新型蝙蝠冠狀病毒研究揭示新冠病毒重組起源
2023-04-01 04:28:51
新蝙蝠冠狀病毒研究揭示新冠狀病毒
科學網
1583480501作者唐毅宸
2年3月6日020，BioRxiv，一個預印的網站，發表了施偉峰的團隊在1999年對新蝙蝠冠狀病毒的研究中國科學院西雙版納熱帶植物園休斯團隊和畢玉海團隊及其合作者。他們發現了病毒尖峰蛋白的S1/S2切割位點的自然插入，並分析了新冠狀病毒的潛在重組來源。
(注意:預先錄製的網站bioRxiv上的所有論文都沒有經過同行評審)
感染人類的冠狀病毒最早是由科學家在20世紀60年代分離出來的。冠狀病毒是以冠狀病毒命名的，因為在電子顯微鏡下可以觀察到冠狀病毒的外觀
引起武漢地區肺炎流行的病毒是一種新的冠狀病毒，以前在人體內從未發現過。
儘管蝙蝠被認為是新冠狀病毒最有可能的天然宿主，但病毒的來源仍不清楚先前對
的研究表明，新的冠狀病毒與蝙蝠樣本中的冠狀病毒基因相似，兩種病毒的序列一致性高達96%，後者是2013年從中國雲南省紅鼻菊屬中分離的鼠13
這表明蝙蝠可能是新型冠狀病毒的天然宿主
在本文中，研究人員報導了一種新的蝙蝠來源的冠狀病毒，標記為RmYN02
該病毒是從2019年5月至10月從雲南省收集的227個蝙蝠樣本的宏基因組分析中鑑定的
RmYN02在全基因組範圍內與新冠狀病毒有93.3%的同源性，與最接近新冠狀病毒的1ab基因有97.2%的同源性與
相比，RmYN02在受體結合域(RBD)與新冠狀病毒具有較低的序列一致性(61.3%)，並且可能不與血管緊張素轉換酶2(ACE2)結合
然而，與新的冠狀病毒相似，RmYN02的關鍵特徵是在棘蛋白的S1和S2亞基的連接位點插入多個胺基酸
提供了強有力的證據，證明這種插入事件可能在自然界中發生
rbd結構、RmYN02的S1/S2切割位點和典型冠狀病毒b的分子特徵的同源性建模
名研究人員對RmYN02、RaTG13、新冠狀病毒和穿山甲冠狀病毒進行了系統發育分析
與以前的研究結果一致。這些穿山甲冠狀病毒形成兩個完全支持的亞科，分別代表廣西和廣東省的反走私部門緝獲的動物
但是，無論穿山甲是這些病毒的天然宿主，還是它們是從蝙蝠或其他野生動物中獨立獲得的，都需要進一步取樣和分析
更值得注意的是，在大多數病毒基因組中，RmYN02與新的冠狀病毒密切相關，儘管這兩種病毒仍然以相對較長的分支長度彼此分離
在穗狀基因樹中，新的冠病毒與鼠13成簇，但它遠離RmYN02，表明RmYN02病毒在該基因中重組
在RBD的系統發育過程中與穿山甲冠狀病毒廣東亞型關係最密切，而蝙蝠病毒則較為分散，這再次顯示了它們的重組。
最後，RNA聚合酶基因系統發育分析顯示RmYN02、RaTG13和新冠狀病毒形成了一個與穿山甲冠狀病毒不同的具有良好支持的亞系
研究人員認為，總之，這些數據表明，新的冠狀病毒可能源自蝙蝠和其他野生物種的病毒之間的多次自然重組事件。
相關論文信息:
https://doi.org/10.1101/2020.03.02.974139
