黃病毒和瘟病毒衣殼蛋白的組成和使用方法

2023-05-19 01:00:11 2

專利名稱：黃病毒和瘟病毒衣殼蛋白的組成和使用方法
技術領域：
本發明涉及使用西尼羅病毒衣殼蛋白以及包括黃病毒和瘟病毒的其他病毒衣殼蛋白和其它蛋白誘導細胞凋亡，涉及西尼羅病毒及包括黃病毒和瘟病毒的其它病毒感染的疫苗和診斷方法。本發明還涉及通過對能選擇性抑制病毒衣殼蛋白誘導細胞凋亡活性的物質的鑑定來篩選抗病毒藥物成分的方法。
背景技術：
最近，在歐洲和北美洲的溫帶地區出現西尼羅病毒(WNV)感染，威脅到人類、馬和鳥類的健康。WNV感染最嚴重的臨床表現為致命的腦炎。WNV是1937年在非洲的烏幹達西尼羅河地區首次被分離出來的，它是一種黃病毒，屬於黃病毒族，其大小為40-60nm，有二十面核殼體包膜，含有一條10,000-11,000個鹼基的正義單鏈RNA。有關WNV最近的綜述見Holloway，沒有被控制住的2000爆發。西尼羅病毒引發了對公共健康監督的重新評估，科學美國，28220-22.(Holloway，2000，Outbreak not contained.West Nile virustriggers a reevaluation of public health surveillance，Sci Am.，28220-22)文獻在此處列出作為參考。對黃病毒族病毒的綜述可參考下列文獻Neyts等，1999，黃病毒族病毒感染，Verh.K.Acad.Geneeskd.Belg.，61661-697，討論697-699(Neyts et al.，1999，Infections withFlaviviridae，Verh.K.Acad.Geneeskd.Belg.，61661-697，discussion697-699)；Leyssen等，2000，黃病毒族病毒感染的治療觀察，臨床微生物研究，1367-82(Leyssen，et al.，2000，Perspectives for the treatmentof infections with Flaviviridae，Clin.Microbiol.Rev.，1367-82)；Sherlock，1999，肝黃病毒族病毒概要，肝炎病毒雜誌，增刊6.11-5(Sherlock，1999，The hepatic Flaviviridaesummary，J.Viral.Hepat.，6 Suppl.11-5)以及Fields，Knipe和Howley編寫，病毒學領域(第三版)卷I和II，Lippincott Willliams Wilkins出版社，(1996)(Fields，Knipe， Howley，eds.，Fields Virology(3rded.)Vols.I II，LippincottWilliams Wilkins Pubs.(1996))，文獻在此處列出作為參考。
預防和治療黃病毒和瘟病毒感染的方法改進是很需要的。誘導細胞死亡和治療高度增生細胞性疾病的方法也需要改進。

發明內容
本發明提供誘導細胞死亡的方法。這些方法包括用能有效地誘導細胞死亡的數量的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段接觸細胞的步驟。依照本發明的一些具體實例，黃病毒衣殼蛋白或其功能性片段是西尼羅病毒(WNV)的衣殼蛋白或其功能性片段。依照本發明的一些具體實例，細胞與黃病毒和瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段接觸，是為了誘導細胞的死亡。依照本發明的一些具體實例，包含黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段編碼序列的核酸分子被導入細胞，細胞內編碼黃病毒或腺病毒衣殼蛋白或其功能性片段的核酸序列的表達，導致黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的在細胞內的產生，從而導致細胞的死亡。依照本發明的一些具體實例，編碼黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的核酸序列，要與細胞內序列表達所必須的調控元件可實施地連接起來。依照本發明的一些具體實例，所指的核酸分子是DNA。依照本發明的一些具體實例，所指的細胞是腫瘤細胞。
本發明提供鑑定能抑制黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的誘導細胞凋亡活性的複合物的方法。此方法包括以下步驟a)在被測組分存在時，用一個足以誘導一可測量到的細胞凋亡數量的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段來接觸細胞，和b)比較在被測組分存在和不存在情況下細胞凋亡發生的數量。本發明涉及一個鑑定抑制WNV衣殼蛋白或其功能性片段誘導細胞凋亡能力的物質的方法。此方法包括以下步驟a)在被測組分存在時，用一個足以引發一可測量的細胞凋亡數量的WNV衣殼蛋白或其功能性片段來接觸細胞，和b)比較在被測組分存在和不存在情況下細胞凋亡發生的數量。依照一些具體實例，此方法的測定是通過檢測與細胞凋亡相關聯的指示物的存在量來實現，這些指示物包括細胞膜中的磷脂醯絲氨酸鏈(PS)和DNA中的游離3′-羥基末端。
本發明涉及包含一個黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段和一個可藥用的載體的藥物組合物。依照本發明的一些具體實例，藥物組合物包含一個WNV衣殼蛋白或其功能性片段和一個可藥用的載體。
本發明涉及包括一個核酸分子和一個可藥用的載體的藥物組合物，此核酸分子包含一個編碼黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的序列。依照本發明的一些具體實例，藥物組合物包括一個包含編碼黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的序列的核酸分子，並且，此序列要和細胞內表達序列所必須的調控元件可實施性的連接。本發明涉及包括一個核酸分子和一個可藥用的載體的藥物組合物，此核酸分子包括一個編碼WNV衣殼蛋白或其功能性片段的序列。依照本發明的一些具體實例，藥物組合物包括一個包含編碼WNV衣殼蛋白或其功能性片段序列的核酸分子，並且，此序列要和細胞內表達序列所必須的調控元件可實施性的連接。按照本發明的一些具體實例，藥物組合物中包含的核酸分子是DNA。
本發明涉及對診斷為或懷疑為患有高度增生細胞性疾病的個體使用足以殺死高度增生細胞的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的給藥步驟和治療方法。本發明還涉及對診斷為或懷疑為患有高度增生細胞性疾病的個體使用足以殺死高度增生細胞的WNV衣殼蛋白或其功能性片段的給藥步驟和治療方法。依照一些具體實例，這些方法包括一個對個體使用有效量的WNV衣殼蛋白或其功能性片段的給藥步驟。按照本發明的一些具體實例，編碼黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的序列，要與細胞內表達序列所必須的調控元件可實施性的連接。按照本發明的一些具體實例，這些方法包括使用有效劑量的核酸分子來對這些個體給藥的步驟，此核酸分子包含一個能編碼WNV衣殼蛋白或其功能性片段的序列。按照本發明的一些具體實例，編碼WNV衣殼蛋白或其功能性片段的序列要與細胞中表達這些序列所必需的調控元件可操作性的連接起來。按照本發明的一些具體實例，這個核酸分子是DNA。按照本發明的一些具體實例，高度增生細胞性疾病是指癌症或牛皮癬。
本發明涉及包含一個免疫有效數量的WNV或黃病毒或瘟病毒的相關成員的衣殼蛋白和一個藥用載體的疫苗組合物。按照本發明的一些具體實例，疫苗組合物包括一個可藥用的載體和有效劑量的具有免疫原性的衣殼蛋白片段，此片段來自於WNV或黃病毒或瘟病毒相關成員的衣殼蛋白。
本發明涉及包括一個可藥用載體的疫苗組合物和一個核酸分子，此核酸分子包含一個WNV或黃病毒或瘟病毒的相關成員衣殼蛋白的編碼核酸序列。按照本發明的一些具體實例，疫苗組合物包括一個可藥用的載體和一個核酸分子，此核酸分子包含一個編碼WNV或黃病毒或瘟病毒相關成員衣殼蛋白免疫原片段的核酸序列。按照本發明的一些具體實例，此核酸分子包含一個編碼來自於WNV或黃病毒或瘟病毒相關成員衣殼蛋白免疫原片段的序列，此序列要與細胞內表達該序列所必須的調控元件可實施性的連接。按照本發明的一些具體實例，疫苗的組合物包含的核酸分子是DNA。按照本發明的一些具體實例，疫苗的組合物包含質粒。
本發明涉及使個體對WNV或黃病毒或瘟病毒的相關成員產生免疫的方法。產生的免疫反應可以是預防性的或者是治療性的。這些方法包括用一些免疫有效劑量的物質來對個體給藥，這些物質包括WNV，或黃病毒或瘟病毒相關成員衣殼蛋白，或其具有免疫原性的片段，或能編碼這些衣殼蛋白或免疫原片段的核酸分子。
本發明涉及對接觸過WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的個體的鑑定，通過用一個能與WNV或相關的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白特異性結合的抗體來檢測樣品中衣殼蛋白存在的方法，所用抗體最好是單克隆抗體。對個體樣本中WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的定量測定可用作被感染個體的病徵指示。
本發明涉及鑑定接觸過WNV或相關黃病毒或瘟病毒的個體的試劑盒以及這些試劑盒中所用的試劑。此試劑盒包含兩個容器，第一個容器中含有能與WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白特異性結合的抗體；第二個容器中含有WNV或相關黃病毒或瘟病毒的衣殼蛋白，所用抗體最好是單克隆抗體。試劑盒可以定量測定個體樣品中的WNV或相關的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白，這個數據可以用作被感染個體的病徵指示。
本發明涉及對接觸過WNV或相關的黃病毒或瘟病毒的個體的鑑定方法，它是通過使用WNV或相關的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白來檢測樣品中抗WNV或相關的黃病毒或瘟病毒的衣殼蛋白抗體的存在量的方法來實現的。樣品中抗WNV或相關的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的抗體量可以用來診斷被感染的個體。
本發明涉及檢測接觸過WNV或相關的黃病毒或瘟病毒的個體的試劑盒及所用試劑。試劑盒包括兩個容器，第一個容器中含有在感染WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白時產生的抗體，第二個容器含有WNV或相關黃病毒或瘟病毒的衣殼蛋白。試劑盒可以用來定量測定個體樣品中抗WNV或相關黃病毒或瘟病毒的抗病毒衣殼蛋白的抗體，這個數據可以用來診斷被感染的個體。
附圖簡要說明

圖1.圖的上部分為1999年在紐約從人體中分離出的WNV(WNV-HNY1999)病毒的基因結構圖示(GenBank序列號AF202541，Jia等，1999，Lancet，3541971-1972，文獻在此處列出作為參考)，衣殼蛋白用「Cp.」表示，圖的下部分為所構建的WNV衣殼蛋白表達載體pWNVh-DJY和pWNVy-DJY，本文中，這些載體也可能用其它名詞表示，此處的pWNVC-DJY也可能用pWNVCh-DJY或者pWNVCh表示，pWNVy-DJY在此也可以用pWNVCy-DJY或pWNVCy表示。
圖2為WNV衣殼蛋白表達載體pWNVh-DJY的限制性核酸內切酶圖譜。
圖3為WNV衣殼蛋白表達載體pWNVh-DJY的特徵圖譜。
圖4為WNV衣殼蛋白表達載體pWNVh-DJY的完整的有注釋的雙鏈核苷酸序列，它是5864個核酸鹼基對的組合物。限制性核酸內切酶位點、特徵和部分的構建載體表達蛋白翻譯信息已在注釋中指出。上面的核苷酸鏈是SEQ IDNO1，N-末端sIgE前導肽的蛋白序列(SEQ ID NO2)出現在其編碼區917-970位核苷酸下面。表達蛋白的WNV Cp蛋白部分的序列(SEQ ID NO3)出現在其編碼區971-1336位核苷酸下面。
圖5為WNV衣殼蛋白表達載體pWNVy-DJY的限制性核酸內切酶圖譜。
圖6為WNV衣殼蛋白表達載體pWNVy-DJY的特徵圖譜。
圖7為WNV衣殼蛋白表達載體pWNVy-DJY的完整的有注釋的雙鏈核苷酸系列，它是5864個核苷酸鹼基對的組合物。限制性核酸內切酶位點、特徵和部分的構建載體表達蛋白的翻譯信息已在注釋中指出。上面的核苷酸鏈是SEQID NO4。N-末端sIgE前導肽的蛋白序列出現在其編碼區917-970位核苷酸下面。表達蛋白的WNV Cp蛋白部分的序列出現在其編碼區971-1336位核苷酸下面。
圖8為兩個不同的WNV衣殼蛋白表達載體pWNVh-DJY和pWNVy-DJY體外轉錄/翻譯的35S標記的表達物的電泳分離的放射性自顯影免疫沉澱圖象。左邊第一泳道為分子量標記物。箭頭指示的是主要的體外翻譯蛋白。該蛋白融合於多組氨酸C末端標籤子並用抗組氨酸抗體進行免疫沉澱。
圖9為WNV Cp蛋白(SEQ ID NO5)的完整的胺基酸序列。本發明實施例3中用到的三個主要組織相容性複合物(MHC)II類限制性抗原決定表位肽WNVC-P1(SEQ ID NO6)、WNVC-P2(SEQ ID NO7)和WNVC-P3(SEQ ID NO8)列在Cp胺基酸序列下面。
圖10為採用流式細胞儀測定DNA免疫小鼠脾細胞在體外刺激後細胞內IFN-γ表達的結果。給出的數值是雙陽性細胞所佔的百分比。上面的平板指染色的細胞是INF-γ和CD44；下面的平板指染色的細胞是CD4和IFN-γ，上面一行的標記指的是用於免疫小鼠的載體加上用於體外重複刺激脾細胞的刺激物。能引起免疫的載體是pcDNA3(pcDNA3.1)、pWNVh-DJY(pWNVCh)和pWNVy-DJY(pWNVCy)。「無Ag」指的是作為體外翻譯的對照組的溫育的脾細胞(例3中有描述)，「蛋白」指的是用pWNVy-DJY體外翻譯產生的Cp蛋白來溫育的脾細胞。
圖11為HeLa細胞在用增強的綠色螢光蛋白(EGFP)表達載體pEGFP2-N1單獨轉染，或者和pWNVh-DJY或pWNVy-DJY雙重轉染後，用膜聯蛋白V流式細胞分析的結果。給出的數值是膜聯蛋白V陽性細胞在EGFP陽性細胞中所佔的百分數。
圖12A，12B，和12C為免疫後小鼠產生的WNV衣殼蛋白(Cp)特異性抗體反應。圖12A在第零周、第四周和第八周用100μg的pCWNVCp表達載體或對照載體進行肌肉內注射。免疫後的不同時間收集血清樣品並分別按為150，1 100，1 200和1 400的稀釋度來檢測WNV Cp特異性抗體。免疫後五個月時檢測到WNV Cp特異性抗體反應，誤差條狀圖代表免疫動物結果的標準偏差(n＝3)。圖12BWNV Cp特異性IgG抗體反應傳導的IgG亞類分析。圖中給出了免疫五個月後檢測的WNV Cp特異性IgG1和IgG2a反應以及IgG2a/IgG1的比例。圖12CWNV Cp特異性血清抗體用免疫沉澱印跡/免疫印跡法分析。每一個固定的膜條用來自於pCWNVCp(W)或pCDNA3(P)的免疫血清溫育。用抗-6X組氨酸單克隆抗體(+)溫育的膜條作為陽性抗體對照物。
圖13為通過刺激T細胞產生的IFN-γ(Th1)，IL-2(Th1)和IL-4(Th2)。如實施例8中描述的方法免疫小鼠和製備其脾細胞。分離的淋巴細胞用WNV Cp多肽庫刺激三天。收集上清液，用ELISA試劑盒檢測IFN-γ，IL-2和IL-4情況。每個實驗的條狀圖的誤差代表了標準偏差(S.D.)值。
圖14為通過刺激T細胞生產的趨化因子。如實施例8中描述的方法免疫小鼠和製備其脾細胞。分離的淋巴細胞用WNV Cp特異肽庫刺激三天。收集上清液，用ELISA試劑盒檢測RANTES和MIP-1β趨化因子情況。每個實驗的條狀圖的誤差代表了標準偏差(S.D.)值。
圖15A和圖15B為陽性抗原特異性CTL反應的誘導。圖15A用WNV衣殼多肽庫處理靶細胞的方法檢測免疫小鼠脾細胞的CTL反應。圖15B收集用於CTL檢測的第五天的刺激效應細胞的上清液，並檢測IFN-γ的產量。每個實驗的條狀圖的誤差代表了標準偏差(S.D.)值。
圖16A，16B和16C為肌肉組織分析。從DNA注射動物體製備冷凍肌肉切片，並用蘇木精和曙紅(HE)染色。顯示了pCDNA3(對照)載體免疫的小鼠(圖16A)和pCWNVCp免疫小鼠的肌肉切片(圖16B)的染色圖。圖放大倍率為40X。圖16CpCWNVCp免疫小鼠肌肉滲入細胞的相同性。按照實施例11中描述的方法收集細胞，並用CD4，CD8，Mac3，CD11c，CD86和B220抗體通過FACS進行鑑定。
圖17為WNV Cp蛋白序列和其它的黃病毒衣殼蛋白序列部分的序列比對。上面為Kunjin病毒衣殼蛋白的前123個胺基酸序列KJV；GenBank系列號為BAA00176(gi221967)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO9)和WNV Cp蛋白的全部123個胺基酸序列的比較。中間為日本腦炎病毒衣殼蛋白的前113個胺基酸序列JEV；GenBank序列號為NP_059434(gi9626461)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO10)和WNV Cp蛋白的前114個胺基酸(SEQ ID NO11)序列的比較。下面為登革熱病毒衣殼蛋白內部胺基酸序列片段DEN2；GenBank序列號為AAG30730(gi11119732)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO12)和WNV Cp蛋白的第10到98位胺基酸序列(SEQ ID NO13)的比較。這個排列需要在DEN2序列LTKR胺基酸延伸中圈出一個賴氨酸(在排列的上方出現的K)。括號中的數字表示相同/同源評分。序列比較和對照是用Mac載體進行的。
圖18為WNV Cp蛋白序列和其它病毒衣殼蛋白序列片段以及和原調亡蛋白序列片段的比對。WNV Cp蛋白的全部序列(胺基酸1-123)出現在圖的上面。圖中給出了WNV Cp蛋白和其它6個病毒蛋白以及其它5個原調亡蛋白的比較結果。用於比較的病毒蛋白序列是1)人體免疫缺乏病毒-1(HIV-1)89.6Vpr蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為AAA81039(gi1055033)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO27)和WNV Cp蛋白的第68位到第110位胺基酸序列(SEQ ID NO28)；2)單純皰疹病毒主要的衣殼蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為AAC57106(gi1718277)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO29)和WNVCp蛋白的第8位到第117位胺基酸序列(SEQ ID NO30)；3)埃波拉病毒核酸蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為AAG40164(gi11761746)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO31)和WNV Cp蛋白的第10位到第117位胺基酸序列(SEQ ID NO32)；4)伊波拉病毒糖蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為AAA96744(gi1141779)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO33)和WNV Cp蛋白的第4位到第23位胺基酸序列(SEQ ID NO34)；5)伊波拉病毒糖蛋白內部的另一個蛋白片段胺基酸序列(SEQ ID NO35)和WNV Cp蛋白的第50位到第73位胺基酸序列(SEQ ID NO36)；和6)風疹病毒衣殼蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為GNWVR4(gi74519)，文獻在此處列出作為參考(SEQID NO37)和WNV Cp蛋白的第64位到第114位胺基酸序列(SEQ ID NO38)。用於比較的調亡蛋白原蛋白序列是1)人BAK蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為Q16611(gi2493274)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO39)和WNV Cp蛋白的第17位到第63位胺基酸序列(SEQ IDNO40)；2)人Bcl-2相關X蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為XP_009093(gi15304386)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO41)和WNV Cp蛋白的第109位到第123位胺基酸序列(SEQ ID NO42)；3)人BIK蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為XP_015353(gi13655199)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO43)和WNV Cp蛋白的第75位到第118位胺基酸序列(SEQ ID NO44)；4)人BID蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為XP_009825(gi13647251)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO45)和WNV Cp蛋白的第84位到第95位胺基酸序列(SEQ ID NO46)；和5)人Bad蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為CAC22429(gi12309966)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO47)和WNV Cp蛋白的第15位到第23位胺基酸序列(SEQ IDNO48)。括號中的數值是相同/同源評分，最高可能的評分是590。序列比較和對照是用Mac載體進行的。
圖19為HIV-1 89.6Vpr蛋白序列和其它病毒蛋白的蛋白片段序列以及原調亡蛋白片段序列的序列對照圖。圖的上部分為HIV-1 89.6Vpr蛋白的完整序列(胺基酸1-96)。圖中給出了HIV-1 89.6Vpr蛋白和其它6個病毒蛋白以及和其它6個原調亡蛋白的比較結果。用於比較的蛋白序列是1)新德畢斯病毒p230非結構蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為NP_062889(gi9790318)(SEQ ID NO49)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第22位到第59位胺基酸序列(SEQ ID NO50)；2)WNV Cp蛋白的第68位到第110位胺基酸序列(參考上圖18中的描述)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第54位到第95位胺基酸序列(SEQ ID NO51)；3)黃瓜花葉病毒2A蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為CAB75953(gi7105855)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO52)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第77位到第89位胺基酸序列(SEQ ID NO53)；4黃瓜花葉病毒2A蛋白內部的另一個蛋白片段胺基酸序列(SEQ ID NO54)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第49位到第67位胺基酸序列(SEQ ID NO55)；5風疹病毒衣殼蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列(SEQ ID NO56)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第38位到第47位胺基酸序列(SEQ ID NO57)；6Nipah病毒融合蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為NP_112026(gi13559813)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO58)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第60位到第72位胺基酸序列(SEQ ID NO59)；和7呼腸病毒次核形式Mu2蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為AAK54467(gi14149150)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO60)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第60位到第72位胺基酸序列(SEQ ID NO61)。用於比較的調亡蛋白原序列有1)小鼠BIM蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為NP_033884(gi6753192)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO62)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第7位到第74位胺基酸序列(SEQ ID NO63)；2)大鼠BOD蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為AAC23593(gi3228566)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO64)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第23位到第74位胺基酸序列(SEQ ID NO65)；3)小鼠Mtd蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列GenBank序列號為AAC53582(gi2689660)，文獻在此處列出作為參考(SEQ ID NO66)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第16位到第67位胺基酸序列(SEQ ID NO67)；4)人Bcl-2相關X蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列(SEQ ID NO68)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第18位到第75位胺基酸序列(SEQ ID NO69)；5)人Bcl-2相關X蛋白內部的另一個蛋白片段胺基酸序列(SEQ ID NO70)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第18位到第42位胺基酸序列(SEQ ID NO71)；和6)人Bad蛋白內部的蛋白片段胺基酸序列(SEQ IDNO72)和HIV-1 89.6Vpr蛋白的第33位到第44位胺基酸序列(SEQ ID NO73)。括號中的數值是同樣/同源性評分，最高可能的評分是590。序列比較和對照是用Mac載體進行的。
具體實施例方式
首選具體實例的詳細描述本發明起於WNV衣殼蛋白(Cp)具有誘導腫瘤來源的細胞產生細胞凋亡的活性的發現。已經發現體外培養的細胞中WNV衣殼蛋白的表達導致對細胞凋亡途徑的誘導，並且最終導致高度增生細胞的死亡。研究還觀察到WNV Cp蛋白C-末端的22個胺基酸殘基肽具有誘導細胞凋亡的活性。WNV衣殼蛋白的誘導細胞凋亡的活性使得Cp蛋白和其功能性片段被用於殺死包括癌症細胞在內的快速生長的細胞以及檢測抑制誘導細胞凋亡活性組分的篩選系統，這些組分可用來治療WNV感染。
黃病毒族病毒是正義單鏈RNA病毒，分為三個屬1)瘟病毒，包括牛腹瀉病毒(BVDV)；2)C型肝炎類似病毒，包括C型肝炎病毒(HCV)；3)黃病毒。除了未分類的病毒，黃病毒屬還包括至少10個血清學決定性亞屬。WNV是蚊生日本腦炎病毒族中的成員，此病毒族也包括與WNV高度相關的日本腦炎病毒(JEV)和St.Louis腦炎病毒(SLEV)。其它的屬於不同的亞屬族的黃病毒包括黃熱病病毒(YFV)和登革熱病病毒(DENV)。核苷酸和胺基酸序列分析揭示了血清群內部和血清群之間的序列的保持性。WNV Cp蛋白也和其它包括哺乳動物調亡蛋白原的非病毒蛋白同源。
在本發明的一些具體實例中，衣殼蛋白源自於瘟病毒。在本發明的一些具體實例中，獲得衣殼蛋白的瘟病毒是牛腹瀉病毒(BVDV)。在本發明的一些具體實例中，衣殼蛋白源自於黃病毒。在本發明的一些具體實例中，獲得衣殼蛋白的黃病毒是日本腦炎病毒(JEV)。在本發明的一些具體實例中，獲得衣殼蛋白的黃病毒是St.Louis腦炎病毒(SLEV)。在本發明的一些具體實例中，獲得衣殼蛋白的黃病毒是黃熱病病毒(YFV)。在本發明的一些具體實例中，獲得衣殼蛋白的黃病毒是登革熱病病毒(DENV)。在本發明的一些具體實例中，獲得衣殼蛋白的黃病毒是西尼羅病毒(WNV)。
本發明提供使用包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白和其它蛋白或其功能性片段誘導細胞死亡的方法，在一些具體實例中，衣殼蛋白或其功能性片段來源於WNV。本發明也提供篩選抑制包括黃病毒或瘟病毒在內的病毒的衣殼蛋白和其它蛋白或其功能性片段的殺死細胞活性的物質組分的方法。在本發明的一些具體實例中，提供了篩選抑制WNV衣殼蛋白或其功能性片段的殺死細胞活性的物質組分的方法。此外，本發明還提供了藥物組成，其中包含WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒的衣殼蛋白或其它蛋白，或其功能性片段，或編碼這些衣殼蛋白或其它蛋白或功能性片段的核酸；給出了用這些藥物組合物治療已經患有細胞高度增生性疾病的方法。本發明還提供了疫苗組成，其中包含一個可藥用載體以及衣殼蛋白或其它蛋白，或其片段，或編碼衣殼蛋白或其它蛋白或其功能性片段的核酸，這些蛋白或其功能性片段來自於WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒。本發明還提供了鑑定接觸過WNV和包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒的診斷方法和試劑盒。
除非另有說明，本發明在實際實施中，運用了傳統的病毒學、免疫學、微生物學、分子生物學和DNA重組技術等學科中的方法。這些技術在文獻中有完整的說明，例如Sambrook等編輯，分子克隆實驗手冊(第二版)，冷泉港實驗出版社，冷泉港，紐約州(1989)Sambrook et al.，eds.，Molecular CloningA Laboratory Manual(2nd ed.)Cold Spring HarborLaboratory Press，Cold Spring Harbor，NY(1989)；Ausubel等編輯，現代分子生物學方法，John WileySons，紐約市，紐約州(2000)Ausubel etal.，eds.，Current Protocols in Molecular Biology，John Wiley Sons，New York，NY(2000)；Glover編輯，DNA克隆實用手冊，卷I和II(Glover，eds.，DNA CloningA Practical Approach，Vol s.I II)；Colowick和Kaplan編輯，酶學方法，學術出版社(Colowick Kaplan，eds.，Methodsin Enzymology，Academic Press)；Weir和Blackwell編輯，實驗免疫學手冊，卷I-IV，Blackwell科學出版社.(1986)Weir Blackwell，eds.，Handbook of Experimental Immunology，Vols.I-IV，Blackwell ScientificPubs.(1986)；Fields，Knipe，Howley編輯，病毒學領域(第三版)，卷I和II，Lippincott Williams和Wilkins出版社.(1996)Fields，Knipe， Howley，eds.，Fields Virology(3rded.)Vols.I II，LippincottWilliams Wilkins Pubs.(1996)；Coligan等編輯，現代免疫學方法，JohnWiley Sons出版社，紐約市，紐約州(2000)Coligan et al.，eds.，Current Protocols in Immunology，John Wiley Sons，New York，NY(2000)，在此列出的文獻均作為參考。
本文中貫穿著各種定義。多數單詞的意思是由技術熟悉人員對這些單詞所賦予的意思。在下面或本文其它地方特別為本發明定義的單詞，能夠為熟悉該技術的人員提供一個完整的特定的理解。
本文中用到的關於細胞死亡或凋亡的術語「誘導」和「產生誘導作用的」是指導致細胞死亡事件開始的行為，包括誘導細胞凋亡途徑中的部分步驟並導致細胞死亡的細胞活動。
本文中用到的「凋亡」指的是真核細胞死亡的一種形式，它與細胞壞死相區別，包括細胞骨架的破裂、細胞質的皺縮和凝聚、細胞膜外表面磷脂醯絲氨酸的表達和膜外突出，導致細胞膜中小囊泡或調亡小體的形成。關於細胞調亡的綜述可以參考文獻，例如Utz和Anderson，2000，生死抉擇信號分子蛋白酶解對調亡的調節，細胞死亡分化，7589-602(Utz Anderson，2000，Life and death decisionsregulation of apoptosis by proteolysisof signaling molecules，Cell Death Differ.，7589-602)，此處列出作為參考。
本說明書和附加的權利要求書中的單數詞「一個」、「這個」除非有明確的規定，否則均包括其複數形式。因此，例如「一個細胞」也包括兩個或更多的細胞的混合物。
本文中用到的關於衣殼蛋白或其功能性片段的短語「有效誘導細胞死亡的數量」和「有效誘導細胞死亡的水平」意思是接觸細胞的病毒衣殼蛋白或其功能性片段的數量或細胞中表達病毒蛋白或其功能性片段的水平，這個數量和水平能有效的觸發能殺死細胞的事件的產生。
本文中用到的名詞「蛋白」指的是一個胺基酸殘基的聚合物，並且不限定最短的長度。這個定義包括多肽、肽、寡肽、二聚體、多聚體等等。也包括完整長度的蛋白質和它的片段，以及蛋白質表達後的修飾蛋白，包括(不限於)糖基化、乙醯化和磷酸化作用。
本文中用到的關於病毒衣殼蛋白的短語「其功能性片段」指的是小於完整長度蛋白的保持病毒衣殼蛋白的功能並能誘導細胞死亡或凋亡的蛋白片段。
本文中用到的關於病毒衣殼蛋白的短語「其免疫原片段」指的是小於完整長度蛋白的能引起免疫反應的蛋白片段。
本文中用到的名詞「核酸」包括DNA和RNA，及其修飾形式，包括糖基修飾、殘基修飾或骨架修飾。
本文中用到的關於編碼病毒衣殼蛋白或其功能性片段的核酸的短語「完整黃病毒或瘟病毒基因組分離形式」指的是以重組體形式、構建載體形式或以其它形式從它在黃病毒或瘟病毒基因組中的自然狀態下分離出來的核酸。
本文中用到的關於編碼病毒衣殼蛋白或其功能性片段的核酸的短語「完整WNV基因組分離形式」指的是以重組體形式、構建載體形式或以其它形式從它在WNV基因組中的自然狀態下分離出來的核酸。
本文中用到的關於細胞凋亡的術語「可檢測水平」意思是可以被技術人員用其技術檢測和測量的能誘導細胞凋亡的物質的臨界的數量或水平。檢測技術依靠測定細胞「凋亡指示物」的存在度或增加度來進行。
本文中用到的細胞「凋亡指示物」指的是可以用於指示細胞凋亡的觸發和進程的細胞因子或形態學變化。細胞「凋亡指示物」包括(不限於)暴露的細胞膜磷脂醯絲氨酸(PS)、游離的DNA 3』-羥基末端和細胞質核小體。
本文中用到的關於WNA或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒的衣殼蛋白或其它蛋白誘導細胞凋亡活性的抑制劑的「複合物」指的是包括(不限於)任何可以識別的化學試劑或分子，包括小分子、肽、多肽、蛋白質、糖、核苷酸或核酸。這些物質可以是自然狀態的也可以是合成的。
本文用到的關於WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒衣殼蛋白或其它蛋白誘導細胞凋亡活性中用到的「抑制」指的是任何幹擾此活性的事件。例如「抑制」包括誘導細胞凋亡活性的消除和減弱。對病毒衣殼蛋白誘導細胞凋亡活性的抑制可以通過多種方式檢測，包括(不限於)用TUNEL(末端脫氧核酸轉移酶介導的dUTP-X平端標記)測定和用膜聯蛋白V檢測PS。
本文中用到的「可注射的藥物組合物」指的是適合病人使用的藥物組分，它無菌、無熱源，也沒有任何微粒子，參考Remington藥物科學，第18版，Gennaro等，Mack出版公司，Easton，PA，1990(Remington’s PharmaceuticalSciences，18th Ed.，Gennaro，ed.，Mack Publishing Co.，Easton，PA，1990)和美國專利美國.藥典標準，在此處列出作為參考。
本文中用到的「可藥用載體」包括任何不給接受組合物的個體造成有害影響的載體。例如，「可藥用載體」不應引起接受者產生有害抗體。專業的技術人員都很熟悉適當的「可藥用載體」，並且在Remington藥物科學(Remington’s Pharmaceutical Sciences)一書(出處見前)中也有描述。
本文中用到的「高度增生細胞」指的是那些在不適當的或不正常的時間或地點生長、分化或增生的細胞，它包括已經結束細胞周期的應該處於G0期或靜止期的細胞。例如，腫瘤細胞就包括在「高度增生細胞」裡。以「高度增生細胞」為特徵或與之相關的疾病包括癌症、自身免疫疾病、非惡性生長以及牛皮癬。
本文針對患有以「高度增生細胞」為特徵或與之相關的疾病或症狀的以及暴露於和/或感染WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒的個體中用到的名詞「治療」指的是對疾病或症狀的改良和/或消除。
本文在治療患疾病或症狀的個體中用到的短語「有效的數量」或「有效量」指的是足夠完成治療和改善和/或消除這種疾病或症狀的數量。
本文在疫苗組合物中用到的短語「免疫有效量」指的是足夠誘導一個治療的或預防性的免疫反應的數量。
本文在治療個體防止病毒感染時用到的短語「預防性免疫反應」指的是個體的免疫反應是預防性的，保護個體免受病毒感染。
本文在治療感染病毒的個體時中到的短語「治療性免疫反應」指的是改善和/或消除病毒感染的免疫反應。
本文在給個體用疫苗藥物的數量時用到的短語「治療有效劑量」指的是足夠引起個體治療性免疫反應的量。
本文在給個體用疫苗藥物的數量時用到的短語「預防有效劑量」指的是足夠引起個體預防性免疫反應的量。
本文用到的「個體」指的是能用本發明中的藥物組合物和疫苗組合物來治療的人和非人類的動物。
本文中用到的「給藥」包括(不限於)腫瘤內部注射、皮膚接種、腸胃外給藥、皮下給藥、肌肉內給藥、口服和局部傳送。
本文在給藥時用到的「腫瘤內部注射」指的是藥物成分直接注射入腫瘤部位。
本發明的多個方面涉及WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒的衣殼蛋白或其功能性片段所具有的抑制細胞增殖的能力。本發明的多個方面也涉及包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒的其它蛋白或其功能性片段所具有的抑制細胞增殖的能力。這些病毒衣殼蛋白或其它蛋白可以誘導細胞凋亡。在一些具體實例中，WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒衣殼蛋白，或其功能性片段，和/或編碼這些衣殼蛋白或片段的核酸分子被用於藥物組合物來治療患以不良細胞、尤其是高度增生細胞性如癌症或與之相關的疾病的個體。WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒衣殼蛋白或其它蛋白提供一個靶標能阻斷活病毒的功能。因此，本發明的一個方面就是可以通過鑑定抑制WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒衣殼蛋白或其它蛋白，或其功能性片段的誘導細胞凋亡的活性的鑑別複合物來鑑定抗-WNV和/或抗-黃病毒或抗-瘟病毒的組分。
本發明也涉及WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒衣殼蛋白或其它蛋白的功能性片段，和/或編碼這些片段或蛋白的核酸來誘導細胞凋亡的活性的使用，以及組成包括WNV和包括黃病毒或瘟病毒在內的病毒衣殼蛋白或其它蛋白功能性片段，和/或編碼這些片段或蛋白的核酸的藥物。在這裡用到的「WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白」的「功能性片段」指的是WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的保持了誘導細胞凋亡功能的蛋白片段。在這裡用到的「WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒衣殼蛋白或其它蛋白」的「功能性片段」指的是WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒衣殼蛋白或其它蛋白的保持了誘導細胞凋亡功能的蛋白片段。WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒衣殼蛋白或其它蛋白的功能性片段至少含有10個來自於WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒衣殼蛋白或其它蛋白的胺基酸，它也可以包含不來自於WNV或包括黃病毒或瘟病毒在內的其它病毒衣殼蛋白或其它蛋白的胺基酸序列。
本發明的特定具體實例中，我們也可以觀察到一個來自於WNV Cp蛋白的C-末端的22個胺基酸殘基的肽具有誘導細胞凋亡的活性。如圖10所示，此肽(「WNVC-P3」，本文也稱「肽3」)出現在WNV Cp蛋白的90-110位胺基酸殘基中。特別要提出的是，依照本發明的一些具體實例，WNV Cp蛋白的功能性片段包括WNVC-P3肽或其片段。WNVC-P3肽的片段包含至少3個胺基酸，這個片段可以有3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，16，17，18，19，20，或21個胺基酸殘基。WNV Cp蛋白的WNVC-P3肽、其片段、包含WNVC-P3肽或其片段的Cp蛋白片段、Cp蛋白或包含Cp蛋白序列和非Cp蛋白序列的融合蛋白都可以被檢測，以決定它們是否持有野生Cp蛋白的誘導細胞凋亡的功
WNV Cp衣殼蛋白與其它病毒，包括但不限於黃病毒家族的病毒和許多其它家族的病毒的衣殼蛋白和其它蛋白也享有同源性。WNV Cp蛋白也與非病毒蛋白，包括哺乳動物來源的原調亡蛋白享有同源性。WNV Cp和HIV-1 Vpr蛋白(具調亡活性)、Kunjin病毒Cp蛋白、日本腦炎病毒Cp蛋白、登革熱病毒Cp蛋白、單純皰疹病毒主要衣殼蛋白、伊波拉病毒核蛋白、伊波拉病毒糖蛋白、風疹病毒衣殼蛋白和下列非病毒原調亡蛋白人BAK蛋白、人Bcl-2相關X蛋白、人BIK蛋白、人BID蛋白和人Bad蛋白之間已鑑定了同源/相同的區域。此外同源/相同區域在HIV-1 Vpr蛋白和新德畢斯病毒p230非結構蛋白、黃瓜花葉病毒2A蛋白、風疹病毒衣殼蛋白、Nipah病毒融合蛋白、呼腸病毒次核形式Mu2蛋白，和下列原調亡蛋白鼠BIM蛋白、大鼠BOD蛋白、鼠Mtd蛋白、人Bcl-2相關X蛋白和人Bad蛋白之間被鑑定到。
通過檢測一個蛋白和肽的序列和測試其誘導細胞凋亡的能力，本領域的一般技術人員不需要過多實驗就可以很容易的測定一個WNV的或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白片段是否具有活性功能。縮短了的WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白可以用常規方法和很容易得到的實驗材料製備和檢測。此處使用的術語「功能性片段」指的是肽、多肽和以非肽鍵連接的胺基酸序列、或者包含與至少部分的WNV衣殼病毒或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白胺基酸序列完全相同或本質同源的胺基酸序列的蛋白，而且它有誘導細胞凋亡的能力。此處的「本質同源」指的是一個保守替代的胺基酸序列。本領域的一般技術人員用本發明中提供的公開說明和已有的公開技術，就可以製造WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的功能性片段。因此，不需要過多的實驗我們就可以用已鑑定的功能性片段取代完整長度的WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的使用和配製。
本發明也涉及了疫苗組合物，這種疫苗包含了WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的免疫原片段，和/或編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的免疫原片段的核酸，以誘導個體中預防性或治療性免疫反應。此處使用的「WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白」的「免疫原片段」指的是具有誘導免疫反應能力的WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的片段。WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的免疫原片段至少含有10個來自於WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的胺基酸，也可以包含不來自於WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的胺基酸序列。本領域的一般技術人員通過用傳統的免疫檢測來篩選一個蛋白和肽免疫響應產生的抗體，而不需要過多實驗就可以很容易的測定一個WNV的或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白片段是否具有免疫原性。例如，這些實驗包括，1)酶聯免疫吸附實驗(ELISA)，2)淋巴器官細胞增生測定，3)細胞對給定抗原所產生的抗體數量的測定。這些標準測試方法的詳細描述可以在Weir和Blackwell，實驗免疫學手冊，Supra和Coligan編寫，免疫學通用方法(Weir Blackwell，eds.，Handbook of Experimental Immunology，supra and Coligan et al.，eds.，Current Protocols in Immunology)等有關免疫學手冊中找到。本領域的一般技術人員可以按照本發明提供的公開說明和已有的廣為人知的技術來生產和鑑定WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的免疫原片段。因此，不需要過多的實驗我們就可以用已鑑定的免疫原片段取代完整長度的WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的使用和配製。
本發明在治療方面的應用包括在藥物組合物中使用WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、WNV的或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的功能性片段、編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的核酸分子、或者編碼WNV的或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的功能性片段的核酸分子，和對患有癌症或牛皮癬等高度增生細胞性或相關疾病的治療。
本發明的一個方面是將WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、或其功能性片段、或編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的核酸分子用於藥物組合物中來治療以不良細胞為特徵的疾病，這些疾病包括(不限於)那些以高度增生細胞為特徵的疾病，如癌症或牛皮癬。按照本發明，提供的藥物組合物包含WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、或其功能性片段、或由包含編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白及其功能性片段的DNA或RNA核酸序列。
本發明的另一個方面涉及包含WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、或其功能性片段、和/或編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的核酸分子和一個可藥用的載體或稀釋劑的藥物組合物，包含WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、或其功能性片段、和/或編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的核酸分子的藥物組合物對治療具有高度增生細胞性疾病和症狀的病人是有用的。如此處所述，由於WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、或其功能性片段的定義就是能誘導細胞凋亡的因子，對以不良細胞(如高度增生細胞)為特徵的疾病的有效藥物組合物就可包括WNV和相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、或其功能性片段、和/或編碼黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白及其功能性片段的核酸分子。本發明中藥物組合物對以腫瘤為特徵的癌症具有特異性的作用。刺激高度增生細胞凋亡的能力提供了一種破壞高度增生細胞的方式，從而使腫瘤縮小。對諸如癌症和牛皮癬等以不適當高度增生細胞為特徵的疾病，本藥物組合物通過對細胞凋亡的誘導，來阻滯高度增生細胞，從而達到對疾病的治療。
如前所述，本發明的另一個方面是對患有與高度增生細胞有關疾病的個體的治療方法，它包含一個對所說的個體的給藥步驟，所用的藥中含有足以誘導所述細胞凋亡數量的WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、或其功能性片段、和/或編碼這些蛋白和片段的核酸分子。
本發明的另一個方面是一個治療患有不良細胞相關疾病如自身免疫疾病的個體的方法，這個方法包含一個對所述個體的給藥步驟，所用的藥中含有足以誘導所述細胞凋亡的WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、或其功能性片段、和/或編碼這些蛋白或片段的核酸分子。
本發明的另一個方面涉及疫苗組合物，它包含WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、或其免疫原片段、和/或編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其免疫原片段的核酸分子，和一個可藥用的載體或稀釋劑。由WNV或相關黃病毒或瘟病毒的衣殼蛋白或它們的免疫原片段組合物的疫苗成分能使個體對WNV或相關黃病毒或瘟病毒產生免疫。這個免疫可以是預防性的(防止感染)或治療性的(治療感染)。預防性免疫能保護個體不受病毒的侵擾，治療性免疫能治療個體當前所受的病毒性感染。
如前所述，本發明的一個方面是一個治療感染WNV或相關黃病毒或瘟病毒個體的方法，它包含一個對所述個體的給藥步驟，所用藥物含有足以誘導一個治療性免疫反應的數量的WNV或相關黃病毒或瘟病毒的衣殼蛋白或其免疫原片段組合物。
本發明的另一個方面是一個防止個體感染WNV或相關黃病毒或瘟病毒的方法。這個方法包含給所述個體用藥的步驟，所用藥物含有足夠誘導一個預防性免疫反應的WNV或一個相關黃病毒或瘟病毒的衣殼蛋白或它們的免疫原片段組合物。
當WNV或相關黃病毒或瘟病毒的衣殼蛋白或其功能性片段作為疫苗組分被用於個體時(不論在疫苗中是以直接的蛋白形式或者是以核酸序列表達的形式被使用)，衣殼蛋白或其免疫原片段成為一個誘導個體產生免疫反應的靶點，防禦個體不受感染(預防性)或者治療個體的感染(治療性)。技術人員會認識到這個免疫反應可以同時是治療性的和預防性的，因為在一個治療性的醫療後，此個體可被保護以免被病毒進一步感染。
病毒衣殼蛋白如上所述，WNV衣殼蛋白或其功能性片段可以用易得的原料和常規方法來生產。我們已經知道編碼WNV衣殼蛋白的核酸序列和胺基酸序列。許多WNV分離株的完整基因組已經公布並可以在基因庫(GenBank)中得到，包括2741號分離株(序列為AF206518)、NY99-火烈鳥382-99毒株(序列號為AF196835)、毒株HNY1999的完整的聚蛋白基因(序列號為AF202541)和序列號為M12294的分離株，在此列出作為參考。有許多涉及WNV基因組的序列信息的文章，它們的引文都與GenBank中的序列信息有關，在這裡列出的每個參考文獻，包括公開的可利用的序列信息，都作為參考。
其它黃病毒或瘟病毒的衣殼蛋白和核酸的序列信息在GenBank中也可以找到。例如(不限於)GenBank所提供的毒株和分離株的完整基因組序列包括JEV(序列號為M18370，D90194和D90195)，SLEV(序列號為M16614)，YFV(序列號為AF094612，U17067，U17066，U54798，U21055，U21056和X03700)，DENV(序列號為M23027，U88535，U88536和U88537)以及BVDV(序列號為M31182)，此處列出作為參考。
提供一段編碼所需蛋白的合適DNA序列可以採用已知的重組技術進行蛋白生產。比如，編碼序列可以採用PCR引物從被感染的細胞中克隆得到，所用的PCR引物可以以公開的可利用的序列信息為基礎設計。DNA序列也可以用DNA合成儀化學合成。當編碼序列採用化學合成時，可以利用該DNA表達的宿主細胞的已知密碼子偏好性的優點。另外還可改變編碼序列，比如點突變，插入或缺失，來產生對照體和衣殼蛋白其他的修改型。
本領域的一般技術人員，使用已知的技術能夠得到編碼WNV或一個相關的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的DNA分子，並且將該DNA分子插入到一個可利用的商業化表達載體使用在眾所周知的的表達系統中。例如，商業化的質粒pSE420(Invitrogen，San Diego，CA)可以用於大腸桿菌生產衣殼蛋白。商業化的質粒pYES2(Invitrogen，San Diego，CA)可以用於酵母細胞如釀酒酵母生產衣殼蛋白。商業化的MaxBac 2.0Kit(Invitrogen，San Diego，CA)，帶有pBlueBac4載體，是一個完整的杆狀病毒表達系統，可以用於昆蟲細胞如Sf9細胞生產衣殼蛋白。商業化的pcDNA I(Invitrogen，San Diego，CA)可用於在哺乳動物細胞如CHO細胞中生產衣殼蛋白。
本領域的一般技術人員，採用常規技術和易得的起始原料，就能夠使用這些商業化的表達載體系統或其他系統生產WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白。
本領域的一般技術人員，可以使用其他商業化的表達載體和系統，或者使用已知方法和易得起始原料來構建載體。包含必須的調控序列，如啟動子、多腺苷酸化信號，最好包含增強子的表達系統很容易得到並被用於廣泛的宿主中。例如，參見Ausubel等編寫的分子生物學通用方法(Current Protocolsin Molecular Biology)一書。
因此，所需蛋白可在原核和真核系統中生產，並會產生一系列的蛋白加工形式。
儘管能夠使用諸如枯草芽胞桿菌、假單胞菌的其他表達系統，最普遍使用的原核表達系統仍然是大腸桿菌表達系統。原核系統合適的調控序列包括組合物型和誘導型啟動子，但這些啟動子包括(不限於)lac啟動子、trp啟動子、雜合啟動子如tac啟動子、λ噬菌體P1啟動子。一般而言，在這些宿主中外源蛋白可以以融合蛋白或完整蛋白形式生產。當所需蛋白以完整蛋白形式生產時，生成的序列前面可能會有一個甲硫氨酸，這個甲硫氨酸不必被有效去除。因此，在此所要求的多肽和蛋白在細菌中生產時其N末端可能會有甲硫氨酸。而且，可以構建在肽鏈編碼序列前加上一個可操作的信號肽從而導致蛋白分泌表達的表達系統。在原核宿主中以這種方式表達時，信號序列在蛋白分泌時被切除。
現在，許多真核宿主也被用來生產重組外源蛋白。儘管在細菌中，原核宿主在被表達系統轉化後能直接產生所需蛋白，但更普遍採用的是用信號肽序列來實現蛋白的分泌表達。真核系統有個額外的優點，能夠加工內含子，內含子可能在編碼高等生物體蛋白的基因組序列中存在。真核系統還提供許多加工機制，例如這些加工機制可以產生糖基化、羧基端醯胺化、某些胺基酸殘基的氧化或衍生化、構象調節等。
一般使用的真核體系包括(不限於)酵母細胞、真菌細胞、昆蟲細胞、哺乳動物細胞、鳥細胞和高等植物細胞。類型的宿主細胞，都有與之相適應的合適的啟動子。另外，還有相應的終止序列和增強子，如杆狀病毒多角體增強子。如上所述，啟動子可以是組合物型的或誘導型的。例如，在哺乳動物體表達系統中，小鼠金屬硫蛋白啟動子被重金屬離子誘導。
適合所需宿主的表達系統的構建細節對技術人員來說是已知的。對於蛋白的重組生產來說，將編碼蛋白的DNA序列合適地連接到所選的表達載體上，然後轉化合適地宿主細胞，宿主細胞在一定條件下培養表達蛋白。從該培養物中，通過裂解細胞或從培養基中分離得到本發明的蛋白，這些對技術熟悉人員來說是已知的。
一個具有普通技術的技術熟練人員，可以採用已知的技術分離得到用這些表達系統生產的WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白。
除了通過重組技術生產這些蛋白外，多肽合成也可用於WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或其功能片段的生產。需要注意地是如果蛋白是化學合成的，胺基酸可以由不能被基因編碼的胺基酸取代。例如，可選的胺基酸殘基分子式為H2N(CH2)nCOOH的胺基酸，其中n為2～6。這些都是中性非極性胺基酸；肌氨酸(Sar)、叔丁基丙氨酸(t-BuAla)、叔丁基甘氨酸(t-BuGly)，N-甲基異亮氨酸(N-MeIle)、正亮氨酸(Nleu)也屬於這類胺基酸。例如，芳香族中性胺基酸苯基甘氨酸能夠取代色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸；瓜氨酸(Cit)和蛋氨酸亞碸(MSO)為極性的中性胺基酸，環己基丙氨酸為非極性中性胺基酸，磺丙氨酸(Cya)為酸性胺基酸，鳥氨酸(Orn)為鹼性胺基酸。如果一個或更多的脯氨酸殘基被羥脯氨酸所取代，可得到脯氨酸殘基所具有的構象特性。
本發明公開的部分涉及藥物組合物，公開的另外部分涉及治療性或預防性的疫苗組合物。本發明的藥物組合物對個體給藥以殺死細胞，本發明的疫苗組合物對個體給藥是為了誘導預防性或治療性的抗病毒免疫反應。本發明的藥物組合物是以有效誘導細胞凋亡和殺死細胞的數量給藥。本發明的疫苗組合物是以有效誘導免疫反應的數量給藥。
無論組分被製備成藥物或是疫苗，組合物成分的很多方面、配方、劑量、藥物和疫苗的給藥都是相關的，而且可以是完全相同的，這些很容易被熟悉的技術人員所理解。例如，本發明的藥物組分和疫苗兩者都可能包含WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或相關的片段。在藥物組合物中衣殼蛋白或相關片段將在細胞凋亡方面起作用，而在疫苗當中衣殼蛋白或相關片段是作為免疫原的。本發明的相關方面被認為與藥物組分和疫苗都有關。
根據選用的給藥方式而確定的藥物組合物，技術熟練的技術人員可配製藥物組合物。該藥物成分被用於治療以高度增生的細胞為特徵的疾病。該藥物成分包含有WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白、或其功能性片段，和一個可藥用的載體或稀釋劑。可藥用的載體描述見Remington藥物科學(Remington’s Pharmaceutical Sciences)一書，該書為該領域標準參考書。
對所有給藥途徑的共同要求是有效性和容易實施性。本發明的一個具體實例中，藥物組分通過注射給藥。在一個首選的具體實例方案中，藥物給藥採用腫瘤內注射。其他的給藥方式包括(不限於)皮膚給藥、皮下給藥、腹膜內給藥、黏膜給藥或一般的持續給藥。
例如，對腸胃外給藥，WNV或相關的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段與合適的腸胃外載體可被配製為溶液、懸浮液、乳劑或凍乾粉。這樣的載體例子有水、鹽水、林格液、葡萄糖溶液、5％人血清白蛋白。也可以使用脂質體和非水性載體如不揮髮油。載體或凍乾粉可包含維持等滲性的添加劑(如氯化鈉，D-甘露醇)和保持化學穩定的添加劑(如緩衝劑和防腐劑)。製劑通過普遍使用的技術滅菌。例如，適用於注射給藥的腸胃外的藥物可按1.5％的活性成分重量比用0.9％氯化鈉溶液配製。
儘管個體的需要會有變化，最佳的藥物有效劑量範圍可用一定的技術方法確定。根據動物研究，很容易推斷出人類的劑量，見Katocs等，Remington藥物科學，第18版，第27章，Gennaro編寫，Mack出版公司，Easton，PA，1990(Katocs et al.，Chapter 27 InRemington’s Pharmaceutical Sciences，18th Ed.，Gennaro，ed.，Mack Publishing Co.，Easton，PA，1990)。一般來說，藥物劑量要求提供有效的藥物量，這個劑量可由熟知該領域的人員進行調整，它根據幾個因素而變化，包括年齡、健康、身體情況、體重、受體疾病的類型和程度、治療頻率、同時治療的特性(如果需要)、和預期效應的性質和範圍，見Nies等，Goodman和Gilman治療藥物基礎，第9版，第三章，Hardman編寫，McGraw-Hill，紐約市，紐約州，1996(Nies et al.，Chapter3InGoodman Gilman’s The Pharmacological Basis of Therapeutics.9thEd.，Hardman et al.，eds.，McGraw-Hill，New York，NY，1996)。通常，WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段的每日劑量大約為1μg 100mg/kg體重。為了有效的達到預期效果，一般劑量為每天0.5mg 50mg/kg體重，更合適的劑量為每天1mg-10mg/kg體重，每天分1-6次或以持續釋放形式給藥。
根據本發明藥物組分可以單劑量或多劑量給藥。本發明藥物組分可以單一治療製劑或聯合其他治療製劑進行給藥。本發明的治療可以結合常規療法，可順序或同時給藥。
任何能夠使活性成分達到受體體內的作用位點的給藥方式都可以用於包含WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段或衍生物的藥物的給藥。由於蛋白通過口服給藥會被消化，一般使用腸胃外給藥如靜脈、皮下、肌肉給藥來優化吸收。另外，本發明藥物可以在細胞高度增生部位或附近位點注射。例如，給藥可以直接對腫瘤硬塊注射或注射在直接與之相鄰的組織中。如果要治療患有牛皮癬的個體，WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或功能性片段可用合適的外用載體配製成霜劑、洗液、軟膏外用給藥。
根據所選用的給藥方式確定的藥物組合物，技術人員可製備疫苗製劑。該疫苗用於預防或治療WNV或相關的黃病毒、瘟病毒對個體的感染。該疫苗成分包含有WNV或相關的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、或其功能性片段，還包含合適的藥物載體或稀釋劑。合適的藥物載體描述見Remington藥物科學(Remington’s Pharmaceutical Sciences)一書，該書為該領域標準參考書。可藥用的載體也包括其它任何不會對受體產生有害抗體的載體。適用的載體包括代謝緩慢的大分子，如蛋白質、多糖、聚乳酸、聚乙醇酸、多聚胺基酸、胺基酸共聚物和脂質聚集體(如油滴或脂質體)。這些載體都為對該領域熟悉的人員所知。另外，這些載體可作為免疫刺激試劑(佐劑)。此外，抗原還可以連接到一個細菌類毒素上，如白喉或破傷風的類毒素。
可以和本發明疫苗同時使用的佐劑包括(不限於)(1)鋁鹽，如氫氧化鋁、磷酸鋁、硫酸鋁等；(2)水包油乳化製劑，如(a)合成佐劑(SAF)，Chiron公司(Emeryville，CA)，(b)Ribi佐劑系統(RAS)(Corixa，Seattle，WA)，該佐劑包含去毒內毒素和分支桿菌細胞壁成分和2％角鯊烷；(3)水包油乳化製劑，如TiterMax，CytRx公司(Norcross，GA)；(4)皂角佐劑，如Stimulon(Cambridge Bioscience，Worcester，MA)或能產生免疫刺激複合物的顆粒；(4)弗氏完全佐劑(FCA)和弗氏不完全佐劑(FIA)；(5)細胞因子，如白細胞介素(IL-1，IL-2等)、巨噬細胞集落刺激因子(M-CSF)、腫瘤壞死因子(TNF)等；(6)能夠作為免疫刺激試劑提高疫苗成分免疫效果的其他物質。
典型的本發明的疫苗包含稀釋劑如水、鹽、甘油、乙醇等。另外，輔助物質如保溼劑或乳化劑，pH緩衝物質等類物質可以存在於載體中。
典型的本發明的疫苗是被製備成溶液或懸浮液形式的血管注射劑。也可以被製備成適合於溶解或懸浮的固體製劑，在注射前用液體載體溶解和懸浮。如上面在可藥用的載體中所述那樣，為了加強佐劑效果，製劑也可被乳化或包在脂質體中。
本發明疫苗組合物包含有效數量的WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段或衍生物。任何能使受體免疫系統產生預防性或治療性免疫反應的給藥方式都可用於該疫苗的給藥。WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段或衍生物的免疫有效劑量是對個體的給藥量，給藥無論以單劑量或作為系列給藥的一部分進行，對個體預防或治療都是有效的。用量隨以下條件不同而不同被治療個體的健康和身體情況、被治療個體的分類(如非人類靈長目動物、靈長目動物等)、個體免疫系統合成抗體的能力、需保護的程度、疫苗的配方、藥學情況的醫師評價及其它相關因素。我們期望藥物用量落在一個比較寬的能通過常規試驗測定的範圍內。
對任何給藥途徑的一個共同要求是有效性和容易實施性。本發明的一個具體實例中，疫苗通過腸道外給藥如注射，可以是皮下注射或肌肉注射。其他的給藥方式包括(不限於)皮膚給藥、皮下給藥、腹膜內給藥、黏膜給藥或一般的持續給藥。劑量處理可以是單劑量或多劑量方案。疫苗可以與其它免疫調節因子和/或其它疫苗聯合給藥。
核酸本發明的另一方面涉及含有編碼WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段的核酸分子及可藥用的載體或稀釋劑的藥物構成。根據本發明，編碼WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段的遺傳物質以一種能表達的形式導入個體中。遺傳物質DNA或RNA被個體細胞攝取並表達。由此生成的WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段能誘導高度增生細胞的凋亡。因此，含有編碼WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段遺傳物質的藥物和含有WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段的藥物一樣有用用於治療以高度增生細胞為特徵的或與之相關的病狀的個體。本發明藥物構成對治療以硬腫瘤為特徵的癌症特別有用。
本發明進一步的方面涉及治療患有與高度細胞增生有關疾病的個體的治療方法。治療方法包含將一定量的核酸分子給所述個體給藥，核酸分子包含編碼WNV或相關的黃病毒、瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段的核酸序列，並且要可執行的連接到表達這些序列所必須的調控元件上。
本發明的另一方面涉及含有編碼來自於WNV或相關的黃病毒、瘟病毒的衣殼蛋白，或其免疫原片段的核酸分子及可藥用的載體或稀釋劑的疫苗。根據本發明，編碼衣殼蛋白或其免疫原片段的遺傳物質以一種能表達的形式導入個體中。遺傳物質DNA或RNA被個體細胞攝取並表達。由此生成的衣殼蛋白，或其免疫原片段用來誘導個體的免疫反應。因此，含有編碼WNV或相關的黃病毒、瘟病毒來源的衣殼蛋白，或其免疫原片段的遺傳物質的疫苗和衣殼蛋白的疫苗一樣可以免疫個體。如果個體未受感染，免疫是預防性的；如果個體已被感染，免疫是治療性的。因此，本發明更深的方面是關於防止感染或治療感染個體的方法。
編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒的衣殼蛋白或其功能性片段的核苷酸序列，與個體細胞中表達所必需的調控元件可實施性的連接，可以被作為藥物組分使用基因治療策略來遞送，這些策略包括(不限於)使用病毒載體如腺病毒或逆轉錄病毒載體，或直接的核酸轉染。用病毒載體傳送感興趣的蛋白的編碼核酸的方法已經有廣泛的報導。用常規方法從起始原料中可以得到一個重組病毒載體如逆轉錄病毒載體、腺病毒或腺關聯病毒載體。重組病毒載體包含一個編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的核苷酸序列。這個載體與可藥用的載體或稀釋劑結合，得到的藥物製劑可以給個體用藥。一旦個體感染病毒載體，被感染的細胞中就會產生WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白、或其功能性片段。
編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其免疫原片段的核苷酸序列，與個體細胞中表達所必需的調控元件可執行性的連接，可以被作為疫苗組分應用，疫苗組分包含病毒載體，例如腺病毒，腺相關病毒，痘苗病毒或逆轉錄病毒，或細菌或分支桿菌載體。此外，核苷酸序列也可以與活的和/或減毒的疫苗聯合使用。
另一個選擇，一個包含編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性或免疫性片段的核酸序列的分子，可以通過直接核酸轉移被作為藥物組分或疫苗給藥，而不使用感染性載體。此核酸分子可以是DNA或RNA，最好是DNA。此DNA分子可以是線性的也可以是環狀的，最好是質粒。此核酸分子可與一個可藥用的載體或稀釋劑合用。
如上所述，本發明的藥學成分和疫苗的組成、配方、劑量和給藥的許多方面是相關的，並且可以是相同的。例如本發明中的藥物組合物和疫苗都可包含一個編碼WNV和相關黃病毒和瘟病毒衣殼蛋白或其片段的核酸。藥物組合物中的編碼衣殼蛋白或其片段的功能是誘導細胞凋亡的活性，而疫苗中編碼的衣殼蛋白或其片段是作為免疫原。相關方面的公開部分被認為與藥物組合物和疫苗兩部分都有關聯。
重要的是，在藥物組合物中，核酸的用量必須足以表達出足夠的產物來誘導細胞死亡。如果核酸編碼的是片段，則此片段必須是功能性片段。免疫原性不是藥物組合物相關的特徵，然而，在疫苗組合物中，免疫原性是決定性的。疫苗的基本活性是誘導一個預防性的或治療性的免疫反應。如果核酸編碼的是一個片段，則此片段必須是免疫原片段。
按照本發明，包含一個編碼WNV或一個相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白，或其功能性片段的藥物成分或疫苗可以直接用於個體給藥。遺傳物質被引進個體的體細胞內。首選的給藥路線包括肌肉注射、腹膜內給藥、真皮內給藥的以及皮下給藥。另一種選擇，就是將藥物成分通過不同的方法引入從個體中取出的細胞中。例如，這些方法包括轉染、電穿孔和微粒轟擊。細胞吸收核酸分子後，將細胞重新植入個體中。期望的是即使此處用的預防接種疫苗的細胞最初來自於另一個個體，這個帶有遺傳重組體的非免疫原細胞也可以被植入到其他個體中。
遺傳重組體可以通過很多工具來給藥，包括但不限於傳統的注射器、無針注射設備或「微粒轟擊基因槍」。在本發明的一些具體實例，遺傳重組體是用無針注射設備對個體給藥。在本發明的一些具體實例，遺傳重組物是採用無針注射設備同時對個體的真皮、皮下和肌肉給藥。無針注射設備是很熟悉的和被廣泛使用的一種設備，一般技術人員按照本文的指導，就可以用無針注射設備來給個體的細胞導入遺傳物質。無針注射設備非常適合對所有組織導入遺傳物質。他們特別適合將遺傳物質導入皮膚和肌肉細胞。在一些具體實例中，一個無針注射設備可以被用來注射包含DNA分子的液體進入個體皮膚表面，液體以一種足夠的速度衝擊皮膚，使液體能滲透皮膚的表面，透入其下的皮膚和肌肉組織，因此，遺傳物質能同時對真皮、皮下和肌肉給藥。在一些具體實例中，為了給某個器官的細胞導入核酸分子，可以使用一個無針注射設備來給這個器官的組織傳送遺傳物質。
按照本發明，基因疫苗可以被直接給藥於個體中使其具有免疫性，或將疫苗導入從個體中取出的細胞中，再將細胞重新植入個體。通過以上的任何一種途徑，都可將遺傳物質導入個體的體細胞中，給藥途徑包括但不限於肌肉給藥、腹膜內給藥、真皮內給藥、皮下給藥、靜脈內給藥、動脈內給藥、眼內給藥和口服以及皮膚穿透給藥(皮下穿刺)，或通過吸入劑或栓劑。首選的給藥途徑包括肌肉給藥、腹膜給藥、真皮內給藥和皮下注射。
按照本發明，藥物組合物或疫苗組合物包含約1納克(ng)到約2000微克(μg)的DNA。在一些首選的具體實例中，藥物或疫苗組合物包含約5ng到約1000μg的DNA。在一些首選的具體實例中，藥物或疫苗組合物包含約10ng到800μg的DNA。在一些首選的具體實例中，藥物或疫苗組合物包含約0.1到500μg的DNA。在一些首選的具體實例中，藥物或疫苗組合物包含約1到350μg的DNA。在一些首選的具體實例中，藥物或疫苗組合物包含約25到250μg的DNA。在一些首選的具體實例中，藥物或疫苗組合物包含約100到200μg的DNA。
本發明的藥物或疫苗組合物的配方是按照所使用的給藥方式來確定的。藥物或疫苗組合物是血管注射劑時，它們是無菌、無熱源和無微粒子的。最好使用一個等滲的配方。通常，維持等滲性的添加劑可以包括NaCl、葡萄糖、D-甘露醇、山梨醇和乳糖。在一些情況下，最好用等滲溶液例如磷酸緩衝鹽溶液。穩定劑包括凝膠和白蛋白。在一些具體實例中，在配方中要加入一個血管收縮劑。
在一些具體實例中，核酸分子與一個多聚核苷酸功能增強子或「基因疫苗助長因子」(GVF)聯合用藥被導入細胞。多聚核苷酸功能增強子在下列的美國專利中有描述，美國專利號(U.S.Patent No.)為5,593,972和5,981,505，及國際申請序列號(International Application Serial Number)為PCT/US94/00899，1994年1月26日存檔。此處列出作為參考。GVF因子在下列的美國專利中亦有描述，專利號(U.S.Patent No.)為5,739,118和5,837,533以及國際申請專利序列號(International Application SerialNumber)為PCT/US99/04332，國際存檔日期為1999年2月26日，此處列出作為參考。
與核酸分子聯合給藥的聯合因子可以與核酸分子混合後給藥，或者與核酸分子分開、同時、或在核酸分子給藥之前或之後給藥。另外，其它具有轉染因子和/或複製因子和/或刺激性因子功能的因子，並且它們可以與GVF一起或不與其一起聯合給藥，這些因子包括生長因子、細胞因子以及淋巴因子如α-幹擾素、γ-幹擾素、血小板衍生生長因子(PDGF)、腫瘤壞死因子(TNF)、表皮生長因子(EGF)、白細胞介素-1(IL-1)、IL-2、IL-4、IL-6、IL-8、IL-10、IL-12、成纖維細胞生長因子，表面活性劑如免疫刺激複合物(ISCOMS)，弗氏不完全佐劑，脂多糖(LPS)類似物包括單磷脂A(MPL)、胞壁醯肽、苯醌類似物、小囊泡、角鯊烯和鯊烯和透明質酸。在一些具體實例中，一個免疫調節蛋白被作為GVF使用。
按照本發明，導入細胞的核酸分子，被作為一個遺傳模板，使細胞表達產生預防性和/或治療性免疫的功能的蛋白。在首選的具體實例中，核酸分子包含動物細胞中轉錄和翻譯編碼區所必需的調整序列。
本發明涉及改良的減毒活疫苗和使用重組載體導入編碼抗原的外源基因的改良疫苗，減毒活疫苗和那些用重組載體來導入外源抗原的疫苗例子在下列美國專利中有描述美國專利號為4,722,848；5,017,487；5,077,044；5,110,587；5,112,749；5,174,993；5,223,424；5,225,336；5,240,703；5,242,829；5,294,441；5,294,548；5,310,668；5,387,744；5,389,368；5,424,065；5,451,499；5,453,364；5,462,734；5,470,734；和5,482,713，每個在此列出的文獻均作為參考。基因重組子提供了可執行性的和在疫苗中具有有效表達功能的調節序列連接的編碼病毒衣殼蛋白的核苷酸序列。按照本發明，基因重組子是用減毒活疫苗和重組疫苗來產生疫苗的。
按照本發明中藥物和疫苗組合物方面的描述，藥物和疫苗組合物包含約0.1μg到約1000μg的DNA。在一些首選的具體實例中，藥物和疫苗組合物中包含約1μg到約500μg的DNA。在一些首選的具體實例中，藥物和疫苗組合物中包含約25μg到約250μg的DNA。最佳的藥物和疫苗組合物中DNA的含量約為100μg。
按照本發明中藥物和疫苗組合物方面的描述，如前討論，藥物和疫苗組合物的配方按照所使用的給藥方式來確定，本領域的一般技術人員可以很容易的給出一個編碼WNV或相關黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的核酸分子的配方。在選擇肌內注射方式給藥的情況下，要使用一個等滲的配方。一般來說，維持等滲性的添加劑可以包括NaCl、葡萄糖、D-甘露醇、山梨醇和乳糖。也可以使用等滲溶液如磷酸緩衝鹽溶液。穩定劑包括明膠和白蛋白。在疫苗組合物中，加入佐劑或免疫刺激劑可以更理想。
凋亡試驗本發明另一個方面描述了鑑定能抑制WNV Cp或衣殼蛋白，或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的其它蛋白，或其功能性片段誘導細胞凋亡的組合物的方法，該方法包括的步驟為在待測組合物存在的情況下，將足夠誘導出可檢測到細胞凋亡的定量WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白或其它蛋白，或其功能性片段與上述細胞進行首先接觸；再對上述細胞進行觀察以鑑定待測組合物存在時是否發生凋亡。能干擾WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白或其它蛋白，或其功能性片段的凋亡誘導活性的組合物可用作抵抗病毒和治療WNV和包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒感染的藥物。
本發明這個方面可用於鑑定能對WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段的誘導擴增細胞凋亡活性起抑制作用的組合物。本發明並提供了一種分析方法用來比較待測組合物存在或不存在時，WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段對凋亡的誘導作用。用該分析方法可鑑定出能抑制WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段的凋亡誘導活性的組合物。該組合物可用於抗WNV和/或抗黃病毒或抗瘟病毒的治療。
本發明中提供的方法包括的步驟有，在待測組合物存在的情況下，細胞與WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段進行接觸；觀察這些細胞以鑑定WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段是否能誘導凋亡；將待測組合物不存在時，細胞與WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段進行接觸的試驗作為對照；將不存在WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段時，細胞與待測組合物進行接觸的試驗作為另一對照。如果當待測組合物存在時，與WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段進行接觸的細胞不發生凋亡，則表明待測組合物具有抗凋亡的活性。該活性可通過待測組合物不存在時與WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段進行接觸的細胞發生可檢測的凋亡，而當不存在WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段時，細胞與待測組合物接觸後不發生凋亡這兩種情況來證實。
優選以溶液形式提供該待測組合物，系列稀釋待測組合物後可用於一系列的分析試驗，待測組合物的濃度可從0.01μM增加到1M。待測組合物最終優選濃度範圍為10μM到100μM。
WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段可以多種方式加入到試驗中。在本發明的一些具體實例中，它是作為蛋白與細胞結合。WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段可直接加入細胞培養基中。可用如前所述的已知的技術從廣泛使用的起始材料中生產WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段。使用WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段的優選濃度範圍為1μg/ml到1mg/ml。
在本發明的其它具體具體實例中，分析試驗中細胞內的WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段是由核苷酸表達。在一個不限制的實例中，試驗中細胞內的WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段可在能誘導的啟動子的控制下由核苷酸表達。
細胞凋亡可通過檢測特徵性的細胞變化或「凋亡標誌物」的方法來進行觀察。比如，在凋亡早期、最終的細胞死亡之前，細胞膜的變化會導致磷脂醯絲氨酸(PS)從細胞膜中向外突出。凋亡過程中PS的持續暴露使之成為一個有用的「凋亡標誌物」和各種檢測技術的具吸引力的靶目標。膜聯蛋白V是一種人內源性蛋白，它與PS有很高的親和性，可作為檢測細胞進入凋亡的便利的反應物。螢光標記的膜聯蛋白V可用於組織學的和細胞分類研究中對凋亡細胞的鑑定。比如，膜聯蛋白V可與藻紅蛋白(PE)連接，PE為含25個氟的大分子，是當今使用的最亮的染色劑之一。PE可購買，也可用已知的分離方法從藻類中分離。結合技術是專業人士知道的，並且結合試劑盒也能購買，如ProZyme，Inc(San Leandro，CA)。關於可用於流式血球計數儀和其它應用使用的螢光蛋白結合的細節和方案可見Hardy，R.，流式細胞儀使用的螢光蛋白的純化和偶聯，第四版.實驗免疫學手冊，Weir，Herzenbery，和Herzenbery編寫，Blackwell科學出版社，波士頓，1986(Hardy，R.，Purification and coupling of fluorescent proteins for use in flowcytometry，4th Ed.Handbook of Experimental Immunology，Weir，Herzenbery， Herzenbery，eds.，Blackwell Scientific Pubs.，Boston，1986)，文獻在此處列出作為參考。此外，放射性標記的膜聯蛋白V可用於體內腫瘤中凋亡細胞的放射性藥物成像。
游離3′-羥基DNA末端也是一種「凋亡標記物」，它是由選擇性活化的DNases內引起的細胞DNA的核小體內片段化產生的。這些游離3′-羥基DNA並不在健康細胞的完整的基因組DNA中存在，也不存在於由壞死導致的死亡細胞中。與凋亡相關的游離3′-羥基DNA可通過末端脫氧核苷酸轉移酶介導的dUTP平端標記試驗(TUNEL)被原位檢測。有關DNA分子在細胞凋亡時被切段的檢測技術的文獻綜述見Kaufmann等，2000，酶分子方法學，3223-15(Kaufmannet al.，2000，Methods Enzymol.，3223-15)。
凋亡相關的核小體內片段化也可通過夾心式免疫反應檢測，該反應使用了一對核小體兩個表位特異的單克隆抗體以捕捉和檢測酶聯免疫吸附測定試驗(ELLSA)平板上的細胞質核小體，詳見參考文獻Salgame等，1997，核酸研究，25680-6814(Salgame，et al.，1997，Nucleic Acids Res.，25680-6814)。該試驗也可用於組織培養細胞的大規模篩選。
檢測凋亡的試驗可通過使用許多不同類型的細胞和用各種方式傳送的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段來實行。在這方面有基本技能的人按照說明書的指導就可容易地用多種方法來付諸實施。在本發明優選的具體具體實例中，試驗可使用腫瘤衍生的細胞，如腺癌衍生的HeLa細胞系和橫紋肌肉瘤衍生的RD細胞系，或者使用轉化細胞，如腺病毒DNA轉化的293腎細胞系。
本發明進一步描述了將以上方法用於試劑盒來鑑定能抑制WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段的誘導凋亡的活性的組合物。本發明描述的試劑盒由一個裝有WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的衣殼蛋白，或其功能性片段的容器，和以下中至少一項組合物說明書，對照，照片或描述數據的圖形。此外，試劑盒可包括含第二個裝有檢測凋亡試劑的容器，如藻紅蛋白(PE)結合的膜聯蛋白V。此外，說明書能指導試劑盒的使用者使用多種已知的檢測凋亡標記物的方法。這個試劑盒也可提供使用者用於試驗的細胞。比如，試劑盒中可包含一瓶深低溫保存的腫瘤細胞。
診斷建立檢測WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒蛋白抗體存在的診斷試劑是非常需要的。
本發明描述了用於鑑定待測樣本中WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白的存在和/或含量的診斷檢測方法。本發明提供了識別WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白的抗衣殼蛋白抗體。個體的待測樣本中存在的衣殼蛋白可能是已被感染的良好標誌。
本發明描述了通過檢測樣本中衣殼蛋白的存在來鑑定受到WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒感染的個體的方法。抗體優選單克隆抗體，最好是採用人細胞、CHO細胞、昆蟲細胞或酵母細胞中生產的衣殼蛋白作為抗原所獲得的抗體。對個體樣本中存在的衣殼蛋白進行定量可用於決定感染個體的病情預斷。
本發明描述了與WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白特異性結合的抗體，抗體優選單克隆抗體，最好是採用人細胞、CHO細胞、昆蟲細胞或酵母細胞中生產的衣殼蛋白作為抗原所獲得的抗體。
本發明描述了鑑定受WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒感染的個體的試劑盒，包括第一個裝有特異結合WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白的抗體的容器和第二個裝有作為正對照的衣殼蛋白的容器。抗體優選單克隆抗體，最好是採用人細胞、CHO細胞、昆蟲細胞或酵母細胞中生產的衣殼蛋白作為抗原所獲得的抗體。該試劑盒可用於個體樣本中存在的衣殼蛋白的含量鑑定。
本發明的另一方面描述了鑑定待測樣本中抗WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白抗體的存在和/或含量的診斷方法。在本發明的診斷方法中，個體待測樣本中抗衣殼蛋白抗體的存在是感染發生的標示。
本發明描述了用衣殼蛋白檢測樣本中抗WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白抗體的存在來鑑定受到WNV或相關的黃病毒或瘟病毒感染的個體的方法。衣殼蛋白優選在人細胞、CHO細胞、昆蟲細胞和酵母細胞中生產的。個體樣本中衣殼蛋白的定量可用於決定感染個體的病情預斷。
本發明描述了分離的衣殼蛋白。該衣殼蛋白優選在人細胞、CHO細胞、昆蟲細胞和酵母細胞生產的。
本發明描述了用於鑑定受WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒感染的個體的試劑盒，該試劑盒包括第一個裝有與特異結合WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白的抗體的容器和第二個裝有衣殼蛋白的容器。該衣殼蛋白優選在人細胞、CHO細胞、昆蟲細胞和酵母細胞中生產的。該抗體優選可封閉衣殼蛋白的，在人細胞、CHO細胞、昆蟲細胞或酵母細胞中生產的抗體。該試劑盒可用於對個體樣本中的抗衣殼蛋白抗體的含量鑑定。這些信息可用於決定感染個體的病情預斷。
檢測WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白和抗WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白抗體的試劑盒對研究、診斷和病情預斷都是有用的。
檢測待測樣本中蛋白或抗體的存在的方法是常規的，一個具有普通技能的技術人員可使用已知的方法檢測蛋白或抗體的存在與否。一個已知的檢測蛋白或抗體存在的方法是結合試驗。一個具普通技能的技術人員能輕鬆的用多種方式來實施檢測蛋白或抗體存在的結合試驗。比如，抗體可用於檢測或定量特異蛋白的免疫試驗。抗原也可用於檢測或定量特異抗體的免疫試驗。一些免疫試驗包括使待測樣本中的蛋白與一個固相支持結合或與固定於固相支持上的抗體結合。再加入能選擇性的結合目的蛋白或者非組合的抗體的可檢測抗體。檢測可檢測抗體的結果表明如果可檢測抗體是特異於蛋白的，則目的蛋白的存在；如果可檢測抗體是特異於非組合的抗體，則不含目的蛋白。一些免疫試驗包括使待測樣本中的抗體結合於固定在固相支持中的抗原，並使用能特異結合於目的抗體或抗原的抗體檢測抗原抗體複合物。多種免疫試驗過程見80年代免疫試驗，A.Voller等編寫，Park大學(1981)Immunoassaysfor the 80’s，A.Voller et al.，eds，.University Park(1981)，文獻在此處列出作為參考。
待測樣本與固相支持接觸時可發生簡單結合試驗，任何結合到固相支持上的待測樣本中存在的蛋白都能被一特異的可檢測抗體製備物檢測。這種技術是點雜交，western雜交和其它類似試驗的本質。待測樣本中存在的特異抗體也能用類似的方式檢測。特異抗體結合的靶蛋白與待測樣本接觸，然後與其抗體結合，如果待測樣本存在這種結合，專業人士可用多種已知的方法對靶蛋白進行分析。任何存在於待測樣本中的抗體與固相支持結合，並用可檢測抗原和特異的可檢測抗體製備物進行檢測。
其它免疫試驗可以是更加複雜的但能準確提供好結果的。典型的和優選的免疫測定試驗包括檢測蛋白的「前項」試驗，其中結合在固相支持上第一個抗蛋白抗體與待測樣本進行接觸。經過合適的溫育期後，清洗固相支持以除去未結合蛋白。再加入第二個特異於特定蛋白的部分區域而，該區域並不被第一抗體識別的直接抗蛋白抗體。第二抗體優選為可檢測的。第二次溫育使可檢測抗體與通過第一抗體結合到固相支持上的特異蛋白形成複合物。第二次清洗固相支持以除去未結合的可檢測抗體。或者，第二抗體可是不可檢測的。在這種情況下，在該體系加入能與第二抗體結合的第三可檢測抗體，這種「前項夾心式」試驗可以是一種決定結合是否發生的簡單的是或否的試驗，或者是一種通過比較可檢測抗體的測量值和從對照中獲得的測量值來定量的試驗。這種「雙位點」或「夾心」試驗見參考文獻Wide，放射免疫分析方法，Kirkham編寫，E.和S.Livingstone，Edinburgh(1970)199-206頁Wide，Radioimmune Assay Method，Kirkham，ed.，E S.Livingstone，Edinburgh(1970)pp.199-206。
「前項」試驗可應用於存在於待測樣本中的抗體，以後可稱為「樣本抗體」的檢測。樣本抗體結合的特異靶蛋白結合在固相支持上，並且與待測樣本進行接觸。經過一段合適的溫育期後，清洗固相支持以除去未結合的樣本抗體。加入能結合樣本抗體Fc區域的第一抗體。這個第一抗體優選可檢測的。或者，在第一抗體是不可檢測的情況下，必須用與第一抗體結合的第二抗體來檢測結合。經過第二個合適的、使可檢測的抗體與結合在靶蛋白/固相支持上的樣本抗體形成複合物的溫育期後，清洗固相支持以除去未結合的可檢測的抗體。這種「前項夾心」試驗也可是一種決定結合是否發生的簡單的是或否的試驗，也可以是通過比較可檢測抗體的測量值和從對照中獲得的測量值來進行定量的試驗。
其它免疫測定試驗類型是所謂的「同時的」或「反向」試驗。同時的試驗包括一次溫育步驟使第一抗體與固相支持結合，同時加入可檢測的第二抗體和待測樣本。當溫育結束後，清洗固相支持以除去未結合的蛋白。結合於固相支持相可檢測抗體存在的檢測方法同傳統的「前項夾心式」試驗一樣。這種同時的試驗可適用於檢測待測樣本中抗體的類似方式。
「反向」試驗包括逐步的，向待測樣本中加入可檢測抗體的溶液進行溫育，再加入結合於固相支持的抗體再進行一次溫育。用傳統的方式清洗固相支持以除去未結合的蛋白/抗體複合物和未反應的可檢測的抗體。然後，和在「同時的」和「反向」試驗進行判定一樣，對聯繫在固相支持上的可檢測的抗體進行判定。反向試驗也可適用於檢測待測樣本抗體的類似方式。
免疫測定試驗的第一個組合物可以加在能固定蛋白的尼龍膜或其它固相支持上。鑑定待測樣本中WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白存在的第一個組合物為抗衣殼蛋白抗體，而檢測待測樣本中抗衣殼蛋白抗體存在的第一個組合物是衣殼蛋白。「固相支持」或「支持」是指任何可以結合蛋白的材料。已知的固相支持包括玻璃片、聚苯乙烯、聚丙烯、聚乙烯、葡聚糖、尼龍、澱粉酶、天然的或修飾的纖維素、聚丙烯醯胺、瓊脂糖和磁鐵礦。天然的支持物既能是在一定程度上是可溶的，也可針對本發明的目的是不可溶的。支持物的形狀可為球形，如圓珠形或圓柱形，也可如試管的內表面形或杆的外表面形。或者表面為扁平的，比如薄層或檢測條等形狀。專業人士了解許多其它適合的用於蛋白結合的固相支持，或者能通過常規試驗的使用對其進行確認。一個優選的固相支持為96孔微孔板。
在這種情況下，為了檢測蛋白的存在，可使用衣殼蛋白或者抗衣殼蛋白抗體，可檢測抗體如抗衣殼蛋白抗體或者抗人抗體。已有一些檢測抗體的已知的方法。
檢測抗體的一個方法是將抗體與一個酶連接，繼而在酶免疫測定(EIA)或者酶聯免疫吸附試驗(ELISA)，如捕獲性ELISA中使用該抗體。然後加入酶的底物，酶與底物發生反應產生一個能用分光光度計測量法，螢光測定法或肉眼觀察的等方式檢測的化合物。用於抗體可檢測的標記的酶可以是蘋果酸脫氫酶，葡萄球菌核酸酶，δ-5-類固醇異構酶，酵母乙醇脫氫酶，α-甘油磷酸脫氫酶，磷酸丙糖異構酶，辣根過氧化物酶，鹼性磷酸酶，天冬醯氨酶，葡萄糖氧化酶，β-半乳糖苷酶，核糖核酸酶，尿素酶，過氧化氫酶，葡糖-6-磷酸脫氫酶，葡糖澱粉酶和乙醯膽鹼脂酶。專業人士能容易的識別其它也可用的酶。
另一個抗體能被檢測的方法是將抗體與放射性同位素連接後用於放射免疫測定(RIA)見參考文獻，如，Work，T.S.等，分子生物學實驗技術和生物化學.North Holland出版社公司，紐約(1978)Work，T.S.et al.，Laboratory Techniques and Biochemisty in Molecular Biology.NortbHolland Publishing Co.，NY(1978)。放射性同位素可用γ計數器或閃爍掃描計數器等方式進行檢測。針對本發明特別有用的同位素是3H，125I，131I，35S和14C。優選的同位素是125I。專業人士能容易的識別其它也可用的放射性同位素。
也可能用螢光化合物來標記抗體。當適合波長的光線照射螢光標記的抗體時，通過檢測其發出的螢光可檢測它的存在。最通用的螢光標記化合物為異硫氰酸螢光系，羅丹明，藻紅蛋白，藻青蛋白，別藻藍蛋白，臨苯二醛和螢光胺。專業人士能容易的識別其它也可用的螢光化合物。
標記有螢光發射金屬如152Eu或其它稀土屬金屬的抗體也是可檢測的。這些金屬通過使用金屬螯合基團如二乙三胺五乙酸(DTPA)或乙二胺四乙酸(EDTA)而粘附上特異蛋白的抗體。專業人士能容易的識別其它也可用的螢光發射金屬和其它可使用的金屬螯合基團。
標記有化學發光化合物的抗體也是可檢測的。化學發光標記抗體的存在可通過檢測一系列化學反應中發出的冷光的存在進行鑑定。特別有用的化學發光標記化合物如氨基苯二醯肼，異氨基苯二醯肼，吖啶酯，咪唑，吖啶鹽和草酸脂。專業人士能容易的識別其它也可用的化學發光化合物。
同樣，一些生物發光物質也可用於標記抗體。生物光物質是一種在生物系統中找到的活性發光物質，在該系統中催化蛋白能增加活性發光反應的效率。生物發光蛋白的存在可通過檢測冷光的存在來鑑定。可用於標記的重要生物發光物質為螢光素，螢光素酶和鈣敏感蛋白。專業人士能容易的識別其它也可用的生物發光物質。
如果可檢測標記為放射性γ發射物時，蛋白特異的抗體、抗體片段或衍生物可通過閃爍掃描計數器進行檢測。或者，如果標記物為一螢光物質時，可通過螢光計進行檢測。在用酶進行標記的情況下，使用酶的底物，並用比色計的方法進行檢測。也可參照類似的已設標準肉眼比較底物的酶促反應程度。專業人士能容易的識別其它也可用的、適當的檢測方法。
可根據已知的方法鑑定一給定的大量抗體的結合活性。專業人士能通過常規試驗容易的鑑定各種鑑定試驗的操作和優化試驗條件。
在試驗中需分別加入含已知量的蛋白的正對照和沒有蛋白的負對照。專業人士應該有必要的使用適合的對照的知識。為了鑑定待測樣本中衣殼蛋白或抗衣殼蛋白抗體的量，需將待測樣本中檢測的蛋白量與正對照中檢測的蛋白量進行比較。根據正對照的值建立標準曲線，待測樣本的蛋白量可從上述標準曲線推斷而得。專業人士應該具有構建標準曲線和推斷待測樣本值的知識。
待測樣本包括那些從懷疑感染WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒的個體中得到的樣本，可由血液，大腦腦髓液，羊水，淋巴液，精液，陰道的液體或其它體液組合物。待測樣本也可包括實驗室製備的，如那些用於研究目的的樣本。如果存在細胞，可用離心或裂解的方法除去。專業人士能容易的鑑別多種用於檢測衣殼蛋白或抗衣殼蛋白抗體的待測樣本。待測樣本可通過用注射針或棉籤取出體液等方法獲得。專業人士能容易的鑑別其它獲得待測樣本的方法。
抗體組合物是指檢測蛋白所需的一種或多種抗體。比如，用於檢測待測樣本中衣殼蛋白的抗體組合物包括結合衣殼蛋白的第一抗體和分別結合第一抗體或第二抗體的第二或第三可檢測的抗體。
用標準的免疫測定試驗來檢測待測樣本中抗衣殼蛋白抗體的存在。在一定體積的緩衝液中的10-15μg/ml的衣殼蛋白被加入到固相支持，如96孔微孔板上，每孔加入50μl。溫育固相支持足夠結合發生的時間後，磷酸緩衝液(PBS)清洗以除去未結合的衣殼蛋白。比如，適合的溫育時間為室溫下2小時或4℃過夜。固相支持再用含BSA的PBS溶液封閉以防止待測樣本中的蛋白非特異的結合在固相支持上。固相支持中加入系列稀釋的待測樣本後再溫育一段足夠結合發生的時間。PBS清洗固相支持以除去未結合的蛋白。再在固相支持混合物中加入識別人抗體Fc區域的標記抗人抗體。溫育平板足夠結合發生的時間後用PBS清洗以除去未結合的標記抗人抗體。結合的標記抗人抗體的量既而通過標準技術測定。抗人抗體可用辣根過氧化物酶標記的羊抗人抗體，按使用說明以1 12,000的比例使用。
用如以下所述的標準的免疫測定試驗來檢查待測樣本中衣殼蛋白的存在。識別衣殼蛋白特異部位的，在一定體積的緩衝液中的第一抗衣殼蛋白抗體被加入到96孔微孔板上。溫育平板足夠結合發生的時間後，PBS清洗以除去未結合的抗衣殼蛋白抗體。再用含BSA的PBS溶液封閉平板以防止待測樣本中的蛋白非特異的結合在微孔板上。每孔加入系列稀釋的待測樣本後溫育平板一段足夠結合發生的時間。PBS清洗每個孔以除去未結合的蛋白。在每孔中加入識別衣殼蛋白的區域而並不被第一抗衣殼蛋白抗體識別的標記的抗衣殼蛋白抗體。溫育平板足夠結合發生的時間後用PBS清洗以除去未結合的標記抗衣殼蛋白抗體。結合的標記抗衣殼蛋白抗體的量可通過標準技術測定。以11000的比例使用識別衣殼蛋白的兔抗衣殼蛋白抗體。適合的溫育條件的例子為室溫下2小時或4℃過夜。
用於檢測待測樣本中衣殼蛋白的試劑盒包括固相支持，正對照和負對照，緩衝液，適合的抗衣殼蛋白抗體和同前所述的實施捕獲性ELLSA的說明書。用於檢測待測樣本中抗衣殼蛋白抗體的試劑盒包括固相支持，正對照和負對照，緩衝液，衣殼蛋白和同前所述的實施捕獲性ELLSA的說明書。
儘管公開的關於藥物成分和方法的部分主要是描述治療人的藥物和方法，但本發明的成分和方法也能當作獸藥使用。治療非人類動物的方法和治療人的一樣也在本發明的範圍內。因此，本發明描述了治療所有動物，特別是哺乳動物如人，牛，羊，豬，馬，狗和貓的方法。
本發明進一步用一些試圖對本發明進行說明的例子進行舉例說明。這些例子和對它們的解釋並不是用於限制本發明的範圍。很清楚，本發明還可應用於除了以下描述的特例外的其它方面。各種本發明的修改和變更都可能參考本文的各種條款，因此它們都包括在本發明的範圍內。
實施例1構建衣殼蛋白的表達根據紐約1999病毒人體提取物(WNV-HNY1999)中報導的多聚蛋白基因序列(GenBank序列號AF202541，Jia et al，.1999，Lancet，3541971-1972)，構建了兩個WNV衣殼蛋白(Cp)的表達載體(pWNVh-DJY和pWNVy-DJY)。WNV-HNY1999的基因組結構見圖1的上半部分。載體構建的框架見圖1的下半部分。每個構建載體都含Cp蛋白開放閱讀框及其前面所融合的來源於人IgE(sIgE)的信號肽(前導序列)編碼序列，並去掉了Cp蛋白的第一個胺基酸的編碼序列(去掉了第一個胺基酸(met))。用含三次分別PCR擴增反應的重疊PCR的方法構建重組克隆，並使用設計的，使在最終的構建載體序列引入物種優化密碼子的引物對Kim等，1997，基因，199293-301(Kim et al，，1997，Gene，199293-301)。pWNVh-DJY含有整個融合sIgE信號肽/Cp蛋白編碼序列的人優化密碼子。pWNVy-DJY含有整個信號肽/Cp蛋白前6個胺基酸(由於除去了第一個胺基酸，所以為Cp蛋白胺基酸殘基2-7)的酵母優化密碼子和剩餘Cp蛋白編碼序列的人優化密碼子。此外，使用PCR引物，在信號肽編碼序列的上遊引入了一適合的Kozak序列。每個編碼序列都克隆進入pcDNA3.1/V5-HisC表達載體(Invitrogen，San Diego，CA)的HindIII和NotI多克隆位點之間以形成表達載體，該載體在CMV啟動子的控制下的表達Cp-His融合蛋白。每個構建載體表達相同的蛋白序列，包括融合於WNV的Cp蛋白2-123胺基酸及其之前的氨基端sIgE前導肽和之後的V5表位序列和多聚組氨酸的羧基端。
以下為重疊PCR構建過程中所使用的10個引物引物1.sIgh-VChU1+(90鹼基)ATGGACTGGACCTGGATCCTGTTCCTGGTGGCCGCCGCCACCCGCGTGCACAGCTCTAAGAAACCAGGAGGCCCCGGCAAGAGCCGCGCC(SEQ ID NO14).
引物2.sIgy-VCyU1.1+(90鹼基)ATGGATTGGACTTGGATCTTATTTTTAGTTGCTGCTGCTACTAGAGTTCATTCTTCTAAAAAACCAGGTGGCCCCGGCAAGAGCCGCGCC(SEQ ID NO15).
引物3.sIgh-VChL1-(88鹼基)GGCTCAGCATGGCGCGCTTCAGGCCAATCAGGCTCAGCACGCGGGGCATGCCGCGCTTCAGCATGTTCACGGCGCGGCTCTTGCCGGG(SEQ ID NO16).
引物4.sIgh-VChU2+(90鹼基)GGCCTGAAGCGCGCCATGCTGAGCCTGATCGACGGCAAGGGCCCCATACGCTTCGTGCTGGCCCTGCTGGCCTTCTTCCGCTTCACCGCC(SEQ ID NO17).
引物5.sIgh-VChL2-(89鹼基)GGTGCTTCATGGCGGTCTGCTTGTTCACGCCGCGCCAGCGGTCCAGCACGGCGCGGGTGGGGGCAATGGCGGTGAAGCGGAAGAAGGCC(SEQ ID NO18).
引物6.sIgh-VChU3+(89鹼基)CCGCCATGAAGCACCTGCTGAGCTTCAAGAAGGAGCTGGGCACCCTGACCAGCGCCATCAACCGCCGCAGCAGCAAGCAGAAGAAGCGC(SEQ ID NO19).
引物7.sIgh-VChL3-(81鹼基)CGCGCCCACGCTGGCGATCAGGCCAATCATCACGGCAATGCCGGTCTTGCCGCCGCGCTTCTTCTGCTTGCTGCTGCGGCG(SEQ ID NO20).
引物8.sIgh-VChFS1+(39鹼基)
CCCAAGCTTGCCGCCACCATGGACTGGACCTGGATCCTG(SEQ ID NO21).
引物9.sIgy-VCyFS1.1+(33鹼基)CCCAAGCTTGCCGCCACCATGGATTGGACTTGG(SEQ ID NO22).
引物10.sIgh-VChFAS2-(37鹼基)ATAGTTTAGCGGCCGCGCCCACGCTGGCGATCAGGCC(SEQ ID NO23).
三套PCR擴增引物按以下順序配對以產生三個重疊PCR擴增產物。引物1和3(對pWNVh-DJY進行擴增)或引物2和3(對pWNVy-DJY進行擴增)，引物4和5，引物6和7。每套引物都使用Pfu DNA聚合酶(Stratagene，La Jolla，CA)進行自退火和延伸。最後的全長的插入片段用含引物8和10的引物對(產生pWNVh-DJY的插入片段)或用含引物9和10的引物對(產生pWNVy-DJY的插入片段)進行擴增，並隨之帶有HindIII(5′端)和NotI(3′端)限制性內切酶位點。這些最終的插入片段用HindIII和NotI進行酶切後，克隆進入HindIII/NotI雙酶切的pcDNA3.1/V5-HisC載體。產生的重組載體(pWNVh-DJY和pWNVy-DJY)都需經測序證實。圖2和圖5分別描述了pWNVh-DJY和pWNVy-DJY的限制性內切酶圖譜。圖3和圖6分別描述了pWNVh-DJY和pWNVy-DJY的特徵圖譜。圖4和圖7分別描述了pWNVh-DJY和pWNVy-DJY全長的和注釋的核苷酸序列。
實施例2由pWNVh-DJY和pWNVy-DJY表達的WNV衣殼蛋白的生物性質在組織培養的細胞中由pWNVh-DJY and pWNVy-DJY表達的Cp蛋白磷酸鈣沉澱法將2μg純化的質粒DNA(pWNVh-DJY或pWNVy-DJY)轉染接種於雙槽載波片上的HeLa，RD或293細胞。轉染後，固定細胞並與鼠抗His抗體溫育後再與FITC偶聯的羊抗鼠IgG抗體溫育。紫外顯微鏡檢測基因的表達。Cp蛋白的表達均可在三種含pWNVh-DJY和pWNVy-DJY的細胞系中獲得，並且蛋白定位於細胞質中。使用FITC濾光片進行的轉染pWNVh-DJY的RD細胞Cp蛋白表達的免疫螢光分析揭示代表Cp蛋白定位的綠色螢光。FITC和羅丹明雙濾光片可捕獲以區分特異的和背景信號的圖像。在雙濾光片下的綠色螢光證實了Cp蛋白的存在。DAPI濾光片可用於顯示DAPI(4′，6-二乙醯基-2-苯基吲哚)染色的細胞核，並且在光域下DAPI濾光片捕獲的圖像揭示了細胞的形態。
WNV衣殼蛋白的體外翻譯使用TNT-T7偶聯的轉錄/翻譯系統(Promega，Madison，WI)製備35S標記的蛋白產物。加入10μl放射性標記的蛋白樣品和1μl抗His(C末端)抗體(Invitrogen，San Diego，CA)到300μl RIPA緩衝液中並輕柔的混勻。4℃溫育90min後，在蛋白-抗體複合物中加入終濃度為5μg每管的蛋白A-瓊脂糖微珠(LKB-Pharmacia Biotech)，樣品在旋轉搖床上4℃溫育90min。RIPA緩衝液清洗微珠3次，懸浮微珠於2xSDS樣品緩衝液中。簡單煮沸以從瓊脂糖微珠中洗脫免疫沉澱蛋白複合物，並在15％的SDS-PAGE上進行分析。比較蛋白樣品與商業用的14C-甲基化分子量標記(Sigma)的遷移率。用1M水楊酸鈉短暫處理凝膠後，用凝膠乾燥儀乾燥使凝膠得以固定。幹膠過夜在X光片(Kodak)上曝光。體外翻譯的蛋白的分子量為21.5kDa(見圖8)。
實施例3表達於pWNVh-DJY和pWNVy-DJY的WNV衣殼蛋白的免疫反應評估多肽通過能夠預測抗原決定區域和親水區域的MacVector軟體選擇得到了三個WNV Cp蛋白的胺基酸序列的組織相容性(MHC)II分子限制表位。使用標準多肽合成法合成這些多肽，請序列如下多肽名稱 WNV Cp蛋白殘基數胺基酸序列 序列號WNVC-P1 2-23 SKKPGGPGKSRAVNMLKRGMPRSEQ ID NO6WNVC-P231-49 KRAMLSLIDGKGPIRFVLA SEQ ID NO7WNVC-P3 90-111 TLTSAINRRSSKQKKRGGKTGISEQ ID NO8圖8描述這些多肽在WNV Cp蛋白中的排布。
體外翻譯的蛋白使用不含放射性成分的TNT-T7偶聯的轉錄/翻譯系統(Promega，Madison，WI)，按實施例2所述的方法也可產生非放射性的體外翻譯的Cp蛋白。使用體外翻譯試劑盒(Invitrogen，San Diego，CA)中不含表達插入片段的pcDNA3.1載體作為體外翻譯的對照。
小鼠的DNA接種為了估量針對WNV Cp基因產物的T細胞調節的免疫反應，建立了一套小鼠體內試驗。在6周或8周齡的雌性BALB/c小鼠(Harlan Sprague Dawley，Inc.，Indianapolis，IN)的四頭肌內注射100μg在PBS中的pWNVh-DJY，pWNVy-DJY或者pcDNA3.1(無插入片段)和0.25％鹽酸布比卡因(Sigma，St.Louis，MO)。兩周後，小鼠接受另一次100μg DNA的放大注射。放大注射13天後，殺死小鼠收集脾臟，分離淋巴細胞以用於細胞免疫反應的檢測。
淋巴增值試驗每組免疫小組取兩隻小鼠收集脾臟淋巴細胞並按5×106細胞/ml的濃度懸浮。立即在96孔平底微孔板的每個孔內加入含5×105細胞的100μl懸浮液。在各孔內加入終濃度為5μg/ml和1μg/ml的重組多肽、體外翻譯蛋白或體外翻譯對照(體外翻譯蛋白和體外翻譯對照蛋白的終濃度為0.5μg/ml)。用伴刀豆球蛋白A(Con A)作為正增值對照。設立三個重複實驗條件。細胞在37℃，5％CO2中溫育3天。每孔中加入1μCi的3H胸苷，37℃溫育細胞18h。收集平板中的細胞後在Beta平板測量儀上測量3H參入量(Wallac，Turku，Finland)。通過以下公司鑑定刺激指數刺激指數(SI)＝(試驗發生的計數/自然發生的計數)自然發生的計數小孔包含作為不相關的蛋白對照的5％的胎牛血清。結果見表1。
從pWNVy-DJY或pWNVh-DJY(「H」或「Y」)免疫小鼠中分離的脾細胞與WNVC-P3(「多肽3」)或三個全部的Cp多肽混合物(「多肽123」)進行溫育後所得到的SI值比從基本載體pcDNA3.1免疫的小鼠小組分離的脾細胞所得的SI值高的多。
表1

表1陳述了淋巴增值試驗的結果。每個條件下所述的值均為三個小孔的平均刺激指數值。針對每個免疫待測小組，脾細胞是從小組內的兩隻小鼠中收集來的。「H」是指從pWNVh-DJY免疫小組中提取的脾細胞。「Y」是指從pWNVy-DJY免疫小組中提取的脾細胞。「pcDNA3.1」是指從pcDNA3.1免疫小組中提取的脾細胞。多肽1，2和3是指上面描述的WNVC-P1，WNVC-P2和WNVC-P3多肽。「多肽123」是指多肽1，2和3的混合物。「Y蛋白」是指pWNVy-DJY重組子體外翻譯的Cp蛋白。「對照蛋白」是指如上所述的，由不含表達插入片段的pcDNA3.1載體的體外表達對照。
流式血球技術儀對細胞內γ-幹擾素的檢測在圓底96孔平板的每個小孔中加入100μl添加了5％小牛血清(FBS)的，含50U/ml重組人白介素2(rHuIL-2)(Intergen，Purchase，NY)，10μg/ml布雷菲德菌素A(BD PharMingen，San Diego，CA)，100ng/ml乙酸豆塞外佛波酯(PMA)(Sigma，St，Louis，MO)，和1μg/ml離子黴素(Sigma)的RPMI-1640溶液(R5培養基)。體外翻譯的Cp蛋白或對照蛋白按4μg/ml的濃度加入到50μl的R5培養基中。加入蛋白抗原(Ag)以後，每孔加入50μl含1×106個提取的脾細胞的R5培養基。為了補償流式細胞計數儀，從天然小鼠中提取的脾細胞只與白介素2和布雷菲德菌素A溫育。平板在37℃，5％CO2孵箱中溫育5-6小時。不含抗原溫育的脾細胞作為對照。溫育後，平板在1200rpm離心5min，除去上清。每孔的細胞用200μl添加1％牛血清白蛋白(BSA)的PBS懸浮，冰上放置15min後1200rpm離心，用50μl含0.1μg PE結合的抗CD4抗體和0.1μg CyC結合的CD44抗體(均來自BD PharMingen，SanDiego，CA)的PBS/1％BSA重懸。4℃溫育30min後，用PBS/1％ BSA清洗細胞兩次，吸取細胞並用100μl Cytofix/Cytoperm溶液(BD PharMingen，SanDiego，CA)重懸，4℃溫育20min。用一倍的Perm/Wash(BD PharMingen，SanDiego，CA)清洗細胞2次，再用50μl含0.1μg每個樣品的濃度的藻膽蛋白(APC)結合的抗γ-幹擾素抗體(BD PharMingen，San Diego，CA)的Perm/Wash溶液懸浮細胞。4℃溫育30min後，用一倍的Perm/Wash溶液清洗細胞兩次，多聚甲醛固定後4℃保存直到用於流式細胞計數儀分析。
CD44的表達可作為活化標記。CD44是廣泛表達於造血細胞和非造血細胞中的一種細胞粘連受體。BALB/c小鼠含相對較多的CD44H+T細胞子集。在外圍，CD44表達水平隨著B細胞，CD4+T細胞，CD8+T細胞和記憶細胞的活化而增加，這種細胞可通過其CD44hi表型(CD44H異型的高效表達)進行鑑定。
CD4+T細胞依賴性IFN-γ的產生可通過流式細胞計數儀進行定量。圖11陳述的結果表明了對從基本載體pcDNA3.1或者Cp蛋白表達載體pWNVh-DJY或pWNVy-DJY免疫的小鼠中提取的脾細胞的抗原特異的IFN-γ反應的結果，從pWNVy-DJY免疫小鼠中提取的脾細胞比起從pWNVh-DJY免疫小鼠中提取的脾細胞，在體外翻譯的Cp蛋白的刺激下能表達更高水平的IFN-γ。
實施例4TUNEL試驗檢測凋亡在HeLa細胞，RD細胞和293細胞三個不同的細胞系中，個體細胞的凋亡可通過TUNEL試驗鑑定。pWNVh-DJY或pWNVy-DJY構建載體轉染的細胞可用TUNEL試驗檢測其凋亡。在三個細胞系中兩種構建載體都能誘導凋亡。
TUNEL試驗可使用「原位細胞死亡檢測試劑盒，螢光素」(Roche MolecularBiochemicals，Indianapoils，IN)，按照使用說明進行試驗。DNA的切割都可由末端轉移酶(TdT)通過螢光素-dUTP標記的基因組DNA的游離3′-羥基端進行檢測。簡而言之，細胞固定後，用添加0.1％Triton-X，0.1％檸檬酸鈉的PBS進行滲透，然後細胞與含TdT和螢光素-dUTP的「TUNEL反應混合物」一起溫育。通過螢光顯微鏡檢測摻入的螢光素偶聯的dUTP。
使用不同的顯微鏡濾光片獲得數據以鑑定特異信號。由FITC濾光片顯示的綠色的信號代表凋亡細胞中摻入的螢光素。用FITC和羅丹名雙濾光片捕獲圖象以區別特異的凋亡信號和背景信號。在雙濾光片下的綠色螢光反映了摻入的螢光素-dUTP的真實螢光信號。DAPI濾光片顯示了細胞中被DAPI染色的核苷酸。並不是所有細胞都是TUNEL陽性。在光域中DAPI濾光片捕獲的圖像揭示了細胞的形態，表明發生凋亡的細胞的核已經收縮。
類似的結果可在含pWNVy-DJY構建載體的人成神經細胞瘤(ATCC #CRL-2266)中獲得。
實施例5膜聯蛋白V流式細胞計數儀分析用含增強的螢光蛋白(EGFP)的pEGFP2-N1(Clontech)表達載體轉染HeLa細胞為轉染標準，或者用pEGFP2-N1與pWNVh-DJY或pWNVy-DJY的重組載體共同轉染HeLa細胞。轉染兩天後，細胞用藻紅蛋白(PE)偶聯的膜聯蛋白V進行染色。染色的細胞用流式細胞計數儀進行分析。膜聯蛋白V陽性的細胞群體可從EGFP陽性事件的門檻值開始進行計數，使用CellQuest軟體獲得所需數據。用WNV-Cp處理的細胞所發生的凋亡相對於對照細胞的提高了10倍(見圖13)。
實施例6WNV Cp蛋白凋亡誘導區域的分析實施例3和圖11中所描述的多肽WNVC-P3被用於檢測其誘導培養中的細胞凋亡的能力。多肽WNVC-P3與SH-SY5Y成神經細胞瘤細胞(ATCC；Manassas，VA)按10μg多肽每1×105細胞的濃度進行溫育。24小時後，用TUNEL試驗進行分析。TUNEL陽性細胞可從用WNVC-P3處理的細胞中鑑定，而不能從胰腺特異性抗原(PSA)的對照多肽處理的細胞中鑑定。
實施例7pCWNVCp免疫誘導抗原特異的體液免疫反應為調查DNA疫苗產生的體內免疫反應水平，用pCWNVCp或對照質粒pCDNA3肌內注射免疫小鼠。在0，4和8周時，向6-8星期母BALB/c小鼠(HarlanSprague Dawley，Inc.，Indianapolis，IN)的四頭肌中注射含每種100μg目的DNA重組載體的磷酸緩衝液(PBS)和0.25％布比卡因-HCl(Sigma，St.Louis，MO)。在注射前和注射後的各個時間點，小鼠進行眼眶取血，收集血清以用於以後的分析。收集的血清樣品按1 100，1 400，1 800和1 1600的比例稀釋，用ELLSA分析反應於Cp多肽(WNVC-P3TLTSAINRRSSKQKKRGGKTGI)的特異性抗體。按前所述的，參考文獻Kim等，1988，CD8陽性T細胞通過趨化因子的表達控制抗原特異性免疫反應，臨床調查雜誌，1021112-1124(Kim et al.，1998，CD8 positive T cells controlsantigen-specific immune responses through the expression of chemokines.J.Clin.Invest.，1021112-1124)的方法，將以10μg/ml濃度稀釋於PBS中的50μl WNVC-P3加入微孔板的微孔中4℃過夜。PBS-0.05％Tween-20清洗平板，並用含3％BSA的PBS-Tween-20 37℃封閉1小時。鼠抗血清用0.05％Tween進行稀釋，並在37℃溫育1小時，再用HRP-偶聯的羊抗鼠IgG(Sigma，St.Louis，MO)進行溫育。清洗平板後，用3』3』5』5』TMD(Sigma)緩衝液顯色。
注射前血清(0天收集的)並不表現任何的Cp特異性抗體反應(數據未顯示)。用pCDNA3對照免疫的小鼠不表現Cp特異抗體反應，但用pCWNVCp免疫的小鼠中可檢測到有效的抗體反應(圖12A)。值得注意的是，DNA免疫產生的Cp特異抗體反應水平比從ATCC(Manassas，VA)獲得的陽性超免疫小鼠血清的Cp特異抗體反應水平更有效。
此外，DNA疫苗誘導產生的WNVCp特異IgGs的亞族是可鑑定的。據報導，IgG1同種型由Th2性細胞因子誘導，而IgG2a同種型由Th1型細胞因子調節見參考文獻Finkelman等，1990，淋巴因子控制的體內免疫球蛋白同種型選擇，免疫綜述年鑑，8303-333(Finkelman et al.，1990，Lymphokinecontrol of in vivo immunoglobulin isotype selection，Ann.Rev.Immunol.，8303-333)。為了鑑定Cp特異IgG亞族的相對水平，用HRP偶聯的抗鼠IgG1和IgG2a(Zymed，San Francisco，CA)替換抗鼠IgG-HRP。接著再加入ABTS底物溶液(Chemicon，Temecula，CA)。在每步中，平板用清洗緩衝液(PBS+0.05％Tween-20)清洗3次。平板用Dynatech MR5000平板讀數儀讀取450nm的光密度。如圖12B所示，大多數用pCWNVCp進行DNA免疫產生的IgG反應是IgG2a同種型反應。這種強烈的Th1型偏差可通過IgG2a的放大和IgG2a與IgG1的相對比例來鑑定。
WNVCp-特異血清抗體可通過免疫沉澱/Western雜交分析進行鑑定。體外翻譯的不帶放射性同位素的WNVCp蛋白可用抗6組氨酸(C末端)多克隆抗體(MBL，Nagoya，Japan)進行免疫沉澱，並在15％SDS-PAGE電泳後轉移到切成小條的PDVF膜(Millipore)上。每條與pCWNVCp或pCDNA3免疫小鼠的小鼠免疫血清(1 100稀釋)進行溫育，並與辣根過氧化物酶(HRP)結合的抗鼠IgG以1 2000的濃度進行雜交。在浸潤後，膜條用ECL化學發光檢測試劑盒(Amersham)進行顯色(圖12C)。
實施例8pCWNVCp免疫誘導有效的抗原特異Th1型細胞免疫反應T細胞釋放的細胞因子水平反映了免疫反應的指示和放大。刺激T細胞產生的Th1(IFN-γ和IL-2)和Th2(IL-4)型細胞因子水平是可檢測的。IFN-γ作為原型Th1型細胞因子主要由CD4+Th1細胞和CD8+T細胞產生。刺激T細胞表達的IFN-γ水平反映了T細胞反應的放大。IL-2是主要由外界刺激活化的T細胞產生的Th1型細胞因子；它對抗原特異的T細胞的增殖和克隆擴增是很關鍵的見參考文獻Morgan等，1976，正常人骨髓T淋巴細胞的選擇性體外生長，科學，1931007-1008(Morgan et al.，1976，Selective invitro growth of T lymphocytes from normal human bone marrwos，Science，1931007-1008)。另一方面，IL-4是一種在B細胞調節的免疫反應中起支配性作用的原型Th2型細胞因子見參考文獻Seder和Paul，1994，通過CD4+T細胞獲得的淋巴因子產生表型，免疫綜述年鑑，12635-673 Seder Paul，1994，Acquisition of lymphokine-producing phenotype by CD4+T cell.Annul.Rev.mmunol.，12635-673)。
免疫後CD4+T幫助細胞調節的免疫反應水平也是可檢測的。每兩周分別向小鼠進行兩次DNA免疫(每次100μg)。第二次注射後一星期時，殺死小鼠，收集脾臟。從脾臟中收集淋巴細胞，並通過除去紅細胞和用新鮮培養基清洗三次來製備效應細胞，見參考文獻Kim等，1997，通過共刺激分子基因共傳遞的DNA免疫的體內免疫反應，自然生物技術，15641-646(Kim et al.，1997，Engineering of in vivo immune responses to DNA immunization viaco-delivery of costimulatory molecule genes，Nat.Biotechnol.，15641-646)。分離的懸浮細胞以5×106細胞/ml的濃度重懸。吸取100μl含5×105細胞的重懸液立即加入到96孔平底微孔板的每個小孔中。WNV衣殼蛋白特異多肽庫(WNVC-P1SKKPGGPGKSRAVNMLKRGMPR；WNVC-P2KRAMLSLIDGKGPIRFVLA；WNVC-P3TLTSAINRRSSKQKKRGGKTGI)以終濃度為5μg/ml的濃度一式三份加入到小孔中。在5％CO2，37℃下溫育細胞4天。在第四天收集細胞上清並用於使用ELISA試劑盒(Biosource，Camarillo，CA；RDSystems，Minneapolis，MN)的細胞因子ELISA檢測IFN-γ，IL-2或IL-4的釋放。
如圖13所示，在pCWNVCp免疫小鼠中可觀察到有效表達水平的IFN-γ和IL-2，而對照免疫小鼠中只觀察到背景水平。另一方面，所有免疫小組的IL-4釋放水平是類似的。這些結果表明DNA疫苗會導致在免疫小鼠中誘導特異的和有效的Th1型細胞免疫反應。
實施例9用pCWNVCp免疫誘導趨化因子MIP-1β和RANTES的抗原特異性產生通過檢測刺激T細胞β-趨化因子(MIP-1β和RANTES)的表達情況可延伸疫苗誘導細胞免疫反應的性質。趨化因子對免疫和感染反應起重要的調節作用。它們對於淋巴細胞從導管運輸到宿主抵抗的外部位點的分子調節起特別重要的作用。已有報導T細胞產生的趨化因子對細胞免疫擴大起關鍵作用見上面的Kim等1998，臨床研究雜誌，(Kim et al.，1998，J.Clin.Invest.，supra)；和參考文獻Kim等，2000，巨細胞集落刺激因子(M-CSF)能體內調節免疫反應，吸引樹突細胞，人類基因治療，11305-321(Kim et al.，2000，Macrophage-colony stimulating factor (M-CSF) can modulate immuneresponses and attract dendritic cells in vivo，Human Gene Therapy，11305-321)。因此，由刺激T細胞產生的趨化因子水平能提供額外的對抗原特異細胞免疫反應水平和質量的洞察。按實施例8中描述的方法刺激的T細胞的上清可用於用ELISA試劑盒(Biosource，Camarillo，CA；RD Systems，Minneapolis，MN)檢測β-趨化因子MIP-1β和RANTES的釋放情況。用pCWNVCp疫苗免疫比用對照載體免疫能顯著地誘導更高水平的MIP-1β和RANTES(圖14)。這些pCWNVC免疫動物的pMIP-1β和RANTES水平的增加更加支持上述的pCWNVCp免疫誘導抗原特異T細胞反應的結論。
實施例10pCWNVCp免疫誘導一抗原特異的CTL反應免疫後抗原特異的細胞毒性T淋巴細胞(CTL)反應的水平也是可檢測的。如前Kim等，1997，自然生物技術，上面(Kim et al.，Nat.Biotechnol.，supra)所述的方法實行5小時51Cr釋放體積CTL分析實驗，並在測量特異和非特異多肽處理目標所釋放的Cr之前對效應脾細胞進行體外刺激。在CTL培養基中的含5×106細胞/ml的效應脾細胞可用WNV衣殼多肽庫(KGPIRFVL(SEQID NO24)，GGPGKSRA(SEQ IN NO25)和IAPTRAVL(SEQ ID NO26))以10μg/ml的濃度進行體外刺激5天。CTL培養基包括RPMI 1640(Gibco-BRL，GrandIsland，NY)，10％胎牛血清(Gibco-BRL)和10％無Con A的RAT-T-STIM(Becton Dickinson Labware，Bedford，MA)。多肽處理目標可用與10μg/ml濃度的多肽庫溫育的P815鼠肥大細胞瘤(ATCC，Manassas，VA)製備。靶細胞用100μCi/ml Na251CrO4標記120min，再與刺激效應脾細胞在37℃溫育6h。CTL裂解在效應細胞靶細胞(ET)為100 1和50 1比例下測定。特異裂解的百分比可按公式測定100×(實驗釋放-自發釋放)/(最大釋放-自發釋放)最大釋放可由含1％Triton X-100培養基中靶細胞的裂解來測定。如果「自發釋放」計數值超過「最大釋放」的20％，該分析實驗認為是無效的。特異殺死的背景水平可從用pCDNA3免疫的對照動物中觀察到。然而，在效應細胞靶細胞(ET)為100 1和50 1時，用pCWNVCp免疫動物表明陽性CTL活性(圖15A)。此外，用於CTL分析實驗體外刺激效應細胞的上清的分析證實了pCWNVCp免疫小鼠中IFN-γ水平的增加(圖15B)。
實施例11pCWNVCp免疫誘導淋巴細胞向免疫動物的肌肉內滲入HIV和HSV DNA免疫模式中疫苗誘導細胞介導的免疫反應的放大與在疫苗注射位點上細胞滲入的水平有很好的相關性見上面的Kim等，2000，人類基因治療，(Kim et al.，2000，Human Gene Therapy，supra)；參考文獻Chattergoon等，2000，通過工程化的Fas介導的調亡傳遞靶抗原到包括樹突細胞的抗原呈遞細胞，自然生物技術，18974-979(Chattergoon et al.，2000，Targeted antigen delivery to antigen-presenting cells includingdendritic cells by engineered Fas-mediated apoptosis，Nat.Biotechnol.，18974-979)和Agadjanyan等，1999，CD86(B 7-2)能起體內驅動MHC限制性抗原特異細胞殺傷性T淋巴細胞反應當功能，免疫雜誌，1623417-3427(Agadjanyan et al.，1999，CD86(B7-2) can function to driveMHC-restricted-antigen-specific cytotoxic T lymphocyte responses invivo，J.Immuol.，1623417-3427)。為進一步調查pCWNVCp免疫誘導的免疫活化的有效性，在注射位點檢測免疫小鼠肌肉組織的免疫組化。
用含100μg pCWNVCp或pCDNA3的磷酸緩衝液(PBS)和0.25％吡比卡因-HCl肌肉內注射(進入腔骨肌)6至8周的母Balb/c小鼠(Charles RiverLaboratories，Inc.，Wilmington，MA)。轉染48h後，收集腔骨肌。再將新鮮的肌肉組織凍於O.C.T.化合物(Sakura Finetek USA，Inc.，Torrance，CA)中。用Leica 1800冷凍切片機得到4微米的冷凍切片。為了檢測肌肉中淋巴細胞的存在，用蘇木精和曙紅(HE)染液(Vector Labs)染色切片。在尼康OPTIPHOT螢光顯微鏡(Nikon Inc.，Tokyo，Japan)下用40倍物鏡(Nikon Fluo 40X Ph3d2)觀察切片。切片成像可用尼康UFX-II曝光控制下的尼康照相機FX35DX和柯達Ektachrome 160T膠片獲得。圖16B表明免疫細胞顯著的滲入到pCWNVCp免疫小鼠的肌肉中。
通過FACS分析對滲入細胞進行定性。按上面的Kim等，2000，人類基因治療，(Kim et al.，2000，Human Gene Therapy，supra)所述的方法，從全腿肌肉中解剖肌肉並機械切碎，從中收集滲入細胞。用帶玻璃羊毛塞子的漏鬥過濾回收細胞。按前面所述的Kim等，2000，人類基因治療，(Kim et al.，2000，Human Gene Therapy，supra)和參考文獻Chattergoon等，1990，免疫學雜誌，1605707-5718(Chattergoon et al.，1990，J.Immunol.，1605707-5718)所述的方法，用CD4，CD8，Mac-3，CD11c，CD86和B220(Pharmingen)抗體通過FACS鑑定滲入細胞。樣本通過Coulter EPICSXL-MCL流式細胞儀進行分析。pCWNVCp免疫小鼠中獲得到滲入細胞包括T細胞(CD4+和CD8+)和巨噬細胞(用抗Mac 3抗體檢測)(圖16C)。免疫肌肉中高水平的CD4+和CD8+T細胞為高水平T細胞的活化提供了進一步證據。另一方面，從pCDNA3(對照)免疫小鼠中獲取得肌肉切片並不表現任何細胞滲入的跡象。總而言之，這些結果證實DNA接種能有效的產生抗原特異免疫反應。
實施例12WNV衣殼蛋白與其它黃病毒衣殼蛋白的比對圖17顯示了WNV Cp蛋白與其它黃病毒，包括kunjin病毒(KJV)，日本腦炎病毒(JEV)和登革熱病毒(DEN2)的衣殼蛋白部分的比對結果，表明這些蛋白間有很高的相同性。
實施例13WNV Cp蛋白誘導通過線粒體途徑的體內和體外調亡在不存在其它WNV基因產物時，西尼羅病毒Cp蛋白在組織培養中誘導快速的核收縮和細胞死亡。調亡是通過線粒體途徑誘導的，因為觀察到的線粒體膜位變化與Caspase 9活化和下遊Caspase 3活化是相伴隨的。此外，通過消除突變分析鑑定調亡決定區域位於WNV Cp蛋白的3』末端。肌肉內注射WNVCp表達盒後，可清楚地觀察到肌肉組織的調亡。更重要的是，WNV Cp基因向鼠腦的紋狀體內的傳遞導致體內由衣殼蛋白誘導調亡引起的細胞死亡。這些研究表明WNV衣殼蛋白的調亡級聯的誘導作用是造成病毒發病機理方面的原因，並且支持抑制這種調亡功能可用於開發有效的治療WNV感染的治療途徑的想法。此外，WNV衣殼蛋白與一已知的HIV-1 vpr基因產物的調亡誘導區域有序列上的相同性/同源性。見參考文獻Ayyavoo等，1997，自然藥物，31117-1123(Ayyavoo et al.，1997，Nat.Med.，31117-1123)；Stwart等，1997，病毒學雜誌，715579-5592(Stwart et al.，1997，J.Virol.，71」5579-5592)(圖18和19)實施例14WNV Cp蛋白和HIV Vpr蛋白與其它調亡相關病毒蛋白的比較
Medline搜查「調亡」，「腦炎」和「腦膜炎」可得到一系列感染個體為這種病症的各種病毒。這些病毒蛋白的胺基酸序列與WNV衣殼蛋白或HIV-189.6Vpr蛋白的胺基酸序列進行比較。
與WNV衣殼蛋白的比對(圖19)1.HIV-1-WNV衣殼蛋白和一已知調亡誘導蛋白HIV-1 Vpr享有的序列同源。
2.單純皰疹病毒(HSV)-主要HSV衣殼蛋白部分與WNV Cp蛋白序列比對結果表明可能的調亡誘導能力。有趣的是，腦炎的破壞已被暗示與疾病的結果相關聯。
3.伊波拉病毒是黃病毒家族黃病毒種中的一員。這種病原體被指出能誘導出血性發熱。WNV衣殼蛋白和伊波拉病毒核衣殼蛋白的比對表明在WNV和nef調亡區有可檢測的胺基酸同源性。與WNV衣殼蛋白的糖蛋白比對也顯示原調亡區域同源性。
4.風診病毒是被膜病毒家族的一員，已被指出在體外標準點誘導調亡。風疹病毒衣殼蛋白的序列比對表明與WNV衣殼蛋白，還有HIV-1 Vpr蛋白(見圖19)和Tat蛋白的調亡區域(數據未顯示)有同源性。與HIV-1 89.6 Vpr蛋白比對(圖19)1.新德畢斯病毒-公布數據報告了新德畢斯病毒的調亡性質，特別是引導神經元細胞死亡。新德畢斯病毒p230非結構蛋白與HIV-1 Vpr蛋白和與Tat蛋白(數據未顯示)的比對表明在Bcl-2相關的調亡區域的單獨同源性。有趣的是，最近公布數據暗示通過Bax新德畢斯調亡的抑制。
2.黃瓜花葉病毒-以期公布報導已暗示黃瓜花葉病毒能誘導通過壞死完全的細胞殺傷。然而，最近的數據表明西紅柿中調亡性質與細胞死亡相關。有趣的是，我們的Vpr 89.6與CMV 2A蛋白的序列比對也顯示調亡區域的同源性。與Tat HIV基因的比較也認為與CMV衣殼蛋白有原調亡同源性。
3.HTLV-比較這種病毒與HIV-1 Tat蛋白為這種病毒的調亡誘導能力提供了可能的觀點。Tat與HTLV-1 p27蛋白的序列比對展示了調亡區域的序列同源性。
4.Nipah病毒-這種病毒是副粘病毒家族的一員，能高效使人致死。最近爆發是在新加坡，因此增加了轉移到美國的可能性。此外，病毒看起來與西尼羅病毒和其它目標為腦脊髓液，並造成神經腦炎的病毒有類似的臨床結果。比較Nipah病毒融合蛋白與HIV 89.6 Vpr蛋白得到一個有趣的相關性。在Nipah融合蛋白的細胞循環停滯區域可見到很強的同源性。這種表面蛋白可是一種強有力的DNA疫苗競爭者；所指的意思是它在調亡發展中和細胞周期停滯中起關鍵作用。
5.呼腸病毒-呼腸病毒誘導神經元細胞的TRAIL依賴性調亡和細胞周期在G2/M期停滯。在呼腸病毒次核形式Mu2蛋白與HIV 89.6 Vpr蛋白之間有同源性。
上述實施例是為了對本發明進行舉例說明，並不是用於限制本發明的。專業人士可識別在本發明本質和範圍內的修改。
權利要求
1.一種誘導細胞死亡的方法，其中含有下列步驟將分離出來的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段與細胞進行接觸，上述衣殼蛋白或其功能性片段的使用量能有效誘導細胞死亡；或者在上述細胞中引入有黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的編碼核苷酸序列的核酸分子，上述核酸分子並不存在於黃病毒或瘟病毒的整個病毒基因組中，其所含的上述的核苷酸序列在上述細胞中表達且其表達水平能有效誘導細胞死亡。
2.如權利要求1所述的方法，其特徵為所用的衣殼蛋白或其功能性片段或核酸分子是從日本腦炎病毒亞屬中的一種病毒中分離出來的。
3.如權利要求1所述的方法，其特徵為所用的衣殼蛋白或其功能性片段或核酸分子是從西尼羅病毒(WNV)中分離出來的。
4.如權利要求3所述的方法，其特徵為所用的功能性片段包含SEQ ID NO8所述的胺基酸序列。
5.如權利要求3所述的方法中，其特徵為所用的核酸分子序列所編碼的胺基酸序列為SEQ ID NO8。
6.如權利要求1所述的方法，其特徵為所用的細胞是腫瘤細胞。
7.如權利要求1所述的方法，其特徵為與細胞接觸的是黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段。
8.如權利要求1所述的方法，其特徵為被引入所述細胞的是核酸分子。
9.一種鑑定能抑制黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段誘導細胞凋亡的化合物的方法，包括的步驟有a)當存在待測物時，將細胞與黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段進行接觸，衣殼蛋白或其功能性片段的使用量必須足夠使其誘導死亡的細胞數目可被檢測出；b)將步驟a)所檢測的細胞凋亡數目與不存在上述待測組合物時，細胞與黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段接觸時所引起的凋亡數目進行比較。
10.如權利要求9所述的方法，其特徵為與細胞接觸的是黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白。
11.如權利要求9所述的方法，其特徵為與細胞接觸的是黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的功能性片段。
12.如權利要求11所述的方法，其特徵為所用的功能性片段包含SEQ IDNO8所述的胺基酸序列。
13.如權利要求9所述的方法，其特徵為所用的細胞是從含HeLa細胞，RD細胞和293細胞中的一種。
14.如權利要求9所述的方法，其特徵為所用的檢測步驟是一種檢測凋亡標記物的分析方法。
15.如權利要求14所述的方法，其特徵為所用的標記物是磷脂醯絲氨酸(PS)或游離3′-羥基DNA末端。
16.如權利要求15所述的方法，其特徵為所用的檢測方法是TUNEL法或膜聯蛋白V流式細胞計數儀分析法。
17.一種實行權利要求9所述方法的試劑盒，包括a)一個含黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的容器；和b)使用說明書，正對照，負對照，描述數據的照片，和數據圖中至少一項作為附加成分。
18.一個可注射的藥物組合物，其中包含a)病毒和瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段，或者含有黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的編碼核苷酸序列的核酸分子；和b)一個可藥用的載體。
19.如權利要求18所述的可注射用的藥物組合物，其中包含a)含有黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的核苷酸序列的核酸分子；和b)一個可藥用的載體。
20.如權利要求18所述的可注射藥用組合物，其中包含a)黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段；和b)一個可藥用的載體。
21.如權利要求18所述的可注射藥用組合物，其中包含a)WNV衣殼蛋白或其功能性片段；和b)一個可藥用的載體。
22.一種治療已確診的或被懷疑患有以細胞高度增生為特徵的疾病的個體的方法，其中包括給上述個體施用有效劑量的權利要求18中所述的可注射藥用組合物。
23.一種治療已確診的或被懷疑患有以細胞高度增生為特徵的疾病的個體的方法，其中包括給上述個體施用有效劑量的權利要求19中所述的可注射藥用組合物。
24.一種治療已確診的或被懷疑患有以細胞高度增生為特徵的疾病的個體的方法，其中包括給上述個體施用有效劑量的權利要求20中所述的可注射藥用組合物。
25.一種治療已確診的或被懷疑患有具有不希望的細胞為特徵的疾病的方法，其中包括通過給上述個體施用有效劑量的權利要求18所述的可注射藥用組合物來消除上述不希望的細胞。
26.如權利要求24所述的方法，其特徵為所用的衣殼蛋白或其功能性片段是WNV衣殼蛋白或其功能性片段。
27.如權利要求22所述的方法，其特徵為所指的疾病是癌症。
28.如權利要求22所述的方法，其特徵為給藥途徑是在腫瘤內注射可注射的藥用組合物。
29.一種鑑定感染黃病毒或瘟病毒的個體的方法，其中包含下列步驟1)將抗黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的抗體與個體樣本進行接觸；2)檢測上述抗體是否結合於樣本中的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白，其中檢測到與抗體的結合的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白是個體感染黃病毒或瘟病毒的症狀指示。
30.如權利要求24所述的方法，其特徵為所述的衣殼蛋白是WNV衣殼蛋白。
31.一個鑑定個體被黃病毒或瘟病毒感染的試劑盒，其中包含a)第一個裝有抗黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的特異抗體的容器；和b)第二個裝有黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其功能性片段的容器。
32.如權利要求31所述的試劑盒，其特徵為所述的第一個容器中裝有特異於WNV衣殼蛋白的抗體，第二個容器中裝有WNV衣殼蛋白或其功能性片段。
33.一種鑑定個體是否被黃病毒或瘟病毒感染的方法，包括的步驟有a)將樣本與黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白進行接觸；和b)檢測在上述樣本中的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白是否與抗體結合。其中檢測到與黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的結合抗體是個體被黃病毒或瘟病毒感染的病徵指示。
34.如權利要求33所述的方法，其特徵為所述的病毒是指WNV，衣殼蛋白是指WNV衣殼蛋白。
35.一種鑑定個體受黃病毒或瘟病毒感染的試劑盒包括a)第一個裝有黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白的容器；和b)第二個裝有與黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白特異結合抗體的容器。
36.如權利要求35所述的試劑盒，其特徵為所述的衣殼蛋白是WNV衣殼蛋白。
37.一種疫苗組合物，其中包含a)有效免疫劑量的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其免疫原片段；和b)一個藥用的載體。
38.如權利要求37所述的疫苗，其特徵為所述的黃病毒或瘟病毒的衣殼蛋白或其免疫原片段是指WNV的衣殼蛋白或其免疫原片段。
39.一種疫苗組合物，其中包含a)黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其免疫原片段的編碼核苷酸；和b)一個藥用的載體。
40.如權利要求39所述的疫苗，其特徵為所述的核苷酸為WNV衣殼蛋白或其免疫原片段的編碼核苷酸。
41.一種治療感染黃病毒或瘟病毒個體的方法，其治療方法為施用有治療效果劑量的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其免疫原片段，或黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其免疫原片段的編碼核苷酸。
42.如權利要求41所述的方法，其特徵為所述的感染個體的病毒是WNV病毒，所用的衣殼蛋白或其功能性片段，或衣殼蛋白或其免疫原片段的編碼核苷酸是從WNV中得到的。
43.一種保護個體不受黃病毒或瘟病毒感染的方法，該法為施用具有預防效果的劑量的黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其免疫原片段，或黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白或其免疫原片段的編碼核苷酸。
44.如權利要求43所述的方法，其特徵為所述的個體保護所抵抗的病毒是WNV，所述的衣殼蛋白或其免疫原片段，或衣殼蛋白或其免疫原片段的編碼核苷酸是來自WNV。
全文摘要
本發明提供一種使用黃病毒或瘟病毒衣殼蛋白，比如西尼羅病毒(WNV)衣殼蛋白，和其功能性片段來誘導細胞死亡的方法。本發明也提供通過施用WNV或其編碼序列藥物組合物治療遭受細胞擴增性疾病的方法。並揭示了鑑定具有抗病毒和/或抗WNV和/或抗黃病毒或抗瘟病毒衣殼蛋白或其它蛋白活性的複合物的方法。本發明還提供了包含WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒衣殼蛋白或其它蛋白，或其功能性片段，或者編碼其的核酸分子和一個藥用載體的疫苗組合物。本發明也進一步提供了鑑定個體遭受WNV或包括黃病毒或瘟病毒的其它病毒感染的診斷方法和試劑盒。
文檔編號A61P37/02GK1549730SQ01819929
公開日2004年11月24日 申請日期2001年10月4日 優先權日2000年10月4日
發明者大衛·B.·威那, 梁周成, 大衛 B. 威那 申請人:賓夕法尼亞大學託管人