的任何羅馬數字(例如「I」、「II」、「III」、「IV」等)是指DV病毒株。另外,在基因型和亞型名稱之後呈現的任何阿拉伯數字(例如「1」、「2」、「3」、「4」等)是指DV病毒株。某些實施例的具體實施方式本發明提供具有具體結構和/或功能特徵的適用的抗DV抗體藥劑以及與所述抗體藥劑相關的組合物和方法。登革病毒(DV)感染DV感染代表一種主要的節肢動物傳播的病毒疾病,有超過35億人生活在疾病風險地區,且每年全世界有超過2億起感染,引起21,000例死亡。值得注意的是,所報導的登革病毒感染的每年平均數、地域拓展和疾病的嚴重度近年來均顯著增加。登革病毒流行可以造成顯著的發病率,產生大量的經濟花費和醫療保健影響(古茲曼等人,2010自然評論·微生物學8:S7-16)。DV感染是由主要通過埃及伊蚊傳播的四種相關病毒中的任一者引起的並且流行於熱帶和亞熱帶地區。哺乳動物中的感染是通過在經感染的伊蚊屬蚊子吸血期間注入DV引發的,由此DV主要沉積在血管外組織中。DV在蚊子叮咬之後的潛伏期是在3天到14天之間。樹突狀細胞、單核細胞和巨噬細胞是DV的首個目標。在皮膚和淋巴節中的最初複製之後,DV在急性發熱階段過程中出現在血液中,通常是3到5天。登革病毒感染的常規實驗室診斷是基於DV的分離和/或對DV具有特異性的抗體的檢測。感染可以引起數種不同的綜合症,受到經感染個體的年齡和/或免疫狀態影響。原發DV感染可能是無症狀的或可能引起登革熱。登革熱的特徵在於通常具有兩個階段的高熱和至少一種其它症狀,如頭痛(通常為重度的);多個身體部分(例如眼睛、關節、肌肉、骨、腹部)中的任一者的疼痛(其可為重度的);皮膚出疹或皮疹;輕度出血表現(例如鼻或牙齦出血、皮下血斑症、容易瘀傷);淋巴結病;嘔吐;變色(黑色)糞便;情緒影響(如疲勞、嗜眠或易怒);蒼白、冷或溼冷的皮膚;呼吸困難;白細胞計數低;一或多種生物體組織(例如血液、骨髓等)和/或器官(例如肝)中有循環病毒粒子(參見例如疾病控制中心介紹(CenterforDiseaseControldescription);也參見US2011/0189226)。時常發生白細胞和血小板數減少。出血性登革熱(DHF)是DV感染的一種潛在致命的併發症。DHF的特徵在於極度嗜睡和嗜眠,伴隨著與登革熱有關的高熱和其它症狀。增加的血管滲透性和異常的內穩定可以引起血容量減少、低血壓,且在嚴重情況下引起低血容性休克和內出血。在出血性登革熱的發生中似乎起主要作用的兩個因素是:伴有高水平病毒血症的快速病毒複製;和伴有高水平炎性介體釋放的重大炎症反應。在不治療的情況下,出血性登革熱的死亡率可達到10%。兒童尤其易受DV感染的影響,所述影響可在反覆暴露的情況下顯著增強。在初次登革病毒感染期間,大部分兒童經歷亞臨床感染或輕度未分型的發熱綜合症。在二次登革病毒感染期間,疾病的病理生理學通常顯著改變。連續感染可以引起被稱為登革休克症候群(DSS)的急性血管滲透性綜合症。DSS通常是DHF的進展且時常是致命的。DSS的特徵在於快速和低容積脈搏、低血壓、肢體發冷和坐立不安。在無醫學幹預的情況下,DSS的死亡率可以達到40%-50%(蒂利耶(Thullier)等人,1999生物技術雜誌(JournalofBiotechnology)69:183-190)。DSS的嚴重度是年齡相關的,且血管滲漏在幼齡兒童中最為嚴重。成人中的DV感染通常伴隨著可導致嚴重出血的出血傾向。DV感染在其發生於患有哮喘、糖尿病和/或其它慢性疾病的個體時可危及生命(古茲曼等人,2010自然評論·微生物學8:S7-16)。所提出的闡明二次DV病例中嚴重疾病風險增加的主要理論為抗體依賴性增強(ADE)。登革病毒(DV)展示出對每一血清型獨特的抗體表位以及血清型之間或當中共有的表位。已經歷初次DV感染(並且從其恢復)的個體可產生與所有DV血清型(DV1-4)交叉反應的穩健抗體反應。然而,儘管有交叉反應性,但抗體僅通過相同(同源)血清型預防再感染,並且個體易受不同(異源)血清型的後續感染。經歷新血清型的二次登革感染的個體面臨遠為更大的發展DHF的風險,指示預先存在的對DV的免疫性可以加重疾病。DV的ADE理論假定來自第一次感染的弱中和抗體結合於第二血清型並且增強攜有FcγR的骨髓細胞(如單核細胞和巨噬細胞)的感染(瓦哈拉(Wahala)等人,2011病毒(Viruses)3:2374-2395)。已提出至少三種類型的機制來闡明DV感染的嚴重形式的發展:(i)其可能由特別毒性的病毒株引起;(ii)預先存在的亞中和抗體可增強單核細胞或巨噬細胞對DV的抗體介導的攝取,所述單核細胞或巨噬細胞被稱為DV的宿主細胞(例如ADE);和(iii)針對病毒的非結構蛋白(NS1)的抗體可能與纖維蛋白原、凝血細胞和內皮細胞交叉反應,由此觸發出血。目前,不存在對登革熱的特定治療。推薦療法解決症狀,並且包括臥床休息、經由退熱劑和/或鎮痛劑控制發熱和疼痛以及充分補水。努力集中於平衡體液損失、置換凝血因子以及輸注肝素。DV的序列和抗原變異性已對開發有效疫苗或治療劑的努力形成挑戰(懷特黑德(Whitehead)等人.,2007自然評論·微生物學(NatureReviewsMicrobiology)5:518-528)。令人遺憾的是,主要疫苗候選物近來在II期研究中展示出僅30%的保護功效(託馬斯(Thomas)等人,2011當前傳染病觀點(CurrOpInfectiousDisease)24:442-450;沙差龍(Sabchareon)等人,2012柳葉刀(Lancet)380(9853):1559-1567)。因此,需要發展改進的DV療法、疫苗。尤其有價值的將是發展適用於所有DV血清型的治療。所述療法將對人類健康(尤其在發展中國家中)具有巨大影響。DV抗原DV感染是由四種病毒(DV1-4)引起的,這四種病毒具有類似的血清學類型但在抗原上不同。DV是屬於黃病毒科內的黃病毒屬的正義單股RNA病毒。病毒粒子包含直徑為40-50nm的球形粒子,其具有脂多糖包膜。長度約11kb的RNA基因組包含5'I型端但缺乏3'聚A尾。基因組的組織包含以下元件:5'非編碼區(NCR)、編碼結構蛋白(衣殼(C)、前膜/膜(prM/M)、包膜(E))的區域和編碼非結構蛋白(NS1-NS2A-NS2B-NS3-NS4A-NS4B-NS5)的區域以及3'NCR。病毒基因組RNA與衣殼蛋白結合以形成核殼體。作為黃病毒的典型,登革病毒基因組編碼不間斷編碼區,其翻譯成會經翻譯後加工的單一多蛋白。DV的重要生物特性(包括受體結合、紅細胞血凝、誘導中和抗體以及保護性免疫反應)與E蛋白相關(瓦哈拉等人,2011病毒3:2374-2395)。PrM蛋白,一種約19kDa的糖蛋白,含有形成三個二硫橋鍵的六個高度保守的半胱氨酸殘基,且在成熟期間利用弗林蛋白酶(furin)或弗林蛋白酶樣蛋白酶裂解成Pr和M蛋白。NS1蛋白質,也是一種約40kDa的糖蛋白,含有形成六個二硫橋鍵的12個高度保守的半胱氨酸殘基,且存在於細胞內、細胞表面上和細胞外部(賴(Lai)等人,2008病毒學雜誌(JournalofVirology)82(13):6631-43)。E蛋白,一種約55kDa的糖蛋白,含有形成六個二硫橋鍵的12個嚴格保守的半胱氨酸殘基,且在病毒粒子成熟之前作為與PrM蛋白的雜二聚體存在。E蛋白的胞外域的X射線晶體學研究已揭示了利用一個螺旋杆錨和兩個反向平行跨膜域連接於病毒膜的三個不同的β-桶域。域III(EDIII)採用免疫球蛋白樣摺疊,且已表明在受體相互作用中起到關鍵作用。域II(EDII)是由兩個長的指狀結構組成的細長域且在頂端含有高度保守的13個胺基酸融合環(EDII-FL)並且參與E蛋白的膜融合和二聚化。E的中央域(域I;EDI)是九股β-桶,其分別利用一個和四個柔性連接子連接於EDIII和EDII。E蛋白對於在黃病毒生命周期期間的病毒裝配、受體連接、進入、病毒融合以及可能的免疫逃避來說很重要,並且因此是在病毒粒子上採用數種不同構象和排列所需的動態蛋白。此外,E蛋白是中和與增強抗體兩者的主要目標(賴等人,2008病毒學雜誌82:6631-6643;皮爾遜(Pierson)等人,2008細胞宿主和微生物(CellHost&Microbe)4:229-38)。DV裝配在內質網(ER)的膜上,且病毒以不成熟病毒粒子形式出芽到ER的管腔中。不同於具有平滑表面的成熟病毒粒子,出芽到ER中的不成熟病毒粒子具有由在病毒包膜上形成六十個具有二十面體對稱性的釘狀突起的E/prM雜二聚體的三聚體形成的粗糙表面(佩雷拉(Perera)等人,2008抗病毒研究(Antivir.Res.)8011-22)。每個三聚體的E蛋白遠離病毒粒子的表面突出且經由包括融合環的EDII的遠端與prM相互作用。不成熟病毒粒子上的PrM限制E蛋白在病毒外溢期間在低pH高爾基體衍生的分泌區室中經歷寡聚重排的能力,由此預防過早和不定的融合(吉拉庫(Guirakhoo)等人,1991病毒學雜誌(JournalofVirology)72:1323-1329;海因茨(Heinz)等人,1994病毒學雜誌198(1):109-117)。隨著不成熟病毒粒子經由跨高爾基體網絡(TGN)的酸性區室運輸,prM和E蛋白的取向變化揭露了細胞絲氨酸蛋白酶弗林蛋白酶的位點。在此低pH環境中,不成熟病毒粒子的E蛋白形成了抵著病毒粒子表面平放的反向平行二聚體且經安排具有T=3準二十面體對稱性(餘(Yu)等人,2009病毒學雜誌83(23):12101-12107)。prM蛋白繼續掩蔽EDII的融合環直到其在弗林蛋白酶裂解之後被釋放為止,且在胞外空間發生pH轉變到中性。所得成熟和感染性的病毒是由90個E蛋白二聚體和約70個胺基酸M蛋白的180個拷貝組成的相對光滑粒子。在此構型中,成熟DV上的E蛋白存在於由其與2重、3重或5重對稱軸的接近性界定的三個不同環境中(庫恩(Kuhn)等人,2002細胞(Cell)108:717-25)。因此,所有E蛋白亞基並不在病毒表面上的相同環境中,且空間和其它考量引起一些E亞基相較於其它E亞基與受體和抗體優先相互作用。識別E蛋白上高度保守融合環的抗體展示出對所有四種DV血清型的廣泛反應性;然而,其中和效力通常是有限的,可能歸因於此表位在成熟DV中基本上是不可到達的。識別E蛋白域III(EDIII)的'A'β股的一些抗體已展示出強力中和特定DV病毒株,但已知不針對所有四種血清型有效(洛克(Lok)等人,自然·結構與分子生物學(NatureStructural&MolecularBiol.)15:312-317)。'A'β股是定在EDIII上的位置305-308(DV3編號)中心處的亞複合表位的一部分。如本文中所述,本發明涵蓋以下發現:E抗原,且尤其是EDIII域可以充當適用於廣譜抗DV抗體藥劑的抗原目標。本發明尤其展示結合於E抗原(例如EDIII域)但不中和所有DV血清型的抗體可經合理地工程化,從而製造中和所有DV血清型1-4的變異體和/或其它抗體藥劑(參見例如圖3)。此外,本發明展示結合於E抗原(例如EDIII域)並中和一些但非所有DV血清型的抗體可經合理地工程化,從而製造變異體和/或其它抗體藥劑,所述變異體和/或其它抗體藥劑與親本抗體相比具有針對一或多種具體病毒株和/或血清型的獲得的中和活性,且與親本抗體相比不顯著耗乏其針對某些其它病毒株和/或亞型的活性。4E11抗體抗體已被證實為一類有效的抗病毒治療劑,在某種程度上歸因為其較高生物化學特異性和其已獲確認的安全性記錄。另外,抗體具有較長的血清半衰期(約21天),使得能夠在人中預防性使用,一種對於展示快速爆發的傳染性疾病(包括登革病毒)尤其需要的應用。保護對抗黃病毒感染的抗體被認為經由多種機制起作用,包括以下各者中的一或多者:(1)直接中和受體結合,(2)抑制病毒融合,(3)Fc-γ-受體依賴性病毒清除,(4)補體介導的病毒或經感染細胞的裂解,以及(5)經感染細胞的抗體依賴性細胞毒性(皮爾遜(Pierson)等人,2008細胞宿主和微生物(CellHost&Microbe)4:229-38)。黃病毒中和被認為需要通過多個抗體結合(道得(Dowd)等人,2011病毒學(Virology)411:306-15)。使用E16(一種在連接後階段中和西尼羅河病毒(WestNilevirus)的EDIII結合mAb)的研究指示需要約30個抗體來結合以實現有效中和。研究表明,抗體結合的親和力和可到達的表位總數兩者促成抗體的中和效力。因此,即使對於以高親和力結合的抗體來說,如果可到達的表位數目低於中和所需的特定水平,則抗體仍將無法中和。相反地,如果許多表位是可到達以結合的,那麼可中和較低親和力抗體。如已注意到,登革病毒(DV)展示出對每一血清型獨特的抗體表位和血清型之間共有的表位。大多數為了理解抗體如何中和或增強DV而進行的研究已使用小鼠單克隆抗體(mAb)進行。由於E蛋白是病毒粒子表面上暴露的主要抗原,故結合於E蛋白的小鼠mAb已成為許多分析的焦點。儘管中和性小鼠mAb已映射到所有三個域,但最強力的中和性mAb是血清型特異性的並且結合於EDIII(其從病毒粒子表面突出)。EDIII上指示側脊和A股表位的兩個部分重疊表位是中和DV的小鼠mAb的主要目標。側脊表位與血清型特異性強力中和抗體相互作用。舉例來說,mAb3H5映射到DV血清型2的EDIII-LR,且由這些mAb識別的表位定位於A股(胺基酸304)和FG環(殘基383和384)兩者上(蘇庫波爾維-佩蒂(Sukupolvi-Petty)等人,2007病毒學雜誌(JournalofVirology)81(23):12816-12826)。然而,並非所有結合EDIII的抗體均展現出類型特異性中和活性。結合於A股表位的mAb與DV的一種以上血清型交叉反應,且稱為登革病毒亞複合體中和mAb。舉例來說,亞複合體特異性mAb1A1D-2識別在EDIII的側表面的A股中心處的表位,且可以通過DV血清型1-3(DV1-3)而非DV血清型4(DV4)中和感染(洛克等人,2008自然·結構與分子生物學15(3):312-317;勒裡希(Roehrig)等人,1998病毒學(Virology)246(2):317-328;蘇庫波爾維-佩蒂等人,2007病毒學雜誌81(23):12816-12826)。已經研究了這種mAb特異性的分子基礎;在1A1D-2表位中心處的三個殘基中僅一者在所有四種DV血清型(DV1-4)之中保守。還通過廣泛地中和交叉反應性DVmAb4E11來識別類似的A股表位(蒂利耶(Thullier)等人,2001普通病毒學雜誌(JournalGenVirol.)82(8):1885-1892)。然而,迄今為止,實驗方法未能得到能夠強力中和所有四種DV血清型的抗體。一種在E糖蛋白的EDIII內結合的稱為4E11的特定鼠類單克隆抗體展示出針對DV血清型1-4的強力中和活性。4E11結合於E糖蛋白的DVEDIII上的構象表位並與所有四種血清型交叉反應。4E11通過幹擾與宿主細胞連接而強力中和DV1-3。然而,其對DV4的親和力不佳,並且因此中和活性較弱。分泌小鼠單克隆抗體4E11的雜交瘤細胞系已寄存在美國典型培養物保藏中心(AmericanTypeCultureCollection,ATCC),登錄號:HB-9259。野生型(「wt」)4E11重鏈(HC;SEQIDNO.1)和輕鏈(LC;SEQIDNO.2)的序列是已知的。野生型4E11框架(FR)和互補決定區(CDR)的序列是已知的(野生型4E11HCFR1是SEQIDNO.3,野生型4E11HCFR2是SEQIDNO.4,野生型4E11HCFR3是SEQIDNO.5,野生型4E11HCFR4是SEQIDNO.6,野生型4E11HCCDR1是SEQIDNO.7,野生型4E11HCCDR2是SEQIDNO.8,野生型4E11HCCDR3是SEQIDNO.9;野生型4E11LCFR1是SEQIDNO.10,野生型4E11LCFR2是SEQIDNO.11,野生型4E11LCFR3是SEQIDNO.12,野生型4E11LCFR4是SEQIDNO.13,野生型4E11LCCDR1是SEQIDNO.14,野生型4E11LCCDR2是SEQIDNO.15,野生型4E11LCCDR3是SEQIDNO.16)。SEQIDNO.1:EVKLLEQSGAELVKPGASVRLSCTASGFNIKDTYMSWVKQRPEQGLEWIGRIDPANGDTKYDPKFQGKATITADTSSNTAYLHLSSLTSGDTAVYYCSRGWEGFAYWGQGTLVTVSASEQIDNO.2:ELVMTQTPASLAVSLGQRATISCRASENVDRYGNSFMHWYQQKAGQPPKLLIYRASNLESGIPARFSGSGSRTDFTLTINPVEADDVATYFCQRSNEVPWTFGGGTKLLIKRSEQIDNO.3:EVKLLEQSGAELVKPGASVRLSCTASSEQIDNO.4:YMSWVKQRPEQGLEWIGRISEQIDNO.5:TKYDPKFQGKATITADTSSNTAYLHLSSLTSGDTAVYYCSRSEQIDNO.6:WGQGTLVTVSASEQIDNO.7:CFNIKDTSEQIDNO.8:DPANGDSEQIDNO.9:GWEGFAYSLQIDNO.10:ELVMTQTPASLAVSLGQRATISCSEQIDNO.11:WYQQKAGQPPKLLIYSEQIDNO.12:GIPARFSGSGSRTDFILTINPVEADDVATYFCSEQIDNO.13:FGGGTKLEIKRSEQIDNO.14:RASENVDRYGNSFMHSEQIDNO.15:RASNLESSEQIDNO.16:QRSNEVPWT本發明涵蓋所希望的是開發作為野生型4E11的變異體的抗體(或其它抗體藥劑)的認識。本發明尤其提供所述抗體和抗體藥劑。也就是說,本發明提供各種抗體藥劑,其展示出與4E11的顯著結構一致性且此外展示出與在野生型4E11下觀察到的功能特徵相比改進的功能特徵(例如DV4的中和)。本發明為對接抗原-抗體相互作用提供新穎評分量度。評分量度框架根據在分子間界面中觀察到的物理化學特徵和成對胺基酸相互作用傾向對蛋白質-蛋白質界面進行評級。本發明使用這一框架來修改現有抗體的特性。在一些實施例中,修改抗體對其抗原的特異性和親和力。在一些實施例中,經修飾的抗體為單克隆抗體。在一些實施例中,公開於本發明中的框架用於工程化對抗DV中和單抗的更廣泛特異性和親和力。使用對接模型,檢查抗DV抗體結合於DV的所有四種血清型(DV1-4)的模式,並鑑別這些抗體對DV4的不佳親和力的結構基礎。在這些抗體的互補位上小心設計突變以改進其對DV4的親和力,並由此改進其對DV4的中和活性,同時維持對DV1-3的親和力和中和活性。為了設計突變,一次一個小心地檢查單抗的CDR環殘基。在給定CDR位置處,除甘氨酸(Gly)和脯氨酸(Pro)以外,「野生型」殘基系統地經其餘胺基酸取代,且使用統計成對傾向在每一實例處評估置換的概率。Gly和Pro殘基不經修飾以避免主鏈構象的變化。將具有高置換可能性的單一突變模型化,且計算地再評估以尋找這樣的突變:(1)不改變值;(2)不掩埋極性基團;和(3)改進H鍵、鹽橋、範德華力(vanderWaals)、疏水性接觸和堆積。使用高通量間接酶聯免疫吸附分析(ELISA)方法來篩選通過計算方法鑑別的有前景的單一突變,從而鑑別改進對DV4EDIII的親和力同時維持對DV1-3EDIII的親和力的陽性突變。最後,將陽性單一突變組合以合理地設計高親和力抗體。進行競爭ELISA實驗以測定工程化的抗體與來自四種血清型中的每一者的EDIII之間在平衡和呈溶解狀態時的親和力。使用表面等離子體子共振(SPR)分析驗證結合測量值。在一些實施例中,針對A股表位的抗體可經工程化以結合於DV的所有四種血清型。在一些實施例中,野生型4E11抗DV抗體經修飾以改進其對DV4的親和力,且由此改進其對DV4的中和活性,同時維持對DV1-3的親和力。在一些實施例中,經工程化的抗體中的一者在對DV2和DV4的EDIII的親和力方面分別展示出約15和約450倍改進,同時維持對DV1和DV3的EDIII的原始親和力。在一些實施例中,與野生型mAb4E11相比,經工程化的抗體對DV4展示出>75倍增加的中和潛力,同時仍維持對其它血清型的「野生型」活性。根據本發明的工程化的4E11抗體代表了令人感興趣的治療登革疾病的治療性抗體的候選物。抗體4E5A一種在E糖蛋白的EDIII內結合的稱為4E5A的特定鼠類單克隆抗體展示出針對DV血清型1-4的強力中和活性。4E5A結合於E糖蛋白的DVEDIII上的構象表位並與所有四種血清型交叉反應。4E5A通過幹擾與宿主細胞連接而強力中和DV1-4。與前身抗體E411比較,4E5A具有五個突變,四個在輕鏈(VL)中且一個在重鏈(VH)中。下文呈現4E5A框架(FR)和互補決定區(CDR)的序列(4E5AHCFR1為SEQIDNO.31,4E5AHCFR2為SEQIDNO.32,4E5AHCFR3為SEQIDNO.33,4E5AHCFR4為SEQIDNO.34,4E5AHCCDR1為SEQIDNO.35,4E5AHCCDR2為SEQIDNO.36,4E5AHCCDR3為SEQIDNO.37;4E5ALCFR1為SEQIDNO.38,4E5ALCFR2為SEQIDNO.39,4E5ALCFR3為SEQIDNO.40,4E5ALCFR4為SEQIDNO.41,4E5ALCCDR1為SEQIDNO.42,4E5ALCCDR2為SEQIDNO.43,4E5ALCCDR3為SEQIDNO.44)。SEQIDNO.29:EVKLLEQSGAELVKPGASVRLSCTASGFNIKDTYMSWVKQRPEQGLEWIGRIDPENGDTKYDPKFQGKATTTADTSSNTAYLHLSSLTSGDTAVYYCSRGWEGFAYWGQGTLVTVSASEQIDNO.30:FLVMTQTPASLAVSLGQRATISCRASENVDKYGNSFMHWYQQKAGQPPKLLIYRASELQWGIPARFSGSGSRTDFTLTINPVEADDVATYFCQRSNEVPWTFGGGTKLEIKRSEQIDNO.31:EVKLLEQSGAELVKPGASVRLSCTASSEQIDNO.32:YMSWVKQRPEQGLEWIGRISEQIDNO.33:TKYDPKFQGKATTTADTSSNTAYLHLSSLTSGDTAVYYCSRSEQIDNO.34:WGQGTLVTVSASEQIDNO.35:GFNIKDTSEQIDNO.36:DPENGDSLQIDNO.37:GWEGFAYSEQIDNO.38:ELVMTQTPASLAVSLGQRATISCSEQIDNO.39:WYQQKAGQPPKLLIYSEQIDNO.40:GIPARFSGSGSRTDFTLTINPVEADDVATYFCSEQIDNO.41:FGGGTKLEIKRSEQIDNO.42:RASENVDKYGNSFMHSEQIDNO.43:RASELQWSEQIDNO.44:QRSNEVPWT本發明涵蓋所希望的是開發作為野生型4E5A的變異體的抗體(或其它抗體藥劑)的認識。本發明尤其提供所述抗體和抗體藥劑。也就是說,本發明提供各種抗體藥劑,其展示出與4E5A的顯著結構一致性且此外展示出與在野生型4E5A下觀察到的功能特徵相比改進的功能特徵(例如DV4的結合和中和)。使用以上部分中描述的對接模型,檢查抗DV抗體與DV的所有四種血清型(DV1-4)的結合模式,且鑑別這些抗體對DV4的較差親和力的結構基礎。在這些抗體的互補位上小心設計突變以改進其對DV4的親和力,並由此改進其對DV4的中和活性,同時維持對DV1-3的親和力和中和活性。為了設計突變,一次一個小心地檢查單抗的CDR環殘基。在給定CDR位置處,除甘氨酸(Gly)和脯氨酸(Pro)以外,「野生型」殘基系統地經其餘胺基酸取代,且使用統計成對傾向在每一實例處評估置換的概率。Gly和Pro殘基不經修飾以避免主鏈構象的變化。將具有高置換可能性的單一突變模型化,且計算地再評估以尋找這樣的突變:(1)不改變值;(2)不掩埋極性基團;和(3)改進H鍵、鹽橋、範德華力(vanderWaals)、疏水性接觸和堆積。使用高通量間接酶聯免疫吸附分析(ELISA)方法來篩選通過計算方法鑑別的有前景的單一突變,從而鑑別改進對DV4EDIII的親和力同時維持對DV1-3EDIII的親和力的陽性突變。最後,將陽性單一突變組合以合理地設計高親和力抗體。進行競爭ELISA實驗以測定工程化的抗體與來自四種血清型中的每一者的EDIII之間在平衡和呈溶解狀態時的親和力。使用表面等離子體子共振(SPR)分析驗證結合測量值。在一些實施例中,針對A股表位的抗體可經工程化以結合於DV的所有四種血清型。在一些實施例中,野生型4E5A抗DV抗體經修飾以改進其對DV4的親和力,且由此改進其對DV4的中和活性,同時維持對DV1-3的親和力。在一些實施例中,經工程化的抗體中的一者在對DV4的EDIII的親和力方面展示出約8.75倍改進,同時維持(或改進)對DV1、DV2和DV3的EDIII的原始親和力。根據本發明的工程化的4E5A抗體代表了令人感興趣的治療登革疾病的治療性抗體的候選物。所提供的變異DV抗體藥劑應了解,所提供的抗體藥劑可以改進抗體藥劑的特徵和/或活性的方式工程化、產生和/或純化。舉例來說,所提供的抗體藥劑的改進的特徵尤其包括(但不限於)增加的穩定性、改進的結合親和力和/或親合力、增大的結合特異性、增加的產生、減少的聚集、減少的非特異性結合。一般來說,如本文中所述,所提供的抗體藥劑可以為或包括例如多克隆抗體;單克隆抗體或其抗原結合片段;經修飾的抗體,如嵌合抗體、再成形抗體、人類化抗體或其片段(例如Fab'、Fab、F(ab')2);或生物合成抗體,例如單鏈抗體、單域抗體(DAB)、Fv、單鏈Fv(scFv)等。製造和使用多克隆和單克隆抗體的方法例如描述在哈洛(Harlow)等人,使用抗體:實驗室手冊:可攜式方案I(UsingAntibodies:ALaboratoryManual:PortableProtocolI).冷泉港實驗室(ColdSpringHarborLaboratory)(1998年12月1日)中。製造經修飾的抗體藥劑(如抗體和抗體片段(例如嵌合抗體、再成形抗體、人類化抗體或其片段,例如Fab'、Fab、F(ab')2片段);或生物合成抗體(例如單鏈抗體、單域抗體(DAB)、Fv、單鏈Fv(scFv)等))的方法為此項技術中已知且可見於例如左拉(Zola),單克隆抗體:單克隆抗體和工程化抗體衍生物的製備和使用(MonoclonalAntibodies:PreparationandUseofMonoclonalAntibodiesandEngineeredAntibodyDerivatives),斯普林格出版社(SpringerVerlag)(2000年12月15日;第1版)中。本發明提供結合於DV的所有四種血清型(DV1-4)的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以與另一抗體對DV1的親和力相比更高的親和力結合於DV1。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以與另一抗體對DV2的親和力相比更高的親和力結合於DV2。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以與另一抗體對DV3的親和力相比更高的親和力結合於DV3。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以與另一抗體對DV4的親和力相比更高的親和力結合於DV4。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以與另一抗體對DV1、DV2、DV3和DV4的親和力相比更高的親和力結合於DV1、DV2、DV3和DV4。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以與另一抗體對這些DV血清型的親和力相比更高的親和力結合於DV4,且保持對DV1、DV2和DV3的結合親和力。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以與另一抗體對這些DV血清型的親和力相比更高的親和力結合於DV1和DV4。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑以與另一抗體對這些DV血清型的親和力相比更高的親和力結合於DV1和DV4,且保持其對DV2和DV3的結合親和力。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以與另一抗體對這些DV血清型的親和力相比更高的親和力結合於DV2和DV4。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑以與另一抗體對這些DV血清型的親和力相比更高的親和力結合於DV2和DV4,且保持其對DV1和DV3的結合親和力。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以與另一抗體對這些DV血清型的親和力相比更高的親和力結合於DV3和DV4。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑以與另一抗體對這些DV血清型的親和力相比更高的親和力結合於DV3和DV4,且保持其對DV1和DV2的結合親和力。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑以與不同抗體對DV1-4中的一或多者的親和力相比至少5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%或90%以上的親和力結合於DV1-4中的一或多者。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑以與不同抗體對DV1-4中的一或多者的親和力相比至少2倍、至少5倍、至少10倍、至少20倍、至少30倍、至少40倍、至少50倍、至少60倍、至少70倍、至少80倍、至少90倍、至少100倍、至少200倍、至少300倍、至少400倍、至少500倍或500倍以上親和力的親和力結合於DV1-4中的一或多者。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑對不同DV血清型展示出在彼此親和力的2倍以內、5倍以內、10倍以內、25倍以內、50倍以內、100倍以內、150倍以內、200倍以內、250倍以內、300倍以內、350倍以內或400倍以內的結合親和力。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示在如本文中所述和/或示例的範圍內的中和IC50(μg/ml)。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示下限為約0.05μg/ml且上限為約10μg/ml的中和IC50(μg/ml)。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示中和IC50(μg/ml),其下限選自由以下組成的群組:0.05μg/ml、0.1μg/ml、0.2μg/ml、0.3μg/ml、0.4μg/ml、0.5μg/ml、0.6μg/ml、0.7μg/ml、0.8μg/ml、0.9μg/ml、1.0μg/ml、1.1μg/ml、1.2μg/ml、1.3μg/ml、1.4μg/ml、1.5μg/ml、1.6μg/ml、1.7μg/ml、1.8μg/ml、1.9μg/ml、2.0μg/ml、2.5μg/ml、3.0μg/ml、3.5μg/ml、4.0μg/ml、4.5μg/ml、5.0μg/ml或5.0μg/ml以上,且其上限比下限高且選自由以下組成的群組:1.5μg/ml、1.6μg/ml、1.7μg/ml、1.8μg/ml、1.9μg/ml、2.0μg/ml、2.5μg/ml、3.0μg/ml、3.5μg/ml、4.0μg/ml、4.5μg/ml、5.0μg/ml、5.5μg/ml、6.0μg/ml、6.5μg/ml、7.0μg/ml、7.5μg/ml、8.0μg/ml、8.5μg/ml、9.0μg/ml、9.5μg/ml、10.0μg/ml或10.0μg/ml以上。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示以一定的KD(nM)結合於DV1-4,所述KD低於40000nM、低於30000nM、低於20000nM、低於10000nM、低於5000nM、低於2000nM、低於1500nM、低於1000nM、低於500nM、低於250nM、低於225nM、低於200nM、低於175nM、低於150nM、低於125nM、低於100nM、低於75nM、低於50nM、低於25nM、低於15nM、低於10nM、低於5nM、低於2.5nM、低於1nM、低於0.5nM、低於0.25nM、低於0.1nM。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示以下限為約0.01×105M-1s-1且上限為約5.0×106M-1s-1的Kon(M-1s-1)結合於DV1-4。在一些實施例中,所提供的抗體展示以一定的Kon(M-1s-1)結合於DV1-4,所述Kon的下限選自由以下組成的群組:0.01×105M-1s-1、0.05×105M-1s-1、0.1×105M-1s-1、0.5×105M-1s-1、1.0×105M-1s-1、2.0×105M-1s-1、5.0×105M-1s-1、7.0×105M-1s-1或7.0×105M-1s-1以上,且其上限比下限高且選自由以下組成的群組:1.0×106M-1s-1、1.5×106M-1s-1、2.0×106M-1s-1、2.5×106M-1s-1、3.0×106M-1s-1、3.5×106M-1s-1、4.0×106M-1s-1、4.5×106M-1s-1、5.0×106M-1s-1或5.0×106M-1s-1以上。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示以下限為約5×10-4s-1且上限為約900×10-4s-1的Koff(s-1)結合於DV1-4。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示以一定的Koff(s-1)結合於DV1-4,所述Koff的下限選自由以下組成的群組:5×10-4s-1、10×10-4s-1、12×10-4s-1、13×10-4s-1、14×10-4s-1、15×10-4s-1、18×10-4s-1、20×10-4s-1或20×10-4s-1以上,且其上限比下限高且選自由以下組成的群組:50×10-4s-1、100×10-4s-1、120×10-4s-1、140×10-4s-1、150×10-4s-1、200×10-4s-1、300×10-4s-1、400×10-4s-1、500×10-4s-1、600×10-4s-1、700×10-4s-1、800×10-4s-1、900×10-4s-1或900×10-4s-1以上。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑結合於DV1-4的E糖蛋白。在某些實施例中,所提供的抗體藥劑結合於DV1-4的EDIII(SEQIDNO.17-20)。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑結合於DV1-4的A股。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以更高親和力結合於DV4的EDIII(SEQIDNO.20)。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以更高親和力結合於DV4的A股。SEQIDNO.17:MCTGSFKLEKEVAETQHGTVLVQVKYEGTDAPCKIPFSSQDEKGVTQNGRLITANPIVTDKEKPVNIEAEPPFGESYIVVGAGEKALELSWFKSEQIDNO.18:MCTGKFKVVKEIAETQHGTMVIRVQYEGDDSPCKIPFEIMDLEKKHVLGRLITVNPIVIEKDSPINIEAEPPFGDSYIIIGVEPGQLKLNWFKSEQIDNO.19:MCTNTFVLKKEVSETQHGTILIKVEYKGEDAPCKIPFSTEDGQGKAHNGRLITANPVVTKKEEPVNIEAEPPFGESNIVIGIGDNALKINWYKSEQIDNO.20:MCSGKFSIDKEMAETQHGTTVVKVKYEGAGAPCKVPIEIRDVNKEKVVGRIISSTPLAENTNSVTNIELEPPFGDSYIVIGVGNSALTLHWFR在一些實施例中,所提供的抗體藥劑結合於DV1-4的E糖蛋白。在某些實施例中,所提供的抗體藥劑結合於DV1-4的EDIII(SEQIDNO.17-20)。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑結合於DV1-4的A股。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以更高親和力結合於DV4的EDIII(SEQIDNO.20)。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其以更高親和力結合於DV4的A股。在一些實施例中,本發明鑑別出在位置305、306、307、308、309、310、311、312、323、325、327、329、360、361、362、363、364、385、387、388、389、390、391和/或其組合處結合於DV1-4的EDIII(SEQIDNO.17-20)中的一或多個胺基酸殘基的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明鑑別出在位置305、310、311、323、327、329和/或其組合處結合於DV1-4的EDIII(SEQIDNO.17-20)中的一或多個胺基酸殘基的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明鑑別出在位置305、310、311、323、327和329處結合DV1-4的EDIII(SEQIDNO.17-20)中的胺基酸殘基的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明鑑別出在位置305處結合DV1-4的EDIII(SEQIDNO.17-20)中的胺基酸殘基的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明鑑別出在位置310處結合DV1-4的EDIII(SEQIDNO.17-20)中的胺基酸殘基的抗體藥劑。在某些實施例中,本發明鑑別出在位置311處結合DV1-4的EDIII(SEQIDNO.17-20)中的胺基酸殘基的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明鑑別出在位置323處結合DV1-4的EDIII(SEQIDNO.17-20)中的胺基酸殘基的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明鑑別出在位置327處結合DV1-4的EDIII(SEQIDNO.17-20)中的胺基酸殘基的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明鑑別出在位置329處結合DV1-4的EDIII(SEQIDNO.17-20)中的胺基酸殘基的抗體藥劑。在一些實施例中,位置305處的絲氨酸、賴氨酸和/或蘇氨酸殘基有助於結合於所提供的抗體藥劑。在一些實施例中,位置310處的賴氨酸殘基有助於結合於所提供的抗體藥劑。在一些實施例中,位置311處的賴氨酸殘基有助於結合於所提供的抗體藥劑。在一些實施例中,位置323處的精氨酸、賴氨酸和/或穀氨醯胺殘基有助於結合於所提供的抗體藥劑。在一些實施例中,位置327處的絲氨酸和/或穀氨酸殘基有助於結合於所提供的抗體藥劑。在一些實施例中,位置329處的精氨酸、天冬氨酸和/或穀氨酸殘基有助於結合於所提供的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其與野生型(「wt」)DV抗體相比以更高親和力結合於DV1。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其與野生型或親本參考DV抗體相比以更高親和力結合於DV2。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其與如野生型DV抗體的參考抗體相比以更高親和力結合於DV3。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其與參考DV抗體相比以更高親和力結合於DV4。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其與參考DV抗體相比以更高親和力結合於DV1、DV2、DV3和DV4。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其與參考DV抗體相比以更高親和力結合於DV4且保持對DV1、DV2和DV3的結合親和力。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其與參考(野生型)DV抗體相比以更高親和力結合於DV2和DV4。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑與參考DV抗體相比以更高親和力結合於DV2和DV4且保持其對DV1和DV3的結合親和力。在一些實施例中,野生型DV抗體為野生型4E11抗體。如本文中所述,本發明提供抗體藥劑,其展示與4E11的特定結構(即,序列)關係和/或具有特定功能屬性,包括例如與野生型4E11相比某些改進的功能屬性。本發明還提供抗體藥劑,其展示與4E5A的特定結構(即,序列)關係和/或具有特定功能屬性,包括例如與4E5A相比某些改進的功能屬性。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其胺基酸序列展示出與野生型4E11的特定水平同源性和/或一致性。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示出與野生型4E11(即,與SEQIDNO.1-2)至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少99%一致性。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑具有包含序列GFNIKDT(SEQIDNO.23)的重鏈(HC;SEQIDNO.21)CDR1、包含序列DPENGD(SEQIDNO.24)的HCCDR2、包含序列GWEGFAY(SEQIDNO.25)的HCCDR3、包含序列RASENVDKYGNSFMH(SEQIDNO.26)的輕鏈(LC;SEQIDNO.22)CDR1、包含序列RASELQW(SEQIDNO.27)的LCCDR2區和包含序列QRSNEVPWT(SEQIDNO.28)的LCCDR3區。SEQIDNO.21:EVKLLEQSGAELVKPGASVRLSCTASGFNIKDTYMSWVKQRPEQGLEWIGRIDPENGDTKYDPKFQGKATITADTSSNTAYLHLSSLTSGDTAVYYCSRGWEGFAYWGQGTLVTVSASEQIDNO.22:ELVMTQTPASLAVSLGQRATISCRASENVDKYGNSFMHWYQQKAGQPPKLLIYRASELQWGIPARFSGSGSRTDFTLTINPVEADDVATYFCQRSNEVPWTFGGGTKLEIKR在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其胺基酸序列展示出與4E5A的特定水平同源性和/或一致性。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑展示出與4E5A(即,與SEQIDNO.29-30)至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少99%一致性。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑具有包含序列GFNIKDT(SEQIDNO.35)的重鏈(HC;SEQIDNO.29)CDR1、包含序列DPENGD(SEQIDNO.36)的HCCDR2、包含序列GWEGFAY(SEQIDNO.37)的HCCDR3、包含序列RASENVDKYGNSFMH(SEQIDNO.42)的輕鏈(LC;SEQIDNO.30)CDR1、包含序列RASELQW(SEQIDNO.43)的LCCDR2區和包含序列QRSNEVPWT(SEQIDNO.44)的LCCDR3區。SEQIDNO.29:EVKLLEQSGAELVKPGASVRLSCTASGFNIKDTYMSWVKQRPEQGLEWIGRIDPENGDTKYDPKFQGKATITADTSSNTAYLHLSSLTSGDTAVYYCSRGWEGFAYWGQGTLVTVSASEQIDNO.30:ELVMTQTPASLAVSLGQRATISCRASENVDKYGNSFMHWYQQKAGQPPKLLIYRASELQWGIPARFSGSGSRTDFTLTINPVEADDVATYFCQRSNEVPWTFGGGTKLEIKR在一些實施例中,所提供的抗體藥劑具有一或多個CDR和/或一或多個FR,其序列與野生型4E11的相應CDR或FR(即,與SEQIDNO.7-9、14-16或3-6、10-13中的一或多者)一致。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑具有一或多個CDR和/或FR,其展示出與如下文所論述的野生型4E11的相應CDR和/或FR的特定程度的同源性和/或一致性。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的所有CDR和FR均展示出至少特定水平的同源性和/或一致性。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑具有CDR和FR序列,其與野生型4E11相比共同含有不超過18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2或1個取代。在一些實施例中,本發明的抗體藥劑的互補決定區(CDR)1展示出與野生型4E11(SEQIDNO.7和SEQIDNO.14)至少65%、大於70%、大於75%、大於80%、大於85%、大於90%、大於95%或大於99%的一致性。在一些實施例中,所提供的CDR1具有與野生型4E11的胺基酸序列一致的胺基酸序列和/或與野生型4E11(SEQIDNO.7和SEQIDNO.14)的CDR1相比不含任何胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的CDR1與野生型4E11(SEQIDNO.7和SEQIDNO.14)相比具有一或多個胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的CDR1與野生型4E11(SEQIDNO.7和SEQIDNO.14)相比將具有兩個或兩個以上胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的CDR與野生型4E11相比具有1、2、3、4或5個取代且在一些實施例中具有1、2或3個取代。在一些實施例中,本發明的抗體藥劑的CDR2展示出與野生型4E11(SEQIDNO.8和SEQIDNO.15)至少65%、大於70%、大於75%、大於80%、大於85%、大於90%、大於95%或大於99%的一致性。在一些實施例中,所提供的CDR2具有與野生型4E11的胺基酸序列一致的胺基酸序列和/或與野生型4E11(SEQIDNO.8和SEQIDNO.15)的CDR2相比不含任何胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的CDR2與野生型4E11(SEQIDNO.8和SEQIDNO.15)相比具有一或多個胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的CDR2與野生型4E11(SEQIDNO.8和SEQIDNO.15)相比將具有兩個或兩個以上胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的CDR與野生型4E11相比具有1、2、3、4或5個取代且在一些實施例中具有1、2或3個取代。在一些實施例中,本發明的抗體藥劑的CDR3展示出與野生型4E11(SEQIDNO.9和SEQIDNO.16)至少65%、大於70%、大於75%、大於80%、大於85%、大於90%、大於95%或大於99%的一致性。在一些實施例中,所提供的CDR3具有與野生型4E11的胺基酸序列一致的胺基酸序列和/或與野生型4E11(SEQIDNO.9和SEQIDNO.16)的CDR3相比不含任何胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的CDR3與野生型4E11(SEQIDNO.9和SEQIDNO.16)相比具有一或多個胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的CDR3與野生型4E11(SEQIDNO.9和SEQIDNO.16)相比將具有兩個或兩個以上胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的CDR與野生型4E11相比具有1、2、3、4或5個取代且在一些實施例中具有1、2或3個取代。在一些實施例中,所提供的本發明的抗體藥劑的框架區1(FR1)與野生型4E11(SEQIDIDNO.3和SEQIDNO.10)將具有大於65%、大於70%、大於75%、大於80%、大於85%、大於90%、大於95%或大於99%的一致性。在一些實施例中,所提供的FR1與野生型4E11(SEQIDIDNO.3和SEQIDNO.10)相比將不具有胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的FR1與野生型4E11(SEQIDIDNO.3和SEQIDNO.10)相比將具有一或多個胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的FR1與野生型4E11(SEQIDIDNO.3和SEQIDNO.10)相比將具有兩個或兩個以上胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的本發明的抗體藥劑的框架區2(FR2)與野生型4E11(SEQIDNO.4和SEQIDNO.11)將具有大於65%、大於70%、大於75%、大於80%、大於85%、大於90%、大於95%或大於99%的一致性。在一些實施例中,所提供的FR2與野生型4E11(SEQIDNO.4和SEQIDNO.11)相比將不具有胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的FR2與野生型4E11(SEQIDNO.4和SEQIDNO.11)相比將具有一或多個胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的FR2與野生型4E11(SEQIDNO.4和SEQIDNO.11)相比將具有兩個或兩個以上胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的本發明的抗體藥劑的框架區3(FR3)與野生型4E11(SEQIDNO.5和SEQIDNO.12)將具有大於65%、大於70%、大於75%、大於80%、大於85%、大於90%、大於95%或大於99%的一致性。在一些實施例中,所提供的FR3與野生型4E11(SEQIDNO.5和SEQIDNO.12)相比將不具有胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的FR3與野生型4E11(SEQIDNO.5和SEQIDNO.12)相比將具有一或多個胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的FR3與野生型4E11(SEQIDNO.5和SEQIDNO.12)相比將具有兩個或兩個以上胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的本發明的抗體藥劑的框架區4(FR4)與野生型4E11(SEQIDNO.6和SEQIDNO.13)將具有大於65%、大於70%、大於75%、大於80%、大於85%、大於90%、大於95%或大於99%的一致性。在一些實施例中,所提供的FR4與野生型4E11(SEQIDNO.6和SEQIDNO.13)相比將不具有胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的FR4與野生型4E11(SEQIDNO.6和SEQIDNO.13)相比將具有一或多個胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的FR3與野生型4E11(SEQIDNO.6和SEQIDNO.13)相比將具有兩個或兩個以上胺基酸取代。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VHCDR展示出與野生型4E11(SEQIDNO.:7-9)至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少99%的一致性。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VHCDR展示出與野生型4E11(SEQIDNO.:7-9)至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少99%的一致性,但因CDR內的至少一個胺基酸取代的取代而不同。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VHCDR在野生型4E11抗體的位置55處具有相應胺基酸殘基的取代。在一些實施例中,位置55處的取代胺基酸殘基選自由穀氨酸和天冬氨酸組成的群組。在一些實施例中,位置55處的取代胺基酸殘基為穀氨酸。在一些實施例中,所提供的抗體的VHCDR中對應於野生型4E11的位置55處的胺基酸殘基的胺基酸殘基不為丙氨酸。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VLCDR展示出與野生型4E11(SEQIDNO.:14-16)至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少99%的一致性。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VLCDR展示出與野生型4E11(SEQIDNO.:14-16)至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少99%的一致性,但因CDR內的至少一個胺基酸取代的取代而不同。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VLCDR在野生型4E11抗體的位置31、57、59、60和/或其組合處具有相應胺基酸殘基的一或多個取代。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VLCDR在野生型4E11抗體的位置31處具有相應胺基酸殘基的取代。在一些實施例中,位置31處的取代胺基酸殘基為賴氨酸。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VLCDR中對應於野生型4E11的位置55處的胺基酸殘基的胺基酸殘基不為精氨酸。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VLCDR在野生型4E11抗體的位置57處具有相應胺基酸殘基的取代。在一些實施例中,位置57處的取代胺基酸殘基選自由穀氨酸和絲氨酸組成的群組。在一些實施例中,位置57處的取代胺基酸殘基為穀氨酸。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VLCDR中對應於野生型4E11的位置57處的胺基酸殘基的胺基酸殘基不為天冬醯胺。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VLCDR在野生型4E11抗體的位置59處具有相應胺基酸殘基的取代。在一些實施例中,位置59處的取代胺基酸殘基選自由穀氨醯胺和天冬醯胺組成的群組。在一些實施例中,位置59處的取代胺基酸殘基為穀氨醯胺。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VLCDR中對應於野生型4E11的位置59處的胺基酸殘基的胺基酸殘基不為穀氨酸。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VLCDR在野生型4E11抗體的位置60處具有相應胺基酸殘基的取代。在一些實施例中,位置60處的取代胺基酸殘基選自由色氨酸、酪氨酸和精氨酸組成的群組。在一些實施例中,位置60處的取代胺基酸殘基為色氨酸。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VLCDR中對應於野生型4E11的位置60處的胺基酸殘基的胺基酸殘基不為絲氨酸。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VH和VLCDR展示出與野生型4E11(分別為SEQIDNO.:7-9和14-16)至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少99%的一致性。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VH和VLCDR展示出與野生型4E11(分別為SEQIDNO.:7-9和14-16)至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少99%的一致性,但因CDR內至少一個胺基酸取代的取代而不同。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的VHCDR在位置55處具有相應胺基酸殘基的取代,且所提供的抗體藥劑的VLCDR在野生型4E11抗體的位置31、57、59和60處具有相應胺基酸殘基的取代。在一些實施例中,位置55處的取代胺基酸殘基為穀氨酸。在一些實施例中,位置31處的取代胺基酸殘基為賴氨酸。在一些實施例中,位置57處的取代胺基酸殘基為穀氨酸。在一些實施例中,位置59處的取代胺基酸殘基為穀氨醯胺。在一些實施例中,位置60處的取代胺基酸殘基為色氨酸。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其相對於4E5A在位置26處具有胺基酸殘基的空取代(即,缺失)。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其相對於4E5A在位置27處具有胺基酸殘基的空取代(即,缺失)。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其相對於4E5A在位置27處具有胺基酸殘基的取代。在一些實施例中,位置27處的取代胺基酸殘基為丙氨酸。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其展示以一定的KD(nM)結合於EDIII-DV4(SEQIDNO.20),所述KD低於40000nM、低於30000nM、低於20000nM、低於15000nM、低於10000nM、低於8000nM、低於5000nM、低於4000nM、低於3000nM、低於2000nM、低於1500nM、低於1000nM、低於500nM、低於250nM、低於225nM、低於200nM、低於175nM、低於150nM、低於125nM、低於100nM、低於75nM或低於50nM。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其展示以一定的KD(nM)結合於EDIII-DV1(SEQIDNO.17),所述KD低於3nM、低於2.5nM、低於2nM、低於1.5nM、低於1.0nM、低於0.5nM、低於0.4nM、低於0.3nM、低於0.2nM、低於0.1nM或低於0.05nM。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其展示以一定的KD(nM)結合於EDIII-DV2(SEQIDNO.18),所述KD低於15nM、低於12nM、低於10nM、低於8nM、低於7nM、低於5nM、低於2.5nM、低於2nM、低於1.5nM、低於1nM、低於0.5nM、低於0.4nM、低於0.3nM、低於0.2nM或低於0.1nM。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其展示以一定的KD(nM)結合於EDIII-DV3(SEQIDNO.19),所述KD低於120nM、低於100nM、低於50nM、低於40nM、低於35nM、低於30nM、低於25nM、低於20nM、低於15nM、低於10nM、低於5nM、低於2.5nM或低於1.0nM。在一些實施例中,本發明提供與野生型4E11相比對結合於EDIII-DV4具有至少2倍、5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍、100倍、200倍、300倍、400倍、500倍或500倍以上親和力的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明提供與野生型4E11相比對結合於EDIII-DV2具有至少2倍、5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍或90倍以上親和力的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明提供與野生型4E11相比對結合於EDIII-DV1和/或EDIII-DV3具有至少1倍、1.5倍、2倍、5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍或60倍以上親和力的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其展示60μg/ml或60μg/ml以下、50μg/ml或50μg/ml以下、40μg/ml或40μg/ml以下、30μg/ml或30μg/ml以下、20μg/ml或20μg/ml以下、10μg/ml或10μg/ml以下、5μg/ml或5μg/ml以下、4μg/ml或4μg/ml以下、3μg/ml或3μg/ml以下、2μg/ml或2μg/ml以下的EDIII-DV4(SEQIDNO.20)的中和IC50(μg/ml)。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其展示7.0μg/ml或7.0μg/ml以下、6.0μg/ml或6.0μg/ml以下、5.0μg/ml或5.0μg/ml以下、4.0μg/ml或4.0μg/ml以下、3.0μg/ml或3.0μg/ml以下、2.0μg/ml或2.0μg/ml以下、1.5μg/ml或1.5μg/ml以下、1.0μg/ml或1.0μg/ml以下、0.90μg/ml或0.90μg/ml以下、0.80μg/ml或0.80μg/ml以下、0.70μg/ml或0.70μg/ml以下、0.60μg/ml或0.60μg/ml以下、0.50μg/ml或0.50μg/ml以下的EDIII-DV3(SEQIDNO.19)的中和IC50(μg/ml)。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其展示0.2μg/ml或0.2μg/ml以下、0.19μg/ml或0.19μg/ml以下、0.18μg/ml或0.18μg/ml以下、0.17μg/ml或0.17μg/ml以下、0.16μg/ml或0.16μg/ml以下、0.15μg/ml或0.15μg/ml以下、0.14μg/ml或0.14μg/ml以下、0.13μg/ml或0.13μg/ml以下、0.12μg/ml或0.12μg/ml以下、0.11μg/ml或0.11μg/ml以下、0.10μg/ml或0.10μg/ml以下、0.09μg/ml或0.09μg/ml以下、0.07μg/ml或0.07μg/ml以下、0.06μg/ml或0.06μg/ml以下、0.05μg/ml或0.05μg/ml以下、0.04μg/ml或0.04μg/ml以下、0.03μg/ml或0.03μg/ml以下、0.02μg/ml或0.02μg/ml以下、0.01μg/ml或0.01μg/ml以下的EDIII-DV2(SEQIDNO.18)的中和IC50(μg/ml)。在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其展示5.0μg/ml或5.0μg/ml以下、4.0μg/ml或4.0μg/ml以下、3.0μg/ml或3.0μg/ml以下、2.5μg/ml或2.5μg/ml以下、2.0μg/ml或2.0μg/ml以下、1.5μg/ml或1.5μg/ml以下、1.0μg/ml或1.0μg/ml以下、0.90μg/ml或0.90μg/ml以下、0.70μg/ml或0.70μg/ml以下、0.50μg/ml或0.50μg/ml以下、0.40μg/ml或0.40μg/ml以下、0.30μg/ml或0.30μg/ml以下、0.20μg/ml或0.20μg/ml以下、0.10μg/ml或0.10μg/ml以下的EDIII-DV1(SEQIDNO.17)的中和IC50(μg/ml)。在一些實施例中,本發明提供與野生型4E11相比對EDIII-DV4的中和具有至少2倍、5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍、100倍、150倍、200倍、400倍、500倍或500倍以上減少的IC50的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明提供與野生型4E11相比對EDIII-DV2的中和具有至少1倍、1.5倍、2倍、5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍或60倍以上減少的IC50的抗體藥劑。在一些實施例中,本發明提供與野生型4E11相比對EDIII-DV1和/或EDIII-DV3的中和具有至少1倍、1.5倍、2倍、5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍或60倍以上減少的IC50的抗體藥劑。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑中的一或多個序列已經工程化(例如通過親和力成熟或其它優化方法工程化)來改進如此項技術中已知的一或多種特徵或活性(例如增大穩定性、減少聚集、減小免疫原性等)。在一些實施例中,抗體藥劑通過聚乙二醇化、甲基化、唾液酸化、胺化或硫酸化來修飾。在一些實施例中,抗體藥劑綴合於兩親性核/殼以產生聚合膠束。在一些實施例中,抗體藥劑綴合於超支化大分子(即樹枝狀聚合物)。在一些實施例中,抗體藥劑綴合於天然聚合物,所述天然聚合物選自由以下組成的群組:白蛋白、殼聚糖、肝素、太平洋紫杉醇(paclitaxel)、聚-(L-穀氨酸)、N-(2-羥丙基)甲基丙烯醯胺(HPMA)、聚-(L-丙交酯)(PLA)、聚(醯胺胺)(PAMAM)葉酸和/或其組合。在一些實施例中,抗體藥劑包含親水性胺基酸的一或多個長的非結構化尾(rPEG)。在一些實施例中,預期使用不改變抗體組合位點的反應條件通過在免疫球蛋白的Fc區中選擇性引入巰基來衍生免疫球蛋白。根據這一方法產生的抗體綴合物可展現改進的長壽命、特異性和敏感性(美國專利第5,196,066號,其以引用的方式併入本文中)。其中報導或效應分子綴合於Fc區中的碳水化合物殘基的效應或報導分子的位點特異性連接也已公開於文獻(奧香內西(O'Shannessy)等人,1987)中。抗體和/或抗體片段在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑為或包含抗體或其片段。在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑為或包含單克隆抗體或其片段。在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑為或包含多克隆抗體或其片段。在一些實施例中,DV抗體藥劑為或包含「全長」抗體,因為其含有兩個重鏈和兩個輕鏈,如在天然產生的抗體下出現般任選地利用二硫鍵結合。在一些實施例中,DV抗體藥劑為或包含全長抗體的片段,因為其含有一些但非所有全長抗體中可見的序列。舉例來說,在一些實施例中,DV抗體藥劑為或包含抗體片段,其包括(但不限於)Fab、Fab'、F(ab')2、scFv、Fv、dsFv雙功能抗體和Fd片段。在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑為或包含作為選自由IgG、IgM、IgA、IgD、IgE組成的群組的抗體類別的成員的抗體或其片段。在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑為或包含通過化學合成產生的抗體。在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑為或包含利用細胞產生的抗體。在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑為或包含使用重組細胞培養系統產生的抗體。在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑為或包含嵌合抗體,例如來自小鼠、大鼠、馬、豬或其它物種,攜有人類恆定和/或可變區域。在一些實施例中,DV抗體藥劑包括一或多種抗體片段,包括(但不限於)Fab'、Fab、F(ab')2、單域抗體(DAB)、Fv、scFv(單鏈Fv)、具有抗體CDR的多肽、展示CDR(例如抗運載蛋白)的骨架域或納米抗體。舉例來說,所提供的抗體可為僅包含重鏈的VHH(即,抗原特異性VHH)抗體。所述抗體分子可來源於羊駝或其它駱駝科抗體(例如駱駝科IgG2或IgG3,或來自所述駱駝科Ig的CDR呈現框架)或來源於鯊魚抗體。在一些實施例中,DV抗體藥劑為或包含avibody(雙功能抗體、三功能抗體、四功能抗體)。製備和使用各種基於抗體的構築體和片段的技術是在此項技術中熟知的。製備和表徵抗體的手段也是在此項技術中熟知的(參見例如,抗體:實驗室手冊(Antibodies:ALaboratoryManual),冷泉港實驗室,1988;以引用的方式併入本文中)。在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑包括一或多種「微抗體」或「微型抗體」。微型抗體是sFv多肽鏈,其在其C端包括寡聚域,利用鉸鏈區與sFv分離(帕克(Pack)等人(1992)生物化學(Biochem)31:1579-1584)。寡聚域包含自締合α-螺旋,例如亮氨酸拉鏈,其可利用其它二硫鍵進一步穩定。寡聚域經設計以與跨膜的矢量摺疊(一種被認為有助於多肽體內摺疊成功能性結合蛋白的過程)相容。微型抗體通常使用此項技術中熟知的重組方法產生。參見例如帕克(Pack)等人(1992)生物化學(Biochem)31:1579-1584;康伯(Cumber)等人(1992)免疫學雜誌(JImmunology)149B:120-126。抗體藥劑綴合物在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑為或包含綴合物,其中抗體部分包含或其組成為具有綴合部分的抗體或其功能性部分。在一些具體實施例中,如本文中所述的DV抗體藥劑與一或多種活性劑或「有效負載(payload)」(如治療劑或檢測劑)結合提供和/或使用。在一些所述實施例中,DV抗體藥劑與活性劑和/或有效負載之間的結合包含至少一種共價相互作用以便提供DV抗體綴合物。在一些實施例中,抗體藥劑為治療性有效負載藥劑,其為具有所需活性(例如抗病毒活性、消炎活性、細胞毒性活性等)的效應實體。治療劑可為或包含任何類別的化學實體,包括例如蛋白質、碳水化合物、脂質、核酸、小有機分子、非生物聚合物、金屬、離子、放射性同位素等。在一些實施例中,根據本發明使用的治療劑可具有與治療DV感染的一或多種症狀或病因有關的生物活性(例如抗病毒、減輕疼痛、消炎、免疫調節、誘導睡眠活性等)。在一些實施例中,根據本發明使用的治療劑具有一或多種其它活性。在一些實施例中,抗體藥劑為有效負載檢測劑,其為或包含任何例如因其特定功能特性和/或化學特徵而可使用分析檢測的部分。所述藥劑的非限制性實例包括酶、放射性標記、半抗原、螢光標記、磷光分子、化學發光分子、發色團、發光分子、光親和性分子、有色粒子或配體(如生物素)。許多適當的有效負載檢測劑是此項技術中已知的,用於其與抗體連接的系統也是此項技術中已知的(參見例如美國專利第5,021,236號、第4,938,948號和第4,472,509號,其各自以引用的方式併入本文中)。此類有效負載檢測劑的實例尤其包括順磁離子、放射性同位素、螢光染料、NMR可檢測物質、X射線成像劑。舉例來說,在一些實施例中,順磁離子為以下各者中的一或多者:鉻(III)、錳(II)、鐵(III)、鐵(II)、鈷(II)、鎳(II)、銅(II)、釹(III)、釤(III)、鐿(III)、釓(III)、釩(II)、鋱(III)、鏑(III)、鈥(III)、鉺(III)、鑭(III)、金(III)、鉛(II)和/或鉍(III)。在一些實施例中,放射性同位素為以下各者中的一或多者:砹211、14碳、51鉻、36氯、57鈷、58鈷、銅67、152Eu、鎵67、3氫、碘123、碘125、碘131、銦111、59鐵、32磷、鐳223、錸186、錸188、75硒、35硫、鎝99m、釷227和/或釔90。放射性標記的抗體藥劑可根據在此項技術中眾所周知的方法產生。舉例來說,單克隆抗體可通過與碘化鈉和/或碘化鉀以及化學氧化劑(如次氯酸鈉)或酶促氧化劑(如乳過氧化酶)接觸來碘化。所提供的抗體藥劑可通過配體交換過程來經鎝99m標記,例如通過以下方式進行:用亞錫溶液還原高鎝酸鹽,將還原的鎝螯合到Sephadex柱上,並將抗體施加到這一柱中。在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑使用直接標記技術,例如通過培育高鎝酸鹽、還原劑(如SNCl2)、緩衝溶液(如鄰苯二甲酸鈉鉀溶液)和抗體來標記。通常用於將以金屬離子形式存在的放射性同位素與抗體結合的中間官能團是二亞乙三胺五乙酸(DTPA)或乙二胺四乙酸(EDTA)。在一些實施例中,螢光標記尤其為或包含以下各者中的一或多者:Alexa350、Alexa430、AMCA、BODIPY630/650、BODIPY650/665、BODIPY-FL、BODIPY-R6G、BODIPY-TMR、BODIPY-TRX、級聯藍(CascadeBlue)、Cy3、Cy5,6-FAM、螢光素異硫氰酸酯、HEX、6-JOE、俄勒岡綠(OregonGreen)488、俄勒岡綠500、俄勒岡綠514、太平洋藍(PacificBlue)、REG、羅丹明綠(RhodamineGreen)、羅丹明紅(RhodamineRed)、腎造影劑(Renographin)、ROX、TAMRA、TET、四甲基羅丹明(Tetramethylrhodamine)和/或德克薩斯紅(TexasRed)。此項技術中已知數種用於將抗體藥劑連接或綴合於有效負載的方法。一些連接方法涉及使用金屬螯合複合體,其利用例如有機螯合劑(如二亞乙三胺五乙酸酐(DTPA);乙三胺四乙酸;N-氯-對甲苯磺醯胺;和/或四氯-3α-6α-二苯基甘脲-3)連接於抗體(美國專利第4,472,509號和第4,938,948號,其各自以引用的方式併入本文中)。所提供的DV抗體藥劑也可與酶在偶合劑(如戊二醛或高碘酸鹽)的存在下反應。與螢光素標記物的綴合物在這些偶合劑的存在下或通過與異硫氰酸酯的反應進行製備。製造抗體所提供的包括抗體和/或其特徵部分或編碼其的核酸的抗體藥劑可通過任何可利用的手段製造。用於產生抗體(例如單克隆抗體和/或多克隆抗體)的方法是此項技術中熟知的。應了解,廣泛範圍的動物物種可用於製造抗血清,包括兔、小鼠、大鼠、倉鼠、天竺鼠或山羊。如所屬領域的技術人員應已知的,動物的選擇可根據操縱的簡易性、成本或所需的血清量決定。應了解,抗體藥劑也可經由產生針對所關注的免疫球蛋白重鏈和輕鏈序列轉基因的哺乳動物或植物並從其製造呈可回收形式的抗體來以轉基因的方式製造。結合哺乳動物中的轉基因製造,抗體可在山羊、牛或其它哺乳動物的乳汁中製造並從所述乳汁中回收。參見例如,美國專利第5,827,690號、第5,756,687號、第5,750,172號和第5,741,957號。所提供的抗體藥劑(包括抗體和/或特徵部分)可例如通過使用經工程化以表達本發明抗體編碼核酸的宿主細胞系統製造。可替代地或另外,所提供的抗體藥劑可部分或完全通過化學合成(例如使用自動肽合成儀)製備。適於本發明的抗體藥劑製劑的示例性來源包括(但不限於):從培養表達所關注的蛋白的重組細胞系獲得的條件培養基、或來自例如抗體產生細胞、細菌、真菌細胞、昆蟲細胞、轉基因植物或植物細胞、轉基因動物或動物細胞的細胞提取物、或動物血清、腹水液、雜交瘤或骨髓瘤上清液。適合的細菌細胞包括(但不限於)大腸桿菌(Escherichiacoli)細胞。適合的大腸桿菌菌株的實例包括:HB101、DH5α、GM2929、JM109、KW251、NM538、NM539和任何無法裂解外來DNA的大腸桿菌菌株。可使用的適合的真菌宿主細胞包括(但不限於)釀酒酵母(Saccharomycescerevisiae)、甲醇酵母(Pichiapastoris)和麴黴(Aspergillus)細胞。適合的昆蟲細胞包括(但不限於)S2施耐德細胞(S2Schneidercell)、D.Mel-2細胞、SF9、SF21、High-5TM、MimicTM-SF9、MG1和KC1細胞。適合的示例性重組細胞系包括(但不限於)BALB/c小鼠骨髓瘤系、人類視網膜母細胞(PER.C6)、猴腎細胞、人類胚胎腎臟系(293)、幼倉鼠腎細胞(BHK)、中國倉鼠卵巢細胞(CHO)、小鼠塞特利氏細胞(mousesertolicell)、非洲綠猴腎細胞(VERO-76)、人類宮頸癌細胞(HeLa)、犬腎細胞、布法羅大鼠肝細胞(buffaloratlivercell)、人類肺細胞、人類肝細胞、小鼠乳房腫瘤細胞、TRI細胞、MRC5細胞、FS4細胞和人類肝癌系(HepG2)。所關注的抗體藥劑可使用此項技術中已知的各種載體(例如病毒載體)表達,並且細胞可在此項技術中已知的各種條件(例如分批進料)下培養。基因工程化細胞以產生抗體的各種方法是此項技術中熟知的。參見例如,奧斯貝(Ausubel)等人,編,(1990),最新分子生物學實驗方法彙編(CurrentProtocolsinMolecularBiology)(紐約威利(Wiley,NewYork))。必要時,所提供的抗體藥劑可使用過濾、離心和/或各種色譜方法(如HPLC或親和色譜法)純化。在一些實施例中,所提供的抗體藥劑的片段是通過包括用酶(如胃蛋白酶木瓜蛋白酶)消化的方法和/或通過化學還原裂解二硫鍵來獲得的。核酸在某些實施例中,本發明提供編碼抗體藥劑的核酸。在一些實施例中,本發明提供與編碼抗體藥劑的核酸互補的核酸。在一些實施例中,本發明提供與編碼抗體藥劑的核酸雜交的核酸分子。所述核酸可以例如用作引物或探針。僅舉幾例,所述核酸可以用作聚合酶鏈反應(PCR)中的引物、用作用於雜交(包括原位雜交)的探針和/或用作用於反轉錄-PCR(RT-PCR)的引物。在某些實施例中,核酸可以為DNA或RNA,並且可以為單股或雙股的。在一些實施例中,核酸可包括一或多個非天然核苷酸;在一些實施例中,核酸僅包括天然核苷酸。DV相關藥劑的表徵和/或鑑別在一些實施例中,本發明提供抗體藥劑,其可用於鑑別和/或表徵一或多種模擬DV表位或藥劑和/或誘發對DV的強力抗體反應的藥劑。在一些實施例中,所述藥劑包括一或多種抗體樣結合肽模擬物。劉(Liu)等人細胞分子生物學(CellMolBiol)(諾伊斯-勒-格蘭德(Noisy-le-grand)).2003年3月;49(2):209-16描述了「抗體樣結合肽模擬物」(ABiP),其是充當簡化抗體的肽,並且具有更長血清半衰期以及更不繁瑣的合成方法的某些優點。同樣,在一些方面中,抗體樣分子是環狀或雙環肽。舉例來說,用於分離抗原結合雙環肽(例如通過噬菌體展示進行)和使用所述肽的方法提供在美國專利公開案第20100317547號中,所述公開案以引用的方式併入本文中。在一些實施例中,所述藥劑包括一或多種抗體樣結合骨架蛋白質。舉例來說,在一些實施例中,一或多個從抗體產生的CDR可接枝到蛋白質骨架上。一般來說,蛋白質骨架可符合最大數目的以下準則:(斯凱拉A.(SkerraA.),分子識別雜誌(J.Mol.Recogn.),2000,13:167-187):良好的系統發生保守;已知的三維結構(如例如通過晶體學、NMR光譜法或所屬領域的技術人員已知的任何其它技術測定);小尺寸;幾乎沒有或沒有轉錄後修飾;和/或易於製造、表達和純化。所述蛋白質骨架的來源可為(但不限於)纖維粘連蛋白(例如纖維粘連蛋白III型域10)、脂質運載蛋白、抗運載蛋白(斯凱拉A.生物技術雜誌(J.Biotechnol.),2001,74(4):257-75)、從金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)的蛋白A的域B產生的蛋白Z、硫氧還蛋白A或具有重複基元(如「錨蛋白重複序列」(科爾(Kohl)等人,美國國家科學院院刊(PNAS),2003,第100卷,第4期,1700-1705)、「犰狳重複序列」、「富亮氨酸重複序列」和「三十四肽重複序列」)的蛋白質。舉例來說,抗運載蛋白或脂質運載蛋白衍生物描述在美國專利公開案第20100285564號、第20060058510號、第20060088908號、第20050106660號和PCT公開案第WO2006/056464號中,所述公開案以引用的方式併入本文中。來源於毒素(如例如來自蠍子、昆蟲、植物、軟體動物等的毒素)的骨架和神經元NO合成酶的蛋白抑制劑(PIN)也可以根據本發明使用。在一些實施例中,所述藥劑包括模擬表位,其可用於破壞流感病毒與HA多肽受體之間的相互作用。在一些實施例中,模擬表位用於引發與其對應的目標表位所引發的抗體反應相同或類似的抗體反應。在一些實施例中,目標表位是在一種以上DV血清型間保守的序列。在一些實施例中,保守表位是在DV血清型1-4間保守的序列。在一些實施例中,表位是位於E糖蛋白的A股區內的保守序列。在一些實施例中,模擬表位是肽。在一些實施例中,模擬表位是小分子、碳水化合物、脂質或核酸。在一些實施例中,模擬表位是保守流感表位的肽或非肽模擬表位。在一些實施例中,通過模擬所界定的病毒表位的結構,模擬表位幹擾DV粒子結合於其天然結合搭配物的能力,例如通過結合於天然結合搭配物自身來幹擾。在一些實施例中,所述藥劑是訂書肽。在一些實施例中,訂書肽包含編碼一或多個CDR和/或FR的胺基酸序列,所述一或多個CDR和/或FR包含與抗DV抗體(例如4E11)的相應CDR和/或FR至少大於65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%的同源性和/或一致性。在一些實施例中,訂書肽包含編碼一或多個VH和/或VL鏈序列的胺基酸序列,所述一或多個VH和/或VL鏈序列包含與抗DV抗體(例如4E11)的對應的VH和VL鏈至少大於65%、70%、75%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%的同源性和/或一致性。在某些實施例中,所述藥劑為或包含核酸,如DNA或RNA。在某些實施例中,核酸可以為DNA或RNA,並且可以為單股或雙股的。在一些實施例中,核酸可包括一或多個非天然核苷酸。在一些實施例中,核酸僅包括天然核苷酸。在一些實施例中,核酸經設計以模擬DV多肽內的表位。在一些實施例中,核酸經設計以模擬一或多種DV血清型內的保守表位。在一些實施例中,所述藥劑為或包含一或多種寡核苷酸。在一些實施例中,所述藥劑為或包含一或多種寡核苷酸,所述一或多種寡核苷酸包含如環、髮夾、摺疊或其組合的二級結構。在一些實施例中,所述藥劑為或包含一或多種寡核苷酸,所述一或多種寡核苷酸包含高級(三級或四級)結構。在一些實施例中,所述藥劑為或包含適體。在一些實施例中,可以將疫苗設計成誘導產生已經發現患者所缺乏的抗體。在一些實施例中,疫苗組合物宜包含具有天然構象、介導保護性反應(例如補體活化、病毒中和等)和/或可誘發強烈的抗體反應的抗原。在一些實施例中,疫苗含有個體體內無法對其自然產生抗體的表位或其模擬表位。舉例來說,用DV抗體(例如識別多種血清型的DV抗體)分離的合成肽模擬表位具有誘發與用於模擬表位原始分離的抗體類似的強力免疫反應的潛力。投與此類疫苗可能誘使患者的免疫系統開始產生一組針對所投與的表位的抗體。應了解,本發明的模擬表位(或表位)可以單獨或與重組蛋白、失活的DV病毒、殺死的DV病毒組合和/或以數種不同模擬表位的混合物形式使用。在一些實施例中,可以利用針對DV的疫苗進行主動免疫接種(即,對個體投與微生物、蛋白質、肽、表位、模擬表位等進行的免疫接種)。在一些實施例中,可使用針對DV的疫苗,其可包含模擬DV包膜糖蛋白的DVA股區的至少一種構象表位的任何藥劑。舉例來說,所述藥劑可為肽、蛋白質、糖肽、糖蛋白、小分子、模擬表位、有機化合物、脂質、糖類、有機金屬化合物、無機化合物等。在一些實施例中,以疫苗形式提供的表位包括針對已知會預防感染的抗體的表位。在一些實施例中,根據本發明以疫苗形式提供的表位包括在不同病毒基因型和/或亞型間或不同病毒株間保守的表位。在一些實施例中,將含有DV的A股區的構象界定的表位的肽或蛋白用於疫苗調配物,從而預防由DV引起的感染、延緩其發作、對其進行治療、改善其症狀和/或降低其嚴重度。在一些實施例中,DVA股區表位可為線性表位。在一些實施例中,A股區表位可為線形和構象表位的混合物。在一些實施例中,A股區表位可為構象表位。在一些實施例中,肽表位的長度小於100個胺基酸。在某些實施例中,肽表位的長度小於50、小於40、小於30、小於20或小於10個胺基酸。在一些實施例中,用於調配疫苗的肽是DV的A股區蛋白的肽片段。通常使用肽,所述肽以與其在天然A股區蛋白中的三維摺疊類似的方式摺疊,由此保存構象表位的三維結構。用於鑑別和/或表徵DV結合劑的系統本發明提供用於測試、表徵和/或鑑別DV抗體藥劑的多種系統。在一些實施例中,所提供的DV抗體藥劑用於鑑別和/或表徵其它DV結合劑(例如抗體、多肽、小分子等)。在一些實施例中,所提供的DV結合劑通過所述系統和方法表徵,所述系統和方法涉及使DV結合劑與一或多種候選底物(如DV多肽區、DV多肽上的N-聚糖、DV受體、唾液酸化DV受體和/或唾液酸化DV受體上的聚糖)接觸。在一些實施例中,可使用計算方法測試、表徵和/或鑑別DV結合劑(例如交叉反應性抗體)。在一些實施例中,計算方法涉及使用蛋白質-蛋白質(例如抗體-抗原)相互作用共有的物理化學特徵來預測蛋白質-蛋白質相互作用和親和力增強性突變。舉例來說,在中和DV中使用這一方法產生的抗體的效力可接著通過此項技術中已知的各種分析(例如斑減少中和測試、ELISA、血凝分析和蛋白質印跡法(Westernblot))加以預測。在一些實施例中,DV結合劑和/或候選底物可游離於溶液中、固定於支撐物、和/或在細胞中和/或在細胞表面上表達。候選底物和/或藥劑可經標記,由此允許檢測結合。或者DV結合劑或者候選底物是經標記的物質。可進行其中一種物質經標記的競爭結合形式,並且可測量游離標記相較於結合標籤的量以測定對結合的作用。在一些實施例中,結合分析例如涉及使候選底物暴露於DV結合劑並且檢測所述候選底物與所述藥劑之間的結合。結合分析可在體外(例如在基本上僅包含所提及的組分的候選試管中;在無細胞提取物中;和/或在基本上純化的組分中)執行。可替代地或另外,結合分析可在細胞中和/或在體內(例如在細胞、組織、器官和/或生物體內;下文進一步詳細描述)執行。在某些實施例中,使至少一種DV結合劑與至少一種候選底物接觸並檢測作用。在一些實施例中,舉例來說,使DV結合劑與候選底物接觸,並且監測兩種實體之間的結合。在一些實施例中,分析可能涉及使候選底物與藥劑的特徵部分接觸。檢測DV藥劑與候選底物的結合。應了解,可使用DV結合劑的片段、部分、同系物、變異體和/或衍生物,其限制條件為其包含結合一或多種候選底物的能力。DV藥劑與候選底物的結合可利用此項技術中熟知的多種方法測定。在一些實施例中,結合測量可使用SPR分析執行。在一些實施例中,SPR分析可用於測量DV結合劑的親和力和動力學結合參數。在一些實施例中,可使用涉及固相結合的DV藥劑並檢測其與一或多種候選底物的相互作用的分析。因此,DV結合劑可包含可檢測標記物,如放射性、螢光和/或發光標記。此外,候選底物可與允許間接檢測(例如藉助於利用會使用顯色底物的酶和/或藉助於結合可檢測抗體)的物質偶聯。由於與候選底物的相互作用而引起的DV結合劑的構象變化可例如通過可檢測標記物的發射光變化來檢測。可替代地或另外,固相結合的蛋白質複合體可藉助於質譜進行分析。在一些實施例中,DV結合劑可為非固定的。在一些實施例中,非固定的組分可經標記(例如經放射性標記、表位標籤、酶-抗體綴合物等標記)。可替代地或另外,結合可利用免疫檢測技術測定。舉例來說,反應混合物可經歷蛋白質印跡法,且印跡用檢測非固定組分的抗體探測。可替代地或另外,ELISA可用於針對結合的分析。在一些實施例中,DV藥劑對候選底物的結合親和力可通過使用高通量間接ELISA分析來測定。在一些實施例中,灶減少中和測試(FRNT)分析可用於測量DV結合劑的活性或中和效力。在一些實施例中,動物宿主可用於測量體內抗DV活性。在某些實施例中,可針對DV藥劑與候選底物之間的結合直接分析細胞。免疫組織化學技術、共聚焦技術和/或評估結合的其它技術是所屬領域的技術人員所熟知的。各種細胞系可用於此類篩選分析,包括為此目的專門工程化的細胞。篩選分析中所用細胞的實例包括哺乳動物細胞、真菌細胞、細菌細胞或病毒細胞。細胞可為經刺激細胞,如用生長因子刺激的細胞。所屬領域的技術人員應理解,本文所公開的本發明涵蓋多種用於測量DV結合劑結合於候選底物的能力的細胞內分析。視分析而定,可能需要細胞和/或組織培養物。細胞可使用多種不同生理分析中的任一者檢查。可替代地或另外,可進行分子分析,包括(但不限於)監測蛋白質表達和/或測試蛋白質-蛋白質相互作用的蛋白質印跡法;監測其它化學修飾的質譜;等。在一些實施例中,本文中所述的結合分析可使用一系列濃度的DV結合劑和/或候選底物進行。在一些實施例中,本文中所述的結合分析用於評估候選底物結合於在抗體濃度範圍內(例如大於約100μg/ml、約100μg/ml、約50μg/ml、約40μg/ml、約30μg/ml、約20μg/ml、約10μg/ml、約5μg/ml、約4μg/ml、約3μg/ml、約2μg/ml、約1.75μg/ml、約1.5μg/ml、約1.25μg/ml、約1.0μg/ml、約0.9μg/ml、約0.8μg/ml、約0.7μg/ml、約0.6μg/ml、約0.5μg/ml、約0.4μg/ml、約0.3μg/ml、約0.2μg/ml、約0.1μg/ml、約0.05μg/ml、約0.01μg/ml和/或小於約0.01μg/ml)的DV藥劑的能力。在一些實施例中,本文中所述的結合研究中的任一者可以高通量方式執行。使用高通量分析,可在一天內篩選高達數千種藥劑。在一些實施例中,微量滴定板的每一孔均可用於運作針對所選候選底物的獨立分析,或者,如果欲觀察濃度和/或孵育時間影響,那麼每5-10孔可以測試單一候選底物。因此,單個標準微量滴定板可以分析藥劑與候選底物之間的最多96個結合相互作用;如果使用1536孔板,那麼單個板可以分析藥劑與候選底物之間的最多1536個結合相互作用;等等。每天可分析許多板。舉例來說,可使用根據本發明的高通量系統對抗體與候選底物之間的結合相互作用進行高達約6,000、約20,000、約50,000或超過約100,000次分析篩選。在一些實施例中,所述方法使用動物宿主。如本文中所用,「動物宿主」包括適於流感研究的任何動物模型。舉例來說,適於本發明的動物宿主可為任何哺乳動物宿主,包括靈長類動物、雪貂、貓、狗、牛、馬、齧齒動物(如小鼠、倉鼠、兔和大鼠)。在某些實施例中,用於本發明的動物宿主是雪貂。具體來說,在一些實施例中,動物宿主在投與藥劑(任選地呈本發明組合物形式)之前未經受病毒暴露或感染。在一些實施例中,動物宿主在投與藥劑之前或同時接種、感染或以其它方式暴露於病毒。用於本發明實踐中的動物宿主可以通過此項技術中已知的任何方法接種、感染或以其它方式暴露於病毒。在一些實施例中,動物宿主可以經鼻內接種、感染或暴露於病毒。可以使用未經處理和/或已接種的動物來進行多種研究中的任一種。舉例來說,如此項技術中已知,所述動物模型可以用於病毒傳播研究。預期在病毒傳播研究中使用雪貂可以充當關於人類病毒傳播的可靠預報因子。病毒傳播研究可用於測試藥劑。舉例來說,DV結合劑可在病毒傳播研究之前、期間或之後投與適合的動物宿主,以便測定所述藥劑在阻斷動物宿主中的病毒結合和/或感染力方面的功效。使用從動物宿主中的病毒傳播研究搜集的信息,可預測藥劑在阻斷人類宿主中的病毒結合和/或感染力方面的功效。醫藥組合物本發明提供包含一或多種所提供的抗體藥劑的組合物。在一些實施例中,本發明提供至少一種抗體和至少一種醫藥學上可接受的賦形劑。所述醫藥組合物可任選地包含一或多種其它治療活性物質和/或與其組合投與。在一些實施例中,所提供的醫藥組合物適用於藥物。在一些實施例中,所提供的醫藥組合物在治療或預防DV感染或與DV感染關聯或相關的負面影響中適用作預防性藥劑(即疫苗)。在一些實施例中,所提供的醫藥組合物適用於治療性應用,例如在罹患或易患DV感染的個體中。在一些實施例中,醫藥組合物被調配成用於投與人類。舉例來說,本文提供的醫藥組合物可以無菌可注射形式(例如適於皮下注射或靜脈內輸注的形式)提供。舉例來說,在一些實施例中,醫藥組合物以適於注射的液體劑型提供。在一些實施例中,醫藥組合物以粉末(例如凍幹和/或滅菌粉末)形式任選地在真空下提供,其在注射之前用水性稀釋劑(例如水、緩衝液、鹽溶液等)復原。在一些實施例中,醫藥組合物在水、氯化鈉溶液、乙酸鈉溶液、苯甲醇溶液、磷酸鹽緩衝鹽水等中稀釋和/或復原。在一些實施例中,粉末應輕輕地與水性稀釋劑混合(例如不振蕩)。在一些實施例中,所提供的醫藥組合物包含一或多種醫藥學上可接受的賦形劑(例如防腐劑、惰性稀釋劑、分散劑、表面活性劑和/或乳化劑、緩衝劑等)。在一些實施例中,醫藥組合物包含一或多種防腐劑。在一些實施例中,醫藥組合物不包含防腐劑。在一些實施例中,醫藥組合物以可冷藏和/或冷凍的形式提供。在一些實施例中,醫藥組合物以不可冷藏和/或冷凍的形式提供。在一些實施例中,復原的溶液和/或液體劑型在復原之後可儲存一定的時間段(例如2小時、12小時、24小時、2天、5天、7天、10天、2周、一個月、兩個月或更長)。液體劑型和/或復原溶液在投與之前可包含微粒物質和/或變色。在一些實施例中,如果變色或混濁和/或如果在過濾之後微粒物質保留,那麼不應使用溶液。本文中所述的醫藥組合物的調配物可通過藥理學領域中已知或此後發展的任何方法製備。在一些實施例中,所述製備方法包括以下步驟:使活性成分與一或多種賦形劑和/或一或多種其它附加成分結合,且接著必要時和/或需要時,將產品成形和/或包裝成所需單劑量或多劑量單位。根據本發明的醫藥組合物可以散裝、以單一單位劑量形式和/或以多個單一單位劑量形式製備、包裝和/或出售。如本文中所用,「單位劑量」是包含預定量的活性成分的醫藥組合物的離散量。活性成分的量通常等於將投與個體的劑量和/或所述劑量的方便分數,如例如所述劑量的二分之一或三分之一。根據本發明的醫藥組合物中的活性成分、醫藥學上可接受的賦形劑和/或任何其它成分的相對量可變化,取決於所治療的個體的身份、身材和/或情況和/或取決於投與組合物的途徑。作為舉例,組合物可包含在0.1%與100%(w/w)之間的活性成分。本發明的醫藥組合物可另外包含醫藥學上可接受的賦形劑,其如本文中所用可為或包含溶劑、分散介質、稀釋劑、或其它液體媒劑、分散或懸浮助劑、表面活性劑、等張劑、增稠或乳化劑、防腐劑、固體粘合劑、潤滑劑等,如適於所需具體劑型。雷明頓氏藥學科學和實踐(Remington'sTheScienceandPracticeofPharmacy),第21版,A.R.根納羅(A.R.Gennaro),(馬裡蘭州巴爾的摩的利平科特威廉士和威爾金斯公司(Lippincott,Williams&Wilkins,Baltimore,MD),2006)公開了用於調配醫藥組合物的各種賦形劑和用於製備其的已知技術。除非任何常規賦形劑介質均不與物質或其衍生物相容,如因產生任何非所需生物作用,或另外與醫藥組合物的任何其它組分以有害方式相互作用,否則預期其使用在本發明的範圍內。疫苗在一些實施例中,本發明提供疫苗組合物,其用於在罹患或易患DV感染的個體的被動免疫接種(即,向個體投與抗體的免疫接種)中使用和/或檢查。在一些實施例中,在懷孕期間在抗體從母親轉移到胎兒時發生被動免疫接種。在一些實施例中,被動免疫接種包括向個體直接投與抗體藥劑(例如通過注射、口服、經鼻等進行)。在一些實施例中,預防應用可包括投與疫苗。在一些實施例中,針對個別患者定製疫苗接種。舉例來說,如下文所述,可從患者收集血清,且針對DV的存在,且在一些實施例中針對一或多種具體DV血清型對其進行測試。在一些實施例中,所提供的疫苗的適當接受者是罹患或易患具有一或多種會被所提供的抗體結合和/或中和的DV血清型的感染的個體。在一些實施例中,疫苗是口服、鼻內、皮下、肌內、皮內或經由任何其它醫學上適當的投與途徑投與的。應了解,每種投與途徑可能需要獨特的調配物或遞送機制,且所述可變參數被涵蓋在本發明的範圍內。在一些實施例中,投與的途徑和/或調配物可在某種程度上由個體的年齡和/或狀況決定。舉例來說,向嬰兒投與疫苗可經由注射到大腿的前外側(因為肌肉質量較大)來進行。在一些實施例中,當個體是兒童或成人時,向三角肌投與疫苗可為優選的。應理解,合理的醫學判斷應用於確定向具體個體投與的適當途徑和/或調配物。在一些實施例中,疫苗組合物包含至少一種佐劑。根據本發明,可以使用任何佐劑。大量佐劑是已知的;許多此類化合物的適用綱要由美國國家衛生研究院擬制且可見於www.niaid.nih.gov/daids/vaccine/pdf/compendium.pdf;也參見艾利森(Allison)(1998,生物標準化進展(Dev.Biol.Stand.),92:3-11;以引用的方式併入本文中)、翁克萊斯(Unkeless)等人(1998,免疫學年度評論(Annu.Rev.Immunol.),6:251-281;以引用的方式併入本文中)和菲利浦(Phillips)等人(1992,疫苗(Vaccine),10:151-158;以引用的方式併入本文中)。此項技術中已知數百種不同的佐劑,並且都可用於實施本發明。可根據本發明使用的示例性佐劑包括(但不限於)細胞因子、凝膠型佐劑(例如氫氧化鋁、磷酸鋁、磷酸鈣等);微生物佐劑(例如包括CpG基元的免疫調節DNA序列;內毒素,如單磷醯脂質A;外毒素,如霍亂毒素、大腸桿菌不耐熱毒素和百日咳毒素;胞壁醯二肽等);基於油-乳液和乳化劑的佐劑(例如弗氏佐劑(Freund'sAdjuvant)、MF59[諾華公司(Novartis)]、SAF等);微粒狀佐劑(例如脂質體、生物可降解微球體、皂苷等);合成佐劑(例如非離子型嵌段共聚物、胞壁醯肽類似物、聚磷腈、合成多核苷酸等);和/或其組合。其它示例性佐劑包括一些聚合物(例如聚磷腈;描述在美國專利5,500,161中,其以引用的方式併入本文中)、Q57、QS21、角鯊烯、四氯十氧化物等。先前已在上文標題為「醫藥組合物」的部分中進一步詳細描述了醫藥學上可接受的賦形劑。組合療法應了解,根據本發明的DV抗體藥劑和/或其醫藥組合物可用於組合療法。「與……組合」並不打算暗示所述藥劑必須同時投與或調配用於一起遞送,不過這些遞送方法也在本發明的範圍內。組合物可在一種或多種其它所需治療劑或醫學程序的同時、之前或之後投與。應了解,組合中所用的治療活性劑可同時以單一組合物投與或分別以不同組合物投與。一般來說,各藥劑將按照對於所述藥劑所確定的劑量和/或時間表來投與。用於組合方案中的療法(例如治療劑或程序)的具體組合應考慮所需治療劑和/或程序的相容性以及需要獲得的治療作用。還應了解,本發明的醫藥組合物可用於組合療法(例如組合疫苗療法),也就是說,醫藥組合物可在一或多種其它所需治療和/或疫苗接種程序的同時、之前或之後投與。根據本發明的抗體藥劑的治療有效量與所提供的醫藥組合物和至少一種其它活性成分組合使用。在一些實施例中,活性成分是抗病毒劑,如(但不限於)幹擾素(例如幹擾素α-2b、幹擾素-γ等)、抗DV單克隆抗體、抗DV多克隆抗體、RNA聚合酶抑制劑、蛋白酶抑制劑、解螺旋酶抑制劑、免疫調節劑、反義化合物、短幹擾RNA、短髮夾RNA、微RNA、RNA適體、核酶和其組合。用於組合方案中的具體療法組合通常將考慮所需治療劑和/或程序的相容性和所需獲得的治療作用。還應了解,所用療法和/或疫苗可對同一病症實現所需作用(例如本發明抗原可與另一DV疫苗同時投與),或其可實現不同作用。應了解,所用療法可為了同一目的實現所需作用(例如適用於治療、預防DV感染和/或延緩其發作的DV抗體可與適用於治療、預防DV感染和/或延緩其發作的另一藥劑同時投與),或其可實現不同作用(例如控制任何不良作用)。本發明涵蓋醫藥組合物與可提高其生物可用性、減少和/或改變其代謝、抑制其排洩和/或改變其體內分布的藥劑的組合的遞送。在一些實施例中,組合使用的藥劑以不超過其單獨使用時的水平的水平使用。在一些實施例中,組合使用的水平將低於單獨使用的水平。在一些實施例中,根據本發明的DV抗體可與幹擾素、與RNA聚合酶抑制劑或與幹擾素和RNA聚合酶抑制劑兩者一起投與。在一些實施例中,組合療法可涉及投與針對單個表位(例如單個構象表位)的多種抗體藥劑。在一些實施例中,組合療法可包含識別不同表位(例如在同一病毒包膜蛋白上或在不同病毒包膜蛋白上,其中表位可能是或可能不是構象的)的多種抗體藥劑,例如從而同時幹擾感染過程中的多種機制。在某些實施例中,根據本發明的組合物恰好包含針對A股區的一種抗體藥劑。在某些實施例中,組合物包括和/或組合療法使用恰好兩種DVA股區抗體藥劑。所屬領域的技術人員應了解,根據本發明的抗體藥劑的任何排列或組合可與任何其它抗體藥劑組合以調配包含多種不同抗體藥劑的組合物和/或組合療法方案。投與方法根據本發明的DV抗體藥劑和根據本發明的其醫藥組合物可根據任何適當途徑和方案投與。在一些實施例中,途徑或方案是已與陽性治療效益相關的途徑或方案。在一些實施例中,途徑或方案是已由FDA和/或EP批准的途徑或方案。在一些實施例中,確切投與量可能在個體與個體間變化,視醫學領域中眾所周知的一或多種因素而定。所述因素可包括例如以下各者中的一或多者:個體的種類、年齡、一般狀況、感染的嚴重度、具體組合物、其投與模式、其活性模式、所治療的病症和病症的嚴重度;所用特定DV抗體藥劑的活性;所投與的特定醫藥組合物;組合物在投與之後的半衰期;個體的年齡、體重、一般健康狀況、性別和飲食;投與時間、投與途徑和所用特定化合物的排洩速率;治療持續時間;與所用特定化合物組合或同時使用的藥物等。醫藥組合物可以單位劑型形式調配以易於投藥且使劑量均一。然而,應了解,本發明的組合物的總日用量將由主治醫生在合理的醫學判斷範圍內決定。本發明的醫藥組合物可利用任何途徑投與,如所屬領域的技術人員將了解。在一些實施例中,本發明的醫藥組合物通過口服(PO)、靜脈內(IV)、肌內(IM)、動脈內、髓內、鞘內、皮下(SQ)、心室內、經皮、皮內、皮內、經直腸(PR)、經陰道、腹膜內(IP)、胃內(IG)、局部(例如利用粉末、軟膏、乳膏、凝膠、洗劑和/或滴劑)、黏膜、鼻內、頰內、經腸、玻璃體、舌下;通過氣管內滴入、支氣管滴入和/或吸入;作為口服噴霧、經鼻噴霧和/或氣溶膠和/或經由門靜脈導管投與。在特定實施例中,根據本發明的DV抗體藥劑和/或其醫藥組合物可例如通過靜脈內輸注來靜脈內投與。在特定實施例中,根據本發明的DV抗體藥劑和/或其醫藥組合物可通過肌內注射來投與。在特定實施例中,根據本發明的DV抗體藥劑和/或其醫藥組合物可通過皮下注射來投與。在特定實施例中,根據本發明的DV抗體藥劑和/或其醫藥組合物可經由門靜脈導管投與。然而,考慮到藥物遞送科學中可能的進展,本發明涵蓋通過任何適當途徑遞送根據本發明的DV抗體藥劑和/或其醫藥組合物。在某些實施例中,根據本發明的DV抗體藥劑和/或根據本發明的其醫藥組合物可以足以遞送每天每千克個體體重約0.001mg到約100mg、約0.01mg到約50mg、約0.1mg到約40mg、約0.5mg到約30mg、約0.01mg到約10mg、約0.1mg到約10mg或約1mg到約25mg的劑量水平投與,從而獲得所需治療作用。可每天超過三次、每天三次、每天兩次、每天一次、每隔一天、每隔兩天、每隔一周、每隔兩周、每隔三周、每隔四周、每隔兩個月、每隔六個月或每隔十二個月遞送所需劑量。在某些實施例中,所需劑量可使用多次投與(例如兩、三、四、五、六、七、八、九、十、十一、十二、十三、十四次或十四次以上投與)遞送。預防應用在一些實施例中,根據本發明的DV抗體藥劑可用於預防應用。在一些實施例中,預防應用涉及用於在易患DV感染和/或呈現DV感染症狀的個體中對DV感染和/或任何其它DV相關病況進行預防、抑制其進展和/或延緩其發作的系統和方法。在一些實施例中,預防應用涉及用於預防腦感染、抑制其進展和/或延緩其發作的系統和方法。在一些實施例中,預防應用涉及用於預防重要器官(例如肝)損傷、抑制其進展和/或延緩重要器官損傷的系統和方法。診斷應用在一些實施例中,根據本發明的DV抗體藥劑用於診斷應用。舉例來說,藉助於DV抗體藥劑的結合特徵曲線的多樣性,可採用診斷分析,其將檢測多種DV血清型的,以便提供泛DV抗體藥劑,而同時能夠通過減去分析來詳細分析個別血清型。出於診斷目的,抗體藥劑可以多種形式用於檢測包膜糖蛋白的A股區,辨別DV血清型,檢測病毒粒子和抗體(參見例如美國專利第5,695,390號;以引用的方式併入本文中)。抗體藥劑可單獨或與主題群組的其它抗體或者其它抗體或與和存在於DV包膜蛋白上的糖基結合的凝集素組合使用。出於診斷目的,可以使用多種標記,其中大部分先前已經提到過。這些標記包括(但不限於)螢光團、化學發光部分、放射性同位素、酶、粒子(例如膠態碳粒子、金粒子、乳膠粒子等)、存在高親和力受體的配體,和前標記(prolabel),其可經活化而提供可檢測的信號。在一些實施例中,表面塗布有蛋白質,所述蛋白質可作為游離蛋白(例如循環蛋白)或作為完整或部分完整病毒粒子的一部分結合於DV抗原。可使用結合於多種DV血清型或凝集素(例如雪滴花(Galanthusnivalis)凝集素;「GNA」)的本發明抗體。在一些實施例中,分析可涉及使表面與可能含有游離或DV締合蛋白的介質接觸,其中所述介質可為樣品或一或多種血清型的已知A股區的溶液。在孵育並洗滌以去除非特異性結合的蛋白質後,可視所分析的目的而定,以各種方式繼續進行所述分析。當分析懷疑血清反應呈陽性的血液樣品時,可將樣品施加到A股區蛋白層,孵育並洗滌,且測定結合於蛋白層的人類抗體的存在。可使用標記的α-人類抗體(不是針對主題抗體的同種型,其中最初已使用主題抗體)。在針對血清反應呈陽性的個體體內抗體的分析中,主題抗體可用作對照,使用相同試劑來檢測所述個體血清中的任何人抗DV抗體。樣品中抗體的特異性可以通過使用主題抗體來確認,其標記與抗人類抗體的標記不同,並確定其是否被樣品中的抗體阻斷。當針對DVA股區蛋白分析樣品時,檢測採用標記的主題抗體,選擇取決於所關注的是基因分型還是檢測A股區蛋白。在洗掉非特異性結合的抗體後,通過根據已知技術檢測標記的存在來確定經標記抗體的存在。可替代地或另外,當主題抗體結合於表面時,A股區的標記的凝集素可用於檢測A股區蛋白的存在。根據本發明的抗體藥劑可用於測量其它抗體(包括血清中的抗體、單克隆抗體、作為基因工程化結果表達的抗體等)的反應性。在一些實施例中,使用完整病毒粒子。在一些實施例中,使用構象保守的包膜蛋白。有關病毒粒子的捕捉,例如參見木村(Kimura)等人,1998,醫學病毒學雜誌(J.Med.Virology),56:25-32;莫瑞塔(Morita)等人,1996,肝臟及胃腸病學(Hapato-Gastroenterology),43:582-585;撒塔(Sata)等人,1993,病毒學(Virology),196:354-357;和土方(Hijikata)等人,1993,病毒學雜誌(J.Virol.),67:1953-1958;所述文獻均以引用的方式併入本文中。一種方案涉及用凝集素(例如GNA)塗布固體支撐物且接著使表面與包含完整DV病毒粒子的介質(例如血清反應呈陽性的患者的血清)接觸的步驟。通常應避免可能破壞病毒粒子的添加劑(例如清潔劑)。在孵育介質並洗滌以去除非特異性結合的介質組分後,可以使病毒粒子與根據本發明的抗體和樣品的抗體接觸。這可以同時或連續進行,其中首先添加樣品。所用主題抗體的量應易於被另一抗體所代替。所述量可憑經驗確定,並且可能希望在一系列測試中使用不同量的主題抗體。由於已知在存在和不存在樣品情況下得到的信號,使得可測定樣品中抗體的反應性或結合親和力。可以使用各種技術來測定結合於病毒粒子的主題抗體的量。在主題抗體經例如生物素或地高辛(digoxigenin)標記的情況下,用螢光團或底物會產生可檢測信號的酶標記的抗生蛋白鏈菌素或抗地高辛可用來測定主題抗體的量。標記的主題抗體藥劑可用於從活檢材料分析DV的存在。可以將經標記抗體與固定的活檢材料(如肝切片)、與一或多種主題經標記抗體的溶液一起孵育。在洗掉非特異性結合的抗體後,可以根據標記的性質,檢測結合於活檢組織的細胞的抗體的存在。在一些實施例中,根據本發明的DV抗體藥劑可用於鑑別DV受體。所屬領域的技術人員應了解,這可以多種方式實現(薩姆布魯克J.(SambrookJ.),弗裡奇E.(FritschE.)和馬尼亞迪斯T.(ManiatisT.)分子克隆實驗指南(MolecularCloning:ALaboratoryManual).冷泉港出版社(ColdSpringHarborPress),冷泉港(ColdSpringHarbor),紐約州(NY),1989;和奧斯貝等人,編,最新分子生物學實驗方法彙編,1987;所述文獻均以引用的方式併入本文中)。通常,蛋白質和肽受體可以通過測定DV包膜糖蛋白的A股區的抗體是否可以抑制DV病毒粒子與易受DV感染的細胞連接來鑑別。因此,可以此方式鑑別DVA股區蛋白和肽的受體。易感細胞可以在DV和抗DVA股區抗體的存在下孵育,並且可以使用細胞結合分析來測定在抗體存在下連接是否減少。可針對表達DV的推定受體和/或DV的推定受體的文庫的細胞結合DV的能力對其進行篩選。舉例來說,表達推定DV受體(例如DVA股區的受體)的細胞可以在抗體存在下和在足以允許DV蛋白或肽結合於細胞表面上推定受體的條件下與DV蛋白或肽接觸一段時間。可替代地或另外,DV蛋白、肽或病毒粒子可以在接觸細胞表面上的推定受體之前預先與抗體一起孵育。結合的檢測可以用例如流式細胞術等此項技術中已知的任何方式進行(參見奧斯貝等人或薩姆布魯克等人,同上文)。與不存在細胞且不存在抗體情況下的結合相比較,在抗體存在下與細胞表面的結合減少,將指示DV受體的鑑別結果。在一些實施例中,鑑別DV受體的方法包括使用固體支撐物(如珠粒、柱等)。舉例來說,DV蛋白和肽(例如A股區蛋白和/或其片段)和/或DV病毒粒子的受體可以通過以下方式鑑別:使DV抗體連接於固體支撐物,並接著使所述抗體與DV蛋白或肽接觸足以使DV蛋白或肽結合於抗體的時間。這提供了推定DV受體的DV蛋白配體,其可在固體支撐物上並在足以允許受體與DV蛋白或肽結合的條件下與抗體:配體複合體接觸一段時間。蛋白質可由文庫表達,或者以來自天然或重組細胞的細胞提取物或純化的蛋白質製劑形式提供。一旦形成DV蛋白肽之間的特異性結合複合體,就例如通過標準洗滌步驟去除未結合的DV蛋白或肽(例如不特異性結合於DV蛋白或肽的文庫蛋白或肽)。接著洗脫並鑑別結合的蛋白質,例如通過凝膠電泳進行。試劑盒本發明提供多種試劑盒,以便利地和/或有效地進行本發明的方法。試劑盒通常包含一或多種本發明的DV抗體藥劑。在一些實施例中,試劑盒包含待用於不同目的(例如診斷、治療和/或預防)的不同DV抗體藥劑的集合。試劑盒通常將包含充足量的DV抗體藥劑以允許使用者對個體進行多次投與和/或進行多次實驗。在一些實施例中,試劑盒提供有或包括已由購買者指定的一或多種DV抗體藥劑。在某些實施例中,根據本發明使用的試劑盒可包括一或多種參考樣品;說明書(例如關於加工樣品,關於執行測試,關於解釋結果,關於增溶DV抗體藥劑,關於儲存DV抗體藥劑等);緩衝液;和/或執行測試必需的其它試劑。在某些實施例中,試劑盒可包含數組抗體。試劑盒中的其它組分可包括細胞、細胞培養基、組織和/或組織培養基。試劑盒可包含使用說明書。舉例來說,說明書可告知使用者製備包含DV抗體藥劑的醫藥組合物的適當程序和/或向個體投與醫藥組合物的適當程序。在一些實施例中,試劑盒包括多個單位劑量的包含DV抗體藥劑的醫藥組合物。可以提供記憶輔助物,其例如為數字、字母和/或其它標記形式,和/或帶有日曆插頁,指定在可投與劑量的治療時程中的天數/時間。可以包括安慰劑量,和/或鈣飲食補充劑,其形式可類似於或不同於醫藥組合物的劑量,由此提供的試劑盒中具有每天服用的劑量。試劑盒可包含一或多個器皿或容器,以便能分開收納某些個別組分或試劑。試劑盒可包含將個別容器封裝於相對封閉的界限內以便上市銷售的構件,例如塑料盒,其中可封裝有說明書、包裝材料(如發泡膠(styrofoam))等。在一些實施例中,試劑盒用於治療、診斷和/或預防罹患和/或易患DV的個體。在一些實施例中,所述試劑盒包含(i)至少一種DV抗體藥劑;(ii)用於向個體投與至少一種DV抗體藥劑的注射器、針、施用器等;和(iii)使用說明書。在一些實施例中,試劑盒用於治療、診斷和/或預防罹患和/或易患DV的個體。在一些實施例中,所述試劑盒包含(i)以凍乾粉末形式提供的至少一種DV抗體藥劑;和(ii)用於將凍乾粉末復水的稀釋劑。所述試劑盒可任選地包含用於向個體投與至少一種DV抗體藥劑的注射器、針、施用器等;和/或使用說明書。本發明提供試劑盒,其含有用於產生包含至少一種DV抗體藥劑的疫苗的試劑。在一些實施例中,所述試劑盒可包括表達DV抗體、其特徵性部分,和/或其生物活性部分的細胞;(ii)供細胞生長的培養基;和(iii)適用於抗體純化的柱、樹脂、緩衝劑、試管和其它工具。在一些實施例中,所述試劑盒可包括(i)質粒,其含有編碼DV抗體、其特徵性部分和/或其生物活性部分的核苷酸;(ii)能夠用所述質粒轉化的細胞,如哺乳動物細胞系,包括(但不限於)Vero和MDCK細胞系;(iii)供細胞生長的培養基;(iv)不含編碼DV抗體的核苷酸的表達質粒,其作為陰性對照;(v)適用於抗體純化的柱、樹脂、緩衝劑、試管和其它工具;和(vi)使用說明書。在一些實施例中,試劑盒用於檢測一或多個樣品中DV的存在。所述樣品可以是病理樣品,包括(但不限於)血液、血清/血漿、外周血單核細胞/外周血淋巴細胞(PBMC/PBL)、痰液、尿液、糞便、喉拭子、皮膚病變拭子、腦脊髓液、宮頸刮片、膿汁樣品、食品基質,以及來自身體各部分的組織,如腦、脾和肝。所述樣品可以是環境樣品,包括(但不限於)土壤、水和植物群。其它未列出的樣品也可為適用的。在一些實施例中,所述試劑盒包含(i)至少一種DV抗體;(ii)已知含有DV的樣品,其作為陽性對照;和(iii)已知不含有DV的樣品,其作為陰性對照;和(iv)使用說明書。在一些實施例中,試劑盒用於中和一或多個樣品中的DV。所述試劑盒可提供用至少一種DV抗體藥劑處理含DV樣品所必需的物質和測試經處理樣品相對於未經處理樣品感染經培養細胞的能力所必需的物質。所述試劑盒可包括(i)至少一種DV抗體藥劑;(ii)能夠被培養並經DV感染的細胞;(iii)不能結合併中和DV的抗體,其作為陰性對照;(iv)能夠結合併中和DV的抗體,其作為陽性對照;(v)已知不含有DV的樣品,其作為陰性對照;(vi)已知含有DV的樣品,其作為陽性對照;和(vii)使用說明書。實例結合以下實例將更好地理解本發明。然而,應理解這些實例僅出於說明性目的且不意欲限制本發明的範圍。所屬領域的技術人員將清楚所公開的實施例的各種變化和修改,且可在不脫離本發明精神和所附權利要求書範圍的情況下作出所述變化和修改,包括(但不限於)與本發明的調配物和/或方法相關的變化和修改。實例1:通過分析相互作用的物理化學特徵來預測蛋白質-蛋白質複合體結構這個實例中的研究說明了模型化蛋白質-蛋白質(例如抗原-抗體)相互作用的關鍵物理化學特徵的發展和使用。這個實例中的分析輔助區分抗原-抗體相互作用的準確類天然結構(native-likestructure)與不準確結構,且由此有助於克服僅使用能量函數對位姿(pose)定等級的限制,如使用計算對接模型在蛋白質-蛋白質相互作用的建模中所進行般。此外,未能鑑別在這個實例中分析的九個測試案例的天然位姿強調了當前搜索算法的局限性以及與設計抗原-抗體複合體的親和力增強性突變相關的挑戰。為了捕捉一樣多的形成分子識別基礎的幾何和化學特性,十三種原子水平特徵:七種化學特徵和六種物理特徵(表1)用於描述抗原-抗體界面。此外,將包含抗原-抗體複合體的77種非冗餘3D結構的數據組組合(參見方法部分)並分成兩個部分;由40種結構組成的訓練組和由其餘37種結構組成的測試組。對應於每一結構,使用計算對接構建100個誘餌模型(參見方法部分),得到總共7,777種結構(7,700種誘餌+77種x射線)。在訓練階段中,多變量邏輯回歸分析(MLR)用於測定每一特徵(解釋性變量)與其可成功地區分x射線與誘餌位姿的程度(結果變量)之間的關係。這一分析輔助獲得可組合以預測結果變量的值的所有解釋性變量的子組。從每一PDB文檔(和其誘餌)產生的輸入特徵呈現為標準化Z分數,從而防止可引起高估(或低估)顯著性的不均勻學習。對於預測階段,預先計算的顯著特徵用於預測測試數據組中的結構是類天然的概率。來自MLR分析的結果表明,會影響準確區別天然與誘餌結構的概率的個別特徵的相對優勢度的次序是ZEPII>主鏈-主鏈H鍵>H鍵密度>帶電荷基團百分比>陽離子-π相互作用的密度>掩埋的表面積>中性極性基團百分比>離子鍵的密度。發現上述特徵中的每一者在0.05的α水平下顯著。基於邏輯回歸係數,H鍵和離子鍵密度、主鏈-主鏈H鍵以及掩埋的表面積在對接模型中似乎被高估。預期這是因為增加上述特徵的值傾向於使評分函數達到最大。相反地,ZEPII、陽離子-π相互作用、帶電荷基團和中性極性基團百分比在對接模型中似乎被低度代表。陽離子-π相互作用、帶電荷基團和中性極性基團百分比不顯著貢獻於能量評分函數;因此這些特徵在對接界面中不被優化。此外,對接模型的評估展示出對接程序並不如實地概括可離解的抗原-抗體複合體共有的成對相互作用;因此發現模擬界面具有低ZEPII值。接著,MLR用於使用預先計算的顯著特徵預測測試數據組中37種抗原-抗體相互作用的x射線結構,且接著將基於MLR的預測的靈敏度與在對接模型中使用的ZRANK能量函數的靈敏度相比較(參見方法部分)。總的來說,MLR展示出與ZRANK能量函數相比在預測x射線結構時更好(圖1),表明MLR方法在預測類天然結合位姿方面產生優於ZRANK的改進。對誘餌模型、其ZRANK分數和基於MLR的預測概率的更仔細檢查揭示了令人感興趣的見解(圖2)。ZDOCK鑑別出37種結構中的29種的類天然結構,指示計算搜索算法極其準確。然而,(1)ZRANK分數即使在結構上類似的位姿之間也會顯著變化(圖2A);(2)極其不同的結構可得到大致相同的分數,使得難以區分準確與不準確的解組(solution)(圖2A);(3)較差的不準確的解組通常得到比類天然結構好的分數(圖2A);(4)雖然基於MLR的預測概率也在結構上類似的位姿之間變化,但非天然位姿很少得到高預測概率,指示假陽性結構預測的可能性在位姿根據預測概率定等級時降低。因此,可見預測概率在與ZRANK分數相比時與RMSD更好地相關(圖2B和2C)。實例2:使用物理化學特徵來預測親和力增強性突變這個實例中的研究展示出用於設計蛋白質-蛋白質(例如抗原-抗體)相互作用的親和力增強性突變的評分流程的發展。具體來說,這個實例描述了經發展以定量成對胺基酸相互作用的傾向的數學模型(參見方法部分)。將這些統計傾向制定成向每一可能的胺基酸對分配權重的相互作用矩陣。殘基在CDR位置處的適合度(也稱為胺基酸界面適合度(AIF))是涉及所述殘基的所有蛋白質間成對接觸(被定義為彼此特定距離內的兩個胺基酸)的組合傾向。引起AIF值提高而無任何結構後果的取代被視為親和力增強的候選者。傾向使用已知蛋白質結構資料庫中對胺基酸接觸的統計來測定(參見方法部分)。避免多個距離截斷值和能量最小化步驟消除了重鏈對原子座標的依賴性。與通過先前研究得到的觀察結果一致,傾向數據展示出在互補位中酪氨酸、色氨酸、絲氨酸和苯丙氨酸優於其它殘基的優勢度(表2)。AIF量度接著用於預測抗體在三個不同系統中的親和力增強性突變,對於其來說,公開的數據驗證了預測。測試用例之一是抗EGFR抗體藥物西妥昔單抗(cetuximab,愛必妥(Erbitux)),其中達到52pM的10倍親和力提高利用輕鏈上的三個突變來工程化。這些預測的突變中的兩者(S26D和T31E)展示出如西妥昔單抗中的單一突變般提高結合親和力,且對第三個突變(N93A)的更仔細檢查揭示了Ala是在具有總體弱接觸傾向的一組殘基之中。另一測試用例是抗溶菌酶模型抗體D44.1,其中十八個突變被預測適於親和力增強。重鏈上預測的突變中的四者(T28D、T58D、E35S、G99D)是D44.1的公開的高親和力變異體的一部分。另一測試用例是靶向癌症相關的絲氨酸蛋白酶MT-SP1的抗體E2。AIF量度預測了包括T98R的八個突變,證實了先前的計算機模擬親和力增強研究,所述研究已鑑別出使抗體親和力提高14倍達到340pM的單一突變T98R。實例3:登革抗體中親和力增強性突變的設計這個實例中的分析說明了僅結合某些DV血清型的抗DV抗體可經由工程化修飾,以便產生強力中和DV的所有四種血清型的活性的變異體。具體來說,這個實例中的研究展示出登革mAb4E11中合理設計的突變加強了其對DV血清型4(DV4)的親和力,且不顯著不利影響其對DV血清型1-3(DV1-3)的結合。mAb4E11的結合和中和活性特徵曲線展示出對DV1-3的高親和力和抑制效力,但對DV4有著低親和力和中和活性(圖3)。為了工程化4E11以實現對所有四種血清型的強力中和活性,設計方法(圖4)依賴於三個重要因素:(1)生成4E11-EDIII相互作用的準確模型,(2)理解血清型特異性結構元件且再捕捉親和力和特異性的決定子,以及(3)設計賦予有利相互作用且因此提高與DV4的親和力的取代。在不存在抗體晶體結構的情況下,構建Fv區的結構模型,且使用ZDOCK軟體將模型化的Fv針對DV1的EDIII對接,且將先前公開的關於表位和CDRH3互補位的功能數據(渡邊(Watanabe)等人,2012微生物學趨勢(TrendsinMicrobiology)20:11-20)作為結合界面中的特定殘基包括在內以確保對接位姿不顯著偏離天然複合體(參見方法部分)。ZDOCK使用不同的輸入界面殘基組合運行五次,且來自每次運行的等級最佳的模型(圖5)使用MLR概率再定等級(表3)。利用MLR方法預測的最好的模型與ZRANK方法的預測不匹配。利用MLR方法預測的最好的模型通過以下方式驗證:在利用網絡伺服器ANCHOR[多斯塔尼(Dosztanyi)等人,2009生物信息學(Bioinformatics)25:2745-2746]以計算方式預測的互補位熱點與通過4E11的所有CDR環中每一位置的Ala掃描以實驗方式確定的熱點之間進行的比較與利用間接ED-III(DV1)ELISA進行的結合評估。所選模型的熱點預測正確鑑別出61%以實驗方式確定的熱點,而其餘位姿具有75倍增加,並且其維持對DV1-3的效力(圖9)。4E5A展示出對所有四種血清型的強力抑制活性,其中對DV1-4的FRNT50值分別為0.19、0.028、0.77和4.0μg/ml。為了進一步闡明4E5A活性,在DV2攻擊的AG129小鼠模型中評估抗體,其在感染後第3天展示出峰值病毒血症。在1mg/kg和5mg/kg兩者下,4E5A展示出病毒血症顯著減少,且5mg/kg治療引起病毒效價水平低於檢測限(圖10)。總起來說,這些結果展示了工程化單抗4E5A展示出對DV的所有四種血清型的強力抑制活性並且在體內具有強力抗病毒活性。可基於這項研究設計的工程化抗體(例如4E5A)代表重要藥物候選物,並且另外可被採用以用於其它輪的如此項技術中已知的親和力成熟和人類化。4E11/ED-III複合體的晶體結構在提交本專利申請案之前已被公開,這允許將這一研究中論述的結構模型與公開的複合體結構進行比較,並且的確觀察到C-αRMSD值為1.4埃的兩個結構之間的極佳對應關係,進一步證實了這項研究的重要性。討論發現治療相關抗體的傳統方法依賴於如噬菌體展示技術的實驗方法。然而,這些方法代價大,技術上具挑戰性且耗費時間。舉例來說,中和進化枝1和2病毒的流感FI6單抗是通過篩選104,000個B細胞來鑑別的。一種替代策略將為經由合理工程化修改現有抗體的特性。在這一研究中,呈現了用於從頭建模和抗體再設計的計算方法。在測試運行中,MLR預測方法在(從數種誘餌模型中)挑選X射線結構方面的靈敏度似乎優於ZRANK。此外,展示了AIF量度可在多個系統中捕捉已知的親和力增強性突變。接著,將這一框架應用於工程化對抗登革中和mAb的更廣泛特異性和親和力。由這一研究獲得的結果因以下各點而重要:(1)僅少數研究嘗試了改進抗體的交叉反應性;(2)這是第一個針對抗體再設計和親和力增強使用經驗方法的研究;以及(3)在無抗體-抗原複合體的晶體結構的情況下預測親和力增強性突變(也稱為盲式預測)。這項研究首次展示了計算方法的應用引起抗體親和力提高超過約400倍(表10)。鑑於這些計算方法的簡單性,其可廣泛地用於抗體工程化,且不同於基於物理學的能量方法,其不受開始結構的原子座標的精確位置影響。來自ZRANK的最好的對接解組在結構上與天然結構極其不同,指示遵循最好的ZRANK模型的任何親和力增強努力將不會產生富有成效的結果。親和力增強性突變也使用X射線結構通過能量學方法預測,且結果突出了在區分穩定和中性突變方面的挑戰(表11)。更值得注目地,親和力增強性突變N57E、N57S和E59N被歸類為不穩定(表11)。由於ZRANK被廣泛使用且在CAPRI實驗中已展示出相當大的成功,故這一研究中呈現的方法將在針對其它對接算法堆疊時比較好地進行。ZEPII顯著呈現的事實指示胺基酸組成和殘基間接觸含有判別能力。有趣的是,一些幾何特徵也具有區分天然界面與誘餌的預測能力。這與由先前研究得到的抗原-抗體界面更平坦且顯著良好排序或堆積的觀察結果相關。在用於生成五種不同模型的界面殘基的不同組合之間,準確模型通過使用所有已知表位和互補位界面殘基來產生,由於加入更多情形,使搜索空間變窄,並且因此增加發現近天然複合體結構的機率。噬菌體展示和定向進化方法隨機化選擇CDR環,尤其是VH-CDR環,因為其負責大部分的穩定接觸。4E11的結果展示了多樣化策略必須使用合理方法且涉及靶向多樣化的VL環。親和力增強性突變在性質上主要是極性的且存在於結合界面的外周的觀察結果與已知數據一致。很可能這些突變通過增加碰撞效率來增加結合速率。預測具有靶向活性的突變的成功率是12%(10/87)。鑑於設計問題的複雜性(即,涉及多種抗原)且考慮到隨機突變將平均地對結合親和力具有不利作用,這些結果是令人鼓舞的。研究已展示鼠類生殖系包含具有固有的以高親和力結合EDIII域的能力的基因區段(參考24,32)。儘管5種突變具有益作用,但這些突變尚未在體內共進化。密碼子水平分析展示出在N57E和S60W處的胺基酸置換需要至少兩個鹼基變化,突出了在基因組水平下的局限性。先前研究已展示由抗DV抗體識別的表位落入三個不同的區域中:(1)ED-III上的側脊表位(血清型特異性強力中和劑);(2)DIII的A股(亞複合體特異性中和劑);和(3)其它DII和DIII表位(複合體特異性或黃病毒交叉反應性中等強力中和劑)。在這一研究中,首次展示了針對A股表位的抗體可經工程化從而以良好的體外效力結合所有四種血清型。總起來說,4E5A展示出令人感興趣廣譜中和概況,且將是因治療登革疾病的潛在治療發展而受關注的抗體。人類中針對DV的單抗治療劑可能因抗體依賴性增強而面臨調節障礙。然而,近來的研究已展示對重組抗DV抗體的Fc區的修飾防止體內ADE,由此為這些較新的互補方法呈現機會。單抗表位的保守程度可為測定中和譜和體內保護的重要因素。DV4病毒的系統發生分析已揭示了存在四種不同的基因型:I(東南亞)、II(印度尼西亞(Indonesia))、III和IV(森林(Sylvatic)或馬來西亞(Malaysia))。在基因型II內,進入兩個不同進化枝的病毒簇先前被定義為IIa和IIb。4E11-5A的表位區的序列分析揭示了基因型IIa、IIb和4中的高度保守,而在基因型I中的相對較低保守,向本發明人表明經工程化的抗體將可能有效針對大部分DV4病毒。表1.物理化學特徵的描述.表2.20×20胺基酸傾向矩陣.互補位胺基酸指示在左側,而表位胺基酸指示在上側。傾向數據使用77個非冗餘抗原-抗體複合體產生。ALAARGASNASPCYSGLUGLNGLYHISILELEULYSMETPHEPROSERTHRTRPTYRVALALA0.250.590.140.5300.280.60.351.330.681.10.332.32.940.770.250.381.490.591ARG0.580.871.112.2901.750.870.670.951.030.990.440.790.750.150.50.660.292.240.57ASN0.741.321.040.940.721.281.321.081.941.030.331.051.530.540.740.780.580.830.820.41ASP0.231.680.810.600.750.540.791.040.41.272.20.620.580.510.841.080.891.050.27CYS5.29005.5936.02002.46000006.852.6800004.17GLU0.221.410.60.2300.360.390.20.570.390.140.850.390.560.440.750.550.850.170.34GLN0.440.20.720.2300.480.260.6100.780.820.3800.570.440.650.4401.020GLY0.311.010.570.491.061.370.990.720.680.560.390.90.760.940.890.510.840.610.970.74HIS0.550.640.760.8700.911.150.510.730.490.520.6100.840.270.5600.430.65ILE0.310.570.170.3200.340.730.141.20.551.330.662.221.580.310.450.9232.361.2LEU0.420.880.70.220.720.70.630.591.121.511.980.831.161.370.860.520.432.091.641LYS00.310.370.7101.860.40.160.8900.420.5901.310.170.670.171.3300.27MET00.991.17001.170.640.51.40.95003.8800.54002.11.650.84PHE1.811.360.740.720.770.871.221.162.980.811.411.170.822.051.490.671.031.780.351.6PRO0.751.040.410.200.411.120.171.9711.40.492.721.940.380.550.570.741.160SER1.121.270.620.931.371.641.540.61.160.431.250.971.021.040.730.830.931.421.430.82THR0.841.170.791.1401.061.150.341.420.540.370.831.310.160.790.771.030.240.560.76TRP1.271.711.161.053.370.472.030.992.610.511.061.781.030.7311.120.860.561.861.56TYR1.482.211.831.562.041.961.61.732.011.92.381.781.892.691.881.351.211.41.361.46VAL0.31.10.490.781.011.30.880.281.560.791.110.260.541.150.30.590.452.920.690.47表3.前五名對接結構模型的物理化學特性.第2-9列提供對接模型的預先計算的顯著特徵的值。p值和比值比(OR)列在列標題中。特徵的MLR回歸係數列在表的最後一行中。第10和11列分別提供基於MLR的預測概率和ZRANK分數。表4.引起EDIII-DV4親和力增加同時維持原始EDIII-DV1-3親和力的突變.鏈CDR位置野生型殘基突變VHH255AlaGluVHH255AlaAspVLL131ArgLysVLL257AsnGluVLL257AsnSerVLL259GluGlnVLL259GluAsnVLL260SerTrpVLL260SerTyrVLL260SerArg表5.通過親和力增強性突變得到的接觸.表6.具有相對於4E11野生型增加的EDIII-DV4親和力和類似的EDIII-DV1-3親和力的單一突變體抗體的親和力.所包括的突變是針對每一所鑑別的位置展示出最大EDIII-DV4親和力同時大致維持EDIII-DV1-3親和力的突變。KD值代表至少兩次獨立實驗的平均值。相對於野生型的親和力表7.組合突變體4E11-5A的親和力.表8.展示出突變對結合能具有加性效應的4E5A的能量計算.抗體EDIII-DV4ΔG(kcal/mol)aEDIII-DV4ΔΔG(kcal/mol)b4E11野生型-5.98---VH-A55E-7.29-1.31VL-R31K-6.03-0.05VL-N57E-6.92-0.93VL-E59Q-6.76-0.77VL-S60W-6.24-0.264E5A-9.59-3.61a在25℃下利用ΔG=RTln(KD)計算的自由能bΔΔG=ΔG突變-ΔG野生型表9.利用SPR測量的4E11和4E5A的動力學結合參數.akon值表示為(×106M-1s-1)bkoff值表示為(×10-4s-1)cN.B.,無結合表10.各種計算機模擬抗體親和力增強研究的結果的比較.表11.使用能量學方法預測的抗體突變.增加4E11的親和力的突變加陰影。方法用於估計抗原-抗體界面中胺基酸的接觸傾向的數學模型簡單來說,在抗原-抗體界面中,一對殘基在其具備有利的相互作用能量學時可能相互作用或偶然出現相互作用。胺基酸相互作用的傾向通過計算偶然預期的相互作用數(即預期的頻率)並用觀察到的頻率除以此數來計算。如果兩個胺基酸(每一者來自抗原-抗體界面的每一側)彼此相距在內(即,最短非H原子距離小於),那麼其被定義為成對殘基。如果界面處的殘基x(抗原)與y(抗體)之間的成對相互作用總數為N(x,y),那麼其同時發生頻率F(x,y)定義如下:上述方程式的分母指示界面中所有殘基對的成對相互作用的總和。必須計算互補位和表位處的每一胺基酸的發生頻率。表位中的具體胺基酸x的頻率F表位(x)定義如下:在上述方程式中,N(x)表示表位中胺基酸x的計數。分母代表表位中所有胺基酸的總數。類似地,互補位中胺基酸y的出現頻率F互補位(y)定義如下:在上述方程式中,N(y)表示互補位中胺基酸y的數目。分母指示互補位中所有胺基酸的總數。參數F(x,y)、F表位(x)和F互補位(y)使用數據組中的所有七十七種基準抗原-抗體結構測定。與先前研究得到的觀察結果一致,酪氨酸、絲氨酸、甘氨酸和天冬醯胺是最豐富的互補位殘基,而賴氨酸、精氨酸、亮氨酸和甘氨酸是最豐富的表位殘基(圖11)。如果胺基酸x和y的出現是獨立的,那麼以下方程式中定義的EF表位-互補位(x,y)是胺基酸x和y同時出現的預期的頻率。EF(x,y)=F表位(x)F互補位(y)如果抗原界面處的胺基酸x和y的同時出現率超過預期的比率,那麼以下比率RAa(x,y)變得大於1。RAs(x,y)是20×20矩陣。下文建議RAs(x,y)的示例性應用。使用RA(x,y)來測定CDR殘基的AIF。界面中CDR殘基的AIF被定義為RA(x,y)與其近鄰的總和。近鄰由距離準則定義。確定界面位置處胺基酸的最佳選擇(互補位再工程化)。鑑於抗原-抗體複合體,在CDR位置處的胺基酸偏好使用接觸潛力分數計算。具體來說,在給定CDR位置處,除甘氨酸和脯氨酸(以避免主鏈構象變化)以外,野生型(WT)殘基系統地經其餘胺基酸取代,且使用AIF量度在每一實例處評估置換的概率。置換潛力比野生型殘基高的單一突變以計算的方式再評估以尋找(a)不掩埋極性基團和(b)不引起位阻的突變。使用RA(x,y)來定量抗原-抗體界面相互作用的強度(表位-互補位界面指數)。抗原與抗體之間的相互作用由形成許多非共價鍵產生。因此,相互作用親和力與吸引力和排斥力(範德華力相互作用、氫鍵、鹽橋和疏水性力)的總和直接相關。本文中,抗體-抗原界面的相互作用強度通過所有胺基酸對組合的RA的線形組合定量研究。表示抗原-抗體界面『i』的強度的指數(稱為表位-互補位界面指數(EPII))由以下定義:在上文方程式中,Fi(x,y)表示界面i處的胺基酸x(x屬於二級結構基團)和y的同時出現頻率。使用EPII來區分真正的抗原-抗體相互作用與對接誘餌。為了區分具有最大潛力的界面與通過計算對接產生的其它誘餌界面,應通過蛋白質中的所有界面標準化EPII值。Z評分的EPII用於這一目的。如果在蛋白質中發現M界面,那麼界面i和Z評分的EPII計算如下:其中分數指示抗體結合於給定界面的概率。蛋白質中分數最高(或高於為抗原抗體相互作用(如上所述)確立的共識值)的界面為抗體結合最可能的位點。非冗餘抗原-抗體結構複合體的數據組和用於生成誘餌模型的計算對接分析來自蛋白質資料庫的總共568種抗原-抗體複合體。為了確保幾何界面特徵(平坦度、掩埋表面積等)的適當枚舉,排除了其中抗原長度小於20個胺基酸的結構。另外,許多結構含有相同或類似抗原(其可能使研究有傾向性),給予來源於多次呈現的蛋白質抗原的因子較高權重。為了從數據組去除冗餘結構,將具有同源抗原(通過BLAST_ENREF_40P值10e27界定)並共有50%表位殘基的結構歸類在同一群組下,並選擇具有最高解析度的結構作為代表。這產生了七十七種非冗餘抗原-抗體複合體結構。ZDOCK用於生成抗原-抗體相互作用的誘餌計算模型。為所有七十七種結構複合體生成誘餌模型的方案是相同的。僅抗體的可變域用於對接。兩個分子中的較大分子被視為受體,而較小分子被視為配體。配體取向在每一步驟旋轉6°以取樣各種構象。由於初始對接程序探索相對較大區域,故設置表位和互補位上推定的熱點殘基之間的距離限制以確保所產生的模型不與天然位姿顯著偏移。在任一側上選擇兩個熱點殘基以確保在結構預測下面對的挑戰相當於4E11情形。在所有誘餌模型中,推定的表位和互補位熱點彼此相距在10埃內。熱點使用網絡伺服器ANCHOR鑑別。初始對接程序產生2,000個位姿,其接著基於先前描述的所有對所有RMSD矩陣聚類。兩個對接位姿之間的RMSD基於結合界面7埃內的配體殘基計算。代表簇中心的對接的蛋白質位姿被視為誘餌模型。ZDOCK使用形狀互補性以及去溶劑化和靜電能量術語(『ZRANK』)將對接的位姿定等級。這些誘餌中的每一者使用CHARMm最小化進一步改進。X射線結構與誘餌模型組合以評估預測方法的靈敏度。4E11Fv的同源建模4E11Fv的結構模型使用SIWW-MODEL同源建模伺服器構建。研究指示將高變CDR建模的整體準確性在以下情況時是適當的:(1)目標與模板之間的序列相似性程度較高,(2)CDR環L1、L2、L3、H1、H2的主鏈構象遵循「典型結構」以及(3)重鏈CDR3(H3)並非特別長。產生4E11-EDIII(DV1-4)位姿的計算對接模型化Fv使用ZDOCK針對所選DV1病毒株的EDIII對接。使用DV1抗原,因為mAb4E11最初是從經DV1病毒感染的小鼠中分離的。DV1抗原的結構使用SWISSMODEL同源建模伺服器建模,將DV1EDIII(PDB:3IRC)的解析的晶體結構保持為模板。ZDOCK使用形狀互補性以及去溶劑化和靜電能量術語(『ZRANK』)將對接的位姿定等級。為了確保對接的位姿不顯著偏離天然複合體,將文獻中發現的映射的表位和互補位殘基強制包括在結合界面中。界面中包括的殘基是307K、389L和391W(表位;如3IRC中的DV1編號)以及101W、102E(互補位;基於序列位置的編號)。4E11與DV2、3、4(EDIII)複合的結構使用4E11-DV1EDIII結構模型作為模板建模。實例5:經修飾的登革抗體的實驗表徵這個實例中的實驗闡明了抗體中的特定工程化定點突變增強其對DV4的EDIII的親和力和/或效力,而對DV1-3的EDIII的結合親和力和/或效力沒有或僅有最低限度的減少。這個實例中的實驗還展示了工程化抗體的結合特性也可被準確定量。此外,這一研究中的實驗展示了通過將特定成功單一突變組合而設計的工程化登革抗體引起抗體親和力的最大增加。與前身抗體4E11(SEQIDNO.2和1)比較,E45A具有五個突變,4個在輕鏈(VL)中且一個在重鏈(VH)中(SEQIDNO.30和29)。這些突變在結合於DENV-4以及增加DENV-3的結合/中和方面提供獲得功能。在下文序列表中,CDR加下劃線,且突變位點為粗體且具有較大字體。SEQIDNO.1SEQIDNO.2SEQIDNO.29SEQIDNO.30為了進一步增強4E5A的活性,構築一系列突變體(表12)且通過ELISA、SPR和作為酵母上的單鏈構築體測試其與DENV1-4的結合。測試一種突變體VH_S26_del的體外活性。表12.基於4E5A的抗體突變.抗體名稱位置突變4E5A無VH_A25_del重鏈Ala25的缺失VH_S26_del重鏈Ser26的缺失VH_G27_del重鏈Gly27的缺失VH_G27A重鏈Gly27→AlaVH_G27P重鏈Gly27→ProVH_Y106R重鏈Tyr106→Arg方法抗體表達和純化抗體的重組表達在HEK293-FFreeStyle懸浮細胞(加利福尼亞州卡爾斯巴德的英傑公司(Invitrogen,Carlsbad,CA))中進行,其培養在293-FFreeStyle表達培養基(加利福尼亞州卡爾斯巴德的英傑公司)中,維持在37℃、80%溼度和8%CO2下。細胞(具有>95%存活率)經聚-乙烯-亞胺Max(PEI-MAX,波利塞斯公司(PolySciences))與等量的含HC和LC的質粒轉染。感染後七天,細胞通過在4℃下以4000rpm旋轉細胞15分鐘來收集,且經由0.45μm過濾系統(奈爾津(Nalgene))過濾。抗體使用蛋白質A鍵聯樹脂(GEHiTrap蛋白質AHP柱)在AKTA純化器FPLC系統上自上清液純化。抗體用100mM甘氨酸-HCl緩衝液(pH2.5)緩衝液洗脫,且pH通過添加10%1MTris-鹼與1MNaCl(pH8.5)來中和。經純化樣品接著緩衝交換到1×PBS(pH7.4)中且通過超濾/透濾(UF/DF)使用30KDaMWCO旋轉過濾器(密理博(Millipore))濃縮。經純化抗體使用NanoDrop分光光度計定量。競爭ELISA平衡時呈溶解狀態的抗體對EDIII的親和力通過競爭ELISA測定(1)。在96孔板中,EDIII的連續稀釋液與0.1nM的抗體在PBS-TB(含有0.01%Tween-20和0.01%BSA的PBS)中混合。將混合物孵育過夜以允許達到平衡。隨後,進行優化的EDIII間接ELISA以測量未結合或單獨結合的抗體的濃度。發展ELISA的條件,使得抗體濃度與吸光度成線性比例,且平衡不被顯著擾亂,對於獲得準確結果重要的條件(1)。經EDIII-DV1(2.5ng/孔,4℃過夜)塗布的Maxisorp板用含有1%BSA的PBS-TB阻斷1小時。在用PBS-TB洗滌孔之後,將平衡抗體-EDIII混合物添加到孔中且孵育20分鐘。在洗滌之後,結合的抗體通過與稀釋的HRP-結合兔抗人類IgG(傑克遜免疫研究(JacksonImmunoResearch))一起孵育1小時,隨後添加TMB底物(KPL)來檢測。反應用1N硫酸停止,且測定OD450。數據通過Excel(微軟(Microsoft))中的最小平方回歸與由質量作用獲得且如所述的以下模型擬合(2),調整以考慮抗體二價(3):其中u=[EDIII]i-[mAb]o+KD且w=[EDIII]i-[mAb]o+KD表面等離子體子共振登革單抗與EDIII的相互作用的結合親和力和動力學利用SPR使用Biacore3000(通用電氣醫療集團(GEHealthcare))儀器評估。簡單來說,山羊抗人類IgGFc多克隆按照製造商的說明書通過胺偶合固定在羧基甲基化聚葡萄糖CM5傳感器晶片上。分析在25℃下用含有0.05%表面活性劑P20和0.5MEDTA的PBS(pH8.5)作為操作緩衝液進行。抗體以10μl/min的流速在個別流動槽中捕獲。每一抗體的注射時間不同,得到約240-280RU為每一循環捕獲的抗體。將來自在操作緩衝液(濃度在0.78nM到50nM範圍內)中稀釋的DV1、DV2、DV3和DV4的EDIII或單獨緩衝液以60μl/min依序注射於參考表面(無抗體)和活性表面(測試抗體)上持續250秒。監測解離階段600秒。表面接著藉助於以30μl/min的流速兩次30秒注射10mM甘氨酸-HCl(pH1.5)來再生。動力學參數使用BIAevalutation軟體(拜而考(Biacore))的動力學功能與參照扣除測定。測定每一抗體的動力學參數,ka(締合速率常數)、kd(解離速率常數)和KD(平衡解離常數)。在酵母細胞表面上的結合scFv構築體使用PCTCON2質粒在酵母表面上表達。經誘導的酵母與抗原一起在室溫下孵育1小時以達到平衡。結合接著通過將酵母置放在冰上來固定,未結合的抗原用冰冷的PBS+0.1%BSA洗掉,且酵母用抗-cmycFITC[表達標籤]和抗-6×HISdylight650[抗原標籤]雙重染色。螢光信號利用FACS定量,且使用一系列抗原濃度生成結合曲線。RVP中和將產生約600,000相對光單位(RLU)的固定體積的登革報導體病毒粒子(RVP,整合分子(IntegralMolecular))在37℃下與不同濃度的抗體一起孵育1小時。RVP的株係為TVP360(DV4)。將抗體/RVP混合物接著施加到預先接種在具有補充有10%胎牛血清、1%非必需胺基酸、2mML-穀氨醯胺、20mMHEPES(pH8.0)的達爾伯克氏改良伊格爾培養基(Dulbecco’smodifiedeaglemedium,DMEM)的96孔中的1.5×104個Vero細胞中,且在37℃下孵育72小時。將海腎螢光素酶溶解試劑(普洛麥格公司(Promega))添加到每一孔中且在室溫下孵育30分鐘。光輸出使用BioTekSynergy2光度計用直接注射的海腎螢光素酶試劑測量。RLU數據通過RVP感染在不存在抗體(100%感染)的情況下標準化,且四參數對數方程擬合所述數據以測定EC50值。結果競爭ELISA相對於4E5A,數種突變體展現對DENV-4的較高親和力結合(定義為大於1.25),包括VH_S26_del、VH_G27_del和VH_G27A(圖12)。這些突變體還展現對DENV-3的較高親和力結合。表面等離子體子共振與ELISA結果一致,兩種突變體展現對DENV-4的較高親和力結合(定義為大於1.25),包括VH_S26_del和VH_G27_del(圖13B)。這些突變體還展現對DENV-3的略微較高親和力結合。對DENV-1和-2(圖13A)的結合不變。在酵母細胞表面上的結合作為單鏈Fv,VH_S26_del和VH_G27_del展現對DENV-4的較高親和力結合(圖14)。RVP中和VH_S26_del展現DENV-4RVP的較強中和,為4E5A的約19倍(圖15)。4G2為用於標準化分析的對照抗體。參考文獻1.弗裡古B(FriguetB),沙福特AF(ChaffotteAF),賈瓦德-歐漢裡恩斯L(Djavadi-OhanianceL),戈德伯格ME(GoldbergME).通過酶聯免疫吸附分析測量抗原-抗體複合物的呈溶解狀態的真正親和力常數(Measurementsofthetrueaffinityconstantinsolutionofantigen-antibodycomplexesbyenzyme-linkedimmunosorbentassay).免疫方法雜誌(JournalofImmunologicalMethods).1985;77(2):305-19.2.馬蒂諾P(MartineauP.)通過競爭ELISA的親和力測量(AffinityMeasurementsbyCompetitionELISA).在:編者孔特曼R(KontermannR),杜貝爾S(DubelS).抗體工程化(AntibodyEngineering).柏林:施普林格(Berlin:Springer);2010.第657-65頁.3.博布洛尼克SA(BobrovnikSA.)通過ELISA測定抗體親和力(DeterminationofantibodyaffinitybyELISA).理論(Theory).生物化學和生物物理學方法雜誌(JournalofBiochemicalandBiophysicalMethods).2003;57(3):213-36.等效物和範圍所屬領域的技術人員頂多使用常規實驗即可識別或能夠確定本文中所述的本發明的具體實施例的許多等效物。本發明的範圍並不打算限於以上說明書,而實際上是如所附權利要求書中所闡述。在權利要求書中,除非相反地指示或另外從上下文顯而易見,否則如「一個(a/an)」和「所述」的冠詞可能意指一或多個。除非相反地指示或另外從上下文顯而易見,否則如果一個、一個以上或所有的群組成員存在、使用於給定產品或方法中或另外與其有關,那麼在群組的一或多個成員之間包括「或」的權利要求書或說明書被視為滿足。本發明包括恰好一個群組成員存在、使用於給定產品或方法中或另外與其有關的實施例。本發明包括一個以上或所有的群組成員存在、使用於給定產品或方法中或另外與其有關的實施例。此外,應理解本發明涵蓋其中來自一或多個所列權利要求的一或多個限制、要素、條款、描述性術語等被引入到另一權利要求中的所有變化形式、組合以及排列。舉例來說,附屬於另一權利要求的任何權利要求可經修改以包括在附屬於同一基本權利要求的任何其它權利要求中可見的一或多個限制。此外,在權利要求列舉組合物時,應理解,除非另外指明,或者除非所屬領域的技術人員將顯而易見會產生矛盾或不一致,否則包括出於本文中所公開的任一目的使用組合物的方法,且包括根據本文中所公開的任一製造方法或此項技術中已知的其它方法製造組合物的方法。在要素作為清單(例如以馬庫西群組(Markushgroup)形式)呈現時,應理解所述要素的各子組也被公開,且任何元素都可從群組中去除。應理解,一般來說,在本發明或本發明的方面被稱為包含具體要素、特徵等時,本發明的或本發明的方面的某些實施例由所述要素、特徵等組成或主要由所述要素、特徵等組成。出於簡單的目的,那些實施例尚未專門地以這些詞語闡述在本文中。應指出,術語「包含」打算是開放的且允許包括額外要素或步驟。在給出範圍時,包括終點。此外,應理解除非另外指明或另外從上下文顯而易見且為所屬領域的技術人員所理解,否則表達為範圍的值可在本發明的不同實施例中採用所述範圍內的任何特定值或子範圍,達到所述範圍的下限單位的十分之一,除非上下文另外明確規定。另外,應理解,處於現有技術內的本發明的任何具體實施例可從任何一或多個權利要求中明確排除。由於所述實施例被認為是所屬領域的技術人員已知的,故其可被排除,即使所述排除在本文中並未明確闡述。本文上文和通篇論述的出版物只是提供本申請案申請日期之前的公開內容。本文中無任何內容可解釋為承認本發明者無權先於根據先前發明的所述公開內容。所屬領域的技術人員頂多使用常規實驗即可識別或能夠確定本文中所述的本發明的具體實施例的許多等效物。本發明的範圍不打算限於上述具體實施方式,而是如隨附權利要求書中所述。當前第1頁1&nbsp2&nbsp3&nbsp當前第1頁1&nbsp2&nbsp3&nbsp

同类文章

一種新型多功能組合攝影箱的製作方法

一種新型多功能組合攝影箱的製作方法【專利摘要】本實用新型公開了一種新型多功能組合攝影箱,包括敞開式箱體和前攝影蓋,在箱體頂部設有移動式光源盒,在箱體底部設有LED脫影板,LED脫影板放置在底板上;移動式光源盒包括上蓋,上蓋內設有光源,上蓋部設有磨沙透光片,磨沙透光片將光源封閉在上蓋內;所述LED脫影

壓縮模式圖樣重疊檢測方法與裝置與流程

本發明涉及通信領域,特別涉及一種壓縮模式圖樣重疊檢測方法與裝置。背景技術:在寬帶碼分多址(WCDMA,WidebandCodeDivisionMultipleAccess)系統頻分復用(FDD,FrequencyDivisionDuplex)模式下,為了進行異頻硬切換、FDD到時分復用(TDD,Ti

個性化檯曆的製作方法

專利名稱::個性化檯曆的製作方法技術領域::本實用新型涉及一種檯曆,尤其涉及一種既顯示月曆、又能插入照片的個性化檯曆,屬於生活文化藝術用品領域。背景技術::公知的立式檯曆每頁皆由月曆和畫面兩部分構成,這兩部分都是事先印刷好,固定而不能更換的。畫面或為風景,或為模特、明星。功能單一局限性較大。特別是畫

一種實現縮放的視頻解碼方法

專利名稱:一種實現縮放的視頻解碼方法技術領域:本發明涉及視頻信號處理領域,特別是一種實現縮放的視頻解碼方法。背景技術: Mpeg標準是由運動圖像專家組(Moving Picture Expert Group,MPEG)開發的用於視頻和音頻壓縮的一系列演進的標準。按照Mpeg標準,視頻圖像壓縮編碼後包

基於加熱模壓的纖維增強PBT複合材料成型工藝的製作方法

本發明涉及一種基於加熱模壓的纖維增強pbt複合材料成型工藝。背景技術:熱塑性複合材料與傳統熱固性複合材料相比其具有較好的韌性和抗衝擊性能,此外其還具有可回收利用等優點。熱塑性塑料在液態時流動能力差,使得其與纖維結合浸潤困難。環狀對苯二甲酸丁二醇酯(cbt)是一種環狀預聚物,該材料力學性能差不適合做纖

一種pe滾塑儲槽的製作方法

專利名稱:一種pe滾塑儲槽的製作方法技術領域:一種PE滾塑儲槽一、 技術領域 本實用新型涉及一種PE滾塑儲槽,主要用於化工、染料、醫藥、農藥、冶金、稀土、機械、電子、電力、環保、紡織、釀造、釀造、食品、給水、排水等行業儲存液體使用。二、 背景技術 目前,化工液體耐腐蝕貯運設備,普遍使用傳統的玻璃鋼容

釘的製作方法

專利名稱:釘的製作方法技術領域:本實用新型涉及一種釘,尤其涉及一種可提供方便拔除的鐵(鋼)釘。背景技術:考慮到廢木材回收後再加工利用作業的方便性與安全性,根據環保規定,廢木材的回收是必須將釘於廢木材上的鐵(鋼)釘拔除。如圖1、圖2所示,目前用以釘入木材的鐵(鋼)釘10主要是在一釘體11的一端形成一尖

直流氧噴裝置的製作方法

專利名稱:直流氧噴裝置的製作方法技術領域:本實用新型涉及ー種醫療器械,具體地說是ー種直流氧噴裝置。背景技術:臨床上的放療過程極易造成患者的局部皮膚損傷和炎症,被稱為「放射性皮炎」。目前對於放射性皮炎的主要治療措施是塗抹藥膏,而放射性皮炎患者多伴有局部疼痛,對於止痛,多是通過ロ服或靜脈注射進行止痛治療

新型熱網閥門操作手輪的製作方法

專利名稱:新型熱網閥門操作手輪的製作方法技術領域:新型熱網閥門操作手輪技術領域:本實用新型涉及一種新型熱網閥門操作手輪,屬於機械領域。背景技術::閥門作為流體控制裝置應用廣泛,手輪傳動的閥門使用比例佔90%以上。國家標準中提及手輪所起作用為傳動功能,不作為閥門的運輸、起吊裝置,不承受軸向力。現有閥門

用來自動讀取管狀容器所載識別碼的裝置的製作方法

專利名稱:用來自動讀取管狀容器所載識別碼的裝置的製作方法背景技術:1-本發明所屬領域本發明涉及一種用來自動讀取管狀容器所載識別碼的裝置,其中的管狀容器被放在循環於配送鏈上的文檔匣或託架裝置中。本發明特別適用於,然而並非僅僅專用於,對引入自動分析系統的血液樣本試管之類的自動識別。本發明還涉及專為實現讀