NVDIDIA GPU雲計算助力DNA定序服務

2023-08-10 17:49:11

2012 年 5月 3 日 — 美國波士頓 — 2012 年 Bio-IT World 展會 — 英偉達公司今天宣布，全球最大的基因組研究所華大基因正在推出一項服務，該服務讓世界各地的研究人員能夠以較低的價格在雲端執行下一代定序 (NGS) 生物信息學分析。

全新的「EasyGenomics 」服務由位於中國深圳的華大基因提供，該項服務將直觀的用戶界面與華大基因自動化的流水線分析、軟體以及工具相結合。它們與業內最大的定序平臺集成在一起，為生物學家、生物信息學家以及最終為內科醫生提供所需的全部內容，使其能夠提交和收到 DNA 定序數據的自動化分析。

英偉達 GPU 可加速處理大型 DNA 數據分析，與使用基於 CPU 的系統相比，能夠令處理時間從數日縮短至區區數小時。EasyGenomics 由英偉達 GPU 加速，因而為全球研究人員大大擴展了高級基因組研究功能的可用性，讓科學離低價可行的個性化藥品時代更近一步。

針對 2012 年 Bio-IT World 展會上符合資格要求的生物學家和生物信息學家，華大基因現在正在推出這項全新服務的有限免費試用。如需了解更多信息或如需申請免費試用，敬請訪問 EasyGenomics 網站。

華大基因副總裁方林 (音譯) 博士表示：「通過讓更多研究人員以更低的價格更輕鬆地加速 DNA 定序數據，我們希望能夠便於醫生在臨床診斷以及複雜的疾病研究中把運用基因組作為醫療工作的一個可行的組成部分。 GPU 加速讓科學家能夠比以往更快地分析 DNA 定序數據，將所用的時間從五天縮短至短短五個小時。在雲端充分完成部署之後，我們預計 EasyGenomics 將在基因組研究領域中掀起革命。」

EasyGenomics 雲服務採用基於英偉達 (NVIDIA®) Tesla M2070 和 M2075 GPU 的混合型計算系統，這些 GPU 連同系統 CPU 一起為 DNA 定序數據分析加速。當 EasyGenomics 服務充分完成部署時，華大基因計劃新增數以百計的英偉達 Tesla GPU 來對其進行升級，屆時預計該服務將支持數以千計的用戶。

英偉達公司 Tesla 事業部高級總監 Sumit Gupta 表示：「由於定序成本的下降，今年或將成為 1,000 美元基因組之年。我們很快將淹沒在基因組定序的海量數據當中。華大基因的 EasyGenomics 服務利用 GPU 計算的處理能力來為科學家提供一條低價且簡單易用的途徑，使其能夠輕鬆解決這種全新的大型基因數據問題，讓我們能夠離有效而低價的個性化醫療更近一步。」

從植物與大腸桿菌到大熊貓，在對各種生命形式進行基因組定序這方面，華大基因從事著開創性的工作，目的是開發出更好的藥物、改善醫療以及開發出基因更優秀的食物。華大基因總部位於中國深圳，在美國麻薩諸塞州坎布裡奇和丹麥哥本哈根設有分支機構，其目標是讓最前沿的基因組科學得到普及。